View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11741_low_11 (Length: 269)

Name: NF11741_low_11
Description: NF11741
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11741_low_11
NF11741_low_11
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (3-269)||(50769-51035)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (3-269)||(14788695-14788961)
chr4 (3-269)||(22801999-22802265)
chr4 (3-269)||(36920760-36921026)
chr4 (1-269)||(47563558-47563826)
chr4 (3-269)||(16454108-16454374)
chr4 (150-269)||(22781663-22781782)
chr4 (150-269)||(22133543-22133662)
chr4 (150-269)||(5099771-5099890)
chr4 (150-269)||(16933074-16933193)
chr4 (150-269)||(9175399-9175518)
chr4 (150-269)||(11007494-11007613)
chr4 (116-269)||(36379144-36379297)
chr4 (150-269)||(22045640-22045760)
chr4 (1-157)||(22046089-22046245)
chr4 (1-157)||(22133991-22134147)
chr4 (150-269)||(12399744-12399863)
chr4 (3-252)||(18536784-18537032)
chr4 (150-269)||(12402019-12402138)
chr4 (1-155)||(22782113-22782267)
chr4 (1-157)||(11007942-11008098)
chr4 (1-157)||(12402470-12402626)
chr4 (1-157)||(16933522-16933678)
chr4 (1-155)||(9175848-9176002)
chr4 (8-155)||(5872503-5872650)
chr4 (4-269)||(10113664-10113914)
chr4 (3-62)||(36379089-36379148)
chr4 (4-155)||(52094695-52094846)
chr4 (1-134)||(12395257-12395389)
chr4 (1-134)||(12400219-12400351)
chr4 (4-155)||(12743261-12743412)
chr4 (4-155)||(5136776-5136927)
chr4 (179-269)||(12740609-12740699)
chr4 (179-269)||(12748815-12748905)
chr4 (150-269)||(34571475-34571591)
chr4 (4-155)||(7123392-7123543)
chr4 (4-155)||(8394102-8394253)
chr4 (1-99)||(3578126-3578224)
chr4 (1-157)||(5206994-5207150)
chr4 (4-155)||(4588636-4588787)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (3-267)||(27911183-27911447)
chr5 (3-269)||(18510676-18510942)
chr5 (3-268)||(658769-659034)
chr5 (3-269)||(20043735-20043989)
chr5 (86-269)||(31467155-31467340)
chr5 (3-142)||(25806212-25806351)
chr5 (150-269)||(10750932-10751051)
chr5 (150-269)||(15355775-15355894)
chr5 (150-269)||(34478345-34478464)
chr5 (150-269)||(23666280-23666400)
chr5 (150-269)||(31543967-31544086)
chr5 (150-269)||(6746305-6746424)
chr5 (175-269)||(25806353-25806447)
chr5 (160-269)||(18467931-18468040)
chr5 (150-267)||(20505131-20505248)
chr5 (1-157)||(6745817-6745973)
chr5 (1-155)||(10750447-10750601)
chr5 (1-155)||(15356225-15356379)
chr5 (1-155)||(23665795-23665949)
chr5 (1-157)||(31543482-31543638)
chr5 (1-157)||(34478793-34478949)
chr5 (1-156)||(18467433-18467588)
chr5 (4-155)||(9788554-9788705)
chr5 (4-155)||(26171451-26171602)
chr5 (4-155)||(29721059-29721210)
chr5 (4-155)||(16408019-16408170)
chr5 (4-157)||(534443-534596)
chr5 (196-269)||(42427311-42427384)
chr5 (4-157)||(42427762-42427915)
chr5 (16-155)||(16545136-16545275)
chr5 (4-155)||(40380800-40380951)
chr5 (4-149)||(13694480-13694625)
chr5 (150-266)||(13487200-13487313)
chr5 (42-138)||(13294861-13294957)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (3-269)||(80617-80883)
[»] scaffold1674 (1 HSPs)
scaffold1674 (3-269)||(714-980)
[»] chr1 (36 HSPs)
chr1 (3-269)||(31736738-31737004)
chr1 (3-269)||(6996335-6996601)
chr1 (3-269)||(29003233-29003499)
chr1 (3-269)||(28997517-28997783)
chr1 (3-269)||(50078056-50078322)
chr1 (40-266)||(31424299-31424525)
chr1 (3-269)||(16429699-16429964)
chr1 (3-243)||(25250569-25250809)
chr1 (150-269)||(51751271-51751390)
chr1 (150-266)||(16227402-16227518)
chr1 (150-269)||(47178596-47178715)
chr1 (150-269)||(20301365-20301484)
chr1 (150-269)||(27338056-27338175)
chr1 (150-265)||(28841623-28841738)
chr1 (1-157)||(51750786-51750942)
chr1 (1-157)||(28841171-28841327)
chr1 (150-267)||(28202625-28202742)
chr1 (1-157)||(20300880-20301036)
chr1 (1-157)||(16226917-16227073)
chr1 (1-157)||(51758283-51758439)
chr1 (1-157)||(27338507-27338663)
chr1 (1-157)||(28203073-28203229)
chr1 (4-156)||(3805513-3805665)
chr1 (1-157)||(8348439-8348595)
chr1 (1-155)||(47178111-47178265)
chr1 (150-269)||(13126663-13126779)
chr1 (1-157)||(13127109-13127265)
chr1 (178-269)||(50168227-50168318)
chr1 (4-155)||(50168683-50168834)
chr1 (179-269)||(31658342-31658432)
chr1 (177-220)||(8348045-8348088)
chr1 (150-269)||(776248-776364)
chr1 (4-81)||(16456402-16456479)
chr1 (150-269)||(28222301-28222414)
chr1 (4-155)||(31657888-31658039)
chr1 (4-155)||(28222754-28222905)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (3-267)||(53916938-53917202)
chr3 (3-269)||(3315412-3315678)
chr3 (1-269)||(42991027-42991295)
chr3 (1-269)||(43422732-43422998)
chr3 (3-269)||(28101270-28101536)
chr3 (150-269)||(457120-457239)
chr3 (150-269)||(6064719-6064838)
chr3 (150-269)||(11169314-11169433)
chr3 (150-269)||(5898625-5898744)
chr3 (150-269)||(10957249-10957368)
chr3 (150-269)||(18098094-18098213)
chr3 (150-269)||(43227293-43227412)
chr3 (130-267)||(891171-891308)
chr3 (152-269)||(4309433-4309550)
chr3 (1-155)||(456635-456789)
chr3 (1-157)||(10957697-10957853)
chr3 (1-157)||(11168829-11168985)
chr3 (1-157)||(4309884-4310040)
chr3 (1-157)||(7769283-7769439)
chr3 (1-157)||(43226805-43226961)
chr3 (1-155)||(6065169-6065323)
chr3 (1-157)||(5192378-5192534)
chr3 (1-157)||(18098545-18098701)
chr3 (1-157)||(23634173-23634329)
chr3 (1-157)||(5898137-5898293)
chr3 (11-151)||(27421376-27421516)
chr3 (150-269)||(23634643-23634759)
chr3 (4-155)||(5259655-5259806)
chr3 (4-155)||(23199471-23199622)
chr3 (1-100)||(25634605-25634704)
chr3 (4-155)||(37407373-37407524)
chr3 (4-155)||(9635456-9635607)
chr3 (4-155)||(10209885-10210036)
chr3 (4-155)||(10056929-10057080)
chr3 (4-155)||(10061373-10061524)
chr3 (4-155)||(10063595-10063746)
chr3 (4-155)||(10065817-10065968)
chr3 (4-155)||(29811553-29811704)
chr3 (177-269)||(25634738-25634827)
chr3 (150-269)||(29812045-29812161)
chr3 (150-269)||(32892264-32892380)
chr3 (181-269)||(7763473-7763561)
chr3 (4-155)||(4600052-4600203)
chr3 (190-269)||(27421889-27421968)
chr3 (179-269)||(23199015-23199105)
chr3 (1-69)||(1619936-1620004)
chr3 (4-155)||(6717197-6717348)
chr3 (190-269)||(7769763-7769842)
chr3 (4-155)||(10059151-10059302)
chr3 (104-157)||(15822016-15822069)
chr3 (43-80)||(24933175-24933212)
chr3 (1-58)||(53597954-53598011)
chr3 (7-155)||(7762958-7763106)
chr3 (103-156)||(15830573-15830626)
chr3 (4-81)||(15830648-15830725)
[»] chr7 (39 HSPs)
chr7 (1-269)||(7471243-7471511)
chr7 (1-269)||(20298073-20298341)
chr7 (3-269)||(28486325-28486591)
chr7 (1-269)||(24749345-24749613)
chr7 (1-269)||(21678817-21679085)
chr7 (67-269)||(4293979-4294181)
chr7 (85-269)||(9679500-9679684)
chr7 (150-269)||(1048215-1048334)
chr7 (150-269)||(7350577-7350696)
chr7 (150-269)||(7093387-7093506)
chr7 (150-269)||(31157211-31157330)
chr7 (150-269)||(22136046-22136166)
chr7 (150-269)||(40551073-40551193)
chr7 (150-269)||(38395227-38395346)
chr7 (150-269)||(44725826-44725945)
chr7 (1-157)||(38394744-38394900)
chr7 (1-157)||(1048663-1048819)
chr7 (1-157)||(7093835-7093991)
chr7 (1-155)||(7351027-7351181)
chr7 (1-155)||(22135561-22135715)
chr7 (1-155)||(40550588-40550742)
chr7 (6-155)||(31159078-31159227)
chr7 (1-157)||(36208-36364)
chr7 (1-157)||(44725333-44725489)
chr7 (4-157)||(13289873-13290026)
chr7 (177-269)||(24816289-24816381)
chr7 (1-71)||(4295401-4295471)
chr7 (150-229)||(36693-36772)
chr7 (11-157)||(24816744-24816890)
chr7 (150-269)||(48490580-48490696)
chr7 (4-138)||(47675487-47675621)
chr7 (4-155)||(6593866-6594017)
chr7 (4-155)||(18391504-18391655)
chr7 (179-269)||(47675014-47675104)
chr7 (225-269)||(43557-43601)
chr7 (4-156)||(26213481-26213632)
chr7 (4-155)||(48490089-48490240)
chr7 (4-157)||(6047245-6047398)
chr7 (190-269)||(6047761-6047840)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (3-269)||(41383459-41383724)
chr8 (150-269)||(18811997-18812116)
chr8 (150-269)||(43080891-43081010)
chr8 (150-269)||(27828274-27828393)
chr8 (1-157)||(18811512-18811668)
chr8 (1-157)||(15069371-15069527)
chr8 (1-157)||(27827789-27827945)
chr8 (150-262)||(15069859-15069971)
chr8 (3-269)||(21481302-21481568)
chr8 (1-157)||(43080406-43080562)
chr8 (5-157)||(31577668-31577819)
chr8 (4-155)||(34255839-34255990)
chr8 (4-155)||(4732342-4732493)
chr8 (177-269)||(41365889-41365981)
chr8 (179-269)||(34255382-34255472)
chr8 (180-269)||(31577228-31577317)
chr8 (1-157)||(17848330-17848486)
chr8 (179-268)||(4732831-4732920)
chr8 (194-269)||(17848859-17848934)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (3-269)||(15533864-15534130)
chr6 (2-269)||(3631205-3631472)
chr6 (150-269)||(26067321-26067440)
chr6 (150-269)||(33310123-33310242)
chr6 (1-157)||(25462839-25462995)
chr6 (1-155)||(33309638-33309792)
chr6 (1-155)||(26931939-26932093)
chr6 (1-105)||(3395145-3395249)
chr6 (185-269)||(3395245-3395329)
chr6 (3-134)||(17012814-17012944)
chr6 (4-155)||(5408402-5408553)
chr6 (4-155)||(5412727-5412878)
chr6 (1-155)||(26067771-26067925)
chr6 (4-157)||(12158003-12158156)
chr6 (177-269)||(26944449-26944541)
chr6 (1-117)||(12936663-12936779)
chr6 (11-117)||(12910987-12911093)
chr6 (3-117)||(26944275-26944389)
chr6 (4-155)||(16553360-16553511)
chr6 (4-155)||(16629916-16630067)
chr6 (4-155)||(34165568-34165719)
chr6 (177-269)||(11137333-11137425)
chr6 (179-269)||(5407953-5408043)
chr6 (179-269)||(5412278-5412368)
chr6 (4-157)||(16651620-16651774)
chr6 (190-269)||(30444562-30444641)
chr6 (179-269)||(16568167-16568257)
chr6 (102-155)||(16567768-16567821)
[»] chr2 (17 HSPs)
chr2 (3-269)||(6263416-6263682)
chr2 (98-269)||(31734141-31734312)
chr2 (150-269)||(19503262-19503381)
chr2 (150-269)||(36560070-36560189)
chr2 (150-269)||(35216896-35217015)
chr2 (150-269)||(21519620-21519739)
chr2 (1-155)||(36560517-36560671)
chr2 (1-157)||(19503710-19503866)
chr2 (1-155)||(35217346-35217500)
chr2 (1-157)||(21520068-21520224)
chr2 (1-141)||(22405320-22405460)
chr2 (178-269)||(14634875-14634966)
chr2 (38-157)||(28569799-28569918)
chr2 (210-269)||(22402266-22402325)
chr2 (190-269)||(28569349-28569428)
chr2 (1-62)||(34574627-34574688)
chr2 (193-269)||(41304143-41304219)
[»] scaffold1899 (2 HSPs)
scaffold1899 (150-269)||(858-977)
scaffold1899 (1-157)||(373-529)
[»] scaffold0140 (2 HSPs)
scaffold0140 (150-269)||(23360-23480)
scaffold0140 (1-155)||(22875-23029)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (150-269)||(34792-34911)
scaffold0011 (1-157)||(34299-34455)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (1-157)||(72891-73047)
scaffold0025 (161-243)||(72466-72548)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (3-134)||(26288-26418)
[»] scaffold1908 (2 HSPs)
scaffold1908 (150-269)||(541-654)
scaffold1908 (102-155)||(148-201)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (179-269)||(115801-115891)
scaffold0016 (4-138)||(115287-115421)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (4-157)||(26747-26900)


Alignment Details
Target: scaffold0005 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 50769 - 51035
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50769 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 50868  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50869 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggatgaagaaggtg 50968  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50969 atgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 51035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14788961 - 14788695
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14788961 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 14788862  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14788861 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttcgaggatgaagaaggtg 14788762  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14788761 atgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 14788695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22802265 - 22801999
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   || ||||||||||||||    
T  22802265 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggtcgtcgtggagctacttgtg 22802166  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22802165 gagttcaacaaaatcattggtgattttgagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 22802066  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22802065 atgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 22801999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36921026 - 36920760
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36921026 tttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcttaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggagctacttgtg 36920927  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  36920926 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttagggatgcgggtgctctgatggtgtggtgatgtttggaggatgaagaatgtg 36920827  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36920826 atgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaa 36920760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 47563558 - 47563826
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  47563558 tctttgtatatgacaaagtcgttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaatttaaaggccatcatggagctacttg 47563657  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  47563658 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagagcattgaggtgtgtcttggggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaatg 47563757  T
Q  201 tgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  47563758 tgatgtgtctcaccttgggattgatacatagtagagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 47563826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 16454108 - 16454374
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||    
T  16454108 tttgtatacgacaaagactttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactaattcaagatggtaaagtcaaaggccaccatagagctaattgtg 16454207  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454208 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 16454307  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||    
T  16454308 atgtgtctcaccttgggagtgatgcctgttagagcggtggttgtctagagagacgttagacactcaa 16454374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22781782 - 22781663
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22781782 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 22781683  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22781682 gagagacgttaaacactcaa 22781663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22133662 - 22133543
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  22133662 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctg 22133563  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22133562 gagagacgttaaacactcaa 22133543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 5099771 - 5099890
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  5099771 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 5099870  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  5099871 gagagacattaaacactcaa 5099890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16933193 - 16933074
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16933193 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 16933094  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16933093 gagagacgttaaacactcaa 16933074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9175518 - 9175399
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9175518 tgaggatgcgggttctctaatggtgtggtgttgcttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 9175419  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9175418 gagagacgttaaacactcaa 9175399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 11007613 - 11007494
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  11007613 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttgaaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 11007514  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11007513 gagagacgttaaacactcaa 11007494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 116 - 269
Target Start/End: Original strand, 36379144 - 36379297
Alignment:
Q  116 tcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcacct 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||||    
T  36379144 tcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttaaggatgtgggtggtctgacggtgtaatgttgtttggaggatgaagaagacgatttttctcacct 36379243  T
Q  216 tgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36379244 tgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 36379297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22045760 - 22045640
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtgg-tagtct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||    
T  22045760 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggttcgtct 22045661  T
Q  249 ggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||| |||||||||||||||    
T  22045660 ggagacacgttaaacactcaa 22045640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22046245 - 22046089
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  22046245 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 22046146  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  22046145 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 22046089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 22134147 - 22133991
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  22134147 tctttttatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 22134048  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  22134047 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 22133991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12399863 - 12399744
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  12399863 tgaggatgcaggtgcactgatggtgtggtgttttttgctggatgaagaaggtgatgcgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 12399764  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12399763 gagagacgttaaacactcaa 12399744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 3 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 18537032 - 18536784
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||| |||||||||| ||||| |    
T  18537032 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggaagagtcgaaggccatcatggagcaacttgcg 18536933  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagt---tgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaag 199  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| ||||| || ||||  |    |  | ||||||||||  ||| | || ||||   |||||||||||||||||||||||    
T  18536932 gagttcaacagaatc-ttgatgacttggaaaatattatctctgagggttttgaggatgcaagtgttttggtggt---gtgttgtttggaggatgaagaag 18536837  T
Q  200 gtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggag 252  Q
    ||||||| |||||||||| || || ||||| ||  |||| |||| ||||||||    
T  18536836 gtgatgtttctcaccttgtgagtgatgcctggtaaagcgttggtcgtctggag 18536784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12402138 - 12402019
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||     
T  12402138 tgaggatgcaggtgcactgatggtgtagtgttttttgctggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtcta 12402039  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  12402038 gagagacgttaaacactcaa 12402019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 22782267 - 22782113
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  22782267 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 22782168  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  22782167 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 22782113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 11008098 - 11007942
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| | | |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  11008098 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgaatctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 11007999  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||  ||||||||||    
T  11007998 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcgacttgaggatg 11007942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12402626 - 12402470
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||| ||||| |||||||||| ||||     
T  12402626 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcgaaggccatcatggagcaactta 12402527  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     ||||||||||||||||  || ||| |||||||| ||| || |||| ||| ||||||    
T  12402526 cggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaatattgaggtgcaacttaaggatg 12402470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16933678 - 16933522
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||     
T  16933678 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaactta 16933579  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  16933578 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 16933522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9176002 - 9175848
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| | |||||||||||| ||| |||||||||  ||||| | | |||||||| |||||||||| ||||     
T  9176002 tctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagactcaaaggccatcatggagcaactta 9175903  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  9175902 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 9175848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 155
Target Start/End: Original strand, 5872503 - 5872650
Alignment:
Q  8 atatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagtt 107  Q
    ||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||| | || ||||||| | |  |||||||    
T  5872503 atatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcattcaagatggtggagtcaaagaccatgatggagcaattaatggagtt 5872602  T
Q  108 caacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  5872603 caacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 5872650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 269
Target Start/End: Original strand, 10113664 - 10113914
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||  ||| | ||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||| |||||||||| |||    |    
T  10113664 ttgtatatgactaagtctttggctcacaggcaattcctaaatcaacaactctactcattcaagacggtggagtcaaaggccatcatggagcgactaacag 10113763  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtga 203  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||            ||||||||||  ||||| || |||    |||||||| |||| ||||||||||| |    
T  10113764 agttcaacaaaatccttgatgatttggaaaaca------------ttgaggatgcatgtgctttggtgg---cgtgttgttgggagaatgaagaaggtaa 10113848  T
Q  204 tgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||| ||  |||||| || || |||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10113849 tgtttccaaccttgtgaatgatgcctagtagagcggtgatcatctggagagacgttaaacactcaa 10113914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 62
Target Start/End: Original strand, 36379089 - 36379148
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcatt 62  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36379089 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatt 36379148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 52094846 - 52094695
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||| |  | ||||||| | |   ||    
T  52094846 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggattcaaagaccgtgatggagcaattgacgg 52094747  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  52094746 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 52094695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12395389 - 12395257
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  | || ||||| |||||||||| ||||     
T  12395389 tctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaactta 12395291  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 134  Q
     ||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  12395290 cggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaa 12395257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 12400351 - 12400219
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  | || ||||| |||||||||| ||||     
T  12400351 tctttgtat-tgaaaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggaatcgaaggccatcatggagcaactta 12400253  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 134  Q
     ||||||||||||||||  || ||| ||||||||    
T  12400252 cggagttcaacaaaatccgtgatgacttggagaa 12400219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 12743412 - 12743261
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || ||| | |||| ||| ||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | |   ||    
T  12743412 ttgtatatgaccaagtctttggcttataggcaattccttaagaaacaactatactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacgg 12743313  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  12743312 agttcaacaaaatctttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 12743261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 5136776 - 5136927
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  5136776 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 5136875  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  5136876 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 5136927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12740699 - 12740609
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||  || |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12740699 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaa 12740609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 12748905 - 12748815
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||  || |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  12748905 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaa 12748815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 34571591 - 34571475
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||| || ||||   | |||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||| ||||| || ||| |||| | ||||     
T  34571591 tgaggatgcgggtgctttggtggt---gagttgttgggaggatgatgaaggtggggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtcta 34571495  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34571494 gagagacgttaaacactcaa 34571475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 7123392 - 7123543
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| | | | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  7123392 ttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 7123491  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  7123492 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 7123543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 8394102 - 8394253
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| | | | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  8394102 ttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattcctcaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 8394201  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  8394202 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 8394253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 3578224 - 3578126
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctactt 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| | |||||||||| ||||    
T  3578224 tctttatatatgacaaagtctttggatcatcgccaacttttaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagacaaagtccatcatggagcaactt 3578126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 5207150 - 5206994
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | | | ||||||| |||||| | ||||||||  |||| || | || |||| |  | ||||||| |||      
T  5207150 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatagacaaatcctaaatcaacaaatctactcatttaagatagtgaggttaaagaccgtaatggagcaactaa 5207051  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |  ||||||||||||| ||  |||||| ||||||||| || |||||||| ||||||    
T  5207050 cgacgttcaacaaaatcctttatgatttagagaacattgaggtgcatcttaaggatg 5206994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 4588636 - 4588787
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| ||| | |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||  |||||||| || | |  |||| | |    |    
T  4588636 ttgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaattctactcattcaagatggtggagtcaaagactgtaacagagcaattaacag 4588735  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| |||||||||| |  || ||||||||||    
T  4588736 agttcaacaaaatcgttgatgattaggagaacattcaagtgaatcttgagga 4588787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Original strand, 27911183 - 27911447
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911183 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 27911282  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27911283 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 27911382  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactc 267  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27911383 acgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactc 27911447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18510942 - 18510676
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18510942 tttgtatatgacaaagtctttggcttatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 18510843  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  18510842 cagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggacgatgaataagatg 18510743  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  18510742 atgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctgaagagacgttaaacactcaa 18510676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 3 - 268
Target Start/End: Original strand, 658769 - 659034
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||     
T  658769 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggacctacttgta 658868  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  658869 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaatattgaggcgcgtcttggggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 658968  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactca 268  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  658969 atgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactca 659034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 20043735 - 20043989
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  20043735 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggcagagtcaaaggccatcatggagcaacttgtg 20043834  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||| | |||| ||| ||| ||||||||||||            |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20043835 gagttcaaaacaatccttgatgacttggagaacatt------------gaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 20043922  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20043923 atgtgtctcaccttgggagtgattcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 20043989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 86 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31467340 - 31467155
Alignment:
Q  86 tcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcat--cttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgt 183  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  31467340 tcatggagctacttgtggagctcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtgtcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgt 31467241  T
Q  184 ttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31467240 ttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactcaa 31467155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 3 - 142
Target Start/End: Original strand, 25806212 - 25806351
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806212 tttgtatattacaaagtctttggctcattggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 25806311  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25806312 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagt 25806351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 10750932 - 10751051
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10750932 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 10751031  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10751032 gagagacgttaaacactcaa 10751051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15355894 - 15355775
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  15355894 tgaggatgcgggtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 15355795  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  15355794 gagagacgttaaacactcaa 15355775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 34478464 - 34478345
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  34478464 tgaggatgctggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgatcgtctg 34478365  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  34478364 gagagacgttaaacactcaa 34478345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 23666280 - 23666400
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggt-ggtagtct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23666280 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 23666379  T
Q  249 ggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23666380 ggagagacgttaaacactcaa 23666400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 31543967 - 31544086
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||     
T  31543967 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 31544066  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
     |||||||||||||||||||    
T  31544067 tagagacgttaaacactcaa 31544086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 6746305 - 6746424
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | ||||     
T  6746305 tgaggatgcgggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttaggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctt 6746404  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6746405 gagagacgttaaacactcaa 6746424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 175 - 269
Target Start/End: Original strand, 25806353 - 25806447
Alignment:
Q  175 tggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25806353 tggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 25806447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 160 - 269
Target Start/End: Original strand, 18467931 - 18468040
Alignment:
Q  160 ggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgtt 259  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18467931 ggtgctatgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgtt 18468030  T
Q  260 aaacactcaa 269  Q
    ||| ||||||    
T  18468031 aaaaactcaa 18468040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 150 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20505248 - 20505131
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||| ||||     
T  20505248 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgaggttgatgcctagtggagtggtggtcgtcta 20505149  T
Q  250 gagagacgttaaacactc 267  Q
    ||||||||||||||||||    
T  20505148 gagagacgttaaacactc 20505131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 6745817 - 6745973
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||     
T  6745817 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactta 6745916  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  6745917 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 6745973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 10750447 - 10750601
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  10750447 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 10750546  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  10750547 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 10750601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15356379 - 15356225
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  15356379 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 15356280  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  15356279 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 15356225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 23665795 - 23665949
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  23665795 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 23665894  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  23665895 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 23665949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 31543482 - 31543638
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||     
T  31543482 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatggagcaactta 31543581  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  31543582 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 31543638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 34478949 - 34478793
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  34478949 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 34478850  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||| || |||| ||||||||||    
T  34478849 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggaaaatattgaggtgcaacttgaggatg 34478793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 18467433 - 18467588
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||| | |||||||||| | ||     
T  18467433 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaattta 18467532  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggat 156  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| |||| ||||    
T  18467533 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgtggat 18467588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9788705 - 9788554
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  9788705 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 9788606  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  9788605 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 9788554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 26171451 - 26171602
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  26171451 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 26171550  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  26171551 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattaaggtgcaaattgagga 26171602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 29721059 - 29721210
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  29721059 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 29721158  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  29721159 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 29721210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 16408019 - 16408170
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| |  | ||||||| | | | ||    
T  16408019 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtaaaagaccgtgatggagcaattggcgg 16408118  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16408119 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16408170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 534443 - 534596
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| |||||||||  | || ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | |   ||    
T  534443 ttgtatatgaccaagtctttggttgataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacgg 534542  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  534543 agttcaacaaaatacttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgaggatg 534596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 196 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 42427384 - 42427311
Alignment:
Q  196 gaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42427384 gaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtggttgtctggagagacgttaaacactcaa 42427311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 42427915 - 42427762
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||| |  | | ||| | | |    |    
T  42427915 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgacggaacaattaacag 42427816  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||||    
T  42427815 agttcaacaaaatccttgatgattttgagaacattgaggtgcaacttgaggatg 42427762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Original strand, 16545136 - 16545275
Alignment:
Q  16 aagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaa 115  Q
    ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | |||||||||||| |    
T  16545136 aagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcggagttcaacaaga 16545235  T
Q  116 tcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    || | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16545236 tcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16545275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 40380800 - 40380951
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| | | | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  40380800 ttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 40380899  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  | ||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  40380900 agttcaacaagatcctcgacggtttggagaacattgaggtgcaacttgagga 40380951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 13694625 - 13694480
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||  || | ||||| | |||||||| |||| |||  |||||||  ||||||| |  |||||||||| |||   ||    
T  13694625 ttgtatatgaccaaatctttggctcatatgcaattcctatatcaacaactctacttatttaagatggtggagtcaaatgtcatcatggagcaactaacgg 13694526  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatct 149  Q
    |||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||| || |||||||    
T  13694525 agttcaacaaaatccttgatgagttggaaaacattgaggtgcatct 13694480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 266
Target Start/End: Original strand, 13487200 - 13487313
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||||||| || |||||||   | |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||   ||| ||||| || ||| |||| | || |     
T  13487200 tgaggatgcgggtactttgatggt---gagttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttgcttttgatgccttgtagagtggtgttcgtata 13487296  T
Q  250 gagagacgttaaacact 266  Q
    |||||||||||||||||    
T  13487297 gagagacgttaaacact 13487313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 42 - 138
Target Start/End: Original strand, 13294861 - 13294957
Alignment:
Q  42 aaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatt 138  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||  |||||||||| ||||   |||||||  | || | ||| ||||||||||||||||    
T  13294861 aaagcaacaactctactcattcatgatggtggagtcaaagggcatcatggagcaacttactgagttcagtagaagccttgatgatttggagaacatt 13294957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 80617 - 80883
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80617 tttgtatatgacaaagtctttggctcaacggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 80716  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  80717 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgttctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 80816  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  80817 atgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 80883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1674 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold1674
Description:

Target: scaffold1674; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 980 - 714
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  980 tttgtatatgacaaagtctttggcttatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggtgctacttgtg 881  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  880 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 781  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  780 atgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaa 714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31737004 - 31736738
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31737004 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 31736905  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31736904 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 31736805  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  31736804 atgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtgaagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactcaa 31736738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 6996335 - 6996601
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  6996335 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaagaccatcatggagctacttgtg 6996434  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6996435 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 6996534  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6996535 atgtgtctcacatttggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 6996601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 29003499 - 29003233
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||    
T  29003499 tttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgcaactgcttatg 29003400  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29003399 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgagtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 29003300  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29003299 atgtgtcacaccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 29003233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28997783 - 28997517
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||    
T  28997783 tttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatgcaactgcttatg 28997684  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28997683 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgttgatgtttgtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 28997584  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||| |||||||| | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28997583 atgtgtcacaccttggcagtgatgcctagtggagcggcggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 28997517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 50078322 - 50078056
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||| |||||||||| ||||  |    
T  50078322 tttgtatatgacaaaatcttgggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagattatagagtcaaaggccatcatggagcaacttacg 50078223  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50078222 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttggagatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 50078123  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||| ||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  50078122 atgtgtctcaccttgggattgattcctattggagtggttgtcttctggagagacgttaaacactcaa 50078056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 40 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 31424525 - 31424299
Alignment:
Q  40 ctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatta 139  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31424525 ctaaagcaacatatttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggatctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattg 31424426  T
Q  140 agttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcgg 239  Q
    || ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  31424425 aggtgtgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtattgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcatcttgggagtgattcctagtggagcgg 31424326  T
Q  240 tggtagtctggagagacgttaaacact 266  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  31424325 tggtcgtctggagagacgttaaacact 31424299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 16429699 - 16429964
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  16429699 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcagaaattcctaaagtaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttgtg 16429798  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||  ||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16429799 gagttcaacaaaacccttgatgatttggagattattgaggtgcatcttgaggatgc-ggtgctctggtggtgtggtgttgtttggaggatgaaaaaggtg 16429897  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  16429898 atgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcttctggagagaagttaaacactcaa 16429964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 25250809 - 25250569
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||  |    
T  25250809 tttgtatatggcaaagtctttggctcttcggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttacg 25250710  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  25250709 gagttcaacaaaatcattgatgatttggacaacattaagctgcaccttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagggtgaagaatgtg 25250610  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggt 243  Q
    ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||    
T  25250609 atgtgtctcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggt 25250569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 51751271 - 51751390
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51751271 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 51751370  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  51751371 gagagacgttaaacactcaa 51751390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 266
Target Start/End: Original strand, 16227402 - 16227518
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16227402 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 16227501  T
Q  250 gagagacgttaaacact 266  Q
    |||||||||||||||||    
T  16227502 gagagacgttaaacact 16227518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 47178596 - 47178715
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47178596 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 47178695  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  47178696 gagagacgttaaacactcaa 47178715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 20301365 - 20301484
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  20301365 tgaggatgcgggtgctctgatgatgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 20301464  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  20301465 gagagacgttaaacactcaa 20301484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 27338175 - 27338056
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  27338175 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgattcctagtggagcggtggtcgtctg 27338076  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27338075 gagagacgttaaacactcaa 27338056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 150 - 265
Target Start/End: Original strand, 28841623 - 28841738
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||| |||| |||||    
T  28841623 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcgtagtggagcgatggtcgtctg 28841722  T
Q  250 gagagacgttaaacac 265  Q
    | ||||||||||||||    
T  28841723 gcgagacgttaaacac 28841738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 51750786 - 51750942
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  51750786 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 51750885  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  51750886 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 51750942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 28841171 - 28841327
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  28841171 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 28841270  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  28841271 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgaaacttgaggatg 28841327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 150 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 28202742 - 28202625
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||    
T  28202742 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaataagttgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgatcttctg 28202643  T
Q  250 gagagacgttaaacactc 267  Q
    ||||||||||||||||||    
T  28202642 gagagacgttaaacactc 28202625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 20300880 - 20301036
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  20300880 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgtcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 20300979  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| |||  || |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  20300980 cggagttcaacaaaatccttgaagacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 20301036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 16226917 - 16227073
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||     
T  16226917 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaactta 16227016  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  16227017 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 16227073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 51758283 - 51758439
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||  ||||     
T  51758283 tctttgtatacgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagtaactta 51758382  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  51758383 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 51758439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27338663 - 27338507
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||| | |||||||||| ||||     
T  27338663 tctttgtatatgacaaagtctttgactcattggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaactta 27338564  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| ||||| || ||| || |||| ||||||||||    
T  27338563 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggataatattgaggtgcaacttgaggatg 27338507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28203229 - 28203073
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||| || |||||||||| |||      
T  28203229 tctttgtataagacaaagtctttgactcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaagccatcatggagcaactga 28203130  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  28203129 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 28203073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3805665 - 3805513
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    |||| |||||| || |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| || |||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||  ||    
T  3805665 ttgtttatgaccaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactgtaatcattcaagatggcagagtcaaaggccatcatggagcaacttacgg 3805566  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggat 156  Q
    |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  3805565 agttcaacaaaattcttgatgacttggagaacattgaggtgcatcttgaggat 3805513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8348595 - 8348439
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||| ||| ||||     
T  8348595 tctttgtatatgacaaagtctttgggacatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatgtagcaactta 8348496  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| ||||| || | | || |||||||||||||||    
T  8348495 cggagttcaacaaaatctttgatgacttggaaaataatgaggtgcatcttgaggatg 8348439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 47178111 - 47178265
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||     
T  47178111 tctttgtatatgacaaagtcattggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaactta 47178210  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  47178211 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 47178265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 13126779 - 13126663
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||| || ||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||    
T  13126779 tgaggatgcgggtgctttggtggt---gtgttgttgggaggatgaagaaggcgatgtttctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctg 13126683  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||    
T  13126682 gagagatgataaacactcaa 13126663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13127265 - 13127109
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| | | || ||||| ||||||| ||||||||| | ||||   ||||||||   |||||| ||| ||||     
T  13127265 tctttgtatatgacaaattctttggctcatcgacaattcttaaagaaacaactatactcattcaatatggcggagtcaaagatcatcatgtagcaactta 13127166  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    ||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  13127165 tggagtttaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 13127109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 50168318 - 50168227
Alignment:
Q  178 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50168318 tgttgttgggaggataaagaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaa 50168227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 50168834 - 50168683
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| |||| |||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | |  |||    
T  50168834 ttgtatatgaccaagtttttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaatgg 50168735  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  50168734 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 50168683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 31658342 - 31658432
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  31658342 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcatctggagagacgttaaacactcaa 31658432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 177 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 8348088 - 8348045
Alignment:
Q  177 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttggga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8348088 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttggga 8348045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 776248 - 776364
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||| || ||||   | |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||  |||| ||||| || ||| |||| | ||||     
T  776248 tgaggatgcgggtgctttggtggt---gagttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttgatattgatgccttgtagagtggtgttcgtctt 776344  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  776345 gagagacattaaacactcaa 776364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Original strand, 16456402 - 16456479
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaag 81  Q
    ||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16456402 ttgtatatgaccaagactttggctcataggcaaatcctaaagcaacaactctactcattcaagatgatagagtcaaag 16456479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28222414 - 28222301
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||| ||||||| || ||||   |||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||| | || ||||| || ||| |||||| || ||    
T  28222414 tgaggatgtgggtgctttggtggt---gtgttgttgggaggatgaag---gtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagtggtggtcgtttg 28222321  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28222320 gagagacgttaaacactcaa 28222301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 31657888 - 31658039
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| || |||||| || || ||  | |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| |  | |  |||| | |   ||    
T  31657888 ttgtatatgaccaaatctttggcttataggaaattccttaagcaacaactttactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgacagagcaattaacgg 31657987  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  31657988 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgaagcttgagga 31658039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28222905 - 28222754
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||| |  | |  |||| | |    |    
T  28222905 ttgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctattcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgacagagcaattgacag 28222806  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  28222805 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgaaacttgagga 28222754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 3 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 53917202 - 53916938
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  53917202 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttaagatggtaaagtcaaagaccatcatggagctacttgtg 53917103  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  53917102 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcgtcttgaggatgcgagtgctctgatggtgtggtgttgtttgtaggatgaagaaggtg 53917003  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactc 267  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53917002 atgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactc 53916938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 3315412 - 3315678
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  3315412 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactttattcattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggagctacttgtg 3315511  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3315512 gagttcaacaaaatcattggtgatttagagaacattgaggtgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 3315611  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||| ||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3315612 atgtatctcaccttgggaatgatgcttagtggagaggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 3315678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 42991027 - 42991295
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  || ||||||| ||||    
T  42991027 tctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaatatggtaaagtcaaaggccttcttggagctgcttg 42991126  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42991127 tggagttcaacaaaatcattgctgatttggagaacattaagttgcgacttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagg 42991226  T
Q  201 tgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||| |||||||||| |  ||| ||||||||||||||||||||    
T  42991227 tgatgtgtctcaccttggaagtgatgcctaatggagcggtgatcatctagagagacgttaaacactcaa 42991295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 43422998 - 43422732
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43422998 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcccaaatcaacaactttactcattgga--ttgtaaagtcaaaggccatcatggagctacttg 43422901  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaagg 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43422900 tcgagttcaacaaaatcattggtgatttgaagaacattgaggtgcatcttgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagg 43422801  T
Q  201 tgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||| |||||||||||| || || ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  43422800 tgatctgtctcaccttgagagtgatgcctagtggaacggtggtcgtatggagagacgataaacactcaa 43422732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28101536 - 28101270
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  28101536 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagtaacaactctactcattcaagatggtaaagttaaaggccatcatggagctacttatg 28101437  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28101436 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgcgggttctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 28101337  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    || ||||||||||||  | || |||||||||||||||||||  ||| ||| || |||||||||||||    
T  28101336 atatgtctcaccttgaaaatgatgcctagtggagcggtggtcatctagagggaagttaaacactcaa 28101270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 457120 - 457239
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  457120 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 457219  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  457220 gagagacgttaaacactcaa 457239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6064838 - 6064719
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||    
T  6064838 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgttcgtctg 6064739  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6064738 gagagacgttaaacactcaa 6064719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 11169314 - 11169433
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11169314 tgaggatgcgggagctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatatgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 11169413  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  11169414 gagagacgttaaacactcaa 11169433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 5898625 - 5898744
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||    
T  5898625 tgaggatgcaagtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtagtcgtctg 5898724  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  5898725 gagagacgttaaacactcaa 5898744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10957368 - 10957249
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| | |||||    
T  10957368 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagtggtgatcgtctg 10957269  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  10957268 gagagacgttaaacactcaa 10957249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 18098213 - 18098094
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||     
T  18098213 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgtctagtggagcggtggtcgtcta 18098114  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18098113 gagagacgttaaacactcaa 18098094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 43227293 - 43227412
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  43227293 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctg 43227392  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  43227393 gagggacgttaaacactcaa 43227412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 891308 - 891171
Alignment:
Q  130 gagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcct 229  Q
    ||||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||    
T  891308 gagaacattgaggtgcgtcttgaggatgagggtgctctggtggtgtggtgttgtttggaagatgaagaaggtgatgtgtctcgcctttggagtgatgcct 891209  T
Q  230 agtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactc 267  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  891208 agtggagcggtggtcgtttggagagacgttaaacactc 891171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4309550 - 4309433
Alignment:
Q  152 aggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctgga 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||| ||||| |    
T  4309550 aggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcactttgggagtgatgcctagtggagtagtggtcgtctgaa 4309451  T
Q  252 gagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||    
T  4309450 gagacgttaaacactcaa 4309433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 456635 - 456789
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  456635 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 456734  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  456735 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 456789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 10957853 - 10957697
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  10957853 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 10957754  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     | |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  10957753 cgaagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 10957697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 11168829 - 11168985
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  11168829 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaactactctactcattctggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 11168928  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  11168929 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 11168985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 4310040 - 4309884
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||| | |||||||||| ||||     
T  4310040 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaactta 4309941  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  4309940 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 4309884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 7769283 - 7769439
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||     
T  7769283 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagaaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggctatcatggagcaactta 7769382  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     ||||||| | |||||| ||| |||  ||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  7769383 cggagttctaaaaaatccttgatgacgtggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 7769439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 43226805 - 43226961
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||||||| ||||     
T  43226805 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccatcatggagcaactta 43226904  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     | |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  43226905 cgaagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 43226961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6065323 - 6065169
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  6065323 tctttgtatacgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatcgtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 6065224  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  6065223 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 6065169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 5192378 - 5192534
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||     
T  5192378 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcattgagcaactta 5192477  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  5192478 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 5192534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18098701 - 18098545
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||     
T  18098701 tctttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattcctaaagcaacaactctacttattcaggatggttgagtcaaaggccatcatggagcaactta 18098602  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  18098601 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 18098545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 23634173 - 23634329
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| | ||     
T  23634173 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaatttctaaagcaacaactctagtcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaattta 23634272  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    | ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  23634273 tagagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 23634329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 5898137 - 5898293
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||  |||||||  |||| ||| | |||||||||| ||||     
T  5898137 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcttaaagcaacaactctactcatttaagatggtggagtcgaagaccatcatggagcaactta 5898236  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  5898237 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 5898293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 151
Target Start/End: Original strand, 27421376 - 27421516
Alignment:
Q  11 tgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaa 110  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||  |||||||||    
T  27421376 tgacaaaatctttggctcatcggcaattcctaaaacaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaa 27421475  T
Q  111 caaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttg 151  Q
    ||| ||| ||| ||| |||||||| ||| || |||||||||    
T  27421476 caagatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttg 27421516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 23634643 - 23634759
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||  |||||||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||||||| ||||     
T  23634643 tgaggatgcatgtgctctggtggt---gtgttttttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgtatggtagagcggtggtcgtcta 23634739  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  23634740 gagagacgttaaacactcaa 23634759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5259806 - 5259655
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | |  |    
T  5259806 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccttgatggagcaattggcag 5259707  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  5259706 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 5259655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 23199622 - 23199471
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||| | || ||||||| | | | ||    
T  23199622 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaatcattcaagatggtggagtcaaagaccatgatggagcaattggcgg 23199523  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||    
T  23199522 agttcaacaaaatccttgatgatttagagaacattgaggtgcaacttgagga 23199471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 25634605 - 25634704
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| || | ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| |||||    
T  25634605 tctttatatatgacaaagtctttgactcatcagcaattcctaaagccacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaacttg 25634704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 37407373 - 37407524
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||| |  | ||||||| | | | ||    
T  37407373 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaagaccgtgatggagcaattggcgg 37407472  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||    
T  37407473 agttcaacaaaatccttgatgatttggaaaacattgaggtgcaacttgagga 37407524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9635607 - 9635456
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||| | ||||||||| |||||||  | |||||| |  | ||||||| | | | |     
T  9635607 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaaatctactcattcaagatggtgcattcaaagaccgtgatggagcaattggcgt 9635508  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  9635507 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 9635456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 10209885 - 10210036
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  10209885 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 10209984  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| |||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  10209985 agttcaacaagatccttgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10210036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 10056929 - 10057080
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  10056929 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 10057028  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  10057029 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10057080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 10061373 - 10061524
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  10061373 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 10061472  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  10061473 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10061524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 10063595 - 10063746
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  10063595 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 10063694  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  10063695 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10063746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 10065817 - 10065968
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  10065817 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 10065916  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  10065917 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10065968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 29811553 - 29811704
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    |||||||| || | ||||||| |||||  || | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | |   ||    
T  29811553 ttgtatataaccaggtctttggctcataagcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacgg 29811652  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  29811653 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 29811704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 269
Target Start/End: Original strand, 25634738 - 25634827
Alignment:
Q  177 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||   |||||||| |||| |||||  |||||| ||||||    
T  25634738 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgcctagt---gcggtggtcgtctagagagttgttaaatactcaa 25634827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 29812045 - 29812161
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||| || ||||   | |||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||  || |||| | |||||    
T  29812045 tgaggatgcgggtgctttggtggt---gagttgttgggaggctgaggaaggtgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtacagtggtgttcgtctg 29812141  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  29812142 gagagacgttaaacactcaa 29812161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 32892264 - 32892380
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||| || |||| || |||||    || |||||||||||||| || ||||||||||| | || ||||| || |||||||| |  ||||    
T  32892264 tgaggatgcgggtgctttggtggtttgttgttga---gatgatgaagaaggtgaggtttctcaccttggtactgatgccttgtagagcggtgctcatctg 32892360  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  32892361 gagagacgttaaacactcaa 32892380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 181 - 269
Target Start/End: Original strand, 7763473 - 7763561
Alignment:
Q  181 tgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7763473 tgttgggaggatgatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaa 7763561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 4600203 - 4600052
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | || |||| | | | ||    
T  4600203 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatagagcaattggcgg 4600104  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  4600103 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 4600052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 269
Target Start/End: Original strand, 27421889 - 27421968
Alignment:
Q  190 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| || || ||||| || |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27421889 gatgaagaaggtgttgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggcggtcgtctggagagactttaaacactcaa 27421968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23199105 - 23199015
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  23199105 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaa 23199015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1620004 - 1619936
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatg 69  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  1620004 tctttgcatatgacaaagtctttggctcattggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatg 1619936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 6717197 - 6717348
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| | |   |||| |||| |||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | || |||| | | | ||    
T  6717197 ttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacatttccttaagcgacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatagagcaattggcgg 6717296  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  6717297 agttcaacaagatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 6717348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 269
Target Start/End: Original strand, 7769763 - 7769842
Alignment:
Q  190 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||| || ||||||||    ||||||||||||||||||| ||||    
T  7769763 gatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgccttgtagagcggtgtctatctggagagacgttaaacagtcaa 7769842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 10059151 - 10059302
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  | | |||| |  | ||||||| | | | ||    
T  10059151 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggatttaaagaccgtgatggagcaattggcgg 10059250  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  10059251 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 10059302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 15822069 - 15822016
Alignment:
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15822069 agttcaacaaaatccttaatgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatg 15822016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 43 - 80
Target Start/End: Original strand, 24933175 - 24933212
Alignment:
Q  43 aagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaa 80  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24933175 aagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaa 24933212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 53597954 - 53598011
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttact 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||| |||| ||||    
T  53597954 tctttgtatatgacaaagtctttacctcatcggcaatttctaaagcaagaactctact 53598011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 155
Target Start/End: Original strand, 7762958 - 7763106
Alignment:
Q  7 tatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagt 106  Q
    |||||||| ||||||||| |||||  || | || | ||||||||||| || |||||  |||||||  |||||||| |  | ||||||| | |   |||||    
T  7762958 tatatgaccaagtctttggctcataagcaattctttaagcaacaactctattcatttaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacggagt 7763057  T
Q  107 tcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || |||| ||||||||    
T  7763058 tcaacaaaatccttgatgattttgagaacattgaggtgcaacttgagga 7763106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 103 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 15830626 - 15830573
Alignment:
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggat 156  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||  |||||||||||||    
T  15830626 gagttcaacaaaatccttgatgatttagagaacattgaggcgcatcttgaggat 15830573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15830725 - 15830648
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaag 81  Q
    ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||  |||||||  ||||||||    
T  15830725 ttgtatatgactaagtctatggttcataggcaattcctaaagcaagaactttactcatttaagatggtggagtcaaag 15830648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 39)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7471511 - 7471243
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7471511 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtaaaaggctatcatggagctacttg 7471412  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7471411 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagg 7471312  T
Q  201 tgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7471311 tgatgtgtctcaccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaa 7471243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 20298073 - 20298341
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  20298073 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccttcatggagctgcttg 20298172  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaagg 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20298173 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgtgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagg 20298272  T
Q  201 tgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20298273 tgatatgtctcaccttgggagtgatgcctagtggaacggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 20298341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 28486325 - 28486591
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28486325 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggaaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 28486424  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28486425 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttggggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggagaatgaagaaggtg 28486524  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28486525 atgtgtctcaccttgagattgatgccttgtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 28486591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 24749345 - 24749613
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24749345 tctttgtatatgacaaagtctttggctgatcggcaattcctaaagcaataactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagctacttg 24749444  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24749445 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaagatgaagaagg 24749544  T
Q  201 tgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  24749545 tgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggttgtcatctggagagacattaaacactcaa 24749613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 21678817 - 21679085
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||||||| | |||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  21678817 tctttgtattttacaaagtctttggctcatcggcagttcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtaaaataaaaggcaatcatggagctacttg 21678916  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaagg 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  21678917 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgcgggtactctgatggcgtagtgttgtttggaggatgaagaagg 21679016  T
Q  201 tgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  21679017 tgatgtgtctcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcatctggagagacgctaaacactcaa 21679085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 67 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 4294181 - 4293979
Alignment:
Q  67 atggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctc 166  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  4294181 atggtaaagtcaaaggccttcatggagctacttatggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttggggatgcgggtgctc 4294082  T
Q  167 tgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacact 266  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  4294081 tgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaacttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacattaaacact 4293982  T
Q  267 caa 269  Q
    |||    
T  4293981 caa 4293979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 269
Target Start/End: Original strand, 9679500 - 9679684
Alignment:
Q  85 atcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtt 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||    
T  9679500 atcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgagtgttcttatggtgtggtgttgtt 9679599  T
Q  185 tggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9679600 tggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttaggagtgatacctagtggagcggtggttgtctggagagacgttaaaaactcaa 9679684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1048334 - 1048215
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  1048334 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 1048235  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  1048234 gagagacgttaaacactcaa 1048215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7350696 - 7350577
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7350696 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 7350597  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7350596 gagagacgttaaacactcaa 7350577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 7093506 - 7093387
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  7093506 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 7093407  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  7093406 gagagacgttaaacactcaa 7093387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31157330 - 31157211
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  31157330 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 31157231  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  31157230 gagagatgttaaacactcaa 31157211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 22136046 - 22136166
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggt-ggtagtct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  22136046 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 22136145  T
Q  249 ggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22136146 ggagagacgttaaacactcaa 22136166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 40551073 - 40551193
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggt-ggtagtct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  40551073 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 40551172  T
Q  249 ggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  40551173 ggagagacgttaaacactcaa 40551193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 38395227 - 38395346
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||     
T  38395227 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtcta 38395326  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| |||||||||||||    
T  38395327 gagagaagttaaacactcaa 38395346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 44725826 - 44725945
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||||    
T  44725826 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggacgaagatggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtggagcggtgttcgtctg 44725925  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  44725926 gagagacgttaaacactcaa 44725945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 38394744 - 38394900
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  38394744 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 38394843  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  38394844 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 38394900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 1048819 - 1048663
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  1048819 tctttgtatatgacaaagtctttggcgcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 1048720  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  1048719 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 1048663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 7093991 - 7093835
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  7093991 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcgacaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 7093892  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  7093891 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 7093835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 7351181 - 7351027
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||| ||||     
T  7351181 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtagagtcaaaggtcatcatggagcaactta 7351082  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  7351081 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 7351027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 22135561 - 22135715
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  22135561 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 22135660  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  22135661 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 22135715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 40550588 - 40550742
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  40550588 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 40550687  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  40550688 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 40550742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 6 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31159227 - 31159078
Alignment:
Q  6 gtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggag 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||  ||||    
T  31159227 gtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttacggag 31159128  T
Q  106 ttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  31159127 ttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 31159078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 36208 - 36364
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||     
T  36208 tctttgtatatgacaaagtctttagctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactta 36307  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || | || ||||||||||    
T  36308 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtacaacttgaggatg 36364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 44725333 - 44725489
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| ||||||| |||| ||||  ||||||  |||||||||| ||||| |||| ||||     
T  44725333 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagtaacaactctacttattcaggatggtggagtcaaaggccatcatagagcaactta 44725432  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  44725433 tggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 44725489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 13290026 - 13289873
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||| |||| |||    
T  13290026 ttgtatatgacaaagtctttggctcatcggtaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttatgg 13289927  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    ||||||||||| || ||| ||| |||||||| ||  || |||||||||| ||||    
T  13289926 agttcaacaaattccttgatgacttggagaatatggaggtgcatcttgacgatg 13289873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 177 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 24816381 - 24816289
Alignment:
Q  177 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24816381 gtgttgtttggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggagtgatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 24816289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 4295471 - 4295401
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4295471 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggt 4295401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 150 - 229
Target Start/End: Original strand, 36693 - 36772
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcct 229  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  36693 tgaggatgtaggtgctctaatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcct 36772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 24816890 - 24816744
Alignment:
Q  11 tgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaa 110  Q
    |||||||||||||| ||||||  | | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||||  |||||||||| ||||  |||||||||    
T  24816890 tgacaaagtctttggctcatctacaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggattcaaaggtcatcatggagcaacttacggagttcaa 24816791  T
Q  111 caaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    ||||||  ||| ||| |||||||  |||||| |||||||||| ||||    
T  24816790 caaaattcttgatgacttggagatgattaaggtgcatcttgaagatg 24816744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 48490580 - 48490696
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||| || ||||   | |||||| | ||||||| |||||||| || ||||||||| | |||| ||||| |||||| |||||| |||||    
T  48490580 tgaggatgcgggtgctttggtggt---gagttgttggcaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttagtattgatgccttgtggagtggtggtcgtctg 48490676  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  48490677 gagagacgttaaacactcaa 48490696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 47675621 - 47675487
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| || |||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| || |||||| |||||||  |||||||| || | ||||||| | |   ||    
T  47675621 ttgtatatgaccaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctaatcattcaagatggtggagtcaaagactgtgatggagcaattaacgg 47675522  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatt 138  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  47675521 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacatt 47675487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6594017 - 6593866
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  6594017 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 6593918  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  6593917 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 6593866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 18391655 - 18391504
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  18391655 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 18391556  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  18391555 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 18391504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 47675104 - 47675014
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| | ||| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  47675104 gttgttgggaggatgaagaaggtgaggtctctcaacttggtattgattccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaa 47675014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 269
Target Start/End: Original strand, 43557 - 43601
Alignment:
Q  225 tgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43557 tgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 43601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 26213481 - 26213632
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||| ||| || |||||| |||||  || | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||  ||||   |    
T  26213481 ttgtataggaccaaatctttggctcatttgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggc-ctcatggagaaacttacag 26213579  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggat 156  Q
    |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || ||| | ||||||||    
T  26213580 agttcaacaaaatctttgatgacttggagaatattgaggtgcctattgaggat 26213632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 48490089 - 48490240
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | |||||||   |   ||    
T  48490089 ttgtatattacaaaatctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcatttaacgg 48490188  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||| || || | ||||||||    
T  48490189 agttcaacaaaatccttaatgatttggagaacattgaggtgaaacttgagga 48490240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 6047245 - 6047398
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||  || |||||| |||||  || | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| | |||||  ||  ||||  ||    
T  6047245 ttgtatatgaacaaatctttggctcatacgcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagtccatcattcagtaacttacgg 6047344  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    |||| ||||| ||| ||| ||| |||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  6047345 agttaaacaatatccttgatgacttggagaacattgagatgcatttttaggatg 6047398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 190 - 269
Target Start/End: Original strand, 6047761 - 6047840
Alignment:
Q  190 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||| || || || || || ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6047761 gatgaagtaggtgatgtttctcgccttgtgaatgatgtcttgtagagtggtggtcgtctagagagacgttaaacactcaa 6047840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 41383459 - 41383724
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41383459 tttgtatatgacaaagtctttgactcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcatttgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 41383558  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  41383559 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgtgactgctctgatggtgtggt-ttgtttggaggatgatgaaggtg 41383657  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41383658 atgtgtctcaccttgagagtgatgcctagtggagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaa 41383724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 18811997 - 18812116
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  18811997 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctg 18812096  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  18812097 gagagacgttaaacactcaa 18812116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 43080891 - 43081010
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43080891 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 43080990  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  43080991 gagagacgttaaacactcaa 43081010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 27828274 - 27828393
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27828274 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaagatgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 27828373  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27828374 gagagacgttaaacactcaa 27828393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 18811512 - 18811668
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  18811512 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 18811611  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  18811612 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 18811668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 15069371 - 15069527
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||| ||||     
T  15069371 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactta 15069470  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  15069471 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 15069527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 27827789 - 27827945
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  27827789 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 27827888  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  27827889 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 27827945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 150 - 262
Target Start/End: Original strand, 15069859 - 15069971
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  15069859 tgaggatgcaggtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatggatctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcatctg 15069958  T
Q  250 gagagacgttaaa 262  Q
     ||||||||||||    
T  15069959 aagagacgttaaa 15069971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Original strand, 21481302 - 21481568
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| | |||||||||   |||| |    
T  21481302 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcgccaattcctaaagaaacaattttactcattcaagatggtagagtcaaagaccatcatggagaaccttgcg 21481401  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagt---tgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaag 199  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| |||||| | |||   |    |  |  |||||||||  ||| | || ||||   | ||||| |||||||||||||||    
T  21481402 gagttcaacagaatccttgatgacttggagtatattgtctctgagggttatgaggatgcatgtgttttggtggt---gcgttgtatggaggatgaagaag 21481498  T
Q  200 gtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  21481499 gtgatgtttctcaccttgggagtgttgcctgatagagcggtggtcgtcaagagagacgttaaacactcaa 21481568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 43080406 - 43080562
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||| ||| |||||||||  ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||     
T  43080406 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaaacaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcatggagcaactta 43080505  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  43080506 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 43080562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 5 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 31577819 - 31577668
Alignment:
Q  5 tgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgga 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||| | |||||||||||||||| |||| |||| |||||||  |||||| ||| |||||||||| ||||  |||    
T  31577819 tgtatatgacaaagtctttggctcttcggcaattcctaaagcaacaactctact-attcaagatggtggagtcaatggccatcatggagcaacttacgga 31577721  T
Q  105 gttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    |||||||||||||  || ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  31577720 gttcaacaaaatccatgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 31577668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 34255990 - 34255839
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  34255990 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 34255891  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  34255890 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 34255839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 4732342 - 4732493
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | |   ||    
T  4732342 ttgtatatgaccaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattaacgg 4732441  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  4732442 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 4732493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 177 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41365981 - 41365889
Alignment:
Q  177 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| | |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||  |||| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  41365981 gtgttgatgggaggatgaagaaggtgaagtctctcaccttggtattgaggccttgtagagtggtgattgtctggagagacgttaaacactcaa 41365889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 34255472 - 34255382
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| |||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  34255472 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtggagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaa 34255382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 180 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31577317 - 31577228
Alignment:
Q  180 ttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |  ||||| || |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  31577317 ttgttgggaggatgaagaatgtgatgtttctcaccttgtgaattatgccttgtagagcggtgttcttctggagagacgttaaacactcaa 31577228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 17848330 - 17848486
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||  | |||||||||||||||| ||||||||  ||||| |  ||||||||   |||||||||  ||||     
T  17848330 tctttgtatatgacaatctctttggctcatcggaaattcctaaagcaacaactctactcattgaagatgttggagtcaaagttcatcatggagtaactta 17848429  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     | ||||||| | |||| ||| ||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||    
T  17848430 cgaagttcaatacaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttaaggatg 17848486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 268
Target Start/End: Original strand, 4732831 - 4732920
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactca 268  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||| |||| | || | |||||||||||||||||||    
T  4732831 gttgttgggaggatgatgaaggtgaggtttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtttagagagacgttaaacactca 4732920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 269
Target Start/End: Original strand, 17848859 - 17848934
Alignment:
Q  194 aagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |  ||||| || |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  17848859 aagaaagtgatgtttctcaccttgggaattatgccttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacattcaa 17848934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 15534130 - 15533864
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||    
T  15534130 tttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaaaccatcatggagctacttgtg 15534031  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534030 gagttcgacaaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 15533931  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||| || || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  15533930 atgtgtctcaccatgagagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttatacactcaa 15533864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 2 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3631472 - 3631205
Alignment:
Q  2 ctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  | | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3631472 ctttgtatatgacaaagtctttgactcatcaacaattcctaaagcaataactttactcattcaagatggtaaagtcaaaggccatcatggagctacttgt 3631373  T
Q  102 ggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggt 201  Q
     |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3631372 agagttcaataaaatcattggtgatttggagaacattgaggtgcgtcttgaggatgtggatgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggt 3631273  T
Q  202 gatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3631272 gatgtgtctcaccttgggggtgatgcctagtggagcggtggttgtctggagagacgttaaacactcaa 3631205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 26067440 - 26067321
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  26067440 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctactggagcggtggtcgtctg 26067341  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  26067340 gagagacgttaaacactcaa 26067321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 33310123 - 33310242
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  33310123 tgaggatacgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagtggtggtcgtctg 33310222  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  33310223 gagagacgttaaacactcaa 33310242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 25462995 - 25462839
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||     
T  25462995 tctttgtatatgacaaagtcttaggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactta 25462896  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  25462895 cggagttcaacaaaatctttgatgacttggagaatattgaggtgcatcttgaggatg 25462839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 33309638 - 33309792
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  33309638 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 33309737  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  33309738 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 33309792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26932093 - 26931939
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||| ||||     
T  26932093 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaagatggaagagtcaaaggccatcatggagcaactta 26931994  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  26931993 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 26931939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 3395145 - 3395249
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||||||| |    
T  3395145 tctttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcacggagctactcg 3395244  T
Q  101 tggag 105  Q
    |||||    
T  3395245 tggag 3395249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 185 - 269
Target Start/End: Original strand, 3395245 - 3395329
Alignment:
Q  185 tggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3395245 tggaggatgaagaatgtgatgtgtctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 3395329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Original strand, 17012814 - 17012944
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |    
T  17012814 tttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttgcg 17012913  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 134  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||    
T  17012914 gagttcaa-aaaatccttgatgacttggagaa 17012944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5408553 - 5408402
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  5408553 ttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 5408454  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  5408453 agttcaacaaaatccttgatgatttggagatcattgaggtgcaacttgagga 5408402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5412878 - 5412727
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  5412878 ttgtatatgacaaagtctttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 5412779  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||    
T  5412778 agttcaacaaaatccttgatgatttggagatcattgaggtgcaacttgagga 5412727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 26067925 - 26067771
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| ||| |||||||||  ||||| | |||||||||| ||||| |||| ||||     
T  26067925 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcagcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggaagagtcaaaggccatcattgagcaactta 26067826  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     ||||||||| |||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  26067825 cggagttcaaaaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 26067771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 12158003 - 12158156
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||  ||| ||||||||| |||||||  |||||||| | | |||||||  ||||   |    
T  12158003 ttgtatatgacaaagtctttggctcattggcaattcctaaagcaagcactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccaccatggagaaacttacag 12158102  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||||||||| |||||    
T  12158103 agttcaacaagatccttgatgatttggagaacattgaggtgcatcttgtggatg 12158156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 177 - 269
Target Start/End: Original strand, 26944449 - 26944541
Alignment:
Q  177 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  26944449 gtgttgtttaaaggatgaagaaggtgatgtttttcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaa 26944541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12936779 - 12936663
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||  |||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||     
T  12936779 tctttgtatatgacaaaatctttggctcattggcaattcctaaagcaacaactctactcatttaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaactta 12936680  T
Q  101 tggagttcaacaaaatc 117  Q
     |||||| |||||||||    
T  12936679 cggagtttaacaaaatc 12936663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 12911093 - 12910987
Alignment:
Q  11 tgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaa 110  Q
    |||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  ||| |||||| |||||||||| ||||  |||||| ||    
T  12911093 tgacaaagtctttggctcattgggaattcctaaagcaacaactctactcattcaagatggtggagttaaaggccatcatggagcaacttacggagtttaa 12910994  T
Q  111 caaaatc 117  Q
    |||||||    
T  12910993 caaaatc 12910987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 117
Target Start/End: Original strand, 26944275 - 26944389
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| | | ||||||||| ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||| ||||| |||    |||||    
T  26944275 tttgtatatgacaaagtctttggcttatcgacaattcctaaagcgacaactttaataattcaagatggtagagtcaaaggccatcatagagaactttgtg 26944374  T
Q  103 gagttcaacaaaatc 117  Q
    |||||||||| ||||    
T  26944375 gagttcaacagaatc 26944389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 16553360 - 16553511
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| | | | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  16553360 ttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 16553459  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16553460 agttcaacaagatccttgatgacttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16553511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 16629916 - 16630067
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| | | | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  16629916 ttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 16630015  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16630016 agttcaacaagatccttgatgacttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16630067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 34165568 - 34165719
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  34165568 ttgtatatgaccaagtcgttggctcataggcaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 34165667  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||| ||| | |  ||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  34165668 agttcaacaagatcctcgacgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 34165719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 269
Target Start/End: Original strand, 11137333 - 11137425
Alignment:
Q  177 gtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||  | |||||||| | ||||  |||||||||||||||||||    
T  11137333 gtgttgttggtacgatgaagaaggtgatgtttctcaccttgggaatgatgccttatagagcggtgatcgtctatagagacgttaaacactcaa 11137425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5408043 - 5407953
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5408043 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaa 5407953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 5412368 - 5412278
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || ||| |||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5412368 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagtggtgttcgtctggagagacgttaaacactcaa 5412278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 16651620 - 16651774
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||| ||| ||||| | | | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||| |  | ||||||| | | | ||    
T  16651620 ttgtatatgaccaagtcgttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggagtcaaagaccgtgatggagcaattggcgg 16651719  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggaga-acattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    |||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||    
T  16651720 agttcaacaagatccttgatgacttggagacacattgaggtgcaacttgaggatg 16651774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 269
Target Start/End: Original strand, 30444562 - 30444641
Alignment:
Q  190 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||  |||  |||||||| || ||| | || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  30444562 gatgaagaaggtgatgattcttgccttgggagtgatgctttgtagagcggtggtcgtctggagagacattaaacactcaa 30444641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 16568167 - 16568257
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| |||||| || |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || |||||||| |  |||||| |||||||||||||||||    
T  16568167 gttgttgggaggaagatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgttcatctggaaagacgttaaacactcaa 16568257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Original strand, 16567768 - 16567821
Alignment:
Q  102 ggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  16567768 ggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 16567821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 17)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 6263682 - 6263416
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||    
T  6263682 tttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaagtcctaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagcaacttatg 6263583  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtg 202  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6263582 gagttcaacaaaacagttggtgatttggagaacattgaggtgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtg 6263483  T
Q  203 atgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||  ||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6263482 atgtccctcaccttgggattgatacctggtggagtggtggtcgtctggagaaacgttaaacactcaa 6263416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 98 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 31734312 - 31734141
Alignment:
Q  98 ttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaaga 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  31734312 ttgtggagttcaacaaaatcattgatgatttgaagaacattaagttgcgtcttgagaatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggataaaga 31734213  T
Q  198 aggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31734212 aggtgatgtttctcaccttgggaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 31734141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19503381 - 19503262
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  19503381 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcagtggtcgtctg 19503282  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19503281 gagagacgttaaacactcaa 19503262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 36560189 - 36560070
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  36560189 tgagcatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcgccttgggattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 36560090  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  36560089 gagagacgttaaacactcaa 36560070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 35217015 - 35216896
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  35217015 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaaaaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtgaagcggtggtcgtctg 35216916  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  35216915 gagagacgttaaacactcaa 35216896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21519739 - 21519620
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | |||||    
T  21519739 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggagtgatgcctagtagagcggtgttcgtctg 21519640  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  21519639 gagagacgttaaacactcaa 21519620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36560671 - 36560517
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  36560671 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 36560572  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  36560571 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 36560517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 19503866 - 19503710
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||| |||||||||  |||| || |||||||||| |||||||||| ||||     
T  19503866 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcaattcctaaagcaatgactctactcattcaggatgatagagtcaaaggccatcatggagcaactta 19503767  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  19503766 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 19503710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35217500 - 35217346
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  35217500 tctttatatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 35217401  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  35217400 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 35217346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21520224 - 21520068
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||   ||||||  ||| ||| || |||||||||| ||||     
T  21520224 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcatttaggatggtggagttaaatgccatcatggagcaactta 21520125  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| |||| ||| ||||||    
T  21520124 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattaaggtgcaacttaaggatg 21520068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 22405460 - 22405320
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||| || | |||||||||||| | | ||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||| ||||     
T  22405460 tctttgtatatgacaaagtctttggcttatcagcaattcctaaagcaacgattctactcattcaagatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactta 22405361  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaag 141  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| || ||||| ||||||    
T  22405360 cggagttcaacaaaatccttgatgacttagagaatattaag 22405320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14634966 - 14634875
Alignment:
Q  178 tgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  14634966 tgttgttgggaggatgaagagggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctggagagacgttaaacactcaa 14634875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 28569918 - 28569799
Alignment:
Q  38 tcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacat 137  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| | ||||  |||||||||||||||| |||  ||  || |||  ||    
T  28569918 tcctaaaacaaaaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggatcaacttacggagttcaacaaaatccttgaagacatgaagactat 28569819  T
Q  138 taagttgcatcttgaggatg 157  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  28569818 taaggtgcatcttgaggatg 28569799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 210 - 269
Target Start/End: Original strand, 22402266 - 22402325
Alignment:
Q  210 tcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22402266 tcaccttgagaatgatgcctagtggagcggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 22402325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 28569428 - 28569349
Alignment:
Q  190 gatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| || || || || || ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  28569428 gatgaagaaggtgatgtttctcaccttgtgaatgatgacttgtagagtggtggtcgtctagagagatgttaaacactcaa 28569349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 34574688 - 34574627
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcatt 62  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||| || ||||||||| ||||||||    
T  34574688 tctttgtatatgacaaagcctttggctcataggcaattccaaatgcaacaactctactcatt 34574627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 193 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 41304219 - 41304143
Alignment:
Q  193 gaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||  | |||||||| || || |||||  | |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  41304219 gaagaaggtgatgcctttcaccttgtgactgatgccttatagagcggtgttcatctggagagacgttaaacactcaa 41304143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold1899
Description:

Target: scaffold1899; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 858 - 977
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  858 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgagattgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 957  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  958 gagagacgttaaacactcaa 977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1899; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 373 - 529
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  373 tctttgtatatgacaaagcctttggctcatcggcaattcctaaagcaacgactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 472  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  473 cggagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgaaacttgaggatg 529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 23360 - 23480
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggt-ggtagtct 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  23360 tgaggatgcgggtgctctgatggtgtggtgttgtttggaggaagaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgatgcctagtggagcggtgggtcgtct 23459  T
Q  249 ggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  23460 ggagagacgttaaacactcaa 23480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 22875 - 23029
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||     
T  22875 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtagagtcaaaggccatcatggagcaactta 22974  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
     |||||||||||||||| | | ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||    
T  22975 cggagttcaacaaaatcctagatgacttggagaatattgaggtgcaacttgagga 23029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 34792 - 34911
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  34792 tgaggatgcaggtgctctgatggtgtggcgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcacgttgggagtgatgcctagtggagcggtggtcgtctg 34891  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    || |||||||||||||||||    
T  34892 gaaagacgttaaacactcaa 34911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Original strand, 34299 - 34455
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||||| |||      
T  34299 tctttgtatatgacaaagtctttggctcatcggcaattcctaaagcaacaactccactcattcaggatggtggagtcaaaggccatcatggagcaactca 34398  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
     |||||| ||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  34399 cggagttaaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 34455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 73047 - 72891
Alignment:
Q  1 tctttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttg 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||  ||||||  |||||||| | |||||||||| ||||     
T  73047 tctttgtatatgacaaaatctttgactcatcggcaattcctaaagcaacaactctactcattcaggatggtggagtcaaagaccatcatggagcaactta 72948  T
Q  101 tggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
      ||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  72947 cagagttcaacaaaatccttgatgacttggagaatattgaggtgcaacttgaggatg 72891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 72548 - 72466
Alignment:
Q  161 gtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggt 243  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  72548 gtgctttgatggtgtggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggatggatgcctagtggagcggtggt 72466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 3 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 26418 - 26288
Alignment:
Q  3 tttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtg 102  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||  ||||| |    
T  26418 tttgtatatgataaagtctttggctcatcggcaattccaaaagcaacaactttactcattcaagatggtagagtcaaaggccatcatggagaaacttgcg 26319  T
Q  103 gagttcaacaaaatcattggtgatttggagaa 134  Q
    |||||||| |||||| ||| ||| ||||||||    
T  26318 gagttcaa-aaaatccttgatgacttggagaa 26288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold1908
Description:

Target: scaffold1908; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 269
Target Start/End: Original strand, 541 - 654
Alignment:
Q  150 tgaggatgcgggtgctctgatggtatggtgttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctg 249  Q
    |||||||| ||||||| |||||||   |||||||| |||||||||||   |||| || ||||||||||| |||| ||||| || |||||||| | |||||    
T  541 tgaggatgtgggtgctttgatggt---gtgttgttgggaggatgaag---gtgaggtctctcaccttggtattgatgccttgtagagcggtgatcgtctg 634  T
Q  250 gagagacgttaaacactcaa 269  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  635 gagagacattaaacactcaa 654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1908; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 102 - 155
Target Start/End: Original strand, 148 - 201
Alignment:
Q  102 ggagttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgagga 155  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  148 ggagttcaacaaaatccttgatgatttggagaacattgaggtgcaacttgagga 201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 179 - 269
Target Start/End: Original strand, 115801 - 115891
Alignment:
Q  179 gttgtttggaggatgaagaaggtgatgtgtctcaccttgggattgttgcctagtggagcggtggtagtctggagagacgttaaacactcaa 269  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| ||  || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  115801 gttgttgggaggatgatgaaggtgagggttctcaccttggtattgatgccttgtaaagtggtggtcgtctggagagacgttaaacactcaa 115891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 138
Target Start/End: Original strand, 115287 - 115421
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| | | | |||| ||||||||||| ||||||||| |||||||  | |||||| |  | ||||||| | |    |    
T  115287 ttgtatatgaccaagtctttggctcatagacaattccttaagcaacaactctactcattcaagatggtggattcaaagaccgtgatggagcaattgacag 115386  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacatt 138  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  115387 agttcaacaaaatccttgatgatttggagaacatt 115421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26900 - 26747
Alignment:
Q  4 ttgtatatgacaaagtctttgcctcatcggcgagtcctaaagcaacaactttactcattcgagatggtaaagtcaaaggctatcatggagctacttgtgg 103  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||   | | ||||||| | ||| || ||||| ||  |||||||  ||||||||| | || |||||| |||  |||    
T  26900 ttgtatgtgacaaattctttggctcatacacaattcctaaaactacatctctactcgtttaagatggtggagtcaaaggttgtcttggagcaactaatgg 26801  T
Q  104 agttcaacaaaatcattggtgatttggagaacattaagttgcatcttgaggatg 157  Q
    |||||||  ||||  ||| |||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  26800 agttcaaacaaattcttgatgatttggagaacattgatgtgcatcttgaggatg 26747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University