View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11754_low_12 (Length: 221)

Name: NF11754_low_12
Description: NF11754
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11754_low_12
NF11754_low_12
[»] chr8 (38 HSPs)
chr8 (1-201)||(14422697-14422897)
chr8 (1-196)||(18594536-18594731)
chr8 (1-196)||(39206585-39206780)
chr8 (1-197)||(29938059-29938255)
chr8 (1-193)||(13110406-13110598)
chr8 (1-191)||(2042537-2042727)
chr8 (3-197)||(35118046-35118240)
chr8 (3-196)||(10836770-10836963)
chr8 (1-196)||(6144286-6144481)
chr8 (1-196)||(22260643-22260838)
chr8 (1-196)||(24113179-24113374)
chr8 (1-190)||(34679470-34679659)
chr8 (1-201)||(4035841-4036041)
chr8 (1-192)||(144397-144588)
chr8 (1-196)||(33278399-33278594)
chr8 (1-196)||(39218776-39218971)
chr8 (1-195)||(34842378-34842572)
chr8 (1-193)||(34998909-34999101)
chr8 (3-198)||(41575510-41575705)
chr8 (1-199)||(38167168-38167366)
chr8 (1-196)||(7774763-7774958)
chr8 (1-194)||(7791412-7791605)
chr8 (1-201)||(44804957-44805157)
chr8 (4-200)||(8021714-8021902)
chr8 (3-196)||(7811994-7812187)
chr8 (3-196)||(36491156-36491349)
chr8 (39-196)||(40117903-40118060)
chr8 (1-197)||(5320562-5320758)
chr8 (39-196)||(33287076-33287233)
chr8 (3-191)||(42571598-42571783)
chr8 (1-193)||(28639280-28639474)
chr8 (56-196)||(26783801-26783941)
chr8 (1-192)||(66192-66384)
chr8 (1-116)||(9807339-9807454)
chr8 (44-196)||(2322068-2322220)
chr8 (44-193)||(39220258-39220407)
chr8 (67-190)||(5005171-5005294)
chr8 (108-193)||(9806875-9806960)
[»] chr6 (23 HSPs)
chr6 (1-201)||(26946889-26947089)
chr6 (1-196)||(2837544-2837739)
chr6 (1-196)||(6086612-6086807)
chr6 (1-201)||(30691845-30692045)
chr6 (1-196)||(3347536-3347731)
chr6 (1-196)||(26704352-26704547)
chr6 (1-199)||(20726787-20726981)
chr6 (1-193)||(17261086-17261278)
chr6 (4-199)||(3955782-3955977)
chr6 (1-201)||(9459557-9459757)
chr6 (1-196)||(21893454-21893649)
chr6 (1-196)||(18613537-18613732)
chr6 (3-196)||(16307023-16307216)
chr6 (1-192)||(34887305-34887496)
chr6 (1-196)||(11167239-11167434)
chr6 (9-196)||(35198283-35198469)
chr6 (1-185)||(1153603-1153787)
chr6 (1-193)||(28199521-28199714)
chr6 (32-196)||(52835-52999)
chr6 (1-191)||(30698942-30699132)
chr6 (1-125)||(33464399-33464523)
chr6 (1-102)||(53001-53102)
chr6 (117-193)||(33463703-33463779)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (1-196)||(22964-23159)
[»] chr5 (31 HSPs)
chr5 (1-196)||(1579036-1579231)
chr5 (1-196)||(1605584-1605779)
chr5 (4-201)||(9008073-9008270)
chr5 (3-196)||(27420858-27421051)
chr5 (1-191)||(16737460-16737650)
chr5 (1-196)||(27679182-27679377)
chr5 (1-193)||(16069356-16069548)
chr5 (1-192)||(24105684-24105875)
chr5 (1-196)||(33491209-33491404)
chr5 (1-190)||(3386499-3386688)
chr5 (1-196)||(4120937-4121132)
chr5 (1-193)||(3921584-3921776)
chr5 (4-196)||(38598466-38598658)
chr5 (1-196)||(8374352-8374546)
chr5 (3-196)||(33991140-33991333)
chr5 (1-189)||(1165614-1165802)
chr5 (4-199)||(5202969-5203164)
chr5 (1-196)||(19358526-19358721)
chr5 (5-196)||(20992163-20992354)
chr5 (1-192)||(31883148-31883339)
chr5 (3-201)||(35782659-35782857)
chr5 (1-197)||(31410475-31410671)
chr5 (3-197)||(26602957-26603141)
chr5 (1-151)||(27025001-27025151)
chr5 (61-201)||(20992354-20992498)
chr5 (55-188)||(33284642-33284775)
chr5 (44-196)||(25634582-25634732)
chr5 (1-46)||(35420437-35420482)
chr5 (60-159)||(31638182-31638281)
chr5 (77-130)||(41818552-41818605)
chr5 (62-159)||(19516044-19516141)
[»] chr3 (39 HSPs)
chr3 (3-199)||(38856084-38856280)
chr3 (4-201)||(25999377-25999574)
chr3 (1-196)||(37698142-37698337)
chr3 (3-196)||(42307906-42308099)
chr3 (3-201)||(15520143-15520341)
chr3 (1-196)||(22174989-22175184)
chr3 (1-196)||(46452161-46452356)
chr3 (1-203)||(8042594-8042796)
chr3 (1-196)||(29445482-29445677)
chr3 (1-196)||(50528923-50529118)
chr3 (1-199)||(25494284-25494482)
chr3 (1-193)||(32244117-32244309)
chr3 (1-196)||(20842347-20842542)
chr3 (1-196)||(24835698-24835893)
chr3 (1-190)||(21581042-21581231)
chr3 (1-196)||(15520630-15520825)
chr3 (1-196)||(54870173-54870368)
chr3 (1-195)||(20699144-20699338)
chr3 (3-202)||(12117659-12117858)
chr3 (1-196)||(35226441-35226636)
chr3 (1-196)||(38933940-38934134)
chr3 (1-196)||(54534327-54534520)
chr3 (3-190)||(44609334-44609521)
chr3 (1-193)||(32359256-32359448)
chr3 (6-197)||(26122807-26122998)
chr3 (1-186)||(42104970-42105155)
chr3 (1-196)||(34700335-34700530)
chr3 (1-196)||(2895179-2895378)
chr3 (1-197)||(44688759-44688949)
chr3 (1-168)||(16354368-16354535)
chr3 (1-190)||(48925002-48925189)
chr3 (1-196)||(53028219-53028406)
chr3 (38-195)||(35643212-35643369)
chr3 (56-190)||(50529827-50529961)
chr3 (62-202)||(49128037-49128177)
chr3 (5-167)||(12915930-12916091)
chr3 (1-76)||(24366143-24366218)
chr3 (1-69)||(13696914-13696982)
chr3 (3-36)||(50528883-50528916)
[»] chr2 (28 HSPs)
chr2 (1-199)||(31517228-31517426)
chr2 (1-196)||(33906060-33906255)
chr2 (1-196)||(18806897-18807092)
chr2 (3-199)||(3873259-3873455)
chr2 (3-196)||(26323201-26323394)
chr2 (8-196)||(1108277-1108464)
chr2 (1-196)||(39635449-39635644)
chr2 (3-196)||(4232157-4232350)
chr2 (1-193)||(4016039-4016231)
chr2 (1-193)||(28329852-28330042)
chr2 (1-192)||(42937720-42937912)
chr2 (1-196)||(5733396-5733591)
chr2 (1-196)||(6174841-6175036)
chr2 (3-203)||(19901153-19901352)
chr2 (1-192)||(1482916-1483106)
chr2 (1-196)||(30270692-30270887)
chr2 (2-192)||(16588790-16588980)
chr2 (1-196)||(2178782-2178977)
chr2 (1-179)||(19383948-19384126)
chr2 (1-193)||(850997-851189)
chr2 (44-194)||(30420223-30420373)
chr2 (1-189)||(16066307-16066495)
chr2 (3-197)||(429812-430006)
chr2 (1-195)||(44947562-44947749)
chr2 (44-196)||(42446625-42446777)
chr2 (51-195)||(22101210-22101353)
chr2 (44-192)||(3585291-3585439)
chr2 (60-200)||(12517256-12517395)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (3-194)||(7164184-7164375)
chr7 (1-196)||(24792335-24792530)
chr7 (1-196)||(43067976-43068171)
chr7 (3-203)||(22649699-22649899)
chr7 (1-201)||(33359093-33359293)
chr7 (5-196)||(30181031-30181222)
chr7 (1-196)||(12101181-12101376)
chr7 (1-196)||(42964999-42965194)
chr7 (1-195)||(20346487-20346681)
chr7 (1-193)||(3511324-3511516)
chr7 (1-197)||(25748484-25748680)
chr7 (1-201)||(42204147-42204348)
chr7 (1-203)||(15655903-15656105)
chr7 (1-202)||(5280852-5281053)
chr7 (1-201)||(12097593-12097793)
chr7 (1-196)||(933283-933478)
chr7 (1-192)||(4477324-4477515)
chr7 (1-191)||(1803029-1803219)
chr7 (1-196)||(6394749-6394944)
chr7 (1-196)||(33846532-33846722)
chr7 (5-202)||(4347265-4347462)
chr7 (4-196)||(32041540-32041732)
chr7 (1-189)||(43156718-43156906)
chr7 (1-196)||(36890833-36891027)
chr7 (1-192)||(42673467-42673654)
chr7 (7-195)||(8630665-8630853)
chr7 (1-193)||(9452591-9452783)
chr7 (1-191)||(38866547-38866737)
chr7 (1-199)||(17753595-17753793)
chr7 (1-193)||(46891342-46891535)
chr7 (3-194)||(46134309-46134500)
chr7 (1-159)||(48865665-48865826)
chr7 (1-201)||(16894510-16894700)
chr7 (1-196)||(43021583-43021774)
chr7 (49-196)||(19828268-19828415)
chr7 (99-196)||(37704978-37705075)
chr7 (44-201)||(37005857-37006014)
chr7 (44-201)||(43405013-43405170)
chr7 (105-189)||(27691433-27691517)
chr7 (44-196)||(15655458-15655610)
chr7 (44-199)||(30075277-30075429)
chr7 (51-198)||(36849590-36849737)
chr7 (60-189)||(20163824-20163953)
[»] chr4 (63 HSPs)
chr4 (3-194)||(1756767-1756958)
chr4 (1-198)||(19913631-19913828)
chr4 (4-196)||(23776463-23776655)
chr4 (1-196)||(50055102-50055297)
chr4 (1-196)||(54189542-54189737)
chr4 (2-199)||(38055151-38055348)
chr4 (3-195)||(11639581-11639773)
chr4 (1-196)||(27488649-27488844)
chr4 (1-196)||(50353798-50353993)
chr4 (1-196)||(53717465-53717660)
chr4 (1-193)||(20877047-20877239)
chr4 (1-196)||(28032713-28032908)
chr4 (3-196)||(23704212-23704405)
chr4 (1-201)||(31969673-31969873)
chr4 (5-193)||(35490778-35490966)
chr4 (1-196)||(2481409-2481604)
chr4 (1-196)||(6611361-6611556)
chr4 (1-196)||(14987789-14987984)
chr4 (1-196)||(15241029-15241224)
chr4 (1-192)||(43289961-43290152)
chr4 (1-196)||(44784918-44785113)
chr4 (1-196)||(45424535-45424730)
chr4 (1-195)||(40428721-40428915)
chr4 (1-199)||(52139197-52139395)
chr4 (1-194)||(54412627-54412820)
chr4 (1-192)||(16700782-16700973)
chr4 (1-196)||(48909843-48910038)
chr4 (1-193)||(1617084-1617276)
chr4 (1-196)||(6688628-6688817)
chr4 (1-193)||(30423566-30423757)
chr4 (1-196)||(37464718-37464913)
chr4 (1-195)||(47632032-47632227)
chr4 (1-196)||(27536105-27536296)
chr4 (1-195)||(37968758-37968952)
chr4 (1-198)||(8591093-8591290)
chr4 (1-206)||(8932179-8932384)
chr4 (1-196)||(53353052-53353255)
chr4 (1-192)||(19164974-19165164)
chr4 (1-196)||(15669180-15669375)
chr4 (1-192)||(53875658-53875849)
chr4 (1-196)||(44379188-44379383)
chr4 (1-197)||(33703837-33704033)
chr4 (3-189)||(40680041-40680227)
chr4 (1-189)||(27583633-27583821)
chr4 (1-192)||(30171581-30171772)
chr4 (22-190)||(28360433-28360602)
chr4 (1-194)||(44375844-44376037)
chr4 (1-196)||(55344826-55345021)
chr4 (44-196)||(50053440-50053592)
chr4 (4-184)||(38071327-38071504)
chr4 (5-158)||(16703856-16704009)
chr4 (1-116)||(23269047-23269162)
chr4 (108-193)||(23265865-23265950)
chr4 (44-196)||(44548185-44548338)
chr4 (1-75)||(53408137-53408212)
chr4 (44-186)||(17493340-17493482)
chr4 (45-127)||(51780763-51780845)
chr4 (1-51)||(23261887-23261937)
chr4 (1-91)||(9595903-9595982)
chr4 (1-54)||(48748197-48748250)
chr4 (1-37)||(50055301-50055337)
chr4 (49-106)||(55344724-55344781)
chr4 (140-196)||(9595975-9596030)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (1-196)||(36702-36897)
[»] chr1 (48 HSPs)
chr1 (1-196)||(1168500-1168695)
chr1 (1-196)||(1940760-1940955)
chr1 (1-196)||(25897371-25897566)
chr1 (1-196)||(33510481-33510676)
chr1 (1-196)||(39260359-39260554)
chr1 (1-194)||(26663257-26663450)
chr1 (1-190)||(29078519-29078708)
chr1 (1-201)||(20089463-20089663)
chr1 (1-196)||(16052093-16052288)
chr1 (1-196)||(26580283-26580478)
chr1 (1-196)||(52753160-52753355)
chr1 (2-190)||(38829072-38829260)
chr1 (4-196)||(41928511-41928703)
chr1 (1-193)||(46760966-46761158)
chr1 (1-196)||(52696788-52696983)
chr1 (1-202)||(42370808-42371009)
chr1 (1-196)||(29288146-29288339)
chr1 (1-197)||(970537-970735)
chr1 (1-196)||(1170457-1170652)
chr1 (1-192)||(43905655-43905846)
chr1 (1-193)||(8079722-8079914)
chr1 (4-196)||(40092488-40092680)
chr1 (5-196)||(32671576-32671767)
chr1 (1-194)||(5215384-5215577)
chr1 (3-196)||(13996738-13996931)
chr1 (1-201)||(12682812-12683012)
chr1 (1-193)||(19715174-19715366)
chr1 (1-196)||(2347653-2347849)
chr1 (1-193)||(2473722-2473914)
chr1 (1-196)||(17591688-17591880)
chr1 (1-192)||(8120870-8121061)
chr1 (1-197)||(51359230-51359425)
chr1 (4-199)||(15203106-15203301)
chr1 (1-196)||(15554165-15554352)
chr1 (1-192)||(46409436-46409629)
chr1 (3-199)||(23498454-23498650)
chr1 (6-192)||(49146173-49146359)
chr1 (1-193)||(7145207-7145399)
chr1 (1-177)||(17587518-17587694)
chr1 (1-191)||(15717787-15717976)
chr1 (1-203)||(6765449-6765651)
chr1 (1-159)||(40149497-40149655)
chr1 (27-195)||(29695673-29695842)
chr1 (1-192)||(38171833-38172011)
chr1 (64-196)||(52086264-52086396)
chr1 (45-180)||(23322897-23323032)
chr1 (44-196)||(5217840-5217991)
chr1 (122-201)||(5675097-5675176)
[»] scaffold0920 (1 HSPs)
scaffold0920 (3-195)||(3708-3900)
[»] scaffold1777 (1 HSPs)
scaffold1777 (1-196)||(19-214)
[»] scaffold0172 (1 HSPs)
scaffold0172 (1-196)||(10235-10430)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-193)||(145258-145450)
[»] scaffold0482 (1 HSPs)
scaffold0482 (1-194)||(308-501)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-193)||(19-212)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14422897 - 14422697
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14422897 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 14422798  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14422797 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggccataa 14422698  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  14422697 t 14422697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18594731 - 18594536
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  18594731 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 18594632  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18594631 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 18594536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39206780 - 39206585
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39206780 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 39206681  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39206680 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 39206585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 29938255 - 29938059
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29938255 aggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 29938156  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29938155 aagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 29938059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 13110598 - 13110406
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  13110598 aggaggttacataaactcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttattaaactatgat 13110499  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13110498 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcatatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 13110406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 2042537 - 2042727
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  2042537 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 2042636  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2042637 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 2042727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 35118046 - 35118240
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  35118046 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 35118145  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35118146 gctatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 35118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 10836770 - 10836963
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  10836770 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 10836869  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  10836870 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 10836963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 6144286 - 6144481
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6144286 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 6144385  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6144386 aagctatttttatttatttacccaaacactgttaaaaaggcatatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6144481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22260643 - 22260838
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22260643 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaggat 22260742  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22260743 aagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagacttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 22260838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 24113179 - 24113374
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24113179 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 24113278  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  24113279 aatctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagggttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 24113374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 34679470 - 34679659
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  34679470 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 34679569  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34679570 aaactatttttatttatttattcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaac 34679659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 4036041 - 4035841
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4036041 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 4035942  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  4035941 aagctatttttatttgtttacccaaacacctttaataaaacttatgggagtagataagcccatataagctaaaaataaaccaatccaaacggggccttaa 4035842  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  4035841 t 4035841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 144588 - 144397
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  144588 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 144489  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||| ||||||||||||    
T  144488 aaactatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacatatgctcaaaataagtcaatccaaacgg 144397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33278594 - 33278399
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33278594 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33278495  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  33278494 aaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgaaagtagataagtccatataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 33278399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39218971 - 39218776
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  39218971 aggaggtcacataaattcatcagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaagctatgat 39218872  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39218871 aaaccatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 39218776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 34842378 - 34842572
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34842378 aggaggtcacataaattaataagctccttgttaagacggtgggtaagctggaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 34842477  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34842478 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 34842572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 34998909 - 34999101
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34998909 aggagattaaataaattcataagctccttgttaagccggagggcaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactaagat 34999008  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  34999009 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccgtataagctcaaaataagccaatccatacggg 34999101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 41575705 - 41575510
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  41575705 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 41575606  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccat 198  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41575605 gcaatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtctacataagctcaaaataagccaatccaaacggagccat 41575510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 38167168 - 38167366
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38167168 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 38167267  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  38167268 aaactagttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataagcccacataaactcaaaataggccaatccaaacagggccata 38167366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7774958 - 7774763
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  7774958 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 7774859  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||    
T  7774858 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaacccgcataagctcaaaataagccaatctaaacgaggcc 7774763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7791605 - 7791412
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  7791605 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 7791506  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7791505 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 7791412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 44804957 - 44805157
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  44804957 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 44805056  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  44805057 aagctatttttatttatttatctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataaacctacataagctcaaaataagccaattcaaatgaggccataa 44805156  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  44805157 t 44805157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8021902 - 8021714
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||     
T  8021902 aggttatataaactcataagctccttgttaagccgga--------tgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaa 8021811  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8021810 ctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggaccataa 8021714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 7812187 - 7811994
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  7812187 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 7812088  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| | || ||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7812087 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagactaatggaagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatcaaaacggggcc 7811994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 36491349 - 36491156
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  36491349 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaagttatgaaactatgataa 36491250  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||| |||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  36491249 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaagacttatgcgattagataatcccacataagcttaaaataagccaatccaaatggggcc 36491156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Original strand, 40117903 - 40118060
Alignment:
Q  39 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 138  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40117903 gagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaa 40118002  T
Q  139 ggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40118003 ggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 40118060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 5320758 - 5320562
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  5320758 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagttgaaaatttaggcttattgaaacatgacataagcaacttatgaaactatgat 5320659  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5320658 aaattatttttatttatttaccaaaacaactttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 5320562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 39 - 196
Target Start/End: Original strand, 33287076 - 33287233
Alignment:
Q  39 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaa 138  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33287076 gagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaa 33287175  T
Q  139 ggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
     || ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  33287176 agcatatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 33287233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 3 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42571783 - 42571598
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  42571783 gaggttgcataaattcataagttccttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggc--attgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataa 42571686  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  42571685 gctatttttatt-atttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacg 42571598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 28639474 - 28639280
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28639474 aggaggttacataa--tcataagctctatgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 28639377  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggct----tatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||    ||| ||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  28639376 aaactatttttatttatttaccaaaacacctttaaaaaagcttgtatataggagtagataagctcacataagcttaaaataagccaattcaaacggg 28639280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 56 - 196
Target Start/End: Original strand, 26783801 - 26783941
Alignment:
Q  56 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26783801 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagat 26783900  T
Q  156 aagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  26783901 aagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 26783941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 66192 - 66384
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgga-gggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataa 99  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  66192 aggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccgaaagggtaagctgaaaatttaaacttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatta 66291  T
Q  100 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| | | ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  66292 taagttatttttatttatttacccaaacacttttaaaaagacatatgggaatagataagcctacagaaactcaaaataagccaatctaaacgg 66384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 9807454 - 9807339
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||    
T  9807454 aggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaagctatgat 9807355  T
Q  101 aagctatttttattta 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  9807354 aagctatttttattta 9807339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 2322068 - 2322220
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2322068 taagcttaaaatttaggcttatcaaaatatgatataagcagcttatgaaattgtgataagctgtttttattgatttacccaaacacctttaaaaaagctt 2322167  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||  |||||||||  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  2322168 atgttagtagataaatccatataagctccgaataagccaatccaaacggggcc 2322220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 39220407 - 39220258
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||| | || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | |    
T  39220407 taagctcaaaatttgagcttattaaaatatagtatgagcagcttatgaaattggaataagctatttttattgatttactcaaacacctttaaaaagacat 39220308  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||  |||||||||  |||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  39220307 atggatgtagataagttcatataagctcaaaataagtcaattcaaacggg 39220258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 67 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 5005294 - 5005171
Alignment:
Q  67 aaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatata 166  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||  |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  5005294 aaaatatagcataagcagtttatgagagtagcataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacata 5005195  T
Q  167 agttcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    || | || ||||||||||||||||    
T  5005194 agcttaagataagccaatccaaac 5005171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 108 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9806960 - 9806875
Alignment:
Q  108 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  9806960 ttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcatatgggagtagataagcacatataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 9806875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 23)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 26946889 - 26947089
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  26946889 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 26946988  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26946989 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccctaa 26947088  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  26947089 t 26947089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2837739 - 2837544
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  2837739 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatgagcagctcatgaaactatgat 2837640  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2837639 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 2837544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 6086612 - 6086807
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  6086612 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 6086711  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6086712 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 6086807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 30692045 - 30691845
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30692045 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 30691946  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  30691945 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggccctaa 30691846  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  30691845 t 30691845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 3347536 - 3347731
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  3347536 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 3347635  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3347636 aagctgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 3347731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 26704352 - 26704547
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26704352 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 26704451  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26704452 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccacgtaagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26704547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 20726981 - 20726787
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20726981 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 20726882  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    ||| ||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20726881 aagttattttta----tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggccata 20726787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 17261086 - 17261278
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17261086 aggaggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaaatattat 17261185  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17261186 aagctatttttatttatttacccaaacacctttagaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 17261278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Original strand, 3955782 - 3955977
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  3955782 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagtttatgaaactatgataag 3955881  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3955882 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggtcata 3955977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 9459757 - 9459557
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9459757 aggaggatacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 9459658  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9459657 aagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatggaaatagataagctcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggccctaa 9459558  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  9459557 t 9459557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 21893649 - 21893454
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21893649 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 21893550  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||    
T  21893549 aagctatttttatatatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataaatcgatccaaacggggcc 21893454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18613732 - 18613537
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  18613732 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatggaactatgat 18613633  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  18613632 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccgcataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 18613537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 16307023 - 16307216
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16307023 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 16307122  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16307123 gctgtttttatttatttatccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 16307216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 34887305 - 34887496
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  34887305 aggaggtcacataaattcattagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgat 34887404  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  34887405 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaggagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 34887496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 11167434 - 11167239
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  11167434 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggtgggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 11167335  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  | || |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11167334 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgaaaataaataagcacacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 11167239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 9 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35198469 - 35198283
Alignment:
Q  9 acataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatt 108  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35198469 acataaattcataagttccttgttaagccggagagtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatt 35198370  T
Q  109 tttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35198369 tttatttatttacccaaacacctttaaaaa-gcttatggaagtagataagcccacataagttcaaaataagccaattcaaacggggcc 35198283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 1153787 - 1153603
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1153787 aggaggttacataaatacataagcaccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1153688  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatc 185  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||    
T  1153687 aatctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccaacataagcttaaaataagccaatc 1153603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 28199521 - 28199714
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  28199521 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgat 28199619  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta---gataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28199620 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28199714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 32 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52999 - 52835
Alignment:
Q  32 taagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacct 131  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52999 taagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacct 52900  T
Q  132 ttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52899 ttaaaaatgcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 30698942 - 30699132
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||    
T  30698942 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagctaataaaactatgat 30699041  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | || |||||| || ||||  ||| |||||| |||||||||||    
T  30699042 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaataaataagctcacataaactcataataagtcaatccaaacg 30699132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 33464523 - 33464399
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33464523 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33464424  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaa 125  Q
    || ||||||||| ||||||||||||    
T  33464423 aaactatttttacttatttacccaa 33464399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 53102 - 53001
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  53102 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 53003  T
Q  101 aa 102  Q
    ||    
T  53002 aa 53001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 117 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 33463779 - 33463703
Alignment:
Q  117 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33463779 tttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 33463703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 184; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22964 - 23159
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22964 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 23063  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23064 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 184; Significance: 1e-100; HSPs: 31)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1579231 - 1579036
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1579231 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1579132  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1579131 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 1579036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 1605584 - 1605779
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1605584 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1605683  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1605684 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 1605779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 1e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Original strand, 9008073 - 9008270
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9008073 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 9008172  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9008173 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttaat 9008270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 27421051 - 27420858
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27421051 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 27420952  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27420951 actatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 27420858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Original strand, 16737460 - 16737650
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16737460 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16737559  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  16737560 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaattcaaacg 16737650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27679182 - 27679377
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27679182 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 27679281  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27679282 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 27679377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 16069548 - 16069356
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16069548 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16069449  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  16069448 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 16069356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 24105684 - 24105875
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  24105684 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgataatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 24105783  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24105784 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 24105875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 33491209 - 33491404
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  33491209 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcaaaagcagcttatgaaactatgat 33491308  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33491309 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33491404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 3386499 - 3386688
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3386499 aggaggttacataaattcataggctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 3386598  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3386599 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 3386688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 4121132 - 4120937
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4121132 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 4121033  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4121032 aaattatttttacttatttacccaaacacctttaaaagggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccattccaaacggggcc 4120937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3921776 - 3921584
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3921776 aggaggttacataaattcataagctcctttttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 3921677  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  |||||||||||||    
T  3921676 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccatataaactcaaaataaatcaatccaaacggg 3921584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 38598466 - 38598658
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38598466 aggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 38598565  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  38598566 ctatttttacttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagctcacataagttcaaagtaagccaatccaaaccgggcc 38598658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 8374352 - 8374546
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8374352 aggaggttacataaat-cataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 8374450  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  8374451 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagcttaaaataaggcaatccaaacggggcc 8374546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33991333 - 33991140
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  33991333 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataa 33991234  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||| |||||||||||    
T  33991233 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaattcaaacggggcc 33991140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 1165614 - 1165802
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  1165614 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgat 1165713  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  1165714 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaa 1165802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 5203164 - 5202969
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  5203164 aggtgacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 5203065  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5203064 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaaccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggccata 5202969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19358721 - 19358526
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19358721 aggagattacataaattcataagctccttgttaagttggagggtaagctgaaaatttaggcttactaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 19358622  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  19358621 aagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggcc 19358526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 20992163 - 20992354
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||    
T  20992163 ggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataatcagcttatgaaactatgatatgc 20992262  T
Q  105 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20992263 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttataggagtagataagaccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 20992354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 31883339 - 31883148
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  31883339 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 31883240  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31883239 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagagtagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 31883148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 35782659 - 35782857
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc-cggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35782659 gaggttacataaattcataagctccttg-taagcacggagggtaggctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 35782757  T
Q  102 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataat 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  35782758 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataaggcaatccaaacggggccttaat 35782857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 31410671 - 31410475
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  31410671 aggaggtcacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttataaaactatgat 31410572  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||  |||||||||  ||||||||||| |||||    
T  31410571 aagctatttttatttgtttactcaaacacctttaaaaagacttatgggggtagataaacccatataaactcaaaataaatcaatccaaacgcggcca 31410475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Original strand, 26602957 - 26603141
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26602957 gaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagagtaaactgaaaaattatgcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 26603056  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26603057 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc----------tcaaaataagccaatccaaacggggcca 26603141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 27025151 - 27025001
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27025151 aggaggttacataaatttataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaaatggcataagcagcttatgaaactatgat 27025052  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagt 151  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||    
T  27025051 aagctatttttatttatttacccgaacatctttaaaaagtcttatgggagt 27025001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 61 - 201
Target Start/End: Original strand, 20992354 - 20992498
Alignment:
Q  61 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20992354 cttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgatatgctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcc 20992453  T
Q  161 cat----ataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataat 201  Q
    |||    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20992454 catgtacataagctcaaaataagccaatccaaacagggccttaat 20992498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 55 - 188
Target Start/End: Original strand, 33284642 - 33284775
Alignment:
Q  55 tttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 154  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33284642 tttaggcttattgaaatatggtataagcagtttataaaactatgataagctatttttatttatttacttaaacacctttaaaaaggcttatgggagtaga 33284741  T
Q  155 taagcccatataagttcaaaataagccaatccaa 188  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  33284742 taagcccatataagctcaaaataagtcaatccaa 33284775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25634732 - 25634582
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||  || |||||||||||||| |||||| |||||||||| | | ||||||||||||   ||||||||||||||   ||| |||  ||||    
T  25634732 taagctcaaaattatggtttattaaaatatggtataagcggcttatgaaattgttataagctatttt--attatttacccaaacgtatttgaaagagctt 25634635  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||  ||||||||| | |  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||    
T  25634634 atgttagtagataaactctcataagcttaaaataagccaatctaaacggggcc 25634582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 35420437 - 35420482
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaa 46  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35420437 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaa 35420482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 60 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 31638281 - 31638182
Alignment:
Q  60 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 159  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| ||| | | ||||| |||||||||  ||||| |||||||| |||| |||||||||||  ||||| |||||    
T  31638281 gcttattaaaatatgacataagaagcttataaaattgtgataagttatttttatcgatttatccaaacacttttacaaaggcttatgttagtaggtaagc 31638182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 77 - 130
Target Start/End: Original strand, 41818552 - 41818605
Alignment:
Q  77 ataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacc 130  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  41818552 ataagcagcttataaaaatatgataagctatttttattaatttacctaaacacc 41818605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 62 - 159
Target Start/End: Original strand, 19516044 - 19516141
Alignment:
Q  62 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 159  Q
    ||||||||||||  ||||||||| |||||||| |   ||||||||||||||||  |||  |||||| || |||||||| ||||||  | |||||||||    
T  19516044 ttattaaaatattacataagcagtttatgaaattgatataagctatttttattactttgtccaaacgccgttaaaaagacttatgttaatagataagc 19516141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 181; Significance: 6e-98; HSPs: 39)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38856280 - 38856084
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38856280 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 38856181  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38856180 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggtcata 38856084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 4 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25999574 - 25999377
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  25999574 aggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 25999475  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataat 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25999474 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccataat 25999377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 37698142 - 37698337
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  37698142 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 37698241  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37698242 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 37698337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 42307906 - 42308099
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42307906 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 42308005  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42308006 gctatttttatttatttacccaaacgcctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 42308099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 3 - 201
Target Start/End: Original strand, 15520143 - 15520341
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||    
T  15520143 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaacgatgataa 15520242  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataat 201  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15520243 gttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttaat 15520341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22174989 - 22175184
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22174989 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 22175088  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22175089 aagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 22175184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 46452161 - 46452356
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  46452161 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtgagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 46452260  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  46452261 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 46452356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 8042796 - 8042594
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8042796 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 8042697  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  8042696 aaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagctcacataagctcaaaataagcccatccaaacggggccttaa 8042597  T
Q  201 tat 203  Q
    |||    
T  8042596 tat 8042594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29445677 - 29445482
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||    
T  29445677 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataaacagcttatgaaactatgat 29445578  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29445577 aagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 29445482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 50529118 - 50528923
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50529118 aggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 50529019  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50529018 aagctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50528923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 25494284 - 25494482
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25494284 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagcaggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 25494383  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25494384 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccata 25494482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32244309 - 32244117
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32244309 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 32244210  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32244209 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 32244117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 20842347 - 20842542
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||    
T  20842347 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcagcttatgaaactatgat 20842446  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20842447 aagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 20842542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 24835698 - 24835893
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24835698 aggagtttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 24835797  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||  ||||||||||||||||    
T  24835798 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagttgataagtctatataagctcaaaataaatcaatccaaacggggcc 24835893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 21581231 - 21581042
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21581231 aggatgttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 21581132  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21581131 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 21581042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15520825 - 15520630
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15520825 aggaggttacaaaaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 15520726  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15520725 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 15520630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 54870173 - 54870368
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  54870173 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacgatgat 54870272  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  54870273 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 54870368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20699338 - 20699144
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20699338 aggaggttacaaaaattcctaagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 20699239  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20699238 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20699144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 3 - 202
Target Start/End: Original strand, 12117659 - 12117858
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  12117659 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgataa 12117758  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataata 202  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  12117759 actatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggccttaata 12117858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 35226636 - 35226441
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  35226636 aggaggttacataaattcataagctccttgttaggctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 35226537  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  35226536 aagctgattttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataagcccacataagctcaaaataggccaatccaaacagggcc 35226441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 38934134 - 38933940
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  38934134 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactggaaatttagacttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 38934035  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  38934034 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 38933940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 54534327 - 54534520
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||| || ||    
T  54534327 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaa-tatggcataagcagcttat-aaaccatgat 54534424  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54534425 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 54534520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 3 - 190
Target Start/End: Original strand, 44609334 - 44609521
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44609334 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 44609433  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  44609434 gctgtttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcaagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaac 44609521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 32359448 - 32359256
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32359448 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 32359349  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||| | |||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32359348 aaactatttttatttatttactcaaacacctttataaaagcttatggaaatagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 32359256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 6 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 26122998 - 26122807
Alignment:
Q  6 gttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagct 105  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26122998 gttacgtaaattcataagctacttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagct 26122899  T
Q  106 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26122898 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggctcatgggaatagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaactgggcca 26122807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 42104970 - 42105155
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  42104970 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcatgagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 42105069  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatcc 186  Q
    || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  42105070 aaactatttttatttttttatccaaacacctttaaaaatgtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatcc 42105155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 34700530 - 34700335
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  34700530 aggaggttatataaattcataagcttcttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 34700431  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  34700430 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatggaagtaaataaacccacataagctcaaaataaaccaatctaaacggggcc 34700335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2895378 - 2895179
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcata----agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 96  Q
    ||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2895378 aggaggttatataaattcatatataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 2895279  T
Q  97 taataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    | ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||| ||||||    
T  2895278 tgataatttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaatggggcc 2895179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 44688949 - 44688759
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  44688949 aggaggttgcataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatg-cataagcagcttatgaaactatgat 44688851  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||      |||||||||| ||||||||||||    
T  44688850 aagctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatggaagtagataaacccacataag-----cataagccaattcaaacggggcca 44688759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 16354535 - 16354368
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  16354535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcaggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaacatggcattagcagcttatgaaactatgat 16354436  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataag 168  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| | ||||||||    
T  16354435 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagtgtagataatctcatataag 16354368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Original strand, 48925002 - 48925189
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  48925002 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctaaaaatttagacttattaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgat 48925101  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    || ||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||||||||||||||    
T  48925102 aaactatttttatttatttacccaa--acttttaaaaaagcttatggaagtagataaacccatataaactctaaataagccaatccaaac 48925189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 53028406 - 53028219
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||    
T  53028406 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaaatatgat 53028307  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  53028306 aagctatttttatttattt--------acctctaaaaagacttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcc 53028219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35643369 - 35643212
Alignment:
Q  38 ggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaa 137  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35643369 ggagggtaagctcaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaagcacctttaaaa 35643270  T
Q  138 aggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    |||||||||| ||||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  35643269 aggcttatggaagtagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggc 35643212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 56 - 190
Target Start/End: Original strand, 50529827 - 50529961
Alignment:
Q  56 ttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50529827 ttaggctcattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagat 50529926  T
Q  156 aagcccatataagttcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    ||| ||| ||||  |||||||||| ||||||||||    
T  50529927 aagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaac 50529961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 62 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 49128177 - 49128037
Alignment:
Q  62 ttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagccc 161  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  49128177 ttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagttatttttattgatttacccaaacatctttaaaaagacttataggagtagataagccc 49128078  T
Q  162 atataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataata 202  Q
    | ||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  49128077 acataagtttaaaataagtcaatccaaacggggccttaata 49128037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12916091 - 12915930
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagc 104  Q
    |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||| |    
T  12916091 ggttacataaattcataaactctttcttaaaccggagggtaagctgaaaacttaagcttatttaaatatgacataagcagtttatgaaattatgataaac 12915992  T
Q  105 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataa 167  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||||||| ||||    
T  12915991 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagatttat-ggagtaaataagcccacataa 12915930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 24366218 - 24366143
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggc 76  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24366218 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggc 24366143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 13696982 - 13696914
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 69  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13696982 aggaggttacacaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaa 13696914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 36
Target Start/End: Original strand, 50528883 - 50528916
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 36  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50528883 gaggttacataaattcataagctccttgttaagc 50528916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 179; Significance: 9e-97; HSPs: 28)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 9e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 31517228 - 31517426
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  31517228 aggaggttacataaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 31517327  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31517328 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacggggccata 31517426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 33906060 - 33906255
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33906060 aggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33906159  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  33906160 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagttcaaaataagtcaatccaaacagggcc 33906255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 18806897 - 18807092
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  18806897 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgat 18806996  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18806997 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 18807092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Original strand, 3873259 - 3873455
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3873259 gaggttatataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3873358  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3873359 gctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggccata 3873455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 26323201 - 26323394
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26323201 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 26323300  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26323301 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaagacttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 26323394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 8 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1108464 - 1108277
Alignment:
Q  8 tacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctat 107  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  1108464 tacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataaactat 1108365  T
Q  108 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  1108364 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagcc-atccaaacggggcc 1108277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 39635644 - 39635449
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  39635644 aggaggttacataaattgataagctcgttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 39635545  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  39635544 aagctatatttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataagctaatccaaacggggcc 39635449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 4232157 - 4232350
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4232157 gaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttgtgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 4232256  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  4232257 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcc 4232350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 4016231 - 4016039
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4016231 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 4016132  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4016131 acgttatttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 4016039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 28329852 - 28330042
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  28329852 aggaggttacataaattcatatgctccttgttaagct--agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 28329949  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  28329950 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggtgtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 28330042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42937912 - 42937720
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggctt-attaaaatatggcataagcagcttatgaaactataa 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  42937912 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggctttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatga 42937813  T
Q  100 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42937812 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaaatagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 42937720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5733591 - 5733396
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  5733591 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 5733492  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  5733491 aagttgtttttatttattcacccaaacacctttaaaaaggctgatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggcc 5733396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 6174841 - 6175036
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  6174841 aggaggtcacgtaaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaatgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 6174940  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6174941 aaaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtatataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 6175036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 19901153 - 19901352
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  19901153 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtgggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagtttatgaaactatgataa 19901252  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataata 202  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19901253 gctattttta-ttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatggaagtagagaagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttaata 19901351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 1482916 - 1483106
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1482916 aggatgttacataaattcataagctccttgttaagtcgaagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaacaataat 1483015  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1483016 aagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaagcttat-ggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatcaaaacgg 1483106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 30270692 - 30270887
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  30270692 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 30270791  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  30270792 aaactattttattttatttatccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaactcatataagcttaaaataagccaatccaaacggggcc 30270887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 2 - 192
Target Start/End: Original strand, 16588790 - 16588980
Alignment:
Q  2 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 101  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16588790 ggaggttacattaattcataagctccttattaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 16588889  T
Q  102 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||    
T  16588890 agctatttttatttatttacccaaacttctttaaaaagacttatgaaagtagataagcccacataaacacaaaataagccaatccaaacgg 16588980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 2178782 - 2178977
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2178782 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 2178881  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||| ||||  | |||||||  ||||||||||||||||    
T  2178882 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgcgaatagataagtccacataaacttaaaataaatcaatccaaacggggcc 2178977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 19383948 - 19384126
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||    
T  19383948 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacaacttatgaaactatgat 19384047  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataag 179  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  19384048 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcatataaactcaaaataag 19384126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 851189 - 850997
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  851189 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttataaaattatgat 851090  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  851089 aagctctatttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataagcctacataagcttaaaataagcaaatccaaacggg 850997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 44 - 194
Target Start/End: Original strand, 30420223 - 30420373
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30420223 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaacctatgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 30420322  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30420323 atgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 30420373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 16066307 - 16066495
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16066307 aggaggttacataaattcataagctccttattaaatcagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16066406  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||  || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16066407 aagctatttttatttatttacccaaacactttaaaaaagacttatgaaagcagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaa 16066495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 3 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 430006 - 429812
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||    
T  430006 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcgaattgtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatcgcataagcaacttatgaaattatgataa 429907  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||| |||||||||||  ||| ||||||| ||||    
T  429906 gctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgagagtagataaatccacataaattcaaaataagggaattcaaacggagcca 429812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 44947562 - 44947749
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  44947562 aggaggttacataaattcataaacttcttgttaagccggagggtaaactgaaaatttagc-------aaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 44947654  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||| | || ||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  44947655 aaactatttttatttatttatccaaacacttttaaaaatgcttatggcactagataaactcacataagatcaaaataagccaatacaaatggggc 44947749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 42446625 - 42446777
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42446625 taagcttaaaatttgatcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttacctaaacacctttaaaaaggctt 42446724  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||  ||||||||||  |  ||||  ||  |||||||||||||||||||||||    
T  42446725 atgttagtagataagttcgcataaactccgaataagccaatccaaacggggcc 42446777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 195
Target Start/End: Original strand, 22101210 - 22101353
Alignment:
Q  51 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggag 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | ||||| | |||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||  ||    
T  22101210 aaaatttgggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaattgtgataagttgtttttattgatttatacaaatacctttaaaaaggcttatgttag 22101309  T
Q  151 tagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    |||||||  ||| |||| |||  ||||| ||||| ||||||||||    
T  22101310 tagataa-accacataaattctgaataacccaattcaaacggggc 22101353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 44 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 3585439 - 3585291
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  | |||||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||    
T  3585439 taagctcataattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattgtgataaattgtttttattaatttaccaaaacacatttaataaggttt 3585340  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    |||  ||| |||||  ||| ||||| |   |||||||| ||||||||||    
T  3585339 atgttagtggataaatccacataagctttgaataagccgatccaaacgg 3585291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 200
Target Start/End: Original strand, 12517256 - 12517395
Alignment:
Q  60 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 159  Q
    |||| ||||||||| || ||||| |||||||||| ||  ||||||| |||| ||| |  || |||||||| ||||  || ||||||   |||||||||||    
T  12517256 gcttgttaaaatattgcttaagctgcttatgaaattaggataagctcttttaattaaggtatccaaacacttttaggaaagcttattttagtagataagc 12517355  T
Q  160 ccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
     || ||||| |  |||||||||||||||||| || ||||||    
T  12517356 tcacataagct-taaataagccaatccaaacaggcccataa 12517395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 7164375 - 7164184
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7164375 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 7164276  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7164275 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 7164184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 24792335 - 24792530
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24792335 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 24792434  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  24792435 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 24792530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 43067976 - 43068171
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  43067976 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagaagcttatgaaactatgat 43068075  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  43068076 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 43068171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 203
Target Start/End: Original strand, 22649699 - 22649899
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  22649699 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataa 22649798  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataata 202  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22649799 actatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggccataata 22649898  T
Q  203 t 203  Q
    |    
T  22649899 t 22649899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 33359093 - 33359293
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33359093 aggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33359192  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33359193 aagctatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccataa 33359292  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  33359293 t 33359293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 30181031 - 30181222
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagc 104  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  30181031 ggttacataaattcataagttccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagc 30181130  T
Q  105 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30181131 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 30181222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 12101181 - 12101376
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12101181 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccatagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 12101280  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  12101281 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaatggggcc 12101376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 42964999 - 42965194
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42964999 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 42965098  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  42965099 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaaaggggcc 42965194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20346681 - 20346487
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20346681 aggaggtttcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 20346582  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20346581 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggc 20346487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3511516 - 3511324
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3511516 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 3511417  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  3511416 aagctatttttatctatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataagctcaaaataagacaatccaaacggg 3511324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 25748680 - 25748484
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25748680 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 25748581  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  25748580 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactaatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcca 25748484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 42204348 - 42204147
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42204348 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 42204249  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacaccttta-aaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42204248 aagctatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcctta 42204149  T
Q  200 at 201  Q
    ||    
T  42204148 at 42204147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15656105 - 15655903
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15656105 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 15656006  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15656005 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagcagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttaa 15655906  T
Q  201 tat 203  Q
    |||    
T  15655905 tat 15655903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 5281053 - 5280852
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5281053 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 5280954  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||    
T  5280953 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgtgaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgggaccttaa 5280854  T
Q  201 ta 202  Q
    ||    
T  5280853 ta 5280852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 12097593 - 12097793
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  12097593 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagtagcttatgaaactatgat 12097692  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||| |||||| |||    
T  12097693 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagctcatataagctcaacttaagccaatccaaatggggccctaa 12097792  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  12097793 t 12097793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 933478 - 933283
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  933478 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 933379  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || || ||||||||||||||| ||||| |||||    
T  933378 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagtccacatgagctcaaaataagccaattcaaacagggcc 933283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 4477324 - 4477515
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4477324 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgat 4477423  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4477424 aagctatttttatttatttacccaaacacctttgaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 4477515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1803219 - 1803029
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||    
T  1803219 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatcgtataagcagcttatgaaactatgat 1803120  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  1803119 aagctatttttatttatttacccaaatacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacg 1803029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6394944 - 6394749
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  6394944 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaaactgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgat 6394845  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  6394844 aaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatctaaacggggcc 6394749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 33846532 - 33846722
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  33846532 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccc-----taagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgat 33846626  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33846627 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33846722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4347462 - 4347265
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4347462 ggttacataaattcataagctccttgttaagctcgagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatggtaagc 4347363  T
Q  105 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataata 202  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4347362 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagtttatgggagtagataagcccacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggccttaata 4347265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32041732 - 32041540
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  32041732 aggttacataaatttataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatgaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataag 32041633  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  32041632 ctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaagacttatggaagtagataagcccacataagcacaaaataagccaatccaaacggggcc 32041540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 43156906 - 43156718
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||| ||    
T  43156906 aggaggttacataaattcataagttctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatttgccataaacagcttatgaaactatgat 43156807  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  43156806 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaa 43156718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 36890833 - 36891027
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  36890833 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaacttaggcttattgaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 36890932  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  36890933 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctc-aaataagtcaatccaaacggggcc 36891027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42673654 - 42673467
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  42673654 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 42673555  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||| ||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  42673554 aagctgtt----tttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctccaaataagtcaatccaaacgg 42673467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8630853 - 8630665
Alignment:
Q  7 ttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagcta 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  8630853 ttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaacta 8630754  T
Q  107 tttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  8630753 tttttatttatttacccgaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatcaacccacataacctcaaaataaacaaatccaaacggggc 8630665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 9452783 - 9452591
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||    
T  9452783 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcatagacagcttatgaaactatgat 9452684  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  || ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  9452683 aaactatttttacttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagaatagataagttcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 9452591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 38866737 - 38866547
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  38866737 aggaggttacataaattcataagctccttcttaagccggagggtaagctgaaaatttatgcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgat 38866638  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| | |||||||||    
T  38866637 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaattatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagtcgatccaaacg 38866547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 17753793 - 17753595
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  17753793 aggagattacataaattcataagctccttgttaagttgaagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgtt 17753694  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  17753693 aagctatttttatttatttacccaaacaccttctaaaaggcttataggagtagataagcttgtataagctcaaaataagctaatccaaacggggtcata 17753595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 46891342 - 46891535
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |     
T  46891342 aggaggttacataaactcataagctccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggctaattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgac 46891441  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46891442 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaggtttataggagtagataagcctatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 46891535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Original strand, 46134309 - 46134500
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  46134309 gaggttacataaattaataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcgtaaacagcttatgaaactataataa 46134408  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  46134409 actatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagagttataggagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaatccaaacgggg 46134500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 48865826 - 48865665
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48865826 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcctgatgttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 48865727  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacaccttta---aaaaggcttatgggagtagataagc 159  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  48865726 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaaaggcttatggaagtagataagc 48865665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Original strand, 16894510 - 16894700
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16894510 aggatgttacataaattcataagctccctgttaagttgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16894609  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    || |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16894610 aaactatttttatttgtttacccaaatacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc----------tcaaaataagccaatccaaacggggccttaa 16894699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 43021583 - 43021774
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |  |    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43021583 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagagtaagctgaaaatttagaccga----aatatgccataagcagcttatgaaactataat 43021678  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||| ||||||    
T  43021679 aagttatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagacttattgaagtagataagtccacataaacttaaaataagccaatccaaatggggcc 43021774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 19828415 - 19828268
Alignment:
Q  49 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggg 148  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19828415 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcaatttatgaaactatgataagctatttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatggg 19828316  T
Q  149 agtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  19828315 agtagataagccaacataaactcaaaataagccaattcaaacggggcc 19828268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 99 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 37705075 - 37704978
Alignment:
Q  99 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37705075 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaacccaaacggggcc 37704978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Original strand, 37005857 - 37006014
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||  |||    
T  37005857 taagctaaaaaattagccttattaaaatatagcataagcagcttatgaaattacgataagctatttttactgatttacccaaacgcctttaaaaaaactt 37005956  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataat 201  Q
    || | ||||||||| | || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  37005957 atagaagtagataaactcacataagcttaaaataagccaatccaaacggagccttaat 37006014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 44 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 43405170 - 43405013
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||| || ||||||||||||||| | | || || ||||||||| ||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  43405170 taagctaaaaaattgggcttattaaaatatagtagaaacaacttatgaaattacgataagctatttttattgatttacccaaacgcctttaaaaagactt 43405071  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataat 201  Q
    || |||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  43405070 ataggagtagataagccaacataagcttaaaataagtcaattcaaacggggccttaat 43405013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 105 - 189
Target Start/End: Original strand, 27691433 - 27691517
Alignment:
Q  105 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||    
T  27691433 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaagatttatgggagtagataagcccatataaattcaaaataaaccaattcaaa 27691517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 15655458 - 15655610
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | |  ||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||||||||| |||    
T  15655458 taagctcaaaatttgagcttattaaaatttggtataagcagtttataaaattgtggtaagctatttttattgatttatccaaatagttttaaaaagactt 15655557  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||  |||||| |||| || ||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  15655558 atgttagtagacaagctcacataagtttagaataagccaatccaaacgcggcc 15655610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 44 - 199
Target Start/End: Original strand, 30075277 - 30075429
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||   | | ||| |||||    
T  30075277 taagctcaaaattatggcttattaaaatatggtataagcggtttatgaaa-tata-taagctatttttatt-atttacccaaacgtatctgaaagggctt 30075373  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    |||  ||||||||| | || ||||| | |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30075374 atgttagtagataaactcacataagcttaaaataagtcaatccaaacggggccata 30075429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 198
Target Start/End: Original strand, 36849590 - 36849737
Alignment:
Q  51 aaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggag 150  Q
    |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | | |||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||  | ||||  ||    
T  36849590 aaaatttgagcttattaaaatatgacataaacagtttatgaaattgtgataagctgattttattgatttatccaaacacctttaaaaaaacatatgttag 36849689  T
Q  151 tagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccat 198  Q
    |||| || |||| ||||| |   |||||| ||||||||||||||||||    
T  36849690 tagacaaacccacataagcttcgaataagtcaatccaaacggggccat 36849737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 60 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 20163953 - 20163824
Alignment:
Q  60 gcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 159  Q
    |||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| ||| |||||||| | || | ||||| |||||   ||| ||||||    
T  20163953 gcttgttaaaatatgctataagcagcttatgaaactgtgataagctattttaattaattcacccaaacgcattcacaaaggattatgttggtaaataagc 20163854  T
Q  160 ccatataagttcaaaataagccaatccaaa 189  Q
     ||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  20163853 tcatataagcccaaaataagtcaatccaaa 20163824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 63)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 194
Target Start/End: Original strand, 1756767 - 1756958
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1756767 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 1756866  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1756867 tctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 1756958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 19913631 - 19913828
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  19913631 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 19913730  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccat 198  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19913731 aagctgttttaatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccat 19913828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 3e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 23776463 - 23776655
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23776463 aggttacataaattcataagatccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 23776562  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23776563 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 23776655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 50055102 - 50055297
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  50055102 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccatgat 50055201  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50055202 aagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50055297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 54189737 - 54189542
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54189737 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 54189638  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  54189637 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgttagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 54189542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 38055348 - 38055151
Alignment:
Q  2 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38055348 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagagtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgata 38055249  T
Q  102 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38055248 aaatatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccata 38055151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Original strand, 11639581 - 11639773
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11639581 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 11639680  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11639681 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 11639773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27488649 - 27488844
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27488649 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 27488748  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  27488749 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccagataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 27488844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 50353993 - 50353798
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  50353993 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaaattaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatcat 50353894  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50353893 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacagaagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50353798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 53717465 - 53717660
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  53717465 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatagggcataagcagcttatgaaactatgat 53717564  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  53717565 aagctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgggagtagataaactcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 53717660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 20877239 - 20877047
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20877239 aggaggttacgtaaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 20877140  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20877139 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 20877047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 28032713 - 28032908
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28032713 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgatactatgat 28032812  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |||| |||||    
T  28032813 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatctaaacagggcc 28032908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 23704212 - 23704405
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23704212 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgataa 23704311  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  23704312 actatttttatttatttacccaaacacctttcaaaaggcttatgtgagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacagggcc 23704405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 31969873 - 31969673
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  31969873 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgat 31969774  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||| ||||||    
T  31969773 aaactatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataaatcaattcaaacgggaccataa 31969674  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  31969673 t 31969673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Original strand, 35490778 - 35490966
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35490778 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgataagc 35490877  T
Q  105 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35490878 tatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatgagagtggataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggg 35490966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 2481409 - 2481604
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2481409 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 2481508  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2481509 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 2481604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 6611361 - 6611556
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||    
T  6611361 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatgacataaacagcttatgaaactatgat 6611460  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  6611461 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagtccacataagctcaaaataaaccaatccaaacggggcc 6611556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 14987984 - 14987789
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  14987984 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagcaagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 14987885  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14987884 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaatggcttatgggagtatataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 14987789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 15241029 - 15241224
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15241029 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 15241128  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  15241129 aaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacgaggcc 15241224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 43289961 - 43290152
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43289961 aggaggttacataaattcataagctccttattaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 43290060  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  43290061 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgtgagtagataagcacataaaagctcaaaataagccaatccaaacgg 43290152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 44784918 - 44785113
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  44784918 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaagtttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 44785017  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44785018 aagctatttttatttgtttacccaaacacttttacaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 44785113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 45424535 - 45424730
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  45424535 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 45424634  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  45424635 aaactatttttatttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagccaacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 45424730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 40428721 - 40428915
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  40428721 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttatcaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 40428820  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  40428821 aagctatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggc 40428915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 52139395 - 52139197
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52139395 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 52139296  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52139295 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatagaaatagataaacccacataagttcaaaataagccaatccaaacgggaccata 52139197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 54412820 - 54412627
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  54412820 aggaggttacataaattcatatgctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttagacttattagaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 54412721  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54412720 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 54412627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16700973 - 16700782
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16700973 aggaggttacataaatttataagctccttgttaagctagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 16700874  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16700873 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 16700782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 48910038 - 48909843
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  48910038 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggtttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 48909939  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  48909938 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgggagtagataaacccacataagctcaaaataagccaatccaaacagggcc 48909843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1617276 - 1617084
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  1617276 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgat 1617177  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1617176 aagttatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgagaatagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 1617084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 6688628 - 6688817
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||| ||    
T  6688628 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcag------aaactatgat 6688721  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  6688722 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggggcc 6688817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 30423566 - 30423757
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30423566 aggaggttacataaattc-taagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttatgcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 30423664  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  30423665 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggg 30423757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 37464913 - 37464718
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37464913 aggaggttacataaattcataagctctttgttaaaccggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 37464814  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  37464813 aaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagcccacataagctcaaaataagccaattcaaacggggcc 37464718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 47632227 - 47632032
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  47632227 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaagcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgag 47632128  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacc-tttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  47632127 aagctatttttatttatttacccaaacaccttttaaaaaggtttatgagagtagataagtccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggc 47632032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 27536105 - 27536296
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27536105 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 27536204  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27536205 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgggag----taagcccgtataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 27536296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 37968758 - 37968952
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37968758 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 37968857  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||| |||||    
T  37968858 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataaaccaatctaaatggggc 37968952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 8591093 - 8591290
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8591093 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaacatatggcataagcagcttatgaaactatgat 8591192  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  8591193 aagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatagaagtagataaacccacataaactcaaaataagccaagtcaaacgggaccat 8591290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 8932179 - 8932384
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  8932179 aggaggttacataaattcataagttccttgttaagctgaagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactacgtt 8932278  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8932279 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttaa 8932378  T
Q  201 tatgat 206  Q
    | ||||    
T  8932379 tttgat 8932384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 53353255 - 53353052
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttat----taaaatatggcataagcagcttatgaaacta 96  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53353255 aggaggttacataaatccataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttatatattaaaatatggcataagcagcttatgaaacta 53353156  T
Q  97 taataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccata----taagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  53353155 tgataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacatatgggagtagataagcccatataattaagctcaaaataagccaatccaaacgg 53353056  T
Q  193 ggcc 196  Q
    ||||    
T  53353055 ggcc 53353052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 19164974 - 19165164
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19164974 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaa-tatggcataagcagcttatgaaactatgat 19165071  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacaccttt-aaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19165072 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 19165164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 15669375 - 15669180
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  15669375 aggaggttacataaattcataagctctttgttaagccggacggtaagctgaaaatttaggcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaactatgat 15669276  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15669275 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaagtcttatgtgattagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 15669180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 53875849 - 53875658
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  53875849 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttataaaactatgat 53875750  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  53875749 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtatataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgg 53875658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 44379188 - 44379383
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||    
T  44379188 aggaggttgcataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcaacttatgaaactatgat 44379287  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||||||||| |||||    
T  44379288 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggtttatggaagtagataagcctatataaactcaaaataagtcaatccaaacagggcc 44379383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 33704033 - 33703837
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  33704033 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaggataagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 33703934  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||| |||||||||| ||||  ||||| |||||    
T  33703933 aagttgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataaactcacataagctcaaaataagtcaattaaaacgaggcca 33703837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 3 - 189
Target Start/End: Original strand, 40680041 - 40680227
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40680041 gaggttacataaattcataagcttcttgttaagccgaagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 40680140  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||    
T  40680141 gctatttttatttatttatccaaatacctttaaaaagacttatggaagtagataagctcacataaattcaaaataagtcaatccaaa 40680227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 189
Target Start/End: Original strand, 27583633 - 27583821
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  27583633 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctaaaaatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgcaactatgat 27583732  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaa 189  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||    
T  27583733 aagttatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaagcttatgggagtagataagcctacataagctcaaaataagtcaatccaaa 27583821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 30171772 - 30171581
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  30171772 aggaggttaaataaattcataagctccttgttaaaccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 30171673  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30171672 aagctattttcatttatttatccaaacacctttaaaaaagcttatggaataagataagctcacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 30171581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 28360602 - 28360433
Alignment:
Q  22 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaata-tggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttattta 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  28360602 agctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttataaaaataatggcataagcagcttataaaactatgataaactatttttatttattta 28360503  T
Q  121 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  28360502 cccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagaaaagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaac 28360433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 44376037 - 44375844
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||    
T  44376037 aggaggttacataaattcataagctcttttttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagtttatgaaactatgat 44375938  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |  ||| ||| |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  44375937 aaactatttttatttatttacccgaacacctataaaaatggctattggaatagataagcccacataagcttaaaataagccaatccaaacgggg 44375844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 128; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 55344826 - 55345021
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || || ||| || ||| ||    
T  55344826 aggaggttacataaattcataagctccttgttaaaccggatggtaagctgaaaattttggcttattaaaatatggtataaacaactcatgcaaatatgat 55344925  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||| |||| |||||||||||    
T  55344926 aagctatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgagagtagataaacccacataagctcaaaataagtcaattcaaacggggcc 55345021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 50053592 - 50053440
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  50053592 taagatgaaaatttagacttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagctatttttatttatttgcccaaacacatttaaaaaggctt 50053493  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  50053492 atgggagtagataagtccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 50053440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Original strand, 38071327 - 38071504
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  38071327 aggttacataaattcataagctccttgttaagcccc---gtaaactgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 38071423  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaat 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||    
T  38071424 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggattatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaat 38071504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 16704009 - 16703856
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagc 104  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  16704009 ggttacataaatttataggctccttgttaagccggaggataaactgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaac 16703910  T
Q  105 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataag 158  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  16703909 tatttttatttatttattcaaacaactttaaaaaagcttatggaagtagataag 16703856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 116
Target Start/End: Original strand, 23269047 - 23269162
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  23269047 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatagcataagcagcttatgaaactatgat 23269146  T
Q  101 aagctatttttattta 116  Q
    ||||||||||||||||    
T  23269147 aagctatttttattta 23269162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 108 - 193
Target Start/End: Original strand, 23265865 - 23265950
Alignment:
Q  108 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23265865 ttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatccgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 23265950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 44548185 - 44548338
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||| | | ||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44548185 taagcttaaaatttgggcttaataaaatagggcataaacaacttataaaattgtgataagatgtttttattgatttatccaaacacctttaaaaaggctt 44548284  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataa-gccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||  |||||||||||||| ||||| || |||||| |||||| |||||||||||    
T  44548285 atgttagtagataagcccacataagctccaaataaggccaattcaaacggggcc 44548338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 53408212 - 53408137
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccgg-agggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgg 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53408212 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagggtaagctgaaaatttaggcttaataaaatatgg 53408137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 17493482 - 17493340
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||    
T  17493482 taagctcaaaatttgagcttattaaaacatggtataagcagcttataaaattagaataagatatttttattgatttactcaaacgcccttaaaaatgctt 17493383  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatcc 186  Q
    || |||||||||| |  ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17493382 ataggagtagatatgttcatataaattcaaaataagtcaatcc 17493340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 127
Target Start/End: Original strand, 51780763 - 51780845
Alignment:
Q  45 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaac 127  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  51780763 aagcttaaaatttgggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaattatgataagctatttttattgatttatccaaac 51780845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 51
Target Start/End: Original strand, 23261887 - 23261937
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23261887 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctga 23261937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Original strand, 9595903 - 9595982
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatga 91  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9595903 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggag-----------agtttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatga 9595982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 48748250 - 48748197
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaa 54  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  48748250 aggagattacataaattcataagctccttattaagacggagggtatgctgaaaa 48748197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 37
Target Start/End: Complemental strand, 50055337 - 50055301
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 37  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50055337 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagcc 50055301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 106
Target Start/End: Original strand, 55344724 - 55344781
Alignment:
Q  49 tgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagcta 106  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||| ||| ||||||||    
T  55344724 tgaaaattttggcttattaaaatatggcataaacaactcatgaaaatatgataagcta 55344781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 196
Target Start/End: Original strand, 9595975 - 9596030
Alignment:
Q  140 gcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9595975 gcttatgagagtagataagcccacataaactcaaa-taagccaatccaaacggggcc 9596030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 36897 - 36702
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  36897 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 36798  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36797 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 36702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 48)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 1168695 - 1168500
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1168695 aggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 1168596  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1168595 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 1168500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 1940760 - 1940955
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||    
T  1940760 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataaacaacttatgaaactatgat 1940859  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1940860 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 1940955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25897566 - 25897371
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25897566 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 25897467  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  25897466 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagatatgcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 25897371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33510676 - 33510481
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33510676 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 33510577  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33510576 aaactatttttatttatttatccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 33510481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 39260359 - 39260554
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  39260359 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 39260458  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39260459 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 39260554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 26663450 - 26663257
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26663450 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataaacagcttatgaaactatgat 26663351  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26663350 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 26663257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 29078708 - 29078519
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29078708 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 29078609  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29078608 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaac 29078519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20089663 - 20089463
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  20089663 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 20089564  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20089563 aagctatttttatttatttacctaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggccttaa 20089464  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  20089463 t 20089463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 16052288 - 16052093
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16052288 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaattcaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 16052189  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  16052188 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatggaagtagataagcccacataaactcaaaataagccaatccaaacggggcc 16052093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 26580283 - 26580478
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26580283 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 26580382  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26580383 aagctatttttatttacttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggaatagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 26580478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 52753160 - 52753355
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  52753160 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgat 52753259  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52753260 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaatgcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52753355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 38829260 - 38829072
Alignment:
Q  2 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataata 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  38829260 ggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcacaagcagcttatgaaactatgata 38829161  T
Q  102 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaac 190  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||    
T  38829160 agctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagccgacataagctcaaaataagccaatccaaac 38829072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Original strand, 41928511 - 41928703
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  41928511 aggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttgttaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataaa 41928610  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41928611 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagtccacataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 41928703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 46761158 - 46760966
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  46761158 aggaagttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagtttatgaaactatgat 46761059  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46761058 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcaagtagataagctcatataagttcaaaataagtcaatccaaacggg 46760966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52696983 - 52696788
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  52696983 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 52696884  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52696883 aagctgtttttgtttatttacccaaacaccttcaaaaaggcttatgcgagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 52696788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 42370808 - 42371009
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||    
T  42370808 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacacaagcagcttatgaaactatgat 42370907  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  42370908 aagttttttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagctcacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggccaaaa 42371007  T
Q  201 ta 202  Q
    ||    
T  42371008 ta 42371009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 29288339 - 29288146
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  29288339 aggaggttacata--ttcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 29288242  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29288241 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 29288146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 970537 - 970735
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactata-- 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  970537 aggagattacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggtttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatatg 970636  T
Q  99 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  970637 ataatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcca 970735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 1170457 - 1170652
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  1170457 aggaggttacataaattcataaactccttgttaagccggatggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 1170556  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1170557 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatggaagtagataagcccacaaaagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 1170652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43905846 - 43905655
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43905846 aggaggttacgtaaattcataagctccttcttaagccggagggtaaactaaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 43905747  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43905746 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagcccaaataagctcaaaataagccaatccaaacgg 43905655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 8079722 - 8079914
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  8079722 aggagattacataaattcataaactccttgttaagccagagggtaagctgaaaacttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgat 8079821  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8079822 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacggg 8079914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 40092680 - 40092488
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  40092680 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagataagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataag 40092581  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||    
T  40092580 atatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagctcatataagctcaaaataagtcaatccaaacagggcc 40092488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32671767 - 32671576
Alignment:
Q  5 ggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  32671767 ggttacataaattcataagctccttgttaagccgaagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagtagcttatgaaactatgataagc 32671668  T
Q  105 tatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32671667 tatttttatttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaatccacataagctcaaaataagccaatccaaacggggcc 32671576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 5215577 - 5215384
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  5215577 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaagttaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaacttatgaaactatgat 5215478  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5215477 aagctatttttacttatttacccaaacatctttaaaaaggcttatgaaagtagataagcccacataagctcaaaataagccaatccaaacgggg 5215384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 3 - 196
Target Start/End: Original strand, 13996738 - 13996931
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13996738 gaggttacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaccattataa 13996837  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  13996838 gctatttttatttatttatccaaacatctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacataatttcaaaataagccaatccaaacagggcc 13996931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 12683012 - 12682812
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12683012 aggaggttacataaattcataagcttcttgttaagccggagggtaagctaaagatttaggcttatgaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 12682913  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||    
T  12682912 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataagcccacataaactcaaaataagtcaatccaaacagggccctaa 12682813  T
Q  201 t 201  Q
    |    
T  12682812 t 12682812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19715174 - 19715366
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  19715174 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctaaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaacaatgat 19715273  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  19715274 aagctatttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggcttataggagtagataagctcacataagctcaaaataaaccaatccaaacggg 19715366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 2347849 - 2347653
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaa-tatggcataagcagcttatgaaactataa 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  2347849 aggaggttacataaattcataagctcattgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaaatatgacataagcagcttatgaaactatga 2347750  T
Q  100 taagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| | |||||||||||||||    
T  2347749 taaactatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccgcataaactcaaaataaacaaatccaaacggggcc 2347653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 2473914 - 2473722
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2473914 aggaggtaacataaattcataagctccttgttaagtaggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactataat 2473815  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| || |||||||||||    
T  2473814 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggcgtagataagcccacataagctcaaaataaaccgatccaaacggg 2473722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 17591880 - 17591688
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  17591880 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctggaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 17591781  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  17591780 aagctgtttttatttatttacccaaacacctttgaaaaggcttatgggagtagataag-ccacataagctc--aataagccaatccaaacggggcc 17591688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8121061 - 8120870
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  8121061 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggaaggtaaactgaaaatttaagcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 8120962  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8120961 aaactgtttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgcgagtagataagtccacataagctcaaaataagccaatccaaacgg 8120870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Original strand, 51359230 - 51359425
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  51359230 aggaggttacataaattcataaactccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcaccttatgaaactatgat 51359329  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcca 197  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51359330 aagctatttttaattatttacccaaa-acctttaagaaggcttatggcagtaaataagcccgcataagctcaaaataagccaatccaaacggggcca 51359425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 4 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 15203301 - 15203106
Alignment:
Q  4 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataag 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15203301 aggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggttggctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataaacagcttatgaaactatgataag 15203202  T
Q  104 ctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15203201 ctatttttatttatttaccctaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataaacccacaaaagcttaaaataagtcaattcaaacggggccata 15203106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 15554165 - 15554352
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||           
T  15554165 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagttgaaaatttaggcttattaaaatatggcatcagcagtttatgaaat------ 15554258  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  15554259 --gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagctcaacttaagccaatccaaacggggcc 15554352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46409629 - 46409436
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaa--gccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactata 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  46409629 aggaggtcacataaattcataagctccttgttaattgtcgaagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatg 46409530  T
Q  99 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  46409529 ataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgagattagataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacgg 46409436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 3 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 23498650 - 23498454
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| || |    
T  23498650 gaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgatataagcaacttatgaaactatgatga 23498551  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccata 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  23498550 actatttttatttatttacccaaacaccttgaaaaaggcttgtggaagtagataagcccacataagcttaaaataagccaattcaaacagggccata 23498454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 6 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 49146359 - 49146173
Alignment:
Q  6 gttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagct 105  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49146359 gttacataaattcataagctctttgttaagccggagggtaagatgaaaatttaggcttattgaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataagct 49146260  T
Q  106 atttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||  ||| ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  49146259 atttttatttatttatccaaacacctttaaaaaaacttatgggagtatataaatccacataagctcaaaataaaccaatccaaacgg 49146173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 134; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 7145399 - 7145207
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7145399 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 7145300  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttc-aaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||   || ||||| || |||||||| |||||||||||||    
T  7145299 aaactatttttgtttatttaccc-aacacttttaaaaaggcttatgggagtagataaatacacataagctcaaaaataagtcaatccaaacggg 7145207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 177
Target Start/End: Original strand, 17587518 - 17587694
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  17587518 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagtgtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaaatatgat 17587617  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaata 177  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||| ||||||||    
T  17587618 aagctgtttttatttatttagccaaacacctttaaaaaggcttatgcgaatagataagctcacataagctcaaaata 17587694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 15717976 - 15717787
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |     
T  15717976 aggaggttacataaaatcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaattatggcataagcagcttatgaaactatga- 15717878  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacg 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | |||||| ||| | ||||  |||||||||| |||||||||||    
T  15717877 aagctatttttatttatttactcaaacacctttaaaaaggcttatgaaattagataggccaacataaactcaaaataagtcaatccaaacg 15717787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6765651 - 6765449
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||    
T  6765651 aggagattacataaattcataaactccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagctcatgaaaatatgat 6765552  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataa 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||||   || ||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6765551 aaactatttttatttatttacccaaacacttttaaaaaggcttataaaagtagataaattcacataaactcaaaataagccaatccaaacggggtcttaa 6765452  T
Q  201 tat 203  Q
    |||    
T  6765451 tat 6765449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 40149655 - 40149497
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||    
T  40149655 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagtcggagggtaaactgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttataaaactatgat 40149556  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagc 159  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40149555 aaattatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagc 40149497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 27 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29695842 - 29695673
Alignment:
Q  27 cttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaa 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| |||||    
T  29695842 cttgttaagtcggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgataaattatttttatttatttatccaaa 29695743  T
Q  127 cacctttaaaaaggc-ttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29695742 cacctttaaaaaaaaattatgggagtagataagcccacgtaagctcaaaataagccaatccaaacagggc 29695673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 38172011 - 38171833
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||              |||||||||||||||||||||| ||    
T  38172011 aggaggttacataaattcataagctcattcttaagccggaggataagctgaaaatttaggca-------------cataagcagcttatgaaactatgat 38171925  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgg 192  Q
    || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  || |||| ||||||||||| |||| |||||||    
T  38171924 aaactgtttttatttatttatccaaacacctttaaaaaggtttatgtgagtagataagttcacataaattcaaaataagtcaatgcaaacgg 38171833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 64 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 52086396 - 52086264
Alignment:
Q  64 attaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccat 163  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||     
T  52086396 attaaattatggcataagcagcttatgaaattatgataagttatttttactgatttacccaaacacctttaaaaaggtttatgggagcagataaacccac 52086297  T
Q  164 ataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    ||||| | |||||||| |||||||||| |||||    
T  52086296 ataagcttaaaataagtcaatccaaacagggcc 52086264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 180
Target Start/End: Original strand, 23322897 - 23323032
Alignment:
Q  45 aagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctta 144  Q
    ||||| |||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||| ||||| | |||    
T  23322897 aagcttaaaatttgcgcttattaaagtatgacataagcagcttatgaaattatgataaactatttttattgatttattcaaacgccttaaaaaaagttta 23322996  T
Q  145 tgggagtagataagcccatataagttcaaaataagc 180  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  23322997 tgggagtagataagcctatataagctcaaaataagc 23323032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 196
Target Start/End: Original strand, 5217840 - 5217991
Alignment:
Q  44 taagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggctt 143  Q
    |||||| ||||||  ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||||||    ||| |||  ||||    
T  5217840 taagctcaaaattatggcttataaaaatatggtataagcggcttatgaaattggtataagctattttta-ttatttacccaaatgtatttgaaagagctt 5217938  T
Q  144 atgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||  ||||||||||| |  ||||| | |||||||||||||||||||| ||||    
T  5217939 atgttagtagataagctctcataagcttaaaataagccaatccaaacgaggcc 5217991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5675176 - 5675097
Alignment:
Q  122 ccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggccataat 201  Q
    ||||||| |||| |||| |||||||  |||||||||||  | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5675176 ccaaacatctttcaaaaagcttatgttagtagataagctaacataagcttaaaataagccaatccaaacggggccttaat 5675097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0920 (Bit Score: 169; Significance: 8e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0920
Description:

Target: scaffold0920; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 8e-91
Query Start/End: Original strand, 3 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 3900 - 3708
Alignment:
Q  3 gaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataataa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3900 gaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgataa 3801  T
Q  103 gctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggc 195  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3800 gctatttttatttatttacccaaacacatttaaaaaggcttatgagagtagataagcccacataagttcaaaataaaccaatccaaacggggc 3708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1777 (Bit Score: 164; Significance: 8e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold1777
Description:

Target: scaffold1777; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 19 - 214
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccagagggtaagctgaaaatttaggattattaaaatatggcataagcagcttatgaaactatgat 118  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||    
T  119 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataaactcaacttaagccaatacaaacggggcc 214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0172 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0172
Description:

Target: scaffold0172; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 10430 - 10235
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  10430 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagctggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggtataagcagcttatgaaactatgat 10331  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggggcc 196  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  10330 aaactatttttatttatttacccaaacacctttaagaaggcttatgagagtagataaacccatataagctcaaaataagtcaatccaaacggggcc 10235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 145258 - 145450
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  145258 aggaggttacataaatttataagctccttgttaagccgaagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 145357  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  145358 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaagcttatgggagtagataagtccacataaactcaaaataagtcaatccaaacggg 145450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 146; Significance: 4e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 4e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 194
Target Start/End: Original strand, 308 - 501
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  308 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaagtttaagcttattgaaatatgacataagcagcttatgaaactatgat 407  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagtagataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacgggg 194  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  408 aatctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaagacttatgggagtagataaactcacataaactcaaaataagccaatccaaacgggg 501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Original strand, 19 - 212
Alignment:
Q  1 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattaaaatatggcataagcagcttatgaaactataat 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19 aggaggttacataaattcataagctccttgttaagccggagggtaagctgaaaatttaggcttattgaaa-atggcataagcagcatatgaaactatgat 117  T
Q  101 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttatgggagta---gataagcccatataagttcaaaataagccaatccaaacggg 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  118 aagctatttttatttatttacccaaacacctttaaaaaggcttat-ggagtagatgataagtccacataagctcaaaataagtcaatccaaacggg 212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University