View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1174_low_12 (Length: 336)

Name: NF1174_low_12
Description: NF1174
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1174_low_12
NF1174_low_12
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (94-329)||(38588588-38588830)
chr8 (94-324)||(33295896-33296134)
chr8 (97-324)||(7949415-7949650)
chr8 (94-329)||(27473278-27473521)
chr8 (94-329)||(15871828-15872071)
chr8 (94-329)||(45077410-45077653)
chr8 (97-329)||(1432134-1432374)
chr8 (94-329)||(15048399-15048642)
chr8 (94-329)||(45276803-45277046)
chr8 (94-329)||(44594808-44595050)
chr8 (99-329)||(1651779-1652016)
chr8 (99-329)||(1740155-1740392)
chr8 (95-317)||(5152753-5152982)
chr8 (94-324)||(7535045-7535283)
chr8 (94-324)||(1646719-1646956)
chr8 (121-321)||(27669443-27669651)
chr8 (94-317)||(5435119-5435350)
chr8 (97-312)||(11173858-11174081)
chr8 (94-324)||(1869934-1870173)
chr8 (94-324)||(40048067-40048293)
chr8 (94-248)||(33819785-33819947)
chr8 (192-323)||(37569527-37569659)
chr8 (106-248)||(38588875-38589025)
chr8 (94-248)||(34470832-34470994)
chr8 (100-248)||(37569320-37569476)
chr8 (99-243)||(40660179-40660331)
chr8 (99-248)||(5152540-5152696)
chr8 (219-329)||(11707957-11708067)
chr8 (94-248)||(1646501-1646663)
chr8 (99-229)||(15048706-15048844)
chr8 (162-284)||(18298481-18298611)
chr8 (94-247)||(1870224-1870385)
chr8 (99-248)||(5434905-5435062)
chr8 (99-227)||(1739953-1740089)
chr8 (99-248)||(7534847-7534995)
chr8 (94-248)||(11707750-11707912)
chr8 (94-248)||(45077221-45077364)
chr8 (94-193)||(22763284-22763383)
chr8 (94-248)||(45276597-45276759)
chr8 (94-248)||(27473072-27473233)
chr8 (94-246)||(40659983-40660143)
chr8 (94-248)||(15871621-15871783)
chr8 (99-248)||(40048342-40048499)
chr8 (256-329)||(34470714-34470787)
chr8 (94-180)||(11920136-11920222)
chr8 (115-248)||(27669709-27669849)
chr8 (99-248)||(44594606-44594763)
chr8 (253-324)||(24659408-24659479)
chr8 (103-193)||(33295745-33295835)
chr8 (94-193)||(22762513-22762612)
chr8 (94-193)||(24666029-24666128)
chr8 (94-176)||(24652823-24652905)
chr8 (106-182)||(33819975-33820051)
[»] chr3 (88 HSPs)
chr3 (94-329)||(10506155-10506398)
chr3 (94-329)||(54108109-54108352)
chr3 (94-323)||(44893740-44893977)
chr3 (94-329)||(32633272-32633515)
chr3 (94-329)||(42591784-42592027)
chr3 (95-324)||(39241359-39241596)
chr3 (94-329)||(53716295-53716536)
chr3 (97-329)||(29818180-29818420)
chr3 (94-329)||(5900630-5900873)
chr3 (94-329)||(15986235-15986477)
chr3 (95-329)||(21969630-21969872)
chr3 (95-329)||(21992066-21992308)
chr3 (95-316)||(47669260-47669489)
chr3 (97-324)||(8474058-8474293)
chr3 (94-329)||(18464456-18464699)
chr3 (94-329)||(26318389-26318632)
chr3 (94-329)||(39664391-39664634)
chr3 (97-329)||(12203758-12203998)
chr3 (94-329)||(16931606-16931849)
chr3 (97-329)||(22201619-22201859)
chr3 (121-329)||(51509326-51509541)
chr3 (94-329)||(21568746-21568988)
chr3 (94-329)||(22151845-22152088)
chr3 (99-329)||(47303226-47303461)
chr3 (94-329)||(54752163-54752406)
chr3 (94-329)||(4773243-4773485)
chr3 (97-324)||(27801492-27801727)
chr3 (94-324)||(39951357-39951595)
chr3 (94-329)||(46152615-46152856)
chr3 (94-329)||(24428567-24428810)
chr3 (94-329)||(11256103-11256346)
chr3 (99-316)||(1994389-1994613)
chr3 (97-329)||(41835133-41835373)
chr3 (94-329)||(4757701-4757943)
chr3 (94-286)||(28986392-28986591)
chr3 (100-248)||(54107908-54108064)
chr3 (94-248)||(39664184-39664346)
chr3 (99-248)||(29818465-29818622)
chr3 (99-248)||(54752451-54752608)
chr3 (99-246)||(44894030-44894185)
chr3 (99-237)||(10505953-10506099)
chr3 (94-248)||(24428855-24429017)
chr3 (100-248)||(21569033-21569189)
chr3 (94-246)||(42592074-42592234)
chr3 (94-230)||(45306832-45306976)
chr3 (94-237)||(12791475-12791626)
chr3 (94-248)||(27801777-27801939)
chr3 (94-248)||(51509119-51509281)
chr3 (99-235)||(11256404-11256548)
chr3 (94-248)||(1994169-1994331)
chr3 (94-248)||(1999328-1999490)
chr3 (99-237)||(16931905-16932051)
chr3 (94-248)||(22201904-22202066)
chr3 (94-247)||(47669548-47669709)
chr3 (206-324)||(19883359-19883477)
chr3 (94-229)||(26318182-26318325)
chr3 (94-237)||(45306991-45307142)
chr3 (94-248)||(12203551-12203713)
chr3 (94-248)||(18464744-18464906)
chr3 (94-248)||(47303019-47303181)
chr3 (129-248)||(41834961-41835088)
chr3 (94-248)||(4757494-4757656)
chr3 (94-248)||(5900423-5900585)
chr3 (94-244)||(15986526-15986684)
chr3 (94-248)||(53716581-53716743)
chr3 (94-248)||(22152133-22152297)
chr3 (94-193)||(28985509-28985608)
chr3 (105-248)||(4773530-4773681)
chr3 (115-229)||(8473867-8473989)
chr3 (122-248)||(21969917-21970051)
chr3 (122-248)||(21992353-21992487)
chr3 (99-248)||(19883528-19883684)
chr3 (94-193)||(44317566-44317665)
chr3 (94-193)||(7681474-7681574)
chr3 (94-193)||(49528149-49528248)
chr3 (115-189)||(7163471-7163545)
chr3 (99-193)||(13866025-13866119)
chr3 (161-248)||(39241646-39241741)
chr3 (97-193)||(15790682-15790778)
chr3 (192-248)||(28986266-28986322)
chr3 (146-245)||(46152904-46153008)
chr3 (94-193)||(30681768-30681867)
chr3 (94-180)||(42853246-42853331)
chr3 (94-193)||(15791460-15791554)
chr3 (192-248)||(32633171-32633227)
chr3 (144-187)||(20963582-20963625)
chr3 (95-193)||(43844386-43844484)
chr3 (144-193)||(43840010-43840059)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (94-329)||(44332726-44332969)
chr7 (97-329)||(33716591-33716831)
chr7 (94-329)||(10526311-10526553)
chr7 (94-329)||(48626270-48626513)
chr7 (113-324)||(28297838-28298057)
chr7 (96-329)||(17359185-17359424)
chr7 (94-329)||(31638150-31638393)
chr7 (94-324)||(6356765-6357003)
chr7 (95-324)||(41191897-41192134)
chr7 (94-329)||(19681702-19681945)
chr7 (94-329)||(21391397-21391640)
chr7 (96-324)||(34037123-34037359)
chr7 (97-329)||(41453212-41453452)
chr7 (94-329)||(41751650-41751893)
chr7 (94-324)||(8542499-8542737)
chr7 (94-329)||(8937056-8937299)
chr7 (95-329)||(28286324-28286566)
chr7 (99-329)||(6356291-6356528)
chr7 (116-322)||(36423391-36423605)
chr7 (96-329)||(7579079-7579320)
chr7 (96-275)||(1114056-1114243)
chr7 (115-324)||(43247436-43247653)
chr7 (97-329)||(35146905-35147136)
chr7 (115-248)||(36423657-36423798)
chr7 (94-246)||(21391190-21391350)
chr7 (121-261)||(7909313-7909461)
chr7 (192-329)||(40673214-40673349)
chr7 (94-248)||(35146699-35146861)
chr7 (97-253)||(4931556-4931720)
chr7 (94-229)||(48626063-48626206)
chr7 (94-248)||(6356573-6356735)
chr7 (94-248)||(7578872-7579034)
chr7 (94-248)||(10526598-10526760)
chr7 (94-244)||(31075485-31075643)
chr7 (94-248)||(41191683-41191844)
chr7 (94-266)||(27738935-27739114)
chr7 (116-248)||(28286139-28286279)
chr7 (106-242)||(17363532-17363674)
chr7 (94-248)||(17749935-17750097)
chr7 (94-248)||(41453005-41453167)
chr7 (99-248)||(19681500-19681657)
chr7 (94-246)||(6357055-6357215)
chr7 (106-230)||(7909472-7909604)
chr7 (99-246)||(31637948-31638103)
chr7 (94-248)||(1114333-1114495)
chr7 (94-248)||(8936849-8937011)
chr7 (116-248)||(28298107-28298247)
chr7 (94-186)||(16867707-16867799)
chr7 (94-189)||(8416485-8416580)
chr7 (94-193)||(36282786-36282885)
chr7 (99-193)||(36673980-36674074)
chr7 (106-248)||(41751938-41752088)
chr7 (94-193)||(4155598-4155697)
chr7 (94-193)||(8417287-8417386)
chr7 (99-242)||(8542793-8542943)
chr7 (94-186)||(41891966-41892058)
chr7 (97-189)||(36283560-36283653)
chr7 (94-154)||(36423790-36423850)
chr7 (94-189)||(29277698-29277793)
chr7 (94-180)||(36674095-36674179)
chr7 (192-242)||(17359479-17359529)
chr7 (127-189)||(32946696-32946758)
chr7 (289-329)||(17363437-17363477)
chr7 (122-248)||(33716872-33717005)
chr7 (99-180)||(29276880-29276961)
chr7 (288-324)||(17750147-17750183)
chr7 (143-193)||(46540019-46540069)
[»] chr4 (86 HSPs)
chr4 (94-329)||(14985331-14985574)
chr4 (96-329)||(52557294-52557535)
chr4 (94-329)||(19088548-19088791)
chr4 (94-329)||(21763388-21763631)
chr4 (94-329)||(15477852-15478095)
chr4 (94-317)||(38339492-38339723)
chr4 (96-329)||(30683735-30683976)
chr4 (97-329)||(24898192-24898432)
chr4 (94-329)||(1433478-1433721)
chr4 (94-329)||(8591969-8592212)
chr4 (94-329)||(16038001-16038244)
chr4 (94-329)||(53751109-53751352)
chr4 (94-324)||(12817806-12818044)
chr4 (97-329)||(33091660-33091900)
chr4 (94-317)||(39448707-39448938)
chr4 (94-329)||(50768821-50769064)
chr4 (95-329)||(41752023-41752264)
chr4 (95-329)||(53259345-53259587)
chr4 (97-329)||(46849876-46850116)
chr4 (94-329)||(6711963-6712206)
chr4 (94-329)||(44957389-44957632)
chr4 (94-329)||(44991485-44991728)
chr4 (126-324)||(19508625-19508831)
chr4 (106-324)||(43734498-43734724)
chr4 (97-324)||(23756012-23756247)
chr4 (94-329)||(36122640-36122882)
chr4 (94-329)||(37206634-37206877)
chr4 (94-329)||(50508664-50508907)
chr4 (94-329)||(53995141-53995385)
chr4 (94-329)||(623886-624129)
chr4 (94-329)||(25182019-25182262)
chr4 (94-329)||(42855546-42855789)
chr4 (94-329)||(41878066-41878308)
chr4 (138-329)||(43566585-43566784)
chr4 (94-248)||(44991279-44991441)
chr4 (94-248)||(16037794-16037956)
chr4 (94-248)||(24898477-24898639)
chr4 (94-248)||(46849669-46849831)
chr4 (94-248)||(53994934-53995096)
chr4 (99-248)||(42855344-42855501)
chr4 (99-248)||(43734291-43734448)
chr4 (99-246)||(43566383-43566538)
chr4 (94-248)||(6505537-6505698)
chr4 (94-248)||(14985619-14985781)
chr4 (94-248)||(15477645-15477807)
chr4 (99-248)||(52557092-52557249)
chr4 (99-244)||(53750907-53751060)
chr4 (99-245)||(30683531-30683686)
chr4 (99-245)||(1433276-1433430)
chr4 (94-248)||(8592257-8592419)
chr4 (94-248)||(33091453-33091615)
chr4 (94-246)||(38339782-38339942)
chr4 (94-232)||(55022284-55022429)
chr4 (94-229)||(25269307-25269450)
chr4 (99-245)||(50769112-50769266)
chr4 (97-246)||(20888146-20888303)
chr4 (99-248)||(36122438-36122595)
chr4 (115-248)||(39448509-39448650)
chr4 (94-248)||(8398031-8398193)
chr4 (95-192)||(52692025-52692122)
chr4 (99-248)||(19088346-19088503)
chr4 (105-249)||(12818093-12818245)
chr4 (105-248)||(19508423-19508575)
chr4 (94-193)||(47603712-47603811)
chr4 (115-246)||(23755439-23755578)
chr4 (94-248)||(6712251-6712411)
chr4 (94-193)||(4513267-4513366)
chr4 (246-329)||(23755625-23755708)
chr4 (94-246)||(37206428-37206587)
chr4 (94-230)||(44125776-44125920)
chr4 (94-248)||(21763180-21763343)
chr4 (101-244)||(41877867-41878017)
chr4 (94-225)||(44957668-44957807)
chr4 (143-248)||(53259187-53259300)
chr4 (250-329)||(6505743-6505822)
chr4 (99-193)||(49135988-49136082)
chr4 (94-248)||(25181812-25181974)
chr4 (94-248)||(41751818-41751978)
chr4 (94-182)||(31214162-31214250)
chr4 (121-229)||(623706-623822)
chr4 (149-244)||(50508512-50508615)
chr4 (94-189)||(47602943-47603038)
chr4 (94-193)||(52692791-52692889)
chr4 (99-193)||(44125627-44125721)
chr4 (115-180)||(55022424-55022489)
chr4 (99-131)||(31214258-31214290)
[»] scaffold0340 (2 HSPs)
scaffold0340 (95-329)||(18274-18516)
scaffold0340 (122-248)||(18561-18695)
[»] chr2 (50 HSPs)
chr2 (94-329)||(38332704-38332947)
chr2 (94-329)||(13192988-13193231)
chr2 (94-329)||(29472242-29472485)
chr2 (94-324)||(26181912-26182150)
chr2 (94-323)||(34735556-34735793)
chr2 (94-329)||(15405963-15406205)
chr2 (95-329)||(15744458-15744700)
chr2 (97-324)||(7469169-7469404)
chr2 (94-329)||(8174092-8174335)
chr2 (94-329)||(19815911-19816154)
chr2 (121-329)||(2148093-2148309)
chr2 (94-329)||(16305025-16305268)
chr2 (94-317)||(10991851-10992082)
chr2 (94-329)||(24372174-24372417)
chr2 (94-329)||(19847526-19847768)
chr2 (94-324)||(24138718-24138957)
chr2 (94-329)||(36713588-36713828)
chr2 (143-317)||(12860586-12860768)
chr2 (96-322)||(41474084-41474318)
chr2 (94-329)||(7496187-7496429)
chr2 (94-264)||(33470195-33470373)
chr2 (94-248)||(24371967-24372129)
chr2 (94-245)||(24138068-24138227)
chr2 (99-244)||(7469458-7469603)
chr2 (94-248)||(15405756-15405918)
chr2 (99-248)||(8173890-8174047)
chr2 (99-248)||(2147890-2148048)
chr2 (94-248)||(7495980-7496142)
chr2 (106-248)||(13193276-13193426)
chr2 (95-248)||(17052342-17052503)
chr2 (94-245)||(41474373-41474532)
chr2 (99-248)||(12860385-12860542)
chr2 (99-245)||(26181705-26181859)
chr2 (143-248)||(10992139-10992252)
chr2 (102-245)||(29472533-29472684)
chr2 (105-248)||(34735354-34735505)
chr2 (99-229)||(19815709-19815847)
chr2 (94-193)||(17050929-17051028)
chr2 (193-324)||(17052164-17052292)
chr2 (105-248)||(36713873-36714024)
chr2 (124-246)||(42834452-42834582)
chr2 (99-248)||(16305313-16305470)
chr2 (99-248)||(30898589-30898746)
chr2 (94-193)||(17032593-17032692)
chr2 (99-230)||(38332986-38333125)
chr2 (94-193)||(15744798-15744897)
chr2 (94-193)||(8963168-8963267)
chr2 (97-193)||(8962363-8962459)
chr2 (99-193)||(8444827-8444921)
chr2 (96-189)||(8445144-8445237)
[»] chr1 (75 HSPs)
chr1 (94-329)||(45052896-45053139)
chr1 (94-329)||(37304028-37304271)
chr1 (94-329)||(1762881-1763124)
chr1 (96-329)||(35612289-35612530)
chr1 (94-329)||(12481266-12481509)
chr1 (94-329)||(16023897-16024140)
chr1 (94-329)||(49140350-49140592)
chr1 (94-324)||(3089342-3089580)
chr1 (94-318)||(2064429-2064661)
chr1 (99-329)||(20306007-20306245)
chr1 (94-324)||(23476553-23476791)
chr1 (96-329)||(6798014-6798255)
chr1 (94-329)||(9006398-9006640)
chr1 (94-329)||(8762606-8762849)
chr1 (94-322)||(27547883-27548119)
chr1 (94-329)||(49643878-49644120)
chr1 (94-329)||(37284935-37285177)
chr1 (99-324)||(38127714-38127947)
chr1 (97-329)||(12127260-12127503)
chr1 (97-329)||(25995787-25996027)
chr1 (94-329)||(37576181-37576424)
chr1 (116-324)||(37585905-37586121)
chr1 (98-323)||(4330050-4330283)
chr1 (143-329)||(31703663-31703857)
chr1 (97-278)||(45843375-45843564)
chr1 (153-329)||(27400631-27400815)
chr1 (94-248)||(23476341-23476503)
chr1 (1-180)||(4697163-4697343)
chr1 (94-248)||(49140143-49140305)
chr1 (99-248)||(44322948-44323105)
chr1 (94-245)||(26723092-26723251)
chr1 (102-248)||(26707204-26707358)
chr1 (99-244)||(37585698-37585851)
chr1 (99-248)||(49643676-49643833)
chr1 (97-248)||(39486205-39486364)
chr1 (94-248)||(4696882-4697044)
chr1 (94-248)||(16024185-16024347)
chr1 (94-248)||(27547669-27547831)
chr1 (94-248)||(37576469-37576631)
chr1 (99-248)||(6797812-6797969)
chr1 (99-248)||(12481064-12481221)
chr1 (94-229)||(12127057-12127200)
chr1 (99-278)||(39486451-39486637)
chr1 (94-248)||(1762674-1762836)
chr1 (99-248)||(9006196-9006353)
chr1 (241-329)||(26707403-26707491)
chr1 (115-248)||(37304316-37304457)
chr1 (246-329)||(4697089-4697172)
chr1 (99-242)||(38000494-38000645)
chr1 (94-193)||(34967073-34967172)
chr1 (99-245)||(35612087-35612241)
chr1 (242-329)||(44322816-44322903)
chr1 (94-248)||(20306290-20306452)
chr1 (94-180)||(13183766-13183852)
chr1 (94-229)||(45052690-45052833)
chr1 (97-193)||(10831937-10832033)
chr1 (94-193)||(23598072-23598171)
chr1 (94-230)||(31703919-31704063)
chr1 (94-189)||(46593586-46593680)
chr1 (94-180)||(13109191-13109277)
chr1 (94-248)||(8760272-8760434)
chr1 (94-193)||(10831131-10831230)
chr1 (94-189)||(37467575-37467670)
chr1 (106-244)||(37284740-37284886)
chr1 (97-189)||(34966306-34966398)
chr1 (95-189)||(46592813-46592907)
chr1 (97-189)||(5537159-5537251)
chr1 (192-248)||(25996072-25996128)
chr1 (99-167)||(46289329-46289397)
chr1 (94-193)||(32047743-32047842)
chr1 (143-193)||(49837420-49837470)
chr1 (122-174)||(49838756-49838808)
chr1 (94-193)||(5536398-5536497)
chr1 (94-175)||(37466802-37466883)
chr1 (99-189)||(28884022-28884112)
[»] scaffold0182 (2 HSPs)
scaffold0182 (97-324)||(19711-19946)
scaffold0182 (99-248)||(19996-20153)
[»] chr6 (66 HSPs)
chr6 (94-329)||(32993222-32993465)
chr6 (94-329)||(34890644-34890887)
chr6 (97-329)||(24744332-24744571)
chr6 (94-329)||(9046086-9046329)
chr6 (97-329)||(5938020-5938260)
chr6 (94-329)||(18052956-18053199)
chr6 (94-329)||(34994587-34994830)
chr6 (94-324)||(7269951-7270191)
chr6 (94-329)||(5310826-5311069)
chr6 (94-329)||(26600357-26600600)
chr6 (99-324)||(6137590-6137822)
chr6 (97-329)||(5639380-5639620)
chr6 (97-329)||(31247119-31247359)
chr6 (94-324)||(21540189-21540428)
chr6 (97-324)||(31237749-31237984)
chr6 (97-324)||(2517005-2517240)
chr6 (94-324)||(21856767-21857005)
chr6 (147-329)||(26957015-26957205)
chr6 (94-329)||(32753177-32753416)
chr6 (99-329)||(6236128-6236366)
chr6 (133-329)||(7270668-7270872)
chr6 (143-329)||(3423377-3423571)
chr6 (94-248)||(6235921-6236083)
chr6 (99-248)||(34994385-34994542)
chr6 (94-248)||(9046374-9046536)
chr6 (94-271)||(6532192-6532377)
chr6 (169-317)||(25176876-25177032)
chr6 (101-248)||(18053241-18053396)
chr6 (99-248)||(32753461-32753618)
chr6 (101-248)||(5311114-5311269)
chr6 (94-248)||(3423170-3423332)
chr6 (94-248)||(21856555-21856717)
chr6 (94-248)||(35167490-35167652)
chr6 (99-248)||(5937818-5937975)
chr6 (192-324)||(35167702-35167836)
chr6 (105-248)||(34890932-34891083)
chr6 (99-248)||(15932844-15933001)
chr6 (94-237)||(26957260-26957411)
chr6 (94-248)||(978415-978577)
chr6 (115-248)||(26600635-26600776)
chr6 (94-229)||(2517309-2517452)
chr6 (94-245)||(7270920-7271079)
chr6 (99-242)||(25176668-25176819)
chr6 (94-248)||(31238034-31238196)
chr6 (94-248)||(31247404-31247566)
chr6 (99-244)||(32993020-32993173)
chr6 (94-246)||(6137379-6137538)
chr6 (94-193)||(7438804-7438903)
chr6 (94-248)||(24744609-24744770)
chr6 (121-237)||(10412800-10412924)
chr6 (94-193)||(15932730-15932829)
chr6 (94-193)||(17244664-17244763)
chr6 (99-193)||(14276404-14276498)
chr6 (94-189)||(29261306-29261401)
chr6 (94-189)||(34517272-34517367)
chr6 (94-193)||(34518043-34518142)
chr6 (95-189)||(29260532-29260626)
chr6 (97-193)||(15286348-15286444)
chr6 (94-248)||(7270241-7270403)
chr6 (94-166)||(35167833-35167905)
chr6 (94-173)||(25180219-25180298)
chr6 (147-232)||(3035933-3036027)
chr6 (94-193)||(6228730-6228828)
chr6 (94-193)||(34251554-34251651)
chr6 (207-248)||(5639294-5639335)
chr6 (121-189)||(27829320-27829388)
[»] scaffold0019 (2 HSPs)
scaffold0019 (94-329)||(50683-50927)
scaffold0019 (99-248)||(50481-50638)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (94-317)||(14354-14585)
scaffold0134 (94-248)||(14135-14297)
[»] chr5 (37 HSPs)
chr5 (94-329)||(9989323-9989566)
chr5 (97-329)||(32288284-32288523)
chr5 (94-329)||(36440407-36440650)
chr5 (95-329)||(37424469-37424713)
chr5 (94-329)||(2182943-2183186)
chr5 (94-329)||(38958931-38959173)
chr5 (94-329)||(24040292-24040537)
chr5 (94-329)||(27185874-27186116)
chr5 (94-329)||(34264555-34264802)
chr5 (115-329)||(35569987-35570209)
chr5 (94-329)||(25567195-25567438)
chr5 (121-290)||(11315985-11316162)
chr5 (94-248)||(36440200-36440362)
chr5 (94-245)||(16860303-16860462)
chr5 (94-248)||(27186161-27186323)
chr5 (94-248)||(37424262-37424424)
chr5 (99-248)||(24040090-24040247)
chr5 (99-248)||(25182941-25183098)
chr5 (115-248)||(9989611-9989752)
chr5 (94-255)||(39325636-39325805)
chr5 (99-247)||(39325417-39325573)
chr5 (99-246)||(32288083-32288237)
chr5 (94-248)||(38958724-38958886)
chr5 (94-230)||(1140079-1140215)
chr5 (99-245)||(35569780-35569934)
chr5 (122-246)||(11316244-11316376)
chr5 (115-248)||(2183231-2183372)
chr5 (251-329)||(16860627-16860705)
chr5 (115-243)||(29198973-29199109)
chr5 (251-329)||(16860510-16860588)
chr5 (99-193)||(19184602-19184696)
chr5 (237-321)||(29199167-29199251)
chr5 (96-169)||(33817659-33817732)
chr5 (128-193)||(34264396-34264461)
chr5 (94-163)||(19128434-19128503)
chr5 (99-189)||(31756657-31756747)
chr5 (94-175)||(19185553-19185634)
[»] scaffold0003 (5 HSPs)
scaffold0003 (115-329)||(349094-349316)
scaffold0003 (101-248)||(349361-349515)
scaffold0003 (239-324)||(113519-113604)
scaffold0003 (94-248)||(113654-113816)
scaffold0003 (94-193)||(113393-113492)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (94-329)||(45756-45999)
scaffold0037 (99-248)||(56424-56581)
scaffold0037 (99-248)||(63549-63706)
[»] scaffold0115 (2 HSPs)
scaffold0115 (94-329)||(21512-21754)
scaffold0115 (94-227)||(22462-22603)
[»] scaffold0221 (2 HSPs)
scaffold0221 (94-329)||(8429-8671)
scaffold0221 (99-248)||(8716-8873)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (94-329)||(24162-24405)
scaffold0186 (94-242)||(24456-24612)
[»] scaffold0029 (2 HSPs)
scaffold0029 (94-317)||(72762-72992)
scaffold0029 (94-248)||(73049-73211)
[»] scaffold0220 (2 HSPs)
scaffold0220 (94-329)||(20751-20993)
scaffold0220 (198-248)||(21038-21088)
[»] scaffold0246 (2 HSPs)
scaffold0246 (143-324)||(6047-6233)
scaffold0246 (125-248)||(6283-6413)
[»] scaffold0032 (3 HSPs)
scaffold0032 (192-329)||(82065-82202)
scaffold0032 (94-237)||(81858-82009)
scaffold0032 (115-193)||(90789-90867)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (97-329)||(15456-15691)
scaffold0072 (94-248)||(15736-15898)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (146-245)||(14243-14350)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (115-193)||(144041-144119)
scaffold0001 (143-193)||(147191-147241)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (121-238)||(9809-9933)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 38588588 - 38588830
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38588588 ggctaaattaccttttcg-tcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 38588686  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  38588687 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 38588786  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38588787 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 38588830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33296134 - 33295896
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296134 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 33296035  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296034 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 33295935  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33295934 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 33295896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Original strand, 7949415 - 7949650
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  7949415 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 7949514  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |    
T  7949515 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcc 7949614  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7949615 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 7949650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27473521 - 27473278
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27473521 ggctaaattacctttttggtcctctaacaatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 27473422  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  27473421 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttat 27473322  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27473321 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 27473278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15872071 - 15871828
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15872071 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcctctaaataaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 15871972  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15871971 actacatttagtcttttttgttagttttattcaaataaacgttagagcttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 15871872  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15871871 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 15871828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45077653 - 45077410
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  45077653 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttgattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 45077554  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  45077553 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttat 45077454  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45077453 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 45077410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 1432134 - 1432374
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  1432134 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 1432233  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  1432234 acatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatttgggtcctctaactttatttattaatatcattttgatcatatgcc 1432333  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  1432334 ttgttaatgtattatgtttaaatagtgactgatattattgg 1432374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 15048399 - 15048642
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15048399 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgtt 15048498  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15048499 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 15048598  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
       |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  15048599 tatttgttaaggtattatgattaaataatgattgatattattgg 15048642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45277046 - 45276803
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45277046 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 45276947  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45276946 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggattgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 45276847  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45276846 tccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattgg 45276803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44595050 - 44594808
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44595050 ggctaaattatctttttg-tcctctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaaccgtt 44594952  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||    
T  44594951 actacatttagtcatttcggttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtattattttggttctat 44594852  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44594851 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 44594808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1652016 - 1651779
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  1652016 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 1651917  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtctt 290  Q
       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||     
T  1651916 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcattttggtcatatatctc 1651818  T
Q  291 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1651817 gttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 1651779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 99 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1740392 - 1740155
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  1740392 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 1740293  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtctt 290  Q
       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||     
T  1740292 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttgttagtatcattttggtcatatatctc 1740194  T
Q  291 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1740193 gttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 1740155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5152982 - 5152753
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    ||||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5152982 gctaaattacctttttg-tcctctgactgtttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 5152884  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  5152883 ttacatttagttttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcatatg 5152784  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgac 317  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5152783 ccttcttaaggtattatgattaaatagtgac 5152753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 7535283 - 7535045
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7535283 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgtt 7535184  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  7535183 actacatttaatcctttatgttagttttattcaaataaacgttatagtttgtgttatgtgagtcctctagctttatttattagtatcattttggtcttat 7535084  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
      || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  7535083 tcctcgttaacgtattatgattaaataatgactgatatt 7535045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 1646956 - 1646719
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1646956 ggcttaattacctttttcgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 1646857  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1646856 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 1646758  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1646757 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 1646719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 121 - 321
Target Start/End: Original strand, 27669443 - 27669651
Alignment:
Q  121 ctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttt 212  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||        |||||||||||||||||||    
T  27669443 ctatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcactgttagtacatttagtcctttctgttagttt 27669542  T
Q  213 tattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaata 312  Q
    |||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||  |||||||||||||||    
T  27669543 tattgaaataaacgttagggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatataccttgttaaattattatgattaaata 27669642  T
Q  313 gtgactgat 321  Q
    |||||||||    
T  27669643 gtgactgat 27669651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 5435350 - 5435119
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||| ||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5435350 ggctaaattatctttttggtcctctaactatataattggtatcggattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 5435251  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5435250 actacatttagtcacttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatat 5435151  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgac 317  Q
    | || ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  5435150 gcctagttaaggtattataattaaataatgac 5435119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 97 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 11174081 - 11173858
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  11174081 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 11173982  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  ||||      
T  11173981 acatttagtcttttatgttagttttattcaaataaatgttagagtttagattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttgggttctatgct 11173882  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaata 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  11173881 ttgttaaggtattatgaataaata 11173858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Original strand, 1869934 - 1870173
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1869934 ggctaaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttctcaccgtt 1870032  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1870033 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgaattgtgggtcccctaactttatttattagtatcattttggtcttat 1870132  T
Q  286 gtcttgttaaggtat--tatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    | ||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1870133 gccttattaatgtattatatgattaaatagtgactgatatt 1870173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Original strand, 40048067 - 40048293
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| | |  |  | ||    
T  40048067 ggctaaattacttttttgataatctaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattaatttattttgattctctaactgttactacatt 40048166  T
Q  194 tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgtt 293  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||    
T  40048167 tagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttatgt----cctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcattgtt 40048262  T
Q  294 aaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40048263 aaggtattatgattaaatagtgactgatatt 40048293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 33819785 - 33819947
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  33819785 ggctaaattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 33819884  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  33819885 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 33819947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 192 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 37569659 - 37569527
Alignment:
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttg 291  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37569659 tttagtcttttcagttagttttattcaaataaacgttagagtttatgctacgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttg 37569560  T
Q  292 ttaaggtattatgatt-aaatagtgactgatat 323  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37569559 ttaaggtattatgattaaaatagtgactgatat 37569527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 106 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 38589025 - 38588875
Alignment:
Q  106 tttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagt 197  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  38589025 tttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactagatttagt 38588926  T
Q  198 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  38588925 cctttatgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggt 38588875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34470994 - 34470832
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||      
T  34470994 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccgtt 34470895  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  34470894 gctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggt 34470832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 37569320 - 37569476
Alignment:
Q  100 attacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-------- 191  Q
    |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  37569320 attacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactaca 37569419  T
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | ||||||||||    
T  37569420 tttagtcatttctgttagttttattcgaataaacgttatggtttttgttatgtgggt 37569476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 40660331 - 40660179
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||| |||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  40660331 aattacctttttggtcctctaactatttagttgttatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 40660232  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatg 243  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40660231 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatg 40660179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 5152540 - 5152696
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca--------cc 190  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |    
T  5152540 aattacctttttgatcctctaactgtttaattggtatcagattggtcctctgactaaaaattgatttattt-ggtcctctaagtttctcattgttactac 5152638  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5152639 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 5152696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 219 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11708067 - 11707957
Alignment:
Q  219 aataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgact 318  Q
    |||||||||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11708067 aataaacgttagggcttatattatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcttatgttttgttaaggtattatgattaaataatgact 11707968  T
Q  319 gatattcttgg 329  Q
    |||||| ||||    
T  11707967 gatattattgg 11707957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 1646501 - 1646663
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  1646501 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 1646600  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||    
T  1646601 actatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggt 1646663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 15048844 - 15048706
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  15048844 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 15048745  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 229  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15048744 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtta 15048706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 162 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 18298611 - 18298481
Alignment:
Q  162 atttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctct 253  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||        | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  18298611 atttattttggtcctctaagtttctcacaattactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgagtcctct 18298512  T
Q  254 aactttatttattagtatcattttgatcata 284  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18298511 aactttatttattagtatcattttaatcata 18298481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1870385 - 1870224
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca----- 188  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  1870385 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagatagatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaaagtt 1870286  T
Q  189 ---ccgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtggg 247  Q
        | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  1870285 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 1870224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 5434905 - 5435062
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||           
T  5434905 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctacctaaaatttgatttatttcggttttctaagtttctcaccgttactac 5435004  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5435005 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 5435062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 227
Target Start/End: Original strand, 1739953 - 1740089
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  1739953 aattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttattac 1740052  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgt 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1740053 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgt 1740089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 7534847 - 7534995
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtttagtc 198  Q
    ||||||||||||| |  ||||  |||||| ||| |||  |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  7534847 aattacctttttggtcttctaattatttagttgatatcggattagtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccgtt-agtc 7534945  T
Q  199 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  7534946 ctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 7534995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 11707750 - 11707912
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||        
T  11707750 ggcttaattatctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttgtttcgatcctctaagtttctcactgtt 11707849  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  11707850 aatacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 11707912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 45077221 - 45077364
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||           ||    
T  45077221 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa-----------tt 45077309  T
Q  194 tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  45077310 tagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtgggt 45077364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 22763383 - 22763284
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  22763383 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 22763284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 45276597 - 45276759
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  45276597 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgtt 45276696  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  45276697 actacatttagtcatttatattagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 45276759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 27473072 - 27473233
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  27473072 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacgtta 27473171  T
Q  190 ---cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
       | |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||||||    
T  27473172 ctacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacattatgatttgtgttatgtgggt 27473233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Original strand, 40659983 - 40660143
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  40659983 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcatctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgtt 40660082  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
        | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  40660083 actacatttagtcttttctaatagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 40660143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 15871621 - 15871783
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | || || ||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||        
T  15871621 ggcttaattacctttttggtcctttaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaaatttctcactgtt 15871720  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15871721 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 15871783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 40048499 - 40048342
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||   |||  |||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||           
T  40048499 aattacctttttgatcctctagttatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgttttattttgatcctctaagtttctcaccgttactac 40048400  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  40048399 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggt 40048342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 256 - 329
Target Start/End: Original strand, 34470714 - 34470787
Alignment:
Q  256 ctttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  34470714 ctttatttattagtatcattttgatcatattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacagatattattgg 34470787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 94 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11920222 - 11920136
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 180  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11920222 ggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttgggtcctctaa 11920136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27669849 - 27669709
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtcctttctgt 206  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||| |||        | ||||||| |||||||    
T  27669849 ctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcgat-ctttaagtttcacactgttactacatttagtcatttctgt 27669751  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||| ||||||||||    
T  27669750 tagttttattcaaataatcattagggtttgtgttatgtgggt 27669709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 44594606 - 44594763
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttct--------cacc 190  Q
    |||||| |||||| | |||||  |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |        |  |    
T  44594606 aattacatttttggtcctctaattatttaattgctattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttatattcgttactac 44594705  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||    
T  44594706 atttagttatttctgttagttttattcatataaacattagagtttgtgctatgtgggt 44594763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24659479 - 24659408
Alignment:
Q  253 taactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || | || ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24659479 taactttatttattagtatcattttggtcctctgccttattaaggtattctgattaaatagtgactgatatt 24659408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 193
Target Start/End: Original strand, 33295745 - 33295835
Alignment:
Q  103 acctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  33295745 acctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtattctaagtttgtcaccgtt 33295835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 22762513 - 22762612
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||  |||||| |  |||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||    
T  22762513 ggctaaattatatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcaccgtt 22762612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 24666128 - 24666029
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||   | || ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  24666128 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctttaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcaccgtt 24666029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 176
Target Start/End: Original strand, 24652823 - 24652905
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct 176  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||   | || |||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  24652823 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcct 24652905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 106 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 33820051 - 33819975
Alignment:
Q  106 tttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 182  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  33820051 ttttttatcctctaactatttaattggtatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcagtcttctaagt 33819975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 88)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 10506398 - 10506155
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10506398 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 10506299  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10506298 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 10506199  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10506198 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 10506155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 54108352 - 54108109
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  54108352 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcagtgtt 54108253  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54108252 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 54108153  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54108152 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 54108109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 94 - 323
Target Start/End: Original strand, 44893740 - 44893977
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44893740 ggctaaattatctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 44893839  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44893840 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 44893939  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatat 323  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  44893940 gtcttgttaagatattatgatcaaatagtgactgatat 44893977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32633515 - 32633272
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| |||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32633515 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattgttatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 32633416  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32633415 actacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 32633316  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32633315 ttcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 32633272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 42591784 - 42592027
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  42591784 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaatcggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgtt 42591883  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  42591884 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 42591983  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42591984 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 42592027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 95 - 324
Target Start/End: Original strand, 39241359 - 39241596
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  39241359 gctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtta 39241458  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  39241459 ctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaatgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatg 39241558  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39241559 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 39241596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 53716295 - 53716536
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53716295 ggctaaattacttttttg-tcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 53716393  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  53716394 actatatttggtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttacgtggg-cctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 53716492  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53716493 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 53716536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 29818180 - 29818420
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||       
T  29818180 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaaataaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgttact 29818279  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  29818280 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtt 29818379  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29818380 ttattaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 29818420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5900873 - 5900630
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5900873 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 5900774  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  5900773 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctat 5900674  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5900673 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatttttgg 5900630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 15986235 - 15986477
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15986235 ggctaaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcccctagctaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15986334  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15986335 actgcatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 15986434  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15986435 -tcgtgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 15986477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 329
Target Start/End: Original strand, 21969630 - 21969872
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21969630 gctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtta 21969729  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  21969730 ctacatttagtcctttttgttacttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttatt 21969829  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21969830 ccttgttaaggtattatgtttaaatagtgactgatattattgg 21969872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 329
Target Start/End: Original strand, 21992066 - 21992308
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     
T  21992066 gctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtta 21992165  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||     
T  21992166 ctacatttagtcctttttgttacttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcgttttggtcttatt 21992265  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  21992266 ccttgttaaggtattatgtttaaatagtgactgatattattgg 21992308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 95 - 316
Target Start/End: Original strand, 47669260 - 47669489
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  47669260 gctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 47669359  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  47669360 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatt 47669459  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtga 316  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47669460 ccttgttaagatattatgattaaatagtga 47669489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 8474293 - 8474058
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||       
T  8474293 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatgaccgttact 8474194  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  8474193 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattct 8474094  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8474093 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 8474058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 18464456 - 18464699
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18464456 ggctaaattacatttttgctcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 18464555  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18464556 actacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctatagctttatttattagtatcattttggtcatat 18464655  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18464656 gcattgttaaggtattatggttaaatagtgactgatattattgg 18464699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26318632 - 26318389
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26318632 ggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgtt 26318533  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26318532 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 26318433  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  26318432 tctttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattgg 26318389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39664634 - 39664391
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39664634 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 39664535  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  39664534 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctat 39664435  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  39664434 gccttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattgg 39664391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12203998 - 12203758
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  12203998 taaattaccgttttggtcccctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 12203899  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||     
T  12203898 acatttagtcctttctgatagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggacctctaactttatttattagtatcattttggtaatatgtt 12203799  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12203798 ttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattgg 12203758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 16931606 - 16931849
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaatt-ggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 192  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||   |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16931606 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaatttggtacg-gattggtgctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 16931704  T
Q  193 t--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcata 284  Q
    |        |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16931705 tactacatttagtcctttctgttagttttatacaaatatacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 16931804  T
Q  285 tgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16931805 tgtcttgttaaggtattaagattaaatagttactgatattattgg 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 22201619 - 22201859
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       
T  22201619 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaaataaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgttact 22201718  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  22201719 acatttagtcctttctgttaggtttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcc 22201818  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  22201819 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattgg 22201859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 51509541 - 51509326
Alignment:
Q  121 ctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttt 212  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||        ||||| |||||||||||||    
T  51509541 ctatttaattggtattggattagtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactacatttagtcttttctgttagttt 51509443  T
Q  213 tattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaata 312  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  51509442 tattcaaataaatgttagggtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgattaaata 51509343  T
Q  313 gtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||| ||||    
T  51509342 gtgactgatattattgg 51509326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 21568746 - 21568988
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21568746 ggctaaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 21568845  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21568846 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgg-tcctctaaccttatttattagtatcattttggtcatat 21568944  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  21568945 gccttgttaagatattatgattaaatagtgactaatattattgg 21568988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 22151845 - 22152088
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | || || ||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22151845 ggctaaattacatttttggtcctataactatttaattggtaacagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttctcaccgtt 22151944  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  22151945 actacatttagtcctttttgttaattttattcaaataaacgatagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 22152044  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22152045 tcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 22152088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 99 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 47303461 - 47303226
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||         
T  47303461 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaagtaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcaccgttactac 47303362  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtctt 290  Q
       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||    
T  47303361 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgt--tatgtgggtcctctaactttatttatta-tatcattttgatcatatgcctt 47303265  T
Q  291 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47303264 attaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 47303226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 54752163 - 54752406
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  54752163 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtataagattggtcctgtaactaaaaattgatttatttcggtcatataagtttctcaccgtt 54752262  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |  ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  54752263 actacatttgatcctttctgttagttttattcaaataaacattatggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 54752362  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54752363 tctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 54752406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 4773243 - 4773485
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4773243 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 4773342  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  4773343 actatatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 4773441  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4773442 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 4773485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Original strand, 27801492 - 27801727
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       
T  27801492 taaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 27801591  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |    
T  27801592 agatttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtggatcctctaactttatttattaatatcattttggttctatgcc 27801691  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27801692 ttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatatt 27801727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Original strand, 39951357 - 39951595
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||| |||||||  |||  |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  39951357 ggctaaattacccttttgatcatctgactatttaattggtatcggattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctttaagtttctcatcgtt 39951456  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39951457 actatatttagttctttatgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctttaactttatttattagtatcattttggtcatat 39951556  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39951557 gccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 39951595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 46152615 - 46152856
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt- 192  Q
    ||||||||||| | |||| | ||||| |||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  46152615 ggctaaattacatctttggtcctctaactatttaattggcatcgaattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatc 46152714  T
Q  193 -------ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||  | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  46152715 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatctgg--catctaactttatttattagtatcattttggtcatat 46152812  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46152813 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 46152856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 24428567 - 24428810
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  24428567 ggctaaattatctttttggtcctctaactattcaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgtt 24428666  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  24428667 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttgggatttgtgttatgtggatcctctaacttaatttattagtatcattttgctcctat 24428766  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24428767 gccttcttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 24428810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 11256103 - 11256346
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  11256103 ggcttaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaaataatttatttcgatcctttaagtttctcatcgtt 11256202  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  11256203 actacatttagtcctttttgatagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgtgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 11256302  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11256303 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 11256346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 99 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 1994613 - 1994389
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||         
T  1994613 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 1994514  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtctt 290  Q
       ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  |||    
T  1994513 atttagtcctttctgttatttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattcctt 1994414  T
Q  291 gttaaggtattatgattaaatagtga 316  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||    
T  1994413 gttaa-gaattatgattaaatagtga 1994389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41835373 - 41835133
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||  ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  41835373 taaattacctttttggtcctctaactatttaattgatattgaattagttctttaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 41835274  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  41835273 acatttagtcctttctattagttttatttaaataaacgttagtgtttgtgttacatgggtcatctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 41835174  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41835173 ttgttaatgtattttgattaaatagtgactgatattattgg 41835133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4757943 - 4757701
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4757943 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 4757844  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||    
T  4757843 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttctat 4757744  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||| ||| | |||||||| |||||||||| |||||| ||||    
T  4757743 tccttgataa-gaattatgatcaaatagtgaccgatattattgg 4757701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 94 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 28986591 - 28986392
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28986591 ggctaaattacctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 28986492  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28986491 actaatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatg 28986392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Original strand, 54107908 - 54108064
Alignment:
Q  100 attacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-------- 191  Q
    |||||||||||| |  |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
T  54107908 attacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactaca 54108007  T
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54108008 tttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 54108064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 39664184 - 39664346
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  39664184 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 39664283  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  39664284 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 39664346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 29818622 - 29818465
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           
T  29818622 aattacctttttgatcttctaattatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactac 29818523  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||    
T  29818522 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggattgtgttatgtgggt 29818465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 54752608 - 54752451
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||           
T  54752608 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcatcgttactac 54752509  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54752508 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 54752451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 44894185 - 44894030
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           
T  44894185 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggacctctaagtttctcaccgttactac 44894086  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
     ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  44894085 atttagtcttttatgttagttttattcaaataaacattagagtttgtgttatgtgg 44894030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Original strand, 10505953 - 10506099
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  10505953 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccattactac 10506052  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgt 237  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10506053 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 10506099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24429017 - 24428855
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  24429017 ggcttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtt 24428918  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24428917 actacatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24428855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21569189 - 21569033
Alignment:
Q  100 attacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-------- 191  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||            
T  21569189 attacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactaca 21569090  T
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  21569089 tttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 21569033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 42592234 - 42592074
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  42592234 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtt 42592135  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  42592134 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgg 42592074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Original strand, 45306832 - 45306976
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  45306832 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 45306931  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttag 230  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45306932 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttag 45306976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 12791626 - 12791475
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  12791626 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttctcaccgtt 12791527  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgt 237  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12791526 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgt 12791475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27801939 - 27801777
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        
T  27801939 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaattaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 27801840  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  27801839 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 27801777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 51509119 - 51509281
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      
T  51509119 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtt 51509218  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  51509219 cctacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 51509281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11256548 - 11256404
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||           
T  11256548 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactaa 11256449  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagttt 235  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11256448 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggttt 11256404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 1994169 - 1994331
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  1994169 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 1994268  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  1994269 gctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 1994331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 1999328 - 1999490
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  1999328 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 1999427  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  1999428 gctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 1999490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 16932051 - 16931905
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||           
T  16932051 aattacctttttggtcctctaactttttaattggtatcggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttctgtcctctaagtttctcaccgttactac 16931952  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgt 237  Q
     ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16931951 atttagtcttttctgttagtcttattcaaataaacgttagagtttgt 16931905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22202066 - 22201904
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  22202066 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggtt 22201967  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  22201966 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgctatgtgggt 22201904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 47669709 - 47669548
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  47669709 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttatttggtatcggattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 47669610  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtggg 247  Q
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  47669609 actacatttagtccttactgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggg 47669548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 206 - 324
Target Start/End: Original strand, 19883359 - 19883477
Alignment:
Q  206 ttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatga 305  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||||||    
T  19883359 ttagttttatttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtaccttaactttatttattagtatcattttggttctaagtcttgttaaggtattatga 19883458  T
Q  306 ttaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19883459 ttaaatagtgactgatatt 19883477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Original strand, 26318182 - 26318325
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26318182 ggcttaattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 26318281  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 229  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26318282 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtta 26318325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 45307142 - 45306991
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  45307142 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 45307043  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgt 237  Q
          ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  45307042 actacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaatgttagggtttgt 45306991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 12203551 - 12203713
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||        
T  12203551 ggcttaattaccttttttatcctctaactatttaattggtatcggattggtcatctaactaaaaattggtatatttcggtcctctaagtttctcactgtt 12203650  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  12203651 actacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 12203713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18464906 - 18464744
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  18464906 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 18464807  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  18464806 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 18464744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 47303019 - 47303181
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  47303019 ggcttaattacttttttgatcatctaactatttaattggtattgaatcagtcctctaattaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 47303118  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  47303119 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 47303181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 129 - 248
Target Start/End: Original strand, 41834961 - 41835088
Alignment:
Q  129 ttggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgttagttttattcaaa 220  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||| ||||||||||||||| |||| |||    
T  41834961 ttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttaatcctttctgttagttgtatttaaa 41835060  T
Q  221 taaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41835061 taaacgttagggtttgtgttatgtgggt 41835088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 4757494 - 4757656
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  4757494 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggaatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccatt 4757593  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  4757594 actacatttattcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 4757656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 5900423 - 5900585
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| |  |||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  5900423 ggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 5900522  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5900523 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 5900585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 15986684 - 15986526
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||| ||||||| | |||||  |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15986684 ggcttaattaactttttggtcctctaattatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15986585  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgt 244  Q
          ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15986584 actacatttagtcctttcaataagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 15986526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 53716743 - 53716581
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca----- 188  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||         
T  53716743 ggcttaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcatcatt 53716644  T
Q  189 ---ccgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  53716643 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaattaacgttagggtttgtgttatgtgggt 53716581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22152297 - 22152133
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctat--ttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac-- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||  ||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||      
T  22152297 ggcttaattacctttttggtcctctaactatatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctgagtttctcactg 22152198  T
Q  190 ------cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  22152197 ttactacatttagtcgtttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 22152133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 28985509 - 28985608
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28985509 ggcttaattacccttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctataagtttctcaccgtt 28985608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 4773681 - 4773530
Alignment:
Q  105 ctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttag 196  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||        | |||||    
T  4773681 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcactgttactacatttag 4773582  T
Q  197 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||    
T  4773581 tcctttatgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggt 4773530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 115 - 229
Target Start/End: Original strand, 8473867 - 8473989
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtcctttctgt 206  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        | ||||||| |||||||    
T  8473867 ctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcactgttactacatttagtcatttctgt 8473966  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgtta 229  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  8473967 tagttttattcaaataaacgtta 8473989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21970051 - 21969917
Alignment:
Q  122 tatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtcctttctgttagtttt 213  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||        | ||||||| ||||||||||||||    
T  21970051 tatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctcactgttactacatttagtcatttctgttagtttt 21969952  T
Q  214 attcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21969951 atttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 21969917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21992487 - 21992353
Alignment:
Q  122 tatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtcctttctgttagtttt 213  Q
    |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||        | ||||||| ||||||||||||||    
T  21992487 tatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattcatttatttcagtcctctgagtttctcactgttactacatttagtcatttctgttagtttt 21992388  T
Q  214 attcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  21992387 atttaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 21992353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 19883684 - 19883528
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  19883684 aattaccttttt-atcctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaaatgatttatttcggtcctctaagtttctcacagttactac 19883586  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     |||| || ||| | ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19883585 atttaatcgtttttattaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19883528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 44317665 - 44317566
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44317665 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 44317566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7681574 - 7681474
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 192  Q
    |||||||||||  ||||| | |||||  ||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7681574 ggctaaattacacttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 7681475  T
Q  193 t 193  Q
    |    
T  7681474 t 7681474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 49528149 - 49528248
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  49528149 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctagctaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 49528248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 189
Target Start/End: Original strand, 7163471 - 7163545
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7163471 ctctaactatttaattggtattggattggtcatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcac 7163545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Original strand, 13866025 - 13866119
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  13866025 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgtt 13866119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 161 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 39241741 - 39241646
Alignment:
Q  161 gatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  39241741 gatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtgggt 39241646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Original strand, 15790682 - 15790778
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  15790682 taaattatctttttggtcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttccatcccttaagtttctcaccgtt 15790778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 192 - 248
Target Start/End: Original strand, 28986266 - 28986322
Alignment:
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28986266 tttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 28986322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 146 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 46153008 - 46152904
Alignment:
Q  146 ctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac-----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtatt 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| ||    
T  46153008 ctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcactactacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttgaggtttgtgtt 46152909  T
Q  241 atgtg 245  Q
    |||||    
T  46152908 atgtg 46152904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 30681867 - 30681768
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||  || || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||    
T  30681867 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtaacagtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcaccgtt 30681768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 180
Target Start/End: Original strand, 42853246 - 42853331
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 180  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||  |||| || |||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  42853246 ggctaaattacctttttggt-ctctatctatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatgtgggtcctctaa 42853331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15791554 - 15791460
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||     ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15791554 ggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggat-----ctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 15791460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 192 - 248
Target Start/End: Original strand, 32633171 - 32633227
Alignment:
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||    
T  32633171 tttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatgatatgtgggt 32633227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 144 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 20963625 - 20963582
Alignment:
Q  144 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctc 187  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20963625 tcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctc 20963582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 43844484 - 43844386
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||  |||||| | || || |||||||||| ||||  | || |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||| |||||    
T  43844484 gctaaattatttttttggtcctttaactatttaattagtatcggtttggtcccctaactaaaaattgatttatttttgtcctttaaatttctctccgtt 43844386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 193
Target Start/End: Original strand, 43840010 - 43840059
Alignment:
Q  144 tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||||| |||||    
T  43840010 tcctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaaatttctctccgtt 43840059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44332969 - 44332726
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44332969 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 44332870  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  44332869 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 44332770  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44332769 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 44332726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 33716591 - 33716831
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  33716591 taaattagttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 33716690  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  33716691 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtc 33716790  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33716791 ttgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattgg 33716831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 10526311 - 10526553
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10526311 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 10526410  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||    
T  10526411 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccaat 10526510  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10526511 g-cctgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattgg 10526553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 48626513 - 48626270
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  48626513 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctgaccgtt 48626414  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  48626413 gctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 48626314  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  48626313 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 48626270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 113 - 324
Target Start/End: Original strand, 28297838 - 28298057
Alignment:
Q  113 ttctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttct 204  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||        ||||| |||||    
T  28297838 ttctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagttctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttct 28297937  T
Q  205 gttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatg 304  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  28297938 gttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgactagttaaggtattatg 28298037  T
Q  305 attaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  28298038 attaaatagtgactgatatt 28298057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 329
Target Start/End: Original strand, 17359185 - 17359424
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt-- 193  Q
    ||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17359185 ctaaattac-tttttg-ttctttaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttac 17359282  T
Q  194 ------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgt 287  Q
          ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |    
T  17359283 tacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctattt 17359382  T
Q  288 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17359383 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 17359424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 31638393 - 31638150
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  31638393 ggctaaattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaaatttctcatcgtt 31638294  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31638293 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttatggtttgtgtcatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 31638194  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31638193 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 31638150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Original strand, 6356765 - 6357003
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6356765 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 6356864  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  6356865 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagtgtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctat 6356964  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
      ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  6356965 tccttgttaaggtattatgattaaacagtgattgatatt 6357003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 95 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 41192134 - 41191897
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||     
T  41192134 gctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgtta 41192035  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41192034 ctacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatt 41191935  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41191934 tcttattaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 41191897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19681945 - 19681702
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19681945 ggctaaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 19681846  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19681845 actacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 19681746  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  19681745 ttcttgttaatgcattatgattaaatattgactgatattattgg 19681702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21391640 - 21391397
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        
T  21391640 ggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcactctt 21391541  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21391540 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagtgtttgtgttatgtggatcatctaactttatttattagtatcattttgatcttat 21391441  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21391440 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 21391397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 96 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 34037359 - 34037123
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt-- 193  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||      
T  34037359 ctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatatgattagtcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatctccgttac 34037260  T
Q  194 ------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgt 287  Q
          ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  34037259 tgcatttagtcctttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcatattt 34037160  T
Q  288 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34037159 tttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 34037123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41453452 - 41453212
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||       
T  41453452 taaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttact 41453353  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  |    
T  41453352 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattcc 41453253  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41453252 ttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattgg 41453212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 41751650 - 41751893
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | || || ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41751650 ggctaaattatctttttggtcctttaactatttaattgatattggattagtcctctaactaaaaattgacttatttcggtcctctaagtttctaaccgtt 41751749  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  41751750 actacatttaatcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcttctaactttatttattagtattattttggtcctat 41751849  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41751850 gtcttgttaagttattatgattaaatagtgactgatattattgg 41751893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Original strand, 8542499 - 8542737
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||  |  |||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8542499 ggctaaattacctttttcgtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccgtt 8542598  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  8542599 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcagagtttgtgttgtgtgggtcttctaactttatttattagcatcattttggtcatat 8542698  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8542699 tccttgttaaggtattatgattaaatattgacggatatt 8542737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8937299 - 8937056
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8937299 ggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattagtatcagatttgtcctctaattaaaagttgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 8937200  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  8937199 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattaatatcatgttggtcatat 8937100  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  8937099 tccttgttaaggtattgtgattaaatagtgattgatattattgg 8937056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 95 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28286566 - 28286324
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    |||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  28286566 gctaaattacatttttggtcctctaactttttaattggtatcggattagtcctttaactaaaaattgattgatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 28286467  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||     
T  28286466 ctacatttagttctttatattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggaactatt 28286367  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28286366 ccttcttaaggtattatgattaaatagtgaccgatattattgg 28286324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 99 - 329
Target Start/End: Original strand, 6356291 - 6356528
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||         
T  6356291 aattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttaccgttactac 6356390  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtctt 290  Q
       ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||     
T  6356391 atttagtcatttttgttagttttattcaaataaa-gttagattttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatatctc 6356489  T
Q  291 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6356490 gttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 6356528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 116 - 322
Target Start/End: Original strand, 36423391 - 36423605
Alignment:
Q  116 tctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgtt 207  Q
    |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||        | || |||||||||    
T  36423391 tctaactatttaattggcattagattggtcctctaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctcactgttgccacttttggttctttctgtt 36423490  T
Q  208 agttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgatt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||     
T  36423491 agttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatacctggttaaggtattatgatc 36423590  T
Q  308 aaatagtgactgata 322  Q
    |||||||||||||||    
T  36423591 aaatagtgactgata 36423605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 96 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7579320 - 7579079
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt-- 193  Q
    |||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||      
T  7579320 ctaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcatctaattttctcaccgttac 7579221  T
Q  194 ------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgt 287  Q
          ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||      
T  7579220 tacatttagtcctttattttagttatattcaaataaacgttatggtttttgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattc 7579121  T
Q  288 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  7579120 cttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattgg 7579079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 96 - 275
Target Start/End: Original strand, 1114056 - 1114243
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt-- 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||      
T  1114056 ctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacacagttac 1114155  T
Q  194 ------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatt 275  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1114156 taaatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcatt 1114243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 115 - 324
Target Start/End: Original strand, 43247436 - 43247653
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcc-tttctg 205  Q
    ||||| ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        || ||| |||||     
T  43247436 ctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactacatttactccctttcta 43247535  T
Q  206 ttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatga 305  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||||||    
T  43247536 ttagttttattcaaataaacattag-gtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcattgttaaggtattatga 43247634  T
Q  306 ttaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||||||||||||    
T  43247635 ttaaatagtgactgatatt 43247653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35147136 - 35146905
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg----- 191  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||         
T  35147136 taaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattagtcctctaactaaaatttgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttact 35147037  T
Q  192 ---tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||         || |||||||||||||||| | |||||||||| ||||||  |    
T  35147036 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttatggtttgt---------gttctctaactttatttatcaatatcattttggtcatattcc 35146946  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35146945 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 35146905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36423798 - 36423657
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgt 206  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||    
T  36423798 ctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttattacatttagtcctttctgt 36423699  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36423698 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36423657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Original strand, 21391190 - 21391350
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  21391190 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgct 21391289  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
          ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21391290 actacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgg 21391350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 121 - 261
Target Start/End: Original strand, 7909313 - 7909461
Alignment:
Q  121 ctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttt 212  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||||||||||||||||    
T  7909313 ctatttaattggtatcagattggttttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 7909412  T
Q  213 tattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttat 261  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  7909413 tattcaaataaacgttatagtttgtgttatgtggatcctctaactttat 7909461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 192 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40673349 - 40673214
Alignment:
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttg 291  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  ||||||| ||||    
T  40673349 tttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagta--attttagtcatatgccttg 40673252  T
Q  292 ttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  40673251 ttaaagtattagaattaaatagtgactgatattattgg 40673214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 35146699 - 35146861
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  35146699 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 35146798  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35146799 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 35146861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 97 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 4931720 - 4931556
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg----- 191  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||         
T  4931720 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgaattatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 4931621  T
Q  192 ---tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctct 253  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||    
T  4931620 atattcagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtaagtcctct 4931556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Original strand, 48626063 - 48626206
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  48626063 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 48626162  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 229  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48626163 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 48626206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6356735 - 6356573
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | || || |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  6356735 ggcttaattacctttttggtcctataactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 6356636  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||    
T  6356635 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggt 6356573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 7578872 - 7579034
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca----- 188  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  7578872 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaatgtt 7578971  T
Q  189 ---ccgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  7578972 acttcatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 7579034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10526760 - 10526598
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10526760 ggcttaattatcttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 10526661  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||    
T  10526660 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaagttttgtgttatgtgggt 10526598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 31075643 - 31075485
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  31075643 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 31075544  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgt 244  Q
          |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  31075543 actacatttagtcctttctgtttgttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgt 31075485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 41191683 - 41191844
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| ||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||      
T  41191683 ggcttaattaccttttt-atcctctaactatttagttgatattggattggtcctctaactaaaaattggtttatttcagttctctaagtttctcaccgtt 41191781  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  41191782 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 41191844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 27739114 - 27738935
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| ||||   |||| || ||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  27739114 ggctaaattactttttctgttctttaactatttatttggtatcagattgatcccctaactaaaaattgatttatttcggtccttttagtttctcaccgtt 27739015  T
Q  194 ----tagtc---ctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttatt 266  Q
        || |    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27739014 actatatttaatctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttatt 27738935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 116 - 248
Target Start/End: Original strand, 28286139 - 28286279
Alignment:
Q  116 tctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgtt 207  Q
    |||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||        ||||||| ||||||||    
T  28286139 tctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcatcgttactacatttagtcatttctgtt 28286238  T
Q  208 agttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  28286239 agttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 28286279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17363674 - 17363532
Alignment:
Q  106 tttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttc----tcac--cgtttagtcc 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    | ||  | |||||||     
T  17363674 tttttggttctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttcaatgttactacatttagtca 17363575  T
Q  200 tttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17363574 tttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 17363532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 17749935 - 17750097
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17749935 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggttctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 17750034  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||    
T  17750035 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatatgggt 17750097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 41453005 - 41453167
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  41453005 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 41453104  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||    
T  41453105 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatatgggt 41453167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 19681500 - 19681657
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||           
T  19681500 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagttttttgccgttactac 19681599  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19681600 atttattcctttctgttagttttagtcgaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19681657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 6357215 - 6357055
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||||| |||||  |||||| || ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  6357215 ggcttaattacatttttgatcctctaattatttagttagtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacagtt 6357116  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
        | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  6357115 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgctatgtgg 6357055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7909604 - 7909472
Alignment:
Q  106 tttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagt 197  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||    
T  7909604 ttttttatcctctaactatttaattgatattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttagtacatttagt 7909505  T
Q  198 cctttctgttagttttattcaaataaacgttag 230  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7909504 catttctgttagttttattcaaataaacgttag 7909472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 31637948 - 31638103
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||           
T  31637948 aattacctttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgaaccactaagtttctcaccgttactac 31638047  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||    
T  31638048 atttagtcatttctgttagttttattcatataaacgttagggtttgtgttacgtgg 31638103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 1114495 - 1114333
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  1114495 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 1114396  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  1114395 actacatttactcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 1114333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 8936849 - 8937011
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||| ||||||  | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  8936849 ggcttaattatctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactttt 8936948  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  8936949 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 8937011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 116 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 28298247 - 28298107
Alignment:
Q  116 tctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgtt 207  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||   ||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||        ||||||| ||||||||    
T  28298247 tctaactatttaattggtatcagatttaccctctaattaaaaattgatttatttcgattctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgtt 28298148  T
Q  208 agttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28298147 aattttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 28298107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Original strand, 16867707 - 16867799
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttct 186  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16867707 ggctaaattacctttttggtcctctaactatataattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttct 16867799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Original strand, 8416485 - 8416580
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  8416485 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcac 8416580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 36282786 - 36282885
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36282786 ggctaaattacatttttagtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 36282885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Original strand, 36673980 - 36674074
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36673980 aattacctttatggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgtt 36674074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 41752088 - 41751938
Alignment:
Q  106 tttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagt 197  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |        ||||||    
T  41752088 ttttttatcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctatctgttaccatatttagt 41751989  T
Q  198 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |  |||||||||    
T  41751988 tctttctgttagttttaatcaaataaacattagggtttatgctatgtgggt 41751938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 4155598 - 4155697
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  | ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  4155598 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 4155697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8417386 - 8417287
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  8417386 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcccttaagtttctcaccgtt 8417287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 8542943 - 8542793
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        |    
T  8542943 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtgactac 8542844  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattat 242  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  8542843 atttaatcctttctg-tagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttat 8542793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 186
Target Start/End: Original strand, 41891966 - 41892058
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttct 186  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  41891966 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttctttcggtcccttaagtttct 41892058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 36283653 - 36283560
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcg-tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    |||||||| |||||  ||||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| ||||||||    
T  36283653 taaattacattttttgttctctaactatttaattggtatcggatttgatcctctaactaaaaattgatttatttccgtcccttaaatttctcac 36283560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 36423850 - 36423790
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaacta 154  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  36423850 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggatttgtcctctaacta 36423790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29277793 - 29277698
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||   | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  29277793 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttatttggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcac 29277698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 36674179 - 36674095
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 180  Q
    |||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||  | || ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36674179 ggctaaattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcgggttagtctt--aactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 36674095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 192 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 17359529 - 17359479
Alignment:
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattat 242  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17359529 tttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 17359479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 127 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 32946758 - 32946696
Alignment:
Q  127 aattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  32946758 aattggtatcagattggtactctaactaaaaattgatttatttcggttttctaagtttttcac 32946696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 289 - 329
Target Start/End: Original strand, 17363437 - 17363477
Alignment:
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17363437 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 17363477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 33717005 - 33716872
Alignment:
Q  122 tatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt-------ttagtcctttctgttagtttta 214  Q
    |||||||||| |||  ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||  ||       |||||| ||| ||||| ||||     
T  33717005 tatttaattgatatcggattgatcatctaactaaaaattaatttatttcggtcatttaagtttctcattgttactacattagtcatttatgttaattttg 33716906  T
Q  215 ttcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||    
T  33716905 ttcaaataaacgttagggttggtgttatgtgggt 33716872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 180
Target Start/End: Original strand, 29276880 - 29276961
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 180  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||   | || ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  29276880 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaa 29276961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 288 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 17750183 - 17750147
Alignment:
Q  288 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17750183 cttgttaaggtattatgattaaataatgactgatatt 17750147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46540069 - 46540019
Alignment:
Q  143 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||    
T  46540069 gtcctctaactaaaaattgattcatttcaatcccttaagtttctcaccgtt 46540019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 86)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 14985331 - 14985574
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14985331 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatt 14985430  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  14985431 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttcgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 14985530  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14985531 gccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatattattgg 14985574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 96 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 52557535 - 52557294
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt-- 193  Q
    |||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||      
T  52557535 ctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgttac 52557436  T
Q  194 ------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgt 287  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52557435 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgt 52557336  T
Q  288 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  52557335 cttgttaaggtattatgattaaatagtaactgatattattgg 52557294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19088791 - 19088548
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19088791 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattaatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 19088692  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19088691 actatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcttat 19088592  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19088591 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 19088548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 21763631 - 21763388
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21763631 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtataagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 21763532  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  21763531 actacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgtttttat 21763432  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21763431 ttcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 21763388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15478095 - 15477852
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15478095 ggctaaattacctttttggtcttctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattaatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 15477996  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  15477995 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttacgtgggtcctctaactttgtttattagtatcattttggtcatat 15477896  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  15477895 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactcatattattgg 15477852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Original strand, 38339492 - 38339723
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  38339492 ggctgaattacctttttggtcctctaactatttaactggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcctctaagtttctcaccgtt 38339591  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  38339592 gctacatttagtcctttcggttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 38339691  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgac 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38339692 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 38339723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 30683976 - 30683735
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt-- 193  Q
    ||||||||  |||||| | |||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  30683976 ctaaattatatttttggtcctctaaatatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcgcaccgttat 30683877  T
Q  194 ------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgt 287  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  30683876 tacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgc 30683777  T
Q  288 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  30683776 cttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatattattgg 30683735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 24898192 - 24898432
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  24898192 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 24898291  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  24898292 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgcgtcctctaactttatttattagtatcattttggtcacatgtc 24898391  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  24898392 ttgttaatgtattatgattaaatagtgactaatattattgg 24898432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1433721 - 1433478
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||    
T  1433721 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaattttctcactgtt 1433622  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  1433621 actacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttat 1433522  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1433521 gccttgttatggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 1433478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 8591969 - 8592212
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8591969 ggctaaattacctttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 8592068  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  8592069 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctat 8592168  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8592169 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattgg 8592212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16038244 - 16038001
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16038244 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 16038145  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  16038144 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctat 16038045  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  16038044 tccttgttaaggtattatgattaagtagtgacggatattattgg 16038001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 53751352 - 53751109
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53751352 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 53751253  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  53751252 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttatgatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtataattttggtcttat 53751153  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  53751152 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgacttatattattgg 53751109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Original strand, 12817806 - 12818044
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  12817806 ggctaaattacctttttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttatcactgtt 12817905  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  12817906 actacatttagccctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctgtaactttatttatcagtatcattttggtcatat 12818005  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12818006 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatatt 12818044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33091900 - 33091660
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||| |||||  | ||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||       
T  33091900 taaattacatttttagtcctctaactatttaattagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcatctaagtttctcaccgttact 33091801  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||      
T  33091800 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgct 33091701  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33091700 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 33091660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 39448938 - 39448707
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39448938 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 39448839  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  39448838 actacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttat 39448739  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgac 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39448738 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 39448707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 50768821 - 50769064
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||   ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50768821 ggcttaattacctttttgatcctttaactatttaattggtatcgaattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 50768920  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  50768921 actacatttagtactttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcttat 50769020  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50769021 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 50769064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41752264 - 41752023
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    ||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||     
T  41752264 gctaaattaccttttgg-tcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattcatttattttggtcctctaagtttctcactgtta 41752166  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41752165 ctacatgtagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaattttatttattaatatcattttgatcatatg 41752066  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41752065 ccttgctaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 41752023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 95 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 53259587 - 53259345
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    ||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  53259587 gctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtta 53259488  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  53259487 ctacatttagtcatttctgttagttttattcaaatacacgttagagtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatg 53259388  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||||    
T  53259387 ccttgttaaggtattatgattaaacaatgagtgatattattgg 53259345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 46850116 - 46849876
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||| ||||||| |  |||| ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||       
T  46850116 taaattatctttttggtcatctaactattaaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcaccgttact 46850017  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |    
T  46850016 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttattcc 46849917  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  46849916 ttgttaagatattatgattaaatagtgaccgatattattgg 46849876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 6711963 - 6712206
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||  ||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6711963 ggctaaattatatttttggccctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 6712062  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  6712063 actacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctgt 6712162  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6712163 gccttattaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 6712206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 44957389 - 44957632
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||| |||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44957389 ggctaaattatatttttggtcctctaactattttattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 44957488  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44957489 actgcatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 44957588  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44957589 gccttgataatgtattatgattaaatagtgactgatattattgg 44957632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 44991728 - 44991485
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44991728 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactgaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 44991629  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  44991628 attacatttagtcttttttgttagttttgttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttat 44991529  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44991528 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 44991485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 126 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 19508831 - 19508625
Alignment:
Q  126 taattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattc 217  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||        ||||||||||||||||||||||||    
T  19508831 taattgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctccaagtttctcacccttactacatttagtcctttctgttagttttattc 19508732  T
Q  218 aaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgac 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19508731 aaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatgattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaacagtgac 19508632  T
Q  318 tgatatt 324  Q
    |||||||    
T  19508631 tgatatt 19508625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 106 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 43734724 - 43734498
Alignment:
Q  106 tttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagt 197  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||    
T  43734724 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccgttattacatttagt 43734625  T
Q  198 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaagg 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||      
T  43734624 cctttctgttagttttattcaaataaacgttaagatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaaa 43734525  T
Q  298 tattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  43734524 tattatgattaaatagtgactgatatt 43734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23756247 - 23756012
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||       
T  23756247 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattaatttattttggtcctctaagtttctcaccgttact 23756148  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  23756147 atatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgcgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtt 23756048  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23756047 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 23756012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 36122882 - 36122640
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  36122882 ggctaaattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatt-atttcggtcctctaagtttctcactgtt 36122784  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  36122783 attacatttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatataggtcctctaactatatttattagtatcattttggtcatat 36122684  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||    
T  36122683 gccttgttaaggtattatgactaaatagtgattgatattattgg 36122640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37206877 - 37206634
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  37206877 ggctaaattaccttttttgttctctaactatttaattgatatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttttcatcgtt 37206778  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            || || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37206777 actacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 37206678  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
       ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  37206677 tctttgttaaggtattatgattaaatagtggctgatattattgg 37206634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 50508907 - 50508664
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  50508907 ggctaaattatctttttggttttctaattatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcaccgtt 50508808  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  50508807 actgcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttatgttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatat 50508708  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  50508707 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattgg 50508664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 53995385 - 53995141
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53995385 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgcattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 53995286  T
Q  194 --------tagtcctttct--gttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcat 283  Q
            ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  53995285 actacatttagtcctttttatgttagttttattcaaataa-cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcct 53995187  T
Q  284 atgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53995186 attccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 53995141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 624129 - 623886
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  624129 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgtt 624030  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  624029 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagcatcattttggtcttat 623930  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  623929 tccttgttaagatattatgattaaatagtgacagatattattgg 623886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25182262 - 25182019
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25182262 ggctaaattatctttttggtcttctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 25182163  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || |||    
T  25182162 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtttgagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtcctat 25182063  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25182062 tccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgg 25182019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 42855789 - 42855546
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||  |  | || |||||||||| ||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42855789 ggctaaattacctttttagtcatttaactatttaattagtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 42855690  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  42855689 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 42855590  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      || |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42855589 tcctcgttaaggtattatgattaaataatgactgatattattgg 42855546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 41878308 - 41878066
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||| ||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  41878308 ggctaaattacttttttggtcctctaactatataattggaatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattgcggtcctctaagtttctcactgtt 41878209  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  41878208 actacattagtcctttctgctagttttattcaaataaatgttagggtttatgttatgtgggtcctccaactttatttattagtatcattttggtcatatt 41878109  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  41878108 atttgttaaggtattatgattaaatattgactgatattattgg 41878066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 138 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 43566784 - 43566585
Alignment:
Q  138 gattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 229  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  43566784 gattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcttttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttatttaaataaacgtta 43566685  T
Q  230 gagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |  ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  43566684 ggatttgtgttatgtgggtcctcaaactttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattgg 43566585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 44991279 - 44991441
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44991279 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 44991378  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  44991379 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 44991441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 16037794 - 16037956
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  16037794 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 16037893  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  16037894 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggt 16037956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24898639 - 24898477
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||  | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||      
T  24898639 ggcttaattactttttttgtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccgtt 24898540  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24898539 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24898477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 46849669 - 46849831
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |      
T  46849669 ggcttaattacctttttcgtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgtt 46849768  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  46849769 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 46849831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 53994934 - 53995096
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  53994934 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 53995033  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53995034 actacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 53995096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 42855344 - 42855501
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  42855344 aattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggagtggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 42855443  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  42855444 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaaggttagggtttgtgttatgtgggt 42855501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 43734291 - 43734448
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  43734291 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 43734390  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  43734391 atttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 43734448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 43566383 - 43566538
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt------ 192  Q
    ||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
T  43566383 aattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 43566482  T
Q  193 --ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
      |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  43566483 aattagtcatttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 43566538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 6505537 - 6505698
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  6505537 ggcttaattacatttttgatcctctaactatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 6505636  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  6505637 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaa-gttagggtttgtgttatgtgggt 6505698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 14985781 - 14985619
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||        
T  14985781 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaatttgtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcactgtt 14985682  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  14985681 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 14985619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 15477645 - 15477807
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  15477645 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaacattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgtt 15477744  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15477745 actacatttagtccattctgttagttttattaaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggt 15477807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 52557092 - 52557249
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||        |    
T  52557092 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttcttactgttactac 52557191  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52557192 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 52557249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 53750907 - 53751060
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||  | ||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  53750907 aattacctttttagtcctctaactattaaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 53751006  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgt 244  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  53751007 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 53751060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 30683531 - 30683686
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  30683531 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctccaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 30683630  T
Q  192 -tttagtcctttctgttag-ttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
     ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30683631 atttagtcatttctgttagtttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 30683686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 1433276 - 1433430
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||           
T  1433276 aattatctttttggtcctctaactatttcattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggttctctaagtttctcatcgttattac 1433375  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  1433376 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 1433430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8592419 - 8592257
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  8592419 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 8592320  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  8592319 actacatttagtcctttctgtttgttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 8592257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 33091453 - 33091615
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||        
T  33091453 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaatcagtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcaccatt 33091552  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  33091553 actgcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 33091615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 38339942 - 38339782
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||        
T  38339942 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcacactgtt 38339843  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
        | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  38339842 actacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 38339782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 232
Target Start/End: Original strand, 55022284 - 55022429
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt- 192  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||     
T  55022284 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgtt 55022383  T
Q  193 ------ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagag 232  Q
          ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55022384 actacatttatcctttctgttagttttattaaaataaacgttagag 55022429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25269450 - 25269307
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  25269450 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 25269351  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 229  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25269350 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 25269307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 50769266 - 50769112
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||           
T  50769266 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttactac 50769167  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  50769166 atttagtcatttcttttagttttattcaaataaacgttagggtttttgttatgtg 50769112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 97 - 246
Target Start/End: Original strand, 20888146 - 20888303
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac------- 189  Q
    ||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  20888146 taaattaccttttaggtactctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttact 20888245  T
Q  190 -cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
     | ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||    
T  20888246 gcatttagtcatttctgttagttttattcaaatgaatgttagggtttgtgttatgtgg 20888303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 36122438 - 36122595
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||        |    
T  36122438 aattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttttgtcatctaagtttttcactgttactac 36122537  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36122538 atttaatcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36122595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Original strand, 39448509 - 39448650
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgt 206  Q
    ||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||||||| |||    
T  39448509 ctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcctttttgt 39448608  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  39448609 tagttttatttaaataagcgttagagtttgtgttatgtgggt 39448650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 8398031 - 8398193
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca----- 188  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||         
T  8398031 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaactttctcattgtt 8398130  T
Q  189 ---ccgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  8398131 actacatttagtcatttctattagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 8398193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 95 - 192
Target Start/End: Original strand, 52692025 - 52692122
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 192  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  52692025 gctaaattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgt 52692122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 19088346 - 19088503
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    ||||| ||||||| | ||||| ||||||| |||||||  || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||         
T  19088346 aattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcggaatgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttaataccgttactac 19088445  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19088446 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 19088503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12818245 - 12818093
Alignment:
Q  105 ctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca--------ccgtttag 196  Q
    ||||||| | |||||  ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||         | |||||    
T  12818245 ctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtgctctaactaaaacttgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttactacatttag 12818146  T
Q  197 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtc 249  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  12818145 tcctttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtc 12818093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Original strand, 19508423 - 19508575
Alignment:
Q  105 ctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttag 196  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||        | |||||    
T  19508423 ctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaacaattgatttatgtcggccctctaagtttctcactgtgactacatttag 19508522  T
Q  197 tcctttctgttagttttattcaaataaacgtta-gagtttgtattatgtgggt 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  19508523 tcatttctgttagttttattcaaataaacgttaggggtttgtgttatgtgggt 19508575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 47603811 - 47603712
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  47603811 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 47603712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 246
Target Start/End: Original strand, 23755439 - 23755578
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgt 206  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| | ||        ||||||||||| |||    
T  23755439 ctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggttctctaagtttcttatcgttactacatttagtcctttatgt 23755538  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||    
T  23755539 tagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttacgtgg 23755578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6712411 - 6712251
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| | ||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||        
T  6712411 ggcttaattacctttttggt-ctctaactatttaattggtaatggattgatcctctaactacaaattgatttatttcggtcctctaaattt-tcactgtt 6712314  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  6712313 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 6712251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4513366 - 4513267
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4513366 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 4513267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23755708 - 23755625
Alignment:
Q  246 ggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23755708 ggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgctttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattgg 23755625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Original strand, 37206428 - 37206587
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| ||| |||||  |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  37206428 ggcttaattacctttt-gatcctctaactattcagttgatatcagattaatcctctagttaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgtt 37206526  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  37206527 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 37206587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44125920 - 44125776
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||| ||||||||||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  44125920 ggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtgtcggattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 44125821  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttag 230  Q
        | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44125820 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttag 44125776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 21763180 - 21763343
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||      
T  21763180 ggcttaattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctccaactaaaaattgatttatttcggtcctccaggtttttcaccgtt 21763279  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttag-ttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21763280 actacatttagtcatttctgtttgtttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 21763343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 101 - 244
Target Start/End: Original strand, 41877867 - 41878017
Alignment:
Q  101 ttacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgt 192  Q
    ||||||||||| |  ||||  |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        | |    
T  41877867 ttacctttttggtcatctaattatttagttggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaag-ttctcactgttactacat 41877965  T
Q  193 ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgt 244  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||    
T  41877966 ttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgt 41878017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 44957807 - 44957668
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        
T  44957807 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcaaattggtcctttaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcacattt 44957708  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaac 225  Q
        | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44957707 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaac 44957668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 143 - 248
Target Start/End: Original strand, 53259187 - 53259300
Alignment:
Q  143 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt 234  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  53259187 gtcctctaactaaaaattaattaatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtt 53259286  T
Q  235 tgtattatgtgggt 248  Q
    ||| ||||||||||    
T  53259287 tgtgttatgtgggt 53259300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6505822 - 6505743
Alignment:
Q  250 ctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6505822 ctctaattttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 6505743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 49136082 - 49135988
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49136082 aattactttttttatcgtctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 49135988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 25181812 - 25181974
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| || ||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||        
T  25181812 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagtttgtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttattttggtcttctaagtttctcactgtt 25181911  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
T  25181912 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatatgggt 25181974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 41751818 - 41751978
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | || || |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||        
T  41751818 ggcttaattacctttttg-tcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggt-ctttaagtttctcactgtt 41751915  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  41751916 actacatttagtctttactgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 41751978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 182
Target Start/End: Original strand, 31214162 - 31214250
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31214162 ggctaaattacatttttgatcatctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctcaaagt 31214250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 229
Target Start/End: Original strand, 623706 - 623822
Alignment:
Q  121 ctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgttagttt 212  Q
    ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||        |||||||||||||||||||||    
T  623706 ctatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgttttattttggtcctataagtttcttaccgttactacatttagtcctttctgttagttt 623805  T
Q  213 tattcaaataaacgtta 229  Q
    |||||||||||||||||    
T  623806 tattcaaataaacgtta 623822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 149 - 244
Target Start/End: Original strand, 50508512 - 50508615
Alignment:
Q  149 taactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtatt 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  50508512 taactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttttgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgtt 50508611  T
Q  241 atgt 244  Q
    ||||    
T  50508612 atgt 50508615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Original strand, 47602943 - 47603038
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  47602943 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcac 47603038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 52692889 - 52692791
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | || || ||||||||||| |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  52692889 ggctaaattacctttttggtcctttagctatttaattgctatc-gattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgtt 52692791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Original strand, 44125627 - 44125721
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||| ||||||| | || || ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  44125627 aattatctttttggtcctttaactatttaattggtattaaattggttctctaactaaaaattgatttttttcggttttctaagtttctcaccgtt 44125721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 55022489 - 55022424
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 180  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55022489 ctctaactatttaattggtatcggattaatcctctaattaaaaattgatttatttcgatcctctaa 55022424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 99 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 31214290 - 31214258
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattg 131  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31214290 aattacctttttgattctctaactatttaattg 31214258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 95 - 329
Target Start/End: Original strand, 18274 - 18516
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--- 191  Q
    |||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||       
T  18274 gctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttaggtcttctaagtttctcaccgcta 18373  T
Q  192 -----tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18374 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatg 18473  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18474 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 18516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 122 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18695 - 18561
Alignment:
Q  122 tatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtcctttctgttagtttt 213  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||        | ||||||| ||||||||||||||    
T  18695 tatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttttcactgttactacatttagtcttttctgttagtttt 18596  T
Q  214 attcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18595 attcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 18561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 50)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 38332704 - 38332947
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38332704 ggctaaattacatttttggttctctaactatttaattggtattggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 38332803  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  38332804 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 38332903  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38332904 gccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 38332947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 13192988 - 13193231
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13192988 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 13193087  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13193088 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 13193187  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  13193188 gccttgttaaggtattatgattaaataatgactcatattattgg 13193231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 29472242 - 29472485
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29472242 ggctcaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaatagatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 29472341  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29472342 cctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 29472441  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29472442 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 29472485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 26182150 - 26181912
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | || ||  |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  26182150 ggctaaattacatttttggtcctttaattatttaattgatatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggccctctaagtttctcactgtt 26182051  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26182050 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 26181951  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26181950 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 26181912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 94 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 34735793 - 34735556
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  34735793 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgtt 34735694  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  34735693 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 34735594  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatat 323  Q
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  34735593 tccttgttaaggtattaggattaaatagtgactgatat 34735556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 15406205 - 15405963
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  15406205 ggctaaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgtt 15406107  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  15406106 actacatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttggtcatat 15406007  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  15406006 gtcttgttaaggtattatgattaaacagtgactgatattattgg 15405963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 95 - 329
Target Start/End: Original strand, 15744458 - 15744700
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||     
T  15744458 gctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaactgtta 15744557  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||     
T  15744558 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatatt 15744657  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  15744658 ccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattgg 15744700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Original strand, 7469169 - 7469404
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  7469169 taaattacctttttggccctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttact 7469268  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||  |    
T  7469269 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttactagtatcattttggtcctattcc 7469368  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  7469369 ttgttaaggtattatgattaaatagttagtgatatt 7469404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8174335 - 8174092
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8174335 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctttaaatttctcaccgtt 8174236  T
Q  194 t--------agtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
    |        |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  8174235 tctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgtttttat 8174136  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8174135 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 8174092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19816154 - 19815911
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||    
T  19816154 ggctaaattacctttttggtcctcaaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcagaccatt 19816055  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19816054 actacatttagtcctttctgctagttttattcaaataaacgttagagtctgtgttatgtgggtcctctgactttatttattagtatcattttgctcatat 19815955  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19815954 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 19815911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 2148309 - 2148093
Alignment:
Q  121 ctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttt 212  Q
    |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||        ||||| |||||||||||||    
T  2148309 ctatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttctcatcgttactacatttagtcatttctgttagttt 2148210  T
Q  213 tattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaata 312  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2148209 tattcaaataaacgttagagtttctgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgtcttgttaaggtattatgattaaata 2148110  T
Q  313 gtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||| ||||    
T  2148109 gtgactgatattattgg 2148093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 16305025 - 16305268
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcg-tcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--- 189  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  16305025 ggctaaattacatttttg-tcctctaactatttaattggtatcggatttggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaat 16305123  T
Q  190 -----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcata 284  Q
         | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  16305124 tactacatttagttctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta 16305223  T
Q  285 tgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  16305224 tgtcttgttaagatattatgattaaatagtgattgatattattgg 16305268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Original strand, 10991851 - 10992082
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  10991851 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttttcaccgtt 10991950  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  10991951 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttacagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctat 10992050  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgac 317  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  10992051 gtcttgctaagatattatgattaaatagtgac 10992082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24372417 - 24372174
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24372417 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 24372318  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  24372317 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattaggatttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 24372218  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24372217 tcctttttaaagtattatgattaaattgtgactgatattattgg 24372174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 19847768 - 19847526
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| |||||| |||||| |  |||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19847768 ggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtattggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtt 19847669  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  19847668 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatat 19847569  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19847568 tccttgttaa-gaattatgattaaatagtgaccgatattattgg 19847526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 24138957 - 24138718
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| |  |||| ||||||||||||||| | ||| || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  24138957 ggcttaattacctttttggtattctaactatttaattggtatcaaattagtactttaattaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgtt 24138858  T
Q  194 --------tagtccttt-ctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcata 284  Q
            ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24138857 actacatttagtctttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 24138758  T
Q  285 tgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  24138757 tgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatatt 24138718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 36713588 - 36713828
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||  || |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||    
T  36713588 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttatgtcctctaaatttctcagtgtt 36713687  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |  |||    
T  36713688 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattag--tcattttggttctat 36713785  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36713786 gccttgttaaggtattatgatt-aatagtgactgatattattgg 36713828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 143 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 12860768 - 12860586
Alignment:
Q  143 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  12860768 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttacggtt 12860669  T
Q  235 tgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgac 317  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12860668 tgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 12860586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 96 - 322
Target Start/End: Original strand, 41474084 - 41474318
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt-- 193  Q
    ||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||  |||  ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  41474084 ctaaattacatttttggtcttctaactatttaattggtatcggatcggtcctgtaattaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttctcactgttat 41474183  T
Q  194 ------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgt 287  Q
          ||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41474184 tacatttagtcttttatgttagttttatttaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcatctaactttatttattagtatcattttgatcctatgc 41474283  T
Q  288 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgata 322  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41474284 cttgttaaggtattataattaaatagtgactgata 41474318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 7496429 - 7496187
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| |||||| |||||  | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7496429 ggcttaattacatttttagtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 7496330  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  7496329 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagcatcattttggtcctat 7496230  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  7496229 tccttgttaa-gaattatgagtaaatagtgaccgatattattgg 7496187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 94 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 33470373 - 33470195
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33470373 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctgactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 33470274  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttattta 264  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33470273 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttattta 33470195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 24371967 - 24372129
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24371967 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 24372066  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24372067 actacatttagttctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggt 24372129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 245
Target Start/End: Original strand, 24138068 - 24138227
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  24138068 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgtt 24138167  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  24138168 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtg 24138227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 7469603 - 7469458
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtttagtc 198  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7469603 aattacctttttggttctctaactatttagttggtatcagattggttctctaactaaaaattgatttatttcagtcgtctaagtttctcatcgtttagtc 7469504  T
Q  199 ctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgt 244  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  7469503 atttatgttagttttattcaaataaacgttatggtttgtgttatgt 7469458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 15405756 - 15405918
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  15405756 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgtt 15405855  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15405856 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 15405918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 8173890 - 8174047
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  8173890 aattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 8173989  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||    
T  8173990 atttagtcctttctgttaattttattcaaatgaacgttagggtttgtgttatgtgggt 8174047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 2147890 - 2148048
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaact-aaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------ 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||          
T  2147890 aattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaaaatgatttatttcgggcctctaagtttctcaccgttacta 2147989  T
Q  192 --tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2147990 catttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 2148048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 7495980 - 7496142
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |      
T  7495980 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 7496079  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  7496080 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggt 7496142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 13193426 - 13193276
Alignment:
Q  106 tttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagt 197  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||    
T  13193426 tttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagt 13193327  T
Q  198 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13193326 cttttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 13193276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17052503 - 17052342
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--- 191  Q
    |||||||||| | |||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||        
T  17052503 gctaaattacatgtttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccntta 17052404  T
Q  192 -----tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
         ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  17052403 ctacatttagtcatttctgttagtttcattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggt 17052342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 94 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 41474532 - 41474373
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||| ||||||| | |||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||        
T  41474532 ggcttaattatctttttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctgagtttctcactgtt 41474433  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41474432 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 41474373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 12860385 - 12860542
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  12860385 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactac 12860484  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  12860485 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 12860542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 26181705 - 26181859
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  26181705 aattacctttttggtcctctaactatttaattggaattggattggtccactaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 26181804  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
       || ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||    
T  26181805 atatattcctttctgttagttttattcaaataaaccttaaggtttgtgttatgtg 26181859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 143 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 10992252 - 10992139
Alignment:
Q  143 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10992252 gtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt 10992153  T
Q  235 tgtattatgtgggt 248  Q
    ||| ||||||||||    
T  10992152 tgtgttatgtgggt 10992139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 29472684 - 29472533
Alignment:
Q  102 tacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tt 193  Q
    |||||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||        ||    
T  29472684 tacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattgatcctctaacaaaaaattgatttattttggtcctctaaatttctcaccgttactacatt 29472585  T
Q  194 tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  29472584 tagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 29472533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Original strand, 34735354 - 34735505
Alignment:
Q  105 ctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttag 196  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| |||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||    
T  34735354 ctttttggtcctctaactatttagttggtatcgaattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttag 34735453  T
Q  197 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34735454 tcctttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 34735505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 229
Target Start/End: Original strand, 19815709 - 19815847
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  19815709 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 19815808  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 229  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19815809 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 19815847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 17050929 - 17051028
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17050929 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaagtttctcaccgtt 17051028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 324
Target Start/End: Original strand, 17052164 - 17052292
Alignment:
Q  193 ttagtcctttctgttagttttattcaaataaa-cgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttg 291  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||      |    
T  17052164 ttagtctttgctgttagttttattcaaataaaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtctta----acg 17052259  T
Q  292 ttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17052260 ttaaggtattatgattaaataatgactgatatt 17052292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 36714024 - 36713873
Alignment:
Q  105 ctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt--------ttag 196  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||        ||||    
T  36714024 ctttttggttctctaactatttaattggtattgaattggtcctcaaactaaaaattgatttattttcgtcatctaggtttctcaccgttaccacacttag 36713925  T
Q  197 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36713924 tcatttctgtttgttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36713873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 246
Target Start/End: Original strand, 42834452 - 42834582
Alignment:
Q  124 tttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtcctttctgttagttttat 215  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        | ||||||| ||||||||||||||||    
T  42834452 tttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactattactacatttagtcttttctgttagttttat 42834551  T
Q  216 tcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  42834552 tcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 42834582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16305470 - 16305313
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||           
T  16305470 aattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcaatcctctaagtttctcaccgttactac 16305371  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||||||    
T  16305370 atttagtcttttttgttagttttattcaaataagagttatggtttgtgttatgtgggt 16305313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 30898746 - 30898589
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||           
T  30898746 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcaccgttactac 30898647  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  30898646 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 30898589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 17032593 - 17032692
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17032593 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctcgaagtttctcaccgtt 17032692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 99 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 38333125 - 38332986
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  38333125 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 38333026  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttag 230  Q
     ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38333025 atttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttag 38332986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 15744897 - 15744798
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15744897 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 15744798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 8963267 - 8963168
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  8963267 ggctaaattacttttttggttctctaactatttaattggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttattttggtcccttaagtttctcaccgtt 8963168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Original strand, 8962363 - 8962459
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||    
T  8962363 taaattatctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccctcaagtttctcaccgtt 8962459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Original strand, 8444827 - 8444921
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||||| ||| |||  |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8444827 aattacctttttggtcttctaactatttagttgatatcggattggttatctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 8444921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 96 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 8445237 - 8445144
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    |||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||  |||| |  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  8445237 ctaaattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcggattagcactctaattaaaaattgatttacttcggtcctctaagtttatcac 8445144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 75)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 45053139 - 45052896
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||    
T  45053139 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcagtgtt 45053040  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  45053039 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 45052940  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45052939 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 45052896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 37304028 - 37304271
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| | |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  37304028 ggctaaattacctttttggtcctctaaccatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcaccgtt 37304127  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37304128 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 37304227  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37304228 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattgg 37304271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 1763124 - 1762881
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1763124 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcaaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgtt 1763025  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1763024 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 1762925  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | |||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||||    
T  1762924 gccttgttaaagtgttctgattaaatagtgactgatattattgg 1762881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 96 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35612530 - 35612289
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt-- 193  Q
    |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||      
T  35612530 ctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttatcactgttac 35612431  T
Q  194 ------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgt 287  Q
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35612430 tacatttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtctgtgttatgttggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgt 35612331  T
Q  288 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35612330 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 35612289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12481509 - 12481266
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12481509 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 12481410  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  12481409 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctat 12481310  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  12481309 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattgg 12481266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 16023897 - 16024140
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16023897 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 16023996  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16023997 actacatttagtcttttctgttagtcttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 16024096  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16024097 gccttgttgaggtattatgattaaatagtgactaatattattgg 16024140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 49140592 - 49140350
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  49140592 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaa-ttgatttatttcggtcctataagtttctcactgtt 49140494  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  49140493 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttatat 49140394  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49140393 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 49140350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Original strand, 3089342 - 3089580
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3089342 ggctaaattaccttttgggtcctctaactatttaattggcatcggattggtactctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 3089441  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  3089442 attacatttagtcctttctgttagtttaattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggatcctataactttatttattagtatcattttggtcatat 3089541  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3089542 gtcttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatatt 3089580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 318
Target Start/End: Complemental strand, 2064661 - 2064429
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  2064661 ggctaaattacatttttgatcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactgtt 2064562  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  2064561 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttat 2064462  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgact 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2064461 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgact 2064429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 99 - 329
Target Start/End: Original strand, 20306007 - 20306245
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||         
T  20306007 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttcccaccgttattac 20306106  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtctt 290  Q
       ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20306107 atttagtcatttctgttggttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgcctt 20306206  T
Q  291 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20306207 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 20306245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 23476791 - 23476553
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  23476791 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgtt 23476692  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  23476691 acttcatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttaatgtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 23476592  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23476591 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatatt 23476553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 96 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6798255 - 6798014
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt-- 193  Q
    |||||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||      
T  6798255 ctaaattatctttttggtcttctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttac 6798156  T
Q  194 ------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgt 287  Q
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||     
T  6798155 tacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgagggtcctctaattttatttattagtatcattttggtcatatgc 6798056  T
Q  288 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  6798055 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactaatattattgg 6798014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 9006640 - 9006398
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt- 192  Q
    |||||||||| ||||||| |  |||| ||||||||| | |||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |     
T  9006640 ggctaaattatctttttggtcttctaactatttaatcgttatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttggatcctccaagtttctcacctta 9006541  T
Q  193 ------ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatg 286  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  9006540 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatg 9006441  T
Q  287 tcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9006440 ccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattgg 9006398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8762849 - 8762606
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      
T  8762849 ggctaaattacatttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcggt 8762750  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta-gagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcata 284  Q
          |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8762749 actacatttagtcctttctgttagctttattcaaataaacgttaagagtt-gtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcata 8762651  T
Q  285 tgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||    
T  8762650 tgtcttgttaaggtattatgaataaatagtaactgatattattgg 8762606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 94 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 27548119 - 27547883
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27548119 ggctaaattaccttttttgtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 27548020  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  27548019 actacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttatggtatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtactat 27547920  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgata 322  Q
    |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27547919 gctttgttaaagtattatgattaaatagtgactgata 27547883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 49644120 - 49643878
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttc------tc 187  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||      |     
T  49644120 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaattaaaaattgatttaattcggtcctctaagtttccatccatt 49644021  T
Q  188 ac--cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
    ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49644020 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttag-gtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttgatcctat 49643922  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  49643921 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgagtgatattattgg 49643878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37285177 - 37284935
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    ||||||||||| |||||| | || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||        
T  37285177 ggctaaattacatttttggtcctttaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgattctctaaatttctcacaatt 37285078  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
        | ||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37285077 actacatttagtcctta-tgttagttttatttaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 37284979  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37284978 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 37284935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 99 - 324
Target Start/End: Original strand, 38127714 - 38127947
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||         
T  38127714 aattacctttttggttctctaactatttaattggtttcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcactgttactat 38127813  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtctt 290  Q
       |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||    
T  38127814 atttagtccttgctgttagttttattcaaataaacgttatggtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgcctt 38127913  T
Q  291 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  38127914 attaaggtattatgattaaatagtgaatgatatt 38127947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 12127503 - 12127260
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgt---cctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||  |||| ||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12127503 taaattacattttttatcctctaactatttaattggtatcggattagttctcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgaccgtt 12127404  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12127403 actacatttagtcatttctgttagttttgttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 12127304  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12127303 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgattgatattattgg 12127260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 25995787 - 25996027
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||       
T  25995787 taaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctttaattaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcactgttact 25995886  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagag-tttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgt 287  Q
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||     
T  25995887 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtt-gagatttgtgttatgtggatcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgc 25995985  T
Q  288 cttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  25995986 cttgttaaggtaatatgattaaatagtggctgatattattgg 25996027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 37576181 - 37576424
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||    
T  37576181 ggctaaattacctttttggtcctttaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaaatttatcaaagtt 37576280  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  37576281 actaaatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttataagtatcattttggtcctat 37576380  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  37576381 tccttgttaaggtattaggattaaatagtgaccgatattattgg 37576424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 116 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 37586121 - 37585905
Alignment:
Q  116 tctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgtt 207  Q
    |||| ||| |||||||||||  ||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||        ||||| ||| ||||    
T  37586121 tctaactacttaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattaatttatttcggtcttctaagtttttcaccgttactacatttagtcatttatgtt 37586022  T
Q  208 agttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgatt 307  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37586021 agttttattcaaataaacgttagagtttatattatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgtcttgttaagatattatgatt 37585922  T
Q  308 aaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||||||||||    
T  37585921 aaatagtgactgatatt 37585905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 98 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 4330283 - 4330050
Alignment:
Q  98 aaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt---- 193  Q
    |||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||  ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||        
T  4330283 aaattaccttttttgtcctctaattatttaattggtatcggattaaccctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttactgttacta 4330184  T
Q  194 ----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtct 289  Q
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  4330183 catttagtcctttctcttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcattttaatcatattcct 4330084  T
Q  290 tgttaaggtattatgattaaatagtgactgatat 323  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  4330083 tgttaaggtattatggttaaatagtggctgatat 4330050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 143 - 329
Target Start/End: Original strand, 31703663 - 31703857
Alignment:
Q  143 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  31703663 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttggggtt 31703762  T
Q  235 tgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31703763 tgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggttctattccttgttaaggtattatgattaaatagtgacggatattattgg 31703857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 97 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 45843564 - 45843375
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg----- 191  Q
    |||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||         
T  45843564 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgttact 45843465  T
Q  192 ---tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttg 278  Q
       ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  45843464 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctagctttttttattagtatcattttg 45843375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 153 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27400815 - 27400631
Alignment:
Q  153 taaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgt 244  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  27400815 taaaaattgatttattttgttcctctaaatttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgt 27400716  T
Q  245 gggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27400715 gggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcttatgccttgttaatgtattatgattaaatagtgactgatattattgg 27400631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 23476341 - 23476503
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  23476341 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgtt 23476440  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||    
T  23476441 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatctgtgttatgtgggt 23476503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4697343 - 4697163
Alignment:
Q  1 tttgtgaaaatttctagagctgatttactcaaatacattttttccgatataatccttccaaacaaaatcgataagatgnnnnnnnnnnnnnnng-gctaa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||                 | |||    
T  4697343 tttgtgaaaatttctagagctgatttactcaaatacatttttttggatataatcctttcaaacaaaatcgataagatgtttttttttttttttttgttaa 4697244  T
Q  100 attacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 180  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4697243 attacctttttaattcgctatctatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 4697163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 49140143 - 49140305
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  49140143 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 49140242  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49140243 actacatttagtcatttctcttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 49140305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 44323105 - 44322948
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  44323105 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 44323006  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  44323005 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 44322948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 26723251 - 26723092
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  26723251 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattgatcatctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 26723152  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  26723151 attacatttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggttcgtgttatgtg 26723092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 248
Target Start/End: Original strand, 26707204 - 26707358
Alignment:
Q  102 tacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tt 193  Q
    |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        ||    
T  26707204 tacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagatcggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctccccgttactacatt 26707303  T
Q  194 tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  26707304 tagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttggagtttgtgttatgtgggt 26707358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 37585698 - 37585851
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||           
T  37585698 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtattagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaaatttctcaccgttattat 37585797  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgt 244  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  37585798 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgt 37585851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 49643676 - 49643833
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  49643676 aattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 49643775  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  49643776 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 49643833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 97 - 248
Target Start/End: Original strand, 39486205 - 39486364
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac------- 189  Q
    ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||           
T  39486205 taaattatctttttggttctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcgtttaagtttctcacatttact 39486304  T
Q  190 -cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     | ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  39486305 gcatttggtcttttctgttagttctattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 39486364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 4696882 - 4697044
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||||||||| ||||||  | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  4696882 ggctaaattatctttttagtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctataactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 4696981  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4696982 actacatttagtcctttctgttagtttaattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 4697044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 16024347 - 16024185
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16024347 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 16024248  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
T  16024247 actacatttagtcctttctggtagttttattcaaataaacgttagggtttatgttatgtgggt 16024185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 27547669 - 27547831
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| |  | || |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  27547669 ggcttaattacctttttggtcttttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 27547768  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  27547769 aatacatttagtcctttctgttggttttattcaaataaacgttagggtttgtgtcatgtgggt 27547831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37576631 - 37576469
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||        
T  37576631 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcactgtt 37576532  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  37576531 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 37576469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 6797812 - 6797969
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||| |||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  6797812 aattacttttttggttctctaactatttaattgatatcagattgatcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactcc 6797911  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6797912 atttagtcatttctgttagttttgttcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 6797969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 12481064 - 12481221
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  12481064 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactac 12481163  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  12481164 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 12481221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Original strand, 12127057 - 12127200
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12127057 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 12127156  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 229  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12127157 tctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 12127200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 39486637 - 39486451
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    |||||| ||||| ||  |||| ||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| | ||||||         
T  39486637 aattacttttttaatcatctaactatttaattggtattgaattgttcctctaactaaaaattgatttatttccgttttctaagttttttaccgttactac 39486538  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttg 278  Q
       |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39486537 atttagtcctttcagttagttttattcaaa-aaacgttagggtttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttg 39486451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 1762674 - 1762836
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  1762674 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 1762773  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | |||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  1762774 acaacatttaatcatttatgttagttttattcaaataaacattagggtttgtattatgtgggt 1762836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 9006196 - 9006353
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||           
T  9006196 aattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttatcaccgttagtac 9006295  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9006296 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 9006353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 241 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26707491 - 26707403
Alignment:
Q  241 atgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26707491 atgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 26707403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 37304457 - 37304316
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgt 206  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||| |||    
T  37304457 ctctaactatttaattggtatcggattgatcctataactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttatgt 37304358  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  37304357 tagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 37304316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 246 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 4697172 - 4697089
Alignment:
Q  246 ggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4697172 ggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 4697089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 242
Target Start/End: Original strand, 38000494 - 38000645
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca--------cc 190  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||         |    
T  38000494 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcttctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgttactac 38000593  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattat 242  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38000594 atttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttat 38000645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34967172 - 34967073
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  34967172 ggctaaattacatttttgattctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccattaagtttctcaccgtt 34967073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 35612087 - 35612241
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||        |    
T  35612087 aattacctttttggtcctctaagtatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttattttgttcctctaagtttctcactgttactac 35612186  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35612187 atttagtcctttcttttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 35612241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 242 - 329
Target Start/End: Original strand, 44322816 - 44322903
Alignment:
Q  242 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44322816 tgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgccttgttaaggtattatgattaaattgtgactgatattattgg 44322903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20306452 - 20306290
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  20306452 ggcttaattacctctttggtcctctaactagttaattggtatcagattgatcctccaactaaagattgatttattttggtcctttaagtttctcactgtt 20306353  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
            ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  20306352 actacatttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 20306290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 180
Target Start/End: Original strand, 13183766 - 13183852
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 180  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183766 ggctaaattacctttttgatcctctaactatttaattggtattgaattagtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13183852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Original strand, 45052690 - 45052833
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||| |||||||||  || | ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||        
T  45052690 ggcttaattatctttttgatcttcaaactatttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcactgtt 45052789  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 229  Q
        | |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45052790 actacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgtta 45052833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 10832033 - 10831937
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  10832033 taaattacttttttggtcctctaactatttaactggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 10831937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 23598072 - 23598171
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  23598072 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaaatttctcaccgtt 23598171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 31704063 - 31703919
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||        
T  31704063 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggacctataagtttctcactgtt 31703964  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttag 230  Q
        | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31703963 actacatttagtcctttctgttaattttattcaaataaacgttag 31703919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 46593680 - 46593586
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  46593680 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcct-taagtttctcac 46593586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 13109277 - 13109191
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 180  Q
    |||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13109277 ggctaaattacctttttagtcctctaactatttaattggtatccgattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaa 13109191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 8760272 - 8760434
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca----- 188  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||         
T  8760272 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgaccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttttcagtgtt 8760371  T
Q  189 ---ccgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||    
T  8760372 actacatttagtcatttatgttagctttattcaaataaacattagggtttgtgttatgtgggt 8760434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 10831131 - 10831230
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| ||||||||    
T  10831131 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttccttaagtttttcaccgtt 10831230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 37467670 - 37467575
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    |||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||    
T  37467670 ggctaaattacctttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttaggtcccttaagtttctcac 37467575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 106 - 244
Target Start/End: Original strand, 37284740 - 37284886
Alignment:
Q  106 tttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagt 197  Q
    |||||| | ||||| ||||||||||| |||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||        ||||||    
T  37284740 tttttggtcctctaactatttaattgatatcggattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcatttaagtttctcaccgttactacatttagt 37284839  T
Q  198 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgt 244  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||  ||||  |||||| ||||||    
T  37284840 cttttttgttagttttattcaaataagagttatggtttgtgttatgt 37284886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Original strand, 34966306 - 34966398
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    |||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  34966306 taaattacctttttggacctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaacttgatttatttcagtcccttaagtttctcac 34966398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 95 - 189
Target Start/End: Original strand, 46592813 - 46592907
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    |||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  46592813 gctaaattacctttttggccctctaactatttaattgatatcagattgatcctctaactaaaaaatgatttatttcgatcccttaagtttctcac 46592907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 5537251 - 5537159
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    |||||||  |||||| | ||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  5537251 taaattatatttttggtcctctaactatttaatcggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagattctcac 5537159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 192 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25996128 - 25996072
Alignment:
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25996128 tttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 25996072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 99 - 167
Target Start/End: Original strand, 46289329 - 46289397
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttat 167  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  46289329 aattatctttttgatcctctaactatttaattggtatcagattggtcatctaactaaaaattgatttat 46289397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 32047743 - 32047842
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||   | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||  ||||||||    
T  32047743 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaacttcatcaccgtt 32047842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Original strand, 49837420 - 49837470
Alignment:
Q  143 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  49837420 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 49837470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 122 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 49838808 - 49838756
Alignment:
Q  122 tatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtc 174  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  49838808 tatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtc 49838756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 5536398 - 5536497
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||   ||||||||||| ||||    
T  5536398 ggctaaattacatttttggccctctaactatttaattggtatcggattggtcctctacctaaaatttgatttatttgggtctcttaagtttctcatcgtt 5536497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 175
Target Start/End: Original strand, 37466802 - 37466883
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 175  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||   |||||||||||||  ||||  | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37466802 ggctaaattacattttttattctctaatcatttaattggtatcggattactgctctaactaaaaattgatttatttccgtcc 37466883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Original strand, 28884022 - 28884112
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||   | || |||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  28884022 aattacctttttggtcctctaattatttaattggtaacggtttggtcctctaactaaaaaataatttattttggtcctctaactttatcac 28884112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0182
Description:

Target: scaffold0182; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Original strand, 19711 - 19946
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  19711 taaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttact 19810  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  19811 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatattcc 19910  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  19911 ttgttaaggttttatgattaaatagtgacggatatt 19946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0182; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 20153 - 19996
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||           
T  20153 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgattattttttgtcctctaagtttctcaccgttactac 20054  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  20053 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 19996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 151; Significance: 7e-80; HSPs: 66)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32993465 - 32993222
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32993465 ggctaaattatatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctataagtttctcaccgtt 32993366  T
Q  194 t--------agtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
    |        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  32993365 tctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttat 32993266  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32993265 gccttgttaaggtgttatgattaaataatgactgatattattgg 32993222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 34890644 - 34890887
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||    
T  34890644 ggctaaattacctttttgttcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctcaaagtttctcactgtt 34890743  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  34890744 attacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 34890843  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34890844 gccttgttaaagtattatgattaaataatgactgatattattgg 34890887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 24744332 - 24744571
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||       
T  24744332 taaattacctttttg-tcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaactttcacaccgttact 24744430  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
T  24744431 gcatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatttc 24744530  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24744531 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 24744571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 9046086 - 9046329
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9046086 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaagtaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttgtcaccgtt 9046185  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||    
T  9046186 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaaatttatttattagtatcattttggtcttat 9046285  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9046286 gccttgttaagctattatgattaaatagtgactgatattattgg 9046329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5938260 - 5938020
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac------- 189  Q
    ||||||||||||||| |  ||||  ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  5938260 taaattacctttttggtcatctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacaattact 5938161  T
Q  190 -cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |    
T  5938160 acatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgcc 5938061  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5938060 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 5938020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 18052956 - 18053199
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18052956 ggctaaattacttttttgatcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 18053055  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||    
T  18053056 actacatttagtcatttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggttctat 18053155  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18053156 gctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 18053199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34994830 - 34994587
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||  |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  34994830 ggctaaattacctttttagtcatctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcactgtt 34994731  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||    
T  34994730 actgcatttagtcttttatgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgcgggtcctctaacttgatttattagtatcattttggtcttat 34994631  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34994630 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 34994587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Original strand, 7269951 - 7270191
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7269951 ggctaaattacttttttaatcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaagtttctcaccgtt 7270050  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagtttt--attcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcat 283  Q
            ||||| ||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7270051 actacatttagtcatttctgttagttttttatttaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcat 7270150  T
Q  284 atgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7270151 atgccttgttaaagtattatgattaaatagtgactgatatt 7270191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 5310826 - 5311069
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  5310826 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattgatatcagagtagtcctataactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgtt 5310925  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5310926 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 5311025  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5311026 tcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 5311069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 26600357 - 26600600
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||| |||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26600357 ggctaaattatctttttggtcctctaactattaaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattaatttatttcggtcctctaagtttatcaccgtt 26600456  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26600457 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 26600556  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26600557 tccttattaaggtattatgattaaatagtgaccgatattattgg 26600600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 99 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 6137822 - 6137590
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  6137822 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 6137723  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtctt 290  Q
       ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  6137722 atttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttagattttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatatctc 6137624  T
Q  291 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  6137623 gttaagatattatgattaaatagtgagtgatatt 6137590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5639620 - 5639380
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||| ||||||||  |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||       
T  5639620 taaattacatttttgatcttctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaatttatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttact 5639521  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  5639520 acatttagtcctttttgttagttttattcaaataaacattatggtttgtgttatgtgggttctctaactttatttattagtatcattttggtcatattcc 5639421  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5639420 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 5639380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 31247119 - 31247359
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||       
T  31247119 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtgttctaagtttctcaccgttact 31247218  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31247219 acatttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgttttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatattcc 31247318  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  31247319 ttgttaaggtattatgattaaataatgacagatattattgg 31247359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21540428 - 21540189
Alignment:
Q  94 ggctaaattaccttttt-gattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 192  Q
    ||||||||||||||||| | | || || ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21540428 ggctaaattaccttttttggtcctttaactatttaattggtatcagattagtcctctaattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcatcgt 21540329  T
Q  193 t--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcata 284  Q
    |        || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21540328 tactacatttaatcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgcgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatccta 21540229  T
Q  285 tgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  21540228 tgccttgttaagatattatgattaaatagtgattgatatt 21540189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Original strand, 31237749 - 31237984
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       
T  31237749 taaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgttact 31237848  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |    
T  31237849 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttagagtttgttttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttgatcatgttcc 31237948  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  31237949 ttgttaaggtattatgattaaataatgacagatatt 31237984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 97 - 324
Target Start/End: Original strand, 2517005 - 2517240
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||       
T  2517005 taaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctgactgttact 2517104  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||| ||||||       
T  2517105 acatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagtgtttgtgttatgtgggtcctccaactttatttataagaatcattttggtcatattct 2517204  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517205 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 2517240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 21857005 - 21856767
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | |||||  |||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21857005 ggctaaattacctttttggtcctctaagtatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 21856906  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  21856905 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttatggtttttgttatatgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttat 21856806  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
      ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21856805 tccttgttaaggtattatgattaaacagtgacggatatt 21856767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 147 - 329
Target Start/End: Original strand, 26957015 - 26957205
Alignment:
Q  147 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgta 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  26957015 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcttaccgttactacatttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttaaagtttatg 26957114  T
Q  239 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26957115 ttatgggggtcctctagctttatttattagtatcattttggtcctatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 26957205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 32753177 - 32753416
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  32753177 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 32753276  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    | || |||    
T  32753277 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaatgttaaggtttgtgttatgtgggtcctctaactgtatttattagtataa----ggtcctat 32753372  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32753373 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 32753416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 99 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 6236366 - 6236128
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt----- 193  Q
    |||||| |||||| | | ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||         
T  6236366 aattacttttttggtcccctaactatttaattgatatttgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctaacagttactaa 6236267  T
Q  194 ---tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtctt 290  Q
       || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||| |||    
T  6236266 atttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgaatcctctaacttcatttattagtatcatcttggtcctatgcctt 6236167  T
Q  291 gttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  6236166 gttaagatattatgattaaatagtgaccgatattattgg 6236128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 133 - 329
Target Start/End: Original strand, 7270668 - 7270872
Alignment:
Q  133 tattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaa 224  Q
    |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||| | || | ||||||||| ||||||        ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  7270668 tattggattggtcctctaattaaaaattgatttattttgatcttttaagtttcttaccgttactatatttagtcttttttgttagttttattcaaataaa 7270767  T
Q  225 cgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7270768 cgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 7270867  T
Q  325 cttgg 329  Q
     ||||    
T  7270868 attgg 7270872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 143 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3423571 - 3423377
Alignment:
Q  143 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt 234  Q
    |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3423571 gtccgctaattaaaaattggtttatttcggtcctctaattttctcaccgttactacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt 3423472  T
Q  235 tgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  3423471 tgtgatatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcttatgccttgttaaggtattacgattaaatagtgaccgatattattgg 3423377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 6235921 - 6236083
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6235921 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctataattaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 6236020  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6236021 actgcatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 6236083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 34994385 - 34994542
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | || || |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  34994385 aattacctttttggtcctttaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactat 34994484  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  34994485 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagaatttgtgttatgtgggt 34994542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9046536 - 9046374
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||      
T  9046536 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtattggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccgctaagtttctcaccgct 9046437  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  9046436 actacatttagtcctttctgttagttctattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 9046374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 94 - 271
Target Start/End: Original strand, 6532192 - 6532377
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||  | ||||| |||||||||| ||||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  6532192 ggcttaattaccttttttgtcctctaactatttaatttgtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggttctctaaatttctcaccgtt 6532291  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtat 271  Q
            ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6532292 actacatttagtgatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtat 6532377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 169 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 25177032 - 25176876
Alignment:
Q  169 tcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaacttta 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25177032 tcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggggcctctaacttta 25176933  T
Q  261 tttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgac 317  Q
    |||||||| ||||||||| || |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25176932 tttattagcatcattttggtcctattccttgttaagatattatgattaaatagtgac 25176876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 101 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 18053396 - 18053241
Alignment:
Q  101 ttacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------t 192  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||        |    
T  18053396 ttacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtactctaagtttctcaccgttactacat 18053297  T
Q  193 ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  18053296 ttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgttttatatgggt 18053241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 32753618 - 32753461
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  32753618 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 32753519  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  32753518 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtcagagtttgtgttatgtgggt 32753461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 101 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 5311269 - 5311114
Alignment:
Q  101 ttacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------t 192  Q
    ||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||        |    
T  5311269 ttacctttttggtcctctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtgctctaagtttctcatcgttactacat 5311170  T
Q  193 ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5311169 ttagtcctttatgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 5311114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 3423170 - 3423332
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  3423170 ggcttaattaccattttggttctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 3423269  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  3423270 actacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 3423332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 21856555 - 21856717
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  21856555 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 21856654  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21856655 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatatgggt 21856717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 35167490 - 35167652
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  35167490 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 35167589  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  35167590 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 35167652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 5937818 - 5937975
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  5937818 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgattctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 5937917  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  5937918 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 5937975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 192 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 35167836 - 35167702
Alignment:
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttg 291  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||||    
T  35167836 tttaatcctttctgttagttttattcaagtaaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttagtcctaatccttg 35167737  T
Q  292 ttaaggtat--tatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  35167736 ttaaggtattatatgattaaatagtgactgatatt 35167702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 105 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 34891083 - 34890932
Alignment:
Q  105 ctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttag 196  Q
    ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||    
T  34891083 ctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttag 34890984  T
Q  197 tcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||    
T  34890983 tcttttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgtgggt 34890932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15933001 - 15932844
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||           
T  15933001 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgttactac 15932902  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  15932901 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 15932844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 94 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 26957411 - 26957260
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||| ||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||      
T  26957411 ggcttaattatctttttggtcatctaactatttaattggtattagattggtcctttaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttttcaccgtt 26957312  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgt 237  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26957311 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 26957260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 978415 - 978577
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  978415 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcgtattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 978514  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  978515 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 978577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 26600776 - 26600635
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtcctttctgt 206  Q
    ||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||| |||||||    
T  26600776 ctctaactatttagttggtattggattggtcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcatttctgt 26600677  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26600676 tagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 26600635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 2517452 - 2517309
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2517452 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 2517353  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgtta 229  Q
          |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2517352 actacatttaatcctttctgttagttttatttaaataaacgtta 2517309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7271079 - 7270920
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||      
T  7271079 ggcttaattgcctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcatcgtt 7270980  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
          ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  7270979 actatatttagtcctttctattagttttatttaaataaacgttggggtttgtgttatgtg 7270920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 242
Target Start/End: Original strand, 25176668 - 25176819
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||           
T  25176668 aattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattatggtcctctaagtttctcaccgttactac 25176767  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattat 242  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  25176768 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 25176819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31238196 - 31238034
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctct-aagtttctcaccgt 192  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  31238196 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtc-tctaactaaaaattgatttatttcggtcctcttaagtttttcaccgt 31238098  T
Q  193 t--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31238097 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 31238034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 31247566 - 31247404
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctc-taagtttctcaccgt 192  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| |||||||    
T  31247566 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattaatttatttcagtcctcttaagtttttcaccgt 31247467  T
Q  193 -------ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
           |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31247466 tactacattagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaagtttgtgttatgtgggt 31247404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 244
Target Start/End: Original strand, 32993020 - 32993173
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca--------cc 190  Q
    ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||         |    
T  32993020 aattaccttcttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaagtaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcattgttactac 32993119  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgt 244  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  32993120 atttggtcctttctgttagttttattcaaataaacgttaggatttgtgttatgt 32993173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 246
Target Start/End: Original strand, 6137379 - 6137538
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||        
T  6137379 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaattaaaaa-tgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 6137477  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
        | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||||||    
T  6137478 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgttatgtgg 6137538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 7438804 - 7438903
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  7438804 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcaccgtt 7438903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 24744770 - 24744609
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||| ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||        
T  24744770 ggcttaattatctttttggtcctctaactatttagttggtatta-attggtcctctaactaaaaattgatttatttccattctttaagtttctcactgtt 24744672  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24744671 attacatttagtcttttctattagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 24744609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 121 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 10412924 - 10412800
Alignment:
Q  121 ctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgttagttt 212  Q
    ||||||| |||||||  |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||| ||| |||    
T  10412924 ctatttagttggtatcggattagttctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactatatttagtcatttctattaattt 10412825  T
Q  213 tattcaaataaacgttagagtttgt 237  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  10412824 tattcaaataaacgttagggtttgt 10412800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 15932730 - 15932829
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||    
T  15932730 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttgatcctctaagtttctcatcgtt 15932829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 17244664 - 17244763
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17244664 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttatcaccgtt 17244763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Original strand, 14276404 - 14276498
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  14276404 aattacctttttggtcctctacctatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaattgatttacttcggtcctctaaatttctcaccgtt 14276498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 29261401 - 29261306
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    ||||||||||  |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  29261401 ggctaaattatatttttagtcctctaactatttaattggtattagattggtcctctaactaaaaattgatttatgtcggtcccttaagtttctcac 29261306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 189
Target Start/End: Original strand, 34517272 - 34517367
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  34517272 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaagtttctcac 34517367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 34518142 - 34518043
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||    
T  34518142 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctcaaactaaaaattgatttatttcgatcccttaagtttctcatcgtt 34518043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 95 - 189
Target Start/End: Original strand, 29260532 - 29260626
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    |||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||    
T  29260532 gctaaattacctttctggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctcaaactaaaaattaatttatttcggtcccttaagtttctcac 29260626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 193
Target Start/End: Original strand, 15286348 - 15286444
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||  ||||||||||||||||    
T  15286348 taaattacctttttgatcctctaactatttaattggtgtcggattggtcctctgactaaaaattgatttatttcaatcccttaagtttctcaccgtt 15286444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 7270403 - 7270241
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||| ||||||| | || || |||||||||||||||   |||  ||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| ||||||| ||||    
T  7270403 ggcttaattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcgaattgatcctctaactaaaaattaattttttttggttctctaaatttctcatcgtt 7270304  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
            ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  7270303 actacatttagtcttttctgttaattttattcaaataaacgttagagtttgtggtatgtgggt 7270241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 94 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 35167905 - 35167833
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgattta 166  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35167905 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgattta 35167833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 94 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 25180298 - 25180219
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 173  Q
    ||||||||||||||| || | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25180298 ggctaaattacctttctggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggt 25180219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 147 - 232
Target Start/End: Original strand, 3035933 - 3036027
Alignment:
Q  147 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtc-ctttctgttagttttattcaaataaacgttagag 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3035933 tctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactcttactacatttagtcattttctgttaattttattcaaataaacgttagag 3036027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 6228730 - 6228828
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||  | |||||  ||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  6228730 ggcttaattacctttttagtcctctaattatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcc-ctaagtttatcaccgtt 6228828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 34251554 - 34251651
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||  |||| |||||   |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  34251554 ggctaaattacctttttaatcctctaattatttagttggtatcggattagtcctg--actaaaaattaatttatttcgatcctctaagtttctcatcgtt 34251651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 207 - 248
Target Start/End: Original strand, 5639294 - 5639335
Alignment:
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  5639294 tagttttattcaaataaatgttagagtttgtgttatgtgggt 5639335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 121 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 27829388 - 27829320
Alignment:
Q  121 ctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  27829388 ctatttaattggtaacagtttggtcctctaattaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcac 27829320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 148; Significance: 4e-78; HSPs: 2)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 50927 - 50683
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctattt-aattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt 192  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  50927 ggctaaattacatttttggtcctctaactattttaattggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcaccgt 50828  T
Q  193 t--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcata 284  Q
    |        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  50827 tactacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtccta 50728  T
Q  285 tgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50727 tgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 50683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 50481 - 50638
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||           
T  50481 aattatctttttggtcctctacctatttaattggtatctgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgttactac 50580  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  50581 atttagtcctttctgttatttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 50638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14585 - 14354
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14585 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattgatatcggattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctatgtttctcaccgtt 14486  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14485 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatctgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcatat 14386  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgac 317  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14385 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgac 14354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 14135 - 14297
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  14135 ggcttaattacctgtttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 14234  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14235 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 14297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 37)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 9989323 - 9989566
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9989323 ggctaaattacttttttggtcatctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 9989422  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  9989423 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 9989522  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  9989523 gtcttattaaggtattatgattaaacagtgactaatattattgg 9989566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 32288523 - 32288284
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||       
T  32288523 taaattacctttttgatcctctaactatttaattgatattagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttatcactgttaat 32288424  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  32288423 acatttagtcatttctgttagttttattcaaataat-gttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtattattttggtcatatgcc 32288325  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32288324 ttgttaaagtattatgattaaatagtgattgatattattgg 32288284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 36440650 - 36440407
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgt- 192  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |     
T  36440650 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactata 36440551  T
Q  193 -------ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  36440550 actatatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttggggtttgtgttatatgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 36440451  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36440450 tcattgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 36440407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 95 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 37424713 - 37424469
Alignment:
Q  95 gctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt- 193  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  37424713 gctaaattacctttttggtcctctaactatttaattg-tattggattagtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtta 37424615  T
Q  194 -------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt---cctctaactttatttattagtatcattttgatcat 283  Q
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| || |    
T  37424614 ctacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctcctctaactttatttattaatatcattttggtcct 37424515  T
Q  284 atgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37424514 attttttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 37424469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 2182943 - 2183186
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||  |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  2182943 ggctaaattaattttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgtcgtctaagtttctcaccgtt 2183042  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2183043 actacatttagtcctttatgttagctttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatat 2183142  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  2183143 atcttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatattattgg 2183186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 38959173 - 38958931
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38959173 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 38959074  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||    
T  38959073 actacatttagtcctttttgttaattttattcaaataaa-gttagattttgtgttatgtgagtcctctaactttatttataagtatcattttggtcttat 38958975  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38958974 atctcgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 38958931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 24040537 - 24040292
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||  ||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  24040537 ggctaaattacttttttggtcctctaactatttaattagtatcggattgatcctctaactaaaaattgacttatttcagtcctttaagtttctcaccgtt 24040438  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatc--attttgatcat 283  Q
            ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  24040437 cctacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcttctaactttatttattagtatcatattttggtcat 24040338  T
Q  284 atgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24040337 atgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 24040292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 27185874 - 27186116
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  27185874 ggcttaattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcttctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactttt 27185973  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
        | |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| || |||    
T  27185974 actacatttagtccttcctgt-agttttattcaaataaatgttagggtttgttttatgtgggtcctctaattttattaattagtatcattttggtcttat 27186072  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||    
T  27186073 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgaatggtattattgg 27186116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34264802 - 34264555
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgattta----tttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    ||||||||||  |||||| | ||| | ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||     
T  34264802 ggctaaattatatttttggtcctccaactatttaattggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttaattatttcggtcctctaagtttctcat 34264703  T
Q  190 cgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatc 281  Q
     |||        ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |     
T  34264702 tgttattacatttagtcatttctgttggttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtt 34264603  T
Q  282 atatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34264602 ctatgccttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 34264555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 115 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 35570209 - 35569987
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgt 206  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||        |||||  ||||||    
T  35570209 ctctaactatttaattggtatttgattactcctctaactaaaaattgatttattttagtcttctaagtttctcaccgttactacatttagtcacttctgt 35570110  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgat 306  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||  ||||||||| |||||||||    
T  35570109 tagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgagtcctctaactttatttattagtatcatttcggtcttattccttgttaagttattatgat 35570010  T
Q  307 taaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  35570009 taaatagtgactgatattattgg 35569987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25567438 - 25567195
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||| |||||  | || || |||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||||    
T  25567438 ggctaaattacttttttagtcctttaactatttaattggtatcggattggttctttaactaaaaattgatttattttgatcctttaagtttttcaccgtt 25567339  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||    
T  25567338 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttttgttatgtgagtcctctaactttatttattagtattattttagtcatat 25567239  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  25567238 gccttgttaaagtattatgattaaatagtgactaatattattgg 25567195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 121 - 290
Target Start/End: Original strand, 11315985 - 11316162
Alignment:
Q  121 ctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtcctttctgttagttt 212  Q
    |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||        | ||||||| |||||||||||||    
T  11315985 ctatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttcttactattactacatttagtcatttctgttagttt 11316084  T
Q  213 tattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtctt 290  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  11316085 tattccaataaacgttagggtttgtgttatgtaggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctatgtctt 11316162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 36440200 - 36440362
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  36440200 ggcttaattacctttttgatcctctaactatttagttggtatcagattgatcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 36440299  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36440300 attacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 36440362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 94 - 245
Target Start/End: Original strand, 16860303 - 16860462
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||      
T  16860303 ggctaaattatctttttggtcctctaactatttaatcggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctttaagtttctcaccgtt 16860402  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
          ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16860403 actacatttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtg 16860462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 27186323 - 27186161
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        
T  27186323 ggctaaattacatttttggtcctctaactatttaattggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcagtcctctaagtttctcactgtt 27186224  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  27186223 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatatgggt 27186161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 37424262 - 37424424
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        
T  37424262 ggcttaattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcactgtt 37424361  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37424362 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatttgggt 37424424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Original strand, 24040090 - 24040247
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||| ||||||| | || || |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||           
T  24040090 aattatctttttggtcctttaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtccactaagtttctcaccgttactac 24040189  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  24040190 atttagtcctttctattagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 24040247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 25183098 - 25182941
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |           
T  25183098 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagcttctcaatgttgctat 25182999  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25182998 atttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 25182941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 9989752 - 9989611
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgt 206  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||        |||||||||||||    
T  9989752 ctctacctatttaattggtatcggattgatcttctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctgt 9989653  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9989652 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 9989611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 39325805 - 39325636
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctca----- 188  Q
    ||||||||||| |||||  | |||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
T  39325805 ggctaaattacatttttagtcctctaattatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcattgtt 39325706  T
Q  189 ---ccgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaa 255  Q
        | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||    
T  39325705 attacatttagtactttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtggctcctctaa 39325636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 247
Target Start/End: Original strand, 39325417 - 39325573
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  39325417 aattacctttttggtcctctgactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 39325516  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtggg 247  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||    
T  39325517 atttaatcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttctgttatgtggg 39325573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 99 - 246
Target Start/End: Original strand, 32288083 - 32288237
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |    
T  32288083 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtattagattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcatctaagtttctcactgttactac 32288182  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
     ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32288183 atttagtcatttctattagttttattcaaataaacgttag-gtttgtgttatgtgg 32288237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Original strand, 38958724 - 38958886
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  38958724 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 38958823  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||    
T  38958824 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgtcaaggtttgtgctatgtgggt 38958886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 94 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1140215 - 1140079
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1140215 ggcttaattgcctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 1140116  T
Q  194 tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttag 230  Q
        | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1140115 actacatttatgttagttttattcaaataaacgttag 1140079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 99 - 245
Target Start/End: Original strand, 35569780 - 35569934
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------c 190  Q
    ||||||||||||| |  |||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |    
T  35569780 aattacctttttggtcttctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactac 35569879  T
Q  191 gtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtg 245  Q
     |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35569880 atttaatcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtg 35569934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 122 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 11316376 - 11316244
Alignment:
Q  122 tatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgtttagtcctttctgttagtttt 213  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        | ||||||||||||| ||| ||||    
T  11316376 tatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgttactacatttagtcctttctattaatttt 11316277  T
Q  214 attcaaataaacgttagagtttgtattatgtgg 246  Q
    |||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  11316276 attcgaataaacgttagggtttgtgttatgtgg 11316244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 115 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 2183372 - 2183231
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgt 206  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||        ||||||||||||| |    
T  2183372 ctctaactatttaattggtatcggattgatcctttaactaaaaattgatttatttcggttctgtaagtttctcaccgttactacatttagtcctttctat 2183273  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||    
T  2183272 tagttttattcaaataaacattaaggtttgtcttatgtgggt 2183231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 251 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16860705 - 16860627
Alignment:
Q  251 tctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  16860705 tctaactttatttattagtatcattttggtcttatgtcttgttaatgtattatgattaattagtgactgatattattgg 16860627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 243
Target Start/End: Original strand, 29198973 - 29199109
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgt 206  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||        ||||||| |||||||    
T  29198973 ctctaactatttaattgatattaaattagtcctctaattaaaaattgatttatttcgattctttaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgt 29199072  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatg 243  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||    
T  29199073 tagttttattcaaataaagtttagggtttgtgttatg 29199109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 251 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 16860588 - 16860510
Alignment:
Q  251 tctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16860588 tctaactttatttattagtatcattttggttccatgtcttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 16860510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 99 - 193
Target Start/End: Original strand, 19184602 - 19184696
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  19184602 aattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggtttggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctttaagtttatcaccgtt 19184696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 237 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 29199251 - 29199167
Alignment:
Q  237 tattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgat 321  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29199251 tattatgtggatcttctaacattatttattagtatcattttaattctatgctttgttaaggtattatgattaaatagtgactgat 29199167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 96 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 33817732 - 33817659
Alignment:
Q  96 ctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttattt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33817732 ctaaattacctttttgattctctaactatttaattggtatcggattgatcctctaactaaaaatttatttattt 33817659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 193
Target Start/End: Original strand, 34264396 - 34264461
Alignment:
Q  128 attggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34264396 attggtgttggattggccctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtt 34264461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 94 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19128503 - 19128434
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgat 163  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  19128503 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattagtatcagattgatcctctaactaaaaattgat 19128434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 31756747 - 31756657
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac 189  Q
    ||||||||||||| |   ||| ||||||||||||||   | || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||    
T  31756747 aattacctttttggtctcctaactatttaattggtaacggtttagtcctctaactaaaaaatgatttattttggtcctctaactttatcac 31756657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 94 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 19185634 - 19185553
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcc 175  Q
    |||||||||||||||||| | |  || |||||||||| ||||| | || |||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19185634 ggctaaattacctttttggtcccttaactatttaattagtattggtttggtcccctaactaaaatttgatttattttggtcc 19185553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 146; Significance: 7e-77; HSPs: 5)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 7e-77
Query Start/End: Original strand, 115 - 329
Target Start/End: Original strand, 349094 - 349316
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttt--------agtcctttctgt 206  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||        |||| |||||||    
T  349094 ctctaactatttaattagtattagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtttttacatttagtcatttctgt 349193  T
Q  207 tagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgat 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  349194 tagttttattcaaataaacgttagagtttgcgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcatattccttgttaaggtattatgat 349293  T
Q  307 taaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||| ||||||||||| ||||    
T  349294 taaatattgactgatattattgg 349316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 101 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 349515 - 349361
Alignment:
Q  101 ttacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac--------cgt 192  Q
    ||||||||||| | | ||| ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||        | |    
T  349515 ttacctttttggtcccctaactatttagttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaag-ttctcacttttactacat 349417  T
Q  193 ttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||    
T  349416 ttagtcctttctgttaattttattcaaataaatgttagggtttgtgttatgtgggt 349361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 239 - 324
Target Start/End: Original strand, 113519 - 113604
Alignment:
Q  239 ttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  113519 ttatgtggctcctctaactttatttattagtatcattttggttctatgccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 113604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 113816 - 113654
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| |||||||| || ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||        
T  113816 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttaagtgctatcagattggtcctgtaactaaaaattgatttctttcggtcatctaaatttctcactgtt 113717  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || ||||||||||    
T  113716 actacatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttaaggttagtgttatgtgggt 113654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 193
Target Start/End: Original strand, 113393 - 113492
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||| || |||||| | ||||| || ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  113393 ggctaaataacatttttggtcctctaactgtttaattggtatccgattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttttcatcgtt 113492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 45756 - 45999
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||  ||||| | |||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45756 ggctaaattactattttggtcctctaattatttaattggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcacggtt 45855  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  45856 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttacttattagtttcattttggtcatat 45955  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45956 tccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 45999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 56581 - 56424
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  56581 aattatcttttttatcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 56482  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  56481 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgggt 56424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 63706 - 63549
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    ||||| |||||| || ||||| ||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
T  63706 aattatcttttttatcctctaactatttagttggtatttgattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttactac 63607  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  63606 atttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgttttatgtgggt 63549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 21512 - 21754
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21512 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 21611  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  21612 actacatttagtcctttttgttagttttattcaaataaa-gttaggttttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 21710  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
     ||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21711 atctcgttaaaatattatgattaaatagtgactgatattattgg 21754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0115; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 94 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22603 - 22462
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  22603 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactatt 22504  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgt 227  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgt 22462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 8429 - 8671
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||    
T  8429 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttaattggtatcagattgatctt-taactaaaaattgatttatttcgatcctttaagtttctcactgtt 8527  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||  |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||    
T  8528 acaatatttagtattttctgttagttttattcaaataaacgttgaggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttggtcctat 8627  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8628 gccttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattattgg 8671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 99 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 8873 - 8716
Alignment:
Q  99 aattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg------- 191  Q
    |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||           
T  8873 aattacttttttggtcctctaactatttaattggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttatgttctctaagtttctcaccgttactac 8774  T
Q  192 -tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  8773 atttagtcttttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgcgggt 8716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 24162 - 24405
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| ||||||| ||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24162 ggctaaattacctttttggtcctctaactatttagttggtattgaattggtcctctaactaaaaattgatttatttcgatcctctaagtttctcaccgtt 24261  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| || | |    
T  24262 attacatttagtcatttctgttagtttttttcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaacatcattttggtcctgt 24361  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24362 tccttgttaagatattatgattaaatagtgacggatattattgg 24405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 94 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 24612 - 24456
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||        
T  24612 ggcttaattacatttttggtactctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcactgtt 24513  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattat 242  Q
        | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24512 actacatttagtcatttctgttaattttattcaaataaacgttagggtttgtgttat 24456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 94 - 317
Target Start/End: Original strand, 72762 - 72992
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  72762 ggcttaattacctttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 72861  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  72862 actacatttattcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcttat 72961  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgac 317  Q
      |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  72962 tccttgttaa-gaattatgattaaatagtgac 72992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 73211 - 73049
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg-- 191  Q
    |||| |||||| |||||| | ||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||      
T  73211 ggcttaattacatttttggtcctctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttattttggtcctctaagtttctcaccgtt 73112  T
Q  192 ------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  73111 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 73049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 94 - 329
Target Start/End: Original strand, 20751 - 20993
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||| |||||| |||||| |  |||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  20751 ggcttaattacatttttggtcatctaactatttagttggtatcggattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttcacactgtt 20850  T
Q  194 --------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatat 285  Q
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  20851 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagcatcattttggtcctat 20950  T
Q  286 gtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
      |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  20951 tccttgttaa-gaattatgattaaatagtgaccgatattattgg 20993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 21088 - 21038
Alignment:
Q  198 cctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| |||||    
T  21088 cctttctattagttttattcaaataaacgttcgggtttgtgttatatgggt 21038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 143 - 324
Target Start/End: Original strand, 6047 - 6233
Alignment:
Q  143 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtt 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||        ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6047 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcttctaagtttctcattgttactatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacattagagtt 6146  T
Q  235 tgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 324  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6147 tgtgttatgtggatcctctaactttatttat---tatcattttgatcatatgtcttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatatt 6233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 6413 - 6283
Alignment:
Q  125 ttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--------tagtcctttctgttagttttatt 216  Q
    |||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||        ||||| |||||||||||||||||    
T  6413 ttaattggtatcgtattggtcctctaactaaaaattgatt-atttcggtcctctaagtttctcaccgttactacatttagtcatttctgttagttttatt 6315  T
Q  217 caaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6314 caaataaacgttagagtttgtgttatgtgggt 6283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 192 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 82202 - 82065
Alignment:
Q  192 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtcttg 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||    
T  82202 tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattaatatcattttggtcctatttcttg 82103  T
Q  292 ttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  82102 ttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 82065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 94 - 237
Target Start/End: Original strand, 81858 - 82009
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  81858 ggcttaattatctttttgatcctctaactatttatttggtatcagattggtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcactgtt 81957  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgt 237  Q
        | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  81958 actacatttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgt 82009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 90867 - 90789
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||| ||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90867 ctctaactatttagttggtatcggattagtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 90789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 97 - 329
Target Start/End: Original strand, 15456 - 15691
Alignment:
Q  97 taaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt--- 193  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||  ||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||       
T  15456 taaattaccttttttatcctctaactattcaattggtatcggattgatcctctaattaaaaattgatttattttggtcatttaagtttctcactgttact 15555  T
Q  194 -----tagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggtcctctaactttatttattagtatcattttgatcatatgtc 288  Q
         ||||| |||||||||     ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| |    
T  15556 acatttagtcatttctgtta-----attcaaataaatgtttgagtttgtgttatgtgggtcctctaactttatttattagtatcatttttgtcctatgcc 15650  T
Q  289 ttgttaaggtattatgattaaatagtgactgatattcttgg 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15651 ttgttaagatattatgattaaatagtgactgatattattgg 15691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 15898 - 15736
Alignment:
Q  94 ggctaaattacctttttgattctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcac---- 189  Q
    |||| |||||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
T  15898 ggcttaattacttttttgatcctctaactatttaactggtatcggattggtcatctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccatg 15799  T
Q  190 ----cgtttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgtattatgtgggt 248  Q
        | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15798 actacatttaatcccttctgttagttttattcaaataaacgttagggtttgtgttatgtgggt 15736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 146 - 245
Target Start/End: Original strand, 14243 - 14350
Alignment:
Q  146 ctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgt 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14243 ctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgttgctatatttagtcatttctgttagttttattcaaataaacgttagagtttgt 14342  T
Q  238 attatgtg 245  Q
     |||||||    
T  14343 gttatgtg 14350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 115 - 193
Target Start/End: Original strand, 144041 - 144119
Alignment:
Q  115 ctctatctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  144041 ctctaactatttaattggtatcatattggttctctaactaaaaattgatttatttcggtcccttaaatttctcaccgtt 144119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 147241 - 147191
Alignment:
Q  143 gtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccgtt 193  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  147241 gtcctcgaactaaaaattgatttatttcggtccgttaagtttctcatcgtt 147191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 121 - 238
Target Start/End: Original strand, 9809 - 9933
Alignment:
Q  121 ctatttaattggtattagattcgtcctctaactaaaaattgatttatttcggtcctctaagtttctcaccg--------tttagtcctttctgttagttt 212  Q
    |||||||||||||||  | ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  |||        |||||||||||| ||||||||    
T  9809 ctatttaattggtatcggtttgctcctctaactaaaatttgatttattttggtcctttaagtttctatccgttactacttttagtcctttccgttagttt 9908  T
Q  213 tattcaaataaacgttagagtttgta 238  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  9909 tatt-aaaaaaacgttagggtttgta 9933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University