View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11758_low_10 (Length: 684)

Name: NF11758_low_10
Description: NF11758
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11758_low_10
NF11758_low_10
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (18-676)||(10034645-10035300)
chr3 (18-630)||(9841500-9842109)
chr3 (35-676)||(9980125-9980763)
chr3 (21-676)||(10263346-10263998)
chr3 (28-630)||(10520137-10520736)
chr3 (18-676)||(10129564-10130212)
chr3 (38-572)||(10430914-10431448)
chr3 (32-587)||(10360658-10361214)
chr3 (35-384)||(9852398-9852747)
chr3 (35-429)||(10583172-10583566)
chr3 (40-573)||(11778855-11779387)
chr3 (40-573)||(11771898-11772430)
chr3 (33-317)||(10372970-10373254)
chr3 (329-622)||(10583535-10583829)
chr3 (329-630)||(9852830-9853128)
chr3 (164-585)||(10531569-10531989)
chr3 (21-300)||(10666111-10666390)
chr3 (34-378)||(10503240-10503584)
chr3 (164-583)||(10680367-10680785)
chr3 (344-583)||(10666503-10666742)
chr3 (36-393)||(10091457-10091805)
chr3 (36-393)||(10198339-10198687)
chr3 (382-587)||(10372768-10372974)
chr3 (163-555)||(10192883-10193274)
chr3 (163-555)||(10085963-10086354)
chr3 (371-583)||(10503646-10503857)
chr3 (610-676)||(10430720-10430786)
chr3 (329-527)||(10091948-10092146)
chr3 (329-527)||(10198830-10199028)
chr3 (140-309)||(13852579-13852755)
chr3 (33-84)||(13852822-13852873)
chr3 (34-135)||(10531319-10531420)
chr3 (44-84)||(10680127-10680167)
chr3 (175-299)||(13163782-13163906)
chr3 (245-304)||(10892187-10892246)
chr3 (175-293)||(12131049-12131167)
chr3 (175-304)||(13173830-13173959)
chr3 (245-304)||(11128158-11128217)
chr3 (467-518)||(11242500-11242551)
chr3 (174-304)||(8864096-8864226)
chr3 (174-304)||(11145980-11146110)
chr3 (247-304)||(11157149-11157206)
chr3 (491-537)||(8585532-8585578)
chr3 (28-65)||(10085907-10085944)
chr3 (28-65)||(10192827-10192864)
chr3 (344-416)||(10091894-10091966)
chr3 (344-416)||(10198776-10198848)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (35-676)||(54374-55012)
[»] chr2 (1 HSPs)
chr2 (33-553)||(26909545-26910065)
[»] chr4 (1 HSPs)
chr4 (33-530)||(17849838-17850338)
[»] chr8 (3 HSPs)
chr8 (32-386)||(11487685-11488039)
chr8 (173-513)||(44954592-44954932)
chr8 (38-80)||(44955024-44955066)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (175-299)||(143082-143206)
scaffold0002 (175-304)||(133029-133158)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 421; Significance: 0; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 421; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 676
Target Start/End: Original strand, 10034645 - 10035300
Alignment:
Q  18 gaatctaagatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggtt 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||   ||  | ||     
T  10034645 gaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattacgatttcatcccaaagaacaaagccatctgta 10034744  T
Q  118 acggaatggggtctccaatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctaccca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    ||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10034745 acggaatggggtctccaatatttgacagcactttccaacttgagtattgaaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctaccca 10034844  T
Q  218 tctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctatttttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||     
T  10034845 tctcccttgtgtatctatatatcagggatttcgatgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaaactctctgtttttg 10034944  T
Q  318 gggttgtccacagcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaa 417  Q
    |  |||||  || |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | | ||||| |||  ||||||||||||||||||    
T  10034945 gaattgtcatcaacttgagacattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatcacttagattgtgggattgtaaaaagcttgagtcattaccagaa 10035044  T
Q  418 gacagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcaca 517  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||  ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10035045 gacagcctcactgactctcttagggaactctgcatttggaattgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcaca 10035144  T
Q  518 tccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaaactgccaataa 617  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  10035145 tccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaa---gccaataa 10035241  T
Q  618 tcaatcatctgtacgacacacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctatgct 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10035242 tcaatcatctgtacgacacacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctctgct 10035300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 375; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 630
Target Start/End: Original strand, 9841500 - 9842109
Alignment:
Q  18 gaatctaagatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggtt 117  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9841500 gaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattgctatttctacccaaaaaacagcaccgccggtt 9841599  T
Q  118 acggaatggggtctccaatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctaccca 217  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| || ||||| |  ||| | ||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9841600 acggaatggggtcaccaatatttgacggcactttcctacttgcgaattgataagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcgttgctaccca 9841699  T
Q  218 tctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctatttttt 317  Q
    |||||||||||| |||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||     
T  9841700 tctcccttgtgtctctaaatatcagggatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaatatctcgatttttc 9841799  T
Q  318 gggttgtccacagcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaa 417  Q
    |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||| ||  | |||||||  ||||||||||||||||||    
T  9841800 gttttgtccacagcttgagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatcacttatattgtttcaatgtgaaaagcttgagtcattaccagaa 9841899  T
Q  418 gacagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcaca 517  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || | |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9841900 gacagcctccctgactctcttgagcgtctgaacatttggggatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattgctccaaaattgctcaca 9841999  T
Q  518 tccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaaactgccaataa 617  Q
    ||||| |||||   ||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  9842000 tccctgtcatatggataaaccaccaagtcagaatatgatagacaagttgtgttcccgtttcaggtatgttccacagttcctaccagaaa---gccaataa 9842096  T
Q  618 tcaatcatctgta 630  Q
    |||||| ||||||    
T  9842097 tcaatcctctgta 9842109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 676
Target Start/End: Original strand, 9980125 - 9980763
Alignment:
Q  35 agttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcca 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9980125 agttgtcattttctgaaggagtttgtctacctctcaaattacaatcaattgtgatttctaccaaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcca 9980224  T
Q  135 atatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatcta 234  Q
    |||||||||||| ||||     ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  9980225 atatttgacagcacttttcgacttgagaattgtaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgcatcta 9980324  T
Q  235 tatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttg 334  Q
      ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||| ||| ||||    
T  9980325 cgtatctgtgatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggctgcgacacctctcctctctccaaagtctctgttttttgttttgtcaacaacttg 9980424  T
Q  335 ggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactc 434  Q
     | ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||  |||||   ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9980425 agacattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatcacttgaattttatgattgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgaatc 9980524  T
Q  435 tcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatata 534  Q
    |||| |||||||   |||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  9980525 tcttaaggaactgtacatcgatggttgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatatcaata 9980624  T
Q  535 aatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaaactgccaataatcaatcatctgtacgac 634  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  9980625 aattacaaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaa---gccaataatcaatcatctgtacgac 9980721  T
Q  635 acacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctatgct 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9980722 acacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctctgct 9980763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 363; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 21 - 676
Target Start/End: Original strand, 10263346 - 10263998
Alignment:
Q  21 tctaagatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacg 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10263346 tctaacatgtgcagagttgtcattttctgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattgagatttctacccaaaaaacaacaccgccggttacg 10263445  T
Q  121 gaatggggtctccaatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||   |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10263446 gaatggggtctccaatatttgacagcactttcctacttgactattcaaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatct 10263545  T
Q  221 cccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttggg 320  Q
    ||||| ||||||||  | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||||       
T  10263546 cccttttgtatctacgtgtctttgatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcaacacctctcctctctccaatatctctgttttttctt 10263645  T
Q  321 ttgtccacagcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagattt-ttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaaga 419  Q
    |||||  || |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||  |||  ||| || ||||||  || |||||||||||||||||    
T  10263646 ttgtcatcaacttgagacattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatcacttctattgcttggat-gtgaaaagctagagtcattaccagaaga 10263744  T
Q  420 cagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatc 519  Q
    ||||||||||  ||||||| |   |||| | ||   |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10263745 cagcctcccttcctctcttaaactactcgctatcgagttttgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattagtccaaaattgctcacatc 10263844  T
Q  520 cctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaaactgccaataatc 619  Q
    |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  10263845 cctttcataagaataaatgatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaa---gccaataatc 10263941  T
Q  620 aatcatctgtacgacacacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctatgct 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10263942 aatcatctgtacgacacacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctctgct 10263998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 630
Target Start/End: Original strand, 10520137 - 10520736
Alignment:
Q  28 tgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggg 127  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10520137 tgtgtagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattgcaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggg 10520236  T
Q  128 gtctccaatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgt 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||    ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10520237 gtctccaatatttgacagcactttccgacttgggtattgtaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgt 10520336  T
Q  228 gtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtcca 327  Q
    |  ||||  |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||  ||||| || ||||  |    
T  10520337 gactctaactatcagggatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaaagggcttcgtcacctctcctctctccaacgtctccgtttttgggattgtgaa 10520436  T
Q  328 cagcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagattt-ttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctc 426  Q
    || |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||| |||| ||||| | ||| |||||||  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  10520437 caacttgagacattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattactt-gatttgtggaaatgtgaaaagcttaaatcattaccagaagacagcctc 10520535  T
Q  427 cctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttca 526  Q
    |||||||||||  ||  |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  10520536 cctgactctctgaagagactgctcatttgggaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatcccagtca 10520635  T
Q  527 tagatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaaactgccaataatcaatcatc 626  Q
    ||   |||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||    
T  10520636 tatcaataaattaccaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaa---gccaataatcaatcctc 10520732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 18 - 676
Target Start/End: Original strand, 10129564 - 10130212
Alignment:
Q  18 gaatctaagatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggtt 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     || ||| |||||||||||| ||     
T  10129564 gaatctaaaatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattgagatacagtccaaaagaacagcaccgcctgtg 10129663  T
Q  118 acggaatggggtctccaatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctaccca 217  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10129664 acagaatggggtcttcaagatttgaccgctctttcaagattgagtattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctaccca 10129763  T
Q  218 tctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctatttttt 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||   || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||  ||||     
T  10129764 tctcccttgtgtatctatatatcagggatttcgatgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctcttctctctccaacatctcttcttttg 10129863  T
Q  318 gggttgtccacagcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaa 417  Q
    |  |||||  || |||| | ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||   |||| | |||||||||  || |||||||||||||||    
T  10129864 gaattgtcatcaacttgagacattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatcacttgacttttgggattgtgaaaagctagagtcattaccagaa 10129963  T
Q  418 gacagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcaca 517  Q
    |||||||||||||| ||||||  | ||||   ||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10129964 gacagcctccctgattctcttatgcaactgtgcattcaaggatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattgctccaaaattgctcaca 10130063  T
Q  518 tccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaaactgccaataa 617  Q
    ||||||||| | |||| |      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||   ||||||||    
T  10130064 tccctttcaaaaatatca------aaggcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgctcc-tagttcctaccagaaa---gccaataa 10130153  T
Q  618 tcaatcatctgtacgacacacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctatgct 676  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10130154 tcaatcctctgtacgacacacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctctgct 10130212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 312; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 38 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 10431448 - 10430914
Alignment:
Q  38 tgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctccaata 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||  | | || || | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10431448 tgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaatttggttttcatctcgaagaataactccgccggttacggaatggggtctccaata 10431349  T
Q  138 tttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatat 237  Q
    ||||||||| ||||| | ||||   |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10431348 tttgacagcactttccttattgacaattcaaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatat 10431249  T
Q  238 atcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttgggt 337  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| |  ||||   || |||| |     
T  10431248 atcactgatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggctgcgacacctctcctctctccaaactctctgtttttggttttgtgatcaacttgaga 10431149  T
Q  338 cattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttg-aattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctc 436  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||| || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10431148 cattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatcactt-gatttgtggaaatgtgaaaagcttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctc 10431050  T
Q  437 ttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaa 536  Q
    || || |||| |  ||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10431049 ttaagcaactgagaattagggaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatagatataaa 10430950  T
Q  537 tcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcc 572  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10430949 tgatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcc 10430914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 32 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 10361214 - 10360658
Alignment:
Q  32 cagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtct 131  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     || ||| |||||||| ||| || || |||||||||||    
T  10361214 cagagttgtcgttttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattatgatacagtccaaaagaacagcactgcctgtgacagaatggggtct 10361115  T
Q  132 ccaatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtat 231  Q
    ||||||||||||||| |||||    ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |    
T  10361114 ccaatatttgacagcactttccaacttgggtattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccgtctcccttgtgtct 10361015  T
Q  232 ctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctc-tattttttgggttgtccacag 330  Q
    ||  | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |  |||| ||||    
T  10361014 ctggaaatccatcatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaacatctcgtatttttt-gaatgtcgacag 10360916  T
Q  331 cttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctg 430  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||    ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  10360915 cttgagtcattaccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatcacttacattttatggttgtgaaaagcttaaatcattaccagaagacagcctccctg 10360816  T
Q  431 actctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcataga 530  Q
    |||||||| |||||||   ||| |   | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  10360815 actctcttaaggaactggacatctatgattgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattgctccaaaattgctcacatccccgtcataaa 10360716  T
Q  531 tataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttccc-atttcaggtatgtt 587  Q
     |||||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  10360715 aataaacgaccaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccgttttcaggtatgtt 10360658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 35 - 384
Target Start/End: Original strand, 9852398 - 9852747
Alignment:
Q  35 agttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcca 134  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9852398 agttgtcattttctgaaggagtttgtctacctcccaaattaagaacaattgtgatttctaccaaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcca 9852497  T
Q  135 atatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatcta 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  9852498 atatttgacagctctttcatcattgtggattgtaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgtctcta 9852597  T
Q  235 tatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttg 334  Q
     ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  9852598 aatatcatggttctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctcttctctctccaatatctctattttgcgggttgtcaacagcttg 9852697  T
Q  335 ggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagattt 384  Q
    |||||||| ||||||||||| |||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  9852698 ggtcattgccagaaaactgcttcccttcctcactgaaatcacttaaattt 9852747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 35 - 429
Target Start/End: Original strand, 10583172 - 10583566
Alignment:
Q  35 agttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcca 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10583172 agttgtcattttctgaaggagtttgtctacctctcaaattacgatcaattgtgatttttacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcaa 10583271  T
Q  135 atatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatcta 234  Q
    | || | ||||||||||||   | | | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10583272 agatctaacagctctttcaagctggagtattggaaaggatgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatcta 10583371  T
Q  235 tatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttg 334  Q
    ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||| ||||||   |||||  || ||||    
T  10583372 tatatctggaatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggctgcgacacctctcctctctccaatatctctgttttttcatttgtcatcaacttg 10583471  T
Q  335 ggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccct 429  Q
     | ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||  |||| || |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10583472 agacattgccagaaaactgcctcccttcctcactgaaatcactttcatttatggattgtgaaaagcttgggtcattaccagaagacagcctccct 10583566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 40 - 573
Target Start/End: Complemental strand, 11779387 - 11778855
Alignment:
Q  40 tcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctccaatatt 139  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || || | |||||| |||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |      
T  11779387 tcattttgtgaaagagtttgtctacctcccaaattacaatcaattgtgagtttttcccaaataacaacaccaccagttacagaatggggtctccaaaacc 11779288  T
Q  140 tgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatat 239  Q
      ||  ||||||||  | ||   |||||||| | |||| ||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| | || | |||    
T  11779287 aaaccactctttcagaactggttattggaaatgatgataatatagtcaccaccttgatgaaggatttgttgctacctatctcccttgtggacctgtctat 11779188  T
Q  240 caattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttgggtca 339  Q
    || | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| |||||| | ||||    
T  11779187 cattgatctctatgaaatgaagtccttcgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaatatctctatttttggaattgtcaacagctcgagtca 11779088  T
Q  340 ttggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttg 439  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||||  ||||   |  |||||    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  11779087 ttgccagaaaactgcctcccttcctcgttgaaatcactttcatttcaaatgtgtgaggagcttgagtcattaccggaagacagcctccccgactctctta 11778988  T
Q  440 aggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaatca 539  Q
    || |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  11778987 agcaactgaccatttggggatgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaagaacattggtccaaaatcgctcacatccctgtcatagaaataaatga 11778888  T
Q  540 tgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttccc 573  Q
      |||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  11778887 aaaagtcacaatatgaga-acaagctgtgttccc 11778855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 40 - 573
Target Start/End: Original strand, 11771898 - 11772430
Alignment:
Q  40 tcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctccaatatt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  || || | |||||| |||| |||| || ||||| ||||||||||||||| |      
T  11771898 tcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaacttacaatcaattgtgagtttttcccaaataacaacaccaccagttacagaatggggtctccaaaacc 11771997  T
Q  140 tgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatat 239  Q
      ||  |||||||   ||||   |||||||| | |||| ||||||| | |||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||| | || | |||    
T  11771998 aaaccactctttcgaaattggttattggaaatgatgataatatagtcaccaccttgatgaaagagttgttgctgcctatctcccttgtggacctgtctat 11772097  T
Q  240 caattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttgggtca 339  Q
    || | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |  ||||| |||||| | ||||    
T  11772098 cattgatctctatgaaatgaagtcttttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaatatctctatttttggaattgtcaacagctcgagtca 11772197  T
Q  340 ttggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttg 439  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||  | |||||||||  ||||   |  |||||    |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  11772198 ttgccagaaaactgcctcccttcctcgttgaaatcactttcatttcaaatgtgtgaggagcttgagtcattaccggaagacagcctccccgactctctta 11772297  T
Q  440 aggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaatca 539  Q
    || |||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |    
T  11772298 agcaactgaccatttggggatgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaagaacattggtccaaaatcgctcacatccctgtcatagatataaatga 11772397  T
Q  540 tgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttccc 573  Q
      |||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  11772398 aaaagtcacaatatgaga-acaagctgtgttccc 11772430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 33 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10373254 - 10372970
Alignment:
Q  33 agagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctc 132  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  | | || || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10373254 agagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctctcaaattacaatcaatttggatttcatctcgaagaataacaccgccggttacggaatggggtctc 10373155  T
Q  133 caatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatc 232  Q
    ||| || | |||||||| |||   ||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10373154 caagatctaacagctctgtcaagcttgagtattagaaaggatgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgcatc 10373055  T
Q  233 tatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctatttttt 317  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10373054 tacgtatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcaaaaatctctatttttt 10372970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 329 - 622
Target Start/End: Original strand, 10583535 - 10583829
Alignment:
Q  329 agcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccc 428  Q
    |||||||||||||  ||||| || ||||||| ||||| || |||||||||  |||| ||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10583535 agcttgggtcattaccagaagacagcctcccttcctcgctgaaatcacttcaatttgtgggttgtgtaagactcgagtcattaccagaagacagcctccc 10583634  T
Q  429 tgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcata 528  Q
    |||||||||||||  ||| |||||       || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10583635 tgactctcttgagcgactgaccatccaattttgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaatgaatattggtccaaaattgctcacatccctgtcata 10583734  T
Q  529 gatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttccc-atttcaggtatgttccacagttcctaccagaaaactgccaataatcaat 622  Q
     | ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10583735 caaataaatcacaaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccgttttcaggtatgttccacatttcctaccagaaaactgccaataatcaat 10583829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 329 - 630
Target Start/End: Original strand, 9852830 - 9853128
Alignment:
Q  329 agcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccc 428  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||| || || || |||||||||  ||| | ||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9852830 agcttgagtcattaccagaaaactgcctcccatcatcgctgaaatcacttgaattgtggaaatgtgaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccc 9852929  T
Q  429 tgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcata 528  Q
    |||||| ||  ||  |||   |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9852930 tgactcactgaagagactggacatttatggatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcata 9853029  T
Q  529 gatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaaactgccaataatcaatcatctg 628  Q
    || |||||| |  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| ||||    
T  9853030 gaaataaatgaccaggttacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaa---gccaataatcaatcctctg 9853126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 142; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 164 - 585
Target Start/End: Original strand, 10531569 - 10531989
Alignment:
Q  164 ttggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtc 263  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||   | ||||||||||||| |||||    
T  10531569 ttggaacggttgatgatatagttaacaccgtgctgaacgagtcattgcttcccatctcccttgtgtctctatctattggtcatctctctgaaataaagtc 10531668  T
Q  264 ctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcc 363  Q
     ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| |   |||     |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  10531669 atttgaaggaaatggacttcgacacctctcctctctcaaaaatcttcactttcttaattgcttggagcttgagtcattgccagaaaattgcctcccttcc 10531768  T
Q  364 tccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtc 463  Q
    || || || ||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |   |||||| ||   |   || |    
T  10531769 tcgctgaagtcacttcaattttcgagttgtgtaagacttgagtcattaccagaagacagcctcccttcctctcttaaactactcactatcgagttttgcc 10531868  T
Q  464 cattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaag 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||  |  |||| ||||||||| |||||||    
T  10531869 cattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaaaattggtccaaaatttctcacatccctgtcataataataaacaagcaagttacaatatga-agacaag 10531967  T
Q  564 ttgtgttcccatttcaggtatg 585  Q
    |||||||||| |||||||||||    
T  10531968 ttgtgttcccgtttcaggtatg 10531989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 300
Target Start/End: Original strand, 10666111 - 10666390
Alignment:
Q  21 tctaagatgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacg 120  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||  | |||| || | | ||||||||||||    
T  10666111 tctaagatgtgcacagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaaacaattgtgatttcatctcaaagaataactccgccggttacg 10666210  T
Q  121 gaatggggtctccaatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatct 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10666211 gaatggggtctccaatatttgacagcactttcctacttgagtattgaaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatat 10666310  T
Q  221 cccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaa--tgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctc 300  Q
    ||||||||| ||||    |||   | ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10666311 cccttgtgtctctaacgttca--gagctctctgcaatttgaagtcctttaatggaaatgggcttctacacctctcctctctc 10666390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 34 - 378
Target Start/End: Original strand, 10503240 - 10503584
Alignment:
Q  34 gagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcc 133  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||   |||||| |||| || | ||  | | | ||||||||||      
T  10503240 gagttatcattttgtgaaggagtttgtcttcctcccaaattacaatcaattgatatttggtcccaaagaacaacaactcctataatgaaatggggtcttg 10503339  T
Q  134 aatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatct 233  Q
    || || |||| |||||||||  | ||   ||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||    
T  10503340 aagatctgaccgctctttcaagactgaaaattggagcaggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcgttgcttcccatctcccttgcatctct 10503439  T
Q  234 atatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagctt 333  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||  | ||| |   ||||| |||||||    
T  10503440 atatatcagtgatctctatgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacaaatctcctctctcgaaaatcttgaatttcttaattgtctacagctt 10503539  T
Q  334 gggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcactt 378  Q
    | ||||||| |||||||||||||||| ||||| || |||| ||||    
T  10503540 gagtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaattactt 10503584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 164 - 583
Target Start/End: Original strand, 10680367 - 10680785
Alignment:
Q  164 ttggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtc 263  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| |||   | ||||||||||||| |||||    
T  10680367 ttggaacggttgatgatatagttaacaccgtgctgaacgagtcattgcttcccatctcccttgtgtctctatctattggtcatctctctgaaataaagtc 10680466  T
Q  264 ctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcc 363  Q
      |||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  | ||| |   |||  |  |||||| ||||||  ||||||| |||||||| |||    
T  10680467 acttgaaggaaatggacttcgacacctctcctctctcaaaaatcttaactttcttaattgctcggagcttgagtcatttccagaaaattgcctcccttcc 10680566  T
Q  364 tccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtc 463  Q
    || || |||||||||  |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |   |||||| ||   |   || |    
T  10680567 tcgctgaaatcacttcaatttttgagttgtgtaagacttgagttgttaccagaagacagcctcccttcctctcttaaactactcactatcaagttttgcc 10680666  T
Q  464 cattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaag 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   |||||  |  ||||||||||||||  | ||||    
T  10680667 cattgttagaagaaaggtataaaaggaatgaacatcggtccaaaatttctcacatccctgtcataataataaacaagcaagtcacaatatga-ggtcaag 10680765  T
Q  564 ttgtgttcccatttcaggta 583  Q
    ||||||| || |||||||||    
T  10680766 ttgtgtttccgtttcaggta 10680785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 344 - 583
Target Start/End: Original strand, 10666503 - 10666742
Alignment:
Q  344 cagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatt-tttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttgagg 442  Q
    ||||| || ||||||| ||||| || |||||||||  ||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10666503 cagaagacagcctcccttcctcgctgaaatcacttgaattgtttgaat-gtgaaaagcttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttaagg 10666601  T
Q  443 aactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaatcatga 542  Q
    ||||   ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||| |  |    
T  10666602 aactgcacattgaggaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatatcaataaattacaa 10666701  T
Q  543 agtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggta 583  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    
T  10666702 agtcacaatatgatagacgagttgtgttcctgtttcaggta 10666742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 393
Target Start/End: Original strand, 10091457 - 10091805
Alignment:
Q  36 gttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctccaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||   |||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10091457 gttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaaaagattgttattttttccaaaaaaataacaccgccggttacggaatggggtctccaa 10091556  T
Q  136 tatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctat 235  Q
     || | ||  |||||||   ||||  ||||  | |||  | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  10091557 gatctaaccactctttccgaattgatgattaaagaggcaggtgatatagttaacaacttggtgacggagtcgttgctacccatctcccttgtgtctctgg 10091656  T
Q  236 atatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttgg 335  Q
    ||         |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |     |||| |||||||      
T  10091657 at---------ctctataagatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaacgtctcgatttctgtcaatgtcgacagcttca 10091747  T
Q  336 gtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgt 393  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||| || |||||    
T  10091748 gtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaaacacttcgatttgtggattgt 10091805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 36 - 393
Target Start/End: Original strand, 10198339 - 10198687
Alignment:
Q  36 gttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctccaa 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||   |||| | || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10198339 gttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaaaagattgttattttttccaaaaaaataacaccgccggttacggaatggggtctccaa 10198438  T
Q  136 tatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctat 235  Q
     || | ||  |||||||   ||||  ||||  | |||  | |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||      
T  10198439 gatctaaccactctttccgaattgatgattaaagaggcaggtgatatagttaacaacttggtgacggagtcgttgctacccatctcccttgtgtctctgg 10198538  T
Q  236 atatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttgg 335  Q
    ||         |||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| |     |||| |||||||      
T  10198539 at---------ctctataagatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctccaacgtctcgatttctgtcaatgtcgacagcttca 10198629  T
Q  336 gtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgt 393  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||| ||||| ||||| || |||||    
T  10198630 gtcattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaaacacttcgatttgtggattgt 10198687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 382 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 10372974 - 10372768
Alignment:
Q  382 tttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggt 481  Q
    ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||  |||   ||||  |  ||| |||||||||||||||||||    
T  10372974 ttttttaattgtgaaaagcttgagtcattaccagaagacagcctcccttcctctctgaagagactggtcattatgggatgcccattgttagaagaaaggt 10372875  T
Q  482 ataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttccc-atttcag 580  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  10372874 ataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccccgtcataaaaataaacgaccaaatcacaatatgatagacaagttgtgttcccgttttcag 10372775  T
Q  581 gtatgtt 587  Q
    |||||||    
T  10372774 gtatgtt 10372768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 163 - 555
Target Start/End: Original strand, 10192883 - 10193274
Alignment:
Q  163 attggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagt 262  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||||||||||||||||| |||  ||||   | |||||| | | |||||||    
T  10192883 attgaaaaggatggtgatatagttaacaccttggtaaaagagccgttgctacccatctcccttgtgtctctgaatattggtgatctctataacatgaagt 10192982  T
Q  263 cctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  | |||     ||||| ||| |||| | ||||  | ||||| ||| | || ||    
T  10192983 cctttgatggaaatgggcttcaacacctctcctttctcg-aaatcttcactttcgtaattgtcaacaacttgagccatttcctgaaaattgcgttccttc 10193081  T
Q  363 ctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgt 462  Q
    ||| || |||||||||  | ||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||   || | || | | |  | |    
T  10193082 ctcgctgaaatcacttgaaatttggagttgtgaaagacttgaatcattaccggaagactgcctccctgattctctgaagcgtctaagca-tcgtattttt 10193180  T
Q  463 -ccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatga 555  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| | ||||||   ||| |||||||||||    
T  10193181 ccctttgttaaaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaatttctctcattcctgtcataaaaataaatggcgaaatcacaatatga 10193274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 163 - 555
Target Start/End: Original strand, 10085963 - 10086354
Alignment:
Q  163 attggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagt 262  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||| | || ||| |||||||| ||||||||||||||| |||  ||||   | |||||| | | |||||||    
T  10085963 attgaaaaggatggtgatatagttaacaccttggtaaaagagccgttgctaaccatctcccttgtgtctctgaatattggtgatctctataacatgaagt 10086062  T
Q  263 cctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctc 362  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  | |||     ||||| ||| |||| | ||||  | ||||| ||| | || ||    
T  10086063 cctttgatggaaatgggcttcaacacctctcctttctcg-aaatcttcactttcgtaattgtcaacaacttgagccatttcctgaaaattgcgttccttc 10086161  T
Q  363 ctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgt 462  Q
    ||| || |||||||||  | ||| || ||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||  ||   || | || | | |  | |    
T  10086162 ctcgctgaaatcacttgaaatttggagttgtgaaagacttgaatcattaccggaagactgcctccctgattctctgaagcgtctgagca-tcgtattttt 10086260  T
Q  463 -ccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatga 555  Q
     || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||| | ||||||   ||| |||||||||||    
T  10086261 ccctttgttaaaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaatttctctcattcctgtcataaaaataaatggcgaaatcacaatatga 10086354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 371 - 583
Target Start/End: Original strand, 10503646 - 10503857
Alignment:
Q  371 aatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgtt 470  Q
    |||||||||||||||    ||||||||  ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||  ||| | ||||   | ||| |||   ||    
T  10503646 aatcacttagattttatggttgtgaaaagctttactcattaccagaagacagccttcctgattctcttaagctactgatcattcaaagatgcccaacatt 10503745  T
Q  471 agaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgtt 570  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||    ||||||||||||||  |||| | ||||||    
T  10503746 agaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaatttctcacatccctgtcatagaaatagatggacaagtcacaatatga-ggacaggctgtgtt 10503844  T
Q  571 cccatttcaggta 583  Q
    ||| |||||||||    
T  10503845 cccgtttcaggta 10503857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 5e-27
Query Start/End: Original strand, 610 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 10430786 - 10430720
Alignment:
Q  610 gccaataatcaatcatctgtacgacacacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctatgct 676  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10430786 gccaataatcaatcatctgtacgacacacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctctgct 10430720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 329 - 527
Target Start/End: Original strand, 10091948 - 10092146
Alignment:
Q  329 agcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccc 428  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||     ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10091948 agcttgagtcatttccagacaactgcctcccgtcctcgctgaaatcacttagattgagtgattgtaaaatgcttgattcattaccagaagacagcctccc 10092047  T
Q  429 tgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcat 527  Q
    |   ||||||      ||   ||||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10092048 ttcatctcttatcactctgtacattatgggatgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaatttctcacatccctgtcat 10092146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 329 - 527
Target Start/End: Original strand, 10198830 - 10199028
Alignment:
Q  329 agcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccc 428  Q
    |||||| ||||||  |||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||     ||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10198830 agcttgagtcatttccagacaactgcctcccgtcctcgctgaaatcacttagattgagtgattgtaaaatgcttgattcattaccagaagacagcctccc 10198929  T
Q  429 tgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcat 527  Q
    |   ||||||      ||   ||||  |  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10198930 ttcatctcttatcactctgtacattatgggatgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaatttctcacatccctgtcat 10199028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 140 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13852755 - 13852579
Alignment:
Q  140 tgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacac-------cttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatc 232  Q
    |||| ||||||||| |||||   ||||||||| ||||||||||||||| |||       |||||||||||||  |||| |||||||||||||| ||| ||    
T  13852755 tgaccgctctttcaacattgactattggaaagagtgatgatatagttagcacttagcaccttgatgaaggagctgttgatacccatctcccttttgtctc 13852656  T
Q  233 tatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctc 309  Q
    | | ||||     |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  13852655 tgtttatcggcagtctctctgaaatgaagtctttcgatggaaatgggcttcgacatctctcctctctcaacaatctc 13852579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 13852873 - 13852822
Alignment:
Q  33 agagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13852873 agagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcctaaattacaatcaatt 13852822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 135
Target Start/End: Original strand, 10531319 - 10531420
Alignment:
Q  34 gagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcc 133  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||  ||||| | || | ||||| || || |||||||||||||    
T  10531319 gagttgttattttgtgaaggaatttgtctacctcccaaattacaatcaattgtgatatctttccaaagagcaacgccgcctgtaacagaatggggtctcc 10531418  T
Q  134 aa 135  Q
    ||    
T  10531419 aa 10531420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 44 - 84
Target Start/End: Original strand, 10680127 - 10680167
Alignment:
Q  44 tttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaatt 84  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10680127 tttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaatt 10680167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 299
Target Start/End: Original strand, 13163782 - 13163906
Alignment:
Q  175 gatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaa 274  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| || || || ||||||| | | |||||   | |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  13163782 gatgatattgttaacaccttgctgaaggagcggttgctgccaatttcacttgtgtctttgtatatttctaatctctgtgaaataaaatcctttgatggaa 13163881  T
Q  275 atgggcttcgacacctctcctctct 299  Q
    |||| || |||||||| ||||||||    
T  13163882 atggactccgacacctatcctctct 13163906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Original strand, 10892187 - 10892246
Alignment:
Q  245 atctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaa 304  Q
    |||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10892187 atctctctgaaatgaaatgcttaggtggaaatgggcttcgacacctctcctctctggaaa 10892246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 175 - 293
Target Start/End: Original strand, 12131049 - 12131167
Alignment:
Q  175 gatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaa 274  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||| || | |||    ||   |||||||||||||||||| || |||||  |||    
T  12131049 gatgatattgttaacaccttgttgaaggagcagttgctgcccatctccctagtctctctcacaatttgttatctctctgaaatgaaatcatttgaaagaa 12131148  T
Q  275 atgggcttcgacacctctc 293  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  12131149 atgggcttcgaaacctctc 12131167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 304
Target Start/End: Original strand, 13173830 - 13173959
Alignment:
Q  175 gatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaa 274  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| || || || ||||||| | | |||||   | |||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  13173830 gatgatattgttaacaccttgctgaaggagcggttgctgccaatttcacttgtgtctttgtatatttctaatctctgtgaaataaaatccattgatggaa 13173929  T
Q  275 atgggcttcgacacctctcctctctcgaaa 304  Q
    |||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  13173930 atggactccgacacctatcctctcttgaaa 13173959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 245 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11128217 - 11128158
Alignment:
Q  245 atctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaa 304  Q
    ||||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11128217 atctctctgaagtgaaatgcttaggtggaaatgggcttcgacacctctcctctcttgaaa 11128158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000006
Query Start/End: Original strand, 467 - 518
Target Start/End: Complemental strand, 11242551 - 11242500
Alignment:
Q  467 tgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacat 518  Q
    ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11242551 tgttagaagaaaggtatcaaaagcaggaacattggtccaaaatagctcacat 11242500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Original strand, 8864096 - 8864226
Alignment:
Q  174 tgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatgga 273  Q
    ||||||| | ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||| ||| | |||| ||| |  || | | |||||||||||  ||| | ||| ||||||    
T  8864096 tgatgatgttgttcacaccttgttgaaggagcaattgctacccatttccttggtgtttctgtcaataagtaatctctctgaagcgaaatgcttagatgga 8864195  T
Q  274 aatgggcttcgacacctctcctctctcgaaa 304  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8864196 aatgggcttcgatacctctcctctctggaaa 8864226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 174 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11146110 - 11145980
Alignment:
Q  174 tgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatgga 273  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||   ||||||||||| ||| | |||| ||| |  || | | ||||||||||| |||| | ||| | ||||    
T  11146110 tgatgatattgttcacaccttgttgaaggagcaattgctacccatttccttggtgtttctgtcaataagtaatctctctgaagtgaaatgcttaggtgga 11146011  T
Q  274 aatgggcttcgacacctctcctctctcgaaa 304  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||||    
T  11146010 aatgggcttcgacaactctccgctcttgaaa 11145980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 11157206 - 11157149
Alignment:
Q  247 ctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaa 304  Q
    ||||||||| |||| | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11157206 ctctctgaagtgaaatgcttaggtggaaatgggcttcgacacctctcctctctggaaa 11157149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 491 - 537
Target Start/End: Complemental strand, 8585578 - 8585532
Alignment:
Q  491 aggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatataaat 537  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  8585578 aggaacattggtccaacattgctcacatacctgtcataaatataaat 8585532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Original strand, 10085907 - 10085944
Alignment:
Q  28 tgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacc 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10085907 tgtggagagttgtcattttgtgaaggagtttgcctacc 10085944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 65
Target Start/End: Original strand, 10192827 - 10192864
Alignment:
Q  28 tgtgcagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacc 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10192827 tgtggagagttgtcattttgtgaaggagtttgcctacc 10192864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 416
Target Start/End: Original strand, 10091894 - 10091966
Alignment:
Q  344 cagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccaga 416  Q
    |||||||||||||||| |  || || ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  10091894 cagaaaactgcctccctttgtcgctgaaatcacttcgatttgcgaattgtgaaaagcttgagtcatttccaga 10091966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.000001
Query Start/End: Original strand, 344 - 416
Target Start/End: Original strand, 10198776 - 10198848
Alignment:
Q  344 cagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccaga 416  Q
    |||||||||||||||| |  || || ||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  10198776 cagaaaactgcctccctttgtcgctgaaatcacttcgatttgcgaattgtgaaaagcttgagtcatttccaga 10198848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 376; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 35 - 676
Target Start/End: Complemental strand, 55012 - 54374
Alignment:
Q  35 agttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcca 134  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55012 agttgtcattttctgaaggagtttgtctacctctcaaattacaatcaattgtgatttctaccaaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctcca 54913  T
Q  135 atatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatcta 234  Q
    |||||||||||||||||  |  ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  54912 atatttgacagctcttttttttttgtgtattgtaaagggtgatgatatatttaacaccttgatgaaggagtcattgctacccatctcccttgtgcatcta 54813  T
Q  235 tatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttg 334  Q
      ||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||  ||||| ||| ||||    
T  54812 cgtatctgtgatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggctgcgacacctctcctctctccaaagtctctgttttttgttttgtcaacaacttg 54713  T
Q  335 ggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactc 434  Q
     | ||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||  |||||   ||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  54712 agacattgccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatcacttgaattttatgattgtaaaaagctagagtcattaccagaagacagcctccctgaatc 54613  T
Q  435 tcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagatata 534  Q
    |||| |||||||   |||       || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||    
T  54612 tcttaaggaactgtacatcgatggttgcccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatatcaata 54513  T
Q  535 aatcatgaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaaactgccaataatcaatcatctgtacgac 634  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  54512 aattacaaagtcacaatatgatagacaagttgtgttcccatttcaggtatgttccacagttcctaccagaaa---gccaataatcaatcatctgtacgac 54416  T
Q  635 acacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctatgct 676  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54415 acacctcttaatattttcatatcatctcatgggtcctctgct 54374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 149; Significance: 2e-78; HSPs: 1)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 33 - 553
Target Start/End: Original strand, 26909545 - 26910065
Alignment:
Q  33 agagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtctc 132  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||   | |||| |||| ||||| | |||||||||||| |||||    
T  26909545 agagttgtcattttgtgaaggtgtttgtctacctcccaacttacaatcaattgacctttggtctcaaataacaacaccgtctgttacggaatggtgtctc 26909644  T
Q  133 caatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatc 232  Q
    ||| || | ||  ||||||||  ||||   ||   | ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||    
T  26909645 caagatctaaccactctttcagaattgactatcaaagagggtcatgatacatttaacaccttgatgaaggagttgttgctacccatctcccttgtttctc 26909744  T
Q  233 tatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagct 332  Q
    || | ||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  | ||| |   ||||  ||| ||    
T  26909745 tacaaatcatggatctctatgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacgcctctcctctctccaaaatcttcactttattaattgtgaacaact 26909844  T
Q  333 tgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgac 432  Q
       ||||||  |||||||||||||||| ||||| || ||||  |||  |||||     ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26909845 caagtcatttccagaaaactgcctcccttcctcgctgaaatatcttcaattttatggctgtgagaaacttgagtcattaccagaagacagcctccccgac 26909944  T
Q  433 tctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatagata 532  Q
    |||||||||   ||    || |     || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |    
T  26909945 tctcttgagatgctggaaatgtcatcttgcccattgttagaagaaaggtacaaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatacaaa 26910044  T
Q  533 taaatcatgaagtcacaatat 553  Q
    |||||||  |||||| |||||    
T  26910045 taaatcaacaagtcataatat 26910065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 1)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 33 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 17850338 - 17849838
Alignment:
Q  33 agagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagca---ccgccggttacggaatggggt 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||||| | |||  | ||| || |||| ||   ||||| || || |||||||||    
T  17850338 agagttgtcattttgtggaggagtttccctacctcccaagttacaatcaattgatattcattcccgaagaacaacagccccgcctgtaacagaatggggt 17850239  T
Q  130 ctccaatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgt 229  Q
    ||||||    | || ||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  17850238 ctccaaggcctaactgctctttcatcattgagtcttggaaaggatgatgatatagtgaacaccttgatgaaggagtcgttgctcccaatatccctcgtgt 17850139  T
Q  230 atctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccaca 329  Q
     |||   ||||  | |||||| | |  |||| ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||| |||  | ||| |    |||| |||    
T  17850138 ctctgactatctgtcatctctataatctgaactcctttgatggaaatggacttcgacatctttcctctcttgaaagtcttgactttcttaactgtcaaca 17850039  T
Q  330 gcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccct 429  Q
     |||| ||||||| || ||||||||||||| ||||| || ||||| |||  |||||   ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17850038 acttgagtcattgccacaaaactgcctcccttcctcactgaaatcgcttgaattttgttattgtaaaagacttgagtcgttaccagaagacagcctccct 17849939  T
Q  430 gactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgttagaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgctcacatccctttcatag 529  Q
      ||||||| ||  |||   |||||||  ||| ||  | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17849938 tcctctcttaagcgactggtcatttggcgatgccctatattagaagaaaggtataaaaggcaggaacattggtccaaaattgctcacatccctgtcatag 17849839  T
Q  530 a 530  Q
    |    
T  17849838 a 17849838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 99; Significance: 2e-48; HSPs: 3)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 386
Target Start/End: Original strand, 11487685 - 11488039
Alignment:
Q  32 cagagttgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatcaattaagatttctacccaaaaaacagcaccgccggttacggaatggggtct 131  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||   |  ||| | || | ||||| |||||||||||||||||    
T  11487685 cagagttgtcattttgtgaagatgtttctctacctcccaaattagaatcaattgagattttgtcggaaagatcaacgccgcctgttacggaatggggtct 11487784  T
Q  132 ccaatatttgacagctctttcatcattgtggattggaaagggtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtat 231  Q
    | || || |||| |||||||||   |||   ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  11487785 caaagatctgaccgctctttcacggttgactattggagtgggtgatgatatacttaacaccttgatgaagcagtcgttgctacccatctcccttgtgtct 11487884  T
Q  232 ctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaaatgggcttcgacacctctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagc 331  Q
    ||   |||| ||| || ||   |||||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||| |  |||| | || ||  |||      
T  11487885 ctgactatcgattgtcgctacaaaatgaagccctatgatggaagtgggcttcgatacctctcctctctcaaagatctttcattttggtgtagtgaacact 11487984  T
Q  332 ttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaaatcacttagattttt 386  Q
    ||| ||||||  ||||||||| |||||| ||||| || | |||||||| ||||||    
T  11487985 ttgagtcattaccagaaaacttcctcccatcctcgctgatatcacttaaattttt 11488039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 173 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 44954932 - 44954592
Alignment:
Q  173 gtgatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatgg 272  Q
    |||||||||  ||||| |||||| | | |||| || ||||||||||||||||||||| |||   ||||| ||||||   |||||||||||||||| | ||    
T  44954932 gtgatgatactgttaagaccttggttatggagccgctgctacccatctcccttgtgtctctgactatcagttatctggatgaaatgaagtcctttcaagg 44954833  T
Q  273 aaatgggcttcgacacct-ctcctctctcgaaaatctctattttttgggttgtccacagcttgggtcattggcagaaaactgcctcccctcctccctcaa 371  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |||      |||| |||||||| ||||||  |||||||||| || || ||||| || ||    
T  44954832 aaatgggcttcaacacctactcctctctcgaaaatctccactttcgtaactgtcaacagcttgagtcatttccagaaaactgtcttccttcctcgctgaa 44954733  T
Q  372 atcacttagatttttgaattgtgaaagacttgagtcattaccagaagacagcctccctgactctcttgaggaactcaccatttggaaatgtccattgtta 471  Q
    |||||||  |||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||| |   |||   |||||||  ||| ||  | | |    
T  44954732 atcacttcaatttttgttttgtg-aagacttgagtcgttaccagaagaaagcctccccaactctcttaatcgactggtcatttggcgatgccctgtatca 44954634  T
Q  472 gaagaaaggtataaaaggaaggaacattggtccaaaattgct 513  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  44954633 gaagaaaggtatagaaggaaggaacattggtccaaaattgct 44954592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 44955066 - 44955024
Alignment:
Q  38 tgtcattttgtgaaggagtttgtctacctcccaaattacaatc 80  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44955066 tgtcattttgtgaaggtgtttgcctacctcccaaattacaatc 44955024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 175 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 143206 - 143082
Alignment:
Q  175 gatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaa 274  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| || || || ||||||| | | |||||   | |||||| |||||| || |||||||||||||    
T  143206 gatgatattgttaacaccttgctgaaggagcggttgctgccaatttcacttgtgtctttgtatatttctaatctctgtgaaataaaatcctttgatggaa 143107  T
Q  275 atgggcttcgacacctctcctctct 299  Q
    |||| || |||||||| ||||||||    
T  143106 atggactccgacacctatcctctct 143082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 175 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 133158 - 133029
Alignment:
Q  175 gatgatatagttaacaccttgatgaaggagtcgttgctacccatctcccttgtgtatctatatatcaattatctctctgaaatgaagtcctttgatggaa 274  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||| || || || ||||||| | | |||||   | |||||| |||||| || ||| |||||||||    
T  133158 gatgatattgttaacaccttgctgaaggagcggttgctgccaatttcacttgtgtctttgtatatttctaatctctgtgaaataaaatccattgatggaa 133059  T
Q  275 atgggcttcgacacctctcctctctcgaaa 304  Q
    |||| || |||||||| |||||||| ||||    
T  133058 atggactccgacacctatcctctcttgaaa 133029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University