View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11768_low_66 (Length: 231)

Name: NF11768_low_66
Description: NF11768
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11768_low_66
NF11768_low_66
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (15-213)||(16278154-16278353)
chr4 (21-213)||(4170887-4171082)
chr4 (21-213)||(14698579-14698774)
chr4 (15-213)||(53387764-53387965)
chr4 (21-213)||(41791533-41791729)
chr4 (15-158)||(33848780-33848923)
chr4 (23-110)||(31117185-31117272)
chr4 (23-110)||(55502880-55502967)
chr4 (15-158)||(286962-287106)
chr4 (15-158)||(28382696-28382840)
chr4 (15-158)||(15280187-15280330)
chr4 (15-158)||(47126929-47127073)
chr4 (15-134)||(16359376-16359495)
chr4 (21-210)||(56115656-56115847)
chr4 (15-110)||(10313587-10313683)
[»] chr3 (17 HSPs)
chr3 (15-213)||(10554294-10554492)
chr3 (21-213)||(55292468-55292663)
chr3 (23-213)||(54973249-54973443)
chr3 (23-213)||(54975859-54976053)
chr3 (23-213)||(54978469-54978663)
chr3 (21-210)||(16799684-16799876)
chr3 (23-210)||(15010208-15010395)
chr3 (23-210)||(54046595-54046782)
chr3 (23-210)||(603698-603885)
chr3 (15-158)||(2035087-2035231)
chr3 (15-158)||(2038594-2038738)
chr3 (15-158)||(2042335-2042479)
chr3 (15-158)||(14038049-14038193)
chr3 (15-158)||(14041517-14041661)
chr3 (21-158)||(39230603-39230741)
chr3 (15-158)||(18958768-18958912)
chr3 (22-210)||(10989622-10989812)
[»] chr8 (11 HSPs)
chr8 (21-213)||(6608317-6608512)
chr8 (21-213)||(45134969-45135165)
chr8 (23-207)||(7301129-7301317)
chr8 (15-158)||(17795270-17795413)
chr8 (27-134)||(28853836-28853943)
chr8 (15-158)||(24707911-24708055)
chr8 (21-158)||(22059494-22059632)
chr8 (21-158)||(22145490-22145628)
chr8 (21-210)||(363829-364020)
chr8 (21-210)||(44431902-44432093)
chr8 (15-101)||(17614791-17614879)
[»] chr7 (13 HSPs)
chr7 (21-213)||(21743348-21743543)
chr7 (15-213)||(17505831-17506032)
chr7 (15-213)||(17547182-17547383)
chr7 (21-213)||(16006279-16006475)
chr7 (21-207)||(8776224-8776414)
chr7 (17-158)||(4993361-4993502)
chr7 (21-212)||(38828109-38828302)
chr7 (23-110)||(124324-124411)
chr7 (23-210)||(35366106-35366293)
chr7 (15-158)||(13395568-13395712)
chr7 (15-158)||(13733637-13733780)
chr7 (15-158)||(48785185-48785329)
chr7 (21-114)||(21065306-21065400)
[»] chr2 (12 HSPs)
chr2 (21-213)||(20591149-20591344)
chr2 (21-213)||(21239169-21239365)
chr2 (21-213)||(21241719-21241915)
chr2 (21-213)||(24504564-24504760)
chr2 (23-213)||(31503463-31503656)
chr2 (23-213)||(31506029-31506222)
chr2 (15-158)||(23339271-23339414)
chr2 (23-210)||(12627942-12628129)
chr2 (23-110)||(31755818-31755905)
chr2 (21-210)||(28348948-28349139)
chr2 (21-158)||(44620806-44620944)
chr2 (15-156)||(41684868-41685010)
[»] chr6 (9 HSPs)
chr6 (21-213)||(8522793-8522989)
chr6 (21-210)||(15539148-15539340)
chr6 (21-210)||(2287966-2288158)
chr6 (15-189)||(15686183-15686360)
chr6 (15-210)||(16812650-16812845)
chr6 (15-158)||(16102215-16102359)
chr6 (15-158)||(16829670-16829814)
chr6 (15-110)||(12595829-12595925)
chr6 (15-157)||(29492627-29492770)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (21-213)||(29325284-29325480)
chr5 (21-213)||(26495747-26495943)
chr5 (23-110)||(43121057-43121144)
chr5 (23-110)||(43124590-43124677)
chr5 (15-158)||(4397581-4397725)
chr5 (15-158)||(26361186-26361329)
chr5 (37-110)||(22880122-22880195)
chr5 (16-134)||(23693331-23693450)
chr5 (15-134)||(16256061-16256181)
chr5 (15-134)||(22589858-22589978)
chr5 (15-134)||(22593413-22593533)
chr5 (15-134)||(22596968-22597088)
chr5 (15-97)||(16259730-16259814)
chr5 (21-202)||(22758719-22758902)
[»] scaffold0525 (2 HSPs)
scaffold0525 (21-213)||(9032-9228)
scaffold0525 (15-158)||(10978-11122)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (53-213)||(20579359-20579520)
chr1 (15-158)||(45307163-45307306)
chr1 (27-158)||(296405-296536)
chr1 (21-212)||(2333021-2333214)
chr1 (15-158)||(20631188-20631332)
chr1 (15-158)||(36181447-36181591)
chr1 (15-158)||(37358344-37358487)
chr1 (23-156)||(24087299-24087432)
chr1 (21-123)||(14432492-14432595)
chr1 (21-210)||(294076-294267)
chr1 (15-134)||(22900379-22900499)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (23-110)||(33047-33134)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (23-110)||(81678-81765)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (21-210)||(8548-8739)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (19-158)||(134072-134211)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (21-209)||(2380-2570)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (53-209)||(162359-162515)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (15-158)||(1572-1716)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (21-114)||(137816-137910)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 16278353 - 16278154
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca 114  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16278353 cataggcaacgacaacgatcttgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccattacttagaaacgacaacttgca 16278254  T
Q  115 -ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 213  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16278253 accttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 16278154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 4170887 - 4171082
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  4170887 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 4170985  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4170986 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatat 4171082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 14698579 - 14698774
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  14698579 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 14698677  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14698678 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatat 14698774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 53387965 - 53387764
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactt 111  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||||||||| |   ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  53387965 cataggcaacgacatcgactgtgcataataacttatgactcactccccaacttggccaacatcaacatcctctgactccgttacttagaa-cgacaactt 53387867  T
Q  112 gca-ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  53387866 gcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgcatgcatacaccaacaatcagtagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 53387767  T
Q  211 tat 213  Q
    |||    
T  53387766 tat 53387764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 41791533 - 41791729
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  41791533 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacctggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 41791631  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41791632 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 41791729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 33848780 - 33848923
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  33848780 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactcgcc 33848879  T
Q  115 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
     ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  33848880 acttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 33848923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 31117272 - 31117185
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31117272 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 31117185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 55502967 - 55502880
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  55502967 acgacaacgattgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 55502880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 286962 - 287106
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  286962 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 287060  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  287061 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 287106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 28382696 - 28382840
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  28382696 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 28382794  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  28382795 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 28382840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 15280330 - 15280187
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||      
T  15280330 cataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccattactta-taacgacaactca 15280232  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    || ||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  15280231 caacttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaatgca 15280187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 47127073 - 47126929
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  47127073 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactctccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 47126975  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  47126974 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 47126929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Original strand, 16359376 - 16359495
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||      
T  16359376 cataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttactta-taacgacaactca 16359474  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaaca 134  Q
    || ||||||||| |||||||||    
T  16359475 caacttacaacc-gaaccaaca 16359495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 56115847 - 56115656
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacc-- 116  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |      
T  56115847 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaactt 56115749  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| |||||||  ||  |||| || | ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  56115748 ttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaaca 56115656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Original strand, 10313587 - 10313683
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  10313587 cataggcaacaacaacgaccgtgtataataactatgactcactcctcaacttggtcaacatcaacaacctatgacttcgttgcttag-aacgacaact 10313683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 17)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 10554294 - 10554492
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgc- 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  10554294 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgca 10554392  T
Q  114 accttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10554393 accttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatccataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatat 10554492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 55292663 - 55292468
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||    
T  55292663 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttggaa-cgacaacttgcaacc 55292565  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  55292564 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatat 55292468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 54973249 - 54973443
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cctt 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  54973249 acgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacctt 54973347  T
Q  119 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54973348 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 54973443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 54975859 - 54976053
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cctt 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  54975859 acgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacctt 54975957  T
Q  119 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54975958 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 54976053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 54978469 - 54978663
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cctt 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  54978469 acgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacctt 54978567  T
Q  119 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  54978568 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 54978663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 16799684 - 16799876
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  16799684 caacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggttaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgtcaacttgcaacc 16799782  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  16799783 ttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcaacatcaaatcatattcaatcaacaacaaca 16799876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15010395 - 15010208
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcaccttac 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||    
T  15010395 acgacaacgaccgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactctcaacttac 15010297  T
Q  121 aacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||  || ||||| |||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  15010296 aactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagcataaaccatcaatcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 15010208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 54046595 - 54046782
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcaccttac 120  Q
    ||||||| || ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  54046595 acgacaatgaccgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaaactatgactccgttacttag-aacgacaactcgcaacttac 54046693  T
Q  121 aacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||  || ||||| ||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  54046694 aactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcagttaagcataaaccaacaatcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 54046782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 603885 - 603698
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcaccttac 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  603885 acgacaacgaccgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcgcaacttac 603787  T
Q  121 aacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||  ||||||||| ||| |||| || |||||||||||  || ||||| |||  |||||| || | ||||||| |||||||||| |||||    
T  603786 aactcgaaccaacaccttatatattctaattgaatgcagttaagcataaacctgcaatcatcaac-aatcataatcaatcaacagcaaca 603698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2035231 - 2035087
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  2035231 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 2035133  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  2035132 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 2035087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2038738 - 2038594
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  2038738 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 2038640  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  2038639 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 2038594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 2042479 - 2042335
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  2042479 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 2042381  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  2042380 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 2042335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 14038049 - 14038193
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14038049 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 14038147  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  14038148 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 14038193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 14041517 - 14041661
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  14041517 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 14041615  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  14041616 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 14041661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Original strand, 39230603 - 39230741
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacctt 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||    
T  39230603 caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcgccactt 39230701  T
Q  119 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  39230702 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 39230741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 18958768 - 18958912
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |    
T  18958768 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactagatcaacatcaacaacctataactacgttacttag-aacgacaactcg 18958866  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||| ||||| | || |||||||||||    
T  18958867 ccacttacaactcgaaccaacatattgtacattctaattgaatgca 18958912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 10989812 - 10989622
Alignment:
Q  22 aacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacc--t 117  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |    
T  10989812 aacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactcctttacttag-aacgacaacttgcaacttt 10989714  T
Q  118 tacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    ||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| |||||||  ||  |||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  10989713 tacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaatcaacaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaaca 10989622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 11)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 6608512 - 6608317
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6608512 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 6608414  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6608413 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 6608317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 45135165 - 45134969
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  45135165 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttacttcccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 45135067  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45135066 ttaccacttgaaccaacatcttgtataattcaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 45134969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7301317 - 7301129
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cctt 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  7301317 acgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggccaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacctt 7301219  T
Q  119 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaaca 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7301218 acaacctgaactaacatcttgtataatctaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcaacagcaaatcatattcaattcaacaaca 7301129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 17795270 - 17795413
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  17795270 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactcgcc 17795369  T
Q  115 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
     ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  17795370 acttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 17795413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 134
Target Start/End: Original strand, 28853836 - 28853943
Alignment:
Q  27 caacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcaccttacaacctg 126  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  |||||||| ||    
T  28853836 caacgatcgtgcatcataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacccgccacttacaacttg 28853935  T
Q  127 aaccaaca 134  Q
    ||||||||    
T  28853936 aaccaaca 28853943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 24708055 - 24707911
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||      
T  24708055 cataggcaacaacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttactta-taatgacaactca 24707957  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    || ||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  24707956 caacttacaacccgaaccaacacattgtatattctaattgaatgca 24707911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22059632 - 22059494
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacctt 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||    
T  22059632 caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcgccactt 22059534  T
Q  119 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |||||  |||| ||||  ||||| |||| |||||||||||    
T  22059533 acaactcgaactaacacattgtacaatctaattgaatgca 22059494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 22145628 - 22145490
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacctt 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||    
T  22145628 caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcgccactt 22145530  T
Q  119 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  22145529 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 22145490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 363829 - 364020
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacc-- 116  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |      
T  363829 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaactt 363927  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| |||||||  ||  |||| || | ||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||    
T  363928 ttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaactagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaaca 364020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 44431902 - 44432093
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacc-- 116  Q
    |||||||||| || |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |      
T  44431902 caacgacaacaattgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacatatgactccgttatttag-aacgacaacttgcaactt 44432000  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||| |  ||  |||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||    
T  44432001 ttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgtagttaaacataaaccatcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacaacaaca 44432093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 101
Target Start/End: Original strand, 17614791 - 17614879
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa 101  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17614791 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttacttagaa 17614879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 13)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21743543 - 21743348
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21743543 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 21743445  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21743444 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatat 21743348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 17506032 - 17505831
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactt 111  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17506032 cataggcaacgacaacgactgtgcagaataacttatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaccctctgactccgttacttagaa-cgacaactt 17505934  T
Q  112 gca-ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17505933 gcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagtagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 17505834  T
Q  211 tat 213  Q
    |||    
T  17505833 tat 17505831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 15 - 213
Target Start/End: Original strand, 17547182 - 17547383
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactt 111  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  17547182 cataggcaacgacaacgactgtgcagaataacttatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaccctctgactccgttacttagaa-cgacaactt 17547280  T
Q  112 gca-ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  17547281 gcaaccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagtagcaaatcatattcaatcaacagcaaca 17547380  T
Q  211 tat 213  Q
    |||    
T  17547381 tat 17547383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 16006279 - 16006475
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  16006279 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacttatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 16006377  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16006378 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 16006475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 21 - 207
Target Start/End: Original strand, 8776224 - 8776414
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8776224 caacgacaacgactgtgaataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 8776322  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaaca 207  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8776323 ttaccacttgaaccaacatcttgtataattcaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaaca 8776414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 17 - 158
Target Start/End: Original strand, 4993361 - 4993502
Alignment:
Q  17 taggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacc 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  4993361 taggcaacgacaacgatcgtgcatattaactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccac 4993460  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  4993461 ttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 4993502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Original strand, 38828109 - 38828302
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgc-acct 117  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  38828109 caaccacaacgatggtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaactt 38828207  T
Q  118 tacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacata 212  Q
    ||||||  ||||| ||| |||||||| || |||||||||||  |||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||| | |||||||    
T  38828208 tacaactcgaacccacaccttgtatattctaattgaatgcagctatgcacaaaccagcagtcagcaacaaatcatattcaatcaatagcaacata 38828302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 124411 - 124324
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  124411 acgacaacgattgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 124324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Original strand, 35366106 - 35366293
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcaccttac 120  Q
    ||||||||||  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||    
T  35366106 acgacaacgactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcaaaacttac 35366204  T
Q  121 aacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||  ||||||||| |||||||| || |||||||||||  || ||||| |||| |||||| || | |||||||||||||||||| |||||    
T  35366205 aactcgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgcaattaagcataaaccagcaatcatcaac-aatcatattcaatcaacagcaaca 35366293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13395712 - 13395568
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  13395712 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 13395614  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  13395613 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 13395568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 13733780 - 13733637
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||      
T  13733780 cataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttactta-taacgacaactca 13733682  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    || ||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  13733681 caacttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaatgca 13733637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 48785185 - 48785329
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  48785185 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 48785283  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  48785284 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 48785329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 21065400 - 21065306
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca 114  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21065400 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgca 21065306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 139; Significance: 7e-73; HSPs: 12)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 20591344 - 20591149
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  20591344 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcagcc 20591246  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20591245 ttacaacctaaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatat 20591149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21239365 - 21239169
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21239365 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 21239267  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21239266 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 21239169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 21241915 - 21241719
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  21241915 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 21241817  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21241816 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 21241719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 24504564 - 24504760
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  24504564 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 24504662  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24504663 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 24504760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 31503463 - 31503656
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cctt 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31503463 acgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacctt 31503561  T
Q  119 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 213  Q
    |||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31503562 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatat 31503656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 23 - 213
Target Start/End: Original strand, 31506029 - 31506222
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cctt 118  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31506029 acgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaatctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacctt 31506127  T
Q  119 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacatat 213  Q
    |||||  |||||||||  ||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31506128 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacagcaacatat 31506222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 23339414 - 23339271
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||     
T  23339414 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactcgcc 23339315  T
Q  115 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
     ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  23339314 acttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 23339271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 23 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 12628129 - 12627942
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcaccttac 120  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  12628129 acgacaacgaccgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcgcaacttac 12628031  T
Q  121 aacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||  ||||||||| |||||||  || |||||||||||  || ||||| |||| |||||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  12628030 aactcgaaccaacaccttgtatgttctaattgaatgcagttaagcataaaccagcaatcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 12627942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 31755818 - 31755905
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31755818 acgacaacgattgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 31755905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 28348948 - 28349139
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacct- 117  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  28348948 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaactt 28349046  T
Q  118 -tacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
     ||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| |||||||  || ||||| |||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||    
T  28349047 ctacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaaccagcaatcagcaac-aatcatattcaatcaacagcaaca 28349139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 21 - 158
Target Start/End: Original strand, 44620806 - 44620944
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacctt 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||    
T  44620806 caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcgccactt 44620904  T
Q  119 acaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  44620905 acaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 44620944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 15 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 41685010 - 41684868
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  41685010 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacgtcaacaacctatgactccgttacctag-aacgacaactcg 41684912  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatg 156  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||    
T  41684911 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatg 41684868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 9)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 8522793 - 8522989
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  8522793 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 8522891  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8522892 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 8522989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 15539148 - 15539340
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataact---cactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||   |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  15539148 caacgacaacgactgtgcataataacttatcacttactccccaacttcgtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 15539246  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  15539247 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaactaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 15539340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 2288158 - 2287966
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    |||||| |||||  ||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  2288158 caacgataacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacaccaacaacctatgactccgttacttagaa-cgtcaacttgcaacc 2288060  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  2288059 ttacaacctgaatcaacatcttgtataatcccatggaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcatcaaatcatattcaatcaacagcaaca 2287966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 15 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 15686360 - 15686183
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactt 111  Q
    |||||||||| ||||| |  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  15686360 cataggcaactacaacaactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctaggactccgttacttagaa-cgacaactt 15686262  T
Q  112 gca-ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaat 189  Q
    ||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15686261 gcaaccttacaaccggcaccaacatcttgtataatccaattgaatgcgtttatgcataaaccaacaatcagcagcaaat 15686183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 210
Target Start/End: Original strand, 16812650 - 16812845
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||      
T  16812650 cataggcaacgacaacgattgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttactta-taacgacaactca 16812748  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||| ||  || | ||| ||||||| ||| || | ||||||| ||||||||||||||||    
T  16812749 caacttacaacccgaaccaacaccttgtatattctaattgaatacagttaagtataaaccaacattcatcaac-aatcataatcaatcaacaacaaca 16812845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 16102215 - 16102359
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  16102215 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 16102313  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  16102314 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 16102359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 16829670 - 16829814
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataact--cactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||      
T  16829670 cataggcaacaacaacgactgtgcacaataactatcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttactta-taacgacaactaa 16829768  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  16829769 caacttacaacccgaaccaacaccttgtatattctaattgaatgca 16829814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 110
Target Start/End: Original strand, 12595829 - 12595925
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12595829 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaact 12595925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 15 - 157
Target Start/End: Original strand, 29492627 - 29492770
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||      
T  29492627 cataggcaacgacaacgaccgtgcacaatgactacgactcactccccaacttggtcaacgtcaacaacttatgactccgttactta-taacgacatctca 29492725  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgc 157  Q
    || ||||||||| ||||| ||| |||||||| || ||||||||||    
T  29492726 caacttacaacccgaacccacaccttgtatattctaattgaatgc 29492770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 136; Significance: 4e-71; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 29325480 - 29325284
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  29325480 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 29325382  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29325381 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 29325284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 26495747 - 26495943
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  26495747 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacttggtcatcatcaacaacctatgactccgttacttagaa-cgacaacttgcaacc 26495845  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26495846 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 26495943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 43121057 - 43121144
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43121057 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 43121144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 43124590 - 43124677
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  43124590 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 43124677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 4397581 - 4397725
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||      
T  4397581 cataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgtttctta-taacgacaactca 4397679  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    || ||||||||| ||||||||| |||||||| || |||||||||||    
T  4397680 caacttacaacccgaaccaacaccttgtatattcgaattgaatgca 4397725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 26361329 - 26361186
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||      
T  26361329 cataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactataactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgtttctta-taacgacaactca 26361231  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    || ||||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  26361230 caacttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaatgca 26361186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 110
Target Start/End: Original strand, 22880122 - 22880195
Alignment:
Q  37 gcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22880122 gcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 22880195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 16 - 134
Target Start/End: Original strand, 23693331 - 23693450
Alignment:
Q  16 ataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgc 113  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||    
T  23693331 ataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactttgttacttag-aacgacaactcgc 23693429  T
Q  114 accttacaacctgaaccaaca 134  Q
      ||||||||  |||||||||    
T  23693430 cacttacaactcgaaccaaca 23693450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 16256181 - 16256061
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |    
T  16256181 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttactt-ggaacgacagctcg 16256083  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaaca 134  Q
    |  ||||||||  |||||||||    
T  16256082 ccacttacaactcgaaccaaca 16256061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22589978 - 22589858
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |    
T  22589978 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttactt-ggaacgacagctcg 22589880  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaaca 134  Q
    |  ||||||||  |||||||||    
T  22589879 ccacttacaactcgaaccaaca 22589858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22593533 - 22593413
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |    
T  22593533 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttactt-ggaacgacagctcg 22593435  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaaca 134  Q
    |  ||||||||  |||||||||    
T  22593434 ccacttacaactcgaaccaaca 22593413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22597088 - 22596968
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |    
T  22597088 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttactt-ggaacgacagctcg 22596990  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaaca 134  Q
    |  ||||||||  |||||||||    
T  22596989 ccacttacaactcgaaccaaca 22596968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16259814 - 16259730
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttactt 97  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16259814 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttactt 16259730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 22758902 - 22758719
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacc-- 116  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||| |      
T  22758902 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctttgactccattacttag-aacgacaacttgcaactt 22758804  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaa 202  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| |||||||  ||  |||| |||| ||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  22758803 ttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaaacataaaccagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaa 22758719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 2)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 21 - 213
Target Start/End: Original strand, 9032 - 9228
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactca---ctcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-cc 116  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| |   || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||    
T  9032 caacgacaacgactgtgcataataacttatgacttactccccaacatggtcaacatcaacaacctatgactcagttacttagaa-cgacaacttgcaacc 9130  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9131 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcgaatcatattcaattcaacaacaacatat 9228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 11122 - 10978
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  11122 cataggcgacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 11024  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  11023 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 10978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 53 - 213
Target Start/End: Original strand, 20579359 - 20579520
Alignment:
Q  53 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca-ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaatt 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20579359 actccccaacttggccaacatcaacaacctatggctccgttacttagaa-cgacaacttgcaaccttacaacccgaaccaacatcttgtataatccaatt 20579457  T
Q  152 gaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaa-tcaacaacaacatat 213  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20579458 gaatgcatttatgcataaaccaacaatcagcagcaaatcatattcaattcaacaacaacatat 20579520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 45307163 - 45307306
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||     
T  45307163 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttggaaacgacaactcgcc 45307262  T
Q  115 ccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
     ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  45307263 acttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 45307306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 158
Target Start/End: Original strand, 296405 - 296536
Alignment:
Q  27 caacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcaccttacaacctg 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  |    
T  296405 caacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaactcgccacttacaactcg 296504  T
Q  127 aaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    ||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  296505 aaccaacacattgtacattctaattgaatgca 296536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 2333214 - 2333021
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgc-acct 117  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |    
T  2333214 caaccacaacgacggtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaactt 2333116  T
Q  118 tacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaacata 212  Q
    ||||||  ||||  ||| |||||||| || |||||||||||  |||||| | |||| || |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||    
T  2333115 tacaactcgaactcacaccttgtatattctaattgaatgcagttatgcacaaaccagcagtcagcaacaaaacatattcaatcaatagcaacata 2333021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 20631188 - 20631332
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  20631188 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 20631286  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  20631287 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 20631332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 36181447 - 36181591
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  36181447 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcg 36181545  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  36181546 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 36181591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 37358344 - 37358487
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||      
T  37358344 cataggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttactta-taacgacaactca 37358442  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    || ||||||||| |||||||||  ||||||| || || ||||||||    
T  37358443 caacttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaactgaatgca 37358487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 156
Target Start/End: Original strand, 24087299 - 24087432
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcaccttac 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  24087299 acgacaacgatcgtgcataataactatgacatactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcgcaacttac 24087397  T
Q  121 aacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatg 156  Q
    || ||  ||||||| |||||||| || |||||||||    
T  24087398 aa-ctcgaccaacaccttgtatattctaattgaatg 24087432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 21 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 14432595 - 14432492
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacctt 118  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||    
T  14432595 caacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaacttgatcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaactcgccactt 14432497  T
Q  119 acaac 123  Q
    |||||    
T  14432496 acaac 14432492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Original strand, 294076 - 294267
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacct- 117  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||     
T  294076 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaactt 294174  T
Q  118 -tacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
     ||||||  ||||  ||| ||||| || || ||| |||||||  || ||||| || | ||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||    
T  294175 ctacaactcgaacttacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaactagcaatcagcaac-aatcatattcaattaacagcaaca 294267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22900499 - 22900379
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |    
T  22900499 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactccccaactcgatcaacatcaaccacctatgactccgttactt-ggaacgacagctcg 22900401  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaaca 134  Q
    |  ||||||||  |||||||||    
T  22900400 ccacttacaactcgaaccaaca 22900379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Original strand, 33047 - 33134
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33047 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 33134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 23 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 81765 - 81678
Alignment:
Q  23 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaact 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  81765 acgacaacgatcgtgcataataactcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactctgttacttagaaacgacaact 81678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 21 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 8739 - 8548
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacc-- 116  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |      
T  8739 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaactt 8641  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaaca 210  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| |||||||  || ||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8640 ttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgcagttaagcataaaccagcaatcagcaac-aatcatattcaatcaacaacaaca 8548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 134211 - 134072
Alignment:
Q  19 ggcaacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacc 116  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||  || |    
T  134211 ggcaacgacaacgaccgtgcacaataactatgactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgtttctta-taacgacaactcacaac 134113  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||| || |||||||||||    
T  134112 ttacaacc-gaaccaacacattgtatattctaattgaatgca 134072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 209
Target Start/End: Original strand, 2380 - 2570
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacc-- 116  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |      
T  2380 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaactt 2478  T
Q  117 ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaac 209  Q
    |||||||  ||||| ||| ||||| || || ||| ||||| |  ||  |||| |||| ||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||    
T  2479 ttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaatggaatgtagttaaacataaaccagcaatcagcaac-aatcatactcaatcaacagcaac 2570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 56; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 209
Target Start/End: Original strand, 162359 - 162515
Alignment:
Q  53 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgcacc--ttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaat 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |  |||||||  ||||| ||| ||||| || || |||    
T  162359 actccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttag-aacgacaacttgcaacttttacaactcgaacctacaccttgtgtattctaat 162457  T
Q  151 tgaatgcatgtatgcatacaccaacaatcagcagcaaatcatattcaatcaacaacaac 209  Q
     |||||||  ||  |||| || | ||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||    
T  162458 ggaatgcagttaaacataaactagcaatcagcaac-aatcataatcaatcaacagcaac 162515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 158
Target Start/End: Original strand, 1572 - 1716
Alignment:
Q  15 cataggcaacgacaacgatcgtgcataataac--tcactcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttg 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||||| |||| | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |    
T  1572 cataggcaacgacaacgaccgtgcataataactatgactcactcccaaactcgatcaacatcacccacctaagactccgttacttag-aacgacaactcg 1670  T
Q  113 caccttacaacctgaaccaacatcttgtataatccaattgaatgca 158  Q
    |  ||||||||  |||||||||  ||||| | || |||||||||||    
T  1671 ccacttacaactcgaaccaacacattgtacattctaattgaatgca 1716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Original strand, 137816 - 137910
Alignment:
Q  21 caacgacaacgatcgtgcataataactc--actcactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccgttacttagaaacgacaacttgca 114  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  137816 caacgacaacaactgtgcataataactatgacttactccccaacttggtcaacatcaacaacctatgactccattacttag-aacgacaacttgca 137910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University