View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11777_low_3 (Length: 376)

Name: NF11777_low_3
Description: NF11777
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11777_low_3
NF11777_low_3
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (15-366)||(33970-34321)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (15-366)||(7341240-7341591)
chr8 (15-366)||(32377457-32377808)
chr8 (15-366)||(32431414-32431765)
chr8 (15-363)||(30304159-30304507)
chr8 (15-366)||(8422405-8422756)
chr8 (15-363)||(35965294-35965642)
chr8 (15-363)||(43370931-43371279)
chr8 (26-363)||(43688731-43689068)
chr8 (15-359)||(2145548-2145897)
chr8 (20-361)||(45455542-45455883)
chr8 (15-363)||(7169064-7169403)
chr8 (15-294)||(22581061-22581340)
chr8 (191-363)||(1115936-1116108)
chr8 (210-363)||(39751772-39751925)
chr8 (32-192)||(45116582-45116742)
chr8 (31-192)||(44321173-44321334)
chr8 (52-226)||(14401359-14401532)
chr8 (49-197)||(17316787-17316935)
chr8 (88-171)||(13781580-13781663)
[»] chr7 (23 HSPs)
chr7 (15-366)||(43622684-43623035)
chr7 (15-366)||(30787700-30788051)
chr7 (15-366)||(45764540-45764891)
chr7 (15-366)||(617298-617649)
chr7 (15-363)||(18106552-18106900)
chr7 (15-363)||(42500571-42500919)
chr7 (15-363)||(47062047-47062395)
chr7 (15-254)||(15067162-15067401)
chr7 (20-363)||(43827160-43827503)
chr7 (107-363)||(8400750-8401006)
chr7 (250-363)||(15060777-15060890)
chr7 (15-135)||(12116918-12117038)
chr7 (33-217)||(16795663-16795847)
chr7 (32-192)||(1297321-1297481)
chr7 (31-192)||(40445130-40445291)
chr7 (32-192)||(47867065-47867225)
chr7 (32-192)||(16794179-16794339)
chr7 (32-192)||(43378874-43379034)
chr7 (32-192)||(40794258-40794418)
chr7 (32-192)||(45172475-45172635)
chr7 (48-192)||(46791660-46791804)
chr7 (32-205)||(8193845-8194019)
chr7 (48-278)||(3762154-3762384)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (15-366)||(49565013-49565364)
chr4 (15-363)||(19072206-19072554)
chr4 (15-363)||(9891186-9891534)
chr4 (15-363)||(3404954-3405302)
chr4 (15-363)||(41024363-41024711)
chr4 (20-363)||(4769298-4769641)
chr4 (15-363)||(4976919-4977267)
chr4 (15-363)||(38463386-38463734)
chr4 (15-363)||(44049774-44050122)
chr4 (20-363)||(11502670-11503013)
chr4 (15-363)||(21471958-21472306)
chr4 (15-363)||(4978507-4978851)
chr4 (179-363)||(51643211-51643395)
chr4 (31-330)||(6182875-6183174)
chr4 (252-363)||(18580117-18580225)
chr4 (33-192)||(32716628-32716787)
chr4 (32-165)||(4617919-4618052)
chr4 (32-192)||(1591168-1591328)
chr4 (32-192)||(17916521-17916681)
chr4 (32-192)||(46517000-46517160)
chr4 (31-157)||(17496893-17497019)
chr4 (32-209)||(13897349-13897526)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (15-366)||(3949904-3950255)
chr3 (15-363)||(6742051-6742399)
chr3 (15-366)||(8159532-8159883)
chr3 (15-366)||(30946191-30946542)
chr3 (15-363)||(13746270-13746618)
chr3 (15-363)||(16445784-16446132)
chr3 (15-363)||(36816065-36816413)
chr3 (20-363)||(14399719-14400063)
chr3 (15-361)||(46991795-46992141)
chr3 (15-363)||(48249415-48249764)
chr3 (23-363)||(7841573-7841912)
chr3 (15-361)||(77569-77915)
chr3 (15-363)||(6504504-6504852)
chr3 (15-363)||(21954788-21955135)
chr3 (21-363)||(7838760-7839102)
chr3 (143-363)||(9428510-9428730)
chr3 (15-319)||(29949193-29949496)
chr3 (15-319)||(29998347-29998650)
chr3 (79-319)||(29908027-29908266)
chr3 (20-168)||(28610473-28610621)
chr3 (33-185)||(9556331-9556483)
chr3 (31-192)||(51548098-51548259)
chr3 (32-192)||(2284623-2284783)
chr3 (32-192)||(4120360-4120520)
chr3 (32-192)||(33940190-33940350)
chr3 (32-192)||(40467774-40467934)
chr3 (32-192)||(12491422-12491582)
chr3 (315-363)||(29930532-29930580)
chr3 (315-363)||(29979686-29979734)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (15-366)||(211990-212341)
chr2 (15-366)||(5348328-5348679)
chr2 (15-366)||(41561173-41561524)
chr2 (15-366)||(10623003-10623354)
chr2 (15-363)||(27274909-27275257)
chr2 (15-365)||(38946925-38947275)
chr2 (15-363)||(39795134-39795482)
chr2 (15-363)||(3802115-3802463)
chr2 (15-363)||(24750822-24751171)
chr2 (15-363)||(1098375-1098723)
chr2 (15-363)||(24604638-24604986)
chr2 (15-361)||(45476524-45476869)
chr2 (15-363)||(12907041-12907389)
chr2 (15-363)||(43948831-43949179)
chr2 (15-363)||(34920331-34920679)
chr2 (15-363)||(41007529-41007877)
chr2 (15-363)||(436475-436824)
chr2 (22-363)||(9655320-9655661)
chr2 (15-278)||(7264229-7264492)
chr2 (15-363)||(11692379-11692712)
chr2 (15-363)||(17996721-17997069)
chr2 (113-363)||(28354549-28354799)
chr2 (15-170)||(24941199-24941354)
chr2 (53-217)||(28423061-28423225)
chr2 (32-209)||(21535507-21535678)
chr2 (79-170)||(3353894-3353985)
chr2 (325-363)||(7264196-7264234)
[»] chr1 (31 HSPs)
chr1 (15-366)||(3947010-3947361)
chr1 (15-366)||(3984274-3984625)
chr1 (15-366)||(44466743-44467094)
chr1 (15-366)||(20350617-20350968)
chr1 (15-366)||(38774664-38775015)
chr1 (15-363)||(29355237-29355585)
chr1 (15-363)||(5079099-5079447)
chr1 (15-363)||(13630580-13630928)
chr1 (15-363)||(41455001-41455349)
chr1 (15-363)||(12649128-12649476)
chr1 (15-363)||(37016078-37016426)
chr1 (20-363)||(50116317-50116660)
chr1 (15-363)||(38691488-38691836)
chr1 (20-363)||(46974328-46974671)
chr1 (15-363)||(13174945-13175293)
chr1 (15-363)||(51663422-51663770)
chr1 (71-363)||(21942969-21943261)
chr1 (15-280)||(19498013-19498277)
chr1 (20-356)||(32106208-32106533)
chr1 (268-363)||(44619905-44620000)
chr1 (202-356)||(26466006-26466160)
chr1 (32-192)||(36360086-36360246)
chr1 (32-192)||(45472687-45472847)
chr1 (32-192)||(7403953-7404115)
chr1 (36-192)||(28863225-28863381)
chr1 (32-165)||(27283402-27283535)
chr1 (32-192)||(18887360-18887520)
chr1 (322-363)||(7980068-7980109)
chr1 (80-165)||(20240037-20240122)
chr1 (174-271)||(25231558-25231655)
chr1 (82-190)||(31445866-31445974)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (15-363)||(2045-2393)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (15-366)||(1611300-1611651)
chr6 (15-363)||(31147486-31147834)
chr6 (15-288)||(28357557-28357830)
chr6 (15-363)||(29287502-29287845)
chr6 (15-363)||(18607160-18607508)
chr6 (15-363)||(21357899-21358244)
chr6 (15-363)||(23961881-23962226)
chr6 (289-363)||(28251060-28251134)
chr6 (32-192)||(9095463-9095623)
chr6 (287-363)||(24220332-24220408)
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (15-363)||(37819426-37819774)
chr5 (15-363)||(11032001-11032349)
chr5 (15-363)||(38858739-38859087)
chr5 (15-363)||(28884957-28885305)
chr5 (15-363)||(7020429-7020777)
chr5 (15-363)||(34078944-34079292)
chr5 (15-363)||(27866394-27866742)
chr5 (15-363)||(1036515-1036863)
chr5 (15-363)||(7799555-7799903)
chr5 (15-363)||(18536885-18537233)
chr5 (15-363)||(4202488-4202836)
chr5 (15-363)||(13566656-13566988)
chr5 (15-363)||(25895646-25895998)
chr5 (15-356)||(20287439-20287781)
chr5 (125-356)||(20286180-20286410)
chr5 (32-192)||(11819551-11819711)
chr5 (32-192)||(27013235-27013395)
chr5 (32-192)||(42343826-42343985)
chr5 (32-192)||(6553124-6553284)
chr5 (32-192)||(43295549-43295709)
chr5 (112-217)||(25053043-25053148)
[»] scaffold0341 (1 HSPs)
scaffold0341 (15-363)||(15906-16254)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (15-363)||(17233-17581)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (210-363)||(12426-12580)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (15-123)||(25495-25603)
[»] scaffold0340 (1 HSPs)
scaffold0340 (20-116)||(4-100)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (32-192)||(28452-28612)
[»] scaffold0325 (1 HSPs)
scaffold0325 (48-165)||(4198-4315)


Alignment Details
Target: scaffold0101 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 34321 - 33970
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34321 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 34222  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34221 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 34122  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34121 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 34022  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34021 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 33970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 7341591 - 7341240
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341591 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 7341492  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341491 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 7341392  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341391 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 7341292  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7341291 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 7341240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 32377457 - 32377808
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377457 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 32377556  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377557 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 32377656  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377657 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 32377756  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32377757 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 32377808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 32431414 - 32431765
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431414 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 32431513  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431514 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 32431613  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431614 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 32431713  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32431714 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 32431765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 30304159 - 30304507
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304159 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 30304258  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304259 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 30304358  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304359 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 30304458  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30304459 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 30304507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 8422405 - 8422756
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422405 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 8422504  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422505 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatataatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 8422604  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422605 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 8422704  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8422705 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 8422756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 35965294 - 35965642
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35965294 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaatcgaatatgtcaaatcggtcgaagggaccccaactacctcaaatattggcatcctgtacatgtt 35965393  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||| |||||    
T  35965394 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaactgtagtactt 35965493  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35965494 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 35965593  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35965594 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 35965642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 43371279 - 43370931
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||    
T  43371279 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacgttgacatcctgtacatgtt 43371180  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  43371179 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 43371080  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  43371079 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagctgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcagctctatttgccttccatattt 43370980  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43370979 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 43370931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 26 - 363
Target Start/End: Original strand, 43688731 - 43689068
Alignment:
Q  26 tcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacg 125  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| |    
T  43688731 tcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtagg 43688830  T
Q  126 tggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||| ||  || ||||||||  ||||||    
T  43688831 tggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggattttggatgagcccaaaagatatcttcgattatagtactttcactttgtgt 43688930  T
Q  226 tcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttca 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43688931 tcttgagtaataagtatagttgtgctcccccaacttcgaaattagaaattgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatatttgttgacgttca 43689030  T
Q  326 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43689031 ttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 43689068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 359
Target Start/End: Original strand, 2145548 - 2145897
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2145548 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgtt 2145647  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  2145648 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 2145747  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccc-----tatttgccttcca 309  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |     |||||||||||||    
T  2145748 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacaacttcttgtcacctctattatatttgccttcca 2145847  T
Q  310 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 359  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2145848 tatttgttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtg 2145897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 45455883 - 45455542
Alignment:
Q  20 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 119  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  45455883 tctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccaaatatgtcaaatcgatcgaagtgatcccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttt 45455784  T
Q  120 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 219  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||  || ||  ||||||||      
T  45455783 tgttggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaaattttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaaaatatatttgattgtggtactttcact 45455684  T
Q  220 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 319  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  45455683 ttgtgctcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggctttttgtcacctctatttgcctttcatatttgttga 45455584  T
Q  320 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 361  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45455583 cgttgattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatatggt 45455542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7169403 - 7169064
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | || |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  7169403 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccctaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 7169304  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  7169303 ggttttgtaggtggagttcataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 7169204  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| | |||||||||         |||| |||||||||||||||||||    
T  7169203 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcatccaactttgagattatatattgcaacg---------cacctctatttgccttccatattt 7169113  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7169112 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatggaatgtggtct 7169064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 15 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22581340 - 22581061
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  22581340 tttcctctttctcatgtgtcgcaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattgacatcttgtacatgtt 22581241  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||| || ||| |||||    
T  22581240 ggttttgcaggtggagtccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatattttcgattgtagtactt 22581141  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacc 294  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  22581140 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggattcttgtcacc 22581061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 191 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1116108 - 1115936
Alignment:
Q  191 aaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 290  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1116108 aaaacatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgt 1116009  T
Q  291 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1116008 cacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacatttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtct 1115936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 210 - 363
Target Start/End: Original strand, 39751772 - 39751925
Alignment:
Q  210 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttcca 309  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||    
T  39751772 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtgaagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaatggtttcttgtcacctctatttgccttcca 39751871  T
Q  310 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39751872 tatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 39751925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45116742 - 45116582
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  45116742 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 45116643  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45116642 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45116582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 44321334 - 44321173
Alignment:
Q  31 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 130  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| |  ||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  44321334 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtaactccaactatttcaaacaataacattctatacaagttggttttgtacgtggaa 44321235  T
Q  131 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  44321234 tccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 44321173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 52 - 226
Target Start/End: Original strand, 14401359 - 14401532
Alignment:
Q  52 cgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttgga 151  Q
    ||||||||||| ||| ||||| || | |||||||| |||||||| || |||||||||| ||||||| || || ||| |||| || | ||||||  | | |    
T  14401359 cgaatatgtcatatcagttgaggtgaccccaactatctcaaacaatgacatcctatacgtgttggttttataggtgaagtcgatgaacaaaactatcgaa 14401458  T
Q  152 aaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgtt 226  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||   |||||||||||||| ||||| | ||||||| ||||||||  |||||||    
T  14401459 aaattattaaacaacttaacagattcaggatgagcccaaaatatatcatgaatagta-tactttcacattgtgtt 14401532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 17316935 - 17316787
Alignment:
Q  49 aaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgtt 148  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  | ||  |||||| |||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||| ||| | | ||| | |||||| ||     
T  17316935 aaccgaatatgtcatatcagttgagttgatttcaactatctcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtatgtgaaattcatgatcaaaacagtc 17316836  T
Q  149 ggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatat 197  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||  ||| ||||| ||||||||||    
T  17316835 ggaaaattgttaaacaacttaaatgattgtgggtgagctcaaaaaatat 17316787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 171
Target Start/End: Original strand, 13781580 - 13781663
Alignment:
Q  88 ctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaat 171  Q
    ||||||||  ||||| | ||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| |||| | |||||||||    
T  13781580 ctcaaacaacggcattcgatagatgttggttttgtaagtggagtccatgaccaaaacggtcggaaaagtgttgagcaatttaat 13781663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 23)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 43622684 - 43623035
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622684 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 43622783  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622784 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 43622883  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622884 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 43622983  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43622984 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 43623035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 30788051 - 30787700
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30788051 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 30787952  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30787951 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 30787852  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30787851 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgctttccatattt 30787752  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30787751 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtatctg 30787700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 45764891 - 45764540
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45764891 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgct 45764792  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764791 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 45764692  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45764691 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 45764592  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45764591 gttgacgttcattgtacacttgcttcgcatttgtcatgcaatgtggtctctg 45764540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 617298 - 617649
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617298 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 617397  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617398 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaatcgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 617497  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617498 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatattt 617597  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  617598 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 617649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18106900 - 18106552
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18106900 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattagcatcctatacatgtt 18106801  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106800 ggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 18106701  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106700 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 18106601  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18106600 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 18106552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 42500919 - 42500571
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500919 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 42500820  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500819 ggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 42500720  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500719 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 42500620  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42500619 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 42500571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 47062395 - 47062047
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  47062395 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatttt 47062296  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| |||||    
T  47062295 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaattttttaaacaacttaacggatgttggatgagcccgaaagatatcttcaattgtagtactt 47062196  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtc-acccctatttgccttccatatt 313  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  47062195 tcactttgtgtt-ttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcaacctctatttgccttccatatt 47062097  T
Q  314 tgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47062096 tgttgacgttcatcgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 47062047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 15 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 15067401 - 15067162
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067401 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 15067302  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067301 ggttttgtatgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 15067202  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 254  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15067201 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcct 15067162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 363
Target Start/End: Original strand, 43827160 - 43827503
Alignment:
Q  20 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaa-gtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtc 118  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | || |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||     
T  43827160 tctttctcatatgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaaagtgacccaaactacctcaaacattggcatcttgtacacgttggtt 43827259  T
Q  119 ttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaa 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||     
T  43827260 ttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatattttcaattgtagtactttcac 43827359  T
Q  219 gttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttg 318  Q
     ||||||||||| | ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  43827360 tttgtgttcttgtgaaataagtatagttgtgctcattcaacttcgaga-tagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgctg 43827458  T
Q  319 acgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  43827459 acgttcattgtacacttgcttgatatttgtcatgcaatgtggtct 43827503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 107 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 8401006 - 8400750
Alignment:
Q  107 tacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatag 206  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8401006 tacatgttggttttgtaggtgaaatccataaccaaaaccgttagaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaaaatatctttaattg 8400907  T
Q  207 tattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcctt 306  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| |||||||||||    
T  8400906 tagtactttcactttgtgttcttgagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgccgtcttgtcacctctatttgcctt 8400807  T
Q  307 ccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||    
T  8400806 ccatatttgttgacgttcaatgtacacttgcttgatatttgtcatccaatgtggtct 8400750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 250 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 15060890 - 15060777
Alignment:
Q  250 ctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 349  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15060890 ctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtc 15060791  T
Q  350 atgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||    
T  15060790 atgcaatgtggtct 15060777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 135
Target Start/End: Original strand, 12116918 - 12117038
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12116918 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggccgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 12117017  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccat 135  Q
    ||| ||||| |||||||||||    
T  12117018 ggttttgtaggtggagtccat 12117038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 217
Target Start/End: Original strand, 16795663 - 16795847
Alignment:
Q  33 tcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtc 132  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||  ||||||| ||||||| | |||| ||| || |||||| |||| ||    
T  16795663 tcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaagtgagttcaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacatggaatc 16795762  T
Q  133 cataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttca 217  Q
    ||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |  |||| || ||| |||||||||    
T  16795763 cattatcaaaacagttggaaaattgttaaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaataagtcttgaacagttttactttca 16795847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1297481 - 1297321
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    |||||||  ||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  1297481 gtcataaatgaaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtggctccaactatttcaaaaaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 1297382  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  1297381 ccattatcaaaacagttggaaaaatgttaaacaactttatcgatgttggatgagtccaaaa 1297321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 40445130 - 40445291
Alignment:
Q  31 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 130  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||     
T  40445130 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacatggaa 40445229  T
Q  131 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    ||||| | |||||| ||  ||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40445230 tccattatcaaaacagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40445291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 47867065 - 47867225
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  47867065 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggagt 47867164  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||| | ||  ||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  47867165 ccattatcaaagcagtcagaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 47867225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 16794179 - 16794339
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| ||||||| | |||| ||| || ||||||||||| |    
T  16794179 gtcataaatgaaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagtttgttttgtacgtggaat 16794278  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  |||||| |||||| ||||||    
T  16794279 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttactgatgtttgatgagtccaaaa 16794339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 43378874 - 43379034
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| || || |  |||||||  ||||||| | | |||||||||| |||||| ||||| ||||| |    
T  43378874 gtcataaatgcaaaatcaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatagaatcctatacaagttggttttgtatgtggaat 43378973  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  43378974 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43379034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 40794418 - 40794258
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  | ||||| |||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |    
T  40794418 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttaaaacaatggcattctatacaagttgattttgtacgtggaat 40794319  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    ||||   |||||  || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40794318 ccattctcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40794258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 45172475 - 45172635
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| ||| ||||| |  | |||||  ||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  45172475 gtcataaatgcaaaatcaactgaatatgtcaaataggtcgaagtgactcaaactatttcaaataatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 45172574  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    | || | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45172575 caattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45172635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 48 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 46791804 - 46791660
Alignment:
Q  48 caaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgt 147  Q
    |||||||||||||||||| ||| || || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| ||| || ||||||||||| ||||| | |||||| ||    
T  46791804 caaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttagttttgtacgtggaatccattatcaaaacagt 46791705  T
Q  148 tggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
     |||||| ||||||| || || |  ||||||||||||| ||||||    
T  46791704 cggaaaagtgttaaataactttactgatgttggatgagtccaaaa 46791660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 205
Target Start/End: Original strand, 8193845 - 8194019
Alignment:
Q  32 gtcataaat-ccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 130  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||||||| ||  ||||| || |  | |||||  ||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||||     
T  8193845 gtcataaatgcctaaccaaaccgaatatgtcatattagttgaggtgactctaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaa 8193944  T
Q  131 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaata 205  Q
    | ||| | |||||| || |||||||| |||||||| || |   |||||||||||| |||||| || |||| ||||    
T  8193945 tgcattatcaaaacagtcggaaaattattaaacaactttaccaatgttggatgagtccaaaatatgtcttgaata 8194019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 48 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 3762384 - 3762154
Alignment:
Q  48 caaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgt 147  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||| || | ||||| || |||||||| | ||||| | |||| |||||| || || ||||||||||| | ||||||  |    
T  3762384 caaccgaatatttcatatcggttgaggtgaacccaattatctcaaacaattgcatcatgtacaagttggttttataggtggagtccatgatcaaaacttt 3762285  T
Q  148 tggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttg 247  Q
      | |||| ||||||||| ||||  |||   | |||||||||||| || || | |||||||  ||| |||  ||||||||||| | |||||  ||| |||    
T  3762284 caggaaatcgttaaacaacttaaccgattcggaatgagcccaaaatatgtcctgaatagtagaactctcacattgtgttcttgtgaaataaacatatttg 3762185  T
Q  248 tgctcctccaacttcgagattagaaattgca 278  Q
    | ||| |||||||| || | |||||| ||||    
T  3762184 tactcttccaactttgacactagaaactgca 3762154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 49565013 - 49565364
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565013 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 49565112  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565113 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 49565212  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565213 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 49565312  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49565313 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 49565364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 19072206 - 19072554
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072206 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 19072305  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072306 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 19072405  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072406 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 19072505  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19072506 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 19072554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9891534 - 9891186
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891534 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 9891435  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891434 ggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagtccaaaaaatatcttcaatagtattactt 9891335  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891334 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 9891235  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9891234 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 9891186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 3405302 - 3404954
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405302 tttcttctttctcatgtgccataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 3405203  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405202 ggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 3405103  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3405102 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 3405003  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3405002 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtct 3404954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41024711 - 41024363
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41024711 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaaccacctcaaacattggcctcctatacatgtt 41024612  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024611 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 41024512  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024511 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacgactttttgtcacccctatttgccttccatattt 41024412  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41024411 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 41024363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4769641 - 4769298
Alignment:
Q  20 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |    
T  4769641 tctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattgacatcttgtacatgttggttt 4769542  T
Q  120 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  4769541 tgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 4769442  T
Q  220 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  4769441 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatcagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgtaga 4769342  T
Q  320 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4769341 cattcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 4769298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 4977267 - 4976919
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4977267 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcatgtacatgtt 4977168  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  4977167 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 4977068  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  4977067 tcactttgtgctctttagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgcattccatattt 4976968  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4976967 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 4976919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 38463386 - 38463734
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  38463386 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgactccaactacctcaaacattagcatcttgtacatgtt 38463485  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  38463486 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 38463585  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  38463586 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccgtattt 38463685  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  38463686 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcagtgtggtct 38463734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 44050122 - 44049774
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44050122 tttcctctttctcatgtgtcacaaatttaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgtt 44050023  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| || ||    
T  44050022 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtagtt 44049923  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44049922 tcactttgtgttattgagtaataagtatagctgcgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 44049823  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44049822 gttgacgttcgttgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 44049774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 11503013 - 11502670
Alignment:
Q  20 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 119  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  11503013 tctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttt 11502914  T
Q  120 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||       
T  11502913 tgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgtttgatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttctct 11502814  T
Q  220 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  11502813 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcttccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccatatttgttga 11502714  T
Q  320 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11502713 cgttcattgtttacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtct 11502670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 21472306 - 21471958
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21472306 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 21472207  T
Q  115 ggtctt-gtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattact 213  Q
    ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||  ||  || ||||    
T  21472206 ggtgtttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatctttgattttagtact 21472107  T
Q  214 ttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatt 313  Q
    ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21472106 ttcactttgtgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaaatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatt 21472007  T
Q  314 tgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||    
T  21472006 tgttgacgttcattgtacacttgcttcacattt-ttatccaatgtggtct 21471958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 4978507 - 4978851
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | || ||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  4978507 tttcctctttctcatgtatcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccctaactacctcaaacattgacatcatgtacatgtt 4978606  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  || |||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  4978607 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttcgaaaattgttaaacaacttaacagacgttggaagagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 4978706  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  4978707 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacggcttcttgtcacc----tttgccttccatattt 4978802  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4978803 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 4978851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 179 - 363
Target Start/End: Original strand, 51643211 - 51643395
Alignment:
Q  179 ggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 278  Q
    |||||||||||||| |||||||  || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51643211 ggatgagcccaaaagatatctttgattgtagtactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgca 51643310  T
Q  279 acggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51643311 acggcgtcttgtcaactctatttgccttccatatttgttgacgttcatcgtacacttgctttacatttgtcatgcaatgtggtct 51643395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6183174 - 6182875
Alignment:
Q  31 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 130  Q
    ||||| ||||||||| |||||  ||| |||||||||||| ||  | | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||  |||||    
T  6183174 tgtcaaaaatccaaaaccaactaaatttgtcaaatcggtcgagatgaccccaactatctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttgtagatggag 6183075  T
Q  131 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttg 230  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||||| | |    
T  6183074 ttcataatcaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaatatgtcttgaatagtagtactttcaatttgtgttatgg 6182975  T
Q  231 agtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgta 330  Q
     | |||||  ||||||||| |||||||| || ||||||||| |||||| |  | |||||||||| || |||| |||  |||||| |||| ||||||||||    
T  6182974 tgaaataaacatagttgtgttcctccaattttgagattagatattgcatcaccgtcttgtcacctctgtttgacttgaatattttttgatgttcattgta 6182875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 252 - 363
Target Start/End: Original strand, 18580117 - 18580225
Alignment:
Q  252 cctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 351  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18580117 cctcaaacttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcacctctatttg---tccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcat 18580213  T
Q  352 gcaatgtggtct 363  Q
    |||||| |||||    
T  18580214 gcaatgaggtct 18580225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 33 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 32716787 - 32716628
Alignment:
Q  33 tcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtc 132  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||    
T  32716787 tcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaatc 32716688  T
Q  133 cataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    ||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  32716687 cattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 32716628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4618052 - 4617919
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||||| || |  |||||||  ||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  4618052 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataagttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcgtcctatacaagttggttttgtacgtggaat 4617953  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 165  Q
    |||| | |||||| || |||||||||||||||||    
T  4617952 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaa 4617919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 1591328 - 1591168
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    |||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| || |||||||| |    
T  1591328 gtcacaaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttctacgtggaat 1591229  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || | ||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  1591228 ccattatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 1591168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 17916681 - 17916521
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | || |  |||||||  ||||||| |||||| |||||||   |||| ||||||||| | |    
T  17916681 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaatgggttaaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaaaatggttttgtacgtgaaat 17916582  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  17916581 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 17916521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 46517000 - 46517160
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| ||    |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||| | |||| |||||| |    
T  46517000 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgtctccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttgattttgttcgtggaat 46517099  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
     ||| | |||||| || ||||||  ||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  46517100 tcattatcaaaacagtcggaaaaacgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 46517160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 17497019 - 17496893
Alignment:
Q  31 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 130  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| |||||| || |  |||||||  ||||||| || |||| ||||||  ||||| |||||||||||     
T  17497019 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtctaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcttatacaaattggttttgtacgtggaa 17496920  T
Q  131 tccataaccaaaaccgttggaaaattg 157  Q
    ||||| | |||||  || |||||||||    
T  17496919 tccattatcaaaatagtcggaaaattg 17496893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Original strand, 13897349 - 13897526
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||| || |  ||||||| |||||||| || |||| | |||| |||||| || |||| ||| |    
T  13897349 gtcataaattcaaaacccaccgaatatgtcatatcgggtgaggtgactccaactatctcaaacaatgacatcatgtacaagttggttttctacgaggaat 13897448  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtat 209  Q
    |||| | |||||| || |  |||||||||||||| ||||  |||  ||||||| ||||||| || | || ||||||||    
T  13897449 ccatgatcaaaacagtcgagaaattgttaaacaacttaaccgattctggatgaccccaaaatatgtattgaatagtat 13897526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3950255 - 3949904
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950255 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 3950156  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950155 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 3950056  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950055 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 3949956  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3949955 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 3949904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 6742399 - 6742051
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742399 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 6742300  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742299 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 6742200  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742199 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 6742100  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6742099 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 6742051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 8159532 - 8159883
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159532 tttcttctttctcgtgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 8159631  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159632 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 8159731  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159732 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 8159831  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8159832 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 8159883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 30946191 - 30946542
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946191 tttcttctttcgcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 30946290  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946291 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 30946390  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946391 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 30946490  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30946491 gttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 30946542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 13746270 - 13746618
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746270 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 13746369  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746370 ggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 13746469  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746470 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 13746569  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13746570 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13746618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 16446132 - 16445784
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16446132 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 16446033  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16446032 ggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagtattactt 16445933  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445932 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 16445833  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16445832 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 16445784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 297; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 36816065 - 36816413
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816065 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 36816164  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  36816165 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtattactt 36816264  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36816265 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 36816364  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36816365 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 36816413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 14400063 - 14399719
Alignment:
Q  20 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatccc-aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtc 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  14400063 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtt 14399964  T
Q  119 ttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaa 218  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||     
T  14399963 ttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcac 14399864  T
Q  219 gttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttg 318  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14399863 tttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaaattcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttg 14399764  T
Q  319 acgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14399763 acgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 14399719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 46991795 - 46992141
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46991795 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 46991894  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  46991895 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 46991994  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  46991995 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacataaagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccatattt 46992094  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  46992095 gttgacgttcattgtacacttgcttcatatttgtcatgcaatgtggt 46992141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 48249415 - 48249764
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatccc-aactacctcaaacattggcatcctatacatgt 113  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249415 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaactcaaccgaatatgtcaaattggtcaaagtgacccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgt 48249514  T
Q  114 tggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattact 213  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||    
T  48249515 tggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtact 48249614  T
Q  214 ttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatt 313  Q
    ||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48249615 ttcactttgtgttcttgagtgataagtatagttgtgctcatccaacatagagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatt 48249714  T
Q  314 tgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48249715 tgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 48249764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 23 - 363
Target Start/End: Original strand, 7841573 - 7841912
Alignment:
Q  23 ttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgt 122  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  7841573 ttctcatgtgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaatcggtctaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctctacatgttggttttgt 7841672  T
Q  123 acgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttg 222  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||    
T  7841673 aggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgaacccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttg 7841772  T
Q  223 tgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgt 322  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  7841773 tgttcttgagtaataagt-tagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatgt 7841871  T
Q  323 tcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7841872 tcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7841912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Original strand, 77569 - 77915
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  77569 tttcctctttctcatgtgtcaaaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattgacatcttgtacatgtt 77668  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  77669 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacaaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgatggtagtactt 77768  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  77769 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgcctttcatattt 77868  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  77869 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 77915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 6504504 - 6504852
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6504504 tttcctcttcctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcatcctgtacatgtt 6504603  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    |||  |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  6504604 ggttatgtaggtggagtccataaccaaaacggttggaaaattgttaaaaaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 6504703  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  6504704 tcactttgtgttcttgagtaataagaatagttgtgctcctccaacttcgaggttagatattgcaacggcttcttgtcacctctatgtgccttccatattt 6504803  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6504804 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 6504852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 21954788 - 21955135
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21954788 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaatcgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaatattggcatcctgtacatgtt 21954887  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||  |||||    
T  21954888 cgttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaggtatcttcgattgtggtactt 21954987  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21954988 tcactttgttttcttgagaaataagtatagttgtggtcctccaacttcgagatta-atattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 21955086  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21955087 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 21955135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 21 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7839102 - 7838760
Alignment:
Q  21 ctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtctt 120  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||    
T  7839102 ctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggtttt 7839003  T
Q  121 gtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagt 220  Q
    ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |    
T  7839002 gtaggtggagtccatgaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgtcggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactt 7838903  T
Q  221 tgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgac 320  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7838902 tatgttcttaagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcaagattagatattgcaacggcttcttgccacctctatttgccttccatatttgttgac 7838803  T
Q  321 gttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7838802 gttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7838760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 143 - 363
Target Start/End: Original strand, 9428510 - 9428730
Alignment:
Q  143 accgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 242  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428510 accgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtat 9428609  T
Q  243 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 342  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9428610 agttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcac 9428709  T
Q  343 atttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  9428710 atttgtcatgcaatgtggtct 9428730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29949496 - 29949193
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29949496 tttcctctttctcatgtgtctcaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 29949397  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  29949396 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactactt 29949297  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29949296 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatattt 29949198  T
Q  315 gttga 319  Q
    |||||    
T  29949197 gttga 29949193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29998650 - 29998347
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  29998650 tttcctctttctcatgtgtctcaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 29998551  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  29998550 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactactt 29998451  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29998450 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatattt 29998352  T
Q  315 gttga 319  Q
    |||||    
T  29998351 gttga 29998347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 79 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 29908266 - 29908027
Alignment:
Q  79 cccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgtt 178  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  29908266 cccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgtt 29908167  T
Q  179 ggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 278  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||    
T  29908166 ggatgagcccaaaagatatcttcgattgtactactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgct-ctctaacttcgagattagatattgca 29908068  T
Q  279 acggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 319  Q
    ||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29908067 acgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 29908027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 168
Target Start/End: Original strand, 28610473 - 28610621
Alignment:
Q  20 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 119  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| || ||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| |    
T  28610473 tctttctcatatgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaattggccgaagtgattccaactacctcaaacattgacatcttctacatgttggttt 28610572  T
Q  120 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaattt 168  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28610573 tgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaaccattt 28610621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 33 - 185
Target Start/End: Original strand, 9556331 - 9556483
Alignment:
Q  33 tcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtc 132  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| || |||||| |||| |||||| ||||||||| | ||    
T  9556331 tcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcctgtacaagttggttttgtacgtgaaatc 9556430  T
Q  133 cataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgag 185  Q
    ||| | |||||| || ||||||||||||||||| || | ||||||||||||||    
T  9556431 cattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttacggatgttggatgag 9556483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Original strand, 51548098 - 51548259
Alignment:
Q  31 tgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggag 130  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| || || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||     
T  51548098 tgtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaa 51548197  T
Q  131 tccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    ||||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  |||||||||| || ||||||    
T  51548198 tccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggataagtccaaaa 51548259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 2284623 - 2284783
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| || || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  2284623 gtcataaatgcaaaatcaaccgaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 2284722  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||  || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  2284723 ccattatcaaaatagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 2284783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 4120360 - 4120520
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| | || |  |||||||  ||||| | || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  4120360 gtcataaatacaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttaatgtgactccaactatttcaaagaatgtcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 4120459  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  4120460 ccattatcaaaacggtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 4120520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 33940350 - 33940190
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  33940350 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtggaat 33940251  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || |  ||| |||||||| | || |  ||||||||||||| ||||||    
T  33940250 ccattatcaaaacagtcgagaaagtgttaaacgactttaccgatgttggatgagtccaaaa 33940190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 40467774 - 40467934
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| || |||  |||||| |||||| ||||||||||| |    
T  40467774 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatttcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattttatacaagttggttttgtacgtggaat 40467873  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  40467874 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 40467934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12491582 - 12491422
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| || || |  |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||| | ||||||| ||| |    
T  12491582 gtcataaatgcaaaaccaaccaaatatgtcaaataggtcgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttgattttgtacgcggaat 12491483  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| ||||||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  12491482 ccattatcaaaacagttggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 12491422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29930580 - 29930532
Alignment:
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29930580 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29930532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 29979734 - 29979686
Alignment:
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29979734 gttgacgttcattgtacatttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29979686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 211990 - 212341
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  211990 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 212089  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212090 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 212189  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212190 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 212289  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  212290 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 212341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5348679 - 5348328
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348679 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 5348580  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348579 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 5348480  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348479 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 5348380  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5348379 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 5348328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 41561524 - 41561173
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561524 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 41561425  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561424 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 41561325  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561324 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 41561225  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41561224 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 41561173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 10623003 - 10623354
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623003 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 10623102  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623103 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttagatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 10623202  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623203 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 10623302  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10623303 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 10623354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 27274909 - 27275257
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27274909 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 27275008  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275009 ggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 27275108  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275109 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 27275208  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27275209 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 27275257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 38947275 - 38946925
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38947275 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcagttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcttatacatgtt 38947176  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947175 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 38947076  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38947075 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatattt 38946976  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctct 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38946975 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtctct 38946925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 39795482 - 39795134
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795482 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 39795383  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  39795382 ggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattacta 39795283  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795282 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 39795183  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39795182 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 39795134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 3802115 - 3802463
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaa-cattggcatcctatacatgt 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3802115 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaactgaatatgtcaagtcggttgaagtca-cccaactacctcaaaacattggcatcctatacatgt 3802213  T
Q  114 tggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattact 213  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802214 tggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattact 3802313  T
Q  214 ttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatt 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802314 ttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctccttcaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatt 3802413  T
Q  314 tgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3802414 tgttgaagttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 3802463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24751171 - 24750822
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctata-catgt 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24751171 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctataacatgt 24751072  T
Q  114 tggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattact 213  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||    
T  24751071 tggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatctttgatcgtattact 24750972  T
Q  214 ttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatt 313  Q
    ||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24750971 ttcactttgtattcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatt 24750872  T
Q  314 tgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24750871 tgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 24750822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 1098375 - 1098723
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1098375 tttcctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaaccgattatgtcaaatcggtcgatgtgaccccaactacctcaaacattggcatcatgtacatgtt 1098474  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||    
T  1098475 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcggttgtagtactt 1098574  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1098575 tcactttgtgttcttgaataataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 1098674  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098675 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 1098723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 24604638 - 24604986
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24604638 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgtt 24604737  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||    
T  24604738 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatctttgattgtagtactt 24604837  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||    
T  24604838 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgtcttccctattt 24604937  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24604938 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 24604986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 15 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 45476869 - 45476524
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  45476869 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaaccaaaccgaatatgtcagatcgtttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 45476770  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  45476769 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 45476670  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  45476669 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccata-tt 45476571  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 361  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45476570 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggt 45476524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 12907041 - 12907389
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  12907041 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaaccaaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 12907140  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| |||| ||| || ||| |||||    
T  12907141 ggttttgtaggtgaagtccataaccaaatccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagtccaaaagatattttcgattgtagtactt 12907240  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12907241 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgaaatttgaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 12907340  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12907341 gttgactttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 12907389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 43948831 - 43949179
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  43948831 tttcctctttctcatgtgtcacaaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcagtagaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 43948930  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  43948931 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 43949030  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  43949031 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctctaacttcgagattagataacgcaacggcttcttgtcacctatatttgtcttccatattt 43949130  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43949131 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 43949179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 34920331 - 34920679
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  34920331 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatatcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 34920430  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  34920431 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaatattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 34920530  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34920531 tcactttgtgttcttgagtaataagtataagtgtgctcctccaacttcgaaattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 34920630  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34920631 gttgaatttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 34920679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 41007529 - 41007877
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41007529 tttcctctttctcatgtgtcacaaatcgaaacccaaccgaatatatcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgtt 41007628  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
     || ||||| ||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  41007629 agttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttgagaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 41007728  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41007729 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttacatattt 41007828  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41007829 gttgacgttcattttagacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 41007877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 436824 - 436475
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaac-attggcatcctatacatgt 113  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  436824 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaacggaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaaccattggcatcctgtacatgt 436725  T
Q  114 tggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattact 213  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||||||||||| |||||||  || ||| ||||    
T  436724 tggttttgtaggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaagatgttagatgagcccaaaagatatcttagattgtagtact 436625  T
Q  214 ttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatt 313  Q
    ||||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  436624 ttcactatgtgttcttgaataataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatt 436525  T
Q  314 tgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  436524 tgttgacgttcattgtacaattgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 436475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 22 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 9655661 - 9655320
Alignment:
Q  22 tttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttg 121  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||    
T  9655661 tttctcatgtgttacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaaatgaccccaactacctcaaacattggcatcatgtacatgttggttttg 9655562  T
Q  122 tacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagtt 221  Q
    || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||    
T  9655561 taggtggagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcacttt 9655462  T
Q  222 gtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacg 321  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  9655461 gtgttcttgagtaataaatatagttgtgctccttcaacttcgacattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttgatg 9655362  T
Q  322 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  9655361 ttcattgtacacttacttcacatttttcatgcaatgtggtct 9655320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 15 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 7264492 - 7264229
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7264492 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacatcaaacattggcatcctatacatgtt 7264393  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
      | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7264392 aattttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtttaactacttaatggatgttggatgagcctaaaaaatatcttcaatggtattactt 7264293  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7264292 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgca 7264229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 11692379 - 11692712
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||               
T  11692379 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaactgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactaccttaaacattggcatc----------- 11692467  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
        ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| |||||||| |||||||| || ||| || ||    
T  11692468 ----ttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattcttaaacaacttaacggatgttggatgggcccaaaatatatcttctattgtagtaatt 11692563  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  11692564 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaatttcgagattaaatattgcaacggcttcttgtcaactctatttgccttccatattt 11692663  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11692664 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 11692712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 17996721 - 17997069
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||| || || | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  17996721 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaagccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaggtgaccccaactatctcaaacattggcatcttgtacatgtt 17996820  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||    
T  17996821 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaatattgttaaacaacgtaacggatgttggatgagcctaaaagatatcttcaatagtagtactt 17996920  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||  | |||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  17996921 tcactttgtgttcttgagaaataaacacagttgtgctcctccaactttgagattagaaactacaacatcgtcttgtcacctctatttgacttccatattt 17997020  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||||| ||||    
T  17997021 gttgacgttcattgtatacttgcttgatatttggcatgcaatgttgtct 17997069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 113 - 363
Target Start/End: Original strand, 28354549 - 28354799
Alignment:
Q  113 ttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattac 212  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||    
T  28354549 ttggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtac 28354648  T
Q  213 tttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatat 312  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  28354649 tttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctatatttgacttccatat 28354748  T
Q  313 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28354749 ttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgaaatgtggtct 28354799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 15 - 170
Target Start/End: Original strand, 24941199 - 24941354
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24941199 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtccaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgtt 24941298  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 170  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24941299 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaa 24941354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 217
Target Start/End: Original strand, 28423061 - 28423225
Alignment:
Q  53 gaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaa 152  Q
    |||||||||| ||||||||| || |  |||||||  ||||||| ||||||| | |||| |||||| |||||||||||  |||| | |||||| || || |    
T  28423061 gaatatgtcacatcggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcatcatgtacaagttggttttgtacgtggaacccattatcaaaacagtcggga 28423160  T
Q  153 aattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttca 217  Q
    ||||||||||||| || |  ||||||||||||| |||||| || |||| |||||| | |||||||    
T  28423161 aattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaatatgtcttgaatagtttgactttca 28423225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21535678 - 21535507
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||| |||||| | ||||||| | ||||||||||| || |      |||    
T  21535678 gtcatatatgcaaaaccaaccgaatatgtcatatcagttgaggtgaccccaactatctcaaatagtggcatcatgtacatgttggttttat------agt 21535585  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtat 209  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||  |||   |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  21535584 ccataaccaaaactgttggaaaattgttaaccaacctaactgattgaggatgagcccaaaatatgtcttgaatagtat 21535507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 79 - 170
Target Start/End: Original strand, 3353894 - 3353985
Alignment:
Q  79 cccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 170  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||| ||||||||||| || || ||||||||||| | |||||| || | ||||||||||||||||||||    
T  3353894 cccaactatctcaaacaataacatcctgtacatgttggttttataggtggagtccatgatcaaaacagtcgaaaaattgttaaacaatttaa 3353985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 325 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 7264234 - 7264196
Alignment:
Q  325 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7264234 attgcacacttgcttcacaattgtcatgcaatgtggtct 7264196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 3947010 - 3947361
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947010 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 3947109  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947110 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 3947209  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947210 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 3947309  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3947310 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 3947361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 3984625 - 3984274
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984625 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 3984526  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984525 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 3984426  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984425 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 3984326  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984325 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 3984274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 44467094 - 44466743
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467094 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 44466995  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466994 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 44466895  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466894 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 44466795  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44466794 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 44466743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20350968 - 20350617
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350968 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcacccaaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 20350869  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350868 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 20350769  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350768 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 20350669  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20350668 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 20350617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 38774664 - 38775015
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774664 tttcttctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 38774763  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774764 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 38774863  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38774864 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccatatttgccttccatattt 38774963  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38774964 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 38775015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 29355237 - 29355585
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355237 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 29355336  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355337 ggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 29355436  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355437 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 29355536  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29355537 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 29355585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 5079447 - 5079099
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079447 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 5079348  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079347 ggttttgtacgtggagtccgtaaccaaaaccgtttgaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 5079248  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5079247 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatctgccttccatattt 5079148  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5079147 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 5079099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13630928 - 13630580
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630928 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 13630829  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13630828 ggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagtattactt 13630729  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630728 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 13630629  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13630628 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13630580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 41455349 - 41455001
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41455349 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctttacatgtt 41455250  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41455249 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaatatatcttcaatagtattactt 41455150  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455149 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 41455050  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41455049 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 41455001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 12649128 - 12649476
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649128 tttcctctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 12649227  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  12649228 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 12649327  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12649328 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatagatattagatattgcaacgacttcttgtcacctctatttgtcttccatattt 12649427  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12649428 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 12649476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 37016426 - 37016078
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37016426 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaaatgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 37016327  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  37016326 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 37016227  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37016226 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 37016127  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37016126 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 37016078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 363
Target Start/End: Original strand, 50116317 - 50116660
Alignment:
Q  20 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  50116317 tctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgttggttt 50116416  T
Q  120 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 219  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  50116417 tgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttagatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 50116516  T
Q  220 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  50116517 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgacattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatatttgttga 50116616  T
Q  320 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50116617 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 50116660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 38691488 - 38691836
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  38691488 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 38691587  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  38691588 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttgaaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 38691687  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  38691688 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatcgagattagatattgcaacggcttcttgtcatctctatttgccttccatattt 38691787  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38691788 gttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 38691836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 46974671 - 46974328
Alignment:
Q  20 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 119  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| |    
T  46974671 tctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaaccgaatatgtcaaatcgattgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacctgttggttt 46974572  T
Q  120 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||      
T  46974571 tgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaagattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcact 46974472  T
Q  220 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  46974471 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgagattagatattgcaacgacttcttgtcacctttatttgccttccatatttgttga 46974372  T
Q  320 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46974371 cgttcattgtacacttgtttcacatttgtcatgcaatgtggtct 46974328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 13175293 - 13174945
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |    
T  13175293 tttcctctttctcatgggtcacaaatccacacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgat 13175194  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| |||||    
T  13175193 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgctggaaatttgttaaacaacttagcggatgttggatgagcacaaaagatatcttcgattgtagtactt 13175094  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13175093 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaactttgaaattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 13174994  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13174993 gttgattttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13174945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 51663770 - 51663422
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  51663770 tttcctctttctcatgtgtcacatattcaaactcaaccaaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacactggcattttatacatgtt 51663671  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  51663670 ggttttgtaggtagagtccataatcaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaaaggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 51663571  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||    
T  51663570 tcactttgtgttcttgactaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacgacttattgtcacctctatttgccttccattttt 51663471  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51663470 gttgacgttcaatgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 51663422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 71 - 363
Target Start/End: Original strand, 21942969 - 21943261
Alignment:
Q  71 gaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaa 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21942969 gaagtgatcccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgttggttttgtaggtggaatccataaccaaaaccgttgaaaatttgttaaacaacttaa 21943068  T
Q  171 tggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattag 270  Q
     | ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||  ||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21943069 cgaatgatggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactttcactttgtgtttttgagaaataagcatagttgtgctcctccaacttcgagattag 21943168  T
Q  271 aaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    | |||||||| | |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  21943169 atattgcaacagtttcttgtcgcctctatttgccttccatatttgttgacgtttattgtacacttgtttgacatttgtcatgcaatgtggtct 21943261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 15 - 280
Target Start/End: Original strand, 19498013 - 19498277
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19498013 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaagcctaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 19498112  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
     || ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||| |||||    
T  19498113 tgttttgtgggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagccc-aaaagtatctttgattgtagtactt 19498211  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaac 280  Q
    |||  ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19498212 tcactttgtgttttttagaaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaac 19498277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 32106208 - 32106533
Alignment:
Q  20 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtct 119  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||| |||||||||||||| ||  | || | |||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |    
T  32106208 tctttctcatgtgtcaaaaatccaaaatcaactgaatatgtcaaatcagtcaaggtgaccccaactatctcaaacattggcatcatgtacatgttggttt 32106307  T
Q  120 tgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaag 219  Q
    |||| |||||||||||||||||||           ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||||||||      
T  32106308 tgtaggtggagtccataaccaaaa-----------ttgttaaacaacttaatggatgttggatgagcttaaaatatgtcttcaatagtagtactttcact 32106396  T
Q  220 ttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttga 319  Q
    ||||||||| | | |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||| | | |||| |  | |||||||||| || || | ||||||||||||||||    
T  32106397 ttgtgttctggtgaaataaacatagttgtgctcctccaactttgagattatataatgcatcatcgtcttgtcacctctgttcgacttccatatttgttga 32106496  T
Q  320 cgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 356  Q
     ||| |||| | |||||||| | ||||||| ||||||    
T  32106497 tgttaattgcatacttgcttgatatttgtcttgcaat 32106533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 268 - 363
Target Start/End: Original strand, 44619905 - 44620000
Alignment:
Q  268 tagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44619905 tagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgcacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 44620000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 202 - 356
Target Start/End: Original strand, 26466006 - 26466160
Alignment:
Q  202 aatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctattt 301  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||  | | || | ||| || | |    
T  26466006 aatagtagtactttcattttgtgttcttgagaaataaacatagttgtgctccttcaactttgagattagaaactgcaacaccgttttttaacctctgtat 26466105  T
Q  302 gccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 356  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  26466106 gacttccatatttattgacgttcattgtatacttgcttgatatttgtcatgcaat 26466160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 36360086 - 36360246
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||||| |||||| || |  | |||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  36360086 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatatcaaataggttgaggtgactcaaactatttcaaacagtgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 36360185  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  36360186 ccattatcaaaacagttggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 36360246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45472847 - 45472687
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||  |    
T  45472847 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtgggat 45472748  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  45472747 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 45472687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7404115 - 7403953
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacatt--ggcatcctatacatgttggtcttgtacgtgga 129  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| |  ||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  7404115 gtcataaatgcaaaactaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatatggcattctatacaagttggttttgtacgtgga 7404016  T
Q  130 gtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
     ||||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  7404015 atccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttactgatgttggatgagtccaaaa 7403953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 36 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 28863381 - 28863225
Alignment:
Q  36 taaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccat 135  Q
    ||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||| || |||||    
T  28863381 taaatgcaaaaccaatcaaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtacgtagaatccat 28863282  T
Q  136 aaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
     | |||||| || | |||| ||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||    
T  28863281 tatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaattttacgaatgttggatgagtccaaaa 28863225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 27283535 - 27283402
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  | ||| | |||||||||||||| |||||| |||| |||||| |    
T  27283535 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactattttaaataatggcatcctatacaagttggttttgtgcgtggaat 27283436  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 165  Q
    |||  |  ||||| || |||||||||||||||||    
T  27283435 ccaatattaaaacagtcggaaaattgttaaacaa 27283402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 18887360 - 18887520
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| || |||| |||||| ||| ||  |||||||||| |    
T  18887360 gtcataaatgcaaaaccaacagaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacatcttatacaagttagttctgtacgtggaat 18887459  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||   | ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  18887460 ccattatcaaaaaaatcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagaccaaaa 18887520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 322 - 363
Target Start/End: Original strand, 7980068 - 7980109
Alignment:
Q  322 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7980068 ttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7980109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 20240122 - 20240037
Alignment:
Q  80 ccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaa 165  Q
    |||||||  ||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | |||| | ||  ||||||||||||||||    
T  20240122 ccaactatttcaaacaatgacatcctatacaagttggttttgtacgtggaatccattatcaaagcagtcagaaaattgttaaacaa 20240037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25231655 - 25231558
Alignment:
Q  174 atgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattaga 271  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||| ||| ||| ||||||||  || |||| | | | |||||  |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  25231655 atgttggatgaacccaaaatatgtctttaattgtagtactttcactttttgttatggtgaaataaacatagttgtgctcctccaattttgagattaga 25231558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 82 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 31445974 - 31445866
Alignment:
Q  82 aactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttgga 181  Q
    |||||||| ||||| || ||| | |||||  ||||| || | ||||||||| || | |||||| |||| |||| |||||||||| || || ||| |||||    
T  31445974 aactaccttaaacaatgacattcaatacacattggttttatgcgtggagtctatgatcaaaactgttgaaaaagtgttaaacaactttatagattttgga 31445875  T
Q  182 tgagcccaa 190  Q
    |||||||||    
T  31445874 tgagcccaa 31445866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 2393 - 2045
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2393 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 2294  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2293 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 2194  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2193 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 2094  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2093 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 2045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 344; Significance: 0; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 366
Target Start/End: Original strand, 1611300 - 1611651
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1611300 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctataaatgtt 1611399  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611400 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 1611499  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611500 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 1611599  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1611600 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtctctg 1611651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 31147834 - 31147486
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31147834 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaacacaactacctcaaacattggcatcatgtacatgtt 31147735  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  31147734 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttgtatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 31147635  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31147634 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 31147535  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31147534 gttgacgttcattgtacacttgcttcaaatttatcatgcaatgtggtct 31147486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 15 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 28357830 - 28357557
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28357830 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacatttgcatcctatacatgtt 28357731  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  28357730 ggtcttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaattgtattactt 28357631  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttctt 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28357630 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttctt 28357557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 29287502 - 29287845
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29287502 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaatccaaccgaatatgtcaaatcgatcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 29287601  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  29287602 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaatt-ttaaacaaattaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 29287700  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29287701 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgatattaga----gcaacgacttcttgtcacctctatttgccttccatattt 29287796  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29287797 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtct 29287845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 18607508 - 18607160
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  18607508 tttcctctttctcatgtgtcacaaatctaaacccaatcgaatatgtcaaatctgtcgaagtgaccccaactacttcaaatattggcatcctgtacatgtt 18607409  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  18607408 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacgaatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 18607309  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  18607308 tcactttgtgttcttgagtaataagtattgttgtgctcctccaacttaaaaattagatattgcaacggcttcttatcacctctatttgccttccatattt 18607209  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18607208 gttgatgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 18607160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 21357899 - 21358244
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  21357899 tttcctctttctcatttgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccgaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 21357998  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  21357999 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaatatatcttcgattgtagtactt 21358098  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21358099 tcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 21358198  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||   |  ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  21358199 gt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtct 21358244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 23961881 - 23962226
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  23961881 tttcctctttctcatttgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgacccgaactacctcaaacattggcatcttgtacatgtt 23961980  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  23961981 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaatatatcttcgattgtagtactt 23962080  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23962081 tcactttgtgttcttgacaaataagtatagttgtgctcctcgaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 23962180  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||   |  ||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23962181 gt---ctatcattttacgcttgcttgacctttgtcatgcaatgtggtct 23962226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 289 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 28251134 - 28251060
Alignment:
Q  289 gtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28251134 gtcacctctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 28251060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 9095623 - 9095463
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||  ||||||||||| |    
T  9095623 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggctttgtacgtggaat 9095524  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || |||||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  9095523 ccatgatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 9095463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 287 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 24220408 - 24220332
Alignment:
Q  287 ttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||    
T  24220408 ttgtcacctctatttgccttccatatttgttgacgtttattttacacttacttgatatttgtcatgcaatgtggtct 24220332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 333; Significance: 0; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 37819426 - 37819774
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819426 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacctaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 37819525  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819526 ggttttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 37819625  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819626 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 37819725  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37819726 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 37819774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 11032001 - 11032349
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032001 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 11032100  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032101 ggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 11032200  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032201 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggtttcttgtcacccctatttgccttccatattt 11032300  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11032301 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 11032349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 38858739 - 38859087
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38858739 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatatatgtt 38858838  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858839 ggttttgtacgtcgagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 38858938  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38858939 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatacttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 38859038  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38859039 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 38859087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 28884957 - 28885305
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28884957 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaacggattatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatccaatacatgtt 28885056  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885057 ggtttcgtacgtggaatccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 28885156  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885157 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 28885256  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28885257 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 28885305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 7020429 - 7020777
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020429 tttcctctttctcatgtgtcataaatctaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 7020528  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7020529 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaatagtattactt 7020628  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020629 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagatgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 7020728  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7020729 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7020777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 34079292 - 34078944
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34079292 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 34079193  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  34079192 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaattgtattactt 34079093  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34079092 tcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 34078993  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34078992 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 34078944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 27866394 - 27866742
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27866394 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaaccacctcaaacattggcctcctatacatgtt 27866493  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  27866494 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcaattgtattactt 27866593  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  27866594 tcacgttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaaaggtttcttgtcacctctattttccttccatattt 27866693  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27866694 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 27866742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 1036863 - 1036515
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1036863 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 1036764  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    | | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  1036763 gattttgtaggttgagtccgtaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttagatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 1036664  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1036663 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattttccttccatattt 1036564  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  1036563 gttgacgttcattgtacacttgtgtcacatttgtcatgcaatgtggtct 1036515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 7799555 - 7799903
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7799555 tttcctctttctcatgtctcacaaatccaaacccaaccgaatatgttaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgtt 7799654  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  7799655 ggttttgtaggtggagtccttaaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 7799754  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7799755 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctattttccttccatattt 7799854  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7799855 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 7799903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 18536885 - 18537233
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||    
T  18536885 tttcctctttctcatgcgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattagcatcttgtacatgtt 18536984  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
     || ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  18536985 agttttgtaggtggagtccataaccaaaaccattggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 18537084  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18537085 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 18537184  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18537185 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 18537233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 4202488 - 4202836
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  4202488 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaacagaatatgtcaaatcggtcgaagtgacctcaactacctcaaacattggcatcatgtacatgtt 4202587  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||    
T  4202588 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaactgttggaaaattgttaaacaacttaacggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactt 4202687  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4202688 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 4202787  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4202788 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttatcatgcaatgtggtct 4202836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 13566656 - 13566988
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13566656 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctagacatgtt 13566755  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||                |||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  13566756 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaacc----------------acaacttaatggatgttgaatgatcccaaaagatatcttcaattgtattactt 13566839  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13566840 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 13566939  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13566940 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 13566988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 25895646 - 25895998
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25895646 tttcctctttctcatgtgtcataaatccaaactcacccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaagcattggcatcctatacatgtt 25895745  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||     
T  25895746 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggatgttggatgagcccaaaagatatcttcgattgtagtactc 25895845  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaac----ttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccat 310  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     | || |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25895846 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacatatatagatattagatattgcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccat 25895945  T
Q  311 atttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25895946 atttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 25895998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 15 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20287781 - 20287439
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| ||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||    
T  20287781 tttcctctttctcatgcgtcacaaattcaaagccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaggtgaccccaactatctcaaacataggcatcttgtacatgtt 20287682  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgtt-aaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattact 213  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||    
T  20287681 ggtttggtaggtggagtccataaccagaaccgttggaaaattgttaaaaaaacttaacggatgttggatgagcgcaaaatatgtcttcaatagtagtact 20287582  T
Q  214 ttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatt 313  Q
    || |   | |||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  | |||||||||| || |||| ||| ||||||    
T  20287581 ttgaccatttgttcttgagaaataaacataattgtgctcctccaactttgagattagaaactggaaccccgtcttgtcacctctgtttgactttcatatt 20287482  T
Q  314 tgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 356  Q
    | |||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||    
T  20287481 tattgacgttcattatatacttgcttgatatttgtcatacaat 20287439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 125 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 20286410 - 20286180
Alignment:
Q  125 gtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactttcaagttgtg 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| | |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||  |||||    
T  20286410 gtggagtccataaccaaaactgttggaaaattcataa-caactaagcggatgttggatgagcccaaaatatgtcttcaatagtagtactttcattttgtg 20286312  T
Q  225 ttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatatttgttgacgttc 324  Q
    || ||||| |||||  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |    |||||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||    
T  20286311 ttattgagaaataaagataattgtgctcctccaactttgagattagaaactgcaccacagtcttgtcacctctgtttgacttccatatttgttgatgttc 20286212  T
Q  325 attgtacacttgcttcacatttgtcatgcaat 356  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  20286211 attgtatacttgcttgatatttgtcatgcaat 20286180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11819711 - 11819551
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||  ||| | || |  |||||||  ||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  11819711 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataagttaaggtgactccaactatttcaaacaatagcatcctatacaagttggttttgtacgtggaat 11819612  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||| ||||||    
T  11819611 ccattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgattttggatgagtccaaaa 11819551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 27013235 - 27013395
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  27013235 gtcataaatgcaaaaccaacagaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 27013334  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    | || | |||||| || ||||||||||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  27013335 ctattatcaaaacagtcggaaaattgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 27013395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42343985 - 42343826
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||| |    
T  42343985 gtcataaatgcaaaactaaccgaatatgtcaaataggttgaggttactccaactatttcaaacaatggcattctatacaagttggttttgtatgtggaat 42343886  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || |||||| ||||||||||| || | ||||||||||||| ||||||    
T  42343885 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaatatact-gatgttggatgagtccaaaa 42343826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6553284 - 6553124
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  || ||||  ||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |    
T  6553284 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactcccactatttcaaacaatggcattctatacaaattggttttgtacgtggaat 6553185  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  || |||||||||| ||||||    
T  6553184 ccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgaagttggatgagtccaaaa 6553124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43295709 - 43295549
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| || | | ||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||| | || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  43295709 gtcataaatgcagaacaaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaataatgacattctatacaagttggttttgtacgtggaat 43295610  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || | |||| |||||||||| || |  ||||||||||||| ||||||    
T  43295609 ccattatcaaaacagtcgaaaaagtgttaaacaactttaccgatgttggatgagtccaaaa 43295549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 112 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25053148 - 25053043
Alignment:
Q  112 gttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtatta 211  Q
    |||||| ||||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||  || || ||| ||||||||| |||||| || |||| |||||| | |    
T  25053148 gttggttttgtacgtggaatccattatcaaaacagccggaaaattgttaaacagctttatcgatattggatgagtccaaaatatgtcttgaatagtttga 25053049  T
Q  212 ctttca 217  Q
    ||||||    
T  25053048 ctttca 25053043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0341 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0341
Description:

Target: scaffold0341; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Original strand, 15906 - 16254
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15906 tttcctctttctcatgtgtcataaattcaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 16005  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16006 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaatggaagttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 16105  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16106 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcgttccatattt 16205  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16206 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 16254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 15 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 17581 - 17233
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17581 tttcctctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcaaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatgtt 17482  T
Q  115 ggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaaaatatcttcaatagtattactt 214  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||    
T  17481 ggttttgtaggtggagtccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaacttaacagatgttggatgagcctaaaagatatcttcgattgtagtactt 17382  T
Q  215 tcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgccttccatattt 314  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17381 tcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatatttcaacggcttcttgtcacctctatttgccttccatattt 17282  T
Q  315 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17281 gttgacgttcattgtacacttgcttcacatttttcatgcaatgtggtct 17233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 210 - 363
Target Start/End: Complemental strand, 12580 - 12426
Alignment:
Q  210 tactttcaagttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagaaattgcaacggcttcttgtcacccctatttgcc-ttcc 308  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||     
T  12580 tactttcactttgtgttcttgagtaataagtatagttgtgctcctccaacttcgagattagatattgcaacagcttcttgtcacctctatttgcctttcg 12481  T
Q  309 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 363  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12480 atatttgttgacgttcattgtacacttgcttcacatttgtcatgcaatgtggtct 12426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 15 - 123
Target Start/End: Original strand, 25495 - 25603
Alignment:
Q  15 tttcttctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 114  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25495 tttcctctttctcatatgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaattggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctatacatgtt 25594  T
Q  115 ggtcttgta 123  Q
    ||| |||||    
T  25595 ggttttgta 25603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0340 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0340
Description:

Target: scaffold0340; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 116
Target Start/End: Original strand, 4 - 100
Alignment:
Q  20 tctttctcatgtgtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttgg 116  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  4 tctttctcatgtgtcacaaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggtcgaagtgaccccaactacctcaaacattggcatcctgtacatcttgg 100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 192
Target Start/End: Original strand, 28452 - 28612
Alignment:
Q  32 gtcataaatccaaacccaaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagt 131  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |  |||||||  ||||||| || ||| ||||||| |||||| || || || || |    
T  28452 gtcataaatgcaaaaccaaccgaatatgtcaaataggttgaggtgactccaactatttcaaacaatgacattctatacaagttggttttttatgtagaat 28551  T
Q  132 ccataaccaaaaccgttggaaaattgttaaacaatttaatggatgttggatgagcccaaaa 192  Q
    |||| | |||||| || |||||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  28552 ccattatcaaaacagtcggaaaagtgttaaacaattttaccgatgttggatgagtccaaaa 28612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0325 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0325
Description:

Target: scaffold0325; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 48 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 4315 - 4198
Alignment:
Q  48 caaccgaatatgtcaaatcggttgaagtcatcccaactacctcaaacattggcatcctatacatgttggtcttgtacgtggagtccataaccaaaaccgt 147  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| || |  |||||||  ||||||| ||||||  | |||| |||||| || || ||||| ||||| | |||||| ||    
T  4315 caaccgaatatgtcaaatatgttgaggtgactccaactatttcaaacaatggcattttctacaagttggttttatatgtggaatccattatcaaaacagt 4216  T
Q  148 tggaaaattgttaaacaa 165  Q
      ||||||||||||||||    
T  4215 cagaaaattgttaaacaa 4198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University