View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11745_low_27 (Length: 550)

Name: NF11745_low_27
Description: NF11745
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11745_low_27
NF11745_low_27
[»] scaffold0640 (1 HSPs)
scaffold0640 (16-539)||(5128-5651)
[»] scaffold0648 (1 HSPs)
scaffold0648 (133-539)||(3855-4261)
[»] scaffold0274 (1 HSPs)
scaffold0274 (133-539)||(3325-3731)
[»] chr3 (42 HSPs)
chr3 (14-539)||(14896142-14896667)
chr3 (87-539)||(17949624-17950080)
chr3 (76-539)||(19351179-19351641)
chr3 (13-539)||(18146552-18147078)
chr3 (14-536)||(16676942-16677464)
chr3 (58-539)||(25462817-25463298)
chr3 (76-539)||(19399493-19399956)
chr3 (88-539)||(18108236-18108687)
chr3 (14-539)||(19380625-19381141)
chr3 (57-539)||(17941720-17942202)
chr3 (14-536)||(18115697-18116210)
chr3 (14-539)||(19413916-19414432)
chr3 (15-539)||(19392873-19393397)
chr3 (13-539)||(19333740-19334257)
chr3 (14-539)||(18164879-18165404)
chr3 (14-471)||(19461264-19461712)
chr3 (273-539)||(19424669-19424935)
chr3 (349-539)||(19375680-19375870)
chr3 (13-311)||(19436752-19437050)
chr3 (76-293)||(18015879-18016096)
chr3 (14-311)||(19424339-19424636)
chr3 (375-539)||(17727289-17727453)
chr3 (375-539)||(19028518-19028682)
chr3 (375-539)||(18103430-18103594)
chr3 (14-341)||(17727631-17727957)
chr3 (14-341)||(19028860-19029186)
chr3 (76-269)||(19375479-19375672)
chr3 (375-539)||(18016106-18016270)
chr3 (13-236)||(18022524-18022747)
chr3 (380-539)||(19437047-19437206)
chr3 (379-539)||(19464444-19464604)
chr3 (385-539)||(18144284-18144438)
chr3 (14-198)||(24493511-24493695)
chr3 (14-322)||(18143965-18144260)
chr3 (208-294)||(18103335-18103421)
chr3 (76-156)||(19436653-19436733)
chr3 (76-177)||(17941523-17941624)
chr3 (269-341)||(19464334-19464406)
chr3 (265-341)||(17727559-17727635)
chr3 (265-341)||(19028788-19028864)
chr3 (238-273)||(19407112-19407147)
chr3 (392-446)||(24493373-24493427)
[»] chr4 (3 HSPs)
chr4 (14-539)||(2710328-2710853)
chr4 (306-539)||(15535548-15535781)
chr4 (14-294)||(15532083-15532354)
[»] scaffold2156 (1 HSPs)
scaffold2156 (17-218)||(1-202)
[»] chr6 (2 HSPs)
chr6 (375-539)||(13666702-13666866)
chr6 (76-294)||(13666875-13667095)
[»] chr8 (2 HSPs)
chr8 (302-536)||(8459559-8459793)
chr8 (14-342)||(8459202-8459527)
[»] chr2 (2 HSPs)
chr2 (16-117)||(16436121-16436222)
chr2 (16-117)||(16436590-16436691)


Alignment Details
Target: scaffold0640 (Bit Score: 480; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0640
Description:

Target: scaffold0640; HSP #1
Raw Score: 480; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 16 - 539
Target Start/End: Original strand, 5128 - 5651
Alignment:
Q  16 cttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5128 cttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactc 5227  T
Q  116 tttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatatata 215  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5228 tttatctttctggaaacaactttacctccaatttaccaaatgggttttttaatctaaccaaagatatcacctctcttgaccttgcgcaaaataatatata 5327  T
Q  216 tggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaa 315  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5328 tggcgagataccttctagcatgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaa 5427  T
Q  316 ctagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattg 415  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5428 ctagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctactg 5527  T
Q  416 gctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatt 515  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5528 gctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtatttcgatt 5627  T
Q  516 tgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5628 tgatttggattgggttcctccttt 5651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0648 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0648
Description:

Target: scaffold0648; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 133 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 4261 - 3855
Alignment:
Q  133 aacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatatatatggtgagataccttcta 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4261 aacttcacctctaatttaccaaatgggttttttaatctcaccaaagatatcacctctcttgaccttgcgcaaaataatatatatggtgagatacctcgta 4162  T
Q  233 gcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaaca 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4161 gcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaaca 4062  T
Q  333 ccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4061 ccttgatctttccatcaacatgttaagtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctct 3962  T
Q  433 ggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3961 ggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttc 3862  T
Q  533 ctccttt 539  Q
    |||||||    
T  3861 ctccttt 3855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0274 (Bit Score: 383; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0274
Description:

Target: scaffold0274; HSP #1
Raw Score: 383; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 133 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 3731 - 3325
Alignment:
Q  133 aacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatatatatggtgagataccttcta 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  3731 aacttcacctctaatttaccaaatgggttttttaatctcaccaaagatatcacctctcttgaccttgcgcaaaataatatatatggtgagatacctcgta 3632  T
Q  233 gcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaaca 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3631 gcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaaca 3532  T
Q  333 ccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctct 432  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3531 ccttgatctttccatcaacatgttaagtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctct 3432  T
Q  433 ggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttc 532  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3431 ggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttc 3332  T
Q  533 ctccttt 539  Q
    |||||||    
T  3331 ctccttt 3325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 14 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 14896667 - 14896142
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||| | | || ||||| |||||||||||| ||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||     
T  14896667 cacttccctcactattagaactacaattgactgattgcaaactgaacaacttcatgttcaactcatcttttgagtatttgaatttgtcttcaattgtaat 14896568  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||| || | |||| |||| |||||    |||  ||||||    
T  14896567 tcttaatctttctttaaacaacttcacctctcatttgccaaatgggttttttaatctcacaaaaaatctcacctatctttaccttcatgaaagcaatata 14896468  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtc 313  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || || || ||||||| |    
T  14896467 catggtgagataccttcaagcttgctaaaccttcaaattttaagacaccttgatctctctaaaaacaacctacaaggatcaattccagatagaatagggc 14896368  T
Q  314 aactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctat 413  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||    
T  14896367 aactaccaaatattcaacaccttgatctttcaatgaacatgttaagcggtttcattccttcaactctaggaaacctctcatccttaatttccttatccat 14896268  T
Q  414 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccga 513  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||| || |||||||||||||| ||| ||||| |    
T  14896267 tggctctaataatttctctgctgaaatttcaaatttaactttttccaaacactctagtttagtttcactagacatgagtaattcaaatgttgcattccaa 14896168  T
Q  514 tttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  14896167 tttgatttggattgggttcctccttt 14896142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 87 - 539
Target Start/End: Original strand, 17949624 - 17950080
Alignment:
Q  87 gtatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacc 186  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  17949624 gtatttgaatttatcttcacttgtaactctttatcttgatgaaaacaacttcacctcccatttaccaaatgggtttttcaatctcaccaaagatatcacc 17949723  T
Q  187 tctcttgaccttgcacaaaataatatatatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaa---- 282  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||| ||        
T  17949724 tctcttgaccttgcactaaataatatatatggtgagataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgagacaccttgatctctcaaataacaaattaa 17949823  T
Q  283 ctacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctag 382  Q
    |||||||||||| ||  | || |||| || |||||| ||||| || || |||||||| |||||   |||||||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  17949824 ctacaaggatcaattatagatagaattggccaactaccaaattttgaataccttgatatttccgcgaacatgtttggtggtctcattccttcaactctag 17949923  T
Q  383 gaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaact 482  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  17949924 gaaacctctcatccttatattacttatctattggctctaataatttctctggtaaaatttcaaatttacatttttccaaattatttagtttagatgaact 17950023  T
Q  483 atacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17950024 agacttgagtaattcaaattttgtaatccaatttgatttggattgggttcctccttt 17950080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 76 - 539
Target Start/End: Original strand, 19351179 - 19351641
Alignment:
Q  76 ccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcacca 175  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  19351179 ccatctgttgagtatttgaatttgtcttcacttgtaactcttgatctttttcgaaataacttcaactttaatttaccagatgggttttttaatctcacca 19351278  T
Q  176 aagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatatatatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctga 275  Q
    ||||| | || | |||| ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||    |    
T  19351279 aagatctcacttatcttcacctttcacaaagtaatatatatggtaagataccttcaagcttactaaaccttcaaaaactgagacaccttgatctcaaata 19351378  T
Q  276 aaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgta 375  Q
     |||||||||||||||||| || || |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||  |    
T  19351379 taaccaactacaaggatcaattccagatggaataagccaactaccaaatattcaataccttgatctttcatggaacatgttaagtggtttcattccttca 19351478  T
Q  376 actctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttca-aatttaactttttccaaactctctagttta 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||    
T  19351479 actctaggaaacctctcatccttaatttccttatcgattggctctaatcatttcactggtgaaatttcacaattt--ttttttccaaactctctagttta 19351576  T
Q  475 gatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    ||    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19351577 gaatggctagacttgagtaattcaaattttgtattccaatttgatttggattgggttcctccttt 19351641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 13 - 539
Target Start/End: Original strand, 18146552 - 18147078
Alignment:
Q  13 tcacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |  ||  | | ||||| || ||||||||||| || ||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||    
T  18146552 tcacttccttcactattaaaattaaagttgtttaattgtaacctgaacaacttcataattaacacatctattgggtatttgaatttgtcttcacttataa 18146651  T
Q  113 ctctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatat 212  Q
    ||||| ||||||| |||||||| || |||||| |||||||  |||||| | ||||||| ||||||||||| | || ||||  |||||   | |  |||||    
T  18146652 ctcttgatctttcaggaaataatttaacctctcatttacctgatgggtattttaatcttaccaaagatatcaactatcttagccttgaggagagcaatat 18146751  T
Q  213 atatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | | ||| ||||||| |||||| || || ||||||||||     
T  18146752 atatggtgagataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgagacaccttaatctctataataacaaactacacggatcaattccaaatggaataggc 18146851  T
Q  313 caactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatcta 412  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |    
T  18146852 caacttgcacatattcaataccttgatctttcatggaacatgttaagtggtttcattccttcaactctaggaaacctctcatccttaaattacttatgga 18146951  T
Q  413 ttggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||||||||| | |||||||||     
T  18146952 ttggctctaataatttctctggtgcaatttcaaaattaactttttccaacctctctagtttagattcactagacatgagtaattcaagttttgtattcca 18147051  T
Q  513 atttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18147052 atttgatttggattgggttccaccttt 18147078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 536
Target Start/End: Original strand, 16676942 - 16677464
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||| |   ||||||  |||||| | |||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||  |||||| |||||||    
T  16676942 cacttccttcactattagaattgcggttgagttcttgtaaattgaacaacttcatgctcaactcatctattgggtatttgaattcctcttcaattgtaac 16677041  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||| ||||||||   || || || |||| | | |||| ||| |||||| | ||||||||||||||||| |    |||||||||| ||   |||||||||    
T  16677042 tcttgatctttcttacaacaatttaacctttcagttactaaacgggtttttaaatctcaccaaagatatcaagcatcttgacctttcatggaataatata 16677141  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtc 313  Q
     |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  |||| || || ||| ||||||||    
T  16677142 catggtgagataccttcaagcttgttaaaccttcaacatttgagacaccttgatgtctctcaaaaccaactacaactatcaattccagatgaaataggtc 16677241  T
Q  314 aactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctat 413  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16677242 aactagcacatattcaagaccttgatctttccatgaacatgttaagtggtttcattccttcaactctaggaaacctctcatctttaaattccttatctat 16677341  T
Q  414 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccga 513  Q
    ||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| |  | || | ||||||||| |    
T  16677342 tggcaataatgatttctctggtgaagtttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatatactagacctgagaagattaagtgttgtattccaa 16677441  T
Q  514 tttgatttggattgggttcctcc 536  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16677442 tttgatttggattgggttcctcc 16677464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 58 - 539
Target Start/End: Original strand, 25462817 - 25463298
Alignment:
Q  58 aacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatg 157  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||   || |||||||||||| |||||||  |||    
T  25462817 aacaacttcatgaccaaatcatctattgggtatttgaatttgtcttcgcttttaactcttgatctttcttacaacaacttcacctctcatttacctgatg 25462916  T
Q  158 ggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatatatatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgag 257  Q
    | ||| |||||||| | |||||| | |  | |||||||||| ||   |||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25462917 gtttttttaatctctcaaaagatttcatgtatcttgacctttcatttaataatgtacatggtgacataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgag 25463016  T
Q  258 acatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgtta 357  Q
    ||| |||||||| ||| | |||||| |||| ||| || || || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  25463017 acaccttgatctatctcataaccaattacagggaccaattccagatggaataggccaactaccaaatattcaataccttgatctttccattaacatgtta 25463116  T
Q  358 ggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaacttttt 457  Q
      |||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||| |    
T  25463117 attggtttaatccctttaactataggaaacctctcatccttaacttccttatctatcggctctaataacttctctggggcaatttcaaaattaactttct 25463216  T
Q  458 ccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    ||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  25463217 ccaaactctttagtttagattcactagacttgagtaattcaacttttgtattacaatttgatttggattgggttcctccttt 25463298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 76 - 539
Target Start/End: Original strand, 19399493 - 19399956
Alignment:
Q  76 ccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcacca 175  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    || |||||||||| | || ||||  |||||||| ||||| ||||||    
T  19399493 ccatctcttgagtatttgaatttgtcttcacttgtaactcttgatctttcaaacaacaacttcacctttcatatacctgatgggttttttaatttcacca 19399592  T
Q  176 aagatataacctctcttgaccttgcacaa-aataatatatatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctg 274  Q
    ||||| | |||| |||| |||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  ||    
T  19399593 aagatctcacctgtctttaccttg-acaataacaatatatatggtgagataccttcaagcttgctaacccttcaaaatttgaaacaccttgatctcgttg 19399691  T
Q  275 aaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgt 374  Q
    | ||| ||||||| ||| || ||  | ||| |||||||||||||||| ||||| || | |||| |||| |    ||||||||| ||||||||||||||      
T  19399692 ataacaaactacagggaccaattcaagatgaaataggtcaactagcacatattgaatatcttggtcttgcttggaacatgttaagtggtttcattccttc 19399791  T
Q  375 aactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagttta 474  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  19399792 aactctaggaaacctctcttccttaaattacttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttacttttttccaaactctctagttta 19399891  T
Q  475 gatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||  |||| ||||||||||||||||| || ||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  19399892 gattcactagacttgagtaattcaaattttctattccagtttgatttagattgggttcctccttt 19399956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 88 - 539
Target Start/End: Original strand, 18108236 - 18108687
Alignment:
Q  88 tatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacct 187  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  18108236 tatttgaatttgtcttcacttgtaactcttaatcttgatgaaaacaacttcacctcccatttaccaaatgggtttttcaatctcaccaatgatatcacct 18108335  T
Q  188 ctcttgaccttgcacaaaataatatatatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactaca 287  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||    
T  18108336 ctcttgaccttgcgctgaataatatatatggtgagataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgagacaccttgatctctcaaataaccaactaca 18108435  T
Q  288 aggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaac 387  Q
    ||||||| ||  | || ||||    |||||| ||||| ||||| |||||||| | |||   ||||||||  ||||| ||||||||  |||| ||||||||    
T  18108436 aggatcaattatagatagaatttcccaactaccaaattttcaataccttgatatatccgcgaacatgtttagtggtctcattccttcaactgtaggaaac 18108535  T
Q  388 ctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatact 487  Q
    ||||| |||||| |   ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||  |  |||| |||    
T  18108536 ctctcttccttaaagcacttatttattggctctaataatttctctggcgaaatttcaaatttacatttttccaatctctctactttattttcactagact 18108635  T
Q  488 tgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  18108636 tgagtaattcaaattttgtattccagtttgatttggattgggttcctccttt 18108687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 14 - 539
Target Start/End: Original strand, 19380625 - 19381141
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| || |||||||||         |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19380625 cacttccttcactattagaattacagttgagtcattgtaacctgaacaacttc---------ccatctgttgagtatttgaatttgtcttcacttgtaac 19380715  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||||||  |||||||||| |||||||| | |||||||    |||     |  ||||||    
T  19380716 tctccatctttctggaaacaacttcacctctcacttaccagatgggttgtttaatctcacgaaagatatcaactctcttagatttgagggtagcaatata 19380815  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtc 313  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||   ||| || |||| |||  | || || ||| |||||| |    
T  19380816 tatggtgagatgccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgaaactccttgatctttctagtaacaaattacagggactaattccagatgaaataggcc 19380915  T
Q  314 aactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctat 413  Q
    |||||||| ||||| || | || |||||| | |  ||||||||| |||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  19380916 aactagcacatattgaatatctggatcttgctaggaacatgttaagtggtttcataccattaactctaggaaacctctcatccttatatttgttatctat 19381015  T
Q  414 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||| || |||||| |    
T  19381016 tggctctaataatttctctggtgaaatttctaaattaactttttccaaactctctagtttagattcgctagacttgagtaattcaaattttttattccaa 19381115  T
Q  514 tttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  19381116 tttgatttggattgggttcctccttt 19381141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 57 - 539
Target Start/End: Original strand, 17941720 - 17942202
Alignment:
Q  57 aaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaat 156  Q
    |||| ||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||  ||    
T  17941720 aaactacttcatgatcagctcatctattgagtatttgaatttgtcttcacttgtaactctttctctttctggaaacaatttcacctctcatatacctgat 17941819  T
Q  157 gggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaat-aatatatatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttg 255  Q
    |||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||||| ||| | |  |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17941820 gggttttttaatctcaccaaagatctcacttatcttgacctt-cacgagagcaatatacatggtgagataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttg 17941918  T
Q  256 agacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgt 355  Q
    ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||  | || || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||| ||    |||        
T  17941919 agacacctttatctctcttataaccaactacaaggactaattccaaatggaataggccaactaccaaatattcaatacctcgatctctctgaaaacgaac 17942018  T
Q  356 taggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaacttt 455  Q
    ||   || |  |||||    |||||||||||||||||||| ||| |||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17942019 tacaaggatcaattcccacgactctaggaaacctctcatcattaaattggttatttattggttctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaacttt 17942118  T
Q  456 ttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    || ||||||||||||||||||   |||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17942119 tttcaaactctctagtttagactcactagacttgagtaattcaagttttgtattccaatttgatttggattgggttcctccttt 17942202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 536
Target Start/End: Original strand, 18115697 - 18116210
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| || |||||||||         |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  18115697 cacttccttcactattagaattacagttgagtcattgtaacctgaacaacttc---------ccatctgttgagtatttgaatttgtctttacttgtaac 18115787  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||  |||||||| ||||||| ||||||||| | || | |||||||||| |||| | |||||||    
T  18115788 tcttgatctttctttaaacaacttcacctctcatttacctgatgggttttttaatcttaccaaagatctcacttatcttgacctttcacagagtaatata 18115887  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtc 313  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||  | ||||||||||||| |||| || || | | |||||| |    
T  18115888 tatggtgagataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgagagacctttatctctcctataaccaactacaagaatcaattccagaagaaataggcc 18115987  T
Q  314 aactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctat 413  Q
    |||| ||  |||||||||| |||||||| ||    |||    ||   || |  ||||||  |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||    
T  18115988 aacttgcccatattcaacaacttgatctctctgaaaaccaactacaaggatctattccttcaactctaggaaatctctcttccctaaattacttatctat 18116087  T
Q  414 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| || ||||| |||      
T  18116088 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttacatttttccaaactctctagtttagatcatctagacttgcgtaattcagattttgtaatccag 18116187  T
Q  514 tttgatttggattgggttcctcc 536  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  18116188 attgatttggattgggttcctcc 18116210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 539
Target Start/End: Original strand, 19413916 - 19414432
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| ||||| ||||||         |||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  19413916 cacttccttcactattagaattacagatgagtcattgtaacctaaataacttc---------ccatctgttgagcatttgaatttgtcttcaattgtaac 19414006  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||| ||||||||   || |||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || | |  ||||||    
T  19414007 tcttgatctttcttacaacaacttcacctctcatatacctgatgggttttttaatctcaccaaagatctcacctctcttgacctttcatatagcaatata 19414106  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtc 313  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||| |||||| || ||||||||||      
T  19414107 catggtgagataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgagacaccttgatctatcaaataaccaactacaagggtcagttccagatggaataggca 19414206  T
Q  314 aactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctat 413  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||||| ||    |||    ||   || ||||||| |  |||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||    
T  19414207 aattagcacatattcaacacctcgatctctctgaaaaccaactacaaggattcattctttcaactctaggaaatctcccatccttaaattacttatctat 19414306  T
Q  414 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccga 513  Q
    ||| || ||||||||||||||| | |||| |||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||||||| | |||| |||| |    
T  19414307 tggttcgaataatttctctggtaatattttaaatttatatttttccaaactctctagtttaaatcatctagacttgagtaattcaagttttgttttccaa 19414406  T
Q  514 tttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  19414407 tttgatttggattgggttcccccttt 19414432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 15 - 539
Target Start/End: Original strand, 19392873 - 19393397
Alignment:
Q  15 acttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaact 114  Q
    |||| ||||||| |||||||||||| | ||| | ||||| ||  | ||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19392873 actttcttcactgttagaattacaattaagtgaatgtaacctcgaaaacttcaagatcaagccatcttttgagtatttgaatttgtcttcacttgtaact 19392972  T
Q  115 ctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatatat 214  Q
    ||| ||||||||   || ||||||||||| ||| |||| ||||||||| ||||||  |||| | ||   ||||  ||| |||||    | |  || ||||    
T  19392973 cttgatctttcttacaacaacttcacctccaatatacctaatgggttttttaatcgtaccacatatgccacctaccttcaccttaaggagagcaacatat 19393072  T
Q  215 atggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtca 314  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||  | |||||||||| ||    
T  19393073 atggtgagataccttcaagtttgctaaaccttcaaaatttgagataccttaatctctttgaaaatcaactacaaggatcaattcaagatggaataggcca 19393172  T
Q  315 actagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctatt 414  Q
    ||| | | || ||||| |||||||| |||| |  ||||||||  ||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  19393173 acttgaacatcttcaataccttgatgtttcgaaaaacatgttgagtggttttattccttcaactttaggaaacctctcatccttaaattacttatctatt 19393272  T
Q  415 ggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgat 514  Q
     ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||| |  |||| ||||||||||||||| | ||| ||||| ||    
T  19393273 agcgataacaatttctctggtgaaatttcaaatttacatttttccaaactccatagtttagtttcactaaacttgagtaattcaatttttgaattccaat 19393372  T
Q  515 ttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||||||| ||||||||||||||||    
T  19393373 ttgatttgaattgggttcctccttt 19393397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 539
Target Start/End: Original strand, 19333740 - 19334257
Alignment:
Q  13 tcacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||| | |||||||||         |||| |  ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19333740 tcacttccttcactattagaattacagttgagtgattgtaaattgaacaacttc---------ccatttgatgagtatttgaatttgtcttcaattgtaa 19333830  T
Q  113 ctctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatat 212  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||   |||||||| |||||||  |||||||| | |  | ||| |||||| |    || |||||    
T  19333831 ctcttgatctttctagaaacaactttacctctcatttacttgatgggttttttaatctttccaaagatctcaagtatctcgacctttcttggaacaatat 19333930  T
Q  213 atatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggt 312  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || | | ||||||     
T  19333931 atatggtgagataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgagacaccttgatctctcttataaccaactacaaggatcagttccagaagaaataggc 19334030  T
Q  313 caactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatcta 412  Q
    |||||  |  |||||||||| |||||||| ||    |||    ||   || |  ||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||    
T  19334031 caactttcccatattcaacaacttgatctctctgaaaaccaactacaaggatctattccttcaactctaggaaacctctcttccttaaattacttattta 19334130  T
Q  413 ttggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccg 512  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |   ||| || ||||| ||||||||||||||||||     
T  19334131 ttggctctaataatttctctggtgaaatttcaaaattaactttttccaaactctatactttaggtttgctagacatgagttattcaaatattgtattcca 19334230  T
Q  513 atttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19334231 atttgatttggattggattcctccttt 19334257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 539
Target Start/End: Original strand, 18164879 - 18165404
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | || || || ||||||||||| ||   | ||||| || ||||| | |||||||||||| |||||||    
T  18164879 cacttccttcactattagaattacagttgagtaattgcaacctgaacaacttcataattggaacatcttttaagtatgtgaatttgtcttcaattgtaac 18164978  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||| ||||||||   ||  | ||||||||| | ||||   |||| ||| ||||||||||||||||||| | || ||||  |||| ||   || ||||||    
T  18164979 tcttgatctttcttacaactatttcacctctcacttacttgatggattttttaatctcaccaaagatatcaactttcttagcctttcagggaacaatata 18165078  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtc 313  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  | | |||   ||  || ||| |||| || |||||||| || || |||||||||| |    
T  18165079 aatggtgagataccttcaagcttgctaaaacttcaaaatttgcaataccttttgctagctaaaacccaattaaaaggatcaattccagatggaataggcc 18165178  T
Q  314 aactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctat 413  Q
    |||||  ||||||| ||  ||||||||||||    ||||||||| | ||||| || |||   |||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||    
T  18165179 aactaataaatattaaaggccttgatctttcagggaacatgttaagcggttttatcccttcgactctaggaaacctctcatccttaaatgacttatctat 18165278  T
Q  414 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccga 513  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||| | |||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  18165279 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttacattttgccaaactctccaatttagattcactagacttgagtaattcaaattttgtattccaa 18165378  T
Q  514 tttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  18165379 tttgctttggattgggttcctccttt 18165404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 14 - 471
Target Start/End: Original strand, 19461264 - 19461712
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||| || ||||| |||         |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  19461264 cacttccttcactattagaattacagttgagtcattgtaacctgaacaatttc---------ccatctgttgagtatttgaatttgtctttacttgtaac 19461354  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||| ||||||||  ||| || ||||||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | || | |||||||||| |||| | |||||||    
T  19461355 tcttgatctttctttaaacaatttcacctctcatttacctgatgggttttttaatctcaccaaagatctcacttatcttgacctttcacagagtaatata 19461454  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtc 313  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||| | ||||||||||||| ||||||| || | | |||||| |    
T  19461455 tacggtgagataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgagagacctttatctctcttataaccaactacaagaatcagttccaaaagaaataggcc 19461554  T
Q  314 aactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctat 413  Q
    |||| ||  |||||||||| |||||||| ||    |||    ||   || |  ||||||  |||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||    
T  19461555 aacttgcccatattcaacaacttgatctctctgaaaaccaactacaaggatctattccttcaactctaggaaacctctcttccctaaattacttatctat 19461654  T
Q  414 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagt 471  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19461655 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttacatttttccaaactctctagt 19461712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 273 - 539
Target Start/End: Original strand, 19424669 - 19424935
Alignment:
Q  273 tgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcct 372  Q
    |||||||||||||||||||||| || | || |||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||| | ||| |||||| ||||||| ||||||    
T  19424669 tgaaaaccaactacaaggatcaattccgcacggaataggccaactagcacatattcaaagccttgatctttcaaacaatatgttaagtggtttaattcct 19424768  T
Q  373 gtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtt 472  Q
      |||| |||||||||||||||| ||| ||  |||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19424769 tcaactttaggaaacctctcatcattaaatcacttatggattggctctaataaattctcaggtgaaatttcaaaattaactttttccaaactctctagtt 19424868  T
Q  473 tagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19424869 tagaagaactagacttgagtaattcaacttttgtattccaatttgatttggattgggttcctccttt 19424935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 349 - 539
Target Start/End: Original strand, 19375680 - 19375870
Alignment:
Q  349 aacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatt 448  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  19375680 aacatgttaagtggtttcattcctttaactctaggaaacctctcatccttaaatttgttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttctaaat 19375779  T
Q  449 taactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19375780 taactttttccaaactctctagtttagattcactagacttgagtaattcaaattttgtattccaatttgatttggattgggttcctccttt 19375870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Original strand, 19436752 - 19437050
Alignment:
Q  13 tcacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  |||||   || |  || ||||||||| |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19436752 tcacttccttcactattagaattaaagttgagtgggtgcagcctgaacaacttcgtgattaatccatctattcagtatttaaatttgtcttcacttgtaa 19436851  T
Q  113 ctctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatat 212  Q
    ||||||||||||| |  ||  | ||||||||| | |||||  |||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |    || |||||    
T  19436852 ctctttatctttcagataacgatttcacctctcacttaccggatgggttttttaatctcaccaaagatctcacctctctttacctttcgtttaacaatat 19436951  T
Q  213 atatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaatagg 311  Q
      |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  19436952 tcatggggagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacaccttgatctctcttataaccaactacaaggatcaattccagatggaatagg 19437050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 76 - 293
Target Start/End: Original strand, 18015879 - 18016096
Alignment:
Q  76 ccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcacca 175  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||   || |||||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  18015879 ccatctgttgagtatttgaatttgccttcacttgtaactctttctctttctttcaacaacttcacctctcatatacctgatgggttttttaatctcacca 18015978  T
Q  176 aagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatatatatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctga 275  Q
    ||||| | ||||||||||||||| || | |  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |    
T  18015979 aagatctcacctctcttgacctttcatatagcaatatacatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacaacttcatctctctaa 18016078  T
Q  276 aaaccaactacaaggatc 293  Q
     |||||||||||||||||    
T  18016079 taaccaactacaaggatc 18016096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 14 - 311
Target Start/End: Original strand, 19424339 - 19424636
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | ||| | || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19424339 cacttccttcactattacaattacaaataagtgattggaaaccaaacaacttcatgatcaacccatcaattgagtatttgaatttgtcttcaattgtaac 19424438  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
     ||| ||||||||   || || ||| ||||| |||||||  |||||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||   |||   || |  ||||||    
T  19424439 acttgatctttctttcaacaatttcgcctctcatttacctgatgggttttttaatctcaccaaagatctcacctatcttagacttcaccagagcaatata 19424538  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaatagg 311  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||    
T  19424539 catggtgggataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgacataccttgatctctctgaaaaccaactataaggatcaattccagatggaatagg 19424636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 375 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 17727453 - 17727289
Alignment:
Q  375 aactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagttta 474  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17727453 aactctaggaaacctctcatctttaattttcttatctattggttctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagttta 17727354  T
Q  475 gatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||  |||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17727353 gattcactacaattgagtaattcaaattttgcattccaatttgatttggattgggttcctccttt 17727289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 375 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 19028682 - 19028518
Alignment:
Q  375 aactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagttta 474  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19028682 aactctaggaaacctctcatctttaattttcttatctattggttctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagttta 19028583  T
Q  475 gatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||  |||| | ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19028582 gattcactacaattgagtaattcaaattttgcattccaatttgatttggattgggttcctccttt 19028518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 375 - 539
Target Start/End: Original strand, 18103430 - 18103594
Alignment:
Q  375 aactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagttta 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||| |||||||    
T  18103430 aactctaggaaacctctcatccttaaattacttatttattggctctaataatttctctggtaaaatttcaaatttgcatttttccaaactctgtagttta 18103529  T
Q  475 gatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18103530 gatgaactagacttgagtaactcaaattttgtattccaatttgatatggattgggtacctccttt 18103594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17727957 - 17727631
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||   || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  17727957 cacttccttcactgttagaattacagttgagtgggtgcaacctaaacaacttcctgatcaatccatctattgagtatttgaatttgtcttcaattgtaac 17727858  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaat-aatat 212  Q
    ||||||||||||    ||  | ||||||||| | || ||   ||| ||| ||||||||||||||||| | |||| | |||||||| ||| | |  |||||    
T  17727857 tctttatctttcaaacaacgatttcacctctcactt-cctggtggattttttaatctcaccaaagatctcacctatgttgacctt-cacgagagcaatat 17727760  T
Q  213 atatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||     
T  17727759 acatggtgagataccttctagcttggtaaaccttcaaaatttaacacaccttggtctctctgaaaaccaactacaagggtcagttccatatgatataggc 17727660  T
Q  313 caactagcaaatattcaacaccttgatct 341  Q
      ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  17727659 agactagtacatattcaacacctcgatct 17727631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19029186 - 19028860
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  |||||   || || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  19029186 cacttccttcactgttagaattacagttgagtgggtgcaacctaaacaacttcctgatcaatccatctattgagtatttgaatttgtcttcaattgtaac 19029087  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaat-aatat 212  Q
    ||||||||||||    ||  | ||||||||| | || ||   ||| ||| ||||||||||||||||| | |||| | |||||||| ||| | |  |||||    
T  19029086 tctttatctttcaaacaacgatttcacctctcactt-cctggtggattttttaatctcaccaaagatctcacctatgttgacctt-cacgagagcaatat 19028989  T
Q  213 atatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggt 312  Q
    | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||  |||||     
T  19028988 acatggtgagataccttctagcttggtaaaccttcaaaatttaacacaccttggtctctctgaaaaccaactacaagggtcagttccatatgatataggc 19028889  T
Q  313 caactagcaaatattcaacaccttgatct 341  Q
      ||||| | ||||||||||||| |||||    
T  19028888 agactagtacatattcaacacctcgatct 19028860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 76 - 269
Target Start/End: Original strand, 19375479 - 19375672
Alignment:
Q  76 ccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcacca 175  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||||| |||||| |||| ||||||||  ||| || ||||||| | |||||||  |||||||| ||||||||||||    
T  19375479 ccatctgttgagtttttgaatttgtcttcaattgtaagtcttgatctttcttcaaacaatttcacctttcatttacctgatgggttttttaatctcacca 19375578  T
Q  176 aagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatatatatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatct 269  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  19375579 aagatatcacctatcttgaccttgcgatgaataatatatatggtgagataccttcaagcttgctaaaccttccaaatttgagacaacttgatct 19375672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 375 - 539
Target Start/End: Original strand, 18016106 - 18016270
Alignment:
Q  375 aactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagttta 474  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||||||||||    
T  18016106 aactctaggaaacctgtcatccttaatttccttatcgattggctctaataatttctctggtgaaatttcacaattttttttttccaaactctctagttta 18016205  T
Q  475 gatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
     || |  || ||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18016206 aatcatttagacttgagtaattcaaattttgaattccaatttgatttggattgggttcctccttt 18016270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 18022524 - 18022747
Alignment:
Q  13 tcacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaa 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||  ||||  | |||||| | || | |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18022524 tcacttccttcactattacaattacagttgagcgattgtaaattgaatagcttcatgatcaacccatctattgagtatttgaatttgtcttcacttgtaa 18022623  T
Q  113 ctctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatat 212  Q
    ||||| ||||||||   || |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||| |||   | | |  |||||    
T  18022624 ctcttgatctttctttcaacaacttcacctctcatttaccaaatgggttttttaatctcaccaaagatatcaactatcttgtcctcttagagagcaatat 18022723  T
Q  213 atatggtgagataccttctagctt 236  Q
    | |||||||||||||||| |||||    
T  18022724 acatggtgagataccttcaagctt 18022747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 380 - 539
Target Start/End: Original strand, 19437047 - 19437206
Alignment:
Q  380 taggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatga 479  Q
    ||||||||||||||||||||  || | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  19437047 taggaaacctctcatccttaagttacctatctattggttctaataatttctctggtgaaatttcaaaattaactttttccaaactctctagtttagattg 19437146  T
Q  480 actatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
     ||  ||||||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19437147 gctcgacttgagcaattcaaattttgtattcaaatttgatatggattgggttcctccttt 19437206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 379 - 539
Target Start/End: Original strand, 19464444 - 19464604
Alignment:
Q  379 ctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatg 478  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  19464444 ctaggaaacctctcatctttaaatgacttatctatcggctctaacaatttctcaggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttacatt 19464543  T
Q  479 aactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |  || ||||||||||||||||| |||| | || | |||||||||||||||||||||||||    
T  19464544 atttagacttgagtaattcaaattttgtctcccaaattgatttggattgggttcctccttt 19464604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 385 - 539
Target Start/End: Original strand, 18144284 - 18144438
Alignment:
Q  385 aacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactat 484  Q
    |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18144284 aacctctcttccttaatttacttatctattggctctaacaatttctctggtgaaatttcaaatttacatttttccaaactctctagtttagttgtactat 18144383  T
Q  485 acttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |  |||| ||||||  | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  18144384 agatgaggaattcacgttttgtattccaatttgatttggattaggttcctccttt 18144438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 24493695 - 24493511
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| | | ||||| ||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  24493695 cacttccttcactattagaattacgtatgattgattgtaacctaaacaacttcatgatcaactcattttttgagtattcgaatttgtcttcacttgtaac 24493596  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgacctt 198  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||  ||| |||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||    
T  24493595 tcttgatctttctgaaaacaacttcagctctcagttaccaaatgcattttttaacctcaccaaagatatcacctatcttggcctt 24493511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 14 - 322
Target Start/End: Original strand, 18143965 - 18144260
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||  ||||||| |||||||| ||| |||||||    
T  18143965 cacttccttcactattagaattacagttgagttcttgtaacctgaacaacttaatgatcaacccatatatcaagtatttgaatttgtcgtcaattgtaac 18144064  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||| ||||||||  ||| |||||||||||| |||||||  || ||||| ||||||||||      |||        |||||||| || | | |||||||    
T  18144065 tcttgatctttctttaaacaacttcacctctcatttacctgataggttttttaatctcac-----ttat--------ttgacctttcatagagtaatata 18144151  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtc 313  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| || | |||| | |||||||||| | | |||||  |||||||||||||| || | | |||||| |    
T  18144152 tatggtgacttaccttcaagcttgctaaaccttcagaaatcgagataccttgatctctttcataaccagttacaaggatcagttccagaagaaataggcc 18144251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 208 - 294
Target Start/End: Original strand, 18103335 - 18103421
Alignment:
Q  208 aatatatatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatca 294  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  18103335 aatatatatggtgagataccttcaagcttgctaaaccttcaaaatttgagacaccttgatctctcttataaccaactacaaggatca 18103421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 76 - 156
Target Start/End: Original strand, 19436653 - 19436733
Alignment:
Q  76 ccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaat 156  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  19436653 ccatctgttgagtatttcaatttatcttcacttgtaactcttgatctttctggaaacaaattcacctcttatttaccaaat 19436733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Original strand, 17941523 - 17941624
Alignment:
Q  76 ccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcacca 175  Q
    |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||||||| || ||||  |||||||| ||||||||||||    
T  17941523 ccatctgttgaatatttgaatttgtcttcacttgtaactctttctctttctagaaacaatttcacctcttatatacctgatgggttttttaatctcacca 17941622  T
Q  176 aa 177  Q
    ||    
T  17941623 aa 17941624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 341
Target Start/End: Original strand, 19464334 - 19464406
Alignment:
Q  269 tctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatct 341  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  19464334 tctcggaaaaacaactacaaggatcaatttcagatagaataggccaactagcacatattcaagagcttgatct 19464406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 17727635 - 17727559
Alignment:
Q  265 gatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatct 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| |  | ||| |||||||||||  |||||||||    
T  17727635 gatctctctgaaaaccaactacgaggatcaattccagatggaatatgcaatctatcaaatattcaaatccttgatct 17727559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 265 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 19028864 - 19028788
Alignment:
Q  265 gatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatct 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||| |  | ||| |||||||||||  |||||||||    
T  19028864 gatctctctgaaaaccaactacgaggatcaattccagatggaatatgcaatctatcaaatattcaaatccttgatct 19028788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 238 - 273
Target Start/End: Original strand, 19407112 - 19407147
Alignment:
Q  238 ctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctct 273  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19407112 ctaaaccttcaaaatttgagacaccttgatctctct 19407147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 392 - 446
Target Start/End: Original strand, 24493373 - 24493427
Alignment:
Q  392 catccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaa 446  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24493373 catccttatcttacttatctattgcctctaataatttctcaggtgaaatatcaaa 24493427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 3)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 14 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 2710853 - 2710328
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2710853 cacttccttcactattagaagtacaattgtctttttgtaaactaagcaacttcatgatcaacccgtctattgcatatttgaatttgtcttcacttataac 2710754  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||| | |||||| | || ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | || | || |||||||||| || | |  ||||||    
T  2710753 tcttgaactttcttggaacaacttcacctctcctttaccaaatgggttttttaatctcaccaaacacatcaactatcttgacctttcatatagcaatata 2710654  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtc 313  Q
     ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||| || ||  | ||| |||||| |    
T  2710653 catggtgagataccttctagcttgttaaagcttcgaaatttgagacaactttatctttctaataaccaactacaaggaccaattcaagatgaaataggcc 2710554  T
Q  314 aactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattccttatctat 413  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||    
T  2710553 aactagcatatattcaataccttgatctttccatgaacatgttaagcggtttcattccttcaactctaggaaacctctcatccttaaagtccttacttat 2710454  T
Q  414 tggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccga 513  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||||| ||||| |  |||||||| |    
T  2710453 tggcactaatcatttttctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagattcactagacgtgagtagttcaacttgtgtattccaa 2710354  T
Q  514 tttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2710353 tttgatttgaattgggttcctccttt 2710328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 306 - 539
Target Start/End: Original strand, 15535548 - 15535781
Alignment:
Q  306 aataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttacattcc 405  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||||| |  ||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15535548 aataggccaactagcacatattcaatatcttgatctttctaggaacatgttaagttctttcattccttcaactctaggaaacctctcatccttaaattcc 15535647  T
Q  406 ttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaatattg 505  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||| |||    
T  15535648 ttatctattggatctaataatttatctggtgcaaattcaaaattaactttttccaaactctctggtttagattcactagacttgagtaattcaaattttg 15535747  T
Q  506 tattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  15535748 tattccaattttatttggattgggttcctccttt 15535781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 294
Target Start/End: Original strand, 15532083 - 15532354
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||    ||||| |||||||||| |||||||||         |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15532083 cacttccttcactattagatttaaggttgagtgactgtaaactgaacaacttc---------ccatctatcgagtatttgaatttgtcttcacttgtaac 15532173  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||| |||||||| | || ||||||| |  | ||||||||||||||||| |||||||  ||||| || | |  | |||||||||| || |||||||||||    
T  15532174 tcttgatctttcttggaacaacttcagccatcatttaccaaatgggttttttaatctttccaaatatctcaattatcttgacctttcaaaaaataatata 15532273  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatca 294  Q
      || |||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15532274 cttgatgagataccttcaagtttgctaaatcttcaaaatttgagaatccttgatctctctaataaccaactacaaggatca 15532354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2156 (Bit Score: 170; Significance: 6e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold2156
Description:

Target: scaffold2156; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 6e-91
Query Start/End: Original strand, 17 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 202 - 1
Alignment:
Q  17 ttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactct 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  202 ttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaatccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactct 103  T
Q  117 ttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatatatat 216  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  102 ttatctttctggaaacaactttacctccaatttaccaaatgggttttttaatctaaccaaagatatcacctctcttgaccttgcgcaaaataatatatat 3  T
Q  217 gg 218  Q
    ||    
T  2 gg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 121; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 375 - 539
Target Start/End: Complemental strand, 13666866 - 13666702
Alignment:
Q  375 aactctaggaaacctctcatccttacattccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagttta 474  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13666866 aactctaggaaacctctcatccttaaattacttatctattagctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttctaaactctctagttta 13666767  T
Q  475 gatgaactatacttgagtaattcaaatattgtattccgatttgatttggattgggttcctccttt 539  Q
    ||   ||||| |||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  13666766 gacacactatgcttgagtaattcaaagcttgtattccaatttgatttggattgggttcctccttt 13666702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 76 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13667095 - 13666875
Alignment:
Q  76 ccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcacca 175  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||| || |||| |||| |||| ||||||||||||    
T  13667095 ccatctcttgagtatttgaatttgtcttcgctggtaactcttgatctttctgaaaacaacttcacctctcatatacctaatgagttttttaatctcacca 13666996  T
Q  176 aagatataacctctcttgaccttgcacaaaata--atatatatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctct 273  Q
    || || | ||| || |||||||| |||| | ||  ||||||||||| | |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| |    
T  13666995 aaaatctcaccactgttgacctttcacatagtaatatatatatggtaaaataccttcaaccttgctaaacattcaaactttgagatatattgatctcttt 13666896  T
Q  274 gaaaaccaactacaaggatca 294  Q
    |||||| | ||||||||||||    
T  13666895 gaaaacaacctacaaggatca 13666875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 2)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 302 - 536
Target Start/End: Original strand, 8459559 - 8459793
Alignment:
Q  302 atggaataggtcaactagcaaatattcaacaccttgatctttccatcaacatgttaggtggtttcattcctgtaactctaggaaacctctcatccttaca 401  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||| |    
T  8459559 atggaataggccaactagcacatattcaataccttgatctttccaaaaacatgttaagtggtttcattccttctactcttggaaacctctcatccttata 8459658  T
Q  402 ttccttatctattggctctaataatttctctggtgaaatttcaaatttaactttttccaaactctctagtttagatgaactatacttgagtaattcaaat 501  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||| |||| ||| |   ||| |||| |||| || ||||    
T  8459659 ttccttatctattggctcaaataacttctctagtgaaatttcaaacagaaccttttccaaactctatagtctaggttttctagacttaagtagtttaaat 8459758  T
Q  502 attgtattccgatttgatttggattgggttcctcc 536  Q
    |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  8459759 attgtatttcaattcgatttggattgggttcctcc 8459793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 342
Target Start/End: Original strand, 8459202 - 8459527
Alignment:
Q  14 cacttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaac 113  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||  | ||| | |||||||| |||||||| ||   ||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8459202 cactttcttccctattagagttacacttaagtaagtgtaaactgaacaactttat---caacccatctcttgagtatttgaatttgtcttcacttgtaac 8459298  T
Q  114 tctttatctttctggaaataacttcacctctaatttaccaaatgggtttcttaatctcaccaaagatataacctctcttgaccttgcacaaaataatata 213  Q
    |||| |||||||| | || |||||||| |||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |        |||||    
T  8459299 tcttgatctttcttggaacaacttcacatctcctttacctaatgggttttttaatctgaccaaagatatcacctatcttgacctttcggtttgccatata 8459398  T
Q  214 tatggtgagataccttctagcttgctaaaccttcaaaatttgagacatcttgatctctctgaaaaccaactacaaggatcagtttcacatggaataggtc 313  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||  | |    
T  8459399 tatggcgagatgccttcaagcttgttataccttccaaatttgagacaccttgatctctcttataaccaactacaaggatcaattccaaatggaatccgcc 8459498  T
Q  314 aactagcaaatattcaacaccttgatctt 342  Q
    |||||| | ||||| || |||||||||||    
T  8459499 aactagaacatattaaataccttgatctt 8459527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Original strand, 16436121 - 16436222
Alignment:
Q  16 cttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactc 115  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||| ||| ||||| || | ||||||||||| ||| ||| |||||||  |||| |||||| ||||||||  |||||    
T  16436121 cttccttccctgttagaattacaattgaattattgtaatctgagcaacttcatgaccaacccacctattgaacattttaatttgccttcacttaaaactc 16436220  T
Q  116 tt 117  Q
    ||    
T  16436221 tt 16436222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 16436691 - 16436590
Alignment:
Q  16 cttccttcactattagaattacaactgagttactgtaaactaaacaacttcatgatcaaaccatctattgagtatttcaatttgtcttcacttgtaactc 115  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||   ||||||||||| ||| ||| |||||||  |||| |||||| ||||||||  |||||    
T  16436691 cttccttccctattagaattacaattgaattattgtaatctttgcaacttcatgaccaacccacctattgaacattttaatttgccttcacttaaaactc 16436592  T
Q  116 tt 117  Q
    ||    
T  16436591 tt 16436590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University