View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11791_low_8 (Length: 390)

Name: NF11791_low_8
Description: NF11791
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11791_low_8
NF11791_low_8
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (83-371)||(20608-20896)
[»] scaffold0023 (9 HSPs)
scaffold0023 (83-371)||(94272-94560)
scaffold0023 (83-371)||(44315-44604)
scaffold0023 (83-228)||(17453-17598)
scaffold0023 (174-335)||(119774-119937)
scaffold0023 (103-344)||(100269-100507)
scaffold0023 (182-369)||(101371-101552)
scaffold0023 (114-342)||(40173-40398)
scaffold0023 (312-370)||(100182-100240)
scaffold0023 (177-305)||(38542-38672)
[»] chr8 (100 HSPs)
chr8 (83-371)||(5853305-5853593)
chr8 (83-371)||(1484263-1484551)
chr8 (83-371)||(20403088-20403376)
chr8 (83-371)||(20046208-20046496)
chr8 (83-371)||(4542386-4542674)
chr8 (83-371)||(22001615-22001902)
chr8 (83-371)||(19896126-19896417)
chr8 (83-371)||(15203244-15203532)
chr8 (83-368)||(14823638-14823922)
chr8 (83-371)||(41598049-41598337)
chr8 (87-370)||(45290711-45290996)
chr8 (114-371)||(26219577-26219834)
chr8 (114-370)||(26225292-26225548)
chr8 (83-327)||(14409457-14409702)
chr8 (83-306)||(4483207-4483429)
chr8 (114-346)||(16092341-16092575)
chr8 (82-346)||(6759147-6759409)
chr8 (82-335)||(18818376-18818631)
chr8 (123-335)||(23406278-23406492)
chr8 (82-345)||(22874954-22875218)
chr8 (83-327)||(7372685-7372931)
chr8 (89-338)||(28649018-28649273)
chr8 (83-327)||(25484288-25484524)
chr8 (83-306)||(16413329-16413547)
chr8 (89-338)||(22626631-22626882)
chr8 (82-335)||(21923895-21924149)
chr8 (85-335)||(21918969-21919222)
chr8 (82-329)||(20536113-20536362)
chr8 (88-335)||(18879209-18879451)
chr8 (95-259)||(19937030-19937194)
chr8 (83-306)||(26223841-26224068)
chr8 (83-335)||(13597585-13597840)
chr8 (83-335)||(13508053-13508308)
chr8 (136-335)||(31971155-31971356)
chr8 (83-216)||(19801395-19801527)
chr8 (114-370)||(38855250-38855506)
chr8 (136-335)||(45131019-45131218)
chr8 (136-335)||(16199666-16199866)
chr8 (185-335)||(21255121-21255272)
chr8 (121-335)||(5866280-5866496)
chr8 (174-335)||(21490893-21491057)
chr8 (121-370)||(6520233-6520483)
chr8 (174-335)||(17140815-17140978)
chr8 (185-335)||(21249283-21249434)
chr8 (137-335)||(23648446-23648652)
chr8 (121-335)||(21389458-21389672)
chr8 (121-335)||(21778784-21778998)
chr8 (83-334)||(17612078-17612332)
chr8 (99-219)||(15070571-15070692)
chr8 (182-370)||(26355766-26355951)
chr8 (174-344)||(23760903-23761071)
chr8 (121-335)||(21395988-21396202)
chr8 (121-335)||(21790481-21790695)
chr8 (114-370)||(21285465-21285719)
chr8 (174-370)||(983465-983657)
chr8 (83-370)||(20498432-20498715)
chr8 (182-344)||(21673599-21673757)
chr8 (121-306)||(32121654-32121847)
chr8 (228-327)||(22965608-22965707)
chr8 (311-371)||(28397381-28397441)
chr8 (312-371)||(22995674-22995733)
chr8 (312-370)||(22525391-22525449)
chr8 (312-370)||(24352854-24352912)
chr8 (315-371)||(16799316-16799372)
chr8 (312-368)||(22963642-22963698)
chr8 (312-368)||(37515361-37515417)
chr8 (320-371)||(20502339-20502390)
chr8 (311-370)||(23944181-23944240)
chr8 (189-338)||(17267069-17267214)
chr8 (312-370)||(17439736-17439794)
chr8 (316-370)||(20533643-20533697)
chr8 (121-262)||(18678108-18678256)
chr8 (189-366)||(24352896-24353066)
chr8 (311-368)||(40493203-40493260)
chr8 (312-371)||(2419100-2419159)
chr8 (316-371)||(5083350-5083405)
chr8 (312-371)||(22253395-22253453)
chr8 (313-367)||(19155118-19155172)
chr8 (312-370)||(22419642-22419700)
chr8 (317-370)||(18833309-18833362)
chr8 (312-368)||(5760354-5760409)
chr8 (313-365)||(17086382-17086434)
chr8 (312-366)||(5760433-5760486)
chr8 (312-370)||(20498394-20498452)
chr8 (312-369)||(6520196-6520253)
chr8 (313-370)||(23761077-23761134)
chr8 (311-370)||(20502293-20502351)
chr8 (311-370)||(22963603-22963662)
chr8 (312-366)||(983637-983691)
chr8 (83-119)||(24486057-24486093)
chr8 (312-370)||(22253357-22253415)
chr8 (312-366)||(22381962-22382017)
chr8 (311-370)||(22525429-22525487)
chr8 (311-345)||(20533601-20533635)
chr8 (312-370)||(22995713-22995770)
chr8 (312-370)||(28397420-28397477)
chr8 (312-370)||(37515397-37515454)
chr8 (278-327)||(19937195-19937244)
chr8 (337-369)||(4381787-4381819)
chr8 (337-369)||(22473555-22473587)
[»] chr7 (113 HSPs)
chr7 (83-371)||(11972357-11972645)
chr7 (83-371)||(14949135-14949423)
chr7 (83-371)||(32125352-32125640)
chr7 (83-371)||(41522778-41523066)
chr7 (83-371)||(41525240-41525528)
chr7 (83-371)||(15376726-15377014)
chr7 (83-371)||(21189608-21189896)
chr7 (83-371)||(456182-456470)
chr7 (83-371)||(16232381-16232669)
chr7 (83-371)||(16409920-16410208)
chr7 (83-371)||(20385136-20385424)
chr7 (83-371)||(11393300-11393588)
chr7 (83-371)||(24702099-24702387)
chr7 (83-371)||(27216721-27217009)
chr7 (83-371)||(24704549-24704834)
chr7 (83-371)||(44116369-44116658)
chr7 (83-371)||(18640133-18640421)
chr7 (83-371)||(20110416-20110695)
chr7 (113-371)||(48273252-48273512)
chr7 (82-371)||(18456380-18456670)
chr7 (83-327)||(3386239-3386482)
chr7 (83-370)||(26355996-26356303)
chr7 (83-370)||(26358448-26358755)
chr7 (82-329)||(3564331-3564580)
chr7 (83-328)||(13647230-13647478)
chr7 (83-327)||(38898389-38898635)
chr7 (83-337)||(17061928-17062183)
chr7 (109-327)||(13869250-13869470)
chr7 (82-335)||(9509088-9509343)
chr7 (83-307)||(24275089-24275320)
chr7 (83-258)||(18430686-18430861)
chr7 (83-260)||(16213656-16213833)
chr7 (121-335)||(38227379-38227595)
chr7 (82-335)||(12698730-12698986)
chr7 (109-327)||(13831279-13831496)
chr7 (121-335)||(10588935-10589154)
chr7 (203-370)||(15082017-15082182)
chr7 (121-335)||(26211894-26212111)
chr7 (254-371)||(18427393-18427510)
chr7 (79-344)||(2280083-2280348)
chr7 (121-335)||(34200684-34200901)
chr7 (114-345)||(15144037-15144267)
chr7 (113-344)||(67635-67868)
chr7 (182-335)||(16386316-16386470)
chr7 (83-216)||(12756684-12756817)
chr7 (136-329)||(40443296-40443490)
chr7 (182-344)||(47831696-47831860)
chr7 (174-306)||(28505357-28505492)
chr7 (182-327)||(11996095-11996242)
chr7 (95-335)||(10063798-10064041)
chr7 (182-370)||(44014048-44014231)
chr7 (182-344)||(811199-811359)
chr7 (182-335)||(15754955-15755110)
chr7 (210-335)||(14258158-14258286)
chr7 (185-329)||(27847901-27848046)
chr7 (182-344)||(16219785-16219944)
chr7 (182-306)||(16495329-16495455)
chr7 (114-339)||(18005546-18005768)
chr7 (249-335)||(13032657-13032744)
chr7 (114-344)||(16056223-16056449)
chr7 (83-305)||(19486712-19486937)
chr7 (114-265)||(22072882-22073036)
chr7 (234-370)||(16091629-16091764)
chr7 (189-370)||(1868070-1868246)
chr7 (234-370)||(9177781-9177917)
chr7 (311-370)||(17017647-17017706)
chr7 (313-371)||(11525796-11525854)
chr7 (189-366)||(14044621-14044792)
chr7 (189-366)||(14354651-14354822)
chr7 (189-366)||(20220263-20220435)
chr7 (311-371)||(11769106-11769166)
chr7 (311-370)||(48991050-48991109)
chr7 (312-371)||(9033541-9033600)
chr7 (312-370)||(14323199-14323257)
chr7 (174-370)||(18203683-18203873)
chr7 (291-370)||(16461127-16461207)
chr7 (312-370)||(15008730-15008788)
chr7 (225-306)||(16213550-16213632)
chr7 (313-370)||(2282482-2282539)
chr7 (312-368)||(12256052-12256108)
chr7 (291-335)||(16579473-16579517)
chr7 (291-335)||(16586146-16586190)
chr7 (310-370)||(22072825-22072885)
chr7 (311-370)||(14044579-14044638)
chr7 (311-370)||(14354609-14354668)
chr7 (174-229)||(18154901-18154956)
chr7 (312-366)||(12901156-12901210)
chr7 (189-370)||(15008574-15008750)
chr7 (312-370)||(16219949-16220007)
chr7 (312-370)||(44014010-44014068)
chr7 (331-368)||(11772503-11772540)
chr7 (189-327)||(12901232-12901369)
chr7 (202-370)||(14323237-14323399)
chr7 (182-231)||(14932802-14932851)
chr7 (83-139)||(15081962-15082019)
chr7 (182-231)||(15356237-15356286)
chr7 (182-231)||(15360351-15360400)
chr7 (312-371)||(16996053-16996113)
chr7 (313-368)||(67574-67629)
chr7 (288-370)||(12255992-12256072)
chr7 (312-370)||(16056160-16056218)
chr7 (312-370)||(18005477-18005535)
chr7 (312-371)||(38519203-38519263)
chr7 (312-371)||(42461780-42461840)
chr7 (177-232)||(2832504-2832559)
chr7 (316-370)||(811368-811422)
chr7 (90-148)||(15113031-15113088)
chr7 (177-231)||(19649552-19649606)
chr7 (331-365)||(29329138-29329172)
chr7 (312-366)||(47831637-47831691)
chr7 (174-231)||(12187019-12187076)
chr7 (312-345)||(16996117-16996150)
chr7 (174-231)||(17138120-17138177)
[»] chr6 (104 HSPs)
chr6 (83-371)||(18334605-18334893)
chr6 (83-371)||(19004907-19005195)
chr6 (83-371)||(24422408-24422696)
chr6 (83-371)||(33861655-33861943)
chr6 (83-371)||(19858932-19859220)
chr6 (83-371)||(33864139-33864427)
chr6 (83-371)||(26924653-26924941)
chr6 (83-369)||(2291193-2291479)
chr6 (83-371)||(8054890-8055178)
chr6 (83-371)||(12742178-12742466)
chr6 (83-371)||(1595410-1595698)
chr6 (83-367)||(1540924-1541208)
chr6 (83-371)||(20556907-20557194)
chr6 (83-370)||(22782089-22782376)
chr6 (83-327)||(25754715-25754958)
chr6 (83-337)||(25688395-25688651)
chr6 (83-327)||(3852030-3852273)
chr6 (82-338)||(25629322-25629580)
chr6 (83-337)||(16448539-16448793)
chr6 (110-338)||(19303536-19303765)
chr6 (110-338)||(20593669-20593899)
chr6 (82-335)||(29060438-29060694)
chr6 (83-306)||(34963292-34963522)
chr6 (83-305)||(30676723-30676952)
chr6 (82-329)||(17287763-17288012)
chr6 (82-335)||(20360927-20361183)
chr6 (113-338)||(18409825-18410056)
chr6 (123-338)||(20076596-20076812)
chr6 (87-325)||(22780199-22780439)
chr6 (130-335)||(20638298-20638506)
chr6 (83-242)||(25656619-25656778)
chr6 (83-216)||(18456735-18456868)
chr6 (83-216)||(18461895-18462028)
chr6 (174-371)||(25714275-25714478)
chr6 (182-335)||(28496539-28496694)
chr6 (182-335)||(29808950-29809105)
chr6 (83-369)||(20109006-20109291)
chr6 (121-274)||(16496204-16496359)
chr6 (210-335)||(19773818-19773945)
chr6 (188-370)||(22080799-22080979)
chr6 (182-370)||(19652064-19652248)
chr6 (114-344)||(23019298-23019528)
chr6 (182-335)||(1561201-1561356)
chr6 (136-335)||(35245484-35245684)
chr6 (83-306)||(19847962-19848194)
chr6 (182-324)||(16920698-16920841)
chr6 (234-335)||(22805647-22805749)
chr6 (174-335)||(22831402-22831565)
chr6 (121-370)||(19668241-19668488)
chr6 (83-216)||(18821813-18821946)
chr6 (83-304)||(8227479-8227703)
chr6 (83-264)||(25644295-25644474)
chr6 (182-329)||(11185418-11185558)
chr6 (123-306)||(23992349-23992540)
chr6 (312-371)||(16492980-16493039)
chr6 (312-370)||(33442880-33442938)
chr6 (225-335)||(25603502-25603612)
chr6 (225-335)||(25611840-25611950)
chr6 (174-232)||(27333277-27333336)
chr6 (174-232)||(27394017-27394076)
chr6 (316-370)||(23076564-23076618)
chr6 (312-369)||(18896539-18896596)
chr6 (312-368)||(19362261-19362317)
chr6 (174-322)||(4185880-4186023)
chr6 (312-367)||(17743073-17743128)
chr6 (312-370)||(20223777-20223835)
chr6 (312-370)||(22117761-22117819)
chr6 (183-322)||(4738626-4738759)
chr6 (174-326)||(9098573-9098714)
chr6 (311-371)||(18453051-18453111)
chr6 (312-368)||(27573292-27573348)
chr6 (312-368)||(35007984-35008040)
chr6 (312-370)||(17105564-17105621)
chr6 (312-370)||(19668203-19668261)
chr6 (182-305)||(31155465-31155582)
chr6 (288-368)||(13019361-13019439)
chr6 (312-368)||(25644172-25644228)
chr6 (312-370)||(19652026-19652084)
chr6 (312-370)||(23538460-23538517)
chr6 (312-370)||(23538538-23538595)
chr6 (174-370)||(33442918-33443108)
chr6 (183-322)||(4186286-4186419)
chr6 (194-251)||(19008787-19008843)
chr6 (312-368)||(22080959-22081015)
chr6 (312-371)||(15705797-15705855)
chr6 (311-370)||(16493019-16493077)
chr6 (312-370)||(17105486-17105543)
chr6 (312-366)||(19656328-19656381)
chr6 (312-370)||(19656484-19656541)
chr6 (312-370)||(23019235-23019293)
chr6 (312-370)||(23538382-23538439)
chr6 (313-370)||(27333357-27333414)
chr6 (313-370)||(27394097-27394154)
chr6 (312-368)||(19656406-19656461)
chr6 (288-370)||(15705738-15705817)
chr6 (311-370)||(23076602-23076660)
chr6 (311-370)||(35008020-35008078)
chr6 (312-366)||(13019325-13019379)
chr6 (177-231)||(18907111-18907165)
chr6 (177-231)||(19862978-19863032)
chr6 (177-231)||(19873120-19873174)
chr6 (312-366)||(20108971-20109025)
chr6 (312-369)||(1595369-1595431)
chr6 (174-231)||(21766695-21766752)
[»] chr3 (123 HSPs)
chr3 (83-371)||(17463039-17463327)
chr3 (83-371)||(34159187-34159475)
chr3 (83-371)||(16454294-16454582)
chr3 (83-371)||(28848624-28848912)
chr3 (83-371)||(13151803-13152092)
chr3 (83-371)||(13154268-13154557)
chr3 (83-371)||(45606920-45607208)
chr3 (83-371)||(8898955-8899243)
chr3 (83-371)||(29172596-29172885)
chr3 (83-371)||(16282824-16283112)
chr3 (83-368)||(17446668-17446952)
chr3 (83-371)||(9707620-9707908)
chr3 (83-371)||(10247736-10248024)
chr3 (83-370)||(38961904-38962192)
chr3 (83-371)||(6469147-6469431)
chr3 (121-371)||(55500803-55501053)
chr3 (83-370)||(7781360-7781653)
chr3 (83-365)||(41123757-41124036)
chr3 (101-371)||(15977373-15977646)
chr3 (114-371)||(36166458-36166715)
chr3 (82-371)||(24153176-24153466)
chr3 (114-371)||(21618308-21618566)
chr3 (83-306)||(55476417-55476640)
chr3 (82-345)||(14972743-14973008)
chr3 (179-371)||(45577947-45578139)
chr3 (110-335)||(40213716-40213942)
chr3 (83-327)||(50242728-50242971)
chr3 (82-335)||(17487755-17488010)
chr3 (82-335)||(17499237-17499492)
chr3 (99-327)||(15412333-15412563)
chr3 (88-335)||(25476358-25476607)
chr3 (83-327)||(8499422-8499668)
chr3 (83-327)||(12119737-12119983)
chr3 (82-335)||(43840831-43841086)
chr3 (121-328)||(23083367-23083576)
chr3 (83-306)||(12567479-12567709)
chr3 (83-306)||(13543944-13544174)
chr3 (83-328)||(43550491-43550739)
chr3 (82-329)||(26686792-26687041)
chr3 (82-335)||(13442173-13442428)
chr3 (129-334)||(10556882-10557088)
chr3 (82-335)||(11424730-11424981)
chr3 (121-335)||(18438432-18438649)
chr3 (85-335)||(20698405-20698658)
chr3 (121-335)||(12399108-12399324)
chr3 (83-327)||(27165154-27165400)
chr3 (133-327)||(44494715-44494908)
chr3 (83-232)||(17672626-17672775)
chr3 (83-335)||(24340691-24340946)
chr3 (82-335)||(14576800-14577052)
chr3 (83-216)||(53070666-53070799)
chr3 (92-309)||(53301527-53301747)
chr3 (121-335)||(14572490-14572703)
chr3 (134-327)||(17737142-17737337)
chr3 (174-327)||(28194599-28194752)
chr3 (121-335)||(13210333-13210550)
chr3 (121-335)||(12510949-12511172)
chr3 (82-370)||(42386289-42386564)
chr3 (114-370)||(15470793-15471046)
chr3 (91-335)||(23274585-23274832)
chr3 (174-370)||(9512791-9512982)
chr3 (174-370)||(9520766-9520957)
chr3 (174-370)||(49668135-49668326)
chr3 (114-370)||(16103651-16103901)
chr3 (121-343)||(14234374-14234602)
chr3 (83-370)||(52523695-52523980)
chr3 (110-370)||(32307548-32307802)
chr3 (137-335)||(30029731-30029939)
chr3 (83-305)||(37642233-37642458)
chr3 (174-369)||(12174318-12174500)
chr3 (182-338)||(16097228-16097381)
chr3 (121-306)||(46822187-46822380)
chr3 (174-370)||(1644733-1644924)
chr3 (174-371)||(13919198-13919390)
chr3 (83-304)||(22147493-22147717)
chr3 (312-371)||(15245849-15245908)
chr3 (189-370)||(22110427-22110603)
chr3 (316-371)||(323889-323944)
chr3 (312-371)||(15206767-15206826)
chr3 (114-370)||(37251165-37251419)
chr3 (312-366)||(315957-316011)
chr3 (312-370)||(23318944-23319002)
chr3 (311-368)||(12377793-12377850)
chr3 (312-368)||(15264973-15265029)
chr3 (312-371)||(32404381-32404440)
chr3 (312-371)||(43889997-43890056)
chr3 (189-370)||(606401-606576)
chr3 (312-370)||(9577495-9577553)
chr3 (312-370)||(1644904-1644962)
chr3 (312-370)||(17661106-17661164)
chr3 (114-370)||(43925829-43926082)
chr3 (312-368)||(606556-606612)
chr3 (83-154)||(2051167-2051238)
chr3 (311-370)||(16103613-16103672)
chr3 (312-370)||(37251399-37251457)
chr3 (312-370)||(42386251-42386309)
chr3 (312-370)||(43925791-43925849)
chr3 (312-370)||(52523960-52524018)
chr3 (293-335)||(10542621-10542663)
chr3 (174-232)||(14665400-14665458)
chr3 (312-370)||(15245888-15245945)
chr3 (174-231)||(856140-856197)
chr3 (312-369)||(14441234-14441290)
chr3 (311-368)||(22110582-22110639)
chr3 (174-231)||(23077537-23077594)
chr3 (312-369)||(49668306-49668363)
chr3 (312-364)||(15470761-15470813)
chr3 (312-368)||(18700688-18700743)
chr3 (311-370)||(315991-316049)
chr3 (311-370)||(323928-323986)
chr3 (312-371)||(9707887-9707951)
chr3 (320-371)||(10562613-10562664)
chr3 (177-232)||(14668556-14668611)
chr3 (316-370)||(14234310-14234364)
chr3 (312-370)||(15206806-15206863)
chr3 (312-370)||(15265009-15265066)
chr3 (177-231)||(15878114-15878168)
chr3 (312-370)||(23318907-23318964)
chr3 (312-365)||(9520733-9520786)
chr3 (312-365)||(32307515-32307568)
chr3 (183-231)||(26196500-26196548)
chr3 (312-371)||(35065650-35065709)
chr3 (339-371)||(43890067-43890099)
[»] chr2 (96 HSPs)
chr2 (83-371)||(18808804-18809092)
chr2 (83-371)||(23135451-23135739)
chr2 (83-371)||(23712026-23712314)
chr2 (83-368)||(39682177-39682462)
chr2 (83-371)||(24905645-24905934)
chr2 (83-371)||(24908120-24908409)
chr2 (83-371)||(23709545-23709833)
chr2 (83-371)||(26505240-26505528)
chr2 (83-371)||(26507718-26508006)
chr2 (83-371)||(24898208-24898497)
chr2 (83-371)||(24900691-24900980)
chr2 (83-371)||(24903168-24903457)
chr2 (83-371)||(571258-571546)
chr2 (83-371)||(45029867-45030155)
chr2 (83-369)||(6725858-6726144)
chr2 (83-371)||(32039511-32039799)
chr2 (83-371)||(21155073-21155361)
chr2 (83-371)||(28576960-28577248)
chr2 (83-370)||(24367635-24367923)
chr2 (83-366)||(24529541-24529826)
chr2 (83-306)||(23130788-23131011)
chr2 (83-306)||(23133255-23133478)
chr2 (83-306)||(34402535-34402758)
chr2 (154-371)||(24643034-24643252)
chr2 (83-327)||(43137204-43137448)
chr2 (83-326)||(22105319-22105562)
chr2 (83-327)||(38967279-38967524)
chr2 (82-335)||(23060411-23060667)
chr2 (83-306)||(32214934-32215164)
chr2 (82-329)||(23076346-23076596)
chr2 (82-335)||(22337022-22337269)
chr2 (82-335)||(22731201-22731456)
chr2 (82-317)||(23659940-23660176)
chr2 (82-335)||(22738147-22738401)
chr2 (174-328)||(23040249-23040405)
chr2 (121-327)||(298820-299027)
chr2 (83-335)||(19671728-19671982)
chr2 (174-335)||(8946555-8946718)
chr2 (85-335)||(23654356-23654609)
chr2 (136-335)||(38136-38337)
chr2 (121-335)||(20309007-20309221)
chr2 (87-335)||(23103369-23103616)
chr2 (184-327)||(23072019-23072163)
chr2 (85-279)||(23285820-23286012)
chr2 (174-370)||(7679446-7679647)
chr2 (114-344)||(28405872-28406099)
chr2 (114-370)||(25175720-25175972)
chr2 (223-335)||(21900562-21900676)
chr2 (182-370)||(18786971-18787154)
chr2 (83-344)||(7701-7959)
chr2 (174-370)||(22134266-22134462)
chr2 (83-265)||(23708587-23708769)
chr2 (189-370)||(24697682-24697858)
chr2 (121-306)||(25616107-25616300)
chr2 (189-370)||(23004618-23004794)
chr2 (83-147)||(24642869-24642933)
chr2 (312-371)||(43947558-43947617)
chr2 (174-371)||(26392252-26392443)
chr2 (189-370)||(22413213-22413388)
chr2 (312-370)||(22252718-22252776)
chr2 (114-370)||(23207147-23207401)
chr2 (316-369)||(39828191-39828244)
chr2 (288-368)||(23713058-23713136)
chr2 (312-367)||(18547176-18547231)
chr2 (312-371)||(21115572-21115631)
chr2 (311-370)||(24688519-24688578)
chr2 (83-370)||(23791143-23791427)
chr2 (83-370)||(20520161-20520443)
chr2 (312-370)||(18787134-18787192)
chr2 (312-370)||(22413368-22413426)
chr2 (312-370)||(25108749-25108807)
chr2 (312-369)||(23791106-23791163)
chr2 (312-371)||(23287195-23287254)
chr2 (314-370)||(28405809-28405865)
chr2 (311-370)||(21115611-21115669)
chr2 (311-370)||(25175682-25175741)
chr2 (293-370)||(10822795-10822870)
chr2 (312-368)||(7964-8020)
chr2 (312-368)||(10822850-10822906)
chr2 (318-370)||(23207109-23207161)
chr2 (174-214)||(23287384-23287424)
chr2 (306-370)||(24688477-24688540)
chr2 (83-216)||(32451896-32452031)
chr2 (312-371)||(34136771-34136831)
chr2 (312-371)||(23712293-23712357)
chr2 (312-370)||(7679408-7679466)
chr2 (312-370)||(18547139-18547196)
chr2 (334-368)||(21237606-21237640)
chr2 (311-345)||(21237650-21237684)
chr2 (312-370)||(22252681-22252738)
chr2 (312-370)||(23713118-23713176)
chr2 (306-368)||(25108789-25108850)
chr2 (312-365)||(22134442-22134495)
chr2 (315-368)||(23287236-23287288)
chr2 (318-371)||(24643237-24643295)
chr2 (312-371)||(28653571-28653630)
[»] chr5 (91 HSPs)
chr5 (83-371)||(42245378-42245666)
chr5 (83-371)||(264781-265069)
chr5 (83-371)||(29329795-29330083)
chr5 (83-371)||(10732953-10733241)
chr5 (83-371)||(20908873-20909161)
chr5 (83-371)||(29345841-29346129)
chr5 (83-370)||(39244998-39245285)
chr5 (83-371)||(2154626-2154915)
chr5 (83-371)||(29348314-29348602)
chr5 (83-371)||(29350787-29351075)
chr5 (83-365)||(32027260-32027542)
chr5 (83-370)||(10775688-10775977)
chr5 (83-371)||(11581212-11581501)
chr5 (83-369)||(20917965-20918246)
chr5 (114-371)||(22412047-22412305)
chr5 (83-306)||(39363310-39363533)
chr5 (83-371)||(36154796-36155088)
chr5 (128-335)||(21997547-21997756)
chr5 (83-307)||(20902021-20902248)
chr5 (82-335)||(23390463-23390718)
chr5 (110-335)||(24529119-24529346)
chr5 (83-329)||(18319046-18319291)
chr5 (79-327)||(31060974-31061222)
chr5 (110-338)||(9077848-9078078)
chr5 (82-338)||(1096362-1096621)
chr5 (83-337)||(24067003-24067257)
chr5 (99-327)||(23064415-23064645)
chr5 (99-325)||(38619337-38619568)
chr5 (82-335)||(24493467-24493722)
chr5 (82-335)||(25421430-25421686)
chr5 (121-335)||(13025209-13025425)
chr5 (121-335)||(13095393-13095609)
chr5 (82-335)||(25431293-25431548)
chr5 (121-335)||(8286848-8287066)
chr5 (121-328)||(21808395-21808604)
chr5 (121-328)||(21729070-21729280)
chr5 (121-335)||(22074919-22075134)
chr5 (174-328)||(19660894-19661050)
chr5 (173-327)||(20806845-20806998)
chr5 (136-335)||(21292992-21293191)
chr5 (87-335)||(37723802-37724050)
chr5 (174-344)||(21329556-21329723)
chr5 (182-344)||(21565436-21565595)
chr5 (174-306)||(36314504-36314639)
chr5 (83-370)||(22143917-22144202)
chr5 (114-370)||(26012034-26012289)
chr5 (126-370)||(21502167-21502409)
chr5 (121-370)||(20026945-20027192)
chr5 (174-370)||(22959591-22959782)
chr5 (182-338)||(19668795-19668951)
chr5 (121-306)||(17517207-17517400)
chr5 (174-370)||(26740705-26740895)
chr5 (83-304)||(40725782-40726006)
chr5 (189-370)||(27989004-27989180)
chr5 (83-370)||(22178188-22178471)
chr5 (312-371)||(21732158-21732217)
chr5 (312-371)||(21809809-21809868)
chr5 (312-370)||(22178451-22178509)
chr5 (312-370)||(26740875-26740933)
chr5 (312-368)||(25578261-25578317)
chr5 (114-177)||(20766119-20766181)
chr5 (312-370)||(26733062-26733120)
chr5 (312-371)||(16227313-16227372)
chr5 (312-371)||(25574695-25574754)
chr5 (312-371)||(25575888-25575947)
chr5 (311-370)||(20027171-20027230)
chr5 (278-371)||(14047939-14048038)
chr5 (312-370)||(22143879-22143937)
chr5 (312-370)||(26012269-26012327)
chr5 (311-371)||(23469634-23469695)
chr5 (312-371)||(23202759-23202819)
chr5 (137-225)||(18418590-18418678)
chr5 (312-370)||(21502389-21502447)
chr5 (312-370)||(22959762-22959820)
chr5 (311-369)||(23202720-23202778)
chr5 (177-231)||(26704075-26704129)
chr5 (177-231)||(26973808-26973862)
chr5 (312-370)||(27989160-27989218)
chr5 (311-370)||(21809771-21809829)
chr5 (312-370)||(19668727-19668785)
chr5 (210-301)||(22107709-22107802)
chr5 (174-219)||(26732892-26732937)
chr5 (255-306)||(18418528-18418580)
chr5 (312-368)||(21329728-21329784)
chr5 (312-368)||(21565375-21565431)
chr5 (312-371)||(2154894-2154958)
chr5 (311-345)||(21731651-21731685)
chr5 (174-231)||(22032323-22032380)
chr5 (312-369)||(23469675-23469731)
chr5 (278-327)||(41095699-41095747)
chr5 (337-369)||(6551516-6551548)
[»] chr4 (91 HSPs)
chr4 (83-371)||(15118365-15118653)
chr4 (83-371)||(50222352-50222640)
chr4 (83-371)||(52312371-52312659)
chr4 (83-371)||(18239432-18239720)
chr4 (83-371)||(44615149-44615437)
chr4 (83-371)||(1837522-1837810)
chr4 (83-366)||(44773100-44773383)
chr4 (83-371)||(18215287-18215576)
chr4 (83-339)||(12320-12577)
chr4 (83-371)||(7641205-7641483)
chr4 (83-371)||(15355337-15355627)
chr4 (114-371)||(54798753-54799012)
chr4 (83-344)||(44928892-44929155)
chr4 (114-368)||(8574868-8575121)
chr4 (83-327)||(51463881-51464124)
chr4 (83-370)||(44102070-44102363)
chr4 (83-327)||(23803278-23803521)
chr4 (82-329)||(16377490-16377737)
chr4 (90-371)||(14280170-14280458)
chr4 (83-327)||(12610856-12611092)
chr4 (82-327)||(7798681-7798928)
chr4 (110-345)||(14038545-14038774)
chr4 (123-329)||(52873375-52873583)
chr4 (82-335)||(22636334-22636589)
chr4 (83-259)||(19242673-19242848)
chr4 (87-335)||(7893601-7893852)
chr4 (95-327)||(15369925-15370159)
chr4 (83-327)||(15402610-15402856)
chr4 (83-260)||(3514979-3515156)
chr4 (82-335)||(16270203-16270458)
chr4 (83-327)||(15367597-15367843)
chr4 (83-327)||(15371109-15371355)
chr4 (83-306)||(19618185-19618415)
chr4 (85-335)||(12902656-12902908)
chr4 (83-371)||(20149686-20149979)
chr4 (83-306)||(14970720-14970950)
chr4 (83-327)||(15373390-15373636)
chr4 (88-335)||(44052728-44052977)
chr4 (95-327)||(16223439-16223673)
chr4 (82-335)||(16239937-16240192)
chr4 (150-335)||(3096192-3096379)
chr4 (83-216)||(21815598-21815731)
chr4 (85-279)||(7088832-7089028)
chr4 (89-316)||(6899808-6900037)
chr4 (121-335)||(23374365-23374575)
chr4 (174-335)||(15551716-15551879)
chr4 (182-370)||(39706356-39706545)
chr4 (136-335)||(14053323-14053523)
chr4 (174-335)||(17046386-17046549)
chr4 (83-327)||(22353740-22353986)
chr4 (83-370)||(13819-14102)
chr4 (282-371)||(29267481-29267570)
chr4 (83-370)||(43198521-43198803)
chr4 (114-369)||(46640453-46640706)
chr4 (110-370)||(12773879-12774132)
chr4 (83-369)||(52243162-52243446)
chr4 (234-370)||(14157718-14157854)
chr4 (234-370)||(14164423-14164559)
chr4 (174-306)||(8846287-8846418)
chr4 (312-371)||(14853103-14853162)
chr4 (222-344)||(14927842-14927964)
chr4 (121-344)||(12288214-12288436)
chr4 (312-371)||(15791516-15791575)
chr4 (312-369)||(14825303-14825360)
chr4 (312-365)||(15791648-15791701)
chr4 (312-371)||(13592334-13592393)
chr4 (311-370)||(32307184-32307243)
chr4 (312-369)||(37018519-37018576)
chr4 (312-370)||(17333110-17333168)
chr4 (312-370)||(53082384-53082442)
chr4 (312-370)||(53631609-53631666)
chr4 (312-368)||(43198783-43198839)
chr4 (315-370)||(12288445-12288500)
chr4 (312-370)||(14082-14140)
chr4 (312-370)||(39706525-39706583)
chr4 (312-369)||(14927969-14928026)
chr4 (83-156)||(15464899-15464972)
chr4 (312-370)||(52243427-52243485)
chr4 (189-369)||(53082227-53082403)
chr4 (339-371)||(13592404-13592436)
chr4 (312-368)||(14157682-14157738)
chr4 (311-370)||(14853065-14853123)
chr4 (312-366)||(26045523-26045578)
chr4 (312-366)||(26050704-26050759)
chr4 (136-216)||(6190481-6190563)
chr4 (312-370)||(13592297-13592354)
chr4 (312-370)||(15791555-15791612)
chr4 (278-327)||(19242623-19242672)
chr4 (312-371)||(11424957-11425016)
chr4 (312-364)||(14164391-14164443)
chr4 (174-214)||(17333298-17333338)
[»] chr1 (89 HSPs)
chr1 (83-371)||(21923304-21923592)
chr1 (83-368)||(13988730-13989015)
chr1 (83-371)||(23593748-23594036)
chr1 (83-368)||(21475100-21475385)
chr1 (83-371)||(29297998-29298285)
chr1 (83-371)||(22123080-22123369)
chr1 (83-371)||(31612173-31612462)
chr1 (83-327)||(29776592-29776837)
chr1 (83-373)||(21711561-21711858)
chr1 (110-335)||(34509679-34509906)
chr1 (83-373)||(21707019-21707316)
chr1 (83-307)||(21346885-21347111)
chr1 (83-328)||(45574855-45575103)
chr1 (88-335)||(50210186-50210439)
chr1 (83-307)||(21342021-21342246)
chr1 (83-306)||(13212874-13213099)
chr1 (83-371)||(40389011-40389304)
chr1 (82-335)||(22532168-22532423)
chr1 (83-307)||(16361835-16362066)
chr1 (83-306)||(21840686-21840916)
chr1 (83-293)||(432950-433159)
chr1 (83-323)||(16275376-16275616)
chr1 (85-335)||(27250699-27250951)
chr1 (225-371)||(27161617-27161764)
chr1 (134-335)||(20847173-20847376)
chr1 (95-259)||(15860033-15860197)
chr1 (85-335)||(20135080-20135338)
chr1 (114-370)||(33680876-33681129)
chr1 (174-335)||(38801447-38801609)
chr1 (109-321)||(22468690-22468910)
chr1 (174-306)||(14295610-14295745)
chr1 (83-370)||(21896224-21896507)
chr1 (289-371)||(431619-431701)
chr1 (182-344)||(22237521-22237680)
chr1 (189-370)||(50686481-50686657)
chr1 (182-344)||(52928038-52928197)
chr1 (114-370)||(22921868-22922120)
chr1 (174-306)||(20454613-20454752)
chr1 (110-338)||(21753947-21754170)
chr1 (83-370)||(35261049-35261329)
chr1 (234-335)||(21477540-21477643)
chr1 (182-370)||(20248150-20248332)
chr1 (121-265)||(21026649-21026795)
chr1 (189-370)||(16368361-16368536)
chr1 (312-371)||(21534100-21534159)
chr1 (312-371)||(48520166-48520225)
chr1 (83-370)||(16758520-16758803)
chr1 (83-262)||(21861538-21861714)
chr1 (312-371)||(20316288-20316347)
chr1 (83-368)||(41050004-41050285)
chr1 (312-371)||(22124116-22124175)
chr1 (114-366)||(50614114-50614364)
chr1 (114-366)||(50621942-50622192)
chr1 (165-322)||(21161635-21161787)
chr1 (191-370)||(26064808-26064982)
chr1 (312-370)||(16758482-16758540)
chr1 (177-231)||(21714546-21714600)
chr1 (312-370)||(21753879-21753937)
chr1 (312-370)||(26064770-26064828)
chr1 (312-370)||(50614348-50614406)
chr1 (312-370)||(50622176-50622234)
chr1 (278-335)||(20916126-20916182)
chr1 (312-368)||(16368516-16368572)
chr1 (312-368)||(35261309-35261365)
chr1 (288-371)||(47190469-47190550)
chr1 (312-370)||(33680838-33680896)
chr1 (312-370)||(41050267-41050325)
chr1 (182-219)||(20918620-20918657)
chr1 (312-371)||(14800359-14800419)
chr1 (312-371)||(14809233-14809293)
chr1 (190-370)||(21533948-21534120)
chr1 (312-368)||(21896487-21896543)
chr1 (312-356)||(52954556-52954600)
chr1 (312-370)||(20248113-20248170)
chr1 (312-366)||(22124159-22124213)
chr1 (312-370)||(22237458-22237516)
chr1 (312-370)||(22922100-22922158)
chr1 (312-368)||(52928202-52928258)
chr1 (312-371)||(23967586-23967644)
chr1 (177-232)||(24783155-24783210)
chr1 (312-370)||(42912054-42912112)
chr1 (278-327)||(15860198-15860247)
chr1 (82-159)||(22354539-22354616)
chr1 (312-369)||(29297957-29298019)
chr1 (174-231)||(42865273-42865330)
chr1 (339-371)||(431576-431608)
chr1 (312-371)||(21043511-21043571)
chr1 (337-369)||(24720814-24720846)
chr1 (312-371)||(42911974-42912033)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (83-371)||(37682-37970)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (83-369)||(136543-136829)
scaffold0028 (83-369)||(139012-139298)
scaffold0028 (83-369)||(143950-144236)
scaffold0028 (83-369)||(141481-141767)
scaffold0028 (83-371)||(134072-134360)
scaffold0028 (110-344)||(132554-132784)
scaffold0028 (174-217)||(62216-62260)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (83-368)||(13256-13541)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (83-371)||(40261-40549)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (83-371)||(13808-14096)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (83-371)||(158463-158752)
scaffold0003 (89-338)||(339924-340172)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (83-371)||(9609-9899)
scaffold0145 (82-335)||(32840-33095)
scaffold0145 (82-335)||(38659-38914)
scaffold0145 (245-335)||(32374-32465)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (83-371)||(11924-12207)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (114-371)||(44706-44965)
scaffold0122 (88-228)||(26038-26179)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (83-370)||(4070-4364)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (83-371)||(16638-16933)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (114-371)||(116283-116547)
scaffold0022 (189-370)||(129045-129221)
scaffold0022 (312-369)||(44435-44492)
scaffold0022 (189-344)||(78217-78368)
scaffold0022 (312-369)||(78156-78212)
[»] scaffold0001 (5 HSPs)
scaffold0001 (83-334)||(85592-85845)
scaffold0001 (83-306)||(501003-501233)
scaffold0001 (121-338)||(160584-160798)
scaffold0001 (312-370)||(160516-160574)
scaffold0001 (312-371)||(497294-497353)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (83-326)||(81978-82221)
scaffold0037 (114-370)||(22669-22921)
scaffold0037 (312-370)||(22901-22959)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (83-327)||(12-255)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (82-345)||(4397-4661)
scaffold0228 (82-345)||(11979-12243)
scaffold0228 (82-345)||(21931-22195)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (82-345)||(16567-16832)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (82-338)||(3118-3375)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (174-371)||(15298-15496)
scaffold0106 (174-335)||(1188-1351)
scaffold0106 (182-306)||(7193-7319)
scaffold0106 (312-371)||(19877-19936)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (82-335)||(1750-2005)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (83-334)||(2141-2394)
scaffold0247 (83-335)||(17995-18250)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (82-335)||(13111-13365)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (89-335)||(128650-128897)
scaffold0031 (83-216)||(20392-20524)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (82-335)||(51812-52067)
scaffold0011 (85-335)||(167948-168200)
scaffold0011 (312-371)||(125562-125621)
scaffold0011 (312-371)||(38345-38404)
scaffold0011 (312-366)||(125642-125695)
scaffold0011 (339-370)||(38415-38446)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (83-306)||(29856-30081)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (83-334)||(161102-161355)
scaffold0007 (83-153)||(164603-164674)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (83-337)||(1293-1547)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (82-338)||(32925-33181)
scaffold0120 (82-338)||(45824-46080)
scaffold0120 (82-335)||(16012-16267)
scaffold0120 (173-338)||(17388-17554)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (83-260)||(4666-4843)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (83-306)||(10692-10922)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (83-306)||(9161-9391)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (88-329)||(3159-3406)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (82-335)||(8500-8751)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (86-335)||(25794-26045)
scaffold0026 (86-335)||(39756-40007)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (83-306)||(11207-11437)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (88-334)||(17188-17442)
scaffold0056 (83-216)||(79297-79430)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (85-335)||(1018-1270)
[»] scaffold0292 (4 HSPs)
scaffold0292 (82-329)||(3375-3624)
scaffold0292 (82-335)||(243-496)
scaffold0292 (312-371)||(4579-4637)
scaffold0292 (312-370)||(4617-4674)
[»] scaffold0046 (8 HSPs)
scaffold0046 (121-335)||(28312-28529)
scaffold0046 (182-335)||(4450-4605)
scaffold0046 (182-335)||(1895-2050)
scaffold0046 (121-274)||(11252-11407)
scaffold0046 (312-371)||(17147-17206)
scaffold0046 (312-371)||(26296-26355)
scaffold0046 (312-370)||(26222-26279)
scaffold0046 (312-370)||(26259-26316)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (82-335)||(39376-39630)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (82-335)||(75182-75436)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (83-306)||(12262-12492)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (82-335)||(39812-40066)
scaffold0080 (115-370)||(19883-20136)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (82-259)||(22859-23036)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (82-329)||(6088-6340)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (121-329)||(8386-8594)
[»] scaffold0021 (5 HSPs)
scaffold0021 (174-335)||(121665-121827)
scaffold0021 (87-335)||(174665-174913)
scaffold0021 (226-370)||(136491-136635)
scaffold0021 (312-370)||(136615-136673)
scaffold0021 (226-329)||(145199-145303)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (121-334)||(4749-4964)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (83-327)||(38670-38916)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (174-335)||(4893-5055)
scaffold0395 (82-159)||(930-1006)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (179-335)||(172-329)
scaffold0175 (182-329)||(34028-34176)
scaffold0175 (82-170)||(13158-13246)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (85-335)||(1851-2103)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (145-335)||(4611-4803)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (83-229)||(4300-4446)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (136-335)||(31966-32165)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (85-335)||(10395-10646)
[»] scaffold0165 (3 HSPs)
scaffold0165 (83-370)||(27717-28001)
scaffold0165 (210-305)||(3442-3539)
scaffold0165 (210-305)||(7506-7603)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (136-335)||(13395-13596)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (136-335)||(11464-11666)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (121-327)||(15570-15776)
[»] scaffold0530 (2 HSPs)
scaffold0530 (182-370)||(1102-1290)
scaffold0530 (312-370)||(1270-1328)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (182-370)||(6476-6664)
scaffold0333 (182-344)||(13881-14044)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (136-335)||(15485-15686)
scaffold0114 (174-231)||(7295-7352)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (136-329)||(46900-47093)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (83-370)||(16068-16352)
scaffold0357 (189-368)||(2534-2707)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (85-340)||(4412-4675)
[»] scaffold0621 (3 HSPs)
scaffold0621 (83-344)||(8361-8619)
scaffold0621 (114-343)||(6428-6657)
scaffold0621 (312-370)||(8298-8356)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (121-328)||(20815-21026)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (114-370)||(19131-19386)
scaffold0102 (315-370)||(19093-19148)
[»] scaffold0020 (4 HSPs)
scaffold0020 (182-370)||(15845-16033)
scaffold0020 (312-371)||(142450-142509)
scaffold0020 (177-231)||(178898-178952)
scaffold0020 (312-370)||(16013-16071)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (114-370)||(14696-14951)
scaffold0008 (312-370)||(14931-14989)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (114-370)||(10540-10794)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (208-335)||(32059-32188)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (83-327)||(11370-11617)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (182-344)||(2713-2870)
scaffold0207 (312-369)||(2875-2932)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (83-327)||(38224-38471)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (182-335)||(5196-5350)
[»] scaffold0130 (2 HSPs)
scaffold0130 (199-338)||(27771-27913)
scaffold0130 (82-155)||(27911-27984)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (174-344)||(23942-24110)
scaffold0100 (312-370)||(24115-24173)
[»] scaffold0628 (3 HSPs)
scaffold0628 (114-370)||(2805-3056)
scaffold0628 (290-344)||(3280-3333)
scaffold0628 (312-366)||(3036-3090)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (189-335)||(1124-1271)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (182-338)||(45860-46013)
scaffold0125 (312-370)||(46023-46081)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (174-371)||(30199-30392)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (114-365)||(1-251)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (114-370)||(32403-32657)
scaffold0034 (312-370)||(32365-32423)
scaffold0034 (188-216)||(51957-51985)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (114-370)||(10394-10649)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (110-370)||(31969-32224)
scaffold0150 (312-370)||(31931-31989)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (174-335)||(51481-51644)
scaffold0032 (311-369)||(63273-63330)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (208-329)||(2494-2616)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (182-370)||(12631-12819)
scaffold0476 (312-370)||(12593-12651)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (182-306)||(1137-1263)
[»] scaffold2014 (2 HSPs)
scaffold2014 (134-344)||(928-1134)
scaffold2014 (312-370)||(865-923)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (121-335)||(16181-16395)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (121-344)||(12833-13054)
scaffold0138 (312-370)||(12770-12828)
[»] scaffold0697 (2 HSPs)
scaffold0697 (288-371)||(6463-6546)
scaffold0697 (318-371)||(6420-6478)
[»] scaffold0211 (2 HSPs)
scaffold0211 (183-344)||(28839-28995)
scaffold0211 (312-370)||(29000-29058)
[»] scaffold0075 (2 HSPs)
scaffold0075 (83-370)||(53517-53800)
scaffold0075 (312-370)||(53780-53838)
[»] scaffold0413 (2 HSPs)
scaffold0413 (83-344)||(12463-12720)
scaffold0413 (313-370)||(12400-12457)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (114-344)||(5538-5765)
[»] scaffold1765 (2 HSPs)
scaffold1765 (182-370)||(955-1135)
scaffold1765 (312-370)||(917-975)
[»] scaffold0010 (7 HSPs)
scaffold0010 (114-338)||(129805-130027)
scaffold0010 (83-262)||(60683-60860)
scaffold0010 (306-370)||(117814-117877)
scaffold0010 (312-373)||(6844-6906)
scaffold0010 (312-370)||(129737-129795)
scaffold0010 (312-368)||(117857-117913)
scaffold0010 (314-368)||(481-536)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (83-366)||(106157-106437)
scaffold0006 (312-366)||(96842-96896)
scaffold0006 (83-370)||(96876-97159)
[»] scaffold0556 (3 HSPs)
scaffold0556 (174-338)||(6718-6874)
scaffold0556 (312-370)||(6650-6708)
scaffold0556 (114-160)||(8091-8137)
[»] scaffold0507 (2 HSPs)
scaffold0507 (79-344)||(8023-8286)
scaffold0507 (312-370)||(8291-8349)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (121-370)||(8078-8324)
scaffold0218 (312-370)||(8304-8362)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (82-217)||(24269-24406)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (82-170)||(3497-3585)
scaffold0327 (177-231)||(289-343)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (182-250)||(6191-6259)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (83-148)||(13092-13157)
[»] scaffold0914 (2 HSPs)
scaffold0914 (312-371)||(1532-1591)
scaffold0914 (312-370)||(1571-1628)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (312-371)||(55912-55971)
scaffold0077 (311-370)||(55874-55932)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (312-370)||(4925-4983)
scaffold0081 (311-370)||(4887-4945)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (311-369)||(206716-206774)
scaffold0014 (174-214)||(206584-206624)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (163-216)||(11982-12035)
scaffold0503 (83-126)||(12039-12082)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (234-344)||(225344-225455)
scaffold0012 (83-160)||(225483-225559)
scaffold0012 (339-371)||(221388-221420)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (311-370)||(12417-12476)
[»] scaffold0090 (1 HSPs)
scaffold0090 (312-370)||(2509-2567)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (283-345)||(10185-10247)
[»] scaffold0047 (1 HSPs)
scaffold0047 (312-369)||(22113-22170)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (312-369)||(14349-14406)
[»] scaffold0347 (1 HSPs)
scaffold0347 (311-371)||(8721-8781)
[»] scaffold0072 (2 HSPs)
scaffold0072 (312-368)||(57652-57708)
scaffold0072 (312-370)||(57688-57745)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (189-344)||(103706-103857)
scaffold0040 (311-370)||(103861-103920)
scaffold0040 (312-371)||(102086-102145)
[»] scaffold0293 (2 HSPs)
scaffold0293 (312-371)||(17335-17394)
scaffold0293 (312-369)||(17375-17431)
[»] scaffold0737 (2 HSPs)
scaffold0737 (190-370)||(1874-2049)
scaffold0737 (317-370)||(2034-2087)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (314-368)||(2791-2845)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (306-370)||(38263-38326)
scaffold0139 (182-231)||(19980-20029)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (312-368)||(24942-24998)
scaffold0123 (189-370)||(24978-25152)
[»] scaffold1539 (2 HSPs)
scaffold1539 (313-371)||(770-828)
scaffold1539 (312-370)||(809-866)
[»] scaffold1283 (1 HSPs)
scaffold1283 (312-370)||(1603-1660)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (177-231)||(23843-23897)
[»] scaffold0096 (1 HSPs)
scaffold0096 (285-335)||(20907-20957)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (313-371)||(332150-332208)
scaffold0004 (177-231)||(69794-69848)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (182-231)||(36454-36503)
[»] scaffold0107 (3 HSPs)
scaffold0107 (312-369)||(10365-10422)
scaffold0107 (312-369)||(36052-36108)
scaffold0107 (312-371)||(36011-36071)
[»] scaffold1403 (2 HSPs)
scaffold1403 (189-344)||(446-596)
scaffold1403 (312-370)||(383-441)
[»] scaffold0601 (1 HSPs)
scaffold0601 (312-360)||(7854-7902)
[»] scaffold0420 (4 HSPs)
scaffold0420 (312-366)||(6459-6513)
scaffold0420 (312-366)||(13913-13967)
scaffold0420 (306-370)||(6416-6479)
scaffold0420 (306-370)||(13870-13933)
[»] scaffold0780 (2 HSPs)
scaffold0780 (322-370)||(4837-4885)
scaffold0780 (339-372)||(4897-4930)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (312-370)||(3507-3565)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (312-370)||(1803-1861)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (182-231)||(29558-29607)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (177-249)||(193039-193112)
[»] scaffold0452 (2 HSPs)
scaffold0452 (312-371)||(13774-13832)
scaffold0452 (312-368)||(13737-13792)
[»] scaffold0425 (1 HSPs)
scaffold0425 (177-231)||(159-213)
[»] scaffold0210 (2 HSPs)
scaffold0210 (177-231)||(21866-21920)
scaffold0210 (177-231)||(29758-29812)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (312-366)||(61760-61817)
[»] scaffold2080 (1 HSPs)
scaffold2080 (311-364)||(950-1002)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (174-231)||(1881-1938)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (312-368)||(1728-1785)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (85-170)||(6676-6761)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (174-231)||(10582-10639)
[»] scaffold0301 (1 HSPs)
scaffold0301 (312-371)||(10840-10899)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (312-371)||(18398-18458)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (312-371)||(19871-19930)


Alignment Details
Target: scaffold0254 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20896 - 20608
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20896 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 20797  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20796 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 20697  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20696 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 20608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 9)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 94560 - 94272
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  94560 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 94461  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94460 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 94361  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94360 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 94272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44604 - 44315
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttct-gtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  44604 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgttgtgttgctg 44505  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44504 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttcaaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 44405  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44404 gaggtcgagtccatgcattagcttttaattgttggggacttgatgccctggagcctttgctcaattaagttaagggcttgatgccctggg 44315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 83 - 228
Target Start/End: Original strand, 17453 - 17598
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |    
T  17453 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctat 17552  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17553 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 17598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 119937 - 119774
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  119937 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaatt 119838  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  119837 aagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgagggcttgatgccctggagc 119774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 103 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 100507 - 100269
Alignment:
Q  103 tatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctg 200  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||    
T  100507 tatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctg 100409  T
Q  201 catgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||   || ||||| ||||||  || | ||||||||||    
T  100408 catgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattgga-tatataagaggttgttttttataagaagttaagttgttgtgtccatgcat 100313  T
Q  300 tagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  100312 tagca-ttcattgttgggagcttgatgccctggagcctttgctca 100269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 101552 - 101371
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||   |||||||| |||| ||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| ||||||    
T  101552 ttgttgtttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgat---gatgatgatgttctaaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgttaa 101457  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    || || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  | |||| |||||||||||||||    
T  101456 gatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcccttgctc-accacgttgggggcttgatgccctg 101371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 342
Target Start/End: Original strand, 40173 - 40398
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || ||  |||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  40173 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcctactgcctatgttgctgtttattatttaactaagctgcatgagtcagt 40271  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||||||||||| |||||    
T  40272 ctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttggttataagaagttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcat 40366  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgct 342  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||    
T  40367 tgttggggacttgatgccgtggagcctttgct 40398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #8
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 100240 - 100182
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  100240 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 100182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #9
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 305
Target Start/End: Original strand, 38542 - 38672
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga---tgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaa 273  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||   ||||  |||||||| ||||||| ||||||| | ||  || ||||    
T  38542 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtcaatataagatgattaagatgatgttgaacctccaaattattggatt-tataaga-gatgatga-ttaa 38638  T
Q  274 gatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 305  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38639 gatgttttaagagatcgagtccatgcattagcat 38672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 100)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 5853305 - 5853593
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5853305 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 5853404  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853405 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 5853504  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853505 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 5853593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1484551 - 1484263
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1484551 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 1484452  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1484451 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 1484352  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484351 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 1484263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20403376 - 20403088
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20403376 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 20403277  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20403276 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 20403177  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403176 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 20403088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 20046208 - 20046496
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  20046208 tatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgt 20046307  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20046308 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 20046407  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046408 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 20046496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 4542386 - 4542674
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||    
T  4542386 tatatgcattacttgaactatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatcttgttgtgttgctgt 4542485  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542486 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 4542585  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542586 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 4542674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22001902 - 22001615
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22001902 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 22001803  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22001802 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaacatgttaag 22001703  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001702 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgtt-ggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 22001615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19896417 - 19896126
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat---gtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19896417 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattattatgtcatgctgtttttgtataccgttgtgttgc 19896318  T
Q  180 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896317 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt 19896218  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896217 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 19896126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 15203244 - 15203532
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15203244 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 15203343  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203344 tgttatttaactaagctgcatgagtcgctctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 15203443  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15203444 aggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgcccaggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttggg 15203532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 83 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14823922 - 14823638
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  14823922 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgt 14823823  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823822 tgttatttaactttgctgcatgagt-ggtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 14823724  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823723 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 14823638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41598337 - 41598049
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  41598337 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgt 41598238  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  41598237 tgttattcaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcaatttaagatgtttaa 41598138  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598137 gaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagtctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 41598049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 87 - 370
Target Start/End: Original strand, 45290711 - 45290996
Alignment:
Q  87 tgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgt 185  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  45290711 tgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattggcttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgt 45290810  T
Q  186 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagag 284  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45290811 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagag 45290910  T
Q  285 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  45290911 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctgg 45290996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 114 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26219834 - 26219577
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 213  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219834 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactattt-tgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26219736  T
Q  214 aagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 312  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219735 aagttgattatgatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 26219636  T
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26219635 ttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 26219577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Original strand, 26225292 - 26225548
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 213  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225292 ttgagatgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatactgttt-tgtatattgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 26225390  T
Q  214 aagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26225391 aagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 26225490  T
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  26225491 ttgggggcttgatgccctggagcctttgcttaattaagttaagggcttgatgccctgg 26225548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 14409457 - 14409702
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  14409457 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 14409556  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14409557 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaa 14409656  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  14409657 gaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 14409702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 4483429 - 4483207
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4483429 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 4483330  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  4483329 tgtta-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcga-ttaagatgtttaa 4483232  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  4483231 gaggtcgagtccatgcattagcatt 4483207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 114 - 346
Target Start/End: Original strand, 16092341 - 16092575
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092341 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 16092440  T
Q  213 taagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 311  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092441 taagttgatgaagatgatgatgttccaaactattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 16092540  T
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaat 346  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16092541 gttggaggcttgatgccctggagcctttgctcaat 16092575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 82 - 346
Target Start/End: Complemental strand, 6759409 - 6759147
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||| |||||| |||||||||  ||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  6759409 ttatacgcattaattgaattatgagtgtataattgaga---tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctgtgttgct 6759313  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt- 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6759312 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgt-ccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttt 6759214  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaat 346  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6759213 aagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaat 6759147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 18818376 - 18818631
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  18818376 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 18818475  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  18818476 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 18818575  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18818576 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgccctggagc 18818631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 123 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23406492 - 23406278
Alignment:
Q  123 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406492 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 23406393  T
Q  222 taagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 320  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406392 gaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 23406293  T
Q  321 ttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||| |||||    
T  23406292 ttgatgccctggagc 23406278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 82 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22875218 - 22874954
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  22875218 ttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatactgcctgtgttgct 22875120  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat-gtt 279  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||    
T  22875119 gctgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgttccaaattattggactatataagaggttgttgatttaagatattt 22875020  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22875019 aagaggtcgagtccatgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa 22874954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7372931 - 7372685
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    |||| |||||||||||| ||||  | |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  7372931 tataagcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctg 7372832  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  7372831 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttta 7372732  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  7372731 agaggttgagtccatgcatcaacatttcattgttgggggcttgatgc 7372685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 89 - 338
Target Start/End: Original strand, 28649018 - 28649273
Alignment:
Q  89 cattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgtta 187  Q
    |||||||||||||||   |  |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||| ||||||    
T  28649018 cattacttgaattatgaatgtataattaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgcttttgtta 28649117  T
Q  188 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag----ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  28649118 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaag 28649217  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  28649218 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttggagcctt 28649273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 25484288 - 25484524
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||        |||||    
T  25484288 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacta-------gctgt 25484380  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25484381 tgttatttaactaagctgcacgagttggtctaagttgattaagatgatgaagttctaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaa 25484479  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  25484480 gaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgtgggcttgatgc 25484524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Original strand, 16413329 - 16413547
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16413329 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 16413428  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||| ||| ||||||||  |  | |||||||| ||||    
T  16413429 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat------gttccaaattattggactatttaagaggtcatttaattaagatgtttaa 16413522  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16413523 gtggtcgagtccatgcattagcatt 16413547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 89 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 22626882 - 22626631
Alignment:
Q  89 cattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgtta 187  Q
    ||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||    
T  22626882 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgatttgtatttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatactgcctatgttgctgttgtta 22626784  T
Q  188 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 285  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  22626783 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttttcaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagg 22626684  T
Q  286 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  22626683 tcgagtccatgcattaacatttcattgttggaggcttgatgccctggagcctt 22626631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 21923895 - 21924149
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||  | |||||||    
T  21923895 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattatcatgtcatgttgtttttgtagactgcctatgttgct 21923994  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||    
T  21923995 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatgtaagaggttgtcgaattaagatgttt 21924094  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  21924095 aagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgtt-ggggcttaatgccctggagc 21924149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 21918969 - 21919222
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattat-atgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||||||||  || || | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||    
T  21918969 tatgcattacttgaagaattatttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgt 21919068  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  21919069 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgttta 21919168  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  21919169 agaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgcgggcttgatgccctggagc 21919222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 20536362 - 20536113
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||| ||    
T  20536362 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgtttct 20536263  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt-t 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| |||| || ||||||||| |    
T  20536262 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattgaattatataagagattgttgaattaagatgtct 20536163  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20536162 aagaggtctagtccatgcattagcatttcattgttgggggtttgatgccc 20536113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Original strand, 18879209 - 18879451
Alignment:
Q  88 gcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgtt 186  Q
    ||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||     ||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  18879209 gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgt-----tgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 18879303  T
Q  187 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 285  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||||    
T  18879304 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtc--attaagatgtttaagagg 18879401  T
Q  286 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18879402 tcgagttcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 18879451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 95 - 259
Target Start/End: Original strand, 19937030 - 19937194
Alignment:
Q  95 ttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaac 193  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19937030 ttgaattatttgtgagtaattgagacgttgattgacttgcatttgatcttattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 19937129  T
Q  194 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataaga 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19937130 taagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaag-tccaaattattggattatataaga 19937194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 26224068 - 26223841
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| || | | |||||||    
T  26224068 tatatgcattaattaaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatattgctttattgctgt 26223969  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga---tgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || ||||| || |    
T  26223968 tgttatttaattaagctgcatgggtcgatctaagttgattaagatgttgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagttgtt 26223869  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26223868 taagaggtcgagtccatgcattaacatt 26223841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 13597585 - 13597840
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || || ||| || ||||||||    
T  13597585 tatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgggatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttt-tgcattctgcttatgttgctg 13597683  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattat-ataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13597684 attgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgacgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtt 13597783  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13597784 taagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagc 13597840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 13508053 - 13508308
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||  | ||||||||    
T  13508053 tatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttg-tgcatattgcctatgttgctg 13508151  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattat-ataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  13508152 attgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgacgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtt 13508251  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13508252 taagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagc 13508308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 31971356 - 31971155
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  31971356 ttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 31971258  T
Q  235 ttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 331  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  31971257 ttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgttttaagagatcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 31971159  T
Q  332 gagc 335  Q
    ||||    
T  31971158 gagc 31971155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 19801395 - 19801527
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  19801395 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcgtttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgttgtgttgctat 19801493  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19801494 tgttatttaactaagctgcatgagccggtctaag 19801527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Original strand, 38855250 - 38855506
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  38855250 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 38855348  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||  ||   ||||||||||||||| |||||    
T  38855349 ctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgga-tatataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttatgtccatgcattagca-ttcat 38855446  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  38855447 tgttgggggcttgatgcactggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 38855506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 45131019 - 45131218
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |    
T  45131019 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatg 45131116  T
Q  235 ttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 332  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  45131117 ttccaaattattggactaatttaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctgg 45131215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 16199666 - 16199866
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  | ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  16199666 ttgatattattatgtcatgttgttt--gaatactgtctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 16199763  T
Q  234 gttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 331  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  16199764 gttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 16199862  T
Q  332 gagc 335  Q
    ||||    
T  16199863 gagc 16199866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21255272 - 21255121
Alignment:
Q  185 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21255272 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaag 21255173  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21255172 aggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 21255121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Original strand, 5866280 - 5866496
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5866280 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 5866378  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    | | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5866379 gttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgg 5866477  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  5866478 gggcttgatgccctggagc 5866496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21491057 - 21490893
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||    
T  21491057 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattgaattaatataagaggttgtcgaatt 21490958  T
Q  272 aagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  21490957 aagatgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcgttgttgggggcttgatgccctggagc 21490893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6520483 - 6520233
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6520483 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 6520385  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  6520384 gattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgtcgg 6520286  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  6520285 gggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 6520233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17140978 - 17140815
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  17140978 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaatt 17140879  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17140878 aagttgtttaagaggtcgagtccatacattagta-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 17140815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 185 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21249434 - 21249283
Alignment:
Q  185 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||    
T  21249434 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaag 21249335  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21249334 aggccgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 21249283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 137 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23648652 - 23648446
Alignment:
Q  137 tgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------a 229  Q
    |||||||||||||||||| ||||  ||||  |||  | ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |    
T  23648652 tgatattattatgtcatgttgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatga 23648553  T
Q  230 tgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 328  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  23648552 tgatgttccaaattattggactatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcacagttgggggcttgatgcc 23648453  T
Q  329 cgggagc 335  Q
    | |||||    
T  23648452 ctggagc 23648446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Original strand, 21389458 - 21389672
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21389458 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21389554  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    | | |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21389555 gttgaagatgatgatgttccaaattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgg 21389653  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  21389654 gggcttgatgccctggagc 21389672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Original strand, 21778784 - 21778998
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   |||||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21778784 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactacctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21778880  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    | | |||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21778881 gttgaagatgatgatgttccaaattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgg 21778979  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  21778980 gggcttgatgccctggagc 21778998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 83 - 334
Target Start/End: Original strand, 17612078 - 17612332
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | ||||| ||    
T  17612078 tatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttt-tgcatactgcctatgttgttg 17612176  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  17612177 attgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgttgatttaagatgtt 17612276  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 334  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||    
T  17612277 taagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgccctggag 17612332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 99 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15070692 - 15070571
Alignment:
Q  99 attatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15070692 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 15070593  T
Q  198 ctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  15070592 ctgcatgagtcggtctaagttg 15070571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Original strand, 26355766 - 26355951
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtta 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||   ||||    
T  26355766 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaaatggtta 26355862  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  26355863 agatgttgtgtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 26355951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 344
Target Start/End: Original strand, 23760903 - 23761071
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| | | | |    
T  23760903 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttattgttct 23760999  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||| |||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23761000 aagttgttaagatgttttgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 23761071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Original strand, 21395988 - 21396202
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21395988 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21396084  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    | | |||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21396085 gttgaagatgatgatgttccacattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgg 21396183  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  21396184 gggctttatgccctggagc 21396202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Original strand, 21790481 - 21790695
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21790481 gttgatgaattgaatttgatataattatctcatgctgtt---gtatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 21790577  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    | | |||||||||| |||||| ||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21790578 gttgaagatgatgatgttccacattattggactatattaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgg 21790676  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||| |||||| |||||    
T  21790677 gggctttatgccctggagc 21790695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21285719 - 21285465
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||  | ||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21285719 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaacaaagctgcatgagtcggt 21285621  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 309  Q
    ||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || || || ||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  21285620 ctaagttgattaagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctatgaggttgagtagttgagtccatgcattagca-ttca 21285525  T
Q  310 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||| || ||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  21285524 ttgctgagggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 21285465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Original strand, 983465 - 983657
Alignment:
Q  174 tgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt- 270  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| ||||| || |||||||||| || | ||     
T  983465 tgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaattattggatttttataagaggtcgttgtttc 983559  T
Q  271 taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  983560 taagatgttaagttgttgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagtctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 983657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20498715 - 20498432
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |  ||||||  | ||||||||    
T  20498715 tatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctattt-tacatactgcctatgttgctg 20498617  T
Q  182 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
    || |||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || |||||||     
T  20498616 tttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgc 20498522  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    | ||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  20498521 tgagttgttgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 20498432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 182 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21673757 - 21673599
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgtta 280  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   |||||| | |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||    
T  21673757 ttgttatttaactatgatgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatcatgttccaaattattggact-tataagaggttgttgtttataagaagtta 21673662  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21673661 agttgttgtgtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 21673599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 32121847 - 32121654
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  32121847 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 32121748  T
Q  220 attaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32121747 attaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgagttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 32121654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 228 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22965707 - 22965608
Alignment:
Q  228 gatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||||||||||    
T  22965707 gatgaagttccaaattattggattatataagaggttgccgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcagtgattggggcttgatg 22965609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28397441 - 28397381
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28397441 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 28397381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22995733 - 22995674
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995733 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 22995674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22525449 - 22525391
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22525449 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 22525391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24352912 - 24352854
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24352912 gttgggggcttgatgccttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 24352854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 315 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16799372 - 16799316
Alignment:
Q  315 gggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16799372 gggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctggg 16799316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 22963642 - 22963698
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22963642 gttgggggcttgatgccctggagccttcgctcaattaagttgagggcttgatgccct 22963698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 37515417 - 37515361
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37515417 gttgggggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 37515361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Original strand, 20502339 - 20502390
Alignment:
Q  320 cttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20502339 cttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 20502390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 23944181 - 23944240
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23944181 tgttgggggcttgatgcccttgagcctttgctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 23944240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 338
Target Start/End: Original strand, 17267069 - 17267214
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||  ||    
T  17267069 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgt 17267163  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
     ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17267164 tgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 17267214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 17439736 - 17439794
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17439736 gttgggggcttgatgacctggagcctttgctcaattaagttgagggcttaatgccctgg 17439794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Original strand, 20533643 - 20533697
Alignment:
Q  316 ggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20533643 ggggtttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 20533697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 121 - 262
Target Start/End: Original strand, 18678108 - 18678256
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18678108 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 18678207  T
Q  220 attaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggt 262  Q
    |||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||    
T  18678208 attaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagaggt 18678256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 24353066 - 24352896
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||||||    | | |||||||| |||  ||     
T  24353066 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtccatgttctaagatgt-aagttgtt 24352973  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  24352972 gagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgcc 24352896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 311 - 368
Target Start/End: Original strand, 40493203 - 40493260
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40493203 tgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaactaagttgagggcttgatgccct 40493260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 2419100 - 2419159
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2419100 gttgggggcttgatgccctggagcttctgctcaattaagttgaggggttgatgccctggg 2419159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 316 - 371
Target Start/End: Original strand, 5083350 - 5083405
Alignment:
Q  316 ggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  5083350 ggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggtttgatgccctggg 5083405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 22253395 - 22253453
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22253395 gttgggggcttgatgccctggagcctttactcaa-taagttgagggcttgatgccctggg 22253453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 367
Target Start/End: Original strand, 19155118 - 19155172
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccc 367  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19155118 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccc 19155172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 22419642 - 22419700
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  22419642 gttgggggtttgatgccctggagcctttgctcaattatgttgagggcttaatgccctgg 22419700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 317 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18833362 - 18833309
Alignment:
Q  317 gggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18833362 gggcttgatgccatggagcctttgctcaattaagttgagggctggatgccctgg 18833309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 5760409 - 5760354
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5760409 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaa-taagttgagggcttgatgccct 5760354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 365
Target Start/End: Original strand, 17086382 - 17086434
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 365  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17086382 ttgggggtttgatgtcctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 17086434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 5760486 - 5760433
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5760486 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaa-taagttgagggcttgatgcc 5760433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20498452 - 20498394
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  20498452 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggtttgatgccctgg 20498394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6520253 - 6520196
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  6520253 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctg 6520196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Original strand, 23761077 - 23761134
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  23761077 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 23761134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 20502293 - 20502351
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  20502293 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgaggacttgatgccctgg 20502351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 22963603 - 22963662
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||   | |||| ||||||||||||||||    
T  22963603 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcatacacgttgggggcttgatgccctgg 22963662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 983637 - 983691
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  983637 gttgggggcttgatgccctggagctttaactcaactaagttgagggcttgatgcc 983691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 119
Target Start/End: Original strand, 24486057 - 24486093
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgaga 119  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24486057 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgaga 24486093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 22253357 - 22253415
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgccc-gggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  22253357 gttgggggcttgatgccctgggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 22253415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 22381962 - 22382017
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22381962 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttgggggcttgatgcc 22382017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22525487 - 22525429
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  22525487 tgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 22525429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 345
Target Start/End: Original strand, 20533601 - 20533635
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20533601 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa 20533635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22995770 - 22995713
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  22995770 gttgggggcttgatgccctggagtctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 22995713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28397477 - 28397420
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  28397477 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcaa-catgttgggggcttgatgccctgg 28397420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 37515454 - 37515397
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||    
T  37515454 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgctctgg 37515397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 327
Target Start/End: Original strand, 19937195 - 19937244
Alignment:
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  19937195 ttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 19937244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 369
Target Start/End: Original strand, 4381787 - 4381819
Alignment:
Q  337 tttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4381787 tttgctctattaagttgagggcttgatgccctg 4381819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22473587 - 22473555
Alignment:
Q  337 tttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22473587 tttgctctattaagttgagggcttgatgccctg 22473555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 113)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11972645 - 11972357
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11972645 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 11972546  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972545 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 11972446  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972445 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 11972357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 14949135 - 14949423
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14949135 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 14949234  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949235 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 14949334  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949335 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 14949423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 32125640 - 32125352
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32125640 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 32125541  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125540 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 32125441  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125440 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 32125352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41523066 - 41522778
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41523066 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 41522967  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522966 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 41522867  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522866 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 41522778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 41525528 - 41525240
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41525528 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 41525429  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525428 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 41525329  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525328 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 41525240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 15376726 - 15377014
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15376726 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 15376825  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15376826 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 15376925  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376926 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 15377014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 21189608 - 21189896
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21189608 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 21189707  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21189708 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 21189807  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189808 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 21189896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 456470 - 456182
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  456470 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 456371  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  456370 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 456271  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456270 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 456182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16232669 - 16232381
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16232669 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 16232570  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  16232569 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 16232470  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232469 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 16232381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16410208 - 16409920
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16410208 tatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 16410109  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410108 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 16410009  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410008 acgtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 16409920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 20385136 - 20385424
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20385136 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 20385235  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  20385236 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 20385335  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385336 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 20385424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 11393300 - 11393588
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11393300 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 11393399  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  11393400 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatggagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 11393499  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393500 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 11393588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24702387 - 24702099
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24702387 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgt 24702288  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24702287 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 24702188  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702187 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 24702099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 27217009 - 27216721
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27217009 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 27216910  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27216909 tgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 27216810  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27216809 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 27216721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24704834 - 24704549
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||| |||||||||||||||||||||    
T  24704834 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttg---tttttgtatactgttgtgttgctgt 24704738  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  24704737 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 24704638  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704637 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 24704549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44116658 - 44116369
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44116658 tatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgt 44116559  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  44116558 tgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaa 44116459  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116458 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 44116369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18640421 - 18640133
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18640421 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 18640322  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18640321 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaaggtccaaattattggactatataagaggttgtcgatttaagatattaag 18640222  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18640221 agttcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggtttgatgccgtggg 18640133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20110695 - 20110416
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||          |||||    
T  20110695 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtata----------gctgt 20110606  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20110605 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaa 20110506  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110505 gaggtcgagtccatgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 20110416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 113 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 48273512 - 48273252
Alignment:
Q  113 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  48273512 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcataagtcggt 48273413  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48273412 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattagcatttcat 48273313  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48273312 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggtttgatgccctggg 48273252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 82 - 371
Target Start/End: Original strand, 18456380 - 18456670
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||    
T  18456380 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatactgcctatgttgct 18456478  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18456479 atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttt 18456578  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18456579 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttaggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgaggccttgatgccctggg 18456670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3386482 - 3386239
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3386482 tatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 3386383  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3386382 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaa 3386284  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3386283 gaagtcgagttcatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 3386239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 26355996 - 26356303
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgtt----- 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||         
T  26355996 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgt 26356095  T
Q  178 ------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcga--- 268  Q
          | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  26356096 tgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattt 26356195  T
Q  269 tttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttga 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||||    
T  26356196 tttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagttgagggcttgatgccctgtgagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttga 26356295  T
Q  363 tgccctgg 370  Q
    ||||||||    
T  26356296 tgccctgg 26356303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 26358448 - 26358755
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgtt----- 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||         
T  26358448 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgttgtgtttatgt 26358547  T
Q  178 ------gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcga--- 268  Q
          | |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||       
T  26358548 tgtgttgttgttgttatttaactttgctgcatgagtcagtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattt 26358647  T
Q  269 tttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttga 362  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | ||||||||    |||| ||| |||||||||||||||    
T  26358648 tttaagatattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagttgagggcttgatgccctgtgagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttga 26358747  T
Q  363 tgccctgg 370  Q
    ||||||||    
T  26358748 tgccctgg 26358755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 329
Target Start/End: Original strand, 3564331 - 3564580
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||    
T  3564331 ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgct 3564430  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3564431 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgaagttctaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttt 3564530  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3564531 aagaggtcgagttcatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccc 3564580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 13647478 - 13647230
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||    
T  13647478 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctg 13647379  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--t 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  13647378 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 13647279  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13647278 taagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttaatgcc 13647230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 38898389 - 38898635
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| | ||    
T  38898389 tatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgctgtgtcgttg 38898488  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  38898489 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaagatggtgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 38898588  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  38898589 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 38898635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 83 - 337
Target Start/End: Original strand, 17061928 - 17062183
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg- 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || |||||||     
T  17061928 tatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgctgacttgcatttgatattattatgtcatgctattt-tgtatactgctgagttgctga 17062026  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||    
T  17062027 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattattggattatacaagagtttgtcgatttaagatgttta 17062126  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 337  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  17062127 agaggtc-aatccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 17062183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 109 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13869470 - 13869250
Alignment:
Q  109 aataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 207  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869470 aataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 13869371  T
Q  208 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13869370 cggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatt 13869271  T
Q  307 tcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||  | | ||||||||||||    
T  13869270 tcagcgataggggcttgatgc 13869250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 9509343 - 9509088
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||  | |||| ||    
T  9509343 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttattgtatactgcctatgttact 9509244  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  9509243 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 9509144  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9509143 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 9509088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 24275320 - 24275089
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  24275320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 24275221  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga------tgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || ||||||     
T  24275220 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagac 24275121  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24275120 gtttaagaggtcgagtccatgcattaacattt 24275089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 18430861 - 18430686
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  18430861 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgt 18430762  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataag 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  18430761 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggattatataag 18430686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 16213833 - 16213656
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16213833 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattaagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgt 16213734  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagag 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16213733 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagag 16213656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38227595 - 38227379
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  38227595 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtag 38227497  T
Q  220 attaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    || |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38227496 atgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagaatttcattgttggg 38227397  T
Q  318 ggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||| |||||    
T  38227396 ggcttgatgccctggagc 38227379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12698986 - 12698730
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||    
T  12698986 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgc 12698887  T
Q  180 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt- 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||||||     
T  12698886 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataaaaggttgttgaattaagatgtc 12698787  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12698786 taagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgtcctggagc 12698730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 109 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 13831496 - 13831279
Alignment:
Q  109 aataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13831496 aataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgttgtttttgtatactaccgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 13831397  T
Q  209 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  13831396 ggtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-tt 13831299  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgc 327  Q
    | | ||||| ||||||||||    
T  13831298 cttggttggaggcttgatgc 13831279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 10589154 - 10588935
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10589154 gttgttgaattgcaattgatatgattatgtcatgttgtttttgtatactgcatatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttg 10589055  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagca--tttcattgttg 315  Q
       |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  10589054 tcgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcagcattcattgttg 10588955  T
Q  316 ggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  10588954 ggggcttgatgccctggagc 10588935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 203 - 370
Target Start/End: Original strand, 15082017 - 15082182
Alignment:
Q  203 tgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcatta 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15082017 tgagtcggtctaagttgattaagatga---agttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcatta 15082113  T
Q  302 gcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15082114 gcatttcattgtttggggcttgatgccctggagcatttgctcacttaagttgagggcttgatgccctgg 15082182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26212111 - 26211894
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||  | |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  26212111 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttg 26212012  T
Q  220 attaag-atgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
     | ||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26212011 ttgaagaatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgcttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgg 26211913  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  26211912 gggcttgatgccctggagc 26211894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 254 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18427510 - 18427393
Alignment:
Q  254 ataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttg 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18427510 ataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcaattaagttg 18427411  T
Q  354 agggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18427410 agggcttgatgccctggg 18427393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 79 - 344
Target Start/End: Original strand, 2280083 - 2280348
Alignment:
Q  79 attttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgtt 177  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||  | ||||    
T  2280083 attttatatgtattatttgaattatatatgaatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctgttt-tgcatactgcctatgtt 2280181  T
Q  178 gctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taag 274  Q
    | |||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| ||| ||||||||||| || | || ||||    
T  2280182 gttgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaag 2280279  T
Q  275 atgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    | ||| ||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2280280 aggttgagttgttgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 2280348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34200901 - 34200684
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34200901 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 34200803  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttg 315  Q
    | | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34200802 gttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttg 34200704  T
Q  316 ggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  34200703 ggggcttgatgccctggagc 34200684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 114 - 345
Target Start/End: Original strand, 15144037 - 15144267
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 213  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||  || ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15144037 ttgagatgttgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgttattgcatactgagatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 15144136  T
Q  214 aagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat-- 310  Q
    ||||||    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||| | |||||| ||||||| |||||||||| |||||||      
T  15144137 aagttg----agatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgtttaaagaggtttaagatgtcgagttcatgcattagtatttcatag 15144232  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
     | |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15144233 cgatgggggctagatgccctggagcctttgctcaa 15144267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 113 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 67868 - 67635
Alignment:
Q  113 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 210  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  67868 attgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcgg 67770  T
Q  211 tctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||||||||||| |||    
T  67769 tctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaagttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttc 67671  T
Q  309 attgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  67670 attgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 67635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Original strand, 16386316 - 16386470
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  16386316 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgttt 16386415  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16386416 aagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16386470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 12756684 - 12756817
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12756684 tatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgctgt 12756783  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  12756784 tgttatttaactaaactgctcgagtcggtctaag 12756817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 136 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 40443490 - 40443296
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || |||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||     
T  40443490 ttgatattattatgtcatgctgttt--gtttactgcgtatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 40443393  T
Q  234 gttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
     ||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40443392 attccaaattattggactaatataaaaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccc 40443296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 47831860 - 47831696
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tata-taagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||| ||    
T  47831860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatattaagaggttgttgtttataagaagt 47831761  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47831760 taagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 47831696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 174 - 306
Target Start/End: Original strand, 28505357 - 28505492
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  28505357 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgatgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaatt 28505456  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28505457 aagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 28505492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 327
Target Start/End: Original strand, 11996095 - 11996242
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg--t 278  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  11996095 ttgttaattaactaagatgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 11996194  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11996195 taagaggttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgc 11996242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 95 - 335
Target Start/End: Original strand, 10063798 - 10064041
Alignment:
Q  95 ttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaa 192  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||  || ||||||||||| ||||| ||||  || |||| |  | |||||||| |||||| ||||    
T  10063798 ttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatgttg-tgcataccgcctatgttgctgattgttaattaa 10063896  T
Q  193 ctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattat-ataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgag 290  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| | | ||| || ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||    
T  10063897 ctaagttgcatgagtcagtctaagtcgttgaaggtgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaatgaagatgtttaagaagtcgag 10063996  T
Q  291 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10063997 tccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagc 10064041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44014231 - 44014048
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgtta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||    
T  44014231 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttgtttataagaagtta 44014136  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  44014135 agttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 44014048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 182 - 344
Target Start/End: Original strand, 811199 - 811359
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgtt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||    
T  811199 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgtttataagaagtt 811295  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    |||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  811296 aagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 811359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Original strand, 15754955 - 15755110
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--t 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  |    
T  15754955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaataattggattaatatacgagattgtcgaattaagttgttt 15755054  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15755055 taagaggtcgaatccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 15755110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14258286 - 14258158
Alignment:
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 308  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14258286 gtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatacattagcatttc 14258187  T
Q  309 a-ttgtt-gggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    | ||||| |||||| |||||||| |||||    
T  14258186 atttgttggggggcatgatgccctggagc 14258158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 185 - 329
Target Start/End: Original strand, 27847901 - 27848046
Alignment:
Q  185 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||| ||| ||||| || |||||    
T  27847901 ttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactagtataagaggttgccgaattaagttgtttaag 27848000  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27848001 aggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttgatgccc 27848046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 182 - 344
Target Start/End: Original strand, 16219785 - 16219944
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtta 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| | | |||| |||||    
T  16219785 ttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgttccaaattattcgacttatataagaggttgttgttctaagttgtta 16219881  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||  || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  16219882 agttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctca 16219944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16495455 - 16495329
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||    
T  16495455 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggtcgttgaattaagatgttt 16495356  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  16495355 aagaggtcaagtccatgcattagcatt 16495329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 114 - 339
Target Start/End: Complemental strand, 18005768 - 18005546
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || |  |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18005768 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tccatactgcttatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 18005670  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||| |||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | || |||||||||||| |||||    
T  18005669 ctaagttgat---gatgatgatgttccgaattattggact-tataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgttcatgcattagca-ttcat 18005575  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagccttt 339  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18005574 tgttgggggcttgatgccctggagccttt 18005546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 249 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13032744 - 13032657
Alignment:
Q  249 attatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13032744 attatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 13032657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 114 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16056449 - 16056223
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||  | ||| ||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16056449 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttgttt--gcataatgtctatgttgctgtttgttatttaactaaggtgcatcagtcggt 16056352  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 309  Q
    |||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||| ||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  16056351 ctaagttga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcattagca-ttca 16056258  T
Q  310 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  16056257 ttgttgggggcttgatgccctgtagccttcgctca 16056223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 305
Target Start/End: Original strand, 19486712 - 19486937
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | ||||||||    
T  19486712 tatatgcataacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttt-tgcatactgcctatgttgctg 19486810  T
Q  182 ttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
     |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| | |    
T  19486811 atcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagacgtt 19486910  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcat 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19486911 taagaagtcgagtccatgcattagcat 19486937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22073036 - 22072882
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || || ||| ||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  22073036 ttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgcatagtgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgggtcagt 22072937  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgt 265  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  22072936 ctaagttgattaagatgatgatgttccaaactattggatatatataagaggttgt 22072882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16091764 - 16091629
Alignment:
Q  234 gttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 332  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |  | | ||||||||||||  || ||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  16091764 gttccaaattattggatatatataagaggtcgatgttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcatt-cat-gttgggggcttgatgccctgg 16091667  T
Q  333 agcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16091666 agcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 16091629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 1868070 - 1868246
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   ||||||||| ||| ||| ||||||||||| |  | || |||||||| |||  ||    
T  1868070 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgttg---ttccaaattattgaatttatataagaggtcgatgtttctaagatgt-aagttgt 1868163  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
     ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1868164 tgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 1868246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 234 - 370
Target Start/End: Original strand, 9177781 - 9177917
Alignment:
Q  234 gttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 331  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || ||||||||||||  || ||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||| |    
T  9177781 gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcatt-cat-gttgggggcttgatgccctg 9177878  T
Q  332 gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9177879 gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 9177917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 17017647 - 17017706
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17017647 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 17017706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 313 - 371
Target Start/End: Original strand, 11525796 - 11525854
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11525796 ttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 11525854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14044792 - 14044621
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || |||||||| |||  ||    
T  14044792 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgt-aagttgt 14044699  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
     ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  14044698 tgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-catgttgagggcttgatgcc 14044621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14354822 - 14354651
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || |||||||| |||  ||    
T  14354822 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgt-aagttgt 14354729  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
     ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  14354728 tgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-catgttgagggcttgatgcc 14354651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 366
Target Start/End: Original strand, 20220263 - 20220435
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || |||||||| |||  ||    
T  20220263 ttaactaagctgtatgagtcggtctaagatga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgt-aagttgt 20220356  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
     ||||||||||||   |||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20220357 tgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgacctggagcttttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 20220435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 311 - 371
Target Start/End: Original strand, 11769106 - 11769166
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11769106 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttaagggcttgatgccctggg 11769166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 48991109 - 48991050
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  48991109 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgtcctgg 48991050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 9033541 - 9033600
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9033541 gttgggggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgtcctggg 9033600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14323257 - 14323199
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14323257 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 14323199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18203873 - 18203683
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-t 271  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || |    
T  18203873 tgttgttgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatctaagatga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttct 18203779  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||| |||  || ||||||| ||||   |||| ||| |||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18203778 aagatgt-aagttgttgagtccacgcatactcatt-cat-gttgggggcttgatgccctgaaacctttgctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 18203683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 291 - 370
Target Start/End: Original strand, 16461127 - 16461207
Alignment:
Q  291 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaatta-agttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || |||||||||  | || ||||||||||||||||    
T  16461127 tccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgccctggagctttagctcaattagcgatgggggcttgatgccctgg 16461207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 15008730 - 15008788
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15008730 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 15008788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 225 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 16213632 - 16213550
Alignment:
Q  225 gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||  | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16213632 gatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcattgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 16213550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Original strand, 2282482 - 2282539
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2282482 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 2282539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 12256052 - 12256108
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12256052 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccct 12256108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16579517 - 16579473
Alignment:
Q  291 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16579517 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16579473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 335
Target Start/End: Original strand, 16586146 - 16586190
Alignment:
Q  291 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16586146 tccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16586190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 310 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22072885 - 22072825
Alignment:
Q  310 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22072885 ttgttgggggcttgatgccctggagctttaactcaactaagttgagggcttgatgccctgg 22072825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14044638 - 14044579
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044638 tgttgagggcttgatgccatggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 14044579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14354668 - 14354609
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||| ||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354668 tgttgagggcttgatgccatggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 14354609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 229
Target Start/End: Original strand, 18154901 - 18154956
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 229  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  18154901 tgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatga 18154956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 12901210 - 12901156
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12901210 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgcc 12901156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 15008574 - 15008750
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||   |||  |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||    | || ||||||||||||  ||    
T  15008574 ttaactaagctgcatgagtcggtccaagatga---aga--atgatgttccaaattattggatttatataagaggtcaatgtttctaagatgttaagttgt 15008668  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
     ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  15008669 tgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctgaagcctttactc-accacgttgggggcttgatgccctgg 15008750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 16219949 - 16220007
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||| | || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16219949 gttgggggcttgatgccctggatctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 16220007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44014068 - 44014010
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  44014068 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 44014010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 368
Target Start/End: Original strand, 11772503 - 11772540
Alignment:
Q  331 ggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11772503 ggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 11772540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12901369 - 12901232
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgat-ttaagatgttaagaggt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |  || |||||||||| | ||| ||||||||||||| || | |  ||||||||||||  ||    
T  12901369 ttaactaagctgcatgagtcggtttaagttga--aagaggccgatgttccaaattataggatttatataagaggtcgttgttgctaagatgttaagttgt 12901272  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
     ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||    
T  12901271 tgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgc 12901232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14323399 - 14323237
Alignment:
Q  202 atgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcat 299  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || |||||||| |||  || ||||||||||||    
T  14323399 atgagtcggtctaagttga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgt-aagttgttgagtccatgcat 14323306  T
Q  300 tagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
       |||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  14323305 actcatt-cattgttggggggttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 14323237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 231
Target Start/End: Original strand, 14932802 - 14932851
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14932802 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 14932851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 139
Target Start/End: Original strand, 15081962 - 15082019
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttga 139  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15081962 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttga 15082019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 231
Target Start/End: Original strand, 15356237 - 15356286
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15356237 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15356286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 231
Target Start/End: Original strand, 15360351 - 15360400
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15360351 ttgttatttaactaagtcgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 15360400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16996113 - 16996053
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgat-gcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  16996113 gttgggggcttgaacgccctggagcctttgctcaattaagttgagagtttgatgccctggg 16996053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 313 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 67629 - 67574
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  67629 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccct 67574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Original strand, 12255992 - 12256072
Alignment:
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  12255992 gagtccatgcattcgcatt-cagtgatgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 12256072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16056218 - 16056160
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  16056218 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcgattatgttgagggcttgatgccctgg 16056160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 18005535 - 18005477
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18005535 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 18005477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 38519263 - 38519203
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  38519263 gttgggggcttgatgccttgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgataccctggg 38519203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42461840 - 42461780
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||| ||||||| | | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42461840 gttgggggtttgatgctctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccctggg 42461780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 232
Target Start/End: Original strand, 2832504 - 2832559
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 232  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  2832504 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 2832559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Original strand, 811368 - 811422
Alignment:
Q  316 ggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  811368 ggggcttgatgccctggagctttagctcaatcatgttgggggcttgatgccctgg 811422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 90 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 15113088 - 15113031
Alignment:
Q  90 attacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 148  Q
    ||||||||| |||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||    
T  15113088 attacttgagttatatgtgaata-ttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttat 15113031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 19649552 - 19649606
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19649552 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19649606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 365
Target Start/End: Original strand, 29329138 - 29329172
Alignment:
Q  331 ggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29329138 ggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgc 29329172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 47831691 - 47831637
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  47831691 gttgggggcttgatgctctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgcc 47831637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 12187076 - 12187019
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  12187076 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 12187019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 16996150 - 16996117
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  16996150 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa 16996117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 17138120 - 17138177
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  17138120 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 17138177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 104)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 18334605 - 18334893
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18334605 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 18334704  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334705 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 18334804  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334805 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 18334893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 19005195 - 19004907
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19005195 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 19005096  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005095 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 19004996  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19004995 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 19004907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 24422696 - 24422408
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24422696 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 24422597  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422596 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 24422497  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422496 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 24422408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33861943 - 33861655
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33861943 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 33861844  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861843 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 33861744  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861743 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 33861655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 19858932 - 19859220
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19858932 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 19859031  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859032 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggactatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 19859131  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859132 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 19859220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 33864427 - 33864139
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33864427 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 33864328  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33864327 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 33864228  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864227 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 33864139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 26924653 - 26924941
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26924653 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 26924752  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26924753 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 26924852  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924853 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 26924941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Original strand, 2291193 - 2291479
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2291193 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgt 2291292  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2291293 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 2291392  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2291393 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagccttttctcaattaagttgaggtcttgatgccctg 2291479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8055178 - 8054890
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8055178 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatacttttgtgttgctgt 8055079  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  8055078 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 8054979  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8054978 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttggg 8054890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12742466 - 12742178
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12742466 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 12742367  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||      
T  12742366 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatattaca 12742267  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742266 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 12742178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1595698 - 1595410
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  1595698 tatatccattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttatgttgctgt 1595599  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595598 tgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 1595499  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1595498 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 1595410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 83 - 367
Target Start/End: Original strand, 1540924 - 1541208
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  1540924 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatactgtttttgtatactgttgtgttgctgt 1541023  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1541024 tgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 1541123  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccc 367  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1541124 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccc 1541208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 20556907 - 20557194
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20556907 tatatgcattacttgaattatatgtgaa--attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 20557004  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||    
T  20557005 tgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttttcaatttaagatgtttaa 20557104  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20557105 gtggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgtgggcttgatgtcgtggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 20557194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22782376 - 22782089
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22782376 tatatgcattacttgaattatgtgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 22782277  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  22782276 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaatttccaaattattggattatatgagaggttgtcgatttaagatgtttaa 22782177  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctc-aattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |   |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  22782176 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggg--gggggggggggagcctttgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 22782089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 25754958 - 25754715
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  25754958 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgt 25754859  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  25754858 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaa 25754760  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  25754759 gaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 25754715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 83 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 25688651 - 25688395
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25688651 tatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttatgttgctgt 25688552  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  25688551 tgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagataatgaggttccaaattattggattatataagaggttatcgatttacgatgtttaa 25688452  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25688451 gaggtcgagtccatgcattagcatttcaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 25688395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 3852030 - 3852273
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3852030 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattatcatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 3852129  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3852130 tgttattaaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaa 3852228  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  3852229 gaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 3852273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 338
Target Start/End: Original strand, 25629322 - 25629580
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||  |||||| ||    
T  25629322 ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttcct 25629421  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||    
T  25629422 gttgtaatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaagttttcgatttaagatgttt 25629521  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25629522 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 25629580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 337
Target Start/End: Original strand, 16448539 - 16448793
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  16448539 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctg 16448638  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||    
T  16448639 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaa---gatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgttta 16448735  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16448736 agaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 16448793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 338
Target Start/End: Original strand, 19303536 - 19303765
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19303536 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatacttcctgtgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 19303634  T
Q  209 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19303635 ggtctaagatgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagtattt 19303734  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19303735 cattgttgggggcttgatgccctggagcctt 19303765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 110 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20593899 - 20593669
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||    
T  20593899 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcatgtgttgctgtttttatttaactgagctgcatgattc 20593800  T
Q  209 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20593799 ggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcattt 20593700  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  20593699 cattgctgggggcttgatgccctggagcctt 20593669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 29060694 - 29060438
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||    
T  29060694 ttatgtgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgct 29060595  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  29060594 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagctgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtt 29060495  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29060494 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 29060438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34963522 - 34963292
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34963522 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 34963423  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  34963422 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 34963323  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963322 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 34963292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 83 - 305
Target Start/End: Original strand, 30676723 - 30676952
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  30676723 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 30676822  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  30676823 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 30676922  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 305  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676923 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcat 30676952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 82 - 329
Target Start/End: Original strand, 17287763 - 17288012
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||   | |||||||    
T  17287763 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtgtttgtatactacctatgttgct 17287862  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||    
T  17287863 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgccgaattaagatgctt 17287962  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17287963 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgtgggcttgatgccc 17288012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 20360927 - 20361183
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  | |||||||    
T  20360927 ttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatgctgcctatgttgct 20361026  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  20361027 gttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgatgaaaatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtt 20361126  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20361127 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 20361183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 113 - 338
Target Start/End: Original strand, 18409825 - 18410056
Alignment:
Q  113 attgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18409825 attgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttttcgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactgagctgcatgagtcggt 18409924  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaag----ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||| |||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18409925 ctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagttcatgcattatcatt 18410024  T
Q  307 tcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18410025 tcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 18410056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 123 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 20076812 - 20076596
Alignment:
Q  123 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 221  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076812 tgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 20076714  T
Q  222 taagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 320  Q
     |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20076713 gaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagattttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 20076614  T
Q  321 ttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  20076613 ttgatgccctggagcctt 20076596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 87 - 325
Target Start/End: Original strand, 22780199 - 22780439
Alignment:
Q  87 tgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgt 185  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||  | ||||  ||||||    
T  22780199 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcaagctgtttttgtatattgcctatgtttttgttgt 22780298  T
Q  186 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagag 284  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  22780299 tatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggtagtcgaattaagatgtttaagag 22780398  T
Q  285 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgat 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22780399 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgat 22780439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 130 - 335
Target Start/End: Original strand, 20638298 - 20638506
Alignment:
Q  130 ttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20638298 ttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatg 20638397  T
Q  229 atgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 326  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20638398 atgatgttccaaattattggattaatataagaggttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgacg 20638497  T
Q  327 cccgggagc 335  Q
    ||| |||||    
T  20638498 ccctggagc 20638506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 83 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 25656778 - 25656619
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  25656778 tatatgtattagttgaattatatgtgaataattgagacgttattaacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgctgt 25656679  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaat 242  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25656678 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaat 25656619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18456868 - 18456735
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18456868 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 18456769  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456768 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18456735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18462028 - 18461895
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  18462028 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 18461929  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461928 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18461895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 174 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 25714478 - 25714275
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaa 273  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  25714478 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgccggtttaa 25714379  T
Q  274 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctcaattaagttgagggcttgatgccc 367  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||  |||| ||||||||||||| |||||||| |    |||||| ||||||||||| ||||||| |    
T  25714378 tatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacttttcaaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataagttgagggtttgatgctc 25714279  T
Q  368 tggg 371  Q
    ||||    
T  25714278 tggg 25714275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Original strand, 28496539 - 28496694
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt- 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  28496539 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 28496638  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  28496639 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagc 28496694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Original strand, 29808950 - 29809105
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt- 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  29808950 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtttttgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 29809049  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  29809050 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagc 29809105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 20109291 - 20109006
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| | ||| ||||| || ||||||  | ||||||||    
T  20109291 tatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttgttt-tgcatactgcctatgttgctg 20109193  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
     |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| || | || ||||| ||    
T  20109192 tttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaagaggt 20109095  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    | ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  | |||| |||||||||||||||    
T  20109094 tgagttgttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcatttgctc-accacgttgggggcttgatgccctg 20109006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 16496359 - 16496204
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16496359 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 16496260  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaag 274  Q
     | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  16496259 ttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaag 16496204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 335
Target Start/End: Original strand, 19773818 - 19773945
Alignment:
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19773818 gtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 19773917  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  19773918 cattgttgggggcttgatgccctggagc 19773945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 188 - 370
Target Start/End: Original strand, 22080799 - 22080979
Alignment:
Q  188 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||  |     
T  22080799 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttttaag-tgttaagttga 22080897  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
     | |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  22080898 tgtgtccatacattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 22080979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19652248 - 19652064
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtta 280  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||| |||||    
T  19652248 ttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggagttatttaagaggttgttgttctaagttgtta 19652152  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  19652151 agatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttcctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 19652064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23019528 - 23019298
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||||    
T  23019528 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactgcttatgttgctgtttgtttattaactaagctgcataagtcggt 23019430  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 309  Q
    ||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | |||||||||||| || ||||    
T  23019429 ctaagatga--aagatgatgatgttccaaattattggatatatataagaggttgttgtttataagaggttaagttgttgtgtccatgcattaaca-ttca 23019333  T
Q  310 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  23019332 ttgttgggggcttaatgctctggagcctttgctca 23019298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1561356 - 1561201
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--t 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||||  ||||||| ||||| ||| ||||||| ||||| ||  |    
T  1561356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaataattggattaatatacgagattgtcgaattaagttgttt 1561257  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1561256 taagaggtcgaatccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1561201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 35245684 - 35245484
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   ||||||||  | ||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  35245684 ttgatattattatgtcatgttgtt---gtatactgcctatgttggtgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 35245588  T
Q  234 gttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccg 330  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||| || | ||| ||  ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35245587 gttccaaattattggactaatataagaggttgttgaatcaagttgttttaagaggtcgagtctatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccct 35245489  T
Q  331 ggagc 335  Q
    |||||    
T  35245488 ggagc 35245484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Original strand, 19847962 - 19848194
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || || || |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||  |||||||  ||||  |||  | || ||||    
T  19847962 tatatgcattatttgaattatatgtgaaatatttaagatattgttgaattgcaattgatatttttatgtgttgctgttgatgtaatctgcctatgctgct 19848061  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaag 274  Q
     |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||    
T  19848062 attgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgtcgaattaag 19848161  T
Q  275 atgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19848162 atgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 19848194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 182 - 324
Target Start/End: Original strand, 16920698 - 16920841
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  16920698 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcaaagatgttgaagatgatgatgttccaaattgttggactaatataagaggttgtcgaattaagttgttt 16920797  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttga 324  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||    
T  16920798 aagaggtcaagtccatgcattagca-ttcatagtagggggcttga 16920841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 234 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22805749 - 22805647
Alignment:
Q  234 gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  22805749 gttccaaattattggattatataagaagttgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgg 22805650  T
Q  333 agc 335  Q
    |||    
T  22805649 agc 22805647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22831565 - 22831402
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   || | |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||    
T  22831565 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctactatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgttgaatt 22831466  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||    
T  22831465 aagttgtttaagaggtcgagtccatacattagca-ttcatagttgggggcttgattccctggagc 22831402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19668488 - 19668241
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| || ||||| | | |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19668488 gttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttt-tgcatactatctatgttgctgtttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaag 19668390  T
Q  217 ttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtt 314  Q
    ||||  ||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||  || ||||||||||||   || |||||||||    
T  19668389 ttga--aagatgat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgattctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgtt 19668296  T
Q  315 gggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||  |||||||| |||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  19668295 gggggcttgatgccttggagccttcgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 19668241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 18821813 - 18821946
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    |||| |||||||||||| | ||  | ||||||||||| | |||||| ||||| || |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18821813 tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcgtt-gatattgttatggcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctg 18821911  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18821912 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 18821946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 304
Target Start/End: Original strand, 8227479 - 8227703
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  |  |||||||    
T  8227479 tatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttt-tgcatactgcctacgttgctg 8227577  T
Q  182 ttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
     |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| | |    
T  8227578 atcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagttgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagacgtt 8227677  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagca 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  8227678 taagaagtcgagtccatgcattagca 8227703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 83 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 25644474 - 25644295
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||  |||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| || ||||||  | ||||||||    
T  25644474 tatacgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttacatttgatattgttatatcacgctgtttttgcatactgcctatgttgctg 25644375  T
Q  182 t-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttg 264  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  25644374 tctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggttg 25644295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 11185558 - 11185418
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt- 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| ||||     
T  11185558 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag---------atgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgttt 11185468  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  11185467 taagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttgatgccc 11185418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23992540 - 23992349
Alignment:
Q  123 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 221  Q
    |||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  23992540 tgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtcagtctaagttgat 23992441  T
Q  222 taagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||| ||| || |  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992440 taagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagcggtcgttgtattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 23992349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16493039 - 16492980
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16493039 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 16492980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33442938 - 33442880
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33442938 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 33442880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Original strand, 25603502 - 25603612
Alignment:
Q  225 gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 323  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || | |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25603502 gatgttgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaat-aagatgtttaagaggtcgtgtccatgcattagcatttcattgttgagggcttg 25603600  T
Q  324 atgcccgggagc 335  Q
    |||||| |||||    
T  25603601 atgccctggagc 25603612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 225 - 335
Target Start/End: Original strand, 25611840 - 25611950
Alignment:
Q  225 gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 323  Q
    |||| ||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || | |||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  25611840 gatgttgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaat-aagatgtttaagaggtcgtgtccatgcattaggatttcattgttgggggcttg 25611938  T
Q  324 atgcccgggagc 335  Q
    |||||| |||||    
T  25611939 atgccctggagc 25611950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Original strand, 27333277 - 27333336
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27333277 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27333336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Original strand, 27394017 - 27394076
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 232  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27394017 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 27394076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23076618 - 23076564
Alignment:
Q  316 ggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076618 ggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 23076564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Original strand, 18896539 - 18896596
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18896539 gttgggggcttgatgccctggagcttttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 18896596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19362317 - 19362261
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19362317 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggattgatgccct 19362261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 174 - 322
Target Start/End: Original strand, 4185880 - 4186023
Alignment:
Q  174 tgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 272  Q
    ||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    ||||    
T  4185880 tgttgctgtctgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat---gatgacgatgttccaaattattggactatttaagaagttg----ttta 4185972  T
Q  273 agatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 322  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||    |||||||||||||    
T  4185973 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattatcatacatttgttgggggctt 4186023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 17743128 - 17743073
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccc 367  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17743128 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccc 17743073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20223835 - 20223777
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20223835 gttggaggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 20223777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22117819 - 22117761
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22117819 gttggtggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 22117761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Original strand, 4738626 - 4738759
Alignment:
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt-taa 281  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||| || |||||||||| ||||| ||| |||||  |||    |||||||||| |||    
T  4738626 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat---gatgacgatgttccaaattattggactatttaagaaattg----tttaagatgtctaa 4738718  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  4738719 gaggtcgagtccatgcattagcatacatttgttgggggctt 4738759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 174 - 326
Target Start/End: Original strand, 9098573 - 9098714
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt- 270  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | ||     
T  9098573 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttc 9098667  T
Q  271 taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 326  Q
    |||||||||        ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  9098668 taagatgtt--------gagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatg 9098714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18453111 - 18453051
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18453111 tgttgggggcttgatgccctggagcttttgctcaaataagttgaaggcttgatgccctggg 18453051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 27573292 - 27573348
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27573292 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccct 27573348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 35008040 - 35007984
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35008040 gttgggggcttgatgccctggagccttcgctccattaagttgagggcttgatgccct 35007984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17105621 - 17105564
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17105621 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaa-taagttgagggcttgatgccctgg 17105564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19668261 - 19668203
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19668261 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 19668203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 305
Target Start/End: Original strand, 31155465 - 31155582
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||| || || ||||    ||||||||| |||    
T  31155465 ttgttatttaactaagttgcatgagtcaatccaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggactatttacgaagttg----tttaagatgttta 31155557  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcat 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  31155558 agatgtcgagtccatgcattagcat 31155582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13019439 - 13019361
Alignment:
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  13019439 gagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagtcgttgctc-actacgttgggggcttgatgccct 13019361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25644228 - 25644172
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  25644228 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccct 25644172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19652084 - 19652026
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19652084 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 19652026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23538517 - 23538460
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23538517 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaa-taatttgagggcttgatgccctgg 23538460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23538595 - 23538538
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23538595 gttgagggcttgatgcactggagcctttgctcaat-aagttgagggcttgatgccctgg 23538538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33443108 - 33442918
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-t 271  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||  | ||   ||||||||| ||||| || ||||||| || |  | || |    
T  33443108 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatg--taaggagttg---ttccaaattattggagttgtataagatgtcgatgtttct 33443014  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||   |||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  33443013 aagatgttaagttgttgagtccatgcatactcattta--tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 33442918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 183 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 4186419 - 4186286
Alignment:
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||  ||||||||| ||||| ||| ||||| ||||    ||||||||| ||||    
T  4186419 tgttgtttaactatgctgcatgagtcggtccaagttgat---gatgacgatattccaaattattggactatttaagaagttg----tttaagatgtttaa 4186327  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 322  Q
    |||||||||  |||||||||||||    |||||||||||||    
T  4186326 gaggtcgaggtcatgcattagcatacatttgttgggggctt 4186286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 194 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19008843 - 19008787
Alignment:
Q  194 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt 251  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19008843 taagctgcatgagttggtccaagttgattaagatgatgaag-tccaaattattggatt 19008787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 22080959 - 22081015
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  22080959 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccct 22081015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 15705797 - 15705855
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  15705797 gttgagggattgatgccctggagcctttgctcaa-taagttgagggcttgttgccctggg 15705855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16493077 - 16493019
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  16493077 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 16493019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17105543 - 17105486
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  17105543 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaa-tattttgagggcttgatgccctgg 17105486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 19656328 - 19656381
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19656328 gttgagggcttgatgccctggagactttgctcaa-taagttgagggcttgatgcc 19656381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 19656484 - 19656541
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19656484 gttgagggcttgatgttctggagcctttgctcaat-aagttgagggcttgatgccctgg 19656541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23019293 - 23019235
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23019293 gttgggggcttgattccctggagctttagctcaactaagtttagggcttgatgccctgg 23019235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23538439 - 23538382
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  23538439 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaa-tattttgagggcttgatgccctgg 23538382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Original strand, 27333357 - 27333414
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  27333357 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgctctgg 27333414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Original strand, 27394097 - 27394154
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  27394097 ttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgctctgg 27394154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 19656406 - 19656461
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  19656406 gttgagggcttgatgtcctggagcctttgctcaa-taaattgagggcttgatgccct 19656461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 288 - 370
Target Start/End: Original strand, 15705738 - 15705817
Alignment:
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||| | ||||| |  ||||||||||||||| || |||||||||||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  15705738 gagtccatgcataatcatttaa--gttgggggcttgatgacctggagcctttgctcaa-cacgttgagggattgatgccctgg 15705817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23076660 - 23076602
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||    
T  23076660 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttcggggcttgatgccctgg 23076602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 35008078 - 35008020
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  35008078 tgttgggggcttgatggcctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 35008020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 13019379 - 13019325
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||  ||||||||||||    
T  13019379 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattaagttaggggcttgatgcc 13019325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18907165 - 18907111
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||    
T  18907165 tgctattgttatttaactaagctgcatgagtctatacaagatgattaagatgatg 18907111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19863032 - 19862978
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19863032 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19862978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 19873174 - 19873120
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  19873174 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19873120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 20109025 - 20108971
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  20109025 gttgggggcttgatgccctgtagctttagctcaactaagttgagggctcgatgcc 20108971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 1595431 - 1595369
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1595431 gttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 1595369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21766752 - 21766695
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||| ||||||||||    
T  21766752 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattataagatgaataagatgatg 21766695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 123)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17463327 - 17463039
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17463327 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 17463228  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463227 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 17463128  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463127 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 17463039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34159475 - 34159187
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34159475 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 34159376  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159375 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 34159276  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159275 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 34159187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 16454294 - 16454582
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16454294 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 16454393  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454394 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 16454493  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454494 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 16454582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 28848624 - 28848912
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  28848624 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 28848723  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28848724 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttaag 28848823  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848824 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 28848912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 13151803 - 13152092
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13151803 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 13151902  T
Q  183 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151903 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 13152002  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13152003 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 13152092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 13154268 - 13154557
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13154268 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 13154367  T
Q  183 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154368 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 13154467  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154468 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 13154557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 45606920 - 45607208
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45606920 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 45607019  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  45607020 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 45607119  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607120 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 45607208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8899243 - 8898955
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  8899243 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 8899144  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899143 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 8899044  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8899043 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctggg 8898955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 29172596 - 29172885
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  29172596 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 29172695  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29172696 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaa 29172795  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172796 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 29172885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 16282824 - 16283112
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16282824 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattcaatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 16282923  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282924 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgataaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 16283023  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16283024 aggtcgagtccatgcattagcattttattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 16283112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 83 - 368
Target Start/End: Original strand, 17446668 - 17446952
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17446668 tatatgcattacttgaatgatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 17446767  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446768 tgttatttaactaagctgcatgagtcg-tctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 17446866  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446867 aggtcgagcccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 17446952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 9707620 - 9707908
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9707620 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgtatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 9707719  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9707720 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcgatttaagatgttaag 9707819  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9707820 aggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 9707908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 10247736 - 10248024
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10247736 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgt 10247835  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  10247836 tgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagaggttgtcgatttaagatattacg 10247935  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247936 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 10248024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 38961904 - 38962192
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38961904 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 38962003  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38962004 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaa 38962103  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38962104 gagatcgagtctatgcattagcattacattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctgg 38962192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 6469147 - 6469431
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6469147 tatatgcattacttcaattatatgtgactaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 6469246  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||    
T  6469247 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaag----taag 6469342  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469343 aggtcgagtccatgcattagcatgtcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 6469431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 121 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 55501053 - 55500803
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55501053 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga 55500954  T
Q  221 ttaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55500953 ttaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacgaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 55500854  T
Q  321 ttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55500853 ttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 55500803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 7781360 - 7781653
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7781360 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 7781459  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7781460 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 7781559  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  7781560 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 7781653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 83 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 41124036 - 41123757
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||   |    
T  41124036 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttg---t 41123940  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41123939 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgataaagttccaaattattggattatataaaaggttgtcgatttaagatgttaag 41123840  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 365  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123839 aggtcgaatccatgcattagcatttcattgatggggccttaatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 41123757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 101 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15977646 - 15977373
Alignment:
Q  101 tatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctg 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977646 tatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgttgttatttaactaagctg 15977547  T
Q  201 catgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcga---tttaagatgttaagaggtcgagtccatgc 297  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15977546 catgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagaggttgtcgattttttaagatattaagaggtcgagtccatgc 15977447  T
Q  298 attagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977446 attagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 15977373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 114 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36166715 - 36166458
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166715 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 36166617  T
Q  214 aagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  36166616 aagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagaagttaaagaggccgagttcatgcattagcatttcattg 36166517  T
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166516 ttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 36166458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 82 - 371
Target Start/End: Original strand, 24153176 - 24153466
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||    
T  24153176 ttatgtgcattatttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactacctatgttgct 24153274  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24153275 atcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttt 24153374  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153375 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 24153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 114 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21618566 - 21618308
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618566 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 21618468  T
Q  214 aagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 312  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21618467 aagttgattgagaagatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagaagtttaagaggtcgagttcatgcattagcatttcattg 21618368  T
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctc-aattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21618367 ttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataaagttgagggcttgatgccctggg 21618308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 55476640 - 55476417
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  55476640 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 55476541  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  55476540 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcga-ttaagatgtttaa 55476442  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    ||||||||||| |||||||||||||    
T  55476441 gaggtcgagtctatgcattagcatt 55476417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 82 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14973008 - 14972743
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  14973008 ttatatgcattacttgaattatgaatgtatatatgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgct 14972909  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14972908 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttt 14972809  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  14972808 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgtcctggagcctttgctcaa 14972743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 179 - 371
Target Start/End: Original strand, 45577947 - 45578139
Alignment:
Q  179 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  45577947 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatat 45578046  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45578047 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagtctttgcttaattaagttgagggcttgatgccctggg 45578139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 110 - 335
Target Start/End: Original strand, 40213716 - 40213942
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcg 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40213716 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttatgtatactgctgtgttgatgttgttatttaactaagctacatgagtcg 40213815  T
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 308  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213816 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 40213915  T
Q  309 attgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||| |  ||||||||| || |||||    
T  40213916 attgtggatggcttgatgtcctggagc 40213942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 50242971 - 50242728
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  50242971 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgt 50242872  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  50242871 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaa 50242773  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || ||||||||||||||| | |  ||| ||||||||||||||||||    
T  50242772 gaagtcgagtccatgcatcaac-gttctttgttgggggcttgatgc 50242728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17488010 - 17487755
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||    
T  17488010 ttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgct 17487911  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17487910 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 17487811  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17487810 aagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 17487755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17499492 - 17499237
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | |||||    
T  17499492 ttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctattttgct 17499393  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  17499392 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 17499293  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17499292 aagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 17499237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 99 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15412563 - 15412333
Alignment:
Q  99 attatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  15412563 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgctgttgttatttaactaag 15412464  T
Q  198 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  15412463 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatg 15412364  T
Q  297 cattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  15412363 cattagcatttcagcgataggggcttgatgc 15412333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Original strand, 25476358 - 25476607
Alignment:
Q  88 gcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgtt 186  Q
    ||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  25476358 gcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactacctgtgttgctgttgtt 25476457  T
Q  187 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 285  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  25476458 ttttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagg 25476557  T
Q  286 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  25476558 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggtttgatgccctggagc 25476607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 8499668 - 8499422
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||| ||||    
T  8499668 tatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgtcgctg 8499569  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8499568 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 8499469  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  8499468 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 8499422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 12119737 - 12119983
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||  ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  12119737 tatatgcattaattagattatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctg 12119836  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12119837 ttgttatttaacaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 12119936  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||| ||  || ||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  12119937 agaagtaaaggccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 12119983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 43841086 - 43840831
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |    
T  43841086 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgtctatgttgtt 43840987  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  43840986 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgatgaagataatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 43840887  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43840886 aagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 43840831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 121 - 328
Target Start/End: Original strand, 23083367 - 23083576
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083367 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcattctgtttttgtatactgcctatgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 23083466  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggg 318  Q
    || |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23083467 atgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggg 23083566  T
Q  319 gcttgatgcc 328  Q
    | ||||||||    
T  23083567 gtttgatgcc 23083576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 12567709 - 12567479
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||    
T  12567709 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgt 12567610  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  12567609 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgtttatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 12567510  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567509 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 12567479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13544174 - 13543944
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||    
T  13544174 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatattgctgtgttgctgt 13544075  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  13544074 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 13543975  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13543974 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 13543944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 328
Target Start/End: Original strand, 43550491 - 43550739
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||  | ||||||||    
T  43550491 tatatacattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgcatactgcatatgttgctg 43550590  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--t 278  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  43550591 tcattatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 43550690  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43550691 taagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcc 43550739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 82 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 26687041 - 26686792
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||    |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |    
T  26687041 ttatgtgcattacttgaagtataatggaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgtt 26686942  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  26686941 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaagaagatgatgatgttccaaattattggactatataagaggttgtcgaattaagatgttt 26686842  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686841 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 26686792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13442428 - 13442173
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||     
T  13442428 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgcc 13442329  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13442328 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 13442229  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13442228 aagaggtcgagtccatgcattaatatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 13442173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 129 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10557088 - 10556882
Alignment:
Q  129 cttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10557088 cttgcatttgatattattatgtcatgccgtttttgtatgctgatgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 10556989  T
Q  229 atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  10556988 atgaagttccaaattattgaattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 10556889  T
Q  328 ccgggag 334  Q
    || ||||    
T  10556888 cctggag 10556882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 11424730 - 11424981
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  ||||||||||   |||||| ||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  11424730 ttatacgcattacttgaattatgaatgcataattgaga---tgttgatttgctattgatattgttatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgct 11424825  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  11424826 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 11424925  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11424926 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 11424981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 18438649 - 18438432
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18438649 gttgttgacttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg 18438550  T
Q  220 attaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    || |||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  18438549 atgaagatgatgatgttttcaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgga 18438450  T
Q  318 ggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||| |||||    
T  18438449 ggcttgatgccctggagc 18438432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 20698405 - 20698658
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||  |||| | ||||  | ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  20698405 tatgcattacttgaagaatatttgaatatataagatgttgatgaattgcaattgatattattacgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 20698504  T
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20698505 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaa 20698604  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  20698605 gaagtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgattccctggagc 20698658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12399324 - 12399108
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12399324 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 12399225  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
     | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  12399224 ttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttggt 12399126  T
Q  318 ggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||| |||||    
T  12399125 ggcttgatgccctggagc 12399108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 27165400 - 27165154
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    |||| ||| ||||| |||||||| | |||| ||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||| || ||||||| | | ||||||    
T  27165400 tatacgcaatacttaaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattggtatatcatgttgttt-tgcatactgtctatattgctg 27165302  T
Q  182 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27165301 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttt 27165202  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  27165201 aagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 27165154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 133 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 44494908 - 44494715
Alignment:
Q  133 catttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  44494908 catttgatattattatgttatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgatctaagttgattaagatgatga 44494809  T
Q  233 agttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||||| ||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  44494808 agttctaaattattgaattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattaaca-ttctttgttgggggcttgatgc 44494715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 83 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17672775 - 17672626
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||    
T  17672775 tatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgttgttgt 17672676  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672675 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 17672626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 24340691 - 24340946
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||||||  | ||||||||    
T  24340691 tatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttg-tgcatactgcatatgttgctg 24340789  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattat-ataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24340790 attgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtt 24340889  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  24340890 taagaagtcgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagc 24340946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 14576800 - 14577052
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||||||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | |||||||| | |||||||    
T  14576800 ttatatgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctg-ttgtttatactgtctatgttgct 14576898  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||   | |||||| |||||||||| ||||| |||  |||||||||||   ||||||||| |    
T  14576899 gttgttatttaactaagttgaatgagtcggtctaagttgat---gttgatgatgttccaaattattggacttacttaagaggttgttattttaagatgtt 14576995  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  14576996 taagaggtcgagtccatgcatttgcatttcatttttgggggcttgatgccctggagc 14577052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 53070666 - 53070799
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  53070666 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgttgtttttgtatactgttatgttgctgt 53070765  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070766 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 53070799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 92 - 309
Target Start/End: Original strand, 53301527 - 53301747
Alignment:
Q  92 tacttgaattatatgtcaataattgagacgttgt-tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttat 188  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||  |||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||| | |||||||||| |||||    
T  53301527 tacttgaattatatatgaatatttgagatattgaatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactgtctatgttgctgtttgttat 53301625  T
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtc 287  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||    
T  53301626 ttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgtttaagaagtc 53301725  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttca 309  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  53301726 gagtccatgcattagcatttca 53301747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14572703 - 14572490
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14572703 gttgttgactctcaattgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgtctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 14572605  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    ||   | |||||  |||||||||| ||||| |||  ||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  14572604 at---gttgatgttgttccaaattattggacttacttaagaggatgttgttttaagatgtttaagaggtcgagtctatgcatttgcatttcattgttggg 14572508  T
Q  318 ggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||| |||||    
T  14572507 ggcttgatgccctggagc 14572490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 134 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 17737337 - 17737142
Alignment:
Q  134 atttgatattattatgtcatgctgtttct---gtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17737337 atttgatattattatgtcatgctgttgttgtagtatattgctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgat 17737238  T
Q  231 gaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||||||||| || |||||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  17737237 gaagttccaagttattggatcatacaata-gttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtctatgcattatca-ttctttgttgggggcttgatgc 17737142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 174 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 28194752 - 28194599
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 272  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  28194752 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgattta 28194654  T
Q  273 agatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  28194653 agatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggtttgatgc 28194599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Original strand, 13210333 - 13210550
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||  | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13210333 gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 13210431  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaag--atgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttg 315  Q
    | | |||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13210432 gttgaagatgatgatgtttcaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagtcgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttg 13210530  T
Q  316 ggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  13210531 ggggcttgatgccctggagc 13210550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12511172 - 12510949
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  12511172 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcattctaagttg 12511073  T
Q  220 attaagatg------atgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 311  Q
    |||||||||      |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511072 attaagatgttgataatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcaaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 12510973  T
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||    
T  12510972 gttgggggcttgatgccctggagc 12510949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 82 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42386564 - 42386289
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgct 180  Q
    ||||||||||| ||||||||||   | |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  42386564 ttatatgcattgcttgaattatgaatgaatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 42386465  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgtt 279  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |  |||| |||   |||||||||  |||||||   |||||||| || |||| ||||||| |    
T  42386464 gttgttatttaactaaactgcatgagtcggtctaagtcaa--aagaggat---gttccaaatcattggatttattaagaggtcgttgattctaagatgat 42386370  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
            ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||    
T  42386369 --------gagtccatgcattagca-tacattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgagggcttgatgccctgg 42386289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15471046 - 15470793
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471046 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtctgttatttaactaagctgcatgagtcggt 15470948  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    ||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||| |||||||  || | ||| ||||||||||| |||||    
T  15470947 ctaagttg---aagatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagttgttaagttgttgtgtcaatgcattagca-ttcat 15470852  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  15470851 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 15470793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 91 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23274832 - 23274585
Alignment:
Q  91 ttacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg-ttgttat 188  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | |||||||| ||||||     
T  23274832 ttacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttt-tgcatactgcctatgttgctgattgttaa 23274734  T
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggt 286  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||     |||||| ||| ||| |||| | ||||| || ||||| |||||||| | |||||||| |||||| ||    
T  23274733 ttaactaagttgcatgagtcagtctaagtcatcgaagatgttgatgtttcaaagtattggactattataaaaggttgtcaaattaagatgtttaagaagt 23274634  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  23274633 cgagtccatgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagc 23274585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9512982 - 9512791
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 272  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | ||||    
T  9512982 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgtttta 9512887  T
Q  273 agatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    || |||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  9512886 agttgttaagatgttgtgtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accatgttgggggcttgatgccctgg 9512791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9520957 - 9520766
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 272  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | ||    
T  9520957 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttcta 9520862  T
Q  273 agatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  9520861 agatgttaagatgttgtgtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 9520766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Original strand, 49668135 - 49668326
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 272  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | ||    
T  49668135 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttcta 49668230  T
Q  273 agatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    || |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  49668231 agttgttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 49668326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16103901 - 16103651
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16103901 ttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgttcgttgtttaactaagctgcatgagtcggt 16103804  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 311  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| || ||||| |  | |||||||||||| || ||||||    
T  16103803 ctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgctaagatgatgtgtccatgcattaaca-ttcatt 16103709  T
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||    
T  16103708 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-actatgttgggggcttgatgccctgg 16103651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 121 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 14234602 - 14234374
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14234602 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgcttgttatttaactaagctgcatgaatcagtctaagtt 14234504  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggat-----tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||     ||||||| ||||||| | || ||||| ||||||   | | ||||||||||||||| |||||||    
T  14234503 gattaagatgatgatgttccaaattattggatatatatatataaaaggttgttgtttataagaagttaagttattgtgtccatgcattagca-ttcattg 14234405  T
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctc 343  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  14234404 ttgggggcttgatgccttggagcctttgctc 14234374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 52523695 - 52523980
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||  |||||| || ||||||  | |||||     
T  52523695 tatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgaactgttt-tgcatactgcctatgttgt 52523793  T
Q  180 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagat 276  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||   ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||   || ||||||    
T  52523794 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgac--agaagatg---ttccaaattattggatttatataagagtttgttatttctaagat 52523888  T
Q  277 gttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||| ||  || |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  52523889 gttgagttgttgagtccatgcattaacatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcccttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 52523980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 110 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32307802 - 32307548
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 207  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32307802 ataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 32307705  T
Q  208 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||||||||||   |||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | |||| |||||||| ||   ||||||||||||||| ||    
T  32307704 cggtctaagttgat---gatgatgttgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaagttgttaagatgttatgtccatgcattagca-tt 32307610  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  32307609 cactattgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 32307548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 137 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 30029939 - 30029731
Alignment:
Q  137 tgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------a 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||  |||| | || |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| | |||||      |    
T  30029939 tgatattcttatgtcatgctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttgaatgagatgttgatga 30029840  T
Q  230 tgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcat--tgttgggggcttgatg 326  Q
    ||| |||||||||| ||||| |||| ||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||    
T  30029839 tgatgttccaaattattggactatacaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatagtgatgggggcttgatg 30029740  T
Q  327 cccgggagc 335  Q
    ||| |||||    
T  30029739 ccctggagc 30029731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 305
Target Start/End: Original strand, 37642233 - 37642458
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | ||||||||    
T  37642233 tatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttt-tgcatactgcctatgttgctg 37642331  T
Q  182 ttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
     |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| | |    
T  37642332 atcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagacgtt 37642431  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcat 305  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  37642432 taagaagtcgagtccatgcattagcat 37642458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 369
Target Start/End: Original strand, 12174318 - 12174500
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 272  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | | ||    
T  12174318 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttgttcta 12174413  T
Q  273 agatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||||||        | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||    
T  12174414 agatgtt--------gtgtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctg 12174500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 182 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 16097381 - 16097228
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| |||| | | |||| |||||    
T  16097381 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagagattgttgttctaagttgtta 16097285  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||| || | ||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  16097284 agatgttgtgtccatgaattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctt 16097228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 46822380 - 46822187
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| || ||||  ||||  |||  | || |||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  46822380 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgttgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 46822281  T
Q  220 attaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  46822280 attaagatgttgataatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 46822187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Original strand, 1644733 - 1644924
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaa 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||| | |||| ||   ||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | |||    
T  1644733 tgttgttgttgttatttaactaagcaacataagttggtctaagttgatgacgatgttg---ttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaa 1644828  T
Q  274 gatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    | |||||||| || | ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  1644829 gttgttaagatgttgtgtccatgcattagcatt-cattgttaggggcttgatgccctagagcctttgctcaaccacgttgggggcttgatgccctgg 1644924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 174 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 13919390 - 13919198
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-t 271  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||   ||||||||| ||||| || ||||||| || |  | || |    
T  13919390 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatg--taagaagttg---ttccaaattattggagttgtataagatgtcgatgtttct 13919296  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13919295 aagatgttaagttgttgagtccatgcatactcatt-cat-gttgggggcttgatgccctggagccttttctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 13919198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 304
Target Start/End: Original strand, 22147493 - 22147717
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||| || |||| |  |  |||||||    
T  22147493 tatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttt-tgcataccgcctacgttgctg 22147591  T
Q  182 ttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
     |  |||  |||||||||||||||| |||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| | |    
T  22147592 atcattaactaactaagctgcatgactcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagacgtt 22147691  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagca 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22147692 taagaagtcgagtccatgcattagca 22147717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15245908 - 15245849
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15245908 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 15245849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 22110427 - 22110603
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||||||||  ||    
T  22110427 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aggatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgttaagttgt 22110521  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
     ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  | ||||||| |||||||||||||    
T  22110522 tgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttcctc-accatgttgaggccttgatgccctgg 22110603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 316 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 323944 - 323889
Alignment:
Q  316 ggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  323944 ggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 323889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15206826 - 15206767
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15206826 gttgggggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 15206767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Original strand, 37251165 - 37251419
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 209  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| | |||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||    
T  37251165 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttt-tatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgactcg 37251263  T
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||| ||     || ||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |    || ||||||||||||  || ||||||||||||   ||||     
T  37251264 gtctaagatg-----gaagatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgatttttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcatt- 37251357  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||    
T  37251358 cattgtcgggggcttgatgccctagagcctttgctc-accacgttgagggcttgatgccctgg 37251419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 316011 - 315957
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  316011 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 315957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 23318944 - 23319002
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23318944 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 23319002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 12377850 - 12377793
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12377850 tgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 12377793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 15265029 - 15264973
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15265029 gttgggggcttgatgccctggagccattgctcaattaagttgagggcttgatgccct 15264973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 32404381 - 32404440
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32404381 gttgggggcttgatgtcctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctggg 32404440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 43889997 - 43890056
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43889997 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttggg 43890056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 606401 - 606576
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||     ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |  | | ||||||| |||   ||     
T  606401 ttaactaagctgcatgagtcggtataagatga-----atgatgatgttccaaattgttggatttatataagaggtcgatgttctaagatgctaatttgta 606495  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||   || | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  606496 gagtccatgcatactca-tacattgttgggggcttgatgccctggagccattgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 606576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 9577553 - 9577495
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9577553 gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 9577495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 1644904 - 1644962
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1644904 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgggggcttgatgccctgg 1644962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 17661106 - 17661164
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17661106 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 17661164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43926082 - 43925829
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 209  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| | | |||||  | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  43926082 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgagctgttt-tatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 43925984  T
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||| ||||  || ||||||||||||   || ||    
T  43925983 gtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatg-taagttgttgagtccatgcatactca-tt 43925891  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  43925890 cattgttgggggcttgatgccctgaagcctttactc-accacgttgggggcttgatgccctgg 43925829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 606556 - 606612
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  606556 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccct 606612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 83 - 154
Target Start/End: Original strand, 2051167 - 2051238
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  2051167 tatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatg 2051238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16103672 - 16103613
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16103672 tgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 16103613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 37251399 - 37251457
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37251399 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 37251457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42386309 - 42386251
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42386309 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 42386251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 43925849 - 43925791
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  43925849 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgggggcttgatgccctgg 43925791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 52523960 - 52524018
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  52523960 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 52524018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 335
Target Start/End: Original strand, 10542621 - 10542663
Alignment:
Q  293 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10542621 catgcattatcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 10542663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14665458 - 14665400
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 232  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  14665458 tgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 14665400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15245945 - 15245888
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  15245945 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 15245888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 856197 - 856140
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  856197 tgttgctattgttattcaactaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 856140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14441290 - 14441234
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  14441290 gttgagggcttgatgcgctggagcctttgctcaa-taagttgagggtttgatgccctg 14441234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 368
Target Start/End: Original strand, 22110582 - 22110639
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||| || |||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22110582 tgttgaggccttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccct 22110639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 23077537 - 23077594
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23077537 tgttgctgttgttatttaaccaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 23077594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Original strand, 49668306 - 49668363
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  49668306 gttgggggcttgatgccctggagctttaactcaattatgttgggggcttgatgccctg 49668363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 15470813 - 15470761
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatg 364  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||    
T  15470813 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatg 15470761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 18700688 - 18700743
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||||||||||||||||||    
T  18700688 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacattgagggcttgatgccct 18700743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 316049 - 315991
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  316049 tgttgggggcttgatgccctggagcttttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 315991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 323986 - 323928
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||  ||||||||||||||||    
T  323986 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttcggggcttgatgccctgg 323928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 9707887 - 9707951
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9707887 gttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaataaagttgagggcttgatgccctggg 9707951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 320 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10562664 - 10562613
Alignment:
Q  320 cttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10562664 cttgatgctctggtgcctttactcaattaagttgagggcttgatgccttggg 10562613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14668611 - 14668556
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 232  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  14668611 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatga 14668556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 316 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14234364 - 14234310
Alignment:
Q  316 ggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  14234364 ggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgctctgg 14234310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15206863 - 15206806
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||    
T  15206863 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgctctgg 15206806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15265066 - 15265009
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  15265066 gttgggggcttgataccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 15265009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 15878114 - 15878168
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  15878114 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 15878168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 23318907 - 23318964
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  23318907 gttgggggcttgatgtcctggagcctttgctgaa-cacgttgagggcttgatgccctgg 23318964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 9520786 - 9520733
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||| |||||||    
T  9520786 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggattgatgc 9520733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32307568 - 32307515
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |||| |||||||||||    
T  32307568 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactatgttgggggcttgatgc 32307515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 183 - 231
Target Start/End: Original strand, 26196500 - 26196548
Alignment:
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  26196500 tgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 26196548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 35065650 - 35065709
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  35065650 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgagggcttgatgccctggg 35065709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 371
Target Start/End: Original strand, 43890067 - 43890099
Alignment:
Q  339 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  43890067 tgctcaaataagttgagggcttgatgccctggg 43890099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 96)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 18809092 - 18808804
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18809092 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 18808993  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808992 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 18808893  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808892 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 18808804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23135739 - 23135451
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23135739 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 23135640  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135639 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 23135540  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135539 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 23135451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 23712026 - 23712314
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23712026 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 23712125  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712126 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 23712225  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712226 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 23712314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 83 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 39682462 - 39682177
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39682462 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 39682363  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682362 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 39682263  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682262 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 39682177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 24905645 - 24905934
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24905645 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 24905744  T
Q  183 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905745 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 24905844  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905845 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 24905934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 24908120 - 24908409
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24908120 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 24908219  T
Q  183 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908220 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 24908319  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908320 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 24908409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 23709545 - 23709833
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23709545 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 23709644  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23709645 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 23709744  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709745 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 23709833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26505528 - 26505240
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  26505528 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgt 26505429  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505428 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 26505329  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505328 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 26505240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26508006 - 26507718
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  26508006 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgctgtgttgctgt 26507907  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507906 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 26507807  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507806 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 26507718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 24898208 - 24898497
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24898208 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 24898307  T
Q  183 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24898308 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttaa 24898407  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898408 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 24898497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 24900691 - 24900980
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24900691 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 24900790  T
Q  183 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24900791 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttaa 24900890  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900891 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 24900980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 24903168 - 24903457
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24903168 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 24903267  T
Q  183 tgttatttaactaa-gctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24903268 tgttatttaactaaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttaa 24903367  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903368 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 24903457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 571546 - 571258
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  571546 tatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 571447  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  571446 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 571347  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571346 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 571258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 45029867 - 45030155
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||    
T  45029867 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgttgtgttgttgt 45029966  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029967 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 45030066  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45030067 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 45030155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 6726144 - 6725858
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6726144 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 6726045  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6726044 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgaattatataagaggttgtcgatgtaagatgttaag 6725945  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6725944 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 6725858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 32039511 - 32039799
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  32039511 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttactgt 32039610  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  32039611 tgttatttaactaagctgcatgagccggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 32039710  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039711 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 32039799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 21155073 - 21155361
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21155073 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 21155172  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155173 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgaagaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 21155272  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21155273 aggtcgagttcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttggg 21155361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 28577248 - 28576960
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28577248 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttggcttgcatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgttgcgttgctgt 28577149  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  28577148 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaagttgttgatttaagatgttaag 28577049  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577048 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 28576960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 24367923 - 24367635
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24367923 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 24367824  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24367823 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaaatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaa 24367724  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24367723 gaggtcgagtccatgcattaacattacattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctgg 24367635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 83 - 366
Target Start/End: Original strand, 24529541 - 24529826
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  24529541 tatatgcattatttgaattatatatgaaataattgagacgttgttaacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgttgttg 24529640  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24529641 ttgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 24529740  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24529741 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggtttgatgcc 24529826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23131011 - 23130788
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23131011 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 23130912  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23130911 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcga-ttaagatgtttaa 23130813  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23130812 gaggtcgagtccatgcattagcatt 23130788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 23133478 - 23133255
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23133478 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 23133379  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23133378 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcga-ttaagatgtttaa 23133280  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23133279 gaggtcgagtccatgcattagcatt 23133255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Original strand, 34402535 - 34402758
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34402535 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 34402634  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  34402635 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcga-ttaagatgtttaa 34402733  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  34402734 gaggtcgagtccatgcattagcatt 34402758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 154 - 371
Target Start/End: Original strand, 24643034 - 24643252
Alignment:
Q  154 gctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattat 253  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  24643034 gctgtttttgtatactgatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgacgaagttccaaattattggattat 24643133  T
Q  254 ataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagtt 352  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  24643134 ataagaggttgtcgatttaagatgattaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagtt 24643233  T
Q  353 gagggcttgatgccctggg 371  Q
    || ||||||||||||||||    
T  24643234 gaaggcttgatgccctggg 24643252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 43137448 - 43137204
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |  |||||||||||    
T  43137448 tatatgcattacttgaattatatgtgaacaattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattactgtgttgctgt 43137349  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  43137348 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgattaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaa 43137249  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  43137248 gaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 43137204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 83 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 22105562 - 22105319
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||    
T  22105562 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagaagttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctg 22105463  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  22105462 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgttta 22105364  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  22105363 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttggggacttgatg 22105319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 38967524 - 38967279
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| | ||    
T  38967524 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatttcatgctatttttgtatattgttgtgtcgatg 38967425  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||    
T  38967424 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaaatattggattatataggagtttgtcgatttaagatgttta 38967325  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38967324 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 38967279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23060667 - 23060411
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||    
T  23060667 ttatgtgcattacttgaagtataatttaatatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgct 23060568  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23060567 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtt 23060468  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23060467 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 23060411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Original strand, 32214934 - 32215164
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  32214934 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgttgt 32215033  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  32215034 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 32215133  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215134 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 32215164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 23076596 - 23076346
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || |||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  23076596 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatattgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 23076497  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  23076496 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtggatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtt 23076397  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076396 taagaggccgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 23076346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22337269 - 22337022
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||||    
T  22337269 ttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgtcttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatacagcctgtgttgct 22337170  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||        |||||||||||||||||||| |||||| | ||    
T  22337169 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaa--------attatataagaggttgtcgaattaagaagttt 22337078  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22337077 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22337022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 22731201 - 22731456
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || | | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | |||||||    
T  22731201 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaatatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatgttgct 22731300  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt-t 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||| |    
T  22731301 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgaataaagatgtct 22731400  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  22731401 aacaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgattccctggagc 22731456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 82 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23660176 - 23659940
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||| ||||   | |||| || ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  | |||||||    
T  23660176 ttatacgcattacttgagttatgattgaatatttaagatgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatcctgtttc-gtatactgcctatgttgct 23660078  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23660077 gttgttgtttaactaagatacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 23659978  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23659977 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 23659940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 22738147 - 22738401
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||     ||  ||    
T  22738147 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgcctatttaatg 22738246  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt-ta 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||    
T  22738247 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgaattaagatgtcta 22738346  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    | ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22738347 aaaggtcggatccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22738401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Original strand, 23040249 - 23040405
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattta 272  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||    
T  23040249 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatta 23040348  T
Q  273 agatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 328  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040349 agatgtttaagaggtcgagtgcatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 23040405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 121 - 327
Target Start/End: Original strand, 298820 - 299027
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  298820 gttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 298919  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  298920 gattaagatgatgaagtttcaaatttttggattatacaaga-gttgtcgatttaacatgtttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttggg 299017  T
Q  318 ggcttgatgc 327  Q
    ||||||||||    
T  299018 ggcttgatgc 299027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19671982 - 19671728
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | ||||||||    
T  19671982 tatatgcattacttgaattatatgtgaata-ttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttt-tgcatactgcctatgttgctg 19671885  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattat-ataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19671884 attgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtt 19671785  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||    
T  19671784 taagaagtcgagtctatgcattagcatttcatggttgggagcttgatgccctggagc 19671728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 8946718 - 8946555
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 272  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  8946718 tgttgctattgttatctaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaatta 8946619  T
Q  273 agatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  8946618 agatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttagggacttgatgccctggagc 8946555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 23654356 - 23654609
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    |||||||||||||| | |||  | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||  | || || ||||    
T  23654356 tatgcattacttgagtaatacttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgatgtatttgtatgctgcctatgctgttgtt 23654455  T
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  23654456 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaa 23654555  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtt-gggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  23654556 gaggtcgagtccatgcactagca-ttcattgttggggggcttgatgccctggagc 23654609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 38136 - 38337
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  38136 ttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 38234  T
Q  235 ttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcg-atttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccg 330  Q
    ||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||| | ||  ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||     
T  38235 ttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatttatgttgttttaagaggtggagtccatgcattagca-ttcattgtt-ggggcttgatgccct 38332  T
Q  331 ggagc 335  Q
    |||||    
T  38333 ggagc 38337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20309221 - 20309007
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20309221 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctatttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 20309125  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    | | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20309124 gttgaagatgatgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagttgtttaagatgtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgg 20309026  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  20309025 gggcttgatgccctggagc 20309007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Original strand, 23103369 - 23103616
Alignment:
Q  87 tgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgt 185  Q
    ||||| |||||||||||   | ||| ||||||| |||| ||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||  ||||||||  | |||||||||| |    
T  23103369 tgcatgacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgctgtttt 23103466  T
Q  186 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaaga 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||| | ||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  23103467 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaaatattggactaatttaagaggttgtcgaattaagttgtttaaga 23103566  T
Q  284 ggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  23103567 ggtcgagtccatgcattagca-ctcattgtt-ggggcttgatgccctggagc 23103616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 184 - 327
Target Start/End: Original strand, 23072019 - 23072163
Alignment:
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||| || ||||    
T  23072019 gttatttaactaagctgcatgagtcggactaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttttcgaattaagttgtttaa 23072118  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23072119 gaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgc 23072163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23286012 - 23285820
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||  | || | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||    ||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  23286012 tatgcattacttgaagaacatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtc----tgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 23285917  T
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| || ||||||||||    
T  23285916 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgttgaattaagatgtt 23285820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7679647 - 7679446
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagat----gatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcg 267  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||  |    
T  7679647 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgattaagatgatggatgatgttccaaattattggatatatataagaggttgaag 7679548  T
Q  268 att-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
     || ||||| ||||||  || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||    
T  7679547 tttataagaagttaagttgttgtgtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgcc 7679450  T
Q  367 ctgg 370  Q
    ||||    
T  7679449 ctgg 7679446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 114 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 28406099 - 28405872
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  28406099 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 28406000  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 311  Q
    ||||||||||   ||||||||  ||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | |||| |||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||    
T  28405999 ctaagttgat---gatgatgattttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaagttgttaagatgatgtgtccatgcattagca-ttcatt 28405905  T
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28405904 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 28405872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25175972 - 25175720
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||    
T  25175972 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgaatctgt 25175874  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||||||||||| |||||    
T  25175873 ctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcat 25175779  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| || |  | |||| ||||||||||||||||    
T  25175778 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgttc-accatgttgggggcttgatgccctgg 25175720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 223 - 335
Target Start/End: Original strand, 21900562 - 21900676
Alignment:
Q  223 aagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 320  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21900562 aagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 21900661  T
Q  321 ttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||| |||||    
T  21900662 ttgatgccctggagc 21900676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Original strand, 18786971 - 18787154
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgtt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || |||||||||    
T  18786971 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgtt 18787065  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  18787066 aagttgttgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctgtggcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 18787154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 83 - 344
Target Start/End: Original strand, 7701 - 7959
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||  | ||||||||    
T  7701 tatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactgcctatgttgctg 7799  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
     |||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||| ||    
T  7800 tttgtttattaactaagctgcatgattcagtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagaggt 7894  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    | ||  || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  7895 tgagttgttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctatgctca 7959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Original strand, 22134266 - 22134462
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag---ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt 270  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||| |   ||||||||| ||||| | ||||||| |  || | |     
T  22134266 tgttgctgttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctatgatgatgatgatgatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgaagttgttc 22134364  T
Q  271 taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| |||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  22134365 taagttgttaagatgttgtgtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 22134462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 265
Target Start/End: Original strand, 23708587 - 23708769
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| || | ||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||  | |||||||     
T  23708587 tatatgcattacttgaattatatttgaatgtttgagatgtcgatgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactgcctatgttgcta 23708685  T
Q  182 t-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgt 265  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  23708686 tctgttatttaactaagctgcttgagtcggtctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattggatttatataagaggttgt 23708769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 24697682 - 24697858
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||| |||  |||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |  | || |||||||| |||  ||    
T  24697682 ttaactatgttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttg---ttccaaattgttggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgt-aagttgt 24697775  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
     ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24697776 tgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 24697858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 121 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 25616300 - 25616107
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  25616300 gttgttgaattgcaattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 25616201  T
Q  220 attaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||      |||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25616200 attaagatgttaataatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 25616107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23004794 - 23004618
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||| |  | || ||| |||| |||  ||    
T  23004794 ttaactaagctgcatgagtcggtttaagatga--aagatgatg---ttccaaattgttggatttatataagaggtcgatgtttctaaaatgt-aagttgt 23004701  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
     ||||||||||||   | || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23004700 tgagtccatgcatactcctt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctgg 23004618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 147
Target Start/End: Original strand, 24642869 - 24642933
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642869 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattatta 24642933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 43947558 - 43947617
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43947558 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 43947617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 174 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26392443 - 26392252
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-t 271  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||| | ||   ||||||||| ||||| |||||||||| || |  | || |    
T  26392443 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgatg--taagaagttg---ttccaaattattggagttatataagatgtcgatgtttct 26392349  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||| |||  || ||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26392348 aagatgt-aagttgttgagtccatgcatactcatt-cat-gttgggggcttgatgccctgaagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 26392252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 22413213 - 22413388
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtc 287  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||    | ||||||||||||||  ||     
T  22413213 ttaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgatg---ttccaaattattggatttatataagaggtcaatgttttaagatgttaagttgtt 22413307  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  22413308 gagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagccttcgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 22413388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 22252718 - 22252776
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22252718 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccctgg 22252776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23207401 - 23207147
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 209  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| | |||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  23207401 ttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttt-tatatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 23207303  T
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||| |||  ||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||    | || || |||||||||  || ||||||||||||   || ||    
T  23207302 gtctaagatga--aagatgat---gttccaaattattggatttatataagaggtcaatgtttctatgatgttaagttgttgagtccatgcatactca-tt 23207209  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||    
T  23207208 cattgttgggggcttgatgccctggaccctttgctc-accacgttgaaggcttgatgccctgg 23207147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 316 - 369
Target Start/End: Original strand, 39828191 - 39828244
Alignment:
Q  316 ggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39828191 ggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 39828244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 288 - 368
Target Start/End: Original strand, 23713058 - 23713136
Alignment:
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | || |||| ||||||||||||||    
T  23713058 gagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-actacgttgggggcttgatgccct 23713136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 367
Target Start/End: Original strand, 18547176 - 18547231
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccc 367  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18547176 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagtgcttgatgccc 18547231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 21115631 - 21115572
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21115631 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattcagttgagggcttgatgcactggg 21115572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 24688519 - 24688578
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24688519 tgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 24688578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23791427 - 23791143
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| | | |||||  | |||||     
T  23791427 tatatgcattacatgaattatatat-aatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcatgaactgttt-tatgtactgcctatgttgt 23791330  T
Q  180 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagat 276  Q
    |||| | |  ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| |||||||||||    | || ||||||    
T  23791329 tgtttgcttattaactaagctacatgagtcggtctaagatga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcaatgtttctaagat 23791235  T
Q  277 gttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||  || ||||||||||||   |||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  23791234 gttaagttgttgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttggtgccctggagcctctgctcaa-caggttgggggcttgatgccctgg 23791143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 20520161 - 20520443
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | |  |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| |||||  |||||| | | |||||  | ||||||    
T  20520161 tatatgcattacttgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcatgaactgttt-tatgtactgcatatgttgc 20520257  T
Q  180 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg 277  Q
    |||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||   |||||||||| ||||| |||||||||||||    | | ||||||     
T  20520258 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagataat---gttccaaattattggatttatataagaggtcaatgttctaagata 20520352  T
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||  || ||||||||||| |||   ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | ||||||||||| |||||||||    
T  20520353 ttaagttgttgagtccatgca-tagtcattctttgttgggggcttgatgccctagagcctttgctc-accacgttgagggcttcatgccctgg 20520443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 18787134 - 18787192
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18787134 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 18787192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 22413368 - 22413426
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22413368 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 22413426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25108807 - 25108749
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25108807 gttgggggcttgatgcccttgagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 25108749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23791163 - 23791106
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23791163 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgagggctttatgccctg 23791106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23287254 - 23287195
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23287254 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattaagttgagggcttgatgcactggg 23287195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 28405865 - 28405809
Alignment:
Q  314 tgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  28405865 tgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 28405809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21115669 - 21115611
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  21115669 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 21115611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25175741 - 25175682
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25175741 tgttgggggcttgatgccctggagatttaggtcaattatgttgagggcttgatgccctgg 25175682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 370
Target Start/End: Original strand, 10822795 - 10822870
Alignment:
Q  293 catgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||  |||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  10822795 catgcattagcatt-cattgtcgggggcttgatgccctagagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 10822870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 7964 - 8020
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||| ||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7964 gttgggggtttgatgccttggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccct 8020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 10822850 - 10822906
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  10822850 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagtcgagggcttggtgccct 10822906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 23207161 - 23207109
Alignment:
Q  318 ggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23207161 ggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgataccctgg 23207109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23287424 - 23287384
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 214  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  23287424 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtcta 23287384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 370
Target Start/End: Original strand, 24688477 - 24688540
Alignment:
Q  306 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  24688477 ttcattgttgggagcttgatgccctggagcctttgctc-accatgttgggggcttgatgccctgg 24688540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 32451896 - 32452031
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacg-ttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||| | ||  | ||||||||||| | |||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||| || || |||  | |||||||    
T  32451896 tatacgcattacttgaagtttaaatgaataattgagatgattgttggcttgcatt-gatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgct 32451994  T
Q  181 gtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    ||| | | |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32451995 gtttgatgtttaaccaagctgcatgagtcggtctaag 32452031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 34136831 - 34136771
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  34136831 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttaagggattgatgccctggg 34136771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 23712293 - 23712357
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23712293 gttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctggg 23712357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 7679466 - 7679408
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  7679466 gttgggggcttgatgccctggagctttatctcaattatgttgggggctttatgccctgg 7679408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 18547139 - 18547196
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  18547139 gttgggggcttgataccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 18547196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 334 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21237640 - 21237606
Alignment:
Q  334 gcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21237640 gcctttgctcaattaagttgagggcttgacgccct 21237606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 21237684 - 21237650
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21237684 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa 21237650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 22252681 - 22252738
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  22252681 gttgggggcttgataccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 22252738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 23713118 - 23713176
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  23713118 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaactaagttaagggcttgataccctgg 23713176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 306 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 25108850 - 25108789
Alignment:
Q  306 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  25108850 ttcattgttgggggcttgacgccctggtgcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccct 25108789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 365
Target Start/End: Original strand, 22134442 - 22134495
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 365  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||| |||||||    
T  22134442 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggattgatgc 22134495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 23287288 - 23287236
Alignment:
Q  315 gggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  23287288 gggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccct 23287236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 371
Target Start/End: Original strand, 24643237 - 24643295
Alignment:
Q  318 ggcttgatgccc-gggagccttt----gctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24643237 ggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctggg 24643295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 28653571 - 28653630
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  28653571 gttgagggcttgatgccccgtgagcttttgctct-ttaagttgagggcttgatgccctggg 28653630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 91)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 42245378 - 42245666
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  42245378 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 42245477  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245478 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 42245577  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245578 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 42245666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 264781 - 265069
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  264781 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 264880  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  264881 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatattacg 264980  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264981 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 265069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29330083 - 29329795
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  29330083 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgt 29329984  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29329983 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttcgaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 29329884  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29329883 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagagcttgatgccctggg 29329795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 10732953 - 10733241
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10732953 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 10733052  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733053 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 10733152  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10733153 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccttgagcttttgctcaattaagttgagggcatgataccctggg 10733241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20909161 - 20908873
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  20909161 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcttt 20909062  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |    
T  20909061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatattacg 20908962  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20908961 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 20908873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29346129 - 29345841
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29346129 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgt 29346030  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29346029 tgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 29345930  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29345929 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 29345841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 39245285 - 39244998
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39245285 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgggacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 39245186  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  39245185 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatactaag 39245086  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245085 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 39244998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 2154626 - 2154915
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  2154626 tatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcagttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgcta 2154725  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154726 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 2154825  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154826 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 2154915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29348602 - 29348314
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29348602 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgt 29348503  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29348502 tcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 29348403  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348402 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 29348314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29351075 - 29350787
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29351075 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgatgctgt 29350976  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  29350975 tcttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 29350876  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350875 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccaggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 29350787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 83 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 32027542 - 32027260
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  32027542 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttggatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgttgt 32027443  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027442 tgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 32027343  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 365  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32027342 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggtttgatgc 32027260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 10775688 - 10775977
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| ||||    
T  10775688 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttatatactgctgtgtcgctg 10775787  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10775788 tcgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 10775887  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10775888 agaggtcgagtccatgcattagcattacattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctgg 10775977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 11581212 - 11581501
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  11581212 tatatacattacttgaattatacgtgaataattgagacgttattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgttgctgt 11581311  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11581312 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttttcgatttaagatgtttaa 11581411  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  11581412 gaggtcgagtccatgacttagcatttcattgttgggggcttgatgcccttgagcctttgctcacttaagttgagggcttcatgccctggg 11581501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Original strand, 20917965 - 20918246
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    || |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20917965 tatatgctttacttgaattagatgtgaataattgagacgttgttgactt----tttatattattttgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 20918060  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918061 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaactattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 20918160  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20918161 aggtcgagt-catgcattagcatttcagtgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgtcctg 20918246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 114 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22412305 - 22412047
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| | | |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22412305 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgttatcgttatttaactaagctacatgagtcggtc 22412207  T
Q  213 taagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412206 taagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 22412107  T
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412106 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 22412047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 39363533 - 39363310
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39363533 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 39363434  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  39363433 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcga-ttaagatgtttaa 39363335  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39363334 gaggtcgagtccatgcattagcatt 39363310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 36154796 - 36155088
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||   |    
T  36154796 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttg---t 36154892  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  36154893 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcgatttaagatgtttaa 36154992  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||| |    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  36154993 gaggtcgagtccatgcattaacattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctggg 36155088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 128 - 335
Target Start/End: Original strand, 21997547 - 21997756
Alignment:
Q  128 acttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21997547 acttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaaga 21997646  T
Q  227 tgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgat 325  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21997647 tgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgat 21997746  T
Q  326 gcccgggagc 335  Q
    |||| |||||    
T  21997747 gccctggagc 21997756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 83 - 307
Target Start/End: Original strand, 20902021 - 20902248
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20902021 tatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctg 20902120  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||| ||    
T  20902121 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgaattaagatgatgaagttccaaattattggactatttaagaggttgttgaattaagatgttt 20902220  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||    
T  20902221 aagaggtcgagtccatacattagcattt 20902248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 23390463 - 23390718
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||    
T  23390463 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgct 23390562  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  23390563 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 23390662  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23390663 aagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 23390718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24529346 - 24529119
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 208  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529346 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtc 24529247  T
Q  209 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24529246 ggtctaagttgatgaagatgatgaagttccaaattattggattatataagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggttgagtccatgcattagcattt 24529147  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24529146 cattgttgggggcttgatgccctggagc 24529119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 329
Target Start/End: Original strand, 18319046 - 18319291
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  18319046 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctg 18319145  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||    
T  18319146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgattaa---gatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgttta 18319242  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||    
T  18319243 agaggtcgagtccatgcattatcattttaaagttgagggcttgatgccc 18319291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 79 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31061222 - 31060974
Alignment:
Q  79 attttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgtt 177  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||    
T  31061222 attttatatgcattaattaaattatttgtgaataattgatacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtttt 31061123  T
Q  178 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg 277  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  31061122 gctgttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatg 31061024  T
Q  278 -ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  31061023 tttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggagcttgatgc 31060974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 110 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 9078078 - 9077848
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 208  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9078078 ataattgagatgttgttgacttgcacttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgggtc 9077979  T
Q  209 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
     |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9077978 agtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 9077879  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9077878 cattgttgggggcttgatgccctggagcctt 9077848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 1096621 - 1096362
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  |||  ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| || |||||   |||||||||    
T  1096621 ttatatgcattacttgaattatgaatgtatatgtgagatgttgttgatttgcatttgatattattatgttatgttgtttttgcatactacctgtgttgct 1096522  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1096521 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgttgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtt 1096422  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1096421 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 1096362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 24067257 - 24067003
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  24067257 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctg 24067158  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||    
T  24067157 ttgttatttaaccaagctgcattggtcggtctaagttgattaag---atgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgttta 24067061  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24067060 agaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 24067003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 99 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 23064645 - 23064415
Alignment:
Q  99 attatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  23064645 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattaggtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaag 23064546  T
Q  198 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatg 296  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  23064545 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatggggttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaagtcgagtccatg 23064446  T
Q  297 cattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  23064445 cattagcatttcagcgataggggcttgatgc 23064415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 99 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 38619568 - 38619337
Alignment:
Q  99 attatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaag 197  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| | ||||||||||||||||||    
T  38619568 attatctgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgtcgttgttgttatttaactaag 38619469  T
Q  198 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagag---gtcgagtcc 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||    
T  38619468 ctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattatttgattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaattagtcgagtcc 38619369  T
Q  294 atgcattagcatttcattgttgggggcttgat 325  Q
    |||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  38619368 atgcattagcatttcagtgataggggcttgat 38619337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24493722 - 24493467
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  24493722 ttatgtgcatcacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgct 24493624  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
     |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  24493623 attgttacttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaaataagatgtt 24493524  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24493523 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 24493467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25421686 - 25421430
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| |    
T  25421686 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgctgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgtt 25421587  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||| |    
T  25421586 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaatttattggattatataagaggttgtcgaattatgatgtt 25421487  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  25421486 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctttatgccctggagc 25421430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13025425 - 13025209
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13025425 gttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 13025327  T
Q  220 attaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    || |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13025326 atgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcactgttggg 13025227  T
Q  318 ggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||| |||||    
T  13025226 ggcttgatgccctggagc 13025209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13095609 - 13095393
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13095609 gttgttgacttgcatttgatatcaatatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgctattgttatttaactatgctgcatgagtcggtctaagttg 13095511  T
Q  220 attaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    || |||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13095510 atgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcatttcactgttggg 13095411  T
Q  318 ggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||| |||||    
T  13095410 ggcttgatgccctggagc 13095393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 25431548 - 25431293
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | || | || ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||    
T  25431548 ttatgtgcattacttgaagtataattgaacatttaagatgttgttgacttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgct 25431449  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25431448 gttgttatttaactaagatgcatgagtcggtctaattt-atgaagatgatgatgtttccaatttattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtt 25431350  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  25431349 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatggcctggagc 25431293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Original strand, 8286848 - 8287066
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttct-gtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286848 gttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 8286947  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    ||| |||||||||| ||||||||||  |||| | ||||||| ||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286948 gatgaagatgatgatgttccaaattactggactaatataagtggttgtcgaattatgatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 8287047  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  8287048 gggcttgatgccctggagc 8287066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 121 - 328
Target Start/End: Original strand, 21808395 - 21808604
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21808395 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21808494  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
     | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  21808495 ttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagc-cttcattgttggg 21808593  T
Q  318 ggcttgatgcc 328  Q
    |||||||||||    
T  21808594 ggcttgatgcc 21808604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 121 - 328
Target Start/End: Original strand, 21729070 - 21729280
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21729070 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21729169  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtt-gg 316  Q
     | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||||   |||||||| ||    
T  21729170 ttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagttcatgcattagc-cgtcattgttggg 21729268  T
Q  317 gggcttgatgcc 328  Q
    ||||||||||||    
T  21729269 gggcttgatgcc 21729280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22075134 - 22074919
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| || || ||||||||   | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22075134 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgattttgtatacttcctatgttgctgttgttatttaactaagctgaatgagtcggtctaagttg 22075035  T
Q  220 attaag-atgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
     | ||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22075034 ttgaagaatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaat--agatgcttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgg 22074938  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  22074937 gggcttgatgccctggagc 22074919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 174 - 328
Target Start/End: Original strand, 19660894 - 19661050
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  19660894 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaatt 19660993  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 328  Q
    ||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19660994 aagttgtttaagaggttgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcc 19661050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 173 - 327
Target Start/End: Original strand, 20806845 - 20806998
Alignment:
Q  173 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 272  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  20806845 gtgtcgctgttgttatttaattaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatgaatttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgattta 20806943  T
Q  273 agatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20806944 agatgtttaagaattcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 20806998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 21292992 - 21293191
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag 234  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| |    
T  21292992 ttgatattattatgtcatactgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagatgttgaagatgatgatg 21293089  T
Q  235 ttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 332  Q
    ||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21293090 ttccaaattattggactaatttaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgaattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctgg 21293188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 37724050 - 37723802
Alignment:
Q  87 tgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgt-tg 184  Q
    |||||||||||||||||   | ||| ||||||| |||| ||| ||  ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | ||||||||| ||    
T  37724050 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgatgaatttaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtctg 37723954  T
Q  185 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagaggttgtcgatttaagatg-ttaag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  37723953 ttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagatgttgaagatgttgaagttccaaattattggactaaattaagaggttgtcgaattaagttgtttaag 37723854  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  37723853 aggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttgatgccctggagc 37723802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 344
Target Start/End: Original strand, 21329556 - 21329723
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||   | |    
T  21329556 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggttgt---tct 21329652  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    |||| ||| ||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  21329653 aagaggttgagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggag-ctttgctca 21329723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 182 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 21565595 - 21565436
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | |||| |||||    
T  21565595 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgtcgttctaagttgtta 21565499  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||| || | | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||    
T  21565498 agatgttgtgaccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgacgccctggagcccttgctca 21565436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 174 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 36314639 - 36314504
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || || ||    
T  36314639 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggtcgttgaatt 36314540  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36314539 aagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 36314504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22144202 - 22143917
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| ||||| || |||||   | ||||| ||    
T  22144202 tatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactacctatgttgatg 22144104  T
Q  182 t-tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat---tatataagaggttgtcgatttaagatg 277  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||   ||||||||| ||||||   ||||||||||||||| | | |||| ||    
T  22144103 tctgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagaagatg---ttccaaattattggatatatatataagaggttgttgttctaagttg 22144009  T
Q  278 ttaagaggtc-gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    || ||  ||  ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  | || |||| ||||||||||||||||    
T  22144008 ttgagttgtttgagtccatgcattagcatt-cattgttgagggcttgatgccctggagcctttgct-tactacgttgggggcttgatgccctgg 22143917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Original strand, 26012034 - 26012289
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| |  ||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  26012034 ttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctt-tgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 26012132  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 309  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||||||||||| ||||    
T  26012133 ctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattggatatatataagaggttgttgtttataagaggttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttca 26012229  T
Q  310 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  26012230 ttgttgggggtttgatgccctggagccttttctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 26012289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 126 - 370
Target Start/End: Original strand, 21502167 - 21502409
Alignment:
Q  126 tgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 223  Q
    ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || |  ||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21502167 tgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatt-tacatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatta 21502265  T
Q  224 agatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 322  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||   | ||||| ||| ||  || | ||| ||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  21502266 agatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggttgt--ttctaagaggttgagttgttgtgtcaatgcattagca-ttcattgttaagggctt 21502362  T
Q  323 gatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||| ||||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||||    
T  21502363 gatgccctggagcctttgctc-accaagttgggggcttgatgccctgg 21502409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Original strand, 20026945 - 20027192
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||| || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20026945 gttgttgaattgcatttgatattattatatcatgaactgttt-tggatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20027043  T
Q  217 ttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtt 314  Q
     |||  |||| ||||   || |||||| ||||||| ||||||||||| || | || ||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||| |||||||    
T  20027044 atga--aagaagatg---tttcaaattattggatttatataagaggtcgttgtttataagaggttgagttgttgagtccatgcattagcatt-cattgtt 20027137  T
Q  315 gggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  20027138 gggggcttgatgccctggagcctttgctc-accatgttgggggcttgatgccctgg 20027192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Original strand, 22959591 - 22959782
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 272  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | ||    
T  22959591 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttcta 22959686  T
Q  273 agatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    || |||||||| || | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  22959687 agttgttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcccttgagcccttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 22959782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 19668951 - 19668795
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtta 280  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||| |||||    
T  19668951 ttgttatttaactgagctgcaagagtcggtctaagttgatgatgatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagttgtta 19668852  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||| || | ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||    
T  19668851 agatgttgtgtccatgcattagca-ttcattcttgggggcttgatgccctagagcctt 19668795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 306
Target Start/End: Original strand, 17517207 - 17517400
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||  |||||||| ||||||| |||||||  ||||  |||  | || |||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  17517207 gttgttgaattgcgattgatatttttatgtcttgctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtcagtctaagttg 17517306  T
Q  220 attaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||      |||| ||| |||||| ||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17517307 attaagatgttgataatgatgtttcaaattattggactatttaagaggtcgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 17517400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 174 - 370
Target Start/End: Original strand, 26740705 - 26740895
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-t 271  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || |    
T  26740705 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggagttatataagaggtcgatgtttct 26740799  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||  || |||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  26740800 aagatgttaagttgttgagtccatgcataatca-ttca-tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 26740895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 83 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 40726006 - 40725782
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| || || || ||||||  |  |||||||    
T  40726006 tatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgctt-tgcatactgcctacgttgctg 40725908  T
Q  182 ttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
     |  |||  ||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||| | |    
T  40725907 atcattaactaactaagctgcatgagtcggtccaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagacgtt 40725808  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagca 304  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40725807 taagaagtcgagtccatgcattagca 40725782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 27989004 - 27989180
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||| ||||  ||    
T  27989004 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----atgatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgctaagttgt 27989098  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
     ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||    
T  27989099 tgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgagggcttgatgccctgg 27989180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 22178188 - 22178471
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | |  |||||| |||||||| |||||||||||||| | || |||||  |||||| | |||||||  | |||||     
T  22178188 tatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcatgagctgttt-tatatactgcctatgttgt 22178285  T
Q  180 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg 277  Q
    |||| |||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || ||||||    
T  22178286 tgtttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggattgatataagaggtcgatgtttcaagatg 22178380  T
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||  || ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  22178381 ttaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 22178471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 21732158 - 21732217
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21732158 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 21732217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 21809809 - 21809868
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21809809 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 21809868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 22178451 - 22178509
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22178451 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 22178509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 26740875 - 26740933
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26740875 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 26740933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 25578261 - 25578317
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25578261 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 25578317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 114 - 177
Target Start/End: Original strand, 20766119 - 20766181
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgtt 177  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20766119 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgttgtgtt 20766181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 26733062 - 26733120
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26733062 gttgggggtttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 26733120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16227372 - 16227313
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  16227372 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgtcctggg 16227313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 25574695 - 25574754
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25574695 gttgggggcttgatgtcttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 25574754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 25575888 - 25575947
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25575888 gttgggggcttgatgtcttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 25575947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 20027171 - 20027230
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20027171 tgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 20027230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14048038 - 14047939
Alignment:
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||| |    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14048038 ttaagaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctggg 14047939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22143937 - 22143879
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22143937 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 22143879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 26012269 - 26012327
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26012269 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 26012327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23469695 - 23469634
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23469695 tgttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccctggg 23469634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 23202759 - 23202819
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23202759 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgccctggg 23202819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 137 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 18418678 - 18418590
Alignment:
Q  137 tgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttattt-aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaag 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  18418678 tgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgatgttgttattttaactaagttgcacgagtcagtctaagttgattaag 18418590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 21502389 - 21502447
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21502389 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 21502447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 22959762 - 22959820
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22959762 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 22959820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Original strand, 23202720 - 23202778
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  23202720 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaacacgttgggggcttgatgccctg 23202778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26704129 - 26704075
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26704129 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26704075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 26973862 - 26973808
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  26973862 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 26973808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 27989160 - 27989218
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27989160 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 27989218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 21809771 - 21809829
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  21809771 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 21809829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19668785 - 19668727
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19668785 gttgggggcttgatgtcctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 19668727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 301
Target Start/End: Original strand, 22107709 - 22107802
Alignment:
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcatta 301  Q
    |||||||||  | ||||| |||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||    
T  22107709 gtctaagtttttgaagataatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaagtcgagtctatgcatta 22107802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 174 - 219
Target Start/End: Original strand, 26732892 - 26732937
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26732892 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctatgttg 26732937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 18418580 - 18418528
Alignment:
Q  255 taagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||| || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18418580 taagaggtcgttgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 18418528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 21329728 - 21329784
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21329728 gttgggggcttgataccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccct 21329784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 21565431 - 21565375
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  21565431 gttgggggcttggtgccctggagctttagctcaattacgttgggggcttgatgccct 21565375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 2154894 - 2154958
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2154894 gttgagggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctggg 2154958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 311 - 345
Target Start/End: Original strand, 21731651 - 21731685
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21731651 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa 21731685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22032380 - 22032323
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  22032380 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 22032323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 23469731 - 23469675
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  23469731 gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaa-catgttgggggcttgatgccctg 23469675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 327
Target Start/End: Original strand, 41095699 - 41095747
Alignment:
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  41095699 ttaagaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttggaggcttgatgc 41095747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 369
Target Start/End: Original strand, 6551516 - 6551548
Alignment:
Q  337 tttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6551516 tttgctctattaagttgagggcttgatgccctg 6551548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 91)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 15118365 - 15118653
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15118365 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 15118464  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15118465 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 15118564  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118565 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 15118653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 50222352 - 50222640
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  50222352 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtataatgttgtgttgctgt 50222451  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222452 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 50222551  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222552 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 50222640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 52312659 - 52312371
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52312659 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 52312560  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  52312559 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 52312460  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312459 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 52312371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 18239432 - 18239720
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18239432 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgctgctgt 18239531  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18239532 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 18239631  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239632 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 18239720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 44615437 - 44615149
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  44615437 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgt 44615338  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44615337 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttaag 44615238  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615237 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 44615149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 1837522 - 1837810
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1837522 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 1837621  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  1837622 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 1837721  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1837722 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 1837810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 83 - 366
Target Start/End: Original strand, 44773100 - 44773383
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44773100 tatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 44773199  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44773200 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 44773299  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44773300 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttaatgcc 44773383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 18215287 - 18215576
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18215287 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 18215386  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  18215387 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattattggattatatgagaggttgtcgatttaagatgtttaa 18215486  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18215487 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctggg 18215576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 83 - 339
Target Start/End: Original strand, 12320 - 12577
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12320 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 12419  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12420 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 12519  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt 339  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12520 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctgggagccttt 12577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 7641205 - 7641483
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||          ||||||||||||    
T  7641205 tatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt----------ttgtgttgctgt 7641294  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7641295 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 7641394  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7641395 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 7641483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 15355337 - 15355627
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  15355337 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgtcgctg 15355436  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | |||    
T  15355437 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgaagttccaaattattggattatataagaggtagtcgatttaagaagttta 15355536  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15355537 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggcttgatgccctggg 15355627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 114 - 371
Target Start/End: Original strand, 54798753 - 54799012
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  54798753 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctgttgttattcaactaagctgcatgagtcggtc 54798852  T
Q  213 taagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga-tgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798853 taagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaagatttttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 54798952  T
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798953 gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 54799012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 83 - 344
Target Start/End: Original strand, 44928892 - 44929155
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  44928892 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttattgacttgcatttgacattattatgtcatgctgtttttgtatactgcttgtgttgctg 44928991  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  44928992 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgattaaagatgttta 44929091  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  44929092 agaggtcgaatccatggattagcatttcattgttggtggcttgatgccctggagcctttgctca 44929155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 114 - 368
Target Start/End: Original strand, 8574868 - 8575121
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 213  Q
    |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574868 ttgagatgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 8574966  T
Q  214 aagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 312  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8574967 aagttaattaagatgatgaggttccaaagcattggattatataagaggttgtggatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattg 8575066  T
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8575067 tt-ggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 8575121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 51463881 - 51464124
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  51463881 tatatgcattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgt 51463980  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  51463981 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaa 51464079  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  51464080 gaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 51464124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 44102363 - 44102070
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  |||    
T  44102363 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttattgt 44102264  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt-taa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  44102263 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcgatttaagatgtctaa 44102164  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||| | |||||| |    |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  44102163 gaggtcgagtccatgcattagcataataaagttgagggcttgatgccctgagagcctatttacgctcaaatacgttgggggcttgatgccctgg 44102070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 23803278 - 23803521
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  23803278 tatatgcattacttgaattatatgtgaataatttagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgt 23803377  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  23803378 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattgaattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaa 23803476  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||||||    
T  23803477 gaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgtgggcttgatgc 23803521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 329
Target Start/End: Original strand, 16377490 - 16377737
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | |||||||    
T  16377490 ttatacgcattacttgaattatgaatgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt--gtatactgcctatgttgct 16377587  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16377588 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgaagttccaaattattggattatgtaagaggttgtcgatttaagatgttt 16377687  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377688 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 16377737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 90 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14280458 - 14280170
Alignment:
Q  90 attacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatt 189  Q
    ||||||||||||||   || ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  14280458 attacttgaattatgaatctatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgccgtgttgctgttgttatt 14280359  T
Q  190 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcg 288  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||||||    
T  14280358 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgtttaagaggtcg 14280259  T
Q  289 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||| |    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14280258 agtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctggg 14280170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12611092 - 12610856
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||    
T  12611092 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgt-------tgtgttgctgt 12611000  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | ||||||||||||||||| ||||    
T  12610999 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaata-gttgtcgatttaagatgtttaa 12610901  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  12610900 gaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 12610856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7798928 - 7798681
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  7798928 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgatgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 7798829  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  7798828 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttctaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 7798729  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798728 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 7798681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 110 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 14038774 - 14038545
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 208  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038774 ataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgccatgttgtttttgtatactgcatgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 14038675  T
Q  209 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
     |||||||||||| ||||||||        ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14038674 agtctaagttgatgaagatgat--------aaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 14038583  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14038582 cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa 14038545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 123 - 329
Target Start/End: Original strand, 52873375 - 52873583
Alignment:
Q  123 tgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 221  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873375 tgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat 52873474  T
Q  222 taagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 320  Q
     |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  52873475 gaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggc 52873574  T
Q  321 ttgatgccc 329  Q
    |||||||||    
T  52873575 ttgatgccc 52873583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22636589 - 22636334
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| |    
T  22636589 ttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtaaactgtctatgttgtt 22636490  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt-t 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  22636489 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgattttccaaattattggattatataagaggttgttgaattaagatgtct 22636390  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22636389 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22636334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 83 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 19242848 - 19242673
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  19242848 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgt 19242749  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataaga 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  19242748 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-tccaaattattggattatataaga 19242673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 7893852 - 7893601
Alignment:
Q  87 tgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgt 185  Q
    ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||||    
T  7893852 tgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctattgt 7893753  T
Q  186 tatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aaga 283  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  7893752 tatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaaga 7893653  T
Q  284 ggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7893652 ggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 7893601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 95 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15370159 - 15369925
Alignment:
Q  95 ttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaac 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15370159 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 15370060  T
Q  194 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagt 291  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  15370059 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagt 15369960  T
Q  292 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15369959 ccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatgc 15369925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15402856 - 15402610
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15402856 tatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctg 15402757  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagat-gtt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  15402756 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatggtt 15402657  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  15402656 aagaagtcgagtccatgcatttgca-ttctttgttgggggcttgatgc 15402610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 3515156 - 3514979
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3515156 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 3515057  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagag 260  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  3515056 tgttttttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaggttctaaattattggattatataagag 3514979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 16270203 - 16270458
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  16270203 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgct 16270301  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16270302 attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtt 16270401  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16270402 taagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16270458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15367843 - 15367597
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15367843 tatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctg 15367744  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15367743 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 15367644  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  15367643 aagaagtcgagtccattcattagca-ttctttgttgggggcttaatgc 15367597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15371355 - 15371109
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15371355 tatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctg 15371256  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15371255 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgttt 15371156  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  15371155 aagaagtcgagtccatgcattacca-ttctttgttgggggcttgatgc 15371109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Original strand, 19618185 - 19618415
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  19618185 tatatgcattacttgaattataggtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgt 19618284  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| | |||||||| | ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  19618285 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgttccaaactattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 19618384  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618385 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 19618415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12902908 - 12902656
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| || ||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  12902908 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattacaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 12902809  T
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  12902808 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaa 12902709  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  12902708 gaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 12902656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20149979 - 20149686
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20149979 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgtcgctg 20149880  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-a 280  Q
    ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| || || |||||||||||| |    
T  20149879 ttgttattttatcaagttgcatgagtcagtctaagttgattaag---atgaagttccaaattattggattatacaagagtttatcaatttaagatgttaa 20149783  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||| |    |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  20149782 agaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgaggacttgatgccctggg 20149686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Original strand, 14970720 - 14970950
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||    
T  14970720 tatatgtattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgctgttttgctgt 14970819  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  14970820 tgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaaaatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 14970919  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14970920 gtttaagaggtcgagtcgatgcattagcatt 14970950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15373636 - 15373390
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15373636 tatatgcgttagttgaattatatgtgaataattgagacattgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctg 15373537  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||| ||    
T  15373536 ttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgtttcaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgttt 15373437  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||    
T  15373436 aagaagtcgagtccatgcattacca-ttctttgttgggggcttgatgc 15373390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 44052977 - 44052728
Alignment:
Q  88 gcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgtt 186  Q
    ||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||    
T  44052977 gcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgatgttgtt 44052878  T
Q  187 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 285  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  44052877 atttaactgagctgcatgagtcggcctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagg 44052778  T
Q  286 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44052777 tcgaatctacgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 44052728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 95 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 16223673 - 16223439
Alignment:
Q  95 ttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaac 193  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16223673 ttgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcattagatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaac 16223574  T
Q  194 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagt 291  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  16223573 taagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagt 16223474  T
Q  292 ccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  16223473 ccattcattagca-ttctttgttgggggcttaatgc 16223439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 16239937 - 16240192
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||| || ||||  | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | | |||||    
T  16239937 ttatttgcattacttaaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctattttgct 16240035  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
     ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16240036 attgttatttaattaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattagattatataagaggttgtcgaattaagatgtt 16240135  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  16240136 taacaggtcgagtccatgcattagcatttcattgatgggggcttgatgccctggagc 16240192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 150 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 3096379 - 3096192
Alignment:
Q  150 tcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgtt-g 247  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| || |    
T  3096379 tcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattag 3096280  T
Q  248 gattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3096279 aataatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 3096192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 21815598 - 21815731
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21815598 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcattttatattattatgtcatgctgtttttgtatacagttgtgttgctgt 21815697  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21815698 cgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaag 21815731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 85 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 7089028 - 7088832
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||| |||| | ||||  | ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||    
T  7089028 tatgcattacttgaataatatttgaatatgtaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgtt 7088929  T
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7088928 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttctaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgtt 7088832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 89 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 6900037 - 6899808
Alignment:
Q  89 cattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgtta 187  Q
    ||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||  | ||||||| ||||||    
T  6900037 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgctatgttgttt-tgtatactgcctatgttgctattgtta 6899939  T
Q  188 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagagg 285  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||    
T  6899938 tttaactaagatgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattgaattatataagaggttttcgaattaaaatgtttaagagg 6899839  T
Q  286 tcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  6899838 tcgaatccatgcattagcatttcattattgg 6899808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Original strand, 23374365 - 23374575
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||||||||||||| || |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23374365 gttgttgaattgcaattgatatatttatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcgttctaagttg 23374464  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
     | ||||||      ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23374465 ttgaagatg------ttccaaattattggattaatataagaggttgtcgagttaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttggg 23374557  T
Q  318 ggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||| |||||    
T  23374558 ggcttgatgccctggagc 23374575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15551879 - 15551716
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15551879 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaatt 15551780  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||| || |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15551779 aagttgtttaataggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 15551716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Original strand, 39706356 - 39706545
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tata-taagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| | || ||||| ||    
T  39706356 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatattaagaggttgttgtttataagaagt 39706455  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  39706456 taagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 39706545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 14053323 - 14053523
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || || || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || | ||||||||||     
T  14053323 ttgatattattatgtcatgctgtt--tgtatactgtctatgctgttgtttgttatttaactaagttgcatgagtcgatctaagatgttgaagatgatgat 14053420  T
Q  234 gttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 331  Q
    |||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  14053421 gttccaaattattggactaatgtaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 14053519  T
Q  332 gagc 335  Q
    ||||    
T  14053520 gagc 14053523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17046549 - 17046386
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  17046549 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatt 17046450  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||| |||||    
T  17046449 aagttgtttaagaggtcgagtccatgcattaaca-ttcatagttgagggcttgatgccctggagc 17046386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 22353986 - 22353740
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||||| |||| ||  |  |||  | || |||||    
T  22353986 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgaattgtaattgatattgttatgtcatgttgttgctacaatctgcctatgctgctg 22353887  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga-agttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-- 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| | | ||||||| || |||| ||||||||||  ||| | ||||||||      
T  22353886 ttgttatttacctaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatattcccaaattattcgattaatataagagg--gtcaaattaagatgtt 22353789  T
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||    
T  22353788 ttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcagtgattggggcttgatgc 22353740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 13819 - 14102
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||  | ||||||||    
T  13819 tatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactgcctatgttgctg 13917  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcg-atttaagatgt 278  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |  ||||||||||    
T  13918 tttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttttaagatgt 14012  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    | ||  || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  14013 tgagttgttgagtccatgcattcaca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 14102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 282 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29267570 - 29267481
Alignment:
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29267570 gaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 29267481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 43198521 - 43198803
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc--tgtttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||  |||| |||||   ||||| || ||| ||| | ||||||    
T  43198521 tatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcatgaattgttt-tgcatattgtctatgttgc 43198619  T
Q  180 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg 277  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||||||   | ||||| |    
T  43198620 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggttgt--ttctaagagg 43198712  T
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    || ||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  43198713 ttgagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 43198803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 369
Target Start/End: Original strand, 46640453 - 46640706
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 209  Q
    |||||| ||| |||| || ||||||||||| |||| |||||  |||||| | |||||||| | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  46640453 ttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcatgaactgttt-tatatactgtctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 46640551  T
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 308  Q
    ||||||| |||  || ||| ||   || |||||| ||||||| ||||||||||| |  | | ||||||||||||| || ||||||||||||   |||| |    
T  46640552 gtctaagatga--aaaatgttg---tttcaaattattggatttatataagaggtcgatggtctaagatgttaagatgttgagtccatgcatactcatt-c 46640645  T
Q  309 attgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46640646 attgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctg 46640706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 110 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12774132 - 12773879
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 207  Q
    |||||||||| |||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12774132 ataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagt 12774035  T
Q  208 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||||||||||   |||||||| ||| |||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| |||||||| |  | ||| |||||||| || ||    
T  12774034 cggtctaagttgat---gatgatgatgtt-caaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgttaagatgatgtgtcgatgcattaaca-tt 12773941  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  12773940 cattgttgggggcttgatgccctggagcttttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 12773879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Original strand, 52243162 - 52243446
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    ||||||||||||||| ||||||| | |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| |||||  ||| || || ||||||  | ||||||    
T  52243162 tatatgcattacttggattatatatgaatgtttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatt-tgcatactgcctatgttgc 52243260  T
Q  180 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagat 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||| |     
T  52243261 tgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctaatag 52243355  T
Q  277 gttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||  ||  || | ||||| ||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| |||||||||||||||    
T  52243356 gtcgagttgttgtgtccaggcattagca-ttcatttatgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctg 52243446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14157854 - 14157718
Alignment:
Q  234 gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 332  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||    
T  14157854 gttccaaattattggactatataagatgttgtcgtttctaagaggttgagttgtctagtccatgcattagcata-cattgttgagggcttgatgccctgg 14157756  T
Q  333 agcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  14157755 agcctttgctcaaccacgttgagggcttgatgccctgg 14157718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 234 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14164559 - 14164423
Alignment:
Q  234 gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 332  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| || ||||| ||| ||  ||| |||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||    
T  14164559 gttccaaattattggactatataagatgttgtcgtttctaagaggttgagttgtctagtccatgcattagcata-cattgttgagggcttgatgccctgg 14164461  T
Q  333 agcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  14164460 agcctttgctcaaccacgttgagggcttgatgccctgg 14164423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 174 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 8846418 - 8846287
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |    
T  8846418 tgttgctgtttgttatttaactaagctgaataagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttct 8846322  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    ||| |||||||| || | |||||||||||||||||    
T  8846321 aagttgttaagatgttgtgtccatgcattagcatt 8846287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 14853103 - 14853162
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14853103 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 14853162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 222 - 344
Target Start/End: Original strand, 14927842 - 14927964
Alignment:
Q  222 taagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggc 320  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||| | | ||| | ||||||  || | ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14927842 taagatgatgatgttccaaattattagatatatataagaggttgttgttataaaaagttaagttgttgtgtccatgcattagcatt-cattgttgggggc 14927940  T
Q  321 ttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  14927941 ttgatgccctggagcctttgctca 14927964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 344
Target Start/End: Original strand, 12288214 - 12288436
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||| || || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12288214 gttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactggtt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 12288312  T
Q  217 ttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtt 314  Q
    ||||  ||||||||   |||||||||| ||||| ||| ||||||| |  | | || |||||||||| |  || ||||||  ||||| ||| |||||||||    
T  12288313 ttga--aagatgat---gttccaaattattggatttacataagagatcattgtttctaagatgttaggttgttgagtcccagcattcgca-ttcattgtt 12288406  T
Q  315 gggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  12288407 gggggcttgatgctctggagcctttgctca 12288436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 15791575 - 15791516
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791575 gttgggggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 15791516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 14825360 - 14825303
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14825360 gttgggggcttgatgtcctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 14825303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 15791701 - 15791648
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 365  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791701 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 15791648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 13592334 - 13592393
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13592334 gttgggggcttgatgccctggagcctttactcaattaagttgaggtcttgatgccctggg 13592393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 32307184 - 32307243
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  32307184 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaactaagttgagggcttgatgtcctgg 32307243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 37018576 - 37018519
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37018576 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgaaggcttgatgccctg 37018519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 17333168 - 17333110
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17333168 gttgggggtttgataccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgattccctgg 17333110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 53082384 - 53082442
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53082384 gttgggggcttgatgccctgaagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 53082442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 53631609 - 53631666
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53631609 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaa-taagttgagggcttgatgccctgg 53631666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 43198783 - 43198839
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  43198783 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgaggacttgatgccct 43198839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Original strand, 12288445 - 12288500
Alignment:
Q  315 gggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12288445 gggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 12288500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 14082 - 14140
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  14082 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaaccaagttgagggcttgatgccctgg 14140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 39706525 - 39706583
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39706525 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattacgttgggggcttgatgccctgg 39706583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Original strand, 14927969 - 14928026
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14927969 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctg 14928026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 83 - 156
Target Start/End: Original strand, 15464899 - 15464972
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgct 156  Q
    |||||||| |||||||||||||| | |||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||||    
T  15464899 tatatgcaatacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgct 15464972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 52243427 - 52243485
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| | ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  52243427 gttgggggcttgatgccctgaagctttagctcaactaagttgagtgcttgatgccctgg 52243485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 369
Target Start/End: Original strand, 53082227 - 53082403
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | || ||||||||||||  ||    
T  53082227 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagatgttaagttgt 53082321  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattg-ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
     | ||||||||||   || ||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  53082322 tgtgtccatgcatactca-ttcattgctggggggttttatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctg 53082403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 371
Target Start/End: Original strand, 13592404 - 13592436
Alignment:
Q  339 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13592404 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 13592436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 14157738 - 14157682
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14157738 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcacctaagttgagggcttgatgccct 14157682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 14853065 - 14853123
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  14853065 tgttgggggcttgatgccctggagcttttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 14853123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 26045523 - 26045578
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26045523 gttgggggcttgatgacctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgcc 26045578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 26050704 - 26050759
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    ||||||||||||||| || | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26050704 gttgggggcttgatgtcctgtgagcttttgctcaaataagttgagggcttgatgcc 26050759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 136 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 6190563 - 6190481
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    |||||||| |||||||||||| ||| || || |||  | |||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6190563 ttgatattgttatgtcatgctatttttgaatgctgcctatgttgctgtttgatgtttaactaagctgcatgagtcggtctaag 6190481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 13592297 - 13592354
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||  | |||| ||||||||||||||||    
T  13592297 gttgggggcttgatgccctggagcctttgcccaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 13592354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 15791612 - 15791555
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||    
T  15791612 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgctctgg 15791555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 19242672 - 19242623
Alignment:
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  19242672 ttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 19242623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 11425016 - 11424957
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  11425016 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgagggcttgatgccctggg 11424957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 14164443 - 14164391
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatg 364  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||  ||||||||||||||||||    
T  14164443 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcacctaagttgagggcttgatg 14164391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 17333338 - 17333298
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 214  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||    
T  17333338 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcagtcta 17333298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 89)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 21923304 - 21923592
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21923304 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 21923403  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21923404 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 21923503  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923504 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 21923592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13989015 - 13988730
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13989015 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 13988916  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13988915 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattaag 13988816  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988815 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 13988730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 23593748 - 23594036
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23593748 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 23593847  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  23593848 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 23593947  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593948 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 23594036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 368
Target Start/End: Original strand, 21475100 - 21475385
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21475100 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 21475199  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  21475200 tgttatttaactaagctgcatgagttggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 21475299  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475300 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 21475385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 29298285 - 29297998
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  29298285 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat-tcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 29298187  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298186 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtttcaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 29298087  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298086 aggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgttcaattaagttgagggcttgatgccctggg 29297998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 22123080 - 22123369
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22123080 tatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacattgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctatttttgtatactgttgtgttgctgt 22123179  T
Q  183 t-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123180 ttgctatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtagattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 22123279  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123280 gaggtcgagtccatgcattagcatttcgttgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 22123369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31612462 - 31612173
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  31612462 tatatgcattacttgaattatatgtgaataactgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactattgtgttgctgt 31612363  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  31612362 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagagtttgtcgatttaagatgtttaa 31612263  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  31612262 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcacttaagttgagggtttgatgccctggg 31612173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 29776837 - 29776592
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  29776837 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttatttttgtatactgttgtgttgctgt 29776738  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29776737 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaa 29776638  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  29776637 gaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgattggggcttgatgc 29776592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 83 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21711858 - 21711561
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||    
T  21711858 tataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgt 21711759  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||    
T  21711758 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcgatttagaatgtttaa 21711659  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctgggtg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||| |    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21711658 gaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgggtg 21711561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 110 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 34509906 - 34509679
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 208  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509906 ataattaagatgttgttgacttgcatttgatatcattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtc 34509807  T
Q  209 ggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34509806 ggtctaagttgatgaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 34509707  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||    
T  34509706 cattgttgggggcttgatgccctggagc 34509679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 83 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21707316 - 21707019
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||| |||    
T  21707316 tataggcattacatgatttatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattctgtcatgctttttttgtatactattgtgttgttgt 21707217  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||  ||| ||||    
T  21707216 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcgatttagaatgtttaa 21707117  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc-ccgggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctgggtg 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  |||| |||||||||||   |||||||| |    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21707116 gaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgcaatgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgggtg 21707019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21347111 - 21346885
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||   ||    
T  21347111 tatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttg 21347012  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21347011 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 21346912  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21346911 agaattcgagtccatgcattagcattt 21346885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 83 - 328
Target Start/End: Original strand, 45574855 - 45575103
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||||    
T  45574855 tatatgcattacttgaattatatgttaataattgagacgttgttgacttgcatttggtattattatgtcatgctgtttttgcatactgcctatgttgctg 45574954  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--t 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  45574955 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaatatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 45575054  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcc 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45575055 taagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgcc 45575103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 88 - 335
Target Start/End: Original strand, 50210186 - 50210439
Alignment:
Q  88 gcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgtt 186  Q
    ||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  50210186 gcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 50210285  T
Q  187 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag----ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  50210286 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaa 50210385  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  50210386 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 50210439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 83 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 21342246 - 21342021
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||   ||    
T  21342246 tatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtctttg 21342147  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21342146 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-tccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 21342048  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||    
T  21342047 agaattcgagtccatgcattagcattt 21342021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Original strand, 13212874 - 13213099
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| || ||||    
T  13212874 tatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgcgtcgctg 13212973  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||| |||    
T  13212974 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagatgttta 13213073  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  13213074 agaggtcgagtccatgcattagcatt 13213099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40389304 - 40389011
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  40389304 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgatgtgtcgctg 40389205  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-a 280  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||   ||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| |    
T  40389204 ttgttatttaaccaagttgcatgagtcagtctaggttgattaag---atgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgttaa 40389108  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| |||||||| |    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40389107 agaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctggg 40389011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22532423 - 22532168
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||||||   | |||| || ||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  22532423 ttatgtgcattacttgaattatgaatgaatatttaagatgttgttgaattgcaatggatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 22532324  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  22532323 gttgttatttaactaaattgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 22532224  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22532223 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 22532168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 16362066 - 16361835
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  16362066 tatatgcattacttgaattatttgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttatatactgttgtgttgctgt 16361967  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||| |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  16361966 cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 16361867  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16361866 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 16361835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 21840916 - 21840686
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21840916 tatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgt 21840817  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg------aagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      | |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||||||    
T  21840816 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataacaatgttccaaattattggactatttaaaaggttgttgaattaagat 21840717  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840716 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 21840686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 83 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 433159 - 432950
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||  ||||||||      
T  433159 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcttgatgtttttgtatactgcctgtgttgc-- 433062  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  433061 -cgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcaatttaagatgttta 432963  T
Q  281 agaggtcgagtcc 293  Q
    |||||||||||||    
T  432962 agaggtcgagtcc 432950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 83 - 323
Target Start/End: Original strand, 16275376 - 16275616
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| | ||    
T  16275376 tatatgcattaattgaattttatgtgaataattgagacgttgattgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctatgtcgttg 16275475  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||    
T  16275476 ttgttatttaactaagttgtatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttctaaattattggattatacaaga-gctgtcgatttaagatgttta 16275574  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 323  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  16275575 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttg 16275616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 27250699 - 27250951
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||||| ||    
T  27250699 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctatt 27250798  T
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||||||| ||||    
T  27250799 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagagattgtcgaattaagatgtttaa 27250898  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||    
T  27250899 gaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgataggggcttgatgccctggagc 27250951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 225 - 371
Target Start/End: Original strand, 27161617 - 27161764
Alignment:
Q  225 gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 323  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27161617 gatgatgaagttccaaattattggattatataagagtttgtcgatttaagatgtttaagaggtctagtccatgcattagcatttcattgttgggggctgg 27161716  T
Q  324 atgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161717 atgccctgtagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 27161764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 134 - 335
Target Start/End: Original strand, 20847173 - 20847376
Alignment:
Q  134 atttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 232  Q
    |||||||||  ||||||||||||| || ||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  20847173 atttgatatatttatgtcatgctgattttgtgtactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatga 20847272  T
Q  233 agttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccg 330  Q
     |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  20847273 tgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccct 20847371  T
Q  331 ggagc 335  Q
    |||||    
T  20847372 ggagc 20847376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 95 - 259
Target Start/End: Original strand, 15860033 - 15860197
Alignment:
Q  95 ttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaac 193  Q
    ||||||||| ||| | ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  15860033 ttgaattatttgtgagtaattaagacgttgattgacttgcatttaatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgtcgctgttgttatttaac 15860132  T
Q  194 taagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataaga 259  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  15860133 taagctgcatgagtcggtccaagttgattaagatgatgaag-tccaaattattggattatataaga 15860197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20135338 - 20135080
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaa-ttatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||| || ||| | |||| || ||| |||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||  ||||  |||  | || |||| |    
T  20135338 tatgcattacttgaagttttat-tgaatacttaagatgttgttgaattgcacatgatattattatgtcatgatgttgttgtaatctgcctatgctgctat 20135240  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||      |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  20135239 tgttgtttaactaagttgcatgagtcagtctaagttgattaagatgttgatgatgatgttccaaattattggactatataagaggttgtcgaattaagat 20135140  T
Q  277 gtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  20135139 gtttaagaggtcgagtccatgcatcagcatttcatagttgggggcttgatgccctggagc 20135080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33681129 - 33680876
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  33681129 ttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggt 33681031  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    |||||||||   ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | | ||||  ||||||| || | ||||||||||||||||| |||    
T  33681030 ctaagttga---agatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggtggttgttctaagtggttaagatgttgtgtccatgcattagcatt-cat 33680935  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  33680934 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 33680876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Original strand, 38801447 - 38801609
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  38801447 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtc-gtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatt 38801545  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  38801546 aagttgtttaagaggtcgagtccatgcataagca-ttcatagttgggggcttgatgccctggagc 38801609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 109 - 321
Target Start/End: Original strand, 22468690 - 22468910
Alignment:
Q  109 aataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagt 207  Q
    ||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||  |||  | ||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  22468690 aataattaagatgttgttgaattgcaattgatattatgatgtcatgctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagt 22468789  T
Q  208 cggtctaagttgattaaga---tgatgaa---gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcatt 300  Q
    | |||||||||||||||||   |||||||   |||||||||| ||||| |||||| ||||||||    |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  22468790 cagtctaagttgattaagatgttgatgaagatgttccaaatttttggactatatacgaggttgtttgattaagatgtttaagagatcgagtccatgcatt 22468889  T
Q  301 agcatttcattgttgggggct 321  Q
    ||||| |  ||||||||||||    
T  22468890 agcatatatttgttgggggct 22468910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 306
Target Start/End: Original strand, 14295610 - 14295745
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || || ||    
T  14295610 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaaatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggtcgttgaatt 14295709  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14295710 aagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 14295745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 21896224 - 21896507
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||| |||||| |||||||||| | |||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  | ||||||||    
T  21896224 tatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgctg 21896322  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
     |||||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||     | || || |||||||||| ||||| ||||||||||||   | | || ||||||||    
T  21896323 tttgtttattaactaagttgcatgagtcggtctaagatga-----aggaagatgttccaaattattggatttatataagaggccattgtttctaagatgt 21896417  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    | ||  || ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  21896418 tgagttgttgagtccatgcattcgca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 21896507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 431701 - 431619
Alignment:
Q  289 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  431701 agtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 431619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 22237680 - 22237521
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtta 280  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| ||| |||||| ||||| || ||||||||||||| | | |||| |||||    
T  22237680 ttgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgtttcaaattattggacttgtataagaggttgttgttctaagttgtta 22237584  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||  || | ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22237583 agttgttgtgtccatgcattagca-ttcatcgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 22237521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 50686657 - 50686481
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtc 287  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |   |||||||||| ||||| ||||||||||||| |  | | ||||||||||||  ||     
T  50686657 ttaactaaactgcatgagtcggtctaagatga--aagatgtt---gttccaaattattggatttatataagaggtcgatgttctaagatgttaagttgtt 50686563  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50686562 gagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgcccttgagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 50686481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 344
Target Start/End: Original strand, 52928038 - 52928197
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||    
T  52928038 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg---aagatggtgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttgtta 52928134  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||  || | |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  52928135 agttgttgtgtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttggtgccctagagcctttgctca 52928197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Original strand, 22921868 - 22922120
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22921868 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22921966  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    ||||| ||||   |||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||| | || ||||| |||| |  || | |||||||||||| || |||||    
T  22921967 ctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattgga-aatataagaggttgttgtttataagaagttatgttgttgtgtccatgcattaaca-ttcat 22922061  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  22922062 tgttaggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 22922120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 174 - 306
Target Start/End: Original strand, 20454613 - 20454752
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcg 267  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||| || |    
T  20454613 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgatgataatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttg 20454712  T
Q  268 atttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  20454713 aattaagatgtttaagatgtcgagtccatgcattaacatt 20454752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 110 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 21754170 - 21753947
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 207  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||  | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21754170 ataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctgcatgagt 21754073  T
Q  208 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||||||||||   |||||||  |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | | |||| |||||||| || | ||||||||||||||| |     
T  21754072 cggtctaagttgat---gatgatgttgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatgcattagca-tc 21753978  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  21753977 cattgttgggggcttgatgccctagagcctt 21753947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 35261049 - 35261329
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||| | | |||  ||||||   |||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||  | ||||||||    
T  35261049 tatatgcattacttgaattatgtatgaatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctgttt-tgcatactgcctatgttgctg 35261144  T
Q  182 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
    || |||  |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||  || | |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||||    
T  35261145 tttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaa---gatgaaga--attatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgt 35261239  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||  || ||||||||||||   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  35261240 taagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttggaggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 35261329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 234 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21477643 - 21477540
Alignment:
Q  234 gttccaaattgttggattat-ataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 331  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21477643 gttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctg 21477544  T
Q  332 gagc 335  Q
    ||||    
T  21477543 gagc 21477540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20248332 - 20248150
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||  | | |||| ||||||    
T  20248332 ttgttttttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgatgttctaagttgttaa 20248237  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    || || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  20248236 gatgttgtgtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcccttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 20248150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21026795 - 21026649
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| |||||||  ||| ||||||||| || |||||||||  | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026795 gttgttgaattgcaattgatatatttacgtcatgctgattttgtatactgcctatattgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 21026696  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgt 265  Q
     | | |||||||| |||||||||| ||||| | |||| |||||||||    
T  21026695 ttgacgatgatgatgttccaaattattggactaatatgagaggttgt 21026649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 16368361 - 16368536
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | | ||||||| ||||  ||     
T  16368361 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----atgatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgttctaagatgctaagttgtt 16368455  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  16368456 gagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 16368536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 21534100 - 21534159
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21534100 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 21534159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 48520225 - 48520166
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48520225 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 48520166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16758803 - 16758520
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  ||| || |||||||  ||| |||||||||| |||| |||||  ||| || || ||||||  | ||||||    
T  16758803 tatatgcattacttgaattatatatgaatg-ttgtgatgttgttgtattgtatttgatattgttatatcatgaactggtt-tgcatactgcctatgttgc 16758706  T
Q  180 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagat 276  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||| ||||| || |||| ||||| || | || ||||||    
T  16758705 tgtttgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttga--aagatgat---gttccaaattattggatttttatacgaggtcgttgtttctaagat 16758611  T
Q  277 gttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    | | ||  || ||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  16758610 gctgagtcgttgagtccatgcatttgca-ttcattgtt-ggggcttgatgcccttgagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 16758520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Original strand, 21861538 - 21861714
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||  |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||  | ||||||||    
T  21861538 tatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttt-tgcatactgcctatgttgctg 21861636  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 262  Q
     |||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  21861637 tttgtttattagctaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggt 21861714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 20316347 - 20316288
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20316347 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgctctggg 20316288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 83 - 368
Target Start/End: Original strand, 41050004 - 41050285
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||| | |||||||  | ||||||    
T  41050004 tatatgcattacttgaattatatatgatg--ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactattt-tatatactgcctatgttgc 41050100  T
Q  180 tgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagat 276  Q
    |||| |||   ||||||||||||||||||||||||||| |||     | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || ||||||    
T  41050101 tgttcgtttagtaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aggatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagat 41050195  T
Q  277 gttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    | ||||  || ||||||||||||   || ||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| | |  | |||||||||||||||||||    
T  41050196 gctaagttgttgagtccatgcatactca-ttcattgttaggggcttgatgccctggaacctttgc-ccaccacgttgagggcttgatgccct 41050285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 22124175 - 22124116
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22124175 gttgggggcttgatgccgtggagcctttgctcaattaagttgagggcttgacgccctggg 22124116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 366
Target Start/End: Original strand, 50614114 - 50614364
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 209  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| | | |||||  | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  50614114 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttt-tatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 50614212  T
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||| |||     | ||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||  | || ||||||||||||  || ||||||||||||   ||||     
T  50614213 gtctaagatga-----aggatgttgttccaaattattggatttatatgagaggttggtgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcatt- 50614306  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  50614307 cattgttgagggcttgatgccctagagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgcc 50614364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 366
Target Start/End: Original strand, 50621942 - 50622192
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcg 209  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| | | |||||  | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  50621942 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttt-tatgtactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcg 50622040  T
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||| |||     | ||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||  | || ||||||||||||  || ||||||||||||   ||||     
T  50622041 gtctaagatga-----aggatgttgttccaaattattggatttatatgagaggttggtgtttctaagatgttaagttgttgagtccatgcatactcatt- 50622134  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  50622135 cattgttgagggcttgatgccctagagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgcc 50622192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 165 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 21161787 - 21161635
Alignment:
Q  165 atactgttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggtt 263  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| ||| || || |||    
T  21161787 atactgttttgttgctgtttgttgtttaactaagttgcatgagtcgatccaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggactatttacgaagtt 21161691  T
Q  264 gtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggctt 322  Q
    |    ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||    |||||||||||||    
T  21161690 g----tttaagatgtttaagatgtcaagtccatgcattagcatacatttgttgggggctt 21161635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 191 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26064982 - 26064808
Alignment:
Q  191 aactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcg 288  Q
    ||||||||||||||||| |||||| | |||  |||||||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||    | || ||||||||||||  || |    
T  26064982 aactaagctgcatgagttggtctatgatga--aagatgatg---ttccaaattattggatttatataagaggtcaatgtttctaagatgttaagttgttg 26064888  T
Q  289 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  26064887 agtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 26064808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 16758540 - 16758482
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16758540 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 16758482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 21714600 - 21714546
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21714600 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 21714546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 21753937 - 21753879
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21753937 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgggggcttgatgccctgg 21753879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 26064828 - 26064770
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26064828 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 26064770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 50614348 - 50614406
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50614348 gttgggggcttgatgccatggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 50614406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 50622176 - 50622234
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50622176 gttgggggcttgatgccatggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 50622234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20916182 - 20916126
Alignment:
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||    
T  20916182 ttaagaggttgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagc 20916126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 16368516 - 16368572
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16368516 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccct 16368572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 35261309 - 35261365
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  35261309 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccct 35261365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 288 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 47190550 - 47190469
Alignment:
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||| ||||  |  ||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  47190550 gagtccatgcattatcattaaa--gttgggggcttgatgacctggagcctttgctaaattaagttgagagattgatgccctggg 47190469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 33680896 - 33680838
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  33680896 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 33680838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 41050267 - 41050325
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| |||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41050267 gttgagggcttgatgccctagagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 41050325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 20918657 - 20918620
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20918657 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 20918620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14800419 - 14800359
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14800419 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttgagggtttgatgccctggg 14800359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14809293 - 14809233
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  14809293 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgctcaaataagttgagggtttgatgccctggg 14809233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 190 - 370
Target Start/End: Original strand, 21533948 - 21534120
Alignment:
Q  190 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcg 288  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||   |||||||| ||||| |||||||||| || |  | | |||||||| |||  ||||    
T  21533948 taactaagctgcatgagtcggtctaagatg--taagatgttga---tccaaattattggagttatataagatgtcgatgttctaagatgt-aagttgtcg 21534041  T
Q  289 agtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||| |||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  21534042 agttcatgcatactcatt-cat-gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 21534120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 21896487 - 21896543
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  21896487 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgggggcttgatgccct 21896543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 356
Target Start/End: Original strand, 52954556 - 52954600
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagg 356  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  52954556 gttggaggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagg 52954600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 20248170 - 20248113
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  20248170 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttg-gggcttgatgccctgg 20248113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 22124213 - 22124159
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||    
T  22124213 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaacacgttgggggcttgatgcc 22124159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 22237516 - 22237458
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22237516 gttggggtcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 22237458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 22922100 - 22922158
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22922100 gttgggggcttgatgccctggagctttaactcaattatgttgggggcttgatgccctgg 22922158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 52928202 - 52928258
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  52928202 gttggtggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccct 52928258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 23967644 - 23967586
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  23967644 gttgagggcttgatgccctggagcttttgctcaac-acgttgagggcttgatgccctggg 23967586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 177 - 232
Target Start/End: Original strand, 24783155 - 24783210
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga 232  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||| |  |||| |||||||||||||||    
T  24783155 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctgaataagatgattaagatgatga 24783210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 42912112 - 42912054
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  42912112 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctca-ttaagttgagggcttgatgccctgg 42912054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 327
Target Start/End: Original strand, 15860198 - 15860247
Alignment:
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  15860198 ttaagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 15860247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Original strand, 22354539 - 22354616
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 159  Q
    |||||| |||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  22354539 ttatatacattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtt 22354616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 29298019 - 29297957
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29298019 gttgagggcttgatgccctgggagcctttttatgctcaaataagttgagggcttgatgccctg 29297957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 42865273 - 42865330
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  42865273 tgttgctattgttatttaactatgttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 42865330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 431608 - 431576
Alignment:
Q  339 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  431608 tgctcaaataagttgagggcttgatgccctggg 431576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 21043511 - 21043571
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| | |||| |||||  || ||||||| |||||||||||||||||    
T  21043511 gttgggggcttgatgccctgtgagcttttgcaaaaataagttgggggcttgatgccctggg 21043571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 337 - 369
Target Start/End: Original strand, 24720814 - 24720846
Alignment:
Q  337 tttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24720814 tttgctctattaagttgagggcttgatgccctg 24720846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 42912033 - 42911974
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  42912033 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgagggcttgatgccctggg 42911974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 37970 - 37682
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37970 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 37871  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  37870 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 37771  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37770 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 37682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 136829 - 136543
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  136829 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgt 136730  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  136729 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttaag 136630  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136629 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 136543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 139298 - 139012
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  139298 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgt 139199  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  139198 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttaag 139099  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139098 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 139012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 144236 - 143950
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  144236 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgt 144137  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  144136 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttaag 144037  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144036 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 143950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 83 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 141767 - 141481
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  141767 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgt 141668  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  141667 tgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttaag 141568  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141567 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 141481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 134360 - 134072
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  134360 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtatttgtatactgttgtgttgctgt 134261  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  134260 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctatgttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttaag 134161  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134160 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccgtggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 134072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 110 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 132784 - 132554
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 207  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| || | ||||| || || || |||||  || |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  132784 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttgtatcatgatgattttgcatactacttatgttgctgtttgttatttatctaagctgcatgagt 132686  T
Q  208 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||     
T  132685 cggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgttaagatgatgtgtccatgcattagcatt- 132591  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  132590 cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 132554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 62260 - 62216
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 217  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  62260 tgttgctgtttgttgtttaactaagctgcatgagtcggtttaagt 62216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 83 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 13541 - 13256
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13541 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 13442  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13441 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 13342  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13341 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 13256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 40549 - 40261
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40549 tatatgcattacttgaattttatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatcctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 40450  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40449 tgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 40350  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40349 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 40261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14096 - 13808
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14096 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 13997  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  13996 tgttatttatctaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatattacg 13897  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13896 agatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 13808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Original strand, 158463 - 158752
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  158463 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 158562  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  158563 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgtttaa 158662  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  158663 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccttggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccttggg 158752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 89 - 338
Target Start/End: Original strand, 339924 - 340172
Alignment:
Q  89 cattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgtta 187  Q
    |||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| ||| ||||    
T  339924 cattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttg-atttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatactgcctatgttgttgt-gtta 340020  T
Q  188 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  340021 tttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgacgaagatgatgaagttcaaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggt 340120  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  340121 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 340172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 9899 - 9609
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaa-taattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9899 tatatgcattatttgaattatatgtgaaataattgagacgttgttgacttgcacttgatattattatgtcattctgtttttgtatactgttgtgttgctg 9800  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  9799 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtcccaaattattggattatataggaggttgtcgatttaagatgttta 9700  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9699 agaggtcgagtccatgcattattttttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 9609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 33095 - 32840
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  33095 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttaacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgct 32997  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
     ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  32996 attgttatttaattaagctgcatgagtcggtctaacttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtt 32897  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32896 taagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 32840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 38914 - 38659
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  38914 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgtttatttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgct 38816  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38815 attgttatttaattaagctgcatgactcggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtt 38716  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38715 taagagttctagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 38659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 245 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32465 - 32374
Alignment:
Q  245 ttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32465 ttggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagagatcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 32374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 12207 - 11924
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||    
T  12207 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttttagtatactgctgtgttgctgt 12108  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12107 t------taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaa 12014  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12013 gaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttggtggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgattccctggg 11924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 114 - 371
Target Start/End: Original strand, 44706 - 44965
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtc 212  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  44706 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcagtc 44805  T
Q  213 taagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44806 taagttgattaagatgatgaagttccaaagtattggattatataagaggttgtcgatttaatatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 44905  T
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44906 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttaatgccctggg 44965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 228
Target Start/End: Original strand, 26038 - 26179
Alignment:
Q  88 gcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgtt 186  Q
    ||||||||||||||||   |  ||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  26038 gcattacttgaattatgaatgtatacttgagacgttgttgaattacatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 26137  T
Q  187 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26138 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatg 26179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 202; Significance: 1e-110; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4364 - 4070
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  4364 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctggttttgtatactgctgtgtcgctg 4265  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4264 tcgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttta 4165  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |    |||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  4164 agaggtcgagtccatgcattagcattacattgttgggggcttgatgccctggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctgg 4070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 83 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 16933 - 16638
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  16933 tatatgcattacttgaattatatgtaaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgt 16834  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| ||||    
T  16833 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaagagttggtcgatttaagatgtttaa 16734  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |  |||| ||||||||||||| |||||||| |    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16733 gaggtcgagtccatgcattagcataataaagttgagggcttgatgccctgggagcctatttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctggg 16638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 114 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 116547 - 116283
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116547 ttgagatgttgttgacttgcatttgatatgattatgtcatgctgttt-tgtatactgttgtgtcgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtct 116449  T
Q  214 aagttgattaagatgatgaagttccaaa-ttgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  116448 aagttgattaagatgatgaagttccaaagtatttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 116349  T
Q  312 gttgggggcttgatgccc-gggagccttt----gctc-aattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||    |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  116348 gttgggggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataaagttgagggcttgatgccctggg 116283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Original strand, 129045 - 129221
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||  | |  | || |||||||| |||  ||    
T  129045 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaattcgatgtttctaagatgt-aagttgt 129138  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
     ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  129139 tgagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccatggagcctttgctcaattaagatgagggcttgatgccctgg 129221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 44492 - 44435
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44492 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctg 44435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 78368 - 78217
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| |  || ||||   ||||||||  ||||||| ||||||||||| |  | | ||||||| ||||  ||     
T  78368 ttaactaagctgcatgagtcggtccaagatgaat--gaagatgt--ttccaaatgattggatttatataagaggtcgatgttctaagatgctaagttgtt 78273  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  78272 gagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 78217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 78212 - 78156
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||||||||||||||||  | ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  78212 gttgggggcttgatgcctag-agctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctg 78156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 178; Significance: 7e-96; HSPs: 5)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 83 - 334
Target Start/End: Original strand, 85592 - 85845
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  85592 tatatgcattaattgaattatttgtgaataattcagacgttgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgtcgctg 85691  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  85692 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagaggttgttgatttaagatgttta 85791  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 334  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||    
T  85792 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgccctggag 85845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 501233 - 501003
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||||||||||    
T  501233 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatattgctgtgttgctgt 501134  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaaga------tgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  501133 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgttgattatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 501034  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  501033 gtttaagaggtcgagtctatgcattagcatt 501003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 121 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 160798 - 160584
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  160798 gttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 160701  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttgg-attatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    |||   |||||||| || ||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  160700 gat---gatgatgatgtcccaaattattggaattatttaagaggttgttgctttaagttgttaagaggttgcgtccatgcattagca-ttcattgttggg 160605  T
Q  318 ggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||||||||||||  |||||||    
T  160604 ggcttgatgcccttgagcctt 160584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 160574 - 160516
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  160574 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgggggcttgatgccctgg 160516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #5
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 497353 - 497294
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  497353 gttgggggcttgatgccttggagcctttgcttaattaagttgggggcttgatgccgtggg 497294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 174; Significance: 2e-93; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 83 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 82221 - 81978
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  82221 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactactgtgttgctgt 82122  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa-gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  82121 tgttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaaggttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgttta 82023  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatg 326  Q
    ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  82022 agaagtcgagtccatgcattagca-ttctttgttgggggcttgatg 81978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Original strand, 22669 - 22921
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22669 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgtctatgtcgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 22767  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    ||||||||   ||| |||||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||| | | |||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  22768 ctaagttg---aaggtgatgatgttccaaattattggacttgtataagaggttgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcat 22863  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    | |||||||||||||||||  ||||||| |||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  22864 t-ttgggggcttgatgcccttgagccttggctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 22921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 22901 - 22959
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  22901 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 22959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 255 - 12
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  255 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgatttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactattgtgttgctgt 156  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||    
T  155 tgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttcccaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaa 57  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    || |||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  56 gaagtcgagtccatgtattggca-ttctttgttgggggcttgatgc 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4661 - 4397
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  4661 ttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgct 4562  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt- 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  4561 gttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgttccaaattattggattatacaagaggttgtcgatttaagatgttt 4463  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4462 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttactcaa 4397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 12243 - 11979
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  12243 ttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgct 12144  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt- 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  12143 gttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgttccaaattattggattatacaagaggttgtcgatttaagatgttt 12045  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  12044 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttactcaa 11979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 22195 - 21931
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  22195 ttatacgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttatatactgcttgtgttgct 22096  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt- 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  22095 gttgttatttaactaagc-gcatgagtcggtctaagttgatgaaaatgattatgttccaaattattggattatacaagaggttgtcgatttaagatgttt 21997  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21996 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttactcaa 21931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 170; Significance: 4e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 82 - 345
Target Start/End: Original strand, 16567 - 16832
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgct 180  Q
    ||||| ||||||||||||||||   |  ||| |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  16567 ttatacgcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgctgttgacttccatttgatattattatgtcatgctgttttcgtatactgcttgtgttgct 16666  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16667 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaaattgatgaagatgatgatgtttcaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgttt 16766  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  16767 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctgaagcctttgctcaa 16832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 82 - 338
Target Start/End: Original strand, 3118 - 3375
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||    
T  3118 ttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatactgcctatgttgct 3216  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||    
T  3217 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgttt 3316  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3317 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 3375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 174 - 371
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15496
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaa 273  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15298 tgttgctattgttatttaactaagctgcatgagtcggtctacgttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataagagtttgtcgatttaa 15397  T
Q  274 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  15398 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgcttacttaagttgagggcttgatgccctggg 15496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 1351 - 1188
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  1351 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatt 1252  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||    
T  1251 aagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttcatgccctggagc 1188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 182 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 7319 - 7193
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  7319 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgttt 7220  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  7219 aagaggtcgagtccatgcattagcatt 7193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 19877 - 19936
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19877 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcatttaagttgagggcttgatgccctggg 19936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 160; Significance: 4e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1750
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| | |||||||    
T  2005 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgtctatgttgct 1906  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  1905 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 1806  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1805 aagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 83 - 334
Target Start/End: Original strand, 2141 - 2394
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||    
T  2141 tatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagacgttaattgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgttgtgtcgctg 2240  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||    
T  2241 ttgttatttaactaagctgcaagagtcggtctaagttgattaaaatgatgaagttctaaattattggattatataagaggttgtcggtttaaaatgttta 2340  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 334  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| |||||| ||||    
T  2341 agaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggctttatgccctggag 2394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 83 - 335
Target Start/End: Original strand, 17995 - 18250
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| || ||||||||||| ||||| ||||  || ||| ||  | ||||||||    
T  17995 tatatgcattacttgaattatatgtgaatatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatgttg-tgcataatgcatatgttgctg 18093  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattat-ataagaggttgtcgatttaagatgtt 279  Q
     |||||| |||||||||||||||||||| |||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  18094 attgttaattaactaagctgcatgagtcagtctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgaattaagatgtt 18193  T
Q  280 -aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  18194 taagaagtcgagtccatgcattatcatttcagtgttggggggttgatgccctggagc 18250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13365 - 13111
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||||||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  13365 ttatatgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 13266  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13265 gttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 13166  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  13165 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgtt-ggggcttgatgccctggagc 13111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 89 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 128897 - 128650
Alignment:
Q  89 cattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgttgttat 188  Q
    ||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |  | || ||||||| |||||||    
T  128897 cattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttttttttttttgttgcttttgttat 128798  T
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtc 287  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128797 ttaactaagttgcatgagttggtctaatttgattaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgatttaagatgtttaagaggtc 128698  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  128697 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 128650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 20392 - 20524
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  20392 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatactgatgtgttgctgt 20490  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 20524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 156; Significance: 9e-83; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 52067 - 51812
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | |||||||    
T  52067 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatattgcctatgttgct 51968  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||    
T  51967 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggtttttgttttaagatgttt 51868  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  51867 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 51812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 167948 - 168200
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| ||||    
T  167948 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 168047  T
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  168048 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaa 168147  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  168148 gaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 168200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 125621 - 125562
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  125621 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 125562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 38345 - 38404
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38345 gttgggggcttgatgccctggagcctatgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 38404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 125695 - 125642
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  125695 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-taagttgagggcttgatgcc 125642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 339 - 370
Target Start/End: Original strand, 38415 - 38446
Alignment:
Q  339 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38415 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 38446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 30081 - 29856
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30081 tatatgaattatttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttacacttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgttgtgttgctgt 29982  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt-gattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||| |||    
T  29981 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttcaattaagatgatgaagttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagatgttta 29882  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  29881 agaggtcgattccatgcattagcatt 29856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 154; Significance: 1e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 83 - 334
Target Start/End: Original strand, 161102 - 161355
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  161102 tatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcattatgtttttgtatactgctgtgtcgctg 161201  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  161202 ttgatatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttggttaagatgatgaagtttcaaattattggattatataagaggttgtcgatttaaaatgttta 161301  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 334  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||  | | |||||||||||||| ||||    
T  161302 agaagtcgagtccatgcattaacatttcagcgataggggcttgatgccctggag 161355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 83 - 153
Target Start/End: Original strand, 164603 - 164674
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcat 153  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  164603 tatatgcattaattgaattatttgtgaataattgagatgttgattgacttgcatttgatattattatgtcat 164674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 83 - 337
Target Start/End: Original strand, 1293 - 1547
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttg-ttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||  ||    
T  1293 tatatgcattaattgaattatatgtgaataattgagacgatgattgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactcatgtgttattg 1392  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tta 280  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||    
T  1393 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa---gatgaagttccaaattattggattatacaagagtttgtcaatttaagatgttta 1489  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc-gggagcct 337  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  1490 agaggtcgagtccatgcattagcattttaaagttgagggcttgatgccctgggagcct 1547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 151; Significance: 8e-80; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 338
Target Start/End: Original strand, 32925 - 33181
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  32925 ttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctgtgttgct 33022  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||    
T  33023 gttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgttt 33122  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33123 aagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 33181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 82 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 46080 - 45824
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  46080 ttatatgcattactcgaagtataa-tgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctgtgttgct 45983  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||| ||    
T  45982 gttgttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgttt 45883  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45882 aagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 45824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16267 - 16012
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |  ||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||  | ||||| |    
T  16267 ttatatgcattacttgagttatgaatgtatacttgagatgatgttggcttgcatttgatattatgatatcttgctgtttttgtatactgcctatgttgtt 16168  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16167 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttttcgaattaagatgttt 16068  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16067 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 16012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 173 - 338
Target Start/End: Original strand, 17388 - 17554
Alignment:
Q  173 gtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgattta 272  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17388 gtgttgctgttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgttcta 17487  T
Q  273 agatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    | ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  17488 aaatgtttaagaggttgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttaatgccctagagcctt 17554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 83 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 4843 - 4666
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  4843 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgctgtgttgctgt 4744  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagag 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  4743 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaggatgatgaggttccaaattattggattatataagag 4666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 10922 - 10692
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  10922 tatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttgtatactgctgtgttgctgt 10823  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg------aagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||      | |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||||||    
T  10822 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataacaatgttccaaattattggactatttaaaaggttgttgaattaagat 10723  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10722 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 10692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 9391 - 9161
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||    
T  9391 tatatgcattacttaaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgatgtttttatatactgttgtgttgctgt 9292  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatg------atgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      | || |||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || |||||||    
T  9291 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgttgataacgatgttccaaattattggactatttaaaaggttgttgaattaagat 9192  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9191 gtttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 9161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 329
Target Start/End: Original strand, 3159 - 3406
Alignment:
Q  88 gcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgtt 186  Q
    ||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  | |||||||||||||    
T  3159 gcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgaattacatttgatattattatatcatgctgtttttgtatactgcctatgttgctgttgtt 3258  T
Q  187 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag----ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat-gttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||    
T  3259 atttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatatttaa 3358  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 3406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 8500 - 8751
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||  | ||||||     
T  8500 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttg-atactgcctatgttgc- 8597  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  8598 --tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgaattaagatgttt 8695  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8696 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 8751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 141; Significance: 8e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 26045 - 25794
Alignment:
Q  86 atgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttg 184  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  | ||||||| |||    
T  26045 atgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattt-tgtatactgcctatgttgctattg 25947  T
Q  185 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt-taag 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  25946 ttatttaactaagcttcatgagtcggtctaagttgatgaagataatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtataag 25847  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  25846 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccctggagc 25794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 86 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40007 - 39756
Alignment:
Q  86 atgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttg 184  Q
    |||||||||||||| ||||  | |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||  | ||||||| |||    
T  40007 atgcattacttgaagtataattgaatatttgagatgttgtttacttgcatttgatattattatgtcatgatattt-tgtatactgcctatgttgctattg 39909  T
Q  185 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagtt-ccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aag 282  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | || |||    
T  39908 ttatttaactaagcttcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgtttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagttttttaag 39809  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  39808 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgataccctggagc 39756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 140; Significance: 3e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 3e-73
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 11437 - 11207
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  11437 tatatgcattacttgaatcatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgctgtgttgctgt 11338  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||      |||||| | |||||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  11337 tgttatttaactaagttgcatgagtcggtctaatttgattaagatgttgatgataatgttccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 11238  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11237 gtttaagaggtcgagtccatgcattaacatt 11207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Original strand, 17188 - 17442
Alignment:
Q  88 gcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttct--gtatactgt-tgtgttgctgttg 184  Q
    ||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||  | |||||||||||    
T  17188 gcattacttgaattatgaatgtatacttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttttgtatactgcctatgttgctgttg 17287  T
Q  185 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag----ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  17288 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgatgtttccaaattattggattatatgagaggttgtcgaattaagatgttt 17387  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggag 334  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17388 acgaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggag 17442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 83 - 216
Target Start/End: Original strand, 79297 - 79430
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  79297 tatatgcattacttgaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgaaattattatgtcatgctgtttttatatactgtcgtgttgctgt 79396  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  79397 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 79430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 1018 - 1270
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||  | ||||| ||||    
T  1018 tatgcattacttgaataatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctatttttgtatactgcctatgttgttgtt 1117  T
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  1118 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaa 1217  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1218 gaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 82 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 3624 - 3375
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | |||||||    
T  3624 ttatttgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgct 3525  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgt-t 279  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||| |    
T  3524 ttagttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgttgaattaagatgtct 3425  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  3424 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcatttttgggggctagatgccc 3375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 496 - 243
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||    |||| || ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||||| ||| |||||||||  | ||||  |    
T  496 ttatgtgcattacttgaagtataatcgaatatttaagatgttgttgacttccaattgatattattacgtcatgctattt-tgtatactgcctatgttatt 398  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||| ||    
T  397 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtcgataaagatgatgatgttccaaattattagactatataagagg-tgtcgaattaagatgttt 299  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  298 aagaggtcgagtccatgcattagcatttctttgttgggggcttgatgccctggagc 243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 4637 - 4579
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4637 gttgggggcttgatgccctggagcctttactcaa-taagttgagggcttgatgccctggg 4579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 4674 - 4617
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  4674 gttggggacttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 4617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 8)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28529 - 28312
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28529 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 28430  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    || |||||||||| |||||||| | ||||| | ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28429 atgaagatgatgatgttccaaactattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 28330  T
Q  318 ggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||| |||||    
T  28329 ggcttgatgccctggagc 28312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4605 - 4450
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg--t 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  4605 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagatgttt 4506  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4505 ttagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 4450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2050 - 1895
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg--t 278  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||| || | ||| ||  |    
T  2050 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgttgaatcaagttgttt 1951  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1950 taagaggtcgagtctatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 121 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11407 - 11252
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11407 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 11309  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaag 274  Q
    | | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11308 gttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaag 11252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #5
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 17147 - 17206
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17147 gttgggggcttgacgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 17206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 26296 - 26355
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26296 gttgggggcttgacgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 26355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 26222 - 26279
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  26222 gttgggggcttgatgccctggagtctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 26279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #8
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 26259 - 26316
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| |||||||| |||||||    
T  26259 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgacgccctgg 26316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39630 - 39376
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |    
T  39630 ttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgtt 39532  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga-agttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  39531 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgatctttccaaattattggattatataagaggttgtccaattaagatgtt 39432  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  39431 taagaggtcgagtccatgcattagcatttaattgtt-ggggcttgatgccctggagc 39376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Original strand, 75182 - 75436
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| |||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |    
T  75182 ttatgtgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt-tgtatactgcctatgttgtt 75280  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatga-agttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||   ||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  75281 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagacgatgatctttccaaattattggattatataagaggttgtccaattaagatgtt 75380  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  75381 taagaggtcgagtccatgcattagcatttaattgtt-ggggcttgatgccctggagc 75436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 306
Target Start/End: Original strand, 12262 - 12492
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  12262 tatatgcattacttgaattaaatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattttgtcatgctgtttttgtattctgctgtgttgctgt 12361  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaa------gatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      |||||||| || ||||||| ||||| ||| |||||||| || || |||||||    
T  12362 tgttatttaactaagctgcataagtcggtctaagttgattaagatgttgatgatgatgtaccaaattattggactatttaagaggtcgttgaattaagat 12461  T
Q  277 g-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12462 gtttaagaggtcgagtacatgcattagcatt 12492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 136; Significance: 8e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 82 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 40066 - 39812
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgct 180  Q
    |||| ||||||||||||| ||||    |||| || ||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | |||||||    
T  40066 ttatgtgcattacttgaagtataatcaaatatttaagatgttattgacatgcatttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatactgcctatgttgct 39968  T
Q  181 gttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  39967 attgttatttaattaagctgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgttt 39868  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  39867 aagaggtcgggtccatgcattagcatttcattgttggggacttgatgccctggagc 39812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 115 - 370
Target Start/End: Original strand, 19883 - 20136
Alignment:
Q  115 tgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcgg 210  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| | |||||||  | |||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  19883 tgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcatgaactgttt-tatatactgcctatgttgctgtttgtttattaattaagctgcatgagtcgg 19981  T
Q  211 tctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttc 308  Q
    |||||| |||  |||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || ||||| ||||||  || ||||||||||||    ||| |    
T  19982 tctaagatga--aagatgatg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagaggttaagttgttgagtccatgcatacttatt-c 20075  T
Q  309 attgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |  | |||||||||||||||||||||    
T  20076 attgttgggggcttgatgccctggagcctttactc-accatgttgagggcttgatgccctgg 20136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 82 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23036 - 22859
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctg 181  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  23036 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactggtgtgttgctg 22937  T
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataaga 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22936 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattattggattatataaga 22859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 82 - 329
Target Start/End: Original strand, 6088 - 6340
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg----ttgtgtt 177  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||     |  ||||    
T  6088 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatattatcatgtcatgctgtttttgtatactacctatgttgtt 6187  T
Q  178 gctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg 277  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6188 gttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaatttttggattatataagaggttgtcaaattaagatg 6287  T
Q  278 -ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6288 tttaagaggtcgagtctatgcattagcatttcattgttggaggcttgatgccc 6340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 121 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 8594 - 8386
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||   | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  8594 gttgttgacttgcaattgatattattatgtcatactgtttttgtatactacctatgttgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttg 8495  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaaga-tgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggg 318  Q
    || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  8494 atgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcga-ttaagatttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggg 8397  T
Q  319 gcttgatgccc 329  Q
    |||||||||||    
T  8396 gcttgatgccc 8386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 5)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 121827 - 121665
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaa 273  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  121827 tgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaa 121728  T
Q  274 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  121727 tatgtttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 121665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 87 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 174913 - 174665
Alignment:
Q  87 tgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-g 184  Q
    |||||||||||||||||   | ||| ||||||| |||||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||   ||||||||  | |||||||||| |    
T  174913 tgcattacttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaattgaatttgatataatcatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttg 174817  T
Q  185 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattata-taagaggttgtcgatttaagatg-ttaag 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||| | |||||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||| || |||||    
T  174816 ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagttgatgatgctccaaattattggactaaattaagaggttatcgaattaagttgtttaag 174717  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  174716 aggtcgagtccatgcattagca-ttcatagttgggggcttgatgccctggagc 174665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 226 - 370
Target Start/End: Original strand, 136491 - 136635
Alignment:
Q  226 atgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 323  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  136491 atgatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgaggtttctaagatgttgagttgtcgagtccatgcattcgcatt-cattgttgggggcttg 136589  T
Q  324 atgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||  ||||||| |||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  136590 atgccctagagccttcgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 136635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 136615 - 136673
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  136615 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 136673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 226 - 329
Target Start/End: Original strand, 145199 - 145303
Alignment:
Q  226 atgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttg 323  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || ||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  145199 atgatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgaggtttctaagatgttgagttgtcgagtccatgcattcgcatt-cattgttgggggcttg 145297  T
Q  324 atgccc 329  Q
    ||||||    
T  145298 atgccc 145303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 125; Significance: 3e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 121 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4964 - 4749
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg 219  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4964 gttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaatctgcatgagtcggtctaagttg 4865  T
Q  220 attaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
     | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4864 ttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaatttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttggg 4766  T
Q  318 ggcttgatgcccgggag 334  Q
    |||||||||||| ||||    
T  4765 ggcttgatgccctggag 4749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 38670 - 38916
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | |||| ||||||  ||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||| | ||||||||    
T  38670 tatacgcaatacttgaattatatataaatatttgagatattgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactgtctatgttgctg 38768  T
Q  182 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    || |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  38769 tttgttatttaactaaggtgcatgagtaggtctaagttgattaagatgatgaggttccaaattattggattatataagaggttttcgatttaagatgttt 38868  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  | | ||||||||||||    
T  38869 aagaagtcgagtccatgcattagcatttcagcgataggggcttgatgc 38916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Original strand, 4893 - 5055
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaa 273  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4893 tgttgctgttgttatttaactaagttgcatgagttggtctaagttgatgaagatgatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaa 4992  T
Q  274 gatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4993 gatgtttaagaggtcgagtccatgcattaacatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 5055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 82 - 159
Target Start/End: Original strand, 930 - 1006
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtt 159  Q
    |||| |||||||||||||||||   | |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  930 ttatgtgcattacttgaattatgattgaatatttgagattttgttgacttgca-ttgatattattatgccatgctgtt 1006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 179 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 172
Alignment:
Q  179 ctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg- 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  329 ctgttgttatttaactaagctgcatgaatcggtctaagttgatgaagataatgatgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgt 230  T
Q  278 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  229 ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagc 172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 182 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 34176 - 34028
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  34176 ttgttatttaactaagctgtatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgctt 34077  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34076 aagaggtcgagtctatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccc 34028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 82 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 13246 - 13158
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg 170  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  | |||| || ||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13246 ttatgtgcattacttgaagtataattgaatatttaagatgatgttgacttgcaattgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 13158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 2103 - 1851
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||| || | | |||| || ||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||||  | ||| ||||||    
T  2103 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgcaattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactgcctatgtcgctgtt 2004  T
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaa 281  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||    
T  2003 gttaattaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaa 1904  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1903 gaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 145 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 4803 - 4611
Alignment:
Q  145 ttatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag-ttccaaat 242  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| | ||||||||    
T  4803 ttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgtttccaaat 4704  T
Q  243 tgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    | |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4703 tattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttaggggcttgatgccctggagc 4611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 83 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 4446 - 4300
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgttgtgttgctgt 182  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||||||||||    
T  4446 tatatgcattacttgaattatatgtgattaattgagacgttgttgatttgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgtatactactgtgttgctgt 4347  T
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4346 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatga 4300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 112; Significance: 2e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32165 - 31966
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag 234  Q
    ||||||||||||||||||| |||||  || |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |    
T  32165 ttgatattattatgtcatgttgttt--gtttactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatg 32068  T
Q  235 ttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccggg 332  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  32067 ttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctgg 31969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 85 - 335
Target Start/End: Original strand, 10395 - 10646
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    |||||||||||||||  |||| |  ||| || ||| |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||    
T  10395 tatgcattacttgaagaatatttgtatacttaagatgttgttgaattgaaattgatattattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtt 10491  T
Q  184 -gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaag--atgtt 279  Q
     |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||   | ||    
T  10492 tgttaattaactatgctgcatgagtcggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagtcgtttt 10591  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10592 aagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 10646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 27717 - 28001
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||   | ||||| ||    
T  27717 tatatgcattactagaattatatgtgaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgctgttt-tgcatactacctatgttgttg 27815  T
Q  182 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| || | || ||||||||    
T  27816 tttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgt 27910  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27911 taagttgttgagtccatgcattcgcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 28001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 3539 - 3442
Alignment:
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcat 305  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  3539 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaagtcaagtccatgcattagcat 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 210 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 7603 - 7506
Alignment:
Q  210 gtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcat 305  Q
    |||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  7603 gtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaagtctagtccatgcattagcat 7506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 13596 - 13395
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag 234  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| |    
T  13596 ttgatattatcatgtcatgttgttt-tgtatactgcctatgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgttgaagttgatgatg 13498  T
Q  235 ttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaag--atgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 331  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13497 ttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagtcgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 13399  T
Q  332 gagc 335  Q
    ||||    
T  13398 gagc 13395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 11464 - 11666
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| || |    
T  11464 ttgatattattatgtcatgttgtttttgtatactacctatgttgttgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtttaagttgttgaagatgaagatg 11563  T
Q  235 ttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaag--atgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 331  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||   | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  11564 ttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagtcgttttaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 11662  T
Q  332 gagc 335  Q
    ||||    
T  11663 gagc 11666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 121 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 15776 - 15570
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||||||| || |||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15776 gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgtatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcacgagtcggtctaagtt 15678  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  15677 gattaagatgatgaagttccaaattattggattatacaaga-gttgtcgatttaagatgtttaagaattcgagtccatggattagca-ttctttgttggg 15580  T
Q  318 ggcttgatgc 327  Q
    ||||||||||    
T  15579 ggcttgatgc 15570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Original strand, 1102 - 1290
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgtt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| |||    
T  1102 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgtttataagaagtt 1201  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  1202 aagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 1290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 1270 - 1328
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || | ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1270 gttgggggcttgatgccctggagatttagatcaattatgttgggggcttgatgccctgg 1328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 99; Significance: 9e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 9e-49
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6664 - 6476
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgtt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| |||    
T  6664 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaagtt 6565  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||| ||||||    
T  6564 aagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgattccctgg 6476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 182 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 14044 - 13881
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgtt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| |||    
T  14044 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaagtt 13945  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13944 aagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 13881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 335
Target Start/End: Original strand, 15485 - 15686
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag 234  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||| |    
T  15485 ttgatattattatgtcatgttgttt-tgtatactgcctatgttgctcttgttatttaactaagctgcatgagtcagtctaagttgttgaagatgatgatg 15583  T
Q  235 ttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg--ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 331  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||| ||  |||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  15584 ttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatcaagttgttttaagaggtctagtccatgcattaaca-ttcattgttgggggcttgatgccctg 15682  T
Q  332 gagc 335  Q
    ||||    
T  15683 gagc 15686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 7352 - 7295
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  7352 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatttaagatgattaagatgatg 7295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 136 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 47093 - 46900
Alignment:
Q  136 ttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||   ||||| ||||  | ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||||||     
T  47093 ttgatattattatgtcatgctg---ctgtaaactgcctatgttgttgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgat 46997  T
Q  234 gttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46996 gttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgttcaagaggtcgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccc 46900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 16068 - 16352
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg 181  Q
    |||||||||||||||||||||||   |||  |||||| |||||||| || ||||||||||| |||| ||||| ||||| || |||||   | ||||| ||    
T  16068 tatatgcattacttgaattatataagaatgtttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactacctatgttgttg 16166  T
Q  182 tt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| || | || ||||||||    
T  16167 tttgtttattaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagatgatg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttctaagatgt 16261  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    | ||  || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16262 tgagttgttgagtccatgcattcgcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 16352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 189 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2707 - 2534
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || |||||||| |||  ||    
T  2707 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttgtaagatgt-aagttgt 2614  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
     ||||||||||||   |||| ||| ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2613 tgagtccatgcatactcatt-cat-gttggggacttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 2534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 85 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 4675 - 4412
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt 183  Q
    ||||||||||||||| ||||  | |||| || ||| |||||||| ||  |||||||||||| || || ||||| |  || ||||||  | || || ||||    
T  4675 tatgcattacttgaagtataaatgaatatttaagatgttgttgaattatatttgatattatgatatcttgctgctgttgcatactgcctatgctgttgtt 4576  T
Q  184 gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaa-------gttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagat 276  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||        ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||    
T  4575 gttatttaactaagttgcatgagtcggtctatataagaggttgattaagatgatgatgttccaaattattggattatatacgaggttgttg-tttaagat 4477  T
Q  277 gtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttg 340  Q
    ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4476 gtttaagaggttgagtccatgcattagcatttcattgttgggggattgatgccccggagcctttg 4412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 83 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8619 - 8361
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||  | ||||| ||    
T  8619 tatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttt-tgcatactgcctatgttgttg 8521  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgg-attatataagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||    ||||||||| ||||  |||||||||||||||| | || ||||| ||    
T  8520 tttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaagat---attccaaattattggttttatataagaggttgttgtttctaagaggt 8426  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    | ||  || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  8425 tgagtagttgagtccatgcattagca-ttcattgttggtggcttgatgccctggagcctttgctca 8361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6657 - 6428
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6657 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 6559  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    |||||||||| | |||||||| |||||||||| ||||| | |||||||||||||   || ||||| ||||||  || | ||||||||||||||| |||||    
T  6558 ctaagttgatgatgatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttttttataagaagttaagttgttgtgtccatgcattagca-ttcat 6461  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctc 343  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  6460 tgttgcgggcttgatgccctggagcctttgctc 6428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 8356 - 8298
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  8356 gttgggggcttgatgctctggagctttagcttaactaagttgagggcttgatgccctgg 8298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 121 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 21026 - 20815
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| || ||| ||  | |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||     
T  21026 gttgttgaattgcaattgatattattatgtcatgttgtttttgcatattgcctatgttgctgattgttaattaactaagctttatgagtcggtctaagtc 20927  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20926 gttgaagatgttgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaagtcgagtccatgcattaggatttcattgttgg 20827  T
Q  317 gggcttgatgcc 328  Q
    ||| ||||||||    
T  20826 gggattgatgcc 20815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19386 - 19131
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19386 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 19288  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 309  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||||  ||   ||||||||||||||| ||||    
T  19287 ctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgtttataagaagttaagttgttatgtccatgcattagca-ttca 19192  T
Q  310 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||  | || | ||||||||||||||||    
T  19191 ttgttgggggcttgatgccttggagcctttgctcaaccacgtcgggggcttgatgccctgg 19131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 315 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 19148 - 19093
Alignment:
Q  315 gggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||  ||| ||||||||||||||||    
T  19148 gggggcttgatgccctggagctttagctcaattatattgggggcttgatgccctgg 19093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 4)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Original strand, 15845 - 16033
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgtt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | || ||||| |||    
T  15845 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgcttataagaagtt 15944  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||  || | ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  15945 aagttgttgtgtctatgcattagca-ttcattgttgggggtttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 16033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 142509 - 142450
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  142509 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccttggg 142450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 178952 - 178898
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  178952 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagtcgatcaagatgatg 178898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 16013 - 16071
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  16013 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactatgttgggggcttgatgccctgg 16071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Original strand, 14696 - 14951
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||| || || | | |||||  | |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  14696 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgattttct-tactgcctatgttgctgtttgttagttaactaagctgcatgagtcggt 14794  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 309  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || | ||||| ||||||  || | ||||||||||||||||| ||    
T  14795 ctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggatatatttaagaggttgttgaatataagaagttaagttgttgtgtccatgcattagcatt-ca 14890  T
Q  310 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  14891 ttgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaccacgttgggggcttgatgccctgg 14951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 14931 - 14989
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||  || |||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  14931 gttgggggcttgatgccctggagatttagctcaaatatgttgggggcttgatgccctgg 14989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Original strand, 10540 - 10794
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  10540 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcataagtcggt 10638  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    |||||||||   ||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||| || | ||||||||||| ||||| |||    
T  10639 ctaagttga---agatggtgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttgttaagatgttgtgtccatgcatttgcatt-cat 10734  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
     |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  10735 cgttgggggcttgatgccttggagctttagctcaattaggttgggggcttgatgccctgg 10794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 90; Significance: 2e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 208 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 32188 - 32059
Alignment:
Q  208 cggtctaagttgattaagatgatgaa-gttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccatgcattagcat 305  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  32188 cggtctaagttgatgaagatgatgattgttccaaattattggattatataagaggttgtcgaattaagatgtttaagaggtcaagtccatgcattagcat 32089  T
Q  306 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32088 ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 32059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11617 - 11370
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | ||||||||    
T  11617 tatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttt-tgcatactgcctatgttgctg 11519  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  11518 attgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgatttaagatgtt 11419  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||    
T  11418 taagaagtcgagtccatgcattatcatttcagcgataggggcttgatgc 11370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 182 - 344
Target Start/End: Original strand, 2713 - 2870
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaa 281  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  2713 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagaggttgttgttttaagaagttaa 2808  T
Q  282 gaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    |  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2809 gttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 2870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Original strand, 2875 - 2932
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2875 gttgggggcttgatgccctcgagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctg 2932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 83 - 327
Target Start/End: Original strand, 38224 - 38471
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||| |||| | |  ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||  | ||||||||    
T  38224 tatatgcattacttgaattatatgtgattatttgagatgttgtttacttacgtgcgatattattatatcatgatgttt-tgcatactgcctatgttgctg 38322  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-t 278  Q
     |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||| | | |||||| ||| |||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |    
T  38323 attgttaattaactaagctgcatgagtcaatctaagtcgttgaagatgttgatgttccaaattattggactattataagaggttgtcgatttaagatgtt 38422  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgc 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||  | | ||||||||||||    
T  38423 taagaagtcgagtccatgcattatcatttcagcgataggggcttgatgc 38471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 182 - 335
Target Start/End: Original strand, 5196 - 5350
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||| || ||    
T  5196 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgacgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaattaagttgttt 5295  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  5296 aagaggtcgagtccatgcattaaca-ttcatagttgggggcttgatgccctggagc 5350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 199 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 27913 - 27771
Alignment:
Q  199 tgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaag--ttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgtt-aagaggtcgagtccat 295  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||| |||| |||||||||||    
T  27913 tgcatgagtcggtctaagtttatgaagatgatgatggtttccaaattattggattatataagaggttgttgttctaagatgtttaagaagtcgagtccat 27814  T
Q  296 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27813 gcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 27771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 82 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 27984 - 27911
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 155  Q
    ||||||||||||||||||||||   |  ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27984 ttatatgcattacttgaattatgaatgtatatttgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgc 27911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 174 - 344
Target Start/End: Original strand, 23942 - 24110
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||   |||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | | |    
T  23942 tgttgctgtttgttatttaactaagctacatgagtcggtctaagttg---aagatgatgatgttccaaattattggacttatataagaggttgttgttct 24038  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  24039 aagttgttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggattgatgccctggagcctttgctca 24110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 24115 - 24173
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24115 gttgggggcttgatgccttggagctttagctcaattacgttgagggcttgatgccctgg 24173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 3)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Original strand, 2805 - 3056
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| || || || ||||||  | ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2805 ttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgtagctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggt 2903  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcatt 311  Q
    ||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| |||||||| |  | ||||||||||||||| ||||||    
T  2904 ctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgttaagatgatgtgtccatgcattagca-ttcatt 2998  T
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  2999 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 3056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 344
Target Start/End: Original strand, 3280 - 3333
Alignment:
Q  290 gtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3280 gtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 3333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 3036 - 3090
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||    
T  3036 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgcc 3090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 189 - 335
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1271
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatta-tataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||| || | |||||||||||||| ||||| || |||||||||    
T  1124 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggactattttaagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggt 1223  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1224 cgagtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagc 1271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 84; Significance: 8e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 182 - 338
Target Start/End: Original strand, 45860 - 46013
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |||| |||||    
T  45860 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttctaagttgtta 45956  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  45957 agatgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctt 46013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 46023 - 46081
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46023 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 46081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 174 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 30392 - 30199
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-t 271  Q
    ||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || |    
T  30392 tgttgctgttgtatattaattaaactgcatgagtcggtctaagatga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttct 30298  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||| ||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30297 aagttgt-aagacgtcaagtccatgcattagcattacattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 30199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 251 - 1
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | ||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||    
T  251 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgttgtttgttgtttaactaagctgcatgaatcggt 153  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 309  Q
    ||||||||||   |||||||| |||||||||| |||||| ||  ||||||||||| |||| ||||| ||||||  || | ||||||||||||||||| ||    
T  152 ctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggatatacttaagaggttgttgattataagaagttaagttgttgtgtccatgcattagcatt-ca 57  T
Q  310 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgc 365  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| |||||||||||    
T  56 ttgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaccacgttgggggcttgatgc 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32657 - 32403
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||  | |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  32657 ttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactgcctatgttgctgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggt 32560  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 309  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||| || | || ||||| ||| ||  || ||||||||||||||||| ||||    
T  32559 ctaagttga--aagatgatgatgttccaaattattgaatttatataagaggtcgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcattagca-ttca 32463  T
Q  310 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| || |  | |||| ||||||||||||||||    
T  32462 ttgttgggggcttgatgccctggagcctttgttc-accacgttgggggcttgatgccctgg 32403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32423 - 32365
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32423 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 32365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 216
Target Start/End: Original strand, 51957 - 51985
Alignment:
Q  188 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  51957 tttaactaagctgcatgagtcggtctaag 51985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 114 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 10649 - 10394
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | ||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  10649 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaaaaaagctgcatgagtcggt 10551  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat-tatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttca 309  Q
    |||||||||  |||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||  || | ||||||| ||||||||| ||    
T  10550 ctaagttga--aagatgat-atgttccaaattattggatatatataagaggttgttgtttataagaggttaagttgttgtgtccatggattagcatt-ca 10455  T
Q  310 ttgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||||    
T  10454 ttgttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagtacttgatgccctgg 10394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 32224 - 31969
Alignment:
Q  110 ataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagt 207  Q
    ||||||||||||||| ||| || |||| |||||| |||| ||||| || || || |||||  || ||||| |||| |||||||| |||||||||||||||    
T  32224 ataattgagacgttgatga-ttacattcgatattgttatatcatgatgattttgcatactacttatgttgttgtttgttatttatctaagctgcatgagt 32126  T
Q  208 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcattt 307  Q
    ||||||||| ||||   |||||||| |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| | |||||| |||||||| |  | |||||||||||||||||     
T  32125 cggtctaagatgat---gatgatgatgttccaaattattggact-tataagatgatgttgttttaagttgttaagatgatgtgtccatgcattagcatt- 32031  T
Q  308 cattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  32030 cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 31969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 31989 - 31931
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31989 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 31931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 77; Significance: 1e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 174 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 51644 - 51481
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | || ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||    
T  51644 tgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaaaatgatgatgttccaaattattggactaatataagaggttgtcgaatt 51545  T
Q  272 aagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||| |||||    
T  51544 aagttgtttaagaggtcgagtccatgcatgagca-ttcttagttgggggcttaatgccctggagc 51481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Original strand, 63273 - 63330
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  63273 tgttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgagggcttgatgccctg 63330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 76; Significance: 5e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 208 - 329
Target Start/End: Original strand, 2494 - 2616
Alignment:
Q  208 cggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-ttaagaggtcgagtccatgcattagcat 305  Q
    |||||||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||     
T  2494 cggtctaagttgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggttgtcgaattaagttgtttaagaggtcgagtccatgcattagca- 2592  T
Q  306 ttcattgttgggggcttgatgccc 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2593 ttcattgttgggggcttgatgccc 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12819 - 12631
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgat-ttaagatgtt 279  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||||| | |  ||||| |||    
T  12819 ttgttatttagctaagctgcatgagtcggtctaagttgatgattatgatgatgttccaaatgattggacttatataagaggttgttgttaataagaagtt 12720  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||  || | |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  12719 aagttgttgtgtccatgcattatca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 12631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12651 - 12593
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12651 gttgggggcttgatgccctggagctttatctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 12593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 182 - 306
Target Start/End: Original strand, 1137 - 1263
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatg-tt 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| || || |||||||| ||    
T  1137 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatgttgaagatgatgatgttccaaattattggattaatataagaggtcgttgaattaagatgttt 1236  T
Q  280 aagaggtcgagtccatgcattagcatt 306  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1237 aagaggtcaagtccatgcattagcatt 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 134 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 1134 - 928
Alignment:
Q  134 atttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||     
T  1134 atttgatattgttatatcatgctgttt-tgcatactgcctatgttgctgtttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga--aagaagat- 1039  T
Q  232 aagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccg 330  Q
      |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| || | |||| ||  || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  1038 --gttccaaattattggacttatataagaggttgttgatctatgttgttgagttgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgctct 942  T
Q  331 ggagcctttgctca 344  Q
    ||||||||||||||    
T  941 ggagcctttgctca 928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 923 - 865
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  923 gttgggggcttgatgcccttgagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 16395 - 16181
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgttg-ttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||  | ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16395 gttgatgaattgaatttgatataattatgtcatgctgtt---gtatactgcctatgttgctgtttcttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagat 16299  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgt-taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgg 316  Q
    | | |||||||||| |||||||||| || || | || |||||||||||||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16298 gttgaagatgatgatgttccaaattattagactaatgtaagaggttgtcgaattaagttgtctaagagatcgagtccatgcaatagca-ttcatagttgg 16200  T
Q  317 gggcttgatgcccgggagc 335  Q
    | ||||||| ||| |||||    
T  16199 gcgcttgataccctggagc 16181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 121 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 13054 - 12833
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagtt 218  Q
    |||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || ||||||  | ||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  13054 gttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatt-tgcatactgcctatgttgttgtttgttatttaactgagcagcatgagtcggtctaagtt 12956  T
Q  219 gattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttggg 317  Q
    ||   ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||||| | | |||| |||||||  || |  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12955 ga---agatgatgatgttcaaaattattggacttatataagaggttgttgttctaagttgttaagttgttgtttccatgcattagcatt-cattgttggg 12860  T
Q  318 ggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||    
T  12859 ggcttcatgccctggagcctttgctca 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12828 - 12770
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| |||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  12828 gttgcgggcttgatgccctagagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 12770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 288 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6546 - 6463
Alignment:
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6546 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaattaagttgaaggcttgatgccctggg 6463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 6478 - 6420
Alignment:
Q  318 ggcttgatgccc-gggagccttt----gctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||| ||||||||||    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6478 ggcttgatgccctgggagcctttttacgctcaaataagttgagggcttgatgccctggg 6420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 183 - 344
Target Start/End: Original strand, 28839 - 28995
Alignment:
Q  183 tgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatttaagatgttaag 282  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||||||| ||||| | || |||| | ||| | | |||| |||||||    
T  28839 tgttgtttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgat---gatgatgatgttccaaattattggact-taaaagatgatgttgttctaagttgttaag 28934  T
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    | || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28935 atgttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 28995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 29000 - 29058
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  29000 gttggaggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 29058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 71; Significance: 5e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Original strand, 53517 - 53800
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||||  | ||||||||    
T  53517 tatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttgttt-tgcatactgcctatgttgctg 53615  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
     |||||  ||||||||||||||||| || ||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | || |||||||     
T  53616 tttgtttattaactaagctgcatgaatcagtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgtttataagatga 53710  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    | ||  || |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  53711 tgagttgttgagtccatgcattcaca-ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 53800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 53780 - 53838
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  53780 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaaccaagttgagggcttgatgccctgg 53838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 83 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 12720 - 12463
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg-ttgtgttgctg 181  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| | | || |||||| |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||  | ||||||||    
T  12720 tatatacattact-gaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttt-tgcatactgcctatgttgctg 12623  T
Q  182 -ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgt 278  Q
     |||||  ||||||||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||    
T  12622 tttgtttattaactaagctacatgagtcggtctaagatga--aagaagat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatgt 12528  T
Q  279 taagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||  || ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12527 taagttgttgagtccatgcattcgcattt-atcgttgggggcttgatgccctggagcatttgctca 12463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 313 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12457 - 12400
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||  |||| || ||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12457 ttgggggcttgatgccctagagctttagcctaattatgttgagggcttgatgccctgg 12400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 114 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 5765 - 5538
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||||||| ||||||| |||||| |||| ||||| || || |  ||||||  | |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5765 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttc-atactgcctatgttgctgtttgttattttactaagctgcatgagtcggt 5667  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggattatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    ||||||||||   ||| || | |||||||||| ||||||| ||||||||||||| | || || || ||||||  || | ||||||||||||||| | |||    
T  5666 ctaagttgat---gataatcatgttccaaattattggatt-tataagaggttgttgtttatatgaagttaagttgttgtgtccatgcattagca-tccat 5572  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5571 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctca 5538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 182 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1135 - 955
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgtta 280  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   | ||||| |||     
T  1135 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagaagat---gttccaaattattggatttatataagagattgt---tctaagaggttg 1042  T
Q  281 agaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||  || | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  1041 agttgttgtgtccatgaattagca-ttcattgttgggggcttgatgccctggag-ctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 975 - 917
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  975 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 7)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 130027 - 129805
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgt-tgttatttaactaagctgcatgagtcggt 211  Q
    |||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| || || || ||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  130027 ttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatgttgctgtgtgttatttaactaagatgcatgagtcggt 129929  T
Q  212 ctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcat 310  Q
    ||||||||||   ||||| || ||||||||||  |||| |||| ||||||||||| | |  ||| |||||||| || | ||||||||||||||| |||||    
T  129928 ctaagttgat---gatgaagatgttccaaattaatggacttatttaagaggttgttgttccaagttgttaagatgttgtgtccatgcattagca-ttcat 129833  T
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||||    
T  129832 tgttgcaggcttgatgccctggagcctt 129805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 83 - 262
Target Start/End: Original strand, 60683 - 60860
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcat--gctgtttctgtatactg-ttgtgttgc 179  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||| ||||| ||||||||  ||| ||||  ||||||| |||||||||  | ||||||    
T  60683 tatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttgatttgca-ttgatattggtatatcatgagctgttt-tgtatactgcctatgttgc 60780  T
Q  180 tg-ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggt 262  Q
    || |||||  ||||||||||||||||||||||| |||| |||  ||||||||   |||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  60781 tgtttgtttattaactaagctgcatgagtcggtttaagatga--aagatgat---gttccaaattattggatttatataagaggt 60860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 370
Target Start/End: Original strand, 117814 - 117877
Alignment:
Q  306 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  117814 ttcattgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaa-tacgttgagggcttgatgccctgg 117877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 6906 - 6844
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggtg 373  Q
    |||||||||||||||||| | |||  ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6906 gttgggggcttgatgccctgtgagattttgctcaaataagttaagggcttgatgccctgggtg 6844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #5
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 129795 - 129737
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  129795 gttggggtcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 129737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 117857 - 117913
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  117857 gttgagggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgataccct 117913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 314 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 536 - 481
Alignment:
Q  314 tgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  536 tgggggcttgatgccctgtgagattttgctcaaataagttgagggcttgatgccct 481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 83 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 106437 - 106157
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| | | |||||  | ||||||    
T  106437 tatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttt-tatgtactgcctatgttgc 106340  T
Q  180 tgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagat 276  Q
    ||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || ||||||    
T  106339 tgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagat 106245  T
Q  277 gttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    ||||||  || ||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  106244 gttaagttgttgagtccatgcatactcatt-cat-gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 106157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 96896 - 96842
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  96896 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 96842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 83 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 97159 - 96876
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    |||||||||||| |||||||||| | | |  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||| |||||  |||||| | | |||||  | ||||||    
T  97159 tatatgcattacatgaattatatatga-tgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgaactgttt-tatgtactgcctatgttgc 97062  T
Q  180 tgttgttat-ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagat 276  Q
    ||||  | | ||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||| ||   ||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | || ||||||    
T  97061 tgtttatttattaactaagctgcatgagtgggtctaagatga--aagatgttg---ttccaaattattggatttatataagaggtcgatgtttctaagat 96967  T
Q  277 gttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||  || ||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  96966 gttaagttgttgagtccatgcatactcatt-cat-gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 96876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 6874 - 6718
Alignment:
Q  174 tgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgattt 271  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||         ||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | | |    
T  6874 tgttgctgtttgttatttaactgagctgcatgagtcggtctaag---------atgatgatgttccaaattattggacttatttaagaggttgttgttct 6784  T
Q  272 aagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctt 338  Q
    ||| ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6783 aagttgttaagaggttgtgtccatgcattagca-ttcattgttgggggcttgatgccatggagcctt 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 6708 - 6650
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  6708 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 6650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 8137 - 8091
Alignment:
Q  114 ttgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 160  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  8137 ttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcatgctgttt 8091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 79 - 344
Target Start/End: Original strand, 8023 - 8286
Alignment:
Q  79 attttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtg 175  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| | |||  || ||| |||||||| || |||||||||||||||| |||||  ||| || || ||||||  | ||    
T  8023 attttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatt-tgcatactgcctatg 8121  T
Q  176 ttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaa 273  Q
     |||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||  |||| ||||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| |||    
T  8122 ctgctatttgttatttaattaagctgcatgcgtcggtctatgatga--aagaagatg---ttccaaattattggatttatataagaggttgttgatctaa 8216  T
Q  274 gatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    | |||| |   || | ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  8217 gttgttgacttgttgtgtccatgcattagcatt-cattgttgggggattgatgccctggagcctttgctca 8286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 8291 - 8349
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8291 gttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 8349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 121 - 370
Target Start/End: Original strand, 8078 - 8324
Alignment:
Q  121 gttgttgacttgcatttgatattattatgtcatg--ctgtttctgtatactgt-tgtgttgctgtt-gttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    |||||||| ||| |||||||||| |||| |||||  ||| || |||||||||  | |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8078 gttgttgatttgtatttgatattgttatatcatgaactggtt-tgtatactgcctatgttgctgtttgtttgttaactaagctgcatgagtcggtctaag 8176  T
Q  217 ttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttg 315  Q
    ||||  ||||||||   |||||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||||| ||||  |  ||||||||||||| |||  |||| || |    
T  8177 ttga--aagatgat---gttccaaattattggatttatttaagaggttgatgatttaagatgctaagttgatgagtccatgcatttgca-ctcatagtgg 8270  T
Q  316 ggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |  | |||| ||||||||||||||||    
T  8271 ggggcttgatgccctggagcctttgctc-accacgttgggggcttgatgccctgg 8324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 8304 - 8362
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8304 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 8362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 217
Target Start/End: Original strand, 24269 - 24406
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgt-ttctgtatactgt-tgtgttgc 179  Q
    |||| |||||||||||||  |||| | |||| || ||| |||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||  | ||||||    
T  24269 ttatgtgcattacttgaagaatatttgaatatttaagatgttgatgaattgcaattgatatttttatgtcatgctgtgttttgtatactgcctatgttgc 24368  T
Q  180 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24369 tgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagt 24406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 82 - 170
Target Start/End: Original strand, 3497 - 3585
Alignment:
Q  82 ttatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg 170  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3497 ttatacgcattacttgaattatgagtgtataattgagatgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttttgtatactg 3585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 343 - 289
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  343 tgcttttgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 182 - 250
Target Start/End: Original strand, 6191 - 6259
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggat 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  6191 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgatgttccaaattattggat 6259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 83 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 13157 - 13092
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 148  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13157 tatatgcattacttcaattatatgtgaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattat 13092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0914
Description:

Target: scaffold0914; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 1591 - 1532
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1591 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 1532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0914; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1628 - 1571
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  1628 gttgggggcttgatgccctggagtctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 1571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 55912 - 55971
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55912 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 55971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 55874 - 55932
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  55874 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 55932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 4925 - 4983
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4925 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 4983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 4887 - 4945
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  4887 tgttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaa-aacgttgggggcttgatgccctgg 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 311 - 369
Target Start/End: Original strand, 206716 - 206774
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  206716 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 206774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 214
Target Start/End: Original strand, 206584 - 206624
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtcta 214  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  206584 tgttgctgttgtttattaactaagctgcatgagtcgatcta 206624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 163 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 12035 - 11982
Alignment:
Q  163 gtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12035 gtatactgttgtgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaag 11982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12082 - 12039
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  12082 tatatgcattgcttgaattatatgtgaataattgaggcgttgtt 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 234 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 225455 - 225344
Alignment:
Q  234 gttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgg 331  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | || ||||| ||| ||  || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |    
T  225455 gttccaaattattggatttatataagaggttgttgtttctaagaggttgagttgttgagtccatgcattagcatt-cattgttgggggcttgatgccctg 225357  T
Q  332 gagcctttgctca 344  Q
    |||||||||||||    
T  225356 gagcctttgctca 225344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 83 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 225559 - 225483
Alignment:
Q  83 tatatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgttt 160  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  225559 tatatgcattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattattatatcacgctgttt 225483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 371
Target Start/End: Original strand, 221388 - 221420
Alignment:
Q  339 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  221388 tgctcatttaagttgagggcttgatgccctggg 221420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 12476 - 12417
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476 tgttgggggcttgatgctctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 12417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 2567 - 2509
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2567 gttgggggcttgatgccccggagcctttgctcaattaagttaagggcttgatgccctgg 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 10247 - 10185
Alignment:
Q  283 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaa 345  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  10247 aggtcgagtccatgcattagcatttcattgtttgggccttgatgccctggagcctttgctcaa 10185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 22170 - 22113
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22170 gttgggggcttgatgtcctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 22113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Original strand, 14349 - 14406
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14349 gttgggggcttgatgtcctggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 14406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0347 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0347
Description:

Target: scaffold0347; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 311 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 8781 - 8721
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  8781 tgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaattaagttgtgggcttgatgccatggg 8721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 57708 - 57652
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  57708 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcagttaagttgagggcttgatgccct 57652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 57745 - 57688
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  57745 gttgggggcttaatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 57688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Original strand, 103706 - 103857
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgat-ttaagatgttaagaggt 286  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||| ||||| ||||||||||||| || | |  ||||||||||||  ||    
T  103706 ttaactaagctgcattagtcggtctaagttga--aagaggat---gttccaaattattggatttatataagaggtcgttgttgctaagatgttaagttgt 103800  T
Q  287 cgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
     ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  103801 tgagtccatgcatactca-ttcattgttgggggcttgatgccatggagcctttgctca 103857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 370
Target Start/End: Original strand, 103861 - 103920
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  103861 tgttgggggcttgatgccctagagctttagctcaattatgttgagggcttgatgccctgg 103920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 102086 - 102145
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  102086 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgagggcttgatgccctggg 102145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 17394 - 17335
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17394 gttgggggcttgatgccctgaagcctttggtcaattaagttgagggcttgatgccctggg 17335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 17431 - 17375
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||    
T  17431 gttgggggcttgatgccctagagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctg 17375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 190 - 370
Target Start/End: Original strand, 1874 - 2049
Alignment:
Q  190 taactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttgga-ttatataagaggttgtcgatt-taagatgttaagaggtc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||     | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| ||   || ||||||||||||  ||     
T  1874 taactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----aggatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgttttttctaagatgttaagttgtt 1968  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||    || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |  | ||| |||||||||||||||||    
T  1969 gagtccatgcacactca-ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctgtgctc-accacgttaagggcttgatgccctgg 2049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 370
Target Start/End: Original strand, 2034 - 2087
Alignment:
Q  317 gggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2034 gggcttgatgccctggagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 2087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 314 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2791
Alignment:
Q  314 tgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2845 tgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggcttgatgccct 2791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 306 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 38326 - 38263
Alignment:
Q  306 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||    
T  38326 ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-tacgttgggggcttgatgccctgg 38263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 182 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20029 - 19980
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  20029 ttgttatttaatcaagctgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 19980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 24998 - 24942
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24998 gttgggggcttgatgccctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgccct 24942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 189 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 25152 - 24978
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtc 287  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||   |||||| || ||||||| |||  |||||| |  | | |||||||| |||  ||     
T  25152 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttga--aagaggttg---ttccaatttattggatttataatagaggtcgatgttctaagatgt-aagttgtt 25059  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||||    
T  25058 gagtccatgcatactcatt-cattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgccctgg 24978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1539
Description:

Target: scaffold1539; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 770
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  828 ttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaaataagttgagggattgatgctctggg 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1539; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 866 - 809
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||  |  ||| ||||||||||||||||    
T  866 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cactttgggggcttgatgccctgg 809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1283 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1283
Description:

Target: scaffold1283; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Original strand, 1603 - 1660
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1603 gttgagggcttgatgccctggagcctttgctcaa-taagttgagggcttgatgccctgg 1660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23897 - 23843
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23897 tgctattgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 23843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 285 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 20957 - 20907
Alignment:
Q  285 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagc 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  20957 gtcgagtccatgcattagcatttcattgttggggccttgatgccctggagc 20907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 313 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 332208 - 332150
Alignment:
Q  313 ttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  332208 ttgggggcttgatgccctggagacttagctcaattaagttcagggcttgatgccctggg 332150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 69848 - 69794
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  69848 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataagatgatcaagatgatg 69794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 182 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 36503 - 36454
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36503 ttgttatttaaccaagctgcatgagtcggtctaagttgatcaagatgatg 36454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000009; HSPs: 3)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Original strand, 10365 - 10422
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10365 gttgggggcttgatgctctggagccttttctcaaataagttgagggcttgatgccctg 10422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 369
Target Start/End: Complemental strand, 36108 - 36052
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctg 369  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  36108 gttgagggcttgatgcccttgagcctttgctcaa-cacgttgagggcttgatgccctg 36052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 36071 - 36011
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  36071 gttgagggcttgatgccctgtgagctttttctcaaataagttgagggcttgattccctggg 36011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 189 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 596 - 446
Alignment:
Q  189 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatgaagttccaaattgttggatt-atataagaggttgtcgatttaagatgttaagaggtc 287  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||     || |||| |||||||||| ||||||| ||||||||||| |  | | ||||||| ||||  ||     
T  596 ttaactaagctgcatgagtcggtctaagatga-----attatgatgttccaaattattggatttatataagaggtcgatgttctaagatgctaagttgtt 502  T
Q  288 gagtccatgcattagcatttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctca 344  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  501 gagtccatgcatactcatt-cattgttgggggctttgtgccctggagccttttctca 446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 441 - 383
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| || | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  441 gttgggggcttggtgccctggagctttagatcaactaagttgagggcttgattccctgg 383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0601 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0601
Description:

Target: scaffold0601; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 312 - 360
Target Start/End: Original strand, 7854 - 7902
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggctt 360  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7854 gttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaatttagttgagggctt 7902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 4)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 6459 - 6513
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  6459 gttgggggcttgatgctctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgcc 6513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Original strand, 13913 - 13967
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  13913 gttgggggcttgatgctctggagctttagctcaattaagttgagggcttgatgcc 13967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 370
Target Start/End: Original strand, 6416 - 6479
Alignment:
Q  306 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||    
T  6416 ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgctctgg 6479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 306 - 370
Target Start/End: Original strand, 13870 - 13933
Alignment:
Q  306 ttcattgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||||    
T  13870 ttcattgttgggggcttgatgccctggagcctttgctcaa-cacgttgggggcttgatgctctgg 13933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0780
Description:

Target: scaffold0780; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 322 - 370
Target Start/End: Original strand, 4837 - 4885
Alignment:
Q  322 tgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4837 tgatgccctagagcctttgctcaattaagttgagggtttgatgccctgg 4885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0780; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 372
Target Start/End: Original strand, 4897 - 4930
Alignment:
Q  339 tgctcaattaagttgagggcttgatgccctgggt 372  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4897 tgctcaaataagttgagggcttgatgccctgggt 4930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 3565 - 3507
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3565 gttgggggcttgatgctctggagctttagctcaattatgttgggggcttgatgccctgg 3507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 1861 - 1803
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctgg 370  Q
    |||||||| ||||||||| | ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1861 gttgggggtttgatgccctgaagctttagctcaactaagttgagggcttgatgccctgg 1803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 182 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29607 - 29558
Alignment:
Q  182 ttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29607 ttgttatttaactaagtcacatgagtcagtctaagttgattaagatgatg 29558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 177 - 249
Target Start/End: Original strand, 193039 - 193112
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttg-attaagatgatgaagttccaaattgttgga 249  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  193039 tgctgttgttaattaactaagttgcatgagtcagtccatgttgaattaagatgttgatgttccaaattattgga 193112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0452
Description:

Target: scaffold0452; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 13774 - 13832
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  13774 gttgagggcttgatgccctagagcctttgctcaa-taagttaagggcctgatgccctggg 13832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0452; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Original strand, 13737 - 13792
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||    
T  13737 gttgggggcttgatgccctagagcctttactcaa-cacgttgagggcttgatgccct 13792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 213 - 159
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||  | |||| ||||||||||||||    
T  213 tgctattgttatttaactaagttgcatgagtctatataagatgattaagatgatg 159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 21866 - 21920
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  21866 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 21920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 177 - 231
Target Start/End: Original strand, 29758 - 29812
Alignment:
Q  177 tgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  29758 tgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 29812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 312 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 61817 - 61760
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcct--ttgctcaattaagttgagggcttgatgcc 366  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  61817 gttgggggcttgatgccctgtgagcctatttgctctattaagttgagggcttgatgcc 61760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2080 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold2080
Description:

Target: scaffold2080; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 364
Target Start/End: Original strand, 950 - 1002
Alignment:
Q  311 tgttgggggcttgatgcccgggagcctttgctcaattaagttgagggcttgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| || |||| ||||||||||    
T  950 tgttgggggcttgatgccctcgagcctttgctcaa-tacgttgggggcttgatg 1002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1938 - 1881
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||| | |||| ||||||||||||||    
T  1938 tgttgctattgttattcaaccaagttgcatgagtcgatataagatgattaagatgatg 1881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 1785 - 1728
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccct 368  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1785 gttgggggcttgataccctgtgagcttttgctcaaataagttgggggcttgatgccct 1728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 6761 - 6676
Alignment:
Q  85 tatgcattacttgaattatatgtcaataattgagacgttgttgacttgcatttgatattattatgtcatgctgtttctgtatactg 170  Q
    |||||||||||||||| || | | |||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| || || |||||||||    
T  6761 tatgcattacttgaataatgtttgaatatttaagatgttgttgaattgctattgatatcattatgtcatgttgattttgtatactg 6676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 174 - 231
Target Start/End: Original strand, 10582 - 10639
Alignment:
Q  174 tgttgctgttgttatttaactaagctgcatgagtcggtctaagttgattaagatgatg 231  Q
    ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  10582 tgttgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcgatataagatgatcaagatgatg 10639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0301 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0301
Description:

Target: scaffold0301; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 10899 - 10840
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  10899 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgagggcttgatgccctggg 10840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 18398 - 18458
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18398 gttgggggcttgatgccatgtgagcttttgcgcaaataagttaagggcttgatgccctggg 18458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 312 - 371
Target Start/End: Original strand, 19871 - 19930
Alignment:
Q  312 gttgggggcttgatgcccgg-gagcctttgctcaattaagttgagggcttgatgccctggg 371  Q
    |||| ||||||||||||| | |||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  19871 gttgagggcttgatgccctgtgagcttttgctct-ttaagttgagggcttgatgccctggg 19930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University