View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11737A_low_76 (Length: 410)

Name: NF11737A_low_76
Description: NF11737A
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11737A_low_76
NF11737A_low_76
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (75-410)||(20774166-20774501)
chr5 (72-410)||(22462356-22462694)
chr5 (75-410)||(28894568-28894903)
chr5 (75-410)||(28916039-28916374)
chr5 (75-410)||(28923394-28923729)
chr5 (75-410)||(20821860-20822195)
chr5 (75-410)||(22235546-22235881)
chr5 (78-410)||(21890385-21890717)
chr5 (75-410)||(17268960-17269294)
chr5 (75-406)||(21563603-21563934)
chr5 (75-410)||(24716152-24716487)
chr5 (75-410)||(24619921-24620256)
chr5 (75-410)||(22503086-22503421)
chr5 (75-410)||(24749180-24749515)
chr5 (75-410)||(25848482-25848817)
chr5 (77-410)||(21831387-21831720)
chr5 (75-410)||(14886617-14886952)
chr5 (75-410)||(20342689-20343024)
chr5 (75-376)||(22381606-22381907)
chr5 (72-410)||(24798023-24798361)
chr5 (75-391)||(19770385-19770701)
chr5 (75-391)||(27668135-27668451)
chr5 (75-410)||(23079715-23080050)
chr5 (80-394)||(25423619-25423933)
chr5 (75-391)||(14999384-14999700)
chr5 (75-391)||(34566919-34567235)
chr5 (75-391)||(37291141-37291457)
chr5 (72-394)||(20467739-20468060)
chr5 (75-393)||(23471654-23471972)
chr5 (75-391)||(16356927-16357243)
chr5 (75-403)||(22332520-22332848)
chr5 (75-391)||(22348848-22349164)
chr5 (75-391)||(27610779-27611095)
chr5 (75-391)||(27685045-27685361)
chr5 (75-391)||(40709205-40709521)
chr5 (75-276)||(21339046-21339247)
chr5 (75-391)||(41771267-41771583)
chr5 (75-391)||(27518832-27519148)
chr5 (75-391)||(29475718-29476034)
chr5 (75-391)||(22135093-22135409)
chr5 (75-403)||(23574167-23574490)
chr5 (75-301)||(21497772-21497997)
chr5 (79-270)||(21496569-21496760)
chr5 (163-403)||(26738360-26738600)
chr5 (199-410)||(37543007-37543218)
chr5 (78-276)||(18776198-18776396)
chr5 (75-223)||(23516966-23517114)
chr5 (75-204)||(20799185-20799314)
chr5 (75-187)||(23440650-23440762)
chr5 (155-298)||(21407643-21407786)
chr5 (75-204)||(37545328-37545457)
chr5 (75-142)||(922-989)
chr5 (339-403)||(23440899-23440963)
chr5 (75-130)||(26738611-26738666)
chr5 (201-403)||(20799999-20800201)
chr5 (340-391)||(21338942-21338993)
chr5 (339-394)||(23517215-23517270)
chr5 (360-394)||(21936830-21936864)
chr5 (360-394)||(24581902-24581936)
chr5 (378-406)||(21680408-21680436)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (72-410)||(681-1019)
[»] chr1 (32 HSPs)
chr1 (72-410)||(20856277-20856615)
chr1 (75-397)||(19662670-19662992)
chr1 (75-410)||(20835404-20835739)
chr1 (75-410)||(22432632-22432967)
chr1 (75-410)||(19854821-19855148)
chr1 (75-410)||(20939579-20939914)
chr1 (75-410)||(31539513-31539848)
chr1 (75-410)||(24099119-24099454)
chr1 (75-410)||(37677588-37677923)
chr1 (75-403)||(21749449-21749777)
chr1 (71-403)||(50619767-50620099)
chr1 (75-410)||(20294920-20295255)
chr1 (75-391)||(16350134-16350450)
chr1 (75-403)||(22361767-22362095)
chr1 (75-391)||(51333028-51333344)
chr1 (75-391)||(21837458-21837774)
chr1 (75-391)||(33390564-33390880)
chr1 (75-391)||(21830811-21831127)
chr1 (75-391)||(17044550-17044866)
chr1 (75-301)||(16369805-16370031)
chr1 (75-223)||(19106875-19107023)
chr1 (138-394)||(20139401-20139657)
chr1 (71-403)||(19760389-19760721)
chr1 (144-403)||(20250379-20250638)
chr1 (75-187)||(16078391-16078503)
chr1 (75-187)||(41354208-41354320)
chr1 (336-410)||(21951678-21951752)
chr1 (75-148)||(41308333-41308406)
chr1 (360-394)||(20830924-20830958)
chr1 (339-391)||(16078191-16078243)
chr1 (339-391)||(20937686-20937738)
chr1 (339-391)||(41353197-41353249)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (75-410)||(27900879-27901214)
chr4 (75-410)||(15002808-15003143)
chr4 (75-407)||(15358537-15358869)
chr4 (75-410)||(15246417-15246752)
chr4 (77-403)||(15078130-15078456)
chr4 (75-410)||(1648721-1649056)
chr4 (75-410)||(8706411-8706746)
chr4 (75-394)||(15319644-15319963)
chr4 (75-410)||(3264238-3264573)
chr4 (75-410)||(33223416-33223751)
chr4 (75-410)||(11206675-11207010)
chr4 (71-410)||(14691391-14691730)
chr4 (75-410)||(20891475-20891810)
chr4 (75-410)||(29452981-29453316)
chr4 (77-410)||(44661310-44661643)
chr4 (75-403)||(15414477-15414805)
chr4 (71-403)||(14850557-14850889)
chr4 (78-391)||(16251648-16251961)
chr4 (75-391)||(8052826-8053142)
chr4 (75-391)||(8386905-8387221)
chr4 (75-391)||(12477093-12477409)
chr4 (75-391)||(14681060-14681376)
chr4 (75-391)||(27711829-27712145)
chr4 (75-391)||(29038607-29038923)
chr4 (71-399)||(1639620-1639948)
chr4 (75-403)||(7090925-7091253)
chr4 (75-391)||(12524169-12524485)
chr4 (75-403)||(15147076-15147403)
chr4 (75-391)||(40473533-40473849)
chr4 (75-391)||(18297698-18298014)
chr4 (75-391)||(19777996-19778312)
chr4 (75-391)||(23956240-23956556)
chr4 (75-391)||(14303181-14303497)
chr4 (75-408)||(16354631-16354964)
chr4 (78-391)||(18226649-18226962)
chr4 (82-399)||(14159970-14160287)
chr4 (144-220)||(18549694-18549770)
chr4 (360-394)||(15292618-15292652)
chr4 (77-115)||(16146409-16146447)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (72-410)||(95449-95787)
scaffold0029 (79-406)||(113087-113414)
scaffold0029 (75-391)||(109277-109593)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (78-410)||(67897-68229)
scaffold0034 (75-410)||(4400-4735)
scaffold0034 (75-409)||(13349-13683)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (75-406)||(6708-7039)
[»] chr6 (55 HSPs)
chr6 (75-410)||(15459693-15460028)
chr6 (75-406)||(34645179-34645510)
chr6 (75-408)||(21563723-21564056)
chr6 (75-408)||(21569582-21569915)
chr6 (75-403)||(25768548-25768876)
chr6 (75-410)||(19453777-19454112)
chr6 (77-410)||(17415845-17416178)
chr6 (75-410)||(8762522-8762857)
chr6 (79-410)||(21471962-21472293)
chr6 (75-410)||(5296795-5297130)
chr6 (75-410)||(14381056-14381391)
chr6 (75-370)||(22796261-22796556)
chr6 (75-406)||(27560210-27560541)
chr6 (75-403)||(18795047-18795375)
chr6 (75-406)||(28282406-28282737)
chr6 (78-406)||(19879658-19879986)
chr6 (75-410)||(10468438-10468773)
chr6 (75-391)||(1542692-1543008)
chr6 (75-410)||(24364769-24365104)
chr6 (75-403)||(18407538-18407866)
chr6 (75-391)||(24312776-24313092)
chr6 (75-408)||(5838810-5839143)
chr6 (71-403)||(15896447-15896779)
chr6 (75-403)||(19865044-19865372)
chr6 (75-406)||(28262790-28263121)
chr6 (75-406)||(28341539-28341870)
chr6 (75-391)||(16626325-16626641)
chr6 (75-391)||(29591528-29591844)
chr6 (138-391)||(20636909-20637162)
chr6 (75-391)||(2874411-2874727)
chr6 (75-403)||(22762051-22762379)
chr6 (79-406)||(28291965-28292292)
chr6 (82-403)||(27391769-27392090)
chr6 (75-403)||(25112909-25113237)
chr6 (82-403)||(27331029-27331350)
chr6 (75-403)||(22078286-22078614)
chr6 (72-391)||(25609469-25609788)
chr6 (75-403)||(16927236-16927564)
chr6 (75-403)||(23078826-23079154)
chr6 (75-391)||(27187793-27188109)
chr6 (75-391)||(27261131-27261447)
chr6 (75-394)||(22434226-22434545)
chr6 (78-343)||(11280161-11280426)
chr6 (72-211)||(17032737-17032876)
chr6 (75-158)||(1641129-1641212)
chr6 (75-218)||(16963148-16963291)
chr6 (162-394)||(22442711-22442943)
chr6 (138-399)||(18197328-18197589)
chr6 (75-222)||(27559765-27559912)
chr6 (138-223)||(21836973-21837058)
chr6 (360-394)||(1648419-1648453)
chr6 (171-301)||(18966984-18967114)
chr6 (363-394)||(23996893-23996924)
chr6 (360-394)||(16381978-16382012)
chr6 (369-410)||(19435653-19435694)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (75-410)||(10419717-10420052)
chr3 (75-410)||(13322324-13322659)
chr3 (75-406)||(14086795-14087126)
chr3 (75-406)||(13971796-13972127)
chr3 (75-407)||(12360217-12360549)
chr3 (75-410)||(17492752-17493087)
chr3 (75-410)||(18134018-18134353)
chr3 (75-410)||(16827875-16828209)
chr3 (75-410)||(16836182-16836517)
chr3 (75-406)||(13942146-13942477)
chr3 (78-408)||(14574054-14574378)
chr3 (75-406)||(8758758-8759089)
chr3 (75-406)||(41177644-41177975)
chr3 (75-410)||(11303445-11303780)
chr3 (75-379)||(15952671-15952975)
chr3 (75-406)||(4678560-4678891)
chr3 (75-410)||(28754440-28754775)
chr3 (75-406)||(44777369-44777700)
chr3 (75-410)||(47124066-47124401)
chr3 (75-409)||(16380601-16380935)
chr3 (75-410)||(10384091-10384425)
chr3 (75-390)||(15227771-15228086)
chr3 (75-410)||(16338184-16338519)
chr3 (75-403)||(9522831-9523159)
chr3 (75-408)||(12498360-12498693)
chr3 (75-404)||(16329339-16329668)
chr3 (75-408)||(16491866-16492199)
chr3 (75-391)||(10005712-10006028)
chr3 (75-403)||(17489962-17490290)
chr3 (75-406)||(6600848-6601179)
chr3 (75-391)||(5424632-5424948)
chr3 (75-391)||(10906322-10906638)
chr3 (75-391)||(13252802-13253118)
chr3 (75-391)||(16635885-16636201)
chr3 (75-391)||(43163209-43163525)
chr3 (75-406)||(53384705-53385036)
chr3 (75-391)||(48425559-48425875)
chr3 (76-223)||(14126464-14126611)
chr3 (75-391)||(15347947-15348263)
chr3 (75-391)||(20061756-20062072)
chr3 (72-403)||(16371522-16371853)
chr3 (75-257)||(12850104-12850286)
chr3 (78-391)||(16411984-16412297)
chr3 (72-403)||(14876188-14876520)
chr3 (75-391)||(15589094-15589410)
chr3 (78-406)||(16756272-16756600)
chr3 (72-370)||(15061865-15062163)
chr3 (77-391)||(15339383-15339697)
chr3 (78-391)||(26792101-26792414)
chr3 (75-391)||(15402212-15402528)
chr3 (75-391)||(16806628-16806944)
chr3 (288-410)||(11960841-11960963)
chr3 (78-403)||(15209006-15209331)
chr3 (78-391)||(15724636-15724949)
chr3 (75-301)||(16692272-16692502)
chr3 (79-403)||(15248263-15248587)
chr3 (75-223)||(11564551-11564699)
chr3 (87-276)||(15015573-15015762)
chr3 (72-130)||(11960986-11961044)
chr3 (36-72)||(14685174-14685210)
chr3 (75-114)||(26008961-26009000)
chr3 (360-394)||(8274098-8274132)
chr3 (360-394)||(13967039-13967073)
chr3 (360-394)||(30138213-30138247)
chr3 (360-394)||(30147764-30147798)
chr3 (36-72)||(10790579-10790615)
chr3 (84-248)||(18748796-18748960)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (136-409)||(468-741)
[»] chr8 (57 HSPs)
chr8 (75-410)||(20975538-20975873)
chr8 (75-410)||(1266797-1267132)
chr8 (78-410)||(23655489-23655821)
chr8 (75-410)||(21840976-21841311)
chr8 (75-410)||(31416361-31416696)
chr8 (77-410)||(22061320-22061653)
chr8 (75-403)||(20388658-20388986)
chr8 (75-410)||(19851970-19852305)
chr8 (75-410)||(19858006-19858341)
chr8 (75-410)||(22371499-22371834)
chr8 (75-410)||(6679670-6680005)
chr8 (75-406)||(31570733-31571064)
chr8 (75-410)||(803560-803895)
chr8 (75-410)||(16271111-16271446)
chr8 (75-409)||(22051422-22051756)
chr8 (75-410)||(6604217-6604552)
chr8 (75-410)||(27355107-27355442)
chr8 (75-410)||(29303313-29303648)
chr8 (72-410)||(14565698-14566036)
chr8 (75-410)||(12305317-12305652)
chr8 (73-393)||(23949476-23949796)
chr8 (71-410)||(20396012-20396351)
chr8 (75-391)||(19113249-19113565)
chr8 (71-403)||(22377348-22377680)
chr8 (71-403)||(22383523-22383855)
chr8 (75-394)||(16407949-16408267)
chr8 (75-393)||(21393769-21394087)
chr8 (75-393)||(21788263-21788581)
chr8 (75-408)||(21251500-21251833)
chr8 (75-391)||(32600703-32601019)
chr8 (77-403)||(21921630-21921955)
chr8 (75-391)||(17673929-17674245)
chr8 (75-391)||(18857136-18857452)
chr8 (75-403)||(21166432-21166759)
chr8 (79-403)||(22040422-22040746)
chr8 (79-391)||(30313050-30313362)
chr8 (75-256)||(20009941-20010122)
chr8 (75-403)||(23650600-23650928)
chr8 (75-403)||(19978526-19978854)
chr8 (75-223)||(22046932-22047080)
chr8 (79-220)||(15533943-15534084)
chr8 (78-391)||(22164098-22164411)
chr8 (79-391)||(22120080-22120392)
chr8 (75-391)||(22132947-22133263)
chr8 (72-394)||(22987757-22988074)
chr8 (75-182)||(20017865-20017972)
chr8 (75-187)||(19484980-19485092)
chr8 (144-220)||(19863684-19863760)
chr8 (144-220)||(19868321-19868397)
chr8 (285-403)||(20009813-20009931)
chr8 (357-403)||(22248311-22248357)
chr8 (360-393)||(21850241-21850274)
chr8 (339-403)||(21043268-21043332)
chr8 (105-220)||(22129017-22129132)
chr8 (360-394)||(16876998-16877032)
chr8 (40-72)||(1733390-1733422)
chr8 (339-391)||(19483970-19484022)
[»] scaffold0076 (3 HSPs)
scaffold0076 (75-406)||(33128-33459)
scaffold0076 (237-410)||(56347-56520)
scaffold0076 (360-394)||(41067-41101)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (75-406)||(49965-50296)
scaffold0028 (75-391)||(43678-43994)
scaffold0028 (75-391)||(8998-9314)
scaffold0028 (75-223)||(15460-15608)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (75-410)||(6685-7020)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (75-410)||(27749-28084)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (75-410)||(51627-51962)
scaffold0067 (75-410)||(60661-60996)
scaffold0067 (75-410)||(67049-67384)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (75-410)||(118092-118427)
scaffold0004 (75-410)||(323228-323563)
scaffold0004 (75-408)||(202917-203250)
scaffold0004 (75-276)||(386343-386544)
scaffold0004 (72-301)||(112542-112771)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (75-406)||(27365067-27365398)
chr2 (75-410)||(24641866-24642201)
chr2 (75-410)||(19652036-19652371)
chr2 (75-408)||(24948713-24949046)
chr2 (228-410)||(27210156-27210338)
chr2 (75-403)||(23276900-23277228)
chr2 (75-410)||(21125143-21125476)
chr2 (75-406)||(12574477-12574808)
chr2 (75-406)||(27787865-27788196)
chr2 (75-410)||(1063875-1064210)
chr2 (75-410)||(20828383-20828718)
chr2 (75-410)||(20833109-20833444)
chr2 (75-410)||(31830782-31831117)
chr2 (75-307)||(23294082-23294314)
chr2 (123-403)||(23110907-23111187)
chr2 (75-403)||(24675613-24675941)
chr2 (75-410)||(11357858-11358193)
chr2 (78-391)||(27371396-27371709)
chr2 (75-391)||(9610260-9610576)
chr2 (75-403)||(21325257-21325585)
chr2 (75-391)||(27218140-27218456)
chr2 (75-391)||(16923013-16923329)
chr2 (75-391)||(16982276-16982592)
chr2 (75-391)||(17063841-17064157)
chr2 (75-391)||(17067499-17067815)
chr2 (75-391)||(22324859-22325175)
chr2 (75-391)||(24707485-24707801)
chr2 (138-403)||(23107721-23107986)
chr2 (78-391)||(24262497-24262810)
chr2 (75-391)||(10868974-10869290)
chr2 (75-391)||(16925484-16925800)
chr2 (75-391)||(16999124-16999440)
chr2 (75-403)||(22756456-22756784)
chr2 (75-301)||(23064201-23064427)
chr2 (78-391)||(21145044-21145357)
chr2 (75-388)||(41608391-41608704)
chr2 (75-391)||(24876752-24877068)
chr2 (75-223)||(24710157-24710305)
chr2 (75-223)||(44385740-44385888)
chr2 (77-223)||(20442684-20442830)
chr2 (75-223)||(23189131-23189279)
chr2 (331-410)||(23294315-23294394)
chr2 (75-274)||(30211037-30211236)
chr2 (84-394)||(45529644-45529954)
chr2 (71-204)||(24825472-24825605)
chr2 (215-403)||(24819677-24819865)
chr2 (237-403)||(21890709-21890875)
chr2 (360-391)||(22276687-22276718)
chr2 (332-391)||(24710415-24710474)
chr2 (336-391)||(44385572-44385627)
chr2 (360-393)||(12640234-12640267)
chr2 (96-249)||(25128792-25128945)
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (77-410)||(14285807-14286140)
chr7 (78-410)||(13666023-13666355)
chr7 (75-410)||(6413994-6414329)
chr7 (75-410)||(13021840-13022175)
chr7 (75-410)||(19147694-19148029)
chr7 (75-410)||(20747093-20747428)
chr7 (75-410)||(15102034-15102369)
chr7 (75-406)||(18053388-18053719)
chr7 (75-406)||(23505305-23505636)
chr7 (75-410)||(14263675-14264010)
chr7 (72-410)||(11305694-11306032)
chr7 (75-410)||(14130356-14130691)
chr7 (75-410)||(14434174-14434509)
chr7 (71-394)||(15625030-15625353)
chr7 (75-410)||(16949902-16950237)
chr7 (75-410)||(49152784-49153119)
chr7 (78-394)||(16071741-16072057)
chr7 (207-406)||(19613290-19613489)
chr7 (75-403)||(11387866-11388194)
chr7 (75-391)||(12206250-12206566)
chr7 (72-410)||(15340911-15341249)
chr7 (75-410)||(8211559-8211894)
chr7 (73-403)||(11771701-11772031)
chr7 (73-408)||(840-1175)
chr7 (75-410)||(12456185-12456520)
chr7 (75-410)||(13968099-13968434)
chr7 (75-410)||(26118036-26118371)
chr7 (75-391)||(12687983-12688299)
chr7 (75-391)||(9596539-9596855)
chr7 (75-391)||(18551230-18551546)
chr7 (75-391)||(8199110-8199426)
chr7 (75-391)||(44790823-44791139)
chr7 (75-402)||(14040178-14040504)
chr7 (75-402)||(14350208-14350534)
chr7 (75-391)||(11236685-11237001)
chr7 (75-391)||(8708087-8708403)
chr7 (75-391)||(10871477-10871793)
chr7 (75-391)||(11552574-11552890)
chr7 (75-391)||(13686546-13686862)
chr7 (75-391)||(14332879-14333195)
chr7 (75-391)||(15160529-15160845)
chr7 (71-403)||(15154117-15154449)
chr7 (75-391)||(18178224-18178540)
chr7 (252-410)||(12457300-12457458)
chr7 (79-391)||(16788-17100)
chr7 (84-403)||(21662452-21662771)
chr7 (75-248)||(14955102-14955275)
chr7 (108-391)||(23203085-23203368)
chr7 (108-391)||(23509212-23509495)
chr7 (262-394)||(321506-321638)
chr7 (84-248)||(4440419-4440583)
chr7 (75-133)||(23199451-23199509)
chr7 (360-394)||(27107243-27107277)
chr7 (75-111)||(12457262-12457298)
chr7 (36-68)||(14325743-14325775)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (75-410)||(19644-19979)
[»] scaffold0298 (5 HSPs)
scaffold0298 (75-410)||(20507-20842)
scaffold0298 (75-353)||(12865-13143)
scaffold0298 (75-353)||(16635-16913)
scaffold0298 (349-410)||(11504-11565)
scaffold0298 (349-410)||(15274-15335)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (75-410)||(41443-41776)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (82-410)||(25312-25640)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (75-410)||(40262-40597)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (75-410)||(21118-21453)
scaffold0235 (151-410)||(10904-11163)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (75-410)||(48654-48989)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (75-410)||(46846-47181)
scaffold0010 (75-410)||(41780-42115)
scaffold0010 (75-403)||(2445-2773)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (77-410)||(3277-3610)
scaffold0035 (144-220)||(12833-12909)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (75-403)||(27048-27376)
scaffold0192 (75-253)||(26666-26844)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (82-410)||(195151-195479)
scaffold0011 (72-410)||(149091-149429)
scaffold0011 (73-403)||(25987-26317)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (75-410)||(114704-115044)
scaffold0001 (75-276)||(90513-90714)
scaffold0001 (71-394)||(390663-390986)
scaffold0001 (136-276)||(89835-89975)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (75-394)||(10317-10636)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (75-410)||(5782-6117)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (77-394)||(18000-18317)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (75-403)||(6690-7019)
scaffold0149 (75-403)||(11121-11450)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (151-410)||(2188-2447)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (78-409)||(47651-47982)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (75-410)||(4899-5234)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (72-409)||(12233-12570)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (78-410)||(100999-101331)
scaffold0020 (77-403)||(180725-181051)
[»] scaffold0120 (3 HSPs)
scaffold0120 (75-410)||(971-1306)
scaffold0120 (75-391)||(6547-6863)
scaffold0120 (339-391)||(12846-12898)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (168-410)||(5830-6072)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (75-394)||(6499-6818)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (75-410)||(44029-44364)
scaffold0114 (75-410)||(45041-45376)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (177-410)||(13746-13979)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (75-398)||(2336-2657)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (75-410)||(31934-32269)
scaffold0106 (75-408)||(14563-14896)
scaffold0106 (75-223)||(17965-18113)
scaffold0106 (155-391)||(18321-18557)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (75-410)||(51310-51645)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (96-410)||(81279-81593)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (75-403)||(1426-1754)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (79-403)||(28222-28546)
scaffold0064 (79-403)||(40213-40537)
[»] scaffold0053 (3 HSPs)
scaffold0053 (218-410)||(57294-57486)
scaffold0053 (72-394)||(48497-48819)
scaffold0053 (75-133)||(57541-57599)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (75-410)||(11293-11628)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (75-410)||(4954-5289)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (75-393)||(393-711)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (72-409)||(260829-261166)
scaffold0005 (75-391)||(278296-278612)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (75-410)||(5274-5609)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (75-410)||(596-931)
scaffold0139 (75-202)||(28043-28170)
scaffold0139 (75-202)||(34296-34423)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (75-353)||(11412-11690)
scaffold0124 (75-256)||(5-186)
scaffold0124 (349-410)||(12996-13057)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (75-410)||(3315-3650)
scaffold0403 (75-408)||(6896-7229)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (151-410)||(7660-7919)
scaffold0222 (75-410)||(2802-3137)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (75-410)||(2318-2653)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (75-410)||(43307-43642)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (78-410)||(249140-249472)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (216-388)||(49437-49609)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (77-391)||(19375-19689)
scaffold0090 (77-391)||(23537-23851)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (215-410)||(528-723)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (75-410)||(24519-24853)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (228-410)||(5-183)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (75-409)||(17883-18206)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (187-410)||(14644-14867)
scaffold0261 (187-410)||(22823-23046)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (75-410)||(16160-16495)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (75-403)||(19126-19454)
scaffold0081 (75-276)||(50017-50218)
scaffold0081 (138-403)||(34613-34878)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (71-391)||(1428-1748)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (138-410)||(12081-12353)
scaffold0483 (75-158)||(9782-9865)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (76-408)||(19451-19783)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (75-403)||(32207-32534)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (75-410)||(32766-33101)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (75-410)||(26785-27120)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (75-408)||(6573-6906)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (75-394)||(1991-2310)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (75-394)||(4555-4874)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (71-410)||(25166-25505)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (77-399)||(218875-219197)
scaffold0012 (71-403)||(229563-229895)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (73-390)||(3872-4189)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (73-390)||(9118-9435)
scaffold0109 (73-391)||(33039-33357)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (75-403)||(15870-16198)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (75-391)||(160-476)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (71-403)||(3660-3992)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (75-403)||(14884-15212)
scaffold0044 (75-391)||(1144-1460)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (75-249)||(4399-4573)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (138-403)||(39465-39730)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (75-403)||(277-605)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (75-403)||(63485-63813)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (79-403)||(3911-4232)
scaffold0023 (75-252)||(130672-130849)
scaffold0023 (75-274)||(28963-29161)
scaffold0023 (84-210)||(59287-59413)
scaffold0023 (339-403)||(28826-28890)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (75-403)||(14533-14861)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (75-403)||(3268-3596)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (75-275)||(13011-13211)
scaffold0293 (339-391)||(13256-13308)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (75-403)||(220-548)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (75-391)||(7921-8237)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (71-410)||(9490-9829)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (212-403)||(28718-28909)
scaffold0026 (75-217)||(37726-37868)
scaffold0026 (185-403)||(29578-29797)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (78-391)||(112953-113266)
scaffold0040 (75-403)||(15401-15729)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (75-403)||(4553-4881)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (75-391)||(7463-7779)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (75-403)||(16179-16507)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (75-301)||(18761-18987)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (253-410)||(20096-20253)
scaffold0104 (253-410)||(22916-23073)
scaffold0104 (75-256)||(1052-1233)
scaffold0104 (156-256)||(12582-12682)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (75-408)||(25498-25831)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (75-251)||(622-798)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (91-403)||(2914-3226)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (75-391)||(7890-8206)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (75-391)||(22391-22707)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (151-403)||(8541-8793)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (79-391)||(65933-66245)
scaffold0042 (75-403)||(39274-39601)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (75-249)||(68199-68373)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (105-402)||(4425-4722)
scaffold0270 (105-402)||(11555-11852)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (75-391)||(938-1254)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (72-403)||(1197-1528)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (71-394)||(116368-116691)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (75-394)||(196941-197260)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (75-403)||(6538-6866)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (75-391)||(8314-8630)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (75-394)||(5745-6064)
[»] scaffold2094 (1 HSPs)
scaffold2094 (285-410)||(508-633)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (75-276)||(80075-80276)
scaffold0022 (71-103)||(126953-126985)
[»] scaffold0379 (2 HSPs)
scaffold0379 (215-403)||(7345-7533)
scaffold0379 (71-187)||(12647-12763)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (75-222)||(844-991)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (75-391)||(7797-8110)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (348-410)||(7592-7654)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (75-301)||(9867-10093)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (78-202)||(4953-5077)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (151-403)||(24098-24350)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (84-394)||(5055-5364)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (77-403)||(1791-2117)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (75-169)||(10428-10522)
scaffold0130 (231-391)||(10274-10434)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (75-214)||(1523-1662)
scaffold0413 (339-403)||(1681-1745)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (360-410)||(20888-20938)
scaffold0077 (360-394)||(27729-27763)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (337-403)||(17467-17533)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (360-401)||(880-921)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (154-211)||(86156-86213)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (215-403)||(11651-11839)
scaffold0018 (215-403)||(17843-18031)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (239-310)||(17524-17595)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (162-249)||(71830-71917)
scaffold0021 (96-249)||(33021-33174)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (360-394)||(3338-3372)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (360-394)||(3967-4001)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (360-394)||(24203-24237)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (360-410)||(3391-3441)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (360-394)||(44347-44381)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (84-249)||(182-347)
[»] scaffold1701 (1 HSPs)
scaffold1701 (36-68)||(28-60)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (75-115)||(195-235)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (378-406)||(34015-34043)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 288; Significance: 1e-161; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 20774166 - 20774501
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20774166 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaaccttg 20774265  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20774266 ggtctctgtctgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 20774365  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20774366 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcgaagtattaggtaaacttgacacaaaatccatagaa 20774465  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20774466 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 20774501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Original strand, 22462356 - 22462694
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22462356 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 22462455  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462456 ttgggtctctatctgacactatacttgacggaactccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 22462555  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462556 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 22462655  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22462656 gaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggt 22462694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28894903 - 28894568
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28894903 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28894804  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894803 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28894704  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28894703 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28894604  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28894603 atactatcccatttccactccggtacatccaacggt 28894568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28916374 - 28916039
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28916374 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28916275  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28916274 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28916175  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28916174 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28916075  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28916074 atactatcccatttccactccggtacatccaacggt 28916039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 28923729 - 28923394
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28923729 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctccaaaacctcgaagtaaaccttg 28923630  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28923629 ggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataactgatattaat 28923530  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28923529 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccatatcgaatcatgtcctctcggagtattaggcaaacttgtcacaaaatccatagaa 28923430  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28923429 atactatcccatttccactccggtacatccaacggt 28923394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 20821860 - 20822195
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  20821860 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaacctcg 20821959  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20821960 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatttccgccaactgagctactggataacttatattaat 20822059  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20822060 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaactacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacgaaatccatagaa 20822159  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20822160 atactatcccatttccactccggtacatccaacggt 20822195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22235881 - 22235546
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||||    
T  22235881 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccttg 22235782  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||||    
T  22235781 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactaagctaccgaataactaatattaat 22235682  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22235681 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaaccaatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22235582  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  22235581 atgctatctcacttccactccggcacatccaacggt 22235546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 78 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21890717 - 21890385
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  21890717 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggat 21890618  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||     
T  21890617 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcgg 21890518  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21890517 aataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatagacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattttgtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 21890418  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  21890417 ttgtcccacttccactctggcacatctaacggt 21890385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 17269294 - 17268960
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | | | ||||||| |||||||   | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  17269294 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaatt-agtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 17269196  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  17269195 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 17269096  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  17269095 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 17268996  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17268995 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggt 17268960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21563934 - 21563603
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21563934 tccgactgaccatatgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21563835  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  21563834 gatctctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaat 21563735  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | ||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||     
T  21563734 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatcgtgccctcttggagtattcggtaaacttgtcacaaaatccatggat 21563635  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21563634 atgctatcccatttccactccggcacatccaa 21563603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24716487 - 24716152
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24716487 tccgactgaccatctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24716388  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24716387 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24716288  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24716287 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24716188  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716187 ataatgtcccatttccactccggtacatccaacggt 24716152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24620256 - 24619921
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24620256 tccgactgaccatctgtctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24620157  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24620156 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24620057  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24620056 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24619957  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24619956 ataatgtcccatttccactccggtacatccaacggt 24619921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 22503086 - 22503421
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  22503086 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 22503185  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22503186 gatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 22503285  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22503286 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctttcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22503385  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22503386 atactgtcccacttccactccgatacatccaacggt 22503421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24749515 - 24749180
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||| ||||| |    
T  24749515 tccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcg 24749416  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||| ||||| ||    
T  24749415 aatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccatattatgaatgtaaatctctgccaactctgctaccggataactaatatttat 24749316  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||    
T  24749315 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttgctaaactcgtcacgaaatccatagaa 24749216  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24749215 ataatgtcccatttccactccagtacatccaacggt 24749180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 25848482 - 25848817
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||||| |  |||| || || ||||| ||||| |    
T  25848482 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcg 25848581  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  25848582 gatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctactggataactgatattgat 25848681  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| ||||| ||||||||| |||||| ||| || |||||||| || |  |||||| | |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  25848682 aggaataaagtgtgccgacttcatcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgctctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 25848781  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25848782 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 25848817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21831720 - 21831387
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||| |     
T  21831720 cgactgaccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcga 21831621  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||| |  |||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| || |    
T  21831620 tctctatctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgattg 21831521  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||| |||||||||||||||| ||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||  | ||    
T  21831520 gaataaagtgcgccgacttcgacaatctatcaacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaatcttgttacaaaatccatgcatat 21831421  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  21831420 gctatctcattttcactccggcacatctaacggt 21831387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14886952 - 14886617
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  14886952 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 14886853  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14886852 gatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 14886753  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||| ||  ||| ||| || |||||||| || ||||||||||| ||     
T  14886752 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggag 14886653  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14886652 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 14886617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 20342689 - 20343024
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20342689 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20342788  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20342789 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 20342888  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| ||||||||| |||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20342889 aggaatgaagtgtgccgacttcctcaaccggtcgacaacgacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20342988  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20342989 atactgtcccacttccactccggtacgtccaacggt 20343024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 376
Target Start/End: Original strand, 22381606 - 22381907
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  22381606 tccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 22381705  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||  || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22381706 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaacataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 22381805  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22381806 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctatcaaccagaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 22381905  T
Q  375 at 376  Q
    ||    
T  22381906 at 22381907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24798361 - 24798023
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||    
T  24798361 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 24798262  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    | || || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24798261 tcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatatt 24798162  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || | |||||| ||  ||| ||| || |||||||| || |||||||||||     
T  24798161 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatggcatcatgtcctttcgaagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatg 24798062  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  24798061 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 24798023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 19770385 - 19770701
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19770385 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19770484  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  19770485 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 19770584  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  19770585 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggat 19770684  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  19770685 atactatcccatttcca 19770701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27668451 - 27668135
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27668451 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27668352  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27668351 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 27668252  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27668251 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 27668152  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  27668151 atactatcccatttcca 27668135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23080050 - 23079715
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||  |||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  23080050 tccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 23079951  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      || ||||| || || ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23079950 aatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 23079851  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
       |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  23079850 atgaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 23079751  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||  | ||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  23079750 atattgtccgacttccactccggcacatccaacggt 23079715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 80 - 394
Target Start/End: Original strand, 25423619 - 25423933
Alignment:
Q  80 ctgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtct 179  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25423619 ctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttggatct 25423718  T
Q  180 ctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaa 279  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||| |||||||||| ||    
T  25423719 ctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaatcggaa 25423818  T
Q  280 tgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgct 379  Q
      || || ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||    
T  25423819 gaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatact 25423918  T
Q  380 atcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||    
T  25423919 atcccatttccactc 25423933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14999700 - 14999384
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||  || || |||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14999700 tccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14999601  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  14999600 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 14999501  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14999500 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 14999401  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  14999400 atactatcccatttcca 14999384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 34566919 - 34567235
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  34566919 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 34567018  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  34567019 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 34567118  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  34567119 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 34567218  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  34567219 atactatcccatttcca 34567235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37291457 - 37291141
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  37291457 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 37291358  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  37291357 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 37291258  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||| ||     
T  37291257 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 37291158  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  37291157 atactatcccatttcca 37291141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 72 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20468060 - 20467739
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  20468060 ctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacc 20467961  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    | || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||| | |||||||||||   | ||||| ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||    
T  20467960 tcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgtcaactgagatacaggacaactgatatt 20467861  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||||||||||||||||||     
T  20467860 aatcggaatgaa-tgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatg 20467762  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    || || |||||||||||||||||    
T  20467761 gatatactatcccatttccactc 20467739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 393
Target Start/End: Original strand, 23471654 - 23471972
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  23471654 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 23471753  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || || || ||||  ||||| | ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||    
T  23471754 gatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgtagcttcacaatattgcgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatattaat 23471853  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || || |||||||||||||| || || || |  || || ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23471854 cggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacacaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 23471953  T
Q  375 atgctatcccatttccact 393  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23471954 atgctatcccatttccact 23471972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 16356927 - 16357243
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16356927 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16357026  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16357027 gatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16357126  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16357127 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16357226  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  16357227 atactatcccatttcca 16357243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22332848 - 22332520
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22332848 tccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22332749  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  22332748 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 22332649  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22332648 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22332549  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || |||||||| ||||| ||||| |||||    
T  22332548 atactatcccacttccattccggcacatc 22332520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 22348848 - 22349164
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||   || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22348848 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22348947  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  22348948 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 22349047  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||  || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22349048 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataaccctaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 22349147  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  22349148 atactatcccatttcca 22349164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 27610779 - 27611095
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27610779 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27610878  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27610879 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27610978  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || ||||| |||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27610979 aggtagaaaatgagctgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27611078  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  27611079 atactatcccatttcca 27611095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27685361 - 27685045
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27685361 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27685262  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27685261 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 27685162  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27685161 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 27685062  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  27685061 atactatcccatttcca 27685045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 40709205 - 40709521
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40709205 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 40709304  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  40709305 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 40709404  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  40709405 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 40709504  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  40709505 atactatcccatttcca 40709521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 21339247 - 21339046
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  21339247 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 21339148  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21339147 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatataaatctccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 21339048  T
Q  275 cg 276  Q
    ||    
T  21339047 cg 21339046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 41771267 - 41771583
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41771267 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41771366  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||| ||||    
T  41771367 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatactaat 41771466  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  41771467 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 41771566  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  41771567 atactatcccatttcca 41771583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 27518832 - 27519148
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27518832 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27518931  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27518932 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27519031  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27519032 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27519131  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  27519132 atactatcccatttcca 27519148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 29476034 - 29475718
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |||||| |  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29476034 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29475935  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | || ||| || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  29475934 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttaatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 29475835  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  29475834 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 29475735  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  29475734 atactatcccatttcca 29475718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 22135093 - 22135409
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22135093 tccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22135192  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  22135193 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 22135292  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22135293 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 22135392  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  22135393 atactatcccatttcca 22135409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 23574167 - 23574490
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  23574167 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 23574266  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||  ||  ||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  23574267 gatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttaatatagatctctgccaactgggcaaccggaaaactaatattaat 23574366  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||     || || |  |||||  | |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23574367 cggtagaaaatgagccgacttcgtca-----tcaacaatcacccaatttgtgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 23574461  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23574462 atactatcccatttccactctggcacatc 23574490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21497997 - 21497772
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| ||| || |||||||||  |||||||| ||||    
T  21497997 tccggctgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttccaaaatccagaagtaaatcttg 21497898  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21497897 gatctctatctgacacaatgctcga-agaacaccatgcaacttcacaatatcatgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 21497799  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 301  Q
    || ||  || || ||||||||||||||    
T  21497798 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 21497772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 79 - 270
Target Start/End: Original strand, 21496569 - 21496760
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||||  | || || |||||||   ||| ||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || ||    
T  21496569 actgaccatctatttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatc 21496668  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  21496669 tctatccgacacaatacttgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatatccgccaactgagctaccggaaaactaatat 21496760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 163 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26738600 - 26738360
Alignment:
Q  163 aagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggata 262  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||| ||||  || ||| |    
T  26738600 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaattgagaaacaggaaa 26738501  T
Q  263 actgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcaca 362  Q
    | ||||||||||   || ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||    
T  26738500 attgatattaattagaaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcaca 26738401  T
Q  363 aaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26738400 aaatccatggatatgctatcacatttccactctggtacatc 26738360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 199 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 37543218 - 37543007
Alignment:
Q  199 acggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgt 298  Q
    ||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||    
T  37543218 acggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgactttgt 37543119  T
Q  299 caacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggt 398  Q
    ||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| |||    
T  37543118 caaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagagataatgtcccacttccactctggt 37543019  T
Q  399 acatccaacggt 410  Q
    ||||| ||||||    
T  37543018 acatctaacggt 37543007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 78 - 276
Target Start/End: Original strand, 18776198 - 18776396
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18776198 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggat 18776297  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||| ||| | ||  || || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||||||||    
T  18776298 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctccttgatttaaatctccgccaattgggcaacaggaaaactaatattaatcg 18776396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 23516966 - 23517114
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| |||||||| ||||    
T  23516966 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactctttcaaaatctagaagtaaatcttg 23517065  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  |||||||    
T  23517066 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaat 23517114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Original strand, 20799185 - 20799314
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||||| |||| || |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  20799185 tccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttg 20799284  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaa 204  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  20799285 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Original strand, 23440650 - 23440762
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  23440650 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 23440749  T
Q  175 ggtctctatctga 187  Q
    | |||||||||||    
T  23440750 gatctctatctga 23440762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 155 - 298
Target Start/End: Original strand, 21407643 - 21407786
Alignment:
Q  155 aaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagct 254  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||||||||||||| |    
T  21407643 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacggatataaatctccgccaactgagat 21407742  T
Q  255 actggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgt 298  Q
    || ||| ||||||| ||||||| ||| || || |||||||||||    
T  21407743 acaggaaaactgatgttaatcggaataaaatgggccgacttcgt 21407786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37545457 - 37545328
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || |||||| || |||| || || ||||| ||||| |    
T  37545457 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttccagaacctagaagtgaacctcg 37545358  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaa 204  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||    
T  37545357 gatctctatccgacacaatgctagacggaa 37545328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 989 - 922
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttg 142  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||    
T  989 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttg 922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 403
Target Start/End: Original strand, 23440899 - 23440963
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23440899 ggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 23440963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26738666 - 26738611
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacc 130  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||    
T  26738666 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttagaacc 26738611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 201 - 403
Target Start/End: Original strand, 20799999 - 20800201
Alignment:
Q  201 ggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtca 300  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| | || ||||||||||  |  || || |||||||| ||||    
T  20799999 ggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaacctaatattaatcggtagaaaatgagccgactttgtca 20800098  T
Q  301 acctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtac 400  Q
    | || || |  | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  20800099 atctatcaataataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggtaaacgcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcac 20800198  T
Q  401 atc 403  Q
    |||    
T  20800199 atc 20800201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 340 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21338993 - 21338942
Alignment:
Q  340 gagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  21338993 gagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttcca 21338942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 394
Target Start/End: Original strand, 23517215 - 23517270
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  23517215 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactc 23517270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 21936864 - 21936830
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21936864 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 21936830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Original strand, 24581902 - 24581936
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24581902 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 24581936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 21680436 - 21680408
Alignment:
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680436 ctatcccatttccactccggtacatccaa 21680408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1019 - 681
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||     
T  1019 ctttccgaatgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttcaagtaaact 920  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  919 ttgggtctctatttgacactatactcgacggaaccccatgcaatttcacaatattctgaatgtagatctccgctaactgagctactggataactgatatt 820  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  819 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 720  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  719 gaaatgttatcccatttccactctggtacttccaacggt 681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 32)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20856615 - 20856277
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  20856615 ctttccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacc 20856516  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856515 ttgggtctctatctgacactatacttgacggaacaccatgcaacttaacaatattctaaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 20856416  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20856415 aatcagaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 20856316  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20856315 gaaatgatatcccatttccactctggtacctccaacggt 20856277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 75 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 19662992 - 19662670
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  19662992 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 19662893  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19662892 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 19662793  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||| ||    
T  19662792 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccacatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccataaaa 19662693  T
Q  375 atgctatcccatttccactccgg 397  Q
    ||||||| ||| |||||||||||    
T  19662692 atgctataccacttccactccgg 19662670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20835739 - 20835404
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||| | ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20835739 tccgattgaccgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 20835640  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| || |||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20835639 gatccctatccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 20835540  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || |||| |||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20835539 cggaataaaatgcgtcgactttgtcaacatgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 20835440  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20835439 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 20835404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22432967 - 22432632
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || ||  |||| ||||| |    
T  22432967 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctataagtgaacctcg 22432868  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  22432867 gatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgcagcttcacaattttctgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 22432768  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  22432767 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaattatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 22432668  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22432667 atgctatcccatttccactctggtacatccaacggt 22432632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 19854821 - 19855148
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  19854821 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 19854920  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| || || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  19854921 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcaccatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 19855020  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||||||||||||        |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19855021 cggaataaagtgcgccgactt--------tgtcaaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 19855112  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  19855113 atgctatcccacttccactctggcacatccaacggt 19855148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20939914 - 20939579
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||    |||| ||  ||||||| || ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  20939914 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 20939815  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||  ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  20939814 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcattatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccgaataattgatattaat 20939715  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20939714 cgaaataaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagcgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 20939615  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20939614 ataaaatcccacttccactccggcacatccaacggt 20939579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31539848 - 31539513
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  31539848 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 31539749  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31539748 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 31539649  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||     
T  31539648 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagag 31539549  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31539548 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 31539513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24099454 - 24099119
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||  ||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  24099454 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 24099355  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || || | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  24099354 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattgat 24099255  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  24099254 tggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatagcatcatgccctctcgtagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 24099155  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24099154 atactgtcccatttccactccggcacatctaacggt 24099119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 37677588 - 37677923
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  37677588 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 37677687  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37677688 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 37677787  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  37677788 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactagttacaaaatccatagag 37677887  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  37677888 atactatcccacttccactccggtacatctaacggt 37677923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 21749449 - 21749777
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21749449 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21749548  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  21749549 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 21749648  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  21749649 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 21749748  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21749749 atactatcccatttccactctggcacatc 21749777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 50620099 - 50619767
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  50620099 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaat 50620000  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||    ||| || ||||| ||||||||||  ||  || |||||||||    
T  50619999 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatttcacaatatcacaaatataaatctctgccaactgagaaacaagaaaactgatat 50619900  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    ||||||  ||||| || ||| |||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  50619899 taatcgggatgaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 50619800  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  50619799 ggatatactatcccatttccactctggtacatc 50619767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 20294920 - 20295255
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||| |||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20294920 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20295019  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||||||||||||    
T  20295020 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgagtaactgatattaat 20295119  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || | |||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  20295120 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaataacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 20295219  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||  | ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20295220 ataatgtcccacttccagtccggtacatccaacggt 20295255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16350450 - 16350134
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16350450 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16350351  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  16350350 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 16350251  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  16350250 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16350151  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  16350150 atactatcccatttcca 16350134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22362095 - 22361767
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || |  ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22362095 tccgactgaccatatgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22361996  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| |   || ||| |||| ||||||||    
T  22361995 ggtctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctccgccaactaataaacaggaaaactaatattaat 22361896  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22361895 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22361796  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22361795 atactatcccatttccactctggcacatc 22361767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 51333344 - 51333028
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  51333344 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 51333245  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  51333244 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 51333145  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  51333144 cggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 51333045  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  51333044 atactatcccatttcca 51333028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 21837458 - 21837774
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21837458 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21837557  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  21837558 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 21837657  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21837658 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctgggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21837757  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  21837758 atactatcccatttcca 21837774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33390880 - 33390564
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  33390880 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 33390781  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  33390780 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 33390681  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  33390680 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 33390581  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  33390580 atactatcccatttcca 33390564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 21830811 - 21831127
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21830811 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21830910  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  21830911 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 21831010  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |   |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21831011 ctgtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggat 21831110  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  21831111 atactatcccatttcca 21831127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17044866 - 17044550
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  17044866 tccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 17044767  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||    
T  17044766 gatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacaggaaaactaatattaat 17044667  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || ||| |||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17044666 cggtagaaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17044567  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  17044566 atactatcccatttcca 17044550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 301
Target Start/End: Original strand, 16369805 - 16370031
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  | || ||  | ||||| ||||   |||||||||| |||||||| || |    
T  16369805 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatctcg 16369904  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   |||| || ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  16369905 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagctataggaaaactgatattaat 16370004  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 301  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  16370005 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaa 16370031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 19106875 - 19107023
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||  |||    
T  19106875 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatattg 19106974  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19106975 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19107023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 394
Target Start/End: Original strand, 20139401 - 20139657
Alignment:
Q  138 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 237  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| |    
T  20139401 tcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcccaaatgtaaa 20139500  T
Q  238 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 337  Q
    | || |||||| |||  || ||  |||| |||||||||| ||  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| ||    
T  20139501 tttctgccaaccgagaaacagggaaactaatattaatcggaagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgtgtcattccctct 20139600  T
Q  338 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  20139601 aggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactc 20139657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 19760721 - 19760389
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  || ||||||| || ||||||    
T  19760721 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttctaaaatctagaggtaaac 19760622  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    || || | |||||| || || ||  |||| ||||| ||||| | |||||||||||     ||||| |||||||| |||| || |||  || |||||||||    
T  19760621 ctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgtagcttcacaatatcgcagatgtaaatctccgctaactaagatacatgaaaactgatat 19760522  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||||||| || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| || |  ||||  ||  |||||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  19760521 taatcgaaattaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatagcgtcatttcctttcggagtactcggcaaacttgtcacaaaatccat 19760422  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19760421 ggatatactatctcatttccactctggcacatc 19760389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 144 - 403
Target Start/End: Original strand, 20250379 - 20250638
Alignment:
Q  144 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccg 243  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||| || || ||||| ||||| |||||| | ||||||||||   |||| || ||||| |    
T  20250379 aaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgccaattcacaatatcacgaatataaatctctg 20250478  T
Q  244 ccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagt 343  Q
    |||||||||  || ||| ||||||||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||    
T  20250479 ccaactgagaaacaggaaaactgatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtaattccctttaggagt 20250578  T
Q  344 attaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||| || ||||| ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| || |||||    
T  20250579 attcggaaaactcgtcacaaaatccatgtatatactatcccatttccactctggcacatc 20250638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 16078503 - 16078391
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  16078503 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 16078404  T
Q  175 ggtctctatctga 187  Q
    | |||||||||||    
T  16078403 gatctctatctga 16078391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 41354320 - 41354208
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41354320 tccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41354221  T
Q  175 ggtctctatctga 187  Q
    | |||||||||||    
T  41354220 gatctctatctga 41354208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 336 - 410
Target Start/End: Original strand, 21951678 - 21951752
Alignment:
Q  336 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21951678 ctcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 21951752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 148
Target Start/End: Original strand, 41308333 - 41308406
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaact 148  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||    
T  41308333 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaact 41308406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 20830958 - 20830924
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20830958 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 20830924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16078243 - 16078191
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16078243 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 16078191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 391
Target Start/End: Original strand, 20937686 - 20937738
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20937686 ggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 20937738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 41353249 - 41353197
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  41353249 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 41353197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 27900879 - 27901214
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |    
T  27900879 tccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccccg 27900978  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27900979 ggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaat 27901078  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901079 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27901178  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27901179 atgctgtcccatttccactccggtacatccaacggt 27901214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15003143 - 15002808
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  15003143 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 15003044  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||| | ||| ||    
T  15003043 ggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaaccgagctaccggataactaacattgat 15002944  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  15002943 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 15002844  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| |||| ||| || ||||| ||||||    
T  15002843 atgatctcccacttccgctctggcacatctaacggt 15002808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 75 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 15358869 - 15358537
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| | |||  ||| |||||||||||| ||||| |    
T  15358869 tccgactgaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatcttgaagtgaacctcg 15358770  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15358769 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 15358670  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  15358669 tggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcagaaaatccatagaa 15358570  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaac 407  Q
    || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15358569 atactgtcccatttccactccggcacatccaac 15358537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 15246417 - 15246752
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15246417 tccgactgaccatctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15246516  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      |||||||| || || |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||    
T  15246517 aatctctatccgatacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaatattgtgaatataaatctctgccaactgagctattggataactaatattgat 15246616  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  15246617 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaa 15246716  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  15246717 atgctatcccacttccactccggcacatctaacggt 15246752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 9e-80
Query Start/End: Original strand, 77 - 403
Target Start/End: Original strand, 15078130 - 15078456
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| ||     
T  15078130 cgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgga 15078229  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  15078230 tctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccaccaactaagctaccggaaaactaatattgatcg 15078329  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||| || |||||||||||| ||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |||||    
T  15078330 gaataaaatgcgccgacttcatcaacctttcaacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaatccatggaaat 15078429  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    | | ||||| |||||||| || |||||    
T  15078430 gttgtcccacttccactctggcacatc 15078456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1649056 - 1648721
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  || ||||||| ||||| ||||| |    
T  1649056 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttctaaaatctggaagtgaacctcg 1648957  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | |||||||||||  ||||| || ||||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||    
T  1648956 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgaagcttcacaatatgatgaatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatattaat 1648857  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1648856 aggaatgaaatgtgccgacttagtcaacctatcgaccacaacccatatagaattatgccctctcggagtattaggtaaactcgttacaaaatccatagaa 1648757  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  1648756 atgctgtcccatttccactccagtatatccaacggt 1648721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 8706411 - 8706746
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8706411 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8706510  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||    
T  8706511 gatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattgat 8706610  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| |||||||||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  8706611 tggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggat 8706710  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  8706711 atgctatctcatttccactccggcacatctaacggt 8706746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 15319644 - 15319963
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  15319644 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 15319743  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  15319744 gatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatttccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 15319843  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  || || ||| |||| ||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  15319844 cgggataaaatgccccgagttcgtcaacctatcaacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 15319943  T
Q  375 atgctatcccatttccactc 394  Q
    ||| | ||||| ||||||||    
T  15319944 atgttgtcccacttccactc 15319963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3264573 - 3264238
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  3264573 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 3264474  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3264473 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 3264374  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  3264373 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 3264274  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  3264273 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 3264238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 33223416 - 33223751
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  33223416 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 33223515  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  33223516 gatctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 33223615  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  33223616 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaatccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 33223715  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33223716 atactgtcccacttccattccggtacatccaacggt 33223751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11207010 - 11206675
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  || | || || ||||| |||||      
T  11207010 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttcaagaacctagaagtgaacctca 11206911  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  11206910 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtatatctctgctaactgcgctaccggataactgatattaat 11206811  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||| | ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  11206810 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaatcggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 11206711  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11206710 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 11206675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Original strand, 14691391 - 14691730
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  14691391 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 14691490  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  14691491 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcgggaatgtaaatctccaccaactgaggtacaggaaaactgatat 14691590  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  14691591 tactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 14691690  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14691691 ggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggt 14691730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 20891475 - 20891810
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  20891475 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 20891574  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||| |||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  20891575 gatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaacttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 20891674  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||     
T  20891675 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacgaaatccatagag 20891774  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20891775 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 20891810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29453316 - 29452981
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  29453316 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 29453217  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  29453216 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatgttaat 29453117  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  29453116 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 29453017  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  29453016 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 29452981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 44661643 - 44661310
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| ||     
T  44661643 cgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcgga 44661544  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||| || |    
T  44661543 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattgatag 44661444  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  44661443 gaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagagat 44661344  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  44661343 actatcccacttccactccggtacatctaacggt 44661310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15414805 - 15414477
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||| | ||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  15414805 tccgactggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttg 15414706  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||  || || | | |||| ||||||||    
T  15414705 gatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactatgccaccgaaaaactaatattaat 15414606  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| || |||||||| || || || || || | |||||| | ||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15414605 cggaataaagtgtgctgacttcgttaatctatcaacaaccagccatatggcatcatgccctctcgaagtattcagtaaacttgttacaaagtccatggat 15414506  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||    
T  15414505 atgctatcccatttccactctggcacatc 15414477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14850889 - 14850557
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  14850889 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 14850790  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||  | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||  || ||| |||| ||||    
T  14850789 ctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaattcccgccaactgagaaacaggaaaactcatat 14850690  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  || ||||||| || |||||  ||||||||| |||    
T  14850689 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattccctttctgagtattcggaaaactcatcacaaaatacat 14850590  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || ||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  14850589 ggatatgttatcccatttccactctggtacatc 14850557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16251961 - 16251648
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16251961 gactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16251862  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||     
T  16251861 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcgg 16251762  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | |||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | ||     
T  16251761 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgaatata 16251662  T
Q  378 ctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||    
T  16251661 ctatcccatttcca 16251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8053142 - 8052826
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8053142 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8053043  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| || ||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8053042 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgctaactgggcaacagggaaactaatattaat 8052943  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || ||||||||||||||||| || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8052942 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8052843  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  8052842 atactatcccatttcca 8052826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 8386905 - 8387221
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8386905 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8387004  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8387005 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8387104  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8387105 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8387204  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  8387205 atactatcccatttcca 8387221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 12477093 - 12477409
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12477093 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12477192  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  12477193 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 12477292  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12477293 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12477392  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  12477393 atactatcccatttcca 12477409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 14681060 - 14681376
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14681060 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14681159  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  14681160 gatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 14681259  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14681260 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 14681359  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||| ||||||    
T  14681360 atactatcccttttcca 14681376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 27711829 - 27712145
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27711829 tccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27711928  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27711929 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27712028  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27712029 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgtgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27712128  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  27712129 atactatcccatttcca 27712145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 29038923 - 29038607
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29038923 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29038824  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  29038823 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 29038724  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  29038723 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 29038624  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  29038623 atactatcccatttcca 29038607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 71 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 1639948 - 1639620
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||     
T  1639948 tctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaat 1639849  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattct-gaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgata 269  Q
    ||||| ||||||||||| || || || || ||||| ||||||||||||||||| |||| | || || ||||| | |||||||||||| ||| ||||||||    
T  1639848 cttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat-ttctcggatataaatctctgtcaactgagctacgggaaaactgata 1639750  T
Q  270 ttaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatcca 369  Q
    ||||||| ||  || || |||| ||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  1639749 ttaatcggaagaaaatgagccgtcttcgtcaatctatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatcca 1639650  T
Q  370 tagaaatgctatcccatttccactccggta 399  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||    
T  1639649 tggatatgctatcccacttccactctggta 1639620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 7090925 - 7091253
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| || ||||||| ||||||||  |||    
T  7090925 tccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttctaaaatctagaagtaaattttg 7091024  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattct-gaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaa 273  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||    
T  7091025 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat-ttctcgaatatagatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaa 7091123  T
Q  274 tcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccataga 373  Q
    ||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||  ||||  |||| |||  | |||||||| |  |||||||||||||||||||| ||    
T  7091124 tcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccctaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaaacttgtcacaaaatccatgga 7091223  T
Q  374 aatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7091224 tatactatcccatttccactctggcacatc 7091253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 12524169 - 12524485
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  12524169 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 12524268  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| || ||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  12524269 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgctaactgggcaacaggaaaactaatattaat 12524368  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12524369 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12524468  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  12524469 atactatcccatttcca 12524485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15147403 - 15147076
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  15147403 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttg 15147304  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||||||||  ||||||  || |  ||| |||||||||||||    
T  15147303 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttaatatagatctctaccaactaggcaataggaaaactgatattaat 15147204  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  15147203 cg-tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 15147105  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15147104 atactatcccatttccactctggcacatc 15147076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 40473533 - 40473849
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  40473533 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 40473632  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||  |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  40473633 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctttgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 40473732  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  40473733 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 40473832  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  40473833 atactatcccatttcca 40473849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 18297698 - 18298014
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||| |||||| |||||||| ||||    
T  18297698 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccgaaatctagaagtaaatcttg 18297797  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  18297798 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 18297897  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||| ||| ||     
T  18297898 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaattcatggat 18297997  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  18297998 atactatcccatttcca 18298014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19778312 - 19777996
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19778312 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19778213  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  19778212 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttggtataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 19778113  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19778112 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19778013  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  19778012 atactatcccatttcca 19777996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 23956240 - 23956556
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23956240 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23956339  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  23956340 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 23956439  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  23956440 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 23956539  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  23956540 atactatcccatttcca 23956556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14303497 - 14303181
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14303497 tccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14303398  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  14303397 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 14303298  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14303297 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 14303198  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  14303197 atactatcccatttcca 14303181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16354964 - 16354631
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  16354964 tccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 16354865  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||  |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16354864 gatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaatctctttaatataaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 16354765  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  |||| ||| |   ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16354764 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16354665  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  16354664 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 16354631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18226962 - 18226649
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |    
T  18226962 gactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaatcttggat 18226863  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||| |||||| || || ||||| || || ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||| |||||||||||||||     
T  18226862 ctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaatcgg 18226763  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  18226762 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 18226663  T
Q  378 ctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||    
T  18226662 ctatcccatttcca 18226649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 82 - 399
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160287
Alignment:
Q  82 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 181  Q
    ||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  182 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 281  Q
     ||| | || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || || ||||||||||  || ||| |||| |||||||| | || |    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatttctgccaactgagacacaggaaaactaatattaattggaagg 14160169  T
Q  282 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 381  Q
    || || |||||||| ||||  || |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||| | |||||||||||||| || |||||||    
T  14160170 aaatgagccgacttagtcagtctatagacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaaatcgtcacaaaatccatggatatgctat 14160269  T
Q  382 cccatttccactccggta 399  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  14160270 cccatttccactctggta 14160287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 18549770 - 18549694
Alignment:
Q  144 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 220  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18549770 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 15292652 - 15292618
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15292652 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 15292618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 77 - 115
Target Start/End: Original strand, 16146409 - 16146447
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaa 115  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16146409 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaa 16146447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 95787 - 95449
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  95787 ctttccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctccaaaatctcgaagtaaacc 95688  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  95687 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattctggatgtagatttccgccaactgagctactgggtaacttatatt 95588  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  95587 aatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacgaaatccata 95488  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  95487 gaaatactatcccatttccactccggtacatccaacggt 95449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 79 - 406
Target Start/End: Original strand, 113087 - 113414
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| |  ||    
T  113087 actgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcgaatc 113186  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||||| | | |||| || ||||| |||||||| || || | | |||||||||| || | |    
T  113187 tctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaatgtcccgaatataaatctctgccaactgcgccaccgtaaaactgatatttattgga 113286  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    || |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||| |    
T  113287 ataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatattgaatcatgtcctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatac 113386  T
Q  379 tatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  113387 tatcccatttccactccggtacatccaa 113414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 109593 - 109277
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  109593 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 109494  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  109493 gttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 109394  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  109393 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatcgat 109294  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  109293 atactatcccatttcca 109277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 78 - 410
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68229
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcgg 68096  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  68097 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaagtccatagaaatg 68196  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
     | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  68197 ttgtcccatttccactccagtacatccaacggt 68229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 4735 - 4400
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  4735 tccgactgaccatctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcg 4636  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  4635 gatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagctttacaatattatgaatataaatctccgccaactgagccaccggataactaatattaat 4536  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4535 cggaataaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4436  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  4435 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 4400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 75 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 13683 - 13349
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  13683 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctct 13584  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |  ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||| | || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13583 gattcctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgactataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 13484  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  13483 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaacttgttacaaaatccatagaa 13384  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacgg 409  Q
    ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  13383 atattgtcccacttccactccggcacatctaacgg 13349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Original strand, 6708 - 7039
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||| |||||||    
T  6708 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttccaaaatctagaagtgaaccttg 6807  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6808 ggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgcaacttcacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 6907  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6908 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatggaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 7007  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7008 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 7039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 55)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 15459693 - 15460028
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15459693 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttg 15459792  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  15459793 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacgatattatgaatgtaaatctctgccagctgagctactggataacttatattaat 15459892  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15459893 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 15459992  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15459993 atgctatcccatttccactccggtatatccaacggt 15460028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 34645510 - 34645179
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  34645510 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttg 34645411  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||| ||||| || || || ||| |||||||||| ||    
T  34645410 gatccctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctctgccaattgcgccaccggaaaactgatatttat 34645311  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  34645310 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgactacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 34645211  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34645210 atactatcccatttccactccggtacatccaa 34645179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21564056 - 21563723
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21564056 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21563957  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      ||||||||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21563956 aatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaatattatgaatatatatctccgccaactgagctacctgataactgatattgat 21563857  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21563856 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 21563757  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21563756 atgttatcccatttccactccggcacatccaacg 21563723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 21569915 - 21569582
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21569915 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21569816  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      ||||||||  |||| ||||||||| | || ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  21569815 aatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaatattatgaatatatatctccgccaactgagctaccagataactgatattgat 21569716  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21569715 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 21569616  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21569615 atgttatcccatttccactccggcacatccaacg 21569582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 25768548 - 25768876
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||| ||||||| |    
T  25768548 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcg 25768647  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  25768648 gatctctatcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattataaatgtaaatctccgccaactgagctactggaaaactaatattgat 25768747  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |||||| || |||||||||||||||||| | || || |||||||| || | |||||| ||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  25768748 cgaaataaaatgcgccgacttcgtcaacgtatcgacgacaacccaaatggcatcatgtcccctcgaagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 25768847  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || || ||||| |||||||| || |||||    
T  25768848 atactgtcccacttccactctggcacatc 25768876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 19453777 - 19454112
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  19453777 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 19453876  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19453877 gatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 19453976  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19453977 cggaataaagtgcgctgactttgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 19454076  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19454077 atgatatcccaattccactccggcacatccaacggt 19454112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Original strand, 17415845 - 17416178
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| ||     
T  17415845 cgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcgga 17415944  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17415945 tccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattg 17416044  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  17416045 gaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgactactacccaaatggcatcatgtcctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaat 17416144  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  17416145 gttatcccacttccactccggcacatccaacggt 17416178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8762857 - 8762522
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  8762857 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 8762758  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  8762757 gatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaatatcatgaatatagatctccgccaactgagctaccggataattgatatcaat 8762658  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8762657 cagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctctgagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatataa 8762558  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  8762557 atgtcgtcccacttccactccggcacatccaacggt 8762522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 79 - 410
Target Start/End: Original strand, 21471962 - 21472293
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| || ||    
T  21471962 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatc 21472061  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||      
T  21472062 tctatccgacacaatactcgatggaactccatgaaacttcacaataatatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggg 21472161  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| ||| |||||| ||| || || |    
T  21472162 ataaaatgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcgcaaaattcatggagatac 21472261  T
Q  379 tatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    | ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21472262 tgtcccacttccactccggtacatctaacggt 21472293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 5297130 - 5296795
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  5297130 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 5297031  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| ||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  5297030 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaatataaatctcagccaactgagctacccgataattgatgttaat 5296931  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5296930 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactagtcacaaaatccatagaa 5296831  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5296830 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 5296795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14381391 - 14381056
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  14381391 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 14381292  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||| |||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  14381291 gatctctattcgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctcccccaactgagctaccaggtaactaatattaat 14381192  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  14381191 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 14381092  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  14381091 atgctatctcacttccactccggcacatccaacggt 14381056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22796556 - 22796261
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||  || |||| ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  22796556 tccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 22796457  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| | ||    
T  22796456 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactaataatgat 22796357  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    || ||| ||||| | |||||| |||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22796356 cggaataaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccat 22796261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27560541 - 27560210
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27560541 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27560442  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  27560441 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 27560342  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  27560341 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27560242  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27560241 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 27560210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 18795047 - 18795375
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| ||||   |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  18795047 tccgattgaccatccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttccataatctagaagtgaacctcg 18795146  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |   | || || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||    
T  18795147 gatctctatctgacacagtactcgacggaacaccatgcatcttcacaatgtcacggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactgatatttat 18795246  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18795247 cggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaaattgtcacaaaatccatagaa 18795346  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||| | ||||| |||||||| || |||||    
T  18795347 atgttgtcccacttccactctggaacatc 18795375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28282737 - 28282406
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  28282737 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 28282638  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  28282637 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 28282538  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  28282537 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 28282438  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28282437 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 28282406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 78 - 406
Target Start/End: Original strand, 19879658 - 19879986
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || |    
T  19879658 gactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggat 19879757  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | |   || || |||||||||||||| || |  ||| |||||||||| ||||     
T  19879758 ctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccagatataaatctccgccaactgcgccatcggaaaactgatatttatcgg 19879857  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||  ||||||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||||||    
T  19879858 aataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatattgaatcatatcccctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagaaatg 19879957  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19879958 ctatcccatttccactctggtacatccaa 19879986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10468773 - 10468438
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| ||||||||  ||||||| || || || ||||| |    
T  10468773 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccaaaacctagaggtgaacctcg 10468674  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||||| || |  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10468673 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatattatggacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 10468574  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||     
T  10468573 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaattgcttcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatctatagag 10468474  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10468473 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 10468438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1543008 - 1542692
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1543008 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1542909  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1542908 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 1542809  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||| || | ||  | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  1542808 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatatttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 1542709  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  1542708 atactatcccatttcca 1542692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 24364769 - 24365104
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  24364769 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 24364868  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||| | |||||| ||||||| ||    
T  24364869 gatctctattcgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctgccggataattgatattgat 24364968  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  24364969 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagat 24365068  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24365069 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 24365104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18407866 - 18407538
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||    
T  18407866 tccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagacgtaaaccttg 18407767  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| |||||| |||  || ||| |||||||||||||    
T  18407766 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaacagagaaacaggaaaactgatattaat 18407667  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||| | ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  18407666 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 18407567  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  18407566 atactatcccatttccactctggcacatc 18407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24313092 - 24312776
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24313092 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24312993  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  24312992 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactgatattaat 24312893  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24312892 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24312793  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  24312792 atactatcccatttcca 24312776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 5839143 - 5838810
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  5839143 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 5839044  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || |||||  |||||||||  || ||| |||| ||||| ||    
T  5839043 gatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttgatataaatctctaccaactgagaaacaggaaaactaatatttat 5838944  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||||||||| || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  5838943 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactagtcacaaaatccatggat 5838844  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  5838843 atactatcccatttccattccggcacatctaacg 5838810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 15896447 - 15896779
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |   | ||||| |||||  |||||||| | |||||| ||    
T  15896447 tctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatac 15896546  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||    ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  15896547 ctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatat 15896646  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||| |||||| || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||     ||| |||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15896647 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaataacgccattccctttcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccat 15896746  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || || ||||||||||||||||  ||||||||    
T  15896747 ggatatactatcccatttccactttggtacatc 15896779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 19865044 - 19865372
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19865044 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19865143  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||  ||||| ||||| ||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || ||  || |||||||||||||    
T  19865144 gatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacacgaaaactgatattaat 19865243  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19865244 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19865343  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  19865344 atactatcccatttccactctggcacatc 19865372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28263121 - 28262790
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28263121 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 28263022  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  28263021 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 28262922  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  28262921 aggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 28262822  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28262821 atactatcccatttccattccggcacatccaa 28262790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28341870 - 28341539
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  28341870 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 28341771  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  28341770 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcaaaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 28341671  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  28341670 aggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 28341571  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28341570 atactatcccatttccattccggcacatccaa 28341539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16626641 - 16626325
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||  |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16626641 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16626542  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16626541 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 16626442  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16626441 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16626342  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  16626341 atactatcccatttcca 16626325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 29591844 - 29591528
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| | |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  29591844 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 29591745  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  29591744 gatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 29591645  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  | ||| || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  29591644 cggtaggaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 29591545  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  29591544 atactatcccatttcca 29591528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20637162 - 20636909
Alignment:
Q  138 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 237  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  20637162 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataga 20637063  T
Q  238 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 337  Q
    |||| ||||||||||  || |||||||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  20637062 tctctgccaactgagaaacaggataactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 20636963  T
Q  338 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20636962 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 20636909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2874727 - 2874411
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  2874727 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 2874628  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||  |||| ||||||||    
T  2874627 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacagggaaactaatattaat 2874528  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  2874527 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 2874428  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  2874427 atactatcccatttcca 2874411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22762379 - 22762051
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||| | |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22762379 tccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22762280  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  22762279 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 22762180  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |  ||  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22762179 cataagaaaatgagccgacttagtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22762080  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22762079 atactatcccatttccactctggcacatc 22762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 79 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 28292292 - 28291965
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28292292 actgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 28292193  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |      
T  28292192 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaataggt 28292093  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  28292092 aggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatac 28291993  T
Q  379 tatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28291992 tatcccatttccattccggcacatccaa 28291965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 82 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27392090 - 27391769
Alignment:
Q  82 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 181  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27392090 gaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 27391991  T
Q  182 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 281  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| | ||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||      
T  27391990 atctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaaga 27391891  T
Q  282 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 381  Q
    || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||    |||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27391890 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattcccttaaggagtatttggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctat 27391791  T
Q  382 cccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||| |||| || |||||    
T  27391790 cccatttctactctggcacatc 27391769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 25112909 - 25113237
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  25112909 tccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 25113008  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  25113009 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 25113108  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  25113109 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgat 25113208  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||    
T  25113209 atactatcccatttccattctggtacatc 25113237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 82 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 27331350 - 27331029
Alignment:
Q  82 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 181  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || |||| |||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  27331350 gaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 27331251  T
Q  182 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 281  Q
    |||||| || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| | ||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||      
T  27331250 atctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgtcaactgagaaacaggaaaacttatattaatcggaaga 27331151  T
Q  282 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 381  Q
    || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||    |||||||  || || ||||||||||||||||| || |||||||    
T  27331150 aaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattcccttaaggagtatagggcaagcttgtcacaaaatccatggatatgctat 27331051  T
Q  382 cccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||| |||| || |||||    
T  27331050 cccatttctactctggcacatc 27331029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22078614 - 22078286
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || || ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22078614 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22078515  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||   |||| |||||||| | ||||||||  || ||| ||||||||||||     
T  22078514 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatatctcgaatatagatctctgtcaactgagaaacaggaaaactgatattaac 22078415  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || ||||||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || |||||  ||||||||||||  ||     
T  22078414 cggaagaaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcgttccctttaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccacggat 22078315  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || |||||||| |||||||| || |||||    
T  22078314 atactatcccacttccactctggcacatc 22078286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25609788 - 25609469
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  25609788 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 25609689  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    |||| ||||||||||| || ||  |||| ||||| |||||||||||||| || |  | ||  || ||||| ||||| ||||  || ||| |||||||| |    
T  25609688 ttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcacgatctctttaacataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactgatact 25609589  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||| | || ||||| ||||| ||||||||     
T  25609588 aatcgccagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtaatcggcaaactcgtcacgaaatccatg 25609489  T
Q  372 gaaatgctatcccatttcca 391  Q
    || || ||||||||||||||    
T  25609488 gatatactatcccatttcca 25609469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16927564 - 16927236
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || | ||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  16927564 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 16927465  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    ||||||||| ||| || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| |  | ||| || | ||| |||||||  || || ||| ||||||| |||||    
T  16927464 ggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctctttaatataaacctctgccaactatgcaacaggaaaactgatgttaat 16927365  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16927364 cggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16927265  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  16927264 atactatcccatttccactctggcacatc 16927236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 23078826 - 23079154
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||    |||||||||||  || ||||||| |||||||| ||||    
T  23078826 tccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactcttcaaaaatctagaagtaaatcttg 23078925  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   |||| || || |||||||||||||  ||  || |||||||||||||    
T  23078926 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatctcgaatataaatttccgccaactgagacacatgaaaactgatattaat 23079025  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || |||||| || ||| |||||||||| || ||||| |  ||||| ||||  |||| | |  | ||||||||    ||||| |||||||||||||| ||     
T  23079026 cggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatcgcgtcattcactttaggagtattctaaaaactcgtcacaaaatccatggat 23079125  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  23079126 atactatctcatttccactctggtacatc 23079154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 27187793 - 27188109
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27187793 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27187892  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27187893 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27187992  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || || |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27187993 aggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27188092  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  27188093 atactatcccatttcca 27188109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 27261447 - 27261131
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27261447 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27261348  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27261347 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27261248  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || || |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27261247 aggtagaaaatgagctgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggtgtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27261148  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  27261147 atactatcccatttcca 27261131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 22434226 - 22434545
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||  |||||||| ||||    
T  22434226 tccgactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatccagaagtaaatcttg 22434325  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |  ||| || ||||| | |||||| || || ||| |||||||||||||    
T  22434326 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttccataatataaatctctgtcaactgggcaacaggaaaactgatattaat 22434425  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |   |  || || ||||||||||||||  | || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22434426 cagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22434525  T
Q  375 atgctatcccatttccactc 394  Q
    || |||||||||||||||||    
T  22434526 atactatcccatttccactc 22434545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 11280426 - 11280161
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| || || ||||| || |    
T  11280426 gactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggat 11280327  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    |||||||||| || |||||||| | ||  ||||||||||||||||| | | | || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||| ||||     
T  11280326 ctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaacttcacaatttcccggatataaatctctgccaactgtgccaccggaaaactgatatttatcgg 11280227  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagt 343  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |  || || |||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  11280226 aataaagtgcgccaacttcgtcaatccatcgactacaaccaatattgaatcatgtcccctcggagt 11280161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 72 - 211
Target Start/End: Original strand, 17032737 - 17032876
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  17032737 ctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 17032836  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatg 211  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  17032837 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 158
Target Start/End: Original strand, 1641129 - 1641212
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaat 158  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| ||||||||    
T  1641129 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 16963291 - 16963148
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || | ||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| || |    
T  16963291 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctcg 16963192  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttc 218  Q
    ||||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||    
T  16963191 ggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttc 16963148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 162 - 394
Target Start/End: Original strand, 22442711 - 22442943
Alignment:
Q  162 gaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggat 261  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || | |  ||| || ||||| | |||||| || || |||     
T  22442711 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttccataatataaatctctgtcaactgggcaacaggaa 22442810  T
Q  262 aactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac 361  Q
    ||||||||||||||   |  || || ||||||||||||||  | || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||    
T  22442811 aactgatattaatcagtagaaaatgagccgacttcgtcaatatatcgacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcac 22442910  T
Q  362 aaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  22442911 aaaatccatggatatactatcccatttccactc 22442943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 138 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 18197589 - 18197328
Alignment:
Q  138 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 237  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |    
T  18197589 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaa 18197490  T
Q  238 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 337  Q
    |||| || ||||||| |||   | ||||||| ||||||| |||||| ||  | |||||||||||  | || || |  ||||| || |  || | |||  |    
T  18197489 tctctgctaactgagatacaaaaaaactgatgttaatcggaatgaaatgatctgacttcgtcaatttatccacaatcacccaaatagcgtcgttcccttt 18197390  T
Q  338 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggta 399  Q
     |||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||    
T  18197389 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcatatgctatcccatttccactctggta 18197328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 27559912 - 27559765
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27559912 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27559813  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 222  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||    
T  27559812 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 138 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 21837058 - 21836973
Alignment:
Q  138 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21837058 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21836973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 1648453 - 1648419
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1648453 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 1648419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 171 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18967114 - 18966984
Alignment:
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||||| |||||||||||||  ||  |||||  ||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| |||  || ||||||| |    
T  18967114 cttggatctctatctgacataatgatcgacaaaacaccatgtaccttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaagaaaactgatgt 18967015  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 301  Q
    |||||| |||||| || |||||| |||||||    
T  18967014 taatcggaatgaaatgagccgacgtcgtcaa 18966984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 363 - 394
Target Start/End: Original strand, 23996893 - 23996924
Alignment:
Q  363 aaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23996893 aaatccatagaaatgctatcccatttccactc 23996924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16382012 - 16381978
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16382012 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 16381978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 369 - 410
Target Start/End: Original strand, 19435653 - 19435694
Alignment:
Q  369 atagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19435653 atagaaatactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 19435694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 10420052 - 10419717
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10420052 tccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctccaaaatcttgaagtaaaccttg 10419953  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  10419952 ggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacgatattatgaatgtaaatctccgccagctgagctactggataacttatattaat 10419853  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10419852 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccatatagaatcgtgtcctctcggggtattgggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 10419753  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10419752 atgctatcccatttccactccggtatatccaacggt 10419717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13322659 - 13322324
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | ||  | |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||      
T  13322659 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacctca 13322560  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13322559 gatccctatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctctgccaactgagctaccggataactgatattaat 13322460  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  13322459 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaactcgtcacaaaatccatagag 13322360  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13322359 atgctgtcccatttccactccggtacatccaacggt 13322324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Original strand, 14086795 - 14087126
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  14086795 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 14086894  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  14086895 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 14086994  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14086995 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14087094  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14087095 atactatcccatttccactccggtacatccaa 14087126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 13972127 - 13971796
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  13972127 tccgactgaccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 13972028  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  13972027 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 13971928  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13971927 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 13971828  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13971827 atactatcccatttccactccggtatatccaa 13971796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 12360549 - 12360217
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  12360549 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttccataatctagatgtgaacctcg 12360450  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||  |||||  ||||||||||    
T  12360449 gatccctatccgacacaatactctacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgagctatcggatatttgatattaat 12360350  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12360349 cggaataaagtgcgccaactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12360250  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaac 407  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  12360249 atgttatcccacttccactccggcacatccaac 12360217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 17492752 - 17493087
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  17492752 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 17492851  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| || || | || | ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17492852 gatctctatccgaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataattgatattaat 17492951  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || ||||||||||||||||| || || || | ||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17492952 tggaataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcgacaataacccatatggcatcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 17493051  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  17493052 atgctatcccacttcaactctggtacatccaacggt 17493087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 18134353 - 18134018
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||    || || |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  18134353 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 18134254  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18134253 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtaaccttacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 18134154  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18134153 cggaataaagtgcgccgaattcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccattgaa 18134054  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  18134053 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 18134018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16828209 - 16827875
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| ||| |  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  16828209 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtgaacctcg 16828110  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  16828109 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 16828010  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  16828009 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcca-cacaacccaaatggcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 16827911  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  16827910 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggt 16827875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16836517 - 16836182
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| ||||| || || ||||| |    
T  16836517 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcg 16836418  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16836417 gatctctatccgatgcaatactcgacggaactccatgaagcttcacaacattatgaatgtaaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 16836318  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| || |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16836317 aggaatgaagtgcgccgactttgtcaacttgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctcttggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 16836218  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  16836217 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggt 16836182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Original strand, 13942146 - 13942477
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  13942146 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 13942245  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||| | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  13942246 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 13942345  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  13942346 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 13942445  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13942446 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 13942477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 78 - 408
Target Start/End: Original strand, 14574054 - 14574378
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||    |    
T  14574054 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaat 14574153  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||         
T  14574154 ctctatctgacacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactg--atta----g 14574247  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14574248 aataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 14574347  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||    
T  14574348 ctatcccacttccactctggcacatctaacg 14574378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 8759089 - 8758758
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  8759089 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 8758990  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  8758989 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 8758890  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  8758889 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 8758790  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8758789 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 8758758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Original strand, 41177644 - 41177975
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  41177644 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 41177743  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  41177744 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 41177843  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  41177844 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 41177943  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41177944 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 41177975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11303780 - 11303445
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || || |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  11303780 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 11303681  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  11303680 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccagataactaatattgat 11303581  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  11303580 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacgacgacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaa 11303481  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11303480 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggt 11303445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 15952975 - 15952671
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15952975 tccgactgaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15952876  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||   ||||| ||    
T  15952875 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataagcaatattgat 15952776  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||| |||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||    
T  15952775 cggaataaagtgtgccgacttcgtcagcctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaa 15952676  T
Q  375 atgct 379  Q
    |||||    
T  15952675 atgct 15952671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Original strand, 4678560 - 4678891
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  4678560 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 4678659  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| || | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4678660 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 4678759  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  4678760 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4678859  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4678860 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 4678891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 28754440 - 28754775
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||||||||| |    
T  28754440 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcg 28754539  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28754540 gatctctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaat 28754639  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||     
T  28754640 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggggtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 28754739  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  28754740 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 28754775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Original strand, 44777369 - 44777700
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||  |||| ||||||||  |||| || || ||||||||||| |    
T  44777369 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtaaacctcg 44777468  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||||| | | || || || || || |||||||||||||| |||||| |||| || ||    
T  44777469 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgtagcttcacaacactatgtatataaatttcagccaactgagctaccggataattgatgttgat 44777568  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  44777569 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccaccacccaaatcgaatcatgtcccttcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 44777668  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44777669 atgctatcccatttccactctggtacatccaa 44777700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 47124066 - 47124401
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  47124066 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 47124165  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  47124166 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaat 47124265  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  ||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||     
T  47124266 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgcctcctcggagtgttcggtaaacttgtcacaaaatccatagag 47124365  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  47124366 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 47124401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 75 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 16380935 - 16380601
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||| | |    
T  16380935 tccgactgaccatctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcg 16380836  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16380835 gatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 16380736  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || |||||||| | ||| || || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  16380735 aggaataaaatgtgccgactttgacaatctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaagcttgtcacgaaatccatagaa 16380636  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacgg 409  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16380635 atgctatcccatttccactctggtacatccaacgg 16380601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 10384091 - 10384425
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||| | |||| || || ||||| ||||| |    
T  10384091 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttccagaacctagaagtgaacctcg 10384190  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||  ||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  10384191 gatctctatccgacacaatacta-acggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 10384289  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  10384290 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 10384389  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  10384390 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 10384425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 390
Target Start/End: Original strand, 15227771 - 15228086
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  15227771 tccgactgaccaattgtttgcggatgataagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagatgtaaatcttg 15227870  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||    |||||| ||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||||    
T  15227871 gatctctatccgatacaatactcgatggaacaccatgcagcttcgcaatatcacaaatgtaaatctctgccaactgtgccaccagaaaactaatattaat 15227970  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  15227971 cggaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaacaactacccatatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaagtccatggat 15228070  T
Q  375 atgctatcccatttcc 390  Q
    ||||||||||||||||    
T  15228071 atgctatcccatttcc 15228086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16338519 - 16338184
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||| | ||||| |    
T  16338519 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcg 16338420  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16338419 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaat 16338320  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  16338319 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcgtcatgccctcttggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagag 16338220  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16338219 atattgtcccacttccactccggtacatccaacggt 16338184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 9522831 - 9523159
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  9522831 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 9522930  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||| ||  |  ||| |||||||||||||    
T  9522931 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactaagaaataggaaaactgatattaat 9523030  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  9523031 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgggtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 9523130  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  9523131 atactatcccatttccactctggcacatc 9523159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Original strand, 12498360 - 12498693
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12498360 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12498459  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  12498460 gatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 12498559  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || ||||||||| |||| || || || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  12498560 cggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatagat 12498659  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  12498660 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 12498693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 404
Target Start/End: Complemental strand, 16329668 - 16329339
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | |||||||||||  |||| || || ||| | ||||| |    
T  16329668 tccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttccagaacctagaaatgaacctcg 16329569  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| ||    
T  16329568 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattgat 16329469  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| || ||||||||||||| ||  || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| ||||| |||||||||||     
T  16329468 aggaatgaagtgtgctgacttcgtcaaccggttgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtagactcgtcacgaaatccatagag 16329369  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatcc 404  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16329368 atactgtcccacttccactccggtacatcc 16329339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 16492199 - 16491866
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||| ||||| |||||||| ||||    
T  16492199 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccataatctagaagtaaatcttg 16492100  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  16492099 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 16492000  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||  || ||| | |||||||||||||| ||     
T  16491999 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatgcggaaaaatcgtcacaaaatccatggat 16491900  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    ||  |||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  16491899 atattatcccatttccactctggcacatctaacg 16491866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 10005712 - 10006028
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10005712 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10005811  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10005812 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10005911  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10005912 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10006011  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  10006012 atactatcccatttcca 10006028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 17489962 - 17490290
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17489962 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17490061  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  17490062 gatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatatagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 17490161  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || |  |  ||||| || |  |||| |||  |  ||||||| || ||||| | |||||||||||| ||     
T  17490162 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaattgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgacacaaaatccatggat 17490261  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||| ||||||||||| || |||||    
T  17490262 atgctatctcatttccactctggcacatc 17490290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Original strand, 6600848 - 6601179
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6600848 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6600947  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  6600948 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 6601047  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || ||||||||||| || || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  6601048 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgctccctctcggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccatcgat 6601147  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6601148 atactatcccatttccattccggcacatccaa 6601179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 5424948 - 5424632
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5424948 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 5424849  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  5424848 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 5424749  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  5424748 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatcgat 5424649  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  5424648 atactatcccatttcca 5424632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 10906322 - 10906638
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10906322 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10906421  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10906422 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10906521  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10906522 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10906621  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  10906622 atactatcccatttcca 10906638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 13252802 - 13253118
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13252802 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13252901  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| || |||||    
T  13252902 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaat 13253001  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  13253002 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 13253101  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  13253102 atactatcccatttcca 13253118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 16635885 - 16636201
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16635885 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16635984  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16635985 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16636084  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16636085 aggcaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 16636184  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  16636185 atactatcccatttcca 16636201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 43163209 - 43163525
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43163209 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 43163308  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  43163309 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 43163408  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  43163409 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 43163508  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  43163509 atactatcccatttcca 43163525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 53385036 - 53384705
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  53385036 tccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 53384937  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatat-tctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaa 273  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||    
T  53384936 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctctg-atgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaa 53384838  T
Q  274 tcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccataga 373  Q
    | |  | ||| || || ||||| ||||| || || || | |||||| || | |||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||    
T  53384837 taggtaggaaatgagctgactttgtcaatctatcaactataacccaaattgcatcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcga 53384738  T
Q  374 aatgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
     || |||||||||||||| ||||  ||||||||    
T  53384737 tatactatcccatttccattccgacacatccaa 53384705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 48425559 - 48425875
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  48425559 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 48425658  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  48425659 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 48425758  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  48425759 aggtaggaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 48425858  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  48425859 atactatcccatttcca 48425875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 76 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 14126611 - 14126464
Alignment:
Q  76 ccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgg 175  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  14126611 ccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 14126512  T
Q  176 gtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  14126511 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15348263 - 15347947
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15348263 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15348164  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15348163 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 15348064  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15348063 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15347964  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  15347963 atactatcccatttcca 15347947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 20062072 - 20061756
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20062072 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20061973  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  20061972 gatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 20061873  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  20061872 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 20061773  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  20061772 atactatcccatttcca 20061756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 403
Target Start/End: Original strand, 16371522 - 16371853
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  16371522 ctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16371621  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||| || || || | |||||| || ||  || |||| |||||    
T  16371622 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttccttaatataaatatctggcaactgggcaacatgaaaactaatatt 16371721  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| |||   |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  16371722 aatcggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcacgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatg 16371821  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  16371822 gatatactatcccatttccactctggcacatc 16371853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 12850286 - 12850104
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| ||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  12850286 tccgactgaccatctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 12850187  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctact 257  Q
    | |||||||| ||||| || || || || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12850186 gatctctatccgacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctact 12850104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16412297 - 16411984
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| || || || |||||  ||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16412297 gactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16412198  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||     
T  16412197 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcgg 16412098  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16412097 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggatata 16411998  T
Q  378 ctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||    
T  16411997 ctatcccatttcca 16411984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 72 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14876520 - 14876188
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  14876520 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 14876421  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataact-gatat 270  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| ||| |||| || || ||| ||||  ||||    
T  14876420 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgcctactgggcaacaggaaaactaaatat 14876321  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    ||||||  |  || || |||| ||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || ||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  14876320 taatcggtagaaaatgagccggcttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcattccctctaggagtattctgcaaactcgtcacaaaatccat 14876221  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  14876220 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 14876188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15589410 - 15589094
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15589410 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15589311  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15589310 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 15589211  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||  || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15589210 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaaccgatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 15589111  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  15589110 atactatcccatttcca 15589094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 78 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 16756600 - 16756272
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  16756600 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 16756501  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| |||||||| |     
T  16756500 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaatagg 16756401  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     |  || || || ||||||||||| || || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  16756400 tagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatata 16756301  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  16756300 ctatcccatttccattccagcacatccaa 16756272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 370
Target Start/End: Original strand, 15061865 - 15062163
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |    
T  15061865 ctttccgactgaccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatc 15061964  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| | || ||| || || || ||||| || || || ||| |||| |||||    
T  15061965 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttccttaatataaatatctgccaattgggcaacaggaaaactaatatt 15062064  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  15062065 aatcggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 15062163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 77 - 391
Target Start/End: Original strand, 15339383 - 15339697
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||| |||||||||||| |||  |  ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  15339383 cgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 15339482  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || |   |||| ||||||||||    
T  15339483 tctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagtgaaactaatattaatcg 15339582  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
      |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  15339583 gtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 15339682  T
Q  377 gctatcccatttcca 391  Q
     ||||||||||||||    
T  15339683 actatcccatttcca 15339697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 26792414 - 26792101
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  26792414 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 26792315  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||||||||| || || || ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| |||||||| |     
T  26792314 ctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaaatgggcaacggggaaactaatattaattgg 26792215  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     || || || ||| |||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  26792214 tataaaatgagccaacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgatata 26792115  T
Q  378 ctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||    
T  26792114 ctatcccatttcca 26792101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15402528 - 15402212
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||| | ||||  |||||||| |||||||||||| |||  || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15402528 tccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15402429  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  || | ||||||||    
T  15402428 gatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaagtaatattaat 15402329  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || | ||| |||||||||||||| ||     
T  15402328 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcatactcgtcacaaaatccatggat 15402229  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  15402228 atactatcccatttcca 15402212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 16806944 - 16806628
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  | |||||  ||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  16806944 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 16806845  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  16806844 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 16806745  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||| | || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  16806744 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacctaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaagtccatggat 16806645  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  16806644 atactatcccatttcca 16806628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 288 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11960963 - 11960841
Alignment:
Q  288 gccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatt 387  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||    
T  11960963 gccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtgtttggaaaactcgtcacaaaatccatagaaatactgtctcatt 11960864  T
Q  388 tccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  11960863 tccactccggtacatccaacggt 11960841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 78 - 403
Target Start/End: Original strand, 15209006 - 15209331
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||  |||| || ||||| |  || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||| ||    |    
T  15209006 gactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatcttccaaaatctagaagtaaatctcatat 15209105  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||   || || || || || ||||||| ||  || ||| |||||||||||||||     
T  15209106 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaataacgtggatataaatttctgccaactaagacacaggaaaactgatattaatcgg 15209205  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    |||||| |  |||||||| ||||| || || || |  | ||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  15209206 aatgaaataagccgactttgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatg 15209305  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||    
T  15209306 ctatcccatttccactctggtacatc 15209331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15724949 - 15724636
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||| |    
T  15724949 gactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttggat 15724850  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||||||||| || |  || ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||| ||||||     
T  15724849 ctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaataataatcgg 15724750  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  15724749 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 15724650  T
Q  378 ctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||    
T  15724649 ctatcccatttcca 15724636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 75 - 301
Target Start/End: Original strand, 16692272 - 16692502
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatct----tgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| || ||||||||  | |||    || |||||| |||||||||| ||||||||     
T  16692272 tccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 16692371  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||| | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  || || ||||||||||| || || || ||| |||| ||||    
T  16692372 cttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgatataaatctccgccaattgggcaacaggaaaactaatat 16692471  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 301  Q
    ||||||  | ||| || ||||||||||||||    
T  16692472 taatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaa 16692502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 79 - 403
Target Start/End: Original strand, 15248263 - 15248587
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||    ||    
T  15248263 actgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatctcatatc 15248362  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    ||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||   | || || || |||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |    
T  15248363 tctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcggatataaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcgga 15248462  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    ||||| || |||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||||  || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  15248463 atgaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatacggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgc 15248562  T
Q  379 tatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    | ||||||||||||||  |||||||    
T  15248563 tgtcccatttccactctagtacatc 15248587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 11564699 - 11564551
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||  ||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  11564699 tccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaacttcgaacccaaagcctcttgctaacttttccaaaatctagaagaaaatcttg 11564600  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  11564599 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 11564551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 87 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 15015762 - 15015573
Alignment:
Q  87 tccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctg 186  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  ||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  15015762 tccgactgcggatgatatgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttcctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctg 15015663  T
Q  187 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    | || |||||||||||||| ||||| | | ||| ||| |   |||| || || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  15015662 atacaatactcgacggaacaccatgtagcctcaaaatctcacgaatataaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatattaatcg 15015573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 72 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 11961044 - 11960986
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacc 130  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||    
T  11961044 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacc 11960986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 14685210 - 14685174
Alignment:
Q  36 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14685210 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 14685174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 75 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 26009000 - 26008961
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactca 114  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  26009000 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactca 26008961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 8274132 - 8274098
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8274132 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 8274098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 13967073 - 13967039
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13967073 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 13967039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Original strand, 30138213 - 30138247
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30138213 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 30138247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Original strand, 30147764 - 30147798
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30147764 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 30147798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 72
Target Start/End: Original strand, 10790579 - 10790615
Alignment:
Q  36 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 72  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  10790579 ttgatagctgtacacaccataggggcttccagcggtc 10790615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 84 - 248
Target Start/End: Original strand, 18748796 - 18748960
Alignment:
Q  84 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 183  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || ||   ||    
T  18748796 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaatttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgat 18748895  T
Q  184 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 248  Q
    ||||||| ||||| || ||||   |||||||| | ||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  18748896 ctgacacaatactagaaggaatatcatgcaacctaacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 18748960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 136 - 409
Target Start/End: Original strand, 468 - 741
Alignment:
Q  136 catcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgta 235  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  468 catcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaatattatgaatgta 567  T
Q  236 gatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgcccc 335  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  568 aatctctgccaactgagctactggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgatttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccct 667  T
Q  336 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacgg 409  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  668 cttggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccatttccactccggtacatccaacgg 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 57)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20975873 - 20975538
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  20975873 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 20975774  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  20975773 gatctccatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactgatattaat 20975674  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||    
T  20975673 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtatgtggtaaattcgtcacaaaatccatagaa 20975574  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20975573 atgctatcccatttccactccggcacatccaacggt 20975538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 1266797 - 1267132
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  1266797 tccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccataatctagaagtgaacctcg 1266896  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| || |||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  1266897 gatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgcagcttaacaatgttatgaatgtaaatctccgccaactgtgctacaggataactgatattaat 1266996  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || || ||  |||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  1266997 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcgtgtcctctaagagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 1267096  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1267097 atgctatcccatttccactccggcacatccaacggt 1267132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 410
Target Start/End: Original strand, 23655489 - 23655821
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |  ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || |    
T  23655489 gactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggat 23655588  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| |    
T  23655589 ctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccgccaactaagctaccggataactaatattaatcaa 23655688  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  23655689 aatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaactacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggaaatg 23655788  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
     | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23655789 ttgtcccacttccactccggcacatctaacggt 23655821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 21840976 - 21841311
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||| ||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21840976 tccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21841075  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||    
T  21841076 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgctaactgagctactggaaaactaatattgat 21841175  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||    
T  21841176 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaccaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaa 21841275  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  21841276 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggt 21841311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 31416696 - 31416361
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  31416696 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 31416597  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || | ||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31416596 gatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttataaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 31416497  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31416496 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgctcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 31416397  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  31416396 atgctatcccacttccactccggcacatctaacggt 31416361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 22061653 - 22061320
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || | |||  |||| || || ||||| ||||||||     
T  22061653 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttccagaacctagaagtgaaccttgga 22061554  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |    
T  22061553 tccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagtttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggatacttgatgttaatag 22061454  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||| || || |||| ||| || ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  22061453 gaatgaagtgcgccgactttctcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcgtgtcctctcgtagtgtttggtaaactcatcacaaaatccatagaaat 22061354  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22061353 gctatcccatttccactccggtacatccaacggt 22061320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 20388658 - 20388986
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20388658 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20388757  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||||||||| |||||||   |||| || ||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  20388758 gatctctatctgatacaattatcgacggaacaccatgcaactttacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccactggaaaactaatattgat 20388857  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||     
T  20388858 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgtcacacaatccatggat 20388957  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20388958 atgctatcccatttccactccggcacatc 20388986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 19851970 - 19852305
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19851970 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 19852069  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19852070 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcccaatattatgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgat 19852169  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19852170 cgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaa 19852269  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  19852270 atgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggt 19852305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 19858006 - 19858341
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||  ||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  19858006 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 19858105  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19858106 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcccaatattatgaatgtaaatttctgccaactgtgctaccggaaaactaatattgat 19858205  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |||||| || ||  ||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| |||    
T  19858206 cgaaataaaatgtaccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtctcaaaatccatggaa 19858305  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  19858306 atgctgtcccacttccactctggcacatcgaacggt 19858341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 22371499 - 22371834
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||| ||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  22371499 tccgactcaccatctgtttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcg 22371598  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||  ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22371599 gatctctattcgacacaatactcgatggaagcccatgaaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgtcaaatgagctaccggaaaactaatattgat 22371698  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  22371699 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcaacaactacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 22371798  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  22371799 atgttgtcccacttccactcaggcacatctaacggt 22371834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 6679670 - 6680005
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  6679670 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 6679769  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6679770 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 6679869  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  6679870 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 6679969  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6679970 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 6680005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 31571064 - 31570733
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  31571064 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 31570965  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| | |||||| || || ||    
T  31570964 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccgaataactaatgttgat 31570865  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  31570864 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 31570765  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31570764 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 31570733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 803895 - 803560
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  803895 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 803796  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  803795 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactatgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 803696  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||| ||||     
T  803695 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccgtagag 803596  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  803595 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 803560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16271446 - 16271111
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  16271446 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccataacctagaagtgaacctcg 16271347  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16271346 gatccctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacattgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccgggtaactgatattaat 16271247  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  16271246 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 16271147  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16271146 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 16271111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 409
Target Start/End: Original strand, 22051422 - 22051756
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  22051422 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 22051521  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||  | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  22051522 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 22051621  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| ||  |||||||||| || |||||||| |  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22051622 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcacccacaacccaaatagaatcatgtcttctcggagtgtttagtaaacttgtcacaaaatccatagaa 22051721  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacgg 409  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22051722 atgctatcccatttccactccggtacatccaacgg 22051756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 6604217 - 6604552
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  6604217 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 6604316  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  6604317 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataactgatattgat 6604416  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  6604417 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 6604516  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  6604517 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 6604552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 27355107 - 27355442
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27355107 tccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 27355206  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||||||||||| ||    
T  27355207 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactatgaatgtaaatctctgccaactgttctaccggataactgatattgat 27355306  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||| | |||||||||||||||||     
T  27355307 gggaatgaagtgtgtcgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaattcgtcacaaaatccatagag 27355406  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||| ||||||| ||||||    
T  27355407 atactgtcccacttccactccagtacatctaacggt 27355442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 29303648 - 29303313
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  29303648 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 29303549  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| || | ||  || ||||| ||||| || ||||| | |||||||||||||||    
T  29303548 gatccctatccgacacaatactcgaaggaaccccatgtagcttcacaatgttataaacataaatctctgccaattgtgctaccgaataactgatattaat 29303449  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||| | ||||| |||||||||||     
T  29303448 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgaagtgtttggtaaattcgtcacgaaatccatagag 29303349  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  29303348 atactatcccacttccactccggtacatccaacggt 29303313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Original strand, 14565698 - 14566036
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||    
T  14565698 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacc 14565797  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    | || |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14565798 tcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatatt 14565897  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||  || || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  14565898 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccgatcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccata 14565997  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14565998 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 14566036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 12305317 - 12305652
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||    || ||||||||  |||| ||  | ||||| ||||| |    
T  12305317 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacatagaagtgaacctcg 12305416  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12305417 gatccctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattaat 12305516  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || ||||| || || |  |||| ||| |||||||| || |||||  | ||||| |||||||||||     
T  12305517 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaactcaaatagtgtcataccctctcggagtgttcggtaaggtcgtcacgaaatccatagag 12305616  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12305617 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 12305652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 73 - 393
Target Start/End: Original strand, 23949476 - 23949796
Alignment:
Q  73 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 172  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || | ||| | |||  |||||||||| |||||||||||    
T  23949476 tttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttccaaaatctagaagtaaacct 23949575  T
Q  173 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 272  Q
     || ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| | ||||||| |||   | ||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  23949576 cggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacagtatcgcggatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgtta 23949675  T
Q  273 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 372  Q
    |||| |||||| || ||| |||||||||| || ||||| |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  23949676 atcggaatgaaatgagccaacttcgtcaatctatctacaatcacccaaatagcgtcattccctcttggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatgg 23949775  T
Q  373 aaatgctatcccatttccact 393  Q
    | ||  |||||||||||||||    
T  23949776 atatattatcccatttccact 23949796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20396351 - 20396012
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||   ||  || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  20396351 tctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 20396252  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| | | || ||||||||||||||||| |   ||||||| |||||||||||||||| ||  ||| |||||||||    
T  20396251 cttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaacttcacaatctggcgaatgtaaatctccgccaactgagatagaggaaaactgatat 20396152  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    ||| || |||||| || || |||||||| || || || || |  ||||| || |   ||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  20396151 taaccggaatgaaatgagctgacttcgttaatctatccacaatcacccaaatagcggcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 20396052  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
     || || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  20396051 ggatatactatcccattttcactctggcacatctaacggt 20396012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 19113249 - 19113565
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19113249 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19113348  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||    
T  19113349 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaat 19113448  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  19113449 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 19113548  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  19113549 atactatcccatttcca 19113565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22377680 - 22377348
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  22377680 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22377581  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22377580 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatat 22377481  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||  |||  | || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | ||||||  | ||||| |||||||||| |||    
T  22377480 taatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcat 22377381  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22377380 ggatatgctatcccattcccactctggtacatc 22377348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22383855 - 22383523
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  22383855 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 22383756  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  22383755 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagatacaggaaaactgatat 22383656  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||  |||  | || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | ||||||  | ||||| |||||||||| |||    
T  22383655 taatcagaatagaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttagaagtattcagcaaactcgtcacaaaattcat 22383556  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || ||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  22383555 ggatatgctatcccattcccactctggtacatc 22383523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16408267 - 16407949
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  16408267 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctataagtaaatcttg 16408168  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||| ||    
T  16408167 ggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttc-caatctccttaatataaatctctgccaactgggccacaggaaaactaatatttat 16408069  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || |  | |||||| || |  | || ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16408068 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaattataacccaaattgcgtaattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16407969  T
Q  375 atgctatcccatttccactc 394  Q
    || |||||||||||||||||    
T  16407968 atactatcccatttccactc 16407949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21394087 - 21393769
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21394087 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttg 21393988  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||  ||||  || ||| || | ||||||||    
T  21393987 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctctgccagttgagaaacaggaaaattaatattaat 21393888  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21393887 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21393788  T
Q  375 atgctatcccatttccact 393  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21393787 atactatcccatttccact 21393769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21788581 - 21788263
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21788581 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctggaagtaaatcttg 21788482  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||||  ||||  || ||| || | ||||||||    
T  21788481 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatataaatctctgccagttgagaaacaggaaaattaatattaat 21788382  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21788381 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21788282  T
Q  375 atgctatcccatttccact 393  Q
    || ||||||||||||||||    
T  21788281 atactatcccatttccact 21788263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Original strand, 21251500 - 21251833
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21251500 tccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21251599  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    |||||| ||||||||||| ||||  || ||| |||| ||||||||    
T  21251600 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacaaatgtaaatctccgccaattgagaaacaggaaaactaatattaat 21251699  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  21251700 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21251799  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    || | |||||||||||| || || ||||| ||||    
T  21251800 atacgatcccatttccaatctggcacatctaacg 21251833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 32600703 - 32601019
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  32600703 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaacctagaagtaaatcttg 32600802  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  32600803 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 32600902  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  32600903 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 32601002  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||| ||||||||    
T  32601003 atactatctcatttcca 32601019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 77 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21921955 - 21921630
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  21921955 cgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 21921856  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||  |||| ||||  || ||| |||||||||||||||    
T  21921855 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctcttccaattgagaaacaggaaaactgatattaatcg 21921756  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||  || || |||||||||| ||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||   | ||||| || || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  21921755 gaagaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccgtttaggagt-ttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 21921657  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
      |||||||||||||||| || |||||    
T  21921656 attatcccatttccactctggcacatc 21921630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17674245 - 17673929
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17674245 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17674146  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||   | || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17674145 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttggtataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17674046  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17674045 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17673946  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  17673945 atactatcccatttcca 17673929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 18857136 - 18857452
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  18857136 tccgactgaccatctgtctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 18857235  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| || |||||    
T  18857236 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatgttaat 18857335  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  18857336 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggat 18857435  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  18857436 atactatcccatttcca 18857452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21166759 - 21166432
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21166759 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21166660  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| | || ||| || ||||| || ||||  || || ||| |||||||||||||    
T  21166659 gatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttaatataaatctctgctaactaggcaacaggaaaactgatattaat 21166561  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  21166560 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 21166461  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||  ||||||| |||||||| || |||||    
T  21166460 atattatcccacttccactctggcacatc 21166432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 403
Target Start/End: Original strand, 22040422 - 22040746
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  22040422 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatgttggatc 22040521  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||| ||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  22040522 tctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccagctgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 22040621  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  22040622 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 22040721  T
Q  379 tatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||    
T  22040722 tatcccatttccattccggcacatc 22040746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 79 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 30313362 - 30313050
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  30313362 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 30313263  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || |||||| ||||||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  30313262 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctccaccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 30313163  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  30313162 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 30313063  T
Q  379 tatcccatttcca 391  Q
    |||||||||||||    
T  30313062 tatcccatttcca 30313050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20010122 - 20009941
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||   | || |||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  20010122 tccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctga 20010023  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 256  Q
      | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20010022 aatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgggctac 20009941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 23650600 - 23650928
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23650600 tccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23650699  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  ||  || || | ||||||||    
T  23650700 gatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaaatgagaaacaagaaaaataatattaat 23650799  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |  ||  || || ||||| |||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||   ||     
T  23650800 cagaagaaaatgagccgaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatcctgggat 23650899  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23650900 atactatcccatttccactctggcacatc 23650928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 19978526 - 19978854
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||| |||| || ||||||||  | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19978526 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19978625  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||| ||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  || || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  19978626 gatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcattgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 19978725  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || ||    ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||     
T  19978726 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacagtcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcatcacaaaatccatggat 19978825  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  19978826 atactatcccatttccactctggcacatc 19978854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 22046932 - 22047080
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22046932 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 22047031  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    | ||||||||||| |  || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  22047032 gatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 22047080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 220
Target Start/End: Original strand, 15533943 - 15534084
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    ||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15533943 actgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 15534042  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 220  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| ||||    
T  15534043 tctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcac 15534084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22164411 - 22164098
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||  |||||||||||| | || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  22164411 gactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 22164312  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    |||||||| | || || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||     
T  22164311 ctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatcttacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcgg 22164212  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  22164211 taggaattgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatata 22164112  T
Q  378 ctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||    
T  22164111 ctatcccatttcca 22164098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 79 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22120392 - 22120080
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  22120392 actgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatc 22120293  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  | || ||||||||||      
T  22120292 tctatctgacacaatgctcgaaggaataccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaagctaatattaatcggt 22120193  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    |  || || |||||||| ||||| || || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  22120192 agaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatac 22120093  T
Q  379 tatcccatttcca 391  Q
    | |||||||||||    
T  22120092 tgtcccatttcca 22120080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22133263 - 22132947
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22133263 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22133164  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||  | || || | ||  || || |||||   |||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  22133163 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaatcttacgatctccttgatataaatctctttcaactgggcaacaggaaaactaatattaat 22133064  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||  ||||||||||||| ||     
T  22133063 cggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcatcacaaaatccatggat 22132964  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  22132963 atactatcccatttcca 22132947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 72 - 394
Target Start/End: Original strand, 22987757 - 22988074
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||  ||||||||||     |||| |    
T  22987757 ctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactcttccaaaatct-----taaatc 22987851  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    | |  ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || || |||||||||||||  || ||| ||||||||||    
T  22987852 tcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcgaatataaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatatt 22987951  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    |||||  || || ||  ||||||| ||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||     
T  22987952 aatcggtataaaatgatccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatg 22988051  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    || ||| ||||||||||| ||||    
T  22988052 gatatgttatcccatttctactc 22988074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 75 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 20017972 - 20017865
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  20017972 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 20017873  T
Q  175 ggtctcta 182  Q
    | ||||||    
T  20017872 gatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 19485092 - 19484980
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| | |||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  19485092 tccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 19484993  T
Q  175 ggtctctatctga 187  Q
    | |||||||||||    
T  19484992 gatctctatctga 19484980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 19863684 - 19863760
Alignment:
Q  144 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 220  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19863684 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 19863760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Original strand, 19868321 - 19868397
Alignment:
Q  144 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 220  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19868321 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 19868397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 20009931 - 20009813
Alignment:
Q  285 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatccc 384  Q
    |||| ||| ||||||||||  || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| | ||||    
T  20009931 tgcgtcgaattcgtcaaccgatcgacaacaacccaaatggcatcattccctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtccc 20009832  T
Q  385 atttccactccggtacatc 403  Q
    | |||||||| || |||||    
T  20009831 acttccactctggcacatc 20009813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 357 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22248357 - 22248311
Alignment:
Q  357 gtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22248357 gtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatc 22248311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 21850274 - 21850241
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21850274 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 21850241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 403
Target Start/End: Original strand, 21043268 - 21043332
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21043268 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 21043332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 105 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129017
Alignment:
Q  105 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 204  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  205 ccccatgcaacttcac 220  Q
      ||||||||| ||||    
T  22129032 taccatgcaacctcac 22129017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16877032 - 16876998
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16877032 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 16876998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 40 - 72
Target Start/End: Original strand, 1733390 - 1733422
Alignment:
Q  40 tagccgtacacaccatatgggcttccagcggtc 72  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1733390 tagctgtacacaccatatgggcttccagcggtc 1733422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19484022 - 19483970
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19484022 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 19483970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 184; Significance: 2e-99; HSPs: 3)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 33459 - 33128
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  33459 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 33360  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  33359 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 33260  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33259 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 33160  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33159 atactatcccatttccactccggtacatccaa 33128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 237 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 56520 - 56347
Alignment:
Q  237 atctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccc 336  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |    
T  56520 atctccgccaactgtgctaccggataactaatattaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcataccctc 56421  T
Q  337 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| ||| || |||||||||| | | |||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  56420 tcgaagtgtttggtaaacttggctccaaatccatagaaatgctatctcacttccactccggcacatccaacggt 56347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Original strand, 41067 - 41101
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41067 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 41101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 50296 - 49965
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  50296 tccgactgaccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 50197  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  50196 gatctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 50097  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  50096 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattatgtaaacttgtcacaaaatccatagaa 49997  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  49996 atactatcccatttccactccggtacatccaa 49965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 43678 - 43994
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  43678 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 43777  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  43778 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 43877  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || ||||||||||||||||| || || | |||||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  43878 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcatcgttccctctgggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 43977  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  43978 atactatcccatttcca 43994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 8998 - 9314
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8998 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9097  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  9098 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaatagggaaactaatattaat 9197  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  9198 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 9297  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  9298 atactatcccatttcca 9314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 15460 - 15608
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15460 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15559  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15560 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 15608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7020 - 6685
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  | || ||||| ||||| ||||| |    
T  7020 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactctttcagaatctagaagtgaacctcg 6921  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6920 gatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatgtagatttccgccaactgagctaccggataactgatattaat 6821  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |  ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  6820 cagaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 6721  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  6720 atgctatcccacttccactccggtacatccagcggt 6685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 27749 - 28084
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  27749 tccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 27848  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27849 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctaacggataactgatattaat 27948  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27949 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgtcctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 28048  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  28049 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 28084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 51962 - 51627
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  51962 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 51863  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  51862 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 51763  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  51762 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 51663  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51662 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 51627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 60996 - 60661
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  60996 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 60897  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  60896 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 60797  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  60796 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 60697  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  60696 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 60661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 67384 - 67049
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  67384 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 67285  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  67284 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattctgaatatatatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 67185  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  67184 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 67085  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67084 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 67049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 118092 - 118427
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  118092 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 118191  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  118192 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaat 118291  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  118292 cggaataaagtgcgccgacttcatcaacatgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 118391  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  118392 ataaaatcccacttccactccggcacatccaacggt 118427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 323228 - 323563
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  323228 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 323327  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  323328 gatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 323427  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  323428 cggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 323527  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  323528 atgttatcccacttccactccggcacatccaacggt 323563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 203250 - 202917
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  203250 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctacaagtaaatcttg 203151  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||| |||||| || ||||||||||| ||||| | |||||||||||   |||| || || || ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||    
T  203150 gatctctatttgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatatcacgaatataaatttctgccaactgagccactggaaaactaatattgat 203051  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||| || || || || ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  203050 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggat 202951  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||    
T  202950 atgctatcctatttccactccggcacatctaacg 202917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 386343 - 386544
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  386343 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 386442  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  386443 gatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaattctccgctaactgagctaccggaaaactaatattgat 386542  T
Q  275 cg 276  Q
    ||    
T  386543 cg 386544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 301
Target Start/End: Original strand, 112542 - 112771
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||    
T  112542 cttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacc 112641  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    |  | ||||||||||| || || || | |||||| ||||| | |||||||||||  || ||||| || ||||||||||||| ||  ||| ||||||||||    
T  112642 tcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgtagcttcacaatatcgtggatgtaaatatccgccaactgagatataggaaaactgatatt 112741  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 301  Q
    ||||| |||||| || ||| ||||||||||    
T  112742 aatcggaatgaaatgagcccacttcgtcaa 112771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 172; Significance: 3e-92; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 27365398 - 27365067
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  27365398 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 27365299  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || || ||||||||||||||||| || ||| |||||||||| ||    
T  27365298 gatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactgatatttat 27365199  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27365198 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 27365099  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27365098 atactatcccatttccactccggtatatccaa 27365067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 24641866 - 24642201
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  24641866 tccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 24641965  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    |  ||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24641966 gacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaatattgtgaatatgaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 24642065  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24642066 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 24642165  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24642166 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 24642201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 19652371 - 19652036
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  19652371 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 19652272  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||  |||| ||||| ||||||||||| || ||||  ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19652271 gatccttatccgacacaatactcgacggtactccatataacttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 19652172  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||    
T  19652171 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtctacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtatacttgtcactaaatccatagaa 19652072  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  19652071 atactgtcccacttccactccggcacatccaacggt 19652036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Original strand, 24948713 - 24949046
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||  | ||| ||||  ||||||| |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  24948713 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatcgaaaccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 24948812  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24948813 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 24948912  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  24948913 cggaataaagtgcgccaacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 24949012  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    || |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  24949013 atcctatcccatttcaactccggcacatccaacg 24949046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 228 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 27210338 - 27210156
Alignment:
Q  228 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 327  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27210338 tgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatagaat 27210239  T
Q  328 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27210238 catgccccctcggagtattaggtaaacttatcacaaaatccatataaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 27210156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 23276900 - 23277228
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23276900 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 23276999  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23277000 aatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgcgctaccggataactgatattaat 23277099  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  23277100 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctcttggagtgttcggtaaaatcgtcacaaaatccatagaa 23277199  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  23277200 atgctatcccacttccattccggcacatc 23277228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21125476 - 21125143
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  21125476 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 21125377  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||   ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  21125376 gatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcac--gattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 21125279  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || |  |||||||| || | | |||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  21125278 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgaaaacaacccaaatggcaccatgtcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 21125179  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  21125178 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggt 21125143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Original strand, 12574477 - 12574808
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  12574477 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 12574576  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  12574577 gatctctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 12574676  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12574677 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccactacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12574776  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12574777 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 12574808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Original strand, 27787865 - 27788196
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  27787865 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 27787964  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  27787965 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 27788064  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  27788065 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacgacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 27788164  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27788165 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 27788196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 1063875 - 1064210
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  1063875 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 1063974  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  1063975 gatctctatccgacacaatactagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattgat 1064074  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  1064075 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 1064174  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1064175 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 1064210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 20828383 - 20828718
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  20828383 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 20828482  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20828483 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 20828582  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20828583 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20828682  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20828683 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 20828718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 20833109 - 20833444
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  20833109 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 20833208  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20833209 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 20833308  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  20833309 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 20833408  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20833409 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 20833444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 31830782 - 31831117
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  31830782 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 31830881  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  ||||| | | | |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  31830882 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatgtaaatctctgccaactgcgctaccgggtaactgatattaat 31830981  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||     
T  31830982 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatggag 31831081  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  31831082 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 31831117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 307
Target Start/End: Original strand, 23294082 - 23294314
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  23294082 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 23294181  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23294182 gatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgattttaat 23294281  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 307  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23294282 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 23294314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 403
Target Start/End: Original strand, 23110907 - 23111187
Alignment:
Q  123 tttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 222  Q
    |||||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23110907 tttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacacaatgcaacttcacaa 23111006  T
Q  223 tattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatat 322  Q
    |||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||||||  || || |||||  |||||||||| || || || || ||||| ||    
T  23111007 tatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgggataaaatgcgctaacttcgtcaatctatcgacaactacccaaat 23111106  T
Q  323 cgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  23111107 agcatcatgccctcttggagtattgggtaaacttgttacaaaatccatggatatgttatcccatttccactctggcacatc 23111187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 24675613 - 24675941
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  24675613 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 24675712  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||| ||| || || |||||  |||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||  || || ||| |||||||||||||    
T  24675713 gatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactgatattaat 24675812  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24675813 cggtagaaaatgggccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24675912  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||||    
T  24675913 atgctattccatttccactctggcacatc 24675941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11358193 - 11357858
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  11358193 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 11358094  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| || || |||||||| ||||| |  || || | | |  |||| || ||||| || ||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  11358093 gatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagttttaccacactgcgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataattgatattaat 11357994  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  11357993 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 11357894  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11357893 atactatcccacttccactccggtacatctaacggt 11357858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Original strand, 27371396 - 27371709
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  27371396 gactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 27371495  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| |||||||| |     
T  27371496 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaatagg 27371595  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  27371596 tagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 27371695  T
Q  378 ctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||    
T  27371696 ctatcccatttcca 27371709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 9610260 - 9610576
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9610260 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9610359  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  9610360 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 9610459  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  9610460 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 9610559  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  9610560 atactatcccatttcca 9610576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21325585 - 21325257
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  21325585 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 21325486  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| |  || |||||| |||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  21325485 gatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgcaacttcacaatttccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 21325386  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| |||   ||||  || || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  21325385 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacaatcacccaaatctcgtcatatcctctaggagtattcggaaaactcgtcacgaaatccatggat 21325286  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  21325285 atactatcccatttccactctggcacatc 21325257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 27218140 - 27218456
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  27218140 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 27218239  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  27218240 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 27218339  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  27218340 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 27218439  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  27218440 atactatcccatttcca 27218456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 16923013 - 16923329
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16923013 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16923112  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16923113 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16923212  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16923213 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16923312  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  16923313 atactatcccatttcca 16923329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 16982276 - 16982592
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16982276 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16982375  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16982376 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16982475  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  16982476 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 16982575  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  16982576 atactatcccatttcca 16982592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 17063841 - 17064157
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17063841 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17063940  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17063941 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17064040  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17064041 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17064140  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  17064141 atactatcccatttcca 17064157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 17067499 - 17067815
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  17067499 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 17067598  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  17067599 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 17067698  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||| ||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  17067699 aggtagaaaatgagctgacttcgtcagcctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 17067798  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  17067799 atactatcccatttcca 17067815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22325175 - 22324859
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  22325175 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 22325076  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || |  ||  |||| ||||||||    
T  22325075 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaatagggaaactaatattaat 22324976  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22324975 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22324876  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  22324875 atactatcccatttcca 22324859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24707801 - 24707485
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||    
T  24707801 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtaaatcttg 24707702  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  24707701 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttccttaatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 24707602  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  24707601 cgctagaaaatgagccgacttcgtcaatctgtcaacgattacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 24707502  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  24707501 atactatcccatttcca 24707485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 138 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 23107986 - 23107721
Alignment:
Q  138 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 237  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||||||||    
T  23107986 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaga 23107887  T
Q  238 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 337  Q
    |||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  ||  |    
T  23107886 tctcggccaactgaggaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttccttt 23107787  T
Q  338 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  23107786 aggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 23107721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Original strand, 24262497 - 24262810
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  24262497 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 24262596  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||||     
T  24262597 ctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaatcgg 24262696  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||     
T  24262697 tagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatata 24262796  T
Q  378 ctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||    
T  24262797 ctatcccatttcca 24262810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 10868974 - 10869290
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10868974 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10869073  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10869074 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10869173  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || | |||||| ||||  ||   ||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10869174 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaatcgcgtcgctccctctcggagtactcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10869273  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  10869274 atactatcccatttcca 10869290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 16925484 - 16925800
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16925484 tccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16925583  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16925584 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16925683  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  16925684 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgtt 16925783  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  16925784 atactatcccatttcca 16925800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 16999124 - 16999440
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  16999124 tccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 16999223  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  16999224 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 16999323  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  16999324 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgtt 16999423  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  16999424 atactatcccatttcca 16999440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 22756784 - 22756456
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| || ||||| ||||    
T  22756784 tccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttccaaaatctagaggtaaatcttg 22756685  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  22756684 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 22756585  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||| ||||| || || |  |  |||||  |||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||| |||||||||| ||     
T  22756584 cggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaaaaatcacccaagtcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcgcaaaatccatggat 22756485  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  22756484 atactatcccatttccactctggcacatc 22756456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 75 - 301
Target Start/End: Original strand, 23064201 - 23064427
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23064201 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaacttg 23064300  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||   |||| || ||||| ||||| ||||  || ||| |||| ||||||||    
T  23064301 gatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcactatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaggaaaactaatattaat 23064400  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 301  Q
    || ||  || || ||||||||||||||    
T  23064401 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaa 23064427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21145357 - 21145044
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  ||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |    
T  21145357 gactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 21145258  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| || || |||||||  || || ||  |||| ||||| ||||     
T  21145257 ctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatttctgccaacttggcaacagggaaactaatattgatcgg 21145158  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||     
T  21145157 tagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgatata 21145058  T
Q  378 ctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||    
T  21145057 ctatcccatttcca 21145044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 41608704 - 41608391
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  41608704 tccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 41608605  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  41608604 gatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 41608505  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  41608504 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 41608405  T
Q  375 atgctatcccattt 388  Q
    || |||||||||||    
T  41608404 atactatcccattt 41608391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24877068 - 24876752
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||| | |||||||| ||||    
T  24877068 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaagtaaatcttg 24876969  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  24876968 gatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 24876869  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  | ||| || ||||| |||||||| || || || |||||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| ||||| |||||||| ||     
T  24876868 cggtaggaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacgaaatccatcgat 24876769  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  24876768 atactatcccatttcca 24876752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 24710157 - 24710305
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24710157 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24710256  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    | |||||||||||||| || || || ||||| |||||||||||||||||    
T  24710257 gatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 24710305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44385888 - 44385740
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  44385888 tccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 44385789  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44385788 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 44385740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 77 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442684
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| |||||     
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaat 20442684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 23189131 - 23189279
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  23189131 tccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 23189230  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||| |||||||    
T  23189231 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 331 - 410
Target Start/End: Original strand, 23294315 - 23294394
Alignment:
Q  331 gccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  23294315 gccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccactttcactccggcacatccaacggt 23294394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 30211236 - 30211037
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  30211236 tccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 30211137  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  30211136 gatccctatctgatacaatactcgatggaacaccatgtagcttcacaatctcacggatataaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgttaat 30211037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 394
Target Start/End: Original strand, 45529644 - 45529954
Alignment:
Q  84 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 183  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  45529644 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctat 45529743  T
Q  184 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 283  Q
    |||| || |||||||| | ||| ||||| | ||||||||| |   | || || |||||   ||||||||  || ||| ||||||| |||||   ||| ||    
T  45529744 ctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaatctctcggatataaatctctatcaactgagacacaggaaaactgatgttaattagaataaa 45529843  T
Q  284 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 383  Q
     || |||||||||||||  || || || |  ||||| |||| |||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  45529844 atgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggacatactatcc 45529943  T
Q  384 catttccactc 394  Q
    || ||||||||    
T  45529944 cacttccactc 45529954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 71 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24825605 - 24825472
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  24825605 tctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 24825506  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 204  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  24825505 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 215 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 24819865 - 24819677
Alignment:
Q  215 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 314  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  24819865 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 24819766  T
Q  315 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  24819765 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggcacatc 24819677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 237 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 21890875 - 21890709
Alignment:
Q  237 atctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccc 336  Q
    ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| |||| ||||| |||      
T  21890875 atctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctt 21890776  T
Q  337 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    | ||| |||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||| ||||||||| || |||||    
T  21890775 taggattattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccttttccactctggcacatc 21890709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 360 - 391
Target Start/End: Original strand, 22276687 - 22276718
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22276687 acaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 22276718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 332 - 391
Target Start/End: Original strand, 24710415 - 24710474
Alignment:
Q  332 ccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24710415 ccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 24710474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 336 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44385627 - 44385572
Alignment:
Q  336 ctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  44385627 ctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 44385572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 360 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 12640267 - 12640234
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccact 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12640267 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccact 12640234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Original strand, 25128792 - 25128945
Alignment:
Q  96 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 195  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||  ||||||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  25128792 ggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 25128891  T
Q  196 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 249  Q
    | || ||||  ||||||||| | ||||| |  | |||||||||| | |||||||    
T  25128892 tagaaggaataccatgcaacctaacaatctgttcaatgtagatcccagccaact 25128945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14286140 - 14285807
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| || ||  ||| |||||| || || ||||| ||     
T  14286140 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttccgaaatctagatgtgaacctcgga 14286041  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  14286040 tctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattatgaatgtagatctccgctaactgtgctaccggataactgatgttaatcg 14285941  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14285940 gaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgttacaaaatccatagaaat 14285841  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
     || ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14285840 actgtcccacttccactccggcacatccaacggt 14285807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 78 - 410
Target Start/End: Original strand, 13666023 - 13666355
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||| ||  |||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  13666023 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttccagaatctagaagtgaacctcggat 13666122  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    | ||||| ||||| ||||||||||  || ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||     
T  13666123 ccctatccgacacaatactcgacgatacaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccaccaactgagctaccggataactgatattgatcgg 13666222  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13666223 aataaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagaaatg 13666322  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||    
T  13666323 ctatcccacttccactccggcacatccatcggt 13666355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 6413994 - 6414329
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||| ||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  6413994 tccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 6414093  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  6414094 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctctgctaactgagctatcggataactgatattgat 6414193  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6414194 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 6414293  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  6414294 atactatcccacttccactccggcacatccaacggt 6414329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 13021840 - 13022175
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||| |||| || || || || ||||| |    
T  13021840 tccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttttccagaacctagaggtgaacctcg 13021939  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13021940 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 13022039  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | |||||||||||||||||| || ||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  13022040 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccccctcggagtgtttggttaactcgtcacgaaatccatagaa 13022139  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13022140 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 13022175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 19147694 - 19148029
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  19147694 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 19147793  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  19147794 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 19147893  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  19147894 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcataccctctaggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 19147993  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  19147994 atgctatcccacttccattctggcacatccaacggt 19148029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 20747093 - 20747428
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||  |||  || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||      
T  20747093 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctca 20747192  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  20747193 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 20747292  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||| ||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  20747293 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcataccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 20747392  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  20747393 atgctatcccacttccattctggcacatccaacggt 20747428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15102369 - 15102034
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  15102369 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 15102270  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||| |||| || |  ||||| | |||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  15102269 gatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 15102170  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||||| || | ||||||||  |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  15102169 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaatctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccgtctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 15102070  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15102069 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggt 15102034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 18053719 - 18053388
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  18053719 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 18053620  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||| | | || || || ||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||    
T  18053619 gatccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaacactatgtatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgttgat 18053520  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||    
T  18053519 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaattcgtcacaaaatccatagaa 18053420  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18053419 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 18053388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 406
Target Start/End: Complemental strand, 23505636 - 23505305
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  23505636 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 23505537  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||| ||| ||||| ||||| | |||||| | | | || || || ||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  23505536 gatccctatccgacacaatacacgaaggaactccatgtagcttcaccacactatgtatataaatctcagccaactgagctactggataactgatgttgat 23505437  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  23505436 aggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcaaccacaacccaaatcgaatcatgtcccctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 23505337  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23505336 atgctatcccatttccactccggtacatccaa 23505305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14264010 - 14263675
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  14264010 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 14263911  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  14263910 gatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 14263811  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || | ||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| |||    
T  14263810 cggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaacaacgcaaatggcatcatgccctctcggagtattcgataaactcgtcacaaaattcatggaa 14263711  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  14263710 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggt 14263675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11306032 - 11305694
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||||||||| ||||| ||||    
T  11306032 ctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccaaaatctagaagtgaacc 11305933  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    | || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11305932 tcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatatt 11305833  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  11305832 aataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccata 11305733  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  11305732 gagatactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 11305694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 14130356 - 14130691
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  14130356 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 14130455  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14130456 gatccctatccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 14130555  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14130556 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14130655  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14130656 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggt 14130691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 14434174 - 14434509
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||| |||| || |||| |||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  14434174 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 14434273  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||    
T  14434274 gatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttgat 14434373  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14434374 aggaataaaatgtgccgactttgtcaacctatcaaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 14434473  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14434474 atgctatcccatttccactccggcacatctaacggt 14434509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 71 - 394
Target Start/End: Original strand, 15625030 - 15625353
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || |||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  15625030 tctttccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 15625129  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||| |||||| ||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  15625130 cttggatctctatctgacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaatatcgcgaatgtagatctccgccaactgagacacaggaaaactgatat 15625229  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || || |||| |||  | |||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  15625230 taatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagagtcattcccttttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccat 15625329  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactc 394  Q
     || ||  ||||||||||||||||    
T  15625330 ggatatagtatcccatttccactc 15625353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16950237 - 16949902
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  16950237 tccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 16950138  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      |||||||| ||||| ||||||||| | || ||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16950137 aatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccggataactgatattaat 16950038  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| ||||||||  | |||| ||| ||||| ||||||||||||    
T  16950037 cggaatgaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatggcatcatgccctctcggagtgctcggtagactcgtcacgaaatccatagaa 16949938  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16949937 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 16949902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 49152784 - 49153119
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  | || ||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  49152784 tccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 49152883  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | |||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49152884 gatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatgtaaatctctgctaactgtgctaccggataactgatattaat 49152983  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| || ||||||||||||||     
T  49152984 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacaaaatccatagag 49153083  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  49153084 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 49153119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 78 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 16072057 - 16071741
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||| | ||||| || |    
T  16072057 gactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaactgaacctcggat 16071958  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  16071957 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgatcgg 16071858  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    ||  ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||  |||| || | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16071857 aagaaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctttgagtgttcgataaactcgtcacaaaatccatggaaatg 16071758  T
Q  378 ctatcccatttccactc 394  Q
     | ||||| ||||||||    
T  16071757 ttgtcccacttccactc 16071741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 207 - 406
Target Start/End: Original strand, 19613290 - 19613489
Alignment:
Q  207 ccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgt 306  Q
    ||||||||||||||||| | | |||| || ||||||||||||||||| || | | |||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| || |    
T  19613290 ccatgcaacttcacaatgtcccgaatataaatctccgccaactgagccaccgaaaaactgatatttatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctat 19613389  T
Q  307 ctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    | |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19613390 caaccacaacccatatagaatcatgtcctctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatactatcccatttccactccggtacatccaa 19613489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11388194 - 11387866
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  11388194 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 11388095  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||     | ||||| |||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||| ||    
T  11388094 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatggcacggatgtaaatctccgccagctgaggtaccggaaaactgatatttat 11387995  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||| |||||||||||||| || || | |||||| || | |||||||||  |||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||    
T  11387994 cggaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccacaaaaacccaaatagcatcatgccctatcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccgtagaa 11387895  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||| | ||||| |||||||| || |||||    
T  11387894 atgttgtcccacttccactctggcacatc 11387866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 12206566 - 12206250
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| || ||||| ||||    
T  12206566 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctcgatgtaaatcttg 12206467  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||   ||||||| ||||| |||||||| || |||||| |||| ||||||||    
T  12206466 gatctctatccaacacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactgtgccactggaaaactaatattaat 12206367  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| ||||| || |||||| |||| || || || || | ||||||   ||||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||     
T  12206366 tggaataaagtgtgctgacttcttcaatctatcaacaaccatccatatgacatcatgccctctcagagtatttggtaaacttgttacaaagtccatggat 12206267  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    |||||||||||||||||    
T  12206266 atgctatcccatttcca 12206250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Original strand, 15340911 - 15341249
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||    
T  15340911 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagatgtgaacc 15341010  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| | ||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||    
T  15341011 tcggatccctatccgacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactaatgtt 15341110  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
     || | ||| ||||| ||| |||| |||||||| || || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || |||||||| |||| ||||||||||    
T  15341111 gataggaataaagtgtgccaactttgtcaacctatcgactacaacccatatagaatcatgtcctctcggggtgtttggtaaactcgtcataaaatccata 15341210  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341211 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 15341249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 8211894 - 8211559
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | |||||||||||| |||| || || ||||| ||||| |    
T  8211894 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcg 8211795  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || || |||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||    
T  8211794 gatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaattgcgctaccggataactgatattgat 8211695  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || || ||||| || |  |||||||| |||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||     
T  8211694 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaactacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagag 8211595  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || || || ||||||||||||||||| ||||||    
T  8211594 atactgtctcacttccactccggtacatctaacggt 8211559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 73 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11772031 - 11771701
Alignment:
Q  73 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 172  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  11772031 tttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcctccaaaatctagaagtaaacct 11771932  T
Q  173 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 272  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| || |||||||||||||  ||  || ||||||||||     
T  11771931 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatatcgcggatgtaaatttccgccaactgagacacaagaaaactgatattt 11771832  T
Q  273 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 372  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  11771831 atcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 11771732  T
Q  373 aaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11771731 atatgctatcccatttccactctggtacatc 11771701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 73 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 1175 - 840
Alignment:
Q  73 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 172  Q
    ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||  | || |||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| |||||    
T  1175 tttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacct 1076  T
Q  173 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 272  Q
    ||  || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||  || |||||||||||||| |||||  |||||||||||||     
T  1075 tgtatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgttatgaacataaatctccgccaactgtgctaccagataactgatattg 976  T
Q  273 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 372  Q
    |||| |||||| || || ||||||||||||||||| || |  ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||| ||| ||||||||||    
T  975 atcggaatgaaatgtgctgacttcgtcaacctgtcgacaatgacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaacttggcacgaaatccatag 876  T
Q  373 aaatgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    ||||  | ||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  875 aaatattgtcccacttccactccggcacatctaacg 840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 12456185 - 12456520
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| || || |||||  ||||||||||| |  |||| || || ||||| ||||| |    
T  12456185 tccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttccagaacctagaagtgaacctcg 12456284  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || || || | |||||||||  | | ||  || |||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  12456285 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgctataaacataaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattgat 12456384  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  12456385 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 12456484  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12456485 atattgtcccacttccactccggtacatccaacggt 12456520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13968434 - 13968099
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  13968434 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 13968335  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  13968334 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactgcgctaccggataacttatattaat 13968235  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| ||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  13968234 aggaataaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagag 13968135  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13968134 atactgtcccacttccagtccggtacatccaacggt 13968099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 26118371 - 26118036
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || |||||||   |||| || || ||||| ||||| |    
T  26118371 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacgcttccagaacctagaagtgaacctcg 26118272  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || || || || ||||| ||||| |||||| ||||||| ||    
T  26118271 gatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcactacactgtgaatataaatttctgctaactgcgctaccggataattgatattgat 26118172  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  26118171 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 26118072  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  26118071 atactatcccacttccactccggtacatctaacggt 26118036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 12687983 - 12688299
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  12687983 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 12688082  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| || || || ||||| ||||  ||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  12688083 gatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctccgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 12688182  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | |||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  12688183 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccccctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 12688282  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  12688283 atactatcccatttcca 12688299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 9596539 - 9596855
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  9596539 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 9596638  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| || || ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  9596639 gatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 9596738  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||| | ||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||     
T  9596739 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaacttgtcacaaagtccatggat 9596838  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  9596839 atactatcccatttcca 9596855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18551546 - 18551230
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  18551546 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 18551447  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  18551446 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 18551347  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  18551346 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 18551247  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  18551246 atactatcccatttcca 18551230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 8199110 - 8199426
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8199110 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8199209  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  8199210 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8199309  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8199310 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 8199409  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  8199410 atactatcccatttcca 8199426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44791139 - 44790823
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  44791139 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 44791040  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  44791039 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 44790940  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  44790939 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 44790840  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  44790839 atactatcccatttcca 44790823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 402
Target Start/End: Original strand, 14040178 - 14040504
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |   | ||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  14040178 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttg 14040277  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  14040278 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatatagatttctgccaactgaaacacaggaaaactgatattaat 14040377  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||     
T  14040378 cggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcacaacatccatggat 14040476  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacat 402  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14040477 atactatcccatttccactctggtacat 14040504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 402
Target Start/End: Original strand, 14350208 - 14350534
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| |   | ||||| ||| || |||||||| | |||||||| ||||    
T  14350208 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttccaaaatgtagaagtaaatcttg 14350307  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||| || |||||||||   || ||| |||||||||||||    
T  14350308 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatttcgaatatagatttctgccaactgaaacacaggaaaactgatattaat 14350407  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||| |||| || ||||| ||||||| |||||| ||     
T  14350408 cggaataaagtgagccgacttcgtcaatctatc-acaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggaatattcggcaaactcgtcacaacatccatggat 14350506  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacat 402  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||    
T  14350507 atactatcccatttccactctggtacat 14350534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11237001 - 11236685
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  11237001 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 11236902  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  11236901 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 11236802  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||     
T  11236801 cggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattttgcaaactcgtcacaaaatccatggat 11236702  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  11236701 atactatcccatttcca 11236685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 8708087 - 8708403
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8708087 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8708186  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  8708187 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 8708286  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || |  ||||| |||||||| || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8708287 aggtagaaaatgagttgactttgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 8708386  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  8708387 atactatcccatttcca 8708403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 10871477 - 10871793
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  10871477 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 10871576  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||||| ||||||||| |  |  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  10871577 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgcagcttcacaatctctttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 10871676  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  | ||| || || |||||||||||||| || || | |||||| || |  ||   ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  10871677 aggtaggaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgctccctctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 10871776  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  10871777 atactatcccatttcca 10871793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11552890 - 11552574
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||| |||||  |||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  11552890 tccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaaggaaatcttg 11552791  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||| ||    
T  11552790 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattgat 11552691  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  11552690 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccattgat 11552591  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  11552590 atactatcccatttcca 11552574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 13686546 - 13686862
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13686546 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13686645  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || |||||  ||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  13686646 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctaccaactgggcaacggggaaactaatattaat 13686745  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  13686746 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 13686845  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  13686846 atactatcccatttcca 13686862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 14332879 - 14333195
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14332879 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14332978  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  ||  | ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  14332979 gatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgataaaaatctctgccaactgggcaacgggaaaactaatattaat 14333078  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || |  |||||||||||||| || || | |||||| || |  || | ||| ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  14333079 aggtagaaaatgagttgacttcgtcaacctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 14333178  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  14333179 atactatcccatttcca 14333195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 15160845 - 15160529
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  15160845 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 15160746  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  15160745 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacggggaaactaatattaat 15160646  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||| ||||||||| ||     
T  15160645 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcaaaaaatccatggat 15160546  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  15160545 atactatcccatttcca 15160529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 15154449 - 15154117
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | |  || |||||| |||||||||| ||||| ||     
T  15154449 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttttccaaaatctagaagtgaat 15154350  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| || ||||||    
T  15154349 cttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaattgatat 15154250  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||| |||| |||  | |||||||| || ||||| || | |||||||||    
T  15154249 taatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaattacccaaatcgagtcattccctttaggagtattcggcaaactcgttaaaaaatccat 15154150  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  15154149 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 15154117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 18178224 - 18178540
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| ||||||||||  ||||||| ||||    
T  18178224 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctaaaagtaaatcttg 18178323  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || ||  |||| ||||| ||||| | ||||||||| | ||  ||||| ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  18178324 gatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 18178423  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||     
T  18178424 aggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatagat 18178523  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  18178524 atactatcccatttcca 18178540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 252 - 410
Target Start/End: Original strand, 12457300 - 12457458
Alignment:
Q  252 gctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggta 351  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||| | || | ||||||||| |||||||| ||  |||    
T  12457300 gctaccggataactgatattaataggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtctacaacaacctaaatagcatcatgccctctcggagtgttccgta 12457399  T
Q  352 aacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12457400 aactcgtcacgaaatccatagagatactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 12457458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 79 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 17100 - 16788
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  17100 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 17001  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | | ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||||      
T  17000 tctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaatcggt 16901  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    |  || || |||||||||| ||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |    
T  16900 agaaaatgagccgacttcgacaatctatcaacgatgacccaaattgtgtcgttccctctaggagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggatatac 16801  T
Q  379 tatcccatttcca 391  Q
    |||||||||||||    
T  16800 tatcccatttcca 16788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 84 - 403
Target Start/End: Original strand, 21662452 - 21662771
Alignment:
Q  84 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 183  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||  |||| || ||||||||| | || |  |||||  |||||||||| |||||||| ||||| || ||||    
T  21662452 ccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatccctat 21662551  T
Q  184 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 283  Q
    || | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   | || || ||||   ||||||||| ||| ||| || |||| ||||||| ||| ||    
T  21662552 ctaatacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaatctcacggatataaatcttttccaactgagatacaggaaaattgatgttaatcggaataaa 21662651  T
Q  284 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 383  Q
     || |||||||||||||  || || || |  ||||| |||| |||||| ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  21662652 atgagccgacttcgtcagtctatccacaattacccaaatcgcatcatgtccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcc 21662751  T
Q  384 catttccactccggtacatc 403  Q
    ||  ||||||| || |||||    
T  21662752 cacgtccactctggaacatc 21662771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 75 - 248
Target Start/End: Original strand, 14955102 - 14955275
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | | ||| |||||| |  |||  || |||||||| ||||    
T  14955102 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttttgaaaatcctagaagtaaatcttg 14955201  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 248  Q
    | ||||||||  | || || ||||| ||||  ||||||||| ||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  14955202 gatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctccttaatgtaaatctccgccaac 14955275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203085
Alignment:
Q  108 gaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccc 207  Q
    ||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  208 catgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 307  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| |  || || ||  |||| |||||||| |  |  || || || ||||||||||| || ||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaatttggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatc 23203169  T
Q  308 taccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
     || | |||||| || |  || | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23203168 aacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 23203085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509212
Alignment:
Q  108 gaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccc 207  Q
    ||||||||| |||| || || |||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  208 catgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtc 307  Q
    |||||| ||||||||| | ||  ||||| ||||| ||||| |  || || ||  |||| |||||||| |  |  || || || ||||||||||| || ||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttgatgtaaatctctgccaatttggcaacagggaaactaatattaataggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatc 23509296  T
Q  308 taccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
     || | |||||| || |  || | ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23509295 aacaataacccaaattgcgtcgttccctctcgtagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgatatactatcccatttcca 23509212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 262 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 321638 - 321506
Alignment:
Q  262 aactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac 361  Q
    |||| |||||||||| ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||    
T  321638 aactaatattaatcggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaacttgtcac 321539  T
Q  362 aaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||    
T  321538 aaaatccatggatatactatcccatttccactc 321506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 84 - 248
Target Start/End: Original strand, 4440419 - 4440583
Alignment:
Q  84 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 183  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||    
T  4440419 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 4440518  T
Q  184 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaac 248  Q
    ||||||| ||||| || ||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||| ||||||    
T  4440519 ctgacacaatactagaaggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaac 4440583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 23199509 - 23199451
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaa 133  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||| || ||||||||    
T  23199509 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaa 23199451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27107277 - 27107243
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27107277 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 27107243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 111
Target Start/End: Original strand, 12457262 - 12457298
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaac 111  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12457262 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14325775 - 14325743
Alignment:
Q  36 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagc 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14325775 ttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagc 14325743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 168; Significance: 6e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 19644 - 19979
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  19644 tccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 19743  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  19744 gatccctatcagacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaatgttctgaatataaatctccgccaactgagctacgagataactgatattaat 19843  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  19844 aggaatgaagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctttcggagtgtttggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 19943  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19944 atgctatcccacttccactccggtacatccaacggt 19979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 20507 - 20842
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  20507 tccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 20606  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20607 gatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccacaaactgagctaccgggtaactgatattaat 20706  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||    
T  20707 cggaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcaacaacaacccaaatggaatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcataaaatccatagaa 20806  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20807 atgttgtcccacttccactccggcacatccaacggt 20842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13143 - 12865
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  13143 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 13044  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13043 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 12944  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 353  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  12943 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 12865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 16913 - 16635
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  16913 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 16814  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16813 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 16714  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 353  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  16713 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 16635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11565 - 11504
Alignment:
Q  349 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11565 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 11504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 15335 - 15274
Alignment:
Q  349 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  15335 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 15274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 41443 - 41776
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||  |    
T  41443 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaac--aacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccg 41540  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||  ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41541 gatctctattcgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 41640  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  41641 cggaataaagtgcgccgacttcatcaacctgtcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 41740  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  41741 atgctatcccacttccactccggcatatccaacggt 41776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25640 - 25312
Alignment:
Q  82 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 181  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| || |||||    
T  25640 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttccataatctagaagtgaacctcggatctct 25541  T
Q  182 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 281  Q
    ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| | |||     
T  25540 atccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcataaaattatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgataataattggaata 25441  T
Q  282 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 381  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | |    
T  25440 aagtgcgctgacttcgtcaacctgtcaaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgtttt 25341  T
Q  382 cccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  25340 cccacttccactccggcacatccaacggt 25312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 40262 - 40597
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  40262 tccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 40361  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40362 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaatattgat 40461  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  40462 cggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 40561  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  40562 atgttgtcccacttccactctggcacatctaacggt 40597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 21453 - 21118
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  21453 tccgactgaccgtctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaacctcg 21354  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21353 gatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 21254  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21253 cgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcatcatgccctctcggagtgttaggtagactcgtcacaaaatccatagaa 21154  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  21153 atgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 21118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 151 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 11163 - 10904
Alignment:
Q  151 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 250  Q
    |||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| | || ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||||||||||||    
T  11163 tccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactg 11064  T
Q  251 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||    
T  11063 agctaccggataactgatattaatcgaaataaagtgcgccaactttgtcaatttgtcgaccacaacccatatcgcatcatgccctctcggagtgttaggt 10964  T
Q  351 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  10963 agactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 10904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 48989 - 48654
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  48989 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 48890  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |  ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  48889 gattcctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccagataactgatgttaat 48790  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  48789 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcactaaatccatagaa 48690  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48689 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 48654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 47181 - 46846
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||| || || ||||| |||||||    
T  47181 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaaccttg 47082  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||    
T  47081 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgcagcttcacaatattatgaatataaatctccgccaactaagctatcggataattgatattaat 46982  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  46981 cggaataaaatgcgccgacttcgtcaacctgttgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 46882  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  46881 atgttatcccacttccactccggcacatccaacggt 46846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 42115 - 41780
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| |    
T  42115 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcg 42016  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |  ||||| | | | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  42015 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcaccacactgtgaatataaatctctgccaactgcgctaccggataactgatattaat 41916  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |  ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  41915 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgtcatgccccctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 41816  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  41815 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 41780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2773
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| | |||  |||||||||| || |||||||| |    
T  2445 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaacctcg 2544  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| ||  | ||||| ||||| ||||| | ||||| |||||   |||| || || | |||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  2545 gatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttcataatatcgcgaatataaattttcgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 2644  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || |||||| || |||||||||||||| || || || |  | ||| || |   ||| |||  | |||||||| |  ||||| |||||||||||||  ||     
T  2645 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcagccaaattgcgccattccctttaggagtattcgacaaactcgtcacaaaatccacggat 2744  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2745 atgctatcccatttccattctggtacatc 2773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 77 - 410
Target Start/End: Original strand, 3277 - 3610
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||| ||| | |||  |||||||||| ||||| |||||  |     
T  3277 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcaga 3376  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  3377 tcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaatgttatgaatgtagatctccgccaactgagctaccggataactgatattaattg 3476  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||| || || |||||||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3477 gaataaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 3576  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||    
T  3577 gctgtcccacttccattccgccacatccaacggt 3610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 12909 - 12833
Alignment:
Q  144 aaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcac 220  Q
    ||||||| |||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  12909 aaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacgaaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 27048 - 27376
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  27048 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttg 27147  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  27148 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatcttctccaactgagctaccggaaaactaatattgat 27247  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  27248 cggaataaaatgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 27347  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  27348 atgctatcccacttccactctggcacatc 27376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 253
Target Start/End: Original strand, 26666 - 26844
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  26666 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaaccttg 26765  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagc 253  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||    
T  26766 gatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatcttctccaactgagc 26844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 82 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 195479 - 195151
Alignment:
Q  82 gaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctct 181  Q
    ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  195479 gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctct 195380  T
Q  182 atctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatg 281  Q
    ||| ||||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||     
T  195379 atccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaatgttatgaatataaacctctgctaactgagctaccggataaatgatattaatcggaata 195280  T
Q  282 aagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctat 381  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  195279 aagtgcgccgactttgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcagagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctat 195180  T
Q  382 cccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||||    
T  195179 ccaacttccactccggcacatccaacggt 195151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 410
Target Start/End: Original strand, 149091 - 149429
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    |||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||  ||||||| | |||  |||||||||| ||||| ||||    
T  149091 ctttccgactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacc 149190  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    | || || ||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||| ||| || | ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  149191 tcggatccctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcaaaatgttatcaatataaatctcctccaactgagctaccggataactgatatt 149290  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  ||||||| |||||||||||||||    
T  149291 aatcggaatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatggaatcatgccctctcggagtgttcagtaaactcgtcacaaaatccata 149390  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||| ||||| || |||||| | ||||||||||||    
T  149391 gaaatgctgtcccaattacactccagcacatccaacggt 149429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 73 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 26317 - 25987
Alignment:
Q  73 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 172  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||    
T  26317 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacct 26218  T
Q  173 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 272  Q
     || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||| |||||||||||   | ||||| || ||||||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  26217 cggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatatcgcggatgtaaatttccgccaactgggatacaggaaaactgatatta 26118  T
Q  273 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 372  Q
    |||| ||| || || |||||||||||||| || || |  |  ||||| ||||  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  26117 atcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaataatcacccaaatcgcgtcattccctttcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 26018  T
Q  373 aaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    | ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  26017 atatgctatgccatttccactctggtacatc 25987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 153; Significance: 6e-81; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 6e-81
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 114704 - 115044
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  114704 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 114803  T
Q  175 ggtct-----ctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgata 269  Q
    | ||      |||||  |||| ||||||||||| || ||||||| ||| |||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  114804 gatcggatccctatccaacacaatactcgacggtacaccatgcagctttacaatattatgactgtaaatctccgccaactgagctaccggataactgata 114903  T
Q  270 ttaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatcca 369  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  114904 ttaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaatctgtcaaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatcca 115003  T
Q  370 tagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  115004 tagaaatgctattccacttccactccagcacatccaacggt 115044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 90714 - 90513
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||   ||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  90714 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 90615  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||    
T  90614 gatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctctgccaactgagctactagataactaatattgat 90515  T
Q  275 cg 276  Q
    ||    
T  90514 cg 90513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 390986 - 390663
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||     
T  390986 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaat 390887  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||||| ||| ||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  |  ||| |||||||||    
T  390886 cttggatctttatctgatacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctcagccaactgagaaataggaaaactgatat 390787  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||| ||| || || | | |||||||||| || || || || ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||  | ||||| ||||||||||||||    
T  390786 taatcggaataaaatgagtcaacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcatcccctttaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccat 390687  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactc 394  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  390686 ggatatactatcccatttccactc 390663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 136 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 89975 - 89835
Alignment:
Q  136 catcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgta 235  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  89975 catcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatata 89876  T
Q  236 gatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
     ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  89875 aatctctgccaactgagctactagataactaatattgatcg 89835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 10317 - 10636
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  10317 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttg 10416  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  10417 gatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctcctccaactgagctaccggaaaactaatattgat 10516  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| ||   ||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||  ||    
T  10517 tggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatgacatcatgccctctcggactattcggtaaactcgtcacaaaatccatgaaa 10616  T
Q  375 atgctatcccatttccactc 394  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  10617 atgctatcccacttccactc 10636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 6117 - 5782
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| |||||      
T  6117 tccgactgaccatctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatccagaacctagaagtgaacctca 6018  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  6017 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatcttagccaactgagctaccggataactgatgttaat 5918  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5917 aggaatgaagtgtgtcgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 5818  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5817 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 5782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 77 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 18317 - 18000
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||||||     
T  18317 cgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaaccttgga 18218  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  18217 tctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctactggataactaatattgatcg 18118  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||| ||||| |||||||| |||||| |||| || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| || || |||||||| |||||    
T  18117 gaataaagtgtgccgactttgtcaacttgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgttacgaaatccatggaaat 18018  T
Q  377 gctatcccatttccactc 394  Q
    ||| ||||| || |||||    
T  18017 gctgtcccactttcactc 18000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7019 - 6690
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  7019 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctca 6920  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  6919 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgat 6820  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccataga 373  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  6819 cagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatgga 6720  T
Q  374 aatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  6719 aatgctgtcccacttccactccggcacatc 6690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11450 - 11121
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| |||||      
T  11450 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctca 11351  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| | ||| ||    
T  11350 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactaacattgat 11251  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccataga 373  Q
    |  ||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  11250 cagaataaagtgcgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaaatccatgga 11151  T
Q  374 aatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  11150 aatgctgtcccacttccactccggcacatc 11121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 151 - 410
Target Start/End: Original strand, 2188 - 2447
Alignment:
Q  151 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 250  Q
    |||||||||| ||||| ||||| || ||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2188 tccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaatattatgaatgtagatctccgccaactg 2287  T
Q  251 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 350  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||    
T  2288 agctaccggataactgatattaatcggaataaagtgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggt 2387  T
Q  351 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  2388 aaacttgtcacaaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatcaaacggt 2447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 78 - 409
Target Start/End: Original strand, 47651 - 47982
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  47651 gactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgggt 47750  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||     
T  47751 ctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctcccccaactgagctaccggataactaatattgatcgg 47850  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    ||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || | |||| | || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47851 aataaagtgtgccgacttagtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcagggcctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatg 47950  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaacgg 409  Q
     | ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  47951 ttgtcccacttccactctggcacatctaacgg 47982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 5234 - 4899
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||| ||||| || |||||  |||| || || ||||| |||||      
T  5234 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctca 5135  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      || ||||| ||||| ||||||||  |||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  5134 aatccctatccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 5035  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  5034 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaatccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 4935  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4934 atgttatcccatttccactccgatacatccaacggt 4899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 146; Significance: 9e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 72 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 12570 - 12233
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||||||||| || || ||||    
T  12570 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacc 12471  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    | || || ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| ||    
T  12470 tcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataattgatgtt 12371  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
     ||   ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||| | ||||| |||||||||    
T  12370 gataccaatgaagtgcgtcgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaaatcgtcacgaaatccata 12271  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacgg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12270 gaaatgctatcccatttccactctggtacatccaacgg 12233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 78 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 101331 - 100999
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| || |    
T  101331 gactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggat 101232  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    | ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||  || |||| ||||| ||||     
T  101231 ccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccagaaaactaatatttatcgg 101132  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
     || || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||     
T  101131 gataaaatgtgccgacttcgtcaacctatctaccacgacccaaatggcatcatgccctcttggagtgtttggcaaactcgtcacaaaatccatagaaata 101032  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  101031 ttgtcccacttccactccggtacatccaacggt 100999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 77 - 403
Target Start/End: Original strand, 180725 - 181051
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| |||||     
T  180725 cgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgttccaaaatctagaagtaaatcttgga 180824  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||| || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || |  ||| |||||||||||||||    
T  180825 tctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaagaggaaaactgatattaatcg 180924  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
      |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  180925 gtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 181024  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  181025 actatcccatttccactctggcacatc 181051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 1306 - 971
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  1306 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 1207  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || || || ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1206 gatccctgtccgacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttataaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 1107  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || |||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1106 cggaatatagtgtgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 1007  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||    ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1006 attaggtcccacttccactccggcacatccaacggt 971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 6547 - 6863
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||| ||  | || || |||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  6547 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttttccaaaatctagaagtaaaccttg 6646  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  6647 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 6746  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||||||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||     
T  6747 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccatatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgttacaaaatccatggat 6846  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  6847 atactatcccatttcca 6863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 391
Target Start/End: Original strand, 12846 - 12898
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12846 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 12898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 168 - 410
Target Start/End: Original strand, 5830 - 6072
Alignment:
Q  168 aaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactga 267  Q
    |||||||| || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  5830 aaccttggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatgtaaatctcagccaactgagctacaggataactaa 5929  T
Q  268 tattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatc 367  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  5930 tgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccaaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatc 6029  T
Q  368 catagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6030 catagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 6072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6818 - 6499
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  6818 tccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 6719  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  6718 gatctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgtaacttcacaatattatgaatgtaaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 6619  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  || || |||||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  6618 cgggataaaatgcgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggtatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 6519  T
Q  375 atgctatcccatttccactc 394  Q
    ||||| ||||| ||||||||    
T  6518 atgctgtcccacttccactc 6499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 44029 - 44364
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  44029 tccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 44128  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  44129 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaat 44228  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  44229 agggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaa 44328  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44329 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 44364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 45041 - 45376
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  45041 tccgactgaccatgtatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 45140  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  45141 gatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatattatgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactcatgttaat 45240  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  ||||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  45241 agggatgaagtgttccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgttacaaaatccatagaa 45340  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45341 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 45376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 177 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 13979 - 13746
Alignment:
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  13979 tctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatgttaatcg 13880  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13879 gaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 13780  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13779 gctatcccacttccactctggtacatccaacggt 13746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 2657 - 2336
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||   |||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2657 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttg 2558  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| || || ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||| | || |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2557 gatctctatccgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaatattgtgactataaatctccgcc--ctgagctaccggataattgatattaat 2460  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| || | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2459 tggaataaagtgtgccgacttcgttaacctatcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttaggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 2360  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggt 398  Q
    ||||  ||||| ||||||||||||    
T  2359 atgccgtcccacttccactccggt 2336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 31934 - 32269
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||||||| ||||||||   ||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  31934 tccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 32033  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||    
T  32034 gatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaattgagctaccggataactgatattgat 32133  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| ||| || ||||||| || ||||| || |  |||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  32134 tggaataaagagcaccgactttgttaacctatcaaaaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 32233  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  32234 atgttgtcccacttccactcctgcacatccaacggt 32269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Original strand, 14563 - 14896
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||| |||| || ||||| ||||| |||||||||||  |||| || ||| | ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14563 tccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14662  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || |||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  14663 gatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 14762  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || ||||||||||||||||| || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||     
T  14763 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattaggcaaactcttcacaaaatccatggat 14862  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  14863 atactatcccatttccactctggcacatctaacg 14896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 223
Target Start/End: Original strand, 17965 - 18113
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  17965 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 18064  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 223  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| || || ||| |||||||    
T  18065 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaat 18113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 155 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18321
Alignment:
Q  155 aaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagct 254  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| || || || || ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||      
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaatttccgccaactgagaa 18458  T
Q  255 actggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaac 354  Q
    || ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||   ||| |||  | |||||||| | |||||    
T  18457 acaggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcggcattccctttaggagtattcgttaaac 18358  T
Q  355 ttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    | |||||||||| ||| || || ||||||||||||||    
T  18357 tcgtcacaaaatacatggatatactatcccatttcca 18321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 51645 - 51310
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||||||  |||| |||||      
T  51645 tccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctaaaagtgaacctca 51546  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  51545 gatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 51446  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  51445 cggaataaagtgtgacgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccttctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 51346  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||| ||||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  51345 atgctgtcccacttccactctggcacatctaacggt 51310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 96 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81279
Alignment:
Q  96 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 195  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || || ||  |||||||||| || || ||||| || || ||||| ||||| ||||    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  196 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgactt 295  Q
    ||||||| || ||||| | ||||| |||||| ||||| || ||||  | |||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttcaaaatattatgaatataaatctaagtcaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactt 81394  T
Q  296 cgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactcc 395  Q
     |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  81393 tgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgccctctcgtagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactcc 81294  T
Q  396 ggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||||||||||    
T  81293 ggtacatccaacggt 81279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 1754 - 1426
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||  ||||||| |||||  ||||||| || ||||| ||||| |    
T  1754 tccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcg 1655  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| | |||||  ||||| || ||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||| ||    
T  1654 gatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttaaaaatatgatgaatataaatctccgccaactaagctaccggaaaactaatattgat 1555  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || || ||| ||||||||||||| || ||  ||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||    
T  1554 cggaataaaatgtgcctacttcgtcaacctatcgacagcaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcataaaatccatggaa 1455  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  1454 atgctatcccacttccactctggcacatc 1426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28546 - 28222
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28546 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatc 28447  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  28446 tctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgga 28347  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  28346 ataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatcatgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgc 28247  T
Q  379 tatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  28246 tatcccatttccactctggcacatc 28222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 79 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 40537 - 40213
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||   ||| || ||||||||| | ||||| ||| || | |||||||| |||||||| ||||| ||    
T  40537 actgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagtttttcaaaatctagaagtaaatcttggatc 40438  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||| |    
T  40437 tctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctccgccaactgagccaccggaaaactaatattaatcgga 40338  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    || || ||||||||||||||||| || || || || ||||| || | |||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||    
T  40337 ataaaatgcgccgacttcgtcaatctatcaacaactacccaaatggtatcatgtccccttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccatggatatgc 40238  T
Q  379 tatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  40237 tatcccatttccactctggcacatc 40213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 133; Significance: 5e-69; HSPs: 3)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 218 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 57486 - 57294
Alignment:
Q  218 cacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacc 317  Q
    ||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  57486 cacaatattatgaatgtaaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaataggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacc 57387  T
Q  318 catatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || |||||||| || |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57386 caaatagaatcatgtcctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 57294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 72 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 48819 - 48497
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || ||||||||  ||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||    
T  48819 ctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaacatcttgaagtgaacc 48720  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    | || ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| |||||    
T  48719 tcggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatatt 48620  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
     |||| ||  ||||  ||||||||||||||||| || || |||| ||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  48619 gatcggaagaaagtttgccgacttcgtcaacctatcgacaacaatccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatcaatg 48520  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||| | ||||| ||||||||    
T  48519 gaaatgttgtcccacttccactc 48497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 57599 - 57541
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaa 133  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||    
T  57599 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaa 57541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 11293 - 11628
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  11293 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaagtgaacctcg 11392  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  11393 gatctccatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaatgttttgaatataaatctcagccaactgagctaccggataactgatgttaat 11492  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||||||  ||||||| |||||||| || ||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||    
T  11493 aggaatgaagtgtaccgactttgtcaacctatcgaccacaaaccatatagaatcaaaccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaa 11592  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11593 atgttatcccatttccactccgatacatccaacggt 11628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 4954 - 5289
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| |   |||||| |||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  4954 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcg 5053  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| ||    
T  5054 aatctctatccgacacgatgctcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggaaaactaatattgat 5153  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||     
T  5154 cggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggag 5253  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| |||||||  || ||||| ||||||    
T  5254 atgttgtcccacttccactatggcacatctaacggt 5289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 131; Significance: 8e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 75 - 393
Target Start/End: Original strand, 393 - 711
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  393 tccgactgaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 492  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||    
T  493 gatctctatccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaactgagctaccggaaaactaatattgat 592  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| | ||||||||||||||| || || | | |||| || | ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  593 cggaataaagtgtgtcgacttcgtcaacctatcgacaaaatcccaaatggcatcatgccctctcagagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 692  T
Q  375 atgctatcccatttccact 393  Q
    ||| | ||||| |||||||    
T  693 atgttgtcccacttccact 711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 72 - 409
Target Start/End: Original strand, 260829 - 261166
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || || ||||    
T  260829 ctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacc 260928  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    | || || ||||| ||||| ||||| || ||||| ||||| | |||||||| ||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||    
T  260929 tcggatccctatccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaacattatgaatataaatctcagccaattgagctatcggataactgatgtt 261028  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
     || | ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||| |||| || |||||||| |||||||||||||||    
T  261029 gataggaataaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaatcatgtcctctcagagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccata 261128  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacgg 409  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  261129 gaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacgg 261166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 278612 - 278296
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||| ||  | ||||| |||||  ||||||| || |||||||| ||||    
T  278612 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttccaaaacctagaagtaaatcttg 278513  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| ||| || | || || ||| |||||||||||||    
T  278512 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgcctacagggcgacaggaaaactgatattaat 278413  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||     || || |||||||||||||| || || || |  | ||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  278412 cggtggaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 278313  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  278312 atactatcccatttcca 278296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 5274 - 5609
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  5274 tccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 5373  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
      |||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5374 aatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatgttatgaatataaatctccgctaactgagctaccggataactgatattaat 5473  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||| |||| | |||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  5474 aggaatgaagtgtgccaacttcgtcaacctgtcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcgtattattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 5573  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| ||||| || || ||||| ||||||    
T  5574 atgttgtcccacttccagtctggcacatctaacggt 5609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 128; Significance: 5e-66; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 931 - 596
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  931 tccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 832  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||  || |||| ||||| ||    
T  831 gatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgtaacttcataatattatgaatataaatctcagccaattgagctaccagaaaactaatattgat 732  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| || | ||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||    
T  731 cggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatcgacaacaacccaaatggcatcatgccctctcggagtattcagtaaactcgtcacaaaatccatggaa 632  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||| ||||||    
T  631 atgctatcccactttcactctggcacatctaacggt 596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 202
Target Start/End: Original strand, 28043 - 28170
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||||  | ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| |    
T  28043 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcg 28142  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacgg 202  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  28143 gatctctatctgacacaatacttgacgg 28170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 202
Target Start/End: Original strand, 34296 - 34423
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || || |||||  | ||||| |||||  ||||||||||  |||| ||||| |    
T  34296 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtgaacctcg 34395  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacgg 202  Q
    | |||||||||||||| ||||| |||||    
T  34396 gatctctatctgacacaatacttgacgg 34423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 75 - 353
Target Start/End: Original strand, 11412 - 11690
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||  |||||||||| ||  |||||||| | ||| | ||||| |    
T  11412 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcg 11511  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11512 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctaccggataactgatattaat 11611  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaa 353  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| || ||||| | |||||||    
T  11612 cgaaataaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctaggagtgtaaggtaaa 11690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 186 - 5
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  |||||||||||||  |||||||||| || || ||||| |    
T  186 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcg 87  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 256  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||    
T  86 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaatattattaatataaatctccgccaactgagctac 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 349 - 410
Target Start/End: Original strand, 12996 - 13057
Alignment:
Q  349 gtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12996 gtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 13057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 3315 - 3650
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  3315 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcg 3414  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||| ||||| || |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  3415 gatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgtaacttcttaatattatgaatataaatctccgccaactgagctatcggataactaatattgat 3514  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||| |||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  3515 cggaataaagtgcgcggactttgtcaacctatcgacaaccacccaaatggcatcacgccctctgggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 3614  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  3615 atgttgtcccacttccactccggcacatctaacggt 3650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Original strand, 6896 - 7229
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6896 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6995  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  6996 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 7095  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||     
T  7096 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattagacaaactcgtcacaaaatccatggat 7195  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  7196 atactatcccatttccactctggcacatctaacg 7229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 151 - 410
Target Start/End: Original strand, 7660 - 7919
Alignment:
Q  151 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 250  Q
    |||| ||||| ||||| ||| | || || ||||| ||||| ||||||||||| || ||| | | |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||    
T  7660 tccagaatctagaagtgaacatcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccacgtagcttcacaatattatgaatataaatctccaccaactg 7759  T
Q  251 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 350  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||| || |||    
T  7760 agctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcatcaacttgtcgaccacaacccatatagcatcatgccctctcggagtgtttggt 7859  T
Q  351 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  7860 aaactcgtcacaaaatccagagaaatgctatcccacttccactccggcacatccaacggt 7919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3137 - 2802
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| |||||  |||| ||||| |    
T  3137 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcg 3038  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| | |||||| || || ||||  || |||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||    
T  3037 gatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcactatgttatgaacataaatctccgccaactatgctaccagataactgatattaat 2938  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||| | ||| ||||| || ||||| || | || ||| |||||||||| |||||||    
T  2937 aggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtcgataacaacctatatagcatcgtgccctcttggagtgtttgctatactcgtcacaaaattcatagaa 2838  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  2837 atactatcccacttccactccggcacatctaacggt 2802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 2318 - 2653
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  ||||||||| |||||| ||||| |    
T  2318 tccgactgaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtgaagtgaacctcg 2417  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | | |||||| ||||| |||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||    
T  2418 gatgtctatccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaactgagctaccggataactattattgat 2517  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| |  ||||||||||||||||| || || ||||| || | ||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||    
T  2518 cggaataaagtgtgttgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcgtgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 2617  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||| | ||||| ||| |||| || ||||| ||||||    
T  2618 atgttgtcccacttctactctggcacatctaacggt 2653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 43307 - 43642
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||  || || |||||  ||||||| |||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  43307 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 43406  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || |||||||| || ||||||||||| || || || | |||||||||  | ||||  || ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  43407 gatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctgccaactgtgctaccagataactgatattaat 43506  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||    
T  43507 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaatgacatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaa 43606  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43607 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 43642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 78 - 410
Target Start/End: Original strand, 249140 - 249472
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || || |||||  |||| || || || |||||||| || |    
T  249140 gactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtaaacctcggat 249239  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||  | ||||  || |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |     
T  249240 ccctatctgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaatgctatgaacataaatctctaccaactgtgctaccggataactgatattaattgg 249339  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| || | |||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||     
T  249340 aatgaaatgtgccgacttcgtcaacctgtcgacaataacccaaattgcatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacgaaatccatagaaata 249439  T
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  249440 ctgtcccacttcgactccggtacatccaacggt 249472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 113; Significance: 4e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 216 - 388
Target Start/End: Original strand, 49437 - 49609
Alignment:
Q  216 ttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaa 315  Q
    |||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  49437 ttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgagctaccggttaactgatattaatcggaatgaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccacaa 49536  T
Q  316 cccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccattt 388  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49537 cccatatagaatcatgccctctcggagtgtttggtaaactcgccacaaaatccatagaaatgctatcccattt 49609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 77 - 391
Target Start/End: Original strand, 19375 - 19689
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   ||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||   ||     
T  19375 cgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcgga 19474  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| | | | || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  19475 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcactctcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcg 19574  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19575 gaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 19674  T
Q  377 gctatcccatttcca 391  Q
    | | ||||| |||||    
T  19675 gttgtcccacttcca 19689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 77 - 391
Target Start/End: Original strand, 23537 - 23851
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |||||||   ||||||| |||||  || | ||||| ||||| |||   ||     
T  23537 cgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttctagaatctagaagtgaactgcgga 23636  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| | | | || || |||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||    
T  23637 tctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcactctcacaatgtcccggatataaatctccgccaactgagctaccggaaaacttatattgatcg 23736  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23737 gaataaagtgcgctgacttcgtcaacctatccaccacaacccaaatagcatcatgccctctcggagtattgggtaaactcgtcacaaaatccatagaaat 23836  T
Q  377 gctatcccatttcca 391  Q
    | | ||||| |||||    
T  23837 gttgtcccacttcca 23851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 215 - 410
Target Start/End: Original strand, 528 - 723
Alignment:
Q  215 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 314  Q
    |||||||||||| |  || || ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  528 cttcacaatattatcgatataaatctccgccaactgagctaccagataactgatattaatcggaataaagtgcgccgacttcgtcaacttgtcgaccaca 627  T
Q  315 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||| | ||||||||| |||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  628 acccatatagtatcatgccctctcgaagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgttatcccacttccacttcggcacatccaacggt 723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 108; Significance: 4e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 24853 - 24519
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||  |||| || || |||||| | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  24853 tccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 24754  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| |||||| |   |||| || ||||||||||| ||||| ||   | |||| ||||| ||    
T  24753 gatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaactacacaatttcacgaatataaatctccgccaaatgagccaccataaaactaatattgat 24654  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||| || |||| |||||||||||| || ||||| || ||||| || | ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |    
T  24653 tggaataaattgcgtcgacttcgtcaatctatctacaaccacccaaatggtatcatgccctcttggagtattcggtaaacttgttacaaaatccat-gga 24555  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  24554 atactatcccatttccacttcggcacatctaacggt 24519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 106; Significance: 6e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 228 - 410
Target Start/End: Original strand, 5 - 183
Alignment:
Q  228 tgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaat 327  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||    ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  5 tgaatataaatctcagccaactgagc----ggataactgatgttaataggaatgaagtgtgccgactttgtcaacctatcgaccacaacccatatagaat 100  T
Q  328 catgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101 catgccctctcggagtgtttggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 75 - 409
Target Start/End: Original strand, 17883 - 18206
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||| |||  ||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || |    
T  17883 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaatctcg 17982  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||  |||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||||||| ||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  17983 gatctctatcccacacaatactcgatagaactccatgcaactttacaatattatgaatataaacctccgccgactgagctactggataactaatattgat 18082  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||           |||||||| || | ||||||| | | ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  18083 cggaataaagtgtgccgacttcgtca-----------acaacccaaatggcatcatgctctcacggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaa 18171  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacgg 409  Q
    ||| | ||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  18172 atgatgtcccacttccactctggcacatctaacgg 18206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 14867 - 14644
Alignment:
Q  187 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtg 286  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||    
T  14867 acacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattg 14768  T
Q  287 cgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccat 386  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  14767 tgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccac 14668  T
Q  387 ttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  14667 ttccactccggcacatccaacggt 14644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 187 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 23046 - 22823
Alignment:
Q  187 acactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtg 286  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||| |||||||| | ||| |||| ||| || ||    
T  23046 acacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaatattatgaatataaatctccggcaactgagctaccggataactaagattgatcggaataaattg 22947  T
Q  287 cgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccat 386  Q
     |||||||||||||||||||| || || ||||| || | ||||||||| |||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||     
T  22946 tgccgacttcgtcaacctgtcgacaaccacccaaatggcatcatgccctctcggagtgttcggtagactcgtcacaaaatccatagaaatgttgtcccac 22847  T
Q  387 ttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||||| ||||||||||||    
T  22846 ttccactccggcacatccaacggt 22823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 16495 - 16160
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| ||||| |    
T  16495 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcg 16396  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| | |||||| | | | ||||| || ||||| || ||||  ||||| |||||| ||||||| ||    
T  16395 gatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcaccacactgtgaatataaatctctgctaactacgctaccggataattgatattgat 16296  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||| || |  | |||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||     
T  16295 aggaatgaagtgtgccgactttgtcaaccggtcgacaacaacccaaatagcgttatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacaaaatccatagag 16196  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  16195 atactgtcccacttccactccggtacatctaacggt 16160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 19126 - 19454
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  19126 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 19225  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||    
T  19226 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaat 19325  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  19326 cggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 19425  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  19426 atactatctcatttccactctggcacatc 19454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Original strand, 50017 - 50218
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  50017 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 50116  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  50117 gatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatatcaagaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 50216  T
Q  275 cg 276  Q
    ||    
T  50217 cg 50218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 138 - 403
Target Start/End: Original strand, 34613 - 34878
Alignment:
Q  138 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 237  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || |    
T  34613 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaa 34712  T
Q  238 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 337  Q
    |||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| ||    
T  34713 tctctgccaactgggcaacaggaaaactgatattaatcggcagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctct 34812  T
Q  338 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  34813 aggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatc 34878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 71 - 391
Target Start/End: Original strand, 1428 - 1748
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    ||||| ||||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  1428 tcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 1527  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  |||| ||||| || || | ||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |    
T  1528 cttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaatctcgtgaatgtaaatctccgccaactgagatacaggaaaactgatgt 1627  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||  |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  ||||| || || |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  1628 taatcagaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtcatgtcctcttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 1727  T
Q  371 agaaatgctatcccatttcca 391  Q
      | || ||||||||||||||    
T  1728 gtatatactatcccatttcca 1748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 138 - 410
Target Start/End: Original strand, 12081 - 12353
Alignment:
Q  138 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 237  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| | |||||||||||   ||||||| |    
T  12081 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatatcgggaatgtaaa 12180  T
Q  238 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 337  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |  ||||| |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  12181 tctccaccaactgaggtacaggaaaactgatattactcgaaatgaaatgagccgacttcgtcaatccatctacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 12280  T
Q  338 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || |||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12281 cgaagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggtacatctaacggt 12353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 9865 - 9782
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaat 158  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||||||    
T  9865 tccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 76 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 19783 - 19451
Alignment:
Q  76 ccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgg 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||  |||||| |||| ||||| |||||||| |||||    
T  19783 ccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttgg 19684  T
Q  176 gtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatc 275  Q
     |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| |||||||||    
T  19683 atctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatc 19584  T
Q  276 gaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaa 375  Q
    | ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  | || |||  | |||||||| |  | ||| |||||||||||||| || |    
T  19583 ggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgttattccctttaggagtatttgtcatactcgtcacaaaatccatggata 19484  T
Q  376 tgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    | ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19483 tactatcccatttccactctggaacatctaacg 19451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 32534 - 32207
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  32534 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 32435  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||| ||| || || |||||  |||| |||||||||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  32434 gatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 32336  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || |||||| || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  32335 cggaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 32236  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32235 atgctatcccatttccactctggtacatc 32207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 33101 - 32766
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||  |||| || ||||||||  |||| || |||||  |||| || || || || ||||| |    
T  33101 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcg 33002  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| |||   ||||||||||| || || |||| |||||||||  | ||||  || |||||  ||||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  33001 gatccctatccgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaatgctatgaacataaatctctaccaactgtgctaccgggtaactgacattaat 32902  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | |||||| || |||||||||||||||| ||| |   ||||||| || | ||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  32901 aggaatgaaatgtgccgacttcgtcaaccggtcgatagcaacccaaatggcatcatgccctctcggagtgtttggtaaacttgtcacgaaatccatagaa 32802  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32801 atactgtcccacttccactccggtacatccaacggt 32766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 75 - 410
Target Start/End: Original strand, 26785 - 27120
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | || ||||||||  |||| || || ||||| |||||      
T  26785 tccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctca 26884  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | || ||||| ||||| ||||| ||||  || || |||| |||||||||| | ||||  || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  26885 gatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgcagcttcacaatactatgaacataaatctctgccaactgtgctaccggataactgatattgat 26984  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| |  |  |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||     
T  26985 aggaatgaagtgtgccgacttcgtcaaccggtcgacaacaacccaaacagcgtcatgccctctcggagtgttcggtaaactcgtcacgaaatccatagag 27084  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    || || ||||| ||||||| ||||||||| ||||||    
T  27085 atactgtcccacttccactacggtacatcaaacggt 27120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 94; Significance: 9e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Original strand, 6573 - 6906
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||| | ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  6573 tccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 6672  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| ||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||| ||||||||    
T  6673 gatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcagaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaacaggaaaactaatattaat 6772  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || |  |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  6773 cggaagaaaataagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 6872  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    || ||||||||||||||||| || ||||| ||||    
T  6873 atactatcccatttccactcaggcacatctaacg 6906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 1991 - 2310
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1991 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 2090  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| | |||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| ||||||||||||     
T  2091 ggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaag 2190  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| |  ||||| || ||||||||||| ||     
T  2191 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaaactcgttacaaaatccatggat 2290  T
Q  375 atgctatcccatttccactc 394  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  2291 atgctatcccatttccactc 2310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 4555 - 4874
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||  |||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  4555 tccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 4654  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  4655 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcataatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaat 4754  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  4755 cggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttatgagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggat 4854  T
Q  375 atgctatcccatttccactc 394  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  4855 atgctatcccatttccactc 4874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 25505 - 25166
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  25505 tctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 25406  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    | |||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||||||||| |   ||||||| ||||| |||||||||| |||  || ||||||| |    
T  25405 catggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacgaatgtaaatctctgccaactgagatacaagaaaactgatgt 25306  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||| | |||||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||||||    
T  25305 taattggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatccacaatcacccaaatagcgtcatgccctcttggagtattcggcaaactcgtgacaaaatccat 25206  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
     || |  |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||    
T  25205 ggatacactatcccatttccactacggcacatctaacggt 25166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 91; Significance: 6e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 77 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 219197 - 218875
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||     
T  219197 cgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaccttgga 219098  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||  ||||||||||||   ||||||| || |||||||||||||  || ||| |||||||||||||||    
T  219097 tctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtcacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagacacaggaaaactgatattaatcg 218998  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| |  || || |||||||||||||| || ||    
T  218997 gaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcgacaagctcgtcacaaaatccatggatat 218898  T
Q  377 gctatcccatttccactccggta 399  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  218897 gctatcccatttccactctggta 218875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 229563 - 229895
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||  | || || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||| |||  |||||||     
T  229563 tctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaactctataagtaaat 229662  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||    
T  229663 cttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatat 229762  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||| ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  229763 taatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 229862  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || || ||||| || |||||||| || |||||    
T  229863 ggatatactatcacaattccactctggcacatc 229895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 4189 - 3872
Alignment:
Q  73 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 172  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  4189 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 4090  T
Q  173 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 272  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||    
T  4089 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatatta 3990  T
Q  273 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 372  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  3989 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 3890  T
Q  373 aaatgctatcccatttcc 390  Q
    | || |||||||||||||    
T  3889 atatactatcccatttcc 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 73 - 390
Target Start/End: Original strand, 9118 - 9435
Alignment:
Q  73 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 172  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  9118 tttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 9217  T
Q  173 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 272  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||    
T  9218 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatatta 9317  T
Q  273 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 372  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  9318 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 9417  T
Q  373 aaatgctatcccatttcc 390  Q
    | || |||||||||||||    
T  9418 atatactatcccatttcc 9435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 73 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33357 - 33039
Alignment:
Q  73 tttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacct 172  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||    
T  33357 tttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 33258  T
Q  173 tgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatta 272  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||  ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || ||  || |||| ||||||    
T  33257 tggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcaatctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaagaaaactaatatta 33158  T
Q  273 atcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatag 372  Q
    ||||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  33157 atcggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcattccctgtaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgg 33058  T
Q  373 aaatgctatcccatttcca 391  Q
    | || ||||||||||||||    
T  33057 atatactatcccatttcca 33039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 16198 - 15870
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | | ||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  16198 tccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 16099  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || |||||||||| ||  |  ||| |||||||||||||    
T  16098 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaacttagacataggaaaactgatattaat 15999  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  ||||  ||  | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||     
T  15998 cggaataaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcatttcctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15899  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15898 atgctatcccatttccactctggtacatc 15870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 476 - 160
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||  || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  476 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 377  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||  |||| || ||||| ||||  |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |  ||| |||| ||||||||    
T  376 gatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgagaaataggaaaactaatattaat 277  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  276 cggaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggat 177  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  176 atactatcccatttcca 160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 71 - 403
Target Start/End: Original strand, 3660 - 3992
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  3660 tctttccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 3759  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    || || ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   | || || ||||||||||||||||  || ||| |||||||||    
T  3760 ctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcgcggatataaatctccgccaactgagacacaggaaaactgatat 3859  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||| |||||| || ||||||||   ||| || ||||| |  ||| | ||||  |||| |||  ||||||| || |  ||||| ||||||||||||||    
T  3860 taatcggaatgaaatgagccgacttgtgcaatctatctacaatcacctaaatcgcgtcattccctttcggagtgttcgaaaaactcgtcacaaaatccat 3959  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  3960 ggatatactatcccatttccactctggcacatc 3992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 14884 - 15212
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  |||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  14884 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 14983  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||  || || ||| |||| ||||||||    
T  14984 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactaggcaacaggaaaactaatattaat 15083  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  | ||| || | ||| | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15084 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattagccaaattgcatcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 15183  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || |||||||||||||| || ||||||||    
T  15184 atactatcccatttccattctggtacatc 15212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 1144 - 1460
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  1144 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1243  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1244 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 1343  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || | |||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  1344 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcgttccctctagaagtatttggcaaacttgtcacaaaatccatggat 1443  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  1444 atactatcccatttcca 1460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 75 - 249
Target Start/End: Original strand, 4399 - 4573
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| |||||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  4399 tccgactgaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 4498  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 249  Q
    | ||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  4499 gatctctttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaatattatgaatataaatctccgccaact 4573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39465
Alignment:
Q  138 tcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtaga 237  Q
    ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   ||||||| |    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatgtaaa 39631  T
Q  238 tctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccct 337  Q
    |||| ||||||||||  || ||| |||||||| |||||||||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  |    
T  39630 tctctgccaactgagaaacaggaaaactgatactaatcgaaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattcccttt 39531  T
Q  338 cggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  39530 aggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatctcatttccactctggcacatc 39465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 605 - 277
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||  |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  605 tccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 506  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  505 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 406  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || ||||||||| |||| || || || |  ||||| ||||  |||| | | || |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  405 cggtagaaaatgagccgacttcatcaatctatcaactatcacccaaatcgcgtcattctctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaactccatggat 306  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || || |||||||||||||| || |||||    
T  305 atactgtcccatttccactctggcacatc 277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 63813 - 63485
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||   | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  63813 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 63714  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||| | ||||| |  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| ||||||||||| || ||| |||||||||||||    
T  63713 gatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctttatataaatctctgccaactgagcaacaggaaaactgatattaat 63614  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||| ||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| ||| || |||||||| || ||||| ||||||||||||||  |     
T  63613 cggtagaaaatgagccgacgtcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgcat 63514  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  63513 atactatcccatttccactctggcacatc 63485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 79 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4232 - 3911
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  ||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  4232 actgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctataagtaaatcttggatc 4133  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
    |||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   ||||||| ||||||||||||| ||  || ||| ||||||||||||||| |    
T  4132 tctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttcgcgaatgtaaatctccgccaactaagacacgggaaaactgatattaatcgga 4033  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    || || |  || ||||||||||| || |   | |||| ||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  4032 ataaactaagctgacttcgtcaatctat---caacaatccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgc 3936  T
Q  379 tatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||||||||||| || |||||    
T  3935 tatcccatttccactctggaacatc 3911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 252
Target Start/End: Original strand, 130672 - 130849
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  130672 tccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 130771  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgag 252  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  130772 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcacgaatgtagatctccgccaactgag 130849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 29161 - 28963
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||| ||| ||||    
T  29161 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatcttg 29063  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||    
T  29062 gatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgctaactgggcaacaggaaaactgatattaat 28963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 84 - 210
Target Start/End: Original strand, 59287 - 59413
Alignment:
Q  84 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 183  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||| | || || |||||   ||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  59287 ccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 59386  T
Q  184 ctgacactatactcgacggaaccccat 210  Q
    |||| || ||||| |||||||| ||||    
T  59387 ctgatacaatacttgacggaacaccat 59413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 28890 - 28826
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  28890 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 28826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 14861 - 14533
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |    
T  14861 tccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaacctcg 14762  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| |  ||  | |||||||| ||||| | |||||||||||   | ||||| ||||| |||||||||| ||| ||| ||||||| |||||    
T  14761 gatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctctgccaactgagatacaggaaaactgatgttaat 14662  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || |||||| || ||||||||||| || || ||||| |  ||||| || |  |||| |||  |||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||     
T  14661 cggaatgaaatgagccgacttcgttaatctatctacaatcacccaaatagcgtcattcccattcggagtattcggcaaactcgtcacaaattccatggat 14562  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  14561 atactatctcatttccactctggcacatc 14533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 3596 - 3268
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| ||||||||||| | ||||| ||||    
T  3596 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttg 3497  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| ||||||||| ||||||| | || ||| || ||||| |||||||| |  ||  || |||||||||||||    
T  3496 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttaatatatatctctgccaactgggtaacaagaaaactgatattaat 3397  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| |||   |||| ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  3396 cggtagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcccgtcattccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 3297  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3296 atactatctcatttccactctggcacatc 3268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 275
Target Start/End: Original strand, 13011 - 13211
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  13011 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 13110  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  13111 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 13210  T
Q  275 c 275  Q
    |    
T  13211 c 13211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 391
Target Start/End: Original strand, 13256 - 13308
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13256 ggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcca 13308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 220 - 548
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||    ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  220 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 319  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||| || ||||| ||||||||||  || |||  ||||||||||||    
T  320 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaataccacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaagactgatattaat 419  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |  ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |      
T  420 cagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattaggcaaactcgtcacaaaattcatgggt 519  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  520 atactatcccatttccactctggcacatc 548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 7921 - 8237
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7921 tccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8020  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| | ||  || || ||||| || ||| | || ||  || |||| ||||||||    
T  8021 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctccttgatataaatctctgctaacagggcaacaagaaaactaatattaat 8120  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || ||||||||| ||||||| || || |||||||| || |  || | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| ||     
T  8121 cggtagaaaatgagccgacttcatcaacctatcaacaacaacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggaaaacttgtcacaaaatccattgat 8220  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  8221 atactatcccatttcca 8237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 71 - 410
Target Start/End: Original strand, 9490 - 9829
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||  | || || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  9490 tctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 9589  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||  |||| ||||| | |||||||||||   ||||||| || ||| |||||||||  || ||| |||||||||    
T  9590 cttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaatatcgcgaatgtaaatttcctccaactgagacacaggaaaactgatat 9689  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    |||||| |||||| || || || ||||| || || || || |  ||||| |||  ||||| |||  ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  9690 taatcggaatgaaatgagctgatttcgttaatctatcaacaattacccaaatcacatcattccctttcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatccat 9789  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
     || || |||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  9790 ggatatactatcctatttccactctggcacatctaacggt 9829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 212 - 403
Target Start/End: Original strand, 28718 - 28909
Alignment:
Q  212 caacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctacc 311  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||| |  ||     
T  28718 caacttcacaatattatgaatgtaaatctccaccaactgagctaccggaaaactaatattgatcggaataaaatgtgccgacttcgtcaacctatagaca 28817  T
Q  312 acaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||| || | ||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||| || |||||    
T  28818 acaacccaaatggcatcatgccctcttggagtattcggtaaactcgtcacaaaatccatggaaatgttgtcccacttccactctggcacatc 28909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 217
Target Start/End: Original strand, 37726 - 37868
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  |||| |||||||||||  |||||||||| ||  ||||||| |||||||| ||||| |    
T  37726 tccgactgaccatctgtttgcggatgataggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacctcg 37825  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaactt 217  Q
    | |||||||| ||||| || ||||| |||||||||| ||||||    
T  37826 gatctctatccgacacaatgctcgatggaaccccatacaactt 37868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 185 - 403
Target Start/End: Original strand, 29578 - 29797
Alignment:
Q  185 tgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaag 284  Q
    |||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||| |||||||||| ||  ||     
T  29578 tgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactaatattaatcggaagaaaa 29677  T
Q  285 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcac-aaaatccatagaaatgctatcc 383  Q
    || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | ||||||| | | ||||| ||||| ||||||||| || || ||||||    
T  29678 tgagccgacttcgtcaatctttcaacaatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtatcatgcaaactcgtcacaaaaatccatggatatactatcc 29777  T
Q  384 catttccactccggtacatc 403  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  29778 catttccactctggcacatc 29797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 78 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 113266 - 112953
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||| |||| ||||| |    
T  113266 gactgaccatctgtctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggat 113167  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcga 277  Q
    |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |   |||| || || ||  |||||||||  || ||| |||| |||||||| |     
T  113166 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctctggaatataaatttcttccaactgagaaacaggaaaactaatattaattgg 113067  T
Q  278 aatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatg 377  Q
    || ||| || |||||||||||||| || || || || ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||    
T  113066 aaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaaccacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatg 112967  T
Q  378 ctatcccatttcca 391  Q
    ||||||||||||||    
T  112966 ctatcccatttcca 112953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 15401 - 15729
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||| |    
T  15401 tccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcg 15500  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||   | || || |||||||| |||||||  || ||| |||  || |||||    
T  15501 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaactttacaatatcacggatataaatctccgcgaactgagacacaggagaaccaatgttaat 15600  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||| || || ||||||||| |||| |  || || |  ||||| ||||  |||| ||| |||| |||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  15601 cggaataaaatgagccgacttcatcaatccatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctctcgtagtattcggaaaactcgtcacaaaatccatggat 15700  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15701 atgctatcccatttccactatggtacatc 15729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 4881 - 4553
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  4881 tccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 4782  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| |  || ||  |||| ||||||||    
T  4781 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggaaacagggaaactaatattaat 4682  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || |||||||| || || || |||||||||||||| ||     
T  4681 cggtagaaaatgagctgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggat 4582  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  4581 atactatcccatttccactctggcacatc 4553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 7463 - 7779
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7463 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7562  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||| || | ||  || || ||||| ||||| || || || ||  |||| ||||||||    
T  7563 gatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaattgggcaacagggaaactaatattaat 7662  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |   |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  7663 ctgtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatccatggat 7762  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  7763 atactatcccatttcca 7779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 16179 - 16507
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||| | ||||    
T  16179 tccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtatatcttg 16278  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||| |||  | || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||||||||  || ||| |||||||||||||    
T  16279 gatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctgccaactgagaaacaggaaaactgatattaat 16378  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |  ||  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | ||||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||| || ||     
T  16379 cagaagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcatcattcccattaggagtatttggaaaactcgtcacaaaatcgatggat 16478  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||| ||||||||||| || |||||    
T  16479 atactatcgcatttccactctggcacatc 16507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 18987 - 18761
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||  |||| || ||||  ||  | ||||  |||||  |||||||||| |||||||||||      
T  18987 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctctttcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctca 18888  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||||||||||| |||  || |||||||||||||    
T  18887 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatatcgcgaatgtaaatttccgccaactgagatacaagaaaactgatattaat 18788  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 301  Q
    || |||||| || ||||||||||||||    
T  18787 cggaatgaaatgagccgacttcgtcaa 18761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 253 - 410
Target Start/End: Original strand, 20096 - 20253
Alignment:
Q  253 ctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaa 352  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||    
T  20096 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 20195  T
Q  353 acttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  20196 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggt 20253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 253 - 410
Target Start/End: Original strand, 22916 - 23073
Alignment:
Q  253 ctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaa 352  Q
    |||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||| || | |||||| ||   ||||||||| |||||||| || |||||    
T  22916 ctaccggataactgatattaataggaatgaagtgtgccgatttcgtcaacctgtcgacaataacccaaatgtcatcatgccctctcggagtgttcggtaa 23015  T
Q  353 acttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23016 acttgtcacgaaatccatagaaatactgtcccacttccactccggcacatctaacggt 23073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 256
Target Start/End: Original strand, 1052 - 1233
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  ||||||| || ||  |||  ||||| ||||| |||||      
T  1052 tccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttcctgaatctagaagtgaacctca 1151  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctac 256  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || | ||| || |||||||||||||| |||||    
T  1152 gatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaatgttatcaatataaatctccgccaactgtgctac 1233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 156 - 256
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12682
Alignment:
Q  156 aatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagcta 255  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaatgttatgaatataaatctccgccaactgtgcta 12681  T
Q  256 c 256  Q
    |    
T  12682 c 12682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 408
Target Start/End: Original strand, 25498 - 25831
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  25498 tccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 25597  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | | ||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |  | ||| || ||||  |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  25598 gatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaatctctttaatataaatctttgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 25697  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || | |||||| || |  |||| ||| |   ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  25698 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgtgtcattccctccatgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 25797  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatccaacg 408  Q
    || |||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  25798 atactatcccatttccattctggcacatctaacg 25831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 251
Target Start/End: Original strand, 622 - 798
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||  ||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| |    
T  622 tccgtctgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcg 721  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactga 251  Q
    | ||||||||   ||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  722 gatctctatccaccacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaatattgtgaatataaatctccgccaactga 798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 91 - 403
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3226
Alignment:
Q  91 tctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacac 190  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  191 tatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgcc 290  Q
     || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  ||  || || | |||||||||| ||  || || |||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaacaagaaaattaatattaatcggaagaaaatgagcc 3113  T
Q  291 gacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcc 390  Q
    || |||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  3114 gaattcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgtgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttcc 3213  T
Q  391 actccggtacatc 403  Q
    |||| || |||||    
T  3214 actctggcacatc 3226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 7890 - 8206
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||| ||||||||| || || |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  7890 tccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 7989  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    |  |||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  7990 gacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 8089  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || ||||| |||||||| || || || | |||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8090 cggtagaaaatgagccgatttcgtcaatctatcaacaataacccaaattgcgtcgttccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccattgat 8189  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  8190 atactatcccatttcca 8206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 22391 - 22707
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  22391 tccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 22490  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| | ||| ||||| ||| ||||||| | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  22491 gatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaacctcacaatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 22590  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || |  || ||||||||||| || || || |  ||||| || |  || | ||| || |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  22591 cggtagaaaataagcagacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcgtcgtcccctctaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 22690  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  22691 atactatcccatttcca 22707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 151 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 8793 - 8541
Alignment:
Q  151 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 250  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| | || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||  |||||||    
T  8793 tccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctaccaactg 8694  T
Q  251 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 350  Q
    ||  || ||| ||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||| || || || |  ||| | ||||  |||| |||  | |||||||| ||     
T  8693 agaaacaggaaaactgatattaatcggaataaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcaccaaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggc 8594  T
Q  351 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8593 aaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggtacatc 8541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 79 - 391
Target Start/End: Original strand, 65933 - 66245
Alignment:
Q  79 actgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtc 178  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  65933 actgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 66032  T
Q  179 tctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaa 278  Q
     |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||| |||| || | ||  || || ||||| |||||||| || || ||| ||||  |||||||||      
T  66033 cctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttgatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactattattaatcggt 66132  T
Q  279 atgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgc 378  Q
    |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || | |||   |||  | |||||||| || || || |||||||||||||| || || |    
T  66133 agaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattacccaaattgcatcgctccctttaggagtattcggcaagctcgtcacaaaatccatggatatac 66232  T
Q  379 tatcccatttcca 391  Q
    |||||||||||||    
T  66233 tatcccatttcca 66245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 39601 - 39274
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||| | || || ||||||||  | ||||| |||||| || ||||||| |||||||| ||||    
T  39601 tccgactgac-atctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttcgaaaatctagaagtaaatcttg 39503  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||  |||| | || ||| || |||||  | ||||| || |  ||| |||||||||||||    
T  39502 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaactttgcaatctccttaatataaatctctactaactgggcaataggaaaactgatattaat 39403  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| ||| || ||||||||  | ||||| |||||||||||||| ||     
T  39402 tggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaattgcgtcattccctctaggagtattcagcaaactcgtcacaaaatccatggat 39303  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  39302 atactatcccatttccactctggcacatc 39274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 75 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 68373 - 68199
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||||||||  | || || |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||    ||||| |||||  ||||||| |||||||| |||||      
T  68373 tccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctcaactttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctca 68274  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 249  Q
    | |||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  68273 gatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaatattatgaatgtaaatctctgccaact 68199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 402
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4722
Alignment:
Q  105 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 204  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  205 ccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacct 304  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  4525 caccatgtaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatct 4624  T
Q  305 gtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacat 402  Q
     |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  4625 ataaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacat 4722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 402
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11852
Alignment:
Q  105 gccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaa 204  Q
    |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||| | |||||||||||  | ||||||||||| || || ||||| ||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  205 ccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacct 304  Q
    | ||||| |||||||||||||   ||||||| || ||||| ||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| ||    
T  11655 caccatgtaacttcacaatatctcgaatgtaaatttccgctaactgagatacaagaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatct 11754  T
Q  305 gtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacat 402  Q
     |  || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||    
T  11755 ataaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctattctatttccactctggtacat 11852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 938 - 1254
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  938 tccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 1037  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||   ||  || || ||||| |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  1038 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatccccttgatataaatctctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 1137  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
     |  |  || || || |||||||||||||| || || |  ||||| || |  ||   ||  ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  1138 aggtagaaaatgagctgacttcgtcaacctatcaacaatcacccaaattgtgtcgctccatctcggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatcgat 1237  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  1238 atactatcccatttcca 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 403
Target Start/End: Original strand, 1197 - 1528
Alignment:
Q  72 ctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaacc 171  Q
    ||||| ||||||||||  ||||| |||||||| ||| |||||||| |||| || ||||| ||  | || || |||||| |||||||||| |||||||| |    
T  1197 ctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 1296  T
Q  172 ttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatatt 271  Q
    || | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |   |||| || ||||| ||||||||||  || | | |||||||| |    
T  1297 ttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttgacgaatatatatctctgccaactgagacacagaaaaactgatact 1396  T
Q  272 aatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccata 371  Q
    ||||| ||  || || |||||||| ||||| || || || |  ||||| |||| ||||| |||  | |||||||| || ||| | ||||||||||||||     
T  1397 aatcggaagaaaatgagccgactttgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcatcattccctttaggagtattcggcaaagtcgtcacaaaatccatg 1496  T
Q  372 gaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  1497 gatatactatcccatttccactctggcacatc 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 71 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 116691 - 116368
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  116691 tcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 116592  T
Q  171 cttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatat 270  Q
    || || ||||||||||| || || ||||||| ||| ||||| | |||||||||||   | ||||| |||||||||||||| | ||  ||  || || | |    
T  116591 ctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaatatcgcggatgtaaatctccgccaactgggatagaggtaaattgttgt 116492  T
Q  271 taatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccat 370  Q
    ||||   |||||| || | |||||||||||| || || || |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  116491 taatatgaatgaaatgagtcgacttcgtcaatctctccacaatcacccaaatagcgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat 116392  T
Q  371 agaaatgctatcccatttccactc 394  Q
     || || |||||||||||||||||    
T  116391 ggatatactatcccatttccactc 116368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 197260 - 196941
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  197260 tccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 197161  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||| |||||||||||| | || ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  197160 gatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctccttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 197061  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || || ||||||||||| || || || |  | ||| ||||  |||| ||| || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| ||     
T  197060 cggtagaaaatgtgctgacttcgtcaatctatcaacaatcatccaaatcgcgtcattccctctaggagtattcggctaactcgtcacaaaatccatggat 196961  T
Q  375 atgctatcccatttccactc 394  Q
    ||  ||||||||||| ||||    
T  196960 atattatcccatttcgactc 196941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 403
Target Start/End: Original strand, 6538 - 6866
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||| ||||||| |||| |||| || ||||||||  | ||||| |||||  |||||| ||| |||||||| ||||    
T  6538 tccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaattctagaagtaaatcttg 6637  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||  || || || |||||||| || || ||  |||| ||||||||    
T  6638 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctaaaaataaatatctgccaactgggcaacagggaaactaatattaat 6737  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | |||||| | |  ||||| |||||||||||||| ||     
T  6738 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctataggagtaatcgacaaactcgtcacaaaatccatggat 6837  T
Q  375 atgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    || ||||||||||||||||| || |||||    
T  6838 atactatcccatttccactctggcacatc 6866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Original strand, 8314 - 8630
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||  | ||||| |||||| ||||||| || |||||||| ||||    
T  8314 tccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaaactagaagtaaatcttg 8413  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| ||| |||||||   ||  || || ||||| |||||||| || |  ||| |||| ||||||||    
T  8414 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaacctcacaatcaccttgatataaatctctgccaactgggcaataggaaaactaatattaat 8513  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    ||  |  || || |||||||||||||| || || || |   |||| || | ||| | ||| ||| ||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  8514 cggtagaaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacgattgcccaaattgcatcgttccctctctgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 8613  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||||||||||||    
T  8614 atactatcccatttcca 8630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 64; Significance: 7e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 75 - 394
Target Start/End: Original strand, 5745 - 6064
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||| || ||| |||| | ||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  5745 tccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttg 5844  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || ||||  ||||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  5845 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatattacgaatataaatctatgccaacttagaaacaggaaaactgatattaat 5944  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    || ||  || ||  ||||||||||||| ||  | |  |  ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |      
T  5945 cggaagaaaatgaaccgacttcgtcaatctacccataatcacccaaattgcgtcattccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatgggt 6044  T
Q  375 atgctatcccatttccactc 394  Q
    || |||||||||||||||||    
T  6045 atactatcccatttccactc 6064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2094 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold2094
Description:

Target: scaffold2094; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 285 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 633 - 508
Alignment:
Q  285 tgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatccc 384  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||  || |  |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  633 tgcgctgacttcgtcaacctatcgacaacaaccctaatggtgtcatgccctctcggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggaaatgctatccc 534  T
Q  385 atttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    | |||||||| |||||||| ||||||    
T  533 acttccactcaggtacatctaacggt 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 75 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 80276 - 80075
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||  | ||||  |||||  ||||||||||| ||||||| ||||    
T  80276 tccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttg 80177  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||| | ||||| ||||||||||||||||| |  | ||| || ||||| |||||||| || || ||| |||| ||||||||    
T  80176 gatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaatctctttaatataaatctctgccaactgggcaacaggaaaactaatattaat 80077  T
Q  275 cg 276  Q
    ||    
T  80076 cg 80075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 71 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 126985 - 126953
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgata 103  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126985 tctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 126953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 215 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 7533 - 7345
Alignment:
Q  215 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 314  Q
    |||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||| |||||| || | ||||||||||||||| || || |      
T  7533 cttcacaatatcgcgaatgtaaatctccgccaactgagacacgggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagtcgacttcgtcaacctatcaacaatc 7434  T
Q  315 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||| || |  |||| |||  | |||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  7433 acccaaatagcgtcattccctttgggagtattcggcaaacttgtcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 7345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 71 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 12763 - 12647
Alignment:
Q  71 tctttccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaac 170  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||    
T  12763 tctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaac 12664  T
Q  171 cttgggtctctatctga 187  Q
    ||  | |||||||||||    
T  12663 ctcagatctctatctga 12647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 75 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 991 - 844
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||| || || |||||  ||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |    
T  991 tccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcg 892  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaa 222  Q
    | || ||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | ||||||||    
T  891 gatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 75 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 8110 - 7797
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||   |||  |||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| || ||| |||||||||| |||||||| ||||    
T  8110 tccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaa-cttttccaaaatctagaagtaaatcttg 8012  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| |||||||||   || ||| |||| ||||||||    
T  8011 gatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaactga--aacaggaaaactaatattaat 7914  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaa 374  Q
    |  ||  || || | |||||||||||| || || || |  ||||| ||||  || | |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| ||     
T  7913 cagaagaaaatgagtcgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtctttccctttaggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggat 7814  T
Q  375 atgctatcccatttcca 391  Q
    || ||||| ||||||||    
T  7813 atactatctcatttcca 7797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 348 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 7654 - 7592
Alignment:
Q  348 ggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7654 ggtaaactcgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccagtacatccaacggt 7592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 301
Target Start/End: Original strand, 9867 - 10093
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||| || ||||||||  |||| || ||||  ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||||    
T  9867 tccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttg 9966  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaat 274  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||   |||| || |||||  |||||| ||  || ||| |||||||||||||    
T  9967 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatatcacgaatataaatctctcccaactcagaaacaggaaaactgatattaat 10066  T
Q  275 cgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaa 301  Q
    || ||  || || | ||||||||||||    
T  10067 cggaagaaaatgagtcgacttcgtcaa 10093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 78 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5077 - 4953
Alignment:
Q  78 gactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggt 177  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||||| || |    
T  5077 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggat 4978  T
Q  178 ctctatctgacactatactcgacgg 202  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||    
T  4977 ctctatccgacacaatactcgacgg 4953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 403
Target Start/End: Original strand, 24098 - 24350
Alignment:
Q  151 tccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactg 250  Q
    |||||||||| ||||| || ||||| |||||||| ||  | || ||||| ||||| ||||||||||||||||| | || ||| || |||| |||||||||    
T  24098 tccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttaatataaatcttcgccaactg 24197  T
Q  251 agctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggt 350  Q
     || || ||| |||||||||||||||  | ||| || |||||||||||||| || || || |  ||||| ||||  |||| |||  | | |||||| |      
T  24198 ggcaacaggaaaactgatattaatcggtaggaaatgagccgacttcgtcaatctatcaacaatcacccaaatcgcgtcattccctatagaagtattcgac 24297  T
Q  351 aaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  24298 aaactcatcacaaaatccatggatatactatcccatttccactctggcacatc 24350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 84 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 5364 - 5055
Alignment:
Q  84 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctat 183  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||  || ||||||||| | || || ||||   |||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  5364 ccatcggtctgcggatgatacgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 5265  T
Q  184 ctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaa 283  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||| |    ||| || |||||||||| ||||| |||  || |||| || ||||||  ||| ||    
T  5264 ctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaatctcacaaatataaatctccgccacctgagatacaagaaaactaatgttaatcagaataaa 5165  T
Q  284 gtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcc 383  Q
     || ||||| |||||||  || || |  |  ||||| |||| |||||| || ||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||    
T  5164 atgagccgaattcgtcagtctatccataattacccaaatcgcatcatgtcctctttgagtattcggcaaactcgtcacaaaatccat-gatatactatcc 5066  T
Q  384 catttccactc 394  Q
    || ||||||||    
T  5065 cacttccactc 5055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 77 - 403
Target Start/End: Original strand, 1791 - 2117
Alignment:
Q  77 cgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttggg 176  Q
    |||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||     
T  1791 cgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttacaaaatctagaagtaaatcttgga 1890  T
Q  177 tctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcg 276  Q
    ||| ||||||| || ||  | || ||||| |||||||||||||||||||   |||| || ||||| ||||| ||||  |  ||| |||| |||||||||     
T  1891 tctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaatatctcgaatataaatctctgccaattgagaaataggaaaactaatattaatct 1990  T
Q  277 aaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaat 376  Q
     ||  || || ||||||| ||||||  || | || |  ||||| ||||  |||| |||  |  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||    
T  1991 gaagaaaatgagccgactacgtcaatatgccaacaatcacccaaatcgcgtcattccctttaagagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatat 2090  T
Q  377 gctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
     ||||||||||||||||| || |||||    
T  2091 actatcccatttccactctggcacatc 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 75 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10522 - 10428
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaa 169  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||| || ||||||| || |||||    
T  10522 tccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttcgaaaatctagatgtaaa 10428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 231 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10434 - 10274
Alignment:
Q  231 atgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccacaacccatatcgaatcat 330  Q
    ||||| ||||| ||||| || || || ||| |||| ||||||||   ||| ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||| | | |||||    
T  10434 atgtaaatctctgccaattgtgccaccggaaaactaatattaattagaataaagtgtgctgacttcgtcaatctatcaaccaccacccatgtggcatcat 10335  T
Q  331 gccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttcca 391  Q
    |||| ||||  ||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  10334 gccctctcgaggtatttggtaaacttgttacaaagtccatggatatgctatcccatttcca 10274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 44; Significance: 6e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 214
Target Start/End: Original strand, 1523 - 1662
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttg 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||||| ||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||| ||      
T  1523 tccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaaactaa 1622  T
Q  175 ggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaa 214  Q
    | ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||    
T  1623 gatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaa 1662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 339 - 403
Target Start/End: Original strand, 1681 - 1745
Alignment:
Q  339 ggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| || |||||    
T  1681 ggagtatttggcaaactcgtcacaaaatccatggatatactatcccacttccactctggcacatc 1745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 360 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 20938 - 20888
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20938 acaaaatccatagaaatgctgtcccatttccactccggcacatccaacggt 20888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 27763 - 27729
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27763 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 27729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 403
Target Start/End: Original strand, 17467 - 17533
Alignment:
Q  337 tcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||||| || || ||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  17467 tcggagtgttcggcaaactcgtcacaaaatccatggatatgctatcccatttccactctggaacatc 17533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 360 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 921 - 880
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtaca 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  921 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactctggtaca 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 154 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 86213 - 86156
Alignment:
Q  154 aaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatg 211  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  86213 aaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatg 86156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 11839 - 11651
Alignment:
Q  215 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 314  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  11839 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 11740  T
Q  315 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  11739 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatc 11651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 403
Target Start/End: Complemental strand, 18031 - 17843
Alignment:
Q  215 cttcacaatattctgaatgtagatctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctaccaca 314  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||||||| |||||| ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||  | |  || |      
T  18031 cttcacaatatcgcggatgtaaatctccgcccactgagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgagttcgtcaatatatgaacaatc 17932  T
Q  315 acccatatcgaatcatgccccctcggagtattaggtaaacttgtcacaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatc 403  Q
    ||||  || |  |||| |||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || |||||    
T  17931 accccaatagtgtcattcccttttggagtattcggcaaactcgtcacaaaatccatggatattctatcccatttccactctggcacatc 17843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 239 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17595 - 17524
Alignment:
Q  239 ctccgccaactgagctactggataactgatattaatcgaaatgaagtgcgccgacttcgtcaacctgtctac 310  Q
    ||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||| || |||||    
T  17595 ctccgccaactaagatataggaaaactgatattaatcggaatgaaatgagccgacttcgtcaatctatctac 17524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 162 - 249
Target Start/End: Original strand, 71830 - 71917
Alignment:
Q  162 gaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 249  Q
    |||||||||||| | || | ||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||| ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  71830 gaagtaaaccttagatcccgatccgacacaatactagacggaataccatgcaacctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 71917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33021
Alignment:
Q  96 ggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatac 195  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| || |  |||||  || |||| ||||||  ||||||  | ||||||||||| || || | ||||||||| ||||    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  196 tcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 249  Q
    | || ||||  ||||||||  ||||||| | || |||||||||||| |||||||    
T  33074 tagaaggaataccatgcaatctcacaatctgctcaatgtagatctcagccaact 33021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 3372 - 3338
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3372 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 3338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Original strand, 3967 - 4001
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3967 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 4001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Original strand, 24203 - 24237
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24203 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 24237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 3441 - 3391
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactccggtacatccaacggt 410  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||    
T  3441 acaaagtccatagaaatgctatcccacttccactccggcacaaacaacggt 3391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 394
Target Start/End: Original strand, 44347 - 44381
Alignment:
Q  360 acaaaatccatagaaatgctatcccatttccactc 394  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44347 acaaaatccatagaaatgctatcccacttccactc 44381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 84 - 249
Target Start/End: Original strand, 182 - 347
Alignment:
Q  84 ccatccgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaattttgaacccaacacatcttgtaaacttctccaaaatctt-gaagtaaaccttgggtctcta 182  Q
    ||||| |||||  |||||||||| ||||||||| |||| || |  |||||   | |||| |||||| ||||||| ||| ||| ||||||| || || | |    
T  182 ccatcggtctggcgatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagtagcttgcaaactt-tccaaaaacttagaactaaacctcggatcccga 280  T
Q  183 tctgacactatactcgacggaaccccatgcaacttcacaatattctgaatgtagatctccgccaact 249  Q
    |||||||| | ||| || ||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  281 tctgacacaagactagaaggaataccatgcaacctcacaatatgctcaatgtagatctcagccaact 347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1701 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1701
Description:

Target: scaffold1701; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 36 - 68
Target Start/End: Original strand, 28 - 60
Alignment:
Q  36 ttgatagccgtacacaccatatgggcttccagc 68  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28 ttgatagccgtacacaccgtatgggcttccagc 60  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 115
Target Start/End: Original strand, 195 - 235
Alignment:
Q  75 tccgactgaccatccgtctgcggatgataagccgaactcaa 115  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  195 tccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaa 235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 378 - 406
Target Start/End: Original strand, 34015 - 34043
Alignment:
Q  378 ctatcccatttccactccggtacatccaa 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34015 ctatcccatttccactccggtacatccaa 34043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University