View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11743_low_5 (Length: 587)

Name: NF11743_low_5
Description: NF11743
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11743_low_5
NF11743_low_5
[»] chr4 (2 HSPs)
chr4 (207-569)||(11118694-11119057)
chr4 (22-116)||(11119079-11119173)
[»] chr5 (8 HSPs)
chr5 (22-555)||(42124069-42124603)
chr5 (34-315)||(34239569-34239850)
chr5 (26-301)||(42129699-42129974)
chr5 (34-304)||(41712563-41712833)
chr5 (70-315)||(34231853-34232098)
chr5 (139-318)||(41571127-41571306)
chr5 (212-323)||(41432340-41432451)
chr5 (279-326)||(41445148-41445195)
[»] chr3 (1 HSPs)
chr3 (26-314)||(8523841-8524129)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (34-397)||(25522034-25522397)
chr6 (499-541)||(25522500-25522542)
[»] chr2 (4 HSPs)
chr2 (70-330)||(12249269-12249529)
chr2 (86-190)||(32681107-32681211)
chr2 (350-424)||(32681369-32681443)
chr2 (211-261)||(32681216-32681266)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 2)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 207 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 11119057 - 11118694
Alignment:
Q  207 tctaagcaacaacatgctacaaggcaatattccagaatccattttcaaccttacaaacctaaatacactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgct 306  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11119057 tctaagcaacaaccggctacaaggcaatattccagaatgcattttcagcctaacaaagctagatgaactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgtt 11118958  T
Q  307 gtcaattttaaactcttctccaaatttgatgtactggaaattttatccctttcaaggaatagtcagttgtcactaaaattcgaatccaatgacacttata 406  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11118957 gtcaattttaaactcttctccaaatttgctgacctggaaattttatccctttcaaggaatagtcagttgtcactaaaattcgaatccaatgtcacttata 11118858  T
Q  407 gttttactaacctacaaatactgaaattat-ttctgtcatattgattgagtttcacaacttacaaggagatttcccacgtttgcaacatctgcatctttc 505  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||| || ||| |||||  ||||||| |||||||    
T  11118857 gttttactaacctacaaatactcaaattatcttctgtcaacttgatcgaatttcacaacttacaaggagaatttccaagtttgtcacatctggatctttc 11118758  T
Q  506 caataacaaacttaatggaagaatgcccaattggtttcttggaaataatttttggcaatctgtg 569  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  11118757 caaaaacaaacttaatggaagaatgcccaattggtttcttggaaatatttattggcaatctgtg 11118694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 11119173 - 11119079
Alignment:
Q  22 cccctacccaagaaaattacaggattccaaaagctaactgctttgaccttaaatgacaacttactaaatggaacaattccttcctccttgttatc 116  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||   |||||  ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11119173 cccctgcccaacaaaattacagggttccaaaagctaacaaatttgagattaaatgacaacttgataaatggaacaattccttcctccttgttatc 11119079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 8)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 22 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 42124603 - 42124069
Alignment:
Q  22 cccctacccaagaaaattacaggattccaaaagctaactgctttgaccttaaatgacaacttactaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgc 121  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    |||||  ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42124603 cccctacccaacaaaattacaggactccaaaagctaatgtatttgaatttaaaagacaacttgctaaatggaacagttccttcctccttgttatctttgc 42124504  T
Q  122 cttctttggaaggtttagatctatcaaataatcgacttacagggtatatcagtgaaatctcatcatattccatatggtcactaactctaagcaacaacat 221  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||      |||||||||||||||||||     
T  42124503 cttctttggcaattttagatctatcatataatcgacttacagggcatatcagtgaaatatcatcatattctttaaacatgctaactctaagcaacaacag 42124404  T
Q  222 gctacaaggcaatattccagaatccattttcaaccttacaaacctaaatacac-tagatctatcatcaaacaacttgagtggtgctgtcaattttaaact 320  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||  | ||| ||  |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||| ||||    
T  42124403 gctacaaggcaatattcctgagtccattttcaacctaacaaaactatct-cacttaattctatcttcgaacgacttgagtggtcttgtcaattttcaact 42124305  T
Q  321 cttctccaaa-tttgatgtactggaaattttatccctttcaaggaatagtcagttgtcactaaaattcgaatccaatgacacttatagttttactaacct 419  Q
    |||||||||| ||  |||| || ||||| |||||||||||| |||||||||| || || ||||| || |||||||||| || |||||||||| ||| |||    
T  42124304 cttctccaaacttacatgt-ctagaaatgttatccctttcatggaatagtcaattatctctaaattttgaatccaatgtcaattatagtttttctagcct 42124206  T
Q  420 acaaatactgaaattat-ttctgtcatattgattgagtttcacaacttacaaggagatttcccacgtttgcaacatctgcatctttccaataacaaactt 518  Q
    |||| || || |||| | ||||||||  |||||  | || || || ||||||||||| |||  |  ||||  |   ||  || ||||  |||||||||||    
T  42124205 acaagtattggaattgtcttctgtcaatttgatcaaattccataatttacaaggagaattcttagatttgatatcacttgatatttctgataacaaactt 42124106  T
Q  519 aatggaagaatgcccaattggtttcttggaaataatt 555  Q
     |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||    
T  42124105 catggaagaatgcccaattggttacttgaaaaaaatt 42124069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 315
Target Start/End: Original strand, 34239569 - 34239850
Alignment:
Q  34 aaaattacaggattccaaaagctaactgctttgaccttaaatgacaacttactaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccttctttggaag 133  Q
    |||||| |||| || |||||||||| |  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  34239569 aaaattgcaggttttcaaaagctaatttatttgaggttaaatgacaacttgctaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccttctttggtac 34239668  T
Q  134 gtttagatctatcaaataatcgacttacagggtatatcagtgaaatctcatcatattccatatggtcactaactctaagcaacaacatgctacaaggcaa 233  Q
     | |  |||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||  |    
T  34239669 ttctgtatctatcaaacaatcgacttacagggcctatcagtgaaatctcatcatattccttagagtatctatctctatgcaacaacaagctacaaggtga 34239768  T
Q  234 tattccagaatccattttcaaccttacaaacctaaatacactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgctgtcaatttt 315  Q
    ||||||| | || |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34239769 tattccaaattcaattttcaaccttgcaaacctaattacactatgtctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaatttt 34239850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 26 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 42129974 - 42129699
Alignment:
Q  26 tacccaagaaaattacaggattccaaaagctaactgctttgaccttaaatgacaacttactaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccttc 125  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||| |||||| || |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42129974 tacccaacaaaactacagggttccaagagctaaatgatttgagattaaatgacaacttgttaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccgtc 42129875  T
Q  126 tttggaaggtttagatctatcaaataatcgacttacagggtatatcagtgaaatctcatcatattccatatggtcactaactctaagcaacaacatgcta 225  Q
    |||||    ||||| ||||||||||||||| |||||| || |||||| || |||||||||||||||| ||  |   |||  |||||||  ||||| ||||    
T  42129874 tttggttcatttagttctatcaaataatcgtcttacaaggcatatcactgcaatctcatcatattccttaaagaagctagatctaagcggcaacaagcta 42129775  T
Q  226 caaggcaatattccagaatccattttcaaccttacaaacctaaatacactagatctatcatcaaacaacttgagtg 301  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  42129774 caaggcaatattccaaaatctattttcaaccttgcaaacttaactttgctagatctatcatcaaacaacttgagtg 42129699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 34 - 304
Target Start/End: Original strand, 41712563 - 41712833
Alignment:
Q  34 aaaattacaggattccaaaagctaactgctttgaccttaaatgacaacttactaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccttctttggaag 133  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||   ||||||| ||||||  |||||||| |||||||| |||||||||| || || |||||||||||||    
T  41712563 aaaattacagggttccaaaagctaactaatttgtatttaaatggcaacttgttaaatggagcaattcctccctccttgttttcctttccttctttggaag 41712662  T
Q  134 gtttagatctatcaaataatcgacttacagggtatatcagtgaaatctcatcatattccatatggtcactaactctaagcaacaacatgctacaaggcaa 233  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||| ||  |   |||  ||||  |  |||||  ||| |||||||    
T  41712663 atttagatctatcaaataaccgacttatagggcatatcattgcaatctcatcatattccttagaggagctatatctattcggcaacaaactagaaggcaa 41712762  T
Q  234 tattccagaatccattttcaaccttacaaacctaaatacactagatctatcatcaaacaacttgagtggtg 304  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| || |||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  41712763 tattccagaatcaattttcaaacttataaacctaactagactagacctatcatcaaacaacttcagtggtg 41712833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 70 - 315
Target Start/End: Original strand, 34231853 - 34232098
Alignment:
Q  70 ttaaatgacaacttactaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccttctttggaaggtttagatctatcaaataatcgacttacagggtata 169  Q
    ||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  |  |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  34231853 ttaaatgacaaccgtctaaacggaacaattccttcctctttgttatctttgcctcgtttgctaaatttatatctatcaaacaatcaacttacagggcata 34231952  T
Q  170 tcagtgaaatctcatcatattccatatggtcactaactctaagcaacaacatgctacaaggcaatattccagaatccattttcaaccttacaaacctaaa 269  Q
    |||||| |||||| || |||||  ||  | | |||| |||| ||   |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||  ||      
T  34231953 tcagtgcaatctcgtcctattcgttagaggctctaaatctaggcggtaacaagctacaaggcaatattccagaatcaattttcaaccttgtaaatttagc 34232052  T
Q  270 tacactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgctgtcaatttt 315  Q
    |  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34232053 tgtattagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaatttt 34232098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 139 - 318
Target Start/End: Original strand, 41571127 - 41571306
Alignment:
Q  139 gatctatcaaataatcgacttacagggtatatcagtgaaatctcatcatattccatatggtcactaactctaagcaacaacatgctacaaggcaatattc 238  Q
    ||||||||||||||||   |||| ||  |||| |||| | |||||||||||||  | ||||  ||||  ||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  41571127 gatctatcaaataatcagtttactggaaatataagtgcagtctcatcatattctttgtggtatctaaaactatgcagcaacaagctacaaggcgatattc 41571226  T
Q  239 cagaatccattttcaaccttacaaacctaaatacactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgctgtcaattttaaa 318  Q
    | ||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||   || |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  41571227 ctgaatctattttcaaccttgtaaacctaactacactatgcctgtcatcaaacaacttgagtggtattgtcaattttaaa 41571306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 212 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 41432451 - 41432340
Alignment:
Q  212 gcaacaacatgctacaaggcaatattccagaatccattttcaaccttacaaacctaaatacactag-atctatcatcaaacaacttgagtggtgctgtca 310  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||  |||||| | || ||| |  |||||| ||||| ||||||||||||  |||||    
T  41432451 gcaacaacatgttacaaggaaatattccagaatcacttttcaaccttgtaaaccttacta-acttgtgtctatcttcaaataacttgagtggttttgtca 41432353  T
Q  311 attttaaactctt 323  Q
    |||||||||||||    
T  41432352 attttaaactctt 41432340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 41445195 - 41445148
Alignment:
Q  279 tctatcatcaaacaacttgagtggtgctgtcaattttaaactcttctc 326  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  41445195 tctatcttcaaataacttgagtggttttgtcaattttaaactcttctc 41445148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 26 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 8524129 - 8523841
Alignment:
Q  26 tacccaagaaaattacaggattccaaaagctaactgctttgaccttaaatgacaacttactaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccttc 125  Q
    ||||||| |||| ||||||  | ||||||||||||  ||||   |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| |     
T  8524129 tacccaacaaaactacaggtcttcaaaagctaactaatttgcgattaaatgacaacttgctaaatggtacaattcctccctccttgttatccttgccatt 8524030  T
Q  126 tttggaaggtttagatctatcaaataatcgacttacagggtatatcagtgaaatctcatcatattccatatggtcactaactctaagcaacaacatgcta 225  Q
    ||||  ||  |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| ||  ||  ||| ||||||| ||||||| ||||    
T  8524029 tttgctagtattagatttatcaaataatcaacttacagggaatatcagcgcaatctcatcatattccttagagtttctatctctaagtaacaacaggcta 8523930  T
Q  226 caaggcaatattccagaatccattttcaaccttacaaacctaaatacactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgctgtcaattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8523929 caaggcaatattccagaatccattttcaaccttgcaaacctaagtagactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgttgtcaattt 8523841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 124; Significance: 2e-63; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 34 - 397
Target Start/End: Original strand, 25522034 - 25522397
Alignment:
Q  34 aaaattacaggattccaaaagctaactgctttgaccttaaatgacaacttactaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccttctttggaag 133  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||| ||| |  ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25522034 aaaattatagggttccaaaagctaactgatttaagtttacatgacaacttgttaaatggaacaattccttcctctttgttatctttgccttctttggtat 25522133  T
Q  134 gtttagatctatcaaataatcgacttacagggtatatcagtgaaatctcatcatattccatatggtcactaactctaagcaacaacatgctacaaggcaa 233  Q
     |||| ||||||| || |||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||| ||  |    ||| ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  25522134 atttatatctatctaacaatcgacttacaggatctatcagtgcaacctcatcatattccttagagagtttaaatctatacaacaacaagctacaaggcaa 25522233  T
Q  234 tattccagaatccattttcaaccttacaaacctaaatacactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgctgtcaattttaaactcttctccaaattt 333  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||  |||||| | |||| |||||||||||  |||||||||| ||| ||| |||||| ||    
T  25522234 tattccagaatccattttcaatcttacaaacctaactaatctaattctatctttaaacgacttgagtggttttgtcaattttcaacacttttccaaactt 25522333  T
Q  334 gatgtactggaaattttatccctttcaaggaatagtcagttgtcactaaaattcgaatccaatg 397  Q
          ||   | |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25522334 acaaatcttcgatttttatccctttcatggaatactcaattgtcactaaacttcgaatccaatg 25522397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 499 - 541
Target Start/End: Original strand, 25522500 - 25522542
Alignment:
Q  499 atctttccaataacaaacttaatggaagaatgcccaattggtt 541  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25522500 atctttccaataacaaacttgatggaagaatgcccaattggtt 25522542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 4)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 70 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12249529 - 12249269
Alignment:
Q  70 ttaaatgacaacttactaaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccttctttggaaggtttagatctatcaaataatcgacttacagggtata 169  Q
    |||| ||| ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||  | |||| || ||||| |||||| |||||||  |||    
T  12249529 ttaagtgataactttctaaacggaacaattcctcccaccttgttatctttgccttctttggaacatctagagctgtcaaacaatcgatttacaggacata 12249430  T
Q  170 tcagtgaaatctcatcatattccatatggtcactaactctaagcaacaacatgctacaaggcaatattccagaatccattttcaaccttacaaacctaaa 269  Q
    |||||| ||||||||| |||||  ||    | |||  ||||      |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||     
T  12249429 tcagtgcaatctcatcgtattcgttagatacgctatatctatctggtaacaagctacaaggcaatattccaaaatccattttcaaccttacaaccctaac 12249330  T
Q  270 tacactagatctatcatcaaacaacttgagtggtgctgtcaattttaaactcttctccaaa 330  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||    
T  12249329 tagactagatttatcatcaaacaacttgagtggtgttgttgattttcaactcttttccaaa 12249269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 7e-26
Query Start/End: Original strand, 86 - 190
Target Start/End: Original strand, 32681107 - 32681211
Alignment:
Q  86 taaatggaacaattccttcctccttgttatctttgccttctttggaaggtttagatctatcaaataatcgacttacagggtatatcagtgaaatctcatc 185  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||| || |||||||||    
T  32681107 taaatggaacgattccttccttcttgttatctttgccttatttggaatatttggatctatcaaataacctacttagagggtatatcaatgcaatctcatc 32681206  T
Q  186 atatt 190  Q
    |||||    
T  32681207 atatt 32681211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 350 - 424
Target Start/End: Original strand, 32681369 - 32681443
Alignment:
Q  350 tatccctttcaaggaatagtcagttgtcactaaaattcgaatccaatgacacttatagttttactaacctacaaa 424  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||| || ||||| |||| || |||||||||    
T  32681369 tatctctttcatggaatagtcaattgtcactaaactttgaatccaatgtcagttatacttttccttacctacaaa 32681443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 211 - 261
Target Start/End: Original strand, 32681216 - 32681266
Alignment:
Q  211 agcaacaacatgctacaaggcaatattccagaatccattttcaaccttaca 261  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||||    
T  32681216 agcaacaacaagctacaaggcaatatttcagaatctgtttttaaccttaca 32681266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University