View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF11768_low_58 (Length: 251)
Name: NF11768_low_58
Description: NF11768
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF11768_low_58 |
 | |
|
| [»] chr3 (10 HSPs) |
| |
|
| [»] chr6 (6 HSPs) |
| |
|
| [»] chr4 (7 HSPs) |
| |
|
| [»] chr2 (8 HSPs) |
| |
|
| [»] chr5 (4 HSPs) |
| |
|
| [»] chr7 (8 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0525 (1 HSPs) |
| |
|
| [»] chr1 (2 HSPs) |
| |
|
| [»] scaffold0586 (1 HSPs) |
| | |
|
| [»] scaffold0395 (1 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 228; Significance: 1e-126; HSPs: 10)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 55292322 - 55292561
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55292322 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
55292421 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataa |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
55292422 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataa |
55292521 |
T |
|
| Q |
212 |
atgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
55292522 |
atgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
55292561 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10554638 - 10554399
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10554638 |
cagagaggatgtttataatgtttattgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
10554539 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataa |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
10554538 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatggataa |
10554439 |
T |
|
| Q |
212 |
atgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
10554438 |
atgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
10554399 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54973589 - 54973349
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54973589 |
cagagaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
54973490 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54973489 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
54973390 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
54973389 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
54973349 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54976199 - 54975959
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54976199 |
cagagaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
54976100 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54976099 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
54976000 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
54975999 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
54975959 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 54978809 - 54978569
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54978809 |
cagagaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
54978710 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54978709 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
54978610 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
54978609 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
54978569 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16799876 - 16799786
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
16799876 |
tgttgttgttgattgaatatgatttgatgttgattgttggtttatgcataaatgcattccatgggattatacaagatgttgattcaggttg |
16799786 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 54046782 - 54046699
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
54046782 |
tgttgttgttgattgattatgattgt-tgatgattgttggtttatgcttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttc |
54046699 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Original strand, 15010208 - 15010291
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15010208 |
tgttgttgttgattgattatgattgt-tgatgattgatggtttatgcttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttc |
15010291 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Original strand, 603698 - 603781
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| ||| ||||||||||| || |||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
603698 |
tgttgctgttgattgattatgattgt-tgatgattgcaggtttatgcttaactgcattcaattagaatatataaggtgttggttc |
603781 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Original strand, 10989622 - 10989705
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||| || || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10989622 |
tgttgctgttgattgagtatgattgt-tgctgattgttgatttatgtttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttc |
10989705 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 6)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 8523135 - 8522895
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8523135 |
cagagaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
8523036 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8523035 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
8522936 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
8522935 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
8522895 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 15 - 243
Target Start/End: Original strand, 15686021 - 15686244
Alignment:
| Q |
15 |
agaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15686021 |
agaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggatatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgtt |
15686120 |
T |
|
| Q |
115 |
gtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatg |
214 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
15686121 |
gtatatgatggttattattgctgttgtctcgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatttg-----ctgctgattgttggtttatgcataaacg |
15686215 |
T |
|
| Q |
215 |
cattcaattggattatacaaggtgttggt |
243 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15686216 |
cattcaattggattatacaagatgttggt |
15686244 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Original strand, 2287966 - 2288056
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||||||| |
|
|
| T |
2287966 |
tgttgctgttgattgaatatgatttgatgctgattgttggtttatgcataaatgcattccatgggattatacaagatgttgattcaggttg |
2288056 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15539340 - 15539250
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15539340 |
tgttgctgttgattgaatatgatttgatgctgattgttagtttatgcataaatgcattccatgggattatacaagatgttggttcaggttg |
15539250 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16812845 - 16812756
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| | ||| || |||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16812845 |
tgttgttgttgattgattatgattgt-tgatgaatgttggtttatacttaactgtattcaattagaatatacaaggtgttggttcgggttg |
16812756 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16829865 - 16829776
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
16829865 |
tgttgatgttgattgattatgattgt-tgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaaggtgttggttcgggttg |
16829776 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 41791875 - 41791635
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41791875 |
cagagaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
41791776 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41791775 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
41791676 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
41791675 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
41791635 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 16278008 - 16278247
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16278008 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgtttatatgagtcctactt |
16278107 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataa |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
16278108 |
gttgtatatgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgttgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatac |
16278207 |
T |
|
| Q |
212 |
atgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16278208 |
atgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
16278247 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 53387620 - 53387857
Alignment:
| Q |
14 |
gagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgt |
113 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
53387620 |
gagagaatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgt |
53387719 |
T |
|
| Q |
114 |
tgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaat |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| || |
|
|
| T |
53387720 |
tgtatatgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctactgattgttggtgtatgcatgcat |
53387819 |
T |
|
| Q |
214 |
gcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
53387820 |
gcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
53387857 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14698919 - 14698681
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14698919 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaa-tgaggggatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
14698821 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataa |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
14698820 |
gttgtatatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatac |
14698721 |
T |
|
| Q |
212 |
atgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
14698720 |
atgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
14698681 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4171227 - 4170989
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
4171227 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaa-tgaggggatagttatataatatgaaaaatgttgatatgagtcctactt |
4171129 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataa |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
4171128 |
gttgtatatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatac |
4171029 |
T |
|
| Q |
212 |
atgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4171028 |
atgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
4170989 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 75 - 158
Target Start/End: Original strand, 21189768 - 21189851
Alignment:
| Q |
75 |
ttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattatta |
158 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| || | |||||||||||||| |
|
|
| T |
21189768 |
ttatatgttatgaaagatgttgatatcagttatacttgttgtatatgatgattattattgttggtgacttgctgcttattatta |
21189851 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Original strand, 15280136 - 15280219
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15280136 |
tgttgctgttgattgattatgattgt-tgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttc |
15280219 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 21241573 - 21241813
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21241573 |
cagagaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
21241672 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21241673 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
21241772 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21241773 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
21241813 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Original strand, 21239026 - 21239263
Alignment:
| Q |
15 |
agaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgtt |
114 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
21239026 |
agaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactcgtt |
21239125 |
T |
|
| Q |
115 |
gtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaat |
213 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
21239126 |
gtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataaat |
21239225 |
T |
|
| Q |
214 |
gcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21239226 |
gcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
21239263 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24504906 - 24504666
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24504906 |
cagagaggatgtttgtaatgtttaatgatgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
24504807 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
24504806 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
24504707 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
24504706 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
24504666 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 20591005 - 20591242
Alignment:
| Q |
14 |
gagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgt |
113 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20591005 |
gagagaatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagattttgatatgagtcctacttgt |
20591104 |
T |
|
| Q |
114 |
tgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaat |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
20591105 |
tgtatatgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcataaat |
20591204 |
T |
|
| Q |
214 |
gcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
20591205 |
gcattcaattggattatacaagatgttggtttaggttg |
20591242 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 12 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31506368 - 31506135
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31506368 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaatatgttgatatgagtcctactt |
31506269 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataa |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
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|
| T |
31506268 |
gttgtatatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatac |
31506169 |
T |
|
| Q |
212 |
atgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31506168 |
atgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttc |
31506135 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 31503801 - 31503569
Alignment:
| Q |
13 |
agagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttg |
112 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31503801 |
agagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaatatgttgatatgagtcctacttg |
31503702 |
T |
|
| Q |
113 |
ttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaa |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |
|
|
| T |
31503701 |
ttgtatatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcataca |
31503602 |
T |
|
| Q |
213 |
tgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
||||||||||| || | ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31503601 |
tgcattcaattagaatgtacaatgtgttggttc |
31503569 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 28349139 - 28349056
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||| || || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
28349139 |
tgttgctgttgattgaatatga-ttgttgctgattgctggtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttc |
28349056 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Original strand, 12627942 - 12628025
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12627942 |
tgttgttgttgattgattatgattgt-tgatgattgctggtttatgcttaactgcattcaattagaacatacaaggtgttggttc |
12628025 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 4)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26496089 - 26495849
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26496089 |
cagagaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgtaagatgttgatatgagtcctactc |
26495990 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26495989 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
26495890 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
26495889 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
26495849 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 29325138 - 29325378
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29325138 |
cagagaggatgtctgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
29325237 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
29325238 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
29325337 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
29325338 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
29325378 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 4397776 - 4397687
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
4397776 |
tgttgctgttgattgattatgattgt-tgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattcgaatatacaaggtgttggttcgggttg |
4397687 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 51 - 124
Target Start/End: Original strand, 27869316 - 27869390
Alignment:
| Q |
51 |
gttgatgaa-caaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgttgtatatgatg |
124 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| | ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
27869316 |
gttgatgaatcaaaagtggaaataattatatatcatgaaagatgttgatatgagttacacttgttgtatatgatg |
27869390 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 8)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16006621 - 16006381
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16006621 |
cagagaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagataattatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
16006522 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16006521 |
gttgtatatgatggttattattgttgtagtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
16006422 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
16006421 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
16006381 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 17505687 - 17505924
Alignment:
| Q |
14 |
gagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgt |
113 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17505687 |
gagagaatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgt |
17505786 |
T |
|
| Q |
114 |
tgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaat |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
17505787 |
tgtatatgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctactgattgttggtgtatgcatacat |
17505886 |
T |
|
| Q |
214 |
gcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17505887 |
gcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
17505924 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17547527 - 17547290
Alignment:
| Q |
14 |
gagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctacttgt |
113 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
17547527 |
gagagaatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctacttgt |
17547428 |
T |
|
| Q |
114 |
tgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaat |
213 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
17547427 |
tgtatatgatggttattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctactgattgttggtgtatgcatacat |
17547328 |
T |
|
| Q |
214 |
gcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
17547327 |
gcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
17547290 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 21743203 - 21743441
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21743203 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaa-tgaggggatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
21743301 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataa |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21743302 |
gttgtatatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgctgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatac |
21743401 |
T |
|
| Q |
212 |
atgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
21743402 |
atgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
21743441 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 8776563 - 8776331
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
8776563 |
cagaaaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttaatatgagtcctactc |
8776464 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataa |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8776463 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttg--aattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcataa |
8776366 |
T |
|
| Q |
212 |
atgcattcaattggattatacaaggtgttggttca |
246 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8776365 |
atgcattcaattgaattatacaagatgttggttca |
8776331 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 35366293 - 35366210
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
35366293 |
tgttgctgttgattgaatatgattgt-tgatgattgctggtttatgcttaattgcattcaattagaatatacaaggtgttggttc |
35366210 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 38828302 - 38828216
Alignment:
| Q |
159 |
tatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
38828302 |
tatgttgctattgattgaatatgatttgttgctgactgctggtttgtgcatagctgcattcaattagaatatacaaggtgtgggttc |
38828216 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Original strand, 13733586 - 13733669
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || ||| || |||||||| | ||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13733586 |
tgttgctgttgattgattatgattgt-tgatgaatgctggtttatacttaactgcattcaattagaatatacaatgtgttggttc |
13733669 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 246
Target Start/End: Original strand, 45134823 - 45135058
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45134823 |
cagaaaggatgtttgtaatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
45134922 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45134923 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgcata |
45135022 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttca |
246 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
45135023 |
aatgcattcaattgaattatacaagatgttggttca |
45135058 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 6608172 - 6608410
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6608172 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaac-gaggggatagttatataatatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
6608270 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataa |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
6608271 |
gttgtatatgatgattattattattgttgtctcgctgcttgttattatatgttgttgttgattgaatatgatttgctgctgattgttggtgtatgcatac |
6608370 |
T |
|
| Q |
212 |
atgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
6608371 |
atgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
6608410 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Original strand, 7300980 - 7301217
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7300980 |
cagagaggacgtttgtaatgtttaatgacatcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
7301079 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataa |
211 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
7301080 |
gttgtatatgatggttattatggtcgttgtctcgctgcttgttattatatgttgttg--aattgaatatgatttgctgttgattgttggtttatgcataa |
7301177 |
T |
|
| Q |
212 |
atgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |
|
|
| T |
7301178 |
atgcattcaattagattatacaagatgttagttcaggttg |
7301217 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 162
Target Start/End: Original strand, 21415144 - 21415294
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21415144 |
cagagaggatgtatataatgtttaatgacgtcgatttaagttaataaacaaatgaggagatagttaaatattatgaaagatgttgatatgagttatactt |
21415243 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatg |
162 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
21415244 |
gttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgcttattattatatg |
21415294 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Original strand, 10829505 - 10829588
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||||| | || ||||| || |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10829505 |
tgttgctgttgattgattatgattgt-tgatgattgctggtttatgcataactacaaacaattagaatatacaaggtgttggttc |
10829588 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0525 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:
Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9374 - 9134
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9374 |
cagagaggatgttggtaaggtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
9275 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcata |
210 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9274 |
gttgtatatgatggttattattgttgttgtctcgctgcttattgttatatgttgttgttgaattgaatatgattcgctgctgattgttggtttatgcata |
9175 |
T |
|
| Q |
211 |
aatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
9174 |
aatgcattcaattggattatacaagatgttggttcaggttg |
9134 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 12 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 20579668 - 20579426
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20579668 |
cagagaggatgtttgtagtgtttaatgacgtcgacttaggtcgatgaacaaatgaggagatagttatatgttatgaaagatgttgatatgagtcctactc |
20579569 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgc---ttattattatatgttgctgttg-attgaatatgatttactgctgattgttggtttatgc |
207 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20579568 |
gttgtatatgatggttattattgttg-tgtctcgctacttattattattatatgttgttgttgaattgaatatgatttgctgctgattgttggtttatgc |
20579470 |
T |
|
| Q |
208 |
ataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttcaggttg |
251 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |
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| T |
20579469 |
ataaatgcattcaattggattatacaagatgttggttcgggttg |
20579426 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 239
Target Start/End: Original strand, 2333021 - 2333101
Alignment:
| Q |
159 |
tatgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgt |
239 |
Q |
| |
|
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| T |
2333021 |
tatgttgctattgattgaatatgttttgttgctgactgctggtttgtgcataactgcattcaattagaatatacaaggtgt |
2333101 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0586 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0586
Description:
Target: scaffold0586; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 12 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2057 - 1911
Alignment:
| Q |
12 |
cagagaggatgtttataatgtttaatgacgtcgacttaggttgatgaacaaatgaggagatagttatatattatgaaagatgttgatatgagtcctactt |
111 |
Q |
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|
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| T |
2057 |
cagagaggatgtatataatgtttaatgacgtcgatttaagttaataaacaaatgaggagatagttaaatattatgaaagatgttgatatgagttatactt |
1958 |
T |
|
| Q |
112 |
gttgtatatgatggttattatcgttgttgtcccgctgcttattatta |
158 |
Q |
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| T |
1957 |
gttgtatatgatgattattattgttgttgacttgctgcttattatta |
1911 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0395 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:
Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 245
Target Start/End: Original strand, 8548 - 8631
Alignment:
| Q |
161 |
tgttgctgttgattgaatatgatttactgctgattgttggtttatgcataaatgcattcaattggattatacaaggtgttggttc |
245 |
Q |
| |
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| T |
8548 |
tgttgttgttgattgaatatga-ttgttgctgattgctggtttatgcttaactgcattccattagaatacacaaggtgtaggttc |
8631 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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