View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11793_low_11 (Length: 487)

Name: NF11793_low_11
Description: NF11793
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11793_low_11
NF11793_low_11
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (1-472)||(22698933-22699404)
chr7 (253-443)||(42798622-42798809)
chr7 (254-438)||(42805478-42805661)
chr7 (254-439)||(2541018-2541201)
chr7 (253-438)||(43557425-43557610)
chr7 (254-442)||(47716413-47716600)
chr7 (253-438)||(21172009-21172189)
chr7 (254-438)||(32758215-32758394)
chr7 (251-387)||(46354145-46354281)
chr7 (254-441)||(48735119-48735302)
chr7 (269-437)||(11617589-11617754)
chr7 (254-436)||(35334818-35334995)
chr7 (269-438)||(19426890-19427055)
chr7 (261-439)||(10693072-10693245)
chr7 (255-393)||(5180199-5180337)
chr7 (258-428)||(14732831-14732999)
chr7 (253-428)||(47077865-47078035)
chr7 (262-438)||(27629596-27629769)
chr7 (283-438)||(42391100-42391250)
chr7 (274-443)||(33871905-33872070)
chr7 (276-414)||(14099030-14099165)
chr7 (276-414)||(14409047-14409182)
chr7 (260-438)||(40463837-40464011)
chr7 (301-438)||(7879639-7879773)
chr7 (254-438)||(34626208-34626388)
chr7 (263-387)||(23419724-23419845)
chr7 (289-437)||(29907408-29907552)
chr7 (275-375)||(7644931-7645031)
chr7 (254-387)||(42476827-42476956)
chr7 (298-384)||(35203437-35203523)
chr7 (263-437)||(3469176-3469350)
chr7 (276-416)||(19266426-19266563)
chr7 (291-438)||(38262196-38262340)
chr7 (254-354)||(42495917-42496016)
chr7 (254-376)||(12473258-12473380)
chr7 (253-438)||(13805056-13805235)
chr7 (275-426)||(39123865-39124018)
chr7 (263-392)||(48123529-48123655)
chr7 (286-429)||(18747472-18747613)
chr7 (255-354)||(18326989-18327087)
chr7 (260-378)||(1423967-1424085)
chr7 (254-428)||(2662946-2663112)
chr7 (304-434)||(21566439-21566567)
chr7 (263-387)||(28362195-28362316)
chr7 (254-416)||(28078154-28078312)
chr7 (276-429)||(16341254-16341405)
chr7 (254-342)||(7193039-7193127)
chr7 (276-387)||(19265791-19265899)
chr7 (297-438)||(31591109-31591245)
chr7 (259-345)||(7794596-7794682)
chr7 (255-387)||(8148995-8149126)
chr7 (299-436)||(18512455-18512588)
chr7 (283-437)||(11741778-11741927)
chr7 (276-423)||(42101899-42102044)
chr7 (277-374)||(6736867-6736963)
chr7 (356-428)||(36267827-36267897)
chr7 (254-346)||(21447544-21447636)
chr7 (279-438)||(32233135-32233290)
chr7 (312-409)||(1408469-1408563)
chr7 (291-439)||(23231550-23231693)
chr7 (319-430)||(38604546-38604654)
chr7 (5-63)||(22688355-22688413)
chr7 (343-413)||(33500556-33500625)
chr7 (172-256)||(22688250-22688333)
chr7 (276-344)||(44123712-44123780)
chr7 (257-362)||(25198679-25198788)
chr7 (356-438)||(27889316-27889395)
chr7 (257-308)||(29140487-29140538)
chr7 (304-374)||(15108458-15108527)
chr7 (257-326)||(31533641-31533710)
chr7 (356-438)||(45018923-45019006)
chr7 (262-354)||(5814433-5814525)
chr7 (331-438)||(35787269-35787372)
chr7 (336-427)||(13792161-13792250)
chr7 (315-429)||(27697452-27697565)
chr7 (397-438)||(36602541-36602582)
chr7 (304-369)||(43852047-43852111)
chr7 (330-425)||(21139761-21139852)
chr7 (270-310)||(28685259-28685299)
[»] chr5 (56 HSPs)
chr5 (254-438)||(38879535-38879718)
chr5 (257-416)||(27328709-27328867)
chr5 (257-438)||(4619104-4619284)
chr5 (257-438)||(43334159-43334339)
chr5 (254-438)||(24448844-24449025)
chr5 (254-438)||(41014273-41014453)
chr5 (253-438)||(8169984-8170164)
chr5 (254-438)||(35710267-35710446)
chr5 (287-438)||(32703411-32703557)
chr5 (254-376)||(22187239-22187361)
chr5 (253-439)||(1565384-1565567)
chr5 (254-365)||(37024626-37024735)
chr5 (254-416)||(22600408-22600567)
chr5 (309-440)||(13801765-13801895)
chr5 (254-360)||(23974735-23974840)
chr5 (269-437)||(12006329-12006496)
chr5 (257-427)||(22861680-22861844)
chr5 (283-438)||(1405170-1405322)
chr5 (303-429)||(43574609-43574732)
chr5 (276-438)||(28516433-28516593)
chr5 (292-428)||(42924840-42924977)
chr5 (275-425)||(19142956-19143102)
chr5 (255-415)||(2838733-2838890)
chr5 (263-429)||(39301087-39301249)
chr5 (276-429)||(208936-209086)
chr5 (284-434)||(1850624-1850770)
chr5 (331-440)||(16880645-16880751)
chr5 (319-437)||(20135623-20135740)
chr5 (260-440)||(30006285-30006462)
chr5 (295-354)||(22025538-22025597)
chr5 (259-374)||(31299591-31299705)
chr5 (315-431)||(7368413-7368524)
chr5 (320-438)||(29334415-29334531)
chr5 (331-426)||(7097772-7097863)
chr5 (346-441)||(34154811-34154903)
chr5 (283-438)||(3771324-3771474)
chr5 (285-387)||(22907915-22908014)
chr5 (283-374)||(34074623-34074714)
chr5 (272-326)||(17419886-17419940)
chr5 (276-373)||(24903758-24903855)
chr5 (360-438)||(16957374-16957449)
chr5 (263-326)||(39079875-39079937)
chr5 (253-310)||(19438702-19438759)
chr5 (304-373)||(41425952-41426021)
chr5 (366-438)||(25622524-25622595)
chr5 (390-438)||(32354214-32354262)
chr5 (283-354)||(10634227-10634298)
chr5 (318-440)||(12575658-12575779)
chr5 (278-416)||(24323727-24323862)
chr5 (278-416)||(24360351-24360486)
chr5 (277-371)||(31694172-31694266)
chr5 (280-322)||(9794472-9794514)
chr5 (275-337)||(18698586-18698648)
chr5 (275-316)||(31362454-31362495)
chr5 (342-374)||(9794439-9794471)
chr5 (390-438)||(16028624-16028672)
[»] chr2 (69 HSPs)
chr2 (255-438)||(10543653-10543835)
chr2 (254-440)||(14530272-14530457)
chr2 (255-438)||(24200623-24200805)
chr2 (253-438)||(8455316-8455498)
chr2 (256-438)||(11514392-11514570)
chr2 (254-438)||(21779261-21779440)
chr2 (257-438)||(25249738-25249915)
chr2 (251-387)||(12023969-12024102)
chr2 (254-438)||(9671134-9671314)
chr2 (252-381)||(7214486-7214615)
chr2 (271-438)||(17667973-17668137)
chr2 (254-440)||(23397720-23397901)
chr2 (256-438)||(19977714-19977893)
chr2 (254-438)||(5840982-5841165)
chr2 (255-444)||(14544018-14544207)
chr2 (254-438)||(25079717-25079899)
chr2 (291-438)||(10546153-10546298)
chr2 (256-438)||(17896215-17896395)
chr2 (260-438)||(27573581-27573755)
chr2 (271-438)||(17623535-17623699)
chr2 (254-407)||(22371011-22371158)
chr2 (289-426)||(19614981-19615116)
chr2 (291-438)||(14444720-14444863)
chr2 (254-372)||(17705449-17705567)
chr2 (255-416)||(32781310-32781467)
chr2 (278-426)||(31158451-31158598)
chr2 (275-440)||(40416869-40417031)
chr2 (276-416)||(21377095-21377232)
chr2 (269-438)||(39914306-39914472)
chr2 (278-374)||(5450263-5450360)
chr2 (254-428)||(26684630-26684803)
chr2 (277-422)||(99281-99421)
chr2 (276-390)||(23145745-23145857)
chr2 (276-390)||(23557535-23557647)
chr2 (276-416)||(33795261-33795398)
chr2 (264-428)||(24859998-24860157)
chr2 (285-428)||(25641487-25641626)
chr2 (263-429)||(4516360-4516522)
chr2 (320-438)||(40762234-40762349)
chr2 (276-375)||(29419945-29420048)
chr2 (316-438)||(36871509-36871626)
chr2 (255-349)||(17472926-17473020)
chr2 (276-374)||(44521434-44521532)
chr2 (275-438)||(44643497-44643658)
chr2 (285-426)||(31821355-31821491)
chr2 (272-355)||(44604826-44604908)
chr2 (335-438)||(25632544-25632644)
chr2 (277-387)||(45235867-45235976)
chr2 (283-374)||(17380298-17380388)
chr2 (277-438)||(4795730-4795890)
chr2 (294-374)||(2003597-2003678)
chr2 (354-431)||(23488535-23488611)
chr2 (299-374)||(12315713-12315787)
chr2 (309-375)||(15296467-15296533)
chr2 (254-300)||(39189556-39189602)
chr2 (258-345)||(4852304-4852388)
chr2 (296-428)||(17471544-17471675)
chr2 (386-438)||(22371195-22371247)
chr2 (253-303)||(27466262-27466312)
chr2 (376-437)||(40579750-40579810)
chr2 (263-322)||(35017781-35017840)
chr2 (388-431)||(124921-124964)
chr2 (260-326)||(15896350-15896416)
chr2 (357-439)||(19185742-19185823)
chr2 (340-425)||(24890451-24890533)
chr2 (315-426)||(30826052-30826158)
chr2 (277-326)||(34752771-34752820)
chr2 (377-438)||(34766330-34766390)
chr2 (341-426)||(39499242-39499324)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (254-438)||(29355855-29356039)
chr6 (264-438)||(12221914-12222088)
chr6 (254-438)||(1346918-1347097)
chr6 (254-438)||(1354757-1354936)
chr6 (256-431)||(3815084-3815256)
chr6 (254-438)||(9161077-9161259)
chr6 (259-438)||(2166410-2166587)
chr6 (259-438)||(2178043-2178220)
chr6 (251-386)||(6024184-6024319)
chr6 (254-368)||(8409197-8409311)
chr6 (252-427)||(20400619-20400791)
chr6 (270-417)||(14553482-14553627)
chr6 (254-425)||(15866052-15866218)
chr6 (292-439)||(17432332-17432484)
chr6 (255-407)||(13905011-13905158)
chr6 (254-431)||(14975097-14975261)
chr6 (254-387)||(1941809-1941940)
chr6 (305-427)||(33138838-33138957)
chr6 (293-425)||(7947384-7947514)
chr6 (257-374)||(32728217-32728334)
chr6 (257-345)||(12063424-12063512)
chr6 (276-440)||(12889402-12889564)
chr6 (278-438)||(28007604-28007760)
chr6 (271-422)||(24097552-24097696)
chr6 (253-438)||(23930127-23930308)
chr6 (253-387)||(24734586-24734729)
chr6 (318-438)||(26097178-26097293)
chr6 (253-326)||(33922937-33923010)
chr6 (276-384)||(2755475-2755583)
chr6 (286-373)||(23240886-23240971)
chr6 (285-387)||(18277243-18277343)
chr6 (356-438)||(12885967-12886048)
chr6 (318-438)||(25557743-25557858)
chr6 (375-438)||(6808468-6808530)
chr6 (278-387)||(32068074-32068179)
chr6 (295-438)||(3116129-3116263)
chr6 (270-332)||(8417442-8417504)
chr6 (357-438)||(12892064-12892144)
chr6 (283-385)||(4136567-4136669)
chr6 (254-344)||(22967125-22967215)
chr6 (254-344)||(23821178-23821268)
chr6 (333-375)||(24751134-24751176)
chr6 (272-372)||(27855500-27855601)
chr6 (264-310)||(19649292-19649338)
chr6 (304-344)||(3564817-3564857)
chr6 (374-438)||(13267797-13267860)
chr6 (339-371)||(14341134-14341166)
chr6 (310-421)||(32579436-32579543)
[»] chr3 (77 HSPs)
chr3 (254-438)||(13628790-13628974)
chr3 (252-438)||(13730602-13730787)
chr3 (253-438)||(46421034-46421219)
chr3 (254-438)||(40272812-40272993)
chr3 (254-436)||(8247688-8247870)
chr3 (255-438)||(29366720-29366902)
chr3 (254-438)||(1217066-1217245)
chr3 (258-437)||(22122918-22123092)
chr3 (286-438)||(516417-516569)
chr3 (254-388)||(4495713-4495845)
chr3 (254-438)||(5173719-5173902)
chr3 (254-374)||(7696948-7697066)
chr3 (254-437)||(22609743-22609921)
chr3 (254-439)||(39203492-39203672)
chr3 (253-438)||(12914035-12914217)
chr3 (269-438)||(26869698-26869863)
chr3 (254-387)||(9607179-9607312)
chr3 (277-425)||(34420656-34420802)
chr3 (254-427)||(6411833-6412002)
chr3 (252-362)||(10870025-10870134)
chr3 (254-438)||(16735417-16735597)
chr3 (254-426)||(26573104-26573272)
chr3 (254-438)||(52926219-52926391)
chr3 (306-439)||(10795422-10795554)
chr3 (310-438)||(14986989-14987116)
chr3 (276-443)||(53996560-53996725)
chr3 (283-431)||(7942995-7943140)
chr3 (276-429)||(19731000-19731150)
chr3 (331-440)||(45786212-45786320)
chr3 (254-373)||(45620890-45621009)
chr3 (254-385)||(12525386-12525512)
chr3 (289-387)||(45139526-45139624)
chr3 (289-387)||(33926094-33926190)
chr3 (277-426)||(25944468-25944615)
chr3 (307-438)||(31592878-31593004)
chr3 (321-438)||(49013473-49013589)
chr3 (293-426)||(54374357-54374488)
chr3 (289-388)||(54032608-54032705)
chr3 (318-444)||(54484730-54484854)
chr3 (286-373)||(30928209-30928296)
chr3 (283-428)||(45948848-45948993)
chr3 (291-369)||(39212003-39212081)
chr3 (257-374)||(26782345-26782462)
chr3 (336-436)||(353351-353450)
chr3 (255-438)||(25517170-25517353)
chr3 (276-429)||(19751576-19751726)
chr3 (261-387)||(33235513-33235639)
chr3 (276-352)||(53062036-53062112)
chr3 (310-387)||(55401208-55401284)
chr3 (257-370)||(21874999-21875106)
chr3 (263-350)||(35417902-35417988)
chr3 (276-439)||(28904941-28905101)
chr3 (342-443)||(34771359-34771457)
chr3 (297-374)||(52428538-52428616)
chr3 (267-416)||(11461656-11461809)
chr3 (342-438)||(15797284-15797377)
chr3 (276-429)||(44403564-44403715)
chr3 (331-413)||(9276317-9276395)
chr3 (284-373)||(8410929-8411016)
chr3 (278-375)||(1121285-1121382)
chr3 (276-428)||(829452-829601)
chr3 (317-387)||(31904907-31904975)
chr3 (276-374)||(29106547-29106645)
chr3 (331-407)||(47624095-47624167)
chr3 (311-424)||(43114882-43114994)
chr3 (386-438)||(47624204-47624256)
chr3 (326-431)||(26292380-26292480)
chr3 (393-438)||(40390353-40390398)
chr3 (377-438)||(14266372-14266431)
chr3 (317-394)||(31672732-31672807)
chr3 (251-345)||(43956550-43956643)
chr3 (397-438)||(10484616-10484657)
chr3 (377-438)||(30452892-30452952)
chr3 (265-322)||(33075931-33075987)
chr3 (253-298)||(39430464-39430509)
chr3 (332-388)||(16130329-16130384)
chr3 (374-438)||(24851301-24851364)
[»] chr8 (60 HSPs)
chr8 (254-438)||(39460994-39461177)
chr8 (251-438)||(12670250-12670432)
chr8 (252-438)||(35261631-35261814)
chr8 (253-438)||(7136527-7136711)
chr8 (254-438)||(28817626-28817807)
chr8 (254-438)||(36720750-36720931)
chr8 (251-431)||(20284076-20284257)
chr8 (251-431)||(21070704-21070886)
chr8 (254-439)||(17823530-17823712)
chr8 (254-438)||(30454097-30454276)
chr8 (252-431)||(44530101-44530277)
chr8 (254-439)||(13160656-13160837)
chr8 (251-431)||(29521692-29521869)
chr8 (254-438)||(6760777-6760959)
chr8 (258-438)||(25250480-25250659)
chr8 (252-437)||(45071217-45071398)
chr8 (254-426)||(2626473-2626645)
chr8 (254-431)||(18164767-18164940)
chr8 (254-438)||(12625843-12626025)
chr8 (253-438)||(26954085-26954270)
chr8 (254-373)||(20869560-20869677)
chr8 (263-425)||(44781517-44781677)
chr8 (263-424)||(42083712-42083870)
chr8 (255-387)||(11748254-11748386)
chr8 (253-416)||(24245404-24245562)
chr8 (271-438)||(8897764-8897928)
chr8 (318-438)||(20869941-20870060)
chr8 (283-370)||(14018034-14018121)
chr8 (263-354)||(28407379-28407469)
chr8 (311-425)||(17250888-17251001)
chr8 (277-416)||(24365081-24365218)
chr8 (283-438)||(31457156-31457307)
chr8 (276-426)||(22598133-22598279)
chr8 (306-438)||(5135290-5135418)
chr8 (331-440)||(16225050-16225158)
chr8 (309-428)||(5689640-5689756)
chr8 (255-387)||(44742568-44742698)
chr8 (299-434)||(389642-389776)
chr8 (283-386)||(35105906-35106008)
chr8 (317-426)||(29877111-29877217)
chr8 (293-429)||(8483947-8484080)
chr8 (278-374)||(36918102-36918198)
chr8 (283-361)||(30962847-30962925)
chr8 (334-439)||(33866983-33867088)
chr8 (254-370)||(40604970-40605086)
chr8 (331-387)||(43942355-43942411)
chr8 (286-387)||(23000269-23000365)
chr8 (276-416)||(11000971-11001109)
chr8 (331-438)||(10857859-10857964)
chr8 (321-438)||(19729363-19729475)
chr8 (254-297)||(23286431-23286474)
chr8 (357-431)||(16013511-16013584)
chr8 (361-438)||(26102578-26102652)
chr8 (377-431)||(27507985-27508038)
chr8 (291-332)||(27635020-27635061)
chr8 (390-438)||(27468092-27468140)
chr8 (342-414)||(31454236-31454307)
chr8 (374-438)||(35107311-35107374)
chr8 (291-345)||(3377506-3377560)
chr8 (374-438)||(28407475-28407538)
[»] chr1 (85 HSPs)
chr1 (253-438)||(18944619-18944804)
chr1 (254-438)||(46247953-46248134)
chr1 (253-438)||(10668196-10668385)
chr1 (260-438)||(30395726-30395903)
chr1 (254-438)||(34725098-34725277)
chr1 (253-438)||(20004090-20004274)
chr1 (253-438)||(32632557-32632738)
chr1 (254-438)||(14617015-14617196)
chr1 (254-438)||(41319806-41319987)
chr1 (254-438)||(27201624-27201807)
chr1 (260-438)||(9939443-9939622)
chr1 (254-431)||(46991781-46991955)
chr1 (253-438)||(38478282-38478462)
chr1 (253-438)||(47214487-47214667)
chr1 (259-438)||(18741957-18742137)
chr1 (257-424)||(23768334-23768498)
chr1 (253-431)||(45812544-45812717)
chr1 (276-438)||(35117765-35117927)
chr1 (293-438)||(35005139-35005283)
chr1 (273-427)||(6925096-6925247)
chr1 (254-438)||(27474258-27474438)
chr1 (258-438)||(19414420-19414595)
chr1 (263-428)||(2435796-2435958)
chr1 (254-438)||(8197020-8197201)
chr1 (254-409)||(19932782-19932933)
chr1 (251-374)||(4430087-4430210)
chr1 (276-374)||(18724606-18724704)
chr1 (259-431)||(45402077-45402247)
chr1 (252-387)||(22930119-22930250)
chr1 (283-429)||(22327105-22327245)
chr1 (291-438)||(35253187-35253329)
chr1 (260-438)||(12126837-12127010)
chr1 (276-375)||(17470406-17470505)
chr1 (275-438)||(6983811-6983969)
chr1 (277-438)||(19701570-19701729)
chr1 (277-416)||(25468285-25468421)
chr1 (264-387)||(33222971-33223092)
chr1 (257-387)||(25290143-25290280)
chr1 (275-414)||(20036218-20036355)
chr1 (338-439)||(4349699-4349797)
chr1 (287-416)||(11596523-11596648)
chr1 (254-332)||(34714600-34714678)
chr1 (276-373)||(50760288-50760385)
chr1 (263-438)||(50811926-50812098)
chr1 (275-429)||(15511157-15511311)
chr1 (256-321)||(40424721-40424786)
chr1 (277-374)||(44485170-44485267)
chr1 (255-374)||(24564322-24564441)
chr1 (258-390)||(18335335-18335465)
chr1 (309-426)||(22324925-22325039)
chr1 (341-438)||(42304207-42304303)
chr1 (255-367)||(18335914-18336026)
chr1 (276-428)||(27136661-27136811)
chr1 (277-429)||(39214967-39215117)
chr1 (276-371)||(52910216-52910312)
chr1 (258-325)||(21006125-21006192)
chr1 (276-429)||(10378744-10378884)
chr1 (288-438)||(19974074-19974221)
chr1 (276-345)||(2435983-2436052)
chr1 (293-426)||(45264411-45264542)
chr1 (345-416)||(15505632-15505700)
chr1 (263-429)||(35019217-35019378)
chr1 (340-431)||(31442396-31442485)
chr1 (363-438)||(50606487-50606561)
chr1 (276-374)||(34679280-34679378)
chr1 (287-364)||(31272446-31272522)
chr1 (318-438)||(31382214-31382330)
chr1 (270-365)||(14987989-14988084)
chr1 (294-429)||(23371141-23371271)
chr1 (340-385)||(46859129-46859173)
chr1 (278-390)||(19656152-19656263)
chr1 (263-424)||(43207476-43207640)
chr1 (287-326)||(43768168-43768207)
chr1 (333-438)||(20999850-20999952)
chr1 (255-341)||(21723642-21723727)
chr1 (331-438)||(1517311-1517416)
chr1 (319-438)||(23796507-23796623)
chr1 (358-426)||(4249455-4249520)
chr1 (358-426)||(4249779-4249844)
chr1 (358-426)||(4250103-4250168)
chr1 (251-387)||(10163733-10163867)
chr1 (275-340)||(25554817-25554882)
chr1 (308-416)||(30682845-30682948)
chr1 (343-438)||(43768205-43768297)
chr1 (283-367)||(49722641-49722724)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (259-440)||(58936-59116)
[»] chr4 (92 HSPs)
chr4 (261-438)||(16408601-16408777)
chr4 (254-438)||(5648213-5648393)
chr4 (254-437)||(6430627-6430806)
chr4 (253-438)||(11054148-11054328)
chr4 (254-438)||(20224938-20225117)
chr4 (253-438)||(23501746-23501924)
chr4 (254-438)||(48598825-48599004)
chr4 (257-438)||(16911519-16911699)
chr4 (273-440)||(44363128-44363294)
chr4 (253-438)||(47528530-47528710)
chr4 (253-431)||(21646917-21647094)
chr4 (254-438)||(30639334-30639514)
chr4 (251-438)||(13256399-13256581)
chr4 (254-438)||(5306660-5306844)
chr4 (275-387)||(25343162-25343274)
chr4 (283-438)||(54175046-54175200)
chr4 (259-438)||(30352580-30352767)
chr4 (276-438)||(35567146-35567305)
chr4 (292-436)||(29207900-29208039)
chr4 (264-428)||(19027813-19027973)
chr4 (273-437)||(40915802-40915962)
chr4 (249-438)||(20405042-20405224)
chr4 (253-424)||(37494804-37494972)
chr4 (278-438)||(9832313-9832468)
chr4 (257-438)||(54730206-54730387)
chr4 (283-415)||(7385499-7385628)
chr4 (254-387)||(10660358-10660491)
chr4 (254-387)||(10874503-10874636)
chr4 (317-438)||(20639658-20639777)
chr4 (258-386)||(14590795-14590922)
chr4 (283-387)||(17043444-17043546)
chr4 (299-438)||(47443956-47444092)
chr4 (286-438)||(25463108-25463256)
chr4 (285-439)||(30690175-30690333)
chr4 (269-437)||(8473621-8473786)
chr4 (312-431)||(21489099-21489216)
chr4 (328-439)||(48327762-48327872)
chr4 (257-422)||(14983791-14983953)
chr4 (283-431)||(39077803-39077946)
chr4 (254-438)||(55766466-55766647)
chr4 (278-375)||(23580268-23580365)
chr4 (276-384)||(487187-487294)
chr4 (255-429)||(54966977-54967145)
chr4 (276-374)||(47441591-47441689)
chr4 (254-370)||(55830786-55830902)
chr4 (276-416)||(39029082-39029220)
chr4 (276-360)||(42164224-42164307)
chr4 (288-375)||(7038041-7038127)
chr4 (257-344)||(17315389-17315476)
chr4 (320-438)||(25629069-25629184)
chr4 (276-425)||(20908649-20908797)
chr4 (318-437)||(7909281-7909397)
chr4 (345-440)||(20225119-20225213)
chr4 (283-374)||(41018855-41018945)
chr4 (283-416)||(49938615-49938742)
chr4 (263-429)||(36589708-36589870)
chr4 (263-345)||(54640429-54640510)
chr4 (344-438)||(2813169-2813263)
chr4 (342-429)||(16494259-16494345)
chr4 (264-374)||(30496383-30496491)
chr4 (276-359)||(43035224-43035307)
chr4 (331-428)||(51865048-51865142)
chr4 (257-322)||(5313107-5313172)
chr4 (278-440)||(32478790-32478942)
chr4 (299-416)||(9037729-9037844)
chr4 (278-387)||(30581515-30581624)
chr4 (285-354)||(32629350-32629418)
chr4 (361-438)||(33836487-33836563)
chr4 (341-438)||(36816384-36816479)
chr4 (320-416)||(49796818-49796910)
chr4 (277-374)||(3580901-3580994)
chr4 (283-372)||(51420556-51420646)
chr4 (374-439)||(11394924-11394988)
chr4 (374-439)||(11404651-11404715)
chr4 (263-340)||(12257688-12257764)
chr4 (312-387)||(9987884-9987957)
chr4 (375-439)||(38755907-38755970)
chr4 (275-375)||(44357195-44357295)
chr4 (275-378)||(11579819-11579922)
chr4 (263-385)||(49938490-49938610)
chr4 (309-390)||(17079698-17079777)
chr4 (334-387)||(35894511-35894563)
chr4 (390-439)||(40553936-40553985)
chr4 (257-297)||(18969698-18969738)
chr4 (390-438)||(35532079-35532127)
chr4 (374-438)||(38786681-38786744)
chr4 (291-374)||(10380004-10380086)
chr4 (332-374)||(12711510-12711553)
chr4 (263-326)||(50856345-50856407)
chr4 (376-438)||(32484307-32484368)
chr4 (375-440)||(25388249-25388313)
chr4 (332-384)||(23914379-23914430)
[»] scaffold0168 (1 HSPs)
scaffold0168 (254-438)||(30533-30712)
[»] scaffold0187 (4 HSPs)
scaffold0187 (257-436)||(10052-10226)
scaffold0187 (257-436)||(20380-20554)
scaffold0187 (254-319)||(8899-8964)
scaffold0187 (254-319)||(19227-19292)
[»] scaffold0057 (4 HSPs)
scaffold0057 (254-438)||(24772-24948)
scaffold0057 (263-438)||(46794-46966)
scaffold0057 (313-438)||(43672-43793)
scaffold0057 (277-323)||(46995-47041)
[»] scaffold0258 (2 HSPs)
scaffold0258 (256-438)||(13024-13202)
scaffold0258 (255-297)||(17507-17549)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (270-431)||(10780-10938)
[»] scaffold1176 (1 HSPs)
scaffold1176 (262-440)||(1585-1758)
[»] scaffold0223 (1 HSPs)
scaffold0223 (261-439)||(11093-11265)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (258-386)||(226456-226583)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (259-387)||(4117-4245)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (270-390)||(35064-35184)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (254-326)||(83829-83901)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (262-438)||(72867-73034)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (309-438)||(48634-48758)
[»] scaffold0954 (1 HSPs)
scaffold0954 (291-439)||(3537-3680)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (253-344)||(8847-8935)
[»] scaffold0194 (1 HSPs)
scaffold0194 (255-326)||(24619-24690)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (269-344)||(43098-43173)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (283-390)||(32913-33019)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (348-438)||(24133-24220)
[»] scaffold0167 (1 HSPs)
scaffold0167 (291-366)||(23590-23665)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 452; Significance: 0; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 1 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 22699404 - 22698933
Alignment:
Q  1 aagggtagttatctctttaaggaaaaccaagatgattataattctttaactatacctcttgttaccgaggaagattcaatcaaaaaagatgatccgactt 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22699404 aagggtagttatctctttaaggaaaaccaagatgattataattctttaactatacctcttgttaccgaggaagattcaatcaaaaaagaggatccgactt 22699305  T
Q  101 caacaacatctcatcatcaatcacctgtcagctgttcaaaaatctctacctctgaatttccaacaccacagaggcaatgctccttggcacaatcagtaat 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22699304 caacaacatctcatcatcaatcacctgtcagctgttcaaaaatctctacctctgaatttccaacaccacagaggcaatgctccttggcacaatcagtaat 22699205  T
Q  201 taatggtataactaatttgctctatgattaatttctcatctacatatgtcttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactga 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22699204 taatggtataactaatttgctctatgattaatttctcatctacatatgtcttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga 22699105  T
Q  301 aaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccc 400  Q
    ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  22699104 aaggttatgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccggaccc 22699005  T
Q  401 tgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatatgtcttcgactgtctttattttctaagaact 472  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22699004 tgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatatgtcttcgactgtctttattttctaagaact 22698933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 253 - 443
Target Start/End: Original strand, 42798622 - 42798809
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  42798622 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacaaggta 42798721  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatatg 443  Q
    || ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  42798722 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-tttcccggaccctgcatatgcgggagctatagtgcatcgggttgccctttttatg 42798809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 42805478 - 42805661
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  42805478 gaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 42805577  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42805578 ggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 42805661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 254 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 2541201 - 2541018
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactg-aaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  2541201 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 2541102  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    || |||||||| |||||||  ||||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2541101 aggctgcgtactatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtttcccttta 2541018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Original strand, 43557425 - 43557610
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||    
T  43557425 agaggggtaaccttgccgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagta 43557524  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc-tatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||| || ||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  43557525 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cctcccggactctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 43557610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 254 - 442
Target Start/End: Original strand, 47716413 - 47716600
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  47716413 gaggggtaaccttggcacaactggaaaagttgttgccatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 47716512  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatat 442  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||    
T  47716513 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttggtgcaccgggttgccctttatat 47716600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21172189 - 21172009
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  21172189 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 21172092  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21172091 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 21172009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 32758215 - 32758394
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  32758215 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 32758312  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32758313 ggctgtgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 32758394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 251 - 387
Target Start/End: Original strand, 46354145 - 46354281
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  46354145 ttagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacaggg 46354244  T
Q  351 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46354245 taaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc 46354281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 48735302 - 48735119
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcc-tggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||  |||||| ||||    
T  48735302 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttggaaacaacctcttgtgt--aaaacacggta 48735205  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttata 441  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  48735204 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttata 48735119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 269 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 11617754 - 11617589
Alignment:
Q  269 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11617754 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 11617655  T
Q  369 accaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    |||  ||||||||||||||  |||| | |||||| |||||| ||| || |||||||||||||| |||||    
T  11617654 acc--aaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcgtatgcaggacctttagtgcaccgggttgccctt 11617589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 254 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 35334995 - 35334818
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  35334995 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagtctc--gtgtaaaaaacagggtaa 35334898  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 436  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  35334897 gactgtgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggtttccct 35334818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 269 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19427055 - 19426890
Alignment:
Q  269 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 368  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19427055 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatac 19426956  T
Q  369 accaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||  ||||||||||||||  ||| || ||||||  |||||| |||||  ||||||||||||| ||||||    
T  19426955 acc--aaatggtgggaccc--ttctcggaccctgcatatgcgagagcttcagtgcaccgggttgcccttt 19426890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 261 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 10693245 - 10693072
Alignment:
Q  261 aaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 360  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||| |||||    
T  10693245 aaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaagagggtaaggctgcg 10693148  T
Q  361 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  10693147 tacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcactgggttgcccttta 10693072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 255 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 5180337 - 5180199
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  5180337 aggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaacttctggaaacagcctcttgtgtcaaaaacagggtaag 5180238  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcc 393  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | |||||| |||||    
T  5180237 actgtgtacaacacaccaaaaatgattggacccctttcc 5180199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 258 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 14732999 - 14732831
Alignment:
Q  258 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 357  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||   |||||||||||||||||| ||    
T  14732999 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcccatgtaaaaaacagggtaaggct 14732900  T
Q  358 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    |||| |||||||||||||||||||  || |  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  14732899 gcgt-caatacaccaaaaatggtgaaactc-cttcccgaaccctgtttatgcgggagctttagtgcaccgg 14732831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 253 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 47078035 - 47077865
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||  ||    
T  47078035 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaatagag--ta 47077938  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    |   ||||||||||||||  ||||||||||||||| || ||| ||||||   |||||||||||| |||||||||||    
T  47077937 aagttgcgtacaatacac--aaaatggtgggacccctt-cccaaaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgg 47077865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 262 - 438
Target Start/End: Original strand, 27629596 - 27629769
Alignment:
Q  262 accttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgt 361  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  27629596 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatttgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgt 27629695  T
Q  362 acaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||  ||||||||||||||  ||||||  |||||  ||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||    
T  27629696 aaaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgggccctgcatatgcggtagcttcagtgcaccgggttgcccttt 27629769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 283 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 42391250 - 42391100
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  42391250 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcttcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgg 42391155  T
Q  383 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  42391154 gaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 42391100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 274 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 33872070 - 33871905
Alignment:
Q  274 ctggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||      
T  33872070 ctggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacaggataaggctgcgtacaatacacc-- 33871974  T
Q  374 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatatg 443  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||||||    
T  33871973 aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgtgtatgcgagagctttagtgcaccaggttgccttttatatg 33871905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 276 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14099165 - 14099030
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  14099165 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacc--aa 14099068  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 414  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||    
T  14099067 atggtgggaccc-cttcccgaaccctacgtatgcaggag 14099030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 276 - 414
Target Start/End: Complemental strand, 14409182 - 14409047
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||    
T  14409182 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttgaagtcctggaaatagccttttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtacaatacacc--aa 14409085  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 414  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||  |||||| ||||    
T  14409084 atggtgggaccc-cttcccgaaccctacgtatgcaggag 14409047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 260 - 438
Target Start/End: Original strand, 40463837 - 40464011
Alignment:
Q  260 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 359  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||| |||||| ||||||| ||||    
T  40463837 taaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatagaaacagtctcttgtgt-aaaaactgggtaaggctgc 40463935  T
Q  360 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||| ||||||||  ||||||||||||||  ||| || |||||| |||||||||||||  ||||||||| ||| ||||||    
T  40463936 gtataatacacc--aaatggtgggaccc-cttctcggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgagttgcccttt 40464011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 301 - 438
Target Start/End: Original strand, 7879639 - 7879773
Alignment:
Q  301 aaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccc 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  7879639 aaggtcacgggttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccc 7879735  T
Q  401 tgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  7879736 tgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttt 7879773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34626388 - 34626208
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||    
T  34626388 gaggggtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggccacagattcaagtcctggaaacagcctcctgtgt-aaaaacagggtaa 34626290  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | |||||| |||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||    
T  34626289 ggctgcgttcaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagttcatcgggttgcccttt 34626208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 263 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23419845 - 23419724
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23419845 ccttggcgcaac-ggtaaagttgctgtcatgtgactaaaaggtcacaggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 23419747  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  23419746 caatacacc--aaatggtgggaccc 23419724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 437
Target Start/End: Original strand, 29907408 - 29907552
Alignment:
Q  289 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccct 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||| || ||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||     
T  29907408 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatagtgtaaggctgcgttcaatacacc-aaaatggtgggaccc- 29907505  T
Q  389 tttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
      ||||| ||||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  29907506 catcccggaccc--tgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 29907552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 275 - 375
Target Start/End: Original strand, 7644931 - 7645031
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  7644931 tggtaaatttgttgtaacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagatagcgtacaatacaccaaa 7645030  T
Q  375 a 375  Q
    |    
T  7645031 a 7645031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 254 - 387
Target Start/End: Original strand, 42476827 - 42476956
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||| |||||    
T  42476827 gaggggtaacattggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacggattcaagttctggaaacagtctcttgtgt--aaaacaaggtaa 42476924  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  42476925 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc 42476956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 298 - 384
Target Start/End: Original strand, 35203437 - 35203523
Alignment:
Q  298 tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35203437 tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacattctcttgtgtaaaaaacaggataagactgcgtacaatataccaaaaatggtggga 35203523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 263 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 3469350 - 3469176
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa--aaaacagggtaagactgcg 360  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||| |  ||||    
T  3469350 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagactcaagtcctagaaacattctcttgtgtaaaaaaaacagggtacggttgcg 3469252  T
Q  361 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||  ||||   |||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||    
T  3469251 tacaatacaccaaaaatggcgggaccc-cttcctagaccctgtgtatgcgggagctttagtgcgctgggttgccctt 3469176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Original strand, 19266426 - 19266563
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  19266426 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtgggttcaagtcctgaaaatagccacttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 19266523  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    || |||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||    
T  19266524 attgtgggatcc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagct 19266563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 291 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38262340 - 38262196
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 390  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||   ||| |||||||||||  ||||| ||||||||  |    
T  38262340 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatatggtaatgttgcatacaatacacc--aaatgatgggaccc-ct 38262244  T
Q  391 tcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  38262243 tcccgaacactgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 38262196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 42496016 - 42495917
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||||||    
T  42496016 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtat-aaaaacagggtaa 42495918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 376
Target Start/End: Original strand, 12473258 - 12473380
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||||||    
T  12473258 gaggggtagccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtatctgaaaggtcatgggttcaagtcctgcaaacaacctcttgtgtcaaaaacagggtaa 12473357  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaa 376  Q
    |  ||||||||||||||||||||    
T  12473358 ggatgcgtacaatacaccaaaaa 12473380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Original strand, 13805056 - 13805235
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |  |||||    
T  13805056 agagggggagccttggcgcaa-tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtaacgggttcaagtcctggaaatagcctctggtgtaaaaca-ggggta 13805153  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||| | |||||| ||||||||||||| | |||||| ||| ||||||||    
T  13805154 aggctgtgtacaatacacc--aaatggtggga-ccacttcctggaccctgcgtatgcgggagct-ttgtgcactgggctacccttt 13805235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 426
Target Start/End: Original strand, 39123865 - 39124018
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt----aagactgcgtacaatacac 370  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| |||||||||||    ||| ||||||| |||||||    
T  39123865 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaacgacacgggttcaagtcctagaaacggtctcttgtgt-aaaaacagggtagggaaggctgcgtaaaatacac 39123963  T
Q  371 caaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  39123964 caaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgagggagctttggtgcacc 39124018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 263 - 392
Target Start/End: Complemental strand, 48123655 - 48123529
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||| ||||| ||    
T  48123655 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgtctgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacagggtaaaactgcata 48123557  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggacccttttc 392  Q
    |||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  48123556 caatacacc--aaatggtgggacccctttc 48123529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 429
Target Start/End: Original strand, 18747472 - 18747613
Alignment:
Q  286 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 384  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||  || ||||||||    
T  18747472 ttgtcacgtgactgaaaggtcacgggatcaagtcttggaaacagccttttgtgtaaaaaagcagggtaaggctgcgtataatacacc--aattggtggga 18747569  T
Q  385 cccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    |||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  18747570 ccc-cttcctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 18747613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 255 - 354
Target Start/End: Original strand, 18326989 - 18327087
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  18326989 aggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaggtcacgggttcaagtcccggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaag 18327087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 260 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 1424085 - 1423967
Alignment:
Q  260 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 359  Q
    |||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  1424085 taactttggcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacggattcaaatcctggaaacagtctgttgtgtaaaaaacagggtaatgctgc 1423986  T
Q  360 gtacaatacaccaaaaatg 378  Q
     |||| |||||||| ||||    
T  1423985 atacactacaccaataatg 1423967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2663112 - 2662946
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |  ||||  ||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||    
T  2663112 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgga--gtcataggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaa 2663017  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||  |  ||||||  |||||||||||| ||| |||||||    
T  2663016 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccctttt--cagaccctgcatatgcgggagctctagcgcaccgg 2662946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 304 - 434
Target Start/End: Original strand, 21566439 - 21566567
Alignment:
Q  304 gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgt 403  Q
    ||||| |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||     
T  21566439 gtcacaggttcaagtcttggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagaggaagactgcgtacaatacacc-aaaatggtaggaccc-cttcccgaaccctgc 21566536  T
Q  404 gtatgcgggagctatagtgcaccgggttacc 434  Q
     |||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21566537 atatgcgggagctttagtgcaccgggctacc 21566567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 263 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 28362316 - 28362195
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  28362316 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtggctgaaaggtcacaggttcaagtcctagaaactgcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggctgcgta 28362218  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |||||||||  ||||||||||||||    
T  28362217 caatacacc--aaatggtgggaccc 28362195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 254 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 28078312 - 28078154
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||| || ||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  28078312 gaggggtaaccctggcgcaactcgtgaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagtctcgtgt-aaaaaaacagggtaa 28078214  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    |  ||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||| |||||    
T  28078213 ggttgcatgcaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgaatcctgcatatgcgagagct 28078154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 429
Target Start/End: Original strand, 16341254 - 16341405
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||| ||||||   ||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  16341254 ggtaaagttgttatcatgtatttgaaaggtcacgggttcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctacgtacaatacacc-aaa 16341352  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    |||||||| |||| |||||| |||     |||||||||||| | ||||||||||    
T  16341353 atggtggg-ccctcttcccggacctatcatatgcgggagctttggtgcaccggg 16341405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 254 - 342
Target Start/End: Original strand, 7193039 - 7193127
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaa 342  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||||||||    
T  7193039 gaggggtaaccttggcgtaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaa 7193127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 387
Target Start/End: Original strand, 19265791 - 19265899
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| | || | ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  19265791 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggatacagccgcttgtgt-aaaaagagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 19265887  T
Q  376 atggtgggaccc 387  Q
    ||||||||||||    
T  19265888 atggtgggaccc 19265899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 297 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31591245 - 31591109
Alignment:
Q  297 ctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccga 396  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||  ||||||     
T  31591245 ctgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt--aaaacagagtaaggctgcgtacaataca--ataaatggtgggaccc-cttcccgg 31591151  T
Q  397 accctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31591150 accttgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 31591109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 259 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 7794682 - 7794596
Alignment:
Q  259 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 345  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||    
T  7794682 gtaaccttagcgcaactggtaaagttgttgttatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttatgtaaaaaa 7794596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 255 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 8149126 - 8148995
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtg-taaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||| |||    |||||||| ||||||| |||||||    
T  8149126 aggggtaaccttggcacaactggtaatgttgttgtcatgtgactgcaaagtcacgagttcaagtcctgaaaactacctcttgtgttaaaaaatagggtaa 8149027  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8149026 ggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc 8148995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 299 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 18512588 - 18512455
Alignment:
Q  299 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaac 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||| ||    
T  18512588 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgta-aaaatagggtaaggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttcccggac 18512493  T
Q  399 cctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 436  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||| ||||| ||||    
T  18512492 cctgcgtatgcgggagctttggtgcactgggttgccct 18512455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 283 - 437
Target Start/End: Original strand, 11741778 - 11741927
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||  ||| ||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  11741778 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacagcttctagtgt--aaaatagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgg 11741873  T
Q  383 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    || ||  |||||| |  |||   ||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  11741874 gatcc-cttcccggattctgcacatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctt 11741927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 276 - 423
Target Start/End: Complemental strand, 42102044 - 42101899
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| |||||||   |||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||    
T  42102044 ggtaaagttgttgtcacgtgactggaaggtcaaaagttcaagtcctggaaacagcctcttccgtaaaaaacagggtaacactgcgtacagtac-tctaaa 42101946  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgc 423  Q
     ||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| |||| ||||||    
T  42101945 gtggtgggaccc-tttcccggaccctgcgtatccggcagctttagtgc 42101899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Original strand, 6736867 - 6736963
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |  ||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  6736867 gtaaagttgttgtcatgcgactgaaaggtcacgggttcaagtcctcaaaacaacctcttgtat-aaaaacaaggtaagactgcatacaatacaccaaa 6736963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 356 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 36267897 - 36267827
Alignment:
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36267897 ctgcgtacaatacaccaaa--tggttggacccatttcccgaaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgg 36267827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 254 - 346
Target Start/End: Original strand, 21447544 - 21447636
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaac 346  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||| | || |||||||||| |||||||| || ||| || ||||||||||||||||    
T  21447544 gaggggtaaccttggcgcaactgataaatttgttgtcatgtaattggaaggtcacggattcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaac 21447636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32233290 - 32233135
Alignment:
Q  279 aaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatg 378  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| | ||||| | ||||||  |||||    
T  32233290 aaaattgttgtcacctgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggcagcgtatattacacc--aaatg 32233194  T
Q  379 gtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||  |  ||||| |||||||  |||| |||||||  ||||||||||| | ||||||    
T  32233193 gtgggattc-cttcccaaaccctgcatatgagggagcttcagtgcaccgggctgcccttt 32233135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 312 - 409
Target Start/End: Original strand, 1408469 - 1408563
Alignment:
Q  312 ttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgc 409  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  1408469 ttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgtgtacaatacagc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgc 1408563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 439
Target Start/End: Original strand, 23231550 - 23231693
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 390  Q
    |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||| ||  || |||||||| ||    
T  23231550 atgtgactgaaaggtcacag--tagagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaa--tgatgggacccctt 23231645  T
Q  391 tcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
     ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  23231646 -cccgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccgagtttcccttta 23231693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 319 - 430
Target Start/End: Original strand, 38604546 - 38604654
Alignment:
Q  319 cctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat 418  Q
    |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |    
T  38604546 cctggaaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgagaccccttt-ccggaccctgcgtatgcgggagcttt 38604641  T
Q  419 -agtgcaccgggt 430  Q
     ||||||||||||    
T  38604642 aagtgcaccgggt 38604654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 22688413 - 22688355
Alignment:
Q  5 gtagttatctctttaaggaaaaccaagatgattataattctttaactatacctcttgtt 63  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  22688413 gtagttatctctctaaggaaaaccaagatgattctaactctttaactataccttttgtt 22688355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 413
Target Start/End: Original strand, 33500556 - 33500625
Alignment:
Q  343 aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcggga 413  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||    
T  33500556 aaacagggtaagactgcgtactatacacaaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcggga 33500625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 172 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22688333 - 22688250
Alignment:
Q  172 aggcaatgctccttggcacaatcagtaattaatggtataactaatttgctctatgattaatttctcatctacatatgtcttagag 256  Q
    |||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |||||| | ||| ||||||||    
T  22688333 aggcaatgttcctttgcacgatcagtaattaatggtatgactaatttgttctataattaattt-tcatctgcttatatcttagag 22688250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 44123780 - 44123712
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 344  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  44123780 ggtaaagttggtgtcatgtgactgaaagattacgggttcaagtactggaaacagcctcttgtgtaaaaa 44123712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 257 - 362
Target Start/End: Original strand, 25198679 - 25198788
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttc---aagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||| ||   ||||| |||||| ||||| |||||| |||||||| ||||    
T  25198679 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaagatcatgggatcaaaaagtcttggaaacagtcttttgtgtaaaaaaacaaggta 25198778  T
Q  353 agactgcgta 362  Q
    |||| |||||    
T  25198779 agaccgcgta 25198788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27889395 - 27889316
Alignment:
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| | || ||||||||| ||||||    
T  27889395 ctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttggtacaccgggttgcccttt 27889316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 257 - 308
Target Start/End: Complemental strand, 29140538 - 29140487
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcac 308  Q
    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29140538 gggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcac 29140487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 15108527 - 15108458
Alignment:
Q  304 gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||    
T  15108527 gtcacgagttcaagtcctggaaacagtttcttgtgta-aaaacaaggtaaggctgtgtacaatacatcaaa 15108458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 257 - 326
Target Start/End: Original strand, 31533641 - 31533710
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 326  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||||||  ||||||||| ||||||    
T  31533641 gggtgaccttgacgcaactcgtaaaattgttatcatatgactaaatggtcacatgttcaagtcttggaaa 31533710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 45019006 - 45018923
Alignment:
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaa--tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||| |||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  45019006 ctgcgtacaatataccaaaaaactggtggaacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 45018923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 262 - 354
Target Start/End: Original strand, 5814433 - 5814525
Alignment:
Q  262 accttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||||  |||||| |  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  5814433 accttggcgcaatcggtaaagttgttgttatgtgattggaaagtcacgggttcaagttttggaaagaacctcttatgtaaaaaatagggtaag 5814525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35787372 - 35787269
Alignment:
Q  331 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggt 430  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||| ||| || |||||||||||||  | ||||||||||    
T  35787372 ctcttgtgtaaaaa-catggtaaggttgcgtacaatacacc--aaatggcgggaccc-cttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcaatgcaccgggt 35787277  T
Q  431 tacccttt 438  Q
    | ||||||    
T  35787276 tgcccttt 35787269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 336 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 13792250 - 13792161
Alignment:
Q  336 gtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 427  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||  |||||| |||||||  ||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||||||    
T  13792250 gtgtaaaaaacttggtaagactgcatacaatacacc-caaatggcgggaccc-cttctcgaaccctgcgtatgctggagcttttgtgcaccg 13792161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 315 - 429
Target Start/End: Original strand, 27697452 - 27697565
Alignment:
Q  315 aagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggg--acccttttcccgaaccctgtgtatgcggg 412  Q
    |||||||||||| |  |||||||||||||| ||||| ||| ||| |||  ||||||||||| |||||||  ||||||| |||  |||||| |||||||||    
T  27697452 aagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggcaaggctgtgta--atacaccaaaa-tggtgggggaccctttccccagaccctgcgtatgcggg 27697548  T
Q  413 agctatagtgcaccggg 429  Q
    ||||  | |||||||||    
T  27697549 agcttaaatgcaccggg 27697565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Original strand, 36602541 - 36602582
Alignment:
Q  397 accctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  36602541 accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 36602582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 369
Target Start/End: Original strand, 43852047 - 43852111
Alignment:
Q  304 gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaataca 369  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  43852047 gtcacgggttcaagtcctgaaaaaac-ctcttctgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaataca 43852111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 330 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 21139852 - 21139761
Alignment:
Q  330 tctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 425  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||  ||  |||| |||||||||  ||||||||||| || ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||    
T  21139852 tctcttgtgtaaaaa-cagagtaaggttggatacagtacaccaaa--tggtgggacccctt-cccgaactctgtgtatgcggaagctttagtgcac 21139761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28685299 - 28685259
Alignment:
Q  270 gcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg 310  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28685299 gcaactgttaaagttgttgtcatgtgactgaaagatcacgg 28685259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 56)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 38879535 - 38879718
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  38879535 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaa 38879634  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38879635 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 38879718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 257 - 416
Target Start/End: Original strand, 27328709 - 27328867
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27328709 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 27328808  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27328809 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 27328867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 257 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 4619284 - 4619104
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  4619284 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 4619185  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  4619184 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 4619104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 257 - 438
Target Start/End: Original strand, 43334159 - 43334339
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaaga 355  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||     
T  43334159 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaaacagggtaagg 43334258  T
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  43334259 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcg-atgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 43334339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 24448844 - 24449025
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||||    
T  24448844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 24448943  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24448944 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttt 24449025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 41014273 - 41014453
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  41014273 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 41014371  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| | |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  41014372 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcctggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 41014453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8170164 - 8169984
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||  |||||||||||    
T  8170164 agagggctaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgt--aaaacagggta 8170067  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||| |  ||||||||||||| ||||||    
T  8170066 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagtttcagtgcaccgggttgcccttt 8169984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 35710267 - 35710446
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||    
T  35710267 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaa 35710364  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | |||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||| | | ||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35710365 ggctgcgttcaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaacatgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 35710446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 287 - 438
Target Start/End: Original strand, 32703411 - 32703557
Alignment:
Q  287 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacc 386  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  32703411 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggacc 32703506  T
Q  387 cttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32703507 c-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 32703557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 254 - 376
Target Start/End: Original strand, 22187239 - 22187361
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| | |||    
T  22187239 gaggggtaactttggcgcaactagtaaagttgttgtcatttgactgaaaggtcaccggtttaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgataa 22187338  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaa 376  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  22187339 gactgcgtacaatacaccaaaaa 22187361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 253 - 439
Target Start/End: Original strand, 1565384 - 1565567
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggt 351  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||| || ||||||||   |    
T  1565384 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgagtaaaaaaacatatt 1565483  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    ||| ||||||||||| ||||  |||||| |||||||  |||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1565484 aaggctgcgtacaatgcacc--aaatggcgggaccc-cttcccggaccctgcatatgtgggagct-tagtgcaccgggttgcccttta 1565567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 254 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 37024735 - 37024626
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  37024735 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 37024638  T
Q  354 gactgcgtacaa 365  Q
    | ||||||||||    
T  37024637 ggctgcgtacaa 37024626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 254 - 416
Target Start/End: Original strand, 22600408 - 22600567
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | | | |||||||||| |||||||||    
T  22600408 gaggggtaaccttgacgtaactggtaaagttgttatcatgtgactggaaggttacgggttcaagtcctggaaacaatattttgtgtaaaacacagggtaa 22600507  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    | ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| | |||| |||||||||||||    
T  22600508 ggctgtgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccggatcctgcgtatgcgggagct 22600567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 309 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 13801895 - 13801765
Alignment:
Q  309 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg 408  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  ||||    
T  13801895 gggttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatg 13801797  T
Q  409 cgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13801796 cgagagctttagtgcaccgggttgccctttat 13801765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 360
Target Start/End: Original strand, 23974735 - 23974840
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||    
T  23974735 gaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaagagggtaa 23974833  T
Q  354 gactgcg 360  Q
    | |||||    
T  23974834 ggctgcg 23974840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 269 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 12006496 - 12006329
Alignment:
Q  269 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacggg-ttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaata 367  Q
    |||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |  ||||| ||||||||| |||||||| || | |||||||    
T  12006496 cgcaactgctcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggggttcaagtc-tggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtaaggctccatacaata 12006398  T
Q  368 caccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| |||||    
T  12006397 caccaataatggtgggaccc-cttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgtgttgccctt 12006329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 257 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 22861844 - 22861680
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| |    |||||||    
T  22861844 gggtaaccttggcacaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaagcagtctcttgtgtaaaacaa---gtaagac 22861748  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 427  Q
    |||  |||||||| ||||  ||||||||||| || | |||||||||  |||||||||||| ||||||||||    
T  22861747 tgctcacaatacatcaaa--tggtgggacccctt-ctcgaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccg 22861680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 283 - 438
Target Start/End: Original strand, 1405170 - 1405322
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |  ||||| | ||||||| || |||||  |||||||||||||||  |||||||||    
T  1405170 ttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttatataaaaaatagagtaagtttgcgtacaatacacc--aaatggtgg 1405267  T
Q  383 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  1405268 gaccc-tttcctgaaccctgcatatgcgggagctctagtacaccggattgcccttt 1405322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 303 - 429
Target Start/End: Original strand, 43574609 - 43574732
Alignment:
Q  303 ggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctg 402  Q
    ||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||  ||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  43574609 ggtcacgtgttcaagtcctggaaacaatctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgcgtacaatatacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctg 43574705  T
Q  403 tgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
     ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  43574706 cgtatgcgggagctttagagcaccggg 43574732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 276 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28516593 - 28516433
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||| | |||    
T  28516593 ggtaaagttgttgtcaggtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacatcctcttgtgtaaaaaacaggctagggctgcgtacaatacatc-aaa 28516495  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||  |||||  |||||| | |||| |||||| ||||| ||| |||| ||||||    
T  28516494 atggtgggaccc-attcccagaccctgcgcatgcaggagctttagtggaccaggttgcccttt 28516433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 292 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 42924977 - 42924840
Alignment:
Q  292 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccctttt 391  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |   |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| | || ||     
T  42924977 tgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacaccaaaaatgatggaatcccttc 42924878  T
Q  392 cccga-accctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    || || |||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  42924877 ccagacaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccgg 42924840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 275 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 19143102 - 19142956
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  19143102 tggtaaaattgttgtcacgtgactaaaatgccacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcgtacagtacacc--a 19143006  T
Q  375 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 425  Q
    |||||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||| | ||||||||    
T  19143005 aatggtgggaccc-cttcccggaccatgcgtatgcgggagatttagtgcac 19142956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 415
Target Start/End: Original strand, 2838733 - 2838890
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactg-aaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||   |||| ||  |||||||| |||||||||||||    
T  2838733 aggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaaggtcacgaggtcaagtctcagaaacagcatcttgtgt-aaaaacagggtaa 2838831  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc 415  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||| || |||||| ||||||||||||    
T  2838832 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttctcggaccctgcgtatgcgggagc 2838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 263 - 429
Target Start/End: Original strand, 39301087 - 39301249
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |  |||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  39301087 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgttactgaaaggtcacgggttcaagtcttgggaacaacctcttgtgtataaaacagggtaaggatgcgta 39301185  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
     ||| ||||||||| ||||||||||  |||||| |||||  ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  39301186 taatgcaccaaaaa-ggtgggaccc-cttcccggaccctccgtatgtgggag-tttagtgcaccggg 39301249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 209086 - 208936
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||| || |  |||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||||||| |||    
T  209086 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacaagttcaagtcctggcaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcattcaatacacc-aaa 208989  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    ||||||||||||  |||| | |||||| ||||||  ||||| ||||||||||||    
T  208988 atggtgggaccc-cttcctggaccctgggtatgcaagagctttagtgcaccggg 208936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 284 - 434
Target Start/End: Original strand, 1850624 - 1850770
Alignment:
Q  284 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggg 383  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||  ||||  ||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1850624 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaataacctcttgtgt-aaaaacagaataagggtgcgtacaatacatc--aaatggtggg 1850720  T
Q  384 acccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacc 434  Q
    | ||  |||| | |||||| | |||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  1850721 a-ccacttcctggaccctgcggatgcggaagctttagtgcaccggattacc 1850770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16880751 - 16880645
Alignment:
Q  331 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggt 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||  |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16880751 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgtga-ccacttcccggaccatgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggt 16880655  T
Q  431 taccctttat 440  Q
    | ||||||||    
T  16880654 ttccctttat 16880645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 319 - 437
Target Start/End: Original strand, 20135623 - 20135740
Alignment:
Q  319 cctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat 418  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  ||||| ||||||      
T  20135623 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcaggagcttc 20135721  T
Q  419 agtgcaccgggttaccctt 437  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  20135722 agtgcaccgggttgccctt 20135740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 440
Target Start/End: Original strand, 30006285 - 30006462
Alignment:
Q  260 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 359  Q
    |||| ||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||| |  ||||| | |||| ||||||||||| |||     
T  30006285 taacattggcgcaactgataaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcatagattcaagtccggaaaacaacctcttatataaacaacagggtaaggctgt 30006384  T
Q  360 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    ||||| |||||   ||||||||||||||  ||||||   ||| |||||||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  30006385 gtacattacac--taaatggtgggaccc-cttcccggggcctatgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccttttat 30006462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 295 - 354
Target Start/End: Original strand, 22025538 - 22025597
Alignment:
Q  295 gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  22025538 gactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 22025597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 259 - 374
Target Start/End: Original strand, 31299591 - 31299705
Alignment:
Q  259 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 358  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||  ||||||||||| |||| || ||||||| |  ||||||| |||| ||||    
T  31299591 gtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttacaggtcactagttcaagtcctagaaacagcctcttgtat-taaaacagtgtaaaactg 31299689  T
Q  359 cgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||||||| ||||    
T  31299690 cgtacaatacatcaaa 31299705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 315 - 431
Target Start/End: Original strand, 7368413 - 7368524
Alignment:
Q  315 aagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 414  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  || |||||||||||  |||||| ||||||  |||| |||||    
T  7368413 aagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc--aattggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgtgggag 7368507  T
Q  415 ctatagtgcaccgggtt 431  Q
    || ||||||||||||||    
T  7368508 ctctagtgcaccgggtt 7368524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 29334415 - 29334531
Alignment:
Q  320 ctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctata 419  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||| || ||    
T  29334415 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc-agaatggtgggaccc-attcccggaccctgcgtatgtgggatcttta 29334512  T
Q  420 gtgcaccgggttacccttt 438  Q
     ||||||||| | ||||||    
T  29334513 atgcaccgggctgcccttt 29334531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 7097863 - 7097772
Alignment:
Q  331 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  7097863 ctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacaccaaa--tggtgagacccctt-cccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 7097772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 346 - 441
Target Start/End: Complemental strand, 34154903 - 34154811
Alignment:
Q  346 cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttata 441  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||  ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  34154903 cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcggtagctctagtgcaccgggttgccctttata 34154811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 438
Target Start/End: Original strand, 3771324 - 3771474
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtg 381  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| |||| ||||| || ||| |||||   |||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||   |||||    
T  3771324 ttgttctcacgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcatgtaaacagtct---gtgtaaaaaaacagggtaaggctgtgaacaatacaccaat--tggtg 3771418  T
Q  382 ggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||| || |||| || ||||||||| ||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  3771419 ggacccctt-cccggactctgtgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 3771474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22908014 - 22907915
Alignment:
Q  285 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| || |||||||||| ||||||| |||||  ||| |||||||||||  |||||||||||    
T  22908014 gttgttatgtgactgaaaggtcaagggttcaagtccaagaaacagcctcttgtgta-aaaacagagtaaggttgcatacaatacacc--aaatggtggga 22907918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34074714 - 34074623
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||| || |||||||||||||||||  |||||  ||||| ||||||||||||    
T  34074714 ttgttgtcacatgactgaaaggtcacaagttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacacagtaaggttgcgttcaatacaccaaa 34074623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 272 - 326
Target Start/End: Original strand, 17419886 - 17419940
Alignment:
Q  272 aactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 326  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  17419886 aactggtaaaattgttgtaatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcctggaaa 17419940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 24903855 - 24903758
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||| |||  ||||||||| ||| || || |||||||||||| ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  24903855 ggtaaatttgttgtcacgtgactgaaaagtcatgggcacaagtcctgaaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaagattgtgtacaatccaccaa 24903758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 360 - 438
Target Start/End: Original strand, 16957374 - 16957449
Alignment:
Q  360 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16957374 gtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 16957449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 263 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39079937 - 39079875
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 326  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  39079937 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacagaaaggtcacgggttcaagtcttggaaa 39079875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 253 - 310
Target Start/End: Original strand, 19438702 - 19438759
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg 310  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||    
T  19438702 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactaaaagatcacgg 19438759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 373
Target Start/End: Original strand, 41425952 - 41426021
Alignment:
Q  304 gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |   | ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  41425952 gtcacgggttcaagttctggaaacaacttattgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaa 41426021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 366 - 438
Target Start/End: Original strand, 25622524 - 25622595
Alignment:
Q  366 tacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  25622524 tacaccaataatggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 25622595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Original strand, 32354214 - 32354262
Alignment:
Q  390 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32354214 ttcccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 32354262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 283 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 10634298 - 10634227
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |  ||| |||| ||||| |||||||||    
T  10634298 ttgttgtcaagtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctagaaacaacctcgtgtgcaaaaatcagggtaag 10634227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 318 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 12575779 - 12575658
Alignment:
Q  318 tcctggaaatagtctcttgtgtaaa-aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    ||||||||| || |||||| ||||| ||||||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||| | |||||| |||||| ||||||    
T  12575779 tcctggaaacagcctcttgcgtaaataaacaggctaaagttgcgtacaatacacc-aaaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcgtatgcaggagct 12575682  T
Q  417 atagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
     | |||||||||| | ||||||||    
T  12575681 ttggtgcaccgggctgccctttat 12575658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24323862 - 24323727
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 377  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||  ||||    
T  24323862 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactcc--aaat 24323765  T
Q  378 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
     |||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  24323764 agtgggaccc-cttcccagaccctgtatatgcgggagct 24323727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 278 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24360486 - 24360351
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 377  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||   |||||||| ||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||||| ||  ||||    
T  24360486 taaagttgttatcgtgtgactgaaatgtcaaatgttcaagttctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaagcttgcgtataatactcc--aaat 24360389  T
Q  378 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
     |||||||||  |||||  ||||||| ||||||||||||    
T  24360388 agtgggaccc-cttcccagaccctgtatatgcgggagct 24360351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 31694266 - 31694172
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 371  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||| || ||| |||| || |||||||||| ||| |||  |||| |||||||||||    
T  31694266 gtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcataggttcaagtcttgaaaaaagtcactcgtgtaaaaaataggctaaagctgcatacaatacacc 31694172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 280 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9794514 - 9794472
Alignment:
Q  280 aaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctg 322  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  9794514 aaattgttgtcatgtgatcaaaaggtcacgggttcaagtcctg 9794472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 275 - 337
Target Start/End: Original strand, 18698586 - 18698648
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgt 337  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| ||| ||| || |||||||    
T  18698586 tggtaaaatggttgtcacgtgattgaacggtcacgggttcaagtactgaaaacagcctcttgt 18698648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 316
Target Start/End: Complemental strand, 31362495 - 31362454
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaa 316  Q
    ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31362495 tggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacgggttcaa 31362454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 342 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 9794471 - 9794439
Alignment:
Q  342 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9794471 aaaacagggtaagactgcatacaatacaccaaa 9794439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16028672 - 16028624
Alignment:
Q  390 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16028672 ttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 16028624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 128; Significance: 6e-66; HSPs: 69)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 6e-66
Query Start/End: Original strand, 255 - 438
Target Start/End: Original strand, 10543653 - 10543835
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  10543653 aggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacggcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 10543752  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10543753 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10543835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 254 - 440
Target Start/End: Original strand, 14530272 - 14530457
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  14530272 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaa 14530371  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  14530372 ggctacgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttat 14530457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 255 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24200805 - 24200623
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  24200805 aggggtaaccttgatgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24200706  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||| | ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24200705 gctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaacc-cttcccggaccctgagtatgtgagagctttagtgcaccgggttgcccttt 24200623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8455498 - 8455316
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  8455498 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaacacagggta 8455399  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  8455398 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgccggagctttagtgcaccgggttgcccttt 8455316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 256 - 438
Target Start/End: Original strand, 11514392 - 11514570
Alignment:
Q  256 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||  |||||     
T  11514392 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaactcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaagtaagg 11514491  T
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  11514492 ctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc--ttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 11514570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 21779440 - 21779261
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||  ||||||||||||    
T  21779440 gaggggtaaccttggcgcaactggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggagacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 21779343  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  21779342 ggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 21779261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 257 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25249915 - 25249738
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||| |    
T  25249915 gggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtctcttgtgt-acaaacagggtaaggc 25249817  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25249816 tgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccgaaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcaccgggttgcccttt 25249738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 12024102 - 12023969
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||    
T  12024102 ttagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacaggg 12024004  T
Q  351 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12024003 taaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc 12023969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 9671134 - 9671314
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgact-gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  9671134 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaatgtcacgggttcaaatcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 9671231  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  9671232 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 9671314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 252 - 381
Target Start/End: Original strand, 7214486 - 7214615
Alignment:
Q  252 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 351  Q
    |||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  7214486 tagaggggtaactttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaatacagggt 7214585  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtg 381  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  7214586 aaggctgcgtacaatacacaaaaaatggtg 7214615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 271 - 438
Target Start/End: Original strand, 17667973 - 17668137
Alignment:
Q  271 caactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17667973 caactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaagaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17668072  T
Q  371 caaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |  ||||||||| ||||  ||| ||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  17668073 c--aaatggtggaaccc-cttctcgaaccctgcgtatatgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 17668137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 440
Target Start/End: Original strand, 23397720 - 23397901
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||  |||| |||||||    
T  23397720 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaatagggtaa 23397817  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    | || |||||||||||||  ||||||||||||||  ||| || |||||   |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  23397818 ggctacgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttctcggaccctacatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccctttat 23397901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 256 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19977893 - 19977714
Alignment:
Q  256 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 355  Q
    |||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||| ||| ||||     
T  19977893 ggggtaaccttggcggaactggtgaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttttgtaaaaaataggataagg 19977794  T
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  19977793 ttgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccgaaccttgtgtatgcgggagctttagtgcaccagattacccttt 19977714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 5840982 - 5841165
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||||  |||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || || |||||||||||| |||||||    
T  5840982 gaggggtaaccttggtgcaaatgataaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccttttgtgtaaaaaatagggtaa 5841081  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |  ||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  5841082 ggatgcgtacaatacatcaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 5841165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 255 - 444
Target Start/End: Original strand, 14544018 - 14544207
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgta-aaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||| || || ||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  14544018 aggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacaggtccaggtactggaaacagcctcttgtgtagaaaaacagggtaa 14544117  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatatgt 444  Q
    |||||||| |||||  | ||||||||| ||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||    
T  14544118 gactgcgtgcaataaccaaaaaatggtcggaccc-cttccgggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaagttgccctttatatgt 14544207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25079899 - 25079717
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-aaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| |  ||||||||||| |||||| ||||    
T  25079899 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcttagaaacaacctcttgtgtaaaaaaacaaggta 25079800  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||  |||||||||||||||   |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25079799 aggatgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcaagagctttagtgcaccgggttgcccttt 25079717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 291 - 438
Target Start/End: Original strand, 10546153 - 10546298
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccctt 389  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||      
T  10546153 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacatcctcttgtataaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-c 10546249  T
Q  390 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10546250 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10546298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 256 - 438
Target Start/End: Original strand, 17896215 - 17896395
Alignment:
Q  256 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||| |  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  17896215 ggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaaatagggtaag 17896314  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
     |||||||||||| |||  ||||||||||||||  ||| || |||||| ||||| ||||||| ||||||| || ||| ||||||    
T  17896315 gctgcgtacaatatacc--aaatggtgggaccc-cttctcggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcatcgagttgcccttt 17896395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 260 - 438
Target Start/End: Original strand, 27573581 - 27573755
Alignment:
Q  260 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 359  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||| | ||||| |||||| ||||    
T  27573581 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcattggttcaagtccgggcaacagcctcttgtgt-ataaacatggtaaggctgc 27573679  T
Q  360 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||| || |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  27573680 gtacaatacacc--aaatggt-ggaaccatttcccaaaccctgtgtatgtgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 27573755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 271 - 438
Target Start/End: Original strand, 17623535 - 17623699
Alignment:
Q  271 caactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  17623535 caactggtaaagttgttgtcatgcgactggaaggtcacgggttcaagtcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggctgcgtacaatacac 17623634  T
Q  371 caaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |  ||||||||| ||||  |||||||| |||| ||||| || |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  17623635 c--aaatggtggaaccc-cttcccgaatcctgcgtatgtggaagctttagtgcactgggttgcccttt 17623699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 254 - 407
Target Start/End: Original strand, 22371011 - 22371158
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || ||| |||   |||||||||||||    
T  22371011 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttgtcatgtgactgggaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcgtgt---aaaaacagggtaa 22371107  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtat 407  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  22371108 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgtgtat 22371158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 289 - 426
Target Start/End: Original strand, 19614981 - 19615116
Alignment:
Q  289 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccct 388  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  |||     
T  19614981 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccttgaaacatcctcttgtataaaaaacagggtaagactgcgtacaatataccaataatagtggacccc- 19615079  T
Q  389 tttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
     ||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  19615080 -ttcccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcacc 19615116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 291 - 438
Target Start/End: Original strand, 14444720 - 14444863
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 390  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| |||||||  ||||||||||||||  |    
T  14444720 atgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgtgtacgatacacc--aaatggtgggaccc-ct 14444815  T
Q  391 tcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  14444816 tcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 14444863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 254 - 372
Target Start/End: Original strand, 17705449 - 17705567
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  17705449 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaacaacagagtaa 17705548  T
Q  354 gactgcgtacaatacacca 372  Q
    | ||| |||||||||||||    
T  17705549 ggctgtgtacaatacacca 17705567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 255 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 32781467 - 32781310
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||  ||||||||||||| |||||||||  ||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  32781467 agggggaaccttggcgcaa-tggtaaagttgttgcaatgttgctgaaaggtcacgagttcaagtctcggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 32781369  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  32781368 actgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgtgtatgcgggagct 32781310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 278 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31158598 - 31158451
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 377  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  ||| || |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  31158598 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttaaagtcttcaaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaagattgcatacaataaaccaaaaat 31158499  T
Q  378 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    ||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  31158498 ggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtacacc 31158451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 40417031 - 40416869
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||| |||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||     
T  40417031 tggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaaacagggaaaggctgtgtacaatacaccaat 40416932  T
Q  375 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
      || ||||||||||||   || |||||  |||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  40416931 --tgatgggacccttttttgga-ccctgcatatgcgagagctttagtgcaccgggttgccctttat 40416869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 21377232 - 21377095
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  ||    
T  21377232 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacgagttcaagtcatagaaacatcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgggtacaatgcacc--aa 21377135  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  21377134 atggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgtgggagct 21377095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 39914472 - 39914306
Alignment:
Q  269 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-aaaacagggtaagactgcgtacaata 367  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  || ||||||||    
T  39914472 cgcatctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggatcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggatgtgtacaata 39914373  T
Q  368 caccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||   ||||||||||||| ||  ||  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  39914372 cacc--gaatggtgggacccctt--cctgaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 39914306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 374
Target Start/End: Original strand, 5450263 - 5450360
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5450263 taaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 5450360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 254 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 26684803 - 26684630
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatag-tctcttgtgt-aaaaaacagggt 351  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||| |||||||| ||| ||  ||||||||| |||||| | |||    
T  26684803 gaggggtaactttagcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcaaaggtttaagtcctgaaaacagacctcttgtgtaaaaaaatatggt 26684704  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    ||| |||||||||||| ||   ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  26684703 aaggctgcgtacaatatac--taaatggtggga-cctcttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttaatgcaccgg 26684630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 422
Target Start/End: Complemental strand, 99421 - 99281
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 376  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||  |||||||| || ||| |||||||||||||||||||      
T  99421 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgt--aaaaaacatggcaaggctgcgtacaatacaccaaa-- 99326  T
Q  377 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtg 422  Q
    |||||| |||| ||  | || ||||||||||||||||||| |||||    
T  99325 tggtggaaccccttctcaga-ccctgtgtatgcgggagctttagtg 99281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23145857 - 23145745
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||    
T  23145857 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacacc--aa 23145760  T
Q  376 atggtgggacccttt 390  Q
     ||||||||||||||    
T  23145759 ttggtgggacccttt 23145745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 23557647 - 23557535
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||  ||    
T  23557647 ggtaaagttgttgtagcgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagactcttgtgtaaaaaacagtgtaaggctgcgtacaatacacc--aa 23557550  T
Q  376 atggtgggacccttt 390  Q
     ||||||||||||||    
T  23557549 ttggtgggacccttt 23557535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Original strand, 33795261 - 33795398
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac-aatacaccaaa 374  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||       
T  33795261 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcccggaaacaacctcttgggtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaaatacacc--- 33795357  T
Q  375 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
     ||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||    
T  33795358 tatggtgggaccc-cttcccagaccctgtgtatgcgggagct 33795398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 264 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 24860157 - 24859998
Alignment:
Q  264 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 363  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||| |||||||| |  |||| ||||||||| || |||| | ||||||||    
T  24860157 cttggcgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactggaaggttacgggtttaagccctggaaacaacctctggtgtaaaaa-catggtagg-ctgcgtac 24860060  T
Q  364 aatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    |||||||||||  |||| | |||| || | || |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  24860059 aatacaccaaa--tggtagaacccctt-ctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 24859998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 428
Target Start/End: Original strand, 25641487 - 25641626
Alignment:
Q  285 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | ||||||  ||||||||||||   |||||||||||||||  |||| ||||||    
T  25641487 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcattttgtgt-gaaaacagggtaaagttgcgtacaatacacc--aaattgtggga 25641583  T
Q  385 cccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    |||  |||||||| |||| ||||||| ||||| ||||| |||||    
T  25641584 ccc-cttcccgaatcctgcgtatgcgagagctttagtgaaccgg 25641626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 263 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 4516522 - 4516360
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||   ||||||| || |||| || |||||||||||||||||||| ||  |||||||    
T  4516522 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacatattcaagttctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggcaacgctgcgta 4516424  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    |||||||||  || |||||||||||  |||||| |||||| ||||| || |||| ||||| ||||||    
T  4516423 caatacacc--aattggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtggaagctttagtgtaccggg 4516360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40762349 - 40762234
Alignment:
Q  320 ctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctata 419  Q
    ||||||| || |||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||  |||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| ||||||| ||    
T  40762349 ctggaaacagcctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctacgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-tttcctggaccctgcgtatgtgggagcttta 40762253  T
Q  420 gtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  40762252 gtgcaccgggttgcccttt 40762234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 29420048 - 29419945
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga----ctgcgtacaatacacc 371  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||    
T  29420048 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagtaaggctgcgtacaatacacc 29419949  T
Q  372 aaaa 375  Q
    ||||    
T  29419948 aaaa 29419945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 316 - 438
Target Start/End: Original strand, 36871509 - 36871626
Alignment:
Q  316 agtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc 415  Q
    ||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| || || ||  |||| ||||||||||||    
T  36871509 agtcctggaaacagcctcttgtgtgaaaa-cagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccccttcccgga--cctgcgtatgcgggagc 36871603  T
Q  416 tatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | |||||||||||||| ||||||    
T  36871604 tttagtgcaccgggttgcccttt 36871626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 349
Target Start/End: Original strand, 17472926 - 17473020
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagg 349  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| || ||||||||||||||||    
T  17472926 aggggtaaccttgacgcaactaataaagttgttgtcaaatgattgaaaggtcacgggttcaggtcttagaaatagcctattgtgtaaaaaacagg 17473020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 276 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44521532 - 44521434
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||| || |||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||| || |||||||||||    
T  44521532 ggtaaagttgttatcacgtgactgaaaggtcacgcgttcaaatcttggaaacaatctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggctgcatataatacaccaaa 44521434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 275 - 438
Target Start/End: Original strand, 44643497 - 44643658
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| || |||||  || ||||||||| ||||| |||||||||||  |||      
T  44643497 tggtaaagttgtcatcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagttctagaaagagcctcttccgtaaaaaaacagagtaaggctgcgtacaatgtacc-- 44643594  T
Q  374 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||  |||||||||||| | ||||||    
T  44643595 aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgcgggagccttagtgcaccgggctgcccttt 44643658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 31821491 - 31821355
Alignment:
Q  285 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 384  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| || |   ||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||  ||||| |||||    
T  31821491 gttgttatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcgtagaaacagccg--tgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtacaatacacc--aaatgatggga 31821396  T
Q  385 cccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    ||| ||| ||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  31821395 ccccttt-ccgaaacctgtgtatgcgggagctttaatgcacc 31821355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 272 - 355
Target Start/End: Original strand, 44604826 - 44604908
Alignment:
Q  272 aactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 355  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||||    
T  44604826 aactgctaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaaacagggtaaga 44604908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 335 - 438
Target Start/End: Original strand, 25632544 - 25632644
Alignment:
Q  335 tgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacc 434  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||  |  |||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  25632544 tgtgtaaaaaacaggataaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggattc-cttcccgaaccttacgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcc 25632640  T
Q  435 cttt 438  Q
    ||||    
T  25632641 cttt 25632644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 45235976 - 45235867
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaa-aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||| || |||||||| || |||  |||||||  |||    
T  45235976 gtaaagttgttctcatgtgactgaaagatcacgagttcaagtcctagaaacagtctcttctgtaaaataatagggtaaggctacgtgtaatacac--aaa 45235879  T
Q  376 atggtgggaccc 387  Q
    ||||||||||||    
T  45235878 atggtgggaccc 45235867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 17380388 - 17380298
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |  ||||||||| | ||||||||||||  || || ||||||||||||    
T  17380388 ttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgt-ataaacagggtaaggttgtgtgcaatacaccaaa 17380298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 438
Target Start/End: Original strand, 4795730 - 4795890
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||| |||||  ||| ||||| || ||| || ||| || |||||||| || | | ||||||||| ||||||||| |||    
T  4795730 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaagtcacttgttgaagtcttgaaaacagcctcatgcgtaaaaaaacaagattagactgcgtgcaatacacc-aaa 4795828  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||| |||||||  ||||| ||||||    
T  4795829 atggtggga-ccttttcccggaccttgtgtatgccgaagctttagtgcagtgggttgcccttt 4795890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 294 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 2003678 - 2003597
Alignment:
Q  294 tgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || | |||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  2003678 tgactgaaaggtcacgggtacaagtcctggaaacagccccttgcgtaaaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacaacaaa 2003597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 354 - 431
Target Start/End: Original strand, 23488535 - 23488611
Alignment:
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23488535 gactgcgtgcaatacacaaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtt 23488611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 299 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12315787 - 12315713
Alignment:
Q  299 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12315787 gaaaggtcacgagttcaagtcatggaaacagcttcttat-taaaaaacagggtaagactgtgtacaatacaccaaa 12315713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 309 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 15296533 - 15296467
Alignment:
Q  309 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  15296533 gggttcaagtcccggaaacagcctgttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatataccaaaa 15296467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 254 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 39189602 - 39189556
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactga 300  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39189602 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactga 39189556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 258 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 4852388 - 4852304
Alignment:
Q  258 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 345  Q
    ||||||||||  |||||||| |||   ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  4852388 ggtaaccttggtgcaactggcaaa---gttgtcatgtgaccgaaaagtcaggggttcaagtcctgcaaacagtctcttgtgaaaaaaa 4852304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 296 - 428
Target Start/End: Original strand, 17471544 - 17471675
Alignment:
Q  296 actgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttccc 394  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||   |||| || ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||| |||||| || |||||  |||||    
T  17471544 actgaaatgtcacaggttcaagtctcagaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaggataagactgcgtacaatatacc-aaaatgatgagaccc-cttccc 17471641  T
Q  395 gaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
      ||||||  |||||||||| | |||||||||||    
T  17471642 tgaccctgcctatgcgggagttttagtgcaccgg 17471675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 438
Target Start/End: Original strand, 22371195 - 22371247
Alignment:
Q  386 ccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  22371195 ccttttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 22371247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 27466312 - 27466262
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaag 303  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27466312 agaggcgtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaag 27466262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 376 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 40579810 - 40579750
Alignment:
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  40579810 atggtgggacccctt-cccggaccctgagtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 40579750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 322
Target Start/End: Original strand, 35017781 - 35017840
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgact-gaaaggtcacgggttcaagtcctg 322  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  35017781 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgacttgaaaggtcacgggtttaagtcctg 35017840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 388 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 124964 - 124921
Alignment:
Q  388 ttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  124964 ttttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 124921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 260 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15896416 - 15896350
Alignment:
Q  260 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 326  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || || |||| | ||| ||||| ||||||    
T  15896416 taacgttgatgcaactggtaaaattgttgtcatgtgattggaatgtcaagagttgaagtcttggaaa 15896350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 357 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 19185823 - 19185742
Alignment:
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||| || || | |||||| ||||||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  19185823 tgcgtacaatgcacaaaaaatggtggaacccctt-cctggaccctgcgtatgcgggagctttagtacatcgagttacccttta 19185742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 340 - 425
Target Start/End: Original strand, 24890451 - 24890533
Alignment:
Q  340 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 425  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||  |||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  24890451 aaaaaacaaggtaaggctgcatacaatacacc--aattggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcaggagctttagtgcac 24890533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 315 - 426
Target Start/End: Original strand, 30826052 - 30826158
Alignment:
Q  315 aagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 414  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||  ||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| ||||||  |||  |||||   ||||||||||    
T  30826052 aagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaat-agggtaaggttgcgtacaatacaccaaa--tggtggaaccctt--cccagaccctacatatgcgggag 30826146  T
Q  415 ctatagtgcacc 426  Q
    || |||||||||    
T  30826147 ctttagtgcacc 30826158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 34752820 - 34752771
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 326  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  34752820 gtaaacttgttatcatgtgactgaaaggtcacgaattcaagttctggaaa 34752771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 438
Target Start/End: Original strand, 34766330 - 34766390
Alignment:
Q  377 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  34766330 tggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggtttcccttt 34766390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 341 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 39499324 - 39499242
Alignment:
Q  341 aaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga-cccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    ||||| |||||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  39499324 aaaaatagggtaaagctgcgtacaatacatcaaa--tggtgggatcccttttc--gaatcctgcgtatgcgggagctttagtgcacc 39499242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29356039 - 29355855
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaa-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  29356039 gaggggtaaccttggcacaactggtaaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggta 29355940  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  29355939 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 29355855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 264 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12222088 - 12221914
Alignment:
Q  264 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 363  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12222088 cttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 12221989  T
Q  364 aatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc-tatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  12221988 aatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 12221914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 1346918 - 1347097
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||  ||||||||||||    
T  1346918 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccacttgtgt--aaaacagggtaa 1347015  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1347016 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1347097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1354936 - 1354757
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  1354936 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 1354839  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1354838 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1354757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 256 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 3815256 - 3815084
Alignment:
Q  256 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 355  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||| | |||| ||    
T  3815256 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagactattgtgtaaaaaatatggtacga 3815157  T
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  3815156 ctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-tttcccgaaccctacgtatgcggaagctttagtgcaccgggtt 3815084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 9161077 - 9161259
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||| ||||    
T  9161077 gaggggtaaccttgacgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagagtaa 9161175  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | |||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||| || |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  9161176 ggctgcgtacaatacatcaataatggtgggaccc-cttctcggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcaccaggttgcccttt 9161259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 259 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2166587 - 2166410
Alignment:
Q  259 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 358  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  2166587 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2166489  T
Q  359 cgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2166488 cgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 2166410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 259 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 2178220 - 2178043
Alignment:
Q  259 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 358  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  2178220 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 2178122  T
Q  359 cgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||| | ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  2178121 cgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctatatattcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 2178043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 251 - 386
Target Start/End: Original strand, 6024184 - 6024319
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 350  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||| |||| || ||||||||||||||||| ||    
T  6024184 ttagaggggtaattttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggaaggtcacggtttcaaatcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacatgg 6024283  T
Q  351 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacc 386  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  6024284 taagactgcgtacaatacaccaataatgatgggacc 6024319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 254 - 368
Target Start/End: Original strand, 8409197 - 8409311
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  8409197 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctggaaactgcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 8409296  T
Q  354 gactgcgtacaatac 368  Q
    | |||||||||||||    
T  8409297 ggctgcgtacaatac 8409311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 252 - 427
Target Start/End: Original strand, 20400619 - 20400791
Alignment:
Q  252 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 351  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  20400619 tagagaggtaaccttggcgcaattggtatagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagttatggaaacaatctcttgtgtaaaaaacagggt 20400718  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 427  Q
    ||||||||||||| |||||   |||| | ||||||||||| |||||||||  |||||| | | || ||||||||||    
T  20400719 aagactgcgtacagtacac--taaatagcgggaccctttt-ccgaaccctacgtatgcagaaactttagtgcaccg 20400791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 270 - 417
Target Start/End: Original strand, 14553482 - 14553627
Alignment:
Q  270 gcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaataca 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||    
T  14553482 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgact-aaaggtcacaggttcaagtcctggaaatagcttcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtataataca 14553580  T
Q  370 ccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagcta 417  Q
    |||||| |||||||||||  |||    |||||||||||||||||||||    
T  14553581 ccaaaactggtgggaccc-cttcgtagaccctgtgtatgcgggagcta 14553627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 15866218 - 15866052
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||  ||||||||||||||||    
T  15866218 gaggggtaaccttggcccaactggtaaagttgttggcatgtgattgaaaggtcatgggttcaattcctggaaacagcctcttaagtaaaaaacagggtaa 15866119  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 425  Q
      ||||||  ||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| || ||||||| |||||||||||    
T  15866118 agctgcgt--aatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtttgcgggatctatagtgcac 15866052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 292 - 439
Target Start/End: Original strand, 17432332 - 17432484
Alignment:
Q  292 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga------ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggac 385  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||       ||| ||||||||||| |||||||||| |||    
T  17432332 tgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaagggtaaggctgtgtacaatacactaaaaatggtgagac 17432431  T
Q  386 ccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    | |||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17432432 c-ttttcccggatcctgtgcatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 17432484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 255 - 407
Target Start/End: Complemental strand, 13905158 - 13905011
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||    ||||||||||||||||||||||||    
T  13905158 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggctcaagtcctgaaaacgacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 13905060  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtat 407  Q
     |||| |||||| ||||  ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||    
T  13905059 gctgcatacaattcacc--aaatggt-ggaccc-tttcccgaaccctgcgtat 13905011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 254 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 14975261 - 14975097
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||       
T  14975261 gagggataaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaagg--- 14975165  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
             ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| | ||||||||||||||    
T  14975164 ---------caatacaccaataatggtgggaccc-cttcccgaaccccgcatatgcgggagttttagtgcaccgggtt 14975097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 254 - 387
Target Start/End: Original strand, 1941809 - 1941940
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||| || ||||| || ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  1941809 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatctgactggaaggtcgcggattgaagtcatgtaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 1941908  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  1941909 ggctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccc 1941940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 305 - 427
Target Start/End: Original strand, 33138838 - 33138957
Alignment:
Q  305 tcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtg 404  Q
    |||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  33138838 tcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtataaaaaacagagtaaggccgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccctttt-ccggaccctgtg 33138934  T
Q  405 tatgcgggagctatagtgcaccg 427  Q
    ||||| | |||| ||||||||||    
T  33138935 tatgcagtagctttagtgcaccg 33138957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 7947514 - 7947384
Alignment:
Q  293 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttc 392  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||    
T  7947514 gtgactgaaaggtcaccggttcaactcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaccagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaaatggtggg-cccccttc 7947417  T
Q  393 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 425  Q
    ||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  7947416 ccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcac 7947384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 257 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 32728334 - 32728217
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    |||||||||||  | |||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||  |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32728334 gggtaaccttggtggaacgagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacagattcaagttttggaaacaacctcttatgtaaaaaacagggtaagac 32728235  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    || |||||||| ||||||    
T  32728234 tgtgtacaatataccaaa 32728217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 257 - 345
Target Start/End: Original strand, 12063424 - 12063512
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 345  Q
    |||||||||||  ||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||    
T  12063424 gggtaaccttggtgcaactgataaagttgttatcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaatagcctcttgtataaaaaa 12063512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 440
Target Start/End: Original strand, 12889402 - 12889564
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||| || ||||||||| |||||||||| ||| |||| |||||||||||  ||    
T  12889402 ggtaaagttgttgtcacgtgagtgaaaggtcacaggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgttaaaaacagggcaaggctgcatacaatacacc-taa 12889500  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    | | |||||||| ||| ||| ||||| ||| || ||||||| ||||||| |||| | ||||||||    
T  12889501 acgatgggaccccttt-ccggaccctctgtgtgtgggagctttagtgcatcgggctgccctttat 12889564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 278 - 438
Target Start/End: Original strand, 28007604 - 28007760
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgac-tgaaa-ggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||  ||    
T  28007604 taaagttgttgtcatgtgacatgaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaagagcctcttgtgt--aaaacagggtcaggctgcgtacaatacacc--aa 28007699  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||| ||||||||  ||||| || |||   ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  28007700 atgctgggaccc-cttccctaa-cctccatatgcggaagctctagtgcaccggattacccttt 28007760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 271 - 422
Target Start/End: Original strand, 24097552 - 24097696
Alignment:
Q  271 caactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 370  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||    ||    
T  24097552 caactggtaaaattgatgtcatgttactgaaaggtcacgagtttaagtcctcgaaccagcctcttgtataaaaaacagggtaaggctgcttaca----ac 24097647  T
Q  371 caaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtg 422  Q
    |  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| |||| |||||    
T  24097648 c--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtg 24097696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 23930308 - 23930127
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggtt-caagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 351  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||||  |||||||||||| || |||||||||| ||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||||| | |    
T  23930308 agagaggtaaccttggcgcaactcataaagatgttgtcatgtgtctcaaaggtcacgagttccaagtcatggaaacagtctcatgtgtaaaaaacaagat 23930209  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |    |||||||||||||||  | ||||||||||||  ||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  23930208 a--gttgcgtacaatacacc--agatggtgggaccc-cttcacggaccctgcttatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 23930127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 253 - 387
Target Start/End: Original strand, 24734586 - 24734729
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt---------aaaa 343  Q
    |||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| |||| |  |||||||||         ||||    
T  24734586 agagaggtaacattggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaaaagttcaaatccttgaaacaacctcttgtgtaaaaaaaaaaaaa 24734685  T
Q  344 aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  24734686 aacagggtaaggttgcgtacaatacaacaaaaaaggtgggaccc 24734729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 26097178 - 26097293
Alignment:
Q  318 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagcta 417  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||||  |||||| ||||||  ||||||||||||     
T  26097178 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatgaagggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctc 26097272  T
Q  418 tagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  26097273 tagtgcaccgggttgcccttt 26097293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 33923010 - 33922937
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 326  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  33923010 agaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatttgactgaaaagtcacaggttcaagtcctagaaa 33922937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 276 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 2755583 - 2755475
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||   |||||||||| || ||| |  ||||| |   ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2755583 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcgtaggttcaagtcttgcaaacatcctcttataccaaaaataggctaaggctgcgtacaatacaccaaaa 2755484  T
Q  376 atggtggga 384  Q
    |||||||||    
T  2755483 atggtggga 2755475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 23240971 - 23240886
Alignment:
Q  286 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  23240971 ttgtcacgtgactgaaaggtcacaggtgcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaagtttgcgtacaatataccaa 23240886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 18277343 - 18277243
Alignment:
Q  285 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 384  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||| |||||||||  || |||||  |||||  |||||||||||    
T  18277343 gttgtcctgtgactaaaaggtcacgggttcaaatcttggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgagtacagaacacc--aaatggtggga 18277246  T
Q  385 ccc 387  Q
    |||    
T  18277245 ccc 18277243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 356 - 438
Target Start/End: Original strand, 12885967 - 12886048
Alignment:
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12885967 ctgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12886048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 25557743 - 25557858
Alignment:
Q  318 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagcta 417  Q
    ||||||||| || |||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||  |||||  || ||||  |||||| ||||||  ||||||||||||     
T  25557743 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatgaaggaaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctc 25557837  T
Q  418 tagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  25557838 tagtgcaccgggttgcccttt 25557858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 438
Target Start/End: Original strand, 6808468 - 6808530
Alignment:
Q  375 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6808468 aatggtgggacccctt-cccggaccctgtgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 6808530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 387
Target Start/End: Original strand, 32068074 - 32068179
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 377  Q
    |||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||    ||||||||||||||||||| |||  |||  ||||||||||| |||||    
T  32068074 taaagttgttgtcacgtgaccgaaaggtcacatgttcaagtcttggaaac---ctcttgtgtaaaaaacaggataatgctgtttacaatacacc-aaaat 32068169  T
Q  378 ggtgggaccc 387  Q
    ||||||||||    
T  32068170 ggtgggaccc 32068179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 295 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 3116263 - 3116129
Alignment:
Q  295 gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttccc 394  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||| ||||||         ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |    
T  3116263 gactgaaaggtcatgggttcaagtcatggaaacaacctcttgtataaaaat--------gactgcgcacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttctc 3116173  T
Q  395 gaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||| || ||||||||||||| |||| |||||| || ||||||    
T  3116172 ggaccttgcgtatgcgggagctttagtacaccggattgcccttt 3116129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 270 - 332
Target Start/End: Original strand, 8417442 - 8417504
Alignment:
Q  270 gcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtct 332  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||| |||||    
T  8417442 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgagttcaggtcatggaaacagtct 8417504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 438
Target Start/End: Original strand, 12892064 - 12892144
Alignment:
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12892064 tgcgtataatacaccaataatggtgggacccctt-cccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12892144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 283 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 4136669 - 4136567
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    |||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||||  ||| |   |||||||||||| ||||||||||  |||||| | ||||| |||| ||||||    
T  4136669 ttgttgccacgtgactaaaatgtcacgggttcaagtcctaaaaacaacatcttgtgtaaaatacagggtaaggttgcgtagagtacactaaaattggtgg 4136570  T
Q  383 gac 385  Q
    |||    
T  4136569 gac 4136567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 344
Target Start/End: Original strand, 22967125 - 22967215
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 344  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |   |||||||||||||    
T  22967125 gaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaa 22967215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 254 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 23821268 - 23821178
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 344  Q
    |||||||||||||  |||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||| |   |||||||||||||    
T  23821268 gaggggtaaccttcgcgcatctgataaagttattgtcatgtgactgtaaggtcactagttcaagtcatggaaacaacttcttgtgtaaaaa 23821178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 24751176 - 24751134
Alignment:
Q  333 cttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24751176 cttgtgtaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacactaaaa 24751134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 27855601 - 27855500
Alignment:
Q  272 aactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-aaaacagggtaagactgcgtacaatacac 370  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||| || ||| |||||| | ||| ||  || ||||||| |||| |||||||| ||||||| |||||||    
T  27855601 aactggtaaagtttttgtcatgtgactgaaatgtcgcgagtttaagtcccgaaaacagcttcctgtgtaaaaaaatagggtaaggctgcgtataatacac 27855502  T
Q  371 ca 372  Q
    ||    
T  27855501 ca 27855500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 264 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 19649338 - 19649292
Alignment:
Q  264 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg 310  Q
    |||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19649338 cttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaagatcacgg 19649292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 304 - 344
Target Start/End: Original strand, 3564817 - 3564857
Alignment:
Q  304 gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 344  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  3564817 gtcacgagttcaagttctgaaaatagtctcttgtgtaaaaa 3564857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 438
Target Start/End: Original strand, 13267797 - 13267860
Alignment:
Q  374 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||| || || | |||||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||    
T  13267797 aaatggtgggacccctt-cctggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgcccttt 13267860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 339 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 14341166 - 14341134
Alignment:
Q  339 taaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 371  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14341166 taaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc 14341134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 310 - 421
Target Start/End: Original strand, 32579436 - 32579543
Alignment:
Q  310 ggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgc 409  Q
    ||||||||||||||||| || |||| || | ||||| | |||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||  |||||  ||||||  |||||    
T  32579436 ggttcaagtcctggaaacagcctctggtat-aaaaatacggtaagcctgcgtacaatacccc--aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcatatgc 32579531  T
Q  410 gggagctatagt 421  Q
    ||||||| ||||    
T  32579532 gggagctttagt 32579543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 77)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13628974 - 13628790
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaa-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  13628974 gaggggtaaccttggcacaactggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaagaaacagggta 13628875  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13628874 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13628790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13730787 - 13730602
Alignment:
Q  252 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  13730787 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggt 13730688  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13730687 aaggctgtgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13730602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 46421219 - 46421034
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  46421219 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 46421120  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat-agtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  46421119 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggtttgcccttt 46421034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 40272993 - 40272812
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  40272993 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 40272894  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40272893 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40272812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 254 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 8247870 - 8247688
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  8247870 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 8247771  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat-agtgcaccgggttaccct 436  Q
    |  ||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  8247770 ggttgcgtacaatacaccaataatggtgggactc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttaagtgcactgggttgccct 8247688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 255 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 29366902 - 29366720
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||    
T  29366902 aggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaag 29366803  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  29366802 gctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcactgggttgcccttt 29366720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 1217066 - 1217245
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  1217066 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgtagtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 1217163  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  1217164 ggctgcgtacaatacacc--aaatggcgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 1217245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 258 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 22123092 - 22122918
Alignment:
Q  258 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 357  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  22123092 ggtaaccttggcgccactggtaaatttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaacagggtaaggct 22122995  T
Q  358 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||| ||||| |||||||||||||| |||||    
T  22122994 gcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgagagctctagtgcaccgggttgccctt 22122918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 286 - 438
Target Start/End: Original strand, 516417 - 516569
Alignment:
Q  286 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaaaatggtggga 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||| ||||    
T  516417 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgcacaataaaccaaaaaatggcggga 516516  T
Q  385 cccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  516517 ccccttccccg-accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 516569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 254 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4495845 - 4495713
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4495845 gaggggtaaccttcgcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctgaaaatagcctattgtgtaaaaaacagggtaa 4495746  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccct 388  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4495745 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccct 4495713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5173902 - 5173719
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaa-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||  |||    
T  5173902 gaggggtaaccttggcgcaactcgtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacaaagta 5173804  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  5173803 aggttgcatgcaatacaccaaaaatggtggggccc-cttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 5173719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 254 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 7697066 - 7696948
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||    
T  7697066 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgtgt--aaaacagggtaa 7696969  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  7696968 ggctgcgtacaatacaccaaa 7696948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 437
Target Start/End: Original strand, 22609743 - 22609921
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  22609743 gaggggtaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtaacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 22609840  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  22609841 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 22609921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 439
Target Start/End: Original strand, 39203492 - 39203672
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  39203492 gaggggtaaccttggcacaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccttgaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 39203589  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  39203590 ggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccttgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 39203672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12914217 - 12914035
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  12914217 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtaatgtgaccgaaaggtcacaagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 12914118  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || | ||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||||  ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||    
T  12914117 aggcggcgtacaatacacc--aaatggtgagaccc-cttcccagaccctgcatatgcgggagcttcaatgcaccgggttgcccttt 12914035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 438
Target Start/End: Original strand, 26869698 - 26869863
Alignment:
Q  269 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  26869698 cgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctctggtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatac 26869796  T
Q  369 accaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||  ||||||||||||||  || ||| ||| || ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||    
T  26869797 acc--aaatggtgggaccc-cttgccggaccatgcgtatgcgggagctttggtgcaccgggttgcccttt 26869863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 387
Target Start/End: Original strand, 9607179 - 9607312
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  9607179 gaggggtaaccttggcgcaacttgtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatcggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaa 9607278  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    | ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  9607279 ggctgcgtagaatacaccaataatgttgggaccc 9607312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 277 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 34420802 - 34420656
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 376  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  34420802 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtaccatacacc-aaaa 34420704  T
Q  377 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 425  Q
    |||||||||||  |||||| ||| || ||||| ||||||| ||||||||    
T  34420703 tggtgggaccc-cttcccggaccttgcgtatgtgggagctttagtgcac 34420656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 254 - 427
Target Start/End: Complemental strand, 6412002 - 6411833
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||| || ||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  6412002 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtaactgataggtcatgggttcaagtcttgtaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 6411904  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 427  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||  ||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  6411903 ggctgcgtacaatacacc--aaatgatgggaccc-cttcccagaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6411833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 252 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 10870134 - 10870025
Alignment:
Q  252 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||    
T  10870134 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggt 10870036  T
Q  352 aagactgcgta 362  Q
    ||| |||||||    
T  10870035 aaggctgcgta 10870025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 16735417 - 16735597
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||| || |||||||   |||||||||||||    
T  16735417 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaacgtcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgt-agaaaaacagggtaa 16735515  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| || ||| |||||||| ||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  16735516 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggacactgcgtatgcggtagcttcagtgcactgggttgcccttt 16735597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 426
Target Start/End: Original strand, 26573104 - 26573272
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  26573104 gagggggacccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtaaaaaacagggtaa 26573202  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    | ||||||||||||||||  || |||||||||||   ||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  26573203 ggctgcgtacaatacacc--aattggtgggaccc-catcccggaccctgcgtatgcgtgagctttagtgcacc 26573272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 52926391 - 52926219
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||         ||||    
T  52926391 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta---------gtaa 52926301  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  52926300 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggacac-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgcccttt 52926219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 306 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 10795554 - 10795422
Alignment:
Q  306 cacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgt 405  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | |||||| ||    
T  10795554 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcgt 10795456  T
Q  406 atgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  10795455 atgcgggagcttcagtgcaccaggttgcccttta 10795422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 310 - 438
Target Start/End: Original strand, 14986989 - 14987116
Alignment:
Q  310 ggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgc 409  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||| ||  |||||    
T  14986989 ggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-attcccggaccttgcatatgc 14987087  T
Q  410 gggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14987088 gggagctttagtgcaccgggtttcccttt 14987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 276 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 53996725 - 53996560
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||    
T  53996725 ggtaaatttgttgtcatttgactgaaaggtcacgtgttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcttacaatacacc-aaa 53996627  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttatatg 443  Q
    ||||||||||||  |||||  || ||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||| ||||    
T  53996626 atggtgggaccc-cttccctgacactgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggctgccctttttatg 53996560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 283 - 431
Target Start/End: Original strand, 7942995 - 7943140
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  7942995 ttgttgtcatgtgactggaaggtcacggattcaagtcctggaaacagcatcttgtctaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacatc--aaatggtgg 7943092  T
Q  383 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    || || ||||| | ||| || ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  7943093 gatccctttccag-accatgcgtatgcgggagctttagtgcactgggtt 7943140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 276 - 429
Target Start/End: Original strand, 19731000 - 19731150
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||   |    
T  19731000 ggtaaatttgttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19731097  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
     ||||||||||| ||||||  || |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19731098 ttggtgggaccc-tttcccagactctgtgtatgcaggagctttagtgcaccggg 19731150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 45786320 - 45786212
Alignment:
Q  331 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggt 430  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | |||| |||||| |||||||||||||    
T  45786320 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgaatgctggagctttagtgcaccgggt 45786222  T
Q  431 taccctttat 440  Q
    | ||||||||    
T  45786221 tgccctttat 45786212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 254 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 45621009 - 45620890
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-aaaacagggta 352  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  45621009 gagggggagccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggta 45620911  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  45620910 aggctgcgtacaatacaccaa 45620890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 254 - 385
Target Start/End: Original strand, 12525386 - 12525512
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  12525386 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaa---gttgtcatatgactgaaaggtcacaggttcgagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcagggtaa 12525482  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggac 385  Q
    | |||||   | ||||||||||||||||||||    
T  12525483 ggctgcg--aagtacaccaaaaatggtgggac 12525512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 289 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 45139624 - 45139526
Alignment:
Q  289 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  45139624 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagttttggaaacaacctcttgtgtaaaacacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccc 45139526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 289 - 387
Target Start/End: Original strand, 33926094 - 33926190
Alignment:
Q  289 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  33926094 tcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgtgtacaatacacc-ataatggtgggaccc 33926190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 426
Target Start/End: Original strand, 25944468 - 25944615
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 376  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| ||||    
T  25944468 gtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaaccgcctctcgtgtaaaaaactgggcaaggctgagtacaatacacc-aaaa 25944566  T
Q  377 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    |||||||||||  |||||  |||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  25944567 tggtgggaccc-cttccctgaccctgcgtatgtgggagctttagcgcacc 25944615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 307 - 438
Target Start/End: Original strand, 31592878 - 31593004
Alignment:
Q  307 acgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgta 406  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||| ||||||  ||    
T  31592878 acgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggactc-cttcccggaccctgcata 31592972  T
Q  407 tgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  31592973 tgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 31593004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 321 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 49013589 - 49013473
Alignment:
Q  321 tggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatag 420  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  || ||||||||| |||    
T  49013589 tggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatacgcgggagctttag 49013491  T
Q  421 tgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||| ||||||    
T  49013490 tgcaccgggttgcccttt 49013473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 293 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 54374488 - 54374357
Alignment:
Q  293 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttc 392  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||  |||    
T  54374488 gtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcgtacaatccacc-aaaatggtgggaccc-cttc 54374391  T
Q  393 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    ||| ||||||  |||||||||||| |||| ||||    
T  54374390 ccggaccctgcatatgcgggagctttagttcacc 54374357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 289 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 54032705 - 54032608
Alignment:
Q  289 tcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccct 388  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||   ||||||||||||||    
T  54032705 tcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc--gaatggtgggaccct 54032608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 318 - 444
Target Start/End: Original strand, 54484730 - 54484854
Alignment:
Q  318 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  54484730 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagct 54484826  T
Q  417 atagtgcaccgggttaccctttatatgt 444  Q
     |||||||||||||| |||||| |||||    
T  54484827 ttagtgcaccgggttgccctttttatgt 54484854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 286 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 30928296 - 30928209
Alignment:
Q  286 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||||||||||    
T  30928296 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaaggtaaggttgtgtaaaatacaccaa 30928209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 283 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 45948993 - 45948848
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaa---aggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatgg 379  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||  || |||    
T  45948993 ttgttttcatgtgactgaaggaaggtcacgggttcaattcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcatacaatacacc--aattgg 45948896  T
Q  380 tgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    ||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  45948895 tgggaccc-cttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgg 45948848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 291 - 369
Target Start/End: Original strand, 39212003 - 39212081
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaataca 369  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  39212003 atgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaataacctcttgtgtaaataacaaggtaagactgcgtacaataca 39212081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 257 - 374
Target Start/End: Original strand, 26782345 - 26782462
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||  |    
T  26782345 gggtaaccttgacgcaattggtaaagttattgtcatgcgattgaaaggtcacggattcaagtccttgaaacaatctcttgtgtaaaaaatagggtaatgc 26782444  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||  || |||||||||||    
T  26782445 tgtataaaatacaccaaa 26782462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 336 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 353450 - 353351
Alignment:
Q  336 gtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccc 435  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  353450 gtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccc 353352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 25517353 - 25517170
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagt--cctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggt 351  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| || | | |   |||||||| |  ||||||||||||||| || | |    
T  25517353 agggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggatgatgggacctggaaacatcctcttgtgtaaaaaaacaagat 25517254  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | | |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||| | |||| |||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  25517253 atggctgcgtacaatacac--aaaatggtgggacccctt-cccggatcctgcgtatgctggagctttagtgcaccgggttgcccttt 25517170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 429
Target Start/End: Original strand, 19751576 - 19751726
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||   |    
T  19751576 ggtaaattttttgtcacgtgattgaaaggtcacggatgcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaatcaaggtaaggttgcgtacaatacacc--ta 19751673  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
     ||||||||||| ||||||  ||  |||||||||  ||||| ||||||||||||    
T  19751674 ttggtgggaccc-tttcccagactttgtgtatgcatgagctttagtgcaccggg 19751726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 261 - 387
Target Start/End: Original strand, 33235513 - 33235639
Alignment:
Q  261 aaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgac-tgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaa-aacagggtaagactg 358  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||| || || ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33235513 aaccttgatgcagctggtaaagttgttgtcatgtgacatgaaaggtcacaagttcaaatcgtgtaaagagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagactg 33235612  T
Q  359 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
     |||||||||||   ||||||||||||||    
T  33235613 tgtacaatacac--taaatggtgggaccc 33235639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 276 - 352
Target Start/End: Original strand, 53062036 - 53062112
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||    
T  53062036 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtcaaaaacagggta 53062112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 310 - 387
Target Start/End: Original strand, 55401208 - 55401284
Alignment:
Q  310 ggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    ||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  55401208 ggttcaagtcctgtaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggttaagactgcgtataatacacc-aaaatggtgggaccc 55401284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 257 - 370
Target Start/End: Original strand, 21874999 - 21875106
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtg-taaaaaacagggtaaga 355  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||       |||||||||| | ||||||| |  |||||||| ||||||| ||||||||     
T  21874999 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactg-------acgggttcaaattctggaaacaacctcttgtgttaaaaaagagggtaagg 21875091  T
Q  356 ctgcgtacaatacac 370  Q
    |||||||||||||||    
T  21875092 ctgcgtacaatacac 21875106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 263 - 350
Target Start/End: Original strand, 35417902 - 35417988
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 350  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  35417902 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttatcatgtgactgagaggtcacgagttcaaatcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacaggg 35417988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 439
Target Start/End: Original strand, 28904941 - 28905101
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaa-aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||  ||| |||||| || || |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  28904941 ggtaaagttgttgtcatgtgactaaaaagtcacatgtttaagtccagggaacagtctcttgtgtaaaataacaaggtaagactgtgtacattacaccaaa 28905040  T
Q  375 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
     |   |||||||| ||||||| |||||| ||| |||||| || ||||| | |||| | |||||||    
T  28905041 ta---tgggaccc-tttcccggaccctgcgtaagcgggaactttagtgtaacgggctgcccttta 28905101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 443
Target Start/End: Complemental strand, 34771457 - 34771359
Alignment:
Q  342 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttata 441  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| | |||||| ||    
T  34771457 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggctgcccttttta 34771361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 297 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 52428616 - 52428538
Alignment:
Q  297 ctgaaaggtcacgggttcaagtc-ctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||  || ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52428616 ctgaaaggtcacgggtttaagtctctggaagcagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 52428538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 267 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11461809 - 11461656
Alignment:
Q  267 gacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa---aaaacagggtaagactgcgtac 363  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||| || |||| |||| ||||||||||||| ||||||||   |||||| || |||| ||| |||    
T  11461809 gacgcaactggtaaagttgttgtcatatgacaggaaggttacaggtttaagttctggaaatagtcttttgtgtaaaaaaaaacaaggaaagattgcatac 11461710  T
Q  364 aatacacca--aaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    ||||||| |  |||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||| |||||||    
T  11461709 aatacactagtaaaatggt-ggaaccttttcccggactctgcgtatgtgggagct 11461656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 342 - 438
Target Start/End: Original strand, 15797284 - 15797377
Alignment:
Q  342 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  15797284 aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 15797377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 44403715 - 44403564
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| || |||||| ||| || ||||||||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||||| | ||||| |  |||    
T  44403715 ggtaaagttattgtcacgtggctaaaaggtcacaggttaaagtcctgggaatagcctcttgtgtaaaagacaaggtaaggctgcggagaatac-cacaaa 44403617  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||  |||||| | |||| ||||||||||||    
T  44403616 atggtgggaccc-cttcccggaccctacgtatgctgaagctttagtgcaccggg 44403564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 413
Target Start/End: Original strand, 9276317 - 9276395
Alignment:
Q  331 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcggga 413  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  9276317 ctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggt-ggaccc-tttcccggaccctgcgtatgcggga 9276395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 284 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 8411016 - 8410929
Alignment:
Q  284 tgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||  | |||  ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||    
T  8411016 tgttgtcatgggactgaaaggtcaccggttcaggtcctggaaactgcctc--gtgtaaaaaacagggtaaggctgctcacaatacaccaa 8410929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 1121382 - 1121285
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |   |||||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  1121382 taaatttgttgtccggtggctgaaaggtcacgtgtttaagtcctggaaacaacttcttgtgtaagaaataaggtgagactgcgtacaatacaccaaaa 1121285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 276 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 829601 - 829452
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||  | || |||||||| || |||| |  ||||||| |||| ||||  ||||   |||||||||||||||||||    
T  829601 ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaagacc-cgagttcaagttctagaaacaacctcttgtctaaagaacatagtaaagttgcgtacaatacaccaaaa 829503  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
     ||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  829502 -tggtgggacccctt-cccgaaccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccgg 829452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 31904975 - 31904907
Alignment:
Q  317 gtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31904975 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacagggtatgactgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc 31904907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 374
Target Start/End: Original strand, 29106547 - 29106645
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||| |||||||||||| || |||| |||||||| |||||| || ||| |  ||||||||||||||| ||| ||||  | ||||||||||||||||    
T  29106547 ggtaaaaatgttgtcatgtggctcaaagatcacgggtacaagtcttgaaaacaacctcttgtgtaaaaaataggataaggttacgtacaatacaccaaa 29106645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 407
Target Start/End: Original strand, 47624095 - 47624167
Alignment:
Q  331 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtat 407  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  47624095 ctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgtgtat 47624167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 311 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 43114994 - 43114882
Alignment:
Q  311 gttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaaga-ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg 408  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||  |||||||||||||  |  || ||||| |||||    
T  43114994 gttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggctacctacaatacaccaaa--tggtgggacccttc-ctggacccctgcgtatg 43114898  T
Q  409 cgggagctatagtgca 424  Q
    |||||||| |||||||    
T  43114897 cgggagctttagtgca 43114882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 386 - 438
Target Start/End: Original strand, 47624204 - 47624256
Alignment:
Q  386 ccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47624204 ccttttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 47624256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 326 - 431
Target Start/End: Original strand, 26292380 - 26292480
Alignment:
Q  326 atagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 425  Q
    |||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||||  || ||||| || || |||||||||||  ||||||||| || ||||||||    
T  26292380 atagcctcttgtgtaaaa--cagggtaagaccgcgtacgatacaccaaa--tgatgggatccctt-cccgaaccctgcatatgcgggaactctagtgcac 26292474  T
Q  426 cgggtt 431  Q
    ||||||    
T  26292475 cgggtt 26292480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 438
Target Start/End: Original strand, 40390353 - 40390398
Alignment:
Q  393 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  40390353 ccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 40390398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 377 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 14266431 - 14266372
Alignment:
Q  377 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  14266431 tggtgggaccctt--cctgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 14266372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 394
Target Start/End: Original strand, 31672732 - 31672807
Alignment:
Q  317 gtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttccc 394  Q
    |||||||||| || || || ||||||||||| || |||| |||||||||||||||  |||||||||||| || |||||    
T  31672732 gtcctggaaacagcctattatgtaaaaaacaaggcaagagtgcgtacaatacacc--aaatggtgggactctcttccc 31672807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 43956643 - 43956550
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 345  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||| |  ||||||||| |||  ||||||| || ||||||| || ||| |||||||||||    
T  43956643 ttagagggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgttacttgactgaaaagtccggggttcatgttctggaaacagcctcatgtgtaaaaaa 43956550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 397 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 10484657 - 10484616
Alignment:
Q  397 accctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10484657 accctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10484616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 438
Target Start/End: Original strand, 30452892 - 30452952
Alignment:
Q  377 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30452892 tggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30452952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 265 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33075987 - 33075931
Alignment:
Q  265 ttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctg 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||| |||||    
T  33075987 ttgacgcaac-ggtaaaattgttgtcatgtgattgagaggtcacatgttcaaatcctg 33075931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 253 - 298
Target Start/End: Original strand, 39430464 - 39430509
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgact 298  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||| |||||    
T  39430464 agaggggtaactttgacgcaactggtaaagttgctgtcatctgact 39430509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 332 - 388
Target Start/End: Original strand, 16130329 - 16130384
Alignment:
Q  332 tcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccct 388  Q
    |||| |||||||| |||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  16130329 tcttctgtaaaaagcaggataaggctgcgaacaatacacc-aaaatggtgggaccct 16130384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24851364 - 24851301
Alignment:
Q  374 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||| || |||| | ||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  24851364 aaatggtgggacccctt-cccggatcctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 24851301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 60)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 39461177 - 39460994
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||    
T  39461177 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgagactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagagtaa 39461078  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  39461077 ggctgcgtacaatacaccaataatggtgagaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 39460994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 251 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12670432 - 12670250
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 350  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||    
T  12670432 ttagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaggg 12670335  T
Q  351 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12670334 taaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttacccttt 12670250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 252 - 438
Target Start/End: Original strand, 35261631 - 35261814
Alignment:
Q  252 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35261631 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagccctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggt 35261730  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35261731 aaggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 35261814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 7136711 - 7136527
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||    
T  7136711 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaccagggta 7136612  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7136611 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 7136527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 28817807 - 28817626
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  28817807 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 28817708  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  28817707 ggctgcgtacaatacacc--caatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgcccttt 28817626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 36720750 - 36720931
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  36720750 gaggggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 36720849  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||    
T  36720850 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcggaagctttagtgcacccggttgcccttt 36720931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 251 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 20284257 - 20284076
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt--aaaaaacag 348  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |  |||||| ||    
T  20284257 ttagagcggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaag 20284158  T
Q  349 ggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  20284157 ggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggtt 20284076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 251 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 21070886 - 21070704
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt---aaaaaaca 347  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |   |||||| |    
T  21070886 ttagagcggtaaccttgacgcaacgggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaaaaaaa 21070787  T
Q  348 gggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  21070786 gggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagttttagtgcaccgggtt 21070704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 254 - 439
Target Start/End: Original strand, 17823530 - 17823712
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||| |||    
T  17823530 gaggggtaatcttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaccaggataa 17823629  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    ||||||||| ||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  17823630 gactgcgtaaaatacacc--aaatggtggaaccc-cttcccgaaccctgcatatgcaggagctttagtgcaccgggttgcccttta 17823712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30454276 - 30454097
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  |||||| |||||    
T  30454276 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaaggtaa 30454179  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | |||||||| |||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30454178 ggctgcgtacgatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30454097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 252 - 431
Target Start/End: Original strand, 44530101 - 44530277
Alignment:
Q  252 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  44530101 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgctgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggt 44530200  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44530201 aaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 44530277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 439
Target Start/End: Original strand, 13160656 - 13160837
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  13160656 gaggggtaacctcggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 13160754  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  13160755 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcgccgggttgcccttta 13160837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 251 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 29521869 - 29521692
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 350  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  29521869 ttagaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcgtgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtttaaaaaacaggg 29521770  T
Q  351 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| ||   ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29521769 taaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaacc-catcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 29521692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 6760777 - 6760959
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  6760777 gaggggtaac-ttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 6760875  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6760876 ggcttcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttctcggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 6760959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 258 - 438
Target Start/End: Original strand, 25250480 - 25250659
Alignment:
Q  258 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 357  Q
    |||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||| || || |||||||||||| |||||| | ||    
T  25250480 ggtaaccttggcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacatgttcaagtcctggaaacagcctattgtgtaaaaaatagggtatggct 25250579  T
Q  358 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| |  |||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  25250580 gcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccgaaccccgcatatgcgggagatttagtgcaccgggttgcccttt 25250659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 252 - 437
Target Start/End: Original strand, 45071217 - 45071398
Alignment:
Q  252 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 351  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||| |||||||||||    
T  45071217 tagaggggtaaccttggcgatactggtaaagttgttgtcatgtgattgtaaggtcacgggttcaagttctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggt 45071315  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    ||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||||||| |||||    
T  45071316 aaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccttgcgtatgcgggagcttcagtgcaccgggttgccctt 45071398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 426
Target Start/End: Original strand, 2626473 - 2626645
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt---aaaaaacaggg 350  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||   |||||||||||    
T  2626473 gaggggtaaccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgaccgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaacaggg 2626572  T
Q  351 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||  ||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  2626573 taagactgcgtacaatacacc--aaatgatgggaccc-cttcccagaccctgcatatgcgggagcttcagtgcacc 2626645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 18164940 - 18164767
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  18164940 gaggggtaatcttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 18164842  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    |  |||||||||||||||  ||| | || || || ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18164841 ggttgcgtacaatacacc--aaaggatgtga-ccatttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 18164767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 12625843 - 12626025
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggta 352  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||   |||||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| |||||||||||||    
T  12625843 gagggataacgttcacgcaactggtaaagttgttgtcgtgtgacttgtaggtcacgggctcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggta 12625942  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||   ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  12625943 agactgcatacaatacacc--aaatggtgggaccc-cctcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 12626025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Original strand, 26954085 - 26954270
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggt 351  Q
    ||||||||||| ||| || || ||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
T  26954085 agaggggtaactttggcgtaattggtaaagttgttgtcatgtgattagaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaacagggt 26954184  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||  |  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  26954185 aaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccagacctcgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 26954270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20869677 - 20869560
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  20869677 gagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 20869580  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    | ||| ||||||||||||||    
T  20869579 ggctgtgtacaatacaccaa 20869560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 263 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 44781677 - 44781517
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||| ||| |||    
T  44781677 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaagttcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagacagggtaaggctgtgta 44781579  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 425  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   ||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  44781578 caatacaccaaaaatgttgggaccc-cgtcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 44781517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 263 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 42083870 - 42083712
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||  ||| ||| |||||||    
T  42083870 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaatggggcaaggctgcgta 42083772  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgca 424  Q
    || || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  42083771 cagtatacc-aaaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgtgtacgtgggagctttagtgca 42083712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 255 - 387
Target Start/End: Original strand, 11748254 - 11748386
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||| |||||||||    
T  11748254 aggggtaactttggtgcaactggtgaaattgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttttgtaaaaagcagggtaag 11748353  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    || |||||||||| || ||||||||| ||||||    
T  11748354 acagcgtacaatatacaaaaaatggtaggaccc 11748386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 253 - 416
Target Start/End: Original strand, 24245404 - 24245562
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||    |||||||||    
T  24245404 agaggggtaaccttggggcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa-cgtctcttatgt----aacagggta 24245498  T
Q  353 agactgcgtacaatacacc-aaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    ||||| |||||||| |||| |||||| |||||||||  |||| | |||||| |||||||||||||    
T  24245499 agactacgtacaatgcaccaaaaaattgtgggaccc-cttcctggaccctgcgtatgcgggagct 24245562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 271 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 8897928 - 8897764
Alignment:
Q  271 caactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 370  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  8897928 caactggtaaagttgttgtcatgtgacagcaaggtcacgggttgaagtcctggaaacaaccgcttgtgtaaaaaatagggtaaggctacgtacaatacac 8897829  T
Q  371 caaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| || |||||| |||| ||||||    
T  8897828 c--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctttactgcacccggttgcccttt 8897764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Original strand, 20869941 - 20870060
Alignment:
Q  318 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagcta 417  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| | |||| |  ||||||||||||     
T  20869941 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttccaggaccccgcatatgcgggagctt 20870039  T
Q  418 tagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||| ||||||    
T  20870040 tagtgcaccgggttgcccttt 20870060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 283 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 14018121 - 14018034
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacac 370  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14018121 ttgttgtcacgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtgagactgcgtacaatacac 14018034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 263 - 354
Target Start/End: Original strand, 28407379 - 28407469
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||    
T  28407379 ccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaag 28407469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 311 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 17251001 - 17250888
Alignment:
Q  311 gttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcg 410  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||      
T  17251001 gttcaagtcctggaagcagcctcttgtgtaaaaaacaggttaaggcagcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-tttcccgaaccctgcgtatgaa 17250903  T
Q  411 ggagctatagtgcac 425  Q
    |||||| ||||||||    
T  17250902 ggagctttagtgcac 17250888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 24365218 - 24365081
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||    
T  24365218 gtaaagttgttgtcatgtgactaaaatgtcacgggttcaagccctagaaacagcctcttgtgtaaaaaatcagggtaaggctgcgaacaatacacc--aa 24365121  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    ||||||||||||  |||||| |||||| ||||| |||||||    
T  24365120 atggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtgggagct 24365081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 283 - 438
Target Start/End: Original strand, 31457156 - 31457307
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||| |||  ||| |||||||||||||| |  ||||||| |    
T  31457156 ttgttgtcatgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctgtaaacaacctcttgtgt-aaaaataggaaaaggctgcgtacaatacatc--aaatggtag 31457252  T
Q  383 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||  ||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  31457253 gaccc-cttcccaaaccctgcgtatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 31457307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 426
Target Start/End: Original strand, 22598133 - 22598279
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||    
T  22598133 ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacgggttcaaatcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctatgtacaatacacc--aa 22598230  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||| || |||||||||| || |||||||||    
T  22598231 ttggtgagaccc-tttcccggaccttgcgtatgcggga-ctttagtgcacc 22598279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 306 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5135418 - 5135290
Alignment:
Q  306 cacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgt 405  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||    
T  5135418 cacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaagagggtaaggctgtgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgt 5135322  T
Q  406 atgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||| |||||| | |||||||||| | ||||||    
T  5135321 atgcaggagct-ttgtgcaccgggctgcccttt 5135290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 331 - 440
Target Start/End: Original strand, 16225050 - 16225158
Alignment:
Q  331 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggt 430  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||    
T  16225050 ctcttatgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaataatggtgggatcc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggt 16225148  T
Q  431 taccctttat 440  Q
    |  |||||||    
T  16225149 tgtcctttat 16225158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 428
Target Start/End: Original strand, 5689640 - 5689756
Alignment:
Q  309 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg 408  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  |||||||||| || |||||    
T  5689640 gggttcaagtcttgtaaatagcctcttgtgtaaaaagcagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtggaaccc-cttcccgaaccatgcgtatg 5689736  T
Q  409 cgggagctatagtgcaccgg 428  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  5689737 tgggagctttagtgcaccgg 5689756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 44742698 - 44742568
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||| |||||||  ||||| |||||| ||||||||  |||| || ||||||| | |||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  44742698 agggggaaccttggtgcaac-ggtaaagttgttgtcgcgtgattgtaaggtcatgagttcaagttctggaaacaatctcctgtgtaaaaaacagggtaag 44742600  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  44742599 gctgcgtacaatacacc-aaaatggtgggaccc 44742568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 299 - 434
Target Start/End: Original strand, 389642 - 389776
Alignment:
Q  299 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt--aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccga 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||| || ||||| |     
T  389642 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaccctcttgtgtcaaaaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacc--aaatgatgggatccctttcctg- 389738  T
Q  397 accctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacc 434  Q
    |||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  389739 accctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggattacc 389776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 283 - 386
Target Start/End: Original strand, 35105906 - 35106008
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||| | ||||||||    
T  35105906 ttgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaagagagtgtaaggctgcgtacaatacacc-agaatggtgg 35106004  T
Q  383 gacc 386  Q
    ||||    
T  35106005 gacc 35106008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 317 - 426
Target Start/End: Original strand, 29877111 - 29877217
Alignment:
Q  317 gtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||     
T  29877111 gtcctggaaacagccttttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcg 29877207  T
Q  417 atagtgcacc 426  Q
     |||||||||    
T  29877208 ttagtgcacc 29877217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 293 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 8484080 - 8483947
Alignment:
Q  293 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttc 392  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  || |||||||||||   ||    
T  8484080 gtgacttaaatgtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggcaaggctgcgtacaatacacc--aattggtgggaccc-catc 8483984  T
Q  393 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    ||  |||||| ||||||||||||| ||| ||||||||    
T  8483983 ccagaccctgcgtatgcgggagctttagggcaccggg 8483947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 278 - 374
Target Start/End: Original strand, 36918102 - 36918198
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||  |||||||| ||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36918102 taaaattgttgttatggaactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaacaatttcttatgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaa 36918198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 283 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 30962925 - 30962847
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgt 361  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||| || ||||||    
T  30962925 ttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgacttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggttaggctgcgt 30962847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 334 - 439
Target Start/End: Original strand, 33866983 - 33867088
Alignment:
Q  334 ttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccctt-ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||  || ||| ||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||    
T  33866983 ttgtgtaaaaaagcagggtaagactgcatacaatacataaaaaatggtg--acacttcttcccgaaccctgcgtatgcagaagctttagtgcaccgggtt 33867080  T
Q  432 acccttta 439  Q
     |||||||    
T  33867081 gcccttta 33867088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 254 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 40605086 - 40604970
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||| || | | | | ||||||||||| |||||| | ||| ||||||||||||  || |||    
T  40605086 gaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattggatgattatgggttcaagtcatggaaacaatcttttgtgtaaaaaattggataa 40604987  T
Q  354 gactgcgtacaatacac 370  Q
    |  ||||||||||||||    
T  40604986 ggttgcgtacaatacac 40604970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 331 - 387
Target Start/End: Original strand, 43942355 - 43942411
Alignment:
Q  331 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43942355 ctcttatgtcaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 43942411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 286 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 23000365 - 23000269
Alignment:
Q  286 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggac 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||  | | |||||||||||  ||||||||||||    
T  23000365 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggt--aagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacacggtaaggttccatacaatacacc--aaatggtgggac 23000271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 11001109 - 11000971
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||| |  ||  ||||| |||||||| | |||| ||| ||||||||||||  |    
T  11001109 ggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcgcgggttcaaattctgaaaacaacctactgtgtaaaaaaacaagataaggctgtgtacaatacacc--a 11001012  T
Q  375 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||||    
T  11001011 aatggtgggaccc-ctacccgaaccctgtttatgcaggagct 11000971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 331 - 438
Target Start/End: Original strand, 10857859 - 10857964
Alignment:
Q  331 ctcttgtgtaaaaaa-cagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||  || || | ||| || ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10857859 ctcttgtgtaaaaaaacagggtaaggctgcgcacaatacaccaat--tggtgggaccactt-cctggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcaccggg 10857955  T
Q  430 ttacccttt 438  Q
    || ||||||    
T  10857956 ttgcccttt 10857964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 321 - 438
Target Start/End: Original strand, 19729363 - 19729475
Alignment:
Q  321 tggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatag 420  Q
    |||||| |||||||| |||||||  ||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  ||| |||||||| |||    
T  19729363 tggaaacagtctcttatgtaaaa--cagggtaaggctgtgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatacgggagctctag 19729457  T
Q  421 tgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||| || || ||||||    
T  19729458 tgcactggattgcccttt 19729475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 254 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 23286474 - 23286431
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgac 297  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23286474 gaggggtaaccttgtcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 23286431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 357 - 431
Target Start/End: Original strand, 16013511 - 16013584
Alignment:
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  16013511 tgcgtacaatacactaaaaatggtgcgaccc-cttcccagaccctgcctatgcgggagctttagtgcaccgggtt 16013584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 361 - 438
Target Start/End: Original strand, 26102578 - 26102652
Alignment:
Q  361 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  26102578 tacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcttatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 26102652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 377 - 431
Target Start/End: Original strand, 27507985 - 27508038
Alignment:
Q  377 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27507985 tggtgggacccctt-cccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 27508038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 291 - 332
Target Start/End: Original strand, 27635020 - 27635061
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtct 332  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27635020 atgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctggaaacagtct 27635061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 27468140 - 27468092
Alignment:
Q  390 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  27468140 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 27468092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 342 - 414
Target Start/End: Original strand, 31454236 - 31454307
Alignment:
Q  342 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 414  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||| || |||||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  31454236 aaaacatggtaagactgcgtataatacacaaaaaatgatgagaccctttt-tcaaaccctgcgtatgcgggag 31454307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35107374 - 35107311
Alignment:
Q  374 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||| || |||| || |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  35107374 aaatggtgggacccctt-cccggacgctgtgtatgcggaagctttagtgcaccgggttgcccttt 35107311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 291 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 3377560 - 3377506
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 345  Q
    |||||||| ||||||||||  ||||| || ||||||||| |||||||||||||||    
T  3377560 atgtgactcaaaggtcacgaattcaattcttggaaatagcctcttgtgtaaaaaa 3377506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 374 - 438
Target Start/End: Original strand, 28407475 - 28407538
Alignment:
Q  374 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  28407475 aaatggtgggacccctt-cccggaccctacgtatgcgggagctttactgcaccgggttgcccttt 28407538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 85)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Original strand, 18944619 - 18944804
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18944619 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaaggcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggta 18944718  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc-tatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  18944719 aggctgcgtacaatacaccaacaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcttttagtgcaccgggttgcccttt 18944804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 46248134 - 46247953
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  46248134 gaggggtaaccttggctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46248035  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  46248034 gactgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttt 46247953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Original strand, 10668196 - 10668385
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgt-----gactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaaca 347  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  10668196 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaca 10668295  T
Q  348 gggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
     ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  10668296 aggtaaggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 10668385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 260 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30395903 - 30395726
Alignment:
Q  260 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 359  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30395903 taaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactttaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgc 30395804  T
Q  360 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30395803 gtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgagttgcccttt 30395726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 34725277 - 34725098
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  34725277 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 34725180  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | |||||||||||||||   ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34725179 ggctgcgtacaatacac--taaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 34725098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20004274 - 20004090
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||    
T  20004274 agaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctctcgtgtaaaaaacaaggta 20004175  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20004174 aggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 20004090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 32632738 - 32632557
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||    
T  32632738 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggta 32632640  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||  ||||||||||||  |||||||| |||| ||||||    
T  32632639 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccaaaccctgcatatgcgggagcttgagtgcaccaggtttcccttt 32632557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 14617015 - 14617196
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |||||    
T  14617015 gaggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaataacaaggtaa 14617114  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14617115 ggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggatcc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 14617196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 41319987 - 41319806
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41319987 gaggggtaaccttgacacaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggtttaagtcctggaaacagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 41319888  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||||   |||||||||| |  ||||||| ||||| ||||||    
T  41319887 ggctgcgtacaatacacc--aaatgatgggaccc-cttcccgaacccttcatatgcgggagtttcagtgcactgggttgcccttt 41319806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 27201624 - 27201807
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||    
T  27201624 gaggggtaaccttagcgtaaatggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtcagaaacagggtaa 27201723  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| || ||||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  27201724 ggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccttgcgtatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 27201807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 260 - 438
Target Start/End: Original strand, 9939443 - 9939622
Alignment:
Q  260 taaccttgacgcaactggtaaaa-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 358  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |  ||||||| ||| ||||| ||||||  ||    
T  9939443 taaccttggcgcaaccggtaaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctggaaacaacctcttgtttaagaaacatggtaaggttg 9939542  T
Q  359 cgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9939543 cgtgcaatacaccaaaaatggtgggacccccttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttacccttt 9939622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 431
Target Start/End: Original strand, 46991781 - 46991955
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  46991781 gaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaa 46991880  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    | ||| ||||||||||||   |||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  46991881 ggctgtgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgggtt 46991955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 38478462 - 38478282
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||    
T  38478462 agaggggtaaccttggcgcaactagtaaacttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 38478365  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||| || ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38478364 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtggaaccc-cttctcggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 38478282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Original strand, 47214487 - 47214667
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  |||||||||||    
T  47214487 agaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagtctcttgttt--aaaacagggta 47214584  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  ||||||  |||||||||||| ||||||||| | |||||||||    
T  47214585 aggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccagattacccttt 47214667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 259 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 18742137 - 18741957
Alignment:
Q  259 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcct-ggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | ||||| ||||| |||| | ||||||||||||||| |    
T  18742137 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaagggttcaaatcttgggaaacagtcttttgtataaaaaaacagggtaaggc 18742038  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  18742037 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggtttcccttt 18741957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 257 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 23768498 - 23768334
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||| |    
T  23768498 gggtaacctcgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggc 23768399  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgca 424  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |  |||||  |||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23768398 tgcgtacaatacacc--aaatggtgggacac-cttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgca 23768334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 253 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 45812717 - 45812544
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||||||    
T  45812717 agaggggtaaccttggcgcaactgataaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgt--aaaagagggta 45812620  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    || |||| |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  45812619 aggctgcatacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccaaaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 45812544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 276 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35117927 - 35117765
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  35117927 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaaa 35117828  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgt-atgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||| ||||||||  |||||| |||||| || |||| |||||| |||||||||||| | ||||||    
T  35117827 atgatgggaccc-cttcccggaccctgcgtaatgcaggagctttagtgcaccgggcttcccttt 35117765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 293 - 438
Target Start/End: Original strand, 35005139 - 35005283
Alignment:
Q  293 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttc 392  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||| || |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  35005139 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttc 35005237  T
Q  393 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||| |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  35005238 ccggaccctgcgtatgcgggcgctttagtgcaccgggttgcccttt 35005283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 273 - 427
Target Start/End: Original strand, 6925096 - 6925247
Alignment:
Q  273 actggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||     
T  6925096 actggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgcggacaatacacc- 6925194  T
Q  373 aaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 427  Q
      |||||||||||||  ||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  6925195 -gaatggtgggaccc-cttcccggtccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccg 6925247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 27474258 - 27474438
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||    
T  27474258 gaggggtaaccttagctcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcttggaaacagtctcttgtgt-aaaaacagggcaa 27474356  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
      |||||||||||||||    |||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  27474357 agctgcgtacaatacac--tgaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccggattgcccttt 27474438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 258 - 438
Target Start/End: Original strand, 19414420 - 19414595
Alignment:
Q  258 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 357  Q
    |||||||||| || || ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||  |||||||| |||| ||    
T  19414420 ggtaaccttggcgtaattggtaaagttgttgtcatatgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaagagcctcttatgt--aaaacaggttaaggct 19414517  T
Q  358 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19414518 gcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgtaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 19414595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 263 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 2435958 - 2435796
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||    
T  2435958 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcctgtgtgaaaaatagggtaagcctgcgta 2435860  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||  | ||||||||||| |||||||||||    
T  2435859 caatacacc-aaaatggtgggaccccttt-ccgtaccctccgcatgcgggagctttagtgcaccgg 2435796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 8197020 - 8197201
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  8197020 gaggggtaaccttggtgcaactggtcaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggtaattgcctcttgtgtaaaaaacatggtaa 8197119  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | || |||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| || |||||| |||||  |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  8197120 ggctacgtacagtacacc--aaatggtaggaccc-cttctcggaccctgcgtatgttggagctttagtgtaccgggttgcccttt 8197201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 254 - 409
Target Start/End: Complemental strand, 19932933 - 19932782
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |  || ||||||||||||||||||||    
T  19932933 gaggggttaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagt--tggatacaacct-ttgtgtaaaaaacagggtaa 19932837  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgc 409  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||    
T  19932836 ggctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgc 19932782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 251 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 4430210 - 4430087
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 350  Q
    |||||||| ||| |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || ||| ||| |||||||||||||||||||    
T  4430210 ttagagggttaatcttggcgcagctggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggtttaagtcttgaaaacagtatcttgtgtaaaaaacaggg 4430111  T
Q  351 taagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4430110 taagactgcgtacaatacaccaaa 4430087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 276 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 18724704 - 18724606
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  18724704 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaatacaccaaa 18724606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 259 - 431
Target Start/End: Original strand, 45402077 - 45402247
Alignment:
Q  259 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt--aag-a 355  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||  |||      
T  45402077 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtga-tggaaggtaacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggttcaagtt 45402174  T
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  45402175 ctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggtt 45402247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 252 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 22930250 - 22930119
Alignment:
Q  252 tagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggt 351  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||    
T  22930250 tagaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacagccttttgtgta-aaaacagggt 22930152  T
Q  352 aagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |||  || | ||||||||||  ||||||||||||||    
T  22930151 aaggttgtg-acaatacacc--aaatggtgggaccc 22930119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 283 - 429
Target Start/End: Original strand, 22327105 - 22327245
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||| ||||||||||    
T  22327105 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcgcgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacgatgcacc-aaaatggtgg 22327203  T
Q  383 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    |      ||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22327204 g-----gttcccgaactctgtgtatgcgggagctttggtgcaccggg 22327245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 291 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 35253329 - 35253187
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 390  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |    
T  35253329 atgtgactgaaagatcacgggttcaagtcctcgaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-ct 35253235  T
Q  391 tcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  35253234 tcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 35253187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 260 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 12127010 - 12126837
Alignment:
Q  260 taaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 359  Q
    |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  12127010 taaccttggcgcaactcgtaaagttgttgtcatgtaattgaaaggtcacgggtttaagttctggaaacagcttcttgtgt--aaaacagggtaaggctgc 12126913  T
Q  360 gtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||    
T  12126912 gtacaatacacc--aaattgtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctgtagtgcactgcgttgcccttt 12126837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 276 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 17470505 - 17470406
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17470505 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggtcatgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaaa 17470406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 6983969 - 6983811
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||||  |    
T  6983969 tggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctc--gtataaaaaacagggtaagtatgcgtacaatacacc--a 6983874  T
Q  375 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||| ||| || |||||| | |||||||||| | ||||||    
T  6983873 aatggtgggaccccttt-ccggaccctgcgtaggcaggagctttggtgcaccgggctgcccttt 6983811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 277 - 438
Target Start/End: Original strand, 19701570 - 19701729
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 376  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||  ||||||  || |||||||||||| ||||    
T  19701570 gtaaagttgttgtcgtgtgactgaaatgtcacgggtttaagtcatgaaaacagcctcttgtgtaaaaaacttggtaaggatgggtacaatacacc-aaaa 19701668  T
Q  377 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  19701669 tggtggggccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctacccttt 19701729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 25468421 - 25468285
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 376  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  |||    
T  25468421 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaatcagggtaaggttgcgtacaatacacc--aaa 25468324  T
Q  377 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    |||| ||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||    
T  25468323 tggttgga-cctcttcccagaccctgcgtatgcgggagct 25468285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 264 - 387
Target Start/End: Original strand, 33222971 - 33223092
Alignment:
Q  264 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 363  Q
    |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| || ||||||||| |||||||||| |||  |||||||    
T  33222971 cttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggatttaagtcatggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggaaaggttgcgtac 33223069  T
Q  364 aatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  33223070 aatacacc-aaaatggtgggaccc 33223092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 387
Target Start/End: Original strand, 25290143 - 25290280
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaa--atagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||  | || ||||||||||||||||||||||||    
T  25290143 gggtaaccttggcgcaacaggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcttggaaacacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaag 25290242  T
Q  355 ac-----tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
     |     || ||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25290243 gcaaggttgtgtacaatacaccaaaaatgataggaccc 25290280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 414
Target Start/End: Original strand, 20036218 - 20036355
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaa-aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| | | ||||||||| ||||| |||||||||      
T  20036218 tggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaaactcttgtgtaaagagaaagggtaagattgcgttcaatacacc-- 20036315  T
Q  374 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggag 414  Q
    ||||||||| ||||  |||||| |||||| |||||| ||||    
T  20036316 aaatggtggaaccc-cttcccggaccctgcgtatgcaggag 20036355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 338 - 439
Target Start/End: Original strand, 4349699 - 4349797
Alignment:
Q  338 gtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  4349699 gtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 4349795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 287 - 416
Target Start/End: Original strand, 11596523 - 11596648
Alignment:
Q  287 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacc 386  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |  ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  11596523 tgtcatgtgactgaaatgtcacgggttcaagtcctagaaacaacctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtataatacacc--aaatggtgggacc 11596619  T
Q  387 cttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    |  |||| | |||||| |||||||||||||    
T  11596620 c-cttcctggaccctgcgtatgcgggagct 11596648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 254 - 332
Target Start/End: Original strand, 34714600 - 34714678
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtct 332  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  34714600 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagtct 34714678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 276 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 50760385 - 50760288
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaa 373  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  50760385 ggtaaagtagttgtcatgtgactgagaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgtataaaactgggtaaggctgcgtataatacaccaa 50760288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 263 - 438
Target Start/End: Original strand, 50811926 - 50812098
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgt 361  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||  |||||    
T  50811926 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacggaatcatgtcctggaaacagcttcttgtgtaaaaaaacagggtaaggttgcgt 50812024  T
Q  362 acaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||| ||||||||||  |||  ||||||  ||||| ||||||||||||| || ||||| ||| | ||||||    
T  50812025 acaatacacc-aaaatggtggacccc--ttcccgcgccctgcgtatgcgggagctttaatgcactgggctgcccttt 50812098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 275 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 15511311 - 15511157
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg--tacaatacacca 372  Q
    ||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||   || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||     
T  15511311 tggtaaagttgttgtaatgtggctgaaaggtcacatattgaagtcctggaaaccgcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcggatacaatacacc- 15511213  T
Q  373 aaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    |||||||||| ||||  |||| | |||||| ||||| | ||||| ||||||||||||    
T  15511212 aaaatggtggtaccc-cttcctggaccctgcgtatgtgtgagctttagtgcaccggg 15511157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 256 - 321
Target Start/End: Original strand, 40424721 - 40424786
Alignment:
Q  256 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcct 321  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40424721 ggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggccacgggttcaagtcct 40424786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44485267 - 44485170
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||| |  | ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  44485267 gtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttatagtcctggaaacaaccacttgtgtaaaagacatggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 44485170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 255 - 374
Target Start/End: Original strand, 24564322 - 24564441
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||| ||||| ||||||||| | | |||||||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  24564322 aggggtaaccttggcgcaaccagtaaagttgatgtcttgtgattgaaaggtcgcagattcaagtcttggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 24564421  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaa 374  Q
      |||||||||| |||||||    
T  24564422 ggtgcgtacaattcaccaaa 24564441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 258 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 18335465 - 18335335
Alignment:
Q  258 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagact 357  Q
    |||||||||| ||||| || |||| || |||||||||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||   |    
T  18335465 ggtaaccttggcgcaagtgataaagtttttgtcatgtgtctgaaaggtcacaagttaaagtcctggaaacagtctcttgtttaaaaattagggtaaagtt 18335366  T
Q  358 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 390  Q
    |||||||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  18335365 gcgtacaatacatc--aaatgatgggacccttt 18335335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 309 - 426
Target Start/End: Original strand, 22324925 - 22325039
Alignment:
Q  309 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg 408  Q
    ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||| ||   ||||| |||||| |||||    
T  22324925 gggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaa-acagggtaaggctgcatacaatacaccaaaaatggt-ggagccccgtcccg-accctgcgtatg 22325021  T
Q  409 cgggagctatagtgcacc 426  Q
    |||||||| |||||||||    
T  22325022 cgggagctttagtgcacc 22325039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 341 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 42304303 - 42304207
Alignment:
Q  341 aaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||| |||||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  42304303 aaaaacagggtaaggttgcgtacaatacacaaaaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtgggagctttagtgcaccggattgcccttt 42304207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 255 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 18336026 - 18335914
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||| |||||| |||||| ||||||||||||  |||||||| ||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  18336026 aggggtaatcttggcgcaagtgataaagttgttgccatgtgtctgaaaggtcacatgttcaagttctgaaaataatctattgtttaaagaacagggtaag 18335927  T
Q  355 actgcgtacaata 367  Q
     ||||||||||||    
T  18335926 gctgcgtacaata 18335914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 27136811 - 27136661
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| |||| || |||| |||| |||||||| |||| || |  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||    
T  27136811 ggtaaagttgttgtcacgtgattggaaggacacgagttcaagttctgggaacaacctcttgtgtaaaaaacatggtaaggttgcgtacaatacacc-aaa 27136713  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    ||||||||||||  ||||   | | ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  27136712 atggtgggaccc-cttcctagatcatgtgtatgcgggagctccagtgcaccgg 27136661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 39215117 - 39214967
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 376  Q
    ||||| || |||||| |||||| ||||||| |  |||||||| ||||||| |  |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  || ||||    
T  39215117 gtaaagttattgtcacgtgactaaaaggtcccaagttcaagtactggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggtaaggctgcgtacaatattcc-aaaa 39215019  T
Q  377 tggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    ||||||| |||  ||||| ||||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  39215018 tggtgggtccc-cttcccaaaccctgcgtatgtggaagctttagtgcaccggg 39214967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 276 - 371
Target Start/End: Original strand, 52910216 - 52910312
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc 371  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| || |||||  || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  52910216 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaactcttggaaacagcctcttaggtaaaaaaacagggtaggactgtgtacaatacacc 52910312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 258 - 325
Target Start/End: Original strand, 21006125 - 21006192
Alignment:
Q  258 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaa 325  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  21006125 ggtaaccttgacgcaaccggtaaaattgttgtcatgcgactgaaaggtcaaaggttcaagtactggaa 21006192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 10378884 - 10378744
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||         ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||    
T  10378884 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggttacgggttcaagtcctggaaa---------gtg-agaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aa 10378797  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    ||||||||||||  |||  | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  10378796 atggtgggaccc-cttcttggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccggg 10378744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 288 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 19974221 - 19974074
Alignment:
Q  288 gtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||| || |||  |||| ||||| |||| |||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  19974221 gtcacgtgactgaaagatcacgggttcaagtcttggaaacagcctcaagtgt-aaaaatagggcaaggttgcgtacaatacacc-aaaatgatgggaccc 19974124  T
Q  388 ttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
      |||||| || || |||||||||||||| |||||||| ||| | ||||||    
T  19974123 -attcccggactctatgtatgcgggagctttagtgcacggggctgcccttt 19974074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 276 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 2436052 - 2435983
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 345  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  2436052 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcctgtgtaaaaaa 2435983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 293 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 45264542 - 45264411
Alignment:
Q  293 gtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttc 392  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||| ||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||||  |||    
T  45264542 gtgattgaaaggtcacatgttcaagtcctggaaacaacctcttgtgcaaaaaacagagtaaggctgtgtgcaatacacc-aaaatggtgggaccc-cttc 45264445  T
Q  393 ccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
     |  ||||||  |||||||||||| |||||||||    
T  45264444 tcagaccctgcatatgcgggagctttagtgcacc 45264411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 345 - 416
Target Start/End: Original strand, 15505632 - 15505700
Alignment:
Q  345 acagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  15505632 acagggtaagactgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 15505700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 263 - 429
Target Start/End: Original strand, 35019217 - 35019378
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||| ||| |  ||||||| |||||| |||  |||| |||| ||    
T  35019217 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgactgaaaggtcacagattcaagtcctgtaaacaacctcttgtataaaaatcagtataaggctgcata 35019315  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    |||||||||  || |||||||||||   ||||  |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||    
T  35019316 caatacacc--aattggtgggaccc--ctcccagaccctgcgtatgcgagagctttagtgcaccggg 35019378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 340 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 31442485 - 31442396
Alignment:
Q  340 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| || ||||||||| ||||||| | ||||||||||||    
T  31442485 aaaaaacagggtaaggatgcgtacaatacacc-aaaatggtgggaccc-cttcccggacactgtgtatgtgggagctttggtgcaccgggtt 31442396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 363 - 438
Target Start/End: Original strand, 50606487 - 50606561
Alignment:
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  50606487 caatacaccaaaaatggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 50606561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 276 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 34679378 - 34679280
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||| || |||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  34679378 ggtaaagttattgtcatgtgactgaaatatcacatgttccattcctagaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtactatacatcaaa 34679280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 287 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31272522 - 31272446
Alignment:
Q  287 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtaca 364  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |  |||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  31272522 tgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgta-aaaacatggtaaggctgcgtaca 31272446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 318 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 31382330 - 31382214
Alignment:
Q  318 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagcta 417  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| | ||||||  ||||||||||||     
T  31382330 tcctggaaacagcctcttgtgtaaaaa-caggataaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcctggaccctgcatatgcgggagctt 31382235  T
Q  418 tagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || || |||||||| ||||||    
T  31382234 tactgtaccgggttgcccttt 31382214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 270 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 14988084 - 14987989
Alignment:
Q  270 gcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaa 365  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||  || |||||  |||||||||||| ||| ||| |||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  14988084 gcaactggtaaagttgttgtcatatgactagaaagtcacaagttcaagtcctgaaaacagtatcttatgtaaaatacaggataaggctgcgtacaa 14987989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 294 - 429
Target Start/End: Original strand, 23371141 - 23371271
Alignment:
Q  294 tgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcc 393  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| || | |||| ||||||||| ||| |||  || |||||||||||||||  || |||||||| ||  |    
T  23371141 tgactgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagccacttgggtaaaaaac-gggcaaggttgtgtacaatacaccaaa--tgctgggacccctt--c 23371235  T
Q  394 cgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    |  |||||| ||||| || |||| ||||||||||||    
T  23371236 cagaccctgcgtatgtggtagctttagtgcaccggg 23371271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 340 - 385
Target Start/End: Original strand, 46859129 - 46859173
Alignment:
Q  340 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggac 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  46859129 aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacc-aaaatggtgggac 46859173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 278 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 19656263 - 19656152
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 377  Q
    |||| ||||||||  |||||| |||||||||  | ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |||||  ||  |||||||||||| |||||    
T  19656263 taaagttgttgtcgcgtgactcaaaggtcactagctcaaggcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaacgctatgtacaatacacc-aaaat 19656165  T
Q  378 ggtgggacccttt 390  Q
    ||| |||||||||    
T  19656164 ggtaggacccttt 19656152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 424
Target Start/End: Original strand, 43207476 - 43207640
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaagg------tcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||      |||| |||| ||||| |||||| |  ||||| ||| ||||||||||||||||    
T  43207476 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgactgaatggacacactcacaggtttaagtcttggaaacaacctcttatgtgaaaaacagggtaagac 43207574  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgca 424  Q
     || ||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  43207575 ggcatacaatacacc-aaattggtggga-cctcttcccagaccctatgtatgcgagagctttagtgca 43207640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 287 - 326
Target Start/End: Original strand, 43768168 - 43768207
Alignment:
Q  287 tgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 326  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43768168 tgtcatgtcactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 43768207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 333 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20999952 - 20999850
Alignment:
Q  333 cttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtta 432  Q
    ||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| || || | |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20999952 cttgtgtaaaaaacaaggcaaggctgcgtacaatacaccaaa--tgatggggcccctt-ccggcaccctgcgtacgcgggagctttagtgcaccgggctg 20999856  T
Q  433 cccttt 438  Q
    ||||||    
T  20999855 cccttt 20999850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 255 - 341
Target Start/End: Original strand, 21723642 - 21723727
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa 341  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||  |||| ||||||||||| || |||||||||||    
T  21723642 aggggtaaccttcgcacaactggtaaagttgttgtcatgtgactggatggttacaagttc-agtcctggaaacagcctcttgtgtaa 21723727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 331 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 1517416 - 1517311
Alignment:
Q  331 ctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    ||||||||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||| ||  | || ||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  1517416 ctcttgtgttaaaaaacatgataaggctgcgtacaatacaccaat--tggtgggaccccttctcaga-ccctgcgtatgcaggagctttagtgcaccggg 1517320  T
Q  430 ttacccttt 438  Q
    || ||||||    
T  1517319 ttgcccttt 1517311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 319 - 438
Target Start/End: Original strand, 23796507 - 23796623
Alignment:
Q  319 cctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat 418  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||  ||||||  ||||| |||||| |    
T  23796507 cctggaaacagcctcttgtgtaaaaatcaatgtaaggttgcgtacaatacacc--aaatggtgagaccc-cttcccagaccctgcatatgctggagcttt 23796603  T
Q  419 agtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||| | ||||||    
T  23796604 agtgcaccgggctgcccttt 23796623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4249520 - 4249455
Alignment:
Q  358 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  4249520 gcgtacaatacaccaaa--tggtgggatccctt-cccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4249455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4249844 - 4249779
Alignment:
Q  358 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  4249844 gcgtacaatacaccaaa--tggtgggatccctt-cccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4249779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 358 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 4250168 - 4250103
Alignment:
Q  358 gcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcacc 426  Q
    |||||||||||||||||  |||||||| || || |||||||| |||||||||||||||| || ||||||    
T  4250168 gcgtacaatacaccaaa--tggtgggatccctt-cccgaaccttgtgtatgcgggagctttaatgcacc 4250103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 387
Target Start/End: Original strand, 10163733 - 10163867
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 350  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||||| || ||| || ||  ||| |||| ||| ||| |  ||||| ||||||||| | |     
T  10163733 ttagaggggtaacattggcgcaactgataaagttgttgtcatgtggctaaaatgttacaagtttaagttctgaaaacaacctcttatgtaaaaaatatga 10163832  T
Q  351 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    ||||| ||  ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  10163833 taagattgtatacaatacatc--aaatggtgggaccc 10163867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 275 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 25554882 - 25554817
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgta 340  Q
    ||||||| ||||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| |  ||||||||||    
T  25554882 tggtaaagttgttgtcacgtgactaaaaggccacgtgtttaagtcctggaaacaacctcttgtgta 25554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 416
Target Start/End: Original strand, 30682845 - 30682948
Alignment:
Q  308 cgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtat 407  Q
    ||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||| || |||| |||||  | ||||||||||||||  |||||| ||| || ||||    
T  30682845 cgggttcaaatcctgaaaatagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaagattgtgtac-ataca--acaaatggtgggaccc-cttcccggaccgtgcgtat 30682939  T
Q  408 gcgggagct 416  Q
    |||||||||    
T  30682940 gcgggagct 30682948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 438
Target Start/End: Original strand, 43768205 - 43768297
Alignment:
Q  343 aaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||  || |||||||||||  |||||  |||||| |||| |||||||| || ||||||||| | ||||||    
T  43768205 aaacagggtaaggctgcctacaatacacc--aattggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatacgggagctttaatgcaccgggctgcccttt 43768297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 49722724 - 49722641
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaata 367  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| || ||| |  |||||||  ||| || ||||||||| |||||||||||    
T  49722724 ttgttgtcacgtgaatgaaaggtcacgggtttaagtcatgtaaacaacctcttgt-aaaataatagggtaagattgcgtacaata 49722641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 259 - 440
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59116
Alignment:
Q  259 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 358  Q
    |||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  58936 gtaaccttggagcaactggtaaacttattgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtataaaaaacagggtaagactg 59035  T
Q  359 cgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  || ||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||    
T  59036 cgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttcccagactctgcgtatgcgggagctttagtgcatcgggttgccctttat 59116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 92)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 261 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 16408777 - 16408601
Alignment:
Q  261 aaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408777 aaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 16408678  T
Q  361 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  16408677 tacaatacaccaataatggtggaaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 16408601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 5648213 - 5648393
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  5648213 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaa 5648311  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  5648312 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcactgggttgcccttt 5648393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 254 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 6430806 - 6430627
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||    
T  6430806 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcatggaaacagcctcttgtgta-aaaacagggtaa 6430708  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||    
T  6430707 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtggga-ccacttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagcgcaccgggttgccctt 6430627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 11054328 - 11054148
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||||||    
T  11054328 agaggggtaactttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgt--aaaacagggta 11054231  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| || ||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  11054230 agactgcgtacaatacacc--aaatggcggaaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 11054148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 20224938 - 20225117
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||    
T  20224938 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt--aaaacagggtaa 20225035  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  20225036 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 20225117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Original strand, 23501746 - 23501924
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||      | || ||||||||||||||||||||||    
T  23501746 agaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc------acagcctcttgtgtaaaaaacagggta 23501839  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  23501840 aggttgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 23501924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 48599004 - 48598825
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||    
T  48599004 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaa 48598907  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||| ||  ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48598906 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccatgcatatgccggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48598825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 257 - 438
Target Start/End: Original strand, 16911519 - 16911699
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||| ||| ||||||||| |    
T  16911519 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgacttaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtacaaatcagggtaaggc 16911618  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||||| ||| ||||||||| ||||  |||||||| ||||||    
T  16911619 tgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtacgcgggagctttagtttaccgggttgcccttt 16911699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 273 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 44363294 - 44363128
Alignment:
Q  273 actggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||||||| | ||||||||||  |||||    
T  44363294 actggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgaaaacagcctcgtgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtacaacgcacca 44363195  T
Q  373 aaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    |||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  44363194 aaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttat 44363128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 253 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 47528710 - 47528530
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||    
T  47528710 agaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggta 47528613  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  47528612 aggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgaatatgtgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 47528530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 253 - 431
Target Start/End: Original strand, 21646917 - 21647094
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||    
T  21646917 agagggataaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggta 21647016  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    || |||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||  |||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  21647017 aggctgcgtacaatataccaataatggtgggaccc-cttcccagaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggtt 21647094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 30639334 - 30639514
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||    
T  30639334 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcttgtgactgaaaggtcactggttcaagtcctggaaacagactcttgtgt-aaaaacagggtaa 30639432  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  |||||||| |||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  30639433 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgagaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcactgggttgcccttt 30639514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 251 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13256581 - 13256399
Alignment:
Q  251 ttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacaggg 350  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    || ||||||||||||||||||||    
T  13256581 ttagaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcataggttcaagtcctgg----agcctcttgtgtaaaaaacaggg 13256486  T
Q  351 taagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||||| |  | |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  13256485 taaggctgcgtacaatacaccaataatagtgggaccc-cttcccgaaccccgcatctgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 13256399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 5306844 - 5306660
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||    
T  5306844 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgatgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaatcagggtaa 5306746  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg----cgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |  |||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| |||||    |||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  5306745 ggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgtggacgggagctttaatgcaccgggttgcccttt 5306660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 275 - 387
Target Start/End: Original strand, 25343162 - 25343274
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25343162 tggtaaagttgttgtcacgtgactgataggtcacaggttcaagttctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 25343261  T
Q  375 aatggtgggaccc 387  Q
    || ||| ||||||    
T  25343262 aagggttggaccc 25343274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 283 - 438
Target Start/End: Original strand, 54175046 - 54175200
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgg-aaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtg 381  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  54175046 ttgttgtcatgtgactgaaatgtcacggattcaagtcctggaaaacagcctcttgtgt-aaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaaatggtg 54175143  T
Q  382 ggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  54175144 ggaccccttccccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 54175200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 259 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 30352767 - 30352580
Alignment:
Q  259 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-----aaaacagggtaa 353  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| || |||||||||||     ||||||||||||    
T  30352767 gtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcaagtgaccgaaaggtcacgggttagagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaaaaaaacagggtaa 30352668  T
Q  354 g----actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |     ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||    
T  30352667 gtaaagctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc-cttctcggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgtgttgcccttt 30352580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 276 - 438
Target Start/End: Original strand, 35567146 - 35567305
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||  ||    
T  35567146 ggtaaagttgttgtcatgtaactgaaaggtcatgggttcaagtcttggaaacagccacttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaacacacc--aa 35567243  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||| | ||||||    
T  35567244 atggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtctgcgggagctttagtgcaccgggctgcccttt 35567305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 292 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 29208039 - 29207900
Alignment:
Q  292 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccctttt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||    
T  29208039 tgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaattgcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-ctt 29207945  T
Q  392 cccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 436  Q
    |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  29207944 cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgccct 29207900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 264 - 428
Target Start/End: Original strand, 19027813 - 19027973
Alignment:
Q  264 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 363  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19027813 cttgacgcaa-tggtagagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacatcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtac 19027911  T
Q  364 aatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    ||||||||  || ||||||||||| ||||| | || ||| ||||| ||||||| |||||||||||    
T  19027912 aatacacc--aattggtgggacccctttccag-actctgcgtatgtgggagctttagtgcaccgg 19027973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 273 - 437
Target Start/End: Original strand, 40915802 - 40915962
Alignment:
Q  273 actggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca 372  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||     
T  40915802 actggtaaagttgttgtcatgtgactataaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt-aaaaacaaggtaaggctgcgtacaatacacc- 40915899  T
Q  373 aaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
     ||||||||||| ||  |||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||| || |||||    
T  40915900 -aaatggtgggagcc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagcttcagtgcaccggattgccctt 40915962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 249 - 438
Target Start/End: Original strand, 20405042 - 20405224
Alignment:
Q  249 tcttagaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaaca 347  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||       ||| |||| || ||||||||| ||||||||    
T  20405042 tcttggaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacggg-------cctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaaca 20405134  T
Q  348 gggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||  ||||| ||||||    
T  20405135 gggtaagattgcgtacaatacactaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcattgggttgcccttt 20405224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 253 - 424
Target Start/End: Original strand, 37494804 - 37494972
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||    
T  37494804 agaggggtaaccttggtgcaactggtaaagttgttgccatgcgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggta 37494903  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgca 424  Q
    ||  ||| ||||||| |||  |||||||||||||| ||| | | |||||| |||||| |||||| |||||||    
T  37494904 aggttgcatacaatatacc--aaatggtgggaccccttt-cgggaccctgcgtatgcaggagctttagtgca 37494972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 278 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 9832468 - 9832313
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 377  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||    
T  9832468 taaaattgttgtgatctgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaat 9832373  T
Q  378 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||| || |||||||||||||| ||||||    
T  9832372 ggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcaggaactctagtgcaccgggttgcccttt 9832313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 257 - 438
Target Start/End: Original strand, 54730206 - 54730387
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaaga 355  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||||| ||| ||||     
T  54730206 gggtaactttggcgcaatcggtaaagttgttgtcatgtgaccaaaaggtcacgggttcaagtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaaaataggataagg 54730305  T
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||| |||||||||| |||| ||| ||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  54730306 ctgcgtataatacaccaataatgatggaaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgaattacccttt 54730387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 283 - 415
Target Start/End: Complemental strand, 7385628 - 7385499
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||||||||  || || |||||||||  |||||||||    
T  7385628 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagccctggaaacagcctcatgtgtaaaaaatagggtaaggttgtgtgcaatacacc--aaatggtgg 7385531  T
Q  383 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagc 415  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  7385530 gaccc-tttcccggaccctgtgtatgcgggagc 7385499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 387
Target Start/End: Original strand, 10660358 - 10660491
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||     
T  10660358 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10660457  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10660458 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccc 10660491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 254 - 387
Target Start/End: Original strand, 10874503 - 10874636
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||     
T  10874503 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggttacatgttcaagtcctggaaacaacctcttatgtaaaaaatagggtat 10874602  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    | |||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  10874603 ggctgcatacaatacaccaataatggtgagaccc 10874636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 9e-34
Query Start/End: Original strand, 317 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 20639777 - 20639658
Alignment:
Q  317 gtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||| |||||| |||||||||||||    
T  20639777 gtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc-aaaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagct 20639680  T
Q  417 atagtgcaccgggttacccttt 438  Q
     |||||||||||||| ||||||    
T  20639679 ttagtgcaccgggttgcccttt 20639658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 386
Target Start/End: Original strand, 14590795 - 14590922
Alignment:
Q  258 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagac 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  14590795 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggc 14590894  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacc 386  Q
    ||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  14590895 tgcatacaatacatc--aaatggtgggacc 14590922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 283 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 17043546 - 17043444
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  17043546 ttgttgtcaagtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaatacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgg 17043449  T
Q  383 gaccc 387  Q
    |||||    
T  17043448 gaccc 17043444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 299 - 438
Target Start/End: Original strand, 47443956 - 47444092
Alignment:
Q  299 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaac 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||    
T  47443956 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggac 47444052  T
Q  399 cctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||  ||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||||    
T  47444053 cctgcatatgcaggagcttcagtgcactgggttgcccttt 47444092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 286 - 438
Target Start/End: Original strand, 25463108 - 25463256
Alignment:
Q  286 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggac 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| |||||  ||||||||||||    
T  25463108 ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaaaactgggaaaggttgcgtacaacacacc--aaatggtgggac 25463205  T
Q  386 ccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||  |||||| ||||||  |||||||||||| | ||||||| || ||||||||    
T  25463206 cc-cttcccggaccctgcatatgcgggagct-ttgtgcaccaggctacccttt 25463256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 285 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 30690333 - 30690175
Alignment:
Q  285 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-------aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 377  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||       ||||||||||||| |||| |||||||||||  || |    
T  30690333 gttgtcaagtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaaaagcctcttgtgtaaaaaataaaaaacagggtaaggctgcatacaatacacc--aatt 30690236  T
Q  378 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    ||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| || | |||||||    
T  30690235 ggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggctgcccttta 30690175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 269 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 8473786 - 8473621
Alignment:
Q  269 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatac 368  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||  ||||||||||||||||||| || |||||||||    ||||||||||| |||| ||||||||    
T  8473786 cgcaactggtaaagttgttgtcatatgaccggaaggttgcgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--ttaacagggtaaggctgcatacaatac 8473689  T
Q  369 accaaaaatggtgggacccttttccc-gaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctt 437  Q
    |||  |||||||||||||| || ||| || |||||  |||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  8473688 acc--aaatggtgggaccccttccccggacccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctt 8473621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 312 - 431
Target Start/End: Original strand, 21489099 - 21489216
Alignment:
Q  312 ttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgg 411  Q
    ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  21489099 ttcaagtcctggaaacagcctcttgcgtaaaaaacagagtaagactgcgtacaatgcacc-aaaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgg 21489196  T
Q  412 gagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    ||||| | |||||| |||||    
T  21489197 gagctttcgtgcactgggtt 21489216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 328 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 48327872 - 48327762
Alignment:
Q  328 agtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccg 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||    ||||||| || | ||||||||||    
T  48327872 agtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcatacaatacaccaataatggtggga-cctcttcccgaaccccacatatgcggaagttttagtgcaccg 48327774  T
Q  428 ggttacccttta 439  Q
    ||||||||||||    
T  48327773 ggttacccttta 48327762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 257 - 422
Target Start/End: Original strand, 14983791 - 14983953
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| | |||| || ||||||||||||||| ||||||||      
T  14983791 gggtaaccttggcagaactggtaaagttgttgtcatatgattggaaggtcacggattcaagtctttgaaacagcctcttgtgtaaaaaatagggtaaggt 14983890  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtg 422  Q
    ||| ||||||||||   ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  14983891 tgcctacaatacac--taaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtg 14983953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 283 - 431
Target Start/End: Complemental strand, 39077946 - 39077803
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  |||||||||  ||||||||||| ||||||  |||||     
T  39077946 ttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggttgcgtacaatataccaaa--tggtga 39077851  T
Q  383 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    |||   ||||| || |||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  39077850 gacatctttccgga-ccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggtt 39077803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 55766647 - 55766466
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcac-gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||   ||||||||||    
T  55766647 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgaccggaaggtcacggggttcaagttttggaaacagtttcttgtgt-gtaaacagggta 55766549  T
Q  353 agactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    || |||||||||||||||    |||||||| ||||   ||||| ||| || ||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||    
T  55766548 aggctgcgtacaatacac--tgaatggtggaaccc-catcccggaccttgcgtatgcgagagctttagtgcaccgggatgcccttt 55766466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 23580365 - 23580268
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||    
T  23580365 taaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagttctagaaagagcctcttgtgtaaaaaacaggggaagactgcgtaggatacaccaaaa 23580268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 276 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 487294 - 487187
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||| | |||    
T  487294 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgtataaaacaaggtaaagctgcgtacaataca-ctaaa 487196  T
Q  376 atggtggga 384  Q
    |||||||||    
T  487195 atggtggga 487187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 255 - 429
Target Start/End: Original strand, 54966977 - 54967145
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  54966977 agggggaaccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacatgttcaagttctggaaagaacctcttgtgtaaaaaacagggtaag 54967075  T
Q  355 actgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
      ||| ||||||| |||  ||||||||||||||  |||||| |||||   |||||||||||| | ||||||||||    
T  54967076 gttgc-tacaatatacc--aaatggtgggaccc-cttcccgtaccctacatatgcgggagct-ttgtgcaccggg 54967145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 8e-25
Query Start/End: Original strand, 276 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 47441689 - 47441591
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  47441689 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtccaagaaacagtctcttttgtaaaaatcagggtaaggctgtgtacaatacaccaaa 47441591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 254 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 55830902 - 55830786
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgg-gttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggta 352  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  | |||||||||| ||||||||  |||||| ||||||||||||   ||||||||||    
T  55830902 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgatcggaaggtcacggagttcaagttttggaaacagtctcttgtgt-gtaaacagggta 55830804  T
Q  353 agactgcgtacaatacac 370  Q
    |  |||||||||||||||    
T  55830803 atgctgcgtacaatacac 55830786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 39029220 - 39029082
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    |||||| |||||||| ||||||| ||||||||  |||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||    
T  39029220 ggtaaagttgttgtcgtgtgactaaaaggtcataggttcaagccttggaaacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaaggctgtgtacaataca-cgaaa 39029122  T
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    |||||||||||  ||| ||| ||||||  ||||||||||||    
T  39029121 atggtgggaccacttt-ccggaccctgcatatgcgggagct 39029082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 276 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42164307 - 42164224
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  42164307 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacaacctcttgtgta-aaaacagggtaaggctgcg 42164224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 288 - 375
Target Start/End: Original strand, 7038041 - 7038127
Alignment:
Q  288 gtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaa 375  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  7038041 gtcatgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctg-aaacagcttcttgtgtaaaaaatagggtaagacttcgtacaatacaccaaaa 7038127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 257 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 17315476 - 17315389
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 344  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  ||||||||||||||    
T  17315476 gggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaattcctcgaaacaacctcttgtgtaaaaa 17315389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 320 - 438
Target Start/End: Original strand, 25629069 - 25629184
Alignment:
Q  320 ctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctata 419  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||   |||||||||||| ||    
T  25629069 ctggaaacagtctcttgtgtaaaaaatagggtaaggctgtgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctacatatgcgggagcttta 25629165  T
Q  420 gtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  25629166 gtgcaccgggttgcccttt 25629184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 276 - 425
Target Start/End: Complemental strand, 20908797 - 20908649
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaag-gtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || ||  ||||||||| |||||| |   |||| | ||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  20908797 ggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaatgttacatgttcaagtcatggaaacatcgtcttttctaaaaaagaaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa 20908698  T
Q  375 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcac 425  Q
    | ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  20908697 a-tggtgggacccctt-cccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcac 20908649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 318 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 7909397 - 7909281
Alignment:
Q  318 tcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgc-gggagct 416  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| |||||||    
T  7909397 tcctggaaacagtctcttgtgtaaaaa-cagggtaaggttgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcggggagct 7909302  T
Q  417 atagtgcaccgggttaccctt 437  Q
     ||||||| |||||| |||||    
T  7909301 ttagtgcatcgggttgccctt 7909281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 345 - 440
Target Start/End: Original strand, 20225119 - 20225213
Alignment:
Q  345 acagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||| |||| |  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  20225119 acagggtaaggctgcgtacaatacaccaataatggtgggaccc-cttcccggaccccgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgccctttat 20225213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 41018945 - 41018855
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||  |||||||| || ||||||||||||||||    
T  41018945 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgt-aaaattagggtaaggctacgtacaatacaccaaa 41018855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 283 - 416
Target Start/End: Complemental strand, 49938742 - 49938615
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||||   | |||||||||||| ||||||||||    
T  49938742 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcacaggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgta-aaaacggggtaag---gtgtacaatacacc-aaaatggtgg 49938648  T
Q  383 gacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    |||||  |||||  ||||||  ||||||||||||    
T  49938647 gaccc-cttcccataccctgcatatgcgggagct 49938615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 429
Target Start/End: Original strand, 36589708 - 36589870
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |||||  ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||   |    
T  36589708 ccttggcgcaac-ggtaaagttgatgtcacatgactgaaacgtc-caggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgtaaaaaacatggtaatgctgttga 36589805  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    || |||||| |||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  36589806 cagtacacc-aaaatggtgggaccc-cttcctgaaccctatgtatgcgggagctttggtgcaccggg 36589870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 263 - 345
Target Start/End: Complemental strand, 54640510 - 54640429
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaa 345  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||    
T  54640510 ccttggcgcaac-ggtaaaattgttgtcacgtggctgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaacagcctcttgtgtaaaaaa 54640429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 344 - 438
Target Start/End: Original strand, 2813169 - 2813263
Alignment:
Q  344 aacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctat-agtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||||||||||| | |||||||||| || ||||||    
T  2813169 aacagggtaagactgcgtacaatacatcaataatggtgggaccc-tttcccgaacgatgcgtatgcgggagctttaagtgcaccggattgcccttt 2813263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 342 - 429
Target Start/End: Original strand, 16494259 - 16494345
Alignment:
Q  342 aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccggg 429  Q
    ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||    
T  16494259 aaaacagggtaaagctgcatacaatacaccaaaaatggtgggaccc-tttcccagaccctgtgtatgcggaagctttagtgtaccggg 16494345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 264 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 30496491 - 30496383
Alignment:
Q  264 cttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtac 363  Q
    |||| ||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||| |   ||||||| |||| |||    
T  30496491 cttggcgcaactgtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgtgttcaagtcatggaaacagcctcttgtgtaaaca--cgggtaaggctgcatac 30496394  T
Q  364 aatacaccaaa 374  Q
    |||||||||||    
T  30496393 aatacaccaaa 30496383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 276 - 359
Target Start/End: Original strand, 43035224 - 43035307
Alignment:
Q  276 ggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgc 359  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  43035224 ggtaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacgggttcaagtccaggaaacaacctcttgtgtaagaaacacggtaaggctgc 43035307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 331 - 428
Target Start/End: Complemental strand, 51865142 - 51865048
Alignment:
Q  331 ctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgg 428  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||| |||  |||||| |||||| ||||||||||||| || ||||||||    
T  51865142 ctcttgtgtaaaaaacatggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtggggccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttattgcaccgg 51865048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 257 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 5313172 - 5313107
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctg 322  Q
    ||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  5313172 gggtaaccttggcgtaactggtaaagttgttgtcatgtgattgaaaggtcacgggttcaattcctg 5313107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 278 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 32478942 - 32478790
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaat 377  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||| |  |||| |||| |||||||||||||| |||     ||||||||  ||||    
T  32478942 taaagttgttgtcatgtgaccgagaggtcacaggttcaagtcctggaaacaacctctagtgt-aaaaacagggtaaggctg-----aatacacc--aaat 32478851  T
Q  378 ggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    ||||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| | |||||||||||  ||||||||    
T  32478850 ggtgggaccc-cttcccggacccagcgtatgcgggagct-ttgtgcaccgggtggccctttat 32478790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 299 - 416
Target Start/End: Original strand, 9037729 - 9037844
Alignment:
Q  299 gaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaac 398  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||| ||||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||   |||||| |||||| ||| ||||||    
T  9037729 gaaaggtcacatgttcaagtcatagaaataatctcttgtgcataaaatagggtaagactgcatacaatacacc--gaatggtaggaccccttttccgaac 9037826  T
Q  399 cctgtgtatgcgggagct 416  Q
     ||| |||||| ||||||    
T  9037827 actgcgtatgcaggagct 9037844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 278 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 30581624 - 30581515
Alignment:
Q  278 taaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaa-aaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaa 376  Q
    |||| |||||||||  | ||| |||||||| ||||||||||| |||||| |  ||||||||||| |||||||||||||  || |||||||||||| ||||    
T  30581624 taaagttgttgtcacatcactaaaaggtcaagggttcaagtcgtggaaacaacctcttgtgtaaaaaaacagggtaagggtgtgtacaatacacc-aaaa 30581526  T
Q  377 tggtgggaccc 387  Q
    |||||||||||    
T  30581525 tggtgggaccc 30581515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 285 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32629418 - 32629350
Alignment:
Q  285 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaag 354  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||  |||||||||||||||    
T  32629418 gttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaaatcctcgaaacagcctcttgt-aaaaaaacagggtaag 32629350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 361 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 33836563 - 33836487
Alignment:
Q  361 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||    
T  33836563 tacaatacaccaataatggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaacgggttgcccttt 33836487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 341 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 36816479 - 36816384
Alignment:
Q  341 aaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| |||||||| | || || | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  36816479 aaaaacagggcagggctgcgtacaatacaccaaaaa-ggtgggactcctt-cctggaccctgtgtatgcgggagctttagtgtaccgggttgcccttt 36816384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 416
Target Start/End: Original strand, 49796818 - 49796910
Alignment:
Q  320 ctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagct 416  Q
    ||||||| || ||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49796818 ctggaaacagcctcttgtgttaaaa-catggtaaggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgggagct 49796910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 3580994 - 3580901
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||    |||||||||||||| || |||||| ||| || ||||||||||||    
T  3580994 gtaaagttgttgtcatgtgactgaaaagtcacgagttcaagt-ctggaaa---cctcttgtgtaaaaaccatggtaaggctgtgtgcaatacaccaaa 3580901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 283 - 372
Target Start/End: Original strand, 51420556 - 51420646
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggg-ttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacacca 372  Q
    ||||||||| |||||||||||||||   | |||||||| |||||| |  |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  51420556 ttgttgtcacgtgactgaaaggtcagttgattcaagtcatggaaacaacctcttgtgtagaaaacagggtaaggctgggtacaatacacca 51420646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 439
Target Start/End: Original strand, 11394924 - 11394988
Alignment:
Q  374 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11394924 aaatggtgggacccctttccgga-ccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 11394988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 439
Target Start/End: Original strand, 11404651 - 11404715
Alignment:
Q  374 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  11404651 aaatggtgggacccctttccgga-ccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 11404715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 263 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 12257764 - 12257688
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgta 340  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||  |||||||||    
T  12257764 ccttgacgcaac-ggtaaagttgttgtcacgtgattgaaaggtcacgggttcaaatcctagaaacagcgtcttgtgta 12257688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 312 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 9987957 - 9987884
Alignment:
Q  312 ttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    ||||||||||||||| |  |||||||||||| || |||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  9987957 ttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaacaatagggtaaggctgcatacaatacacc--aaatggtgggaccc 9987884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 375 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 38755970 - 38755907
Alignment:
Q  375 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  38755970 aatggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 38755907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 375
Target Start/End: Original strand, 44357195 - 44357295
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||| || |||| |||| |||||||||||| | ||||||||||| |||| |  || |||||||| ||| || |||||||  ||||||||||||||||    
T  44357195 tggtaaagttattgttatgtaactgaaaggtcatgagttcaagtcctagaaacaaccttttgtgtaataaatagagtaagacgacgtacaatacaccaaa 44357294  T
Q  375 a 375  Q
    |    
T  44357295 a 44357295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 275 - 378
Target Start/End: Original strand, 11579819 - 11579922
Alignment:
Q  275 tggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| | ||  |||| ||||| |||||| | ||| |||| |||||||||   ||| ||||| ||||||||||||||    
T  11579819 tggtaaagttgttgtcatgtgattgaaatggcataggtttaagtcttggaaacaatctattgtataaaaaacaatataaaactgcatacaatacaccaaa 11579918  T
Q  375 aatg 378  Q
    ||||    
T  11579919 aatg 11579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 263 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 49938610 - 49938490
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaa-ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgt 361  Q
    ||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| |||||  ||  | |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  49938610 ccttggcgcaac-ggtaaaagttgttgtcacgtgactgaaaggtcacagattcaagtcttggaagcagcgtattgtgt-aaaaacagggtaaggctgcgt 49938513  T
Q  362 acaatacaccaaaaatggtgggac 385  Q
     |||| || | |||||||||||||    
T  49938512 ccaattcatc-aaaatggtgggac 49938490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 309 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 17079777 - 17079698
Alignment:
Q  309 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 390  Q
    ||||||||||| |||||| | | ||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||| |   |||||||||||||||||    
T  17079777 gggttcaagtcttggaaacaatatcttgtgtataaaacagggtaaggctgcatacaatacgc--taaatggtgggacccttt 17079698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 334 - 387
Target Start/End: Complemental strand, 35894563 - 35894511
Alignment:
Q  334 ttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggaccc 387  Q
    |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35894563 ttgtgtaaaaaacacggtaagtgtgcgtacaatacacc-aaaatggtgggaccc 35894511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 390 - 439
Target Start/End: Complemental strand, 40553985 - 40553936
Alignment:
Q  390 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  40553985 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttta 40553936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 257 - 297
Target Start/End: Original strand, 18969698 - 18969738
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgac 297  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18969698 gggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgac 18969738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 390 - 438
Target Start/End: Original strand, 35532079 - 35532127
Alignment:
Q  390 ttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  35532079 ttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 35532127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 374 - 438
Target Start/End: Original strand, 38786681 - 38786744
Alignment:
Q  374 aaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  38786681 aaatggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 38786744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 291 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 10380086 - 10380004
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |  |||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  10380086 atgtgactgaaaggtcacttgttcaagtcctacaaacaacctcttgtgta-aaaataggataaaattgcgtacaatacaccaaa 10380004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 332 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 12711553 - 12711510
Alignment:
Q  332 tcttgtgtaaaaaac-agggtaagactgcgtacaatacaccaaa 374  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12711553 tcttgtgtaaaaaaatagggtaagactgcgtacaatacaccaaa 12711510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 263 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 50856407 - 50856345
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 326  Q
    ||||| |||||| |||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50856407 ccttggcgcaac-ggtaaagttgttgtcacatgattgaaaggtcacgggttcaagtcctagaaa 50856345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 376 - 438
Target Start/End: Original strand, 32484307 - 32484368
Alignment:
Q  376 atggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  32484307 atggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 32484368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 375 - 440
Target Start/End: Original strand, 25388249 - 25388313
Alignment:
Q  375 aatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  25388249 aatggtgggacccctt-cccggaccctgcgtatgcatgagctttagtgcaccgggttgccctttat 25388313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 332 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23914430 - 23914379
Alignment:
Q  332 tcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtggga 384  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||    
T  23914430 tcttgtgtaaaaat-agggtaagactgcatacaatacatcaaatatggtggga 23914379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Original strand, 30533 - 30712
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||     
T  30533 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagggtag 30630  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | ||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||| ||||||  |||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  30631 ggctgcgtacaatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 30712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0187
Description:

Target: scaffold0187; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 257 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 10226 - 10052
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||    
T  10226 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagac 10129  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 436  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  10128 tgcgtacaatacacc--aaatagtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 10052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 257 - 436
Target Start/End: Complemental strand, 20554 - 20380
Alignment:
Q  257 gggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagac 356  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||| |||||||    
T  20554 gggtaaccttgacgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacagagtaagac 20457  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccct 436  Q
    |||||||||||||||  |||| |||||||||  |||||| ||||||  ||||| ||||||  ||||||||||||| ||||    
T  20456 tgcgtacaatacacc--aaatagtgggaccc-cttcccggaccctgcatatgcaggagctccagtgcaccgggttgccct 20380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 319
Target Start/End: Original strand, 8899 - 8964
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc 319  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8899 gaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 8964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0187; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 254 - 319
Target Start/End: Original strand, 19227 - 19292
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtc 319  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  19227 gaggggtaaccttggcgcaaccggtgaagttgttgtcatgtgactgaaatgtcacaggttcaagtc 19292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 4)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 254 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24948 - 24772
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaa 353  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     || || |||||||||||||||||||||||    
T  24948 gaggggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtc-----aacagcctcttgtgtaaaaaacagggtaa 24854  T
Q  354 gactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    | |||||||||| |||||  ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| ||||||    
T  24853 ggctgcgtacaacacacc--aaatggtgggaccc-cttcccgaaccctgcgtatgcgggagctttagtgcagccggttgcccttt 24772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 263 - 438
Target Start/End: Original strand, 46794 - 46966
Alignment:
Q  263 ccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgta 362  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||  ||||||    
T  46794 ccttggcgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactagaaggtcacgggttcaagtgctggaaacaacctcttgtgtaaaaaatagggtaaggttgcgta 46893  T
Q  363 caatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  46894 caatacacc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcaccgggttgcccttt 46966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 313 - 438
Target Start/End: Original strand, 43672 - 43793
Alignment:
Q  313 tcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcggg 412  Q
    |||||| ||||||| ||  ||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| || ||||||  ||||||||    
T  43672 tcaagttctggaaacagcgtcttgtgtaaaa--caaggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctttctcggaccctgcatatgcggg 43767  T
Q  413 agctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||| |||||||| | ||| ||||||    
T  43768 agctctagtgcactgagttgcccttt 43793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 47041 - 46995
Alignment:
Q  277 gtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctgg 323  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47041 gtaaagttgttgtcaggtgactgaaaggtcacgagttcaagtcctgg 46995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0258
Description:

Target: scaffold0258; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 256 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 13202 - 13024
Alignment:
Q  256 ggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaaga 355  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| || ||||||| ||||||     
T  13202 ggggtaaccttggcgcaaccggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcaccggttcaagtcctggaaacagcctcttgcgt-aaaaacaaggtaagg 13104  T
Q  356 ctgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||  |||||  |||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  13103 ctgcgtacaatacacc--gaatggtgggaccc-cttcccagaccctgcgtatgcgggggctttagtgcaccgggttgcccttt 13024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0258; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 255 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17549 - 17507
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgac 297  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17549 aggggtaaccttaacgcaactgctaaagttgttgtcatgtgac 17507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 270 - 431
Target Start/End: Original strand, 10780 - 10938
Alignment:
Q  270 gcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaataca 369  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |  |||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  10780 gcaactggtaaagttgttgtcatgtgactggaaggtcacgggttcaaggtctgaaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtagggctgcgtccaataca 10879  T
Q  370 ccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggtt 431  Q
    ||  ||||||||||||||  |||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  10880 cc--aaatggtgggaccc-cttcccggaccctgcgtatgcgggagctttagtgcactgggtt 10938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1176 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1176
Description:

Target: scaffold1176; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 262 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 1758 - 1585
Alignment:
Q  262 accttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgt 361  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |  |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
T  1758 accttgacgcaattggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcatgggttcaagtcctgaaaacaacctcttgtgt--aaaacaggataaggctgcat 1661  T
Q  362 acaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttaccctttat 440  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||    
T  1660 acaatacacc--aaatgatgggaccc-cttcccggacccggcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgccttttat 1585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0223 (Bit Score: 73; Significance: 4e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0223
Description:

Target: scaffold0223; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 439
Target Start/End: Original strand, 11093 - 11265
Alignment:
Q  261 aaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 360  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||  ||||| ||||     
T  11093 aaccttggcgcaactggtaaagttgttct-atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacagcctcttgtgt--aaaacaaagtaaggctgct 11189  T
Q  361 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
    |||||||||||  |||||||||||| |  |||||| ||||||  |||||||||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  11190 tacaatacacc--aaatggtgggacac-cttcccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccaggttgcccttta 11265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 258 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 226583 - 226456
Alignment:
Q  258 ggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagac 356  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||||| |    
T  226583 ggtaaccttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacggattcaagtcctagaaacagcctcttgtctaaaaaaacagggtaaggc 226484  T
Q  357 tgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacc 386  Q
    ||| ||||||||| |  |||||||||||||    
T  226483 tgcatacaatacatc--aaatggtgggacc 226456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 259 - 387
Target Start/End: Original strand, 4117 - 4245
Alignment:
Q  259 gtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactg 358  Q
    ||||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  4117 gtaaccttg-cgcaactagtaaagttgttgttatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaacaacctcttgtgtaaaatacaggataaggttg 4215  T
Q  359 cgtacaatacaccaa-aaatggtgggaccc 387  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  4216 cgtacaatacaccaataattggtgggaccc 4245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 64; Significance: 9e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 270 - 390
Target Start/End: Complemental strand, 35184 - 35064
Alignment:
Q  270 gcaactggtaaaattg-ttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgt-aaaaaacagggtaagactgcgtacaata 367  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||    
T  35184 gcaactggtaaagtttattgtcatgtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctgaaaacagtctcttgtgtgtgaaaacagggtaaggctgcgtacaata 35085  T
Q  368 caccaaaaatggtgggacccttt 390  Q
    ||||  |||||||||||||||||    
T  35084 cacc--aaatggtgggacccttt 35064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 254 - 326
Target Start/End: Original strand, 83829 - 83901
Alignment:
Q  254 gaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 326  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  83829 gaggggtaaccttggcgcaactagtaaagttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcttggaaa 83901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 262 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 73034 - 72867
Alignment:
Q  262 accttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaata-gtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcg 360  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||        |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||| ||||     
T  73034 accttggcgcaactggtaaagttgttgtcatgtgt-------gtcacgggttcaagtcctagaaacaagtctcttgtgtaaaaaacacggtaaggctgcc 72942  T
Q  361 tacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||||||  ||||||| | ||||  |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||    
T  72941 tacaatacacc--aaatggtagtaccc-cttcccggaacctgcgtatgcgggagctttagtgcaccaggttgcccttt 72867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 309 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 48758 - 48634
Alignment:
Q  309 gggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatg 408  Q
    ||||||||||  |||||| || |||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||  ||||    
T  48758 gggttcaagtggtggaaacagcctcttgtgtaaaa--cagggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcatatg 48664  T
Q  409 cgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  48663 cgggagctctagtgcaccgggttgcccttt 48634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0954 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0954
Description:

Target: scaffold0954; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 291 - 439
Target Start/End: Original strand, 3537 - 3680
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttt 390  Q
    |||||||||||||||||| |  |  ||||||||||| || ||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||| ||  || |||||||| ||    
T  3537 atgtgactgaaaggtcacag--tagagtcctggaaagagcctcttgtgtaaaatataaggtaaggctgcgtataatacaccgaa--tgatgggacccctt 3632  T
Q  391 tcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttta 439  Q
     ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||| |||||||    
T  3633 -cccgaaccctgcgtatgcggcagctttagtgcaccgagtttcccttta 3680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 46; Significance: 5e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 253 - 344
Target Start/End: Original strand, 8847 - 8935
Alignment:
Q  253 agaggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 344  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |   |||||||||||||    
T  8847 agaggggtaaccttgacgc---tggtaaagttgttgtcatgtgactgtaaggtcacaggttcaattcctggaaacaacttcttgtgtaaaaa 8935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0194 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0194
Description:

Target: scaffold0194; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 255 - 326
Target Start/End: Original strand, 24619 - 24690
Alignment:
Q  255 aggggtaaccttgacgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 326  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24619 aggggtaaccttggcacaattgataaagttgttgtcaagtgactgtaaggtcacgggttcaagtcctggaaa 24690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 344
Target Start/End: Original strand, 43098 - 43173
Alignment:
Q  269 cgcaactggtaaaattgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaa 344  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||||||||||    
T  43098 cgcaactggtaaagttattgtcatgtgattgaaaggtcacgagttcaggtcctagaaacagcctcttgtgtaaaaa 43173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 283 - 390
Target Start/End: Original strand, 32913 - 33019
Alignment:
Q  283 ttgttgtcatgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgg 382  Q
    |||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||  |||| |  ||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||| ||||||    
T  32913 ttgttgccacgtgacttaaaggtcatgggttcaagtccgcgaaaaaacctcttctgtaaaaaacagagtaagactgtatacaatacacc-aaattggtgg 33011  T
Q  383 gacccttt 390  Q
    ||||||||    
T  33012 gacccttt 33019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 348 - 438
Target Start/End: Complemental strand, 24220 - 24133
Alignment:
Q  348 gggtaagactgcgtacaatacaccaaaaatggtgggacccttttcccgaaccctgtgtatgcgggagctatagtgcaccgggttacccttt 438  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||| ||||||  |||||||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  24220 gggtaaggctgcgtacaatacaccaaa--tggtgggacccctt-cccggaccctgcatatgcgggagctctagtgcaccggattgcccttt 24133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0167 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0167
Description:

Target: scaffold0167; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 291 - 366
Target Start/End: Original strand, 23590 - 23665
Alignment:
Q  291 atgtgactgaaaggtcacgggttcaagtcctggaaatagtctcttgtgtaaaaaacagggtaagactgcgtacaat 366  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| || ||| |  ||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  23590 atgtgactgaaagggtacgggttcaagtcttgcaaacaacctcttgtgtaaaaaacagggtgaggctgcgtacaat 23665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University