View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11744_low_1 (Length: 575)

Name: NF11744_low_1
Description: NF11744
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11744_low_1
NF11744_low_1
[»] chr8 (163 HSPs)
chr8 (1-575)||(5866045-5866615)
chr8 (1-575)||(17140694-17141266)
chr8 (47-575)||(21255003-21255526)
chr8 (1-575)||(21249165-21249734)
chr8 (46-575)||(21490775-21491300)
chr8 (236-575)||(18818411-18818748)
chr8 (242-575)||(23406161-23406492)
chr8 (236-575)||(20535990-20536327)
chr8 (1-476)||(21285481-21285950)
chr8 (278-575)||(18879275-18879568)
chr8 (255-575)||(45131019-45131337)
chr8 (5-476)||(6520249-6520716)
chr8 (236-575)||(7372560-7372897)
chr8 (1-460)||(38855019-38855474)
chr8 (176-575)||(13597559-13597958)
chr8 (236-575)||(21389454-21389791)
chr8 (236-575)||(21778780-21779117)
chr8 (176-575)||(13508027-13508424)
chr8 (236-575)||(22626519-22626854)
chr8 (232-575)||(22874851-22875187)
chr8 (236-515)||(21919002-21919279)
chr8 (236-575)||(21395984-21396321)
chr8 (236-575)||(21790477-21790814)
chr8 (236-531)||(21923930-21924222)
chr8 (287-575)||(23648329-23648621)
chr8 (242-530)||(6759088-6759371)
chr8 (1-457)||(23760609-23761062)
chr8 (232-517)||(16092340-16092621)
chr8 (236-510)||(28649046-28649322)
chr8 (255-515)||(31971097-31971356)
chr8 (255-505)||(16199666-16199915)
chr8 (1-475)||(21673591-21674057)
chr8 (1-460)||(26355467-26355919)
chr8 (80-476)||(983249-983641)
chr8 (233-457)||(5853336-5853557)
chr8 (233-456)||(41598086-41598306)
chr8 (233-457)||(1484299-1484520)
chr8 (233-457)||(20403124-20403345)
chr8 (232-457)||(26219613-26219835)
chr8 (248-457)||(45290754-45290961)
chr8 (233-457)||(4542417-4542638)
chr8 (233-457)||(15203275-15203496)
chr8 (233-457)||(20046239-20046460)
chr8 (232-457)||(26225291-26225513)
chr8 (233-457)||(22001651-22001871)
chr8 (233-456)||(14409488-14409709)
chr8 (233-457)||(19896162-19896386)
chr8 (2-476)||(20498448-20498915)
chr8 (186-456)||(17612062-17612332)
chr8 (233-457)||(14823671-14823891)
chr8 (49-457)||(17266808-17267211)
chr8 (233-428)||(4483207-4483398)
chr8 (330-575)||(44384944-44385185)
chr8 (59-336)||(37116366-37116644)
chr8 (233-428)||(16413360-16413547)
chr8 (49-381)||(24352999-24353329)
chr8 (390-575)||(16184500-16184683)
chr8 (233-428)||(26223841-26224037)
chr8 (59-273)||(22364745-22364957)
chr8 (233-456)||(25484319-25484531)
chr8 (390-575)||(19898874-19899057)
chr8 (390-575)||(20466196-20466379)
chr8 (399-575)||(23777000-23777172)
chr8 (287-549)||(17353996-17354255)
chr8 (390-575)||(19982872-19983055)
chr8 (390-575)||(21162213-21162397)
chr8 (390-575)||(21168886-21169070)
chr8 (236-428)||(32121654-32121851)
chr8 (244-369)||(19937061-19937184)
chr8 (492-575)||(14409726-14409808)
chr8 (186-336)||(17439458-17439609)
chr8 (244-339)||(15070571-15070665)
chr8 (498-575)||(22525333-22525409)
chr8 (498-575)||(24352796-24352872)
chr8 (492-575)||(17612349-17612431)
chr8 (492-575)||(18678321-18678404)
chr8 (492-575)||(22965500-22965583)
chr8 (492-575)||(26223671-26223753)
chr8 (498-575)||(22419682-22419758)
chr8 (390-575)||(377052-377232)
chr8 (523-575)||(4083756-4083808)
chr8 (504-575)||(16413648-16413719)
chr8 (236-372)||(18678104-18678246)
chr8 (233-336)||(19801426-19801527)
chr8 (492-575)||(25484591-25484673)
chr8 (410-575)||(30643467-30643626)
chr8 (505-575)||(18717523-18717593)
chr8 (498-575)||(17439776-17439852)
chr8 (498-575)||(20502371-20502447)
chr8 (498-575)||(20533679-20533755)
chr8 (348-449)||(22965608-22965707)
chr8 (498-575)||(28397324-28397400)
chr8 (498-575)||(37515301-37515377)
chr8 (498-575)||(40493244-40493320)
chr8 (503-575)||(32121570-32121642)
chr8 (492-575)||(4483079-4483162)
chr8 (492-555)||(18678277-18678340)
chr8 (492-575)||(19937372-19937454)
chr8 (390-491)||(24755576-24755677)
chr8 (501-575)||(38855491-38855564)
chr8 (410-531)||(15611634-15611753)
chr8 (498-575)||(16799259-16799335)
chr8 (530-575)||(21919250-21919295)
chr8 (498-575)||(22253434-22253510)
chr8 (498-575)||(22995617-22995693)
chr8 (498-575)||(23944222-23944297)
chr8 (1-77)||(39834107-39834184)
chr8 (390-575)||(17926859-17927039)
chr8 (501-575)||(21673480-21673552)
chr8 (501-575)||(26355936-26356008)
chr8 (501-555)||(4483143-4483197)
chr8 (501-555)||(14409692-14409745)
chr8 (410-531)||(16410422-16410542)
chr8 (501-555)||(17612315-17612368)
chr8 (498-575)||(20498337-20498412)
chr8 (501-555)||(22965564-22965618)
chr8 (501-555)||(26223777-26223831)
chr8 (227-273)||(40492844-40492890)
chr8 (498-575)||(2419140-2419216)
chr8 (498-575)||(15203556-15203632)
chr8 (534-575)||(16092594-16092635)
chr8 (498-575)||(19155157-19155233)
chr8 (498-575)||(26225574-26225650)
chr8 (498-575)||(41597949-41598025)
chr8 (498-575)||(45291021-45291097)
chr8 (536-575)||(31971081-31971120)
chr8 (498-575)||(983677-983752)
chr8 (501-555)||(16413557-16413611)
chr8 (501-555)||(25484557-25484610)
chr8 (1-55)||(41598482-41598536)
chr8 (410-531)||(15603182-15603301)
chr8 (498-575)||(17086421-17086497)
chr8 (284-336)||(19154936-19154989)
chr8 (498-575)||(19896026-19896102)
chr8 (287-336)||(20502154-20502203)
chr8 (285-334)||(22525579-22525628)
chr8 (498-575)||(22963682-22963758)
chr8 (498-575)||(26219520-26219596)
chr8 (530-575)||(28649298-28649343)
chr8 (400-456)||(19937195-19937251)
chr8 (186-269)||(18862430-18862512)
chr8 (410-575)||(20856602-20856763)
chr8 (186-269)||(21383896-21383978)
chr8 (186-269)||(21387316-21387398)
chr8 (186-269)||(21411189-21411271)
chr8 (186-269)||(21805681-21805763)
chr8 (186-269)||(21827799-21827881)
chr8 (390-575)||(22010819-22011001)
chr8 (1-68)||(23406665-23406732)
chr8 (492-555)||(26223734-26223796)
chr8 (446-531)||(16861534-16861619)
chr8 (1-39)||(19801196-19801234)
chr8 (501-531)||(23761119-23761149)
chr8 (498-575)||(5083386-5083461)
chr8 (542-575)||(6102778-6102811)
chr8 (502-555)||(16413602-16413655)
chr8 (518-555)||(19937354-19937391)
chr8 (1-46)||(20536514-20536559)
chr8 (174-270)||(14103165-14103260)
chr8 (503-555)||(19937297-19937348)
chr8 (292-328)||(20533467-20533503)
chr8 (2-54)||(21414997-21415049)
chr8 (288-336)||(28397569-28397617)
[»] chr7 (171 HSPs)
chr7 (1-386)||(22072882-22073268)
chr7 (1-575)||(11995798-11996368)
chr7 (1-575)||(34200564-34201136)
chr7 (236-575)||(9508970-9509308)
chr7 (1-457)||(16219485-16219935)
chr7 (1-575)||(28505069-28505625)
chr7 (236-575)||(10588817-10589158)
chr7 (1-453)||(16056236-16056680)
chr7 (236-575)||(26211776-26212115)
chr7 (1-457)||(67644-68098)
chr7 (236-575)||(12698613-12698951)
chr7 (1-476)||(47831687-47832161)
chr7 (1-457)||(810898-811350)
chr7 (62-517)||(15754718-15755171)
chr7 (232-575)||(10063816-10064157)
chr7 (1-476)||(18005531-18005999)
chr7 (236-567)||(38227273-38227599)
chr7 (236-515)||(16386249-16386529)
chr7 (1-476)||(44014064-44014526)
chr7 (373-575)||(13032539-13032741)
chr7 (330-575)||(14258041-14258286)
chr7 (233-455)||(3564363-3564584)
chr7 (233-457)||(48273288-48273511)
chr7 (233-455)||(13647225-13647447)
chr7 (233-457)||(44116405-44116627)
chr7 (233-575)||(15144037-15144371)
chr7 (236-457)||(18456415-18456634)
chr7 (1-381)||(12901299-12901681)
chr7 (286-513)||(27847881-27848109)
chr7 (233-457)||(11972393-11972614)
chr7 (233-457)||(14949166-14949387)
chr7 (233-457)||(32125388-32125609)
chr7 (233-457)||(41522814-41523035)
chr7 (233-457)||(41525276-41525497)
chr7 (413-575)||(16579356-16579517)
chr7 (233-457)||(15376757-15376978)
chr7 (233-457)||(16409956-16410177)
chr7 (233-457)||(21189639-21189860)
chr7 (233-457)||(456218-456439)
chr7 (233-457)||(16232417-16232638)
chr7 (233-457)||(20385167-20385388)
chr7 (413-575)||(16586146-16586306)
chr7 (186-428)||(16495329-16495567)
chr7 (233-457)||(11393331-11393552)
chr7 (233-457)||(18640169-18640390)
chr7 (233-457)||(24702135-24702356)
chr7 (233-457)||(27216757-27216978)
chr7 (1-184)||(16324175-16324358)
chr7 (298-457)||(20110452-20110610)
chr7 (255-455)||(40443292-40443490)
chr7 (287-575)||(18154894-18155177)
chr7 (233-457)||(24704585-24704803)
chr7 (244-456)||(13869243-13869453)
chr7 (233-456)||(3386232-3386451)
chr7 (291-574)||(19649546-19649825)
chr7 (436-575)||(16461338-16461476)
chr7 (176-427)||(19486686-19486937)
chr7 (233-449)||(38898420-38898635)
chr7 (287-575)||(15211234-15211525)
chr7 (436-575)||(15755152-15755292)
chr7 (232-476)||(2280117-2280357)
chr7 (233-456)||(13831272-13831491)
chr7 (436-559)||(16461233-16461355)
chr7 (193-454)||(17061919-17062177)
chr7 (233-429)||(24275089-24275289)
chr7 (1-211)||(9389464-9389675)
chr7 (49-381)||(20220005-20220330)
chr7 (399-575)||(9703043-9703215)
chr7 (1-270)||(15113028-15113296)
chr7 (323-457)||(15082017-15082147)
chr7 (233-369)||(18430695-18430830)
chr7 (395-575)||(24054245-24054421)
chr7 (49-270)||(15116565-15116785)
chr7 (240-369)||(16213667-16213795)
chr7 (390-575)||(32216703-32216886)
chr7 (501-575)||(3564568-3564642)
chr7 (501-575)||(40443234-40443308)
chr7 (287-575)||(17138113-17138398)
chr7 (294-453)||(26356098-26356258)
chr7 (294-453)||(26358550-26358710)
chr7 (474-559)||(16461166-16461250)
chr7 (287-575)||(12186798-12187083)
chr7 (176-340)||(1867937-1868101)
chr7 (511-575)||(16402712-16402776)
chr7 (492-575)||(13869144-13869226)
chr7 (176-575)||(15008441-15008845)
chr7 (492-575)||(38898659-38898741)
chr7 (375-453)||(18427433-18427510)
chr7 (176-333)||(12255733-12255892)
chr7 (521-575)||(28505626-28505680)
chr7 (390-575)||(14429666-14429846)
chr7 (498-575)||(17017688-17017764)
chr7 (492-575)||(13647079-13647162)
chr7 (492-575)||(16495157-16495240)
chr7 (504-575)||(24274918-24274989)
chr7 (498-575)||(16091571-16091647)
chr7 (174-575)||(14044522-14044928)
chr7 (174-575)||(14354552-14354958)
chr7 (345-428)||(16213550-16213632)
chr7 (492-575)||(19486939-19487022)
chr7 (498-575)||(9177899-9177975)
chr7 (492-575)||(16213377-16213461)
chr7 (498-574)||(18203626-18203701)
chr7 (492-575)||(13831173-13831255)
chr7 (492-555)||(16213442-16213505)
chr7 (413-460)||(16461127-16461174)
chr7 (498-575)||(2282521-2282596)
chr7 (501-555)||(13647143-13647197)
chr7 (498-575)||(16056103-16056178)
chr7 (498-575)||(11525835-11525911)
chr7 (498-575)||(11772524-11772600)
chr7 (498-575)||(20220421-20220497)
chr7 (518-575)||(42376304-42376361)
chr7 (498-575)||(42461723-42461799)
chr7 (390-575)||(2759921-2760103)
chr7 (410-575)||(12321917-12322076)
chr7 (233-336)||(12756715-12756817)
chr7 (492-574)||(3386134-3386215)
chr7 (1-55)||(12255560-12255614)
chr7 (498-575)||(12256092-12256167)
chr7 (501-555)||(13869207-13869260)
chr7 (501-555)||(16213486-16213540)
chr7 (501-555)||(16495265-16495319)
chr7 (498-575)||(22072768-22072843)
chr7 (498-575)||(9033581-9033657)
chr7 (498-575)||(12901095-12901170)
chr7 (498-575)||(44116312-44116388)
chr7 (498-575)||(48273151-48273227)
chr7 (498-575)||(48990992-48991068)
chr7 (492-555)||(16495221-16495284)
chr7 (501-575)||(18005420-18005492)
chr7 (500-575)||(20110315-20110389)
chr7 (536-575)||(27848088-27848127)
chr7 (1-55)||(2279887-2279941)
chr7 (501-555)||(3386196-3386249)
chr7 (501-555)||(13647187-13647241)
chr7 (498-575)||(131087-131163)
chr7 (498-531)||(1868228-1868261)
chr7 (502-555)||(13831236-13831288)
chr7 (302-351)||(14932802-14932851)
chr7 (302-351)||(15356237-15356286)
chr7 (302-351)||(15360351-15360400)
chr7 (498-575)||(17062159-17062235)
chr7 (498-575)||(20585303-20585378)
chr7 (498-575)||(29329203-29329279)
chr7 (498-575)||(38519146-38519222)
chr7 (1-54)||(44116804-44116857)
chr7 (285-381)||(18203791-18203882)
chr7 (390-472)||(39268053-39268135)
chr7 (501-575)||(44013953-44014025)
chr7 (501-531)||(811407-811437)
chr7 (292-354)||(2832499-2832561)
chr7 (410-472)||(3271704-3271765)
chr7 (410-476)||(12255992-12256056)
chr7 (1-51)||(12756485-12756535)
chr7 (498-575)||(16219989-16220063)
chr7 (1-55)||(17061729-17061783)
chr7 (410-472)||(18301921-18301982)
chr7 (491-553)||(24275028-24275090)
chr7 (501-555)||(38898625-38898678)
chr7 (410-472)||(42203874-42203934)
chr7 (1-38)||(9177433-9177470)
chr7 (500-537)||(11769149-11769186)
chr7 (542-575)||(14183762-14183795)
chr7 (498-575)||(18456651-18456727)
chr7 (1-46)||(26212302-26212347)
chr7 (292-328)||(9446216-9446252)
chr7 (292-328)||(20569654-20569690)
chr7 (432-460)||(22072857-22072885)
chr7 (233-289)||(26356027-26356083)
chr7 (233-289)||(26358479-26358535)
[»] chr6 (157 HSPs)
chr6 (1-575)||(28496242-28496811)
chr6 (1-575)||(29808653-29809222)
chr6 (62-575)||(1561083-1561593)
chr6 (255-575)||(20638304-20638624)
chr6 (233-575)||(29060322-29060662)
chr6 (236-574)||(17287798-17288134)
chr6 (236-575)||(22780229-22780566)
chr6 (1-476)||(23019289-23019759)
chr6 (233-575)||(25629354-25629692)
chr6 (284-575)||(35245365-35245658)
chr6 (236-512)||(20360962-20361238)
chr6 (242-575)||(20076485-20076812)
chr6 (284-575)||(16920679-16920971)
chr6 (228-531)||(18409821-18410126)
chr6 (1-476)||(19652080-19652547)
chr6 (288-575)||(22831289-22831571)
chr6 (233-517)||(19303540-19303821)
chr6 (1-457)||(19668275-19668725)
chr6 (233-516)||(20593615-20593895)
chr6 (330-515)||(19773818-19774003)
chr6 (302-575)||(11185293-11185558)
chr6 (256-575)||(25611744-25612068)
chr6 (357-575)||(22805531-22805746)
chr6 (233-457)||(19858963-19859184)
chr6 (1-486)||(4185592-4186065)
chr6 (233-457)||(18334636-18334857)
chr6 (233-457)||(19004943-19005164)
chr6 (70-476)||(22080576-22080963)
chr6 (233-457)||(24422444-24422665)
chr6 (256-575)||(25603406-25603730)
chr6 (233-457)||(33861691-33861912)
chr6 (233-457)||(2291224-2291445)
chr6 (233-457)||(33864175-33864396)
chr6 (233-457)||(1595446-1595667)
chr6 (80-476)||(20109021-20109415)
chr6 (193-441)||(22782139-22782385)
chr6 (233-457)||(8054926-8055147)
chr6 (233-457)||(26924684-26924905)
chr6 (233-457)||(12742214-12742435)
chr6 (80-381)||(9098372-9098656)
chr6 (1-186)||(27333053-27333238)
chr6 (1-186)||(27393793-27393978)
chr6 (233-457)||(1540955-1541176)
chr6 (233-457)||(20556936-20557158)
chr6 (233-454)||(25688401-25688620)
chr6 (236-395)||(16496204-16496363)
chr6 (233-449)||(25754715-25754927)
chr6 (3-486)||(31155169-31155641)
chr6 (233-427)||(30676754-30676952)
chr6 (244-454)||(16448582-16448787)
chr6 (291-575)||(25642244-25642524)
chr6 (176-426)||(8227453-8227703)
chr6 (290-575)||(19862758-19863039)
chr6 (287-575)||(19872900-19873184)
chr6 (233-449)||(3852061-3852273)
chr6 (233-428)||(34963292-34963491)
chr6 (390-575)||(22335052-22335234)
chr6 (294-454)||(25714319-25714478)
chr6 (286-575)||(22432029-22432314)
chr6 (286-575)||(22438579-22438864)
chr6 (176-381)||(25644299-25644500)
chr6 (1-301)||(4667982-4668277)
chr6 (2-301)||(4674830-4675124)
chr6 (390-575)||(15894592-15894774)
chr6 (233-362)||(25656619-25656747)
chr6 (252-486)||(4186244-4186470)
chr6 (287-428)||(19848048-19848194)
chr6 (303-486)||(4738626-4738801)
chr6 (257-355)||(27333241-27333339)
chr6 (257-355)||(27393981-27394079)
chr6 (399-575)||(31165006-31165174)
chr6 (59-336)||(23076749-23077027)
chr6 (59-336)||(35008167-35008445)
chr6 (347-575)||(16965428-16965646)
chr6 (2-106)||(4189203-4189307)
chr6 (287-428)||(23992349-23992495)
chr6 (233-336)||(18456735-18456837)
chr6 (233-336)||(18461895-18461997)
chr6 (410-575)||(18906893-18907052)
chr6 (501-575)||(34963164-34963238)
chr6 (390-575)||(16523537-16523718)
chr6 (492-575)||(8227706-8227789)
chr6 (492-575)||(19848283-19848366)
chr6 (255-336)||(18821866-18821946)
chr6 (498-575)||(22117703-22117779)
chr6 (492-575)||(3852341-3852423)
chr6 (498-575)||(16492923-16492999)
chr6 (390-575)||(18692065-18692246)
chr6 (498-575)||(18896579-18896655)
chr6 (498-575)||(20223719-20223795)
chr6 (390-575)||(21740185-21740371)
chr6 (498-575)||(33442822-33442898)
chr6 (492-575)||(23992221-23992304)
chr6 (80-336)||(18199262-18199519)
chr6 (501-575)||(30676963-30677037)
chr6 (284-334)||(33443068-33443118)
chr6 (410-531)||(21830615-21830734)
chr6 (498-575)||(35007924-35008000)
chr6 (500-568)||(18929236-18929303)
chr6 (1-105)||(25644571-25644674)
chr6 (492-575)||(4642937-4643019)
chr6 (536-575)||(19773980-19774019)
chr6 (501-575)||(22081002-22081074)
chr6 (498-573)||(23076508-23076582)
chr6 (492-575)||(25754609-25754691)
chr6 (410-456)||(13019394-13019439)
chr6 (80-273)||(18177518-18177711)
chr6 (80-273)||(18204160-18204353)
chr6 (501-575)||(19651969-19652041)
chr6 (501-555)||(23992285-23992339)
chr6 (134-212)||(28103799-28103877)
chr6 (501-555)||(34963228-34963282)
chr6 (530-575)||(19303790-19303835)
chr6 (498-575)||(19362201-19362277)
chr6 (502-555)||(19848249-19848302)
chr6 (394-485)||(15041710-15041800)
chr6 (174-273)||(18696570-18696667)
chr6 (498-573)||(19668148-19668221)
chr6 (536-575)||(20361218-20361257)
chr6 (501-555)||(3852307-3852360)
chr6 (390-486)||(18180361-18180457)
chr6 (176-303)||(18706357-18706483)
chr6 (498-575)||(25644113-25644188)
chr6 (501-555)||(25754672-25754725)
chr6 (498-575)||(1595310-1595386)
chr6 (498-575)||(15705836-15705912)
chr6 (502-575)||(18452994-18453066)
chr6 (1-54)||(18457014-18457067)
chr6 (534-575)||(20593600-20593641)
chr6 (287-328)||(21766718-21766759)
chr6 (498-575)||(25688343-25688419)
chr6 (314-369)||(19008789-19008843)
chr6 (186-269)||(22949384-22949466)
chr6 (186-269)||(22953340-22953422)
chr6 (186-269)||(23871828-23871910)
chr6 (186-269)||(23875784-23875866)
chr6 (186-269)||(27325388-27325470)
chr6 (498-575)||(9100843-9100918)
chr6 (80-162)||(17105925-17106006)
chr6 (410-472)||(27553749-27553810)
chr6 (410-472)||(27567787-27567848)
chr6 (287-332)||(16493169-16493214)
chr6 (1-38)||(17106048-17106085)
chr6 (542-575)||(17742970-17743003)
chr6 (530-559)||(18410081-18410110)
chr6 (287-336)||(18453201-18453250)
chr6 (498-575)||(19656523-19656597)
chr6 (414-531)||(21766515-21766630)
chr6 (1-38)||(22080506-22080543)
chr6 (80-157)||(23539165-23539242)
chr6 (412-476)||(25644224-25644285)
chr6 (542-575)||(25714218-25714251)
chr6 (236-328)||(15041552-15041644)
chr6 (1-33)||(18177439-18177471)
chr6 (1-33)||(18204400-18204432)
chr6 (292-328)||(18907134-18907170)
chr6 (292-328)||(19790837-19790873)
[»] chr5 (159 HSPs)
chr5 (1-575)||(19660606-19661175)
chr5 (236-575)||(8286844-8287184)
chr5 (236-575)||(21808391-21808729)
chr5 (1-476)||(21329264-21329732)
chr5 (236-575)||(21729066-21729405)
chr5 (236-575)||(24493350-24493687)
chr5 (1-476)||(26011803-26012273)
chr5 (247-575)||(21997547-21997873)
chr5 (236-575)||(24529002-24529339)
chr5 (236-575)||(13095276-13095613)
chr5 (236-575)||(25431176-25431513)
chr5 (236-575)||(23390498-23390835)
chr5 (285-575)||(21293020-21293310)
chr5 (236-575)||(22074801-22075138)
chr5 (236-575)||(25421312-25421651)
chr5 (236-575)||(13025092-13025429)
chr5 (233-575)||(9077736-9078074)
chr5 (1-386)||(21501923-21502308)
chr5 (234-575)||(1096250-1096588)
chr5 (233-575)||(37723683-37724023)
chr5 (1-457)||(21565445-21565896)
chr5 (1-457)||(22959302-22959748)
chr5 (1-476)||(19668781-19669251)
chr5 (49-457)||(20026756-20027158)
chr5 (232-457)||(22412083-22412306)
chr5 (233-460)||(10732984-10733208)
chr5 (233-457)||(42245409-42245630)
chr5 (244-457)||(10775731-10775942)
chr5 (330-575)||(22107709-22107951)
chr5 (233-457)||(2154658-2154879)
chr5 (233-457)||(29329831-29330052)
chr5 (233-457)||(264812-265033)
chr5 (244-457)||(39245033-39245243)
chr5 (233-457)||(11581243-11581465)
chr5 (233-457)||(20908909-20909130)
chr5 (233-457)||(29345877-29346098)
chr5 (233-457)||(32027290-32027511)
chr5 (233-457)||(29348350-29348571)
chr5 (233-457)||(29350823-29351044)
chr5 (233-454)||(36154827-36155043)
chr5 (233-428)||(39363310-39363502)
chr5 (257-428)||(36314504-36314675)
chr5 (233-429)||(20902053-20902248)
chr5 (269-457)||(20918028-20918212)
chr5 (244-453)||(18319089-18319293)
chr5 (244-456)||(23064408-23064618)
chr5 (244-456)||(31060967-31061175)
chr5 (80-381)||(22178066-22178363)
chr5 (287-572)||(26703860-26704139)
chr5 (287-572)||(26973593-26973872)
chr5 (176-426)||(40725782-40726032)
chr5 (244-456)||(38619328-38619541)
chr5 (244-454)||(24067009-24067214)
chr5 (399-575)||(23201139-23201312)
chr5 (269-575)||(21873034-21873336)
chr5 (298-456)||(20806850-20807005)
chr5 (399-537)||(23571893-23572029)
chr5 (1-180)||(21741312-21741492)
chr5 (187-457)||(22143951-22144217)
chr5 (390-575)||(14078929-14079112)
chr5 (287-428)||(17517254-17517400)
chr5 (390-575)||(18770158-18770341)
chr5 (287-575)||(22032102-22032387)
chr5 (446-575)||(23511880-23512006)
chr5 (492-575)||(23064309-23064391)
chr5 (492-575)||(36314332-36314415)
chr5 (501-575)||(38619272-38619345)
chr5 (498-575)||(26740915-26740991)
chr5 (491-575)||(20902247-20902331)
chr5 (492-575)||(31060825-31060907)
chr5 (395-505)||(23501515-23501624)
chr5 (199-306)||(29448052-29448159)
chr5 (1-89)||(5888944-5889033)
chr5 (492-575)||(40725609-40725691)
chr5 (492-575)||(41095900-41095982)
chr5 (392-454)||(14047984-14048046)
chr5 (502-575)||(20807032-20807104)
chr5 (390-575)||(21366818-21366999)
chr5 (498-575)||(22178491-22178567)
chr5 (492-575)||(39363182-39363265)
chr5 (498-575)||(20027212-20027287)
chr5 (498-575)||(2154939-2155015)
chr5 (502-575)||(17517454-17517527)
chr5 (498-575)||(21732198-21732274)
chr5 (498-575)||(21809849-21809925)
chr5 (286-339)||(26732884-26732937)
chr5 (498-575)||(27989200-27989275)
chr5 (1-105)||(22144299-22144402)
chr5 (389-428)||(18418528-18418567)
chr5 (256-341)||(18418594-18418678)
chr5 (501-575)||(22959805-22959877)
chr5 (286-381)||(26740697-26740787)
chr5 (492-555)||(31060888-31060950)
chr5 (492-555)||(36314396-36314459)
chr5 (492-555)||(40725672-40725735)
chr5 (492-555)||(40725716-40725779)
chr5 (492-555)||(41095857-41095919)
chr5 (410-531)||(17919320-17919439)
chr5 (501-575)||(18418312-18418386)
chr5 (501-555)||(18418464-18418518)
chr5 (3-105)||(21871342-21871444)
chr5 (3-105)||(21875622-21875724)
chr5 (501-555)||(23064372-23064425)
chr5 (501-555)||(39363246-39363300)
chr5 (498-575)||(14047882-14047958)
chr5 (498-575)||(20918272-20918348)
chr5 (498-575)||(23469577-23469653)
chr5 (498-575)||(25574735-25574811)
chr5 (309-381)||(27989004-27989071)
chr5 (393-449)||(41095692-41095747)
chr5 (492-555)||(18418420-18418483)
chr5 (516-575)||(21877314-21877371)
chr5 (516-575)||(21887069-21887126)
chr5 (1-55)||(11581014-11581068)
chr5 (501-570)||(19668675-19668742)
chr5 (80-149)||(27988776-27988845)
chr5 (1-55)||(36154597-36154651)
chr5 (501-555)||(36314440-36314494)
chr5 (410-531)||(123480-123599)
chr5 (498-575)||(11581526-11581602)
chr5 (232-289)||(20766118-20766174)
chr5 (186-247)||(21741486-21741545)
chr5 (498-531)||(22143864-22143897)
chr5 (287-336)||(23469822-23469871)
chr5 (503-555)||(18418376-18418428)
chr5 (1-129)||(25743945-25744073)
chr5 (503-555)||(31060931-31060982)
chr5 (186-269)||(10753603-10753685)
chr5 (236-306)||(18356364-18356432)
chr5 (501-575)||(21502432-21502504)
chr5 (186-269)||(21871525-21871607)
chr5 (186-269)||(21875805-21875887)
chr5 (186-269)||(22120149-22120231)
chr5 (1-44)||(23390266-23390309)
chr5 (498-529)||(26012309-26012340)
chr5 (419-486)||(33895953-33896020)
chr5 (186-217)||(36314685-36314716)
chr5 (1-55)||(1096765-1096819)
chr5 (410-472)||(1859151-1859212)
chr5 (410-472)||(23458469-23458530)
chr5 (410-472)||(23462730-23462791)
chr5 (498-575)||(16227257-16227332)
chr5 (542-575)||(18319319-18319352)
chr5 (287-328)||(20805575-20805616)
chr5 (287-336)||(21328268-21328317)
chr5 (287-332)||(21731514-21731559)
chr5 (287-332)||(21809634-21809679)
chr5 (498-575)||(22411948-22412023)
chr5 (542-575)||(24066951-24066984)
chr5 (498-575)||(25578301-25578377)
chr5 (410-475)||(27989100-27989163)
chr5 (498-575)||(29329695-29329771)
chr5 (518-555)||(41095753-41095790)
chr5 (287-351)||(18770054-18770118)
chr5 (288-328)||(20766997-20767037)
chr5 (287-351)||(23201360-23201424)
chr5 (287-351)||(23501408-23501472)
chr5 (292-328)||(26680605-26680641)
chr5 (292-328)||(26952212-26952248)
[»] chr3 (201 HSPs)
chr3 (1-575)||(13210096-13210668)
chr3 (236-575)||(12398990-12399328)
chr3 (236-575)||(20698437-20698776)
chr3 (236-575)||(17487638-17487975)
chr3 (236-575)||(17499120-17499457)
chr3 (236-575)||(23083363-23083700)
chr3 (1-476)||(15470809-15471277)
chr3 (236-575)||(43840714-43841051)
chr3 (236-575)||(18438316-18438653)
chr3 (233-575)||(25476384-25476722)
chr3 (233-575)||(40213720-40214059)
chr3 (234-575)||(14972640-14972975)
chr3 (1-369)||(14234473-14234843)
chr3 (236-515)||(13442115-13442393)
chr3 (232-575)||(23274468-23274810)
chr3 (236-515)||(26686729-26687006)
chr3 (255-517)||(11424781-11425040)
chr3 (1-476)||(16097214-16097682)
chr3 (236-531)||(14572417-14572707)
chr3 (176-491)||(24340665-24340980)
chr3 (236-531)||(14576835-14577124)
chr3 (236-457)||(24153211-24153430)
chr3 (256-575)||(30029616-30029939)
chr3 (233-457)||(29172627-29172849)
chr3 (1-381)||(37250935-37251310)
chr3 (62-457)||(16103685-16104071)
chr3 (233-457)||(17463075-17463296)
chr3 (233-457)||(34159223-34159444)
chr3 (193-455)||(43550482-43550744)
chr3 (287-477)||(12510929-12511125)
chr3 (233-457)||(9707651-9707872)
chr3 (233-457)||(16454325-16454546)
chr3 (233-457)||(28848655-28848876)
chr3 (233-457)||(13151834-13152056)
chr3 (233-457)||(13154299-13154521)
chr3 (233-457)||(8898991-8899212)
chr3 (233-457)||(38961935-38962157)
chr3 (233-457)||(45606951-45607172)
chr3 (238-457)||(55500839-55501055)
chr3 (232-457)||(36166494-36166716)
chr3 (233-457)||(17446699-17446919)
chr3 (232-457)||(21618345-21618567)
chr3 (233-457)||(6469178-6469395)
chr3 (233-457)||(16282855-16283076)
chr3 (437-575)||(14682162-14682300)
chr3 (233-454)||(7781391-7781609)
chr3 (232-456)||(27165147-27165370)
chr3 (233-457)||(10247767-10247988)
chr3 (1-476)||(32307564-32308021)
chr3 (123-476)||(12174152-12174485)
chr3 (437-575)||(14670640-14670778)
chr3 (415-559)||(10542621-10542764)
chr3 (233-457)||(15977409-15977633)
chr3 (244-456)||(15412326-15412536)
chr3 (1-457)||(22110119-22110569)
chr3 (436-575)||(10542852-10542990)
chr3 (233-428)||(55476417-55476609)
chr3 (287-575)||(15878104-15878388)
chr3 (299-456)||(45577947-45578102)
chr3 (245-431)||(53301562-53301747)
chr3 (1-476)||(49667852-49668310)
chr3 (244-449)||(8499422-8499625)
chr3 (232-456)||(10556882-10557105)
chr3 (176-427)||(37642207-37642458)
chr3 (233-457)||(41123787-41124005)
chr3 (1-247)||(1465178-1465423)
chr3 (233-428)||(12567479-12567678)
chr3 (233-428)||(13543944-13544143)
chr3 (244-449)||(12119780-12119983)
chr3 (436-559)||(10542747-10542869)
chr3 (233-456)||(50242721-50242940)
chr3 (176-426)||(22147467-22147717)
chr3 (176-457)||(52523669-52523946)
chr3 (291-456)||(28194592-28194755)
chr3 (395-575)||(23408209-23408385)
chr3 (252-456)||(44494708-44494908)
chr3 (62-246)||(49389459-49389642)
chr3 (1-457)||(1644451-1644889)
chr3 (232-337)||(42386428-42386533)
chr3 (252-476)||(9520782-9520998)
chr3 (46-457)||(9512825-9513216)
chr3 (294-456)||(17737135-17737294)
chr3 (233-352)||(17672626-17672744)
chr3 (287-428)||(46822187-46822333)
chr3 (1-162)||(12934079-12934241)
chr3 (390-575)||(15067462-15067645)
chr3 (287-575)||(14878569-14878853)
chr3 (287-575)||(855919-856204)
chr3 (330-575)||(16796078-16796339)
chr3 (511-575)||(26683136-26683200)
chr3 (1-115)||(12171873-12171988)
chr3 (49-196)||(43927291-43927438)
chr3 (287-535)||(23077530-23077776)
chr3 (193-476)||(43925845-43926121)
chr3 (390-537)||(16369216-16369362)
chr3 (492-575)||(8499316-8499398)
chr3 (492-575)||(15412227-15412309)
chr3 (233-336)||(53070697-53070799)
chr3 (492-575)||(53301789-53301871)
chr3 (492-575)||(27165048-27165130)
chr3 (1-107)||(324481-324587)
chr3 (390-575)||(12172578-12172758)
chr3 (492-575)||(10556783-10556865)
chr3 (492-575)||(43550807-43550890)
chr3 (501-575)||(13543773-13543847)
chr3 (501-575)||(15076258-15076332)
chr3 (498-575)||(23318984-23319060)
chr3 (492-575)||(12120050-12120131)
chr3 (492-575)||(22147808-22147890)
chr3 (492-575)||(28194493-28194575)
chr3 (492-575)||(46822015-46822098)
chr3 (492-575)||(50242622-50242704)
chr3 (492-575)||(55476289-55476372)
chr3 (176-294)||(2051141-2051260)
chr3 (498-575)||(315895-315971)
chr3 (46-162)||(9521074-9521191)
chr3 (390-575)||(11862575-11862756)
chr3 (498-575)||(15206710-15206786)
chr3 (498-575)||(15245792-15245868)
chr3 (390-575)||(18384069-18384250)
chr3 (492-575)||(17736993-17737075)
chr3 (492-555)||(22147720-22147783)
chr3 (390-535)||(23053243-23053387)
chr3 (492-575)||(37642518-37642601)
chr3 (492-555)||(43550763-43550826)
chr3 (492-575)||(44494566-44494648)
chr3 (390-499)||(15051362-15051471)
chr3 (501-555)||(46822123-46822177)
chr3 (498-575)||(10562556-10562632)
chr3 (228-336)||(12377940-12378050)
chr3 (536-575)||(13442099-13442138)
chr3 (492-555)||(22147764-22147827)
chr3 (492-555)||(46822079-46822142)
chr3 (501-575)||(52524003-52524075)
chr3 (390-479)||(322466-322555)
chr3 (233-381)||(606324-606468)
chr3 (501-555)||(10556846-10556899)
chr3 (432-575)||(11849097-11849235)
chr3 (501-555)||(15076170-15076224)
chr3 (501-555)||(15412290-15412343)
chr3 (1-55)||(17248055-17248109)
chr3 (501-555)||(27165111-27165164)
chr3 (498-575)||(42386194-42386269)
chr3 (501-555)||(43550728-43550782)
chr3 (501-555)||(53301755-53301808)
chr3 (501-555)||(55476353-55476407)
chr3 (498-575)||(8898855-8898931)
chr3 (498-575)||(13919141-13919217)
chr3 (285-334)||(13919350-13919399)
chr3 (390-575)||(19726055-19726236)
chr3 (498-575)||(21618251-21618327)
chr3 (498-575)||(24153447-24153523)
chr3 (498-575)||(36166357-36166433)
chr3 (410-475)||(42386306-42386369)
chr3 (1-54)||(53070467-53070520)
chr3 (501-575)||(1644947-1645019)
chr3 (492-555)||(12120007-12120069)
chr3 (492-555)||(15076205-15076268)
chr3 (492-555)||(17737056-17737118)
chr3 (501-555)||(8499379-8499432)
chr3 (501-555)||(13543837-13543891)
chr3 (292-354)||(14665398-14665460)
chr3 (498-575)||(17661146-17661221)
chr3 (505-555)||(28194556-28194605)
chr3 (501-575)||(43925735-43925806)
chr3 (1-55)||(52523496-52523550)
chr3 (530-575)||(11425009-11425054)
chr3 (412-457)||(14234382-14234426)
chr3 (498-575)||(15264913-15264989)
chr3 (498-575)||(16283136-16283212)
chr3 (498-575)||(17446979-17447055)
chr3 (1-54)||(42386710-42386763)
chr3 (498-537)||(323869-323908)
chr3 (390-479)||(11298684-11298773)
chr3 (186-269)||(14501207-14501290)
chr3 (1-68)||(14572873-14572940)
chr3 (186-269)||(19776007-19776089)
chr3 (186-269)||(37439421-37439503)
chr3 (516-555)||(44494629-44494668)
chr3 (288-334)||(9577646-9577691)
chr3 (410-472)||(11557562-11557623)
chr3 (410-472)||(12038126-12038187)
chr3 (501-555)||(12119973-12120026)
chr3 (292-354)||(14668554-14668616)
chr3 (501-531)||(16103598-16103628)
chr3 (501-555)||(17737099-17737152)
chr3 (501-555)||(50242685-50242738)
chr3 (1-38)||(606136-606173)
chr3 (287-328)||(11298580-11298621)
chr3 (410-479)||(12496131-12496199)
chr3 (502-555)||(13543881-13543933)
chr3 (287-336)||(15246037-15246086)
chr3 (542-575)||(18700812-18700845)
chr3 (530-575)||(24340974-24341019)
chr3 (542-575)||(42353622-42353655)
chr3 (498-559)||(43890037-43890097)
chr3 (542-575)||(43890122-43890155)
chr3 (292-328)||(3389994-3390030)
chr3 (542-574)||(14441178-14441210)
chr3 (287-351)||(17525211-17525275)
chr3 (2-46)||(23083132-23083176)
[»] chr4 (165 HSPs)
chr4 (236-575)||(12902539-12902876)
chr4 (236-575)||(7798556-7798893)
chr4 (233-575)||(16377522-16377860)
chr4 (236-575)||(7893484-7893822)
chr4 (236-575)||(22636217-22636554)
chr4 (236-575)||(44052610-44052948)
chr4 (1-476)||(39706056-39706529)
chr4 (62-510)||(15551663-15552105)
chr4 (236-575)||(16239972-16240309)
chr4 (255-575)||(14053323-14053642)
chr4 (236-573)||(23374361-23374691)
chr4 (284-575)||(17046267-17046559)
chr4 (263-515)||(3096134-3096385)
chr4 (236-515)||(16270238-16270515)
chr4 (57-369)||(12288033-12288340)
chr4 (236-453)||(52873369-52873585)
chr4 (232-457)||(54798752-54798976)
chr4 (233-517)||(14038498-14038770)
chr4 (233-457)||(18215318-18215540)
chr4 (232-454)||(14280215-14280435)
chr4 (233-454)||(12351-12569)
chr4 (233-457)||(15118396-15118617)
chr4 (233-457)||(44773131-44773352)
chr4 (233-457)||(44928923-44929146)
chr4 (233-457)||(50222383-50222604)
chr4 (233-457)||(52312407-52312628)
chr4 (1-476)||(12773895-12774351)
chr4 (233-457)||(18239463-18239684)
chr4 (233-457)||(44615185-44615406)
chr4 (2-386)||(8846328-8846725)
chr4 (244-457)||(15355380-15355591)
chr4 (233-457)||(1837553-1837774)
chr4 (80-476)||(13697-14086)
chr4 (244-456)||(15369918-15370128)
chr4 (330-575)||(17048409-17048648)
chr4 (232-457)||(8574867-8575088)
chr4 (244-456)||(15371102-15371312)
chr4 (294-457)||(7641286-7641447)
chr4 (1-247)||(15099457-15099702)
chr4 (244-455)||(15367591-15367800)
chr4 (233-456)||(51463912-51464131)
chr4 (3-247)||(15190424-15190667)
chr4 (236-400)||(7088832-7088996)
chr4 (244-456)||(15373383-15373593)
chr4 (244-456)||(15402603-15402813)
chr4 (244-455)||(16223433-16223642)
chr4 (59-381)||(53081976-53082294)
chr4 (236-438)||(6899808-6900009)
chr4 (59-476)||(43198381-43198787)
chr4 (49-460)||(46640272-46640675)
chr4 (240-456)||(23803316-23803528)
chr4 (233-453)||(44102114-44102332)
chr4 (294-456)||(12610849-12611008)
chr4 (233-428)||(19618216-19618415)
chr4 (233-428)||(14970751-14970950)
chr4 (399-575)||(13569282-13569454)
chr4 (390-575)||(44675411-44675594)
chr4 (46-317)||(16596686-16596953)
chr4 (390-575)||(12569795-12569977)
chr4 (390-575)||(15125196-15125379)
chr4 (233-449)||(22353740-22353955)
chr4 (390-575)||(23843257-23843440)
chr4 (176-386)||(52243136-52243343)
chr4 (244-454)||(20149731-20149936)
chr4 (233-369)||(3514990-3515125)
chr4 (233-369)||(19242683-19242817)
chr4 (390-575)||(15093555-15093737)
chr4 (390-575)||(15121955-15122138)
chr4 (501-575)||(22353588-22353662)
chr4 (492-575)||(15705171-15705253)
chr4 (498-575)||(13592417-13592493)
chr4 (498-575)||(14825244-14825320)
chr4 (404-457)||(29267517-29267570)
chr4 (492-575)||(12610707-12610789)
chr4 (492-575)||(14971083-14971166)
chr4 (492-575)||(19242472-19242554)
chr4 (233-336)||(21815629-21815731)
chr4 (492-575)||(51464148-51464230)
chr4 (255-336)||(6190481-6190563)
chr4 (498-575)||(17333052-17333128)
chr4 (390-575)||(16348817-16348997)
chr4 (492-575)||(19618504-19618588)
chr4 (446-575)||(16488287-16488411)
chr4 (492-575)||(23803631-23803713)
chr4 (498-575)||(14122-14197)
chr4 (498-575)||(12288482-12288557)
chr4 (501-575)||(15367448-15367521)
chr4 (501-575)||(15369776-15369849)
chr4 (498-575)||(15791459-15791535)
chr4 (498-575)||(53082424-53082499)
chr4 (412-476)||(14927911-14927973)
chr4 (408-575)||(5339149-5339311)
chr4 (492-555)||(19242535-19242598)
chr4 (501-575)||(39706568-39706640)
chr4 (501-575)||(15373284-15373357)
chr4 (229-275)||(15464926-15464972)
chr4 (501-555)||(19242579-19242633)
chr4 (1-55)||(44928692-44928746)
chr4 (1-55)||(52242962-52243016)
chr4 (498-575)||(52243467-52243542)
chr4 (534-575)||(14038484-14038525)
chr4 (530-575)||(16270486-16270531)
chr4 (287-575)||(16357004-16357285)
chr4 (498-575)||(18215601-18215676)
chr4 (1-54)||(21815071-21815124)
chr4 (1-54)||(21815400-21815453)
chr4 (1-54)||(21818493-21818546)
chr4 (498-575)||(46640689-46640764)
chr4 (96-164)||(14164739-14164807)
chr4 (492-556)||(23803545-23803608)
chr4 (536-575)||(3096118-3096157)
chr4 (492-555)||(12610770-12610832)
chr4 (498-569)||(14853143-14853213)
chr4 (492-555)||(22353652-22353715)
chr4 (492-555)||(23803588-23803650)
chr4 (501-555)||(14970960-14971014)
chr4 (501-555)||(14971048-14971102)
chr4 (1-55)||(15464698-15464752)
chr4 (501-555)||(19618469-19618523)
chr4 (501-555)||(22353696-22353750)
chr4 (498-574)||(14157624-14157698)
chr4 (285-334)||(17333298-17333347)
chr4 (498-575)||(26045564-26045640)
chr4 (498-575)||(26050745-26050821)
chr4 (502-575)||(37018460-37018532)
chr4 (498-575)||(44102055-44102131)
chr4 (542-575)||(52873568-52873601)
chr4 (498-575)||(54799037-54799113)
chr4 (96-164)||(14158034-14158102)
chr4 (501-569)||(15371009-15371076)
chr4 (501-565)||(15402514-15402577)
chr4 (186-269)||(630728-630810)
chr4 (389-472)||(631134-631216)
chr4 (186-269)||(3331970-3332052)
chr4 (186-269)||(13812763-13812845)
chr4 (186-269)||(14953915-14953997)
chr4 (501-556)||(23803511-23803565)
chr4 (186-269)||(25690146-25690228)
chr4 (1-39)||(13618-13656)
chr4 (501-555)||(12610813-12610866)
chr4 (411-457)||(14157753-14157798)
chr4 (411-457)||(14164458-14164503)
chr4 (410-472)||(15353485-15353546)
chr4 (501-555)||(15369839-15369892)
chr4 (501-555)||(15369882-15369935)
chr4 (501-555)||(15371066-15371119)
chr4 (501-555)||(15373347-15373400)
chr4 (501-555)||(15402567-15402620)
chr4 (501-555)||(15705234-15705287)
chr4 (501-555)||(19618425-19618479)
chr4 (1-55)||(44102508-44102562)
chr4 (501-555)||(51464114-51464167)
chr4 (542-575)||(12773864-12773897)
chr4 (390-482)||(13813172-13813264)
chr4 (542-575)||(14280113-14280146)
chr4 (502-555)||(14971005-14971058)
chr4 (498-575)||(15355608-15355684)
chr4 (287-328)||(16348716-16348757)
chr4 (400-449)||(19242623-19242672)
chr4 (542-575)||(20149629-20149662)
chr4 (542-575)||(35812575-35812608)
chr4 (498-575)||(52312271-52312347)
chr4 (292-328)||(11250619-11250655)
chr4 (292-328)||(15353365-15353401)
chr4 (412-476)||(52243369-52243431)
[»] scaffold0011 (5 HSPs)
scaffold0011 (236-575)||(167980-168318)
scaffold0011 (236-575)||(51695-52032)
scaffold0011 (498-575)||(38385-38461)
scaffold0011 (498-537)||(125542-125581)
scaffold0011 (287-336)||(38204-38253)
[»] scaffold0034 (7 HSPs)
scaffold0034 (1-476)||(32419-32888)
scaffold0034 (436-575)||(116697-116835)
scaffold0034 (438-559)||(116818-116938)
scaffold0034 (436-559)||(116923-117044)
scaffold0034 (433-517)||(117025-117108)
scaffold0034 (498-575)||(32308-32383)
scaffold0034 (255-336)||(51904-51985)
[»] chr2 (137 HSPs)
chr2 (236-575)||(23060294-23060632)
chr2 (236-575)||(23654388-23654727)
chr2 (186-575)||(23071905-23072290)
chr2 (292-567)||(23040247-23040522)
chr2 (255-575)||(38136-38456)
chr2 (238-575)||(22731238-22731573)
chr2 (232-575)||(22336907-22337238)
chr2 (233-575)||(23103396-23103735)
chr2 (277-575)||(8946438-8946735)
chr2 (341-575)||(21900560-21900794)
chr2 (236-575)||(22738182-22738518)
chr2 (1-457)||(28405881-28406331)
chr2 (1-457)||(25175754-25176194)
chr2 (236-518)||(20308945-20309225)
chr2 (236-515)||(23076288-23076561)
chr2 (186-511)||(19671675-19671998)
chr2 (1-457)||(7500-7950)
chr2 (1-453)||(18786670-18787116)
chr2 (233-457)||(18808840-18809061)
chr2 (233-457)||(23135487-23135708)
chr2 (1-381)||(23207256-23207631)
chr2 (233-457)||(23712057-23712278)
chr2 (233-457)||(26505276-26505497)
chr2 (233-457)||(26507754-26507975)
chr2 (233-457)||(39682210-39682431)
chr2 (233-457)||(6725892-6726113)
chr2 (233-457)||(24367670-24367892)
chr2 (233-457)||(24905676-24905898)
chr2 (233-457)||(24908151-24908373)
chr2 (233-457)||(571294-571515)
chr2 (233-457)||(23709576-23709797)
chr2 (233-457)||(24529573-24529795)
chr2 (236-439)||(23659940-23660141)
chr2 (233-457)||(24898239-24898461)
chr2 (233-457)||(24900722-24900944)
chr2 (233-457)||(24903199-24903421)
chr2 (233-457)||(28576996-28577217)
chr2 (233-457)||(45029898-45030119)
chr2 (233-448)||(22105319-22105531)
chr2 (233-457)||(21155104-21155325)
chr2 (233-457)||(32039542-32039763)
chr2 (233-428)||(23130788-23130980)
chr2 (233-428)||(23133255-23133447)
chr2 (233-428)||(34402566-34402758)
chr2 (233-449)||(43137204-43137417)
chr2 (294-457)||(24643054-24643216)
chr2 (291-575)||(22741021-22741301)
chr2 (188-476)||(7679462-7679750)
chr2 (59-381)||(23791252-23791570)
chr2 (236-456)||(298816-299034)
chr2 (278-402)||(23285818-23285942)
chr2 (233-456)||(38967272-38967493)
chr2 (1-476)||(22133984-22134446)
chr2 (233-428)||(32214965-32215164)
chr2 (176-386)||(23708561-23708769)
chr2 (390-575)||(22758874-22759056)
chr2 (59-336)||(25108906-25109184)
chr2 (287-575)||(22799179-22799463)
chr2 (49-270)||(22459377-22459598)
chr2 (236-428)||(25616107-25616304)
chr2 (390-575)||(23019861-23020043)
chr2 (390-575)||(24673346-24673530)
chr2 (390-575)||(40622365-40622548)
chr2 (390-575)||(45678283-45678466)
chr2 (176-575)||(22413078-22413483)
chr2 (390-575)||(24679963-24680147)
chr2 (390-575)||(25963869-25964049)
chr2 (186-381)||(20520145-20520335)
chr2 (501-575)||(299060-299133)
chr2 (435-517)||(23657632-23657713)
chr2 (492-575)||(23130660-23130743)
chr2 (492-575)||(23133127-23133210)
chr2 (492-575)||(32215253-32215336)
chr2 (492-575)||(34402803-34402886)
chr2 (492-575)||(43137054-43137136)
chr2 (501-575)||(25616023-25616097)
chr2 (498-575)||(23004560-23004636)
chr2 (530-575)||(23076272-23076317)
chr2 (498-575)||(43947598-43947674)
chr2 (410-575)||(22812087-22812246)
chr2 (498-575)||(18787174-18787249)
chr2 (255-336)||(32451949-32452031)
chr2 (285-334)||(23287384-23287433)
chr2 (176-273)||(24697548-24697644)
chr2 (492-561)||(32215209-32215278)
chr2 (390-575)||(37524466-37524647)
chr2 (498-575)||(39828227-39828303)
chr2 (503-575)||(22105126-22105197)
chr2 (286-334)||(26392403-26392451)
chr2 (410-457)||(23713058-23713104)
chr2 (492-575)||(38967173-38967255)
chr2 (498-575)||(20520425-20520500)
chr2 (227-381)||(23004727-23004878)
chr2 (501-555)||(23130724-23130778)
chr2 (501-555)||(23133191-23133245)
chr2 (1-55)||(23708387-23708441)
chr2 (501-555)||(34402768-34402822)
chr2 (410-531)||(40428283-40428402)
chr2 (498-575)||(21115515-21115591)
chr2 (410-575)||(21318813-21318973)
chr2 (530-575)||(23657618-23657663)
chr2 (498-575)||(23712338-23712414)
chr2 (498-575)||(24688560-24688635)
chr2 (498-575)||(26392195-26392271)
chr2 (433-575)||(21237546-21237684)
chr2 (1-68)||(23076726-23076793)
chr2 (498-575)||(8004-8079)
chr2 (501-555)||(32215174-32215228)
chr2 (485-555)||(43137117-43137186)
chr2 (498-575)||(6725756-6725832)
chr2 (498-575)||(23791048-23791123)
chr2 (498-531)||(25108734-25108767)
chr2 (498-531)||(25175667-25175700)
chr2 (186-269)||(1283666-1283748)
chr2 (287-334)||(23038048-23038095)
chr2 (186-269)||(30344776-30344858)
chr2 (500-575)||(34136714-34136788)
chr2 (501-555)||(299017-299070)
chr2 (410-479)||(21327744-21327812)
chr2 (1-51)||(22412903-22412953)
chr2 (410-472)||(24174678-24174739)
chr2 (410-472)||(24655516-24655577)
chr2 (501-531)||(28405794-28405824)
chr2 (501-555)||(38967236-38967289)
chr2 (1-46)||(298584-298629)
chr2 (287-336)||(9241945-9241994)
chr2 (415-476)||(10822795-10822854)
chr2 (542-575)||(17306355-17306388)
chr2 (498-575)||(18547216-18547292)
chr2 (530-575)||(19671655-19671700)
chr2 (428-457)||(23004653-23004682)
chr2 (498-575)||(24529856-24529932)
chr2 (292-328)||(24655396-24655432)
chr2 (292-328)||(24869903-24869939)
chr2 (292-328)||(25961592-25961628)
chr2 (2-38)||(31756232-31756268)
chr2 (287-351)||(40622263-40622327)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (1-575)||(33903-34473)
scaffold0175 (299-575)||(55-329)
scaffold0175 (236-303)||(13144-13211)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (236-575)||(12994-13330)
[»] chr1 (138 HSPs)
chr1 (236-575)||(27250731-27251069)
chr1 (236-575)||(34509562-34509899)
chr1 (236-575)||(22532051-22532388)
chr1 (233-575)||(50210212-50210557)
chr1 (253-540)||(20847173-20847459)
chr1 (280-575)||(38801433-38801728)
chr1 (1-476)||(22921636-22922104)
chr1 (1-476)||(33680892-33681361)
chr1 (236-575)||(20134963-20135306)
chr1 (1-476)||(22237512-22237982)
chr1 (1-476)||(52927750-52928206)
chr1 (341-575)||(21477424-21477656)
chr1 (1-381)||(21861337-21861712)
chr1 (193-455)||(45574846-45575108)
chr1 (234-457)||(31612209-31612430)
chr1 (59-476)||(21896084-21896491)
chr1 (236-575)||(22468698-22469039)
chr1 (1-457)||(20248184-20248629)
chr1 (233-457)||(13988763-13988984)
chr1 (233-457)||(21923335-21923556)
chr1 (233-457)||(23593779-23594000)
chr1 (186-428)||(14295507-14295745)
chr1 (233-457)||(21475131-21475352)
chr1 (233-457)||(29298034-29298254)
chr1 (1-476)||(21753933-21754388)
chr1 (59-476)||(16368112-16368520)
chr1 (287-575)||(21714327-21714610)
chr1 (330-574)||(22131180-22131418)
chr1 (241-457)||(22123119-22123333)
chr1 (233-449)||(29776592-29776806)
chr1 (330-575)||(48603048-48603288)
chr1 (4-247)||(49261448-49261690)
chr1 (1-247)||(35981455-35981700)
chr1 (49-381)||(41049851-41050178)
chr1 (193-454)||(21711608-21711867)
chr1 (1-248)||(20636956-20637202)
chr1 (1-339)||(20918620-20918954)
chr1 (193-449)||(21707071-21707325)
chr1 (59-336)||(50613942-50614219)
chr1 (59-336)||(50621770-50622047)
chr1 (4-381)||(50686590-50686963)
chr1 (233-415)||(432950-433128)
chr1 (244-428)||(13212917-13213099)
chr1 (233-428)||(21840686-21840885)
chr1 (244-456)||(21346858-21347068)
chr1 (244-456)||(21341994-21342203)
chr1 (233-429)||(16361835-16362035)
chr1 (236-386)||(21026649-21026799)
chr1 (397-513)||(20916070-20916185)
chr1 (244-454)||(40389056-40389261)
chr1 (244-445)||(16275419-16275616)
chr1 (287-575)||(42865266-42865551)
chr1 (399-575)||(21788208-21788381)
chr1 (287-428)||(20454606-20454752)
chr1 (333-453)||(27161605-27161724)
chr1 (176-476)||(35261023-35261313)
chr1 (135-486)||(21161592-21161932)
chr1 (49-157)||(12271744-12271852)
chr1 (390-575)||(6151628-6151811)
chr1 (177-369)||(16758640-16758828)
chr1 (390-575)||(22831539-22831719)
chr1 (492-575)||(13213144-13213227)
chr1 (492-575)||(16361708-16361791)
chr1 (492-575)||(29776440-29776523)
chr1 (395-575)||(20091636-20091810)
chr1 (244-369)||(15860064-15860187)
chr1 (492-575)||(14295834-14295917)
chr1 (492-575)||(21840428-21840510)
chr1 (390-536)||(18182274-18182418)
chr1 (186-306)||(22130863-22130978)
chr1 (492-575)||(20454840-20454922)
chr1 (410-575)||(22449441-22449600)
chr1 (498-573)||(50686425-50686499)
chr1 (175-336)||(16093825-16093987)
chr1 (518-575)||(16275712-16275769)
chr1 (498-575)||(50622216-50622291)
chr1 (492-575)||(21341894-21341977)
chr1 (492-575)||(21346758-21346841)
chr1 (503-575)||(45575182-45575254)
chr1 (492-575)||(15860314-15860396)
chr1 (498-573)||(21534140-21534214)
chr1 (501-575)||(33680781-33680853)
chr1 (411-457)||(431655-431701)
chr1 (498-575)||(26064713-26064788)
chr1 (501-555)||(45575092-45575146)
chr1 (390-575)||(3473076-3473257)
chr1 (498-575)||(41050307-41050382)
chr1 (498-575)||(50614388-50614463)
chr1 (186-476)||(26064824-26065107)
chr1 (1-116)||(28194217-28194333)
chr1 (410-531)||(8761803-8761924)
chr1 (501-575)||(20248056-20248128)
chr1 (492-555)||(21840578-21840641)
chr1 (501-575)||(22922143-22922215)
chr1 (492-555)||(45575127-45575190)
chr1 (501-555)||(13213109-13213163)
chr1 (501-555)||(14295755-14295809)
chr1 (501-555)||(20454762-20454816)
chr1 (501-575)||(21043555-21043628)
chr1 (501-555)||(21840622-21840676)
chr1 (1-55)||(26065238-26065292)
chr1 (501-555)||(29776504-29776558)
chr1 (505-575)||(47190412-47190481)
chr1 (498-575)||(16758428-16758500)
chr1 (491-555)||(16361772-16361836)
chr1 (491-555)||(21341958-21342021)
chr1 (491-555)||(21346822-21346885)
chr1 (186-280)||(51130639-51130729)
chr1 (492-555)||(14295790-14295853)
chr1 (501-575)||(21753822-21753894)
chr1 (390-486)||(17678739-17678835)
chr1 (501-555)||(29776548-29776602)
chr1 (5-51)||(35260852-35260898)
chr1 (505-575)||(52954595-52954664)
chr1 (498-559)||(431578-431638)
chr1 (1-150)||(16381388-16381537)
chr1 (501-573)||(22237403-22237473)
chr1 (1-48)||(433312-433359)
chr1 (186-269)||(1924914-1924996)
chr1 (492-555)||(15860271-15860333)
chr1 (492-555)||(20454797-20454859)
chr1 (536-575)||(20916052-20916091)
chr1 (186-269)||(20923928-20924010)
chr1 (285-336)||(21533923-21533974)
chr1 (492-555)||(21840535-21840597)
chr1 (498-537)||(48520146-48520185)
chr1 (1-55)||(16758949-16759003)
chr1 (292-354)||(24783150-24783212)
chr1 (542-575)||(431520-431553)
chr1 (233-270)||(12271639-12271676)
chr1 (400-449)||(15860198-15860247)
chr1 (542-575)||(16059466-16059499)
chr1 (498-575)||(22123393-22123468)
chr1 (542-575)||(23967530-23967563)
chr1 (542-575)||(27161831-27161864)
chr1 (542-575)||(29297898-29297931)
chr1 (503-555)||(16275655-16275706)
chr1 (287-339)||(20958124-20958176)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (285-575)||(31848-32137)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (236-573)||(4633-4968)
[»] scaffold0046 (6 HSPs)
scaffold0046 (236-575)||(28194-28533)
scaffold0046 (120-575)||(1777-2228)
scaffold0046 (302-575)||(4332-4605)
scaffold0046 (62-395)||(11252-11581)
scaffold0046 (498-575)||(26336-26412)
scaffold0046 (498-575)||(17187-17263)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (236-575)||(8535-8868)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-460)||(10426-10880)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (236-575)||(1730-2071)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (264-575)||(4493-4803)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (233-575)||(17214-17560)
scaffold0056 (287-575)||(14139-14424)
scaffold0056 (233-336)||(79328-79430)
scaffold0056 (10-54)||(79107-79151)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (255-575)||(11464-11784)
[»] scaffold0023 (17 HSPs)
scaffold0023 (283-575)||(119656-119948)
scaffold0023 (1-457)||(39941-40391)
scaffold0023 (66-457)||(100278-100662)
scaffold0023 (233-457)||(94308-94529)
scaffold0023 (233-457)||(44351-44573)
scaffold0023 (233-348)||(17484-17598)
scaffold0023 (279-457)||(101404-101576)
scaffold0023 (291-575)||(38536-38816)
scaffold0023 (62-149)||(101599-101685)
scaffold0023 (492-575)||(17935-18018)
scaffold0023 (492-555)||(17891-17954)
scaffold0023 (492-555)||(17847-17910)
scaffold0023 (501-555)||(17812-17866)
scaffold0023 (389-428)||(17763-17802)
scaffold0023 (498-575)||(44215-44291)
scaffold0023 (501-575)||(100125-100197)
scaffold0023 (542-575)||(40407-40440)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (277-575)||(13276-13575)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (236-575)||(1633-1970)
scaffold0016 (1-44)||(2159-2202)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (1-475)||(12825-13292)
scaffold0138 (49-273)||(18053-18276)
scaffold0138 (501-575)||(12713-12785)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (236-575)||(3252-3589)
scaffold0292 (236-558)||(143-461)
scaffold0292 (519-575)||(10289-10345)
scaffold0292 (498-575)||(4522-4598)
[»] scaffold0088 (2 HSPs)
scaffold0088 (236-558)||(20707-21030)
scaffold0088 (503-575)||(10097-10169)
[»] scaffold0080 (7 HSPs)
scaffold0080 (236-575)||(39695-40031)
scaffold0080 (1-381)||(19652-20027)
scaffold0080 (390-575)||(18869-19051)
scaffold0080 (428-475)||(20073-20119)
scaffold0080 (186-269)||(48939-49021)
scaffold0080 (1-67)||(40198-40264)
scaffold0080 (287-328)||(18708-18749)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (236-575)||(10427-10765)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (255-573)||(15485-15803)
scaffold0114 (287-575)||(7075-7359)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (229-575)||(8261-8605)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (232-573)||(3149-3484)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (1-369)||(5890-6258)
[»] scaffold0102 (3 HSPs)
scaffold0102 (1-457)||(19166-19618)
scaffold0102 (452-575)||(48662-48783)
scaffold0102 (501-575)||(19036-19108)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (290-575)||(5183-5469)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-457)||(6510-6965)
scaffold0333 (1-457)||(13890-14345)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (233-575)||(339949-340284)
scaffold0003 (233-457)||(158494-158716)
scaffold0003 (410-472)||(414225-414286)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (1-476)||(802-1274)
scaffold0530 (501-575)||(1313-1385)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (289-575)||(4888-5171)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (1-476)||(2412-2879)
[»] scaffold0106 (5 HSPs)
scaffold0106 (286-575)||(1069-1359)
scaffold0106 (287-457)||(15291-15460)
scaffold0106 (284-428)||(7193-7338)
scaffold0106 (498-575)||(19917-19993)
scaffold0106 (498-575)||(15477-15553)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (286-575)||(46775-47065)
[»] scaffold0908 (2 HSPs)
scaffold0908 (233-524)||(3185-3478)
scaffold0908 (530-558)||(3440-3468)
[»] scaffold0621 (3 HSPs)
scaffold0621 (1-457)||(6436-6888)
scaffold0621 (1-476)||(8352-8822)
scaffold0621 (498-531)||(8283-8316)
[»] scaffold0476 (4 HSPs)
scaffold0476 (62-476)||(12647-13058)
scaffold0476 (410-575)||(5376-5535)
scaffold0476 (410-575)||(6571-6730)
scaffold0476 (501-575)||(12536-12608)
[»] scaffold0001 (10 HSPs)
scaffold0001 (5-476)||(160570-161033)
scaffold0001 (244-456)||(85635-85845)
scaffold0001 (233-428)||(501003-501202)
scaffold0001 (492-575)||(500875-500958)
scaffold0001 (501-559)||(85828-85885)
scaffold0001 (492-546)||(85862-85915)
scaffold0001 (501-555)||(500939-500993)
scaffold0001 (501-575)||(160459-160531)
scaffold0001 (508-575)||(204663-204728)
scaffold0001 (410-472)||(422708-422769)
[»] scaffold0556 (3 HSPs)
scaffold0556 (1-276)||(8094-8368)
scaffold0556 (1-476)||(6704-7163)
scaffold0556 (501-575)||(6593-6665)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (236-575)||(128533-128869)
scaffold0031 (287-575)||(65851-66134)
scaffold0031 (233-336)||(20423-20524)
scaffold0031 (1-54)||(20194-20247)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (233-575)||(16599-16935)
scaffold0217 (1-45)||(16369-16413)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (1-476)||(45559-46027)
scaffold0125 (501-531)||(46066-46096)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (284-575)||(51361-51654)
[»] scaffold0021 (8 HSPs)
scaffold0021 (233-575)||(174546-174886)
scaffold0021 (286-515)||(121607-121835)
scaffold0021 (1-336)||(136135-136471)
scaffold0021 (1-336)||(144843-145179)
scaffold0021 (498-575)||(136655-136730)
scaffold0021 (536-575)||(121591-121630)
scaffold0021 (407-457)||(136552-136601)
scaffold0021 (407-452)||(145260-145304)
[»] scaffold0247 (4 HSPs)
scaffold0247 (176-575)||(17969-18366)
scaffold0247 (244-456)||(2184-2394)
scaffold0247 (492-575)||(2411-2492)
scaffold0247 (501-559)||(2377-2434)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (253-575)||(16061-16382)
[»] scaffold0555 (2 HSPs)
scaffold0555 (1-460)||(10309-10762)
scaffold0555 (501-529)||(10779-10807)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (236-493)||(1050-1306)
[»] scaffold0120 (5 HSPs)
scaffold0120 (236-575)||(32959-33292)
scaffold0120 (236-575)||(45713-46046)
scaffold0120 (233-515)||(15955-16235)
scaffold0120 (294-575)||(17389-17664)
scaffold0120 (531-575)||(15939-15983)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (328-575)||(31940-32188)
[»] scaffold0010 (7 HSPs)
scaffold0010 (2-476)||(129791-130258)
scaffold0010 (229-381)||(60710-60858)
scaffold0010 (1-55)||(60482-60536)
scaffold0010 (498-575)||(421-497)
scaffold0010 (501-573)||(129682-129752)
scaffold0010 (500-575)||(6789-6863)
scaffold0010 (288-336)||(666-714)
[»] scaffold0218 (3 HSPs)
scaffold0218 (1-476)||(7844-8308)
scaffold0218 (46-303)||(29093-29348)
scaffold0218 (501-575)||(8347-8419)
[»] scaffold1765 (2 HSPs)
scaffold1765 (45-476)||(971-1391)
scaffold1765 (498-574)||(861-935)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (236-515)||(6123-6404)
scaffold0647 (533-575)||(6378-6420)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (328-575)||(2494-2741)
scaffold0161 (1-280)||(2213-2488)
[»] scaffold0145 (7 HSPs)
scaffold0145 (236-515)||(32783-33060)
scaffold0145 (236-515)||(38602-38879)
scaffold0145 (233-457)||(9645-9867)
scaffold0145 (373-515)||(32317-32458)
scaffold0145 (532-575)||(38586-38629)
scaffold0145 (530-575)||(32301-32346)
scaffold0145 (530-575)||(32767-32812)
[»] scaffold0228 (6 HSPs)
scaffold0228 (232-517)||(4350-4630)
scaffold0228 (232-517)||(11932-12212)
scaffold0228 (232-517)||(21884-22164)
scaffold0228 (534-575)||(21870-21911)
scaffold0228 (534-572)||(4339-4377)
scaffold0228 (534-572)||(11921-11959)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (1-457)||(31-482)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (43-457)||(14506-14916)
scaffold0008 (501-575)||(14974-15046)
scaffold0008 (410-472)||(30918-30979)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (27-476)||(22467-22905)
scaffold0037 (233-448)||(81978-82190)
scaffold0037 (390-575)||(21678-21859)
scaffold0037 (501-575)||(22944-23016)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (232-514)||(25738-26018)
scaffold0026 (232-477)||(39736-39980)
scaffold0026 (530-575)||(25721-25766)
[»] scaffold0628 (2 HSPs)
scaffold0628 (1-476)||(2571-3040)
scaffold0628 (412-476)||(3280-3342)
[»] scaffold0261 (5 HSPs)
scaffold0261 (1-456)||(15563-16011)
scaffold0261 (399-575)||(1119-1292)
scaffold0261 (492-575)||(15465-15546)
scaffold0261 (501-555)||(15527-15580)
scaffold0261 (287-351)||(1339-1403)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (232-505)||(39329-39599)
scaffold0141 (501-575)||(37130-37203)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (232-505)||(75213-75483)
scaffold0049 (501-575)||(77609-77682)
[»] scaffold0598 (2 HSPs)
scaffold0598 (284-518)||(1098-1333)
scaffold0598 (536-575)||(1307-1347)
[»] scaffold0278 (3 HSPs)
scaffold0278 (62-457)||(5547-5934)
scaffold0278 (434-575)||(7344-7482)
scaffold0278 (433-559)||(7463-7585)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (232-457)||(44705-44929)
scaffold0122 (233-348)||(26064-26179)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (319-575)||(27660-27913)
scaffold0130 (232-274)||(27911-27953)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (233-457)||(20644-20865)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (1-457)||(12472-12921)
scaffold0413 (498-575)||(12343-12418)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (1-476)||(7826-8295)
scaffold0507 (498-575)||(8331-8406)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (70-353)||(62200-62479)
scaffold0028 (233-457)||(136577-136798)
scaffold0028 (233-457)||(139046-139267)
scaffold0028 (233-457)||(143984-144205)
scaffold0028 (233-457)||(141515-141736)
scaffold0028 (233-457)||(134108-134329)
scaffold0028 (1-476)||(132545-133005)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (244-457)||(4110-4321)
[»] scaffold0165 (5 HSPs)
scaffold0165 (330-575)||(3298-3539)
scaffold0165 (330-575)||(7361-7603)
scaffold0165 (229-460)||(27744-27969)
scaffold0165 (498-575)||(27983-28058)
scaffold0165 (1-40)||(27487-27526)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (233-457)||(13289-13510)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (233-457)||(37718-37939)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (233-457)||(40297-40518)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (46-298)||(2030-2281)
[»] scaffold0022 (9 HSPs)
scaffold0022 (232-454)||(116328-116548)
scaffold0022 (80-336)||(128817-129072)
scaffold0022 (59-348)||(78328-78617)
scaffold0022 (496-575)||(129201-129279)
scaffold0022 (390-575)||(73920-74101)
scaffold0022 (498-575)||(44377-44452)
scaffold0022 (498-575)||(78098-78173)
scaffold0022 (428-476)||(78208-78255)
scaffold0022 (542-575)||(116221-116254)
[»] scaffold0184 (5 HSPs)
scaffold0184 (186-428)||(1025-1263)
scaffold0184 (492-575)||(1352-1435)
scaffold0184 (501-555)||(1273-1327)
scaffold0184 (492-555)||(1308-1371)
scaffold0184 (292-328)||(4284-4320)
[»] scaffold0040 (4 HSPs)
scaffold0040 (1-381)||(103406-103773)
scaffold0040 (498-575)||(103902-103977)
scaffold0040 (542-575)||(10913-10946)
scaffold0040 (498-575)||(102206-102281)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (233-457)||(13844-14065)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (236-575)||(4301-4643)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (287-575)||(69574-69858)
scaffold0004 (500-575)||(332093-332167)
[»] scaffold0420 (4 HSPs)
scaffold0420 (59-336)||(6108-6386)
scaffold0420 (498-575)||(6499-6574)
scaffold0420 (428-457)||(6416-6445)
scaffold0420 (428-457)||(13870-13899)
[»] scaffold0394 (2 HSPs)
scaffold0394 (233-457)||(11960-12176)
scaffold0394 (542-575)||(11824-11857)
[»] scaffold0461 (3 HSPs)
scaffold0461 (176-449)||(11370-11643)
scaffold0461 (503-575)||(11219-11291)
scaffold0461 (492-555)||(11283-11346)
[»] scaffold0124 (5 HSPs)
scaffold0124 (176-449)||(38198-38471)
scaffold0124 (503-575)||(38550-38622)
scaffold0124 (186-269)||(24605-24690)
scaffold0124 (492-555)||(38495-38558)
scaffold0124 (390-478)||(42505-42593)
[»] scaffold0075 (5 HSPs)
scaffold0075 (80-476)||(53395-53784)
scaffold0075 (1-381)||(53316-53691)
scaffold0075 (498-575)||(53820-53895)
scaffold0075 (498-575)||(52249-52325)
scaffold0075 (1-105)||(8062-8167)
[»] scaffold0074 (3 HSPs)
scaffold0074 (232-449)||(38700-38916)
scaffold0074 (492-575)||(38941-39023)
scaffold0074 (501-555)||(38906-38960)
[»] scaffold0142 (3 HSPs)
scaffold0142 (233-454)||(16683-16902)
scaffold0142 (1-55)||(17078-17132)
scaffold0142 (502-575)||(16538-16610)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (287-575)||(193029-193314)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (1-474)||(1565-2031)
scaffold0737 (498-575)||(2069-2144)
[»] scaffold0139 (4 HSPs)
scaffold0139 (49-332)||(38339-38623)
scaffold0139 (287-575)||(19761-20044)
scaffold0139 (501-575)||(38206-38278)
scaffold0139 (428-457)||(38297-38326)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (405-575)||(10080-10247)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (288-575)||(36235-36517)
[»] scaffold0020 (5 HSPs)
scaffold0020 (1-165)||(15599-15764)
scaffold0020 (220-476)||(15763-16017)
scaffold0020 (288-575)||(178680-178961)
scaffold0020 (501-571)||(16056-16124)
scaffold0020 (498-575)||(142394-142469)
[»] scaffold0149 (5 HSPs)
scaffold0149 (233-428)||(29856-30050)
scaffold0149 (390-575)||(3521-3704)
scaffold0149 (390-575)||(7952-8135)
scaffold0149 (492-575)||(29728-29811)
scaffold0149 (501-555)||(29792-29846)
[»] scaffold0101 (3 HSPs)
scaffold0101 (244-454)||(1336-1541)
scaffold0101 (287-575)||(9016-9300)
scaffold0101 (542-575)||(1566-1599)
[»] scaffold0454 (5 HSPs)
scaffold0454 (233-428)||(10692-10891)
scaffold0454 (492-575)||(10434-10516)
scaffold0454 (492-555)||(10584-10647)
scaffold0454 (501-555)||(10628-10682)
scaffold0454 (492-555)||(10541-10603)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (80-381)||(96984-97280)
scaffold0006 (80-381)||(106262-106558)
scaffold0006 (498-575)||(106095-106171)
[»] scaffold0007 (3 HSPs)
scaffold0007 (233-456)||(161133-161355)
scaffold0007 (517-575)||(161396-161454)
scaffold0007 (501-554)||(161338-161390)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (252-476)||(23901-24119)
scaffold0100 (498-575)||(24155-24230)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (1-301)||(9133-9428)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (233-456)||(5-224)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (287-575)||(23625-23907)
[»] scaffold1403 (2 HSPs)
scaffold1403 (3-381)||(529-900)
scaffold1403 (498-575)||(326-401)
[»] scaffold0494 (4 HSPs)
scaffold0494 (233-428)||(12293-12492)
scaffold0494 (492-575)||(12581-12664)
scaffold0494 (502-555)||(12547-12600)
scaffold0494 (501-555)||(12502-12556)
[»] scaffold0363 (4 HSPs)
scaffold0363 (233-428)||(9161-9360)
scaffold0363 (492-575)||(8903-8985)
scaffold0363 (492-555)||(9053-9116)
scaffold0363 (501-555)||(9097-9151)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (233-428)||(11207-11406)
scaffold0029 (390-566)||(12550-12724)
scaffold0029 (501-575)||(11123-11197)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (49-303)||(57-311)
[»] scaffold0357 (6 HSPs)
scaffold0357 (229-460)||(16095-16320)
scaffold0357 (231-336)||(13147-13252)
scaffold0357 (1-55)||(15867-15921)
scaffold0357 (498-575)||(16334-16409)
scaffold0357 (498-575)||(2474-2550)
scaffold0357 (285-381)||(2640-2732)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (100-476)||(31985-32345)
scaffold0150 (501-531)||(31916-31946)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (287-549)||(7870-8129)
[»] scaffold0671 (2 HSPs)
scaffold0671 (390-575)||(5874-6057)
scaffold0671 (287-351)||(6095-6159)
[»] scaffold0297 (2 HSPs)
scaffold0297 (291-575)||(15736-16015)
scaffold0297 (287-575)||(10575-10855)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (287-575)||(18016-18300)
[»] scaffold2014 (2 HSPs)
scaffold2014 (232-476)||(919-1155)
scaffold2014 (498-575)||(808-883)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (236-369)||(22869-23001)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (233-369)||(4677-4812)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (390-575)||(10274-10457)
[»] scaffold0042 (3 HSPs)
scaffold0042 (390-575)||(35073-35255)
scaffold0042 (236-337)||(24304-24406)
scaffold0042 (517-575)||(24403-24461)
[»] scaffold0096 (3 HSPs)
scaffold0096 (399-575)||(16513-16686)
scaffold0096 (407-483)||(20881-20957)
scaffold0096 (288-328)||(16402-16442)
[»] scaffold0174 (1 HSPs)
scaffold0174 (390-575)||(18609-18792)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (390-575)||(14443-14625)
scaffold0081 (390-575)||(38883-39065)
scaffold0081 (390-575)||(23459-23641)
scaffold0081 (498-575)||(4965-5041)
[»] scaffold0211 (3 HSPs)
scaffold0211 (1-162)||(28578-28740)
scaffold0211 (279-478)||(28813-29006)
scaffold0211 (501-574)||(29043-29114)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (287-575)||(4857-5143)
[»] scaffold0305 (2 HSPs)
scaffold0305 (496-575)||(20450-20529)
scaffold0305 (436-473)||(20553-20590)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (488-574)||(14-100)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (287-575)||(21856-22142)
scaffold0210 (287-575)||(29748-30034)
[»] scaffold0123 (3 HSPs)
scaffold0123 (186-340)||(25121-25275)
scaffold0123 (176-273)||(620-715)
scaffold0123 (498-531)||(24925-24958)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (390-575)||(32226-32406)
scaffold0111 (498-575)||(19911-19986)
scaffold0111 (287-336)||(7450-7499)
scaffold0111 (287-336)||(14569-14618)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (410-575)||(281071-281233)
scaffold0005 (99-381)||(267639-267916)
scaffold0005 (498-575)||(14389-14465)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (390-575)||(46883-47063)
[»] scaffold1124 (2 HSPs)
scaffold1124 (390-575)||(1659-1843)
scaffold1124 (287-351)||(1881-1945)
[»] scaffold0484 (2 HSPs)
scaffold0484 (452-575)||(426-547)
scaffold0484 (330-482)||(539-688)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (233-349)||(4300-4415)
[»] scaffold1655 (1 HSPs)
scaffold1655 (504-575)||(1172-1243)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (390-575)||(2612-2795)
scaffold0158 (390-575)||(6278-6461)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (1-137)||(2070-2207)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (474-575)||(4896-4994)
[»] scaffold0327 (3 HSPs)
scaffold0327 (498-575)||(3590-3665)
scaffold0327 (233-292)||(3529-3588)
scaffold0327 (410-472)||(169-230)
[»] scaffold1276 (1 HSPs)
scaffold1276 (435-575)||(2057-2193)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (498-574)||(14365-14440)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (498-574)||(12360-12435)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (500-575)||(2451-2525)
scaffold0090 (252-336)||(2694-2780)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (498-575)||(22054-22130)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (401-457)||(30235-30291)
scaffold0013 (288-381)||(30310-30398)
[»] scaffold0697 (2 HSPs)
scaffold0697 (410-457)||(6499-6546)
scaffold0697 (498-575)||(6363-6439)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (410-575)||(7305-7464)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (176-298)||(225465-225585)
scaffold0012 (410-476)||(225335-225399)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (294-336)||(11982-12024)
scaffold0503 (1-54)||(12228-12281)
[»] scaffold0914 (1 HSPs)
scaffold0914 (498-575)||(1475-1551)
[»] scaffold0810 (1 HSPs)
scaffold0810 (1-89)||(3195-3284)
[»] scaffold0780 (1 HSPs)
scaffold0780 (498-575)||(4867-4943)
[»] scaffold0615 (1 HSPs)
scaffold0615 (410-531)||(2259-2378)
[»] scaffold1326 (1 HSPs)
scaffold1326 (410-575)||(1656-1815)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (390-472)||(1375-1457)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (410-574)||(4213-4371)
[»] scaffold0412 (1 HSPs)
scaffold0412 (390-531)||(6559-6699)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (408-575)||(17285-17445)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (410-531)||(27300-27419)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (410-531)||(68698-68817)
[»] scaffold1220 (1 HSPs)
scaffold1220 (410-531)||(1622-1741)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (410-479)||(32-100)
[»] scaffold0346 (1 HSPs)
scaffold0346 (410-575)||(14871-15028)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (498-575)||(17278-17354)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (410-575)||(19462-19623)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (498-575)||(10405-10481)
scaffold0107 (498-575)||(35954-36030)
scaffold0107 (287-336)||(36199-36248)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (498-575)||(55995-56071)
scaffold0077 (498-560)||(55952-56013)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (285-334)||(206575-206624)
scaffold0014 (498-571)||(206757-206829)
[»] scaffold1296 (1 HSPs)
scaffold1296 (390-531)||(218-359)
[»] scaffold0452 (1 HSPs)
scaffold0452 (500-575)||(13815-13889)
[»] scaffold0839 (1 HSPs)
scaffold0839 (5-55)||(1850-1900)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (390-479)||(768-857)
[»] scaffold0347 (2 HSPs)
scaffold0347 (501-575)||(8664-8737)
scaffold0347 (186-269)||(6-88)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (47-105)||(12623-12681)
scaffold0221 (498-575)||(1746-1821)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (410-531)||(7448-7567)
scaffold0342 (292-328)||(7328-7364)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (410-486)||(33418-33494)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (410-479)||(1704-1772)
scaffold0104 (410-479)||(9387-9455)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (390-470)||(43964-44044)
scaffold0079 (287-328)||(44104-44145)
[»] scaffold1419 (2 HSPs)
scaffold1419 (2-38)||(338-374)
scaffold1419 (80-212)||(165-296)
[»] scaffold0289 (1 HSPs)
scaffold0289 (390-472)||(2448-2530)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (500-571)||(18441-18511)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (446-531)||(8360-8445)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (501-575)||(1668-1741)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (501-531)||(3492-3522)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (290-328)||(4999-5037)
[»] scaffold1539 (1 HSPs)
scaffold1539 (498-575)||(713-789)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (542-575)||(7980-8013)
[»] scaffold0486 (1 HSPs)
scaffold0486 (542-575)||(8284-8317)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (302-351)||(29558-29607)
[»] scaffold0356 (1 HSPs)
scaffold0356 (174-270)||(602-697)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (287-351)||(26828-26892)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (288-336)||(3276-3324)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 311; Significance: 1e-175; HSPs: 163)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Original strand, 5866045 - 5866615
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | || ||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  5866045 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtga 5866144  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  5866145 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 5866244  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  5866245 gtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgttgct 5866339  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  5866340 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgt 5866439  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  5866440 ttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgat 5866538  T
Q  499 gagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5866539 gggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 5866615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17141266 - 17140694
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||  | || ||||||| ||||||||  |||||   |||||||||||||    
T  17141266 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctttttaggttgaatgcgatctttgtcattcgagttgatgtga 17141167  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  17141166 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 17141067  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  17141066 gtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatgg-attgcatactgcctatgttgct 17140972  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  17140971 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgt 17140872  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct--taaattagcga 497  Q
    |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||    
T  17140871 ttaagaggtcgagtccatacattagta-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaattagcga 17140773  T
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc-aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17140772 tgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 17140694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 47 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21255526 - 21255003
Alignment:
Q  47 ttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgtt 146  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||  |    
T  21255526 ttacagaatgcctttttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgttaccct-gctgttaat 21255428  T
Q  147 gtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 246  Q
    || ||| |||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||    
T  21255427 gtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttg 21255332  T
Q  247 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc--tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 344  Q
    | ||||||| |||||| |||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21255331 atttacattcgatattattatatcatgat-gaattgcatactgcttatgttgctatttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 21255233  T
Q  345 gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 444  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21255232 gatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggctt 21255134  T
Q  445 gatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgg 544  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255133 gatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgg 21255034  T
Q  545 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255033 gggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 21255003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21249734 - 21249165
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||  | |||||||||||    
T  21249734 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctttttaggttaaatgcgatctttgtcgttcaagttgatgtga 21249635  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||  ||| ||| |||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  21249634 gtttatcttagaggttaggaactaagttgttaccct-gctgttaatgtctcactaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 21249536  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc- 299  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| | |  ||||||||||| ||||||||     
T  21249535 gtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgat-gaattgcatactgcttatgttgct 21249441  T
Q  300 -tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
     | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  21249440 atttttttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttg 21249341  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgat 498  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  21249340 tttaagaggccgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgat 21249242  T
Q  499 gagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249241 gggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 21249165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 46 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21491300 - 21490775
Alignment:
Q  46 gttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgt 145  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||||  |||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||      
T  21491300 gttacagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgtagttcgagttaatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaa 21491201  T
Q  146 tgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgtt 245  Q
    |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   ||||||    
T  21491200 tgttccagtaagactgatgcctatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgtt 21491105  T
Q  246 gacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa 344  Q
    || |||||||  ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21491104 gatttacattcaatattattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaa 21491006  T
Q  345 gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  21491005 gatgatgatgttccaaattattgaattaatataagaggttgtcgaattaagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcgttgttgggggct 21490907  T
Q  444 tgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatg 543  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21490906 tgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgattgtggcttgatgccctggaagtataataatactcaaatagcgatt 21490807  T
Q  544 ggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21490806 ggggcttgatgccccgtattggtaccacatgc 21490775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 18818411 - 18818748
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818411 agatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 18818510  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818511 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 18818609  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818610 tgggggattgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 18818708  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818709 tagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 18818748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 242 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406161
Alignment:
Q  242 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 341  Q
    ||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T
Q  342 gaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggg 441  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406392 gaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggg 23406294  T
Q  442 cttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 541  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406293 cttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagccttagc-tcaattagcgatggtggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 23406195  T
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23406194 tgggtgcttgctgccctgtattggtaccacatgc 23406161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20536327 - 20535990
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536327 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20536228  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20536227 gttgatgaagatgatgatgttccaaattatt-gaattatataagagattgttgaattaagatgtctaagaggtctagtccatgcattagcatttcattgt 20536129  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536128 tgggggtttgatgccctagagctttgtactcaccacgttggagctttagctt-aattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 20536030  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536029 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 20535990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21285950 - 21285481
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  21285950 gaactcgctatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagttgcccagttacagaatgctttgttaggttaaatgcgatctttatcgcacgagttgatgtga 21285851  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  21285850 gttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatattgttgttaatgatatataatt 21285751  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  21285750 gtatatacattacatga-actatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgtt 21285653  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatg 398  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||   || ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||    | || || |    
T  21285652 gtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa---gaagatgttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctatga-g 21285557  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     || ||  || ||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  21285556 gttgagtagttgagtccatgcattagca-ttcattgctgagggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 21285481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 278 - 575
Target Start/End: Original strand, 18879275 - 18879568
Alignment:
Q  278 ttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatata 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||    
T  18879275 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tata 18879373  T
Q  378 agagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgga 477  Q
    |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18879374 agaggttgtca--ttaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttgga 18879471  T
Q  478 gctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18879472 gctttagc-tcaattagcgatggtggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 18879568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 255 - 575
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131337
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T
Q  355 tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
    | |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45131117 ttccaaattattggactaatttaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctgg 45131215  T
Q  455 agctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgat 553  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45131216 agctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgat 45131315  T
Q  554 gccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  45131316 gccctctattggtaccacatgc 45131337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 5 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 6520716 - 6520249
Alignment:
Q  5 tcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttg 104  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||    
T  6520716 tcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaaactgcccaattacagaatgctttgttaggttaaatgcgatctttgttgcatgagttgatgtgagttg 6520617  T
Q  105 atcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtat 204  Q
    ||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6520616 atcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataattgtat 6520517  T
Q  205 atacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-tt 303  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||    
T  6520516 atacattacatga-attatg-ttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgttt 6520420  T
Q  304 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatgttta 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   || |||||| ||||    | ||||| | |||    
T  6520419 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgtttataagaag-tta 6520321  T
Q  403 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||  || | ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  6520320 agttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgtcgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 6520249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7372897 - 7372560
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372897 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7372798  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  7372797 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggttgagtccatgcatcaacatttcattgt 7372699  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372698 tgggggcttgatgcactggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tattgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 7372600  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7372599 cagcgatgggggattgatgccctgtattggtaccacatgc 7372560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Original strand, 38855019 - 38855474
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||    
T  38855019 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgcccagttacagaatgccttgcttaggttaaacacgatctttgtcgcacgagttgatgtg 38855118  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    | |||||||| ||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38855119 aattgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataat 38855218  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  38855219 tgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgc 38855315  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagat 397  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||    | |||||     
T  38855316 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgga--tatataagaggttgttgtttataagaa 38855413  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 460  Q
    | |||||  ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38855414 g-ttaagttgttatgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcactggagcttt 38855474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 176 - 575
Target Start/End: Original strand, 13597559 - 13597958
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||| ||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  13597559 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 13597657  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||     
T  13597658 tg-ttttgcattctgcttatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgacgttccaaattattggactat 13597756  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 473  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13597757 tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgt 13597856  T
Q  474 tggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    |||||| |||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13597857 tggagcattagctcaaattagcgactggggcttgatgccctggaagtataataatactcaaatagtgattggggcttgatgctctgtattggtaccacat 13597956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 21389454 - 21389791
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389454 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21389550  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21389551 agatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatag 21389649  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaa-ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactca 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21389650 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaatttagcgatggcggcttgatgccctagaagtatattaatactca 21389749  T
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21389750 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 21389791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 21778780 - 21779117
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21778780 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21778876  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21778877 agatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatag 21778975  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaa-ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactca 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21778976 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaatttagcgatggcggcttgatgccctagaagtatattaatactca 21779075  T
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21779076 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 21779117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 176 - 575
Target Start/End: Original strand, 13508027 - 13508424
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  13508027 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 13508125  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || || |||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||| || ||||||||||||||||     
T  13508126 tg-ttgtgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgacgttccaaattattggactat 13508224  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 473  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13508225 tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 13508324  T
Q  474 tggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||| | |||||||||||||||    
T  13508325 tggagctttagc-tcaattagcgataggggcttgatgccctgg-agtatagtaatactcaaataacgatagaggcttgatgctccgtattggtaccacat 13508422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22626854 - 22626519
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22626854 agatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22626756  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcc-caaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22626755 gttgatgaagatgatgatgttttcaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattg 22626657  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||       
T  22626656 ttggaggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgattgagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtataataatact--t 22626560  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22626559 atagcgatgggggcttgatgccttggattggtaccacatgc 22626519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 232 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22875187 - 22874851
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  22875187 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctgtgttgctgctgctatttaactaagctgcatgagtcggt 22875089  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22875088 ctaaattgatgaagatgatgatgttccaaattattggact-atataagaggttgttgatttaagatatttaagaggtcgagtccatgcattatcatttca 22874990  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22874989 ttgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaacacgatggagctttagctcaa--tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 22874893  T
Q  532 caaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
       ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22874892 --tatagcgacgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 22874851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 236 - 515
Target Start/End: Original strand, 21919002 - 21919279
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919002 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21919101  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21919102 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 21919200  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||    
T  21919201 tgcgggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaa-tagcgatgggggtttgatgccctg 21919279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 21395984 - 21396321
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21395984 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21396080  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    || || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21396081 agatgttgaagatgatgatgttccacattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatag 21396179  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactca 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21396180 ttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatggcggcttgatgccctagaagtatattaatactca 21396279  T
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21396280 aatagcgatgggggcttaatgccctgtattggcaccacatgc 21396321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 21790477 - 21790814
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21790477 agatgttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctg---ttgtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 21790573  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    || || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||   |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  21790574 agatgttgaagatgatgatgttccacattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatag 21790672  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactca 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21790673 ttgggggctttatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatggcggcttgatgccctagaagtatattaatactca 21790772  T
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  21790773 aatagcgatgggggcttaatgccctgtattggcaccacatgc 21790814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 236 - 531
Target Start/End: Original strand, 21923930 - 21924222
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | || ||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923930 agatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21924029  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21924030 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatgtaagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgt 21924128  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21924129 t-ggggcttaatgccctggagctttgtacgcaacaagttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatact 21924222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23648621 - 23648329
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataaga 380  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||      ||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  23648621 ctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta-tataaga 23648523  T
Q  381 gtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagct 480  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  23648522 ggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcacagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacattggagct 23648423  T
Q  481 ttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  23648422 ttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtctattaatactcaattagcgatgggggcttgatgccttgtatttgtaccacatgc 23648329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 242 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 6759371 - 6759088
Alignment:
Q  242 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 341  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759371 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 6759272  T
Q  342 gaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggg 441  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759271 gaagatgatgatgt-ccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttggggg 6759174  T
Q  442 cttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatac 530  Q
    |||||||||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6759173 cttgatgccctggagcctt-tgctcaatacgatggagctttagctcaa--tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatac 6759088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 23760609 - 23761062
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||||    
T  23760609 gaacttgccaaggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtga 23760708  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgttt---gtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaat-tgtataatctaatgttgttgttaatgttatat 196  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||    | ||| |||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  23760709 gttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgttaatggtatat 23760808  T
Q  197 aattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgt 296  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  23760809 aattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgat-gatttacatactgcctatgt 23760905  T
Q  297 tgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaag 395  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |     ||||    
T  23760906 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttattgttctaag 23761002  T
Q  396 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
     || |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761003 ttg-ttaagatgttttgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 23761062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 232 - 517
Target Start/End: Original strand, 16092340 - 16092621
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092340 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 16092439  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092440 ctaagttgatgaagatgatgatgttccaaactattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 16092538  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| || | ||||  ||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  16092539 ttgttggaggcttgatgccctggagcctt-tgctcaatacgatggagctttagctcaa--tagcgatgggggcttgatgccctgga 16092621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 236 - 510
Target Start/End: Original strand, 28649046 - 28649322
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649046 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28649145  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatg----tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||||||||||||    | ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28649146 gttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 28649244  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatg 510  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||    
T  28649245 ttgttgggggcttgatgccttggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatg 28649322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 255 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971097
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T
Q  355 tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31971257 ttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgttttaagagatcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 31971159  T
Q  454 gagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  31971158 gagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaatttagcgatgggggtttgatgccctg 31971097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 255 - 505
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199915
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 353  Q
    |||||||| |||| ||||| ||  |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttg--tttgaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T
Q  354 gtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16199764 gttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 16199862  T
Q  454 gagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggct 505  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||    
T  16199863 gagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggct 16199915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 21674057 - 21673591
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |  |||||||||| | ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| |||| |||||    
T  21674057 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgacttgttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttaatgtg 21673958  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  21673957 agttgatattagaggttaaaaactaagttgtta-tcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 21673859  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||| || |  ||||  ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||    
T  21673858 ttgtatatacattaaat-aaattat-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcataatgcctatgttg 21673762  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
     || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    | |||||    
T  21673761 ttgtttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatcatgttccaaattattggact--tataagaggttgttgtttataaga 21673667  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttg 475  Q
     | |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  21673666 ag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttg 21673591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Original strand, 26355467 - 26355919
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||| || | ||||||||||| | ||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  26355467 gaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcacgagctaactagttacagaatgccttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtg 26355566  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||  |||| |||||  |||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  26355567 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 26355666  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||| ||| |  |||||| ||||  |||||||||||||| || |||| |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||     
T  26355667 tgtatatacattaaatg-gaatatgtt-gatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgattt-gcatactgcctatgttgt 26355762  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||     ||| |||    
T  26355763 tgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaa-atg 26355858  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 460  Q
     |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26355859 gttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 26355919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 80 - 476
Target Start/End: Original strand, 983249 - 983641
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtc---ttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaa 176  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  ||    
T  983249 ttgtcgcacgagttgatatgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaattatatgattgaa 983348  T
Q  177 tgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--c 274  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |    
T  983349 tgttgttgataatgttatatagctgtatatacattacatga-attatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaac 983446  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | |||||||| ||||||||||||| |      
T  983447 ttg-tttgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagatgatgttccaaattattggatttt 983540  T
Q  374 tataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag-ctttgtactcaccac 471  Q
    |||||||| | ||    | ||||||| |||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  983541 tataagaggtcgttgtttctaagatg-ttaagttgttgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagtctttg--ctcaccac 983636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 5853336 - 5853557
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853336 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 5853434  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853435 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 5853532  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  5853533 tgttgggggcttgatgccctggagc 5853557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 41598306 - 41598086
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41598306 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtc 41598208  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41598207 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcat 41598110  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41598109 tgttgggggcttgatgccctggag 41598086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 1484520 - 1484299
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484520 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1484422  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484421 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 1484324  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1484323 tgttgggggcttgatgccctggagc 1484299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20403345 - 20403124
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403345 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20403247  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403246 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 20403149  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20403148 tgttgggggcttgatgccctggagc 20403124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 232 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26219835 - 26219613
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||  ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219835 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatacta-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 26219738  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| | |||||||| || ||||| ||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219737 ctaagttgattatgatgatgaagttccaaagtattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 26219639  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26219638 ttgttgggggcttgatgccctggagc 26219613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 248 - 457
Target Start/End: Original strand, 45290754 - 45290961
Alignment:
Q  248 cttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat 347  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45290754 cttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat 45290852  T
Q  348 gatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgat 447  Q
    | ||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290853 gttgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgat 45290951  T
Q  448 gccctggagc 457  Q
    ||||||||||    
T  45290952 gccctggagc 45290961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 4542417 - 4542638
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||  ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542417 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 4542515  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542516 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 4542613  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4542614 tgttgggggcttgatgccctggagc 4542638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 15203275 - 15203496
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15203275 ttgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgctc 15203373  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15203374 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcat 15203471  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  15203472 tgttgggggcttgatgcccaggagc 15203496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 20046239 - 20046460
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046239 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20046337  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046338 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 20046435  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20046436 tgttgggggcttgatgccctggagc 20046460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 232 - 457
Target Start/End: Original strand, 26225291 - 26225513
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||| ||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225291 tttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactg-ttttgtatattgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 26225388  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225389 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 26225487  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  26225488 ttgttgggggcttgatgccctggagc 26225513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 22001871 - 22001651
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001871 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22001773  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001772 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaacatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 22001675  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||| ||||||||||||||||||||    
T  22001674 tgtt-ggggcttgatgccctggagc 22001651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 456
Target Start/End: Original strand, 14409488 - 14409709
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409488 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14409586  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  14409587 taagttgattaagatgatgaggttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcag 14409685  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
     | | |||||||||||| ||||||    
T  14409686 cgataggggcttgatgctctggag 14409709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19896386 - 19896162
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttata---tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 329  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||    |||||||| ||||| |||| |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896386 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 19896288  T
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896287 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 19896190  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896189 cattgttgggggcttgatgccctggagc 19896162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 20498915 - 20498448
Alignment:
Q  2 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgag 101  Q
    |||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    ||  ||||||  | |||||||||| | || ||   ||||| ||||||||||||||||    
T  20498915 aactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgttaggtttattgtgacctttgtcacacgagttgatgtgag 20498816  T
Q  102 ttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattg 201  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||| ||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| |||||||||    
T  20498815 ttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataattg 20498716  T
Q  202 tatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||| |||  |||| | || ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||    
T  20498715 tatatacattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-attttacatactgcctatgttgct 20498618  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatg 398  Q
    | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||     | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||    | |||||||    
T  20498617 gtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga-----aagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatg 20498523  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
      | ||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  20498522 -ctgagttgttgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 20498448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 186 - 456
Target Start/End: Original strand, 17612062 - 17612332
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 284  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||| || |||||||    
T  17612062 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatg-ttttgca 17612159  T
Q  285 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtt 383  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| |    
T  17612160 tactgcctatgttgttgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggt 17612259  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    |||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||||||    
T  17612260 tgttgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgccctggag 17612332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14823891 - 14823671
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  14823891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagt-ggtc 14823794  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823793 taaattgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 14823696  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14823695 tgttgggggcttgatgccctggagc 14823671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 49 - 457
Target Start/End: Original strand, 17266808 - 17267211
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    |||||| || ||||||||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  17266808 acagaactccttgttaggttaaatgtgacctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgt 17266907  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 248  Q
    |||||| |||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||||     
T  17266908 ttcagtgagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacaaga-attatatatgatgtttgagatgttgttgat 17267006  T
Q  249 ttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 346  Q
    || ||||||||||||||||||||||    |||||   |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     |    
T  17267007 ttgcatttgatattgttatatcatgaaccgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----a 17267101  T
Q  347 tgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 445  Q
     |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||    | ||||||| |||||  || ||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  17267102 agatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatg-ttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttg 17267199  T
Q  446 atgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||    
T  17267200 atgccctggagc 17267211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 4483398 - 4483207
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4483398 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatt-aactaagctgcatgagtcggtc 4483301  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483300 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtc-gattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 4483207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 330 - 575
Target Start/End: Original strand, 44384944 - 44385185
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggt-cgagtccatgcattagcatt 428  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |  ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  44384944 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagatgatga--ttgtgatgtttaagagattcgagtccatgcattagcatt 44385041  T
Q  429 tcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaat 528  Q
       ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44385042 catttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattaacgattgaggctt-atgccctggaagtatattaat 44385139  T
Q  529 actcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  44385140 actcaaataacgatgggggc-tcatgcccttaattggtaccacatgc 44385185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 37116644 - 37116366
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    |||||||| |||||| ||   |||||| ||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  37116644 ttgttaggataaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagc 37116545  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    |||| ||  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  37116544 ctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttga 37116446  T
Q  259 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||  || |||||   ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37116445 tattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 37116366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 16413360 - 16413547
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16413458  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||| ||      ||||| ||||||||||||||| || |||||| |  |  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16413459 taagttgattaa------gatgttccaaattattggact-atttaagaggtcatttaattaagatgtttaagtggtcgagtccatgcattagcatt 16413547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 24353329 - 24352999
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgt--- 145  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| | | | |||| |||||||||| || |||| |||||||       
T  24353329 acagaataccttgttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgt 24353230  T
Q  146 tgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgtt 245  Q
    |||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||  || | |  ||||||||||||||||||    
T  24353229 tgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatga-attgtatacgatgtttgagatgttgtt 24353131  T
Q  246 gacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatg 342  Q
    || || || |||||||||||||||||||  || |||||   ||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  24353130 gatttgca-ttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-- 24353035  T
Q  343 aagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
       | |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  24353034 ---aagatgttgttccaaattattggatttatataagag 24352999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16184683 - 16184500
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  16184683 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctt-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 16184586  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  16184585 aaattagcgatgggggctt-atgccctggaagaatattaatactcaaataacgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 16184500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26224037 - 26223841
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||    
T  26224037 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattgctt-tattgctgttgttatttaattaagctgcatgggtcgatc 26223939  T
Q  333 taagttgatgaaga---tgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||| ||||   ||||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26223938 taagttgattaagatgttgatgatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatt 26223841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22364957 - 22364745
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||   | | |||  |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  22364957 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcagggggataataaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagc 22364858  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  ||| || |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  22364857 ctgaattatatgatttgatgttgttaataaagtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttga 22364760  T
Q  259 tattgttatatcatg 273  Q
    |||||||||||||||    
T  22364759 tattgttatatcatg 22364745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 456
Target Start/End: Original strand, 25484319 - 25484531
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||         ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  25484319 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta--------gctgttgttatttaactaagctgcacgagttggtc 25484410  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || | ||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  25484411 taagttgattaagatgatgaagttctaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctt 25484507  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  25484508 tgttgtgggcttgatgctctggag 25484531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19899057 - 19898874
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||     
T  19899057 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattcgctc 19898960  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||    
T  19898959 aaattaacgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-gcatgccctgaattggtaccacatgc 19898874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 20466196 - 20466379
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  20466196 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 20466294  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  20466295 aattagcgatgggggctt-atgccctgaaagtatattaatacaaaaataatgttggaggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 20466379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 399 - 575
Target Start/End: Original strand, 23777000 - 23777172
Alignment:
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcga 497  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  23777000 tttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcga 23777097  T
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23777098 tgggggctt-atgccttggaagtatattaatactc-aataatgatgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 23777172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 549
Target Start/End: Original strand, 17353996 - 17354255
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  17353996 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagat 17354093  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||| ||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  17354094 gatga--ttatgatgtttaagaaatcgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctc-atgccctagagctttgtactcaacacgatggagcatta 17354190  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggct 549  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  17354191 gctcaaattagcgatgggggctt-atgccttggaagtatattaatactcaattaacgatgggggct 17354255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19983055 - 19982872
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||  |||||     
T  19983055 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtagtcaacacgatggagcactagctc 19982958  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||| |||||||||||||||    
T  19982957 aaattaacgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcaggccctgaattggtaccacatgc 19982872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 21162213 - 21162397
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagt--ccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagc 485  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  21162213 attaagatgttttaagagatcgagtttccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagc 21162310  T
Q  486 ttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21162311 tcaaattagcgatgggggctt-atgccttggaagtatattaatac-ccaataacgatgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 21162397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 21168886 - 21169070
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagt--ccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagc 485  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||    
T  21168886 attaagatgttttaagagatcgagtttccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagc 21168983  T
Q  486 ttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||| |||||| |||||||||||    
T  21168984 tcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactc-aataacgatgggggc-tcatgccatgtattagtaccacatgc 21169070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 236 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 32121851 - 32121654
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||    
T  32121851 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaa 32121752  T
Q  336 gttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    |||||| ||||||      ||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32121751 gttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatt-taagaggtcgttgagttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 32121654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 369
Target Start/End: Original strand, 19937061 - 19937184
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| |||||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  19937061 ttgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 19937159  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  19937160 agatgatgaagt-ccaaattattgga 19937184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 14409726 - 14409808
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14409726 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 14409808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 186 - 336
Target Start/End: Original strand, 17439458 - 17439609
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 283  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||      
T  17439458 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttat 17439555  T
Q  284 atactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
     |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17439556 gtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggactaag 17439609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 244 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 15070665 - 15070571
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 339  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15070665 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22525409 - 22525333
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22525409 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 22525333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24352872 - 24352796
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24352872 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 24352796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 17612349 - 17612431
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17612349 tagcgataggggcttgatgctccgga-gtatattgatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 17612431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 18678321 - 18678404
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18678321 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagagattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 18678404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22965583 - 22965500
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  22965583 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgatagggccttgatgctccgtattggtaccacatgc 22965500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26223753 - 26223671
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  26223753 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 26223671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 22419682 - 22419758
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22419682 tgagggcttaatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 22419758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 377232 - 377052
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||| |||| ||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  377232 attaagatgttttaagagattgagtccatccatttgcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctca 377134  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||  | || |||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  377133 aaataatgttgggggc-tcatgccttgaaagtatattaatactaaaat---gttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 377052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 523 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4083808 - 4083756
Alignment:
Q  523 attaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4083808 attaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 4083756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 504 - 575
Target Start/End: Original strand, 16413648 - 16413719
Alignment:
Q  504 cttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16413648 cttgatgctctggaattataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 16413719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 236 - 372
Target Start/End: Original strand, 18678104 - 18678246
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18678104 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaa 18678203  T
Q  336 gttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggacta 372  Q
    |||||| ||||||      ||||||| ||||||||||||||||    
T  18678204 gttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggacta 18678246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Original strand, 19801426 - 19801527
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19801426 ttgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagccggtc 19801523  T
Q  333 taag 336  Q
    ||||    
T  19801524 taag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 25484591 - 25484673
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25484591 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataagggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 25484673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 30643467 - 30643626
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  30643467 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggaactttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggctt-at 30643564  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  30643565 gccctgaaagtatattaatactaaact---gttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 30643626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 505 - 575
Target Start/End: Original strand, 18717523 - 18717593
Alignment:
Q  505 ttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  18717523 ttgatgctctggaagtataataatactcaaatagagattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 18717593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 17439776 - 17439852
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17439776 tgagggcttaatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgc 17439852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 20502371 - 20502447
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20502371 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 20502447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 20533679 - 20533755
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  20533679 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttatata-cgttgggggcttgatgtcctggattgataccacatgc 20533755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 348 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22965707 - 22965608
Alignment:
Q  348 gatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgat 447  Q
    ||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||    
T  22965707 gatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgccgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcagtgattggggcttgat 22965610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28397400 - 28397324
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  28397400 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatcctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 28397324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 37515377 - 37515301
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  37515377 tgagggcttgatgccctaggagtatattaatgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggactggtaccacatgc 37515301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 40493244 - 40493320
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  40493244 tgagggcttgatgcccttgaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtatcacatgc 40493320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 503 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32121642 - 32121570
Alignment:
Q  503 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  32121642 gcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccatattggtaccacatgc 32121570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4483162 - 4483079
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | |  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  4483162 tagcgattggggcttgatgctccgatagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 4483079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 18678277 - 18678340
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18678277 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 18678340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 19937372 - 19937454
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  19937372 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtataataatactcaaatagcgataggggtttgatgctccgtattggtaccacatgc 19937454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 24755677 - 24755576
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  24755677 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctt-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 24755580  T
Q  488 aaat 491  Q
    ||||    
T  24755579 aaat 24755576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 38855491 - 38855564
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38855491 gggcttgatgccctggaagtatattaatacttaatta-cgttgagggcttgatgccctggattagtaccacatgc 38855564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Original strand, 15611634 - 15611753
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  15611634 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctt-at 15611731  T
Q  510 gccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  15611732 gccctgaaagtatattaatact 15611753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16799335 - 16799259
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16799335 tgagggcttgatgctctgggagtatattaatgctcaatta-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 16799259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Original strand, 21919250 - 21919295
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21919250 ctcaaatagcgatgggggtttgatgccctgtattggtaccacatgc 21919295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 22253434 - 22253510
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22253434 tgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 22253510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22995693 - 22995617
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22995693 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccaaatgc 22995617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 23944222 - 23944297
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  23944222 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-ctttggggacttgatgccct-tgttggtaccacatgc 23944297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 39834184 - 39834107
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgat 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||| ||||||||||||    
T  39834184 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaataccttgtttaagttaaatgcgat 39834107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 17926859 - 17927039
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| |    
T  17926859 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagtatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 17926957  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  17926958 aaataatgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgctggaggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 17927039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21673552 - 21673480
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21673552 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 21673480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 26355936 - 26356008
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26355936 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 26356008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 4483197 - 4483143
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4483197 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 4483143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 14409692 - 14409745
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14409692 gggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 14409745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Original strand, 16410422 - 16410542
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagc-gatgagggcttga 508  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||| || | | || |||||| |    
T  16410422 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggctt-a 16410519  T
Q  509 tgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  16410520 tgccctgaaagtatattaatact 16410542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 17612315 - 17612368
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17612315 gggcttgatgccctgga-gtatattgatactcaaatagcgataggggcttgatgc 17612368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20498412 - 20498337
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20498412 tgagggtttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 20498337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 22965618 - 22965564
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22965618 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 22965564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 26223831 - 26223777
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26223831 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 26223777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 273
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492890
Alignment:
Q  227 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 273  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 40492890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 2419140 - 2419216
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  2419140 tgaggggttgatgccctgggagtatattaatgctcaatta-cgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgc 2419216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 15203556 - 15203632
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15203556 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 15203632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 575
Target Start/End: Original strand, 16092594 - 16092635
Alignment:
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16092594 aatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 16092635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #122
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 19155157 - 19155233
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19155157 tgagggcttgatgcccaggatgtatattaatacttaaaca-ctttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 19155233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #123
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 26225574 - 26225650
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26225574 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgc 26225650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #124
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 41598025 - 41597949
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| ||| ||  |||| || |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41598025 tgagggcttgatgccatgggagcctatttatgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 41597949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 45291021 - 45291097
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45291021 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 45291097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #126
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31971120 - 31971081
Alignment:
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31971120 tagcgatgggggtttgatgccctgtattggtaccacatgc 31971081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #127
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 983677 - 983752
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||  || || |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  983677 tgagggcttgatgccatggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgc 983752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #128
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 16413557 - 16413611
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  16413557 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattgaggcttgatgc 16413611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #129
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 25484557 - 25484610
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25484557 gggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 25484610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #130
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 41598536 - 41598482
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  41598536 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctagttacagaat 41598482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Original strand, 15603182 - 15603301
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||| | |||||| || ||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  15603182 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagatttctactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctt-at 15603279  T
Q  510 gccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  15603280 gccctgaaagtatattaatact 15603301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #132
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 17086421 - 17086497
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  17086421 tgagggcttgatgctcttggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctgaaatggtaccacatgc 17086497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #133
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 284 - 336
Target Start/End: Original strand, 19154936 - 19154989
Alignment:
Q  284 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19154936 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaag 19154989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #134
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19896102 - 19896026
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19896102 tgagtgcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cggtgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 19896026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #135
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Original strand, 20502154 - 20502203
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  20502154 ctgcctatgttgctgttgtatgttaattaagctgcatgagtcggtctaag 20502203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #136
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 22525628 - 22525579
Alignment:
Q  285 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    ||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  22525628 tactgcctaagttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 22525579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 22963682 - 22963758
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  | || ||| |||||||| || |||||||||||||||    
T  22963682 tgagggcttgatgccctaggagtatattaattctcaaata-agttgagggtttgatgccttggattggtaccacatgc 22963758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26219596 - 26219520
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||   ||| | ||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26219596 tgagggcttgatgccctgggagcccatttacactcaaata-cgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgc 26219520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Original strand, 28649298 - 28649343
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||    
T  28649298 ctcaaatagcgatgggggcttgatgtcccggattggtaccacatgc 28649343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #140
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 400 - 456
Target Start/End: Original strand, 19937195 - 19937251
Alignment:
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| ||||||    
T  19937195 ttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgctctggag 19937251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #141
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 18862430 - 18862512
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  18862430 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 18862512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #142
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 20856602 - 20856763
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttga 508  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||  |||| ||||| ||| |||||||||||||  |||| |  | || |||||| |    
T  20856602 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagtcttgtcctcacaacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggctt-a 20856699  T
Q  509 tgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||  |  | ||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  20856700 tgccctgaaagtatattaatacttaa--actgttgggggc-tcatgccttgtattggtaccacatgc 20856763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #143
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21383978 - 21383896
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21383978 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21383896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #144
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21387398 - 21387316
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21387398 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21387316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #145
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21411271 - 21411189
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21411271 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21411189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #146
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 21805763 - 21805681
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21805763 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21805681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #147
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 21827799 - 21827881
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21827799 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21827881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #148
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 22010819 - 22011001
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| |    
T  22010819 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 22010917  T
Q  489 aatt--agcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |  |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  22010918 aaataaactgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgctgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 22011001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 23406732 - 23406665
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggtt 68  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| | | ||||||||||    
T  23406732 gaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtgccttgttaggtt 23406665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 26223796 - 26223734
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  26223796 tagcgattggggcttgatgctccgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 26223734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 531
Target Start/End: Original strand, 16861534 - 16861619
Alignment:
Q  446 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16861534 atgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 16861619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 19801196 - 19801234
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  19801196 gaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcgagt 19801234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 531
Target Start/End: Original strand, 23761119 - 23761149
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23761119 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 23761149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 5083386 - 5083461
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  5083386 tgagggtttgatgccctgggagtatatttatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctg-gttggtaccacatgc 5083461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 6102778 - 6102811
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6102778 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 6102811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 555
Target Start/End: Original strand, 16413602 - 16413655
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  16413602 ggcttgatgctccgaaagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgc 16413655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 555
Target Start/End: Original strand, 19937354 - 19937391
Alignment:
Q  518 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19937354 agtatattgatactcaaatagcgataggggcttgatgc 19937391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 20536559 - 20536514
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 46  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  20536559 gaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 20536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 270
Target Start/End: Original strand, 14103165 - 14103260
Alignment:
Q  174 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 270  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||| || || |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  14103165 taatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatga-attatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 14103260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #160
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 555
Target Start/End: Original strand, 19937297 - 19937348
Alignment:
Q  503 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  19937297 gcttgatgctctgga-gtatattgatactcaaatagcgatagggtcttgatgc 19937348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #161
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 20533467 - 20533503
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20533467 tatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtc 20533503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #162
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 54
Target Start/End: Original strand, 21414997 - 21415049
Alignment:
Q  2 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||  ||| ||||||||    
T  21414997 aactcgccatggcgagtagagcctctcgcctcgcgagttgtccaattacagaa 21415049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 28397617 - 28397569
Alignment:
Q  288 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    ||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  28397617 tgcctatgttgttgttgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 28397569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 307; Significance: 1e-172; HSPs: 171)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 22073268 - 22072882
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22073268 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgctttgttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtga 22073169  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22073168 gttgatcttacaggtaaggaactaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 22073069  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  22073068 gcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgtt 22072969  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgt 386  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||| ||||    
T  22072968 gtttgttatttaactaagctgcatgggtcagtctaagttgattaagatgatgatgttccaaactattggatatatataagaggttgt 22072882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Original strand, 11995798 - 11996368
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | || ||||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  11995798 gaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagcatttgtgttacagaatgcctttttaggttaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtga 11995897  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||| ||||||||||| || |||||| ||||||  |||||||||  |||  ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  11995898 gtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 11995997  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    ||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||   ||||||| |||||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |    
T  11995998 gtatatacattacatgacttaa-gtttgatatttgag---ttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgtt 11996092  T
Q  301 gtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  11996093 gtttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgt 11996192  T
Q  400 tt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgat 498  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11996193 tttaagaggttgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgctctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgat 11996291  T
Q  499 gagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11996292 gggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 11996368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34201136 - 34200564
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||       |||||| ||| | || |||||||||||||||| | ||||   |||||||||||||    
T  34201136 gaactcgccatggcgagcagaggctcttgcctcgcgagcgtttgtgttacataatgcctttttaggttaaatgcgatccctgtcattcgagttgatgtga 34201037  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  |||  ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  34201036 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 34200937  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  34200936 gtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgttgct 34200842  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg- 398  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||     
T  34200841 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgt 34200742  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcga 497  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||    
T  34200741 tttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagtga 34200643  T
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc-aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200642 tgagggtttgatgccttggaagtatattaatactcaaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 34200564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9509308 - 9508970
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509308 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttactgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 9509209  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509208 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 9509110  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9509109 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcgatgggggtttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 9509010  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  9509009 tagcgatgggggcatgatgccttgtattggtaccacatgc 9508970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 16219485 - 16219935
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |    
T  16219485 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgtctagttacagaatgccttgttaggttaaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtta 16219584  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16219585 gttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 16219684  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |    
T  16219685 gtatatacattacatga-attatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgtt 16219782  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||     |||| ||     
T  16219783 gtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgttccaaattattcgacttatataagaggttgttgttctaagttg- 16219878  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16219879 ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagc 16219935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Original strand, 28505069 - 28505625
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | || ||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  28505069 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtga 28505168  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| |||   |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  28505169 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtcaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 28505268  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    ||||||||||||||||| || | |||||||  |||||   ||| ||| ||| ||  |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  28505269 gtatatacattacatgacttaa-gtttgataattgag---ttgctgatttatatccgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgct 28505363  T
Q  301 gtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  28505364 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgt 28505463  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||              ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  28505464 ttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcat--------------tgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgat 28505548  T
Q  499 gagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505549 gggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 28505625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10589158 - 10588817
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10589158 agatgttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaa 10589059  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat--ttcatt 433  Q
    ||||  |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  10589058 gttgtcgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcagcattcatt 10588959  T
Q  434 gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactca 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10588958 gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactca 10588859  T
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10588858 aatagcgatgggggcttgatgccatgtattggtaccacatgc 10588817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 16056680 - 16056236
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  16056680 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagttacagaatgccttgttaggttaaatgcgatctttgtagcacgagttgatgtga 16056581  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16056580 gttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctgaatgatataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 16056481  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| || ||||||||||    
T  16056480 gtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg--tttgcataatgtctatgttgct 16056384  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatg 398  Q
    | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||    | ||||| |    
T  16056383 gtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggtctaagttga-----aagaagatgttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctaaga-g 16056290  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
     || ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16056289 gttgagttgttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 16056236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26212115 - 26211776
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  26212115 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaa 26212016  T
Q  336 gttgatgaag-atgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26212015 gttgttgaagaatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgcttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattg 26211917  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgaggg-cttgatgccctggaagtatattaatactca 533  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26211916 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcagattagcgatgggggccttgatgccctggaagtatattaatactca 26211817  T
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26211816 aatagcgat-ggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 26211776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 68098 - 67644
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  68098 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtg 67999  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  67998 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataa 67899  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| |||||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  67898 ttgtatatacattatatga-attatg-ttgat-attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttg 67803  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   || |||||| ||||    | |||||    
T  67802 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataaga 67703  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
     | |||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  67702 ag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagc 67644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12698951 - 12698613
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698951 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 12698852  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12698851 agttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataaaaggttgttgaattaagatgtctaagaggttgagtccatgcattagcatttcattg 12698753  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  12698752 ttgggggcttgatgtcctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgattccttggaagtatattaatactcaa 12698654  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12698653 atagtgatggcggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 12698613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 47832161 - 47831687
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||  |||||| |||||||||||||    
T  47832161 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatgtgatctttgtcggacgagttgatgtg 47832062  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  47832061 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgtcgctaatgttatataat 47831962  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||| ||||||||     
T  47831961 tgtatatacattatatga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatatgcatactgtctatgttgt 47831864  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaata-taagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||| ||||    | |||||    
T  47831863 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatattaagaggttgttgtttataaga 47831764  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     | |||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  47831763 ag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctt-tgctcaccacgttgg 47831687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 810898 - 811350
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca-gttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgt 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||  | |||||| ||| | ||||| | ||||||||||||  ||||||| | |||||||||    
T  810898 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagt-acttatgttacaaaatgccttgtttaagttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgt 810996  T
Q  99 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    ||||||| ||| || || || ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  810997 gagttgaccttggaagttagaaactaagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataa 811096  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  811097 ttgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttg 811194  T
Q  299 ct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    | |||||    
T  811195 ctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgtttataaga 811291  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
     | |||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  811292 ag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagc 811350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 62 - 517
Target Start/End: Original strand, 15754718 - 15755171
Alignment:
Q  62 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||    
T  15754718 ttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactg 15754817  T
Q  162 aattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgata 260  Q
    |    ||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| ||||    
T  15754818 atgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgata 15754913  T
Q  261 ttgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccca 359  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15754914 ttattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgttcca 15755012  T
Q  360 aattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagct 458  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755013 aataattggattaatatacgagattgtcgaattaagttgttttaagaggtcgaatccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagct 15755111  T
Q  459 ttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| ||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15755112 ttgtactcaccatgttggtgcattacctcaaaattaacgatgggggcttgatgccttgga 15755171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 232 - 575
Target Start/End: Original strand, 10063816 - 10064157
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 330  Q
    |||||||||||||| ||||   || |||||| |||||||||| || || ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  10063816 tttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataccgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcag 10063914  T
Q  331 tctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    ||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10063915 tctaagtcgttgaaggtgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaatgaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttc 10064014  T
Q  431 attgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatac 530  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  10064015 agtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagc-tcaattagcgataggggcttgatgccct-gaagtataataatac 10064112  T
Q  531 tcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10064113 tcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 10064157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 18005999 - 18005531
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | ||||||| ||| | ||||| ||| ||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||    
T  18005999 gaactcgccatggcgactagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtttaggataa-tgcgatctttgtcgcacaagttgatatg 18005901  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  18005900 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 18005801  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||    
T  18005800 ttgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttccatactgcttatgttg 18005704  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||    | |||||    
T  18005703 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccgaattattggact--tataagaggttgttgtttataaga 18005609  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     | |||||  || | || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  18005608 ag-ttaagttgttgtgttcatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagccttttgctcaccacgttgg 18005531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 236 - 567
Target Start/End: Complemental strand, 38227599 - 38227273
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38227599 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 38227501  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    || |||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38227500 gtagatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagaatttcattg 38227402  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||| |  | ||||||||||||||||||| ||  |||| |  ||| |    
T  38227401 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctatagctcaaataa--gttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctc-a 38227305  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggta 567  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  38227304 ata-cgttgggggcttgatgccctggattggta 38227273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 236 - 515
Target Start/End: Original strand, 16386249 - 16386529
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||| |||  |||| |||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386249 agatgttgatgaaatacaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgtcgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 16386348  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16386349 agttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattg 16386447  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16386448 ttgggggcttgatgccctggagctttttactcaccacgttggagcattagctcaaaattagtgatgggggcttgatgccctg 16386529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 44014526 - 44014064
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || || |||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||    
T  44014526 gaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccggttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatcattgtcgcacgaattgatgtg 44014427  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    ||||||||  |||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  44014426 agttgatc--agaggttaaaaactaagttgtta-tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtttttaatggtatataa 44014330  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
     ||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||||||| |   || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  44014329 ctgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatatttgagatgttgat---ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 44014236  T
Q  299 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    | |||||    
T  44014235 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact--tataagaggttgttgtttataaga 44014141  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     | |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  44014140 ag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 44014064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 373 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13032741 - 13032539
Alignment:
Q  373 atataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13032741 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacg 13032642  T
Q  473 ttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccaca 572  Q
    |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  13032641 ttggagctttagctcaaaatagcaatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccttgtattggtaacaca 13032542  T
Q  573 tgc 575  Q
    |||    
T  13032541 tgc 13032539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 330 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14258286 - 14258041
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14258286 gtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatacattagcattt 14258188  T
Q  430 catt-gttggggg-cttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaa 527  Q
    |||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14258187 catttgttggggggcatgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaatt-gcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaa 14258089  T
Q  528 tactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14258088 tactcaattatcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 14258041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 233 - 455
Target Start/End: Original strand, 3564363 - 3564584
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564363 ttgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 3564462  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  3564463 taagttgatgaagatgatgaagttctaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattaacatttcat 3564561  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctgga 455  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  3564562 tgttgggggcttgatgccctgga 3564584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 48273511 - 48273288
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48273511 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtc 48273412  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48273411 taagttgattaagatgatgaagttccaaagtattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattagcatttcat 48273313  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  48273312 tgttgggggcttgatgccctggagc 48273288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 233 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 13647447 - 13647225
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647447 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13647348  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13647347 taagatgttgaatatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttca 13647249  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctgga 455  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||    
T  13647248 ttgttgggggcttaatgccttgga 13647225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 44116627 - 44116405
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44116627 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtc 44116529  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116528 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 44116430  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44116429 tgttgggggcttgatgccctggagc 44116405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144371
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| | ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgag-atgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15144135  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    |||||||    |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||    | |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||    
T  15144136 taagttg----agatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgtttaaagaggtttaagatgtcgagttcatgcattagtatttcat 15144230  T
Q  433 --tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatac 530  Q
       | |||||||| ||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  15144231 agcgatgggggctagatgccctggagcctt-tgctcaacacgatggagctttagctcaa--tagcgatgaggatttgatgccctggaagtatattaatac 15144327  T
Q  531 tcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15144328 tc-aatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 15144371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 236 - 457
Target Start/End: Original strand, 18456415 - 18456634
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456415 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 18456513  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456514 gttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 18456612  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  18456613 taggggcttgatgccctggagc 18456634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 12901681 - 12901299
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||| ||  | ||||||||||||||| || | |||||| ||||||||||||||    
T  12901681 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacaaaacaccttgttaggttaaatgtgacatttgtcgtacgagttgatgtga 12901582  T
Q  101 gttgatcttagaggta---aggaa-ctaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatat 196  Q
    ||||||||| ||||||   ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||    
T  12901581 gttgatcttggaggtacgtaggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatat 12901482  T
Q  197 aattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatg 295  Q
    | |||||||||||||||||||  |||||| ||||| ||| ||||||| ||  || ||||||||||||||||||||||  |  ||||| ||||||||||||    
T  12901481 agttgtatatacattacatga-attatgtatgatg-ttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcatgaattattttgtatactgcctatg 12901384  T
Q  296 ttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    ||| || |||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |  ||||| ||||||||| ||| | |||||||||    
T  12901383 ttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagttga--aagaggccgatgttccaaattataggatttatataagag 12901299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 286 - 513
Target Start/End: Original strand, 27847881 - 27848109
Alignment:
Q  286 actgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagttt 384  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  27847881 actgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactagtataagaggtt 27847980  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttag 484  Q
    | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  27847981 gccgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttgatgccctgaagctttgtactcaccatgttggagcattag 27848079  T
Q  485 ct-taaattagcgatgagggcttgatgccc 513  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  27848080 ctcaaaattagcgatgggggcttgatgccc 27848109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 11972614 - 11972393
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972614 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 11972516  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972515 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 11972418  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11972417 tgttgggggcttgatgccctggagc 11972393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 14949166 - 14949387
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949166 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 14949264  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949265 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 14949362  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  14949363 tgttgggggcttgatgccctggagc 14949387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 32125609 - 32125388
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125609 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 32125511  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125510 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 32125413  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32125412 tgttgggggcttgatgccctggagc 32125388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 41523035 - 41522814
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523035 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 41522937  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522936 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 41522839  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41522838 tgttgggggcttgatgccctggagc 41522814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 41525497 - 41525276
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525497 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 41525399  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525398 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 41525301  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  41525300 tgttgggggcttgatgccctggagc 41525276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 413 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16579517 - 16579356
Alignment:
Q  413 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  16579517 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaa-ttagcgatgggggcttgatgcc 16579419  T
Q  513 ctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16579418 ctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 16579356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 15376757 - 15376978
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376757 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15376855  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376856 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 15376953  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15376954 tgttgggggcttgatgccctggagc 15376978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16410177 - 16409956
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410177 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16410079  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16410078 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagacgtcgagtccatgcattagcatttcat 16409981  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16409980 tgttgggggcttgatgccctggagc 16409956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 21189639 - 21189860
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189639 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21189737  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189738 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 21189835  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21189836 tgttgggggcttgatgccctggagc 21189860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 456439 - 456218
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456439 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 456341  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  456340 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 456243  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  456242 tgttgggggcttgatgccctggagc 456218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16232638 - 16232417
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232638 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16232540  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232539 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 16232442  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16232441 tgttgggggcttgatgccctggagc 16232417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 20385167 - 20385388
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385167 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20385265  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385266 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 20385363  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20385364 tgttgggggcttgatgccctggagc 20385388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 413 - 575
Target Start/End: Original strand, 16586146 - 16586306
Alignment:
Q  413 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||    
T  16586146 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgcc 16586244  T
Q  513 ctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  16586245 ctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatg-cctggattggtaccacatgc 16586306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495329
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 16495473  T
Q  286 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagttt 384  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  16495472 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggtc 16495373  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16495372 gttgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatt 16495329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 11393331 - 11393552
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393331 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 11393429  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393430 taagttgattaagatgatggagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 11393527  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11393528 tgttgggggcttgatgccctggagc 11393552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18640390 - 18640169
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640390 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18640292  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18640291 taagttgattaagatgatgaaggtccaaattattggact-atataagaggttgtcgatttaagat-attaagagttcgagtccatgcattagcatttcat 18640194  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  18640193 tgttgggggcttgatgccctagagc 18640169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24702356 - 24702135
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702356 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24702258  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702257 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 24702160  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24702159 tgttgggggcttgatgccctggagc 24702135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 27216978 - 27216757
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27216978 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtc 27216880  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27216879 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 27216782  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  27216781 tgttgggggcttgatgccctggagc 27216757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16324358 - 16324175
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  | |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16324358 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgccttgcgaactgcccagttacagaatgccttgttaggttaaatgtgatccttgtcgcatgagttgatgtga 16324259  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 184  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16324258 gttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttg 16324175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 298 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20110610 - 20110452
Alignment:
Q  298 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||    
T  20110610 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagat 20110512  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110511 gtttaagaggtcgagtccatgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 20110452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 255 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 40443490 - 40443292
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 353  Q
    |||||||| |||| ||||||||  ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  40443490 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T
Q  354 gtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
     | |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40443392 attccaaattattggactaatataaaaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 40443294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 18154894 - 18155177
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  18154894 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgaagttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagat 18154991  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
      | |  || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  18154992 gatga--ttgagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagcttt 18155087  T
Q  483 agcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  18155088 agctcaaat-agcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 18155177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24704803 - 24704585
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || || |   |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704803 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgtt---tttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24704708  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704707 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 24704610  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24704609 tgttgggggcttgatgccctggagc 24704585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 13869453 - 13869243
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13869453 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13869355  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||    
T  13869354 agatgatgaggttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggct 13869256  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||| ||||||    
T  13869255 tgatgctctggag 13869243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 233 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 3386451 - 3386232
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3386451 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 3386353  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |    
T  3386352 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagttcatgcattagca-ttctt 3386256  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  3386255 tgttgggggcttgatgctctggag 3386232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 574
Target Start/End: Original strand, 19649546 - 19649825
Alignment:
Q  291 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtttgtc 387  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |  |     
T  19649546 ctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagatgatg 19649643  T
Q  388 aaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |  ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  19649644 a--ttatgatatttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc 19649740  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  19649741 aaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatg 19649825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 436 - 575
Target Start/End: Original strand, 16461338 - 16461476
Alignment:
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  16461338 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttgaagctttagctcaa-ttagcgatgagggcttgatgccctgaaagtatattagtactcaaa 16461436  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16461437 tagcgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 16461476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 176 - 427
Target Start/End: Original strand, 19486686 - 19486937
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||| || ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  19486686 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcataacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 19486784  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  19486785 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactat 19486883  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 427  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19486884 tataagaggttgtcgaattaagacgtttaagaagtcgagtccatgcattagcat 19486937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
Target Start/End: Original strand, 38898420 - 38898635
Alignment:
Q  233 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898420 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgc-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38898518  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
     ||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38898519 ttaagttgattaagatggtgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttca 38898617  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgc 449  Q
      | | ||||||||||||    
T  38898618 gcgataggggcttgatgc 38898635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15211525 - 15211234
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-------tgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataag 379  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||||       ||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15211525 ctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttgatgttccaaattattggactaatataag 15211426  T
Q  380 agtttgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgga 477  Q
    || |  | |  ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15211425 agatgatga--ttaagatgttttaagagttagagtccatgcattagcata-cataagttgggggctt-atgccctggagctttgtactcaccacgatgga 15211330  T
Q  478 gctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| |||||| ||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  15211329 gctttagctcaaattaacgatgggggc-tcatgccctggaagtatattaatattcaaataacgttgggggc-tcatgccctgtattggtgccacatgc 15211234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 436 - 575
Target Start/End: Original strand, 15755152 - 15755292
Alignment:
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaa-ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755152 tgggggcttgatgccttggaggtttgtactcgccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 15755251  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15755252 atagcgagaagggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 15755292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 232 - 476
Target Start/End: Original strand, 2280117 - 2280357
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 330  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  2280117 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgct-gttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcgg 2280215  T
Q  331 tctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| | ||    | ||||| | || ||  || ||||||||||||||||| ||    
T  2280216 tctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaaga-ggttgagttgttgagtccatgcattagca-tt 2280311  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  2280312 cattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 2280357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 13831491 - 13831272
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831491 ttgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccg-tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13831393  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  13831392 taaattgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctt 13831296  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
     ||||| |||||||||| ||||||    
T  13831295 ggttggaggcttgatgctctggag 13831272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 436 - 559
Target Start/End: Original strand, 16461233 - 16461355
Alignment:
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16461233 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaaaacgttggagctttagctcaa-ttagcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaa 16461331  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  16461332 tagcgatgggggcttgatgccctg 16461355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 193 - 454
Target Start/End: Original strand, 17061919 - 17062177
Alignment:
Q  193 atataattgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 291  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| |||||||     
T  17061919 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtta-ataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgcta-ttttgtatactgct 17062016  T
Q  292 tatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaa 390  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| | ||| ||||||||||| |     
T  17062017 ga-gttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattattgga-ttatacaagagtttgtcgat 17062114  T
Q  391 ttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  17062115 ttaagatgtttaagaggtc-aatccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgg 17062177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 24275289 - 24275089
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275289 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24275191  T
Q  333 taagttgatgaaga------tgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||||      |||| |||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24275190 taagttgattaagatgttgttgattatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagacgtttaagaggtcgagtccatgcattaaca 24275092  T
Q  427 ttt 429  Q
    |||    
T  24275091 ttt 24275089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Original strand, 9389464 - 9389675
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||| | ||||| |||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||    
T  9389464 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaagcagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcacacgagttgatgtg 9389563  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| |    |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||    
T  9389564 agttgatcttggaggttagaaactaagttatcgaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatattgatgataatgttatataat 9389663  T
Q  200 tgtatatacatt 211  Q
    ||||||||||||    
T  9389664 tgtatatacatt 9389675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 381
Target Start/End: Original strand, 20220005 - 20220330
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||| |||||  || |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  20220005 acagaataccttgttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaggtgatcacaggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgt 20220104  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 248  Q
    | |||||||||||| ||  || || | ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||   ||||||     
T  20220105 tccagtaagcctgatttagatgatttgatgttgttaataatgtgatataattgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgaga---tgttgat 20220200  T
Q  249 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 345  Q
    || ||||||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||         
T  20220201 ttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgtatgagtcggtctaagatga----- 20220294  T
Q  346 atgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    | |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  20220295 aagatgttgttccaaattattggatttatataagag 20220330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 399 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9703215 - 9703043
Alignment:
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcga 497  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  9703215 tttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctgaaattagcga 9703118  T
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  9703117 tgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctg-attggtaccacatgc 9703043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15113296 - 15113028
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||      |  |||| || | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  15113296 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtccttgtgagacaggatgccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtga 15113197  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |  | |||||  |  |||||| ||||||||    
T  15113196 gttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgatttatatgagttgatgttaattataatgtgatataatt 15113097  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 270  Q
    ||||||| ||||| |||| |||| | |||   ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15113096 gtatatatattacttgag-ttatatgtgaatattgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 15113028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 323 - 457
Target Start/End: Original strand, 15082017 - 15082147
Alignment:
Q  323 tgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatt 422  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |   ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15082017 tgagtcggtctaagttgattaagatgaagtt---ccaaattattggatta-tacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatt 15082112  T
Q  423 agcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15082113 agcatttcattgtttggggcttgatgccctggagc 15082147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 233 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 18430830 - 18430695
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430830 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18430732  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18430731 taagttgattaagatgatgatgttccaaattattgga 18430695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 395 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24054421 - 24054245
Alignment:
Q  395 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattag 494  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||| ||    
T  24054421 gatgtttaagtgatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacgcgatggagctttagctcaaat-ag 24054324  T
Q  495 cgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  24054323 agatgggggctc-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 24054245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 15116785 - 15116565
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||| ||||    
T  15116785 acagaatgccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgt 15116686  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 248  Q
    ||||||||| ||||  | ||| |  | ||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||   ||||||||||| ||||    
T  15116685 ttcagtaagactgatgtatatgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatatattacttgag-ttatatgtgaatattgagatgttgatgac 15116587  T
Q  249 ttacatttgatattgttatatc 270  Q
    || || ||||||||||||||||    
T  15116586 ttgcaattgatattgttatatc 15116565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 240 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16213795 - 16213667
Alignment:
Q  240 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 339  Q
    |||||||||||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213795 gttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16213697  T
Q  340 atgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||    
T  16213696 attaagatgatgaggttccaaattattgga 16213667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 32216703 - 32216886
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||| |||||| ||||||     
T  32216703 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtacttaacacgatggagcattagctc 32216800  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| || || ||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  32216801 aaattagcgatgggggctt-atgccttgaaaatattttaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 32216886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 3564568 - 3564642
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3564568 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 3564642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 40443308 - 40443234
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40443308 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 40443234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 17138113 - 17138398
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   |||||||||||   |||| |||       
T  17138113 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatga 17138212  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    ||    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17138213 tg----attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatt 17138307  T
Q  483 agcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||| || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  17138308 agctcaaaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 17138398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 294 - 453
Target Start/End: Original strand, 26356098 - 26356258
Alignment:
Q  294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaa---a 390  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |        
T  26356098 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttt 26356196  T
Q  391 ttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26356197 ttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagttgagggcttgatgccctg 26356258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 294 - 453
Target Start/End: Original strand, 26358550 - 26358710
Alignment:
Q  294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaa---a 390  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |        
T  26358550 tgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttt 26358648  T
Q  391 ttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26358649 ttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagttgagggcttgatgccctg 26358710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 474 - 559
Target Start/End: Original strand, 16461166 - 16461250
Alignment:
Q  474 tggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16461166 tggagctttagctcaa-ttagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 16461250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12187083 - 12186798
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   |||||||||||   |||| |||       
T  12187083 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatga 12186984  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    ||    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  12186983 tg----attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagctttgtactcaccacgatggagcatt 12186889  T
Q  483 agcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||| || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||| ||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  12186888 agctcaaaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttggaggc-tcatgccctaaattggtaccacatgc 12186798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 340
Target Start/End: Original strand, 1867937 - 1868101
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 273  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||||||||||      
T  1867937 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcatgag 1868034  T
Q  274 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340  Q
    ||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868035 ctg-ttttatatactgcctatgttgttgttagtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 1868101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Original strand, 16402712 - 16402776
Alignment:
Q  511 ccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16402712 ccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 16402776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13869226 - 13869144
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13869226 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 13869144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 176 - 575
Target Start/End: Original strand, 15008441 - 15008845
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 273  Q
    ||||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| || || | ||||||||||| ||||||||| || |||| |||||||||||||||||      
T  15008441 atgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttgaatt-atatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaa 15008538  T
Q  274 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggacta 372  Q
    ||| ||||  ||||| ||||||||| |||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||  ||||||| ||||||||||||| |     
T  15008539 ctg-ttttatatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaa---gatgaaga--atgatgttccaaattattggattt 15008632  T
Q  373 atataagagtttgtcaa----attaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcac 468  Q
    |||||||||   |||||      ||||||| |||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  15008633 atataagag---gtcaatgtttctaagatg-ttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctgaagcctt-tactcac 15008726  T
Q  469 cacgt----------------tggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttga 552  Q
    |||||                ||||||||||||| || | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||    
T  15008727 cacgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaa--gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttga 15008822  T
Q  553 tgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  15008823 tgccctggattggtaccacatgc 15008845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 38898659 - 38898741
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38898659 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 38898741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 375 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 18427510 - 18427433
Alignment:
Q  375 ataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    ||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18427510 ataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 18427433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 176 - 333
Target Start/End: Original strand, 12255733 - 12255892
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 273  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||  ||||| ||| || || | ||| ||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||     
T  12255733 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgtattacttgaatt-atatatgaatgtttgagatgttgtagaatttcatttgatattgttatatcatga 12255831  T
Q  274 ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 333  Q
     | | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12255832 attgatttgcatactgactatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtctgtct 12255892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 521 - 575
Target Start/End: Original strand, 28505626 - 28505680
Alignment:
Q  521 atattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505626 atattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 28505680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14429846 - 14429666
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||      
T  14429846 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcata-cattgttgggggctt-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctca 14429749  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14429748 aaataattgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgctgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 14429666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 17017688 - 17017764
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17017688 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 17017764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13647162 - 13647079
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  13647162 tagcgattggggcttgatgctttggaagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 13647079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16495240 - 16495157
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  16495240 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgataggggtttgatgctccgtattggtaccacatgc 16495157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 504 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24274989 - 24274918
Alignment:
Q  504 cttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  24274989 cttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 24274918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16091647 - 16091571
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16091647 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cattgagggcttgatgccctgtattgctaccacatgc 16091571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14044928 - 14044522
Alignment:
Q  174 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcat 272  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||     
T  14044928 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcag 14044831  T
Q  273 g--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    |  ||| ||||   |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     | |||| ||| |||||||||||||    
T  14044830 gagctg-ttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagatgttgttccaaattattgga 14044737  T
Q  370 ctaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcac 468  Q
     | ||||||||| | |     | ||||||||  |||  || ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||     
T  14044736 tttatataagaggtcgatgtttctaagatgt--aagttgttgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaa 14044641  T
Q  469 cacgttg----------------gagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttga 552  Q
    || ||||                ||||||||||| || | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||    
T  14044640 catgttgagggcttgatgccatggagctttagctcaattaagt--tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttga 14044545  T
Q  553 tgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  14044544 tgccttggattggtaccacatgc 14044522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 174 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14354958 - 14354552
Alignment:
Q  174 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcat 272  Q
    ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||     
T  14354958 taatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgttatatcag 14354861  T
Q  273 g--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    |  ||| ||||   |||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     | |||| ||| |||||||||||||    
T  14354860 gagctg-ttttatgtactgcctatgttgctttttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagatgttgttccaaattattgga 14354767  T
Q  370 ctaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcac 468  Q
     | ||||||||| | |     | ||||||||  |||  || ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||     
T  14354766 tttatataagaggtcgatgtttctaagatgt--aagttgttgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaa 14354671  T
Q  469 cacgttg----------------gagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttga 552  Q
    || ||||                ||||||||||| || | ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||    
T  14354670 catgttgagggcttgatgccatggagctttagctcaattaagt--tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttga 14354575  T
Q  553 tgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| || |||||||||||||||    
T  14354574 tgccttggattggtaccacatgc 14354552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 345 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 16213632 - 16213550
Alignment:
Q  345 gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213632 gatgatgatgttccaaattattggactatt-taagaggtcattgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 16213550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 19486939 - 19487022
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19486939 tagcgattggggcttgatgcttcggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 19487022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 9177899 - 9177975
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || || ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  9177899 tgagggcttgatgccctggaagtatattagtacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacatgc 9177975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16213461 - 16213377
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  16213461 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 16213377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 498 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 18203701 - 18203626
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  18203701 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgaggacttgatgccttggattggtaccacatg 18203626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13831255 - 13831173
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  13831255 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatattcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaacacatgc 13831173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16213505 - 16213442
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16213505 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 16213442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 413 - 460
Target Start/End: Original strand, 16461127 - 16461174
Alignment:
Q  413 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 460  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16461127 tccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgccctggagcttt 16461174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 2282521 - 2282596
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2282521 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 2282596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 13647197 - 13647143
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13647197 gggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 13647143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16056178 - 16056103
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16056178 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 16056103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 11525835 - 11525911
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11525835 tgagggcttgatgccctgggagtatatttatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 11525911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 11772524 - 11772600
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11772524 tgagggcttgatgccctaggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 11772600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 20220421 - 20220497
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20220421 tgagggcttgatgccttggaagtatattaatacttaaaca-cattgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 20220497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 518 - 575
Target Start/End: Original strand, 42376304 - 42376361
Alignment:
Q  518 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  42376304 agtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 42376361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 42461799 - 42461723
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||  |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  42461799 tgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataa-gatgggggcttgatgccctagattggtaccacatgc 42461723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2760103 - 2759921
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||    
T  2760103 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctta 2760005  T
Q  489 aatt--agcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |  |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  2760004 aaataaactgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 2759921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 12321917 - 12322076
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  12321917 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctt-at 12322014  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| | ||||||| ||||| ||||   | ||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  12322015 gccctgaacgtatatttatactaaaat---gttgggggc-tcatcccctgaattggtaccacatgc 12322076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Original strand, 12756715 - 12756817
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||  | ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  12756715 ttgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgctgttgttatttaactaaactgctcgagtcggtc 12756813  T
Q  333 taag 336  Q
    ||||    
T  12756814 taag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 492 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 3386215 - 3386134
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
T  3386215 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgctccgtattagtatcacatg 3386134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 12255560 - 12255614
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12255560 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaat 12255614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 12256092 - 12256167
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12256092 tgagggcttgatgccctagaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 12256167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 13869260 - 13869207
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13869260 gggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 13869207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16213540 - 16213486
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16213540 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 16213486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16495319 - 16495265
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16495319 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 16495265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22072843 - 22072768
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22072843 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgattccctggattggtaccacatgc 22072768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 9033581 - 9033657
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9033581 tgagggcttgatgtcctgggattatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 9033657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12901170 - 12901095
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| || || ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  12901170 tgagggcttgatgccttggaagtatattaatact-taata-cgttgagggctcgatgccctggattggtaccacatgc 12901095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44116388 - 44116312
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44116388 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 44116312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 48273227 - 48273151
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  48273227 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 48273151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 48991068 - 48990992
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |  ||  || ||||||||||| |||||||||||||||    
T  48991068 tgagggcttgatgtcctggaagtatattaatacttaaata-cattgaaggattgatgccctggattggtaccacatgc 48990992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16495284 - 16495221
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16495284 tagcgattggggcttgatgctccgggagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 16495221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18005492 - 18005420
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18005492 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgc 18005420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20110389 - 20110315
Alignment:
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20110389 agggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 20110315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 575
Target Start/End: Original strand, 27848088 - 27848127
Alignment:
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27848088 tagcgatgggggcttgatgccccgtattggtaccacatgc 27848127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 2279887 - 2279941
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||    
T  2279887 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcctagttatagaat 2279941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 3386249 - 3386196
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3386249 gggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 3386196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 13647241 - 13647187
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  13647241 gggcttaatgccttggaagtataataatactcaaatagcaattggggcttgatgc 13647187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 131087 - 131163
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||  ||||| ||| |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  131087 tgagggcttgatttcctgggagtgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 131163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 531
Target Start/End: Original strand, 1868228 - 1868261
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868228 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 1868261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 502 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 13831288 - 13831236
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  13831288 ggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 13831236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 351
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932851
Alignment:
Q  302 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 351
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356286
Alignment:
Q  302 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 302 - 351
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360400
Alignment:
Q  302 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 17062159 - 17062235
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |   ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17062159 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgatcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 17062235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20585378 - 20585303
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20585378 tgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tat-gttgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgc 20585303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 29329203 - 29329279
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| |  |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29329203 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cattgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 29329279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 38519222 - 38519146
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||| || ||||||||  | | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38519222 tgagggcttgataccctgggagtgtatttatgctcaaataa-gttaggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 38519146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 44116857 - 44116804
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||||||    
T  44116857 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgactcagttacagaa 44116804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18203882 - 18203791
Alignment:
Q  285 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    ||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||     | |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  18203882 tactgtctatgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaagatga-----aagatgttgttccaaattattggatttatataagag 18203791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 472
Target Start/End: Original strand, 39268053 - 39268135
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  39268053 attaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 39268135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44014025 - 44013953
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    |  || || ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44014025 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tgttacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgc 44013953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 531
Target Start/End: Original strand, 811407 - 811437
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  811407 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 811437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 354
Target Start/End: Original strand, 2832499 - 2832561
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  2832499 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 2832561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 3271765 - 3271704
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3271765 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 3271704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 476
Target Start/End: Original strand, 12255992 - 12256056
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  12255992 gagtccatgcattcgcatt-cagtgatgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 12256056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #155
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 12756485 - 12756535
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttaca 51  Q
    |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||    
T  12756485 gaactcaccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattaca 12756535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #156
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 16219989 - 16220063
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||  || || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16219989 tgagggcttgatgccctggaagtatactaatact--tattacgttgagggcttgatgccctg-gttggtaccacatgc 16220063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #157
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 17061729 - 17061783
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  17061729 gaactcgcgatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat 17061783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #158
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18301982 - 18301921
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18301982 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 18301921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #159
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 491 - 553
Target Start/End: Complemental strand, 24275090 - 24275028
Alignment:
Q  491 ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgat 553  Q
    ||||||||  ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  24275090 ttagcgattggggcttgatgctccagaagtataataatactcaaatagcgattgaggcttgat 24275028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #160
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 38898625 - 38898678
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  38898625 gggcttgatgctcttga-gtatattaattctcaaatagcgataggggcttgatgc 38898678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #161
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 42203934 - 42203874
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  42203934 gagtccatgcattagcata-ctttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 42203874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 9177433 - 9177470
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 38  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  9177433 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgag 9177470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #163
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 537
Target Start/End: Original strand, 11769149 - 11769186
Alignment:
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaata 537  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11769149 agggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata 11769186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #164
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 14183762 - 14183795
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14183762 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 14183795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #165
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 18456651 - 18456727
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18456651 tgaggccttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggagcttgatgccctggattggtaccacatgc 18456727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #166
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 26212347 - 26212302
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 46  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  26212347 gaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 26212302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #167
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 9446216 - 9446252
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  9446216 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 9446252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #168
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 20569654 - 20569690
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20569654 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 20569690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #169
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 432 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 22072885 - 22072857
Alignment:
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagcttt 460  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22072885 ttgttgggggcttgatgccctggagcttt 22072857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #170
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 289
Target Start/End: Original strand, 26356027 - 26356083
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 289  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||    
T  26356027 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg 26356083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #171
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 233 - 289
Target Start/End: Original strand, 26358479 - 26358535
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 289  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||    
T  26358479 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactg 26358535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 157)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Original strand, 28496242 - 28496811
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28496242 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 28496340  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||||||||||||||    
T  28496341 agttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataat 28496440  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  28496441 tgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgc 28496535  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  28496536 taattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagat 28496634  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  28496635 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcga 28496733  T
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28496734 tgtgagcttgatgccttggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 28496811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Original strand, 29808653 - 29809222
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||||||| | ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||    
T  29808653 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaa-tgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 29808751  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||||||||||||||    
T  29808752 agttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgcttataatgttatataat 29808851  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  29808852 tgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttgc 29808946  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  29808947 taattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagat 29809045  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcga 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29809046 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcga 29809144  T
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29809145 tgtgagcttgatgccttggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 29809222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 62 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1561593 - 1561083
Alignment:
Q  62 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 161  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||  | || ||||||| |||    
T  1561593 ttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactg 1561494  T
Q  162 aattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgata 260  Q
    |    ||| ||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| ||||    
T  1561493 atgcatatgaatttaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgata 1561398  T
Q  261 ttgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccca 359  Q
    || |||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  1561397 ttattatatcatgatggttt-gcatactacctatattgttatttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgttcca 1561299  T
Q  360 aattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagct 458  Q
    ||| |||||| ||||||| ||| ||||| ||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1561298 aataattggattaatatacgagattgtcgaattaagttgttttaagaggtcgaatccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagct 1561200  T
Q  459 ttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccct 558  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  1561199 ttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgagaagggcttgatgccct 1561100  T
Q  559 gtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||    
T  1561099 gtattggtaccacatgc 1561083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 255 - 575
Target Start/End: Original strand, 20638304 - 20638624
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20638304 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatg 20638403  T
Q  355 tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20638404 ttccaaattattggattaatataagaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgacgccctgg 20638503  T
Q  455 agctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatg 554  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20638504 agctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatg 20638603  T
Q  555 ccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  20638604 ccctgtattggtaccacatgc 20638624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29060662 - 29060322
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060662 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29060563  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060562 taagctgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 29060464  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29060463 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact 29060365  T
Q  532 caaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29060364 c-aatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 29060322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 236 - 574
Target Start/End: Original strand, 17287798 - 17288134
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287798 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17287897  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287898 gttgattaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgccgaattaagatgcttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 17287996  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17287997 tgtgggcttgatgccctgaagctttgtactcaacacgttggagttttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 17288095  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17288096 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 17288134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 22780229 - 22780566
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||| |||| ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22780229 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 22780328  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780329 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggtagtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 22780427  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22780428 tgggggcttgataccttggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccttggaagtatattaatactcaaa 22780526  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780527 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 22780566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 23019759 - 23019289
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  23019759 gaactcgccatggcgagtagaggcccttgcctcgcgagttgtccaattacaaaatgcttggttaggttaaatgcgatctttgtcgaacgagttgatgtga 23019660  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23019659 gttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaactatataatctaatgtcgttgttaatgttatataatt 23019560  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||    
T  23019559 gtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcttatgttgct 23019462  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatg 398  Q
    | |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||    | ||||| |    
T  23019461 gtttgtttattaactaagctgcataagtcggtctaagatga--aagatgatgatgttccaaattattggatatatataagaggttgttgtttataaga-g 23019365  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||  || | |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  23019364 gttaagttgttgtgtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttaatgctctggagcctt-tgctcaccacgttgg 23019289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Original strand, 25629354 - 25629692
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25629354 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcctgttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtc 25629453  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||  || || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25629454 taagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaagttttcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 25629552  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25629553 tgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact- 25629650  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25629651 -tatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 25629692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 284 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 35245658 - 35245365
Alignment:
Q  284 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagt 382  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  35245658 atactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagg 35245559  T
Q  383 ttgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctt 481  Q
    ||||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  35245558 ttgttgaatcaagttgttttaagaggtcgagtctatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcat 35245460  T
Q  482 tagcttaaa-ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35245459 tagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 35245365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 236 - 512
Target Start/End: Original strand, 20360962 - 20361238
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20360962 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaa 20361061  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20361062 gttgatgaaaatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 20361161  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgcc 512  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20361162 tgggggcttgatgccctggagctttatactcaacacgttggagttttagctcaaattagcgatgggggcttgatgcc 20361238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 242 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076485
Alignment:
Q  242 tgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 341  Q
    |||||| || ||||||||||| |||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  342 gaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggg 441  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||     ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076713 gaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgttctaagatgtttaagattttgagtccatgcattagcatttcattgttggggg 20076615  T
Q  442 cttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcga 541  Q
    |||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  20076614 cttgatgccctggagccttatgctcaacacgatggagctttcgctcaa--tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--aatagcga 20076519  T
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20076518 tgggggcttgatgccctcgattggtaccacatgc 20076485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 284 - 575
Target Start/End: Original strand, 16920679 - 16920971
Alignment:
Q  284 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagt 382  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||     
T  16920679 atactgcctatgctgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgttccaaattgttggactaatataagagg 16920778  T
Q  383 ttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16920779 ttgtcgaattaagttgtttaagaggtcaagtccatgcattagca-ttcatagtagggggcttgacaccctggagctttgtactcaccacgttggagcatt 16920877  T
Q  483 agct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||  ||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16920878 agctcaaaaatagcaatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggtcttgatgccctgtattggtaccacatgc 16920971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 228 - 531
Target Start/End: Original strand, 18409821 - 18410126
Alignment:
Q  228 gatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 327  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18409821 gatgattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagt 18409920  T
Q  328 cggtctaagttgatgaagatgatgatg----tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatta 423  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18409921 cggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagttcatgcatta 18410019  T
Q  424 gcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtata 523  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||  ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18410020 tcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactccacacaatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtata 18410118  T
Q  524 ttaatact 531  Q
    ||||||||    
T  18410119 ttaatact 18410126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 6e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19652547 - 19652080
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19652547 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgggctaactagttacaaaataccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 19652448  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  19652447 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 19652348  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||     
T  19652347 tgtatatactttaaatg-gattatgtt-gatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgt 19652252  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||| | || |||||| ||||     |||| ||    
T  19652251 tgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggagttatttaagaggttgttgttctaagttg 19652155  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  19652154 -ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tcctcaccacgttgg 19652080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 288 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22831571 - 22831289
Alignment:
Q  288 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgt 386  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22831571 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgt 22831472  T
Q  387 caaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct 486  Q
      ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22831471 tgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatacattagca-ttcatagttgggggcttgattccctggagctttgtactcacgacgttggagcattagct 22831373  T
Q  487 -taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22831372 aaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa------atgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 22831289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 233 - 517
Target Start/End: Original strand, 19303540 - 19303821
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303540 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19303638  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  19303639 taagatgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagtatttcat 19303737  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  19303738 tgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccttgga 19303821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19668725 - 19668275
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |  ||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  19668725 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctgtccaattacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtga 19668626  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  | ||| || || |||||||| |||||||||||| ||    
T  19668625 gttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtatatgatgtagtgttgttgataatgttatatagtt 19668526  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||||||  ||| || ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||  ||||||||    
T  19668525 gtatatacattacatga-attacgtatgatg-ttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgcatactatctatgttg 19668429  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||  | | |||||    
T  19668428 ctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgattctaaga 19668334  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    || |||||  || ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19668333 tg-ttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccttggagc 19668275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 233 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 20593895 - 20593615
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20593895 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattcggtc 20593796  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  20593795 taagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcat 20593697  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgg 516  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  20593696 tgctgggggcttgatgccctggagccttgtgctcaacacgatggagctttagctcaa--tagcgatgggggcttgatgccctgg 20593615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 330 - 515
Target Start/End: Original strand, 19773818 - 19774003
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773818 gtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 19773917  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  19773918 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctg 19774003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 302 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185293
Alignment:
Q  302 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgttt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag---------atgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgttt 11185468  T
Q  402 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaa-ttagcgatg 499  Q
     ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |||||||||    
T  11185467 taagaggtcgagtccatgcattagcatt-catagttgggggcttgatgccctggatttttgtactcaccgcgttggagcattagctcaaaattagcgatg 11185369  T
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11185368 ggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggctttatgccctgtattggtaccacatgc 11185293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 256 - 575
Target Start/End: Original strand, 25611744 - 25612068
Alignment:
Q  256 tgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-------tgaagatg 348  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||||       ||  ||||    
T  25611744 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25611843  T
Q  349 atgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 448  Q
     |||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25611844 ttgatgttccaaattattggactatt-taagaggtcgttgaat-aagatgtttaagaggtcgtgtccatgcattaggatttcattgttgggggcttgatg 25611941  T
Q  449 ccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc 548  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25611942 ccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaatttagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc 25612041  T
Q  549 ttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||    
T  25612042 ttgatgccgtatattgataccacatgc 25612068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 357 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22805746 - 22805531
Alignment:
Q  357 ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||||||||| || |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22805746 ccaaattattggatta-tataagaagttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 22805648  T
Q  457 ctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgcc 556  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  22805647 ctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcatttagcgatgggggcttgatgccttggaagtatattaatacttaaatagcgat-ggggcttgatgcc 22805550  T
Q  557 ctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  22805549 ctggattggtaccacatgc 22805531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 19858963 - 19859184
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858963 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19859061  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859062 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattggact-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 19859159  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19859160 tgttgggggcttgatgccctggagc 19859184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 486
Target Start/End: Original strand, 4185592 - 4186065
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  4185592 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttatagaatgccttgctaggttaaatgcgatccttgccgcacgagttgttgtga 4185691  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||  |  | || ||||| |||| |||| || || |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| | || |    
T  4185692 gttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgttgttgatgttccagtgagtct-aattgtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaat 4185790  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |  || |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  4185791 gtataaacattgcatga-tttatg-ttgatg-atatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gagttgcatactgcctatgttgct 4185886  T
Q  301 gt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    || |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||    |||||||||    
T  4185887 gtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat---gatgacgatgttccaaattattggact-atttaagaagttgt----ttaagatgt 4185978  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct 486  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||  ||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4185979 ttaagaggtcgagtccatgcattatcatacatttgttgggggcttactgctccggggctttgtactcaccacgatggagctttagct 4186065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 18334636 - 18334857
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334636 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18334734  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334735 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 18334832  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18334833 tgttgggggcttgatgccctggagc 18334857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19005164 - 19004943
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005164 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19005066  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005065 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 19004968  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  19004967 tgttgggggcttgatgccctggagc 19004943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 70 - 476
Target Start/End: Original strand, 22080576 - 22080963
Alignment:
Q  70 aatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-ta 168  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  22080576 aatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgata 22080675  T
Q  169 taatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgact-tacatttgatattgttat 267  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |  |||||   ||||||||||||||||||  || | |||| |||||||||||    
T  22080676 tgacctaatgatgttgttaatgttatataaatgtatatacattatatta-attatg-acgatgtttgagatgttgtt--ctgtgcattcgatattgttat 22080771  T
Q  268 atcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattg 367  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  22080772 atcatgat-gttttgcatactgcctatg------------tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgttccaaattattg 22080858  T
Q  368 gactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactca 467  Q
    |||| ||||||||| ||||    ||||| || |||||  |  | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  22080859 gacttatataagaggttgttgttttaag-tg-ttaagttgatgtgtccatacattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctca 22080954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24422665 - 24422444
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422665 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24422567  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422566 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 24422469  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24422468 tgttgggggcttgatgccctggagc 24422444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 256 - 575
Target Start/End: Original strand, 25603406 - 25603730
Alignment:
Q  256 tgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-------tgaagatg 348  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||| |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||| | |||||       ||  ||||    
T  25603406 tgatattgttatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatg 25603505  T
Q  349 atgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 448  Q
     |||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25603506 ttgatgttccaaattattggactatt-taagaggtcgttgaat-aagatgtttaagaggtcgtgtccatgcattagcatttcattgttgagggcttgatg 25603603  T
Q  449 ccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc 548  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||    
T  25603604 ccctggagctttgtactcaccatgttggagcattagctcaatttagcgatgggggcttgatgctctggtagtatattaatattcaaatagaaatgggggc 25603703  T
Q  549 ttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25603704 ttgatgccctatattggtaccacatgc 25603730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 33861912 - 33861691
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861912 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 33861814  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861813 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 33861716  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33861715 tgttgggggcttgatgccctggagc 33861691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 2291224 - 2291445
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291224 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 2291322  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291323 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 2291420  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2291421 tgttgggggcttgatgccctggagc 2291445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 33864396 - 33864175
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864396 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 33864298  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864297 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 33864200  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  33864199 tgttgggggcttgatgccctggagc 33864175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 1595667 - 1595446
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1595667 ttgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 1595569  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595568 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 1595471  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1595470 tgttgggggcttgatgccctggagc 1595446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 80 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 20109415 - 20109021
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  ||  |||||| ||||  | ||| |  | ||||    
T  20109415 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgtatatcaattgatgt 20109316  T
Q  180 tgttgttaatgttatataat--tgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg 276  Q
    ||||  |||||| |||||||  |||||||||||||| ||| || || | ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||    
T  20109315 tgtttataatgtgatataatattgtatatacattacttgaatt-atatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg 20109217  T
Q  277 gttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaata 375  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | | |||    
T  20109216 -ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattgaatttata 20109120  T
Q  376 taagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgtt 474  Q
    |||||| | ||    | ||||| | || ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  20109119 taagaggtcgttgtttctaaga-ggttgagttgttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcatt-tgctcaccacgtt 20109023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 193 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 22782385 - 22782139
Alignment:
Q  193 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 291  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||| ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||     
T  22782385 atataattgtatatgcattacttgaatt-atgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc- 22782288  T
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat 391  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||| | |||| |||| ||||| | |    
T  22782287 tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaatttccaaattattgga-ttatatgagaggttgtcgatt 22782189  T
Q  392 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggg 441  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782188 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggg 22782139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 8055147 - 8054926
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055147 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 8055049  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055048 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 8054951  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  8054950 tgttgggggcttgatgccctggagc 8054926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 26924684 - 26924905
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924684 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 26924782  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924783 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 26924880  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26924881 tgttgggggcttgatgccctggagc 26924905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12742435 - 12742214
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742435 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12742337  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742336 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagat-attacaaggtcgagtccatgcattagcatttcat 12742239  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12742238 tgttgggggcttgatgccctggagc 12742214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 80 - 381
Target Start/End: Original strand, 9098372 - 9098656
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||| ||           
T  9098372 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcctgaattatatgat------- 9098464  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc-tggt 278  Q
         |||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||||  | ||||||||||||||||||||||  | ||    
T  9098465 -----ttaatgttatataattatatatacattacatgaatt-atgtttgatgtt-gtgaagttgttgaaatgcatttgatattgttatatcatgaattgt 9098557  T
Q  279 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatata 377  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | || ||||| ||||||||||||| | |||||    
T  9098558 tttgcatactgcctttgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagaagatgttccaaattattggatttatata 9098652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 27333053 - 27333238
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27333053 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccaattacagaatgctttgttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtga 27333152  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgtt 186  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27333153 gttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatccaatgttgttgtt 27333238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 27393793 - 27393978
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  27393793 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcccaattacagaatgctttgttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtga 27393892  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgtt 186  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27393893 gttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcctgaattgtataatccaatgttgttgtt 27393978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 1540955 - 1541176
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1540955 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatc 1541053  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1541054 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 1541151  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  1541152 tgttgggggcttgatgccttggagc 1541176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 20556936 - 20557158
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20556936 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtc 20557034  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  20557035 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttttcaatttaagatgtttaagtggtcgagtccatgcattaacatttcat 20557133  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||    
T  20557134 tgttgtgggcttgatgtcgtggagc 20557158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 233 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25688620 - 25688401
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25688620 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatc 25688522  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| ||||| |||| || ||||||||||||| | ||||||||| || || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25688521 taagttgattaagataatgaggttccaaattattgga-ttatataagaggttatcgatttacgatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcaa 25688423  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  25688422 agttgagggcttgatgccctgg 25688401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 236 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 16496363 - 16496204
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496363 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 16496264  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaag 395  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16496263 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaag 16496204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 25754927 - 25754715
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25754927 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 25754829  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  25754828 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctt 25754732  T
Q  433 tgttgggggcttgatgc 449  Q
    |||||||||||||||||    
T  25754731 tgttgggggcttgatgc 25754715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 486
Target Start/End: Original strand, 31155169 - 31155641
Alignment:
Q  3 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagt 102  Q
    |||| |||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||  |||||  || | ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||     
T  31155169 actctccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagctacccctttacaacatgccttgttaggttaaatgcggtccttgtcgcacgagttgttgtgaga 31155268  T
Q  103 tgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgt 202  Q
    |||| ||||| || | |||||||||||  |  |||||||||| |||| |||| || || |||| | |||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  31155269 tgattttagatgttaagaactaagttgcctagcttgctgttgatgttccagtgagtctaaattttttaatccgatgatgttgttgatgttatataaatgt 31155368  T
Q  203 atatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg- 301  Q
    ||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |  || |||| ||| || |||| ||||||||||||||| | | |  ||||||||||  || |||||||     
T  31155369 ataaacattgcatga-tttatg-ttgatg-atatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgat-gacttgcatactgttta-gttgctgt 31155463  T
Q  302 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtt 400  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || || ||  ||||    ||||||||||    
T  31155464 tttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-atttacgaagttgt----ttaagatgtt 31155555  T
Q  401 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct 486  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31155556 taagatgtcgagtccatgcattagca-tacatatgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagct 31155641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 233 - 427
Target Start/End: Original strand, 30676754 - 30676952
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676754 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 30676852  T
Q  333 taagttgatgaa------gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||      ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676853 taagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 30676951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 454
Target Start/End: Original strand, 16448582 - 16448787
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  16448582 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatta 16448680  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    |||||| | |   ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  16448681 agatgaagtt---ccaaattattggatta-tacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggct 16448776  T
Q  444 tgatgccctgg 454  Q
    |||||||||||    
T  16448777 tgatgccctgg 16448787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 291 - 575
Target Start/End: Original strand, 25642244 - 25642524
Alignment:
Q  291 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---tcccaaattattggactaatataagagtttgtc 387  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||   | ||||||||||||| ||| ||||||| |  |     
T  25642244 ctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattgga-taa-ataagagatgatg 25642341  T
Q  388 aaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  25642342 a--ttaagatgtttaagagatcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc 25642438  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  25642439 aaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 25642524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 176 - 426
Target Start/End: Original strand, 8227453 - 8227703
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  8227453 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 8227551  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || |||||||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  8227552 tg-ttttgcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgttccaaattattggactat 8227650  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8227651 tataagaggttgtcgaattaagacgtttaagaagtcgagtccatgcattagca 8227703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 290 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19863039 - 19862758
Alignment:
Q  290 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtttgt 386  Q
    |||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |  |    
T  19863039 cctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagatgat 19862942  T
Q  387 caaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagc 485  Q
     |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19862941 ga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcata-cataagttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagc 19862846  T
Q  486 ttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  19862845 tcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 19862758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19873184 - 19872900
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| |   ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  19873184 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttaaaccttcaaattattgga-taa-ataagagat 19873087  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||  || ||||  | |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19873086 gatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcata-cataatttgggggctcatgccctggagctttgtactcaacacgatggagcttta 19872990  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  19872989 gctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 19872900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
Target Start/End: Original strand, 3852061 - 3852273
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| | || |||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3852061 ttgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttattaaactaagctgcatgagtcggtc 3852159  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  3852160 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctt 3852256  T
Q  433 tgttgggggcttgatgc 449  Q
    |||||||||||||||||    
T  3852257 tgttgggggcttgatgc 3852273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 34963491 - 34963292
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34963491 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 34963393  T
Q  333 taagttgatgaa------gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||      ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963392 taagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 34963294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 22335052 - 22335234
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaa 489  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| ||    
T  22335052 attaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtacgcaacacgatggagctttagctcaa 22335150  T
Q  490 attagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  22335151 attagcgatgggggctt-ttgccctggaagtatattaatactcaaataacgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 22335234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 294 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714319
Alignment:
Q  294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaatta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||| |   |||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgccggttta 25714380  T
Q  394 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||||||    
T  25714379 atatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacttttcaaagttgagggcttgatgccctgg 25714319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 286 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22432314 - 22432029
Alignment:
Q  286 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagt 382  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||| | ||| |||||||     
T  22432314 actgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgta-taa-ataagaga 22432217  T
Q  383 ttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    |  | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  22432216 tgatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcatttgcatacatttgttgggggctc-atgctctggaactttgtactcaacacgatggagcttt 22432120  T
Q  483 agcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  22432119 agctcaaaatagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 22432029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 286 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22438864 - 22438579
Alignment:
Q  286 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagt 382  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||| | ||| |||||||     
T  22438864 actgcctatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgta-taa-ataagaga 22438767  T
Q  383 ttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    |  | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    ||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  22438766 tgatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcatttgcatacatttgttgggggctc-atgctctggaactttgtactcaacacgatggagcttt 22438670  T
Q  483 agcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  22438669 agctcaaaatagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 22438579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 176 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 25644500 - 25644299
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||  |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25644500 atgttgtttttgatgtgatataattgtatacgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgc 25644402  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | || ||||| ||||||||||||| | |    
T  25644401 tgtttttgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagaagatgttccaaattattggattta 25644307  T
Q  374 tataagag 381  Q
    ||||||||    
T  25644306 tataagag 25644299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Original strand, 4667982 - 4668277
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4667982 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgctaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtga 4668081  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||  |  | |||||||| |||| |||| || || |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| | || |    
T  4668082 gttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-aattgtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaat 4668180  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |  || |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  4668181 gtataaacattgcatga-tttatg-ttgatg-atatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gagttgcatactgcctatgttgct 4668276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 301
Target Start/End: Original strand, 4674830 - 4675124
Alignment:
Q  2 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgag 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4674830 aactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgctaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtgag 4674929  T
Q  102 ttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattg 201  Q
    ||||||||||| || | |||||||||||  |  | |||||||| |||| |||| || || |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| | || ||    
T  4674930 ttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-aattgtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaatg 4675028  T
Q  202 tatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg 301  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |  || |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||    
T  4675029 tataaacattgcatga-tttatg-ttgatg-atatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gagttgcatactgcctatgttgctg 4675124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 15894592 - 15894774
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| || |||| |||||| ||||||     
T  15894592 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctt-atgccctagagcttagtacacaacacgatggagcattagctc 15894689  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15894690 aaataa-cgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 15894774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 233 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 25656747 - 25656619
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656747 ttgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 25656649  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaat 362  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  25656648 taagttgattaagatgatgaggttccaaat 25656619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 4186470 - 4186244
Alignment:
Q  252 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 350  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||  || |||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   |||     
T  4186470 cattcgatattgttatatcatgatgagtt-gcatactgtctatgttgctgcctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga---tgac 4186375  T
Q  351 gatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 450  Q
    ||| | |||||||||||||||| | |||||  ||||    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||  |||     
T  4186374 gatattccaaattattggactatt-taagaagttgt----ttaagatgtttaagaggtcgaggtcatgcattagcatacatttgttgggggcttactgct 4186280  T
Q  451 ctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct 486  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4186279 ccggagctttgtactcaccacgatggagctttagct 4186244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 428
Target Start/End: Original strand, 19848048 - 19848194
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataaga 380  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||      ||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  19848048 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatt-taaga 19848146  T
Q  381 gtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19848147 ggtcgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 19848194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 303 - 486
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738801
Alignment:
Q  303 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgttta 402  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||    ||||||||| ||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgatga---tgacgatgttccaaattattggactatt-taagaaattgt----ttaagatgtcta 4738717  T
Q  403 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct 486  Q
    |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4738718 agaggtcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgatggagctttagct 4738801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 355
Target Start/End: Original strand, 27333241 - 27333339
Alignment:
Q  257 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 355  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27333241 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27333339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 257 - 355
Target Start/End: Original strand, 27393981 - 27394079
Alignment:
Q  257 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 355  Q
    ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27393981 gatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgt 27394079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 399 - 575
Target Start/End: Original strand, 31165006 - 31165174
Alignment:
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgat 498  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||  || |||||||    
T  31165006 tttaagagatcgagtccatgcattagcata-cattgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagctttagctcgaa-tagcgat 31165102  T
Q  499 gagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||| | ||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  31165103 gggggc-tcatgccct-gaagtatattaatact--tatagcgatgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 31165174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23077027 - 23076749
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    |||||||| |||||| ||   |||| ||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  23077027 ttgttaggataaatgtgacctttgttgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagc 23076928  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    ||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| | |||||||| || ||||||||| |  || ||||    
T  23076927 ctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttga 23076829  T
Q  259 tattgttatatcatgct-ggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||| |||||||  | |  |||||   |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076828 tattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 23076749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 35008445 - 35008167
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    |||||||| |||||| ||   |||| ||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||    
T  35008445 ttgttaggataaatgtgacctttgttgcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagc 35008346  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    ||||  |  || || | ||||||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| | |||||||| || |||| |||| |  || ||||    
T  35008345 ctgatatagatgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatattcattacatga-attatatatgatgtttaagttgtttttgattatcacttga 35008247  T
Q  259 tattgttatatcatgct-ggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||| |||||||  | |  |||||   |||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35008246 tattattatatctggatatgttttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 35008167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 347 - 575
Target Start/End: Original strand, 16965428 - 16965646
Alignment:
Q  347 tgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttg 445  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||   |    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||     
T  16965428 tgatgatgttccaaattattggacaaatataagatgat----aattgagatgtttaagagatcgagtccatgcattagtatt-catatgatgggggctt- 16965521  T
Q  446 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 545  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||  |||| |  |||||| ||||||||||||||||   ||  || ||||    
T  16965522 atgctctggagcttagtactcaccacgatggagctttagctcaaaataacgattggggc-tcttgccct-gaagtatattaatact--tattacgttggg 16965617  T
Q  546 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16965618 ggctt-atgccctgtattggtaccacatgc 16965646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 4189307 - 4189203
Alignment:
Q  2 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgag 101  Q
    |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||    
T  4189307 aactcgtcatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgctaggttaaatgcgatcgttgtcgcacgagttgttgtgag 4189208  T
Q  102 ttgat 106  Q
    |||||    
T  4189207 ttgat 4189203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 287 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23992495 - 23992349
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataaga 380  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||      ||||||| |||||||||||||||| | ||||     
T  23992495 ctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatt-taagc 23992397  T
Q  381 gtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    | | ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992396 ggtcgttgtattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 23992349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18456837 - 18456735
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456837 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18456739  T
Q  333 taag 336  Q
    ||||    
T  18456738 taag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18461997 - 18461895
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461997 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18461899  T
Q  333 taag 336  Q
    ||||    
T  18461898 taag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18907052 - 18906893
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  18907052 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggctt-at 18906955  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  18906954 gccctgaaagtatattaatactaaaat---gttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 18906893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34963238 - 34963164
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34963238 gggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 34963164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 16523537 - 16523718
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||      
T  16523537 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctt-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctca 16523635  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |  | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  16523636 aaataattgttgagggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgctgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 16523718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 8227706 - 8227789
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8227706 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 8227789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 19848283 - 19848366
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19848283 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 19848366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Original strand, 18821866 - 18821946
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821866 ttgatattgttatggcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22117779 - 22117703
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  22117779 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtacgacatgc 22117703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 3852341 - 3852423
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  3852341 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 3852423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16492999 - 16492923
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16492999 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 16492923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 18692065 - 18692246
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||| | | |||| |||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||      
T  18692065 attaagatgttttagatgattgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctt-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctca 18692163  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18692164 aaataattgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgctgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 18692246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 18896579 - 18896655
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18896579 tgagggcttgatgccctgtaagtatattaatgctcaaata-cgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgc 18896655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20223795 - 20223719
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20223795 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaaca-cgttgagggcttgatgccctggattggtacgacatgc 20223719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 21740185 - 21740371
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaag-aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |    
T  21740185 attaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatcagctca 21740283  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatg--ggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || | ||| |||| | |||||||| | ||||||||||||| |||||   |||  ||||  | |||||||| |||||||||||||||    
T  21740284 aaataacaatgggggc-tcatgccctgaaggtatattaatactaaaatattaatgttgggggctcatgccctgaattggtaccacatgc 21740371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33442898 - 33442822
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  33442898 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cattgagggcttgatgtcctggattggtaccacatgc 33442822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23992304 - 23992221
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23992304 tagcgattggggcttgatgcttcggaagtataataatactcaaatagtgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 23992221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 80 - 336
Target Start/End: Original strand, 18199262 - 18199519
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| | ||  |||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||  |  || || | ||||    
T  18199262 ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataaatgatttgatgt 18199361  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga-tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctgg 277  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||  |||  |||| | |||||||| ||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||  | |    
T  18199362 tgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtga-attatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatgagttg 18199460  T
Q  278 ttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    ||||   | || ||||||||||||||  |  || | |||||||||||||||||||||||    
T  18199461 ttttatgtgcttcctatgttgctgtttattattgattaagctgcatgagtcggtctaag 18199519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 30676963 - 30677037
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  30676963 gggcttgatgctccgtaagtataataatactcaaatagcgattgagacttgatgccccgtattggtaccacatgc 30677037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 284 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33443118 - 33443068
Alignment:
Q  284 atactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  33443118 atactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 33443068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Original strand, 21830615 - 21830734
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  21830615 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctt-at 21830712  T
Q  510 gccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  21830713 gccctgaaagtatattaatact 21830734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 35008000 - 35007924
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35008000 tgagggcttgatgccctagaagtatattaatgcttaaata-cgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgc 35007924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 500 - 568
Target Start/End: Complemental strand, 18929303 - 18929236
Alignment:
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtac 568  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18929303 aggggttgatgctctgga-gtatattgatactcaaatagcgatggggccttgatgctctgtattggtac 18929236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 25644674 - 25644571
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||| |||  |||||||   ||||||  ||||||||||||||| || ||    
T  25644674 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagttgcccggtttcagaatgcttgtttaggtt-tttgcgatctttgtcgcacgagttgctgaga 25644576  T
Q  101 gttga 105  Q
    |||||    
T  25644575 gttga 25644571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 4642937 - 4643019
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| ||||||    
T  4642937 tagcgataggggcttgatgctctaga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgcttcgtattggtacgacatgc 4643019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 575
Target Start/End: Original strand, 19773980 - 19774019
Alignment:
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773980 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 19774019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 22081002 - 22081074
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22081002 gggcttgatgccctagaagtatattaatact--aattacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgc 22081074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 23076582 - 23076508
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || | ||||||||||||| |||| || |||||    
T  23076582 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagagcttgatgccctggattgatatcacat 23076508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25754691 - 25754609
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| | || |||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  25754691 tagcgataggggcttgatgctctgga-gcatcttaatactcaaataacgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 25754609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 13019439 - 13019394
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13019439 gagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggag 13019394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 273
Target Start/End: Original strand, 18177518 - 18177711
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| | ||  |||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||  |  || || | ||||    
T  18177518 ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatataaatgatttgatgt 18177617  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga-tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 273  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||  |||  |||| | |||||||| ||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  18177618 tgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtga-attatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatg 18177711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 80 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18204353 - 18204160
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| | ||  |||||| || |  ||||||||||||||||||||| ||||  |  || || | ||||    
T  18204353 ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaatgaagttgcttatactgctgttgttgtttcagtaagtctgatgtaaatgatttgatgt 18204254  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgaga-tgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 273  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||||| |||||  |||  |||| | |||||||| ||| || |||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  18204253 tgttaataatgtgatataaatgtatatgcattaagtga-attatatatgatgtttaagattgatgttgattatcatttgatattgttatatcatg 18204160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19652041 - 19651969
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19652041 gggcttgatgccctggaagtatattaatact-tacta-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 19651969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23992339 - 23992285
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23992339 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 23992285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 134 - 212
Target Start/End: Original strand, 28103799 - 28103877
Alignment:
Q  134 tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacatta 212  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||    
T  28103799 tcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcatta 28103877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 34963282 - 34963228
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  34963282 gggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagtgattggggcttgatgc 34963228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Original strand, 19303790 - 19303835
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  19303790 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccttggattggtaccacatgc 19303835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19362277 - 19362201
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19362277 tgagggattgatgccctaggagtatattaatgctcaatta-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 19362201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 502 - 555
Target Start/End: Original strand, 19848249 - 19848302
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19848249 ggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 19848302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 394 - 485
Target Start/End: Original strand, 15041710 - 15041800
Alignment:
Q  394 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagc 485  Q
    |||| ||||||||  |||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
T  15041710 agatttttaagagaacgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagctttagc 15041800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 18696667 - 18696570
Alignment:
Q  174 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 273  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| |||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  18696667 taatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgttggagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 18696570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 498 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 19668221 - 19668148
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  19668221 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-ttata-cgttgagggcttgatgccctagattggtaccacat 19668148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 575
Target Start/End: Original strand, 20361218 - 20361257
Alignment:
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20361218 tagcgatgggggcttgatgccttgtattggtaccacatgc 20361257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 3852307 - 3852360
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3852307 gggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 3852360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 18180457 - 18180361
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct 486  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  18180457 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagct 18180361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 176 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 18706483 - 18706357
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-- 273  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||||||| ||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||      
T  18706483 atgttgttaataatgtcatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttaagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatgaa 18706386  T
Q  274 ctggttttgcatactgcctatgttgctgtt 303  Q
    || |||||  ||| ||||||||||||||||    
T  18706385 ct-gttttatatattgcctatgttgctgtt 18706357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25644188 - 25644113
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||  || || |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  25644188 tgagggcttgatgccctagaagtatattaatact--tattacgttgagggcatgatgccctggattggtaccacatgc 25644113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 25754725 - 25754672
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  25754725 gggcttgatgctctg-aagtatattaatactgaaatagcgataggggcttgatgc 25754672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1595386 - 1595310
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1595386 tgagggcttgatgccctgagagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 1595310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 15705836 - 15705912
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||| |||||||| ||| |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15705836 tgagggcttgttgccctgggagtgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattgttaccacatgc 15705912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 502 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18453066 - 18452994
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18453066 ggcttgatgccctgggagcgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 18452994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 18457067 - 18457014
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  18457067 gaactagccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 18457014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 534 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20593641 - 20593600
Alignment:
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20593641 aatagcgatgggggcttgatgccctggtttggtaccacatgc 20593600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21766759 - 21766718
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21766759 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25688419 - 25688343
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  25688419 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttaatgccctggattggtaccacatgc 25688343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 314 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008789
Alignment:
Q  314 taagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaagt-ccaaattattgga 19008789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22949466 - 22949384
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22949466 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 22949384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 22953422 - 22953340
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22953422 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 22953340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23871910 - 23871828
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  23871910 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 23871828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 23875866 - 23875784
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  23875866 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 23875784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 27325388 - 27325470
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| | || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  27325388 taatgttatataattatatatatattgcattaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 27325470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 9100843 - 9100918
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||| || || |||||||||||||||    
T  9100843 tgagtgcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgataccttggattggtaccacatgc 9100918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 17106006 - 17105925
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 162  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| ||||  ||||||||| | || ||||||||| |||||||| |||||    
T  17106006 ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtagggaatgaagttgtttatattactgttgttg-ttcagtaaccctga 17105925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 27553749 - 27553810
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27553749 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 27553810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 27567787 - 27567848
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  27567787 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 27567848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 16493214 - 16493169
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  16493214 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 16493169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 17106085 - 17106048
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  17106085 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgactcgcgag 17106048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17743003 - 17742970
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17743003 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 17742970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 559
Target Start/End: Original strand, 18410081 - 18410110
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18410081 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 18410110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 18453250 - 18453201
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  18453250 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcataagtcggtctaag 18453201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 19656523 - 19656597
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||| || |||| || ||||| || || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  19656523 tgagggcttgatgccctgga-gtgtatttatgctcaa-ta-cgttgggggcttgatgccctggattgataccacatgc 19656597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 414 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 21766630 - 21766515
Alignment:
Q  414 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccc 513  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || ||| ||| ||  | || |||||| |||||     
T  21766630 ccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagttttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctt-atgcct 21766533  T
Q  514 tggaagtatattaatact 531  Q
    || |||||||||||||||    
T  21766532 tgaaagtatattaatact 21766515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 22080506 - 22080543
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 38  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  22080506 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 22080543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 23539242 - 23539165
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaag 157  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| | | |||| | ||  ||||||||| | || | |||||||||||||||||    
T  23539242 ttgtcgcacgagttgttgtgagttgatccttggggtaggaaataaagttgtttatattacagttgttgtttcagtaag 23539165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 412 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 25644285 - 25644224
Alignment:
Q  412 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||  |||||||||||||    
T  25644285 gtccatgcattaacatt-cattgttgggggcttgatgcgctggatccttg--ctcaccacgttgg 25644224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25714251 - 25714218
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25714251 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 25714218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 236 - 328
Target Start/End: Original strand, 15041552 - 15041644
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    ||||||| |||| || ||||||||||| | || |||||||| | |||    ||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15041552 agatgttattgaattgcatttgatattataatgtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 15041644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 18177439 - 18177471
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctc 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18177439 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctc 18177471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 18204432 - 18204400
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctc 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18204432 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctc 18204400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 18907170 - 18907134
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18907170 tatgctgctattgttatttaactaagctgcatgagtc 18907134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 19790837 - 19790873
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19790837 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 290; Significance: 1e-162; HSPs: 159)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Original strand, 19660606 - 19661175
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||  | || ||||||| ||||| ||  ||||||  |||||||||||||    
T  19660606 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtttgtgttacagaacgcctttttaggttgaatgcaatctttgtcgttcgagttgatgtga 19660705  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  19660706 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 19660805  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||| ||| |||||  |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660806 gtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatgg-tttgcatactgcctatgttgct 19660900  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  19660901 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgt 19661000  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatg 499  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19661001 ttaagaggttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccatggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatg 19661099  T
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19661100 ggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 19661175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 8286844 - 8287184
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt-gcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286844 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 8286943  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286944 agttgatgaagatgatgatgttccaaattactggactaatataagtggttgtcgaattatgatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 8287043  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8287044 ttgggggcttgatgccctggagctttgtacccaccacgttggagctttagctcaaattagcgatggaggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 8287143  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8287144 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 8287184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 21808391 - 21808729
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808391 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21808490  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  21808491 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagc-cttcattgt 21808589  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808590 tgggggcttgatgccttggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggtttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 21808689  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808690 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 21808729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 21329264 - 21329732
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21329264 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgaattacctagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 21329363  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21329364 agttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataat 21329463  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||    
T  21329464 tgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgat-gatttgcatactgcctatgttgc 21329561  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||     ||||| |    
T  21329562 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggttgt---tctaaga-g 21329657  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     || ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  21329658 gttgagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttg--ctcaccacgttgg 21329732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 21729066 - 21729405
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729066 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21729165  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||   |||||||    
T  21729166 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagttcatgcattagc-cgtcattgt 21729264  T
Q  436 t-gggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729265 tggggggcttgatgccttggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggtttgatgccctggaagtatattaatactcaa 21729364  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729365 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 21729405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24493687 - 24493350
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24493687 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaa 24493589  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493588 gttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaaataagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 24493490  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493489 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 24493391  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24493390 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 24493350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 26011803 - 26012273
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||    
T  26011803 gaactcgccatggcgagtagaggccttcgcctcgcgagttgtctagttacagaatgctttgttaggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtga 26011902  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  26011903 gttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaactatataatctgatgttgttgttgatgttatataatt 26012002  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  26012003 gtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatg-ttgctttgcatactgcctatgttgct 26012100  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatg 398  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||| ||||    | ||||| |    
T  26012101 gtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattggatatatataagaggttgttgtttataaga-g 26012197  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  26012198 gttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggtttgatgccctggagcctt-ttctcaccacgttgg 26012273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 247 - 575
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997873
Alignment:
Q  247 acttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 346  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  347 tgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttga 446  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997647 tgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttga 21997745  T
Q  447 tgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggg 546  Q
    ||||||||||||||||||||| || | |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997746 tgccctggagctttgtactcaacatgatggagcttgagctcaaa-tagcgatgggggctttatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggg 21997844  T
Q  547 gcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21997845 gcttgatgccatgtattggtaccacatgc 21997873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24529339 - 24529002
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529339 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24529240  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24529239 gttgatgaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgt 24529141  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529140 tgggggcttgatgccctggagctttgtacttaatacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggctttatgccctggaagtatattaatactcaaa 24529042  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24529041 tagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 24529002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13095613 - 13095276
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13095613 agatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaa 13095515  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13095514 gttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcactg 13095416  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095415 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacaggatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 13095317  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13095316 atagcgatgagggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 13095276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25431513 - 25431176
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25431513 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 25431414  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
     || ||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431413 ttt-atgaagatgatgatgtttccaatttattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 25431316  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25431315 ttgggggcttgatggcctggagctttgtactcaacacgatggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaa 25431217  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25431216 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 25431176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 23390498 - 23390835
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23390498 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23390597  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23390598 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgt 23390696  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23390697 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcattcagtgatgggggcttgataccctggaagtatattaatactcaaa 23390795  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23390796 tagtgatgggggcttgatgccctgtaatggtaccacatgc 23390835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 285 - 575
Target Start/End: Original strand, 21293020 - 21293310
Alignment:
Q  285 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagttt 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||    
T  21293020 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatttaagaggtt 21293119  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttag 484  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21293120 gtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgaattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattag 21293218  T
Q  485 ct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21293219 ctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggacttgatgccctgtattggtaccacatgc 21293310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22075138 - 22074801
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22075138 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaa 22075039  T
Q  336 gttgatgaaga-tgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    |||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22075038 gttgttgaagaatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaat--agatgcttaagaggtcgagtccatgcattagcatt-cattg 22074942  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22074941 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgtttgagtattagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcag 22074842  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22074841 atagtgatgggggcttgatgccctgtattgctaccacatgc 22074801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25421651 - 25421312
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421651 agatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 25421552  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421551 gttgatgaagatgatgatgtttccaatttattggatta-tataagaggttgtcgaattatgatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 25421453  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgat-gagggcttgatgccctggaagtatattaatactca 533  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421452 ttgggggctttatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagc-tcaattagcgatggggggcttgatgccctggaagtatattaatactca 25421354  T
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25421353 aatagcgatgggggtttgatgtcctgtattggtaccacatgc 25421312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13025429 - 13025092
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13025429 agatgttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaa 13025331  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  13025330 gttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcactg 13025232  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025231 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacaggatggagctttagctcaaa-tagtgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 13025133  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13025132 atagcgatgagagcttgatgccctgtattggtaccacatgc 13025092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 9078074 - 9077736
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9078074 ttgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtcagtc 9077975  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9077974 taagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 9077876  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9077875 tgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact- 9077778  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9077777 -tatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 9077736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 386
Target Start/End: Original strand, 21501923 - 21502308
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  21501923 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagtt-cagaatgccttgttgggttaaatgcgatatttgtcgcacgagttgatgtta 21502021  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaa-ctaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    ||||||||| || || || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502022 gttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataa 21502121  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  21502122 ttgtatatacattacatgaatt-atgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgattta-catactgcctatgttg 21502219  T
Q  299 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgt 386  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| ||||    
T  21502220 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggttgt 21502308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 234 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1096588 - 1096250
Alignment:
Q  234 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 333  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| | ||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096588 tgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 1096489  T
Q  334 aagttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1096488 aagttgatgaagatgttgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 1096390  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || | ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  1096389 tgttgggggcttgatgccctggagccttgtgctcaacatgatggagctttagctcaaa-tagcgatg-gggcttgatgccctgaaagtatattaatact- 1096293  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1096292 taatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 1096250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 37724023 - 37723683
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||  | || ||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37724023 ttgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcagt 37723927  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    ||||| || |||||||| ||| || |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37723926 ctaagatgttgaagatgttgaagttccaaattattggactaaattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttca 37723828  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatac 530  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37723827 tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatac 37723728  T
Q  531 tcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37723727 tcgaatagcgatgggggcttgatgccctgtattagtaccacatgc 37723683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21565896 - 21565445
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||| || | |||||||||||   ||||| | || |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  21565896 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgtgagctaactagttacagaatgacttgtttatgtaaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 21565797  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  21565796 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 21565697  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||    
T  21565696 tgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatttgg-atactgcctatgttgc 21565599  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||    |||| ||    
T  21565598 tatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgtcgttctaagttg 21565502  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
     |||||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21565501 -ttaagatgttgtgaccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgacgccctggagc 21565445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 22959302 - 22959748
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  22959302 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgttgcacaagttgatgtg 22959401  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| |  ||| ||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||    ||| |||| ||||||| |   ||||||||||||    
T  22959402 agttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactgatgcatatgaatc-aatgttggttaaaatgttatataa 22959500  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||   ||||||| || ||||  |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  22959501 ttgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 22959595  T
Q  299 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||   |||     |||| |    
T  22959596 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact--tataagatgatgttgttctaagtt 22959690  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22959691 g-ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcccttgagc 22959748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 19669251 - 19668781
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||| | || || | ||||||||||| | ||||| ||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  19669251 gaactcgccatggcgtgtagaggctctcgcctcaccagctaactagttacagaatgccttgtttaggataaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtg 19669152  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatcta-atgttgttgttaatgttatata 197  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    ||| ||| |  ||||||||  ||||||||||||    
T  19669151 agttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatattgatgttgtttataatgttatata 19669052  T
Q  198 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgtt 297  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||   ||||||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| |||||||| |||||||    
T  19669051 attgtatatacattacaggactt-atgtttgatatttgag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgtctatgtt 19668957  T
Q  298 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaaga 396  Q
    | |||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||     ||||     
T  19668956 gttgtttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagt 19668857  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    || |||||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  19668856 tg-ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattcttgggggcttgatgccctagagccttg--ctcaccacgttgg 19668781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 49 - 457
Target Start/End: Original strand, 20026756 - 20027158
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | ||||||| ||||||| ||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||    
T  20026756 acagaatgccttgttagcttaaatgtgaccgttgtcgcacgagtcgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgt 20026855  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 248  Q
    ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||     
T  20026856 ttcagtaagcctgaattatatgttttaatgttgttgataatgctatatagttgtatatacattacatga-attatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaa 20026953  T
Q  249 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 345  Q
    || ||||||||||| ||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         
T  20026954 ttgcatttgatattattatatcatgaact-gttttggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga----- 20027047  T
Q  346 atgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 444  Q
    | || |||||  |||||||||||| | ||||||||| | ||    | ||||| | || ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20027048 aagaagatgtttcaaattattggatttatataagaggtcgttgtttataaga-ggttgagttgttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggctt 20027145  T
Q  445 gatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||    
T  20027146 gatgccctggagc 20027158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 232 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 22412306 - 22412083
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | | |||||||||||||||| |||||||||||    
T  22412306 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggt 22412208  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412207 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 22412109  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22412108 ttgttgggggcttgatgccctggagc 22412083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 460
Target Start/End: Original strand, 10732984 - 10733208
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732984 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 10733082  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733083 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 10733180  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagcttt 460  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10733181 tgttgggggcttgatgcccttgagcttt 10733208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 42245409 - 42245630
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42245409 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 42245507  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245508 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 42245605  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  42245606 tgttgggggcttgatgccctggagc 42245630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 244 - 457
Target Start/End: Original strand, 10775731 - 10775942
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10775731 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatactgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 10775829  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10775830 agatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattacattgttgggggct 10775928  T
Q  444 tgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||    
T  10775929 tgatgccctggagc 10775942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 575
Target Start/End: Original strand, 22107709 - 22107951
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||      
T  22107709 gtctaagtttttgaagataatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaagtcgagtctatgcattaacatac 22107808  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaata 529  Q
      ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22107809 atttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaata 22107906  T
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  22107907 ctcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 22107951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 2154658 - 2154879
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154658 ttgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 2154756  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154757 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 2154854  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  2154855 tgttgggggcttgatgccctggagc 2154879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29330052 - 29329831
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330052 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29329954  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329953 taagttgattaagatgatgaagttcgaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 29329856  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29329855 tgttgggggcttgatgccctggagc 29329831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 264812 - 265033
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264812 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 264910  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  264911 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 265008  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  265009 tgttgggggcttgatgccctggagc 265033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 244 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 39245243 - 39245033
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39245243 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 39245145  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245144 agatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-actaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 39245047  T
Q  444 tgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||    
T  39245046 tgatgccctggagc 39245033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 11581243 - 11581465
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11581243 ttgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 11581341  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  11581342 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttttcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgacttagcatttcat 11581440  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  11581441 tgttgggggcttgatgcccttgagc 11581465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20909130 - 20908909
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909130 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgcttttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20909032  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909031 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 20908934  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20908933 tgttgggggcttgatgccctggagc 20908909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29346098 - 29345877
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  29346098 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtc 29346000  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29345999 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 29345902  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29345901 tgttgggggcttgatgccctggagc 29345877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 32027511 - 32027290
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  32027511 ttgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtc 32027413  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027412 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 32027315  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32027314 tgttgggggcttgatgccctggagc 32027290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29348571 - 29348350
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29348571 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtc 29348473  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348472 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatatt-acgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 29348375  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29348374 tgttgggggcttgatgccctggagc 29348350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29351044 - 29350823
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  29351044 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgatgctgttcttatttaactaagctgtatgagtcggtc 29350946  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350945 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 29350848  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    
T  29350847 tgttgggggcttgatgcccaggagc 29350823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 454
Target Start/End: Original strand, 36154827 - 36155043
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154827 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc---tg-tgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 36154922  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  36154923 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacattttaa 36155021  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  36155022 agttgagggcttgatgccctgg 36155043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 39363502 - 39363310
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363502 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 39363404  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363403 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtc-gattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 39363310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 257 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36314675 - 36314504
Alignment:
Q  257 gatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 355  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  36314675 gatattattatatcatgatggttt-gcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgt 36314577  T
Q  356 cccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
     ||||||||||||| ||||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314576 tccaaattattggattaatataagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 36314504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 233 - 429
Target Start/End: Original strand, 20902053 - 20902248
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902053 ttgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20902151  T
Q  333 taagttg-atgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    ||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20902152 taagttgaattaagatgatgaagttccaaattattggact-atttaagaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatacattagcattt 20902248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 269 - 457
Target Start/End: Original strand, 20918028 - 20918212
Alignment:
Q  269 tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgg 368  Q
    |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||    
T  20918028 tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaactattgg 20918126  T
Q  369 actaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20918127 a-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagt-catgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagc 20918212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 244 - 453
Target Start/End: Original strand, 18319089 - 18319293
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18319089 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatta 18319187  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    |||||| | |   ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||    
T  18319188 agatgaagtt---ccaaattattggatta-tacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattatcattttaaagttgagggct 18319283  T
Q  444 tgatgccctg 453  Q
    ||||||||||    
T  18319284 tgatgccctg 18319293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 23064618 - 23064408
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||  |||||||| ||||| ||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23064618 ttgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 23064520  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||  || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||    
T  23064519 agatgatggggttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggct 23064421  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||| ||||||    
T  23064420 tgatgctctggag 23064408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 31061175 - 31060967
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  31061175 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgttttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 31061077  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||    
T  31061076 agatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggagct 31060980  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||| ||||||    
T  31060979 tgatgctctggag 31060967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 381
Target Start/End: Original strand, 22178066 - 22178363
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||| ||   ||||    
T  22178066 ttgtcacacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaattatatgattggatgt 22178165  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctgg 277  Q
    ||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  ||| |    
T  22178166 tgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagct-g 22178263  T
Q  278 ttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatat 376  Q
    ||||  ||||||||||||||| || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||     | |||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  22178264 ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgttgttccaaattattggattgatat 22178358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 26704139 - 26703860
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  26704139 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctctaaattattgga-taa-ataagagat 26704042  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26704041 gatga--ttgtgatgtttaagagattgagtccatgcattagcatagatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagcttta 26703945  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccaca 572  Q
    ||| ||  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  26703944 gctcaa--tagcgatgggggctt-atgccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctaaattggtaccaca 26703860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 287 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 26973872 - 26973593
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  26973872 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctctaaattattgga-taa-ataagagat 26973775  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||  |||||||||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  26973774 gatga--ttgtgatgtttaagagattgagtccatgcattagcatagatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagcttta 26973678  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccaca 572  Q
    ||| ||  |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||||    
T  26973677 gctcaa--tagcgatgggggctt-atgccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctaaattggtaccaca 26973593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 176 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 40726032 - 40725782
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  40726032 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 40725934  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || ||| |||||||||||| ||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  40725933 tgcttt-gcatactgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactat 40725835  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40725834 tataagaggttgtcgaattaagacgtttaagaagtcgagtccatgcattagca 40725782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 38619541 - 38619328
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38619541 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 38619443  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaaga---ggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggg 440  Q
    ||||||||| || |||||||||| || | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  38619442 agatgatgaggttccaaattatttga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaattagtcgagtccatgcattagcatttcagtgataggg 38619344  T
Q  441 gcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||| | ||||||    
T  38619343 gcttgattctctggag 38619328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 24067214 - 24067009
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| |    
T  24067214 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgatta 24067116  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    |||||| | |   ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  24067115 agatgaagtt---ccaaattattggatta-tacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggct 24067020  T
Q  444 tgatgccctgg 454  Q
    |||||||||||    
T  24067019 tgatgccctgg 24067009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 399 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23201312 - 23201139
Alignment:
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcga 497  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  23201312 tttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattagctcaaattagcga 23201215  T
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  23201214 tgggggctt-atgcactggaagtatattaatacttaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 23201139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 269 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21873336 - 21873034
Alignment:
Q  269 tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattat 365  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||  ||||||||| || |||   |||||||    
T  21873336 tcatgctgatgttgtatcctgcctatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaccctccaaattat 21873237  T
Q  366 tggactaatataagagtttgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgta 463  Q
    ||||   |||| |||  |  |||  |||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| |||    
T  21873236 tggatacatatgaga--tgatca--ttaacatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagta 21873143  T
Q  464 ctcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtatt 563  Q
    |||| |||| |||||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||    
T  21873142 ctcaacacgatggagcattagctcaaattagcaatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactc-aataacgatgggggc-tcatgccctgtatt 21873046  T
Q  564 ggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||    
T  21873045 ggtaccacatgc 21873034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 298 - 456
Target Start/End: Original strand, 20806850 - 20807005
Alignment:
Q  298 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  | ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | |||||||    
T  20806850 gctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatgaatttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagat 20806947  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  20806948 gtttaagaattcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgctctggag 20807005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 399 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 23572029 - 23571893
Alignment:
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgat 498  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23572029 tttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgtttggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagcttaaattagcgat 23571931  T
Q  499 gagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaata 537  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23571930 gggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaata 23571893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Original strand, 21741312 - 21741492
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| || ||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  21741312 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgtgagctaaccagttacataatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 21741411  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgtt 180  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||||  ||  |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21741412 agttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgtt 21741492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 187 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 22144217 - 22143951
Alignment:
Q  187 aatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 285  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22144217 aatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatg-ttgttttgcat 22144120  T
Q  286 actgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga-cta-atataagagt 382  Q
    ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     | || ||||| |||||||||||||  || |||||||||     
T  22144119 actacctatgttgatgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aagaagatgttccaaattattggatatatatataagagg 22144025  T
Q  383 ttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||     |||| |||| |   | | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22144024 ttgttgttctaagttgttgagttgtttgagtccatgcattagca-ttcattgttgagggcttgatgccctggagc 22143951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14079112 - 14078929
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  14079112 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catgtgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 14079015  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| | |||||| | |||||||||||||||    
T  14079014 aaattaacgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaactaacgatgagggc-tcatgccccgaattggtaccacatgc 14078929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 287 - 428
Target Start/End: Original strand, 17517254 - 17517400
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataaga 380  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||      |||||||  ||||||||||||||| | |||||    
T  17517254 ctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgtttcaaattattggactatt-taaga 17517352  T
Q  381 gtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    | | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17517353 ggtcgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 17517400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 18770158 - 18770341
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  18770158 attaagatgttttaagagactgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 18770256  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  18770257 aaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 18770341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22032387 - 22032102
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   |||||||||||   |||| |||       
T  22032387 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatga 22032288  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    ||    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||    
T  22032287 tg----attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgagggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatt 22032193  T
Q  483 agcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||| || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  22032192 agctcaaaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 22032102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 446 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23512006 - 23511880
Alignment:
Q  446 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 545  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| || ||||    
T  23512006 atgccctggagcttagtactcaccacgatggagctttagctcaaattaaagatgggggctt-atgccctggaagtatattaatattc-aataacgttggg 23511909  T
Q  546 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  23511908 ggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 23511880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23064391 - 23064309
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23064391 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 23064309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36314415 - 36314332
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36314415 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 36314332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 38619345 - 38619272
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38619345 gggcttgattctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 38619272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 26740915 - 26740991
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26740915 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 26740991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 491 - 575
Target Start/End: Original strand, 20902247 - 20902331
Alignment:
Q  491 ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20902247 ttagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 20902331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 31060907 - 31060825
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  31060907 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggtttgatgctctgtattggtaccacatgc 31060825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 395 - 505
Target Start/End: Original strand, 23501515 - 23501624
Alignment:
Q  395 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattag 494  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||| |||    
T  23501515 gatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaatag 23501613  T
Q  495 cgatgagggct 505  Q
    ||||| |||||    
T  23501614 cgatgggggct 23501624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 199 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 29448159 - 29448052
Alignment:
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgt 296  Q
    |||||||| |||||||||| || | || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||||  |||||||||||||    
T  29448159 ttgtatatgcattacatgaatt-acgtatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagct-gttttatatactgcctatgt 29448062  T
Q  297 tgctgttgtt 306  Q
    ||||||||||    
T  29448061 tgctgttgtt 29448052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 5888944 - 5889033
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacg 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5888944 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacg 5889033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 40725691 - 40725609
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40725691 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgattggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 40725609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 41095900 - 41095982
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  41095900 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattgataccacatgc 41095982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14048046 - 14047984
Alignment:
Q  392 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  14048046 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgg 14047984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 502 - 575
Target Start/End: Original strand, 20807032 - 20807104
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||| ||||||    
T  20807032 ggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtactacatgc 20807104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 21366818 - 21366999
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||      
T  21366818 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctt-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctca 21366916  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  21366917 aaataattgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 21366999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 22178491 - 22178567
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22178491 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaaca-cgttgagggcttgctgccctggattggtaccacatgc 22178567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 39363265 - 39363182
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | |  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  39363265 tagcgattggggcttgatgctccgatagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 39363182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 20027212 - 20027287
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20027212 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 20027287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 2154939 - 2155015
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| || |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2154939 tgagggcttgatgccctgggagcctatttatgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 2155015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 502 - 575
Target Start/End: Original strand, 17517454 - 17517527
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| | | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  17517454 ggcttgatgctccggaagtataataatactcaaataacgattgagacttgatgccccgtattggtaccacatgc 17517527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 21732198 - 21732274
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21732198 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgcccaggattggtaccacatgc 21732274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 21809849 - 21809925
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  21809849 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgcccaggattggtaccacatgc 21809925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 286 - 339
Target Start/End: Original strand, 26732884 - 26732937
Alignment:
Q  286 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 339  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732884 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 27989200 - 27989275
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27989200 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttaagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 27989275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 22144402 - 22144299
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| |   ||||||  ||||||||||||||| || ||    
T  22144402 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaatgcttgtttaggat-tttgcgatctttgtcgcacgagttgttgaga 22144304  T
Q  101 gttga 105  Q
    |||||    
T  22144303 gttga 22144299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 389 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 18418567 - 18418528
Alignment:
Q  389 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18418567 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 18418528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418594
Alignment:
Q  256 tgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgtta-tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 341  Q
    ||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgat 18418594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 22959805 - 22959877
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22959805 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 22959877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 286 - 381
Target Start/End: Original strand, 26740697 - 26740787
Alignment:
Q  286 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     | |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  26740697 actgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgttgttccaaattattggagttatataagag 26740787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 31060950 - 31060888
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31060950 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 31060888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 36314459 - 36314396
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||| |||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36314459 tagcgattagggcttgatgctccgggagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 36314396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 40725735 - 40725672
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40725735 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgc 40725672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 40725779 - 40725716
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40725779 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 40725716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 41095857 - 41095919
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41095857 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 41095919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Original strand, 17919320 - 17919439
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttga 508  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||| || |||| |  | || |||||| |    
T  17919320 gagtccatgcattagcatt-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcattaactcaaataaatgttgggggctt-a 17919416  T
Q  509 tgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  17919417 tgccctgaaagtatattaatact 17919439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18418386 - 18418312
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| | || || |||||||||||    
T  18418386 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttaatgctccgtgttagtaccacatgc 18418312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 18418518 - 18418464
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18418518 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 18418464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Original strand, 21871342 - 21871444
Alignment:
Q  3 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||  |||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  21871342 actcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgagctaaccaaatacagaatgccttgctaggttaaacgcgatccttgtcgcatgagttgttatgagt 21871441  T
Q  103 tga 105  Q
    |||    
T  21871442 tga 21871444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 3 - 105
Target Start/End: Original strand, 21875622 - 21875724
Alignment:
Q  3 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||   || |||||||| || |||  |||||||| | ||| ||||||||| ||||| ||||||||| |||||| | |||||    
T  21875622 actcgccatggcgagtagaggctcccggctcgcgagctaaccaaatacagaatgccttgctaggttaaacgcgatccttgtcgcatgagttgttatgagt 21875721  T
Q  103 tga 105  Q
    |||    
T  21875722 tga 21875724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23064425 - 23064372
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23064425 gggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 23064372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 39363300 - 39363246
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39363300 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 39363246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14047958 - 14047882
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14047958 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 14047882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 20918272 - 20918348
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20918272 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 20918348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23469653 - 23469577
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23469653 tgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataa-gaagagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 23469577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 25574735 - 25574811
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25574735 tgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 25574811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 309 - 381
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989071
Alignment:
Q  309 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----atgatgatgttccaaattattggatttatataagag 27989071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 449
Target Start/End: Original strand, 41095692 - 41095747
Alignment:
Q  393 aagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 449  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  41095692 aagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttggaggcttgatgc 41095747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 18418483 - 18418420
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  18418483 tagcgattggggcttgatgctatggaagtataataatactcaaatagcgattggagcttgatgc 18418420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 516 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21877371 - 21877314
Alignment:
Q  516 gaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21877371 gaagtatattaatactcaa-taacgatgggggctc-atgccctgtattggtaccacatgc 21877314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 516 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21887126 - 21887069
Alignment:
Q  516 gaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  21887126 gaagtatattaatactcaa-taacgatgggggctc-atgccctgtattggtaccacatgc 21887069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 11581014 - 11581068
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11581014 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccatttacagaat 11581068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 570
Target Start/End: Complemental strand, 19668742 - 19668675
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtacca 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19668742 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtacca 19668675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 149
Target Start/End: Original strand, 27988776 - 27988845
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagg-taaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  27988776 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcat-gaggttaaggaactaagttgtttatatatctgttgttgtt 27988845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 36154597 - 36154651
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  36154597 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat 36154651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 36314494 - 36314440
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36314494 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattagggcttgatgc 36314440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Original strand, 123480 - 123599
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||| |    |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||| || ||| |||| |  | || |||||| ||    
T  123480 gagtccatgcattagcaatgatatgttgggggctc-atgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggctt-at 123577  T
Q  510 gccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  123578 gccctgaaagtatattaatact 123599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 11581526 - 11581602
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11581526 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatat-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 11581602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 232 - 289
Target Start/End: Original strand, 20766118 - 20766174
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactg 289  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  20766118 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct-gttttgtatactg 20766174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 186 - 247
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741545
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 21741545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 22143897 - 22143864
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22143897 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 22143864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23469871 - 23469822
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469871 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 23469822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 503 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 18418428 - 18418376
Alignment:
Q  503 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18418428 gcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagagattggggcttgatgc 18418376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 25744073 - 25743945
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||      ||| ||||| | | |||||||| |  ||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  25744073 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccttgagtgacagactgccttgttagggtttatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtga 25743974  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttg 129  Q
    ||||||| | | |||||  ||||||||||    
T  25743973 gttgatcatgggggtaataaactaagttg 25743945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 503 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 31060982 - 31060931
Alignment:
Q  503 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31060982 gcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 31060931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 10753685 - 10753603
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  10753685 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 10753603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 236 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18356432 - 18356364
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgtt 306  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||    
T  18356432 agatgttgttgaattgaaattgatattattatatcatgctg--tttgtatgctgcctatgttgctgttgtt 18356364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 21502432 - 21502504
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  ||  | ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21502432 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgtagagggattgatgccctggattggtaccacatgc 21502504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 21871525 - 21871607
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21871525 taatgttatataattcgatatatattgcatgaatt-atgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21871607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 21875805 - 21875887
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  21875805 taatgttatataattcgatatatattgcatgaatt-atgtttgatgcttgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 21875887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 22120149 - 22120231
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  22120149 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgttcatttgtaattgttatat 22120231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Original strand, 23390266 - 23390309
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  23390266 gaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccc 23390309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 529
Target Start/End: Original strand, 26012309 - 26012340
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaata 529  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26012309 tgagggcttgatgccctggaagtatattaata 26012340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 419 - 486
Target Start/End: Original strand, 33895953 - 33896020
Alignment:
Q  419 cattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct 486  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||  ||| | ||||||||||||||| |||| || ||||||||||    
T  33895953 catttgcatttcatagttgggggcttactgctccggagctttgtactcaacacgatgaagctttagct 33896020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36314716 - 36314685
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatga 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314716 taatgttatataattgtatatacattacatga 36314685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 1096819 - 1096765
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  1096819 gaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagaat 1096765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 1859151 - 1859212
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1859151 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 1859212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 23458530 - 23458469
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23458530 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 23458469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 23462791 - 23462730
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23462791 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 23462730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16227332 - 16227257
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||  | || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16227332 tgagggcttgatgtcctgggagtatatttatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctg-gttggtaccacatgc 16227257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 18319319 - 18319352
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18319319 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 18319352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20805616 - 20805575
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20805616 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Original strand, 21328268 - 21328317
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21328268 ctgcctatgttgctgctgtctattaattaagctgcatgagtcggtctaag 21328317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Original strand, 21731514 - 21731559
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21731514 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21731559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 332
Target Start/End: Original strand, 21809634 - 21809679
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  21809634 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtc 21809679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22412023 - 22411948
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22412023 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cg-ttggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 22411948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24066984 - 24066951
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24066984 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 24066951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 25578301 - 25578377
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||  | || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25578301 tgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgc 25578377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 475
Target Start/End: Original strand, 27989100 - 27989163
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttg 475  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  27989100 gagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttg 27989163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29329771 - 29329695
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  29329771 tgagggtttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtatcacatgc 29329695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 518 - 555
Target Start/End: Original strand, 41095753 - 41095790
Alignment:
Q  518 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  41095753 agtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 41095790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Original strand, 18770054 - 18770118
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    |||||||||||||| ||||||||  || ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  18770054 ctgcctatgttgctattgttattcgaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 18770118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 20767037 - 20766997
Alignment:
Q  288 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20767037 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 23201424 - 23201360
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||  |||||||||    
T  23201424 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgaacaagatgatg 23201360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Original strand, 23501408 - 23501472
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    |||||| || |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  23501408 ctgcctgtgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 23501472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26680641 - 26680605
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26680641 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26680605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 26952248 - 26952212
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26952248 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 26952212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 201)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Original strand, 13210096 - 13210668
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||       |||||||||| | ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  13210096 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagcacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtg 13210195  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||    || ||||||| ||||    ||| |||  ||||||| |  |||||||||||||    
T  13210196 agttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctgatgcatatgaattcaatgttgcttataatgttatataa 13210295  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||   ||||||| || |||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  13210296 ttgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggttt-gcatactgcctatgttg 13210390  T
Q  299 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||      
T  13210391 ctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtttcaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagtc 13210490  T
Q  398 gttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcg 496  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  13210491 gttttaagaggtcgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 13210589  T
Q  497 atgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210590 atgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 13210668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12399328 - 12398990
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399328 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 12399229  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12399228 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 12399130  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399129 tggtggcttgatgccctggagcactgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 12399030  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399029 tagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 12398990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 20698437 - 20698776
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698437 agatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 20698536  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20698537 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattgt 20698636  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||    
T  20698637 tgggggcttgattccctggagctttgtactcaccacgttggagctttaactcaaattagcgatgggggcttgatgctatgcaagtatattaatactcaaa 20698736  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20698737 tagcgatgggggcttgatgccctgtattgataccacatgc 20698776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17487975 - 17487638
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487975 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17487876  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17487875 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgt 17487777  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487776 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 17487678  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487677 tagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 17487638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17499457 - 17499120
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499457 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 17499358  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17499357 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgt 17499259  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499258 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 17499160  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499159 tagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 17499120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 23083363 - 23083700
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083363 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23083462  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083463 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 23083561  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083562 tgggggtttgatgccttggagttttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 23083660  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083661 tagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 23083700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 15471277 - 15470809
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||     
T  15471277 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgtgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtt 15471178  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    || ||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15471177 agatgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatctaa-gttgttgttaatgttatataat 15471079  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  15471078 tgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgc 15470981  T
Q  300 tgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||     |||| ||    
T  15470980 tgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagttg 15470884  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||  || | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15470883 -ttaagttgttgtgtcaatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 15470809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 43841051 - 43840714
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43841051 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaa 43840952  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43840951 gttgatgaagataatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgt 43840853  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43840852 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgaaagagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 43840754  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43840753 tagcgatgggggtttgatgccctgtattggtaccacatgc 43840714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18438653 - 18438316
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18438653 agatgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 18438554  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatg-tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18438553 gttgatgaagatgatgatgttttcaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattg 18438455  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  18438454 ttggaggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagttttagctcaaa-tagtgaagggggcttgatgccctggaagtatattaatactc-a 18438357  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18438356 atagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 18438316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Original strand, 25476384 - 25476722
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  25476384 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgttttttaactaagctacatgagtcggtc 25476483  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476484 taagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 25476582  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25476583 tgttgggggtttgatgccctggagctttgtactcaacaagatggagctttagctcaaa-tagtgatg-ggggttgatgccctgtaagtatattaatactc 25476680  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25476681 -aatagcgatgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 25476722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Original strand, 40213720 - 40214059
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40213720 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgc-tgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcggtc 40213818  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213819 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 40213917  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213918 tgtggatggcttgatgtcctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactc 40214016  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40214017 aaatagcgatgtgggcttgatgccctggattggtaccacatgc 40214059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 234 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14972975 - 14972640
Alignment:
Q  234 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 333  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972975 tgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 14972876  T
Q  334 aagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 433  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972875 aagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 14972777  T
Q  434 gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactca 533  Q
    |||||||| |||||| |||||||| || | |||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  14972776 gttgggggattgatgtcctggagcctt-tgctcaacacgatggagctttagctcaa--tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact-- 14972682  T
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     |||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14972681 tatagggatgggggcttgatgccctcgattggtaccacatgc 14972640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14234843 - 14234473
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||  |||||| || |||||||||     
T  14234843 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgaacaagttgatgtt 14234744  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtt--tcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatata 197  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14234743 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtttaatctaatgttgttgctaatgttatata 14234644  T
Q  198 attgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgtt 297  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  14234643 attgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgtt 14234546  T
Q  298 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  14234545 gctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgga 14234473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 236 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 13442393 - 13442115
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442393 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgccgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 13442294  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  13442293 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaatatttcattgt 13442195  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  13442194 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctg 13442115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 232 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23274810 - 23274468
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 330  Q
    |||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  23274810 tttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagttgcatgagtcag 23274712  T
Q  331 tctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    |||||||    ||||||| ||||||  |||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23274711 tctaagtcatcgaagatgttgatgtttcaaagtattggactattataaaaggttgtcaaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttc 23274612  T
Q  431 attgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatac 530  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  23274611 agtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaatagcgataggggcttgatgccctgg-agtataataatac 23274513  T
Q  531 tcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  23274512 tcaaatagcgataggggtttgatgctccgtattggtaccacatgc 23274468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 236 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 26687006 - 26686729
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26687006 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 26686907  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686906 gttgaagaagatgatgatgttccaaattattggact-atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 26686808  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||||    
T  26686807 tgggggcttgatgccctagagctttgtactcaacatgttggagttttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctg 26686729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 255 - 517
Target Start/End: Original strand, 11424781 - 11425040
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11424781 ttgatattgttatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatg 11424879  T
Q  355 tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
    | ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11424880 ttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgg 11424978  T
Q  455 agctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||| |||||    
T  11424979 agctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagtgatgggggcttgatgctctgga 11425040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 16097682 - 16097214
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || | ||||||| ||| ||||  ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  16097682 gaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgtcttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 16097583  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  16097582 agttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 16097483  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||| |||||||||||     
T  16097482 tgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgattt-gcatattgcctatgttgt 16097385  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||     |||| ||    
T  16097384 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagagattgttgttctaagttg 16097288  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||| || | ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  16097287 -ttaagatgttgtgtccatgaattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagccttg--ctcaccacgttgg 16097214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 236 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 14572707 - 14572417
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||  || |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572707 agatgttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 14572609  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||    ||||| ||| ||||||||||||||| |  ||||||  |||    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14572608 gttgatgt---tgatgttgttccaaattattggacttacttaagaggatgttgttttaagatgtttaagaggtcgagtctatgcatttgcatttcattgt 14572512  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14572511 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgagggcttgatgctctggaagtatattaatact 14572417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 176 - 491
Target Start/End: Original strand, 24340665 - 24340980
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  24340665 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 24340763  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || || |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  24340764 tg-ttgtgcatactgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactat 24340862  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 473  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24340863 tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 24340962  T
Q  474 tggagctttagcttaaat 491  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  24340963 tggagctttagctcaaat 24340980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 236 - 531
Target Start/End: Original strand, 14576835 - 14577124
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| | ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  14576835 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgttgttt-atactgtctatgttgctgttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaa 14576933  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||    ||||||||| ||||||||||||||| |  |||||| |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14576934 gttgatgt---tgatgatgttccaaattattggacttacttaagaggttgttattttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatttgcatttcatttt 14577030  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14577031 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaa--tagcgatgagggcttgatgccctggacgtatattaatact 14577124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 236 - 457
Target Start/End: Original strand, 24153211 - 24153430
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153211 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactacctatgttgctatcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 24153309  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153310 gttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 24153408  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  24153409 tgggggcttgatgccctggagc 24153430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 256 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 30029939 - 30029616
Alignment:
Q  256 tgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga------tgaagatga 349  Q
    ||||||| |||| |||||||| | ||| |  ||| ||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||      ||  |||||    
T  30029939 tgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatga 30029840  T
Q  350 tgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt--tgggggcttgat 447  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||    
T  30029839 tgatgttccaaattattggacta-tacaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagtgatgggggcttgat 30029741  T
Q  448 gccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 547  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30029740 gccctggagctttgtactcaacatgttggagctttagctcaa-ttagcgatgggggctt-atgcc-tggaagtatattaatactcaaatagcgatggggg 30029644  T
Q  548 cttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  30029643 cttgatgccccatattggtaccacatgc 30029616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 29172627 - 29172849
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172627 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29172725  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172726 taagttgattaagatgatgaagtttcaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 29172824  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29172825 tgttgggggcttgatgccctggagc 29172849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Original strand, 37250935 - 37251310
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||| | ||   |||||||||||||||||||||    
T  37250935 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaacaccttgttaggttaaaagtgacctttgtcgcacgagttgatgtga 37251034  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| |    
T  37251035 gttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaat 37251134  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||| ||||||||||  |||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||    
T  37251135 gtatatgcattacatga-attatttatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgcctatgttg 37251231  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||| ||     || |||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  37251232 ctgtttgtttattaactaagctgcatgactcggtctaagatg-----gaagatgatgttccaaattattggatttatataagag 37251310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 62 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 16104071 - 16103685
Alignment:
Q  62 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 161  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||     
T  16104071 ttaggttaaatgcgctctttgtcgcacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagacta 16103972  T
Q  162 aattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatat 261  Q
    |    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||    
T  16103971 atccatatgaattgatgttgtttataatgttatataattttatatacattaaatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgttga-ttgcattcgatat 16103874  T
Q  262 tgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaa 360  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||    
T  16103873 tgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaa 16103778  T
Q  361 attattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||  |||||||   |||    ||||| ||  ||||| |  | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103777 attattggact--tataagatgatgttgttttaagttg-ctaagatgatgtgtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16103685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 17463296 - 17463075
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463296 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17463198  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463197 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 17463100  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17463099 tgttgggggcttgatgccctggagc 17463075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 34159444 - 34159223
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159444 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 34159346  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159345 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 34159248  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34159247 tgttgggggcttgatgccctggagc 34159223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 193 - 455
Target Start/End: Original strand, 43550482 - 43550744
Alignment:
Q  193 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 291  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||     
T  43550482 atataattgtatatacattacttgaatt-atatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgca 43550580  T
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat 391  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  43550581 tatgttgctgtcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaat 43550680  T
Q  392 taagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgga 455  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43550681 taagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccttgga 43550744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 287 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 12511125 - 12510929
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataaga 380  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||||      ||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  12511125 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggattaatataaga 12511026  T
Q  381 gtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgga 477  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511025 ggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgga 12510929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 9707651 - 9707872
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||||||  |||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707651 ttgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 9707749  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9707750 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagagtttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcat 9707847  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9707848 tgttgggggcttgatgccctggagc 9707872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 16454325 - 16454546
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16454325 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 16454423  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454424 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 16454521  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16454522 tgttgggggcttgatgccctggagc 16454546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 28848655 - 28848876
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848655 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 28848753  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848754 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 28848851  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28848852 tgttgggggcttgatgccctggagc 28848876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 13151834 - 13152056
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13151834 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggt 13151932  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151933 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttca 13152030  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13152031 ttgttgggggcttgatgccctggagc 13152056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 13154299 - 13154521
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13154299 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggt 13154397  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154398 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttca 13154495  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13154496 ttgttgggggcttgatgccctggagc 13154521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 8899212 - 8898991
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899212 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 8899114  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||| ||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899113 taaattgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 8899016  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  8899015 tgttgggggcttgatgccctagagc 8898991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 38961935 - 38962157
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38961935 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 38962033  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    
T  38962034 taagttgattaaaatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagagatcgagtctatgcattagcattacat 38962132  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  38962133 tgttgggggcttgatgccctggagc 38962157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 45606951 - 45607172
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606951 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 45607049  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607050 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 45607147  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45607148 tgttgggggcttgatgccctggagc 45607172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 238 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 55501055 - 55500839
Alignment:
Q  238 atgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 337  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501055 atgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 55500957  T
Q  338 tgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttg 437  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55500956 tgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttg 55500859  T
Q  438 ggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  55500858 ggggcttgatgccctggagc 55500839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 232 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 36166716 - 36166494
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166716 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 36166619  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| || |||||||| ||||| | |||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  36166618 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggatta-tataagaggttgtcgatttaagaagttaaagaggccgagttcatgcattagcatttca 36166520  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  36166519 ttgttgggggcttgatgccctggagc 36166494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 17446699 - 17446919
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17446699 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg-tc 17446796  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17446797 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagcccatgcattagcatttcat 17446894  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  17446895 tgttgggggcttgatgccctggagc 17446919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 232 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 21618567 - 21618345
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618567 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 21618470  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    ||||||||||  ||| ||||| || ||||| ||||||| || |||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21618469 ctaagttgattgagaagatgaagttccaaagtattggatta-tataagaggttgtcgatttaagaagtttaagaggtcgagttcatgcattagcatttca 21618371  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  21618370 ttgttgggggcttgatgccctggagc 21618345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 6469178 - 6469395
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469178 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6469276  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||     ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6469277 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaag-----taagaggtcgagtccatgcattagcatgtcat 6469370  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6469371 tgttgggggcttgatgccctggagc 6469395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 16282855 - 16283076
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282855 ttgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16282953  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16282954 taagttgattaagatgataaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattttat 16283051  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  16283052 tgttgggggcttgatgccctggagc 16283076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 437 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14682300 - 14682162
Alignment:
Q  437 gggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaat 536  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682300 gggggcttgatgccttggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaat 14682201  T
Q  537 agcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14682200 agcgatgggggcttgatgccctatattggtaccacatgc 14682162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 454
Target Start/End: Original strand, 7781391 - 7781609
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781391 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 7781489  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781490 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 7781587  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
    ||||| ||||||||||||||||    
T  7781588 tgttgagggcttgatgccctgg 7781609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 232 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 27165370 - 27165147
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 330  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27165370 tttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttg-ttttgcatactgtctatattgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 27165272  T
Q  331 tctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27165271 tctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttc 27165173  T
Q  431 attgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    |  | | |||||||||||| ||||||    
T  27165172 agcgataggggcttgatgctctggag 27165147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 10247767 - 10247988
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10247767 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgttgttatttaactaagctgtatgagtcggtc 10247865  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247866 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 10247963  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  10247964 tgttgggggcttgatgccctggagc 10247988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 32308021 - 32307564
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||| ||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  32308021 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 32307922  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||| ||||    ||| |  ||||||||||  |||||||           
T  32307921 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactgatgcttatgaattaatgttgtttataatgtt------- 32307829  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
     |||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  32307828 -gtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgc 32307734  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||   |||     |||| ||    
T  32307733 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgttgttccaaattattggact--tataagatgatgttgttctaagttg 32307639  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||| ||   ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  32307638 -ttaagatgttatgtccatgcattagca-ttcactattgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 32307564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 123 - 476
Target Start/End: Original strand, 12174152 - 12174485
Alignment:
Q  123 taagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagttt 221  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  12174152 taagttgtttagcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaatc-aatgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgactt- 12174249  T
Q  222 atgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctg 320  Q
    ||||||||| |||||| |||||||   || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12174250 atgtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 12174345  T
Q  321 catgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtt-taagaggtcgagtccatgc 419  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||          |||| ||||| || | ||||||||    
T  12174346 catgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact--tataagaggttgt----------tgttctaagatgttgtgtccatgc 12174430  T
Q  420 attagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  12174431 attaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 12174485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 437 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14670778 - 14670640
Alignment:
Q  437 gggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaat 536  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14670778 gggggcttgatgccttggagctttgtagtcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagcatattaatactcaaat 14670679  T
Q  537 agcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14670678 agcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 14670640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 415 - 559
Target Start/End: Original strand, 10542621 - 10542764
Alignment:
Q  415 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccct 514  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  10542621 catgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccct 10542719  T
Q  515 ggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542720 ggaagtatattaatattcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 10542764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 15977633 - 15977409
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977633 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15977535  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaa---attaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |    |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977534 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagaggttgtcgattttttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcattt 15977437  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977436 cattgttgggggcttgatgccctggagc 15977409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15412536 - 15412326
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15412536 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15412438  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||    
T  15412437 agatgatgaggttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggct 15412339  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||| ||||||    
T  15412338 tgatgctctggag 15412326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 22110119 - 22110569
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    ||  ||||||  | |||||||||| |||| ||   ||||||||||| |||||||||    
T  22110119 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcaagagggacagaacaccttgttaggtttaatgtgacctttgtcgcacgaattgatgtga 22110218  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||| |   |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || | | ||||||  |||||| |||||| |    
T  22110219 gttgatcatgagggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattgtatgatttgaagttgttaataatgtgatataaat 22110318  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||  ||||||||||  || | | ||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||   ||||||||||||||    
T  22110319 gtatacgcattacatga-attctatatgatg-ttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttg 22110415  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||    | |||||    
T  22110416 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgaag--gatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaaga 22110510  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    || |||||  || ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22110511 tg-ttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22110569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 436 - 575
Target Start/End: Original strand, 10542852 - 10542990
Alignment:
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10542852 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaa-ttagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 10542950  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  10542951 tagcgatgggggcttgatgccttggattggtaccacatgc 10542990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 55476609 - 55476417
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476609 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 55476511  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55476510 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtc-gattaagatgtttaagaggtcgagtctatgcattagcatt 55476417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 15878104 - 15878388
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  15878104 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagat 15878201  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  15878202 gatga--ttatgatgtttaagagatcgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagcttta 15878298  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  15878299 gctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 15878388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 299 - 456
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578102
Alignment:
Q  299 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||     
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat- 45578044  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578045 attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 45578102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 245 - 431
Target Start/End: Original strand, 53301562 - 53301747
Alignment:
Q  245 tgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  53301562 tgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatta 53301660  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  53301661 agatgatgaggttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttca 53301747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 49667852 - 49668310
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||||| | | ||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||    
T  49667852 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatacgatctttgtcgcacgagttgatgtg 49667951  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||  || |||   | | |||| ||||     ||||||||    
T  49667952 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga--tgcata---tga-gttgatgttg----tatataat 49668041  T
Q  200 --tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgtt-gttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgt 296  Q
      ||||||||| ||| ||| | ||||||| |||   ||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  49668042 gctgtatatactttaaatg-gattatgtt-gataaatgagatgtttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgt 49668137  T
Q  297 tgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaag 395  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||   |||     ||||    
T  49668138 tgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgatgatgatgatgttccaaattattggact--tataagatgatgttgttctaag 49668232  T
Q  396 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     || |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  49668233 ttg-ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 49668310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 244 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 8499625 - 8499422
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8499625 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 8499527  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||    
T  8499526 agatgatgaggttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggct 8499428  T
Q  444 tgatgc 449  Q
    ||||||    
T  8499427 tgatgc 8499422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 232 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 10557105 - 10556882
Alignment:
Q  232 tttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 330  Q
    |||||||||||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||| | ||||| || |||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557105 tttgagatgttgattggcttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctga-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 10557007  T
Q  331 tctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||| || | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10557006 tctaagttgattaagatgatgaagttccaaattatt-gaattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttc 10556908  T
Q  431 attgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    |  | | |||||||||||||||||||    
T  10556907 agcgataggggcttgatgccctggag 10556882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 176 - 427
Target Start/End: Original strand, 37642207 - 37642458
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  37642207 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 37642305  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  37642306 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgatcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactat 37642404  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 427  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37642405 tataagaggttgtcgaattaagacgtttaagaagtcgagtccatgcattagcat 37642458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 41124005 - 41123787
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||    |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41124005 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg----ttgtgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 41123910  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||||||||||| | |||||| || ||||| | |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  41123909 taagttgattaagatgataaagttccaaattattgga-ttatataaaaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgaatccatgcattagcatttcat 41123812  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    || ||||| ||| ||||||||||||    
T  41123811 tgatggggccttaatgccctggagc 41123787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 1465178 - 1465423
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||| |  ||  ||||||||||||||||||||    
T  1465178 gaacttgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagtaatctttgtcgcacgagttgatgtg 1465277  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||| || |||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||| |||    
T  1465278 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgctgtcattccagtaagcctggattgtttattctaatgttgatgataatgttatacaat 1465377  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 247  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  1465378 tgtatatacattacatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 1465423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 12567678 - 12567479
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567678 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12567580  T
Q  333 taagttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||||||      ||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567579 taagttgattaagatgttgtttatgatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 12567481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 13544143 - 13543944
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544143 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13544045  T
Q  333 taagttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||||||      ||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544044 taagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 13543946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 244 - 449
Target Start/End: Original strand, 12119780 - 12119983
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12119780 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 12119878  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  || ||||||||||||||||||  | | ||||||    
T  12119879 agatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtaaaggccatgcattagcatttcagcgataggggct 12119977  T
Q  444 tgatgc 449  Q
    ||||||    
T  12119978 tgatgc 12119983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 436 - 559
Target Start/End: Original strand, 10542747 - 10542869
Alignment:
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10542747 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaa-ttagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattagtactcaaa 10542845  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  10542846 tagcaatgggggcttgatgccctg 10542869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 50242940 - 50242721
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50242940 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 50242842  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||| |    
T  50242841 taagttgattaaaatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcatcaac-gttctt 50242745  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  50242744 tgttgggggcttgatgctctggag 50242721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 426
Target Start/End: Original strand, 22147467 - 22147717
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  22147467 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 22147565  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || |||||||||| ||||| ||||||| |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  22147566 tg-ttttgcataccgcctacgttgctgatcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactat 22147664  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22147665 tataagaggttgtcgaattaagacgtttaagaagtcgagtccatgcattagca 22147717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 176 - 457
Target Start/End: Original strand, 52523669 - 52523946
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 273  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||     
T  52523669 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatga 52523767  T
Q  274 -ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggact 371  Q
     || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       || ||||| ||||||||||||| |    
T  52523768 act-gttttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----cagaagatgttccaaattattggatt 52523861  T
Q  372 aatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
     |||||||||||||| |  | ||||||| || ||  || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523862 tatataagagtttgttatttctaagatg-ttgagttgttgagtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 52523946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 291 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 28194755 - 28194592
Alignment:
Q  291 ctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaa 389  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| |    
T  28194755 ctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcga 28194658  T
Q  390 attaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  28194657 tttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggtttgatgctctggag 28194592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 395 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23408385 - 23408209
Alignment:
Q  395 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattag 494  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||    
T  23408385 gatgtttaagagatcgagttcatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaat-ag 23408288  T
Q  495 cgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  23408287 cgatgggggctc-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 23408209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 252 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494708
Alignment:
Q  252 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    ||||||||||| |||| | |||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatg 44494810  T
Q  352 atgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 451  Q
    | || | |||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| |    
T  44494809 aagttctaaattatt-gaattatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattaaca-ttctttgttgggggcttgatgctc 44494713  T
Q  452 tggag 456  Q
    |||||    
T  44494712 tggag 44494708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 62 - 246
Target Start/End: Original strand, 49389459 - 49389642
Alignment:
Q  62 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 161  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||    
T  49389459 ttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactg 49389558  T
Q  162 aattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttg 246  Q
    |    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||  ||||||||||||||    
T  49389559 atgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgtatatacattaaatga-attatgtttgatagttgagatgttgttg 49389642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 1644451 - 1644889
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||| | | | ||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1644451 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacaaactgccttgtttaagttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtg 1644550  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||        |    
T  1644551 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatg--------t 1644642  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||| |||||  ||||||| ||||||| ||  ||| ||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||     
T  1644643 tgtatatacattaaatg-gattatg-ttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgat-gatttgcatactgcctatgttgt 1644738  T
Q  300 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    |||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||   || |||| ||| |||||||||||||||  |||||||   |||     |||| ||     
T  1644739 tgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgat---gacgatgttgttccaaattattggact--tataagatgatgttgttctaagttg- 1644832  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  1644833 ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttaggggcttgatgccctagagc 1644889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 232 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 42386533 - 42386428
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42386533 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaactgcatgagtcggt 42386434  T
Q  332 ctaagt 337  Q
    ||||||    
T  42386433 ctaagt 42386428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 252 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 9520998 - 9520782
Alignment:
Q  252 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 350  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||    
T  9520998 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgatgatgat 9520903  T
Q  351 gatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 450  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||   |||     ||||||| |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9520902 gatgttccaaattattggact--tataagatgatgttgttctaagatg-ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcc 9520807  T
Q  451 ctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||||| || | |||||||||||||    
T  9520806 ctggagcctt-tgctcaccacgttgg 9520782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 46 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 9513216 - 9512825
Alignment:
Q  46 gttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttg 144  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||     
T  9513216 gttacagaatgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtta 9513117  T
Q  145 ttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgt 244  Q
    ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||        ||||||| ||| | ||||||| |||   ||||||||||     
T  9513116 ttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttttata--------tacattaaatg-gattatgtt-gataaatgagatgttga 9513027  T
Q  245 tgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    |    | |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||    
T  9513026 t----tgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatga 9512935  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||   |||    ||||| || |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9512934 tgatgatgatgttccaaattattggact--tataagatgatgttgttttaagttg-ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggct 9512839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 294 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 17737294 - 17737135
Alignment:
Q  294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaatta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||| |||||||| | ||| || || ||||| | |||    
T  17737294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaagttattgga-tcatacaatag-ttgtcgattta 17737197  T
Q  394 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  17737196 agatgtttaagaagtcgagtctatgcattatca-ttctttgttgggggcttgatgctctggag 17737135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 17672744 - 17672626
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672744 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17672646  T
Q  333 taagttgatgaagatgatga 352  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  17672645 taagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 287 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 46822333 - 46822187
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataaga 380  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||      ||||||| |||||||||||||||| | |||||    
T  46822333 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatt-taaga 46822235  T
Q  381 gtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    | | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46822234 ggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 46822187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 12934079 - 12934241
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||      |||||||| ||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  12934079 gaactcgccatggcgagcagagactctcgcctcgcgagtacttgtgttacagacttccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 12934178  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 162  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  12934179 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga 12934241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15067645 - 15067462
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  15067645 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 15067547  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  15067546 aaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 15067462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 14878569 - 14878853
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg--tc-ccaaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||  ||||||||| ||  || |||||||||||||   | ||||||| |    
T  14878569 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaatctccaaattattggat--acataagagat 14878666  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctt 481  Q
      | |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||  ||||||||||| || |||||||||||| ||||||||    
T  14878667 gatga--ttaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgtagggggctc-atgccctggagattagtactcaccacgatggagctt 14878762  T
Q  482 tagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  14878763 tagctcaaattaaagatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactc-aataacgttggaggc-tcatgccctatattggtaccacatgc 14878853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 856204 - 855919
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg---atgtcccaaattattggactaatataagagtt 383  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||   ||   |||||||||||||   |||| |||       
T  856204 ctgcctatgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgtttatcctccaaattattggatatatatgagatga 856105  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    ||    |||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  856104 tg----attaagatgttttaagagattgagtccatgcattaacatacatttgttggaggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatt 856010  T
Q  483 agcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||| || ||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  856009 agctcaaaataacgatgggggc-tcatgccttgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 855919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 330 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16796339 - 16796078
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  16796339 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattgcactaatataagagatgatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatac 16796242  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcacca----------------------cgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttg 507  Q
      ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||                      || ||||||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  16796241 atttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggaattttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggctt- 16796144  T
Q  508 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| | |||||||  |||||||||||||||    
T  16796143 atgccctggaagtatattaatactc-aataacgttgggggc-tcatgccctaaattggtaccacatgc 16796078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 511 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26683200 - 26683136
Alignment:
Q  511 ccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26683200 ccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 26683136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 12171873 - 12171988
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  || | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  12171873 gaactggccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgatctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtg 12171972  T
Q  100 agttgatcttagaggt 115  Q
    ||||||||||||||||    
T  12171973 agttgatcttagaggt 12171988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43927438 - 43927291
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  43927438 acagaataccttgttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgt 43927339  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatat 196  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| ||||    
T  43927338 ttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatat 43927291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 287 - 535
Target Start/End: Original strand, 23077530 - 23077776
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc--caaattattggactaatataagagttt 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||| ||  |  ||||||| ||||   ||||||||| |     
T  23077530 ctgcctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattagtggat--atataagagatg 23077627  T
Q  385 gtcaaattaagatgttt--aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctt 481  Q
     | |  || ||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |    
T  23077628 atga--ttgagatgtttttaagagatcgagtccattcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcat 23077723  T
Q  482 tagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    || || ||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23077724 tatctcaaactagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaa 23077776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 193 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43925845
Alignment:
Q  193 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgc 290  Q
    |||||| ||||||| |||||||||| ||  | | ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||  ||| |||||   ||||||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattg-tatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagct-gttttatgtactgc 43926024  T
Q  291 ctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttg-tca 388  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     | |||| ||| ||||||||||||| | ||||||||| | | |      
T  43926023 ctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgttgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgt 43925929  T
Q  389 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
       |||||||  ||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  43925928 ttctaagatg--taagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctgaagcctt-tactcaccacgttgg 43925845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 390 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 16369362 - 16369216
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  16369362 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggagctt-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 16369264  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaata 537  Q
    || || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  16369263 aaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaata 16369216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8499398 - 8499316
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8499398 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 8499316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15412309 - 15412227
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15412309 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 15412227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Original strand, 53070697 - 53070799
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || || || ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070697 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgt-tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 53070795  T
Q  333 taag 336  Q
    ||||    
T  53070796 taag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 53301789 - 53301871
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53301789 tagcgataggggcttgatgctctg-aagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 53301871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27165130 - 27165048
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27165130 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgacgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 27165048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 324587 - 324481
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||| ||   |||||| || |||||||||||    
T  324587 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccaagttacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgtacaagttgatgtga 324488  T
Q  101 gttgatc 107  Q
    |||||||    
T  324487 gttgatc 324481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12172758 - 12172578
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  12172758 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctgtagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 12172660  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||  | || |||||| |||||||| ||||||||||||| | ||||   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  12172659 aaataatgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatattaaaat---gttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 12172578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10556865 - 10556783
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10556865 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatggtaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 10556783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 43550807 - 43550890
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550807 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaataacgattgagacttgatgccctgtattggtaccacatgc 43550890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13543847 - 13543773
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13543847 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagagattggggcttgatgccccgtattggtaccacatgc 13543773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 15076258 - 15076332
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15076258 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 15076332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 23318984 - 23319060
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  23318984 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggattgataccacatgc 23319060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 12120050 - 12120131
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12120050 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgacgggg-cttgatgctctgtattggtaccacatgc 12120131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 22147808 - 22147890
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22147808 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 22147890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28194575 - 28194493
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  28194575 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgattgaggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 28194493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 46822098 - 46822015
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  46822098 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattgagacttgatgccccgtattggtaccacatgc 46822015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 50242704 - 50242622
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  50242704 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaataacgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 50242622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 55476372 - 55476289
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  55476372 tagcgattggggcttgatgctccggtagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 55476289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 176 - 294
Target Start/End: Original strand, 2051141 - 2051260
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 273  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  2051141 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatga 2051239  T
Q  274 -ctggttttgcatactgcctat 294  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  2051240 act-gttttgcatactgcctat 2051260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 315971 - 315895
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  315971 tgagggcttgatgccttggaagtatattaatactcaaata-agttgagggcttgatgccctggattagtaccacatgc 315895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 9521191 - 9521074
Alignment:
Q  46 gttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttg 144  Q
    |||||||||| | ||| ||| ||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||     
T  9521191 gttacagaatgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgcacaagtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgtta 9521092  T
Q  145 ttgtttcagtaagcctga 162  Q
    ||||| ||||||| ||||    
T  9521091 ttgttccagtaagactga 9521074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11862756 - 11862575
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |    
T  11862756 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctca 11862658  T
Q  489 aattagc-gatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || | | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  |||| |||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  11862657 aaataactgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgatgagggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 11862575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15206786 - 15206710
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15206786 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 15206710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15245868 - 15245792
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15245868 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 15245792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 18384069 - 18384250
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |    
T  18384069 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctt-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctca 18384167  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||    |  ||| || |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  18384168 aaataattgttgggggtttatgccctgaaagtatattaatact---ataatgctgggggc-tcatgccctgtattggttccacatgc 18384250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17737075 - 17736993
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  17737075 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtataataatacttaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 17736993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 22147720 - 22147783
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22147720 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 22147783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 535
Target Start/End: Original strand, 23053243 - 23053387
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  23053243 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcata-catatgttgggggatc-atgccttggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 23053340  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||| |||  ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23053341 aaactagaaatgggggctt-atgccctggaaatatattaatactcaaa 23053387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 37642518 - 37642601
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  |||||||||||   ||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  37642518 tagcgattggggcttgatgcttcggaagtataataataatcaaatagcgattggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 37642601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 43550763 - 43550826
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43550763 tagcgattagggcttgatgctttggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 43550826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44494648 - 44494566
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  44494648 tagcgataggggcttgatgctctaga-gtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 44494566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 390 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 15051471 - 15051362
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  15051471 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttggggcctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 15051373  T
Q  489 aattagcgatg 499  Q
    || || |||||    
T  15051372 aaataacgatg 15051362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 46822177 - 46822123
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46822177 gggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 46822123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10562632 - 10562556
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10562632 tgagggcttgatgccttgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 10562556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 228 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12378050 - 12377940
Alignment:
Q  228 gatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatg 324  Q
    ||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||||||||||||||||||  | | |||||||||||| |||    
T  12378050 gatgtttaagttgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagcta-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattaactaagctgtatg 12377952  T
Q  325 agtcggtctaag 336  Q
    ||||||||||||    
T  12377951 agtcggtctaag 12377940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 536 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13442138 - 13442099
Alignment:
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13442138 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 13442099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 22147764 - 22147827
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22147764 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgc 22147827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 46822142 - 46822079
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46822142 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 46822079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 52524003 - 52524075
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52524003 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 52524075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 390 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 322555 - 322466
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagc 479  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  322555 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctt-atgccctgaagctttgtactcaccacgatggagc 322466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 233 - 381
Target Start/End: Original strand, 606324 - 606468
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttt-tgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    ||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||  ||| ||| ||  | ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  606324 ttgagatgttgttgaattgcatt-gatattgttatatcatgaactgatttatg--tgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtc 606420  T
Q  329 ggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    ||| |||| |||     |||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||    
T  606421 ggtataagatga-----atgatgatgttccaaattgttggatttatataagag 606468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 10556899 - 10556846
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10556899 gggcttgatgccctgga-gtatagtaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 10556846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 432 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11849235 - 11849097
Alignment:
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagc-gatgagggcttgatgccctggaagtatattaatac 530  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| || | | || |||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  11849235 ttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataactgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatac 11849138  T
Q  531 tcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |   |||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  11849137 t---ataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 11849097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 15076170 - 15076224
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15076170 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 15076224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15412343 - 15412290
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15412343 gggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 15412290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 17248055 - 17248109
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17248055 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaat 17248109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 27165164 - 27165111
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27165164 gggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 27165111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 42386269 - 42386194
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42386269 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccatatgc 42386194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 43550728 - 43550782
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  43550728 gggcttgatgccttggaagtataataatactcaaatagcgattagggcttgatgc 43550782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 53301755 - 53301808
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  53301755 gggcttgatgctctggaa-tatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 53301808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 55476407 - 55476353
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55476407 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 55476353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8898931 - 8898855
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8898931 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 8898855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13919217 - 13919141
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  13919217 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-cattgagggcttaatgccttggattggtaccacatgc 13919141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13919399 - 13919350
Alignment:
Q  285 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13919399 tactccctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 13919350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 19726055 - 19726236
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    |||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||      
T  19726055 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgcggg-ttcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctca 19726153  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  19726154 aaataattgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 19726236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21618327 - 21618251
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21618327 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 21618251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 24153447 - 24153523
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24153447 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctgcattggtaccacatgc 24153523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36166433 - 36166357
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36166433 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 36166357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 42386369 - 42386306
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttg 475  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||    
T  42386369 gagtccatgcattagcata-cattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttg 42386306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 53070467 - 53070520
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  53070467 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 53070520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 1644947 - 1645019
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  1644947 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggattgatgccctggattggtaccacatgc 1645019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 12120007 - 12120069
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12120007 tagcgataggggcttgatgctttgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 12120069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 15076205 - 15076268
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15076205 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagagattggggcttgatgc 15076268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 17737118 - 17737056
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17737118 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 17737056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 8499432 - 8499379
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8499432 gggcttgatgctctaga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 8499379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 13543891 - 13543837
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  13543891 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagagattggggcttgatgc 13543837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 292 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14665460 - 14665398
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14665460 tatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14665398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 17661146 - 17661221
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17661146 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggtttgatgccctggattgttaccacatgc 17661221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 28194605 - 28194556
Alignment:
Q  505 ttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28194605 ttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgc 28194556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 43925806 - 43925735
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  43925806 gggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttgatg-cctggattggtaccacatgc 43925735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 52523496 - 52523550
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||    
T  52523496 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctgacgagttgcccagttacagaat 52523550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Original strand, 11425009 - 11425054
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  11425009 ctcaaatagtgatgggggcttgatgctctggattggtaccacatgc 11425054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 412 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14234426 - 14234382
Alignment:
Q  412 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14234426 gtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccttggagc 14234382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15264989 - 15264913
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||  | || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  15264989 tgagggcttgatgccctaagagtatattaatgctcaaata-agttgagggattgatgccctggattggtaccacatgc 15264913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 16283136 - 16283212
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||| |||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16283136 tgagggcttgttgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 16283212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 17446979 - 17447055
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17446979 tgagggattgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 17447055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 42386763 - 42386710
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  42386763 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa 42386710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 323908 - 323869
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaata 537  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  323908 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata 323869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 479
Target Start/End: Original strand, 11298684 - 11298773
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagc 479  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  11298684 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcata-catctgttggggg-ttcatgccctggagctttgtactcaccatgatggagc 11298773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 14501290 - 14501207
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||| |||||  || |||||  ||||| |||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  14501290 taatgttatataattggatatatgttgcatgaaattatgattgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 14501207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 14572940 - 14572873
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggtt 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  ||||| | | ||||||||||    
T  14572940 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacctagaaacagagtaccttgttaggtt 14572873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 19776089 - 19776007
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  19776089 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 19776007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 37439421 - 37439503
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  37439421 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 37439503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 516 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 44494668 - 44494629
Alignment:
Q  516 gaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44494668 gaagtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 44494629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 288 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9577691 - 9577646
Alignment:
Q  288 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||    
T  9577691 tgcctatgttgctgttgt-atataaataagctgcatgagtcggtcta 9577646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 11557562 - 11557623
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  11557562 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 11557623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 12038126 - 12038187
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  12038126 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 12038187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 12119973 - 12120026
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  12119973 gggcttgatgctctaga-gtatattaatacgcaaatagcgataggggcttgatgc 12120026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 14668616 - 14668554
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||||||    
T  14668616 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatgatg 14668554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 16103628 - 16103598
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16103628 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 16103598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 17737152 - 17737099
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17737152 gggcttgatgctctgga-gtataataatacttaaatagcgataggggcttgatgc 17737099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 50242738 - 50242685
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  50242738 gggcttgatgctctgga-gtataataatacttaaatagcgataggggcttgatgc 50242685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 38
Target Start/End: Original strand, 606136 - 606173
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 38  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  606136 gaactcgccatggcgagtagaggtcctcgcctcgcgag 606173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 328
Target Start/End: Original strand, 11298580 - 11298621
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  11298580 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 12496199 - 12496131
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagc 479  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||    
T  12496199 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttttactcaccatgatggagc 12496131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 13543933 - 13543881
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13543933 ggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgat-tgggcttgatgc 13543881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 15246086 - 15246037
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  15246086 ctgcctatgttgctgttgtctattaattaaactgcatgagtcggtctaag 15246037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 18700812 - 18700845
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18700812 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 18700845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Original strand, 24340974 - 24341019
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24340974 ctcaaatagcgatagaggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 24341019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 42353622 - 42353655
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42353622 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 42353655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 559
Target Start/End: Original strand, 43890037 - 43890097
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||    
T  43890037 tgagggcttgatgccttgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctg 43890097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 43890122 - 43890155
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43890122 tgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgc 43890155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 3389994 - 3390030
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3389994 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 542 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 14441210 - 14441178
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14441210 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatg 14441178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Original strand, 17525211 - 17525275
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| || ||||||    
T  17525211 ctgcctatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaaaatgatg 17525275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 46
Target Start/End: Original strand, 23083132 - 23083176
Alignment:
Q  2 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 46  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  23083132 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaatgacccag 23083176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 268; Significance: 1e-149; HSPs: 165)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12902876 - 12902539
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902876 agatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 12902777  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12902776 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 12902678  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902677 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 12902578  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902577 tagcga-aggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 12902539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7798893 - 7798556
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| |||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798893 agatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7798794  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798793 gttgatgaagatgatgatgttctaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 7798695  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798694 tgggggcttgatgctctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaataagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 7798596  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798595 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 7798556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Original strand, 16377522 - 16377860
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377522 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16377619  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| || | |||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377620 taagttgatgaagataatgaagttccaaattattggatta-tgtaagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 16377718  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377719 tgttgggggcttgatgccctgaagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactc 16377817  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377818 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 16377860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7893822 - 7893484
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7893822 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaa 7893723  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893722 gttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 7893624  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893623 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttgaagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 7893525  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893524 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 7893484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22636554 - 22636217
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636554 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22636455  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636454 gttgatgaagatgatgattttccaaattattggatta-tataagaggttgttgaattaagatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 22636356  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636355 tgggggcttgatgccctggagctttgtgctcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 22636257  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22636256 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 22636217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44052948 - 44052610
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  44052948 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgttatttaactgagctgcatgagtcggcctaa 44052849  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||    
T  44052848 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgaatctacgcattagcatttcattgt 44052750  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052749 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 44052650  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44052649 tatcgatgggggcttgatgtcctgtattggtaccacatgc 44052610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 39706056 - 39706529
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  39706056 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcccagttacagaatgctttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 39706155  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||| ||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39706156 agttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaattatatgatctaatgttgttgctaatgttatataat 39706255  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||     
T  39706256 tgtatatacattacatga-attatg-ttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgt 39706352  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaata-taagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||| ||||    | |||||    
T  39706353 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatattaagaggttgttgtttataaga 39706452  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     | |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  39706453 ag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 39706529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 62 - 510
Target Start/End: Complemental strand, 15552105 - 15551663
Alignment:
Q  62 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 161  Q
    |||||| |||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   || ||||||  |||  ||||||| |||    
T  15552105 ttaggtaaaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttaccct-gctgttaatgtcccagtaagactg 15552007  T
Q  162 aattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgata 260  Q
    |    ||| |||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| |||| || ||||    
T  15552006 atgcttatgaatc-aatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttaccttcgata 15551912  T
Q  261 ttgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccca 359  Q
    || |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  15551911 ttattatatcatgatgg-attgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttcca 15551813  T
Q  360 aattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctt 459  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15551812 aattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaataggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctt 15551714  T
Q  460 tgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatg 510  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15551713 tgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgatg 15551663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 16239972 - 16240309
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||    
T  16239972 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctattttgctattgttatttaattaagttgcatgagttggtctaa 16240070  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| || || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16240071 gttgatgaagatgatgatgtttccaaattattagatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaacaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 16240169  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16240170 atgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacatgatggagctttagctcaga-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 16240268  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16240269 atagcgatgggagcttgatgccttgtattggtaccacatgc 16240309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 255 - 575
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053642
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 353  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||| |||||| ||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctg--tttgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T
Q  354 gtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    || |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14053421 gttccaaattattggactaatgtaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 14053519  T
Q  454 gagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttga 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14053520 gagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactaaaatagcgatgggggcttga 14053619  T
Q  553 tgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  14053620 tgccctgtattggtaccacatgc 14053642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 236 - 573
Target Start/End: Original strand, 23374361 - 23374691
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23374361 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaa 23374460  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| |||||||| |      ||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23374461 gttgttgaagatgtt------ccaaattattggattaatataagaggttgtcgagttaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt-cattgt 23374553  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23374554 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaatagcgattggggcttgatgccctggaagtataataatactcaaa 23374653  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23374654 tagcgattggggcttgatgccccgtattggtaccacat 23374691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 284 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17046559 - 17046267
Alignment:
Q  284 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagt 382  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  17046559 atactacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagg 17046460  T
Q  383 ttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17046459 ttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattaaca-ttcatagttgagggcttgatgccctggagctttgcactcaccacgttggagcatt 17046361  T
Q  483 agct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17046360 agctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 17046267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 263 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 3096385 - 3096134
Alignment:
Q  263 gttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaat 362  Q
    |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3096385 gttacatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaat 3096286  T
Q  363 tattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgt 462  Q
    |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3096285 tattagaataatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgt 3096187  T
Q  463 actcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
T  3096186 actcaccacgttgaagcattagctcaaattagcgatgggggcttgacgccctg 3096134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 236 - 515
Target Start/End: Original strand, 16270238 - 16270515
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16270238 agatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaa 16270336  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16270337 cttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattg 16270435  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  16270436 ttgggggcttgatgccctggagctttggactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagagatgggggcttgatgccctg 16270515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 57 - 369
Target Start/End: Original strand, 12288033 - 12288340
Alignment:
Q  57 ctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaa 156  Q
    |||||||||||| |||| ||   ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12288033 ctttgttaggtttaatgtgacttttgtcgcataagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaa 12288132  T
Q  157 gcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacattt 256  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||    
T  12288133 gcctgaattatatgatttaatgttgttggtaatgttatatagttgtatatacattacatga-attatgtttgatg-ttgtgatgttgttgaattgcattt 12288230  T
Q  257 gatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 353  Q
    |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | ||||||    
T  12288231 gatattgttatatcatgaactgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagatgat 12288324  T
Q  354 gtcccaaattattgga 369  Q
    || |||||||||||||    
T  12288325 gttccaaattattgga 12288340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 236 - 453
Target Start/End: Original strand, 52873369 - 52873585
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873369 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 52873468  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  52873469 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgt 52873567  T
Q  436 tgggggcttgatgccctg 453  Q
    ||||||||||||||||||    
T  52873568 tgggggcttgatgccctg 52873585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 232 - 457
Target Start/End: Original strand, 54798752 - 54798976
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54798752 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggt 54798851  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798852 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatttttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 54798950  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||    
T  54798951 ttgttgggggcttgatgccctagagc 54798976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 233 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 14038770 - 14038498
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||  |||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14038770 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 14038671  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||||||||||||        ||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038670 taagttgatgaagatgat--------aaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 14038580  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| || | ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  14038579 tgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaacatgatggagctttagctcaa--tagcgatgggggcttgatgccctgga 14038498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 18215318 - 18215540
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215318 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18215416  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| || ||| |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215417 taagttgattaagatgatgaagtttcaaattattggatta-tatgagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 18215515  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  18215516 tgttgggggcttgatgccttggagc 18215540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 232 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 14280435 - 14280215
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14280435 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 14280337  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14280336 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttta 14280238  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
      |||| ||||||||||||||||    
T  14280237 aagttgagggcttgatgccctgg 14280215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 7e-72
Query Start/End: Original strand, 233 - 454
Target Start/End: Original strand, 12351 - 12569
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12351 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 12449  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12450 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 12547  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12548 tgttgggggcttgatgccctgg 12569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 15118396 - 15118617
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118396 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 15118494  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118495 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 15118592  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  15118593 tgttgggggcttgatgccctggagc 15118617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 44773131 - 44773352
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773131 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 44773229  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773230 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 44773327  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44773328 tgttgggggcttgatgccctggagc 44773352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 44928923 - 44929146
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44928923 ttgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 44929022  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  44929023 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgattaaagatgtttaagaggtcgaatccatggattagcatttcat 44929121  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  44929122 tgttggtggcttgatgccctggagc 44929146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 50222383 - 50222604
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222383 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 50222481  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222482 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 50222579  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  50222580 tgttgggggcttgatgccctggagc 50222604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 52312628 - 52312407
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312628 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 52312530  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312529 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 52312432  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  52312431 tgttgggggcttgatgccctggagc 52312407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 12774351 - 12773895
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||||| | | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12774351 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtg 12774252  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||        |    
T  12774251 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatg--------t 12774160  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||| |||||  ||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  12774159 tgtatatacattaaatg-gattatg-ttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgc 12774064  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    ||||||||||||||  |||||||   |||    ||||| ||    
T  12774063 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgtt----caaattattggact--tataagatgatgttgttttaagttg 12773970  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||| |  | ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  12773969 -ttaagatgatgtgtcgatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt-tgctcaccacgttgg 12773895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 18239463 - 18239684
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239463 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgctgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18239561  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239562 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 18239659  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18239660 tgttgggggcttgatgccctggagc 18239684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 44615406 - 44615185
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 44615308  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615307 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 44615210  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  44615209 tgttgggggcttgatgccctggagc 44615185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 8846725 - 8846328
Alignment:
Q  2 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  8846725 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgtttatgttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtga 8846626  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||    
T  8846625 gttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataatt 8846526  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgactt----------------acatttgatattgttatatcatgctggttttgca 284  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||| ||||||                 |||| ||||||||||| ||||| | | ||||||    
T  8846525 gtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttagcattcgatattgttatctcatgat-gatttgca 8846428  T
Q  285 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |    
T  8846427 tactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggt 8846331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 244 - 457
Target Start/End: Original strand, 15355380 - 15355591
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15355380 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 15355478  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||| | ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355479 agatgttgaagttccaaattattggatta-tataagaggtagtcgatttaagaagtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 15355577  T
Q  444 tgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||    
T  15355578 tgatgccctggagc 15355591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 1837553 - 1837774
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837553 ttgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 1837651  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837652 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 1837749  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  1837750 tgttgggggcttgatgccctggagc 1837774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 80 - 476
Target Start/End: Original strand, 13697 - 14086
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||    
T  13697 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgt 13796  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggt 278  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||  |||| | || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | ||    
T  13797 tgtttataatgtgatataattgtatatacattacttga-attatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgt 13894  T
Q  279 tttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatata 377  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     | || ||||| ||||||||||||| | |||||    
T  13895 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aagaagatgttccaaattattggatttatata 13989  T
Q  378 agagtttg-tcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||| | | |    |||||||| || ||  || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  13990 agaggtcgttgtttttaagatg-ttgagttgttgagtccatgcattcaca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctt-tgctcaccacgttgg 14086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15370128 - 15369918
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  15370128 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15370030  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  15370029 agatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggct 15369931  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||| ||||||    
T  15369930 tgatgctctggag 15369918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 575
Target Start/End: Original strand, 17048409 - 17048648
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  17048409 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagatgatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatac 17048506  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaata 529  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17048507 atttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggcat-atgccctggaagtatattaata 17048604  T
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  17048605 ctc-aataacgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 17048648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 232 - 457
Target Start/End: Original strand, 8574867 - 8575088
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574867 tttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 8574964  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||||  |||||| || |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574965 ctaagttaattaagatgatgaggttccaaagcattggatta-tataagaggttgtggatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 8575063  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8575064 ttgtt-ggggcttgatgccctggagc 8575088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15371312 - 15371102
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  15371312 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15371214  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  15371213 agatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattacca-ttctttgttgggggct 15371115  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||| ||||||    
T  15371114 tgatgctctggag 15371102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 294 - 457
Target Start/End: Original strand, 7641286 - 7641447
Alignment:
Q  294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaatta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||    
T  7641286 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgattta 7641384  T
Q  394 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641385 agat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 7641447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15099702 - 15099457
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  15099702 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtg 15099603  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  15099602 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataat 15099503  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 247  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15099502 tgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 15099457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 244 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 15367800 - 15367591
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  15367800 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15367702  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  15367701 agatgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccattcattagca-ttctttgttgggggct 15367603  T
Q  444 tgatgccctgga 455  Q
    | |||| |||||    
T  15367602 taatgctctgga 15367591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 456
Target Start/End: Original strand, 51463912 - 51464131
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51463912 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 51464010  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  51464011 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctt 51464107  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  51464108 tgttgggggcttgatgctctggag 51464131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15190667 - 15190424
Alignment:
Q  3 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgag 101  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15190667 actcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgag 15190568  T
Q  102 ttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattg 201  Q
    |||||||| | ||| || ||||||||| |||  |||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||    
T  15190567 ttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattg 15190468  T
Q  202 tatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 247  Q
    ||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15190467 tatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 15190424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 236 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 7088996 - 7088832
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088996 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 7088897  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtt 400  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7088896 gttgatgaagatgatgatgttctaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtt 7088832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15373593 - 15373383
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  15373593 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15373495  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  15373494 agatgttgatgtttcaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattacca-ttctttgttgggggct 15373396  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||| ||||||    
T  15373395 tgatgctctggag 15373383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 15402813 - 15402603
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  15402813 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 15402715  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  15402714 agatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatggttaagaagtcgagtccatgcatttgca-ttctttgttgggggct 15402616  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||| ||||||    
T  15402615 tgatgctctggag 15402603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 244 - 455
Target Start/End: Complemental strand, 16223642 - 16223433
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||    
T  16223642 ttgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttga 16223544  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  16223543 agatgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccattcattagca-ttctttgttgggggct 16223445  T
Q  444 tgatgccctgga 455  Q
    | |||| |||||    
T  16223444 taatgctctgga 16223433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 59 - 381
Target Start/End: Original strand, 53081976 - 53082294
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagagg-taaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaag 157  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||    
T  53081976 ttgttaggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaag 53082075  T
Q  158 cctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttg 257  Q
    |||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||| |||| || | ||||    
T  53082076 cctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttg 53082173  T
Q  258 atattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    ||||||||||||||||  || |||||   |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     | |||| ||    
T  53082174 atattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgttg 53082267  T
Q  355 tcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||    
T  53082268 ttccaaattattggatttatataagag 53082294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 236 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6900009 - 6899808
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||   ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6900009 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaa 6899911  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatg-tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||| || | ||||||||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||     
T  6899910 gttgatgaagatgatgatgtttccaaattatt-gaattatataagaggttttcgaattaaaatgtttaagaggtcgaatccatgcattagcatttcatta 6899812  T
Q  435 ttgg 438  Q
    ||||    
T  6899811 ttgg 6899808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 59 - 476
Target Start/End: Original strand, 43198381 - 43198787
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| |   ||||||||  ||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||     
T  43198381 ttgttaggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgct---agaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaaga 43198477  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttg 257  Q
    || |    ||| |  | ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| | |||||||| ||| |||||| ||||||    
T  43198478 ctaatgcatatgaattgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaatt-atatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttg 43198576  T
Q  258 atattgttatatcatgc-tggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 355  Q
    |||| |||||||||||  | |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | || |||||    
T  43198577 atatggttatatcatgaattgttttgcatattgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagaagatgt 43198671  T
Q  356 cccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgga 455  Q
     ||||||||||||| | ||||||||| ||||     ||||| | || ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43198672 tccaaattattggatttatataagaggttgt--ttctaaga-ggttgagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctgga 43198767  T
Q  456 gctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    || || | |||||||||||||    
T  43198768 gcctt-tgctcaccacgttgg 43198787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 460
Target Start/End: Original strand, 46640272 - 46640675
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||| ||||    
T  46640272 acagaataccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgt 46640370  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 248  Q
    |||||||| |||||||| ||| || | ||||||||  | |||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||| |||||||||| ||||     
T  46640371 ttcagtaaacctgaattatatgatttgatgttgttaatgatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatg-ttgagatgttattgat 46640468  T
Q  249 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 345  Q
    || ||||||||||||||||||||||  || |||||  |||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||||     
T  46640469 tttcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgaaa 46640564  T
Q  346 atgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 445  Q
    |  ||| |||  |||||||||||| | ||||||||| | |      ||||||| |||||| || ||||||||||||   || ||||||||||||||||||    
T  46640565 a--atgttgtttcaaattattggatttatataagaggtcgatggtctaagatg-ttaagatgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttg 46640660  T
Q  446 atgccctggagcttt 460  Q
    |||||||||||||||    
T  46640661 atgccctggagcttt 46640675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 240 - 456
Target Start/End: Original strand, 23803316 - 23803528
Alignment:
Q  240 gttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 339  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23803316 gttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23803414  T
Q  340 atgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 439  Q
    || |||||||||| || |||||||||| || | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| |    
T  23803415 attaagatgatgaagttccaaattatt-gaattatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgtg 23803511  T
Q  440 ggcttgatgccctggag 456  Q
    |||||||||| ||||||    
T  23803512 ggcttgatgctctggag 23803528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 453
Target Start/End: Complemental strand, 44102332 - 44102114
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102332 ttgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 44102234  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||   |     
T  44102233 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagagtttgtcgatttaagatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcataataa 44102135  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctg 453  Q
     |||| |||||||||||||||    
T  44102134 agttgagggcttgatgccctg 44102114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 294 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 12611008 - 12610849
Alignment:
Q  294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaatta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| || || ||||| | |||    
T  12611008 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaatag-ttgtcgattta 12610911  T
Q  394 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12610910 agatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgctctggag 12610849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 19618216 - 19618415
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618216 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19618314  T
Q  333 taagttgatgaa------gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||      |||||| |||| ||||| ||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618315 taagttgattaagatgttgatgataatgttccaaactattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 19618413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 14970751 - 14970950
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14970751 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgc-tgttttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtc 14970849  T
Q  333 taagttgatgaa------gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||      ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14970850 taagttgattaaaatgttgatgatgatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtcgatgcattagca 14970948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 399 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13569454 - 13569282
Alignment:
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcga 497  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||    
T  13569454 tttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctgaaattagcga 13569357  T
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  13569356 tgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctg-attggtaccacatgc 13569282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44675594 - 44675411
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  44675594 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 44675497  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||    
T  44675496 aaattaacgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgtcctgaattggtaccacatgc 44675411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 46 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 16596953 - 16596686
Alignment:
Q  46 gttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgt 145  Q
    |||||||||| | || ||||||| |||| |||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||      
T  16596953 gttacagaatgcctttttaggttgaatgtgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaa 16596854  T
Q  146 tgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgtt 245  Q
    ||||  |||||| ||||    |||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| |    
T  16596853 tgttcaagtaagactgatgcttataaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgat 16596758  T
Q  246 gacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaag 317  Q
    || ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16596757 gatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcatactacctatgttgctgtttgttatttaactaag 16596686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12569977 - 12569795
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  12569977 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctt-ataccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 12569880  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  12569879 aaataa-cgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 12569795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 15125196 - 15125379
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  15125196 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-attccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 15125293  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  15125294 aaattaacgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 15125379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 22353955 - 22353740
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| ||  | ||||||||||||| ||||| || |  | ||  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22353955 ttgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctgttgttatttacctaagctgcatgagtcggtc 22353856  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgat-gtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    |||| || |||| ||||||||  |||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22353855 taagatgttgaatatgatgatattcccaaattattcgattaatataagag--ggtcaaattaagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttc 22353759  T
Q  431 attgttgggggcttgatgc 449  Q
    | || | ||||||||||||    
T  22353758 agtgattggggcttgatgc 22353740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23843440 - 23843257
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| || |||     
T  23843440 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattggctc 23843343  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  23843342 aaattaacgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 23843257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 176 - 386
Target Start/End: Original strand, 52243136 - 52243343
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg- 273  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| || | |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  52243136 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttg-gattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatga 52243234  T
Q  274 -ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggact 371  Q
     || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | || ||||| ||||||||||||| |    
T  52243235 act-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagaagatgttccaaattattggatt 52243328  T
Q  372 aatataagagtttgt 386  Q
     ||||||||| ||||    
T  52243329 tatataagaggttgt 52243343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 244 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 20149936 - 20149731
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||| |||||||||||| |    
T  20149936 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgtcgctgttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgatta 20149838  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    |||||| | |   ||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  20149837 agatgaagtt---ccaaattattggatta-tacaagagtttatcaatttaagatgttaaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggct 20149742  T
Q  444 tgatgccctgg 454  Q
    |||||||||||    
T  20149741 tgatgccctgg 20149731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 3515125 - 3514990
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3515125 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttttttaactaagctgcatgagtcggtc 3515027  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    ||||||||| |||||||||| || | |||||||||||    
T  3515026 taagttgattaagatgatgaggttctaaattattgga 3514990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 233 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 19242817 - 19242683
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242817 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 19242719  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  19242718 taagttgattaagatgatgaagt-ccaaattattgga 19242683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15093737 - 15093555
Alignment:
Q  390 attaagatgttta-agaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  15093737 attaagatgtttttagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 15093640  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  15093639 aaattagcgatggtggctt-atgccctggaagtatattaatactc-aataacgatgagggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 15093555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 15121955 - 15122138
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  15121955 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 15122053  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || | ||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  15122054 aaataacaatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataacgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 15122138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22353662 - 22353588
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22353662 gggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 22353588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15705253 - 15705171
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15705253 tagcgataggggcttgatgctctg-aagtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 15705171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 13592417 - 13592493
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  13592417 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatactcaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtatcacatgc 13592493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14825320 - 14825244
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14825320 tgagggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaata-agttgagggcttgatgccctgcattggtaccacatgc 14825244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29267570 - 29267517
Alignment:
Q  404 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267570 gaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 29267517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12610789 - 12610707
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12610789 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataagggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 12610707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 14971083 - 14971166
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  |||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14971083 tagcgattggggcctgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 14971166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19242554 - 19242472
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19242554 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 19242472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Original strand, 21815629 - 21815731
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||| |  | ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21815629 ttgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagt-tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcacgagtcggtc 21815727  T
Q  333 taag 336  Q
    ||||    
T  21815728 taag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 51464148 - 51464230
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  51464148 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 51464230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17333128 - 17333052
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  17333128 tgagggcttgattccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgc 17333052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 16348817 - 16348997
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| |    
T  16348817 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 16348915  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  16348916 aaataatgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgctgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 16348997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 19618504 - 19618588
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatag-cgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19618504 tagcgattggggtttgatgctctggaagtataataatactcaaatagccgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 19618588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 446 - 575
Target Start/End: Original strand, 16488287 - 16488411
Alignment:
Q  446 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatggg 545  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| ||| ||  | || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||   | ||||    
T  16488287 atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcattagctcaaaataatgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatactaaaat---gttggg 16488382  T
Q  546 ggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||    
T  16488383 ggc-tcattccctgtattggtaccacatgc 16488411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 23803631 - 23803713
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  23803631 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagtgataggggcttaatgctccgtattggtaccacatgc 23803713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 14122 - 14197
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14122 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgc 14197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 12288482 - 12288557
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12288482 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 12288557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15367521 - 15367448
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15367521 gggcttgatgctatgga-gtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 15367448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15369849 - 15369776
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15369849 gggcttgatgctatgga-gtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 15369776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15791535 - 15791459
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  15791535 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccatggattggtaccacatgc 15791459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 53082424 - 53082499
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  53082424 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgc 53082499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 412 - 476
Target Start/End: Original strand, 14927911 - 14927973
Alignment:
Q  412 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  14927911 gtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 14927973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 5339149 - 5339311
Alignment:
Q  408 tcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggct 505  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||| ||||| |  | || |||||    
T  5339149 tcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagccttgtcatcaccacgatggagctttagctctaaataattgttgggggct 5339246  T
Q  506 tgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||| ||||||||||||||| || |   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  5339247 t-atgccctgaaagtatattaatactaaact---gttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 5339311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 19242598 - 19242535
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19242598 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgc 19242535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 39706568 - 39706640
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39706568 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 39706640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15373357 - 15373284
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15373357 gggcttgatgctatgga-gtataataatactcaaatagcgataagggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 15373284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 229 - 275
Target Start/End: Original strand, 15464926 - 15464972
Alignment:
Q  229 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgct 275  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  15464926 atgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgct 15464972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 19242633 - 19242579
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19242633 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 19242579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 44928692 - 44928746
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44928692 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaat 44928746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 52242962 - 52243016
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  52242962 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaat 52243016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 52243467 - 52243542
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52243467 tgagtgcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 52243542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14038525 - 14038484
Alignment:
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14038525 aatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 14038484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Original strand, 16270486 - 16270531
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16270486 ctcaaatagagatgggggcttgatgccctgtattggtacaacatgc 16270531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 16357004 - 16357285
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc--caaattattggactaatataagagttt 384  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||  ||||||||| ||  |  ||||||||||||   |||| |||   |    
T  16357004 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatgttgaactccaaattattggatgtatatgagatgat 16357103  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
    |    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||     
T  16357104 g----attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcattt 16357198  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| ||| ||  | ||  ||||| |||||||  |||||||||||||||  |||   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  16357199 gctcaaaataatgttggaggctt-atgccctaaaagtatattaatactgtaat---gctgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 16357285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 18215601 - 18215676
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18215601 tgagggcttgatgccctgga-gcctatttacgctcaaata-cgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 18215676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 21815071 - 21815124
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21815071 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 21815124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 21815400 - 21815453
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21815400 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 21815453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 21818493 - 21818546
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  21818493 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 21818546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 46640689 - 46640764
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  46640689 tgagggcttgatgccctgtaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccatatgc 46640764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14164807 - 14164739
Alignment:
Q  96 tgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaat 164  Q
    |||||| ||||| ||| |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14164807 tgtgagatgatcctaggggttgggaactaagttgtttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaat 14164739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 556
Target Start/End: Original strand, 23803545 - 23803608
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgcc 556  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23803545 tagcgattggggcttgatgccttgga-gtatattaatacttaaatagcgattggggcttgatgcc 23803608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3096157 - 3096118
Alignment:
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3096157 tagcgatgggggcttgacgccctgtattggtaccacatgc 3096118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 12610832 - 12610770
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12610832 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 12610770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 498 - 569
Target Start/End: Original strand, 14853143 - 14853213
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtacc 569  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||  |||||||||    
T  14853143 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctagattggtacc 14853213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 22353715 - 22353652
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  22353715 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagtgattggggcttgatgc 22353652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 23803588 - 23803650
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23803588 tagcgattggggcttgatgccttgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 23803650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 14970960 - 14971014
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  14970960 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattgaggcttgatgc 14971014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 14971048 - 14971102
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  14971048 gggcttgatgctcttgaagtataataatactcaaatagcgattggggcctgatgc 14971102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 15464698 - 15464752
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    |||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15464698 gaactcaccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaat 15464752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 19618469 - 19618523
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  19618469 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggtttgatgc 19618523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 22353750 - 22353696
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22353750 gggcttgatgcttcggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 22353696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 14157698 - 14157624
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||  || |||||||||||||||| | |||| |||||||||    
T  14157698 tgagggcttgatgccctagaagtatattaatact--tattacgttgggggcttgatgccccggattgataccacatg 14157624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 17333347 - 17333298
Alignment:
Q  285 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333347 tactgtctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 26045564 - 26045640
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26045564 tgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 26045640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 26050745 - 26050821
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| ||  ||| |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26050745 tgagggcttgatgccatgagagtgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 26050821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 502 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 37018532 - 37018460
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  37018532 ggcttgatgccctgagagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaacacatgc 37018460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44102131 - 44102055
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||  ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44102131 tgagggcttgatgccctgagagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 44102055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 52873568 - 52873601
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873568 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 52873601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 54799037 - 54799113
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54799037 tgagggtttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctgcattggtaccacatgc 54799113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 96 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 14158102 - 14158034
Alignment:
Q  96 tgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaat 164  Q
    |||||| ||||| ||| |||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14158102 tgtgagatgatcctaggggttgggaactaagttttttatcttgctgttgttgttctagtaagcctgaat 14158034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 501 - 569
Target Start/End: Complemental strand, 15371076 - 15371009
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtacc 569  Q
    |||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||||||    
T  15371076 gggcttgatgctatgga-gtataataatactcaaatagcgataagggcttgatgctccgtattggtacc 15371009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 501 - 565
Target Start/End: Complemental strand, 15402577 - 15402514
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattgg 565  Q
    |||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||    
T  15402577 gggcttgatgctatgga-gtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattgg 15402514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 630728 - 630810
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| ||||  || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  630728 taatgttatataattggatatatattgcatgcatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 630810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 389 - 472
Target Start/End: Original strand, 631134 - 631216
Alignment:
Q  389 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||   | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  631134 aattaagatgtttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 631216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 3332052 - 3331970
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  3332052 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacatgcatttgtaattgttatat 3331970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 13812763 - 13812845
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  13812763 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 13812845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #136
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 14953915 - 14953997
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  14953915 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 14953997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #137
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 556
Target Start/End: Original strand, 23803511 - 23803565
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgcc 556  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  23803511 gggcttgatgctctgga-gtataataatacttaaatagcgattggggcttgatgcc 23803565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #138
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 25690228 - 25690146
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  25690228 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 25690146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #139
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Original strand, 13618 - 13656
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagt 39  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13618 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagt 13656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #140
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 12610866 - 12610813
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  12610866 gggcttgatgctctgga-gtataataatacttaaatagcgataggggcttgatgc 12610813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #141
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14157798 - 14157753
Alignment:
Q  411 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14157798 agtccatgcattagcata-cattgttgagggcttgatgccctggagc 14157753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #142
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 411 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14164503 - 14164458
Alignment:
Q  411 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  14164503 agtccatgcattagcata-cattgttgagggcttgatgccctggagc 14164458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #143
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 15353485 - 15353546
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15353485 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 15353546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #144
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15369892 - 15369839
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  15369892 gggcttgatgctctg-aagtatattaatacttaaatagtgataggggcttgatgc 15369839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #145
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15369935 - 15369882
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  15369935 gggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagtgataggggcttgatgc 15369882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #146
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15371119 - 15371066
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15371119 gggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcaataggggcttgatgc 15371066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #147
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15373400 - 15373347
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15373400 gggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcaataggggcttgatgc 15373347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #148
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15402620 - 15402567
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  15402620 gggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcaataggggcttgatgc 15402567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #149
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15705287 - 15705234
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15705287 gggcttgatgctctgga-gtataataatacttaaatagcgataggggcttgatgc 15705234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #150
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 19618425 - 19618479
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  19618425 gggcttgatgctccagaagtataataatactcaaatatcgattggggcttgatgc 19618479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #151
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 44102562 - 44102508
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  44102562 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat 44102508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #152
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 51464114 - 51464167
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  51464114 gggcttgatgctctgga-gtataataatacttaaatagcgataggggcttgatgc 51464167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #153
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12773897 - 12773864
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12773897 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 12773864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #154
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 482
Target Start/End: Original strand, 13813172 - 13813264
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||    
T  13813172 attaagatgttttagatgatagagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctgaagctttgtcctcaccacgattgagcttt 13813264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #155
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14280146 - 14280113
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14280146 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 14280113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #156
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 555
Target Start/End: Original strand, 14971005 - 14971058
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  14971005 ggcttgatgctacggaagtataataatactcaaatagagattggggcttgatgc 14971058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #157
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 15355608 - 15355684
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  ||||||||  | |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15355608 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaatat-gttgggggcttgatgccctagattggtaccacatgc 15355684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #158
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 328
Target Start/End: Original strand, 16348716 - 16348757
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16348716 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #159
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 19242672 - 19242623
Alignment:
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 449  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  19242672 ttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 19242623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #160
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20149662 - 20149629
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20149662 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 20149629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #161
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 35812575 - 35812608
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35812575 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 35812608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #162
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 52312347 - 52312271
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||| |||| ||  |||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  52312347 tgagggcttgatgctctgggagcctatttacgctcaaata-cgttggggacttgatgccctggattggtaccacatgc 52312271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #163
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 11250619 - 11250655
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11250619 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #164
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 15353365 - 15353401
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  15353365 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 15353401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #165
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 412 - 476
Target Start/End: Original strand, 52243369 - 52243431
Alignment:
Q  412 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||| ||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  52243369 gtccaggcattagcatt-catttatgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 52243431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 5)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 167980 - 168318
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  167980 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 168079  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  168080 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 168178  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  168179 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtattttaatactcaaa 168278  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  168279 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 168318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 240; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 52032 - 51695
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52032 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 51933  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51932 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggtttttgttttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 51834  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51833 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccttggaagtatattaatactcaaa 51735  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51734 tagcgatgggggcttgatgccctgtattgctaccacatgc 51695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 38385 - 38461
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38385 tgagggcttgatgccctgggagtatatttatgctcaattaa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 38461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 125581 - 125542
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaata 537  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  125581 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata 125542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Original strand, 38204 - 38253
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  38204 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 38253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 7)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 32888 - 32419
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  32888 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctacccagttacagaatgccttgttgggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtga 32789  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  32788 gttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgtttttgttaatgttatatagtt 32689  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  32688 gtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgct 32592  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatg 398  Q
    | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||| | ||    | ||||| |    
T  32591 gtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaaga-g 32495  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag-ctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     || ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
T  32494 gttgagttgttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgt--tcaccacgttgg 32419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 436 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 116835 - 116697
Alignment:
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116835 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaa-ttagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 116737  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116736 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 116697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 438 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 116938 - 116818
Alignment:
Q  438 ggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaata 537  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  116938 ggggcttgatgccctgaagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaa-ttagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattagtactcaaata 116840  T
Q  538 gcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  116839 gcaatgggggcttgatgccctg 116818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 436 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 117044 - 116923
Alignment:
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  117044 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagttttagc-tcaattagcgataggggcttgttgccctggaagtatattaatacttaaa 116946  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    ||||||| ||||||||||||||||    
T  116945 tagcgat-ggggcttgatgccctg 116923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 433 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 117108 - 117025
Alignment:
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  117108 tgttgggggcttgatgccctagagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctgga 117025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #6
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32383 - 32308
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32383 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 32308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Original strand, 51904 - 51985
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||| |||| || ||||  ||||| || |||||||||| |||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51904 ttgatattattatgtcttgctatttttgaatgctgcctatgt-gctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 137)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23060632 - 23060294
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060632 agatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23060533  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060532 gttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 23060434  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060433 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 23060335  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23060334 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 23060294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 23654388 - 23654727
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| ||  |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654388 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23654487  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  23654488 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcactagcatt-cattgt 23654586  T
Q  436 tgggg-gcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654587 tggggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 23654686  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23654687 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 23654727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 186 - 575
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072290
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||| ||| |||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgctgatttatattcgatattattatatcatgatgg-tttgcat 23071999  T
Q  286 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagttt 384  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  23072000 actgcctatgttgttgttcgttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggtt 23072099  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttag 484  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23072100 ttcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgctctagagctttgtactcaccacgttggagcattag 23072198  T
Q  485 ct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23072199 ctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 23072290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 292 - 567
Target Start/End: Original strand, 23040247 - 23040522
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  23040247 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaat 23040346  T
Q  392 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaat 491  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23040347 taagatgtttaagaggtcgagtgcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttgaaattttgtactcaccacgttggagctttagctcaaat 23040446  T
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggta 567  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23040447 tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggagcttgatgccctgtattggta 23040522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 255 - 575
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38456
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T
Q  355 tcccaaattattggactaatataagagtttgtc-aaattaagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccct 452  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| | || |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  38235 ttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatttatgttgttttaagaggtggagtccatgcattagca-ttcattgtt-ggggcttgatgccct 38332  T
Q  453 ggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttg 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38333 ggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttg 38432  T
Q  552 atgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  38433 atgccctgtattggtaccacatgc 38456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 238 - 575
Target Start/End: Original strand, 22731238 - 22731573
Alignment:
Q  238 atgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 337  Q
    |||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22731238 atgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaact 22731337  T
Q  338 tgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttg 437  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731338 tgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgaataaagatgtctaacaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttg 22731436  T
Q  438 ggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaata 537  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22731437 ggggcttgattccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttggtgcccttgaagtatattaatactcaaata 22731535  T
Q  538 gcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22731536 acgatgggggcttgataccctgtattggtaccacatgc 22731573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 232 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22337238 - 22336907
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337238 tttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22337139  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||         ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337138 ctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattat---------ataagaggttgtcgaattaagaagtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 22337048  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22337047 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacaatggagctttagctcaaatt-gcgatg-gggcttgatgccctggaagtatattaatact 22336950  T
Q  532 caaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22336949 c-aatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 22336907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Original strand, 23103396 - 23103735
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    ||||||||||| ||| ||  |||||||||  | || ||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103396 ttgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg--tttgtatactgcctatgttgctgtttttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23103493  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    |||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  23103494 taagatgttgaagatgatgatgttccaaaatattggactaatttaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ctcat 23103592  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23103593 tgtt-ggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattactact 23103691  T
Q  532 caaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23103692 caaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 23103735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 277 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8946735 - 8946438
Alignment:
Q  277 gttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaata 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || ||    
T  8946735 gttttgtatactgcctatgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-ta 8946637  T
Q  376 taagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttg 475  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  8946636 taagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttagggacttgatgccctggagctttgtactcaacacgatg 8946537  T
Q  476 gagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8946536 gagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgtcctggaagtatattaatactcaaatagcaatgggggcttaatgccctgtattggtaccacatgc 8946438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 341 - 575
Target Start/End: Original strand, 21900560 - 21900794
Alignment:
Q  341 tgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggg 440  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21900560 tgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgttgggg 21900659  T
Q  441 gcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcg 540  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21900660 gcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaatttagcgatgggggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaatagcg 21900759  T
Q  541 atgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21900760 atgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 21900794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 22738182 - 22738518
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22738182 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctat-ttaatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22738280  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||| ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  22738281 gttgatcaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgttgaattaagatgtctaaaaggtcggatccatgcattagcatttcattgt 22738379  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22738380 tgggggcttgatgccctggagctctgtactcaacacgttggagctttaac-tcaattagtgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaat 22738478  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22738479 tagcgatgggggcttgatgccccgtattggtaccacatgc 22738518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28406331 - 28405881
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||      |||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28406331 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcaagtacttgtgttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgatgtg 28406232  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28406231 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataa 28406132  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||  |||| || |   ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  28406131 ttgtatatacattttatgaattaa--gttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttg 28406034  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||| | |||||||||||||||  |||||||   |||     |||| |    
T  28406033 ctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgattttccaaattattggact--tataagatgatgttgttctaagtt 28405939  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | |||||| |  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405938 g-ttaagatgatgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 28405881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 25176194 - 25175754
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | | |||||||||||| | |||||    ||     |||  ||||||||||| ||||||| |    
T  25176194 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaactgcgcagttacagaatgccttgtt----ta-----gatctttgtcgcacgaattgatgtaa 25176104  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25176103 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataat 25176004  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    | ||||||| ||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  25176003 tatatatacgttatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgc 25175907  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagat 397  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    | |||||     
T  25175906 tgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact--tataagaggttgttgtttataagaa 25175812  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | |||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175811 g-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 25175754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 236 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 20309225 - 20308945
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||| ||| ||  |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20309225 agatgttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 20309129  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |    
T  20309128 agatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagttgtttaagatgtcgagtccatgcattagca-ttcatag 20309030  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaa 518  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20309029 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaa 20308945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 236 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 23076561 - 23076288
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076561 agatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 23076462  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatg-tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    || |||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23076461 gtggatgaagatgatgatgtttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggccgagtccatgcattagcatttcattg 23076363  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||     |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23076362 ttgggggcttgatgccctgaacctttgta-----cacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctg 23076288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 186 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 19671998 - 19671675
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 285  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | |||   ||||||||||||| |||| | || |||||| |||||||||| || ||||||||    
T  19671998 taatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatattgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcat 19671901  T
Q  286 actgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagttt 384  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  19671900 actgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggtt 19671801  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttag 484  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  19671800 gtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtctatgcattagcatttcatggttgggagcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgaagcttaag 19671701  T
Q  485 cttaaattagcgatgagggcttgatgc 511  Q
    | | ||||||||||  |||||||||||    
T  19671700 c-tcaattagcgataggggcttgatgc 19671675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 7500 - 7950
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||| |    ||  ||||||| ||| |||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  7500 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagctcatgagagacagaatacttggttaggtttaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtga 7599  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  7600 gttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgtgatataatt 7699  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||| |||  |||| | || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7700 gtatatacattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgc 7797  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagat 397  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||     | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||    | |||||     
T  7798 tgtttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaagatga-----aagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaaga- 7891  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | || ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7892 ggttgagttgttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 7950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 453
Target Start/End: Original strand, 18786670 - 18787116
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||| |    ||  ||||||  |||||||||||  |||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  18786670 gaacttgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagctcaagagagacagaacactttgttaggtctaatgtgacttttgtcgcacgagttgatgtga 18786769  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  |||||| ||| |||||||||||| ||    
T  18786770 gttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaattatatgattgaatgttattgataatgttatatagtt 18786869  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||| || |||||||| || ||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||     
T  18786870 gtatatacattacatga-attatgtttgatg-ttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcatgaactgg-tttgcatactacctatgtta 18786966  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||    | |||||    
T  18786967 ctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaaga 18787061  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    || |||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18787062 tg-ttaagttgttgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 18787116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 18809061 - 18808840
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809061 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 18808963  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808962 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 18808865  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  18808864 tgttgggggcttgatgccctggagc 18808840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23135708 - 23135487
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135708 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23135610  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135609 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 23135512  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23135511 tgttgggggcttgatgccctggagc 23135487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23207631 - 23207256
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  23207631 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttgcccagttacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtga 23207532  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||  |||||||||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| |    
T  23207531 gttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaat 23207432  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||| ||||||||||  |||| | | ||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||    
T  23207431 gtatatgcattacatga-attatttataatg-ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgcctatgttg 23207335  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     | |||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  23207334 ctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgatgttccaaattattggatttatataagag 23207256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 23712057 - 23712278
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712057 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23712155  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712156 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 23712253  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23712254 tgttgggggcttgatgccctggagc 23712278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26505497 - 26505276
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505497 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 26505399  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505398 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 26505301  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26505300 tgttgggggcttgatgccctggagc 26505276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 26507975 - 26507754
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507975 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 26507877  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507876 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 26507779  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  26507778 tgttgggggcttgatgccctggagc 26507754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 39682431 - 39682210
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682431 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 39682333  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682332 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 39682235  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39682234 tgttgggggcttgatgccctggagc 39682210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6726113 - 6725892
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726113 ttgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6726015  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||||||||| || | ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726014 taagttgattaagatgatgaagttccaaattatt-gaattatataagaggttgtcgatgtaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 6725917  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  6725916 tgttgggggcttgatgccctggagc 6725892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24367892 - 24367670
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367892 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 24367794  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  24367793 taagttgattaaaatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacattacat 24367695  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24367694 tgttgggggcttgatgccctggagc 24367670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 24905676 - 24905898
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24905676 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggt 24905774  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905775 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttca 24905872  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24905873 ttgttgggggcttgatgccctggagc 24905898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 24908151 - 24908373
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24908151 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggt 24908249  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908250 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttca 24908347  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24908348 ttgttgggggcttgatgccctggagc 24908373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 571515 - 571294
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571515 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 571417  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  571416 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 571319  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  571318 tgttgggggcttgatgccctggagc 571294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 23709576 - 23709797
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709576 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23709674  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709675 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 23709772  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23709773 tgttgggggcttgatgccctggagc 23709797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 24529573 - 24529795
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||| |||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24529573 ttgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgttgttgttgttatttaactatgctgcatgagtcggtc 24529671  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529672 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 24529770  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  24529771 tgttgggggcttgatgccctggagc 24529795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 236 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 23660141 - 23659940
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  23660141 agatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctg-tttcgtatactgcctatgttgctgttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaa 23660043  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23660042 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 23659944  T
Q  436 tggg 439  Q
    ||||    
T  23659943 tggg 23659940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 24898239 - 24898461
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24898239 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggt 24898337  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898338 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgttgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttca 24898435  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24898436 ttgttgggggcttgatgccctggagc 24898461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 24900722 - 24900944
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24900722 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggt 24900820  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900821 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgttgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttca 24900918  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24900919 ttgttgggggcttgatgccctggagc 24900944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 24903199 - 24903421
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaa-gctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24903199 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaaagctgcatgagtcggt 24903297  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903298 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgttgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttca 24903395  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  24903396 ttgttgggggcttgatgccctggagc 24903421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 28577217 - 28576996
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577217 ttgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgt-tgcgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 28577119  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||  ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577118 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaagttgttgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 28577021  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  28577020 tgttgggggcttgatgccctggagc 28576996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 45029898 - 45030119
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029898 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgt-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 45029996  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029997 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 45030094  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  45030095 tgttgggggcttgatgccctggagc 45030119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22105531 - 22105319
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105531 ttgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 22105432  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  22105431 taagttgattaagatgatgaagtttcaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctt 22105335  T
Q  433 tgttgggggcttgatg 448  Q
    |||||||| |||||||    
T  22105334 tgttggggacttgatg 22105319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 21155104 - 21155325
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155104 ttgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21155202  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21155203 taagttgattaagatgaagaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagttcatgcattagcatttcat 21155300  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||| ||||    
T  21155301 tgttgggggcttgatgccctagagc 21155325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 32039542 - 32039763
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32039542 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttactgttgttatttaactaagctgcatgagccggtc 32039640  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039641 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 32039738  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  32039739 tgttgggggcttgatgccctggagc 32039763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23130980 - 23130788
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130980 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23130882  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130881 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtc-gattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 23130788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 23133447 - 23133255
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133447 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23133349  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133348 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtc-gattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 23133255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 34402566 - 34402758
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402566 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 34402664  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402665 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtc-gattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 34402758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 43137417 - 43137204
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43137417 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 43137319  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||| | || ||||| ||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |    
T  43137318 taagttgattaagatgattaagttccaaagtattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctt 43137221  T
Q  433 tgttgggggcttgatgc 449  Q
    |||||||||||||||||    
T  43137220 tgttgggggcttgatgc 43137204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 294 - 457
Target Start/End: Original strand, 24643054 - 24643216
Alignment:
Q  294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaatta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||    
T  24643054 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgacgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgattta 24643152  T
Q  394 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  24643153 agatgattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctagagc 24643216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 291 - 575
Target Start/End: Original strand, 22741021 - 22741301
Alignment:
Q  291 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---tcccaaattattggactaatataagagtttgtc 387  Q
    ||||| |||| ||||||||||||  || ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||   | ||||||||||||| ||| ||||||| |  |     
T  22741021 ctatgctgctattgttatttaacctagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattgga-taa-ataagagatgatg 22741118  T
Q  388 aaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||     
T  22741119 a--ttaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctc 22741215  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  22741216 aaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 22741301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 188 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 7679750 - 7679462
Alignment:
Q  188 atgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatac 287  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||    
T  7679750 atgttatataattatatatacattacatgaatt-atgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgattt-gcatac 7679654  T
Q  288 tgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagat----gatgatgtcccaaattattggactaatataagagt 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    |||||||| |||||||||||||   |||||||||     
T  7679653 tgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatggatgatgttccaaattattggatatatataagagg 7679554  T
Q  383 ttgtcaaat---taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||  || |   ||||| | |||||  || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  7679553 ttg--aagtttataagaag-ttaagttgttgtgtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 7679462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23791570 - 23791252
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  23791570 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagc 23791471  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | | ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  23791470 ctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttga 23791372  T
Q  259 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt 355  Q
    |||| ||||||||||  || |||||   |||||||||||||| || ||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||     | |||| |||    
T  23791371 tatttttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgttgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatga-----aagatgttgt 23791278  T
Q  356 cccaaattattggactaatataagag 381  Q
     ||||||||||||| | |||||||||    
T  23791277 tccaaattattggatttatataagag 23791252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 236 - 456
Target Start/End: Original strand, 298816 - 299034
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298816 agatgttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 298915  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||| |||||||||| ||  |||||| ||||| | ||| ||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  298916 agttgattaagatgatgaagtttcaaatttttgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaacatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttg 299012  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  299013 ttgggggcttgatgctctggag 299034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 278 - 402
Target Start/End: Complemental strand, 23285942 - 23285818
Alignment:
Q  278 ttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatata 377  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23285942 ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggactaatata 23285843  T
Q  378 agagtttgtcaaattaagatgttta 402  Q
    |||| ||||  ||||||||||||||    
T  23285842 agaggttgttgaattaagatgttta 23285818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 233 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 38967493 - 38967272
Alignment:
Q  233 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||| ||  | ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967493 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgt-tgtgtcgatgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38967395  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| | ||||| ||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  38967394 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaaatattgga-ttatataggagtttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttct 38967297  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  38967296 ttgttgggggcttgatgctctggag 38967272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 22133984 - 22134446
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| |      |||||||| | | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22133984 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatacttgtgttacagactgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 22134083  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  || || ||||||| ||||  || ||| |  | || |||||||     ||||   |    
T  22134084 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactga--tgcata-tgaattggtgttgtt-----tataatgt 22134175  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||| |||   ||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  22134176 tgtatatacattaaatg-gattatgtt-gataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgattt-gcatactgcctatgttgc 22134271  T
Q  300 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct---aagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaaga 396  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   | | |||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||    ||     ||||     
T  22134272 tgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatgatgttccaaattattggact--tataagatgaagttgttctaagt 22134369  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    || |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22134370 tg-ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 22134446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 32214965 - 32215164
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214965 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 32215063  T
Q  333 taagttgatgaa------gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||      ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215064 taagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 32215162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 176 - 386
Target Start/End: Original strand, 23708561 - 23708769
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || ||||| |||||||||||| | ||| || || |||||||||||||||||||     
T  23708561 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgt 23708659  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | |    
T  23708660 tg-ttttgcatactgcctatgttgctatctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattggattta 23708756  T
Q  374 tataagagtttgt 386  Q
    |||||||| ||||    
T  23708757 tataagaggttgt 23708769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 22758874 - 22759056
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaa 489  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||    
T  22758874 attaagatgtataagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctagagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaa 22758972  T
Q  490 attagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  22758973 attagcgatgggggcct-atgccctggaagtatataaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccttgaattggtaccacatgc 22759056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25109184 - 25108906
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||| |||||||| | | | |||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  25109184 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtaagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagc 25109085  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  |||| | |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||| ||||||| ||   |||||    
T  25109084 ctgaattatatgatttgatgttgttaataatatgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttga 25108986  T
Q  259 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||  ||  ||||   |||||||||||||| || |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25108985 tattgttatatcatgaact-attttatgtactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaag 25108906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 22799179 - 22799463
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg--tc-ccaaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||  ||||||||| ||  || |||||||||||||   | ||||||| |    
T  22799179 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgaataagatgatgttgaatctccaaattattggat--acataagagat 22799276  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctt 481  Q
      | |  ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||    
T  22799277 gatga--ttaagatgttttaagagaccgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagctt 22799372  T
Q  482 tagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  22799373 tagctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactc-aataacgataggggc-tcatgccttgtattggtaccacatgc 22799463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 270
Target Start/End: Original strand, 22459377 - 22459598
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22459377 acagaatgccttgttaggttaaatgtgacctttgtcctacgagttgatgtgagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattgt 22459476  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttga 247  Q
    ||||||||| ||||  | ||  |  | ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |  || |||||||||||| |||    
T  22459477 ttcagtaagactgatgtatacgagttgatgttatttataatgtgatataattgtatatacattacttgagttatatg-tgaatatttgagatgttgatga 22459575  T
Q  248 cttacatttgatattgttatatc 270  Q
    ||| |||||||| ||||||||||    
T  22459576 ctttcatttgatgttgttatatc 22459598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 236 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 25616304 - 25616107
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| || ||||| |  || |  ||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  25616304 agatgttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaa 25616205  T
Q  336 gttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    |||||| ||||||      ||||||| |||||||||||||||| | |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25616204 gttgattaagatgttaataatgatgttccaaattattggactatt-taagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 25616107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 23019861 - 23020043
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |  ||||||     
T  23019861 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggtgaattagctc 23019958  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  23019959 aaattagcgatgggggctt-atgccctggatgtatattaatactc-aataacgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 23020043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24673530 - 24673346
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  24673530 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctca 24673432  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| || ||||| | || | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  24673431 aaaataacgatgggagc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 24673346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 40622365 - 40622548
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    |||||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||||| |    
T  40622365 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgtgggctc-atgcccttgagctttgtactcaccatgatggagcattagctca 40622463  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  40622464 aaataacgatgtgggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 40622548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 45678283 - 45678466
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaag-aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  45678283 attaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 45678381  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || ||||| |||| | |||| ||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  45678382 aaataacgatgggggc-taatgcactgaaagtatattaatactaaaataaagatgggggc-tcatgccatgaattggtaccacatgc 45678466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 176 - 575
Target Start/End: Original strand, 22413078 - 22413483
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatat--tgttatatcatg 273  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||  ||||||||||||    
T  22413078 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atttatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatatattgttatatcatg 22413175  T
Q  274 --ctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggac 370  Q
      ||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||     | |||||||| |||||||||||||     
T  22413176 agctg-ttttatatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgatgttccaaattattggat 22413269  T
Q  371 taatataagagtttgtcaa---attaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactca 467  Q
    | |||||||||   |||||    |||||||| |||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||    
T  22413270 ttatataagag---gtcaatgttttaagatg-ttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-cgctca 22413363  T
Q  468 ccacgt----------------tggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttg 551  Q
    ||||||                ||||||||||||| || | |  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||    
T  22413364 ccacgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaa--gttgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttg 22413459  T
Q  552 atgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  22413460 atgccctggattggtaccacatgc 22413483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 24680147 - 24679963
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||      
T  24680147 attaagatgttttaagagattgagtcaatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 24680049  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  24680048 aaaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 24679963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 25963869 - 25964049
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |    
T  25963869 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctca 25963967  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25963968 aaataatgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgctgggggctt-atgccctgtattggtaccacatgc 25964049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 381
Target Start/End: Original strand, 20520145 - 20520335
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 283  Q
    |||||| ||||| |||||||| |||||| ||| || || | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||  || |||||      
T  20520145 taatgtgatatatttgtatatgcattacttgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaact-gttttat 20520241  T
Q  284 atactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
     |||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     | ||| |||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  20520242 gtactgcatatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aagataatgttccaaattattggatttatataagag 20520335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 299060 - 299133
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  299060 gggcttgatgctctgga-gtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgccccgtattggtaccacatgc 299133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 435 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 23657713 - 23657632
Alignment:
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||    
T  23657713 ttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgataccctgga 23657632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23130743 - 23130660
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23130743 tagcgattggggcttgatgctccggtagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 23130660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23133210 - 23133127
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  23133210 tagcgattggggcttgatgctccggtagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 23133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 32215253 - 32215336
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  32215253 tagcgattggggcttgatgctctgtaagtataataatactcaaatagcgatttggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 32215336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 34402803 - 34402886
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  34402803 tagcgattggggcttgatgctccggtagtataataatactcaaatagcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 34402886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 43137136 - 43137054
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  43137136 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 43137054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25616097 - 25616023
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  25616097 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatatcgattgggacttgatgccccgtattggtaccacatgc 25616023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23004636 - 23004560
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  23004636 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaaca-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccatatgc 23004560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23076317 - 23076272
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076317 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 23076272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 43947598 - 43947674
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43947598 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 43947674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 22812087 - 22812246
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  22812087 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaatattgttgggggctt-at 22812184  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||  |||||||||||||||   |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  22812185 gcccttaaagtatattaatact---ataatgctgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 22812246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 18787174 - 18787249
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18787174 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 18787249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 336
Target Start/End: Original strand, 32451949 - 32452031
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || ||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451949 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23287433 - 23287384
Alignment:
Q  285 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287433 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Original strand, 24697548 - 24697644
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 273  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||  | | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  24697548 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattg-tatatgaagtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatg 24697644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 561
Target Start/End: Original strand, 32215209 - 32215278
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgta 561  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  32215209 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgctctgta 32215278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 37524647 - 37524466
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||      
T  37524647 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 37524549  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  37524548 aaataattgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 37524466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 39828227 - 39828303
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39828227 tgagggcttgatgccctgagagtatatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 39828303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 503 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22105197 - 22105126
Alignment:
Q  503 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||    
T  22105197 gcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgatagggacttgatgctccgtattggtaccacatgc 22105126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 286 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 26392451 - 26392403
Alignment:
Q  286 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  26392451 actgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 26392403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 457
Target Start/End: Original strand, 23713058 - 23713104
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23713058 gagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagc 23713104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 38967255 - 38967173
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38967255 tagcgataggggtttgatgctctgga-gtataataatactcaaatagtgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 38967173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 20520425 - 20520500
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20520425 tgagggcttcatgccctggaagtatattaatacttaa--cacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 20520500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 227 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 23004878 - 23004727
Alignment:
Q  227 tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcat 323  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||  ||  ||||   |||| |||||||||||| |||||  |||||||||||||||    
T  23004878 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcctgaact-attttatgtactacctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcat 23004780  T
Q  324 gagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    |||||||| |||| |||     | |||||||| ||||||| ||||| | |||||||||    
T  23004779 gagtcggtttaagatga-----aagatgatgttccaaattgttggatttatataagag 23004727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23130778 - 23130724
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23130778 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 23130724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 23133245 - 23133191
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23133245 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 23133191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 23708387 - 23708441
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23708387 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgccttgcgagttacccagttacagaat 23708441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 34402768 - 34402822
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34402768 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 34402822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 40428402 - 40428283
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttga 508  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||| || ||| |||| |  | ||||||||| |    
T  40428402 gagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataattgttgagggctt-a 40428306  T
Q  509 tgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  40428305 tgccctgaaagtatattaatact 40428283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21115591 - 21115515
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21115591 tgagggcttgatgcactgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgc 21115515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 21318813 - 21318973
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttg 507  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || |||||| || |||  ||| || || || ||||||     
T  21318813 gagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccgcgatggagcatttgctcaaaaataacgttgggggctt- 21318909  T
Q  508 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||| ||||||||||||||| || |   | ||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21318910 aagccctgaaagtatattaatactaaact---gttgggggctt-atgccctgaattggtaccacatgc 21318973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23657663 - 23657618
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  23657663 ctcaaatagcgatgggggcttgataccctggattggtaccacatgc 23657618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 23712338 - 23712414
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23712338 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 23712414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 24688560 - 24688635
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || ||  ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  24688560 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgaaggcttaatgccctggattggtaccacatgc 24688635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26392271 - 26392195
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26392271 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaatta-cgttgagggtttgatgccctggattggtaccatatgc 26392195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 433 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21237684 - 21237546
Alignment:
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||| || || ||| || | ||   ||||||||||| |||||   ||||||||||| |||    
T  21237684 tgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaacacgttggggcctttgctcaattaagt--tgagggcttgacgccctcagagtatattaatgctc 21237588  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||  | || ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  21237587 aaataa-gttgagggcttgatgccctggaatggtaccacatgc 21237546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 23076793 - 23076726
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggtt 68  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||| | | ||||||||||    
T  23076793 gaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacccagaaacagagtgccttgttaggtt 23076726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 8004 - 8079
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||  || || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8004 tgagggcttgatgcccttgaagtatattaatact--tattacgttgagggcttaatgccctggattggtaccacatgc 8079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 32215174 - 32215228
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32215174 gggcttgatgctcttgaagaataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 32215228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 485 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 43137186 - 43137117
Alignment:
Q  485 cttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||| ||||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  43137186 cttaaataagcgatagggtcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 43137117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6725832 - 6725756
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||| ||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6725832 tgagggcttgatgtcctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 6725756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23791123 - 23791048
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  23791123 tgagggctttatgccctgcaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgc 23791048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 25108767 - 25108734
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25108767 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 25108734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 25175700 - 25175667
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175700 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 25175667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 1283748 - 1283666
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  1283748 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 1283666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23038095 - 23038048
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23038095 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtccgtcta 23038048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 30344776 - 30344858
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  30344776 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 30344858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34136788 - 34136714
Alignment:
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||| || ||||||||  | ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  34136788 agggattgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccatggattggtaccacatgc 34136714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 299017 - 299070
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||    
T  299017 gggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatggcgataggggcttgatgc 299070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 479
Target Start/End: Original strand, 21327744 - 21327812
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagc 479  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  21327744 gagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccgcgatggagc 21327812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 22412903 - 22412953
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttaca 51  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||    
T  22412903 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttaca 22412953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 24174739 - 24174678
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24174739 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 24174678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 24655516 - 24655577
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24655516 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 24655577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 28405824 - 28405794
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28405824 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 28405794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 38967289 - 38967236
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||    
T  38967289 gggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggtttgatgc 38967236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 298584 - 298629
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccag 46  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  298584 gaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccag 298629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9241994 - 9241945
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    ||||||||||||||||||| | || | ||||||||||| |||||||||||    
T  9241994 ctgcctatgttgctgttgtaaattgattaagctgcatgtgtcggtctaag 9241945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 415 - 476
Target Start/End: Original strand, 10822795 - 10822854
Alignment:
Q  415 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  10822795 catgcattagcatt-cattgtcgggggcttgatgccctagagcctt-tgctcaccacgttgg 10822854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17306388 - 17306355
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17306388 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 17306355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 18547216 - 18547292
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||||||||||| |  ||| | ||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18547216 tgagtgcttgatgccccgagagtgttttaatgctcaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 18547292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19671700 - 19671655
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  19671700 ctcaattagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 19671655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 23004682 - 23004653
Alignment:
Q  428 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23004682 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 23004653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 24529856 - 24529932
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||||||    
T  24529856 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttggtggcttgatgccatggattggtaccacatgc 24529932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 24655396 - 24655432
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24655396 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 24655432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24869939 - 24869903
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24869939 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 24869903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 25961592 - 25961628
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25961592 tatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 31756268 - 31756232
Alignment:
Q  2 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 38  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  31756268 aactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgag 31756232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Original strand, 40622263 - 40622327
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  40622263 ctgcctatgctgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 40622327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 255; Significance: 1e-141; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34473 - 33903
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||     |||||| ||||| || ||||||| ||||||||  |||| |  | |||||||||||    
T  34473 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgattttttgtgttacataattcctttttaggttgaatgcgatctttgttgttctagttgatgtga 34374  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  | || ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  34373 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaattttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 34274  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    ||||||| ||||| |||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||  ||| ||||||||||||||| |    
T  34273 gtatatatattacttga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-gttgtatactgcctatgttgtt 34179  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||     
T  34178 gtttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgc 34079  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgat 498  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  34078 ttaagaggtcgagtctatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctgcaactttgtactcaccacgttggagctttagctcaaaattagcgat 33980  T
Q  499 gagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33979 gggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggtttgatgccctgtattcgtaccatatgc 33903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 299 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 55
Alignment:
Q  299 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||    
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatg 231  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgat 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||| | |||||| |||    
T  230 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtacttaatgcgttggagctttagc-tcaattagagat 132  T
Q  499 gagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  131 gggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 55  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 13211 - 13144
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt 303  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13211 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 13144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13330 - 12994
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13330 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaa 13231  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13230 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 13132  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131 t-ggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 13034  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13033 tagcgatggggacttgatgccctgtattggtaccacatgc 12994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 138)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 27250731 - 27251069
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250731 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 27250830  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  27250831 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagattgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattga 27250929  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  27250930 taggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgtcctagaagtatattaatactcaaa 27251029  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251030 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 27251069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 34509899 - 34509562
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509899 agatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 34509800  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509799 gttgatgaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 34509701  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509700 tgggggcttgatgccctggagcattgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggtccttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 34509602  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34509601 tagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 34509562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22532388 - 22532051
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || | |||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  22532388 agatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaa 22532289  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532288 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 22532190  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22532189 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattaccgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 22532091  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  22532090 taccgatggggacttgatgctctgtattggtaccacatgc 22532051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Original strand, 50210212 - 50210557
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210212 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 50210311  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatg----tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50210312 taagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 50210410  T
Q  429 tcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccct-ggaagtatattaa 527  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||| | |||||||||||    
T  50210411 tcattgttgggggcttgatgccctggagcattgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggtttgatgccctcgaaagtatattaa 50210509  T
Q  528 tactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  50210510 tactcaaatagcgatgggggtttgatgccctggattggtaccacatgc 50210557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 253 - 540
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847459
Alignment:
Q  253 atttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatga 352  Q
    |||||||||  |||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  353 tgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccct 452  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20847273 tgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccct 20847371  T
Q  453 ggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcg 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20847372 ggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgattggggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaatagcg 20847459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 280 - 575
Target Start/End: Original strand, 38801433 - 38801728
Alignment:
Q  280 ttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataa 378  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38801433 ttgcacactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcg-tctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataa 38801531  T
Q  379 gagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggag 478  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801532 gaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcataagcatt-catagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggag 38801630  T
Q  479 ctttagcttaaa-ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | ||| || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38801631 cattaactcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 38801728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 22921636 - 22922104
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttagg-ttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  | || ||||||||||| | ||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  22921636 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgaactgcctagttacagaatgccttgtttgggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 22921735  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921736 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatgttatataa 22921835  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||| |||| ||| || ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  22921836 ttgtatatacattatatgaattt-tg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttg 22921932  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||||    | |||||    
T  22921933 ttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgatgatgatgatgttccaaattattgga--aatataagaggttgttgtttataaga 22922027  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     | ||| |  || | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22922028 ag-ttatgttgttgtgtccatgcattaaca-ttcattgttaggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 22922104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 33681361 - 33680892
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| | | ||| ||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  33681361 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaattacccagttacagagtgccttgcttatgttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtg 33681262  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  33681261 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 33681162  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  33681161 tgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgc 33681064  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||     |||| ||    
T  33681063 tgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggtggttgttctaag-tg 33680968  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  33680967 gttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 33680892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20135306 - 20134963
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||| |||| ||||| || | ||| |  ||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||    
T  20135306 agatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaa 20135207  T
Q  336 gttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||| ||||||      ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20135206 gttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggacta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatcagcattt 20135108  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaata 529  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  | | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20135107 catagttgggggcttgatgccctggagctttatactcaacacgttggagctttag-atcatttagcgatgggggcttgatgccctgtaagtatattaata 20135009  T
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20135008 ctcaaatagcgatggggacttgatgccctgtattggtaccacatgc 20134963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 22237982 - 22237512
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  22237982 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttttcgcacgagttgatgtg 22237883  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctg-ttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||  || ||||    ||| |  | ||||||||  ||| |||||||||    
T  22237882 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgatacatatgaattgatgttgtttctaaagttatataa 22237783  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||| |    
T  22237782 ttgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcataatgcctatgtcg 22237685  T
Q  299 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||     |||| |    
T  22237684 ctgtttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgtttcaaattattggacttgtataagaggttgttgttctaagtt 22237588  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    | |||||  || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  22237587 g-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcatcgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 22237512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 52927750 - 52928206
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  52927750 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgaattgaccagttacagaatgccttgttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtga 52927849  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||    
T  52927850 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataatt 52927949  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||            ||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |    
T  52927950 gtatatacattacatga-attatgtttgatatttgagatg------------attcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgtctatgttgtt 52928035  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||     |||| ||     
T  52928036 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt---tgaagatggtgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttg- 52928131  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||||  || | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||| || | |||||||||||||    
T  52928132 ttaagttgttgtgtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttggtgccctagagcctt-tgctcaccacgttgg 52928206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 341 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21477656 - 21477424
Alignment:
Q  341 tgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggg 440  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21477656 tgaaaatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggg 21477557  T
Q  441 gcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcg 540  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21477556 gcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagc-tcaattagcgataggggcttgatgccctgg-agtataataatactcaaatagcg 21477459  T
Q  541 atgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21477458 ataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 21477424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Original strand, 21861337 - 21861712
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||      |  ||||||| | ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||    
T  21861337 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgtgtccttgtgagacagaatgccttgttaggttaaatgtgacatttgtcgcacgagttgatgtga 21861436  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||    
T  21861437 gttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctgaatattatgatatgatgttgtttataatgtgatataatt 21861536  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||| |||  |||| | || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21861537 gtatatacattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgcatactgcctatgttgc 21861634  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    || |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||     | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  21861635 tgtttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aagaagatgttccaaattattggatttatataagag 21861712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 193 - 455
Target Start/End: Original strand, 45574846 - 45575108
Alignment:
Q  193 atataattgtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 291  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||  ||  |||||| ||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  45574846 atataattgtatatgcattacttgaattatatgtta-ataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcc 45574944  T
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  45574945 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaat 45575044  T
Q  392 taagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgga 455  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45575045 taagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccttgga 45575108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 234 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 31612430 - 31612209
Alignment:
Q  234 tgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 333  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612430 tgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 31612332  T
Q  334 aagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 433  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612331 aagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 31612233  T
Q  434 gttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31612232 gttgggggcttgatgccctggagc 31612209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 59 - 476
Target Start/End: Original strand, 21896084 - 21896491
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||    
T  21896084 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatct---tgttgttgtttcagtaagc 21896180  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttg 257  Q
    ||||||  ||| || | ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| | || ||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21896181 ctgaatattatgatttgatgttgtttataatgtgatataattgtatatacattacatga-attatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttg 21896279  T
Q  258 atattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtc 356  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||||||||||||   |||||||  || |||||     
T  21896280 atattgttatatcatgct-gttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaa---gatgaag--gaagatgtt 21896373  T
Q  357 ccaaattattggactaatataagag---tttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    ||||||||||||| | |||||||||    ||||     ||||||| || ||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21896374 ccaaattattggatttatataagaggccattgt--ttctaagatg-ttgagttgttgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 21896469  T
Q  454 gagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||| || | |||||||||||||    
T  21896470 gagcctt-tgctcaccacgttgg 21896491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 8e-75
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 22468698 - 22469039
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| | || |||||||| | ||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22468698 agatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaa 22468797  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatg------tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||| |||||| |||||      | ||||||| |||||||| |||| ||| ||||   ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  22468798 gttgattaagatgttgatgaagatgttccaaatttttggacta-tatacgaggttgtttgattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatat 22468896  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaata 529  Q
      ||||||||||| | |||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22468897 atttgttgggggc-tcatgccctggagcttagtacccaacacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaata 22468994  T
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  22468995 ctcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 22469039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20248629 - 20248184
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||| |||||||||     
T  20248629 gaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttatttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgta 20248530  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    | |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||||| ||||    ||| |||| | |||||||  ||||| |||||||    
T  20248529 aattgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttgtc-cagtaagactgatgcatatgaatcca-tgttgtttataatgatatataa 20248432  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| ||   ||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  20248431 ttgtatatacattacatgactt-atgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 20248337  T
Q  299 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
     |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||   ||      |||| |    
T  20248336 ttgtttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact--tataagatgatgatgttctaagtt 20248242  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | |||||| || | |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20248241 g-ttaagatgttgtgtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 20248184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 13988984 - 13988763
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988984 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13988886  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988885 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 13988788  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13988787 tgttgggggcttgatgccctggagc 13988763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 21923335 - 21923556
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923335 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21923433  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923434 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 21923531  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21923532 tgttgggggcttgatgccctggagc 21923556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 23593779 - 23594000
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593779 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 23593877  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593878 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 23593975  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23593976 tgttgggggcttgatgccctggagc 23594000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 428
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295745
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 14295601  T
Q  286 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagttt 384  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  14295602 actacctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggtc 14295701  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295702 gttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 14295745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 21475131 - 21475352
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21475131 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagttggtc 21475229  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475230 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 21475327  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  21475328 tgttgggggcttgatgccctggagc 21475352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 29298254 - 29298034
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298254 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29298157  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29298156 taagttgattaagatgatgaagtttcaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcat 29298059  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  29298058 tgttgggggcttgatgccctggagc 29298034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 21754388 - 21753933
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||       ||||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  21754388 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgttttacagactgccttgttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtga 21754289  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||            
T  21754288 gttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgtt-------- 21754197  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||| |    
T  21754196 gtatatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgtt 21754101  T
Q  301 gtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||   |||     |||| ||     
T  21754100 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgttgttccaaattattggact--tataagatgatgttgttctaagttg- 21754007  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  21754006 ttaagatgttgtgtccatgcattagca-tccattgttgggggcttgatgccctagagccttg--ctcaccacgttgg 21753933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 59 - 476
Target Start/End: Original strand, 16368112 - 16368520
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16368112 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagc 16368211  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||    |||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  16368212 ctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attataaacgatg-ttgagatgttgttgatttgca-ttga 16368308  T
Q  259 tattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtc 356  Q
    |||||||||||||||  | |||||  || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||||||     
T  16368309 tattgttatatcatgaattgttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----atgatgatgtt 16368403  T
Q  357 ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | |      |||||||  ||||  || ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16368404 ccaaattattggatttatataagaggtcgatgttctaagatg-ctaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggag 16368501  T
Q  457 ctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    | || | |||||||||||||    
T  16368502 cctt-tgctcaccacgttgg 16368520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21714610 - 21714327
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  21714610 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagat 21714513  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  21714512 gatga--ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagcttta 21714416  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  21714415 gctcaaat-agcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 21714327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 330 - 574
Target Start/End: Original strand, 22131180 - 22131418
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  22131180 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagatgatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatac 22131277  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaata 529  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22131278 atttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaata 22131375  T
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    ||| |||| || ||||||| | |||||||| |||| |||||||||    
T  22131376 ctc-aataacgttgggggc-tcatgccctgaattgataccacatg 22131418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 241 - 457
Target Start/End: Original strand, 22123119 - 22123333
Alignment:
Q  241 ttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 339  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||  | |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22123119 ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgt-tgtgttgctgtttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtag 22123217  T
Q  340 atgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 439  Q
    || |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22123218 attaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcgttgttggg 22123315  T
Q  440 ggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22123316 ggcttgatgccctggagc 22123333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 29776806 - 29776592
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776806 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29776708  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  29776707 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcag 29776609  T
Q  433 tgttgggggcttgatgc 449  Q
     | | ||||||||||||    
T  29776608 cgattggggcttgatgc 29776592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 330 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 48603288 - 48603048
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||      
T  48603288 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagatgatga--ttatgatgtttaagagattgagtccatgcattagcatac 48603191  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaata 529  Q
      ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  48603190 atttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatggaggctt-atgccctggaagtatattaata 48603093  T
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||  | |  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  48603092 ctcaataacctttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 48603048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 4 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 49261690 - 49261448
Alignment:
Q  4 ctcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagt 102  Q
    ||||||||||||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49261690 ctcgccatggcgaatagaggctctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagt 49261591  T
Q  103 tgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgt 202  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||| ||||||  || ||||||||| |||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  49261590 tgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaattgtatattctaatgttgatgataatgttatataattgt 49261491  T
Q  203 atatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 247  Q
    |||||||||| || |  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  49261490 atatacattatat-aaattatg-ttgatatttgagatgttgttga 49261448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 247
Target Start/End: Original strand, 35981455 - 35981700
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||| | ||||| |||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||    
T  35981455 gaactcgccatggtgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcacgaattgatgtg 35981554  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  35981555 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatattctaatgttgatgataatgttatataat 35981654  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttga 247  Q
    || |||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35981655 tgcatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttga 35981700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 381
Target Start/End: Original strand, 41049851 - 41050178
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | ||||||||||| ||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||  || |||| ||||||||||    
T  41049851 acagaataccttgttaggttatatgtgacctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcataggggtaaggaactaggtttcttatcttactgttgttgt 41049950  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 248  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | | ||||||  |||||| ||||| |||||||| |||||| |||  |||| | ||||| |||||||||||||||     
T  41049951 ttcagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacttga-attatatatgatg-ttgagatgttgttgat 41050048  T
Q  249 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaag 345  Q
    || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  |||||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  41050049 ttgcatttgatattgttatatcatgaact-attttatatactgcctatgttgctgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgaag 41050144  T
Q  346 atgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
      |||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  41050145 --gatgatgttccaaattattggatttatataagag 41050178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 193 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 21711867 - 21711608
Alignment:
Q  193 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 291  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||       
T  21711867 atataattgtataggcattacatga-tttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat- 21711770  T
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat 391  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |    
T  21711769 tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagagtttgtcgatt 21711671  T
Q  392 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  21711670 tagaatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgg 21711608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20637202 - 20636956
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||    
T  20637202 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaatcagttacagaatgtcttgtttaggttaaaagcgatctttgtcgcatgagttgatgtg 20637103  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||| |||  |||| ||||||  || |||||||||||||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||    
T  20637102 agttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaattgtattttttaatgttgatgataatgttatataat 20637003  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 248  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||| | |||| ||||||||||||    
T  20637002 tgtatatacattatatga-attatgtttg-tatttgggatgttgttgac 20636956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20918954 - 20918620
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |     |||| ||||| | || ||||||| ||||||||  ||||||  ||| |||||||||    
T  20918954 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttgtgtgttaaagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgacttgatgtga 20918855  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||  |||| ||||  |||| ||||||| || |    ||| |  | |||||| |  |||||||||||||||    
T  20918854 gttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactcatgcttatgaattgatgttgcttataatgttatataatt 20918755  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||     
T  20918754 gtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgttgca 20918660  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 339  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918659 gtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 193 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 21707325 - 21707071
Alignment:
Q  193 atataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcc 291  Q
    |||||||||||||  |||||||||| ||||| | ||| |  |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||  ||||| |||||       
T  21707325 atataattgtataggcattacatga-tttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactat- 21707228  T
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat 391  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||| | |    
T  21707227 tgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagagtttgtcgatt 21707129  T
Q  392 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 449  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||    
T  21707128 tagaatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgc 21707071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Original strand, 50613942 - 50614219
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  50613942 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagc 50614040  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    ||||||| ||| || | |||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||    |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50614041 ctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttga 50614139  T
Q  259 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||  || |||||   ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614140 tattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50614219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Original strand, 50621770 - 50622047
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||| ||||||   | |||||| |||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  50621770 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagc 50621868  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    ||||||| ||| || | |||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||    |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  50621869 ctgaattatatgatttgatgttgatattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttga 50621967  T
Q  259 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||  || |||||   ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50621968 tattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaag 50622047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 4 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 50686963 - 50686590
Alignment:
Q  4 ctcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagtt 103  Q
    |||||||| ||||||||||||  ||||||||||||   |   |  ||||||| | |||||||| |||||| ||   |||||||||||||||| |||||||    
T  50686963 ctcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagcccctgtgagacagaataccttgttaggataaatgtgacctttgtcgcacgagttgacgtgagtt 50686864  T
Q  104 gatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgta 203  Q
    |||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||  |||||| |||||| ||||    
T  50686863 gatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatccgatgttgttaataatgtgatataaatgta 50686764  T
Q  204 tatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg 301  Q
    ||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||  ||  ||||    |||||||||||||| |    
T  50686763 tatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcatgaact-attttatgaactgcctatgttgccg 50686666  T
Q  302 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
     |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||     | |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  50686665 tttgtttattaactaaactgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgttgttccaaattattggatttatataagag 50686590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 433128 - 432950
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| || || || ||||| ||||||||| |||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  433128 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgccgtt---atttaactaagctgcatgagtcggtc 433032  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtcc 415  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  433031 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtcc 432950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 244 - 428
Target Start/End: Original strand, 13212917 - 13213099
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13212917 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgcgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 13213015  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13213016 agatgatgatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 13213099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 21840885 - 21840686
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840885 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 21840787  T
Q  333 taagttgatgaagatgatg------atgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| |||||| ||      |||| ||||||||||||||| || ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840786 taagttgattaagatgttgataacaatgttccaaattattggact-atttaaaaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 21840688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 21347068 - 21346858
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21347068 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21346970  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  | | ||||||    
T  21346969 agatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaattcgagtccatgcattagcattttagcgataggggct 21346871  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||| ||||||    
T  21346870 tgatgctctggag 21346858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 21342203 - 21341994
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21342203 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtctttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21342105  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |  | | ||||||    
T  21342104 agatgatgaagt-ccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaattcgagtccatgcattagcattttagcgataggggct 21342007  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||| ||||||    
T  21342006 tgatgctctggag 21341994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 16362035 - 16361835
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362035 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgt-tgtgttgctgtcgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16361937  T
Q  333 taagttgatgaa------gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||      ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361936 taagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 16361838  T
Q  427 ttt 429  Q
    |||    
T  16361837 ttt 16361835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 236 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 21026799 - 21026649
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||  |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026799 agatgttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 21026700  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgt 386  Q
    |||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21026699 gttgttgacgatgatgatgttccaaattattggactaatatgagaggttgt 21026649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 397 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20916185 - 20916070
Alignment:
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcg 496  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20916185 tgtttaagaggttgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcg 20916087  T
Q  497 atgagggcttgatgccc 513  Q
    ||  |||||||||||||    
T  20916086 attggggcttgatgccc 20916070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 40389261 - 40389056
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||| |    
T  40389261 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactga-tgtgtcgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgatta 40389163  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    |||||| | |   ||||||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  40389162 agatgaagtt---ccaaattattggatta-tacaagagtttgtcaatttaagatgttaaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggct 40389067  T
Q  444 tgatgccctgg 454  Q
    |||||||||||    
T  40389066 tgatgccctgg 40389056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 244 - 445
Target Start/End: Original strand, 16275419 - 16275616
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |    
T  16275419 ttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tatgtcgttgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgatta 16275517  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || | ||||||||||| | ||| |||||  |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  16275518 agatgatgaagttctaaattattgga-ttatacaagag-ctgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggct 16275614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 42865266 - 42865551
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   |||||||||||   | ||||||| |    
T  42865266 ctgcatatgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattggat--acataagagat 42865363  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctt 481  Q
      | |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |    
T  42865364 gatga--ttaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcat 42865459  T
Q  482 tagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| ||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  42865460 tagctcaaactagcgatggaggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 42865551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 399 - 575
Target Start/End: Original strand, 21788208 - 21788381
Alignment:
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcga 497  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| || |||    
T  21788208 tttaagagatcgagtctatgcattagcata-catatgttgggggctc-ataccctggagcttagtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacga 21788305  T
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  21788306 tgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 21788381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 287 - 428
Target Start/End: Original strand, 20454606 - 20454752
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaa------gatgatgatgtcccaaattattggactaatataaga 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||    
T  20454606 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgttccaaattattggact-atttaaga 20454704  T
Q  381 gtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    | | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20454705 ggtcgttgaattaagatgtttaagatgtcgagtccatgcattaacatt 20454752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 333 - 453
Target Start/End: Original strand, 27161605 - 27161724
Alignment:
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||||  |||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27161605 taagttgatgttgatgatgaagttccaaattattggatta-tataagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggtctagtccatgcattagcatttcat 27161703  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  27161704 tgttgggggctggatgccctg 27161724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 176 - 476
Target Start/End: Original strand, 35261023 - 35261313
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| || ||||||||||| |||||| ||| || |||| ||| |||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||||    
T  35261023 atgttgttaataatgtgatgtaattgtatatgcattacttgaatt-atgtatgaatgtttgagatgttgat---ttgcatttgatattgttatatcatgc 35261118  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||  || |||| ||||||||||||| | |    
T  35261119 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgaaga--attatgttccaaattattggattta 35261212  T
Q  374 tataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    |||||||| | ||    | ||||||| |||||  || ||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  35261213 tataagaggtcgttgtttctaagatg-ttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttggaggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacg 35261309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 21161932 - 21161592
Alignment:
Q  135 cttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgttt 234  Q
    |||||||||| |||| |||| ||||| | |||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||||| |||| |     
T  21161932 cttgctgttgatgttccagtgagcctaatttgtttaatccaatgatgtcgttgatgttatataagtgtataaacattgtatga-tttatgtt-gatgata 21161835  T
Q  235 gagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtct 333  Q
      || |||| ||| || |||| ||||||||||||||| | || ||| ||||||||  | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| ||     
T  21161834 t-gaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcacgatgattt-gcatactgttt-tgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatcc 21161738  T
Q  334 aagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 433  Q
    ||||||||||   ||||||||| |||||||||||||||| | || ||  ||||    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    ||    
T  21161737 aagttgatga---tgatgatgttccaaattattggactatt-tacgaagttgt----ttaagatgtttaagatgtcaagtccatgcattagcatacattt 21161646  T
Q  434 gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg-ttggagctttagct 486  Q
    |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21161645 gttgggggcttactgctccggagctttgtactcaccacgattggagctttagct 21161592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 12271852 - 12271744
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  12271852 acagaatgccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgt 12271753  T
Q  149 ttcagtaag 157  Q
    |||||||||    
T  12271752 ttcagtaag 12271744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6151811 - 6151628
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  6151811 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 6151713  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  6151712 aaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccttgaattggtaccacatgc 6151628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 177 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 16758828 - 16758640
Alignment:
Q  177 tgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--c 274  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | |||   ||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||  |    
T  16758828 tgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatatgaatgttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaac 16758730  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     | |||||||| |||||||||||||    
T  16758729 tggttt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga-----aagatgatgttccaaattattgga 16758640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 22831539 - 22831719
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaag-aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22831539 attaagatgttttaggagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctca 22831637  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| ||||   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  22831638 aaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaat---gttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 22831719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 13213144 - 13213227
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13213144 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 13213227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16361791 - 16361708
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16361791 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 16361708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29776523 - 29776440
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29776523 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 29776440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 395 - 575
Target Start/End: Original strand, 20091636 - 20091810
Alignment:
Q  395 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattag 494  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||     
T  20091636 gatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaaataa 20091734  T
Q  495 cgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     | || |||| | ||||| || ||||||||||||||| ||||   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  20091735 tgttgggggc-tcatgccttgaaagtatattaatactaaaat---gttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 20091810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 244 - 369
Target Start/End: Original strand, 15860064 - 15860187
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  15860064 ttgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtccaagttgatta 15860162  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    ||||||||| || |||||||||||||    
T  15860163 agatgatgaagt-ccaaattattgga 15860187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 14295834 - 14295917
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  14295834 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 14295917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21840510 - 21840428
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21840510 tagcgataggggtttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 21840428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 390 - 536
Target Start/End: Original strand, 18182274 - 18182418
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaa 489  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||| ||    
T  18182274 attaagatgtttaagagatcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcatgccctggagctttgtactcaccacgaaggagcatttgctcaa 18182372  T
Q  490 attagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaat 536  Q
    | ||  | || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18182373 aataatgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatactaaaat 18182418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 186 - 306
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130978
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 285  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| ||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttggat 22130957  T
Q  286 actgcctatgttgctgttgtt 306  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22130958 actgcctatgttgctgttgtt 22130978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 20454840 - 20454922
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  20454840 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgctccatattggtaccacatgc 20454922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 22449441 - 22449600
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| ||  | |  |||||| ||    
T  22449441 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttaggggctt-at 22449538  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||   | ||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  22449539 gccctgaaagtatattaatactaaaat---gttgggggc-tcattccctgtattggtaccacatgc 22449600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 498 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 50686499 - 50686425
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  50686499 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaaca-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacat 50686425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 175 - 336
Target Start/End: Original strand, 16093825 - 16093987
Alignment:
Q  175 aatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcat- 272  Q
    ||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||  | ||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||||     
T  16093825 aatgttgattttaatgtgatatatttgtatatacattacatga-attacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgca-ttgatattgttatatcatg 16093922  T
Q  273 -gctggttttgcatactgcctatgttgct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
     ||| |||||  |||||||||||||||||  |||||  ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  16093923 agct-gttttctatactgcctatgttgctatttgtttattaactatgttgcatgagtcggtctaag 16093987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 518 - 575
Target Start/End: Original strand, 16275712 - 16275769
Alignment:
Q  518 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16275712 agtatattaatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 16275769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 50622216 - 50622291
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50622216 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 50622291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21341977 - 21341894
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaata-ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21341977 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatatctcaaatagcgttgggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 21341894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21346841 - 21346758
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaata-ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  21346841 tagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattaatatctcaaatagcgttgggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 21346758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 503 - 575
Target Start/End: Original strand, 45575182 - 45575254
Alignment:
Q  503 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||||    
T  45575182 gcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattgaaacttgatgccccgtattggtaccacatgc 45575254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 15860314 - 15860396
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15860314 tagcgataggggctttatgctctgga-gtatattgatactcaaatagcgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 15860396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 498 - 573
Target Start/End: Original strand, 21534140 - 21534214
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21534140 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-tgttgagggcttgatgccctggattggtaccacat 21534214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 33680853 - 33680781
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33680853 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 33680781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 411 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 431701 - 431655
Alignment:
Q  411 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  431701 agtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagc 431655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 26064788 - 26064713
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26064788 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaa--cacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 26064713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 45575092 - 45575146
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45575092 gggcttgatgccttggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 45575146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 3473076 - 3473257
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||      
T  3473076 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-ataccctggagctttgtcctcaccacgatggagcttttgctca 3473174  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  3473175 aaataattgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 3473257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 41050307 - 41050382
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  41050307 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgc 41050382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 50614388 - 50614463
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  50614388 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgc 50614463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 186 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 26065107 - 26064824
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc-tggttttgca 284  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||| ||| || || | |||| |||||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||  |  ||||       
T  26065107 taatgtgatatatttgtatatgtattacttgaatt-atatatgatctttgagatgttgttgatttgcattgg-tattgttatatcatgaattattttatg 26065010  T
Q  285 tactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||| ||||||   |||||||   |||||||| ||||||||||||| | |||||||||      
T  26065009 tactgcctatgttgctgtttgtttatcaactaagctgcatgagttggtcta---tgatgaaa--gatgatgttccaaattattggatttatataagag-- 26064917  T
Q  384 tgtcaaatt----aagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||  |    |||||||| |||  || ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  26064916 -gtcaatgtttctaagatgtt-aagttgttgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 26064824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 28194217 - 28194333
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||  |||||||| |||||||  |||||||||| | || | ||    
T  28194217 gaactcgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacaaaatgtcttgtttaggttacatgcgatctttgtcgcacgtgatgttatg 28194316  T
Q  100 agttgatcttagaggta 116  Q
    |||||| ||| ||||||    
T  28194317 agttgacctttgaggta 28194333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Original strand, 8761803 - 8761924
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttg 507  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |  | || ||||||     
T  8761803 gagtccatgcattagcataacatatgttgggggctc-atgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggctt- 8761900  T
Q  508 atgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  8761901 atgccctgaaagtatattaatact 8761924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20248128 - 20248056
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20248128 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 20248056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21840641 - 21840578
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21840641 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgc 21840578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 22922143 - 22922215
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22922143 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 22922215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 45575127 - 45575190
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  45575127 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattggagcttgatgc 45575190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 13213109 - 13213163
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13213109 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 13213163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 14295755 - 14295809
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14295755 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 14295809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 20454762 - 20454816
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20454762 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 20454816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 21043555 - 21043628
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21043555 gggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 21043628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21840676 - 21840622
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21840676 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 21840622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 26065292 - 26065238
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26065292 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacagaat 26065238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 29776558 - 29776504
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29776558 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 29776504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 505 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 47190481 - 47190412
Alignment:
Q  505 ttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47190481 ttgatgccctgggagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 47190412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16758500 - 16758428
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |     || || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16758500 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactta-----cgttgagggtttgatgccctggattggtaccacatgc 16758428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 16361836 - 16361772
Alignment:
Q  491 ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||  || |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16361836 ttagcgattgggacttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 16361772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21342021 - 21341958
Alignment:
Q  491 ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21342021 ttagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattgatactcaaatagcgataggggcttgatgc 21341958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 491 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21346885 - 21346822
Alignment:
Q  491 ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21346885 ttagcgataggggcttgatgctctgga-gtatattgatactcaaatagcgataggggcttgatgc 21346822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 280
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130639
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttt 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatga-cttaagtctgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 51130639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 14295790 - 14295853
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14295790 tagcgattggggcttgatgctccgggagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 14295853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21753894 - 21753822
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  21753894 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgaggggttgatgccctggattggtaccacatgc 21753822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 486
Target Start/End: Original strand, 17678739 - 17678835
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct 486  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  17678739 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagct 17678835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 29776602 - 29776548
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  29776602 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcaattggggcttgatgc 29776548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 51
Target Start/End: Original strand, 35260852 - 35260898
Alignment:
Q  5 tcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttaca 51  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35260852 tcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtttcccagttaca 35260898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 505 - 575
Target Start/End: Original strand, 52954595 - 52954664
Alignment:
Q  505 ttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52954595 ttgaggccctgggagtatattaatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 52954664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 431638 - 431578
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||    
T  431638 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctg 431578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16381537 - 16381388
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||  |  ||| ||||| | | |||||||| |    ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  16381537 gaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgcgagtccctgagtgacagactgccttgttagggttttagcgattcttggcgtacgagttgatgtga 16381438  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgttt 150  Q
    ||||||| |   |||||| ||||||||||||| | || || |||||||||    
T  16381437 gttgatcatgagggtaagaaactaagttgtttatatttctattgttgttt 16381388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 22237473 - 22237403
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22237473 gggcttgatgccctggaagtatattaatact-tacta-cgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacat 22237403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Complemental strand, 433359 - 433312
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagtt 48  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  433359 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagtt 433312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 1924914 - 1924996
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  1924914 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 1924996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 15860271 - 15860333
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  15860271 tagcgatatgggcttgatgctctgga-gtatattgatactcaaatagcgataggggctttatgc 15860333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 20454797 - 20454859
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  20454797 tagcgattggggcttgatgctccgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 20454859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 536 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20916091 - 20916052
Alignment:
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20916091 tagcgattggggcttgatgccccgtattggtaccacatgc 20916052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 20923928 - 20924010
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  20923928 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 20924010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 336
Target Start/End: Original strand, 21533923 - 21533974
Alignment:
Q  285 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533923 tactgcgtatgttgttgttgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaag 21533974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 21840597 - 21840535
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21840597 tagcgataggggcttgatgctctggat-tataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 21840535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 48520185 - 48520146
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaata 537  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  48520185 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata 48520146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 16759003 - 16758949
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||    
T  16759003 gaactcgccatagcaagtagaggccctcacctcgcgagttgcctagttacagaat 16758949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 354
Target Start/End: Original strand, 24783150 - 24783212
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||| ||||||||||||    
T  24783150 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatgatg 24783212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 431553 - 431520
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  431553 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 431520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12271676 - 12271639
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 270  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12271676 ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatc 12271639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 400 - 449
Target Start/End: Original strand, 15860198 - 15860247
Alignment:
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 449  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  15860198 ttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 15860247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 16059466 - 16059499
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16059466 tgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgc 16059499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 22123393 - 22123468
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22123393 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttg-tgccctggattggtaccacatgc 22123468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23967563 - 23967530
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23967563 tgggagcttgatgccctgtattggtaccacatgc 23967530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 27161831 - 27161864
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27161831 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 27161864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #136
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29297931 - 29297898
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29297931 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 29297898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 503 - 555
Target Start/End: Original strand, 16275655 - 16275706
Alignment:
Q  503 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  16275655 gcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggcgcttgatgc 16275706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #138
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 20958176 - 20958124
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 339  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20958176 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactggatgagtcggtctaagttg 20958124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 285 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32137 - 31848
Alignment:
Q  285 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagttt 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32137 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggtt 32038  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttag 484  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32037 gtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattag 31939  T
Q  485 cttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31938 ctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggtttgatgccctgtattggtaccacatgc 31848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 236 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 4968 - 4633
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4968 agatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaa 4869  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4868 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaatttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 4770  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4769 tgggggcttgatgccctggagttttgtactcaccacgttggagctttag-gtcaattagcgatgggggcttgatgccttggaagtatattaatactcaaa 4671  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4670 tagtgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 4633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 6)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 28533 - 28194
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28533 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 28434  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28433 gttgatgaagatgatgatgttccaaactattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 28334  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  28333 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccatgttggaggtttagctcaaattaacaatgggggcttaaagccctgaaagtatattaatactcaaa 28234  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  28233 tagcgatgggggcttgatgccatgtattagtaccacatgc 28194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 120 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2228 - 1777
Alignment:
Q  120 aactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagt 219  Q
    |||||||||||||  |||||||||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2228 aactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagtctgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataattgtatatacattacatga-c 2130  T
Q  220 ttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagc 318  Q
    ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  2129 ttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgtttgtgtttgttatttaactaagc 2034  T
Q  319 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg-tttaagaggtcgagtccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||| || |||||||||||||||| ||    
T  2033 tgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgttgaatcaagttgttttaagaggtcgagtctat 1934  T
Q  418 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  1933 gcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgattggggcttgatgccctaga 1835  T
Q  518 agtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  1834 agtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgccccatattggtaccacatgc 1777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 302 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4332
Alignment:
Q  302 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgttt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 4506  T
Q  402 a-agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatga 500  Q
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||      
T  4505 ttagaggtcgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcacctcgttggagcattagctcaaattagcgattg 4407  T
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4406 gggcttgatgcctttgaagtataataatactcaaatatcgattggggcttgatgccccttattggtaccacatgc 4332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 62 - 395
Target Start/End: Complemental strand, 11581 - 11252
Alignment:
Q  62 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 161  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||  ||||  |||||| |||    
T  11581 ttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgttaatgttcaagtaagactg 11482  T
Q  162 aattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatat 261  Q
    |    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||    
T  11481 atgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatagtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatat 11386  T
Q  262 tgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaa 360  Q
    | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  11385 tattatatcatgatgg-tttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaa 11287  T
Q  361 attattggactaatataagagtttgtcaaattaag 395  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  11286 attattggattaatataagaggttgtcgaattaag 11252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 26336 - 26412
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  26336 tgagggcttgatgccctgggagtatattaattctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggaaccacatgc 26412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #6
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 17187 - 17263
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17187 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-cgttgggggattgatgccctggattggaaccacatgc 17263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 8535 - 8868
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8535 agatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgctgtt---atttaactaagctgcatgagtcggtctaa 8630  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8631 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 8729  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8730 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagtgatgggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaa 8828  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8829 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 8868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 10880 - 10426
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| || ||| | |||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  10880 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttacctagttccaaaatgccttgttaggttaaatgcgatctctgtcgcacgagttgatgtga 10781  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10780 gttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgtcatataatt 10681  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| |    
T  10680 gtatatacattacatga-attatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgtt 10583  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatg 398  Q
    | |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||   ||||||||| ||||    | ||||| |    
T  10582 gtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat-atgttccaaattattggatatatataagaggttgttgtttataaga-g 10487  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 460  Q
     |||||  || | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10486 gttaagttgttgtgtccatggattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 10426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2071 - 1730
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2071 agatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 1972  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    | || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1971 gatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 1873  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct---taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1872 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaaaattagcgatgggggcttgatgccctagaagtatattaatactc 1773  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1772 aaataacgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 1730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 264 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4493
Alignment:
Q  264 ttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtc-ccaaat 362  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtttccaaat 4704  T
Q  363 tattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgt 462  Q
    ||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4703 tattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt-cattgttaggggcttgatgccctggagctttgt 4606  T
Q  463 actcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtat 562  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4605 actcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaataccgatgggggcttgatgccctgtat 4506  T
Q  563 tggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||    
T  4505 tggtaccacatgc 4493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 233; Significance: 1e-128; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Original strand, 17214 - 17560
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt--gcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 330  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17214 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 17313  T
Q  331 tctaagttgatgaagatgatgatg----tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| || ||| |||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17314 tctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggatta-tatgagaggttgtcgaattaagatgtttacgaggttgagtccatgcattagca 17412  T
Q  427 tttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatatta 526  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17413 tttcattgttgggggcttgatgccctggaggtttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatatta 17511  T
Q  527 atactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17512 atactcaaatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 17560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 14139 - 14424
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcc--caaattattggactaatataagagttt 384  Q
    |||| |||| |||| |||||||||||||| | ||||||||||  | |||| |||| ||||||||| ||  |  ||||||||||||   ||||||||| |     
T  14139 ctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtctatataagatgattaagatgatgttgaactccaaattattggatatatataagagatg 14238  T
Q  385 gtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
     | |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||    
T  14239 atga--ttaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctt-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcatt 14334  T
Q  483 agcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  14335 agctcaaataa-cgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgtattggtaccatatgc 14424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Original strand, 79328 - 79430
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||| ||||  |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79328 ttgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcg-tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 79426  T
Q  333 taag 336  Q
    ||||    
T  79427 taag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Original strand, 79107 - 79151
Alignment:
Q  10 atggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||    
T  79107 atggcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgcccaattacagaa 79151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 255 - 575
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11784
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatg 11563  T
Q  355 tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11564 ttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagtcgttttaagaggtcgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctg 11662  T
Q  454 gagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgat 553  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11663 gagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgat 11762  T
Q  554 gccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  11763 gccctgtattggtaccacatgc 11784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 17)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 283 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 119948 - 119656
Alignment:
Q  283 catactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  119948 catactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagag 119849  T
Q  382 tttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctt 481  Q
     ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  119848 gttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt-cattgttgagggcttgatgccctggagctctgtactcaccacgttggagcat 119750  T
Q  482 tagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  119749 tagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 119656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Original strand, 39941 - 40391
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||| |||||||| |||||||||  |||||||||||| || | ||||||| ||| | || || ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||    
T  39941 gaacttgccatggcaagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttatttaggttaaatgcgatctttgttgcacgagttgatgtg 40040  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||    
T  40041 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttgttaatggtatataa 40140  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||    
T  40141 ttgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcctactgcctatgttg 40237  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    | |||||    
T  40238 ctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact--tataagaggttgttggttataaga 40332  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
     | |||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  40333 ag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttggggacttgatgccgtggagc 40391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 66 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 100662 - 100278
Alignment:
Q  66 gttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 165  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  100662 gttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaatt 100563  T
Q  166 -gtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgt 264  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| || || |||||||||||||||| || |||| |||||| |    
T  100562 aatatgatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattat 100465  T
Q  265 tatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaatt 363  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||    
T  100464 tatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaatt 100369  T
Q  364 attggactaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||   ||||||||| ||||    | ||||| | |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  100368 attgga--tatataagaggttgttttttataagaag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggagcttgatgccctggagc 100278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 94529 - 94308
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94529 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 94431  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94430 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 94333  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  94332 tgttgggggcttgatgccctggagc 94308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 44573 - 44351
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggtttt-gcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| | ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44573 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 44475  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || | ||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  44474 ctaagttgattaagatgatgaagttcaaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcttttaa 44377  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44376 ttgttggggacttgatgccctggagc 44351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Original strand, 17484 - 17598
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17484 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 17582  T
Q  333 taagttgatgaagatg 348  Q
    ||||||||| ||||||    
T  17583 taagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 279 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 101576 - 101404
Alignment:
Q  279 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatata 377  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| | |||||||||||||  ||||    
T  101576 tttgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat---gatgatgatgttctaaattattggact--tata 101482  T
Q  378 agagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||   |||    ||||| || |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  101481 agatgatgttgttttaagttg-ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 101404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 291 - 575
Target Start/End: Original strand, 38536 - 38816
Alignment:
Q  291 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtttgtc 387  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| |  |||||||| |  |     
T  38536 ctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatt--tataagagatgatg 38633  T
Q  388 aaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagc 485  Q
    |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| | |||| |||||    
T  38634 a--ttaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgattgagcattagc 38729  T
Q  486 ttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  38730 tcaaattagcaatgggggctt-atgccctagaagtatattaatactc-aataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 38816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 62 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 101685 - 101599
Alignment:
Q  62 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtt 149  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  101685 ttaggttaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttg-ttctcttgttgttgttgtt 101599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 17935 - 18018
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  17935 tagcgattggggcttgatgctctagaagtataataatactcaaatagcgattgggacttgaggccccgtattggtaccacatgc 18018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 17891 - 17954
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17891 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 17954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 17847 - 17910
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17847 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 17910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 17812 - 17866
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17812 gggcttaatgctctggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 17866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 389 - 428
Target Start/End: Original strand, 17763 - 17802
Alignment:
Q  389 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17763 aattaagatgtttaagaggtcgagtccgtgcattagcatt 17802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #15
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44291 - 44215
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| ||||||||||||| ||  |||| | ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  44291 tgaggccttgatgccctgggagcctatttacactcaaata-cgttgggggcttgatgccctagattggtaccacatgc 44215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 100197 - 100125
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || |||| ||||||| || |||||||||||||||    
T  100197 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcctgatgccttggattggtaccacatgc 100125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 40407 - 40440
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40407 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 40440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 277 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 13575 - 13276
Alignment:
Q  277 gttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatat 376  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13575 gttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatgttccaaattattggactaatat 13476  T
Q  377 aagagtttgtcaaattaagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttg 475  Q
    ||||| ||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13475 aagaggttgtcgaattaagtcgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttg 13377  T
Q  476 gagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13376 gagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccatatg 13277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1970 - 1633
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1970 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1871  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1870 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgt 1772  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | | || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1771 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcattcagtgatgggggcttgataccctggaagtatattaatactcaaa 1673  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1672 tagtgatgggggcttgatgccctgtaatggtaccacatgc 1633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 2202 - 2159
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccc 44  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  2202 gaactcgccatggcgagtagaggctatcgcctcacgagtgaccc 2159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 226; Significance: 1e-124; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 475
Target Start/End: Complemental strand, 13292 - 12825
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||    
T  13292 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgttaggttaaatgtgatctttgtcacacgagttgatgtga 13193  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||| | ||| | || ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13192 gttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggataatctaatgttgttgctaatgttatataatt 13093  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |    
T  13092 gtatatacattacacga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgct-gatttgcatactgcctatgttgtt 12995  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||     |||| ||     
T  12994 gtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagt---tgaagatgatgatgttcaaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttg- 12899  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttg 475  Q
    |||||  || |  |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||    
T  12898 ttaagttgttgtttccatgcattagca-ttcattgttgggggcttcatgccctggagcctt-tgctcaccacgttg 12825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 273
Target Start/End: Original strand, 18053 - 18276
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||| || |||  ||||||||||    
T  18053 acagaataccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgt 18152  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 248  Q
    ||||||||||||||||| |||  | | |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||     
T  18153 ttcagtaagcctgaattatatgttttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgat 18251  T
Q  249 ttacatttgatattgttatatcatg 273  Q
    || ||||||||||||| ||||||||    
T  18252 ttgcatttgatattgtcatatcatg 18276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12785 - 12713
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12785 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 12713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3589 - 3252
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3589 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaa 3490  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3489 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgaattaagatgtctaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatttt 3391  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3390 tgggggctagatgccctagagatttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggacgtatattaatactcaaa 3292  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3291 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 3252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 236 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 461 - 143
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||  |||||||  ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  461 agatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgcta-ttttgtatactgcctatgttattgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 363  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    || ||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  362 gtcgataaagatgatgatgttccaaattattagacta-tataagaggt-gtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttctttgt 265  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  264 tgggggcttgatgccctggagctttgcactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgcgctggaattatattaatactcaaa 166  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccct 558  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  165 tagtgatgggggcttgatgccct 143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 519 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10345 - 10289
Alignment:
Q  519 gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10345 gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 10289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4598 - 4522
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4598 tgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 4522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 2)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 236 - 558
Target Start/End: Complemental strand, 21030 - 20707
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  21030 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtcta 20931  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  20930 agtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattaggatttcattg 20831  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20830 ttgggggattgatgccttggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 20731  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccct 558  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  20730 atagcgatgggggcttgatgccct 20707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 503 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10169 - 10097
Alignment:
Q  503 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10169 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctatattggtaccacatgc 10097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 7)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 40031 - 39695
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40031 agatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagttggtctaa 39933  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39932 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgggtccatgcattagcatttcattgt 39834  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39833 tggggacttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggagcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 39735  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  39734 tagcgatgggggcttgatgccctctattggtactacatgc 39695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Original strand, 19652 - 20027
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||||||||| ||   |||||||||| |||||| |||    
T  19652 gaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgtgagttgcccagttacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgggttgatatga 19751  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||| | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||| |||||| ||| || | ||||| ||  |||||| |||||| |    
T  19752 gttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaattatatgatttgatgttattaataatgtgatataaat 19851  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||| ||||||||||| |||| | |||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||  |||||||||||||||    
T  19852 gtatatgcattacatgag-ttatttatgatg-ctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgcctatgttg 19948  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||     | |||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  19949 ctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgatgttccaaattattggatttatataagag 20027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 18869 - 19051
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  18869 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 18967  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || ||||| || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  18968 aaataacgatggggtctt-atgccctgaaagtatattaatactaaaata-tgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 19051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 428 - 475
Target Start/End: Original strand, 20073 - 20119
Alignment:
Q  428 ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttg 475  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  20073 ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tactcaccatgttg 20119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 48939 - 49021
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  48939 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 49021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 40264 - 40198
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggt 67  Q
    |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||  ||||| | | |||||||||    
T  40264 gaactcgccacggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtgacccagaaacagagtaccttgttaggt 40198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #7
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 328
Target Start/End: Original strand, 18708 - 18749
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  18708 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 10427 - 10765
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||||||| ||  | |||||||| |||| ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  10427 agatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttaattaactatgctgcatgagtcggtcta 10523  T
Q  335 agttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 433  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10524 agttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagtcgttttaagaggtcgagtccatgcattagcatt-catt 10622  T
Q  434 gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaa-ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623 gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactc 10722  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10723 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 10765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 221; Significance: 1e-121; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 255 - 573
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15803
Alignment:
Q  255 ttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg 354  Q
    |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T
Q  355 tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 453  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| || ||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15584 ttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatcaagttgttttaagaggtctagtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 15682  T
Q  454 gagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttga 552  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15683 gagctttgtactcaccacgttggagcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttga 15782  T
Q  553 tgccctgtattggtaccacat 573  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15783 tgccctgtattggtaccacat 15803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7359 - 7075
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   |||||||||||   |||| |||       
T  7359 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatga 7260  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    ||    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    |||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7259 tg----attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttttggg-ttcatgccctggagctttgtactcaccacgatggagcttt 7165  T
Q  483 agcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||| || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | || ||||| |||||| ||||||||    
T  7164 agctcaaa-taacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcataccctgaattggtgccacatgc 7075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 229 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8605 - 8261
Alignment:
Q  229 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8605 atgtttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtc 8506  T
Q  329 ggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  8505 ggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtc-gattaagatttttaagaggtcgagtccatgcattagca-t 8409  T
Q  429 tcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaa-attagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaa 527  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8408 tcatagttgggggcttgatgccctggatctttgtactcaccacattggagcattagctcaacattagcgatggggacttgatgccctggaagtatattaa 8309  T
Q  528 tactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8308 tactaaaatagcgatgggggcttgatgccctatattggtaccacatgc 8261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 232 - 573
Target Start/End: Original strand, 3149 - 3484
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3149 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 3247  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3248 ctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 3346  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3347 ttgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaa-act 3444  T
Q  532 caaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
        |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3445 --tgtagcgatgagggcttgatgccctggattggtaccacat 3484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 369
Target Start/End: Original strand, 5890 - 6258
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||     
T  5890 gaactcgccttagcgagtagaggccctcgcctcgcgaattacccagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgtt 5989  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5990 agttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgctaatgttatataat 6089  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| |    
T  6090 tgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttac 6187  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6188 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgga 6258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 19618 - 19166
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  19618 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgaatgacccagttacagaatgtcttgcttatgttaaatgcgatccttgtcgcacaagttgatgtg 19519  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  19518 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 19419  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  19418 ttgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttg 19322  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    | |||||    
T  19321 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgtttataaga 19225  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
     | |||||  ||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19224 ag-ttaagttgttatgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccttggagc 19166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 452 - 575
Target Start/End: Original strand, 48662 - 48783
Alignment:
Q  452 tggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttg 551  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |     
T  48662 tggagctttgtactcaccacaatggagctttagctcaaaataaagatgggggctc-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgttgggggc-tc 48759  T
Q  552 atgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  48760 atgccctgaattggtaccacatgc 48783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 19108 - 19036
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || | ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19108 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagagcttgatgctctggattggtaccacatgc 19036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 290 - 575
Target Start/End: Original strand, 5183 - 5469
Alignment:
Q  290 cctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtca 388  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  5183 cctatgttgatgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgacgttccaaattattggactaatataagaggttgtcg 5282  T
Q  389 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  5283 aattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattaaca-ttcatagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattagctca 5381  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5382 aaattagcgatgggggcttgataccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 5469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6965 - 6510
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  6965 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttatagaatgcattgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 6866  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||| ||| ||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6865 agttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataat 6766  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||| || | |||| |||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||     
T  6765 tgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcat-catgatttgcatactgcctatgttgt 6668  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagat 397  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   || |||||| ||||    | |||||     
T  6667 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaa 6568  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | |||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6567 g-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 6510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14345 - 13890
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  14345 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcaagctaaccagttatagaatgcattgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 14246  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||| ||| ||| | || | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14245 agttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaattatatgatctaatgttgttgttaatgttatataat 14146  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||   ||| || | |||| |||| |||||||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||     
T  14145 tgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcat-catgatttgcatactgcctatgttgt 14048  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagat 397  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   || |||||| ||||    | |||||     
T  14047 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaa 13948  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | |||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13947 g-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 13890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 208; Significance: 1e-113; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Original strand, 339949 - 340284
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  339949 ttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactgcctatgttgttgt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtc 340045  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    |||||||| ||||||||||| || | ||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  340046 taagttgacgaagatgatgaagttcaaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 340144  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  340145 tgttgggggcttgatgccctggagccttgtactcaacacgatggagctttagctaaaatt-gcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact- 340242  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  340243 -aatagcgatgggggcttgatgccctcgattggtaccacatgc 340284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Original strand, 158494 - 158716
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158494 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 158592  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158593 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgttgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 158691  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  158692 tgttgggggcttgatgccttggagc 158716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 414225 - 414286
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  414225 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 414286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 802 - 1274
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||| | |||||||||     
T  802 gaactcgccttagcgagtagaggccctcgcctcgcgaattacccagttacataatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcgcaagttgatgtt 901  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||| || || || ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  902 agttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgta-aatctaatgttgttgctaatgttatataat 1000  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| || | | ||||||| |||||||||     
T  1001 tgtatatacattacatgaatt-atgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatgatct-gcatactacctatgttgt 1098  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagat 397  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   || |||||| ||||    | |||||     
T  1099 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgtttataagaa 1198  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    | |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  1199 g-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 1274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 1313 - 1385
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1313 gggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 1385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 289 - 575
Target Start/End: Original strand, 4888 - 5171
Alignment:
Q  289 gcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtca 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||||     
T  4888 gcctatgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcg 4986  T
Q  389 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |     
T  4987 aattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagc-tc 5085  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5086 aactagcgatgggggtttgatgccctggaagtatattaatgctc-aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 5171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 2412 - 2879
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  2412 gaactcgccatggcgagtagaggccattgcctcgcgaattgactagttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtg 2511  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  2512 agttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 2611  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||| |||| | | ||| ||||||||||||||||    
T  2612 ttgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgat-gatttacatactgcctatgttg 2708  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    ||||||     
T  2709 atgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact--tataagaggttgttgttttaagaa 2803  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    | |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  2804 g-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 2879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 5)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 286 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1359 - 1069
Alignment:
Q  286 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagttt 384  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1359 actgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggtt 1260  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttag 484  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1259 gtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttcatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcattag 1161  T
Q  485 ct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1160 ctcaaaattagcgatgggggcttgatgtcctggaagtatattaaaactcaaatagcggtcggggcttgatgccccgtattggtaccacatgc 1069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 287 - 457
Target Start/End: Original strand, 15291 - 15460
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgt 386  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  15291 ctgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagagtttgt 15389  T
Q  387 caaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15390 cgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 15460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 284 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 7338 - 7193
Alignment:
Q  284 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagt 382  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  7338 atactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagg 7239  T
Q  383 ttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7238 ttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 7193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 19917 - 19993
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  19917 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatactcaaata-agttgagggctagatgccctggattggtaccacatgc 19993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 15477 - 15553
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15477 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 15553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 286 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 47065 - 46775
Alignment:
Q  286 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagttt 384  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  47065 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggtt 46966  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttag 484  Q
    ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  46965 gtcgaattaagttgttcaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagctttgtactccccacgttggagcattag 46867  T
Q  485 ct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46866 ctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctagaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 46775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 203; Significance: 1e-110; HSPs: 2)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 233 - 524
Target Start/End: Original strand, 3185 - 3478
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3185 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 3284  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatg----tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||||||||||||||||||    | ||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3285 taagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgaattaagatatttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 3383  T
Q  429 tcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatat 524  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  3384 tcattgttgggggcttgatgccctagagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgccctagaagtatat 3478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 530 - 558
Target Start/End: Original strand, 3440 - 3468
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccct 558  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3440 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccct 3468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 3)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6888 - 6436
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||  | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||    
T  6888 gaactcgccatggcgagtggaggccctcccctcgcgaattgactagttacaaaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacaagttgatgtg 6789  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  6788 agttgatcttagaggttaaaaactaagttgtta-tcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataa 6690  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||| |||| || ||||| ||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  6689 ttgtatatacattatatgaatt-atgtt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttg 6593  T
Q  299 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||    | |||||    
T  6592 ctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgttccaaattattggact--tataagaggttgttttttataaga 6495  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
     | |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6494 ag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgcgggcttgatgccctggagc 6436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 8822 - 8352
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||      |  ||||||| | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  8822 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaatgccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtga 8723  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat- 199  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||  | ||| |  | ||||||||  |||||| |||||||     
T  8722 attgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgtatatgaattgatgttgtttataatgtgatataata 8623  T
Q  200 -tgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgtt 297  Q
     |||||||||||||| ||| || || | ||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8622 ttgtatatacattacttgaatt-atatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgtt 8525  T
Q  298 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taag 395  Q
    | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | || ||| | ||||||||||||  | ||||||||| ||||    | ||||    
T  8524 gttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagaagatattccaaattattggttttatataagaggttgttgtttctaag 8430  T
Q  396 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    | | || ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  8429 a-ggttgagtagttgagtccatgcattagca-ttcattgttggtggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 8352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8316 - 8283
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8316 tgagggcttgatgccctggaagtataataatact 8283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 62 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 13058 - 12647
Alignment:
Q  62 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 161  Q
    ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  13058 ttaggttaaatgcaatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctg 12959  T
Q  162 aattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatat 261  Q
    |||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||| |||||| |||| |||||    
T  12958 aattatatgatctaatgttgttattaatgttatataattgtatatacattacatga-attatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatat 12860  T
Q  262 tgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaa 360  Q
    |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  12859 tgttatatcatgat-gatttgcatattgcctatgttgttgtttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgttccaa 12761  T
Q  361 attattggactaatataagagtttg-tcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctt 459  Q
    || |||||||| ||||||||| ||| |   | ||||| | |||||  || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12760 atgattggacttatataagaggttgttgttaataagaag-ttaagttgttgtgtccatgcattatca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcct 12663  T
Q  460 tgtactcaccacgttgg 476  Q
    | | |||||||||||||    
T  12662 t-tgctcaccacgttgg 12647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 5535 - 5376
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| || ||| |||| |  | || |||||| ||    
T  5535 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctgtagccttgtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataattgttgggggctt-at 5438  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |   | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  5437 gccctgaaagtatattaatactaaact---gttgggggc-tcatgccctatattggtaccacatgc 5376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6730 - 6571
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| || ||| |||| |  | || |||||| ||    
T  6730 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctgtagccttgtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataattgttgggggctt-at 6633  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |   | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  6632 gccctgaaagtatattaatactaaact---gttgggggc-tcatgccctatattggtaccacatgc 6571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12608 - 12536
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12608 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacattgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 12536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 10)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 5 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 161033 - 160570
Alignment:
Q  5 tcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagtt 103  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||| |||| || | ||||||||||| |||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||    
T  161033 tcgccatggcgagtagaggctctcacctcacgaggtaactagttacagaatgtcttggttaggataaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtgagtt 160934  T
Q  104 gatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgta 203  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||||||    
T  160933 gatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataattgta 160834  T
Q  204 tatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-t 302  Q
    |||| ||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| |    
T  160833 tatatattacatgactt-atgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgat 160737  T
Q  303 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgttta 402  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||    ||||| || |||    
T  160736 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgtcccaaattattggaattatttaagaggttgttgctttaagttg-tta 160641  T
Q  403 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  160640 agaggttgcgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcccttgagccttg--ctcaccacgttgg 160570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Original strand, 85635 - 85845
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  85635 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatta 85733  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||    
T  85734 agatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggct 85832  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    |||||||||||||    
T  85833 tgatgccctggag 85845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 501202 - 501003
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  501202 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 501104  T
Q  333 taagttgatgaaga------tgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||||      |||| |||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  501103 taagttgattaagatgttgttgattatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtctatgcattagca 501005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 500958 - 500875
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  500958 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagtgattgagacttgatgccccgtattggtaccacatgc 500875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 501 - 559
Target Start/End: Original strand, 85828 - 85885
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  85828 gggcttgatgccctgga-gtatattaatgctcaaatagcgataggggcttgatgccctg 85885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 492 - 546
Target Start/End: Original strand, 85862 - 85915
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggg 546  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  85862 tagcgataggggcttgatgccctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggg 85915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 500993 - 500939
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  500993 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 500939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #8
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 160531 - 160459
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  160531 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggtttgatgccctggattggtaccacatgc 160459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #9
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 508 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 204728 - 204663
Alignment:
Q  508 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  204728 atgccctggaagtatattaatactc-aacaacgacgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 204663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 422708 - 422769
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  422708 gagtccatgcattagcatacttttgttgggggctt-atgccctggagctttgtcctcaccacg 422769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 3)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 8368 - 8094
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||| |||||||||||  |||| |||  ||||| |||||||||||||||    
T  8368 gaactcgccatggcgagtggaggccctcgcctcgcgagttgtccagttacataatgctttgttaggtataatgtgatctttgtctcacgagttgatgtga 8269  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8268 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 8169  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg 276  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8168 gtatatacattacatga-attatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctg 8094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 7163 - 6704
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||| || | ||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  7163 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgccttgcgagctaactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacaagttgatgtg 7064  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  ||||||||||  ||||||||||||||    
T  7063 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattaatgttgtttataatgttatataat 6964  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||   |||||||| || ||||  |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||    
T  6963 tgtatatacattacatga-cttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgc 6869  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||         ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||     |||| ||    
T  6868 tgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtct---------aagatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagttg 6778  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||    
T  6777 -ttaagaggttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccatggagccttg--ctcaccacgttgg 6704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6665 - 6593
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6665 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 6593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 128869 - 128533
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||   |  |   | ||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  128869 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttt-tgttgcttttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaa 128771  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
     ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128770 tttgattaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 128672  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  128671 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatgggggcttgatgcccttgaagtatattaatactcaaa 128573  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  128572 tagcaatgggggcttgatgccctgtattggtaccgcatgc 128533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 65851 - 66134
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||| |||  ||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  65851 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtaggtaaaagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagat 65948  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  65949 gatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgaactcaacacgatggagcttta 66045  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||||||||||    
T  66046 gctcaaat-agcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagtgatgggggc-tcatgccctgaaatggtaccacatgc 66134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 233 - 336
Target Start/End: Original strand, 20423 - 20524
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20423 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttg-ttttgtatactga-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20520  T
Q  333 taag 336  Q
    ||||    
T  20521 taag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 20194 - 20247
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| || | ||||||||    
T  20194 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcaagttgcctaattacagaa 20247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Original strand, 16599 - 16935
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16599 ttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16698  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16699 taaattgatgaagatgatgatgtttcaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 16797  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| || | |||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16798 tgttggaggcttgatgccctgaagcctt-tgctcaacacgatggagctttagctcaa--tagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatact- 16893  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
      |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  16894 -tatagcgatggggacttgatgccctggattggtaccacatgc 16935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 16369 - 16413
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttaccca 45  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||    
T  16369 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgaccca 16413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 45559 - 46027
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || | ||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  45559 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacagaatgtcttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 45658  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||||||||||    
T  45659 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataat 45758  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||| |||||| || |||||||||  ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| || |    
T  45759 tgtatatacatcacatgaatt-atgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatttttc 45856  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||||     |||| ||    
T  45857 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagttg 45953  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  45954 -ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagccttg--ctcaccacgttgg 46027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 531
Target Start/End: Original strand, 46066 - 46096
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46066 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 46096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 196; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 284 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 51654 - 51361
Alignment:
Q  284 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagt 382  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  51654 atactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgttccaaattattggactaatataagagg 51555  T
Q  383 ttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51554 ttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcatgagca-ttcttagttgggggcttaatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatt 51456  T
Q  483 agct--taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
     |||   |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51455 tgctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcaatgggaacttgatgccctgtattggtaccacatgc 51361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 8)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 233 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 174886 - 174546
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||  | || ||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  174886 ttgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 174790  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    ||||| || ||||| ||||||||  |||||||||||||||||  |||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  174789 ctaagatgttgaagttgatgatgctccaaattattggactaaattaagaggttatcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttca 174691  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatac 530  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  174690 tagttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggagaatttgctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatac 174591  T
Q  531 tcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  174590 tcaaatagcgatggtggcttgatgccttgtattggtaccacatgc 174546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 286 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 121835 - 121607
Alignment:
Q  286 actgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttg 385  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| |||    
T  121835 actgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggatta-tataagaggttg 121737  T
Q  386 tcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagc 485  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  121736 tcgaattaatatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc 121637  T
Q  486 ttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    | || ||||||||| ||| |||||||||||    
T  121636 tcaatttagcgatgggggtttgatgccctg 121607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 136135 - 136471
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||  | ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||    
T  136135 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtga 136234  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |    
T  136235 gttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagt 136334  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgtt 297  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||     
T  136335 tgtatatacattacatga-attatgtacgatg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgtgtactgcctatgtc 136431  T
Q  298 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  136432 gctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 136471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 144843 - 145179
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||  ||| ||| ||||  | ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||    
T  144843 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtccatttatagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtga 144942  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtat-aatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||| |    
T  144943 gttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgattttaatgttgttgttaatgttatatagt 145042  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgtt 297  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||  ||||  || ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||     
T  145043 tgtatatacattacatga-attatgtacgatg-atgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttgtgtactgcctatgtc 145139  T
Q  298 gctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  145140 gctgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaag 145179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 136655 - 136730
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  136655 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcctgatgccctggattggtaccacatgc 136730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 536 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 121630 - 121591
Alignment:
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  121630 tagcgatgggggtttgatgccctgtattggtaccacatgc 121591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 407 - 457
Target Start/End: Original strand, 136552 - 136601
Alignment:
Q  407 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  136552 gtcgagtccatgcattcgcatt-cattgttgggggcttgatgccctagagc 136601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 407 - 452
Target Start/End: Original strand, 145260 - 145304
Alignment:
Q  407 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccct 452  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  145260 gtcgagtccatgcattcgcatt-cattgttgggggcttgatgccct 145304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 4)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 176 - 575
Target Start/End: Original strand, 17969 - 18366
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||| | |||||||||||||| |||| | || |||||| ||||||||||     
T  17969 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatga 18067  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || || |||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  18068 tg-ttgtgcataatgcatatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactat 18166  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 473  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18167 tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattatcatttcagtgttggggggttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 18266  T
Q  474 tggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    ||||| |||||| | ||||| ||||  |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18267 tggaggtttagc-tcaattaacgataggggcttgatgccctgg-agtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgctcagtattggtaccacat 18364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 244 - 456
Target Start/End: Original strand, 2184 - 2394
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2184 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgatta 2282  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    | ||||||| || | ||||||||||| | ||||||||| |||||   |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||    
T  2283 aaatgatgaagttctaaattattgga-ttatataagaggttgtcggtttaaaatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggct 2381  T
Q  444 tgatgccctggag 456  Q
    | |||||||||||    
T  2382 ttatgccctggag 2394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 2411 - 2492
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  2411 tagcgataggggcttgatgccctgga-gtatattaatactcaaatagtgat-ggggctcgatgctctgtattggtacaacatgc 2492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 559
Target Start/End: Original strand, 2377 - 2434
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2377 gggctttatgccctgga-gtatattaatgctcaaatagcgataggggcttgatgccctg 2434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 193; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 253 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16382 - 16061
Alignment:
Q  253 atttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    |||||||||  |||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  16382 atttgatataattatgtcatgctg---ttgtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatg 16286  T
Q  352 atgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 451  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||||||| |||    
T  16285 atgttccaaattattagactaatgtaagaggttgtcgaattaagttgtctaagagatcgagtccatgcaatagcatt-catagttgggcgcttgataccc 16187  T
Q  452 tggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaa--ttagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggct 549  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16186 tggagctttgtactcaccacgttggagcatttgctcaaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggct 16087  T
Q  550 tgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16086 tgatgccctgtattggtaccacatgc 16061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 2)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 460
Target Start/End: Original strand, 10309 - 10762
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  ||||||||||||||  || |||||| | | | |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  10309 gaactcgccaaagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttgtcctgttacatactgccttgttaggttaaatgcgatctttgttgcacgagttgatgtga 10408  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  |||||||||||||||    
T  10409 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttatataatt 10508  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  10509 gtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgct 10606  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||     |||| ||     
T  10607 gtttgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagt---tgaagatggtgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttg- 10702  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 460  Q
    |||||| || | ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  10703 ttaagatgttgtgtccatgcatttgca-ttcatcgttgggggcttgatgccttggagcttt 10762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 501 - 529
Target Start/End: Original strand, 10779 - 10807
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaata 529  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10779 gggcttgatgccctggaagtatattaata 10807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 236 - 493
Target Start/End: Original strand, 1050 - 1306
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1050 agatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 1149  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1150 gttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgt 1248  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaatta 493  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1249 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctcaaatta 1306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 190; Significance: 1e-103; HSPs: 5)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Original strand, 32959 - 33292
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32959 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 33057  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33058 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgt 33156  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  33157 tgggggcttgatgccctggagccttgtgctcaacacgatggagctttagctcaa--tagcgataagagcttgatgccctggaagtatattaatact--ta 33252  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  33253 taccgatgggggcttgatgccttggattggtaccacatgc 33292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 46046 - 45713
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46046 agatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctgtgttgctgttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaa 45948  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgt 435  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45947 gttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgt 45849  T
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaa 535  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  45848 tgggggcttgatgccctggagccttgtgctcaacacgatggagctttagctcaa--tagcgataagagcttgatgccctggaagtatattaatact--ta 45753  T
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  45752 taccgatgggggcttgatgccttggattggtaccacatgc 45713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 233 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 16235 - 15955
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16235 ttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16136  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16135 taagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttttcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 16037  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||||||||||    
T  16036 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaaaacgatggagctttag-ttcaaatagcgatgggggcttgatgccctg 15955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 8e-78
Query Start/End: Original strand, 294 - 575
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17664
Alignment:
Q  294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaatta 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    ||    
T  17389 tgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgttcta 17487  T
Q  394 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaatta 493  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||| ||||||| ||||| ||  ||    
T  17488 aaatgtttaagaggttgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttaatgccctagagccttgtgctcaacacgatggagctatagctcaa--ta 17585  T
Q  494 gcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  17586 gcgatacgggcttgatgccctggaagtatattaatact--tatagcgat-ggggcttgattccctggattggtaccacatgc 17664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 531 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15983 - 15939
Alignment:
Q  531 tcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15983 tcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 15939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 328 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32188 - 31940
Alignment:
Q  328 cggtctaagttgatgaagatgatgat-gtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32188 cggtctaagttgatgaagatgatgattgttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagca 32090  T
Q  427 tttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatatt 525  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  32089 tttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacattggggcattagctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatatt 31990  T
Q  526 aatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31989 aatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 31940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 184; Significance: 3e-99; HSPs: 7)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 130258 - 129791
Alignment:
Q  2 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| || | ||||||| ||| | ||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  130258 aactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagctaactagttacaaaatgccttgtttaggataaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtga 130159  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||   ||||||||||||||    
T  130158 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttacaatgttatataatt 130059  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||    
T  130058 gtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgct 129961  T
Q  301 gt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||| || |||||| ||||      ||| ||     
T  129960 gtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgat---gatgaagatgttccaaattaatggacttatttaagaggttgttgttccaagttg- 129865  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||  |||||||||||||    
T  129864 ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgcaggcttgatgccctggagccttg--ctcaccacgttgg 129791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 229 - 381
Target Start/End: Original strand, 60710 - 60858
Alignment:
Q  229 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatga 325  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||| |||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  60710 atgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcatgagctg-ttttgtatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatga 60807  T
Q  326 gtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    |||||| |||| |||     | |||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  60808 gtcggtttaagatga-----aagatgatgttccaaattattggatttatataagag 60858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 60482 - 60536
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  60482 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagtttcccagttacagaat 60536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 497 - 421
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  497 tgagggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 129752 - 129682
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  129752 gggcttgatgccctggaagtatattaatact-tacta-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacat 129682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6863 - 6789
Alignment:
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||  || |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6863 agggcttgatgccctgggtgtgtatttatgctcaaatat-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 6789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 714 - 666
Alignment:
Q  288 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  714 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 182; Significance: 4e-98; HSPs: 3)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 7844 - 8308
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  7844 gaactcgccatagcgagtaaaggctctcgcctcgcgagttgcccagttacaaaatgccttgttagggtaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtga 7943  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  7944 gttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgc---tgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgataatgttatatagtt 8040  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||||||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||    
T  8041 gtatatacattacatga-attatatatgatg-ttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactgg-tttgtatactgcctatgttg 8137  T
Q  299 ctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagat 397  Q
    ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||     | |||||||| ||||||||||||| | || |||||| |||   | |||||||    
T  8138 ctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-----aagatgatgttccaaattattggatttatttaagaggttgatgatttaagat 8232  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |  ||||  |  ||||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  8233 g-ctaagttgatgagtccatgcatttgca-ctcatagtggggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 8308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 46 - 303
Target Start/End: Original strand, 29093 - 29348
Alignment:
Q  46 gttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgt 145  Q
    |||||||||| | || ||||||| ||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||      
T  29093 gttacagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaa 29192  T
Q  146 tgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgtta---atgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgtt 242  Q
    |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  ||   |||||||||||||||||||||| |||||||  ||| |||||||  ||||   |||    
T  29193 tgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataattatgttatataattgtatatacagtacatga-cttaagtttgataattga---gtt 29288  T
Q  243 gttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt 303  Q
    | ||| ||||||| |||||| |||||||||| | | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  29289 gctgatttacattcgatattattatatcatgatag-tttgaatactacctatgttgctgtt 29348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 8347 - 8419
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  8347 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgc 8419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 178; Significance: 1e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 45 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1391 - 971
Alignment:
Q  45 agttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttg 144  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| |||||    
T  1391 agttacagaatgccttgttaggttaaatgcgatctttgtcacacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgttg 1292  T
Q  145 ttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgt 244  Q
    ||||| ||||||| ||||  | ||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||     
T  1291 ttgttccagtaagactgatgtatatgatttgatgttgttgttaatgttatatagttgtatatacattccatga-attatgtttgatgtttgaaatgttga 1193  T
Q  245 tgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    |||| |  ||| ||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1192 tgacctgtattcgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 1094  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    |   || ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||     ||||| | || ||  || | ||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  1093 a---gaagatgttccaaattattggatttatataagagattgt---tctaaga-ggttgagttgttgtgtccatgaattagca-ttcattgttgggggct 1002  T
Q  444 tgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  1001 tgatgccctggagctttg--ctcaccacgttgg 971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 935 - 861
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||  || || ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  935 tgagggcttgatgccctggaagtatatcaatact--tattacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatg 861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 236 - 515
Target Start/End: Original strand, 6123 - 6404
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgtt---atttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| | || |||||||| ||||| ||||| ||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  6123 agatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 6222  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6223 taagttgatgaagatgatgatgttccaaatttttggatta-tataagaggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtctatgcattagcatttcat 6321  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6322 tgttggaggcttgatgccctgaagctttgtactcaacacgttggagctttagctcaaaatagcgatgggggcttgatgccctg 6404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 533 - 575
Target Start/End: Original strand, 6378 - 6420
Alignment:
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6378 aaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 6420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 328 - 575
Target Start/End: Original strand, 2494 - 2741
Alignment:
Q  328 cggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 427  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  2494 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 2592  T
Q  428 ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatatta 526  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2593 ttcattgttgggggcttgatgccctagagctttgtactcacaacgttggagcattagctcaaaattaacgatgggggcttgatgccctggaagtatatta 2692  T
Q  527 atactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  2693 atactcaaatagtgatgggggcttgatgtcttgtattggtaccacatgc 2741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 280
Target Start/End: Original strand, 2213 - 2488
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | || ||||||| ||||||||  ||| ||  |||||| ||||||    
T  2213 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcgtgtgtgttacagaatgcctttttaggttgaatgcgatctttgccgttcgagtttatgtga 2312  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||| |||  |||||| ||  |||| ||||||| ||||    ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  2313 gttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttgctattaatgttccagtaagactgatgcttatgaattaatgttgcttataatgttatataatt 2412  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttt 280  Q
    |||||||||||| ||||  ||| |||||||  ||||   |||| ||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  2413 gtatatacattaaatga-cttaagtttgataattga---gttgctgatttacattcgatattattatatcatgatggttt 2488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 173; Significance: 9e-93; HSPs: 7)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 236 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 33060 - 32783
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  33060 agatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaa 32962  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
     |||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32961 cttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattg 32863  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  32862 ttgggggcttgatgccctggagctttggactcaacacgatggagctttagctcaaa-tagagatgggggcttgatgccctg 32783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 236 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 38879 - 38602
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  38879 agatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaattaagctgcatgactcggtctaa 38781  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 434  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  38780 gttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagttctagtccatgcattagcatttcattg 38682  T
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||  ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  38681 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgatggagctttagcgcaaa-tatcgatgggggcttgatgccctg 38602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 9867 - 9645
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| || |||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9867 ttgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 9769  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||    
T  9768 taagttgattaagatgatgaagtcccaaattattgga-ttatataggaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattattttttcat 9670  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  9669 tgttgggggcttgatgccctggagc 9645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 373 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 32458 - 32317
Alignment:
Q  373 atataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  32458 atataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttggactcaacacg 32359  T
Q  473 ttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctg 515  Q
     ||||||||||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  32358 atggagctttagctcaaa-tagagatgggggcttgatgccctg 32317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 532 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 38629 - 38586
Alignment:
Q  532 caaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38629 caaatatcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 38586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32346 - 32301
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32346 ctcaaatagagatgggggcttgatgccctgtattggtacaacatgc 32301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32812 - 32767
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32812 ctcaaatagagatgggggcttgatgccctgtattggtacaacatgc 32767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 167; Significance: 4e-89; HSPs: 6)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 232 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 4630 - 4350
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4630 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggt 4532  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4531 ctaagttgatgaaaatgattatgttccaaattattggatta-tacaagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 4433  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  4432 ttgttgggggcttgatgccctggagcctt-tactcaacacgatggagctttagctcaa--tagcgatgggggcttgatgccctgga 4350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 232 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 12212 - 11932
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12212 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggt 12114  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12113 ctaagttgatgaaaatgattatgttccaaattattggatta-tacaagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 12015  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  12014 ttgttgggggcttgatgccctggagcctt-tactcaacacgatggagctttagctcaa--tagcgatgggggcttgatgccctgga 11932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 4e-89
Query Start/End: Original strand, 232 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 22164 - 21884
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||  ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22164 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgctgttgttatttaactaagc-gcatgagtcggt 22066  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| || || ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22065 ctaagttgatgaaaatgattatgttccaaattattggatta-tacaagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 21967  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgga 517  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  21966 ttgttgggggcttgatgccctggagcctt-tactcaacacgatggagctttagctcaa--tagcgatgggggcttgatgccctgga 21884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 534 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 21911 - 21870
Alignment:
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21911 aatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 21870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 4377 - 4339
Alignment:
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccaca 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4377 aatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccaca 4339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 534 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 11959 - 11921
Alignment:
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccaca 572  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11959 aatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccaca 11921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 482 - 31
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||||    
T  482 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaatgtcttgcttatgttaaatgcgatctttgtcgtacgagttgatgtg 383  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||  ||||||||||||||||  ||| || ||||    ||| |  | ||||||||  |||| |||||||||    
T  382 agttgatcttagaggttagaaactgagttgtta-tcttgctgttgttgttctagtgagactgatacatatgaattgatgttgtttataatattatataat 284  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||     
T  283 tgtatatacattacatgaatt-atgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgt 186  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagat 397  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||   |  |||||| ||||  | | |||||     
T  185 tgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggatatacttaagaggttgttgattataagaa 89  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | |||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  88 g-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 31  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 165; Significance: 6e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 6e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 457
Target Start/End: Original strand, 14506 - 14916
Alignment:
Q  43 ccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctg 141  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  14506 ccagttacagaatgccttgtttaggataaatgcgatcttggtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctg 14605  T
Q  142 ttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  14606 ttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaatggtatataatagtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatg 14703  T
Q  241 ttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 339  Q
    ||||||| || |||| ||||||  ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14704 ttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgatttt-cttactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14802  T
Q  340 atgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 438  Q
    ||   ||||||||||| |||||||||||||   || |||||| ||||  ||| ||||| | |||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||    
T  14803 at---gatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgaatataagaag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgg 14897  T
Q  439 gggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14898 gggcttgatgccctggagc 14916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 14974 - 15046
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |  || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  14974 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacattgagggcttgatgccttggattggtaccacatgc 15046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Original strand, 30918 - 30979
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30918 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 30979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 27 - 476
Target Start/End: Original strand, 22467 - 22905
Alignment:
Q  27 tcgcctcgcgagttacccagttacagaat-tctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaa 125  Q
    |||||| |||| | ||||||||||||||  ||||  ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  22467 tcgccttgcgaatgacccagttacagaaagtcttgcttatgctaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaa 22566  T
Q  126 gttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgt 225  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||  || ||| |   ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  22567 gttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactga--tgcatattg--atgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgaatt-atgt 22661  T
Q  226 ttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatg 324  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  22662 ttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatg 22760  T
Q  325 agtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattag 424  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||     |||| || |||||| || | |||||||||||||    
T  22761 agtcggtctaagt---tgaaggtgatgatgttccaaattattggacttgtataagaggttgttgttctaagttg-ttaagatgttgtgtccatgcattag 22856  T
Q  425 catttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    || |||||| |||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  22857 ca-ttcatt-ttgggggcttgatgcccttgagccttg-gctcaccacgttgg 22905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 82190 - 81978
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  82190 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagcttcatgagtcggtc 82092  T
Q  333 taagttgatgaagatgatg-atgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    ||||||||| ||||||||| | || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||     
T  82091 taagttgattaagatgatgaaggttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttct 81995  T
Q  432 ttgttgggggcttgatg 448  Q
    |||||||||||||||||    
T  81994 ttgttgggggcttgatg 81978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 21678 - 21859
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||      
T  21678 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctca 21776  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |  | || |||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  21777 aaataattgttgggggctt-atgccttgaaagtatattaatactaaaat---gttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 21859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 22944 - 23016
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22944 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 23016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 232 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 26018 - 25738
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26018 tttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgata-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagtcggt 25920  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    |||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25919 ctaagttgatgaagataatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagatgtataagaggtcgagtccatgcattagcatttc 25821  T
Q  431 attgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccct 514  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||    
T  25820 attgttggaggcttgatgccctggagctttgtactaaacacgatggagctttagctcaaa-taacgatgggggcttgatgccct 25738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 232 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 39980 - 39736
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  39980 tttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgata-ttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagcttcatgagttggt 39882  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtc-ccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39881 ctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgaattaagttttttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 39783  T
Q  431 attgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgga 477  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  39782 attgttgggggcttgataccctggagctttgtactcaacacgatgga 39736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 530 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 25766 - 25721
Alignment:
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  25766 ctcaaataacgatgggggcttgatgccctagattggtaccacatgc 25721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 163; Significance: 9e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 2571 - 3040
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||      |||||||||| | ||||| |||  ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  2571 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggaaaaatgtgatccttgtcgcacgagttgatgtg 2670  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||| |||||||||||||| ||||  |    
T  2671 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttgttaatggtata--a 2768  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatg--tt----tgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcct 292  Q
    ||||||||| || ||||   ||||||  ||    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||    
T  2769 ttgtatatatat-acat---tttatgaattaagctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcct 2863  T
Q  293 atgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat 391  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||   |||    |    
T  2864 atgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgatgatgatgatgttccaaattattggact--tataagatgatgttgttt 2958  T
Q  392 taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||| || |||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  2959 taagttg-ttaagatgatgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 3040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 412 - 476
Target Start/End: Original strand, 3280 - 3342
Alignment:
Q  412 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  3280 gtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 3342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 163; Significance: 9e-87; HSPs: 5)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 16011 - 15563
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| |     |||||||||| | || ||||||  ||||||||  ||||||  |||||||||||||    
T  16011 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcttttgtgttacagaatgcctttttaggtggaatgcgatctttgtcgttcgagttgatgtga 15912  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  || | ||||||| |||| |  ||| |  |||||||| |  |||||||||||||||    
T  15911 gttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactgattcttatgaaataatgttgcttataatgttatataatt 15812  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||    
T  15811 gtatatacattacatga-cttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgg-tttgtatactgcctatgttgct 15717  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgt 399  Q
    | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15716 gtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgt 15619  T
Q  400 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||  ||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15618 ttaagaattcgagtccatggattagca-ttctttgttgggggcttgatgctctggag 15563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 399 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1292 - 1119
Alignment:
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgat 498  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  1292 tttaagatatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgttctggagctttgtactcaacacgatggagctttagctcaaattagcgat 1194  T
Q  499 gagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    | |||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  1193 gggggcat-atgccctagaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 1119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15546 - 15465
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  15546 tagcgataggggcttgatgctctgg--gtataataatactcaaatagcgattggggcttgataccccgtattggtaccacatgc 15465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 15580 - 15527
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  15580 gggcttgatgctctgga-gtatattaatacttaaatagcgataggggcttgatgc 15527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1403 - 1339
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||  ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1403 ctgcctatgttgctattgttacttaaacaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 1339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 163; Significance: 9e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 232 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 39599 - 39329
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39599 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 39501  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgat-gtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39500 ctaagttgatgaagacgatgatctttccaaattattgga-ttatataagaggttgtccaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattta 39402  T
Q  431 attgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggct 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  39401 attgtt-ggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgattgagctttggcctaaa-tagcgatgggggct 39329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 37203 - 37130
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37203 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa-tagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 37130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 163; Significance: 9e-87; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 232 - 505
Target Start/End: Original strand, 75213 - 75483
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75213 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctg-ttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 75311  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgat-gtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  75312 ctaagttgatgaagacgatgatctttccaaattattgga-ttatataagaggttgtccaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattta 75410  T
Q  431 attgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggct 505  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| || |||| |||||||| |||||    
T  75411 attgtt-ggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgattgagctttggcctaaa-tagcgatgggggct 75483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Original strand, 77609 - 77682
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  77609 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa-tagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 77682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 284 - 518
Target Start/End: Original strand, 1098 - 1333
Alignment:
Q  284 atactgcctatgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagt 382  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||     
T  1098 atactgcctatgttgatgtttattaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactattttaagagg 1197  T
Q  383 ttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1198 ttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcatt 1296  T
Q  483 agct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaa 518  Q
    ||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1297 agctcaaaattagcgatgggggcttgatgccctggaa 1333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 536 - 575
Target Start/End: Original strand, 1307 - 1347
Alignment:
Q  536 tagcgatgggggcttgatgccct-gtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  1307 tagcgatgggggcttgatgccctggaattggtaccacatgc 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 62 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 5934 - 5547
Alignment:
Q  62 ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctg 161  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5934 ttaggctaaatgtgattcttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtt-tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctg 5836  T
Q  162 aattg-tataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgata 260  Q
    ||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||    
T  5835 aattaatatgatctaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgata 5738  T
Q  261 ttgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccca 359  Q
    ||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| || |||| |||    
T  5737 ttgttatatcatgatgatttt-catactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gataatcatgttcca 5642  T
Q  360 aattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||| |  |||||||| ||||    | || || | |||||  || | ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641 aattattggatt--tataagaggttgttgtttatatgaag-ttaagttgttgtgtccatgcattagca-tccattgttgggggcttgatgccctggagc 5547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 434 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7482 - 7344
Alignment:
Q  434 gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactca 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  7482 gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagctttagc-tcaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtaaattaatact-a 7385  T
Q  534 aatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7384 aata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 7344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 433 - 559
Target Start/End: Complemental strand, 7585 - 7463
Alignment:
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7585 tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagttttagc-tcaattatcgatg-gggcttgatgccctggaagtatattaatactc 7488  T
Q  533 aaatagcgatgggggcttgatgccctg 559  Q
     |||| || ||||||||||||||||||    
T  7487 -aata-cgttgggggcttgatgccctg 7463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 232 - 457
Target Start/End: Original strand, 44705 - 44929
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44705 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagt 44804  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| ||||||| | ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44805 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtattgga-ttatataagaggttgtcgatttaatatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 44903  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  44904 ttgttgggggcttgatgccctggagc 44929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 348
Target Start/End: Original strand, 26064 - 26179
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26064 ttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 26163  T
Q  333 taagttgatgaagatg 348  Q
    ||||||||||||||||    
T  26164 taagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 145; Significance: 5e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 5e-76
Query Start/End: Original strand, 319 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 27913 - 27660
Alignment:
Q  319 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg--tcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtcca 416  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||| || |||||||| ||||     |||||||||||||| ||||||||||    
T  27913 tgcatgagtcggtctaagtttatgaagatgatgatggtttccaaattattggatta-tataagaggttgttgttctaagatgtttaagaagtcgagtcca 27815  T
Q  417 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctgg 516  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27814 tgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttgtactaaacacgatggagctttagctcaaa-tagcgatg-gggcttgatgccctgg 27717  T
Q  517 aagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27716 aagtatattaatact--tatagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 27660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 27953 - 27911
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||    
T  27953 tttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 141; Significance: 1e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 20865 - 20644
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20865 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 20767  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20766 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 20669  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  20668 tgttgggggcttgatgccctggagc 20644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 140; Significance: 5e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12921 - 12472
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||| |    ||  ||||||  | ||||||||||||||| ||   ||||||||||||| |||||||    
T  12921 gaactcgccatagggagtagaggctctcgcctcgcgagctcatgagagacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagtggatgtga 12822  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |  ||||| || | ||||||||  |||||| ||||||||    
T  12821 gttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgtgtattatttgatgttgtttataatgtgatataatt 12722  T
Q  201 gtatatacattacatgagtt-tatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||| ||| || ||| |  | | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12721 gtatatacattac-tgaattatatataag-tatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgcatactgcctatgttgc 12625  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagat 397  Q
    || |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||     | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||    | ||||||    
T  12624 tgtttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatga-----aagaagatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagat 12530  T
Q  398 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    | |||||  || ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  12529 g-ttaagttgttgagtccatgcattcgcattt-atcgttgggggcttgatgccctggagc 12472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 12418 - 12343
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12418 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacattgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 12343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Original strand, 7826 - 8295
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  ||| |||||| | ||| |||||||||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  7826 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgcgagttaccttgttccagaatgccttgctaggttaaatgcgatctttgtcgcaagaattgatgtga 7925  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| || ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||    
T  7926 gttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgtatatgatttgatgttgtttataatgtgatataatt 8025  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgtt 297  Q
     |||||||||||| |||  |||| | || |||||| |||||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||| | ||||||||||||||||| |    
T  8026 ttatatacattacttga-attatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagct-gatttgcatactgcctatgct 8123  T
Q  298 gct-gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaaga 396  Q
    |||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||   ||||||  | || ||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||  |  ||||     
T  8124 gctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtcta---tgatga--aagaagatgttccaaattattggatttatataagaggttgttgatctaagt 8218  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    || || |   || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  8219 tg-ttgacttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggattgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 8295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 8331 - 8406
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8331 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagagcttgatgccctggattggtaccacatgc 8406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 136; Significance: 1e-70; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 70 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 62479 - 62200
Alignment:
Q  70 aatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-ta 168  Q
    |||||||| |||||||| ||| | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  62479 aatgcgatccttgtcgcccgattcgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtta 62380  T
Q  169 taatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttata 268  Q
    | | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| |||||||||||||||   | |||| |||||| |||||    
T  62379 tgaactaatgatgttgttaatgttatataattgtatatacattatatga-attatg-ttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattata 62285  T
Q  269 tcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgat 353  Q
     |||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||    
T  62284 ccatgat-gtttttcatactgcctatgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagtcgaagatgatgatgat 62200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 136798 - 136577
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136798 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 136700  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136699 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 136602  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  136601 tgttgggggcttgatgccctggagc 136577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 139267 - 139046
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139267 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 139169  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139168 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 139071  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  139070 tgttgggggcttgatgccctggagc 139046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 144205 - 143984
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144205 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 144107  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144106 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 144009  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  144008 tgttgggggcttgatgccctggagc 143984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 141736 - 141515
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  141736 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtc 141638  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141637 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 141540  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  141539 tgttgggggcttgatgccctggagc 141515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 134329 - 134108
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  |||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134329 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 134231  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    || |||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134230 tatgttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgttgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 134133  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  134132 tgttgggggcttgatgccgtggagc 134108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 133005 - 132545
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||       ||||| ||| | ||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  133005 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtcttacataatgccttgtttaggttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtg 132906  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||      
T  132905 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata-- 132808  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
        ||||||||| ||| | ||||||| |||  |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  132807 ----tatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgc 132715  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||   |||    ||||| ||    
T  132714 tgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaa---gatgatgatgatgatgttccaaattattggact--tataagatgatgttgttttaagttg 132620  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  132619 -ttaagatgatgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 244 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 4321 - 4110
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  4321 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgc-tgtgtcgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgatta 4223  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  4222 agatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattacattgttgggggct 4124  T
Q  444 tgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||    
T  4123 tgatgccctggagc 4110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 5)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 330 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3539 - 3298
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||      
T  3539 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaagtcaagtccatgcattagcatac 3440  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaata 529  Q
      ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3439 atttgttgggggc-tcatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaata 3342  T
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||| || ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  3341 ctc-aataacgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 3298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 330 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 7603 - 7361
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||      
T  7603 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaagtctagtccatgcattagcatac 7504  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaata 529  Q
      ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7503 atttgttgggggc-tcatgccctgaagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaata 7406  T
Q  530 ctcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||  | |  ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  7405 ctcaataacctttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 7361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 229 - 460
Target Start/End: Original strand, 27744 - 27969
Alignment:
Q  229 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagt 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  27744 atgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgct-gttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagt 27842  T
Q  328 cggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    |||||||||||||     | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||    | ||||||| |||||  || ||||||||||||| |||    
T  27843 cggtctaagttga-----aagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatg-ttaagttgttgagtccatgcattcgca 27936  T
Q  427 tttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 460  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27937 -ttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 27969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 27983 - 28058
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27983 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 28058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 27487 - 27526
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagtt 40  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27487 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtt 27526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 13510 - 13289
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13510 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 13412  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13411 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 13314  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13313 tgttgggggcttgatgccctggagc 13289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 37939 - 37718
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37939 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 37841  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  37840 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgaggtcgagtccatgcattagcatttcat 37743  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  37742 tgttgggggcttgatgccctggagc 37718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 133; Significance: 7e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 40518 - 40297
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40518 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcacgagtcggtc 40420  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40419 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 40322  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  40321 tgttgggggcttgatgccctggagc 40297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 46 - 298
Target Start/End: Original strand, 2030 - 2281
Alignment:
Q  46 gttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttg 144  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||||||||    
T  2030 gttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttg 2129  T
Q  145 ttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttg 243  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||||  |||| ||||||||||||    
T  2130 ttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttgttaatggtatataattgtatatacattatatga-attatg-ctgatatttgagatgttg 2227  T
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  2228 ttgatttgcatttgatattgttatatcatgat-gatttgcatactgcctatgttg 2281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 131; Significance: 1e-67; HSPs: 9)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 232 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 116548 - 116328
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116548 tttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctg-ttttgtatactgt-tgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 116451  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||||| |||||||||| || ||||| |||| |  | ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116450 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtatttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 116351  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  116350 ttgttgggggcttgatgccctgg 116328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 336
Target Start/End: Original strand, 128817 - 129072
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    |||||||||||| || | |||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||  || || | ||||    
T  128817 ttgtcgcacgagatgttatgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttagatgatttgatgt 128915  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggt 278  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  | ||    
T  128916 tgttaataatgtgatatatttgtatatccattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaattgt 129014  T
Q  279 tttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||   ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  129015 tttatgtactgcctatgttgctgtttgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 129072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 59 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 78617 - 78328
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||| ||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||    
T  78617 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcatgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagc 78518  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    ||||||| ||| || | ||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||    |||| ||||||||||||||| || || ||||    
T  78517 ctgaattatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attataaacgatg-ttgagatgttgttgatttgca-ttga 78421  T
Q  259 tattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-atgaagatg 348  Q
    |||||||||||||||  || |||||  || ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||    
T  78420 tattgttatatcatgaact-gttttatatgctgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaatgaagatg 78328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 496 - 575
Target Start/End: Original strand, 129201 - 129279
Alignment:
Q  496 gatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  129201 gatgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgctctggattggtaccacatgc 129279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 73920 - 74101
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| || |||      
T  73920 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctt-atgccctggagctttgtactaaccacgatggagcatttgctca 74018  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |  | || |||||| |||||||  ||||||||||||||   ||||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  74019 aaataattgttgggggctt-atgccctaaaagtatattaatac---aataatgctgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 74101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 44452 - 44377
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || || | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44452 tgagggcttgatgccctgtaagtatattaatact-taata-cgttgagagcttgatgccctggattggtaccacatgc 44377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 78173 - 78098
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || || | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  78173 tgagggcttgatgccctgtaagtatattaatact-taata-cgttgagagcttgatgccctggattggtaccacatgc 78098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 428 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 78255 - 78208
Alignment:
Q  428 ttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  78255 ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 78208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #9
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 116254 - 116221
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  116254 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 116221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 5)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 186 - 428
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1263
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcat 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||  |||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaa-gtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggttt-gcat 1119  T
Q  286 actgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagttt 384  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  1120 actgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggtc 1219  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1220 gttgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatt 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 1352 - 1435
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  1352 tagcgattggggcttgatgctctggaagtataataatactcaaatagcgataggggtttgatgctccgtattggtaccacatgc 1435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 1273 - 1327
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1273 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 1327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 1308 - 1371
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1308 tagcgattggggcttgatgctccgggagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 1371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 4284 - 4320
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  4284 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 130; Significance: 4e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Original strand, 103406 - 103773
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||  | ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||||||||||    
T  103406 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcacgagttgtccatttacagaacaccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgtacgagttgatgtga 103505  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| || ||    
T  103506 gttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttaatgttgttgttaatgttatgtagtt 103605  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg-ctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||      |||||||   || ||||||||||||||||||||||  | |||||  ||||| ||||||||||    
T  103606 gtatatacattacatga-attatgtatgatgt------tgttgtt---ttgcatttgatattgttatatcatgaattgttttttatactacctatgttgc 103695  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    || || ||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||     | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  103696 tgtttatttattaactaagctgcattagtcggtctaagttga-----aagaggatgttccaaattattggatttatataagag 103773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 103902 - 103977
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  103902 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 103977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10946 - 10913
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10946 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 10913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 102206 - 102281
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||  | ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  102206 tgaggacttgatgccctgggagtgtatttatactcaa-tat-gttgggggcttgatgccctggcttggtaccacatgc 102281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 14065 - 13844
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14065 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttatctaagctgcatgagtcggtc 13967  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13966 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaagat-attacgagatcgagtccatgcattagcatttcat 13869  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13868 tgttgggggcttgatgccctggagc 13844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 236 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 4643 - 4301
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  4643 agatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctat 4544  T
Q  336 -------gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
           |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||| ||||    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4543 ataagaggttgattaagatgatgatgttccaaattattggatta-tatacgaggttgttgt-ttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatt 4446  T
Q  429 tcattgttgggggcttgatgccctggag-ctttg--tactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatatt 525  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  | |||| |||| ||||||||||||| ||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4445 tcattgttgggggattgatgccccggagcctttgtttgctcaacacgatggagctttagctcaa--ttgcgatgagggctt-atgccctggaagtatatt 4349  T
Q  526 aatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||   ||| ||||||||  |||||||||   |||||||||||||||    
T  4348 aatact--tataacgatggggaattgatgccccagattggtaccacatgc 4301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 119; Significance: 2e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 69858 - 69574
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  69858 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagat 69761  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  69760 gatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagcttta 69664  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  69663 gctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 69574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 332167 - 332093
Alignment:
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  332167 agggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaat-tagttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 332093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 4)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 59 - 336
Target Start/End: Original strand, 6108 - 6386
Alignment:
Q  59 ttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagc 158  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||    
T  6108 ttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagc 6207  T
Q  159 ctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttga 258  Q
    ||||||| ||| || | |||||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  6208 ctgaattatatgatttgatgttgttattaatgtgatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttga 6306  T
Q  259 tattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6307 tattgtcatatcatgagct-gttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagttgcatgagtcggtctaag 6386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 6499 - 6574
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6499 tgagggcttgatgccgtggaagtatattaatacttaa--cacgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 6574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 457
Target Start/End: Original strand, 6416 - 6445
Alignment:
Q  428 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6416 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 6445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 457
Target Start/End: Original strand, 13870 - 13899
Alignment:
Q  428 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13870 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 13899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 118; Significance: 6e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 233 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 12176 - 11960
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| | ||||||| | ||||||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  12176 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgc-tgtgttgctgtt------taactaagctgcatgagtcggtc 12084  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12083 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcat 11985  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  11984 tgttggtggcttgatgccctggagc 11960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11857 - 11824
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11857 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 11824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 176 - 449
Target Start/End: Complemental strand, 11643 - 11370
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  11643 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 11545  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  11544 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactat 11446  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 449  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||    
T  11445 tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattatcatttcagcgataggggcttgatgc 11370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11291 - 11219
Alignment:
Q  503 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11291 gcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 11219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 11346 - 11283
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||    
T  11346 tagcgataggggcttgatgctccggaagtataatagtactcaaatagcgattggagcttgatgc 11283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 5)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 176 - 449
Target Start/End: Original strand, 38198 - 38471
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatg-tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| ||| || || | ||||  |||||||||||||| |||||| |  |||||| ||||||||||     
T  38198 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttgaatt-atatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatga 38296  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaa 373  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  38297 tg-ttttgcatactgcctatgttgctgattgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactat 38395  T
Q  374 tataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 449  Q
    |||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||    
T  38396 tataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattatcatttcagcgataggggcttgatgc 38471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 503 - 575
Target Start/End: Original strand, 38550 - 38622
Alignment:
Q  503 gcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38550 gcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 38622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Original strand, 24605 - 24690
Alignment:
Q  186 taatgttatataattg--tatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||| |||||  |||||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  24605 taatgttatataattggatatatatattgcatgaaattatgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 24690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Original strand, 38495 - 38558
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||||||    
T  38495 tagcgataggggcttgatgctccggaagtataatagtactcaaatagcgattggagcttgatgc 38558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 478
Target Start/End: Complemental strand, 42593 - 42505
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggag 478  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    |||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  42593 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggatc-atgccctggaggtttgtactcaccacgatggag 42505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 116; Significance: 1e-58; HSPs: 5)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 80 - 476
Target Start/End: Original strand, 53395 - 53784
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||    
T  53395 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgt 53494  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttga-tgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggt 278  Q
    ||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||| || || | ||| | |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  53495 tgtttataatgtgatataattgtatatacattacttgaatt-atatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-t 53592  T
Q  279 tttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatata 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||     | || ||||| ||||||||||||| | |||||    
T  53593 tttgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatga-----aagaagatgttccaaattattggatttatata 53687  T
Q  378 agagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    |||| | ||    | ||||||| | | |  || |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||||    
T  53688 agaggtcgttgtttataagatgatga-gttgttgagtccatgcattcacatt-cattgttgggggcttgatgccctagagcctt-tgctcaccacgttgg 53784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 381
Target Start/End: Original strand, 53316 - 53691
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||      |  ||||||  | |||| ||||| | || |    |||||||||||||||||||||    
T  53316 gaactcgccatagcgagtagaggccctcgcctcgcgagtccttgtgagacagaacaccttgtaaggtttattgtgtcctttgtcgcacgagttgatgtga 53415  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||| |||| ||||||| ||||  | ||| || | ||||||||  |||||| ||||||||    
T  53416 gttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgtttatgatttgatgttgtttataatgtgatataatt 53515  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
    ||||||||||||| |||  |||| | || || |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  53516 gtatatacattacttga-attatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactgcctatgttgc 53613  T
Q  300 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    || |||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||     | || ||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  53614 tgtttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatga-----aagaagatgttccaaattattggatttatataagag 53691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 53820 - 53895
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53820 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctgaattggtaccacatgc 53895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 52249 - 52325
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  52249 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 52325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Original strand, 8062 - 8167
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||       |||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||    
T  8062 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagcactagtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatatg 8161  T
Q  100 agttga 105  Q
     |||||    
T  8162 ggttga 8167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 115; Significance: 4e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 232 - 449
Target Start/End: Original strand, 38700 - 38916
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 330  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||    
T  38700 tttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatgagtagg 38798  T
Q  331 tctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  38799 tctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattgga-ttatataagaggttttcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttc 38897  T
Q  431 attgttgggggcttgatgc 449  Q
    |  | | ||||||||||||    
T  38898 agcgataggggcttgatgc 38916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 38941 - 39023
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  38941 tagcgatacgggcttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctttgtattggtaccacatgc 39023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 38906 - 38960
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38906 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgatacgggcttgatgc 38960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 233 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 16902 - 16683
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16902 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16804  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |     
T  16803 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattgga-ttatacaagagttggtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcataataa 16705  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctgg 454  Q
     |||| ||||||||||||||||    
T  16704 agttgagggcttgatgccctgg 16683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 17132 - 17078
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||    
T  17132 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacctatttacagaat 17078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 502 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 16610 - 16538
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| ||  |||| |  |||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  16610 ggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaata-cgttgggggcttgatgccctggataggtaccacatgc 16538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 113; Significance: 6e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 193029 - 193314
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga-tgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttg 385  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | ||||| | |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |      
T  193029 ctgcctatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttccaaattattggactaatataagagatga 193128  T
Q  386 tcaaattaagatg-tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
    | |  |||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  193129 tga--ttaagatgctttaacagttagagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcttta 193224  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  193225 gctcaaattaacgatgggggc-tcatgccctggaagtatattaatactcaaataatgttgggggc-tcatgccctatattggtaccacatgc 193314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 106; Significance: 9e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 474
Target Start/End: Original strand, 1565 - 2031
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||| | |||| ||||||||  | ||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||    
T  1565 gaactcgccatagcgagtagaggctctcgcctcgtgagatgcccaattacagaacaccttgttaggttacatgtgacctttgtcgcacgagttgatgtga 1664  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||   |||||| ||||||||||  | |||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| || | | ||||||  |||||| |||||| |    
T  1665 gttgatcttgagggtaagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaattatatgatttgacgttgttaataatgtgatataaat 1764  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    |||||| |||||||| |  |||| | ||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  ||  ||||  ||||| ||||||||     
T  1765 gtatatgcattacat-aaattatatatgatg-ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-attttatatactacctatgtta 1861  T
Q  299 ctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taaga 396  Q
     |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||   |||||||  |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||    | |||||    
T  1862 atgttagtttaataactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgaag--gatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaaga 1956  T
Q  397 tgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgtt 474  Q
    || |||||  || |||||||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  1957 tg-ttaagttgttgagtccatgcacactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc-ctgtgctcaccacgtt 2031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 2069 - 2144
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2069 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctggatttgtaccacatgc 2144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 38623 - 38339
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||| ||   || |||||||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||    
T  38623 acagaataccttgttgggttaaatgagacctttatcgcacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgt 38524  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 248  Q
    ||||||||||||||||| ||| || | ||||||   ||||||| |||||  ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||     
T  38523 ttcagtaagcctgaattatatgatttgatgttgagattaatgtgatatatatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttgttgaa 38425  T
Q  249 ttacatttgatattgttatatcat--gctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    || ||||||||||||| |||||||  ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38424 ttgcatttgatattgtcatatcatgagct-gttttatatactgcctatgttgctgtttgttcattaactaagctgcatgagtcggtc 38339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20044 - 19761
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| | || |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  20044 ctgcctatgctactattgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagat 19947  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||    
T  19946 aatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagttttgtactcaacacgatggagcttta 19850  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| || ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  19849 gctcaa-ttagcgatgggggctc-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 19761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 38278 - 38206
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  38278 gggcttgatgccctggaagtatattaatact-taata-cgttgagggcttgatgccctggactggtaccacatgc 38206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 428 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 38326 - 38297
Alignment:
Q  428 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38326 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 38297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 405 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10247 - 10080
Alignment:
Q  405 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggc 504  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || | |||| |||| ||||||||||||  ||  ||| |||| ||||    
T  10247 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgtttgggccttgatgccctggagcctt-tgctcaacacgatggagctttagcacaa--tagtgatgggggc 10151  T
Q  505 ttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  10150 ttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctagattggtaccacatgc 10080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 288 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36517 - 36235
Alignment:
Q  288 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagttt 384  Q
    |||||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |     
T  36517 tgcctatgctactattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagatg 36420  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttag 484  Q
     | |  ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | |||||||||||    
T  36419 atga--ttgtgatgtttaagaggttgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacatgatggagctttag 36323  T
Q  485 cttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| |||||||||||    
T  36322 ctcaaat-agcgatgggggctc-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggc-tcatgccctgaattagtaccacatgc 36235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 5)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Original strand, 15599 - 15764
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||  ||||||||||||||||||||    
T  15599 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgagctaaccagttacagaatgccttgtttatgttaaatgtgatctttgtcgcacgagttgatgtg 15698  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 165  Q
    |||||||||| ||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15699 agttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt 15764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 220 - 476
Target Start/End: Original strand, 15763 - 16017
Alignment:
Q  220 ttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagc 318  Q
    ||||||||||||| |  |||| || |||||| |||| ||||||||||||||||  || ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  15763 ttatgtttgatgtatatgatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatcatgattt-gcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagc 15861  T
Q  319 tgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccat 417  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||   || |||||| ||||    | ||||| | |||||  || | ||| ||    
T  15862 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaag-ttaagttgttgtgtctat 15960  T
Q  418 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  15961 gcattagca-ttcattgttgggggtttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 16017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 288 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 178961 - 178680
Alignment:
Q  288 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagttt 384  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |     
T  178961 tgcctatgctgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagatg 178864  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttag 484  Q
     | |  ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||| | || ||||||||||||||||| | || | |||||||||||    
T  178863 atga--ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggc-tcataccctggagctttgtacttaacatgatggagctttag 178767  T
Q  485 cttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||  |||||||| |||||| |||||||||  ||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  178766 ctcaa--tagcgatgggggctt-atgccctggcggtatattaacactcaattagcgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 178680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 501 - 571
Target Start/End: Original strand, 16056 - 16124
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccac 571  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  16056 gggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctagattggtaccac 16124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 142469 - 142394
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||  | || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  142469 tgagggcttgatgccttgggagtatatttatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctg-gttggtaccacatgc 142394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 5)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 30050 - 29856
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30050 ttgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 29952  T
Q  333 taagtt-gatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 428  Q
    ||||||  || |||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29951 taagttcaattaagatgatgaagttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgattccatgcattagcatt 29856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 3704 - 3521
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  3704 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagtata-catatgttaggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 3607  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  3606 aaaataacgatgggggctt-atgccctggaagtatatttatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8135 - 7952
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| |||| ||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  8135 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagtata-catatgttaggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 8038  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  8037 aaaataacgatgggggctt-atgccctggaagtatatttatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 7952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #4
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 29811 - 29728
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  29811 tagcgattggggcttgatgctctggaagtgtaataatactcaaataccgataggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 29728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 29846 - 29792
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29846 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 29792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 101; Significance: 9e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 244 - 454
Target Start/End: Original strand, 1336 - 1541
Alignment:
Q  244 ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatga 343  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||| | | ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  1336 ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatact-catgtgttattgttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 1434  T
Q  344 agatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggct 443  Q
    |||||| | |   ||||||||||||| || || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||    
T  1435 agatgaagtt---ccaaattattggatta-tacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggct 1530  T
Q  444 tgatgccctgg 454  Q
    |||||||||||    
T  1531 tgatgccctgg 1541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 9016 - 9300
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  9016 ctgcctatgctgctattattatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagat 9113  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  9114 gatga--ttatgatgtttaagaaatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagcatta 9210  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  9211 gctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaattaacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 9300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 1566 - 1599
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1566 tgggggcttgatgccctgaattggtaccacatgc 1599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 5)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 10891 - 10692
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10891 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 10793  T
Q  333 taagttgatgaagatgatg------atgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| |||||| ||      |||| ||||||||||||||| || ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10792 taagttgattaagatgttgataacaatgttccaaattattggact-atttaaaaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 10694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10516 - 10434
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10516 tagcgataggggtttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 10434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10584
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10647 tagcgattggggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgc 10584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 10682 - 10628
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10682 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 10628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 10603 - 10541
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10603 tagcgataggggcttgatgctctggat-tataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 10541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 97280 - 96984
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||    
T  97280 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgt 97182  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctgg 277  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |    
T  97181 tgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-g 97084  T
Q  278 ttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatat 376  Q
    ||||   ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||     | |||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  97083 ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatga-----aagatgttgttccaaattattggatttatat 96989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 80 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 106558 - 106262
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||  |  || || | ||||    
T  106558 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatagatgatttgatgt 106460  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctgg 277  Q
    ||||  |||||| ||||| |||||||| |||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |    
T  106459 tgttaataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-g 106362  T
Q  278 ttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatat 376  Q
    ||||   ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||| |||     | |||| ||| ||||||||||||| | ||||    
T  106361 ttttatgtactgcctatgttgctgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatga-----aagatgttgttccaaattattggatttatat 106267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 106171 - 106095
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  106171 tgagggcttgatgccttggaagtatattaatactcaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 106095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 3)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 233 - 456
Target Start/End: Original strand, 161133 - 161355
Alignment:
Q  233 ttgagatgttg-ttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 331  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||  || ||||| ||||||| | ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  161133 ttgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgc-tgtgtcgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggt 161231  T
Q  332 ctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 431  Q
    |||||||| | |||||||||| ||  |||||||||||| | ||||||||| ||||| | |||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  161232 ctaagttggttaagatgatgaagtttcaaattattgga-ttatataagaggttgtcgatttaaaatgtttaagaagtcgagtccatgcattaacatttca 161330  T
Q  432 ttgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
      | | |||||||||||||||||||    
T  161331 gcgataggggcttgatgccctggag 161355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 517 - 575
Target Start/End: Original strand, 161396 - 161454
Alignment:
Q  517 aagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  161396 aagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 161454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 501 - 554
Target Start/End: Original strand, 161338 - 161390
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatg 554  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  161338 gggcttgatgccctgga-gtatattaatgctcaaatagcgatagaggcttgatg 161390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 252 - 476
Target Start/End: Original strand, 23901 - 24119
Alignment:
Q  252 catttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgat 350  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||    
T  23901 cattcgatattgttatatcatgatgattt-gcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagt---tgaagatgat 23996  T
Q  351 gatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 450  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||     |||| || |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23997 gatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttg-ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggattgatgcc 24094  T
Q  451 ctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||||| || | |||||||||||||    
T  24095 ctggagcctt-tgctcaccacgttgg 24119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 24155 - 24230
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24155 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatac-ataata-cattgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 24230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 93; Significance: 5e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9428 - 9133
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtga 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  9428 gaactcgccatggcgagtagaggctctcgcctcgcgagctacccatttacagaatgccttgctaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagttgttgtga 9329  T
Q  101 gttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataatt 200  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||  |  | |||||||| |||| |||| || || |||||| ||||| |||| ||||| | |||||| | || |    
T  9328 gttgatcttagatgttaagaactaagttgcctagcatgctgttgatgttccagtgagtct-aattgtttaatccaatgatgttgatgatgttaaacaaat 9230  T
Q  201 gtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| ||||||  |  || |||| ||| || |||| ||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||    
T  9229 gtataaacattgcatga-tttatg-ttgatg-atatgaagttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgat-gagttgcatactgcctatgttgct 9134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 456
Target Start/End: Complemental strand, 224 - 5
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| || ||||| |||||   | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  224 ttgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactat-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtc 126  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 432  Q
    ||||||||| |||||||||| || || |||||||||| | ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| |    
T  125 taagttgattaagatgatgaagttcccaattattgga-ttatacaagag-ttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgtattggca-ttctt 29  T
Q  433 tgttgggggcttgatgccctggag 456  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  28 tgttgggggcttgatgctctggag 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23907 - 23625
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  23907 ctgcctatggtgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagat 23810  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  23809 gatga--ttgtgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccatggagctttgtactcaacacgatagagcttta 23713  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| ||  ||| |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| | |||||||||||||||    
T  23712 gctcaa--tagtgatgggggctt-atgccctggaggtatattaatactcaaatagcgatgggagc-tcatgccccgaattggtaccacatgc 23625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 900 - 529
Alignment:
Q  3 actcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagt 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||       ||||||  | ||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||    
T  900 actcgccatggcgagtagaggccctcacctcgcgagctagtgttagacagaacaccttgttaggttaaatgagacctttgtcgcacgagttgatgtgagt 801  T
Q  103 tgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgt 202  Q
    ||||| ||  |||||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || || |   |||| | |||| | |||    
T  800 tgatcatat-ggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcctgaattatatgatttgatcttttaaataatatgatattaatgt 702  T
Q  203 atatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgct 300  Q
    |||| ||||||||||  |||| | ||||| ||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||  || |||||  || ||||||||||||||    
T  701 atatgcattacatga-attatatatgatg-ttgggatgttgttgatttgca-ttgatattgttatatcatgaact-gttttatatgctgcctatgttgct 606  T
Q  301 g-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    | |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  605 gtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----attatgatgttccaaattattggatttatataagag 529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 401 - 326
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| |  || |||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  401 tgagggcttgattccctggaagtatattaatact-taata-ccttgagggcttgaagccctggattggtaccacatgc 326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Original strand, 12293 - 12492
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| || | |||||||| ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12293 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggtc 12391  T
Q  333 taagttgatgaa------gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||      ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12392 taagttgattaagatgttgatgatgatgtaccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtacatgcattagca 12490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Original strand, 12581 - 12664
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||||||||||| | | ||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12581 tagcgattggggcttgatgctccgaaagtataataatattcaaatagcgattgggacttgatgccctgtattggtaccacatgc 12664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 502 - 555
Target Start/End: Original strand, 12547 - 12600
Alignment:
Q  502 ggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12547 ggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgc 12600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Original strand, 12502 - 12556
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  12502 gggcttgatgctccggaaatataataatactcaaatagcgattgaggcttgatgc 12556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 9360 - 9161
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||  ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 9262  T
Q  333 taagttgatgaagatg------atgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||||||||| ||||||      | ||||| ||||||||||||||| || ||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9261 taagttgattaagatgttgataacgatgttccaaattattggact-atttaaaaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 9163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 492 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8985 - 8903
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||  ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8985 tagcgataggggtttgatgctctgga-gtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgctctgtattggtaccacatgc 8903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 492 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 9116 - 9053
Alignment:
Q  492 tagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    |||||||  |||||| |||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9116 tagcgattggggcttaatgctccggaagtataataatactcaaatagcgataggggcttgatgc 9053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 9151 - 9097
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgc 555  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  9151 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttaatgc 9097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 91; Significance: 8e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 233 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 11406 - 11207
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  11406 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtc 11308  T
Q  333 taagttgatgaa------gatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    ||| ||||| ||      |||||| |||| ||||||||||||||| || |||||| | ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11307 taatttgattaagatgttgatgataatgttccaaattattggact-atttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaaca 11209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 566
Target Start/End: Complemental strand, 12724 - 12550
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  12724 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 12626  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggt 566  Q
    |||||| |||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||  | ||||||| | |||||||| ||||||    
T  12625 aattagtgatgggggctt-acgctctggaagtatactaatactcaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggt 12550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 11197 - 11123
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11197 gggcttgatgctccggaagtataataatactcaaatagcgattggggcttgatgctccgtattggtaccacatgc 11123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 311 - 57
Alignment:
Q  49 acagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgt 148  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||   ||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||    
T  311 acagaataccttgttaggttaaatgtgacctttgtcgcacaagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttgt 212  T
Q  149 ttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgac 248  Q
    |||||||||||| ||||  || || | ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||  |||| | |||||||||||||||| ||||     
T  211 ttcagtaagcctaaattaaatgatttgatgttgttaataatgttatataaatgtatatgcattacatga-attatatatgatgtttgagatgttattgat 113  T
Q  249 ttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgtt 303  Q
    || ||| ||||||||||||||||||  || |||||   |||||||||||||||||||    
T  112 ttgcatctgatattgttatatcatgaact-gttttatgtactgcctatgttgctgtt 57  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 6)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 229 - 460
Target Start/End: Original strand, 16095 - 16320
Alignment:
Q  229 atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagt 327  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||    
T  16095 atgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatg-ttgttttgcatactacctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagt 16193  T
Q  328 cggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaat-taagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca 426  Q
    |||||||||||||     | |||||||| ||||||||||||| | ||||||||| | ||    | ||||||| || ||  || ||||||||||||| |||    
T  16194 cggtctaagttga-----aagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatg-ttgagttgttgagtccatgcattcgca 16287  T
Q  427 tttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 460  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16288 -ttcattgttgggggcttgatgccctggagcttt 16320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 231 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13252 - 13147
Alignment:
Q  231 gtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcg 329  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||    
T  13252 gtttcagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgct-gttttgcatactgcctatgttgttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 13154  T
Q  330 gtctaag 336  Q
    |||||||    
T  13153 gtctaag 13147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 15867 - 15921
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15867 gaactcgccatagcgagtataggccctcgcctcgcgagttgcccagttacagaat 15921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 16334 - 16409
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || ||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16334 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatgc 16409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2550 - 2474
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | || || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  2550 tgagggcttgatgccctagaagtatattaatacttaaaca-tgttgaggacttgatgccctggattggtaccacatgc 2474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 285 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 2732 - 2640
Alignment:
Q  285 tactgcctatgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    |||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||     | |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  2732 tactgcctatgttgttgcttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgttgttccaaattattggatttatataagag 2640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 90; Significance: 3e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 32345 - 31985
Alignment:
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataat 199  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||    ||| |  | ||||||||  ||||||| ||||      
T  32345 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagactgatgcatatgaattgatgttgtttataatgttgtata-- 32248  T
Q  200 tgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgc 299  Q
        ||||||||| ||| | ||||||| |||  |||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||     
T  32247 ----tatacattaaatg-gattatgtt-gataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgt 32155  T
Q  300 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatg 398  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||   |||    ||||| ||    
T  32154 tgtttgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaa---gatgatgatgatgatgttccaaattattggact--tataagatgatgttgttttaagttg 32060  T
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
     |||||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  32059 -ttaagatgatgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 31985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 31946 - 31916
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31946 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 31916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 89; Significance: 1e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 287 - 549
Target Start/End: Original strand, 7870 - 8129
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatg---tcccaaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||| | |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||| ||   | ||||||||||||| ||| ||||||| |    
T  7870 ctgcctaggctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatatgagatgatcaagatgatgttgaacttccaaattattgga-taa-ataagagat 7967  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||    
T  7968 gatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattaacatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagcatta 8064  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggct 549  Q
    ||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8065 gctcaaattagtgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggct 8129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 88; Significance: 5e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6057 - 5874
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||     
T  6057 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagctttagctc 5960  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  5959 aaattagcgatgggagctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgttgggggctt-atgtcctgaattggtaccacatgc 5874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 6159 - 6095
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| |||| |||||||||    
T  6159 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatg 6095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 291 - 575
Target Start/End: Original strand, 15736 - 16015
Alignment:
Q  291 ctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtttgtc 387  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |  |     
T  15736 ctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagatgatg 15833  T
Q  388 aaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |  ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||    |||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||     
T  15834 a--ttatgatgtttaagagatcaagtccatgcattagcatacatttgttgcgggctc-atgccctggagctttgtactcaacacgatggagcattaactc 15930  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15931 aaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactc-aataacgatgggggctt-atgccctgaattggtaccacatgc 16015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 5e-39
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 10575 - 10855
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccca--aattattggactaatataagagttt 384  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   || ||||||| ||| ||||||| |     
T  10575 ctgcctatgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaatattgga-taa-ataagagatg 10672  T
Q  385 gtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttag 484  Q
     | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||    ||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  10673 atga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattaggatacatttgttgggggctc-atgccctagagctttgtactcaacacgatggagcattag 10769  T
Q  485 cttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||||||   ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  10770 ctcaaatta---atgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 10855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 18300 - 18016
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||| | ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   ||||||||||| ||| ||||||| |    
T  18300 ctgcctatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatgttgaacctccaaattattgga-taa-ataagagat 18203  T
Q  384 tgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
      | |  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    ||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | |||| ||||||||||    
T  18202 gatga--ttatgatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-ataccctggagcttagtactgaacacgatggagcttta 18106  T
Q  484 gcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  18105 gctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaattattgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 18016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 232 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 1155 - 919
Alignment:
Q  232 tttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 330  Q
    |||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1155 tttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 1057  T
Q  331 tctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 430  Q
    |||||| |||     | || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||  |  || | || || ||  || | ||||||||||||||| |||    
T  1056 tctaagatga-----aagaagatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgatctatgttg-ttgagttgttgtgtccatgcattagca-ttc 964  T
Q  431 attgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||||||    
T  963 attgttgggggcttgatgctctggagcctt-tgctcaccacgttgg 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 883 - 808
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||  || || | ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  883 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact--tattacgttgagagcttgatgccctggattggtaccacatgc 808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 86; Significance: 8e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 8e-41
Query Start/End: Original strand, 236 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23001 - 22869
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 335  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23001 agatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgg-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa 22903  T
Q  336 gttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    |||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  22902 gttgattaagatgatgaagttccaaattattgga 22869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 81; Significance: 7e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 233 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 4812 - 4677
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4812 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgc-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 4714  T
Q  333 taagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattgga 369  Q
    ||||||||| | |||||||| || |||||||||||||    
T  4713 taagttgattaggatgatgaggttccaaattattgga 4677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 10457 - 10274
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  10457 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggtgctc-atgcccttgagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 10360  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  10359 aaattaacgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 10274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 3)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 35073 - 35255
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  35073 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctt-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 35170  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | ||||| ||||||||||||||||||    
T  35171 aaataa-cgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacaatgggggc-tcatgccttgtattggtaccacatgc 35255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 236 - 337
Target Start/End: Original strand, 24304 - 24406
Alignment:
Q  236 agatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctg-gttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    |||||||| ||| || || |||||||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24304 agatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 24403  T
Q  335 agt 337  Q
    |||    
T  24404 agt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 517 - 575
Target Start/End: Original strand, 24403 - 24461
Alignment:
Q  517 aagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24403 aagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 24461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 78; Significance: 5e-36; HSPs: 3)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 399 - 575
Target Start/End: Original strand, 16513 - 16686
Alignment:
Q  399 tttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcga 497  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||| |||||| |||||| ||| || |||    
T  16513 tttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggatc-atgccctggagcttagtactcaacacgatggagcattagctcaaaataacga 16610  T
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  16611 tgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 16686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 407 - 483
Target Start/End: Complemental strand, 20957 - 20881
Alignment:
Q  407 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttta 483  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20957 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggccttgatgccctggagctttgtactcaacacgttggagcttta 20881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 328
Target Start/End: Original strand, 16402 - 16442
Alignment:
Q  288 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16402 tgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0174 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0174
Description:

Target: scaffold0174; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 18609 - 18792
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||| ||||||     
T  18609 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctagagcttagtactcaacacgatggagcattagctc 18706  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| | ||||| |||||||    
T  18707 aaattaacgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaaatggtaacacatgc 18792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 14625 - 14443
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||     
T  14625 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatgtagcattagctc 14528  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14527 aaattagcgaagggggctt-attccctggaagtatattaatactc-aataacgatgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 14443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 39065 - 38883
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| || ||| ||||||     
T  39065 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatgcagcattagctc 38968  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  38967 aaattagcgaagggggctt-ataccctggaagtatattaatactc-aataacgatgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 38883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 23641 - 23459
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||  ||     
T  23641 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattagcata-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtactcaacacgatgtagctttttctc 23544  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||| |||||| || |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  23543 aaattatcgatgggggctt-attccctggaagtatattaatactc-aataacgatgggggc-tcatgccctgtattggtaccacatgc 23459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 4965 - 5041
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4965 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 5041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 75; Significance: 3e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 28578 - 28740
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||      |||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  28578 gaactcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacgagttgatgtg 28677  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctga 162  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  28678 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga 28740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 279 - 478
Target Start/End: Original strand, 28813 - 29006
Alignment:
Q  279 tttgcatactgcctatgttgctgt--tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatat 376  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||  ||     
T  28813 tttgcatactgcctatgttgctgtaatgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact--taa 28907  T
Q  377 aagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||   |||     |||| || |||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  28908 aagatgatgttgttctaagttg-ttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 29004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 501 - 574
Target Start/End: Original strand, 29043 - 29114
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  29043 gggcttgatgccctggaagtatattaatact-tacta-cgttgagggcttgatgccctagattggtaccacatg 29114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 4857 - 5143
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||| ||||||||| ||  ||   |||||||||||   ||||||||| |    
T  4857 ctgcctatgctgctattattatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatataagagat 4956  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
      | |  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||     |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||| || | |||||| ||    
T  4957 gatga--ttaagatgttttaagagatcgagtccatgcaatagcatagatatgttgggggctt-atgccctaaagcttagtactcaacatgatggagcatt 5053  T
Q  483 agcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | || |||||||||||||||||||||    
T  5054 agctcaaattagcgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactc-aataatgatgggggc-tcataccctgtattggtaccacatgc 5143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 496 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 20529 - 20450
Alignment:
Q  496 gatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20529 gatgggggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggcttgatgccctgtattggtatcacatgc 20450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 436 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20590 - 20553
Alignment:
Q  436 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20590 tgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgt 20553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 488 - 574
Target Start/End: Original strand, 14 - 100
Alignment:
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  14 aaattagcgatgggggcttgatgccctggaagtatattaaaactcaaatagcgatggggtcttcatgccctgtattagtaccacatg 100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 21856 - 22142
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   |||||||||||   |||| |||       
T  21856 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatga 21955  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctt 481  Q
    ||    |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  21956 tg----attaagatgttttaagagattgagcccatgcattagcattacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcat 22050  T
Q  482 tagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || ||| || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  22051 taactcaaaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattgataccacatgc 22142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 287 - 575
Target Start/End: Original strand, 29748 - 30034
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtccc---aaattattggactaatataagagtt 383  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| ||||||||| ||  ||   |||||||||||   |||| |||       
T  29748 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatatatatgagatga 29847  T
Q  384 tgtcaaattaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt-gttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctt 481  Q
    ||    |||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  29848 tg----attaagatgttttaagagattgagcccatgcattagcattacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcat 29942  T
Q  482 tagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || || ||| || ||||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||| ||||||||||    
T  29943 taactcaaaataacgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattgataccacatgc 30034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 186 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25275 - 25121
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgc 283  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||| || |||| ||||| |||||||||||  ||| ||||      
T  25275 taatgtgatatatttgtatatacattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcatgagctg-ttttat 25179  T
Q  284 atactgcctatgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 340  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25178 atactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 25121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 176 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 620
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg 273  Q
    ||||||||  |||||| |||||| ||||||| |||||||||| || || | |||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||||||||    
T  715 atgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcatg 620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 24958 - 24925
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24958 tgagggcttgatgccctagaagtatattaatact 24925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 32406 - 32226
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctt 487  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||  |||||||| ||||| ||   || |||| |||||| ||||||     
T  32406 attaagatgttttaagagatcgagtccatgcattatcata-catatgttgggggctc-atgccctgaagcttagt---caacacgatggagcattagctc 32312  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  32311 aaattaacgatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactcaaataacgatgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 32226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 19911 - 19986
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19911 tgagggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaa-tat-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 19986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7499 - 7450
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  7499 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 7450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 14618 - 14569
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  14618 ctgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaag 14569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 66; Significance: 7e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 281071 - 281233
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| || ||||| |||| | ||    
T  281071 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctcaaaataacgatgggggc-tcat 281168  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  281169 gccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 281233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 99 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 267916 - 267639
Alignment:
Q  99 gagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgttgttgttaatgttatataa 198  Q
    ||||||||| ||  |||||| |||||||||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||||| ||  ||| || | ||| ||||  |||||| ||||||    
T  267916 gagttgatcataagggtaagaaactaagttgcttagcttactgctgttgtttcagtaagcctggatgatatgatttgatggtgttaataatgtgatataa 267817  T
Q  199 ttgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgt 296  Q
     ||||||| |||||||||| || || | ||||||| ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||  || |||||  ||||||| |||||    
T  267816 atgtatatgcattacatgaatt-atatatgatgtt-gagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaact-gttttatatactgcatatgt 267720  T
Q  297 tgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    || || |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||     | |||||||| |||||||||| || | |||||||||    
T  267719 tgatgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgatgttccaaattatttgatttatataagag 267639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 14389 - 14465
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14389 tgagggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaata-agttgagggcttgatgccctgcattggtaccacatgc 14465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 65; Significance: 3e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Original strand, 46883 - 47063
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaa-gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |    
T  46883 attaagatgttttatgagattgagtccatgcattagcatacatttgttaggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcattagctca 46981  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||  | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46982 aaataatgttgagggctt-atgccctgaaagtatattaatactaaaat---gttgggggctt-atgccctgtattggtaccacatgc 47063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1843 - 1659
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  1843 attaagatgttttaagagattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctca 1745  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||| || ||||| | || | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  1744 aaaataacgatgggagc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 1945 - 1881
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  1945 ctgcctatgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 64; Significance: 1e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 452 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 547 - 426
Alignment:
Q  452 tggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttg 551  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||  | |  ||||||| |     
T  547 tggagctttgtactcaccacgatggagctttagctcaaattagcgatggaggctt-atgccctggaagtatattaatactcaataacctttgggggc-tc 450  T
Q  552 atgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  449 atgccctgaattggtaccacatgc 426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 330 - 482
Target Start/End: Complemental strand, 688 - 539
Alignment:
Q  330 gtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagagtttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 429  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |  | |  ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  688 gtcttagttgttgaagataatgatgttccaaattattggactaatataagagatgatga--ttatgatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatac 591  T
Q  430 cattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagcttt 482  Q
      ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  590 atttgttgggggc-tcaggccctggagctttgtactcaccacaatggagcttt 539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 233 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 4415 - 4300
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 332  Q
    |||||| |||||||| || || |||||||| |||| ||||| || ||||| ||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4415 ttgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactac-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 4317  T
Q  333 taagttgatgaagatga 349  Q
    ||||||||| |||||||    
T  4316 taagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1655 (Bit Score: 60; Significance: 3e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold1655
Description:

Target: scaffold1655; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 504 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1243 - 1172
Alignment:
Q  504 cttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  1243 cttgatgccttggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggtttgatgctctgtattggtaccacatgc 1172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2795 - 2612
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  2795 attaagatgttttaagtgattgagtccatgcattaccatacatttgttgggggctc-atgcccttgagctttgtactcaccacgatggagctttagctca 2697  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||  |||| |||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  2696 aaataatgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatactaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 2612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 390 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6461 - 6278
Alignment:
Q  390 attaagatgttt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  6461 attaagatgttttaagggattgagtccatgcattaccatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagctttagctca 6363  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    || ||  |||| |||| | |||||||| ||||||||||||||  |||||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  6362 aaataatgatgggggc-tcatgccctgaaagtatattaatacaaaaataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 6278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 58; Significance: 4e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 2070 - 2207
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttgtt-aggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtg 99  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||      |||||||||| | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2070 gaactcgccatggcaagcagaggctctcgcctcgcgagtacttgtgttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatccttgtcgcacgagtggatgtg 2169  T
Q  100 agttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtctt 137  Q
    |||| ||||||||||| || ||||||||||||| ||||    
T  2170 agttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatctt 2207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0634 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 474 - 575
Target Start/End: Original strand, 4896 - 4994
Alignment:
Q  474 tggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacat 573  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  4896 tggagctttagctcaaat-agcgatgggggcttgatggcctggaagtatattaatact--tatagcaatgggggctttatgccctggattggtaccacat 4992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 3590 - 3665
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3590 tgagggcttgatgccttggaagtatattaatactta--tagcgatgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 3665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 233 - 292
Target Start/End: Original strand, 3529 - 3588
Alignment:
Q  233 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatactgcct 292  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  3529 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcct 3588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 410 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 230 - 169
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  230 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1276 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold1276
Description:

Target: scaffold1276; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 435 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2193 - 2057
Alignment:
Q  435 ttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaa 534  Q
    |||||||||| || |||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||| ||||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  2193 ttgggggctt-ataccctggagcttactactcaccacgatggagcattagctcaaattaaagatgggggctt-atgccctggaagtatattaatactc-a 2097  T
Q  535 atagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||  | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  2096 ataaagttgggggc-tcatgccctgtatttgtaccacatgc 2057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 14440 - 14365
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14440 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaata-cgttgacggcttgatgccctggattggtaccacatg 14365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 53; Significance: 4e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 498 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 12435 - 12360
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||  |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12435 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaata-cgttgacggcttgatgccctggattggtaccacatg 12360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 2525 - 2451
Alignment:
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2525 agggcttgatgccctggaagtatattaatacttaaata-cgttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 2451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 252 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2780 - 2694
Alignment:
Q  252 catttgatattgttatatcatg--ctggttttgcatactgcctatgttgctgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||| ||||  ||||||||||||||||||||  | | || |||||||||||||||||||||||||    
T  2780 catttgatattgttatatcatgagctg-ttttatatactgcctatgttgctgtttgtctattgactaagctgcatgagtcggtctaag 2694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 22130 - 22054
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22130 tgagggcttgatgccctgaaagtatattaatactcaaata-agttgagggcttgatgccctgcattggtaccacatgc 22054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 401 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 30291 - 30235
Alignment:
Q  401 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30291 taagacgtcaagtccatgcattagcattacattgttgggggcttgatgccctggagc 30235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 30398 - 30310
Alignment:
Q  288 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtcccaaattattggactaatataagag 381  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||| |||     | |||| ||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  30398 tgcctatgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatga-----aagatgttgttccaaattattggatttatataagag 30310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 6546 - 6499
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 457  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6546 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagc 6499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 6439 - 6363
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||| |  || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6439 tgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctgaaata-cgttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 6363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 7305 - 7464
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  7305 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtaatcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctt-at 7402  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||| |||||||||| ||||   | ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  7403 gccctgaaagtttattaatactaaaat---gttgggggc-tcatgccctgtattggttccacatgc 7464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 44; Significance: 9e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 225585 - 225465
Alignment:
Q  176 atgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttg-atgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgc 274  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||| |||  |||| | || ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||    
T  225585 atgttgtttataatgtgatataattgtatatgcattacttga-attatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgc 225488  T
Q  275 tggttttgcatactgcctatgttg 298  Q
    | ||||||||||||| ||||||||    
T  225487 t-gttttgcatactgactatgttg 225465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 410 - 476
Target Start/End: Complemental strand, 225399 - 225335
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttgg 476  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||    
T  225399 gagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctt-tgctcaccacgttgg 225335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 294 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12024 - 11982
Alignment:
Q  294 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12024 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 12281 - 12228
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaa 54  Q
    ||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||| ||||||||    
T  12281 gaactcgccatggcgagtagaggctctcacctcgcgagttgcccaattacagaa 12228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1551 - 1475
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  1551 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccttggattggtaccacatgc 1475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0810 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0810
Description:

Target: scaffold0810; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 3284 - 3195
Alignment:
Q  1 gaactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaattctttg-ttaggttaaatgcgatacttgtcgcacg 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  | ||||||||||| | ||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3284 gaactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgtgaattgactagttacagaatgccttgtttaggttaaatgcgatctttgtcgcacg 3195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 4867 - 4943
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  4867 tgagggtttgatgccctggaagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctgggttggtaccacatgc 4943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Original strand, 2259 - 2378
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  2259 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctt-at 2356  T
Q  510 gccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  2357 gccctgaaagtatattaatact 2378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1815
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    |||||||| |||||||||    ||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||| |||||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  1656 gagtccatacattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagccttgtcctcaccacgatggagcattagctcaaaataatgttgggggctt-at 1753  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| |||||||||||||||   |||  | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  1754 gccctgaaagtatattaatact---ataatgttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 1815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 1457 - 1375
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1457 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctt-atgccctggagctttgtactcaccacg 1375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 4371 - 4213
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || ||| ||| ||  | || ||| |  ||    
T  4371 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggaacatttgctcaaaataatgttg-ggggtgcat 4274  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatg 574  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||   | |||||| || |||||||| ||||||||||||||    
T  4273 gccctgaaagtatattaatactaaaat---gttggggg-ttcatgccctgaattggtaccacatg 4213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 390 - 531
Target Start/End: Original strand, 6559 - 6699
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagctta 488  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | |||||| || ||| |    
T  6559 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctt-atgccctagagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 6657  T
Q  489 aattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    || ||  | || |||||| |||||||  |||||||||||||||    
T  6658 aaataatgttgggggctt-atgccctaaaagtatattaatact 6699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 408 - 575
Target Start/End: Original strand, 17285 - 17445
Alignment:
Q  408 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttg 507  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||   | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||| || ||| ||| ||  | || ||||||     
T  17285 tcgagtccatgcattagcatacaattgttggggc--taatgccctggagcttcatactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctt- 17381  T
Q  508 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |   | ||||||| | |||||||||||| |||||||||||    
T  17382 atgccctgaaagtatattaatactaaatt---gttgggggc-tcatgccctgtattagtaccacatgc 17445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Original strand, 27300 - 27419
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttga 508  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||| || ||| |||| |  | || |||||| |    
T  27300 gagtccatgcattagcatt-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggctt-a 27396  T
Q  509 tgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  27397 tgccctgaaagtatattaatact 27419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 68817 - 68698
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttga 508  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||| || ||||||||| |||||| || ||| |||| |  | || |||||| |    
T  68817 gagtccatgcattagcatt-catatgttgggggctc-atgccctggagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggctt-a 68721  T
Q  509 tgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  68720 tgccctgaaagtatattaatact 68698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 1741 - 1622
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| | |||||| || ||| |||| |  | || |||||| ||    
T  1741 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccatgatggagcatttgctcaaataattgttgggggctt-at 1644  T
Q  510 gccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  1643 gccctgaaagtatattaatact 1622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 100 - 32
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagc 479  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  100 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagc 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 15028 - 14871
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    ||||||||||||||||||    ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| ||| ||  | || |||||| ||    
T  15028 gagtccatgcattagcatacatttgttgggggctca---ccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataatgttgggggctt-at 14933  T
Q  510 gccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||||||||||||| || |   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  14932 gccctgaaagtatattaatactaaatt---gttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 14871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 17354 - 17278
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||| |||  ||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17354 tgagggcttgatgccctgggagtgaatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 17278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 410 - 575
Target Start/End: Original strand, 19462 - 19623
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttg 507  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||  ||||||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||  |||| |  | || ||||||     
T  19462 gagtccatgcattagcataacatatgttgggggctc-atgccctagagccttgtcctcaccacgatggagctttagctcaaaataattgttgggggctt- 19559  T
Q  508 atgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || |   | ||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  19560 atgccctgaaagtatattaatactaaact---gttgggggc-tcatgccctgaattggtaccacatgc 19623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 10405 - 10481
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10405 tgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 36030 - 35954
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| |||||| ||| |||| || |||||| |  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36030 tgagggcttgattccctgggagtgtatttatgctcaaacaa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 35954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36248 - 36199
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    |||||||||||| ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36248 ctgcctatgttgttgttgtatattaattaagctgcatgagtcggtctaag 36199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Original strand, 55995 - 56071
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55995 tgagggcttgatgccctgtgagtatatttatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 56071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 560
Target Start/End: Original strand, 55952 - 56013
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgt 560  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  55952 tgagggcttgatgccctgggagtatattaatgctcaaata-agttgagggcttgatgccctgt 56013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 285 - 334
Target Start/End: Original strand, 206575 - 206624
Alignment:
Q  285 tactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 334  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206575 tactgcctatgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 498 - 571
Target Start/End: Original strand, 206757 - 206829
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccac 571  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||||| ||| |||||||    
T  206757 tgagggcttgatgccctgagagtatattaatgctcaacta-cgttgagggcttgatgccctggatttgtaccac 206829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 390 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 359 - 218
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-t 487  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||      
T  359 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagcatttgctca 261  T
Q  488 aaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  260 aaataattgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 500 - 575
Target Start/End: Original strand, 13815 - 13889
Alignment:
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13815 agggcctgatgccctgggagtgtatttatgctcaaataa-gttgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 13889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0839 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0839
Description:

Target: scaffold0839; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 55
Target Start/End: Original strand, 1850 - 1900
Alignment:
Q  5 tcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgagttacccagttacagaat 55  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1850 tcgccatggcgagcagaggctctcgcctcgcgagtgacccagttacagaat 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 390 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 857 - 768
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagc 479  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  857 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccatgatggagc 768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8737 - 8664
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8737 gggcttgatgccatgggagtatatttatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattggtaccacatgc 8664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 88 - 6
Alignment:
Q  186 taatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatat 269  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| | ||||||  ||||||||||    
T  88 taatgttatataattagatatatattgcatgaatt-atgtttgatgattgagatgttgatgacgtgcatttgtaattgttatat 6  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 47 - 105
Target Start/End: Original strand, 12623 - 12681
Alignment:
Q  47 ttacagaattctttgttaggttaaatgcgatacttgtcgcacgagttgatgtgagttga 105  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  12623 ttacagaatgcttgtttaggttaaatgcgattcttgtcgcacgagttgttatgagttga 12681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1821 - 1746
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||  || || | |||||||||| || |||||||||||||||    
T  1821 tgagggcttgatgccctggaaatatattaatact--tattacgttgagagcttgatgccttggattggtaccacatgc 1746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 531
Target Start/End: Original strand, 7448 - 7567
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagcttaaattagcgatgagggcttgat 509  Q
    |||||||||||||||||||    |||||||||||  |||||||| ||||| || ||||||||| |||||| || ||| |||| |  | || |||||| ||    
T  7448 gagtccatgcattagcattaatatgttgggggctc-atgccctgaagcttagtcctcaccacgatggagcatttgctcaaataaatgttgggggctt-at 7545  T
Q  510 gccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  7546 gccctgaaagtatattaatact 7567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 292 - 328
Target Start/End: Original strand, 7328 - 7364
Alignment:
Q  292 tatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7328 tatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 33494 - 33418
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcat-tgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct 486  Q
    ||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||    
T  33494 gagtccatgcattagcataacatatgttgcgggctc-atgccctggagccttgtcctcaccacgatggagctttagct 33418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 1772 - 1704
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagc 479  Q
    ||||| ||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1772 gagtctatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagc 1704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 410 - 479
Target Start/End: Complemental strand, 9455 - 9387
Alignment:
Q  410 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacgttggagc 479  Q
    ||||| ||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9455 gagtctatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcaccacgatggagc 9387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 390 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 44044 - 43964
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcacca 470  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  44044 attaagatgttttagatgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtactcacca 43964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 287 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 44145 - 44104
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  44145 ctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold1419
Description:

Target: scaffold1419; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 2 - 38
Target Start/End: Complemental strand, 374 - 338
Alignment:
Q  2 aactcgccatggcgagtagaggccatcgcctcgcgag 38  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  374 aactcgccatggcgagtagaggccctcgcctcgcgag 338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1419; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 80 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 296 - 165
Alignment:
Q  80 ttgtcgcacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttgtcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgtataatctaatgt 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||| | | |||| | ||  ||||||||| | || || |||||||| ||||||||||||  |  || || | ||||    
T  296 ttgtcgcacgagttgttgtgagtcgatccttggggtaggaaatgaagttgtttatattactattgttgtt-cagtaagcctgatatagatgatttgatgt 198  T
Q  180 tgttgttaatgttatataattgtatatacatta 212  Q
    ||||  |||||| |||||||||||||| |||||    
T  197 tgttaataatgtgatataattgtatatgcatta 165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0289 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0289
Description:

Target: scaffold0289; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 2530 - 2448
Alignment:
Q  390 attaagatgtttaagagg-tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagctttgtactcaccacg 472  Q
    |||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2530 attaagatgttttagacgattgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctc-atgccctggagctttgtcctcaccacg 2448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 500 - 571
Target Start/End: Original strand, 18441 - 18511
Alignment:
Q  500 agggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccac 571  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||  | |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  18441 agggcttgatgccctgggagtgtatttatgctcaaata-agttgggggcttgataccctggattggtaccac 18511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 446 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 8445 - 8360
Alignment:
Q  446 atgccctggagctttgtactcaccacgttggagctttagct-taaattagcgatgagggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  |||| |  | || |||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  8445 atgccctggagctttgtactcaccacgatggagcatttgctcaaaataattgttgggggctt-atgccctgaaagtatattaatact 8360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 1741 - 1668
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||| | ||| |||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1741 gggcttgatgccctaggagtgtatttatgctcaaataa-gttgcgggcttgatgccctggattggtaccacatgc 1668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 501 - 531
Target Start/End: Complemental strand, 3522 - 3492
Alignment:
Q  501 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 531  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3522 gggcttgatgccctggaagtatattaatact 3492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 328
Target Start/End: Original strand, 4999 - 5037
Alignment:
Q  290 cctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  4999 cctatgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtc 5037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 498 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 789 - 713
Alignment:
Q  498 tgagggcttgatgccctggaagtatattaatactcaaatagcgatgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||| ||||||| |||| |||||||| || ||||||||  | || ||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  789 tgagggattgatgctctgggagtatatttatgctcaaataa-gttgagggcttgatgccctggattgataccacatgc 713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Original strand, 7980 - 8013
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7980 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 8013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0486 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0486
Description:

Target: scaffold0486; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 542 - 575
Target Start/End: Complemental strand, 8317 - 8284
Alignment:
Q  542 tgggggcttgatgccctgtattggtaccacatgc 575  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8317 tgggggcttgatgccctggattggtaccacatgc 8284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29558
Alignment:
Q  302 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0356 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0356
Description:

Target: scaffold0356; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 174 - 270
Target Start/End: Original strand, 602 - 697
Alignment:
Q  174 taatgttgttgttaatgttatataattgtatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatc 270  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||  ||||||||||  |||| | |||||||| || || |||||| |  |||||||| ||||||||||    
T  602 taatgttgatattaatgtgatataattgtatacgcattacatga-attatatatgatgtttaagttgatgttgattatcatttgatgttgttatatc 697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 287 - 351
Target Start/End: Complemental strand, 26892 - 26828
Alignment:
Q  287 ctgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatg 351  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| || ||||||    
T  26892 ctgcctatgctgctattgttatttaaccaagatgcatgagtcgatataagatgattaaaatgatg 26828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 288 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3324 - 3276
Alignment:
Q  288 tgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 336  Q
    ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  3324 tgcctatgttgctgttgtatattaattaagctgcatgtgtcggtctaag 3276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University