View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11760_high_6 (Length: 404)

Name: NF11760_high_6
Description: NF11760
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11760_high_6
NF11760_high_6
[»] chr3 (19 HSPs)
chr3 (52-397)||(4856446-4856792)
chr3 (52-397)||(4878181-4878527)
chr3 (85-394)||(4841830-4842138)
chr3 (72-394)||(4835144-4835452)
chr3 (152-397)||(4852475-4852716)
chr3 (226-397)||(4826399-4826570)
chr3 (234-397)||(4871527-4871689)
chr3 (234-397)||(4845768-4845930)
chr3 (149-394)||(4860747-4860975)
chr3 (149-394)||(4880754-4880982)
chr3 (83-258)||(4842873-4843050)
chr3 (83-258)||(4868569-4868746)
chr3 (69-176)||(4826595-4826702)
chr3 (52-220)||(4846018-4846185)
chr3 (83-172)||(4837498-4837587)
chr3 (226-266)||(4837426-4837466)
chr3 (52-115)||(4860974-4861033)
chr3 (52-115)||(4880981-4881040)
chr3 (329-387)||(4536824-4536879)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (255-397)||(21703749-21703891)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 19)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 52 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4856792 - 4856446
Alignment:
Q  52 ttttttcagctaaaccatattggtgtgcaaccaagtggagagatagagccaataatactaaatggtctttttgtgtggaaaattgaacgataggta---- 147  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||        
T  4856792 ttttttcagctaaaccat---ggtgggcaaacaagtggagagatagagccaatattactgaatggtcttgttgtgtggaaaattaaaggataggtaggga 4856696  T
Q  148 ctgatcatcaactagtagcaaatacatggaaggaacatgtaaaattgttgaataattcaattcgtacacaattttgacatttagtaaatgacttagattg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4856695 ctgatcatcaactagtagcaaatacatggaaggaacatgtaacattgttgaataattcaattcatacacaattttgacatttagtacatgacttagattg 4856596  T
Q  248 accataaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcacttcttaaaatggcta 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4856595 accataaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataattatatcacttcttaaaatggcta 4856496  T
Q  348 attcctttttcttatccttactagtgttgttccttgctgctcctatgctt 397  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  4856495 attcatttttcttatccttattagtgttattccttgctgcttttatgctt 4856446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 52 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4878527 - 4878181
Alignment:
Q  52 ttttttcagctaaaccatattggtgtgcaaccaagtggagagatagagccaataatactaaatggtctttttgtgtggaaaattgaacgataggta---- 147  Q
    ||||||||||||||||||   |||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||||        
T  4878527 ttttttcagctaaaccat---ggtgggcaaacaagtggagagatagagccaatattactgaatggtcttgttgtgtggaaaattaaaggataggtaggga 4878431  T
Q  148 ctgatcatcaactagtagcaaatacatggaaggaacatgtaaaattgttgaataattcaattcgtacacaattttgacatttagtaaatgacttagattg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4878430 ctgatcatcaactagtagcaaatacatggaaggaacatgtaacattgttgaataattcaattcatacacaattttgacatttagtacatgacttagattg 4878331  T
Q  248 accataaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcacttcttaaaatggcta 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4878330 accataaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataattatatcacttcttaaaatggcta 4878231  T
Q  348 attcctttttcttatccttactagtgttgttccttgctgctcctatgctt 397  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  4878230 attcatttttcttatccttattagtgttattccttgctgcttttatgctt 4878181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 85 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4842138 - 4841830
Alignment:
Q  85 agtggagagatagagccaataatactaaatggtctttttgtgtggaaaat----tgaacgataggtactgatcatcaactagtagcaaatacatggaagg 180  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||    | || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4842138 agtggaaagatagagccaataatactaaatggtcttgctgtatggaaaatgaaattaaggatagttaatgatcatcaactagtagcaaatacatggaagt 4842039  T
Q  181 aacatgtaaaattgttgaataattcaattcgtacacaattttgacatttagtaaatgacttagattgaccataaactcacattgagtctctaactagtat 280  Q
        ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4842038 ----tgtaacattgttgaataattcaattcatacataattttgacatttagtaaataacttagattgaccataaactcacattgagtctctaattagtat 4841943  T
Q  281 aaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcacttcttaaaatggctaattcctttttcttatccttactagtgttgttcc 380  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  4841942 aaaaccagttaattccatatgtattatgcaccaacac-aataataatatcacttcttaaaatggctaaatcctttttcttatccttattagtgttattcc 4841844  T
Q  381 ttgctgctcctatg 394  Q
    ||||||||| ||||    
T  4841843 ttgctgctcttatg 4841830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 72 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4835452 - 4835144
Alignment:
Q  72 tggtgtgcaaccaagtggagagatagagccaataatactaaatggtctttttgtgtggaaaattgaacgataggtactgatcatcaactagtagcaaata 171  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     || |||     |||||||| ||||||||||||    
T  4835452 tggtgtgcaaacaagcggagagataaagccaataatactaaatggtcttgttgtgtggaaaat-----gaaagg-----atcatcaagtagtagcaaata 4835363  T
Q  172 catggaaggaacatgtaaaattgttgaataattcaattcgtacacaattttgacatttagtaaatgacttagattgaccataaactcacattgagtctct 271  Q
    ||||||     | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4835362 catggac----cttgtaacattgttgaataattcaattcatacacaattttgacatttagtaaatgactttgattgaccataaactcactttgagtctct 4835267  T
Q  272 aactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcacttcttaaaatggctaattcctttttcttatccttactag 371  Q
    || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  4835266 aattagtataaaaccagttaactccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcacttcttaaaatggctaaatcctttttcttatccttgctag 4835167  T
Q  372 tgttgttccttgctgctcctatg 394  Q
    || | ||||||||||||| ||||    
T  4835166 tggtattccttgctgctcttatg 4835144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 152 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4852716 - 4852475
Alignment:
Q  152 tcatcaactagtagcaaatacatggaaggaacatgtaaaattgttgaataattcaattcgtacacaattttgacatttagtaaatgacttagattgacca 251  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4852716 tcataaactagtagcaactacatggaa----cttgtaacattgttgaataattcaattcatacacaattttgacatttagtaaatgacttagatcgacca 4852621  T
Q  252 taaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcacttcttaaaatggctaattc 351  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4852620 taaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataattatatcacttcttaaaatggctaattc 4852521  T
Q  352 ctttttcttatccttactagtgttgttccttgctgctcctatgctt 397  Q
     ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  4852520 atttttcttatccttattagtgttattccttgctgcttttatgctt 4852475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 226 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4826570 - 4826399
Alignment:
Q  226 atttagtaaatgacttagattgaccataaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataata 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4826570 atttagtaaatgacttagattgaccataaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagttaactctctatgtattatgcaccaacactaataata 4826471  T
Q  326 atatcacttcttaaaatggctaattcctttttcttatccttactagtgttgttccttgctgctcctatgctt 397  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  4826470 atatcacttcttaaagtggctaattcctttttcttatccttgctagtggtattccttgctgctcttatgctt 4826399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 128; E-Value: 5e-66
Query Start/End: Original strand, 234 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4871689 - 4871527
Alignment:
Q  234 aatgacttagattgaccataaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcact 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4871689 aatgacttagattgaccataaactcacattgagtctctaactagtataaagccagttaactccatatgtattatgcaccaacac-aataataatatcact 4871591  T
Q  334 tcttaaaatggctaattcctttttcttatccttactagtgttgttccttgctgctcctatgctt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  4871590 tcttaaaatggctaattcctttttcttatccttattagtgttattccttgctgcttttatgctt 4871527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 234 - 397
Target Start/End: Complemental strand, 4845930 - 4845768
Alignment:
Q  234 aatgacttagattgaccataaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcact 333  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4845930 aatgacttagattgaccaaaaaatcacattgagtctctaactagtataaagccagttaactacctatgtattatgcaccaacac-aataataatatcact 4845832  T
Q  334 tcttaaaatggctaattcctttttcttatccttactagtgttgttccttgctgctcctatgctt 397  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||    
T  4845831 tcttaaaatggctaattcctttttcttatccttattagtgttattccttgctgcttttatgctt 4845768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 149 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4860975 - 4860747
Alignment:
Q  149 tgatcatcaactagtagcaaatacatggaaggaacatgtaaaattgttgaataattcaattcgtacacaattttgacatttagtaaatgacttagattga 248  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||              ||||||    
T  4860975 tgatcatcagctagtatcaaatacatggaa----cttgtaacattgttgaataattcaattcgtgcacaattttaacttt--------------gattga 4860894  T
Q  249 ccataaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtata-ctccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcacttcttaaaatggcta 347  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4860893 cgatagactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtttaactccctatgtattatgcaccaacactaataattatatcacttcttaaaatggcta 4860794  T
Q  348 attcctttttcttatccttactagtgttgttccttgctgctcctatg 394  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4860793 aatcctttttcttatccttattagtgttattccttgctgctcttatg 4860747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 149 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 4880982 - 4880754
Alignment:
Q  149 tgatcatcaactagtagcaaatacatggaaggaacatgtaaaattgttgaataattcaattcgtacacaattttgacatttagtaaatgacttagattga 248  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||    | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||              ||||||    
T  4880982 tgatcatcagctagtatcaaatacatggaa----cttgtaacattgttgaataattcaattcgtgcacaattttaacttt--------------gattga 4880901  T
Q  249 ccataaactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtata-ctccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcacttcttaaaatggcta 347  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4880900 cgatagactcacattgagtctctaactagtataaaaccagtttaactccctatgtattatgcaccaacactaataattatatcacttcttaaaatggcta 4880801  T
Q  348 attcctttttcttatccttactagtgttgttccttgctgctcctatg 394  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  4880800 aatcctttttcttatccttattagtgttattccttgctgctcttatg 4880754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4843050 - 4842873
Alignment:
Q  83 caagtggagagatagagccaataatactaaa------tggtctttttgtgtggaaaattgaacgataggtactgatcatcaactagtagcaaatacatgg 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||  |||| ||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4843050 caagtggagagatagagcaaataatactaaaaaaaaatggtctagttgtatggaaaatgaaaggatagttagtgatcatcaactagtagcaaatacatgg 4842951  T
Q  177 aaggaacatgtaaaattgttgaataattcaattcgtacacaattttgacatttagtaaatgacttagattgaccataaactc 258  Q
    |     | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4842950 ag----cttgtaacattgttgaataattcaattcatacacaattttgacatttagtaaatgacttagattgaccataaactc 4842873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 83 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 4868746 - 4868569
Alignment:
Q  83 caagtggagagatagagccaataatactaaa------tggtctttttgtgtggaaaattgaacgataggtactgatcatcaactagtagcaaatacatgg 176  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||      ||||||  |||| ||||||||  || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  4868746 caagtggagagatagagcaaataatactaaaaaaaaatggtctagttgtatggaaaatgaaaggatagttagtgatcatcaactagtagcaaatacatgg 4868647  T
Q  177 aaggaacatgtaaaattgttgaataattcaattcgtacacaattttgacatttagtaaatgacttagattgaccataaactc 258  Q
    |     | ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4868646 ag----cttgtaacattgttgaataattcaattcatacataattttgacatttagtaaatgacttagattgaccataaactc 4868569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 69 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 4826702 - 4826595
Alignment:
Q  69 tattggtgtgcaaccaagtggagagatagagccaataatactaaatggtctttttgtgtggaaaattgaacgataggtactgatcatcaactagtagcaa 168  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4826702 tattggtgtgcaaacaagtggagagatagagccaataatactaaatggtcttgttgtgtggaaaatgaaaggataggtactgatcatcaacaagtagcaa 4826603  T
Q  169 atacatgg 176  Q
    ||||||||    
T  4826602 atacatgg 4826595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 52 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 4846185 - 4846018
Alignment:
Q  52 ttttttcagctaaaccatattggtgtgcaaccaagtggagagatagagccaataatactaaatggtctttttgtgtggaaaattgaacgatagg----ta 147  Q
    |||||||||||||||||   || || |||| |||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| || ||||||    ||    
T  4846185 ttttttcagctaaaccacggtg-tgggcaaacaagtggagatatagagccaatattactgaatggtcttgttgtgtggaaaattaaaggataggtagcta 4846087  T
Q  148 ctgatcatcaactagtagcaaatacatggaaggaacatgtaaaattgttgaataattcaattcgtacacaatt 220  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  4846086 ccaatcatcaactagttgcaaatacat----ggaacatgtaacattgttcaataattcaattcataaacaatt 4846018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 4837587 - 4837498
Alignment:
Q  83 caagtggagagatagagccaataatactaaatggtctttttgtgtggaaaattgaacgataggtactgatcatcaactagtagcaaatac 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||  | ||||||||||    
T  4837587 caagtggagagataaagccaataatactaaatggtcttgttgtgtggaaaatgaaaggatagctactgatcatcaataactagcaaatac 4837498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 4837466 - 4837426
Alignment:
Q  226 atttagtaaatgacttagattgaccataaactcacattgag 266  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4837466 atttagtaaatgacttatattgaccataaactcacattgag 4837426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 4861033 - 4860974
Alignment:
Q  52 ttttttcagctaaaccatattggtgtgcaaccaagtggagagatagagccaataatactaaatg 115  Q
    ||||||||| ||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4861033 ttttttcaggtaaaccat----gtgcgcaaacaagtggagagatagagccaataatactaaatg 4860974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 4881040 - 4880981
Alignment:
Q  52 ttttttcagctaaaccatattggtgtgcaaccaagtggagagatagagccaataatactaaatg 115  Q
    ||||||||| ||||||||    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4881040 ttttttcaggtaaaccat----gtgcgcaaacaagtggagagatagagccaataatactaaatg 4880981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 4536879 - 4536824
Alignment:
Q  329 tcacttcttaaaatggctaattcctttttcttatccttactagtgttgttccttgctgc 387  Q
    ||||||||||||||||||   || |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4536879 tcacttcttaaaatggct---tcattttacctatccttactattgttgttccttgctgc 4536824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 255 - 397
Target Start/End: Original strand, 21703749 - 21703891
Alignment:
Q  255 actcacattgagtctctaactagtataaaaccagtatactccatatgtattatgcaccaacactaataataatatcacttcttaaaatggctaattcctt 354  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| | ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21703749 actcccattgagtctctaactagtataaaaccggttaacttcctatgtcttatgcaccaacactaatattaatatcacttcttaaaatggctaattcttt 21703848  T
Q  355 tttcttatccttactagtgttgttccttgctgctcctatgctt 397  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||  ||||||| |||||||    
T  21703849 tttcttgtccttactagtggtattccacgctgctcttatgctt 21703891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University