View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11809_low_49 (Length: 311)

Name: NF11809_low_49
Description: NF11809
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11809_low_49
NF11809_low_49
[»] chr4 (135 HSPs)
chr4 (1-294)||(10909354-10909647)
chr4 (1-294)||(18077926-18078219)
chr4 (1-294)||(40470608-40470900)
chr4 (1-294)||(4987220-4987512)
chr4 (1-294)||(40454369-40454661)
chr4 (1-294)||(5022682-5022974)
chr4 (1-294)||(25657082-25657374)
chr4 (1-294)||(27814965-27815259)
chr4 (1-294)||(17928646-17928940)
chr4 (1-294)||(48371077-48371371)
chr4 (1-294)||(17917998-17918292)
chr4 (1-294)||(14836124-14836415)
chr4 (1-294)||(18752511-18752803)
chr4 (1-294)||(15561099-15561393)
chr4 (1-294)||(52703734-52704028)
chr4 (1-294)||(18763121-18763413)
chr4 (1-294)||(3370662-3370954)
chr4 (1-294)||(450522-450816)
chr4 (1-294)||(19944347-19944641)
chr4 (1-294)||(24028105-24028399)
chr4 (1-294)||(30937092-30937386)
chr4 (1-294)||(49518081-49518375)
chr4 (1-294)||(3390402-3390694)
chr4 (1-294)||(47152100-47152391)
chr4 (1-294)||(16266405-16266702)
chr4 (1-294)||(461103-461397)
chr4 (1-294)||(14843673-14843967)
chr4 (1-294)||(19954982-19955276)
chr4 (1-294)||(10695587-10695878)
chr4 (1-294)||(16317277-16317569)
chr4 (1-294)||(22006957-22007251)
chr4 (1-294)||(30926514-30926808)
chr4 (1-294)||(4948283-4948575)
chr4 (1-294)||(16255812-16256109)
chr4 (1-294)||(10751188-10751482)
chr4 (1-294)||(10964957-10965251)
chr4 (1-294)||(16305053-16305345)
chr4 (1-294)||(18130259-18130553)
chr4 (1-294)||(21996359-21996653)
chr4 (1-294)||(5873317-5873608)
chr4 (1-294)||(19581188-19581479)
chr4 (1-294)||(36018282-36018576)
chr4 (1-294)||(36028835-36029129)
chr4 (1-294)||(55745272-55745566)
chr4 (1-294)||(55755883-55756177)
chr4 (1-294)||(10740614-10740908)
chr4 (1-294)||(10954383-10954677)
chr4 (1-294)||(27656546-27656841)
chr4 (1-294)||(27667119-27667414)
chr4 (1-294)||(24713377-24713669)
chr4 (1-294)||(24640194-24640488)
chr4 (1-294)||(11535791-11536084)
chr4 (1-219)||(15207434-15207649)
chr4 (1-294)||(10300481-10300773)
chr4 (1-294)||(11514981-11515274)
chr4 (1-294)||(49001999-49002293)
chr4 (1-294)||(31266818-31267105)
chr4 (1-236)||(55651329-55651563)
chr4 (21-234)||(23509124-23509336)
chr4 (21-235)||(18774717-18774930)
chr4 (1-234)||(18007101-18007334)
chr4 (176-294)||(29041852-29041970)
chr4 (21-236)||(8997318-8997532)
chr4 (1-234)||(33378197-33378430)
chr4 (28-234)||(16819421-16819626)
chr4 (1-234)||(14778484-14778715)
chr4 (31-234)||(19242032-19242235)
chr4 (1-234)||(14710820-14711051)
chr4 (1-228)||(14604999-14605224)
chr4 (242-294)||(15207648-15207700)
chr4 (1-129)||(17993835-17993962)
chr4 (1-234)||(36210150-36210383)
chr4 (188-236)||(18773840-18773888)
chr4 (188-235)||(10249646-10249693)
chr4 (184-234)||(1672173-1672223)
chr4 (184-234)||(1674648-1674698)
chr4 (188-238)||(13027560-13027610)
chr4 (189-238)||(2651592-2651641)
chr4 (188-236)||(14154275-14154323)
chr4 (188-235)||(8685721-8685768)
chr4 (188-235)||(10661446-10661493)
chr4 (188-235)||(10875591-10875638)
chr4 (184-227)||(40860459-40860502)
chr4 (188-238)||(20571279-20571329)
chr4 (186-227)||(54679720-54679761)
chr4 (188-228)||(3395380-3395420)
chr4 (188-228)||(10072725-10072765)
chr4 (187-235)||(13890614-13890662)
chr4 (188-228)||(15014667-15014707)
chr4 (188-228)||(22675801-22675841)
chr4 (186-226)||(25651375-25651415)
chr4 (188-228)||(55380081-55380121)
chr4 (188-228)||(56034363-56034403)
chr4 (184-227)||(22190638-22190681)
chr4 (189-228)||(37435817-37435856)
chr4 (1-58)||(10692812-10692870)
chr4 (1-58)||(10906578-10906636)
chr4 (188-238)||(14357411-14357461)
chr4 (188-238)||(16324796-16324846)
chr4 (189-227)||(16939808-16939846)
chr4 (155-228)||(17540190-17540263)
chr4 (192-238)||(19889278-19889324)
chr4 (186-227)||(8105430-8105471)
chr4 (186-227)||(16853295-16853336)
chr4 (186-227)||(17398952-17398993)
chr4 (186-227)||(29121161-29121202)
chr4 (186-227)||(55731637-55731678)
chr4 (186-227)||(56533339-56533380)
chr4 (188-228)||(6641475-6641515)
chr4 (191-227)||(11900982-11901018)
chr4 (188-228)||(11915492-11915532)
chr4 (188-228)||(12600548-12600588)
chr4 (188-228)||(16632231-16632271)
chr4 (188-228)||(19621341-19621381)
chr4 (188-228)||(19884493-19884533)
chr4 (188-228)||(37985892-37985932)
chr4 (188-235)||(17057396-17057443)
chr4 (188-227)||(17247035-17247074)
chr4 (188-231)||(17526668-17526711)
chr4 (200-235)||(17994032-17994067)
chr4 (188-235)||(23087469-23087516)
chr4 (188-235)||(24619430-24619477)
chr4 (188-227)||(40845885-40845924)
chr4 (188-231)||(41115048-41115091)
chr4 (188-227)||(45833186-45833225)
chr4 (5-58)||(9751636-9751690)
chr4 (188-226)||(23750315-23750353)
chr4 (186-227)||(3105697-3105738)
chr4 (186-227)||(6517277-6517318)
chr4 (191-228)||(36470610-36470647)
chr4 (1-41)||(1672368-1672408)
chr4 (1-41)||(1674843-1674883)
chr4 (188-228)||(3483521-3483561)
chr4 (1-41)||(16853482-16853522)
chr4 (187-235)||(18473810-18473858)
[»] chr3 (208 HSPs)
chr3 (1-294)||(23635637-23635930)
chr3 (1-294)||(6490364-6490657)
chr3 (1-294)||(6501018-6501311)
chr3 (1-294)||(12237629-12237921)
chr3 (1-294)||(12249455-12249747)
chr3 (1-294)||(24706569-24706862)
chr3 (1-294)||(933555-933847)
chr3 (1-294)||(7804533-7804825)
chr3 (1-294)||(10626956-10627249)
chr3 (1-294)||(7794622-7794914)
chr3 (1-294)||(9535537-9535828)
chr3 (1-294)||(10655278-10655571)
chr3 (1-294)||(29461228-29461520)
chr3 (1-294)||(29472080-29472372)
chr3 (1-294)||(11216736-11217032)
chr3 (1-294)||(6220716-6221010)
chr3 (1-294)||(9993908-9994201)
chr3 (1-294)||(19778312-19778606)
chr3 (4-294)||(19887372-19887661)
chr3 (1-294)||(39672897-39673191)
chr3 (1-294)||(48337169-48337461)
chr3 (1-294)||(9391217-9391511)
chr3 (1-294)||(13121589-13121883)
chr3 (1-294)||(14465518-14465812)
chr3 (1-294)||(19788949-19789243)
chr3 (1-294)||(23757225-23757519)
chr3 (1-294)||(23767821-23768115)
chr3 (1-294)||(9380671-9380965)
chr3 (1-294)||(6180542-6180836)
chr3 (1-294)||(37759597-37759891)
chr3 (1-294)||(28169010-28169301)
chr3 (4-294)||(13557501-13557792)
chr3 (1-294)||(18483971-18484266)
chr3 (1-294)||(23647676-23647969)
chr3 (1-294)||(11163757-11164049)
chr3 (1-294)||(4174771-4175065)
chr3 (5-294)||(37885505-37885795)
chr3 (1-294)||(14476148-14476444)
chr3 (1-294)||(20673210-20673502)
chr3 (1-294)||(1794497-1794790)
chr3 (1-294)||(5579648-5579942)
chr3 (1-294)||(5628032-5628326)
chr3 (1-294)||(9981900-9982193)
chr3 (1-295)||(13393872-13394163)
chr3 (1-294)||(20721040-20721334)
chr3 (1-294)||(28314246-28314540)
chr3 (1-294)||(37866372-37866666)
chr3 (1-294)||(4456844-4457135)
chr3 (1-294)||(5865708-5866004)
chr3 (1-294)||(5876307-5876603)
chr3 (1-294)||(13372684-13372974)
chr3 (1-294)||(13383278-13383568)
chr3 (1-294)||(17910017-17910309)
chr3 (1-294)||(20683795-20684087)
chr3 (1-294)||(5510623-5510916)
chr3 (1-294)||(5520801-5521094)
chr3 (1-294)||(5537036-5537329)
chr3 (1-294)||(10098995-10099288)
chr3 (1-294)||(12286993-12287287)
chr3 (1-294)||(24659827-24660121)
chr3 (1-294)||(28324862-28325156)
chr3 (1-294)||(35187304-35187598)
chr3 (1-294)||(4404201-4404492)
chr3 (1-294)||(13261688-13261979)
chr3 (1-294)||(1784085-1784378)
chr3 (1-294)||(504182-504476)
chr3 (1-294)||(526548-526842)
chr3 (1-294)||(4743665-4743958)
chr3 (1-294)||(12296815-12297109)
chr3 (1-294)||(24383533-24383827)
chr3 (1-294)||(24670407-24670701)
chr3 (1-294)||(38314627-38314919)
chr3 (1-294)||(11272397-11272692)
chr3 (1-294)||(13131831-13132126)
chr3 (1-294)||(38194651-38194946)
chr3 (1-294)||(38205187-38205482)
chr3 (1-294)||(5547620-5547913)
chr3 (1-294)||(41683605-41683899)
chr3 (1-294)||(41694174-41694468)
chr3 (1-294)||(8774584-8774879)
chr3 (1-294)||(8785169-8785464)
chr3 (1-294)||(39371980-39372275)
chr3 (1-294)||(39382617-39382912)
chr3 (1-294)||(4754252-4754543)
chr3 (1-294)||(27883310-27883603)
chr3 (1-294)||(8995971-8996264)
chr3 (43-294)||(16386002-16386251)
chr3 (1-215)||(18851707-18851919)
chr3 (1-294)||(9006523-9006816)
chr3 (1-294)||(1064065-1064358)
chr3 (1-294)||(16076856-16077149)
chr3 (1-294)||(1053636-1053929)
chr3 (1-233)||(14581126-14581358)
chr3 (1-294)||(8740142-8740434)
chr3 (1-294)||(16671177-16671470)
chr3 (1-294)||(2246293-2246587)
chr3 (1-236)||(17281448-17281682)
chr3 (4-152)||(16391632-16391780)
chr3 (1-235)||(13199257-13199492)
chr3 (1-155)||(16666142-16666295)
chr3 (1-288)||(29933573-29933862)
chr3 (1-288)||(29982727-29983016)
chr3 (8-235)||(29906202-29906429)
chr3 (8-235)||(29947367-29947594)
chr3 (8-235)||(29996521-29996748)
chr3 (21-289)||(15662740-15663009)
chr3 (21-236)||(15651105-15651319)
chr3 (21-234)||(21736098-21736310)
chr3 (1-93)||(15216355-15216446)
chr3 (1-93)||(12567285-12567376)
chr3 (6-234)||(49990052-49990280)
chr3 (1-133)||(16476366-16476499)
chr3 (21-141)||(27172912-27173031)
chr3 (1-234)||(31114001-31114234)
chr3 (1-234)||(15850800-15851033)
chr3 (21-154)||(17961419-17961551)
chr3 (21-154)||(18006364-18006496)
chr3 (1-234)||(51340802-51341035)
chr3 (1-129)||(10529243-10529370)
chr3 (1-234)||(51989158-51989392)
chr3 (1-234)||(15833197-15833428)
chr3 (1-234)||(45861707-45861941)
chr3 (1-234)||(22151037-22151270)
chr3 (30-234)||(13148057-13148261)
chr3 (1-129)||(41045640-41045767)
chr3 (1-76)||(14321697-14321771)
chr3 (188-238)||(13410370-13410420)
chr3 (188-238)||(16879803-16879853)
chr3 (188-235)||(6253209-6253256)
chr3 (188-235)||(14077672-14077719)
chr3 (188-238)||(16882074-16882124)
chr3 (188-238)||(27374550-27374600)
chr3 (1-228)||(47405556-47405784)
chr3 (195-238)||(8729317-8729360)
chr3 (195-238)||(9081204-9081247)
chr3 (188-235)||(12396856-12396903)
chr3 (195-238)||(13653714-13653757)
chr3 (187-234)||(17006985-17007032)
chr3 (187-234)||(17017791-17017838)
chr3 (184-227)||(21636989-21637032)
chr3 (184-227)||(40850774-40850817)
chr3 (4-234)||(12752758-12752988)
chr3 (186-228)||(14955224-14955266)
chr3 (188-234)||(16794604-16794650)
chr3 (188-238)||(20418019-20418069)
chr3 (1-228)||(2560984-2561212)
chr3 (186-227)||(2784862-2784903)
chr3 (186-227)||(11223361-11223402)
chr3 (188-233)||(12968099-12968144)
chr3 (189-238)||(13699153-13699202)
chr3 (187-236)||(21317190-21317239)
chr3 (186-227)||(21640664-21640705)
chr3 (186-227)||(49666726-49666767)
chr3 (188-228)||(12389195-12389235)
chr3 (188-228)||(12726553-12726593)
chr3 (188-228)||(12963408-12963448)
chr3 (188-228)||(13948132-13948172)
chr3 (258-294)||(14321962-14321998)
chr3 (188-228)||(17239245-17239285)
chr3 (188-228)||(18121935-18121975)
chr3 (188-228)||(19249735-19249775)
chr3 (188-228)||(20645949-20645989)
chr3 (188-228)||(28581902-28581942)
chr3 (188-228)||(37467129-37467169)
chr3 (188-228)||(38177966-38178006)
chr3 (188-228)||(49643085-49643125)
chr3 (188-228)||(52920204-52920244)
chr3 (188-235)||(10851598-10851645)
chr3 (187-233)||(11909347-11909393)
chr3 (186-223)||(5213378-5213415)
chr3 (197-238)||(7832970-7833011)
chr3 (1-77)||(17021975-17022051)
chr3 (186-227)||(24775854-24775895)
chr3 (186-227)||(33583027-33583068)
chr3 (195-231)||(17697402-17697438)
chr3 (188-228)||(18143067-18143107)
chr3 (188-228)||(20627755-20627795)
chr3 (188-228)||(20724884-20724924)
chr3 (192-228)||(22804349-22804385)
chr3 (189-229)||(25398579-25398619)
chr3 (187-234)||(41045534-41045582)
chr3 (188-228)||(46350166-46350206)
chr3 (188-228)||(49553812-49553852)
chr3 (192-227)||(16812010-16812045)
chr3 (188-235)||(17762415-17762462)
chr3 (188-235)||(19063735-19063782)
chr3 (186-225)||(21605975-21606014)
chr3 (187-234)||(37412397-37412444)
chr3 (188-227)||(40799670-40799709)
chr3 (186-235)||(7921029-7921078)
chr3 (188-225)||(13823877-13823914)
chr3 (205-234)||(13954043-13954072)
chr3 (188-229)||(16199752-16199793)
chr3 (199-236)||(19198213-19198250)
chr3 (188-225)||(26417998-26418035)
chr3 (186-223)||(46796688-46796725)
chr3 (186-227)||(53057049-53057090)
chr3 (1-41)||(12726365-12726405)
chr3 (188-228)||(14393327-14393367)
chr3 (1-41)||(22140748-22140788)
chr3 (188-228)||(23538487-23538527)
chr3 (5-92)||(24775673-24775760)
chr3 (192-228)||(29951765-29951801)
chr3 (192-228)||(30000919-30000955)
chr3 (1-92)||(40799807-40799898)
chr3 (188-228)||(47207501-47207541)
chr3 (1-41)||(47207690-47207730)
chr3 (1-41)||(53056862-53056902)
[»] chr5 (177 HSPs)
chr5 (1-294)||(20797830-20798123)
chr5 (1-294)||(43043504-43043797)
chr5 (1-294)||(30069737-30070032)
chr5 (1-294)||(8521976-8522268)
chr5 (1-294)||(10754628-10754920)
chr5 (1-294)||(21702962-21703254)
chr5 (1-294)||(21705809-21706101)
chr5 (1-294)||(23406581-23406873)
chr5 (1-294)||(36228874-36229166)
chr5 (1-294)||(31448687-31448982)
chr5 (1-294)||(22559571-22559865)
chr5 (1-294)||(34782991-34783283)
chr5 (1-294)||(36084596-36084888)
chr5 (1-294)||(1108977-1109271)
chr5 (1-294)||(1121735-1122029)
chr5 (1-294)||(24983253-24983546)
chr5 (1-294)||(27622599-27622893)
chr5 (1-294)||(36582390-36582684)
chr5 (1-294)||(36592945-36593239)
chr5 (1-294)||(40390491-40390785)
chr5 (5-294)||(19464110-19464398)
chr5 (5-294)||(19478140-19478428)
chr5 (1-294)||(42395115-42395406)
chr5 (1-291)||(31418796-31419088)
chr5 (1-294)||(5290408-5290702)
chr5 (1-294)||(24925972-24926265)
chr5 (1-294)||(27603250-27603544)
chr5 (1-294)||(39352622-39352916)
chr5 (1-294)||(40401153-40401447)
chr5 (1-294)||(20551950-20552242)
chr5 (1-294)||(34772046-34772338)
chr5 (1-294)||(7031958-7032254)
chr5 (1-294)||(16003723-16004017)
chr5 (1-294)||(23306979-23307273)
chr5 (1-294)||(6130923-6131219)
chr5 (1-294)||(17446530-17446821)
chr5 (1-294)||(31844093-31844389)
chr5 (1-294)||(23296411-23296705)
chr5 (1-294)||(27203927-27204220)
chr5 (1-294)||(17457146-17457437)
chr5 (1-294)||(22146655-22146951)
chr5 (1-294)||(22157238-22157534)
chr5 (1-294)||(14030178-14030472)
chr5 (1-294)||(14040731-14041025)
chr5 (1-294)||(15993161-15993455)
chr5 (1-294)||(27052668-27052962)
chr5 (1-294)||(27460295-27460589)
chr5 (1-294)||(27470694-27470988)
chr5 (1-294)||(39490782-39491076)
chr5 (1-294)||(39501972-39502266)
chr5 (1-294)||(5300979-5301278)
chr5 (1-294)||(23362244-23362539)
chr5 (1-294)||(6975942-6976236)
chr5 (1-294)||(6986432-6986726)
chr5 (1-294)||(22676250-22676544)
chr5 (1-294)||(22686141-22686435)
chr5 (1-294)||(24808047-24808340)
chr5 (1-294)||(27042044-27042338)
chr5 (1-294)||(17607195-17607487)
chr5 (1-294)||(40513821-40514116)
chr5 (1-294)||(9336090-9336383)
chr5 (1-294)||(9346677-9346970)
chr5 (4-294)||(37406786-37407074)
chr5 (1-294)||(14446833-14447126)
chr5 (1-294)||(14457445-14457738)
chr5 (1-294)||(34062755-34063048)
chr5 (1-294)||(15740101-15740396)
chr5 (1-294)||(15769261-15769556)
chr5 (1-294)||(31348669-31348961)
chr5 (1-294)||(31359283-31359575)
chr5 (26-294)||(31833641-31833911)
chr5 (1-294)||(9377294-9377588)
chr5 (1-294)||(14557849-14558143)
chr5 (1-294)||(14568486-14568780)
chr5 (1-294)||(24816718-24817012)
chr5 (1-294)||(24827306-24827600)
chr5 (1-294)||(17617809-17618102)
chr5 (1-294)||(17719052-17719345)
chr5 (1-294)||(17729704-17729997)
chr5 (1-294)||(36687830-36688122)
chr5 (1-294)||(36698396-36698688)
chr5 (1-294)||(15693864-15694157)
chr5 (1-294)||(23707577-23707870)
chr5 (1-294)||(24567224-24567517)
chr5 (1-294)||(34052094-34052387)
chr5 (1-294)||(33951632-33951927)
chr5 (1-294)||(35215639-35215934)
chr5 (1-294)||(35226223-35226518)
chr5 (70-294)||(39364685-39364909)
chr5 (1-294)||(20562475-20562752)
chr5 (1-294)||(42042919-42043212)
chr5 (1-294)||(42053494-42053787)
chr5 (1-294)||(30227328-30227623)
chr5 (1-294)||(30237855-30238150)
chr5 (1-294)||(37729084-37729378)
chr5 (1-294)||(37740400-37740694)
chr5 (1-294)||(20624899-20625193)
chr5 (1-294)||(106253-106547)
chr5 (71-294)||(23696988-23697212)
chr5 (1-134)||(43621853-43621985)
chr5 (1-228)||(32753845-32754071)
chr5 (1-289)||(20417036-20417326)
chr5 (21-234)||(13533705-13533917)
chr5 (1-135)||(21414191-21414324)
chr5 (1-200)||(23372646-23372848)
chr5 (21-234)||(35543281-35543493)
chr5 (21-234)||(13522978-13523190)
chr5 (21-234)||(20168219-20168431)
chr5 (21-234)||(36095805-36096016)
chr5 (21-234)||(36097262-36097473)
chr5 (168-294)||(43621727-43621853)
chr5 (5-234)||(23478157-23478386)
chr5 (1-234)||(11208101-11208334)
chr5 (1-234)||(1915206-1915438)
chr5 (1-234)||(40032882-40033115)
chr5 (1-234)||(13404906-13405137)
chr5 (1-234)||(20215232-20215465)
chr5 (1-234)||(25111994-25112227)
chr5 (1-234)||(25171085-25171318)
chr5 (1-234)||(40228447-40228680)
chr5 (1-234)||(32160554-32160787)
chr5 (1-52)||(23392851-23392901)
chr5 (187-238)||(39799179-39799230)
chr5 (188-238)||(26120132-26120182)
chr5 (1-62)||(39362448-39362510)
chr5 (187-235)||(22586300-22586348)
chr5 (184-227)||(10848567-10848610)
chr5 (184-227)||(31145935-31145978)
chr5 (187-238)||(31589302-31589353)
chr5 (186-228)||(15516762-15516804)
chr5 (186-227)||(3245743-3245784)
chr5 (188-229)||(25097131-25097172)
chr5 (188-229)||(25155101-25155142)
chr5 (186-227)||(25930457-25930498)
chr5 (186-227)||(28139401-28139442)
chr5 (186-227)||(28464640-28464681)
chr5 (188-228)||(89726-89766)
chr5 (188-228)||(13736437-13736477)
chr5 (188-228)||(20550687-20550727)
chr5 (188-228)||(21100008-21100048)
chr5 (188-228)||(21199306-21199346)
chr5 (188-228)||(23413279-23413319)
chr5 (53-234)||(23488303-23488483)
chr5 (188-227)||(6499033-6499072)
chr5 (188-227)||(25740917-25740956)
chr5 (184-223)||(35932306-35932345)
chr5 (190-228)||(19536604-19536642)
chr5 (188-238)||(20567595-20567645)
chr5 (186-227)||(11993682-11993723)
chr5 (186-227)||(29138708-29138749)
chr5 (186-227)||(30742775-30742816)
chr5 (188-228)||(643006-643046)
chr5 (199-235)||(2156591-2156627)
chr5 (188-228)||(7745997-7746037)
chr5 (188-228)||(22000361-22000401)
chr5 (190-238)||(23589496-23589544)
chr5 (188-228)||(23880860-23880900)
chr5 (187-235)||(24019402-24019450)
chr5 (188-228)||(33022460-33022500)
chr5 (192-227)||(12353103-12353138)
chr5 (188-227)||(13545816-13545855)
chr5 (188-227)||(31488042-31488081)
chr5 (204-235)||(34638241-34638272)
chr5 (186-228)||(4886815-4886857)
chr5 (1-58)||(4886985-4887043)
chr5 (1-58)||(33933230-33933288)
chr5 (186-223)||(9088767-9088804)
chr5 (186-227)||(14086840-14086881)
chr5 (187-232)||(17263032-17263077)
chr5 (188-228)||(21072541-21072582)
chr5 (186-227)||(33933062-33933103)
chr5 (186-227)||(42243475-42243516)
chr5 (1-41)||(14086655-14086695)
chr5 (1-41)||(20550876-20550916)
chr5 (188-228)||(21203949-21203989)
chr5 (188-228)||(26784146-26784186)
chr5 (188-228)||(31117670-31117710)
[»] chr7 (154 HSPs)
chr7 (4-294)||(14745767-14746057)
chr7 (1-294)||(1367542-1367834)
chr7 (1-294)||(589125-589417)
chr7 (1-294)||(15888424-15888716)
chr7 (1-294)||(20490919-20491211)
chr7 (1-294)||(31116606-31116898)
chr7 (1-294)||(6867320-6867614)
chr7 (1-294)||(20989564-20989858)
chr7 (1-294)||(21770038-21770330)
chr7 (1-294)||(6877952-6878246)
chr7 (1-294)||(3165647-3165939)
chr7 (1-294)||(9433175-9433469)
chr7 (1-294)||(21003103-21003397)
chr7 (1-294)||(166793-167087)
chr7 (1-294)||(177385-177679)
chr7 (1-294)||(5685430-5685724)
chr7 (1-294)||(8617297-8617591)
chr7 (1-294)||(8627860-8628154)
chr7 (1-294)||(24930698-24930992)
chr7 (1-294)||(48710586-48710880)
chr7 (1-294)||(44280407-44280701)
chr7 (1-294)||(540996-541290)
chr7 (1-294)||(2705707-2706001)
chr7 (1-294)||(2716311-2716605)
chr7 (1-294)||(9443771-9444065)
chr7 (1-294)||(9170899-9171190)
chr7 (1-294)||(467676-467970)
chr7 (1-294)||(17950213-17950507)
chr7 (1-294)||(17960819-17961113)
chr7 (1-294)||(22089034-22089328)
chr7 (1-294)||(22099649-22099943)
chr7 (1-294)||(26294124-26294418)
chr7 (1-294)||(26699749-26700043)
chr7 (1-294)||(4222519-4222815)
chr7 (1-294)||(454894-455188)
chr7 (1-294)||(26653420-26653714)
chr7 (1-294)||(30049432-30049724)
chr7 (1-291)||(40054849-40055137)
chr7 (1-294)||(4211920-4212216)
chr7 (1-294)||(9159643-9159934)
chr7 (1-294)||(9170098-9170389)
chr7 (1-294)||(11005096-11005390)
chr7 (1-294)||(9085195-9085488)
chr7 (1-294)||(9094909-9095202)
chr7 (1-294)||(37344111-37344405)
chr7 (1-294)||(24734664-24734958)
chr7 (1-294)||(24744611-24744905)
chr7 (1-294)||(26390191-26390485)
chr7 (1-294)||(26400833-26401127)
chr7 (1-294)||(11095965-11096260)
chr7 (1-294)||(40042204-40042497)
chr7 (1-294)||(40052753-40053046)
chr7 (1-294)||(8002159-8002454)
chr7 (1-294)||(8012804-8013099)
chr7 (1-294)||(1987451-1987746)
chr7 (1-294)||(1998072-1998367)
chr7 (1-294)||(42865738-42866033)
chr7 (1-294)||(42876364-42876659)
chr7 (1-294)||(18441107-18441401)
chr7 (1-294)||(18419026-18419320)
chr7 (29-294)||(38403331-38403599)
chr7 (1-235)||(3476435-3476668)
chr7 (1-147)||(19985908-19986054)
chr7 (1-294)||(26209643-26209937)
chr7 (1-294)||(29589904-29590198)
chr7 (1-294)||(13682231-13682526)
chr7 (1-294)||(15216228-15216522)
chr7 (1-294)||(12734261-12734553)
chr7 (129-287)||(38593935-38594092)
chr7 (21-234)||(24882535-24882747)
chr7 (1-93)||(8933634-8933725)
chr7 (100-294)||(48382099-48382297)
chr7 (1-93)||(38593830-38593921)
chr7 (1-129)||(8999028-8999155)
chr7 (3-232)||(602553-602784)
chr7 (1-234)||(11087138-11087371)
chr7 (139-294)||(8933475-8933631)
chr7 (1-49)||(6044306-6044354)
chr7 (188-238)||(16308041-16308091)
chr7 (188-235)||(7488229-7488276)
chr7 (184-227)||(19339569-19339612)
chr7 (4-228)||(23280098-23280324)
chr7 (184-227)||(27871511-27871554)
chr7 (184-227)||(32265040-32265083)
chr7 (186-227)||(1292824-1292865)
chr7 (186-227)||(2266646-2266687)
chr7 (186-227)||(12174663-12174704)
chr7 (186-227)||(14425241-14425282)
chr7 (187-227)||(2265842-2265882)
chr7 (188-228)||(9098559-9098599)
chr7 (188-228)||(9099365-9099405)
chr7 (188-228)||(11319198-11319238)
chr7 (188-228)||(11792700-11792740)
chr7 (188-228)||(13260940-13260980)
chr7 (188-228)||(13683388-13683428)
chr7 (188-228)||(24787935-24787975)
chr7 (188-228)||(33692037-33692077)
chr7 (187-234)||(4412287-4412334)
chr7 (189-228)||(5001151-5001190)
chr7 (188-235)||(10254654-10254701)
chr7 (1-234)||(13174699-13174932)
chr7 (188-227)||(13472833-13472872)
chr7 (188-223)||(41842598-41842633)
chr7 (184-227)||(48063141-48063184)
chr7 (188-227)||(48237230-48237269)
chr7 (1-47)||(48382304-48382351)
chr7 (1-58)||(44467027-44467085)
chr7 (186-227)||(15704812-15704853)
chr7 (199-236)||(16105306-16105343)
chr7 (188-237)||(18056577-18056626)
chr7 (186-227)||(21381751-21381792)
chr7 (192-228)||(2499830-2499866)
chr7 (188-228)||(4494370-4494410)
chr7 (192-228)||(9069355-9069391)
chr7 (188-236)||(13172679-13172727)
chr7 (188-228)||(15467710-15467750)
chr7 (188-228)||(16314865-16314905)
chr7 (188-228)||(16316882-16316922)
chr7 (188-228)||(21283698-21283738)
chr7 (188-228)||(21692081-21692121)
chr7 (192-228)||(28408832-28408868)
chr7 (188-228)||(30025698-30025738)
chr7 (188-228)||(33605478-33605518)
chr7 (1-92)||(33691849-33691940)
chr7 (188-235)||(2501363-2501410)
chr7 (192-235)||(11015742-11015785)
chr7 (188-235)||(12222764-12222811)
chr7 (193-228)||(13034169-13034204)
chr7 (188-227)||(14426341-14426380)
chr7 (192-227)||(16112214-16112249)
chr7 (188-235)||(16412522-16412569)
chr7 (188-227)||(28622682-28622721)
chr7 (192-227)||(30945686-30945721)
chr7 (189-227)||(16556915-16556953)
chr7 (189-227)||(16608709-16608747)
chr7 (190-228)||(19237363-19237401)
chr7 (1-58)||(30944460-30944518)
chr7 (1-58)||(30945493-30945551)
chr7 (186-227)||(8182724-8182765)
chr7 (192-225)||(13018834-13018867)
chr7 (4-92)||(16112024-16112112)
chr7 (188-229)||(16310232-16310273)
chr7 (192-225)||(29935675-29935708)
chr7 (186-227)||(35953010-35953051)
chr7 (1-41)||(4821455-4821495)
chr7 (187-234)||(8999213-8999261)
chr7 (188-228)||(10883498-10883538)
chr7 (188-228)||(12367073-12367113)
chr7 (188-228)||(14187484-14187524)
chr7 (188-228)||(15088342-15088382)
chr7 (188-228)||(22579542-22579582)
chr7 (1-41)||(27871699-27871739)
chr7 (188-228)||(39284889-39284929)
chr7 (1-92)||(48237039-48237130)
[»] chr6 (137 HSPs)
chr6 (1-294)||(12827570-12827863)
chr6 (1-294)||(25787579-25787871)
chr6 (1-294)||(25985959-25986252)
chr6 (1-294)||(7751261-7751554)
chr6 (1-294)||(11147275-11147568)
chr6 (1-294)||(27505819-27506114)
chr6 (1-294)||(28251591-28251882)
chr6 (1-294)||(28356738-28357029)
chr6 (1-294)||(27372709-27373004)
chr6 (1-294)||(27463059-27463354)
chr6 (1-294)||(20029930-20030222)
chr6 (1-294)||(9123157-9123451)
chr6 (1-294)||(7375784-7376076)
chr6 (1-294)||(20062681-20062973)
chr6 (1-294)||(9112520-9112814)
chr6 (1-294)||(27474723-27475016)
chr6 (1-294)||(27504222-27504515)
chr6 (1-294)||(26044089-26044383)
chr6 (1-294)||(12854898-12855192)
chr6 (1-294)||(12865424-12865718)
chr6 (1-294)||(33199205-33199499)
chr6 (1-294)||(27384310-27384603)
chr6 (1-294)||(31982651-31982945)
chr6 (1-294)||(34807185-34807479)
chr6 (1-294)||(34817817-34818111)
chr6 (1-294)||(3661260-3661553)
chr6 (1-294)||(26025336-26025630)
chr6 (1-294)||(26035910-26036204)
chr6 (1-294)||(27341571-27341865)
chr6 (1-294)||(27402311-27402605)
chr6 (1-294)||(27412970-27413264)
chr6 (1-294)||(3671924-3672217)
chr6 (1-294)||(29384629-29384922)
chr6 (1-294)||(18925788-18926082)
chr6 (1-294)||(31542923-31543215)
chr6 (1-294)||(26864663-26864959)
chr6 (1-294)||(26875287-26875583)
chr6 (1-294)||(32301068-32301362)
chr6 (1-294)||(32311757-32312051)
chr6 (1-293)||(5844964-5845254)
chr6 (1-294)||(16123563-16123852)
chr6 (1-294)||(16930328-16930621)
chr6 (1-294)||(16959499-16959792)
chr6 (1-294)||(17984735-17985029)
chr6 (1-294)||(12716859-12717155)
chr6 (1-294)||(12727508-12727804)
chr6 (1-294)||(17982526-17982820)
chr6 (1-294)||(4630748-4631044)
chr6 (1-294)||(32961954-32962253)
chr6 (1-294)||(32972573-32972872)
chr6 (1-294)||(8653539-8653830)
chr6 (1-294)||(17745808-17746101)
chr6 (1-294)||(4292603-4292896)
chr6 (1-294)||(31572291-31572584)
chr6 (1-236)||(17064129-17064365)
chr6 (1-236)||(18826264-18826497)
chr6 (1-295)||(29765412-29765705)
chr6 (1-216)||(13913006-13913219)
chr6 (1-294)||(18834660-18834953)
chr6 (4-294)||(22308666-22308957)
chr6 (1-202)||(17042591-17042792)
chr6 (64-294)||(26022882-26023114)
chr6 (1-275)||(25518585-25518860)
chr6 (1-294)||(27166469-27166761)
chr6 (1-294)||(9933697-9933991)
chr6 (1-294)||(17741728-17742022)
chr6 (130-294)||(12353433-12353597)
chr6 (1-294)||(25735584-25735876)
chr6 (1-236)||(11205882-11206116)
chr6 (1-294)||(25679115-25679407)
chr6 (21-234)||(19289426-19289638)
chr6 (21-236)||(12953176-12953391)
chr6 (1-294)||(25686775-25687068)
chr6 (1-236)||(11235435-11235669)
chr6 (21-236)||(18555206-18555420)
chr6 (21-234)||(31931361-31931573)
chr6 (1-137)||(25675196-25675331)
chr6 (21-230)||(18498562-18498770)
chr6 (1-234)||(20635511-20635744)
chr6 (5-234)||(21128019-21128247)
chr6 (1-234)||(17608431-17608663)
chr6 (1-234)||(7586282-7586514)
chr6 (1-62)||(6158316-6158377)
chr6 (1-234)||(22386594-22386827)
chr6 (3-229)||(14051507-14051731)
chr6 (21-129)||(17047597-17047704)
chr6 (1-77)||(25722984-25723059)
chr6 (3-229)||(14070188-14070412)
chr6 (1-228)||(29917814-29918042)
chr6 (188-235)||(12347879-12347926)
chr6 (188-238)||(18172345-18172395)
chr6 (188-238)||(24728858-24728908)
chr6 (187-235)||(31127625-31127673)
chr6 (188-235)||(17927580-17927627)
chr6 (184-227)||(19066326-19066369)
chr6 (188-238)||(10704849-10704899)
chr6 (186-228)||(15954503-15954545)
chr6 (188-238)||(24719054-24719104)
chr6 (1-228)||(9717640-9717868)
chr6 (186-227)||(19833342-19833383)
chr6 (186-227)||(21618041-21618082)
chr6 (1-228)||(32544062-32544290)
chr6 (188-228)||(15531936-15531976)
chr6 (188-228)||(19623776-19623816)
chr6 (188-228)||(20731016-20731056)
chr6 (188-228)||(21624898-21624938)
chr6 (195-235)||(25592408-25592448)
chr6 (188-227)||(20113012-20113051)
chr6 (187-238)||(23230974-23231025)
chr6 (186-228)||(16335923-16335965)
chr6 (188-238)||(17445969-17446018)
chr6 (188-238)||(32335617-32335667)
chr6 (188-229)||(19470463-19470504)
chr6 (186-227)||(33352236-33352277)
chr6 (188-228)||(15301997-15302037)
chr6 (188-228)||(19688576-19688616)
chr6 (188-236)||(23006360-23006408)
chr6 (188-236)||(23781958-23782006)
chr6 (188-228)||(25593865-25593905)
chr6 (195-238)||(13144791-13144834)
chr6 (188-235)||(15478099-15478146)
chr6 (188-235)||(15551775-15551822)
chr6 (189-228)||(15987030-15987069)
chr6 (193-228)||(26943383-26943418)
chr6 (1-110)||(15954619-15954728)
chr6 (186-227)||(17381320-17381361)
chr6 (186-227)||(22076717-22076758)
chr6 (155-235)||(23296515-23296596)
chr6 (187-236)||(24398561-24398610)
chr6 (188-228)||(14100750-14100790)
chr6 (192-228)||(16265466-16265502)
chr6 (188-228)||(16915221-16915261)
chr6 (188-224)||(19625609-19625645)
chr6 (1-92)||(20488042-20488133)
chr6 (188-228)||(22801937-22801977)
chr6 (188-228)||(24116625-24116665)
chr6 (188-228)||(26972538-26972578)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (1-294)||(6940-7232)
[»] chr8 (121 HSPs)
chr8 (1-294)||(23469509-23469802)
chr8 (1-294)||(30314745-30315037)
chr8 (1-294)||(6318565-6318858)
chr8 (1-294)||(18158195-18158486)
chr8 (1-294)||(18769186-18769478)
chr8 (1-294)||(19418291-19418583)
chr8 (1-294)||(3220570-3220864)
chr8 (1-294)||(19428866-19429160)
chr8 (1-294)||(19224873-19225165)
chr8 (1-294)||(18153676-18153966)
chr8 (1-294)||(9341082-9341376)
chr8 (1-294)||(9368226-9368520)
chr8 (1-294)||(20161278-20161572)
chr8 (1-294)||(20195895-20196189)
chr8 (1-294)||(9856520-9856814)
chr8 (1-294)||(18449308-18449602)
chr8 (1-294)||(16746939-16747232)
chr8 (1-294)||(26120847-26121142)
chr8 (1-294)||(15791347-15791641)
chr8 (2-294)||(26111169-26111463)
chr8 (1-294)||(6151006-6151302)
chr8 (1-294)||(210202-210495)
chr8 (1-294)||(241762-242055)
chr8 (1-294)||(252347-252640)
chr8 (1-294)||(723825-724118)
chr8 (1-294)||(849016-849309)
chr8 (1-294)||(15780758-15781052)
chr8 (1-294)||(31214951-31215247)
chr8 (1-294)||(44481029-44481323)
chr8 (1-294)||(44491645-44491939)
chr8 (1-294)||(36292859-36293151)
chr8 (1-294)||(36303462-36303754)
chr8 (1-294)||(3348675-3348969)
chr8 (1-294)||(3359272-3359566)
chr8 (1-294)||(29086920-29087213)
chr8 (1-294)||(32088318-32088611)
chr8 (1-294)||(6160961-6161257)
chr8 (1-294)||(32077745-32078038)
chr8 (6-294)||(43248263-43248553)
chr8 (5-294)||(40213223-40213510)
chr8 (1-294)||(36077875-36078168)
chr8 (1-294)||(36088461-36088754)
chr8 (1-294)||(19128686-19128980)
chr8 (1-294)||(19139218-19139512)
chr8 (10-294)||(795117-795401)
chr8 (1-294)||(13688615-13688910)
chr8 (1-294)||(29076669-29076962)
chr8 (1-179)||(23457353-23457530)
chr8 (1-174)||(30325301-30325473)
chr8 (1-294)||(3843460-3843754)
chr8 (1-133)||(1750193-1750325)
chr8 (1-236)||(7018430-7018664)
chr8 (1-236)||(20259666-20259900)
chr8 (1-236)||(21046296-21046530)
chr8 (21-236)||(22135927-22136141)
chr8 (21-236)||(22167092-22167306)
chr8 (1-144)||(6576568-6576712)
chr8 (21-234)||(22211457-22211670)
chr8 (1-294)||(23370491-23370780)
chr8 (5-234)||(23271257-23271487)
chr8 (4-234)||(28903244-28903473)
chr8 (1-234)||(40003013-40003246)
chr8 (1-234)||(8031817-8032051)
chr8 (1-234)||(21540736-21540969)
chr8 (1-234)||(45568035-45568268)
chr8 (1-234)||(17519192-17519425)
chr8 (1-227)||(15425287-15425515)
chr8 (187-238)||(12193693-12193744)
chr8 (187-238)||(12438121-12438172)
chr8 (188-238)||(17917141-17917191)
chr8 (1-133)||(15336222-15336354)
chr8 (1-133)||(15516591-15516723)
chr8 (184-227)||(1744947-1744990)
chr8 (184-227)||(13430946-13430989)
chr8 (188-235)||(18557804-18557851)
chr8 (1-131)||(19461051-19461180)
chr8 (1-131)||(19558729-19558858)
chr8 (186-227)||(6407516-6407557)
chr8 (186-227)||(14990381-14990422)
chr8 (188-233)||(17267258-17267303)
chr8 (1-228)||(18121240-18121468)
chr8 (186-227)||(18151966-18152007)
chr8 (188-233)||(18321481-18321526)
chr8 (186-227)||(22673568-22673609)
chr8 (1-235)||(29379362-29379595)
chr8 (188-228)||(16188772-16188812)
chr8 (160-234)||(19460969-19461045)
chr8 (160-234)||(19558647-19558723)
chr8 (188-228)||(19956660-19956700)
chr8 (188-228)||(20255833-20255873)
chr8 (188-228)||(20382716-20382756)
chr8 (188-228)||(22461959-22461999)
chr8 (188-228)||(23263934-23263974)
chr8 (188-228)||(30421752-30421792)
chr8 (188-228)||(33082653-33082693)
chr8 (188-227)||(40845709-40845748)
chr8 (184-227)||(43639572-43639615)
chr8 (184-227)||(45292625-45292668)
chr8 (191-228)||(19707296-19707333)
chr8 (186-227)||(24551064-24551105)
chr8 (188-228)||(12758085-12758125)
chr8 (188-228)||(16681625-16681665)
chr8 (188-228)||(18679603-18679643)
chr8 (188-228)||(18685718-18685758)
chr8 (188-228)||(18731312-18731352)
chr8 (188-228)||(19156031-19156071)
chr8 (188-235)||(12541420-12541467)
chr8 (188-227)||(17701530-17701569)
chr8 (188-227)||(17797211-17797250)
chr8 (187-238)||(25850324-25850375)
chr8 (5-58)||(13430766-13430820)
chr8 (189-227)||(14989773-14989811)
chr8 (1-221)||(21932679-21932900)
chr8 (193-227)||(22662906-22662940)
chr8 (1-58)||(45538573-45538631)
chr8 (188-233)||(26832821-26832866)
chr8 (186-227)||(45538759-45538800)
chr8 (197-233)||(2810593-2810629)
chr8 (186-222)||(9320364-9320400)
chr8 (188-228)||(19943024-19943064)
chr8 (192-228)||(25163859-25163895)
[»] chr2 (125 HSPs)
chr2 (1-294)||(21172500-21172792)
chr2 (1-294)||(18768940-18769231)
chr2 (1-294)||(28721350-28721642)
chr2 (1-294)||(28731936-28732228)
chr2 (1-294)||(40222234-40222528)
chr2 (1-294)||(40251095-40251389)
chr2 (1-294)||(1099228-1099522)
chr2 (1-294)||(9897607-9897901)
chr2 (1-294)||(9908195-9908489)
chr2 (1-294)||(17857470-17857764)
chr2 (1-294)||(32217775-32218069)
chr2 (1-294)||(38586121-38586412)
chr2 (1-294)||(22914897-22915191)
chr2 (1-294)||(26866974-26867266)
chr2 (1-294)||(36251877-36252171)
chr2 (1-294)||(24415056-24415347)
chr2 (1-294)||(2561390-2561684)
chr2 (1-294)||(22960365-22960659)
chr2 (1-294)||(24327767-24328061)
chr2 (1-294)||(7005840-7006134)
chr2 (1-294)||(24338437-24338731)
chr2 (1-294)||(34790250-34790544)
chr2 (1-294)||(4220382-4220678)
chr2 (1-294)||(11388842-11389136)
chr2 (1-294)||(21650565-21650858)
chr2 (1-294)||(29244123-29244417)
chr2 (1-294)||(29254702-29254996)
chr2 (1-294)||(34477830-34478123)
chr2 (1-294)||(34804393-34804687)
chr2 (1-294)||(39170128-39170422)
chr2 (1-294)||(26879563-26879855)
chr2 (1-294)||(43354924-43355217)
chr2 (1-294)||(4209790-4210086)
chr2 (1-294)||(10277472-10277766)
chr2 (1-294)||(11395205-11395499)
chr2 (1-294)||(11405521-11405815)
chr2 (1-294)||(43345309-43345602)
chr2 (1-294)||(27221282-27221577)
chr2 (1-294)||(30488856-30489151)
chr2 (1-294)||(35252883-35253178)
chr2 (1-294)||(35263492-35263787)
chr2 (1-294)||(35274117-35274412)
chr2 (1-294)||(10266895-10267189)
chr2 (1-294)||(16768844-16769138)
chr2 (1-294)||(18392670-18392964)
chr2 (1-294)||(27978416-27978708)
chr2 (1-294)||(28064945-28065237)
chr2 (1-294)||(9762803-9763095)
chr2 (1-294)||(9773339-9773631)
chr2 (1-294)||(43082555-43082842)
chr2 (48-294)||(24427667-24427912)
chr2 (1-294)||(43093164-43093451)
chr2 (1-294)||(36784838-36785125)
chr2 (1-236)||(967536-967770)
chr2 (5-294)||(17969246-17969536)
chr2 (1-236)||(24274987-24275221)
chr2 (1-235)||(19498024-19498257)
chr2 (1-294)||(22774260-22774554)
chr2 (1-160)||(4099819-4099979)
chr2 (184-294)||(4099715-4099825)
chr2 (1-234)||(20646640-20646873)
chr2 (30-234)||(19356283-19356486)
chr2 (1-294)||(22763556-22763850)
chr2 (4-234)||(19313053-19313283)
chr2 (1-234)||(19300043-19300276)
chr2 (1-234)||(1083800-1084033)
chr2 (1-123)||(22779811-22779932)
chr2 (1-48)||(28374548-28374595)
chr2 (28-234)||(23392776-23392982)
chr2 (188-238)||(21845930-21845980)
chr2 (1-227)||(28711779-28712007)
chr2 (189-235)||(44880953-44880999)
chr2 (1-129)||(24814664-24814792)
chr2 (188-235)||(20567919-20567966)
chr2 (1-52)||(24425585-24425635)
chr2 (187-234)||(24801817-24801864)
chr2 (184-227)||(40331879-40331922)
chr2 (184-227)||(44840226-44840269)
chr2 (188-238)||(24157622-24157672)
chr2 (188-238)||(24843985-24844035)
chr2 (186-227)||(1587299-1587340)
chr2 (186-227)||(6392426-6392467)
chr2 (186-227)||(22785921-22785962)
chr2 (188-233)||(24575821-24575866)
chr2 (186-227)||(28551185-28551226)
chr2 (186-227)||(33074018-33074059)
chr2 (186-227)||(34322203-34322244)
chr2 (188-228)||(9015637-9015677)
chr2 (188-228)||(19114875-19114915)
chr2 (188-228)||(22317384-22317424)
chr2 (188-228)||(22455257-22455297)
chr2 (188-228)||(24850935-24850975)
chr2 (188-228)||(41121987-41122027)
chr2 (187-234)||(1089151-1089198)
chr2 (188-235)||(22271917-22271964)
chr2 (160-238)||(22383262-22383341)
chr2 (189-228)||(23184573-23184612)
chr2 (189-228)||(23595836-23595875)
chr2 (188-227)||(28701482-28701521)
chr2 (186-225)||(30557587-30557626)
chr2 (188-226)||(18702533-18702571)
chr2 (190-228)||(24376895-24376933)
chr2 (188-233)||(10010020-10010065)
chr2 (188-233)||(18431207-18431252)
chr2 (188-229)||(39037911-39037952)
chr2 (188-228)||(6574395-6574435)
chr2 (188-228)||(20152268-20152308)
chr2 (188-228)||(20569019-20569059)
chr2 (188-228)||(21537519-21537559)
chr2 (5-92)||(22755395-22755481)
chr2 (188-228)||(24779165-24779205)
chr2 (188-228)||(25189189-25189229)
chr2 (188-228)||(28140871-28140911)
chr2 (188-228)||(40782268-40782308)
chr2 (6-92)||(20152112-20152198)
chr2 (192-226)||(26619372-26619406)
chr2 (193-227)||(31968317-31968351)
chr2 (186-227)||(22802253-22802294)
chr2 (4-92)||(31800971-31801059)
chr2 (186-227)||(31801154-31801195)
chr2 (188-232)||(15670888-15670932)
chr2 (188-228)||(19540207-19540247)
chr2 (188-228)||(22257992-22258032)
chr2 (186-238)||(24440985-24441036)
chr2 (1-41)||(28701310-28701350)
[»] chr1 (135 HSPs)
chr1 (1-294)||(4250623-4250915)
chr1 (1-294)||(23580384-23580678)
chr1 (1-294)||(20441375-20441667)
chr1 (1-294)||(7689517-7689810)
chr1 (1-294)||(154347-154639)
chr1 (1-294)||(35012778-35013071)
chr1 (1-294)||(39194152-39194444)
chr1 (3-294)||(5973614-5973910)
chr1 (1-294)||(148272-148564)
chr1 (1-294)||(21877622-21877916)
chr1 (1-294)||(12614374-12614668)
chr1 (1-294)||(12623839-12624133)
chr1 (1-294)||(21863516-21863810)
chr1 (1-294)||(10997842-10998136)
chr1 (1-294)||(39586826-39587118)
chr1 (1-293)||(5639768-5640061)
chr1 (1-294)||(9050546-9050837)
chr1 (1-294)||(21895059-21895351)
chr1 (1-294)||(4167114-4167408)
chr1 (1-294)||(4177770-4178064)
chr1 (1-294)||(5650325-5650619)
chr1 (1-294)||(12730402-12730696)
chr1 (1-294)||(12740995-12741289)
chr1 (1-294)||(33084417-33084711)
chr1 (1-294)||(47195118-47195410)
chr1 (1-294)||(18381962-18382253)
chr1 (1-294)||(12898041-12898333)
chr1 (1-294)||(7507157-7507451)
chr1 (1-294)||(7517754-7518048)
chr1 (1-294)||(19187693-19187987)
chr1 (1-294)||(51629245-51629539)
chr1 (1-294)||(51656506-51656800)
chr1 (1-294)||(35648748-35649043)
chr1 (1-294)||(19178814-19179108)
chr1 (1-291)||(2538394-2538684)
chr1 (1-294)||(5833073-5833368)
chr1 (1-294)||(5843675-5843970)
chr1 (1-294)||(35638096-35638391)
chr1 (1-294)||(47607988-47608283)
chr1 (1-294)||(47618596-47618891)
chr1 (1-294)||(35401222-35401517)
chr1 (1-294)||(35404449-35404744)
chr1 (1-294)||(38094931-38095226)
chr1 (1-294)||(38105556-38105851)
chr1 (1-294)||(17957096-17957388)
chr1 (1-294)||(36236488-36236781)
chr1 (1-294)||(36247035-36247328)
chr1 (1-294)||(3171477-3171772)
chr1 (1-294)||(3182079-3182374)
chr1 (1-294)||(11195125-11195419)
chr1 (1-294)||(20195751-20196043)
chr1 (1-236)||(14388184-14388418)
chr1 (1-294)||(675301-675595)
chr1 (1-294)||(18311030-18311324)
chr1 (1-294)||(41132673-41132968)
chr1 (21-294)||(20798794-20799068)
chr1 (27-234)||(46180963-46181169)
chr1 (21-294)||(22610052-22610326)
chr1 (21-236)||(20883960-20884174)
chr1 (21-288)||(23926795-23927062)
chr1 (21-179)||(45070731-45070887)
chr1 (1-234)||(17370833-17371066)
chr1 (1-234)||(5929496-5929727)
chr1 (1-234)||(44200803-44201035)
chr1 (1-234)||(22655267-22655501)
chr1 (5-234)||(19170394-19170624)
chr1 (1-179)||(28474075-28474251)
chr1 (1-234)||(28379786-28380019)
chr1 (1-234)||(21543820-21544053)
chr1 (1-228)||(22464865-22465093)
chr1 (1-234)||(19037797-19038031)
chr1 (1-234)||(20251566-20251798)
chr1 (1-234)||(22019127-22019360)
chr1 (1-129)||(52350742-52350869)
chr1 (188-235)||(20909198-20909245)
chr1 (10-233)||(24028751-24028974)
chr1 (1-47)||(12946818-12946864)
chr1 (188-238)||(18130254-18130304)
chr1 (1-227)||(25448622-25448849)
chr1 (187-234)||(7745331-7745378)
chr1 (184-227)||(21135400-21135443)
chr1 (184-227)||(21205113-21205156)
chr1 (184-227)||(21984392-21984435)
chr1 (1-234)||(22642685-22642919)
chr1 (184-227)||(46088786-46088829)
chr1 (188-238)||(9346559-9346609)
chr1 (186-227)||(10250783-10250824)
chr1 (160-236)||(20867068-20867145)
chr1 (186-227)||(35039964-35040005)
chr1 (186-227)||(48570473-48570514)
chr1 (188-228)||(2834485-2834525)
chr1 (188-228)||(12624799-12624839)
chr1 (188-228)||(29215592-29215632)
chr1 (188-228)||(33256595-33256635)
chr1 (188-228)||(33276767-33276807)
chr1 (187-235)||(34255759-34255807)
chr1 (187-238)||(18517404-18517455)
chr1 (184-227)||(21121304-21121347)
chr1 (184-227)||(21214917-21214960)
chr1 (188-235)||(23054157-23054204)
chr1 (187-234)||(26548499-26548546)
chr1 (184-227)||(42284425-42284468)
chr1 (186-228)||(21702610-21702652)
chr1 (1-228)||(1900141-1900369)
chr1 (188-228)||(2268327-2268367)
chr1 (188-228)||(12284219-12284259)
chr1 (188-228)||(16235540-16235580)
chr1 (188-228)||(21192109-21192149)
chr1 (184-220)||(21206873-21206909)
chr1 (188-228)||(22201980-22202020)
chr1 (188-228)||(22600426-22600466)
chr1 (188-228)||(26702373-26702413)
chr1 (188-228)||(32786182-32786222)
chr1 (188-228)||(36133985-36134025)
chr1 (188-228)||(38282363-38282403)
chr1 (188-235)||(17018369-17018416)
chr1 (190-233)||(18614707-18614750)
chr1 (188-235)||(20110193-20110240)
chr1 (188-235)||(23935333-23935380)
chr1 (200-235)||(52350939-52350974)
chr1 (186-227)||(14263695-14263737)
chr1 (204-238)||(21684325-21684359)
chr1 (1-58)||(36134156-36134214)
chr1 (191-228)||(10757219-10757256)
chr1 (188-221)||(18896839-18896872)
chr1 (186-227)||(30571994-30572035)
chr1 (5-57)||(37642215-37642268)
chr1 (186-227)||(44824004-44824045)
chr1 (188-228)||(2266885-2266925)
chr1 (188-228)||(7309615-7309655)
chr1 (192-228)||(21028590-21028626)
chr1 (188-228)||(22153653-22153693)
chr1 (1-41)||(22153841-22153881)
chr1 (188-228)||(30892889-30892929)
chr1 (1-41)||(35040150-35040190)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-294)||(10656-10948)
scaffold0068 (1-294)||(7809-8101)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (1-294)||(54178-54470)
scaffold0028 (1-294)||(14492-14786)
scaffold0028 (186-227)||(5874-5915)
[»] scaffold0391 (1 HSPs)
scaffold0391 (1-294)||(2273-2565)
[»] scaffold0047 (3 HSPs)
scaffold0047 (1-294)||(32958-33249)
scaffold0047 (1-294)||(40507-40801)
scaffold0047 (192-228)||(9701-9737)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (1-294)||(36789-37081)
[»] scaffold0133 (2 HSPs)
scaffold0133 (1-294)||(42575-42867)
scaffold0133 (1-294)||(31040-31334)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (1-294)||(6896-7190)
[»] scaffold0272 (1 HSPs)
scaffold0272 (1-286)||(13662-13945)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-294)||(52157-52453)
[»] scaffold0105 (3 HSPs)
scaffold0105 (1-294)||(7869-8164)
scaffold0105 (1-294)||(37011-37306)
scaffold0105 (1-139)||(47645-47785)
[»] scaffold0386 (1 HSPs)
scaffold0386 (1-294)||(12265-12558)
[»] scaffold0407 (2 HSPs)
scaffold0407 (1-294)||(12170-12464)
scaffold0407 (1-93)||(16001-16092)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (1-294)||(5204-5497)
[»] scaffold0497 (1 HSPs)
scaffold0497 (1-294)||(10342-10635)
[»] scaffold0084 (4 HSPs)
scaffold0084 (1-294)||(56836-57130)
scaffold0084 (8-234)||(464-690)
scaffold0084 (188-228)||(32282-32322)
scaffold0084 (188-228)||(49129-49169)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (1-178)||(2824-3000)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (1-294)||(175233-175526)
scaffold0017 (1-234)||(40399-40632)
scaffold0017 (43-234)||(58988-59178)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (1-236)||(35505-35739)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-141)||(1-141)
[»] scaffold0012 (4 HSPs)
scaffold0012 (1-235)||(140773-141007)
scaffold0012 (5-235)||(127615-127844)
scaffold0012 (1-235)||(7704-7938)
scaffold0012 (186-227)||(215769-215810)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (1-147)||(6273-6419)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (1-294)||(16989-17299)
scaffold0099 (1-202)||(19242-19452)
[»] scaffold0002 (4 HSPs)
scaffold0002 (1-154)||(117148-117300)
scaffold0002 (1-234)||(475336-475569)
scaffold0002 (1-234)||(481856-482089)
scaffold0002 (30-234)||(156741-156945)
[»] scaffold0481 (1 HSPs)
scaffold0481 (1-236)||(12879-13113)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (1-235)||(1963-2196)
[»] scaffold0142 (2 HSPs)
scaffold0142 (1-154)||(40552-40704)
scaffold0142 (187-236)||(40470-40519)
[»] scaffold0410 (1 HSPs)
scaffold0410 (1-235)||(15698-15931)
[»] scaffold0752 (2 HSPs)
scaffold0752 (21-235)||(1174-1387)
scaffold0752 (21-235)||(1789-2002)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (21-234)||(28871-29084)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (21-234)||(58271-58483)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (21-234)||(59366-59577)
scaffold0007 (188-228)||(142894-142934)
[»] scaffold0163 (1 HSPs)
scaffold0163 (21-236)||(29441-29657)
[»] scaffold0149 (1 HSPs)
scaffold0149 (70-234)||(38120-38284)
[»] scaffold0544 (1 HSPs)
scaffold0544 (68-234)||(9912-10078)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (28-234)||(688-893)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (1-234)||(17892-18127)
scaffold0280 (186-227)||(3002-3043)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (29-234)||(616-820)
scaffold0090 (29-234)||(4996-5200)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (1-234)||(20463-20695)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (1-234)||(61015-61246)
scaffold0005 (1-228)||(212154-212379)
[»] scaffold0655 (1 HSPs)
scaffold0655 (1-234)||(4909-5142)
[»] scaffold0627 (1 HSPs)
scaffold0627 (1-62)||(8117-8178)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (1-234)||(38171-38403)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (1-234)||(61524-61757)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (1-234)||(7076-7310)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (209-294)||(2601-2688)
[»] scaffold1321 (1 HSPs)
scaffold1321 (1-234)||(1021-1254)
[»] scaffold1263 (1 HSPs)
scaffold1263 (1-234)||(1214-1447)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (113-233)||(16481-16601)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (1-234)||(1758-1991)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (1-234)||(3981-4215)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (1-234)||(11553-11785)
[»] scaffold0201 (1 HSPs)
scaffold0201 (1-58)||(7375-7432)
[»] scaffold0011 (4 HSPs)
scaffold0011 (189-238)||(59345-59394)
scaffold0011 (186-227)||(65677-65718)
scaffold0011 (186-227)||(144722-144763)
scaffold0011 (1-61)||(165032-165093)
[»] scaffold0443 (2 HSPs)
scaffold0443 (26-129)||(1116-1218)
scaffold0443 (187-234)||(1276-1324)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (188-235)||(268571-268618)
scaffold0009 (188-228)||(84191-84231)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (1-234)||(16747-16980)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (1-129)||(6608-6736)
[»] scaffold0567 (1 HSPs)
scaffold0567 (188-236)||(9696-9744)
[»] scaffold0352 (1 HSPs)
scaffold0352 (184-227)||(1090-1133)
[»] scaffold0311 (1 HSPs)
scaffold0311 (187-238)||(19859-19910)
[»] scaffold0207 (2 HSPs)
scaffold0207 (187-234)||(20412-20459)
scaffold0207 (100-234)||(10511-10645)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (188-235)||(32060-32107)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (184-227)||(5594-5637)
[»] scaffold0056 (4 HSPs)
scaffold0056 (184-227)||(35074-35117)
scaffold0056 (184-222)||(25935-25973)
scaffold0056 (188-235)||(36455-36502)
scaffold0056 (1-41)||(34890-34930)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (188-235)||(29584-29631)
scaffold0035 (186-227)||(99477-99518)
[»] scaffold0622 (2 HSPs)
scaffold0622 (189-235)||(2450-2496)
scaffold0622 (187-235)||(3673-3721)
[»] scaffold1331 (2 HSPs)
scaffold1331 (186-227)||(1971-2012)
scaffold1331 (1-92)||(1785-1876)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (188-233)||(1153-1198)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (186-227)||(5804-5845)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (186-227)||(7430-7471)
[»] scaffold0217 (2 HSPs)
scaffold0217 (186-227)||(22403-22444)
scaffold0217 (188-228)||(18828-18868)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (186-227)||(8953-8994)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (187-228)||(1792-1833)
scaffold0040 (187-238)||(4285-4336)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (186-227)||(211198-211239)
scaffold0004 (188-228)||(220035-220075)
scaffold0004 (1-58)||(211365-211423)
scaffold0004 (188-228)||(244555-244595)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (1-41)||(1715-1755)
[»] scaffold0771 (2 HSPs)
scaffold0771 (188-228)||(272-312)
scaffold0771 (205-234)||(6131-6160)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (188-228)||(2266-2306)
[»] scaffold0479 (2 HSPs)
scaffold0479 (188-228)||(9766-9806)
scaffold0479 (1-41)||(9954-9994)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (188-228)||(5964-6004)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (188-228)||(14445-14485)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (188-228)||(5426-5466)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (188-228)||(14914-14954)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (188-228)||(26249-26289)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (188-228)||(1487-1527)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (188-228)||(7723-7763)
scaffold0026 (188-228)||(59813-59853)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (188-228)||(90329-90369)
scaffold0003 (188-235)||(1234-1281)
scaffold0003 (1-58)||(90141-90199)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (184-227)||(87870-87913)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (189-228)||(37199-37238)
scaffold0022 (189-228)||(135259-135298)
scaffold0022 (188-228)||(158906-158946)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (188-227)||(60601-60640)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (187-233)||(2071-2117)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (4-61)||(15711-15769)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (188-233)||(2067-2112)
[»] scaffold0334 (1 HSPs)
scaffold0334 (188-233)||(7617-7662)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (186-227)||(18037-18078)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (192-228)||(13368-13404)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (188-228)||(1457-1497)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (188-228)||(27703-27743)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (184-228)||(2243-2287)
scaffold0116 (188-228)||(21245-21285)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (188-228)||(74378-74418)
[»] scaffold1359 (1 HSPs)
scaffold1359 (188-227)||(929-968)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (192-235)||(3582-3625)
[»] scaffold0488 (1 HSPs)
scaffold0488 (184-227)||(11996-12039)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (193-228)||(9752-9787)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (193-228)||(3021-3056)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (188-223)||(40441-40476)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (5-58)||(7348-7402)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (192-226)||(5807-5841)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (187-221)||(16410-16444)
[»] scaffold0859 (1 HSPs)
scaffold0859 (1-58)||(2951-3007)
[»] scaffold0471 (1 HSPs)
scaffold0471 (186-227)||(3103-3144)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (186-227)||(7013-7054)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (187-236)||(31526-31575)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (188-233)||(144698-144743)
[»] scaffold0758 (1 HSPs)
scaffold0758 (195-235)||(4060-4100)
[»] scaffold0227 (2 HSPs)
scaffold0227 (191-227)||(22473-22509)
scaffold0227 (1-41)||(22661-22701)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (188-228)||(44193-44233)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (188-228)||(103369-103408)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 135)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10909647 - 10909354
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909647 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 10909548  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  10909547 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 10909448  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10909447 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 10909354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18077926 - 18078219
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18077926 tacctccactcctctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 18078025  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18078026 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 18078125  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18078126 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 18078219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 40470608 - 40470900
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470608 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 40470706  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40470707 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 40470806  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470807 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattggagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40470900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4987512 - 4987220
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4987512 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 4987413  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  4987412 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttc 4987314  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4987313 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 4987220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 40454369 - 40454661
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40454369 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 40454467  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40454468 ttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 40454567  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40454568 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattggagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40454661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5022974 - 5022682
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  5022974 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcctttaagatgggaatgaatttggagctaattc 5022876  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5022875 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 5022776  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5022775 acacctctatataaatgagtgaagacttgaagataatagatagatatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 5022682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25657374 - 25657082
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657374 tacctccactactctgcttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 25657276  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25657275 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 25657176  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25657175 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagatatacataagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 25657082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 27814965 - 27815259
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27814965 tacctccactactctgttttatgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 27815064  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27815065 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 27815164  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27815165 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataagacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 27815259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17928940 - 17928646
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17928940 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 17928841  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17928840 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 17928741  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17928740 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17928646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48371371 - 48371077
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  48371371 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcataatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 48371272  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48371271 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 48371172  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  48371171 cacgcctctatataaaggtgtgaagacttgaagattgaagatagaaatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 48371077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17918292 - 17917998
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17918292 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 17918193  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17918192 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 17918093  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17918092 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagataaagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17917998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 14836124 - 14836415
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14836124 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttaaagctaattc 14836222  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  14836223 ttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 14836321  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14836322 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14836415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18752511 - 18752803
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18752511 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaaggcaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 18752609  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18752610 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaatggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 18752709  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18752710 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagataagagagagaaacatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 18752803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 15561099 - 15561393
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  15561099 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 15561198  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15561199 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 15561298  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15561299 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 15561393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 52704028 - 52703734
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  52704028 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 52703929  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  52703928 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 52703829  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52703828 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattatacaaag 52703734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18763121 - 18763413
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18763121 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaaggcaacagttatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 18763219  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18763220 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaatggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 18763319  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18763320 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagataagagagagaaacatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 18763413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3370954 - 3370662
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3370954 tacctccaccactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 3370855  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  3370854 ttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgggtgatcaaagaaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttc 3370756  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3370755 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagatatacaagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 3370662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 450816 - 450522
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  450816 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 450717  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  450716 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 450617  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  450616 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaatagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 450522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 19944347 - 19944641
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19944347 tacctccactactctgttttctgtctacgctataagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 19944446  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19944447 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaatgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 19944546  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19944547 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19944641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 24028105 - 24028399
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24028105 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 24028204  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24028205 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggattatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24028304  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24028305 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24028399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 30937092 - 30937386
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30937092 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 30937191  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30937192 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 30937291  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30937292 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaatagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 30937386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 49518375 - 49518081
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  49518375 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 49518276  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49518275 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 49518176  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49518175 cacgcctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 49518081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3390694 - 3390402
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3390694 tacctccaccactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcatgcagaatttatgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 3390595  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  3390594 ttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgggtgatcaaagaaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttc 3390496  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3390495 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagatatacaagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 3390402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 47152100 - 47152391
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47152100 tacctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaacaaccatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 47152198  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  47152199 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 47152297  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47152298 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgcagatagagacatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 47152391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16266702 - 16266405
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16266702 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 16266603  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16266602 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 16266503  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag---atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16266502 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagaaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 16266405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 461397 - 461103
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  461397 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 461298  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  461297 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 461198  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  461197 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaatagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattatacaaag 461103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 14843673 - 14843967
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14843673 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 14843772  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14843773 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 14843872  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14843873 cacgcctctatataaaagagtgaagacttgaagat--taaatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14843967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 19954982 - 19955276
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| |||||||||||||||| |||    
T  19954982 tacctccactactcttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgagaatgaatttgaagcttatt 19955081  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19955082 cttcaaaggactacacccaaaccaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 19955181  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19955182 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19955276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10695878 - 10695587
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10695878 tacctccactaccctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaat-tgttccttcgagatgggaatgaatttgaagctaattc 10695780  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  10695779 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 10695681  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10695680 acgcctctatataaaggagtgaagatttgaagaatgtagatagagacatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 10695587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16317569 - 16317277
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16317569 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 16317471  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  16317470 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaaatcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 16317372  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16317371 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagatatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatatgattctacaaag 16317277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22007251 - 22006957
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22007251 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 22007152  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22007151 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 22007052  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22007051 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagtgagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttaattctacaaag 22006957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 30926514 - 30926808
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  30926514 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttaaagcttatt 30926613  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30926614 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 30926713  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30926714 cacgcctctatataaatgagtgaagacttgaagattaaatagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 30926808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4948575 - 4948283
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4948575 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatatgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 4948476  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4948475 cttcaaatgaccacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 4948376  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||  ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4948375 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatgatac--agaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 4948283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16256109 - 16255812
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16256109 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaacttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 16256010  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  16256009 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttaaacgtgctgattatctcaacgtctcttt 16255910  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag---atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||   ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16255909 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagaaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 16255812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10751188 - 10751482
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10751188 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 10751287  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10751288 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 10751387  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10751388 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 10751482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10964957 - 10965251
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10964957 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 10965056  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10965057 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 10965156  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10965157 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 10965251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16305345 - 16305053
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16305345 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacaaccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgagaatgaatttgaagctaatt 16305247  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  16305246 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaaatcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 16305148  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16305147 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagatatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 16305053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18130259 - 18130553
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18130259 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 18130358  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18130359 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 18130458  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18130459 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 18130553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21996653 - 21996359
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21996653 tacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 21996554  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21996553 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 21996454  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21996453 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagtgagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttaattctacaaag 21996359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5873608 - 5873317
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||    
T  5873608 tacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaaattgaagttgattc 5873510  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||    
T  5873509 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatccaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctttttc 5873411  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5873410 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaaccctgtcaatttgattctacaaag 5873317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19581479 - 19581188
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19581479 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 19581381  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  19581380 ttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttc 19581282  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||| |||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  19581281 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgaagatagagaaatacaaatttaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctaaaaag 19581188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36018576 - 36018282
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36018576 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 36018477  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36018476 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36018377  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36018376 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 36018282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36029129 - 36028835
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36029129 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 36029030  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36029029 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36028930  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36028929 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 36028835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 55745272 - 55745566
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  55745272 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttgatt 55745371  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55745372 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 55745471  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55745472 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgacagagaaatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 55745566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 55755883 - 55756177
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  55755883 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttgatt 55755982  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  55755983 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 55756082  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55756083 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgacagagaaatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 55756177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10740614 - 10740908
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10740614 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 10740713  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10740714 cttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 10740813  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10740814 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactcggtcaatttgattctaaaaag 10740908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10954383 - 10954677
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10954383 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 10954482  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10954483 cttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 10954582  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  10954583 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactcggtcaatttgattctaaaaag 10954677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27656841 - 27656546
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27656841 tacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 27656742  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27656741 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 27656642  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27656641 tcacccctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27656546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27667414 - 27667119
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27667414 tacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 27667315  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27667314 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 27667215  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27667214 tcacccctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27667119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24713669 - 24713377
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  24713669 tacctccactactctgtttttgtc-acgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 24713572  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24713571 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 24713473  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24713472 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctacaaag 24713377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24640488 - 24640194
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  24640488 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 24640389  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24640388 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 24640289  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  24640288 tcacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatt-tacagagacatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactaaaaag 24640194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11536084 - 11535791
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11536084 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 11535986  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  11535985 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 11535887  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11535886 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 11535791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 219
Target Start/End: Original strand, 15207434 - 15207649
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15207434 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 15207531  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  15207532 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 15207630  T
Q  201 acgcctctatataaaggag 219  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15207631 acgcctctatataaaggag 15207649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10300773 - 10300481
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10300773 tacctccactactctgtttttatctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 10300675  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  10300674 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 10300576  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10300575 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg-ggagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 10300481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11515274 - 11514981
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  11515274 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgagaatgaatttgaagttgattc 11515176  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  11515175 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 11515077  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| | |||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11515076 acacctctatataaaggagtgaagacttaatgattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 11514981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 49001999 - 49002293
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  49001999 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatcc 49002097  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  49002098 ttcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 49002196  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | |  |||||||||||||||| |||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  49002197 ctcatctctatataaaggagtaaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctataaag 49002293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 31266818 - 31267105
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  31266818 tacctccactactctgttcttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattt 31266916  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  || ||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||    
T  31266917 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagaaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaaatctcaacgtctcttt 31267015  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||       |||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31267016 cacacctctat-------agtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 31267105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 55651563 - 55651329
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | || |    
T  55651563 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaatttgatcc 55651465  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  55651464 ttcataggactacacccaaatcagtcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 55651366  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  55651365 ctcacctctatataaaggagtaaagacttgaagattg 55651329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23509336 - 23509124
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||    
T  23509336 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacacccaaa 23509238  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  23509237 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcacctctatataaaggag 23509139  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  23509138 tgaagacttgaagat 23509124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Original strand, 18774717 - 18774930
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  18774717 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcataat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 18774815  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||    
T  18774816 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctctctacacacctctatataaggaag 18774914  T
Q  220 tgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  18774915 tgaagacttgaagatt 18774930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 18007101 - 18007334
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  18007101 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcaaaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 18007199  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctcttt 199  Q
    |||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||| |   || ||||||||||| |    
T  18007200 ttcataggacaacatccaaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctcaa-cgactctttagacgtgcttaaagatctcaacgtctctct 18007298  T
Q  200 -cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18007299 acacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 18007334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 176 - 294
Target Start/End: Original strand, 29041852 - 29041970
Alignment:
Q  176 tgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctg 275  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  29041852 tgctgattatctcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctg 29041951  T
Q  276 tcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29041952 tcaatttgattctacaaag 29041970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 8997318 - 8997532
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||| |||||||||  ||||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||    
T  8997318 tgtcctcgctacaagacaagataacagttctgcctgcagaag-tgttccttcaagacaggaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaa 8997416  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| | | | | ||||||||||| ||    
T  8997417 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcacatctatataaagaag 8997515  T
Q  220 tgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||||||||||    
T  8997516 tgaagacttgaagattg 8997532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 33378430 - 33378197
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | |||    
T  33378430 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctacctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatt 33378332  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||||  ||||| ||||||||| | || |||| | |  || |||||| ||||    
T  33378331 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaag--tttcacaacgactctattgatgtgcttaaagatctcaacgactct 33378234  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33378233 ttcacacctctatataaaggagtgaagacttaaagat 33378197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 234
Target Start/End: Original strand, 16819421 - 16819626
Alignment:
Q  28 gctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggca 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  16819421 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcccacaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggca 16819519  T
Q  128 aaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggagtgaaga 225  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||  | |   | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16819520 aaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgtttaaaggtctcaacgtctctctacacacctctata-aaaggagtgaaga 16819617  T
Q  226 cttgaagat 234  Q
    |||||||||    
T  16819618 cttgaagat 16819626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 14778484 - 14778715
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||  | || |    
T  14778484 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatcc 14778582  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||| |    
T  14778583 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttt-gacgtgcttaaagatctcaacgtctctct 14778680  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14778681 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 14778715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19242235 - 19242032
Alignment:
Q  31 acaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaag 130  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||  |||| ||||| ||| |||||||||| |||     
T  19242235 acaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcattcataggacaacatccaaatcaggaaaaa 19242137  T
Q  131 gattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||| | ||||  ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | |   | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19242136 gatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgcttaaaggtctcaacgtctctctacacacctctatataaaggagtgaagactt 19242038  T
Q  229 gaagat 234  Q
    ||||||    
T  19242037 gaagat 19242032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 14710820 - 14711051
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||  |||| |||| |||||||||  |||||| |||||||  | || |    
T  14710820 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctatagaa-atgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatcc 14710918  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||| |    
T  14710919 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttt-gacgtgcttaaagatctcaacgtctctct 14711016  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14711017 cacacctttatataaaggagtgaagacttgaagat 14711051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14604999 - 14605224
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||    |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  14604999 tacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca----atgttccttcacaattggaatggatttgaaattgatc 14605094  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct--ttagacgtgctgattattt-caacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| | | ||| |||||| ||| ||| | |||||  |||| ||||   |||||||||||||  || || |||||||  |||  |||||||||    
T  14605095 cttcataggacaataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagc--ttcaaacgactctattttgatgtgctgacaattcacaacgtctc 14605192  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14605193 tttcacacctctatataaaggagtgaagactt 14605224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Original strand, 15207648 - 15207700
Alignment:
Q  242 agagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15207648 agagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 15207700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 17993835 - 17993962
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||| | |||||| |||||||  | || |    
T  17993835 tacctccacaactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataatagctctgcctgcagaa-atgtcccttcaagttaggaatggatttgaacttgatcc 17993933  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 129  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  17993934 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 17993962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 36210150 - 36210383
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  36210150 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcataa-atgttccttcaagataggaatggatttgaatgtgatc 36210248  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||| | ||| ||| | |  || |||||||||||     
T  36210249 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactctattgacatgcttaaagatctcaacgtctctc 36210347  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36210348 tcacacctctatataaaggagtgaaaacttaaagat 36210383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18773888 - 18773840
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18773888 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 18773840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10249693 - 10249646
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10249693 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 10249646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1672223 - 1672173
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1672223 atttcaacgtctcttttacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 1672173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1674698 - 1674648
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1674698 atttcaacgtctcttttacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 1674648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13027610 - 13027560
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13027610 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaaaattgta 13027560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2651641 - 2651592
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2651641 aacgtatctttcacgcctctatataaaagagtgaagacttgaagattgta 2651592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 236
Target Start/End: Original strand, 14154275 - 14154323
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14154275 caacgtctatttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 14154323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 8685721 - 8685768
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8685721 caacgtctctttcatacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 8685768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 10661446 - 10661493
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10661446 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaaggcttgaagatt 10661493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 10875591 - 10875638
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10875591 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaaggcttgaagatt 10875638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40860502 - 40860459
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40860502 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 40860459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 20571279 - 20571329
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20571279 caacgtctttttcacacctctatataaaggagtgtagacttgaagattgta 20571329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 54679761 - 54679720
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54679761 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 54679720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3395420 - 3395380
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3395420 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 3395380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10072765 - 10072725
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  10072765 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 10072725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13890662 - 13890614
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13890662 tcaacgtatctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgtagatt 13890614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 15014667 - 15014707
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15014667 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 15014707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 22675801 - 22675841
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22675801 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 22675841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 226
Target Start/End: Original strand, 25651375 - 25651415
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagac 226  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25651375 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagac 25651415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 55380121 - 55380081
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  55380121 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 55380081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 56034403 - 56034363
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  56034403 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 56034363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22190681 - 22190638
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22190681 atttcaacgtctatttcacacctctatataaaggagtgaagact 22190638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 37435817 - 37435856
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37435817 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 37435856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 10692870 - 10692812
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10692870 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 10692812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 10906636 - 10906578
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  10906636 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 10906578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 14357411 - 14357461
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  14357411 caacctctctttcacacctctatataaagaagtgaagacttgaaaattgta 14357461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 16324796 - 16324846
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16324796 caacgtctctttcatacctctgtataaaagagtgaagacttgaagattgta 16324846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 189 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16939846 - 16939808
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16939846 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 16939808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17540263 - 17540190
Alignment:
Q  155 tttcaaacgactc-tttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||| ||| || |||||||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  17540263 tttcaaacgactctttttgatgtgctga-caattcaacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagactt 17540190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 238
Target Start/End: Original strand, 19889278 - 19889324
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  19889278 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaaaaattgaagattgta 19889324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8105471 - 8105430
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8105471 ttcaacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagact 8105430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16853336 - 16853295
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  16853336 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaagact 16853295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 17398952 - 17398993
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17398952 ttcaacgtctcttccacacctctatataaaggagtgaagact 17398993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 29121202 - 29121161
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  29121202 ttcaacgtctctttcacatctctatataaaggagtgaagact 29121161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 55731678 - 55731637
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  55731678 ttcaacgtctctttcacacctcgatataaaggagtgaagact 55731637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 56533339 - 56533380
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  56533339 ttcaacgtttctttcacacctctatataaaggagtgaagact 56533380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6641515 - 6641475
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  6641515 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagactt 6641475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 191 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11901018 - 11900982
Alignment:
Q  191 cgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11901018 cgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 11900982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11915532 - 11915492
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11915532 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 11915492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12600588 - 12600548
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12600588 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagactt 12600548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16632271 - 16632231
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16632271 caacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaagactt 16632231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 19621341 - 19621381
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19621341 caacgtctctttcacatctctatataaaggagtgaagactt 19621381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19884533 - 19884493
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  19884533 caacgtctctttcacacctctatataaatgagtgaagactt 19884493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 37985892 - 37985932
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  37985892 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaaaactt 37985932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 17057396 - 17057443
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17057396 caacgtctatctcacacctctatataatggagtgaagacttgaagatt 17057443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17247074 - 17247035
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  17247074 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagact 17247035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 17526668 - 17526711
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaa 231  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17526668 caacgtctctttcatacctctatataaaggaatgaagacttgaa 17526711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 235
Target Start/End: Original strand, 17994032 - 17994067
Alignment:
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17994032 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 17994067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23087516 - 23087469
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23087516 caacgtctctttgatacctctatataaaggaatgaagacttgaagatt 23087469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24619477 - 24619430
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  24619477 caacgtctctttcatacctctatataaatgaatgaagacttgaagatt 24619430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40845924 - 40845885
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  40845924 caacgtctctttcacacctctatataaaggaatgaagact 40845885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 231
Target Start/End: Original strand, 41115048 - 41115091
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaa 231  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41115048 caacgtctctctcacacctatatataaaggagtgaagacttgaa 41115091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45833225 - 45833186
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  45833225 caacgtctctttcagacctctatataaaggagtgaagact 45833186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 9751636 - 9751690
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  9751636 tccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 9751690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 23750353 - 23750315
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagac 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23750353 caacgtctctttcacacctctatataaacgagtgaagac 23750315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 3105697 - 3105738
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3105697 ttcaacgtctttttcacacctctatataaagaagtgaagact 3105738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6517318 - 6517277
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  6517318 ttcaacgtctctttcacacctttatataaagaagtgaagact 6517277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36470647 - 36470610
Alignment:
Q  191 cgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36470647 cgtctctttcacacctctatataaatgagtgaagactt 36470610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 1672408 - 1672368
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  1672408 tacctccactactctgttcttgtctacgctacaaaacaaga 1672368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 1674883 - 1674843
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||    
T  1674883 tacctccactactctgttcttgtctacgctacaaaacaaga 1674843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3483561 - 3483521
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3483561 caacgtctattttacacctctatataaaggagtgaagactt 3483521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 16853522 - 16853482
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  16853522 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 16853482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18473858 - 18473810
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||| |||| || |||||||||||    
T  18473858 tcaacgtctttttcacacctctatataaaagagtaaatacttgaagatt 18473810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 208)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23635930 - 23635637
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635930 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 23635831  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23635830 ttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 23635731  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23635730 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 23635637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6490364 - 6490657
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6490364 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 6490463  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6490464 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 6490563  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6490564 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagatgatatagagaaatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaactgattctacaaag 6490657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6501018 - 6501311
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6501018 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 6501117  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6501118 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 6501217  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6501218 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagatgatatagagaaatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaactgattctacaaag 6501311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12237629 - 12237921
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12237629 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaatagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 12237727  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12237728 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 12237827  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12237828 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatgacagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 12237921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12249455 - 12249747
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12249455 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 12249553  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12249554 ttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 12249653  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12249654 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatgacaaatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 12249747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 24706569 - 24706862
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706569 tacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 24706668  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  24706669 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattctctcaacgtctctttc 24706768  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706769 acgcctttatataaaggagtgaagacttgaagattggagatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24706862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 933847 - 933555
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  933847 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaaactaattc 933749  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  933748 ttcaaaggactacatccaaatcagacaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacatgctaatcatctcaacgtctctttc 933649  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933648 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 933555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 7804533 - 7804825
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804533 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaatacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 7804631  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  7804632 ttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttc 7804731  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7804732 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 7804825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10626956 - 10627249
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | |||     
T  10626956 tacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagattctgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagattatta 10627055  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10627056 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 10627155  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10627156 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatagtagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 10627249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 7794622 - 7794914
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7794622 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 7794720  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||   || || ||||||||||||||    
T  7794721 ttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgaaaatcatctcaacgtctctttc 7794820  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7794821 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaag 7794914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9535828 - 9535537
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535828 tacctccactactctgtttt-gtccatgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 9535730  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  9535729 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 9535630  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9535629 acacctctatataaaggagtgaagacttgaa-attggagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9535537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10655278 - 10655571
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10655278 tacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagattttgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagattattc 10655377  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10655378 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttcgacgtgctgattatctcaacgtctctttc 10655477  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10655478 acgcctctatataaaggattgaagacttgaagatagtagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 10655571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 29461228 - 29461520
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29461228 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattc 29461326  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29461327 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagatgtgctaattatctcaacgtctctttc 29461426  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29461427 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagacatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 29461520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 29472080 - 29472372
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29472080 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattc 29472178  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29472179 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagatgtgctaattatctcaacgtctctttc 29472278  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29472279 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagacatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 29472372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 228; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 11216736 - 11217032
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11216736 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 11216835  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  11216836 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatctc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 11216934  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg--tacatagag--atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11216935 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagagatagagatatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 11217032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6220716 - 6221010
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6220716 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 6220815  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6220816 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 6220915  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6220916 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattatacatagagatacataaattcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 6221010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9993908 - 9994201
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9993908 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatcc 9994006  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9994007 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 9994106  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatag-agatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9994107 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagatgaaaaatagaaaatatacaagttcaaaagtgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 9994201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19778606 - 19778312
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19778606 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 19778507  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19778506 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgttggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 19778407  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778406 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19778312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 19887372 - 19887661
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 103  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887372 ctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 19887470  T
Q  104 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacg 203  Q
    |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||     
T  19887471 aaagtagtacacccaaatcaggcaaacgattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttcaca 19887570  T
Q  204 cctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19887571 cctctatataaatgagcgaagacttgaagattctagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19887661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 39672897 - 39673191
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||   |||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39672897 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtatgttcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 39672996  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39672997 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 39673096  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39673097 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 39673191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48337461 - 48337169
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48337461 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 48337363  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  48337362 ttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattactggtgaatgatcaaaggattctaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttc 48337263  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48337262 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagacatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 48337169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9391217 - 9391511
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9391217 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 9391316  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  9391317 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatctc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 9391415  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag--atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9391416 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagatagagatatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9391511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13121883 - 13121589
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13121883 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 13121784  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13121783 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactccttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 13121684  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13121683 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 13121589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14465812 - 14465518
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14465812 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 14465713  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14465712 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactccttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 14465613  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14465612 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14465518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19789243 - 19788949
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19789243 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 19789144  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19789143 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgttggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctcttt 19789044  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19789043 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19788949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23757519 - 23757225
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23757519 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 23757420  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23757419 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 23757320  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23757319 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 23757225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23768115 - 23767821
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23768115 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 23768016  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23768015 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 23767916  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23767915 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 23767821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9380671 - 9380965
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9380671 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 9380770  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  9380771 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatctc-aacgactctttagacatgctaatcatctcaacgtctctttc 9380869  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag--atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9380870 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagatagagatatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9380965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6180542 - 6180836
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6180542 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcataatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 6180641  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6180642 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcattggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 6180741  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6180742 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattatacatagagatacataaattcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 6180836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37759891 - 37759597
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37759891 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 37759792  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37759791 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 37759692  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37759691 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcatatagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 37759597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 28169301 - 28169010
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28169301 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 28169203  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  28169202 ttcaaaggactacacccaaatcagacaaatgattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 28169104  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28169103 acacctctatataagggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaaccctgtcaatttgattctacaaag 28169010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13557792 - 13557501
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 102  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  13557792 ctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcatgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgagtttgaagcttattctt 13557693  T
Q  103 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcac 202  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13557692 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcac 13557593  T
Q  203 gcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13557592 gcctctatataaaggagtgaagacttgaagattggagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 13557501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18484266 - 18483971
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  18484266 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 18484167  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18484166 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 18484067  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18484066 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattttagatagagatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 18483971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23647969 - 23647676
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23647969 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 23647870  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23647869 cttcaaatgactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 23647770  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23647769 cacgcctctatataaagga-tgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 23647676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11164049 - 11163757
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11164049 tacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctacagaatttttgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 11163950  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  11163949 ttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttc 11163851  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11163850 acgcctctatataagggagtgaagacttgaagattgtagatagagaaatacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttaattctacaaag 11163757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 4174771 - 4175065
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4174771 tacctccactactctgttttctgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 4174870  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4174871 cttcaaaggactacacccaaattaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 4174970  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4174971 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 4175065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37885795 - 37885505
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 103  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37885795 tccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttc 37885696  T
Q  104 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacg 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  37885695 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcaca 37885596  T
Q  204 cctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37885595 cctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 37885505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14476444 - 14476148
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14476444 tacctccactactctgttttctgtctacactacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 14476345  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgat--tatttcaacgtctct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  14476344 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactccttagacgtgctgattatatctcaacgtctct 14476245  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14476244 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14476148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20673210 - 20673502
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20673210 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 20673309  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20673310 cttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 20673409  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20673410 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt----atagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 20673502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 1794497 - 1794790
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1794497 tacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 1794595  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  1794596 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctt 1794694  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1794695 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 1794790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 5579648 - 5579942
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5579648 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 5579747  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5579748 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5579847  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5579848 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagatagagatacacaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 5579942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 5628032 - 5628326
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5628032 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 5628131  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5628132 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5628231  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5628232 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagatagagatacacaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 5628326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9981900 - 9982193
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9981900 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacatctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatcc 9981998  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9981999 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgatcaaaggatttcaaatgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 9982098  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatag-agatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || | |||||||||  ||||||||||||||||||   | |||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9982099 acacttctatataatagagtgaagacttgaagatgaaaaatagaaaatatacaagttcaaaagtgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 9982193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Original strand, 13393872 - 13394163
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13393872 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 13393971  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13393972 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 13394071  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaagt 295  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13394072 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt----aaagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaagt 13394163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20721334 - 20721040
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  20721334 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 20721235  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20721234 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 20721135  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20721134 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatttaagatagagatacacaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 20721040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 28314246 - 28314540
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28314246 tacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 28314345  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28314346 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 28314445  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28314446 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 28314540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37866666 - 37866372
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37866666 tacctcaactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 37866567  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37866566 cttcaaaggactacacccaaatcgggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 37866467  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37866466 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 37866372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4457135 - 4456844
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4457135 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattc 4457037  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||  | || |||| |||||||||    
T  4457036 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-caactctttagacgtgctattcatctcaatgtctctttc 4456938  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4456937 acgcctatatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagagagatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 4456844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 5865708 - 5866004
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5865708 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 5865807  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5865808 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5865907  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5865908 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattcaagatagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 5866004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 5876307 - 5876603
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5876307 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 5876406  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5876407 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5876506  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5876507 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattcaagatagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 5876603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 13372684 - 13372974
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13372684 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 13372783  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13372784 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 13372883  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13372884 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt----aaagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 13372974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 13383278 - 13383568
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13383278 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 13383377  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13383378 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 13383477  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13383478 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt----aaagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 13383568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17910017 - 17910309
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17910017 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacatctatgcctgcagaatttatgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattc 17910115  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
     | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  17910116 ctaaaaggacaacacccaaatcaggaaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 17910215  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17910216 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattggtgatagatatatacaagttaaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaag 17910309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20683795 - 20684087
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20683795 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 20683894  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  20683895 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtcccttt 20683994  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20683995 cacgcctctatataaagaagtgaagacttgaagatt----atagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 20684087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5510916 - 5510623
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5510916 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 5510818  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5510817 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5510718  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5510717 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 5510623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5521094 - 5520801
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5521094 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 5520996  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5520995 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5520896  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5520895 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 5520801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 5537036 - 5537329
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5537036 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 5537134  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5537135 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5537234  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5537235 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataacatatagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 5537329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10099288 - 10098995
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  10099288 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 10099190  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10099189 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 10099090  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10099089 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagacatagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 10098995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12286993 - 12287287
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12286993 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 12287092  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12287093 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 12287192  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12287193 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12287287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24660121 - 24659827
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24660121 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 24660022  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24660021 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24659922  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24659921 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagtttaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 24659827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 28324862 - 28325156
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  28324862 tacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 28324961  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  28324962 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttaaacgtgctgattatctcaacgtctcttt 28325061  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28325062 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 28325156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35187598 - 35187304
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  35187598 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 35187499  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  35187498 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 35187399  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35187398 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 35187304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4404492 - 4404201
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4404492 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattc 4404394  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | ||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  4404393 ttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-caactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttc 4404295  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4404294 acgcctatatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagagagatacaagttaaaaagcgccaaaactatgtcaatttgattctacaaag 4404201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 13261688 - 13261979
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13261688 taccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 13261786  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||   |||| ||| |||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  13261787 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaagggactcaa-cgaatctttagacgtgttaatcatctcaacgtctctttc 13261885  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13261886 acgcctctatataaaggagtgaagacttgttgattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgtcaaaactttgtcaatttgattctacaaag 13261979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 1784085 - 1784378
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagaca-acagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1784085 tacctccactactctgttttttgtccacgctacaagacaagaaacacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttaat 1784183  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||    
T  1784184 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctt 1784282  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1784283 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctgcaaag 1784378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 504182 - 504476
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  504182 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 504281  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  504282 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 504381  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  504382 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 504476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 526548 - 526842
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  526548 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 526647  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  526648 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 526747  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  526748 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 526842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4743958 - 4743665
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4743958 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 4743860  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4743859 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 4743760  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4743759 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataatagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 4743665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12296815 - 12297109
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12296815 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 12296914  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12296915 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgcctctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 12297014  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12297015 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12297109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 24383533 - 24383827
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24383533 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 24383632  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24383633 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24383732  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24383733 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24383827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24670701 - 24670407
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24670701 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 24670602  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24670601 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24670502  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24670501 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagtttaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 24670407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38314919 - 38314627
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  38314919 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctgttt 38314821  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  38314820 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 38314722  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38314721 cactcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 38314627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 11272397 - 11272692
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  11272397 tacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 11272496  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11272497 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 11272596  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11272597 tcacccctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacatagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 11272692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13132126 - 13131831
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13132126 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 13132027  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13132026 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactccttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 13131927  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatag-agatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |  || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13131926 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagccgaaacattaggtcagaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 13131831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38194946 - 38194651
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  38194946 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 38194847  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38194846 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 38194747  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38194746 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 38194651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38205482 - 38205187
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  38205482 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 38205383  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38205382 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 38205283  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38205282 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 38205187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 5547620 - 5547913
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  5547620 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctacagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 5547718  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5547719 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5547818  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5547819 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataacatatagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactttgtcaatttgattctacaaag 5547913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41683899 - 41683605
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41683899 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 41683800  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41683799 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 41683700  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41683699 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagatatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 41683605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 41694468 - 41694174
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  41694468 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 41694369  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41694368 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 41694269  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41694268 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagatatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 41694174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8774879 - 8774584
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8774879 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 8774780  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8774779 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 8774680  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8774679 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaatagaaatatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 8774584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8785464 - 8785169
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8785464 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 8785365  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8785364 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 8785265  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8785264 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaatagaaatatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 8785169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39372275 - 39371980
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  39372275 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 39372176  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39372175 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 39372076  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39372075 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacataaatacaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 39371980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39382912 - 39382617
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  39382912 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 39382813  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  39382812 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 39382713  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39382712 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacataaatacaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 39382617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4754543 - 4754252
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| || ||    
T  4754543 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttattt 4754445  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  4754444 -ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattact-caacgtctcttt 4754347  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4754346 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataatagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 4754252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27883603 - 27883310
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  | ||||    
T  27883603 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaaattgattc 27883505  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  27883504 ttcaaaggactacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaacatctcaacgtctctttc 27883406  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27883405 acacctctatataaaggagtggagacttgaagattgtagatagagatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctacaaag 27883310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 8995971 - 8996264
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  8995971 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagtcgattc 8996069  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  8996070 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatatcaacgtctctttc 8996168  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8996169 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggcaagagacatcaatacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 8996264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 43 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16386251 - 16386002
Alignment:
Q  43 aacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgg 142  Q
    |||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16386251 aacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaatctaattcttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgg 16386153  T
Q  143 atgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacata 242  Q
    || || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |    
T  16386152 ataatcaaaggatttcatacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttttacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat--tacaga 16386055  T
Q  243 -gagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
     |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16386054 ggagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 16386002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 215
Target Start/End: Original strand, 18851707 - 18851919
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18851707 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 18851805  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18851806 tttaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 18851904  T
Q  201 acgcctctatataaa 215  Q
    |||||||||||||||    
T  18851905 acgcctctatataaa 18851919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9006523 - 9006816
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||    
T  9006523 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagtcgattc 9006621  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  9006622 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgaatctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 9006720  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9006721 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggcaagagacatcaatacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 9006816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1064358 - 1064065
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  1064358 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 1064260  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || |||| |||||||||    
T  1064259 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaaagtctctttc 1064161  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  1064160 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacataaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctaccaaatttgattctacaaag 1064065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16077149 - 16076856
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  16077149 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagca-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 16077051  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  16077050 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagaaactc-aacgactctttagacgtgctcaaaatctcaacgtctctttc 16076952  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| || | |||||||||||||||||    
T  16076951 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggcaagagatatcaatacaagtt-aaaagcgccaaaactttgccaaatttgattctacaaag 16076856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1053929 - 1053636
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  1053929 tacctccactactttgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgtagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 1053831  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  1053830 ttcaaaggactacacccaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 1053732  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| ||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1053731 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagtgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 1053636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14581358 - 14581126
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  14581358 tacctccactaccctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaatttgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaattc 14581259  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  14581258 ttcaaaggacttcatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 14581160  T
Q  201 acgcctctatataaagg-agtgaagacttgaaga 233  Q
    || |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  14581159 acacctccatataaaggaagtgaagacttgaaga 14581126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 8740142 - 8740434
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  8740142 tacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgctccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcc 8740240  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   | |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  8740241 ttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaacac-aacgactc-ttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 8740338  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || | |||||||||||||||||| ||||||||||||   |  || ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  8740339 acacttctatataaaggagtgaaaacttgaagattggcaagtgacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 8740434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 16671177 - 16671470
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||| |  | |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  16671177 tacctccactacttttctcttgtccacactacaagacaagacaacagctctgcctgtagaat-tgttccttcaagatgtgaatgaatttgaagttgattc 16671275  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||||||    
T  16671276 ttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacatctctttc 16671374  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  16671375 acaccactatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 16671470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2246587 - 2246293
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  2246587 tacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcataa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 2246489  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  2246488 ttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 2246390  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  2246389 ctcaccactatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 2246293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 17281448 - 17281682
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||  ||||||||||||| | ||||    
T  17281448 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctatacctgcagaa-atgttccttcaaaatgaaaatgaatttgaagttgattc 17281546  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| ||||  |  || |||||||||||||    
T  17281547 ttcaaaggactacacccaaatctggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacatgctaaaaaatctcaacgtctcttt 17281645  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17281646 cacacttctatataaaggaatgaagacttgaagattg 17281682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 4 - 152
Target Start/End: Original strand, 16391632 - 16391780
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16391632 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatgtgtaccctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttc 16391731  T
Q  104 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaag 152  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  16391732 aaatgagtacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaag 16391780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 13199257 - 13199492
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  13199257 tacctccactactctgtttttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgatccttcaagataggaatgaatttgaagttgat 13199355  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct- 197  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||     
T  13199356 ccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctc 13199454  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    | | | || || ||||||||||||||||||||||||||    
T  13199455 tactcaccactgtataaaggagtgaagacttgaagatt 13199492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 16666142 - 16666295
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  16666142 tacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagatgtgaatgaatttgaagttgattc 16666240  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggat 155  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16666241 ttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggat 16666295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 29933573 - 29933862
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagct-aatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  |  ||     
T  29933573 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaatagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttcgatc 29933671  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctct- 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  |  || |||| ||||||     
T  29933672 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagaatctcaaagtctctc 29933770  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctg-tcaatttgattct 288  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  29933771 tactcacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt-tacagagatataaacacaagtt-aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattct 29933862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 288
Target Start/End: Original strand, 29982727 - 29983016
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagct-aatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  |  ||     
T  29982727 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaatagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttcgatc 29982825  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctct- 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  |  || |||| ||||||     
T  29982826 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagaatctcaaagtctctc 29982924  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctg-tcaatttgattct 288  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||  | ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  29982925 tactcacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt-tacagagatataaacacaagtt-aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattct 29983016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Original strand, 29906202 - 29906429
Alignment:
Q  8 actactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaag 107  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||    
T  29906202 actactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-attttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcatag 29906300  T
Q  108 gactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctct-ttcacgcc 205  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  |  || ||||||||||| | | | ||    
T  29906301 gacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagaatctcaacgtctctctactcacc 29906399  T
Q  206 tctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29906400 tctatataaaggagtgaagacttgaagatt 29906429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Original strand, 29947367 - 29947594
Alignment:
Q  8 actactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaag 107  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||    
T  29947367 actactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-attttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcatag 29947465  T
Q  108 gactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctct-ttcacgcc 205  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  |  || ||||||||||| | | | ||    
T  29947466 gacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagaatctcaacgtctctctactcacc 29947564  T
Q  206 tctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29947565 tctatataaaggagtgaagacttgaagatt 29947594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 8 - 235
Target Start/End: Original strand, 29996521 - 29996748
Alignment:
Q  8 actactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaag 107  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || | |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||    
T  29996521 actactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-attttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcatag 29996619  T
Q  108 gactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctct-ttcacgcc 205  Q
    ||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  |  || ||||||||||| | | | ||    
T  29996620 gacaacatccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagaatctcaacgtctctctactcacc 29996718  T
Q  206 tctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29996719 tctatataaaggagtgaagacttgaagatt 29996748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 289
Target Start/End: Original strand, 15662740 - 15663009
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||    
T  15662740 tgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaattttt-ccttcaaaataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaa 15662838  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||| |   |||| |||||||||||||    
T  15662839 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgaccctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctctagtcgccactatataaaggag 15662937  T
Q  220 tgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattcta 289  Q
    |||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  15662938 tgaagacttgaagattggcaaaagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattcta 15663009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 15651105 - 15651319
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||| | | ||||||| || ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||    
T  15651105 tgtcctcgctacaagaaaagacaacagctctgcctacagaattttt-ccttcaaaataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaa 15651203  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || |||| |||||| | | ||||  ||||||||||||    
T  15651204 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaatgtctctctactcgccattatataaaggag 15651302  T
Q  220 tgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||||||||||    
T  15651303 tgaagacttgaagattg 15651319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21736310 - 21736098
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  21736310 tgtcctcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaat-tgttcccacaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 21736212  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  || |||||| ||||||||||||| |  || ||||||||||| | | | || |||| ||||||||    
T  21736211 tcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgacactttagacgtgctaaagatctcaacgtctctctactcaccactatttaaaggag 21736113  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  21736112 tgaagacttgaagat 21736098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 15216355 - 15216446
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15216355 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 15216446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 12567285 - 12567376
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 93  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12567285 taccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 12567376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 6 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 49990280 - 49990052
Alignment:
Q  6 ccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 104  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |||||    
T  49990280 ccactactctgcttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttca 49990182  T
Q  105 aaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctttcac 202  Q
     ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||||  ||||| ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| |||||||||    
T  49990181 taggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaag--tttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctttcac 49990084  T
Q  203 gcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49990083 acctctatataaaggagtgaagacttgaagat 49990052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 16476499 - 16476366
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttt-ttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||  |||||||||||||||||||| ||     
T  16476499 tacctccactactctgtttcttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaccatgggaatgaatttgaagcttatc 16476400  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 133  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  16476399 cttcaaaggactacaccccaaacaggcacaggat 16476366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 27173031 - 27172912
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||| | |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  27173031 tgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagatt-tgttctttcaagataggaatgaatttgaagttaattcttcaaaggactacatccaaa 27172933  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtg 141  Q
    ||||||||| ||||| |||||    
T  27172932 tcaggcaaaagattaatggtg 27172912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 31114001 - 31114234
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | ||||||  ||||||  | || |    
T  31114001 tacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagttaggaatggttttgaacttgatcc 31114099  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | |   | ||||||| ||| |    
T  31114100 ttcataggacaacatccaaatcaagcaaaagattaatgttgaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgcttaaaggtctcaacgtttctct 31114198  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31114199 acacacctctataaaaaggagtgaagacttgaagat 31114234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15851033 - 15850800
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  15851033 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctccagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatc 15850935  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgt-gctgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | | ||| ||||||||| | ||||| | | |  || |||| | ||||    
T  15850934 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtgtcacaacgactctattgacgtggttaaagatctcaatgactct 15850837  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15850836 ttcacatctctatataaaggagtgaagacttgaagat 15850800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 17961551 - 17961419
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||||||||| || |||||    
T  17961551 tgtccgcgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagatt-tgttccttcaagatagcaatgaatttgaagttgattatgcaaaggactgcatccaaa 17961453  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaagga 154  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  17961452 tcaggcaacagatcactggtggatgatcaaagga 17961419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 18006496 - 18006364
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| | ||||||||||||| | ||| | ||||||||| || |||||    
T  18006496 tgtccgcgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagatt-tgttccttcaagatagcaatgaatttgaagttgattatgcaaaggactgcatccaaa 18006398  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaagga 154  Q
    ||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||    
T  18006397 tcaggcaacagatcactggtggatgatcaaagga 18006364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 51341035 - 51340802
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||| |||||| |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  51341035 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcccgcagaa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatc 51340937  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| || || ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||| | |  || ||||||  |||    
T  51340936 cttcatagtacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgaatct 51340839  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51340838 ttcacacctctatataaaggagtgaagacctgaagat 51340802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 10529370 - 10529243
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  10529370 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatcc 10529272  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 129  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  10529271 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 10529243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 51989158 - 51989392
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | |||    
T  51989158 tacctccacgaatctgtttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatt 51989256  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct- 197  Q
    ||| | ||||| ||| |||||||||| ||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || |||||||||||     
T  51989257 ctttataggacaacatccaaatcaggaaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctc 51989355  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51989356 tacacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 51989392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 15833428 - 15833197
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||||  |||||||  | ||     
T  15833428 tacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttca--ataggaattgatttgaacgtgatc 15833332  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | | ||| ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| || |    
T  15833331 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtgtcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactat 15833234  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15833233 ttcacatctctatataaaggagtgaagacttgaagat 15833197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 45861707 - 45861941
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagac-aagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||| || | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  45861707 tacctccactactatgtttatgtctacgctacaagacaaaaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacttgatc 45861805  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttc-aaacgactct-ttagacgtgc-tgattatttcaacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  ||||||  ||||||||| || ||||||| | |  || |||||| |||    
T  45861806 cttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--gatttctgaacgactctatttgacgtgcttaaagatctcaacgactc 45861903  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  45861904 tttcacacctctatataaaggagtcaagacttaaagat 45861941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22151270 - 22151037
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| | |||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  22151270 tacctccacgattctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttctttcaagataggaatggatttgaacgtgatc 22151172  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||| | || ||  |||| ||||  ||||| ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  22151171 cttcataagacaacatccaaatcaggcaaaagatcattgctgtttgatcaaag--tttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactct 22151074  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22151073 ctcacacctctatataaaggagtgaaaacttgaagat 22151037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13148261 - 13148057
Alignment:
Q  30 tacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 128  Q
    |||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  13148261 tacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaat-tgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaa 13148163  T
Q  129 aggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagac 226  Q
    | ||| | |||||  |||| || |  ||||| ||||||||| | |||||||| |   || |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13148162 aagatcattggtgattgatcaagg--tttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctctcacacctctatataaaggagtgaagac 13148065  T
Q  227 ttgaagat 234  Q
    ||||||||    
T  13148064 ttgaagat 13148057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 41045767 - 41045640
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| | |||||| |||||||  | || |    
T  41045767 tacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagttaggaatggatttgaacttgatcc 41045669  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 129  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| |||||    
T  41045668 ttcataggacaacatccaaatcatgcaaa 41045640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 14321697 - 14321771
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaaga 76  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||||| |||| |||||||||    
T  14321697 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacaactcttcctgcagaa-atgttccttcaaga 14321771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 13410370 - 13410420
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13410370 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 13410420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16879853 - 16879803
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16879853 caacgtctctttcacgcctctatataaaagagtgaagacttgaagattgta 16879803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 6253256 - 6253209
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6253256 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 6253209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 14077672 - 14077719
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14077672 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 14077719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16882124 - 16882074
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  16882124 caacgtctctttcacgcctctatataaaagagtgaagacttaaagattgta 16882074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 27374600 - 27374550
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27374600 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactttaagattgta 27374550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 47405556 - 47405784
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  47405556 tacctccactactatgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaataggaatgcatttgaaattgatc 47405654  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct--ttagacgtgctgattattt-caacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| | | ||| |||||||||| ||| | |||||  |||| ||||   |||||||||||||  || ||  ||||||  |||  |||||||||    
T  47405655 cttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagc--ttcaaacgactctattttgatatgctgacaattcacaacgtctc 47405752  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  47405753 tttcatacctctatataaaggagtgaagactt 47405784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Original strand, 8729317 - 8729360
Alignment:
Q  195 tctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8729317 tctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 8729360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Original strand, 9081204 - 9081247
Alignment:
Q  195 tctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9081204 tctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 9081247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #136
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12396903 - 12396856
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12396903 caacgtctctttcacacctctgtataaaggagtgaagacttgaagatt 12396856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #137
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13653757 - 13653714
Alignment:
Q  195 tctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13653757 tctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 13653714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #138
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17007032 - 17006985
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17007032 tcaacgtctctctcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 17006985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #139
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17017838 - 17017791
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17017838 tcaacgtctctctcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 17017791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #140
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 21636989 - 21637032
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21636989 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 21637032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #141
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40850817 - 40850774
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40850817 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 40850774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #142
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 12752758 - 12752988
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 102  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| ||||||  || ||||||  ||||||  | ||  ||    
T  12752758 ctccacaactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaaa-atgttccttcagaataggaatggctttgaacgtgatcatt 12752856  T
Q  103 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctctttc 200  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| || |  ||||| ||||||| | | |||||||| |   || |||| |  ||||||    
T  12752857 cataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaagg--tttcacaacgactttattgacgtgcttaaagatctcaatgaatctttc 12752954  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12752955 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 12752988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #143
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14955266 - 14955224
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14955266 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 14955224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #144
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 234
Target Start/End: Original strand, 16794604 - 16794650
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16794604 caacgtctctttcacacctctacataaaggagtgaagacttgaagat 16794650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #145
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20418069 - 20418019
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20418069 caacgtctctttcacacgtctatataaaggagtgtagacttgaagattgta 20418019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #146
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2561212 - 2560984
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| || ||||| | |||||| |  |||| ||||||  |||||||||||||||||  | ||     
T  2561212 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctacctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgaatttgaaattgatc 2561114  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct--ttagacgtgctgattattt-caacgtctc 196  Q
     |||| ||||| | | ||| |||||||||| ||| | |||||  |||| ||||   ||||||||||| |  || || ||||||   |||  |||||||||    
T  2561113 attcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagc--ttcaaacgactttattttgatgtgctggcaattcacaacgtctc 2561016  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2561015 tttcacacctctatataaagaagtgaagactt 2560984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #147
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 2784903 - 2784862
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2784903 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 2784862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #148
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11223402 - 11223361
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11223402 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 11223361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #149
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12968144 - 12968099
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12968144 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacatgaaga 12968099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #150
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13699202 - 13699153
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13699202 aacgtatctctcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 13699153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #151
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 21317239 - 21317190
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21317239 tcaacgtatctctcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 21317190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #152
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21640705 - 21640664
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21640705 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 21640664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #153
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 49666726 - 49666767
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  49666726 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 49666767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #154
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 12389195 - 12389235
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12389195 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 12389235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #155
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 12726553 - 12726593
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12726553 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 12726593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #156
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 12963408 - 12963448
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12963408 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 12963448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #157
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13948172 - 13948132
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13948172 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 13948132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #158
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 258 - 294
Target Start/End: Original strand, 14321962 - 14321998
Alignment:
Q  258 aaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14321962 aaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14321998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #159
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 17239245 - 17239285
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  17239245 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 17239285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #160
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 18121935 - 18121975
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18121935 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 18121975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #161
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 19249735 - 19249775
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19249735 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 19249775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #162
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20645989 - 20645949
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20645989 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 20645949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #163
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28581942 - 28581902
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28581942 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 28581902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #164
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37467169 - 37467129
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37467169 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 37467129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #165
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 38177966 - 38178006
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38177966 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 38178006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #166
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 49643085 - 49643125
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49643085 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 49643125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #167
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 52920244 - 52920204
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52920244 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 52920204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #168
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10851645 - 10851598
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10851645 caacatctctttcacacctcaatataaaggagtgaagacttgaagatt 10851598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #169
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 11909347 - 11909393
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11909347 tcaacgactctttcacacctctatataaaggagtgaagacttaaaga 11909393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #170
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 5213415 - 5213378
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaa 223  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5213415 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaa 5213378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #171
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 238
Target Start/End: Original strand, 7832970 - 7833011
Alignment:
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7832970 tttcacacctttatataaaggagtgaagacttgaagattgta 7833011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #172
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 17022051 - 17021975
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagat 77  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17022051 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagat 17021975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #173
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 24775854 - 24775895
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24775854 ttcaacgtctctctcacacctctatataaaggagtgaagact 24775895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #174
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33583068 - 33583027
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33583068 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaagact 33583027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #175
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 195 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 17697438 - 17697402
Alignment:
Q  195 tctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaa 231  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17697438 tctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaa 17697402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #176
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 18143067 - 18143107
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18143067 caacgtctctttcacatctctatataaaggagtgaagactt 18143107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #177
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 20627755 - 20627795
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  20627755 caacgtctcttttacacctctatataaaggagtgaagactt 20627795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #178
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20724924 - 20724884
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  20724924 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagactt 20724884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #179
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Original strand, 22804349 - 22804385
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22804349 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 22804385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #180
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 229
Target Start/End: Original strand, 25398579 - 25398619
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttg 229  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  25398579 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagtcttg 25398619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #181
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 41045582 - 41045534
Alignment:
Q  187 tcaacgtctcttt-cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41045582 tcaacgtctctctacacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 41045534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #182
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 46350166 - 46350206
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  46350166 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtaaagactt 46350206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #183
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 49553812 - 49553852
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  49553812 caacgtctctttcacacccctatataaaggagtgaagactt 49553852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #184
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16812045 - 16812010
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16812045 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 16812010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #185
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 17762415 - 17762462
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  17762415 caacgtctctttcatacctctatatgaaggaatgaagacttgaagatt 17762462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #186
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 19063735 - 19063782
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  19063735 caacgtctctttcatacctctatatgaaggaatgaagacttgaagatt 19063782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #187
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 186 - 225
Target Start/End: Original strand, 21605975 - 21606014
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaaga 225  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21605975 ttcaacgtctcttttacacctctatataaaggagtgaaga 21606014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #188
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 37412444 - 37412397
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||    
T  37412444 tcaacgtctttttcacaccactatataaaggagtgaagacctgaagat 37412397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #189
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40799709 - 40799670
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  40799709 caacgtctctttcacatctctatataaaggagtgaagact 40799670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #190
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 235
Target Start/End: Original strand, 7921029 - 7921078
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7921029 ttcaacgtctcttttcaacctctatataaaggattgaagacttgaagatt 7921078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #191
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 13823914 - 13823877
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaaga 225  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  13823914 caacgtctctttcacacctctatataaatgagtgaaga 13823877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #192
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13954072 - 13954043
Alignment:
Q  205 ctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13954072 ctctatataaaggagtgaagacttgaagat 13954043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #193
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 229
Target Start/End: Original strand, 16199752 - 16199793
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttg 229  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||    
T  16199752 caacgtctcttttacacctctatataaaggagtgaacacttg 16199793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #194
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 199 - 236
Target Start/End: Original strand, 19198213 - 19198250
Alignment:
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19198213 tcacacctctatataaaggagtgaagacctgaagattg 19198250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #195
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 225
Target Start/End: Original strand, 26417998 - 26418035
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaaga 225  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  26417998 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaaga 26418035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #196
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 223
Target Start/End: Original strand, 46796688 - 46796725
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaa 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  46796688 ttcaacgtctctttcacacctctatataaatgagtgaa 46796725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #197
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 53057049 - 53057090
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  53057049 ttcaacgtatctttcacacctctgtataaaggagtgaagact 53057090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #198
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 12726365 - 12726405
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  12726365 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 12726405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #199
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 14393327 - 14393367
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  14393327 caacgtctcttacacacctctatataaaggagtgaaaactt 14393367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #200
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 22140788 - 22140748
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22140788 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22140748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #201
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 23538487 - 23538527
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23538487 caacgtttctttcacacctttatataaaggagtgaagactt 23538527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #202
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 5 - 92
Target Start/End: Original strand, 24775673 - 24775760
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  24775673 tccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagtaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaa 24775760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #203
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Original strand, 29951765 - 29951801
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  29951765 gtctcttttacacctctatataaaggagtgaagactt 29951801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #204
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Original strand, 30000919 - 30000955
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30000919 gtctcttccacacctctatataaaggagtgaagactt 30000955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #205
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 40799898 - 40799807
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||| ||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  40799898 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagataagaaaaacagctctgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaa 40799807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #206
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47207541 - 47207501
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  47207541 caacgtctctttcacatctctatataaagaagtgaagactt 47207501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #207
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 47207730 - 47207690
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  47207730 tacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaaga 47207690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #208
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 53056862 - 53056902
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  53056862 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 53056902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 258; Significance: 1e-144; HSPs: 177)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20797830 - 20798123
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20797830 tacctccactactctgtttttgtccacgctgcaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 20797929  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20797930 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 20798029  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20798030 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcatatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 20798123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43043797 - 43043504
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043797 tacctccactactctgcttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 43043698  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43043697 ttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 43043598  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43043597 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagacatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 43043504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30070032 - 30069737
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30070032 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 30069933  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30069932 ttcaaaggactacacccaaatcaggcataggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 30069833  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacat--agagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30069832 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 30069737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 8521976 - 8522268
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8521976 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 8522074  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8522075 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtgaatgatcaaatgatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 8522174  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8522175 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 8522268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10754628 - 10754920
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10754628 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 10754726  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10754727 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaatgatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 10754826  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10754827 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagatgagatatagagatatacaagttaaaaagctccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 10754920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21703254 - 21702962
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703254 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 21703155  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  21703154 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttc 21703056  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703055 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 21702962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21706101 - 21705809
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21706101 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 21706002  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  21706001 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttc 21705903  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21705902 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattatacaaag 21705809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 23406581 - 23406873
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406581 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaatacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 23406679  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23406680 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 23406779  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23406780 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaag 23406873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36228874 - 36229166
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36228874 tacctccactactctgtttt-gtccacgccacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 36228972  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  36228973 ctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 36229072  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36229073 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36229166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 31448687 - 31448982
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31448687 tacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 31448786  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31448787 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctcttt 31448886  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgt-acatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  31448887 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtaagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctctcaaattgattctacaaag 31448982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 22559571 - 22559865
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22559571 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 22559670  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22559671 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 22559770  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22559771 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 22559865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 34782991 - 34783283
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34782991 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattc 34783089  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34783090 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 34783189  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34783190 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagagagacatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaag 34783283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36084596 - 36084888
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084596 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacatgacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 36084694  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  36084695 ctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 36084794  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36084795 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagatacacaagttaaaaatcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36084888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1109271 - 1108977
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1109271 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattc 1109173  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1109172 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 1109073  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatat--acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1109072 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagagatatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaag 1108977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1122029 - 1121735
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  1122029 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattc 1121931  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1121930 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 1121831  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatat--acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1121830 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagagatatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaag 1121735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24983546 - 24983253
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24983546 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattc 24983448  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24983447 ctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 24983348  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagtt-caaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24983347 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagatatatacaagttaaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24983253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27622893 - 27622599
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27622893 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 27622794  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27622793 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 27622694  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27622693 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27622599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36582684 - 36582390
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36582684 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 36582585  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36582584 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36582485  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36582484 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36582390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36593239 - 36592945
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36593239 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 36593140  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36593139 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36593040  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36593039 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36592945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 40390491 - 40390785
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40390491 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 40390590  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40390591 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 40390690  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40390691 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40390785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 19464110 - 19464398
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19464110 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 19464209  T
Q  105 aaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| |    
T  19464210 aaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttcacac 19464308  T
Q  205 ctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19464309 ctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaag 19464398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 19478140 - 19478428
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19478140 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 19478239  T
Q  105 aaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||  || || |||||||||||||||| |    
T  19478240 aaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttcacac 19478338  T
Q  205 ctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19478339 ctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctataaag 19478428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 42395115 - 42395406
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42395115 tacctccacta-tctgtttt-gtccacactacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatggaaatgaatttgaagctaattc 42395212  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||     
T  42395213 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttt 42395312  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42395313 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 42395406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 31418796 - 31419088
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31418796 tacctccactactctgttttttgtctgcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttatgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 31418895  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31418896 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctcttt 31418995  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgt-acatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaca 291  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31418996 cacgcctctatatagaggagtgaagacttgaagattgtaagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctaca 31419088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5290702 - 5290408
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  5290702 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatggtaatgaatttgaagcttatt 5290603  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5290602 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5290503  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5290502 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 5290408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24926265 - 24925972
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24926265 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacacctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattc 24926167  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24926166 ctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 24926067  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagtt-caaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24926066 acacctttatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagatatatacaagttaaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24925972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27603544 - 27603250
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27603544 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 27603445  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27603444 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 27603345  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27603344 cacacctctatataaatgagtgaagacttgaagataaaagatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27603250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 39352622 - 39352916
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39352622 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 39352721  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39352722 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaagaatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 39352821  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39352822 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagaaagggatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 39352916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 40401153 - 40401447
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40401153 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 40401252  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40401253 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 40401352  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40401353 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40401447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20551950 - 20552242
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20551950 tacctccactactctatttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 20552048  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  20552049 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaatgatttcaaacaactctttagacttgctaatcatctcaacgtctctttc 20552148  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20552149 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaag 20552242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 34772046 - 34772338
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34772046 tacctccaccactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattc 34772144  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  34772145 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgatgattatctcaacgtctctttc 34772244  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  34772245 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagagagacatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaag 34772338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7032254 - 7031958
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt---gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |    
T  7032254 tacctccactactctgttttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagctta 7032155  T
Q  98 ttcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7032154 ttcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctct 7032055  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7032054 ttcacgcctctatataaaggtgtgaagacttgaagattgaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 7031958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16004017 - 16003723
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16004017 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 16003918  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16003917 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 16003818  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16003817 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 16003723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 23306979 - 23307273
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23306979 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 23307078  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23307079 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 23307178  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23307179 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 23307273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6130923 - 6131219
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6130923 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 6131022  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6131023 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 6131122  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6131123 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 6131219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17446821 - 17446530
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17446821 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattc 17446723  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  17446722 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttc 17446624  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446623 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagagagatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17446530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 31844093 - 31844389
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31844093 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 31844192  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31844193 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 31844292  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31844293 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagacagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 31844389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 23296411 - 23296705
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  23296411 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 23296510  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23296511 cttcaaatgactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 23296610  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23296611 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 23296705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 27203927 - 27204220
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27203927 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 27204026  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  27204027 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctcttt 27204126  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27204127 cacgcctctatataaagga-tgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27204220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17457437 - 17457146
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17457437 tacctccactactctgtttttgtatacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattc 17457339  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  17457338 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttc 17457240  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17457239 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagagagatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17457146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 22146655 - 22146951
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22146655 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 22146754  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22146755 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 22146854  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22146855 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 22146951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 22157238 - 22157534
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22157238 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 22157337  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22157338 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 22157437  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22157438 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 22157534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 14030178 - 14030472
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14030178 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 14030277  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14030278 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 14030377  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14030378 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14030472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 14040731 - 14041025
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14040731 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 14040830  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14040831 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 14040930  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14040931 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14041025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15993455 - 15993161
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15993455 tacctccactaatctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 15993356  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15993355 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 15993256  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15993255 cacggctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 15993161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27052962 - 27052668
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27052962 taccaccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 27052863  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27052862 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 27052763  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27052762 cacgcctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27052668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 27460295 - 27460589
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27460295 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 27460394  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27460395 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 27460494  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27460495 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27460589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 27470694 - 27470988
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27470694 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 27470793  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27470794 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 27470893  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27470894 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27470988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39491076 - 39490782
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39491076 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 39490977  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39490976 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 39490877  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39490876 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 39490782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39502266 - 39501972
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39502266 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 39502167  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39502166 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 39502067  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39502066 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 39501972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5301278 - 5300979
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaag-----acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagc 94  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||     |||||||| ||||| ||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  5301278 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaagacaacagccatgccagcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagc 5301179  T
Q  95 taattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtc 194  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5301178 ttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtc 5301079  T
Q  195 tctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5301078 tctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 5300979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 23362244 - 23362539
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23362244 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 23362343  T
Q  100 cttcaaa-ggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23362344 cttcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 23362443  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23362444 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 23362539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6975942 - 6976236
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6975942 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 6976041  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6976042 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 6976141  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6976142 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 6976236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6986432 - 6986726
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6986432 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 6986531  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6986532 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 6986631  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6986632 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 6986726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 22676250 - 22676544
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22676250 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 22676349  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22676350 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 22676449  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22676450 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattcaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 22676544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 22686141 - 22686435
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  22686141 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 22686240  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22686241 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 22686340  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22686341 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattcaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 22686435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 24808047 - 24808340
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24808047 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 24808145  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24808146 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24808245  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24808246 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagatatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24808340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27042338 - 27042044
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  27042338 taccaccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 27042239  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27042238 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 27042139  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27042138 cacgcctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgcgaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27042044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17607195 - 17607487
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  17607195 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 17607294  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17607295 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 17607394  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17607395 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat--ttgatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17607487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40514116 - 40513821
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  40514116 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 40514017  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40514016 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 40513917  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40513916 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40513821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9336090 - 9336383
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9336090 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 9336188  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9336189 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9336288  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9336289 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataacatatagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9336383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9346677 - 9346970
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9346677 tacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 9346775  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9346776 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9346875  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346876 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataacatatagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9346970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 37406786 - 37407074
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 103  Q
    |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  37406786 ctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagttatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgagaattaatttgaagctaattcttc 37406884  T
Q  104 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacg 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| |  | || |||||||||||||||||    
T  37406885 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgttattcatctcaacgtctctttcacg 37406983  T
Q  204 cctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37406984 cctctatataagggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 37407074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14447126 - 14446833
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  14447126 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 14447027  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14447026 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 14446927  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14446926 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aagatagagatacacaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14446833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14457738 - 14457445
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  14457738 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 14457639  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14457638 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 14457539  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14457538 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aagatagagatacacaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14457445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 34062755 - 34063048
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34062755 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagttgggaatgaatttgaagctaattc 34062853  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  34062854 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttc 34062952  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag--atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34062953 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaataaagatagagtcatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 34063048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 15740101 - 15740396
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  15740101 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 15740200  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15740201 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 15740300  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15740301 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattcaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 15740396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 15769261 - 15769556
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  15769261 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 15769360  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15769361 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 15769460  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15769461 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattcaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 15769556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 31348669 - 31348961
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  31348669 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 31348768  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31348769 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 31348868  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31348869 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat--tagatagatatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttaattctacaaag 31348961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 31359283 - 31359575
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  31359283 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 31359382  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31359383 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 31359482  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31359483 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat--tagatagatatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttaattctacaaag 31359575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 294
Target Start/End: Original strand, 31833641 - 31833911
Alignment:
Q  26 acgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 125  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833641 acgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcagg 31833740  T
Q  126 caaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaaga 225  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833741 caaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaaga 31833840  T
Q  226 cttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31833841 cttgaagattgtagagacagatatacataagttcaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaag 31833911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9377588 - 9377294
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9377588 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 9377489  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9377488 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9377389  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9377388 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 9377294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14558143 - 14557849
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14558143 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 14558044  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14558043 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 14557944  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14557943 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttgagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14557849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14568780 - 14568486
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  14568780 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 14568681  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14568680 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 14568581  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14568580 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttgagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 14568486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24817012 - 24816718
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24817012 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 24816913  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24816912 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24816813  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24816812 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 24816718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24827600 - 24827306
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24827600 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 24827501  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24827500 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24827401  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24827400 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 24827306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17617809 - 17618102
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  17617809 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 17617908  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17617909 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 17618008  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcg-ccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17618009 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat--ttgatagagatacacaagttcaaaagcgaccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17618102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17719052 - 17719345
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17719052 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 17719151  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17719152 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 17719251  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17719252 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatttt--atagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17719345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17729704 - 17729997
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  17729704 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 17729803  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17729804 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 17729903  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17729904 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatttt--atagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17729997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36687830 - 36688122
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  36687830 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 36687929  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36687930 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36688029  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36688030 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat--ttgatagagaaaaataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36688122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36698396 - 36698688
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  36698396 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 36698495  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36698496 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36698595  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36698596 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat--ttgatagagaaaaataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36698688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15694157 - 15693864
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  15694157 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 15694059  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15694058 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 15693959  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15693958 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataatatagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 15693864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 23707577 - 23707870
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  23707577 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 23707675  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23707676 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 23707775  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707776 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataaaagagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 23707870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 24567224 - 24567517
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  24567224 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 24567322  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24567323 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24567422  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24567423 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataatatagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 24567517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 34052094 - 34052387
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  34052094 tacctccactagtctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagttggaaatgaatttgaagctaattc 34052192  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||    
T  34052193 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctattcatctcaacgtctctttc 34052291  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag--atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34052292 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaataaagatagagtcatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 34052387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33951927 - 33951632
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  33951927 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcccgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 33951828  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33951827 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 33951728  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33951727 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 33951632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 35215639 - 35215934
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35215639 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 35215738  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35215739 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 35215838  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35215839 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaaaagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 35215934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 35226223 - 35226518
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35226223 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 35226322  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35226323 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 35226422  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35226423 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaaaagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 35226518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 70 - 294
Target Start/End: Original strand, 39364685 - 39364909
Alignment:
Q  70 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctt 169  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  39364685 ttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctt 39364784  T
Q  170 tagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaa 269  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||| | ||||||||||||||||||    
T  39364785 tagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacgcctctatataaagaagtgaagacttgaagattgtagaaagggatacataagttcaaaagcgccaaa 39364884  T
Q  270 actctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  39364885 actctgtcaatttgattctacaaag 39364909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20562475 - 20562752
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||               |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20562475 tacctccactactctgtttt-gtccatgctacaagacaagacaacagctatgcc---------------ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 20562558  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  20562559 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaatgatttcaaacaactctttagacttgctaatcatctcaacgtctctttc 20562658  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20562659 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 20562752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 42042919 - 42043212
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  42042919 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 42043017  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42043018 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 42043117  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | | | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42043118 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataaaagagaaaaatacataagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 42043212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 42053494 - 42053787
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  42053494 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 42053592  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  42053593 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 42053692  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | | | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42053693 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataaaagagaaaaatacataagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 42053787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30227623 - 30227328
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  30227623 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 30227525  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30227524 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 30227425  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagtt--caaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30227424 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataaaagagagaaatacataagttaaaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 30227328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30238150 - 30237855
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  30238150 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 30238052  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  30238051 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 30237952  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagtt--caaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30237951 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataaaagagagaaatacataagttaaaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 30237855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37729378 - 37729084
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37729378 tacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 37729279  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  37729278 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctga-tctctcaacgtctctt 37729180  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagaga--tatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37729179 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat--tacatagagaagtacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 37729084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 176; E-Value: 8e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37740694 - 37740400
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37740694 tacctccactattctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 37740595  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||    
T  37740594 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctga-tctctcaacgtctctt 37740496  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagaga--tatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37740495 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat--tacatagagaagtacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 37740400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20624899 - 20625193
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  20624899 tacctccaccactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaacagctatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgagaatgaatttgaagttgattc 20624997  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||    
T  20624998 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaaatctcaacgtctcttt 20625096  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  20625097 cacacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 20625193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 106253 - 106547
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  106253 tacctccactactctgtttttttctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgtagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcc 106351  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  |  || |||||||||||||    
T  106352 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaaatctcaacgtctcttt 106450  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||   | ||| ||  | |||||||  ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  106451 cacacctctatataaaggagtggagacttgaagattggtaagagacattaacacaagtt-gaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 106547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 71 - 294
Target Start/End: Original strand, 23696988 - 23697212
Alignment:
Q  71 tcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaa-ggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctt 169  Q
    |||||||||||| |||||||||| |  ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||    
T  23696988 tcaagatgggaaggaatttgaaggtttttctttaaaaggactccacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattcaaaacgactctt 23697087  T
Q  170 tagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaa 269  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | ||||||||||||||||||    
T  23697088 tagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataaaagagagaaatacataagttcaaaagcgccaaa 23697187  T
Q  270 actctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  23697188 actctgtcaatttgattctacaaag 23697212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 43621985 - 43621853
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621985 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 43621887  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatt 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43621886 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatt 43621853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32754071 - 32753845
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  32754071 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatcc 32753973  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt- 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| |||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||     
T  32753972 ttcataggactacacccaaatcaggaaaaagattaatggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctcttta 32753874  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||    
T  32753873 ctcacctctatataaaggagtgaagactt 32753845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 289
Target Start/End: Original strand, 20417036 - 20417326
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | || |    
T  20417036 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagagaggaatgaatttgaagttgatcc 20417134  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| ||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  20417135 ttcataggactacatctaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 20417233  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattcta 289  Q
    | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  20417234 ctcactactatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagatatcaacacaagttaaaaagcgccaaaactctgccaaatttgattcta 20417326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #103
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13533917 - 13533705
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  13533917 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 13533819  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||| | ||| || |||||||| | ||    
T  13533818 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaagatcgcaacgtctctctacacaccactatataaggaag 13533720  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  13533719 tgaagacttgaagat 13533705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #104
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 21414324 - 21414191
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  21414324 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcc 21414226  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatta 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21414225 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatta 21414191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #105
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 23372646 - 23372848
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatat-gtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| || |||||||| ||||||  | ||| | || |  ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  23372646 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagaaaaaacaacagccatgcctcaaaaattttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 23372745  T
Q  99 tcttcaaa-ggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct 197  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  23372746 tcttcaaaaggactacccccaaatcaggcaaaggaacactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgggctgattatctcaacgtctct 23372845  T
Q  198 ttc 200  Q
    |||    
T  23372846 ttc 23372848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #106
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 35543281 - 35543493
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  35543281 tgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagatatgaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 35543379  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  35543380 tcaggcaaaagattacttgtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagatctcaacgtctctctactcacctctatataaaggag 35543478  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  35543479 tgaagacttgaagat 35543493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #107
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13523190 - 13522978
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||| |||||||||||||||    
T  13523190 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatctttcataggactacacccaaa 13523092  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | ||| || |||||||| | ||    
T  13523091 tcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctctctacacaccactatataaggaag 13522993  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  13522992 tgaagacttgaagat 13522978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #108
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 20168219 - 20168431
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||    
T  20168219 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccctcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaa 20168317  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | |     
T  20168318 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctctctacacacctctatataaggaaa 20168416  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  20168417 tgaagacttgaagat 20168431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #109
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 36095805 - 36096016
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  36095805 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacatccaaa 36095903  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||    
T  36095904 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg-tctc-aacgaatctttagacgtgcttaagatctcaacgtctctctacacacctctatataaggaag 36096001  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  36096002 tgaagacttgaagat 36096016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #110
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 36097262 - 36097473
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| |||||    
T  36097262 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcaaaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttcataggactacatccaaa 36097360  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || ||||| |||||||||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||    
T  36097361 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagg-tctc-aacgaatctttagacgtgcttaagatctcaacgtctctctacacacctctatataaggaag 36097458  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  36097459 tgaagacttgaagat 36097473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #111
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 168 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43621853 - 43621727
Alignment:
Q  168 tttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgcca 267  Q
    |||||||||||  || || |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  43621853 tttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttcacacctctatataaaggattgaagacttgaagattgtagatagaaatacacaagttaaaaagcgcca 43621754  T
Q  268 aaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  43621753 aaactctgtcaatttgattctacaaag 43621727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #112
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23478386 - 23478157
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||    
T  23478386 tccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgtagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaatgtgatccttc 23478288  T
Q  104 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctttca 201  Q
      ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||||||    
T  23478287 ttaggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctttca 23478190  T
Q  202 cgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23478189 cacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 23478157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #113
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 11208101 - 11208334
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||  ||||| |||||||  |||||    
T  11208101 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaaaataagaatggatttgaacttaatt 11208199  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatt-tcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||  || | |||||  ||| | |||| ||   ||||||||| | |||||||| |   || |||||| |||||    
T  11208200 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaaaatcattggtgattga-tcaaggcttcagaacgactctattgacgtgcttaaagttctcaacgactctt 11208298  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11208299 tcacacctctatataaaggagtgaagacgtgaagat 11208334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #114
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1915438 - 1915206
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  1915438 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacaactctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatcc 1915340  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||| |    
T  1915339 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctat 1915241  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1915240 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 1915206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #115
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 40032882 - 40033115
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  40032882 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcttgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatcc 40032980  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || |||||||||||||    
T  40032981 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctcttt 40033079  T
Q  200 -cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40033080 acacacatctatataaaggagtgaagacttgaagat 40033115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #116
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 13405137 - 13404906
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||  | || |    
T  13405137 tacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatcc 13405039  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||  |||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||||  |  || ||||||||||| |    
T  13405038 ttcattggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttt-gacgtgctaaaagatctcaacgtctctct 13404941  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13404940 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 13404906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #117
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20215232 - 20215465
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  20215232 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatc 20215330  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   | || || |  | ||||| |||||| | ||||||| | |  || |||||||||||     
T  20215331 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttaatcaaggtttctcaaa-gactctattgacgtgcttaaagatctcaacgtctctc 20215429  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20215430 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 20215465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #118
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 25111994 - 25112227
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  25111994 tacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatc 25112092  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  25112093 cttcataagacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgactct 25112190  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25112191 ttcacatctctttataaaggagtgaagacttgaagat 25112227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #119
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 25171085 - 25171318
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  25171085 tacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatc 25171183  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  25171184 cttcataagacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgactct 25171281  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25171282 ttcacatctctttataaaggagtgaagacttgaagat 25171318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #120
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40228680 - 40228447
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||  |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  40228680 tacctccatgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatcc 40228582  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||| |    
T  40228581 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagaccattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctct 40228483  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40228482 acacatctctatataaaggagtgaagacttgaagat 40228447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #121
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 32160787 - 32160554
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||||| ||||||||||| |||| || | |  || |||||| |||||||  | ||     
T  32160787 tacctccactactctgtttatgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcccttagaataggaatggatttgaacttgatc 32160689  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||| | |  ||  ||||| ||||    
T  32160688 cttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--gttttcagaacgactctattgacgtgcttaaagatcgcaacgactct 32160591  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32160590 ttcacacctctatataaaggagtgaagacttaaagat 32160554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #122
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 23392851 - 23392901
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 52  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23392851 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatg 23392901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #123
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Original strand, 39799179 - 39799230
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39799179 tcaacgtatctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 39799230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #124
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 26120132 - 26120182
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120132 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 26120182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #125
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 39362448 - 39362510
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 62  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  39362448 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat 39362510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #126
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Original strand, 22586300 - 22586348
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22586300 tcaacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagacttgaagatt 22586348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #127
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10848610 - 10848567
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10848610 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 10848567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #128
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 31145935 - 31145978
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31145935 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 31145978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #129
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Original strand, 31589302 - 31589353
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31589302 tcaacgtatctttcacacctctatataaaggagtgatgacttgaagattgta 31589353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #130
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15516804 - 15516762
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15516804 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 15516762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #131
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 3245743 - 3245784
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3245743 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 3245784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #132
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 229
Target Start/End: Original strand, 25097131 - 25097172
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25097131 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttg 25097172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #133
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 229
Target Start/End: Original strand, 25155101 - 25155142
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25155101 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttg 25155142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #134
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 25930457 - 25930498
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25930457 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 25930498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #135
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 28139442 - 28139401
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28139442 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 28139401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #136
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 28464640 - 28464681
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28464640 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 28464681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #137
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 89726 - 89766
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  89726 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 89766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #138
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 13736437 - 13736477
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13736437 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 13736477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #139
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20550727 - 20550687
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20550727 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 20550687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #140
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 21100008 - 21100048
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21100008 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 21100048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #141
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 21199306 - 21199346
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21199306 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 21199346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #142
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 23413279 - 23413319
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23413279 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 23413319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #143
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 23488483 - 23488303
Alignment:
Q  53 cctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaag 152  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||| | ||| | |||||  |||| || |    
T  23488483 cctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatccttcataggacaacaaccaaatcaggcagaagatcattggtgattgatcaagg 23488385  T
Q  153 gatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
      ||||| ||||||||| | |||||||| |   || ||||||  |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23488384 --tttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgaatctttcacacttctatataaaggagtgaagacttgaagat 23488303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #144
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6499072 - 6499033
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6499072 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 6499033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #145
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 25740956 - 25740917
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25740956 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 25740917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #146
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 223
Target Start/End: Original strand, 35932306 - 35932345
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaa 223  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35932306 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaa 35932345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #147
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 228
Target Start/End: Original strand, 19536604 - 19536642
Alignment:
Q  190 acgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19536604 acgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 19536642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #148
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 20567645 - 20567595
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  20567645 caacatctctttcacacctctatataaagcagtaaagacttgaagattgta 20567595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #149
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 11993723 - 11993682
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11993723 ttcaacgtctctctcacacctctatataaaggagtgaagact 11993682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #150
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 29138708 - 29138749
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  29138708 ttcaacgtctctttcacacctctatataaatgagtgaagact 29138749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #151
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30742816 - 30742775
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30742816 ttcaacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 30742775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #152
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 643006 - 643046
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  643006 caacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaagactt 643046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #153
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 235
Target Start/End: Original strand, 2156591 - 2156627
Alignment:
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2156591 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 2156627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #154
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 7745997 - 7746037
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  7745997 caacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaagactt 7746037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #155
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 22000361 - 22000401
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22000361 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 22000401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #156
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 190 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23589544 - 23589496
Alignment:
Q  190 acgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||| |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23589544 acgtatctttcacacctctatataaatgagcgaagacttgaagattgta 23589496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #157
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23880900 - 23880860
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  23880900 caacgtctctttcacagctctatataaaggagtgaagactt 23880860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #158
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 24019450 - 24019402
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  24019450 tcaacgtctctttcacacctttatttaaaggagtgaagacctgaagatt 24019402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #159
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33022500 - 33022460
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  33022500 caacgtctctttcacacctctatttaaaggagtgaagactt 33022460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #160
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 227
Target Start/End: Original strand, 12353103 - 12353138
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12353103 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 12353138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #161
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Original strand, 13545816 - 13545855
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  13545816 caacgtctctttcaaacctctatataaaggagtgaagact 13545855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #162
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31488081 - 31488042
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31488081 caacgtctctttcacacctctataaaaaggagtgaagact 31488042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #163
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 204 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 34638272 - 34638241
Alignment:
Q  204 cctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34638272 cctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 34638241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #164
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4886857 - 4886815
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||    
T  4886857 ttcaacgtctctctgacacctctatataaaggagtgaagactt 4886815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #165
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 4887043 - 4886985
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  4887043 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 4886985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #166
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 33933288 - 33933230
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  33933288 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 33933230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #167
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 9088804 - 9088767
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaa 223  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  9088804 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaa 9088767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #168
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 14086840 - 14086881
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  14086840 ttcaacgtctctttcacacatctatataaagaagtgaagact 14086881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #169
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 232
Target Start/End: Original strand, 17263032 - 17263077
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaag 232  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||| || |||||||||    
T  17263032 tcaacgtctctttcacacatctatataaaggagcgatgacttgaag 17263077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #170
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 21072541 - 21072582
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctc-tatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21072541 caacgtctctttcacacctcctatataaaggagtgaagactt 21072582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #171
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33933103 - 33933062
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||    
T  33933103 ttcaacgtctctctcacacctctatataaatgagtgaagact 33933062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #172
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42243516 - 42243475
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  42243516 ttcaacgtctctatcacacctttatataaaggagtgaagact 42243475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #173
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 14086655 - 14086695
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14086655 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 14086695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #174
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 20550916 - 20550876
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  20550916 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 20550876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #175
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 21203949 - 21203989
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||    
T  21203949 caacgtctctttcacacatctatataatggagtgaagactt 21203989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #176
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26784186 - 26784146
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||    
T  26784186 caacgtctctttcacacctctgtataagggagtgaagactt 26784146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #177
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31117710 - 31117670
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  31117710 caacgtccctttcacacctctatataaagaagtgaagactt 31117670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 154)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Original strand, 14745767 - 14746057
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14745767 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccctcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttc 14745866  T
Q  104 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacg 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14745867 aaaggagtacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacg 14745966  T
Q  204 cctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14745967 cctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 14746057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1367834 - 1367542
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367834 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 1367736  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1367735 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 1367636  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1367635 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 1367542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 589417 - 589125
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  589417 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctaggcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 589319  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  589318 ttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggatcactggtgattgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 589219  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  589218 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 589125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 15888424 - 15888716
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15888424 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 15888522  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15888523 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 15888622  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15888623 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatagtagatagagacacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 15888716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20491211 - 20490919
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20491211 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgccttcaagatgagaatgaatttgaagctaattc 20491113  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20491112 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 20491013  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20491012 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtgcagtgagacatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 20490919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 31116606 - 31116898
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116606 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 31116705  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  31116706 ttcaaaggactacacccaaatcaagcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 31116804  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31116805 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagagatacactagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 31116898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6867320 - 6867614
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6867320 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 6867419  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6867420 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagaatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 6867519  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6867520 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 6867614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20989858 - 20989564
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  20989858 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 20989759  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20989758 cttcaaaggactgcacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 20989659  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20989658 cacacctctatataaaggtgtgaagacttgaagattgaatatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 20989564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 21770038 - 21770330
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770038 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 21770136  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  21770137 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttc 21770236  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21770237 acacctctatataaaggagtaaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 21770330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6877952 - 6878246
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  6877952 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacattcaagttgggaatgaatttgaagcttatt 6878051  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6878052 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagaatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 6878151  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6878152 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 6878246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3165939 - 3165647
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3165939 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacaggtatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattc 3165841  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3165840 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 3165741  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3165740 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagacatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 3165647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9433469 - 9433175
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9433469 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 9433370  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9433369 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9433270  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9433269 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9433175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 21003103 - 21003397
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21003103 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttctaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 21003202  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21003203 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaatggatttcaaacgaatctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 21003302  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21003303 cacacctctatataaaggtgtgaagacttgaagattgaatatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 21003397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 167087 - 166793
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  167087 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 166988  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  166987 cttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 166888  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166887 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 166793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 177679 - 177385
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  177679 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 177580  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  177579 cttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 177480  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  177479 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 177385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5685724 - 5685430
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5685724 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 5685625  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5685624 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5685525  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5685524 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatatgagatagagatatacaagttcaaaagcaccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 5685430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8617591 - 8617297
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8617591 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 8617492  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8617491 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 8617392  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8617391 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 8617297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8628154 - 8627860
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8628154 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 8628055  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  8628054 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 8627955  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8627954 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 8627860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 24930698 - 24930992
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24930698 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 24930797  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24930798 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24930897  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24930898 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24930992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 48710586 - 48710880
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  48710586 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 48710685  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  48710686 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 48710785  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48710786 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 48710880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44280701 - 44280407
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  44280701 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattc 44280603  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  44280602 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 44280503  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag--atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44280502 acgcctctatataaaggagtgaagaattgaagattgaagagagagacatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 44280407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 541290 - 540996
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  541290 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 541191  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  541190 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 541091  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  541090 tacgcctctatataaaggtgtgaagacttgaagattgcagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgaatctacaaag 540996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 2705707 - 2706001
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2705707 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 2705806  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2705807 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 2705906  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2705907 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagaggtacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 2706001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 2716311 - 2716605
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  2716311 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgagaatgaatttgaagcttatt 2716410  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2716411 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 2716510  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2716511 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagaggtacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 2716605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9444065 - 9443771
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9444065 tacctccactactctgtgttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 9443966  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9443965 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9443866  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9443865 cacacctttatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9443771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9171190 - 9170899
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9171190 tacctccactactctgttct-gtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 9171092  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  9171091 ttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacatgctaatcatctcaacgtctctttc 9170992  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9170991 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattg-aaagagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9170899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 467676 - 467970
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  467676 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 467775  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  467776 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 467875  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  467876 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaaaatagagatacataagttcaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 467970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17950213 - 17950507
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17950213 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 17950312  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  17950313 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatcgcaacgtctcttt 17950412  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17950413 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17950507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17960819 - 17961113
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17960819 tacctccactactctgttttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 17960918  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17960919 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 17961018  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17961019 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17961113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22089328 - 22089034
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||  ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22089328 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacagtcatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 22089229  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22089228 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 22089129  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22089128 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattatagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 22089034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22099943 - 22099649
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22099943 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacgacaaccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 22099844  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22099843 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 22099744  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22099743 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattatagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 22099649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 26294124 - 26294418
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26294124 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 26294223  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26294224 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgtataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 26294323  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26294324 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 26294418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 26699749 - 26700043
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26699749 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 26699848  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26699849 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 26699948  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26699949 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatatataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 26700043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4222815 - 4222519
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4222815 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 4222716  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4222715 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 4222616  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222615 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattacatatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 4222519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 454894 - 455188
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  454894 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 454993  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  454994 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatcttaacgtctcttt 455093  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  455094 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaaaatagagatacataagttcaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 455188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 26653420 - 26653714
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26653420 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgttcactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 26653519  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26653520 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 26653619  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||   | ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26653620 cacgcctctatataaagaagtgaagacttgaagataaaagatagagatatataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 26653714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 30049724 - 30049432
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049724 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaa-atgttcattcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 30049626  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  30049625 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 30049527  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30049526 cacgcttctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 30049432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Original strand, 40054849 - 40055137
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40054849 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacaaccatgcctgcataa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagctaattc 40054947  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  40054948 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 40055046  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaca 291  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40055047 acacctctatataagggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaca 40055137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4212216 - 4211920
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  4212216 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatggaaatgaatttgaagcttatt 4212117  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4212116 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 4212017  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4212016 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattacatatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 4211920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9159934 - 9159643
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9159934 tacctccactactctgttct-gtctacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttaaagctaattc 9159836  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  9159835 ttaaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 9159736  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9159735 acacctctatataaaggagtgacgacttgaagattg-aaagagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9159643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9170389 - 9170098
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9170389 tacctccactactctgttct-gtctacgctacaagacaanacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttnaagctaattc 9170291  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||    
T  9170290 ttaaaaggactacacccaaatcaggcaaangattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacntgctaatcatctcaacgtctctttc 9170191  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9170190 acacctctatataaaggagtgacgacttgaagattg-aaagagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9170098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11005390 - 11005096
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11005390 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 11005291  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11005290 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 11005191  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11005190 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 11005096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9085488 - 9085195
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9085488 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 9085390  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9085389 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9085290  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9085289 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataacagagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9085195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9095202 - 9094909
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9095202 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 9095104  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9095103 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9095004  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9095003 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataacagagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9094909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 37344405 - 37344111
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37344405 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 37344306  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37344305 cttcaaaagactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 37344206  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||  |||||||||| ||||||||||||||||   | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37344205 cacgcccttatataaaggtgtgaagacttgaagataaaagagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 37344111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24734958 - 24734664
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24734958 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 24734859  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24734858 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24734759  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24734758 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24734664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 24744905 - 24744611
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  24744905 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 24744806  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24744805 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 24744706  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24744705 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24744611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 26390191 - 26390485
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26390191 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 26390290  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26390291 cttcaaaggactacacccaattcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 26390390  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26390391 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttcagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 26390485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 26400833 - 26401127
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26400833 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 26400932  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26400933 cttcaaaggactacacccaattcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 26401032  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26401033 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttcagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 26401127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 11096260 - 11095965
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11096260 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 11096161  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11096160 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 11096061  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaa-tttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11096060 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagtgagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaattttgattctacaaag 11095965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 40042204 - 40042497
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  40042204 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 40042302  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40042303 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 40042402  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40042403 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataatatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40042497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 40052753 - 40053046
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  40052753 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 40052851  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40052852 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 40052951  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40052952 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataatatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40053046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 8002159 - 8002454
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8002159 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttgat 8002258  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8002259 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 8002358  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8002359 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 8002454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 8012804 - 8013099
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8012804 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttgat 8012903  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8012904 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 8013003  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8013004 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 8013099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1987746 - 1987451
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1987746 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 1987647  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1987646 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 1987547  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatata--caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1987546 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaataggaatatacgcaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 1987451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 1998367 - 1998072
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  1998367 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 1998268  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1998267 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 1998168  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatata--caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1998167 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaataggaatatacgcaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 1998072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42866033 - 42865738
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  42866033 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 42865934  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42865933 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 42865834  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatata--caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42865833 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaataggaatatacgcaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 42865738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 42876659 - 42876364
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  42876659 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 42876560  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  42876559 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 42876460  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatata--caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42876459 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaataggaatatacgcaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 42876364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18441401 - 18441107
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18441401 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 18441303  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  18441302 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 18441203  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18441202 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggcaagagaaatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 18441107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18419320 - 18419026
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  18419320 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctcttcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 18419222  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  18419221 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 18419122  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18419121 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggcaagagaaatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 18419026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 29 - 294
Target Start/End: Original strand, 38403331 - 38403599
Alignment:
Q  29 ctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38403331 ctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 38403429  T
Q  129 aggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38403430 aagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaggactt 38403528  T
Q  229 gaagattgtacatagagatat----acaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||  | | ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  38403529 gaagattaaaaaaagagatatcaacacaagttaaaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 38403599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 3476435 - 3476668
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  3476435 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatcc 3476533  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt- 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||     
T  3476534 ttcacaggactacacccaaatcaggcaaaggattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctcttta 3476632  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3476633 ctcacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 3476668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 19985908 - 19986054
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19985908 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagataattc 19986007  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgat 147  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19986008 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgat 19986054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 26209643 - 26209937
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  26209643 tacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 26209741  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  26209742 ttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 26209840  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | ||||||||||||||||| |||| |||||||||| | | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26209841 ctcacctctatataaaggagtaaagatttgaagattggaaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctataaag 26209937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29590198 - 29589904
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  29590198 taccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 29590100  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  29590099 ttcatatgactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 29590001  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga-ttgtacatagagatat----acaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaa 293  Q
    | | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||    
T  29590000 ctcaccactatataaaggagtgaagacttgaagatttgta---agagatatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaa 29589905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 13682526 - 13682231
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  13682526 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctattcctgcagaa-atgttccttcaaaatgggaatgaatttgaagttaatcc 13682428  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  13682427 ttcacaagactacacccaaatcaggcaaaatattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 13682329  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt-gtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | || |||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  13682328 ctcaccactatttaaaggagtgaagacttgaagattggtagagacagatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctataaag 13682231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 15216522 - 15216228
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||      
T  15216522 tacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatct 15216424  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  15216423 gtcataggactacacccaaatcaggcaatagattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 15216325  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | | | ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  15216324 ctcacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaaaagacaaatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 15216228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12734261 - 12734553
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||| | || |    
T  12734261 tacctccattactctgtttttgtctacgctataagacaagacaacaactctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaataaatttgaagttgatcc 12734359  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||| | |     
T  12734360 ttcataggactacacctaaatcaggcaagagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctttcta 12734458  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    |   || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  ||||||| ||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||    
T  12734459 cttaccactatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacaagtt-aaaagcgccaacactctgccaaatttgattctataaag 12734553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 129 - 287
Target Start/End: Original strand, 38593935 - 38594092
Alignment:
Q  129 aggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38593935 aggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-caactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 38594033  T
Q  229 gaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattc 287  Q
    |||||||| | || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38594034 gaagattgaagattgagatatacaagttaaaaagcgcaaaaactctgtcaatttgattc 38594092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 24882535 - 24882747
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  24882535 tgtcctcgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 24882633  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | |   || |||||||||||||    
T  24882634 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagatctcaacgtctctctactaaccactatataaaggag 24882732  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  24882733 tgaagacttgaagat 24882747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 8933725 - 8933634
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 93  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8933725 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaag 8933634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 48382297 - 48382099
Alignment:
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  || ||||||||||||||| |||| |  || ||||||||||| |    
T  48382297 cttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacatgctaaaaatctcaacgtctctct 48382199  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc---aatttgattctacaaa 293  Q
     | | || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||    
T  48382198 actcaccactatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaaaatttgattctacaaa 48382100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 38593830 - 38593921
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 93  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38593830 taccttcactactctgtttttgtctacgctacaagacaagataacagtcatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 38593921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 8999028 - 8999155
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  8999028 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 8999126  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 129  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  8999127 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 8999155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 602784 - 602553
Alignment:
Q  3 cctccactactctgtt-tttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||  |  ||||| |||||||   |||||    
T  602784 cctccactactctgttctttgtctacgctacaggacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccctcaaattcagaatggatttgaaatcaattc 602686  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgattatttca--acgtctct 197  Q
    |||| ||||||| | |||||||||||||||||| | |||||  |||| || || |   | ||||||||||| ||||| || |  ||||||  ||||||||    
T  602685 ttcataggactatatccaaatcaggcaaaggatcattggtgcttgatcaa-ggctacaacaacgactcttt-gacgtactaacaatttcacaacgtctct 602588  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaag 232  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  602587 ttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaag 602553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 11087138 - 11087371
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||  |||||| || |||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||| ||||| |||||| |||||||  | || |    
T  11087138 tacctccatgactctgcttgtgtctacactacaagacaagataacagctctgcctgcataa-atgttcctttaagataggaatggatttgaacgtgatcc 11087236  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||| |    
T  11087237 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctct 11087335  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11087336 acacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 11087371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8933631 - 8933475
Alignment:
Q  139 gtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt-cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgt 237  Q
    ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | | | || ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8933631 gtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcaccactatataaaggagtgaagacttgaagattgg 8933533  T
Q  238 acatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
      | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  8933532 caagagatatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaatttgattctaaaaag 8933475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 49
Target Start/End: Original strand, 6044306 - 6044354
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagct 49  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6044306 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagct 6044354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 16308041 - 16308091
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16308041 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 16308091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 7488229 - 7488276
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7488229 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 7488276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 19339569 - 19339612
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19339569 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 19339612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 23280098 - 23280324
Alignment:
Q  4 ctccactactctg-tttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattct 101  Q
    ||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||| |||||||  | || ||    
T  23280098 ctccactactctgttttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatcct 23280196  T
Q  102 tcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactc--tttagacgtgctgattatt-tcaacgtctctt 198  Q
    ||| ||||| | | ||| |||||||||| ||| | || ||  |||| ||||  |||||||||||||  ||| || ||||||   |||  |||||||||||    
T  23280197 tcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattgctgattgatcaaag--tttcaaacgactctattttgatgtgctggcaattcacaacgtctctt 23280294  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    | || | |||||||||||||||||||||||    
T  23280295 taacacatctatataaaggagtgaagactt 23280324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 27871554 - 27871511
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27871554 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 27871511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 32265040 - 32265083
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32265040 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 32265083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1292865 - 1292824
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1292865 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 1292824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 2266646 - 2266687
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2266646 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 2266687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 12174663 - 12174704
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12174663 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 12174704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14425282 - 14425241
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14425282 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 14425241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 227
Target Start/End: Original strand, 2265842 - 2265882
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2265842 tcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 2265882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 9098559 - 9098599
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9098559 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 9098599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 9099365 - 9099405
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9099365 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 9099405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11319238 - 11319198
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11319238 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 11319198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11792740 - 11792700
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11792740 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 11792700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 13260940 - 13260980
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13260940 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 13260980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13683428 - 13683388
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13683428 caacgtctctttcactcctctatataaaggagtgaagactt 13683388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24787975 - 24787935
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24787975 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 24787935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 33692037 - 33692077
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33692037 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 33692077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Original strand, 4412287 - 4412334
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4412287 tcaacgactctttctcacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 4412334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 5001151 - 5001190
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5001151 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 5001190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 10254654 - 10254701
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10254654 caacgtctctttcatacctctatataaaggaatgaagacttgaagatt 10254701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 13174699 - 13174932
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || | || || ||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  13174699 tacctccacgactctgattgtctctacactacaagacaagaaaaacagctttgcatgcagaa-atgttacttcaagataggaatggatttgaacgtgatc 13174797  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||| | ||||   |||| || |  | |||| ||||||| | |||||||| |   || |||||| ||||     
T  13174798 cttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattggtatttgatcaaggtttctcaa-cgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctc 13174896  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13174897 tcacacctctatataaaggagagaagacttgaagat 13174932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Original strand, 13472833 - 13472872
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13472833 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 13472872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 223
Target Start/End: Original strand, 41842598 - 41842633
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaa 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41842598 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaa 41842633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 48063141 - 48063184
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48063141 atttcaacgtatctttcacacctctatataaaggagtgaagact 48063184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Original strand, 48237230 - 48237269
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48237230 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 48237269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 48382351 - 48382304
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagacaacag 47  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  48382351 tacctccactactctgttttttgtctacgctacaagacaagacaacag 48382304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 44467085 - 44467027
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44467085 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 44467027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 15704812 - 15704853
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15704812 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtaaagact 15704853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 199 - 236
Target Start/End: Original strand, 16105306 - 16105343
Alignment:
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105306 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 16105343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 237
Target Start/End: Original strand, 18056577 - 18056626
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgt 237  Q
    |||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18056577 caacttctctttcacacgtctatataaaggagtgaagacttggagattgt 18056626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 21381751 - 21381792
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21381751 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtggagact 21381792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2499866 - 2499830
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2499866 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 2499830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4494410 - 4494370
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  4494410 caacgtctctttcacacctctatataaaggagggaagactt 4494370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9069391 - 9069355
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9069391 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 9069355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 236
Target Start/End: Original strand, 13172679 - 13172727
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13172679 caacgtatctctcacacctctatataaaggagtgaagacctgaagattg 13172727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15467750 - 15467710
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15467750 caacgtctttttcacacctctatataaaggagtgaagactt 15467710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 16314865 - 16314905
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16314865 caacgtctctttcacacctctataaaaaggagtgaagactt 16314905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 16316882 - 16316922
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16316882 caacgtctctctcacacctctatataaaggagtgaagactt 16316922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 21283698 - 21283738
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  21283698 caacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaagactt 21283738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #120
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21692121 - 21692081
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  21692121 caacgtctctttcacaccactatataaaggagtgaagactt 21692081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #121
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28408868 - 28408832
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28408868 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 28408832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #122
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30025738 - 30025698
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30025738 caacgtctctttcacacctctatataaagaagtgaagactt 30025698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #123
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33605518 - 33605478
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33605518 caacgtgtctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 33605478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #124
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 33691849 - 33691940
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  33691849 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatggatttgaa 33691940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #125
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 2501363 - 2501410
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  2501363 caacgtctctttcatacctctatataaaggaatgaatacttgaagatt 2501410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #126
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 11015785 - 11015742
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11015785 gtctctttcatacctctatataaaggagtgaagacatgaagatt 11015742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #127
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 12222764 - 12222811
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12222764 caacgtctttttcatgcctctatataaaggaacgaagacttgaagatt 12222811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #128
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 228
Target Start/End: Original strand, 13034169 - 13034204
Alignment:
Q  193 tctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13034169 tctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 13034204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #129
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14426380 - 14426341
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  14426380 caacgtctctttcacacctccatataaaggagtgaagact 14426341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #130
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 227
Target Start/End: Original strand, 16112214 - 16112249
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16112214 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 16112249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #131
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16412569 - 16412522
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16412569 caacgtctctttaattcctctatataaaggaatgaagacttgaagatt 16412522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #132
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Original strand, 28622682 - 28622721
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28622682 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 28622721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #133
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 227
Target Start/End: Original strand, 30945686 - 30945721
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30945686 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 30945721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #134
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 227
Target Start/End: Original strand, 16556915 - 16556953
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16556915 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgtagact 16556953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #135
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16608747 - 16608709
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  16608747 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgtagact 16608709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #136
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 190 - 228
Target Start/End: Original strand, 19237363 - 19237401
Alignment:
Q  190 acgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  19237363 acgtctctttcacatctctatataaaggagtgaagactt 19237401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #137
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 30944460 - 30944518
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  30944460 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 30944518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #138
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 30945493 - 30945551
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  30945493 tacctccactactttgtttttgtctcagctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca 30945551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #139
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8182765 - 8182724
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  8182765 ttcaacatctctttcgcacctctatataaaggagtgaagact 8182724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #140
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 13018834 - 13018867
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaaga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13018834 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaaga 13018867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #141
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 16112024 - 16112112
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  16112024 ctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaggaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcataatgggaatgcatttgaa 16112112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #142
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 229
Target Start/End: Original strand, 16310232 - 16310273
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttg 229  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  16310232 caacgtctctctcacacctctatataaaggagtgatgacttg 16310273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #143
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 192 - 225
Target Start/End: Original strand, 29935675 - 29935708
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaaga 225  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29935675 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaaga 29935708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #144
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 35953010 - 35953051
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  35953010 ttcaatgtctctttcacacctctatataaaggagtaaagact 35953051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #145
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 4821495 - 4821455
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  4821495 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 4821455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #146
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Original strand, 8999213 - 8999261
Alignment:
Q  187 tcaacgtctcttt-cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8999213 tcaacgtctctctacacacctctatataaagaagtgaagacttgaagat 8999261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #147
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 10883498 - 10883538
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  10883498 caacgtctctttcacaactctatataaaggagtgacgactt 10883538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #148
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 12367073 - 12367113
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  12367073 caacgtctatttcacacctctatataaaagagtgaagactt 12367113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #149
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14187524 - 14187484
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14187524 caacatctctttcacacctctatataaaagagtgaagactt 14187484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #150
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15088382 - 15088342
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  15088382 caacgtctctttcacaactctatataaagaagtgaagactt 15088342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #151
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 22579542 - 22579582
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  22579542 caacgtctctttcacaactctatataaaggagtaaagactt 22579582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #152
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 27871739 - 27871699
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  27871739 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 27871699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #153
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 39284889 - 39284929
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||    
T  39284889 caacgtctctttcaaacctctatatataggagtgaagactt 39284929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #154
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 48237039 - 48237130
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 92  Q
    ||||||||||||| ||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||  || |||||| |||||||    
T  48237039 tacctccactactttgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaataggaatgcatttgaa 48237130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 137)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12827863 - 12827570
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827863 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 12827764  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  12827763 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 12827664  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12827663 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12827570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25787871 - 25787579
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787871 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 25787773  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25787772 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 25787673  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25787672 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 25787579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25986252 - 25985959
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  25986252 tacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaataaatttgaagctgattc 25986153  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  25986152 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 25986053  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25986052 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 25985959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 7751261 - 7751554
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  7751261 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccttgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaactc 7751360  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7751361 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggaattcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 7751460  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7751461 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 7751554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 11147275 - 11147568
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147275 tacctccactactctatttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 11147374  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  11147375 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaatgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 11147474  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11147475 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagtgatacataagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 11147568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27506114 - 27505819
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27506114 tacctccactactctgtttttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttat 27506015  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27506014 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 27505915  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27505914 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatagaagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 27505819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 28251591 - 28251882
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28251591 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattc 28251689  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28251690 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg-atgatttaaggaattcaaacgactctttagacatgctgattatctcaacgtctctttc 28251788  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28251789 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatagtagacagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 28251882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 28356738 - 28357029
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28356738 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattc 28356836  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  28356837 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg-atgatttaaggaattcaaacgactctttagacatgctgattatctcaacgtctctttc 28356935  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  28356936 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatagtagacagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 28357029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27373004 - 27372709
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27373004 tacctccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttat 27372905  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27372904 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 27372805  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27372804 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatagaagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 27372709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27463354 - 27463059
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt--gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27463354 tacctccactactctgtttttttgtctacactacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcttat 27463255  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27463254 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 27463155  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27463154 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatagaagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 27463059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20029930 - 20030222
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20029930 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 20030028  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  20030029 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttc 20030128  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20030129 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatgtacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 20030222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9123157 - 9123451
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9123157 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 9123256  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9123257 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaaagactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9123356  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9123357 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 9123451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 7375784 - 7376076
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7375784 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgccagcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 7375882  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  7375883 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 7375982  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7375983 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagaaagatatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 7376076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20062681 - 20062973
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062681 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 20062779  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || || |||| |||||||||    
T  20062780 ttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaatgtctctttc 20062879  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20062880 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaag 20062973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9112520 - 9112814
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9112520 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcaaaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 9112619  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9112620 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaaagactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9112719  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9112720 cacgcctctatataaaagagtgaagacttgaagataaaagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 9112814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27475016 - 27474723
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27475016 tacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgattttgaagctaactc 27474917  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27474916 ttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgataatctcaacgtctctttc 27474817  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27474816 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 27474723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27504515 - 27504222
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27504515 tacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgattttgaagctaactc 27504416  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  27504415 ttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgataatctcaacgtctctttc 27504316  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27504315 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 27504222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26044383 - 26044089
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  26044383 tacctccactactctgcttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatcc 26044285  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26044284 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 26044185  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacat--agagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26044184 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 26044089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12855192 - 12854898
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12855192 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 12855093  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12855092 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 12854993  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12854992 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattatagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12854898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12865718 - 12865424
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12865718 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 12865619  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12865618 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 12865519  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12865518 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattatagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12865424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33199499 - 33199205
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||| |||    
T  33199499 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacattcaagataggaatgaatttgaagcttatt 33199400  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33199399 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 33199300  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33199299 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattggagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 33199205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27384603 - 27384310
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  27384603 tacctccattactctgtttttgtcttcgctacaagacaaaacaacagccttgcctgcagaatgtgcgccttcaagatgggaatgattttgaagctaactc 27384504  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  27384503 ttcaaaggactacacccatatcaggcaaaggatcactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgataatctcaacatctctttc 27384404  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27384403 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 27384310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 31982651 - 31982945
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  31982651 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 31982750  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31982751 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 31982850  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31982851 cacgcctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 31982945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 34807185 - 34807479
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34807185 tacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 34807284  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34807285 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 34807384  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34807385 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaatatagagatacataagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 34807479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 34817817 - 34818111
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34817817 tacctccactactctgttttctatctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 34817916  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34817917 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 34818016  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34818017 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaatatagagatacataagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 34818111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3661553 - 3661260
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3661553 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 3661455  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3661454 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 3661355  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3661354 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaatatagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 3661260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26025630 - 26025336
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26025630 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 26025531  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26025530 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 26025431  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26025430 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 26025336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26036204 - 26035910
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  26036204 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 26036105  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26036104 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 26036005  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26036004 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 26035910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27341865 - 27341571
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  27341865 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 27341766  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27341765 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 27341666  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27341665 cacgcctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27341571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27402605 - 27402311
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  27402605 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 27402506  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27402505 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 27402406  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27402405 cacgcctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27402311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27413264 - 27412970
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  27413264 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 27413165  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27413164 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 27413065  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27413064 cacgcctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27412970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3672217 - 3671924
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3672217 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 3672119  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3672118 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 3672019  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3672018 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaatatagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 3671924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29384922 - 29384629
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  29384922 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 29384824  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29384823 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 29384724  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29384723 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 29384629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18925788 - 18926082
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18925788 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 18925886  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  18925887 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 18925985  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag--atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18925986 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagagatatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattccacaaag 18926082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 31542923 - 31543215
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31542923 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 31543022  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31543023 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 31543122  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | ||| ||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31543123 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga--caagagagacatgcataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 31543215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26864959 - 26864663
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26864959 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagattttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 26864860  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26864859 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 26864760  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgt--acatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26864759 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgagtctacaaag 26864663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26875583 - 26875287
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26875583 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagattttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 26875484  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26875483 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggatattcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 26875384  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgt--acatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26875383 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgagtctacaaag 26875287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 32301068 - 32301362
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  32301068 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 32301167  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32301168 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 32301267  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32301268 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgatagagacatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 32301362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 32311757 - 32312051
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  32311757 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 32311856  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32311857 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 32311956  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32311957 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgatagagacatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 32312051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 5845254 - 5844964
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  5845254 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagga-atgttcattcaagatgggaatgaatttgaagccgattc 5845156  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  5845155 ttcaaaggactgcacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 5845057  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaa 293  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5845056 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagataaaaaaaataaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaa 5844964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 16123563 - 16123852
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| || || |||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16123563 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatccatgccttcataa-atgttccttcaagattgtaatgaatttgaagctaattc 16123661  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16123662 ttcaaaggactacacccaaatcagtcaaagtattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 16123760  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16123761 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatat--aagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 16123852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16930621 - 16930328
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16930621 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 16930523  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16930522 cttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 16930423  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16930422 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttatatagatatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 16930328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16959792 - 16959499
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  16959792 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 16959694  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16959693 cttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 16959594  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16959593 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttatatagatatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 16959499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17984735 - 17985029
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17984735 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 17984834  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17984835 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 17984934  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |   ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17984935 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataaaagtgagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17985029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12716859 - 12717155
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12716859 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 12716958  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12716959 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 12717058  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga-ttgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12717059 tcacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttgaagatagagatacacaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12717155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12727508 - 12727804
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  12727508 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 12727607  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12727608 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 12727707  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga-ttgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12727708 tcacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttgaagatagagatacacaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12727804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17982526 - 17982820
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  17982526 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 17982625  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17982626 cttcagaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 17982725  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   |   ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17982726 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataaaagtgagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17982820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4631044 - 4630748
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  4631044 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 4630945  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4630944 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 4630845  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt--gtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  4630844 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgatacagagacatacataagttcaaaagcgccaaaactttgtcaatttgatactacaaag 4630748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 32961954 - 32962253
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32961954 tacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 32962053  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32962054 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 32962153  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt-----gtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32962154 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaaaaagagatagatatacagaagttcaaaagcgtcaaaactctgtcaatttaattctacaaag 32962253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 32972573 - 32972872
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  32972573 tacctccactactctgttttctctctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 32972672  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32972673 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 32972772  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt-----gtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       | ||||| ||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32972773 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaaaaagagatagatatacagaagttcaaaagcgtcaaaactctgtcaatttaattctacaaag 32972872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 178; E-Value: 5e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8653830 - 8653539
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| |    
T  8653830 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaaaagctatgcctgtagaa-atgttccttcaaaacgggaatgaatttgaagctaatcc 8653732  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  8653731 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcaactcaacgtctctttc 8653633  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | || || ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  8653632 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagagagggagatataagttaaaaagcgccaaaactatgtcaatttgattctgcaaag 8653539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17745808 - 17746101
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  17745808 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 17745906  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||| || || ||||||  |||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  17745907 ttcaaaggactacacccaaatcaggaaaatcattactggtgaataatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaaacatctcaacgtctctttc 17746005  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17746006 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagagattaacacaagtt-aaaagtgccaaaactctgtcaaatttgattctacaaag 17746101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4292896 - 4292603
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  4292896 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaggacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctgatcc 4292798  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  |  |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  4292797 ttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaact-taacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 4292699  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||  | ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4292698 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggcaagagatatcaacacaag-tcaaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctacaaag 4292603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31572584 - 31572291
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  31572584 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacgaccatgcctgcagaa-atgttctatcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 31572486  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  31572485 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 31572387  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  31572386 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggcaagagacatcaatacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 31572291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 17064365 - 17064129
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  17064365 tacctccactactatgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttaatac 17064266  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  17064265 ttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 17064166  T
Q  201 acgcctctatataaagg-agtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  17064165 acatctctatataaaggaagtgaagacttggagattg 17064129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 18826264 - 18826497
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  18826264 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcc 18826362  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  18826363 ttcaaaggactttacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 18826461  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18826462 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 18826497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 295
Target Start/End: Complemental strand, 29765705 - 29765412
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  29765705 tacctccactactctgtttttgtctacgctatcagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 29765607  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||| |||||||| || |  || ||||||||||||||    
T  29765606 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc-ttagacgtactaaaaatctcaacgtctctttc 29765509  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaagt 295  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29765508 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaagt 29765412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 148; E-Value: 4e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 13913219 - 13913006
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  13913219 tacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacaactctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagataattc 13913121  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  13913120 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacaactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 13913022  T
Q  201 acgcctctatataaag 216  Q
    ||||||||||||||||    
T  13913021 acgcctctatataaag 13913006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18834660 - 18834953
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  18834660 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcc 18834758  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  18834759 ttcaaaggacttttcccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 18834857  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  18834858 acacctctatataaagaagtgaagacttgaagattggcaaaagacatcaacacaagtt-aaaagcgccacaactctgccaaatttgattctacaaag 18834953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22308957 - 22308666
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 103  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | |||| |||| || | |||||||||||||||||||||||||  | |||| ||    
T  22308957 ctccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagctctacctgtagaa-atattccttcaagatgggaatgaatttgaaattgattcctc 22308859  T
Q  104 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacg 203  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||||     
T  22308858 aaaggactacacccaaatcatgcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttcaca 22308760  T
Q  204 cctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |  |||||  |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22308759 cctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagacattaacgcaagtcaaaaagcaccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 22308666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 17042792 - 17042591
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  17042792 tacctccactactttgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaatttgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttaatac 17042693  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  17042692 ttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 17042593  T
Q  201 ac 202  Q
    ||    
T  17042592 ac 17042591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 64 - 294
Target Start/End: Original strand, 26022882 - 26023114
Alignment:
Q  64 tgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacg 163  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||    
T  26022882 tgtgccttcaaaatgggaatgaatttaaacctaatccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtgaataatcaaaggatttcaaacg 26022981  T
Q  164 actctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacat--agagatatacaagttcaaaa 261  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||   | ||  |||||| ||| |||||||||    
T  26022982 actctttaaacttgctgattatctcaacgtctctttcacacctctttataaaggagtgaagacttgaagatcaaagatggagagatttaccagttcaaaa 26023081  T
Q  262 gcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  26023082 gcgccaaaactctttcaaattgattctacaaag 26023114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 25518860 - 25518585
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||  ||||||||||||||| | || |    
T  25518860 tacctccactactctgtttttgtctacgttacaagacaagacaacagctctgcctccagaa-atgttccttcaagacaggaatgaatttgaagttgatcc 25518762  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  25518761 ttcatagcacaacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 25518663  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat----tgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctg 275  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    |  | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25518662 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaatacagagagagatatacaagtt-aaaagcgccaaaactctg 25518585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 134; E-Value: 9e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 27166469 - 27166761
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  27166469 tacctccactacactgttcttgtccacgctacaagacaagacaacggctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 27166567  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |  || |||||||| ||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  27166568 ttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaagaaactc-aacgactc-ttagacgtgctaaacatctcaacgtctctttc 27166665  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27166666 acacttctatataaaggagtgaagacttgaagattgataagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgtcaaattttattctacaaag 27166761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9933697 - 9933991
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||| |||| |||||||||| | || |    
T  9933697 tacctccactactatgtttctgtctatgctacaagacaagacaacaactctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaaggaatttgaagttgatcc 9933795  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||| ||||| |     
T  9933796 ttcataggactacaccaaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacatctctcta 9933894  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | || |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  9933895 ctcaccactatataaaggagtgaagacttgaagattgaaaagagacattaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 9933991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17741728 - 17742022
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  17741728 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaatacaacatctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 17741826  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  17741827 ttcataggactacacccaaatcaagcataagattactggtgtatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 17741925  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  17741926 ctcaccactatataaaggagtgaagacttgaagattggtaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 17742022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 130 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12353597 - 12353433
Alignment:
Q  130 ggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttg 229  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12353597 ggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctccttcacacctctatataaaggagtgaagacttg 12353498  T
Q  230 aagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||| |   ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12353497 aagattgaagtgagagacatataagttcaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaag 12353433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 25735584 - 25735876
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  25735584 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 25735682  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ctgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||  || |||||||||||||||||| |  |  || ||||||||||| |    
T  25735683 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattactggtagatga-tcaaggaactc-aacgactctttagacgtgccaaagaatctcaacgtctctct 25735780  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacataga-gatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
     | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25735781 actcacctctatataaaggagtaaagacttgaagattgacaagagaccacatacaagtt-aaaagcgcctaaactctgtcaatttgattctataaag 25735876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11206116 - 11205882
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | |||     
T  11206116 tacctccactactctgcttttgtctatgctacaacacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgattt 11206018  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| || || | | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  11206017 ttcatagtacaatatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctctctc 11205919  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11205918 cacacctctatataaaggagtaaagacttgaagattg 11205882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 25679407 - 25679115
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  25679407 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacatcagctcttcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 25679309  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ctgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||| | |||||  || |||||||||||||||||| |  |  || ||||||||||| |    
T  25679308 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattactagtagatga-tcaaggaactc-aacgactctttagacgtgccaaagaatctcaacgtctctct 25679211  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacataga-gatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
     | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||   | |||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  25679210 actcacctctatataaaggagtaaagacttgaagattgacaagagaccacatacaagtt-aaaagcgcctaaactctgtcaatttgattctataaag 25679115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 19289426 - 19289638
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||   || ||||| ||||||||| |||||    
T  19289426 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagtcgatccttcataggactacatccaaa 19289524  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||    
T  19289525 tcagacaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctctctacacacctctatataaggaag 19289623  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  19289624 tgaagacttgaagat 19289638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 12953176 - 12953391
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| |||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  12953176 tgtcctcgctacaatacaagataacagctctgcctgtagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 12953274  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaagga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  12953275 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttaagacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcacctctatataaagga 12953373  T
Q  219 gtgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||||| |||||    
T  12953374 gtgaagacttgatgattg 12953391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 25686775 - 25687068
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  25686775 tacctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 25686873  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctga-ttatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| | |||||  || |||||||||||||||||||| |   || ||||||||||| |    
T  25686874 ttcataggacaacatccaaatcaagaaaaagattactggtggatga-tcaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaggaatctcaacgtctctct 25686971  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacataga-gatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
     | | |||||||||||||||||  ||||||||||||||   | |||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25686972 gctcacctctatataaaggagtatagacttgaagattgacaagagacaacatacaagtt-aaaagcgcctaaactctgtcaaatttgattctataaag 25687068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 11235669 - 11235435
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | |||     
T  11235669 tacctccactattctacttttgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgattt 11235571  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| ||||| | | |||||||||||||| |||||| |||||||||| || || | || |||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| |     
T  11235570 ttcataggacaatatccaaatcaggcaaaagattacaggtggatgatcaatggttctc-aacgactctttagatgtgcttaagatctcaacgtctctctc 11235472  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  11235471 cacacctctatataaaggagtaaagacttgaagattg 11235435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18555420 - 18555206
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| || ||||||| ||||||||||||||| | || ||||  |||||||||||||||    
T  18555420 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccctcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcgtaggactacacccaaa 18555322  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| | ||||| |||||||||  |||||  || |||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  18555321 tcaggcaaaagtttactcgtggatgatctaaggaactc-aacgactctttagatgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcacctctatataaaggag 18555223  T
Q  220 tgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||||||||||    
T  18555222 tgaagacttgaagattg 18555206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 31931573 - 31931361
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||| || |||||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  31931573 tgtcctcgctacaagacaagttaacaactctgcctgcagaat-tgttccttcaagttaggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 31931475  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    |||||||||  |||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | |   || |||||||||||||    
T  31931474 tcaggcaaaatattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagatctcaacgtctctctacttaccactatataaaggag 31931376  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  31931375 tgaagacttgaagat 31931361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 25675331 - 25675196
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  25675331 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 25675233  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattact 137  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  25675232 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaggattact 25675196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18498770 - 18498562
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| | || ||| | |||||||||||||||    
T  18498770 tgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataagaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaa 18498672  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||| |||||||| |  || ||||||||||| | | | || |||||||||||||    
T  18498671 tcagacaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aatgactctttggacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcaccactatataaaggag 18498573  T
Q  220 tgaagacttga 230  Q
    |||||||||||    
T  18498572 tgaagacttga 18498562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20635744 - 20635511
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  20635744 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagca-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatc 20635646  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| || |||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  20635645 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaaagactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactct 20635548  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20635547 ttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 20635511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21128247 - 21128019
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 104  Q
    ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||    ||||||||    
T  21128247 tccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacatctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaatgcgattcttca 21128149  T
Q  105 aaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctttcacg 203  Q
     ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  ||| | |||| ||   ||||||||| | || |||| | |  || ||||||||||||||||     
T  21128148 taggacaacaaccaaatcaggcaaaagataattggtgattga-tcaaggtttcgcaacgactctattgaagtgcttaaagatctcaacgtctctttcaca 21128050  T
Q  204 cctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21128049 cctctatataaaggagtgaagactttaagat 21128019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 17608431 - 17608663
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  17608431 tacctccactactttgtttt-gtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaacgtgatc 17608528  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  17608529 cttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactct 17608626  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  17608627 ttcacacctctatacaaaggagtgaagacttaaagat 17608663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 7586282 - 7586514
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  7586282 tacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 7586380  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||  ||| | ||||  ||   | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||| |    
T  7586381 ttcataggacaacatccaaatcaggcaacagatcattggt--attgatcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctct 7586478  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7586479 acacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 7586514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 6158377 - 6158316
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6158377 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 6158316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22386827 - 22386594
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||| | |||| ||||||||||   |||| |||| ||  | ||     
T  22386827 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagta-atgttccttcaagatattaatggattttaacgtgatc 22386729  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||| ||| | |  || |||||| ||||    
T  22386728 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacatgcttaaagatctcaacgactct 22386631  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22386630 ttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 22386594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 14051507 - 14051731
Alignment:
Q  3 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattct 101  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |  ||||| |||||||  |||||||    
T  14051507 cctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgtttcttcaaattcagaatggatttgaaattaattct 14051605  T
Q  102 tcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattattt--caacgtctcttt 199  Q
    ||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| || |    |  ||| ||||||| |||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  14051606 tcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaagg---ctacaacaactcttt-gacgtgctggcaatttcacaacgtctcttt 14051701  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttg 229  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  14051702 cacatctctatataaaggagtgaagacttg 14051731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 21 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 17047704 - 17047597
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||    
T  17047704 tgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagatt-tgttccttcaagataggaatgaattttaagttaattctttaaaggactacatccaaa 17047606  T
Q  121 tcaggcaaa 129  Q
    |||||||||    
T  17047605 tcaggcaaa 17047597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Original strand, 25722984 - 25723059
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagat 77  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||    
T  25722984 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagat 25723059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 3 - 229
Target Start/End: Original strand, 14070188 - 14070412
Alignment:
Q  3 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattct 101  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||  |  ||||| |||||||  |||||||    
T  14070188 cctccactactctgtttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgtttcttcaaattcagaatggatttgaaattaattct 14070286  T
Q  102 tcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattattt--caacgtctcttt 199  Q
    ||| |||||  || ||||||||| |||| ||| | |||||  |||| || |    |  ||||||||||| |||||||||   ||||  ||||||||||||    
T  14070287 tcataggacatcatccaaatcagacaaaagatcattggtgattgatcaagg---ctacaacgactcttt-gacgtgctggcaatttcacaacgtctcttt 14070382  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttg 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14070383 cacacctctatataaaggagtgaagacttg 14070412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29918042 - 29917814
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| | ||||  ||||||||| |||||||  | |||    
T  29918042 tacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttcattcacaatgggaatgcatttgaaattgatt 29917944  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactc--tttagacgtgctgattatt-tcaacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| |   ||| ||||||||||  || | |||||  |||| ||||   ||||||||||||  ||| || ||||||   |||  |||||||||    
T  29917943 cttcataggacaatgaccatatcaggcaaaaaatcattggtgattgatcaaag--cttcaaacgactctattttgatgtgctggcaattcacaacgtctc 29917846  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29917845 tttcacacctctatataaaggagtgaagactt 29917814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12347926 - 12347879
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12347926 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 12347879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 18172345 - 18172395
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18172345 caacgtctctctcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 18172395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 24728858 - 24728908
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24728858 caacgtctctttcacgcttcaatataaaggagtgaagacttgaagattgta 24728908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Original strand, 31127625 - 31127673
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31127625 tcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttggagatt 31127673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17927627 - 17927580
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17927627 caacgtctctttcaaacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 17927580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 19066326 - 19066369
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19066326 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 19066369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 10704849 - 10704899
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  10704849 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaaaacttgaagattgta 10704899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15954545 - 15954503
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15954545 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 15954503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 24719054 - 24719104
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24719054 caacgtctctttcaaacctcaatataaaggagtgaagacttgaagattgta 24719104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9717868 - 9717640
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||| || ||||| ||||||||  | |||| ||||||  ||||||||| |||||||  | ||     
T  9717868 tacctccactactctgtttttgtctctgatacaagacaagaaaaacagctctgcctgcaaca-atgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatc 9717770  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct--ttagacgtgctgattattt-caacgtctc 196  Q
    ||||| ||||  | | ||| |||||||||| ||| | |||||  |||| ||||   |||||||||||||  || || |||||||  |||  |||||||||    
T  9717769 cttcataggagaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagc--ttcaaacgactctattttgatgtgctgacaattcacaacgtctc 9717672  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||    
T  9717671 tttcacacctttgtataaaggagtgaagactt 9717640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 19833342 - 19833383
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19833342 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 19833383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21618082 - 21618041
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21618082 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 21618041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32544290 - 32544062
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||| ||||   |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||  | ||     
T  32544290 tacctccactactctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatc 32544192  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct--ttagacgtgctgattattt-caacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| | | ||| |||||| ||| ||| | |||||  |||| ||||   |||||||||||||  || || ||||||   |||  |||||||||    
T  32544191 cttcataggacaataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagc--ttcaaacgactctattttgatgtgctggcaattcacaacgtctc 32544094  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  32544093 tttcacatctctatataaaggagtgaagactt 32544062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 15531936 - 15531976
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15531936 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 15531976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19623816 - 19623776
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19623816 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 19623776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 20731016 - 20731056
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20731016 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 20731056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21624938 - 21624898
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21624938 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 21624898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25592448 - 25592408
Alignment:
Q  195 tctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25592448 tctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 25592408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Original strand, 20113012 - 20113051
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20113012 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 20113051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 23231025 - 23230974
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23231025 tcaacgtatctctcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagcttgta 23230974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16335965 - 16335923
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16335965 ttcaacgtctctttcgcacctctatataaaggagtgaagactt 16335923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 17445969 - 17446018
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17445969 caacgtct-tttcacacatctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 17446018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 32335667 - 32335617
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  32335667 caacgtctctctcacacctctatataagtgagtgaagacttgaagattgta 32335617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 19470504 - 19470463
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  19470504 caacgtctctttcacacctctatataaaggaatgaagacttg 19470463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 33352236 - 33352277
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  33352236 ttcaacgtctctttcacacctctatatgaaggagtgaagact 33352277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15302037 - 15301997
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  15302037 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaatactt 15301997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19688616 - 19688576
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  19688616 caacgtctctttcacacctctatataaagaagtgaagactt 19688576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 236
Target Start/End: Original strand, 23006360 - 23006408
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23006360 caacgtctctctcacacctctatataaatgagtgaagactttaagattg 23006408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23782006 - 23781958
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  23782006 caacgtctctctcacacctctatataaatgagtgaagactttaagattg 23781958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25593905 - 25593865
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25593905 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 25593865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 195 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13144834 - 13144791
Alignment:
Q  195 tctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  13144834 tctttcacacctctatataaaggagtgaatacctgaagattgta 13144791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 15478099 - 15478146
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||| |||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15478099 caacatctctttcatacctctatataaaggaatgaagacttgaagatt 15478146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15551822 - 15551775
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15551822 caacgtctctttcatacctctatataaaggaatgaagacttaaagatt 15551775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15987069 - 15987030
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  15987069 aacgtctctttcacacctctatattaaggagtgaagactt 15987030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26943418 - 26943383
Alignment:
Q  193 tctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26943418 tctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 26943383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 15954728 - 15954619
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||  ||||     
T  15954728 tacctccactactctgtttttgtctcttctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-atgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattaatc 15954630  T
Q  100 cttcaaaggac 110  Q
    ||||| |||||    
T  15954629 cttcataggac 15954619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17381361 - 17381320
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  17381361 ttcaacgcctctttcacacctctatataaaggagtaaagact 17381320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 22076717 - 22076758
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||    
T  22076717 ttcaacgtctctttcacatctctatatagaggagtgaagact 22076758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23296596 - 23296515
Alignment:
Q  155 tttcaaacgactctttagacgtgctgattatt-tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||||||||| || |||||||  ||  ||||||||||| |||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  23296596 tttcaaacgactcttttgatgtgctgaaaatcatcaacgtctctctcacaccactatataatggattaaagacttgaagatt 23296515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24398610 - 24398561
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24398610 tcaacgtatctctcacaccactatataaaggagtgaatacttgaagattg 24398561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 14100750 - 14100790
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||    
T  14100750 caacgtctctttcatacctctatataaaggagtaaagactt 14100790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Original strand, 16265466 - 16265502
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  16265466 gtctctttcatacctctatataaaggagtgaagactt 16265502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16915261 - 16915221
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  16915261 caacatctctttcacacctctatgtaaaggagtgaagactt 16915221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 19625645 - 19625609
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaag 224  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19625645 caacgtctctttcacacctctacataaaggagtgaag 19625609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 20488042 - 20488133
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  20488042 tacctccactactctgtttttgtatctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaa 20488133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22801977 - 22801937
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  22801977 caacgtctctttcacatctctatataaagaagtgaagactt 22801937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #136
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24116665 - 24116625
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24116665 caacgtctctcgcacacctctatataaaggagtgaagactt 24116625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #137
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 26972538 - 26972578
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||    
T  26972538 caacgtctctttgacacgtctatataaaggagtgaagactt 26972578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6940 - 7232
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6940 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 7039  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7040 tttaaaggactacacccaaaccaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggttttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 7139  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7140 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg-agatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 7232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 121)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 23469509 - 23469802
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469509 tacctccactcctctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 23469608  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23469609 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggagtactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 23469708  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23469709 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 23469802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 30314745 - 30315037
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30314745 tacctccactactctgtttt-gtcctcgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 30314843  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30314844 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 30314943  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30314944 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 30315037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6318565 - 6318858
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6318565 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcataatttgtgtcctcaagatgggaatgaatttgaagcttattc 6318664  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  6318665 ttcaaaggagtacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgttctgattatctcaacgtctctttc 6318764  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  6318765 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 6318858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18158486 - 18158195
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18158486 tacctccactactctgtttttgtccactctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 18158388  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18158387 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 18158289  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18158288 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 18158195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18769186 - 18769478
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769186 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagataagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 18769285  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  18769286 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttc 18769384  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769385 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 18769478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19418583 - 19418291
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418583 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 19418485  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19418484 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 19418385  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19418384 acatctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagacatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19418291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3220864 - 3220570
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3220864 tacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 3220765  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3220764 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 3220665  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3220664 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 3220570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19429160 - 19428866
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19429160 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 19429061  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19429060 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 19428961  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19428960 cacatctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagacatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19428866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19225165 - 19224873
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19225165 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 19225067  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  19225066 ttcaaaggacaacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaatgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 19224967  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19224966 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagatagtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 19224873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18153966 - 18153676
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18153966 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca-aat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagctaattc 18153869  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| | |||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18153868 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-caactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 18153770  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18153769 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 18153676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9341376 - 9341082
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9341376 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 9341277  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9341276 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9341177  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9341176 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9341082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9368520 - 9368226
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  9368520 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 9368421  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9368420 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9368321  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9368320 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9368226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20161278 - 20161572
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20161278 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattc 20161376  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20161377 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 20161476  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag--atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20161477 acgcctctatataaaggagtgaagaattgaagattgaagagagagacatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 20161572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20196189 - 20195895
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  20196189 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattc 20196091  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  20196090 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 20195991  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag--atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20195990 acgcctctatataaaggagtgaagaattgaagattgaagagagagacatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 20195895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9856520 - 9856814
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9856520 tacctctactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 9856619  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9856620 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9856719  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9856720 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9856814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18449602 - 18449308
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||| |||    
T  18449602 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaaaatgggaatgaatttgaagcttatt 18449503  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18449502 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgactatctcaacgtctcttt 18449403  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18449402 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtatatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 18449308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16747232 - 16746939
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16747232 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctgcagaatttgtgccttcaagatggaaatgaatttgaagctaattc 16747134  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16747133 ttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 16747035  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatat--acaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16747034 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 16746939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26121142 - 26120847
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  26121142 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaataaatttgaagcttatt 26121043  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  26121042 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttaagacgtgctaattatctcaacgtctctt 26120943  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26120942 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 26120847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 15791347 - 15791641
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15791347 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 15791446  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15791447 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgagtatctcaacgtctcttt 15791546  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15791547 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattatagatagagattcataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 15791641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 2 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26111463 - 26111169
Alignment:
Q  2 acctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26111463 acctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattc 26111364  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26111363 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttaagacgtgctaattatctcaacgtctcttt 26111264  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26111263 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 26111169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6151302 - 6151006
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6151302 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 6151203  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6151202 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 6151103  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6151102 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgacaatttgattctacaaag 6151006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 210202 - 210495
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  210202 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 210300  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  210301 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 210400  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  210401 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 210495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 242055 - 241762
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  242055 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 241957  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  241956 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 241857  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  241856 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 241762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 252640 - 252347
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  252640 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 252542  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  252541 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 252442  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  252441 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 252347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 723825 - 724118
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  723825 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 723923  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  723924 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 724023  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  724024 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 724118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 849016 - 849309
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  849016 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 849114  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  849115 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 849214  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  849215 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 849309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 15780758 - 15781052
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15780758 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 15780857  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  15780858 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgagtatctcaacgtctcttt 15780957  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15780958 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattatagatagagattcataagttcaaaagcgccaaagctctgtcaatttgattctacaaag 15781052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31215247 - 31214951
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31215247 tacctccactactctgtttttgtccacgctataagacaagacaacagctatgcctgcataatttatgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 31215148  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  31215147 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtggatgatcaaaagatttcaaacaactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttc 31215048  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgcc---aaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  31215047 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagactgtagaaagatatacacaagttcaaaagcgccaaaaaaactctgtcaatttgattctacaaag 31214951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44481323 - 44481029
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  44481323 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 44481224  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44481223 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgtttatctcaacgtctcttt 44481124  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44481123 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 44481029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 44491939 - 44491645
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||     
T  44491939 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatc 44491840  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44491839 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgtttatctcaacgtctcttt 44491740  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44491739 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 44491645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36293151 - 36292859
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36293151 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 36293052  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36293051 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36292952  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36292951 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaacagagatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36292859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36303754 - 36303462
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  36303754 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 36303655  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36303654 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36303555  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36303554 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaacagagatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36303462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 3348675 - 3348969
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3348675 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 3348774  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3348775 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 3348874  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3348875 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 3348969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 3359272 - 3359566
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  3359272 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 3359371  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3359372 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 3359471  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3359472 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 3359566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29087213 - 29086920
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  29087213 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 29087115  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29087114 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 29087015  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29087014 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagattttagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 29086920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 32088318 - 32088611
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32088318 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 32088416  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32088417 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 32088516  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32088517 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataatagatagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 32088611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 6161257 - 6160961
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  6161257 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaaaacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 6161158  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6161157 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 6161058  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6161057 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 6160961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 32077745 - 32078038
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32077745 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 32077843  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32077844 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgatggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 32077943  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32077944 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataatagatagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 32078038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 6 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43248553 - 43248263
Alignment:
Q  6 ccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 104  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43248553 ccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttattcttca 43248454  T
Q  105 aaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43248453 aaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacgc 43248354  T
Q  205 ctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacata-gagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  | | | |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43248353 ctctatataaaggagtgaaggcttgaagatttgagaaaagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 43248263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 40213223 - 40213510
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 104  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213223 tccactactctgtttttgtctacactacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 40213321  T
Q  105 aaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||| |||| || || ||||||||||||||||      
T  40213322 aaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacctgctaatcatctcaacgtctctttcacat 40213420  T
Q  205 ctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40213421 ctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40213510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36078168 - 36077875
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  36078168 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 36078069  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36078068 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 36077969  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36077968 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aagatagagatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36077875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 36088754 - 36088461
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  36088754 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 36088655  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36088654 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 36088555  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36088554 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aagatagagatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36088461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19128980 - 19128686
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19128980 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 19128881  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19128880 cttcaaaggactacacccaaatcaggaaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctcttt 19128781  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19128780 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaataatagacatacataagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19128686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19139512 - 19139218
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19139512 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 19139413  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19139412 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttgattatctcaacgtctcttt 19139313  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||| ||| | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19139312 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaataatagacatacataagttaaaaatcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19139218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 10 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 795401 - 795117
Alignment:
Q  10 tactctgtttttg-tccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaagg 108  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  795401 tactctgttttcggtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttattcttcaaagg 795303  T
Q  109 actacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctct 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  795302 actacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttcacgcctct 795203  T
Q  209 atataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  795202 atataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 795117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 13688615 - 13688910
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  13688615 tacctccaccactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 13688714  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13688715 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 13688814  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688815 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 13688910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29076962 - 29076669
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||| | |||    
T  29076962 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaagtttatt 29076864  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29076863 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 29076764  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29076763 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataatatagagaaatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 29076669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 23457353 - 23457530
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23457353 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 23457451  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23457452 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggagtactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct 23457530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 30325301 - 30325473
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30325301 tacctccactactctgtttt-gtcctcgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 30325399  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagac 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  30325400 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagac 30325473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3843754 - 3843460
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  3843754 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 3843656  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  3843655 ttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 3843557  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  3843556 ctcacctctatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 3843460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 1750325 - 1750193
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1750325 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaaacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctgattc 1750226  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1750225 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 1750193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 7018430 - 7018664
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  7018430 tacctccactactctgtttgtgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 7018528  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct--- 197  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||       
T  7018529 ttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 7018627  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7018628 ttca--cctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 7018664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 20259666 - 20259900
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||| | || |    
T  20259666 tacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaattcaaagttgatcc 20259764  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt- 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||     
T  20259765 ttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaaggaaatc-aacgactttttagacgtgctaaaaatctcaacgtctcttta 20259863  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20259864 ctcacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 20259900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 21046296 - 21046530
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||| | || |    
T  21046296 tacctccactactctgtttgtgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaattcaaagttgatcc 21046394  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt- 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||  || ||||||| |||||||||||| |  || |||||||||||||     
T  21046395 ttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaaggaaatc-aacgactttttagacgtgctaaaaatctcaacgtctcttta 21046493  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21046494 ctcacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 21046530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 22135927 - 22136141
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  22135927 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 22136025  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||| ||| | | | || |||||||||||||    
T  22136026 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtgtctctactcaccactatataaaggag 22136124  T
Q  220 tgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||||||||||    
T  22136125 tgaagacttgaagattg 22136141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 22167092 - 22167306
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  22167092 tgtcctcgctacaagataagataacagctttgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 22167190  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | | | || |||||||||||||    
T  22167191 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcaccactatataaaggag 22167289  T
Q  220 tgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||||||||||    
T  22167290 tgaagacttgaagattg 22167306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 6576568 - 6576712
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6576568 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 6576667  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggat 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6576668 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggat 6576712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 22211457 - 22211670
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  22211457 tgtcctcgctacaagacaagataacagccctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 22211555  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaagga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  22211556 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttaagacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcacctctatataaagga 22211654  T
Q  219 gtgaagacttgaagat 234  Q
    || |||||||||||||    
T  22211655 gtaaagacttgaagat 22211670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 23370780 - 23370491
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||||||  ||| | || |    
T  23370780 tacctccactactctgtttttgtc-----tacaagacaagacaacacctctgcctacagaa-atgttcctttaagataggaatgaattcaaagttgatcc 23370687  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  23370686 ttcgtaggactacacccaaatcaggaaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 23370588  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||| ||  | ||||||| |||||||| ||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  23370587 ctcacctctatataaatgagtgaagacttgaagattgaaaagagatatcaacacaagtt-aaaagcgcaaaaactctgccaaatttgattctataaag 23370491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 23271257 - 23271487
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 103  Q
    ||||||||||||  | |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||    
T  23271257 tccactactctgcctgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaatttgatccttc 23271355  T
Q  104 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct-ttca 201  Q
    | ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | |  || | ||||||||| | |     
T  23271356 ataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgcttaaagatcttaacgtctctctacc 23271454  T
Q  202 cgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23271455 cacctctatataaaggagtgaaaacttgaagat 23271487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28903473 - 28903244
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 102  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |||    
T  28903473 ctccactactctgtttt-gtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatcctt 28903376  T
Q  103 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    || ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   |||| ||  | ||||| | ||||||| | ||||||| | |  || |||||| |||| ||    
T  28903375 cataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtaattgatcaa--ggtttcacagcgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctctc 28903278  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28903277 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 28903244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 40003246 - 40003013
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| ||||||  | |||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  |||||    
T  40003246 tacctccacgactctgactgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtaatt 40003148  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||  ||||| ||| ||||||||| |||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | || |||| | |  || |||||| ||||    
T  40003147 cttcttaggacaacatccaaatcagacaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgatgtgcttaaagatctcaacgactct 40003050  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40003049 ctcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 40003013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 8032051 - 8031817
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  8032051 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcttgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatc 8031953  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct- 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || |||||||||||     
T  8031952 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctc 8031854  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8031853 tacacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 8031817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21540969 - 21540736
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  21540969 tacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatc 21540871  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||||| ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  21540870 cttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgactct 21540773  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  21540772 ttcacatctcaatataaaggagtgaaaacttgaagat 21540736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 45568035 - 45568268
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| || |||  || |||||| |||||||  | ||     
T  45568035 taccttcactactctgtttatgtctacgctataagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccctcagaataggaatggatttgaatgtgatc 45568133  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  45568134 cttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--gttttcagaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactct 45568231  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45568232 ttcacacctctatataaaggagtgaagacttaaagat 45568268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 17519192 - 17519425
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  17519192 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctcttcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatc 17519290  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||     
T  17519291 cttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctc 17519389  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17519390 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 17519425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 15425287 - 15425515
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||  | ||     
T  15425287 tacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatc 15425385  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactc---tttagacgtgctgattatttcaacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| | | ||| |||||||||||||| | ||||| ||||| ||| |  ||||||||||||   |||  | ||||||   | |||||||||||    
T  15425386 cttcataggacaataaccatatcaggcaaaggatcattggtgaatgatcaaaag-cttcaaacgactctattttgaatgtgctg-gcaattcaacgtctc 15425483  T
Q  197 -tttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
     |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  15425484 ttttcacacctttatataaaggagtgaagact 15425515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12193744 - 12193693
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12193744 tcaacgtatctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 12193693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12438172 - 12438121
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12438172 tcaacgtatctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 12438121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 17917141 - 17917191
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17917141 caacgtctcttttacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 17917191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 15336222 - 15336354
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||  | ||     
T  15336222 tacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatc 15336320  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 133  Q
    ||||| ||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  15336321 cttcataggacaataaccatatcaggcaaaggat 15336354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Original strand, 15516591 - 15516723
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||  | ||     
T  15516591 tacctccactactctgtttttgtctttgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatc 15516689  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggat 133  Q
    ||||| ||||| | | ||| ||||||||||||||    
T  15516690 cttcataggacaataaccatatcaggcaaaggat 15516723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 1744990 - 1744947
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1744990 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 1744947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 13430946 - 13430989
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13430946 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 13430989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 18557851 - 18557804
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18557851 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 18557804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19461180 - 19461051
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||  |||||||  | || |    
T  19461180 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctataagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaatataggaatagatttgaacttgatcc 19461082  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagg 131  Q
    |||| ||||| ||| || |||||| ||||||    
T  19461081 ttcataggacaacatcccaatcagacaaagg 19461051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 19558858 - 19558729
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || |||||  |||||||  | || |    
T  19558858 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctataagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaatataggaatagatttgaacttgatcc 19558760  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagg 131  Q
    |||| ||||| ||| || |||||| ||||||    
T  19558759 ttcataggacaacatcccaatcagacaaagg 19558729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6407557 - 6407516
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6407557 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 6407516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 14990381 - 14990422
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14990381 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 14990422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17267303 - 17267258
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17267303 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttaaaga 17267258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18121240 - 18121468
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||| |||||||||||| ||||   |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  |||| ||||||  |||||||||||||||||  | ||     
T  18121240 tacctcaactactctgtttctgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgaatttgaaattgatc 18121338  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct--ttagacgtgctgattattt-caacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| | | ||| ||||| |||| ||| | || ||  |||| ||||   |||||||||||||  || || ||||||   |||  |||||||||    
T  18121339 cttcataggacaataaccatatcagtcaaaagatcattgatgattgatcaaagc--ttcaaacgactctattttgatgtgctggcaattcacaacgtctc 18121436  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18121437 tttcacacctctatataaaggagtgaagactt 18121468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 18151966 - 18152007
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18151966 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 18152007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 18321481 - 18321526
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18321481 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttaaaga 18321526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22673609 - 22673568
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22673609 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 22673568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29379595 - 29379362
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || || || ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| |||||||  ||||     
T  29379595 tacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagaaaaacatctctgcctgcagaa-atgttccttcaggataggaatggatttgaacataatc 29379497  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||    |||||||||||  ||| | ||||  ||   | |||| ||   ||||||||| | |||||||| |   || |||||| ||||     
T  29379496 cttcataggacaactttgaaatcaggcaacagatcattggt--attgatcaaggtttctcaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctc 29379399  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29379398 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 29379362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16188812 - 16188772
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16188812 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 16188772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19461045 - 19460969
Alignment:
Q  160 aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctcttt-cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||||||| |   || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19461045 aacgactctttagacgtgcttaaagatctcaacgtctctctacacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 19460969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 160 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19558723 - 19558647
Alignment:
Q  160 aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctcttt-cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||||||| |   || ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19558723 aacgactctttagacgtgcttaaagatctcaacgtctctctacacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 19558647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 19956660 - 19956700
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19956660 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 19956700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 20255833 - 20255873
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20255833 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 20255873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 20382716 - 20382756
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  20382716 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 20382756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 22461959 - 22461999
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22461959 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 22461999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 23263934 - 23263974
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23263934 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 23263974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 30421752 - 30421792
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30421752 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 30421792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33082693 - 33082653
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33082693 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 33082653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Original strand, 40845709 - 40845748
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40845709 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 40845748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 43639615 - 43639572
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  43639615 atttcaacgtctctttcacacctctatataaagtagtgaagact 43639572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 45292668 - 45292625
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  45292668 atttcaacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagact 45292625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19707333 - 19707296
Alignment:
Q  191 cgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19707333 cgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 19707296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24551105 - 24551064
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  24551105 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaagact 24551064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 12758085 - 12758125
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12758085 caacgtctctttcacacctctatataaagaagtgaagactt 12758125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #102
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 16681625 - 16681665
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  16681625 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtcaagactt 16681665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #103
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18679643 - 18679603
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  18679643 caacgtctctttcacacctctatataaaggactgaagactt 18679603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #104
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 18685718 - 18685758
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18685718 caacgtctctttcacacctctatataaaggggtgaagactt 18685758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 18731312 - 18731352
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18731312 caacgtctctttcacacctctatataaaggggtgaagactt 18731352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19156071 - 19156031
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19156071 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 19156031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #107
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 12541467 - 12541420
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  12541467 caacgcctctttcacacctctatataaaggaaagaagacttgaagatt 12541420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17701569 - 17701530
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17701569 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 17701530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 17797250 - 17797211
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  17797250 caacgtctctttcacacctctatataaagaagtgaagact 17797211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #110
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Original strand, 25850324 - 25850375
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25850324 tcaacgtatctttcacatttctatataaaggagtgaaaacttgaagattgta 25850375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 13430766 - 13430820
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaa-gacaacagctatgcctgca 58  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||| ||||||||    
T  13430766 tccactactctgtttttgtccctgctacaagacaaggataacagctctgcctgca 13430820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #112
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 227
Target Start/End: Original strand, 14989773 - 14989811
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  14989773 aacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagact 14989811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #113
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21932900 - 21932679
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||| || ||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||  | ||     
T  21932900 tacctccactactcagtgtttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatc 21932802  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactc--tttagacgtgctgattatt-tcaacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| | | ||| |||||||||| ||| | |||||  |||| ||||  |||||||||||||  ||| || ||||||   |||  |||||||||    
T  21932801 cttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaag--tttcaaacgactctattttgatgtgctggcaattcacaacgtctc 21932704  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtg 221  Q
    |||||   |||||||||||||||||    
T  21932703 tttcataactctatataaaggagtg 21932679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #114
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22662940 - 22662906
Alignment:
Q  193 tctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22662940 tctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 22662906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #115
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 45538573 - 45538631
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  45538573 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 45538631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #116
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26832866 - 26832821
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  26832866 caacgtctctttcacacctctatataaaggactaaagacctgaaga 26832821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #117
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 45538759 - 45538800
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    
T  45538759 ttcaacgtctctttcacatctctatataaaggattgaagact 45538800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 197 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2810629 - 2810593
Alignment:
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2810629 tttcacacctctatataaaggagtgaatacttgaaga 2810593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 9320400 - 9320364
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtga 222  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  9320400 ttcaacgtctctttctcacctctatataaaggagtga 9320364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #120
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19943064 - 19943024
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  19943064 caacgtctctttcacaccgttatataaaggagtgaagactt 19943024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25163895 - 25163859
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25163895 gtctctttcacacctctatataaaggagtgacgactt 25163859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 125)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 21172500 - 21172792
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172500 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcttgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 21172598  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21172599 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 21172698  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21172699 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 21172792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18768940 - 18769231
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18768940 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 18769038  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18769039 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 18769137  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18769138 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 18769231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 28721350 - 28721642
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28721350 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattc 28721448  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  28721449 ctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 28721548  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28721549 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 28721642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 28731936 - 28732228
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28731936 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagttaattc 28732034  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  28732035 ctcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 28732134  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28732135 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 28732228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40222528 - 40222234
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40222528 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 40222429  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40222428 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 40222329  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40222328 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40222234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 40251389 - 40251095
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40251389 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 40251290  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40251289 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 40251190  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40251189 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40251095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 1099228 - 1099522
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  1099228 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 1099327  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1099328 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 1099427  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1099428 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 1099522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9897607 - 9897901
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9897607 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 9897706  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9897707 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9897806  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9897807 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9897901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9908195 - 9908489
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9908195 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 9908294  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9908295 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9908394  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9908395 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9908489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 17857470 - 17857764
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  17857470 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 17857569  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17857570 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 17857669  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17857670 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattggagacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 17857764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 32218069 - 32217775
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  32218069 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 32217970  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32217969 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 32217870  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32217869 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 32217775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 38586121 - 38586412
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38586121 tacctccactactctgtttttgtctacgctaaaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 38586219  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  38586220 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 38586318  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38586319 acacctctatataagggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 38586412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 22914897 - 22915191
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22914897 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 22914996  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22914997 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 22915096  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22915097 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtatatagagatacataagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 22915191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26867266 - 26866974
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26867266 tacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 26867168  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  26867167 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattgttggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 26867069  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagtt-caaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26867068 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagatatatacaagttaaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 26866974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36251877 - 36252171
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  36251877 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 36251976  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36251977 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36252076  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36252077 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagagatacataagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36252171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 24415056 - 24415347
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24415056 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgagaatgaatttgaagctaattc 24415154  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  24415155 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 24415253  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24415254 acgcctctatatgaaggagtgaagacttgaagattgtagatagacatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24415347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 2561684 - 2561390
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2561684 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagataattc 2561586  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2561585 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 2561486  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagag--atatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||  ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2561485 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagagacatacacaggttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaag 2561390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 22960365 - 22960659
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| |  |||||||| |||||||||||||||| |||    
T  22960365 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgagaatgaatttgaagcttatt 22960464  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22960465 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 22960564  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22960565 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtatatagagatacataagttcaaaaacgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 22960659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 24327767 - 24328061
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24327767 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagtcatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 24327866  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24327867 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacatgctgattatctcaacgtctcttt 24327966  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24327967 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24328061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 7005840 - 7006134
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  7005840 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 7005939  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7005940 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 7006039  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7006040 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctatcaatttgattctacaaag 7006134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 24338437 - 24338731
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  24338437 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 24338536  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  24338537 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgatggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacatgctgattatctcaacgtctcttt 24338636  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24338637 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24338731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 34790250 - 34790544
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34790250 tacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 34790349  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34790350 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 34790449  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34790450 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagaaagagattcataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 34790544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4220678 - 4220382
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4220678 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 4220579  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4220578 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 4220479  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgt--acatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4220478 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 4220382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 11388842 - 11389136
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11388842 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 11388941  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11388942 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 11389041  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11389042 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagagagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 11389136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 21650565 - 21650858
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  21650565 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 21650663  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21650664 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 21650763  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21650764 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaatatagagatacacaagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 21650858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29244417 - 29244123
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29244417 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 29244318  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29244317 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 29244218  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29244217 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagacagatatacataagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 29244123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 29254996 - 29254702
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29254996 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 29254897  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29254896 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 29254797  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29254796 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagacagatatacataagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 29254702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 34478123 - 34477830
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  34478123 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 34478025  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34478024 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 34477925  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34477924 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataacatatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 34477830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 34804393 - 34804687
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  34804393 tacctccactactctgttttctgtcttcgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 34804492  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  34804493 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtggtgattatctcaacgtctcttt 34804592  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34804593 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagaaagagattcataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 34804687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 39170128 - 39170422
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  39170128 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 39170227  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39170228 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 39170327  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39170328 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 39170422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 26879855 - 26879563
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26879855 tacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 26879757  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  26879756 ttcaaaggactacacccaaatcagacaaaggattgctggtgaatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 26879658  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagtt-caaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26879657 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagatatatacaagttaaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattcaacaaag 26879563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43355217 - 43354924
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  43355217 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 43355119  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43355118 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 43355019  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43355018 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 43354924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4210086 - 4209790
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4210086 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 4209987  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4209986 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 4209887  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgt--acatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4209886 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagacagagatacataagttcaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaag 4209790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10277766 - 10277472
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  10277766 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 10277667  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10277666 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 10277567  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10277566 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 10277472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 11395205 - 11395499
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11395205 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 11395304  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11395305 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 11395404  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11395405 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattcaagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 11395499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 11405521 - 11405815
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  11405521 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 11405620  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11405621 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 11405720  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11405721 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattcaagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 11405815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43345602 - 43345309
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||| ||||||||||||| | |||    
T  43345602 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatggaaatgaatttgaagtttatt 43345504  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43345503 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 43345404  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43345403 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 43345309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 27221577 - 27221282
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27221577 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 27221478  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27221477 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 27221378  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27221377 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27221282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 30488856 - 30489151
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||| |||||||||| | ||    
T  30488856 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaacgaatttgaagtttat 30488955  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30488956 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 30489055  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30489056 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattatatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 30489151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35253178 - 35252883
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35253178 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 35253079  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35253078 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 35252979  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35252978 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 35252883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35263787 - 35263492
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35263787 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 35263688  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35263687 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 35263588  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35263587 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 35263492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35274412 - 35274117
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35274412 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 35274313  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35274312 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 35274213  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35274212 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 35274117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 10267189 - 10266895
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  10267189 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 10267090  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  10267089 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 10266990  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| || | ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  10266989 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagattttagagagagatacataagtttaaaagcgccaaaactttgtcaatttgattctaaaaag 10266895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 16769138 - 16768844
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16769138 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 16769039  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16769038 cttcaaaggaccacacccaaatcaggcaaagtattactggtgaataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 16768939  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16768938 cacgcctttatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagttcaaaagcgtcaaaactctgtcaaattgattctacaaag 16768844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18392670 - 18392964
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  18392670 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagttgatt 18392769  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18392770 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctgactatctcaacgtctcttt 18392869  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | | ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392870 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgagagaaatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 18392964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 27978416 - 27978708
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  27978416 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgagaatgaatttgaagttgattc 27978514  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  27978515 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 27978613  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27978614 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagagatcaacataagtt-aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaag 27978708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 28064945 - 28065237
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||    
T  28064945 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgagaatgaatttgaagttgattc 28065043  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  28065044 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 28065142  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | | ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28065143 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagagatcaacataagtt-aaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaag 28065237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9762803 - 9763095
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9762803 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 9762902  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9762903 cttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9763002  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9763003 cacgcctctatataaagga-tgaagacttgaagatt-aaaacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattttacaaag 9763095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9773339 - 9773631
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9773339 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 9773438  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9773439 cttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 9773538  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9773539 cacgcctctatataaagga-tgaagacttgaagatt-aaaacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattttacaaag 9773631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43082842 - 43082555
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43082842 tacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 43082743  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43082742 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 43082643  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||       |||||||||||   | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082642 cacacctctatataaag-------gacttgaagataaaatatagagatacataagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 43082555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 48 - 294
Target Start/End: Original strand, 24427667 - 24427912
Alignment:
Q  48 ctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgat 147  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  24427667 ctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagtcaaaggattactggtgaatgat 24427766  T
Q  148 taaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat 247  Q
     ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24427767 caaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatcttaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagat 24427865  T
Q  248 atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24427866 acacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 24427912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 43093451 - 43093164
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43093451 tacctccactagtctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagtcatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 43093352  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43093351 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 43093252  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||       |||||||||||   | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43093251 cacacctctatataaag-------gacttgaagataaaatatagagatacataagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 43093164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36784838 - 36785125
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||       ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  36784838 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaa-------gcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcc 36784929  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  36784930 ctcaaatgactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 36785029  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  36785030 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggtcagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 36785125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 967536 - 967770
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  967536 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 967634  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  967635 gtcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 967733  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  967734 ctcacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 967770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 5 - 294
Target Start/End: Original strand, 17969246 - 17969536
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 104  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||    
T  17969246 tccactactctatttttgtctacgctacaagacaaaacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatccttca 17969344  T
Q  105 aaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt-cacg 203  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||| | |     
T  17969345 taggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttactca 17969443  T
Q  204 cctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  17969444 cctctatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctataaag 17969536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 24275221 - 24274987
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | || |    
T  24275221 tacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaatttgatcc 24275123  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  24275122 gtcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 24275024  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24275023 ctcacctctatataaaggagtaaagacttgaagattg 24274987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 19498024 - 19498257
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||  | || |    
T  19498024 tacctccactactctgtttgtgtctactctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcctttaagataggaatgaatttgaacttgatcc 19498122  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  19498123 ttcataggactacacccaaatcatgcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 19498221  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19498222 ctcacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 19498257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22774554 - 22774260
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  22774554 tacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 22774456  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  |  || ||||||||||| |    
T  22774455 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaggatctcaacgtctctct 22774357  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacataga-gatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
     |   |||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22774356 actaacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgataagagacaacatacaagtt-aaaagcgcctaaactctgtcaaatttgattctataaag 22774260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 4099979 - 4099819
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  4099979 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 4099880  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaa 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||    
T  4099879 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaa 4099819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 184 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4099825 - 4099715
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttg 283  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4099825 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttg 4099726  T
Q  284 attctacaaag 294  Q
    |||||||||||    
T  4099725 attctacaaag 4099715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20646640 - 20646873
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  20646640 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaacagctctgcctgcaaaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 20646738  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctcttt 199  Q
    |||| ||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||| |||||||||||||||||| |   || ||||||||||| |    
T  20646739 ttcataggacaacatccaaataaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggttctcaa-cgactctttagacgtgcttaaagatctcaacgtctctct 20646837  T
Q  200 -cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20646838 acacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 20646873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19356486 - 19356283
Alignment:
Q  30 tacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 129  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  19356486 tacaagacaagttaacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcctttataggactacacccaaatcaggcaaa 19356388  T
Q  130 ggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
     |||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | | | || ||||||||||||||||||||||    
T  19356387 agattactgatggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagatctcaacgtctctctactcaccactatataaaggagtgaagactt 19356289  T
Q  229 gaagat 234  Q
    ||||||    
T  19356288 gaagat 19356283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 22763850 - 22763556
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  22763850 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaccagctctacctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 22763752  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctct-t 198  Q
     ||| ||||  ||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  |  || ||||||||||| |    
T  22763751 gtcataggagaacatccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaggatctcaacgtctctct 22763653  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacataga-gatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
     | | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||   | |||  | ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  22763652 actcacctctatataaaggagtaaagacttgaaaattgataagagacaacatacaagtt-aaaagcgcctaaactctgtcaaatttgattctataaag 22763556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 4 - 234
Target Start/End: Original strand, 19313053 - 19313283
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 103  Q
    |||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| | || ||||    
T  19313053 ctccacaactctgagtgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagatagaaatgaatttgaagttgatccttc 19313151  T
Q  104 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgctgattatttcaacgtctct-ttca 201  Q
    | ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||| ||||||||| |  || ||||||||||| | ||    
T  19313152 ataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggtactc-aacgactctttaagacgtgcttaagatctcaacgtctctctaca 19313250  T
Q  202 cgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    | |||||||||||   |||||||||||||||||    
T  19313251 cacctctatataagaaagtgaagacttgaagat 19313283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 19300043 - 19300276
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| ||||||  | |||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  19300043 tacctccacaactctgagtgtgtctacgctaccagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagtttatcc 19300141  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactcttt-agacgtgctgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||| ||||||||| |  || |||||||||||      
T  19300142 ttcataggactacatccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggtactc-aacgactctttaagacgtgcttaagatctcaacgtctctcc 19300240  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     ||| ||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  19300241 acacacctctatataaaaaagtgaatacttgaagat 19300276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1084033 - 1083800
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  1084033 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatc 1083935  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  ||| | |||| ||   ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| |||||    
T  1083934 cttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattga-tcaaggcttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctt 1083836  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1083835 tcacacctctatataaaggagtgaagacctgaagat 1083800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 22779932 - 22779811
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  22779932 tacctccactactctatttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 22779834  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatca 123  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||    
T  22779833 ttcataggacaacatccaaatca 22779811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 28374548 - 28374595
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 48  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28374548 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagc 28374595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 234
Target Start/End: Original strand, 23392776 - 23392982
Alignment:
Q  28 gctacaagacaa-gacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggc 126  Q
    |||||||||||| || ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || | |||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  23392776 gctacaagacaatgataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaatagaaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacaaccaaatcaggc 23392874  T
Q  127 aaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaag 224  Q
    ||| ||| | |||||  |||| ||  ||||||| ||||||| | | |||||||| |   || |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23392875 aaaagatcattggtgattgatcaa--gatttcacaacgactttattgacgtgcttaaagatctcaacgactctttcacacctctatataaaggagtgaag 23392972  T
Q  225 acttgaagat 234  Q
    ||||||||||    
T  23392973 acttgaagat 23392982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21845980 - 21845930
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21845980 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacctgaagattgta 21845930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 28711779 - 28712007
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   |||| ||||||||| || ||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||  | ||     
T  28711779 tacctccactactctgtttttgtctctgctaaaagacaagaaaaacagctctgcctgca-atgatgttccttcacaatgggaatggatttgaaattgatc 28711877  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct---ttagacgtgctgattattt-caacgtct 195  Q
    ||||| ||||| | | | | |||||||||| ||| | |||||  |||| ||||   |||||||||||||   ||  | |||||||  |||| ||||||||    
T  28711878 cttcataggacaataactatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagc--ttcaaacgactctattttgaatgtgctgacaatttacaacgtct 28711975  T
Q  196 ctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28711976 ctttcacacctctatataaaggagtgaagact 28712007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 44880999 - 44880953
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44880999 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 44880953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 24814664 - 24814792
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  24814664 tacctccactactccgcttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatc 24814762  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 129  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  24814763 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 24814792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20567966 - 20567919
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20567966 caacgtctcattcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 20567919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 24425585 - 24425635
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatg 52  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24425585 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacaactatg 24425635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Original strand, 24801817 - 24801864
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24801817 tcaacgactctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 24801864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 40331922 - 40331879
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40331922 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 40331879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44840269 - 44840226
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44840269 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 44840226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24157672 - 24157622
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  24157672 caacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaagacttgaatattgta 24157622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24844035 - 24843985
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24844035 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaatattgta 24843985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 1587299 - 1587340
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1587299 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 1587340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 6392467 - 6392426
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6392467 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 6392426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 22785921 - 22785962
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22785921 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 22785962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24575866 - 24575821
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24575866 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttaaaga 24575821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 28551185 - 28551226
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28551185 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 28551226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 33074059 - 33074018
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33074059 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 33074018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 34322203 - 34322244
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34322203 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 34322244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 9015637 - 9015677
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9015637 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 9015677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19114915 - 19114875
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19114915 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 19114875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22317424 - 22317384
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22317424 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 22317384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 22455257 - 22455297
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22455257 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 22455297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 24850935 - 24850975
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24850935 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 24850975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 41121987 - 41122027
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  41121987 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 41122027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 1089198 - 1089151
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  1089198 tcaacgactctttcactcctctatataaaggagtgaagacctgaagat 1089151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22271964 - 22271917
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22271964 caacgtctctctcaaacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 22271917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 160 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 22383341 - 22383262
Alignment:
Q  160 aacgactctttagacgtgctgattattt-caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||| || |||||||  || | |||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  22383341 aacgactcttttgatgtgctgaaaatctacaacgtctcttttacacctctatataaataagtgaagacttgaagattgta 22383262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 23184573 - 23184612
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23184573 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 23184612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Original strand, 23595836 - 23595875
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23595836 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 23595875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Original strand, 28701482 - 28701521
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28701482 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 28701521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 225
Target Start/End: Original strand, 30557587 - 30557626
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaaga 225  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30557587 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaaga 30557626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #101
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18702571 - 18702533
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagac 226  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18702571 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagac 18702533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #102
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 190 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24376933 - 24376895
Alignment:
Q  190 acgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24376933 acgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 24376895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #103
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 10010020 - 10010065
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  10010020 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaaaacttaaaga 10010065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 18431207 - 18431252
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18431207 caacgtctctttcacacatctatataaaggagtgaagacctgaaga 18431252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #105
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 229
Target Start/End: Original strand, 39037911 - 39037952
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttg 229  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  39037911 caacgtctctttcacacctctatataaagaagtgaagacttg 39037952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 6574395 - 6574435
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  6574395 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaaaactt 6574435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 20152268 - 20152308
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  20152268 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaaaactt 20152308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 20569019 - 20569059
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20569019 caacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaagactt 20569059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 21537519 - 21537559
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  21537519 caacgtctctttcacacctctatataaagaagtgaagactt 21537559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 22755481 - 22755395
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 92  Q
    |||||||||||| |||||||  |||||||||||||| | ||||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  22755481 tccactactctg-ttttgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgtctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaa 22755395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24779205 - 24779165
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24779205 caacgtctcttacacacctctatataaaggagtgaagactt 24779165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25189229 - 25189189
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25189229 caacgtctcttttacacctctatataaaggagtgaagactt 25189189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 28140871 - 28140911
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  28140871 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagactt 28140911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40782308 - 40782268
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  40782308 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaatactt 40782268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 92
Target Start/End: Original strand, 20152112 - 20152198
Alignment:
Q  6 ccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 92  Q
    |||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  20152112 ccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaa 20152198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #116
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 226
Target Start/End: Original strand, 26619372 - 26619406
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagac 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26619372 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagac 26619406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #117
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 227
Target Start/End: Original strand, 31968317 - 31968351
Alignment:
Q  193 tctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  31968317 tctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 31968351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #118
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22802294 - 22802253
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  22802294 ttcaacgtctctttcacaactatatataaaggagtgaagact 22802253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #119
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 92
Target Start/End: Original strand, 31800971 - 31801059
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  31800971 ctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaa 31801059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #120
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 31801154 - 31801195
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  31801154 ttcaacgtctctttcacacctctatataacggagtaaagact 31801195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #121
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 232
Target Start/End: Original strand, 15670888 - 15670932
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaag 232  Q
    |||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15670888 caacgtatctttcatacctctatataaaggaatgaagacttgaag 15670932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #122
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19540247 - 19540207
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19540247 caacgtttctttcatacctctatataaaggagtgaagactt 19540207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #123
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22258032 - 22257992
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  22258032 caacgtctctttcacacctctacataaaggactgaagactt 22257992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #124
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 238
Target Start/End: Original strand, 24440985 - 24441036
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  24440985 ttcaacgtatctttcacacttctatatgaaggagtgaagactt-aagattgta 24441036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #125
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 28701310 - 28701350
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  28701310 tacctccactactttgtttttgtccctgctacaagacaaga 28701350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 135)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 4250623 - 4250915
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250623 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 4250721  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  4250722 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacatctctttc 4250821  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4250822 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacagaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 4250915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 23580384 - 23580678
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  23580384 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 23580483  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23580484 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 23580583  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23580584 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataagagatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 23580678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20441375 - 20441667
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20441375 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacaactatgcctacagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 20441474  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20441475 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaattc-aacgactctttagacgtgcttatcatctcaacgtctctttc 20441573  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20441574 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 20441667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 7689517 - 7689810
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7689517 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgtgaatgaatttgaagctaattc 7689615  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7689616 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacggctctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 7689715  T
Q  201 -acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
     | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7689716 tatgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 7689810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 154347 - 154639
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  154347 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattc 154445  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  154446 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 154545  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  154546 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaag 154639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 35013071 - 35012778
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35013071 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattc 35012972  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35012971 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctttc 35012872  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35012871 acacctctatataaaggagtgaagacttaaagataaaatatagagatatacaatttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 35012778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 39194152 - 39194444
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194152 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 39194250  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  39194251 ctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattccaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 39194350  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39194351 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaagatagatatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 39194444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 3 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5973910 - 5973614
Alignment:
Q  3 cctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 102  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973910 cctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattctt 5973812  T
Q  103 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc------tgattatttcaacgtctc 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||      | ||||| ||||||||||    
T  5973811 caaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattataattatctcaacgtctc 5973712  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5973711 tttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 5973614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 148272 - 148564
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  148272 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgtctgcagaatttgtgccttcaaagtgggaatgaatttgaagctaattc 148370  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  148371 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 148470  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  148471 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagagagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaag 148564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21877916 - 21877622
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21877916 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 21877817  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21877816 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 21877717  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21877716 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 21877622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12614374 - 12614668
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12614374 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 12614473  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12614474 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 12614573  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12614574 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12614668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12623839 - 12624133
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  12623839 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 12623938  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12623939 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 12624038  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12624039 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12624133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21863810 - 21863516
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21863810 tacctccactactctgttttctgtttacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 21863711  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21863710 tttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 21863611  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21863610 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 21863516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10997842 - 10998136
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  10997842 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 10997941  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  10997942 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagaagtgctgattatctcaacgtctcttt 10998041  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10998042 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgcagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 10998136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 39587118 - 39586826
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39587118 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 39587020  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  39587019 cttcaaaggactacactcaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 39586921  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39586920 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 39586826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 293
Target Start/End: Original strand, 5639768 - 5640061
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5639768 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcgtatt 5639867  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5639868 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5639967  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaa 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5639968 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaaaaaagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaa 5640061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 9050546 - 9050837
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||     
T  9050546 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatggtaatgaatttgaagctatttt 9050644  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  9050645 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaagaattactggtggatgatcaaaggaattcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 9050743  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9050744 acacttctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 9050837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 21895351 - 21895059
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21895351 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 21895252  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21895251 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 21895152  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21895151 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaacagagatatataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 21895059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4167408 - 4167114
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4167408 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaatagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 4167309  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4167308 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 4167209  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4167208 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagagagagatacataagttcaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 4167114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 4178064 - 4177770
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4178064 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcaaaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 4177965  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4177964 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 4177865  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | | ||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4177864 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagagagagatacataagttcaaaagcaccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 4177770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 5650325 - 5650619
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5650325 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacaaccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcgtatt 5650424  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5650425 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 5650524  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5650525 cacgcctctatataaaagagtgaagacttgaagattgaaaaaagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 5650619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12730696 - 12730402
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12730696 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 12730597  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12730596 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 12730497  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12730496 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagtgagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12730402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12741289 - 12740995
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12741289 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 12741190  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12741189 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 12741090  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12741089 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattaaagtgagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12740995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 33084711 - 33084417
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||| |||| |||| | |||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33084711 tacctccactactctattttctgtctatgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 33084612  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33084611 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 33084512  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33084511 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgagatagagatacataagttcaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 33084417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 47195410 - 47195118
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47195410 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagtcatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttaatt 47195312  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  47195311 cttcaaaggactacacccaaatcaggcgaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 47195213  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47195212 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagaatgtagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 47195118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18381962 - 18382253
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18381962 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 18382060  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  18382061 ttcaaaggactacatccaaatcaggcaaaggattactagtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgttaatcatctcaacgtctctttc 18382159  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18382160 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagaatatagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 18382253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12898041 - 12898333
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12898041 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 12898140  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12898141 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 12898240  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  || | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12898241 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--taaacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 12898333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7507451 - 7507157
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7507451 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 7507352  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7507351 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 7507252  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7507251 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 7507157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 7518048 - 7517754
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  7518048 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 7517949  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  7517948 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 7517849  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7517848 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 7517754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19187987 - 19187693
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  19187987 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttact 19187888  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19187887 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 19187788  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19187787 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagtgagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19187693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 51629245 - 51629539
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  51629245 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 51629344  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51629345 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 51629444  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51629445 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 51629539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 51656506 - 51656800
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  51656506 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 51656605  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51656606 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 51656705  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  51656706 cacacctctatataaaggaatgaagacttgaagatttaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 51656800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 35648748 - 35649043
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35648748 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 35648847  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35648848 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 35648947  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35648948 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 35649043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 19179108 - 19178814
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| | |    
T  19179108 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttact 19179009  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19179008 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaatgattactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 19178909  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   |   ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19178908 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagtgagagatacacaagttaaaaagcgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaag 19178814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 2538684 - 2538394
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||  | ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2538684 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagttt-tgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 2538586  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2538585 tttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 2538486  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaca 291  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2538485 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaatatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaca 2538394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5833368 - 5833073
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5833368 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 5833269  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5833268 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 5833169  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5833168 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aagatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 5833073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5843970 - 5843675
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  5843970 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 5843871  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5843870 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 5843771  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5843770 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aagatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 5843675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 35638096 - 35638391
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35638096 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 35638195  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  35638196 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacctgctgattatctcaacgtctctt 35638295  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35638296 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactcggtcaatttgattctacaaag 35638391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 47607988 - 47608283
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  47607988 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 47608087  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47608088 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 47608187  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47608188 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aagatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 47608283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 47618596 - 47618891
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  47618596 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 47618695  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47618696 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 47618795  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  47618796 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aagatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 47618891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 35401222 - 35401517
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35401222 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 35401321  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35401322 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtactgattatctcaacgtctctt 35401421  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35401422 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactaaaaag 35401517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 35404449 - 35404744
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  35404449 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 35404548  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  35404549 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtactgattatctcaacgtctctt 35404648  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  35404649 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaacagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactaaaaag 35404744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38095226 - 38094931
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  38095226 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttgat 38095127  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38095126 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 38095027  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38095026 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgatagaaaaatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 38094931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 38105851 - 38105556
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  38105851 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagttgat 38105752  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38105751 ccttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 38105652  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | | | ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38105651 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgatagaaaaatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 38105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 17957388 - 17957096
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17957388 tacctccattactctgtttttgtctacactacaagacaagaaaacaaccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 17957290  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17957289 ttcaaaggactacacccatatcaggcaaagaattactggtggaagatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatttcaacgtctctttc 17957191  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagtt-caaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17957190 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattggagatagagacatacaagttaaaaaagcgccaaaaccctgtcaatttgattctacaaag 17957096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36236488 - 36236781
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||  | |||    
T  36236488 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaaatttatt 36236586  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36236587 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36236686  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36236687 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataaaagagagaaatacagaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36236781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36247035 - 36247328
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||  | |||    
T  36247035 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaat-tgtacactcaagatgggaaggaatttgaaatttatt 36247133  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36247134 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 36247233  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||   | | ||| ||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36247234 cacgcctctataaaaaggagtgaagacttgaagataaaagagagaaatacagaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 36247328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3171772 - 3171477
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  3171772 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 3171673  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3171672 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 3171573  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatata--caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3171572 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaataggaatatacgcaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 3171477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 3182374 - 3182079
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  3182374 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 3182275  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3182274 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctctt 3182175  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatata--caagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3182174 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat--aaaataggaatatacgcaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctaaaaag 3182079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 11195125 - 11195419
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  11195125 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctttgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcc 11195223  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  11195224 ttcaaaggactacactcaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 11195323  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  11195324 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggtaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 11195419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 146; E-Value: 6e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 20195751 - 20196043
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| | || |    
T  20195751 tacctccactactctgttcttgtccacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaat-tgttccatcaagatgggaatgaatttgaagttgatcc 20195849  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  20195850 ttcaaaggacttcacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct-aaaatctcaacgtctctttc 20195947  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  20195948 acaccactatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 20196043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 129; E-Value: 9e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 14388184 - 14388418
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  14388184 tacctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 14388282  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  14388283 ttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 14388381  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    | | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14388382 ctcaccactatataaaggagtgaagacttgaagattg 14388418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 675595 - 675301
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |    
T  675595 tacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaaaatgggaatgaatttgaagttgatcc 675497  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||| | |     
T  675496 ttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctttcta 675398  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | ||||||||||||| |||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  675397 ctcacctctatataaagcagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 675301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 18311030 - 18311324
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  18311030 tacctccactactctgtttctgtctacgctacaagacaagacaacagctctacctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 18311128  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||| |  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  18311129 ttcataggactacacccaaatcaagcaaaagattactggtgaatgatcaaagaaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 18311227  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  18311228 ctcaccactatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcaccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 18311324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 41132673 - 41132968
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| | || |    
T  41132673 tacctctactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaac-tgttccttcaaaatgggaatgaatttgaagttgatcc 41132771  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || || |||||||||||| ||| | |  || ||||||||||| |    
T  41132772 ttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aatgactctttagacatgctttaaaatctcaacgtctctct 41132870  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
     | | || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  41132871 actcaccactatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctataaag 41132968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 20799068 - 20798794
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||  | |||||||||||||||    
T  20799068 tgtcctcgctacaagacaaaataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcctctataggactacacccaaa 20798970  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatt-tcaacgtctct-ttcacgcctctatataaagga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  20798969 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgct-ataattctcaacgtctctctactcacctctatataaagga 20798872  T
Q  219 gtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  20798871 gtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 20798794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 234
Target Start/End: Original strand, 46180963 - 46181169
Alignment:
Q  27 cgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggc 126  Q
    ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||    
T  46180963 cgctacaagacaagttaacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggc 46181061  T
Q  127 aaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggagtgaaga 225  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | |   || |||||||||||||||||||    
T  46181062 aaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaagatctcaacgtctctctacttaccactatataaaggagtgaaga 46181160  T
Q  226 cttgaagat 234  Q
    |||||||||    
T  46181161 cttgaagat 46181169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 294
Target Start/End: Original strand, 22610052 - 22610326
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||  | || ||| | |||||||||| ||||    
T  22610052 tgtcctcgctacaagacaatataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaatttgatcctttataggactacactcaaa 22610150  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  22610151 tcaggcaaaagattactgatggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcacctctatataaaggag 22610249  T
Q  220 tgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  22610250 tgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 22610326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Original strand, 20883960 - 20884174
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| | | |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  20883960 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgccagcagaat-tcttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 20884058  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |   | ||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  20884059 tcaggcaacagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgctaaaagtctcaacgtctctctactcacctctatataaaggag 20884157  T
Q  220 tgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||||||||||    
T  20884158 tgaagacttgaagattg 20884174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 23927062 - 23926795
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||| | |||||||||||||||    
T  23927062 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctacagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatcctttataggactacacccaaa 23926964  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  23926963 tcaggcaaaagattactagtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcacctctatataaaggag 23926865  T
Q  220 tgaagacttgaagattgtacatagagatat----acaagttcaaaagcgccaaaactctg-tcaatttgattct 288  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||    ||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||    
T  23926864 tgaagacttgaagactg---atagagatatcaacacaagtt-aaaagcgtcaaaactctgctaaatttgattct 23926795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 21 - 179
Target Start/End: Original strand, 45070731 - 45070887
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| |||||    
T  45070731 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaa 45070829  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct 179  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||  || ||||| ||||||||||||||    
T  45070830 tcaggcaaaagattagtggtgaatgatcaaaggaactc-aacgattctttagacgtgct 45070887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 17371066 - 17370833
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | || |||| ||||||||||| |||| |||||| ||| |||||| |||||||  | ||     
T  17371066 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcagaa-atgttccttcatgataggaatggatttgaacgtgatc 17370968  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  17370967 cttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactct 17370870  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17370869 ttcacatctctatataaaggagtgaagacttgaagat 17370833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5929727 - 5929496
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  5929727 tacctccacgactctgattgtgtctacgctacaagacaagacaccagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatcc 5929629  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||   | |||| ||   |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  5929628 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt--attgatcaaggtttctcaacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctctcta 5929531  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5929530 cacacccctatataaaggaatgaagacttgaagat 5929496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 44201035 - 44200803
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||      
T  44201035 tacctccacgactctgtttgtgtctacgctacaagacaagataacaactttgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatct 44200937  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||| ||| ||| | ||||   |||| ||||| ||   |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  44200936 ttcataggacaacatccaaatcaggaaaaagatcattggt-attgatcaaaggtttctcaacgactctttagacgtgcttaagatctcaacgtctctcta 44200838  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||| || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  44200837 cacaccactatataaaggaatgaagacttgaagat 44200803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22655501 - 22655267
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||| | ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  22655501 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaatgtgatc 22655403  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgct--gattatttcaacgtctc 196  Q
    ||||  ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||||   |  || |||||| |||    
T  22655402 cttcttaggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgactgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacgtgcttaaaagatctcaacgactc 22655305  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22655304 tttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 22655267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Original strand, 19170394 - 19170624
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttc 103  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||| |||||| |||||||  | || ||||    
T  19170394 tccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttcgttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttc 19170492  T
Q  104 aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactct-ttagacgtgct-gattatttcaacgtctctttc 200  Q
    | ||||| ||| |||||||| ||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||| ||||| || || |||||  |  || ||||||||||||||    
T  19170493 ataggacaacaaccaaatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaactactctatttgaagtgctaaaagatctcaacgtctctttc 19170590  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19170591 acatctctatataaaggagtgaagacttgaagat 19170624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28474251 - 28474075
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| |||||||  | || |    
T  28474251 tacctccacgactctgcttgtgtctgcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttcctttaagataggaatggatttgaacgtgatcc 28474153  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct 179  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||||    
T  28474152 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgct 28474075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 28380019 - 28379786
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||  || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||  |||||||  | || |    
T  28380019 tacctccacgactctaattgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaattgatttgaacgtgatcc 28379921  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||| |    
T  28379920 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctct 28379822  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     ||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28379821 acacacatctatataaaggagtgaagacttgaagat 28379786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 21544053 - 21543820
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||| |||||||| | |||||| |||||||  | |||    
T  21544053 tacctccactactttgcttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaa-atgttccttcaagttaggaatggatttgaacatgatt 21543955  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  21543954 ctttataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactct 21543857  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||  | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  21543856 ttcacatcactatataaaggaatgaagacttgaagat 21543820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 22464865 - 22465093
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| || ||||| |||||||| || |||| ||||||  ||||||||| |||||||  | ||     
T  22464865 tacctccactactctatttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-aagatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatc 22464963  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct--ttagacgtgctgattattt-caacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| | | ||| |||||||||| ||| | |||||  |||| ||||   |||||||||||||  || || |||||||  |||  |||||||||    
T  22464964 cttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaagc--ttcaaacgactctattttgatgtgctgacaattcacaacgtctc 22465061  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22465062 tttcacacctctatataaaggagtgaagactt 22465093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 19038031 - 19037797
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || ||||  ||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | |||    
T  19038031 tacctccacgactctgattgtgtctgcgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatt 19037933  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct- 197  Q
    ||| | ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || |||||||||||     
T  19037932 ctttataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctc 19037834  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19037833 tacacacctctatataaaggagtgaagacttgcagat 19037797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20251798 - 20251566
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| | ||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |    
T  20251798 tacctccacgactctgcttgtgtctatgctacaaaacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatcc 20251700  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||   | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||| |    
T  20251699 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggt--attgatcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctct 20251602  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20251601 acacacctctatataaaggagtaaagacttgaagat 20251566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22019360 - 22019127
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  22019360 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctcttcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatc 22019262  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||     
T  22019261 cttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctc 22019163  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22019162 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 22019127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 52350742 - 52350869
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||| |||| |||||||| | |||||| |||||||  | || |    
T  52350742 tacctccacaactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataatagctctgcctgcagaa-atgtcccttcaagttaggaatggatttgaacttgatcc 52350840  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 129  Q
    |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  52350841 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 52350869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20909245 - 20909198
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909245 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 20909198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 24028751 - 24028974
Alignment:
Q  10 tactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaac-agctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaagg 108  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||| |||||||| |  ||||  |||||||  | || ||| | ||     
T  24028751 tactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaatagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagttatgaatagatttgaacgtgatcctttataga 24028849  T
Q  109 actacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctctttcacgcct 206  Q
    || ||| ||||||| |||||| ||| | |||||  |||| || |  ||||| ||||||||| | |||||||| |   || |||||| ||||||||| |||    
T  24028850 acaacatccaaatctggcaaaagatcattggtgattgatcaagg--tttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctttcacacct 24028947  T
Q  207 ctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  24028948 ctatataaaggagtgaagacttgaaga 24028974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Complemental strand, 12946864 - 12946818
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacag 47  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12946864 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacag 12946818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Original strand, 18130254 - 18130304
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18130254 caacgtctctttcacacctctatatataggagtgaagacttgaagattgta 18130304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 25448622 - 25448849
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||  | ||     
T  25448622 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca-acgatgttccttcacaatgggaatgcatttgaaattgatc 25448720  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactc---tttagacgtgctgattatttcaacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| ||| ||| ||||||||||| || | || ||  |||| ||| |  ||||||||||||   |||  | ||||||   | |||||||||||    
T  25448721 cttcataggacaacaaccatatcaggcaaagaatcattgatgattgatcaaaag-cttcaaacgactctattttgaatgtgctg-gcaattcaacgtctc 25448818  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  25448819 tctcacacctctatataaaggagtgaagact 25448849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Original strand, 7745331 - 7745378
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  7745331 tcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacctgaagat 7745378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 21135400 - 21135443
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21135400 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 21135443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 21205113 - 21205156
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21205113 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 21205156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 21984435 - 21984392
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21984435 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 21984392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 22642919 - 22642685
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga-caacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| ||| ||||||||||||  ||||| | ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  22642919 tacctccacgactctgcttgtgtctacggtacaagacaagataaacagttctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatc 22642821  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgct--gattatttcaacgtctc 196  Q
    ||||  ||||| ||| |||||| ||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||| ||   |  || |||||  |||    
T  22642820 cttcttaggacaacatccaaataaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacgttcttaaaagatctcaaccactc 22642723  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22642722 tttcacacctttatataaaggagtgaagacttgaagat 22642685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 46088829 - 46088786
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  46088829 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 46088786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 188 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 9346609 - 9346559
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9346609 caacgtctccttcacacctctatataaaggagtgaagagttgaagattgta 9346559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 10250824 - 10250783
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10250824 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 10250783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 160 - 236
Target Start/End: Original strand, 20867068 - 20867145
Alignment:
Q  160 aacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt-cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20867068 aacgactctttggacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 20867145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 35040005 - 35039964
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35040005 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 35039964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 48570473 - 48570514
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  48570473 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 48570514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2834525 - 2834485
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2834525 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 2834485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 12624799 - 12624839
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12624799 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 12624839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #93
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29215632 - 29215592
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29215632 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 29215592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #94
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 33256595 - 33256635
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33256595 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 33256635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #95
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 33276767 - 33276807
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33276767 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 33276807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #96
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Original strand, 34255759 - 34255807
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34255759 tcaacgtctcttttacacctctatataaaggagtgaagacctgaagatt 34255807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Original strand, 18517404 - 18517455
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18517404 tcaacgcctctttcacatctctatataaatgagtgaagacttgaagattgta 18517455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #98
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 21121304 - 21121347
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  21121304 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgtagact 21121347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #99
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 21214917 - 21214960
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  21214917 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagttaagact 21214960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #100
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23054204 - 23054157
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23054204 caacgtctctttcacatctctatacaaaggagtgaagacttgaagatt 23054157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #101
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Original strand, 26548499 - 26548546
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26548499 tcaacgactctctcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 26548546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #102
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 42284468 - 42284425
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  42284468 atttcaacgtctctttcacaactctatataaaggagtgaagact 42284425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #103
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21702652 - 21702610
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21702652 ttcaacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagactt 21702610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #104
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1900369 - 1900141
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| |||||||| |  || | ||||||  ||||| ||| |||||||  | ||     
T  1900369 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca-acaatattccttcacaatggggatggatttgaaattgatc 1900271  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactc--tttagacgtgctgattatt-tcaacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| | | ||| |||||||||| ||| | |||||  |||| ||||   ||||||||||||  ||| || ||||||   |||  |||||||||    
T  1900270 cttcataggacaataaccatatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaaag--cttcaaacgactctattttgatgtgctggcaattcacaacgtctc 1900173  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  1900172 tttcgcacctctatataaaggaatgaagactt 1900141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #105
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2268367 - 2268327
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  2268367 caacgtctctttcacacctctatataatggagtgaagactt 2268327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12284259 - 12284219
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  12284259 caacgtctctttcacacctctatataaagaagtgaagactt 12284219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 16235540 - 16235580
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  16235540 caacgtctctttcacacctccatataaaggagtgaagactt 16235580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #108
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 21192109 - 21192149
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21192109 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 21192149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #109
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 220
Target Start/End: Original strand, 21206873 - 21206909
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagt 220  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21206873 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagt 21206909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 22201980 - 22202020
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  22201980 caacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaagactt 22202020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 22600426 - 22600466
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22600426 caacgtctctttcacacctctataaaaaggagtgaagactt 22600466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 26702373 - 26702413
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26702373 caacgtctttttcacacctctatataaaggagtgaagactt 26702413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 32786182 - 32786222
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  32786182 caacgtctcttttacacctctatataaaggagtgaagactt 32786222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 36134025 - 36133985
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36134025 caacgtctcttccacacctctatataaaggagtgaagactt 36133985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 38282403 - 38282363
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  38282403 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaatactt 38282363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17018416 - 17018369
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17018416 caacgtctcttttacacgtctatataaaggagtgaaaacttgaagatt 17018369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 190 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18614750 - 18614707
Alignment:
Q  190 acgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18614750 acgtatctttcacacctctatataaaggagtgaagacgtgaaga 18614707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 20110193 - 20110240
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20110193 caacgtctctttcataactctatataaaggagtgaagactttaagatt 20110240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 23935333 - 23935380
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  23935333 caacgtctctttcatacctctatataaaagaatgaagacttgaagatt 23935380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 200 - 235
Target Start/End: Original strand, 52350939 - 52350974
Alignment:
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52350939 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 52350974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #121
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 14263695 - 14263737
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctcttt-cacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14263695 ttcaacgtctcttttcacacctctatataaaggagtgaagact 14263737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #122
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 204 - 238
Target Start/End: Original strand, 21684325 - 21684359
Alignment:
Q  204 cctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21684325 cctctatataaaggagtaaagacttgaagattgta 21684359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #123
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 36134214 - 36134156
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  36134214 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 36134156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 191 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10757256 - 10757219
Alignment:
Q  191 cgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  10757256 cgtctctttcacacctctgtataaaggagtgaagactt 10757219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 221
Target Start/End: Original strand, 18896839 - 18896872
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtg 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18896839 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtg 18896872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30572035 - 30571994
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  30572035 ttcaatgtctctttcacacctctatataaatgagtgaagact 30571994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 37642268 - 37642215
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgc 57  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37642268 tccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgc 37642215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 44824004 - 44824045
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  44824004 ttcaacgtctctttcaaacttctatataaaggagtgaagact 44824045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2266925 - 2266885
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  2266925 caacgtctttttcacacatctatataaaggagtgaagactt 2266885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7309655 - 7309615
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||    
T  7309655 caacgtctctttctcacctctatttaaaggagtgaagactt 7309615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21028626 - 21028590
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  21028626 gtctctttcacacctctatataaaggagtgatgactt 21028590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22153693 - 22153653
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  22153693 caacgtctctttcacacctctatataaaagagtgaaaactt 22153653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 22153881 - 22153841
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22153881 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22153841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30892929 - 30892889
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||    
T  30892929 caacgtctctttcacacctctatgtaaaggaatgaagactt 30892889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 35040190 - 35040150
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  35040190 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 35040150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10656 - 10948
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10656 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 10755  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  10756 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttc 10854  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10855 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 10948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 238; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 7809 - 8101
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7809 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 7908  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  7909 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcctctcaacgtctctttc 8007  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8008 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagtgccaaaactctgtcaatttgattatacaaag 8101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 54178 - 54470
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54178 tacctccactactctgtttt-gtccatgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 54276  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  54277 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaattatctcaacgtctctttc 54376  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54377 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgagaagtgagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 54470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 14786 - 14492
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  14786 tacctccactactctgctttctgtctacgctacaagacaagacaacagccatgcctgcagaatttgtaccttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 14687  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14686 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 14587  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  14586 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataagatatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaagttgattctacaaag 14492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 5874 - 5915
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5874 ttcaacgtctctctcacacctctatataaaggagtgaagact 5915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 2273 - 2565
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2273 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcttgcagattttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 2371  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  || || ||||||||||||||    
T  2372 ttcaaaggactacaccaaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggattacaaacgactctttagacgtgcaaatcatctcaacgtctctttc 2471  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2472 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 2565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 230; Significance: 1e-127; HSPs: 3)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 32958 - 33249
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32958 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 33056  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  33057 ttcaaaggactacacctaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctctttc 33155  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33156 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 33249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 40507 - 40801
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  40507 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 40606  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40607 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 40706  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatac--aagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40707 cacgcctctatataaaagagtgaagacttgaagat--taaatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 40801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9737 - 9701
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  9737 gtctctttcacacctctatataaatgagtgaagactt 9701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 36789 - 37081
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36789 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagaaaaacagccatgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 36887  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||  |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  36888 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctcttt 36986  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36987 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatacacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 37081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 42575 - 42867
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575 tacctccactactctgtttt-gtcctcgctacaagacaagacatcagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 42673  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||    
T  42674 ctcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattattggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaacgtctccttc 42773  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42774 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagaaagagatacacaagttaaaaagcgccgaaactctgtcaatttgattctacaaag 42867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133; HSP #2
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 31334 - 31040
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||| | |||    
T  31334 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagtttatt 31235  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  31234 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 31135  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31134 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatttaagatagagatacataagtttaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 31040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 6896 - 7190
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6896 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaagttgtacgttcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 6995  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  6996 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 7095  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7096 cacacctctatataaaggagtgaagacttgaagataaaagatagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatactacaaag 7190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0272 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0272
Description:

Target: scaffold0272; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 286
Target Start/End: Original strand, 13662 - 13945
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13662 tacctccactactatgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcataat-tattccttcaagatgggaatgaatttgaagcttattc 13760  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||||| | || || ||||||||||||||    
T  13761 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggaactcaa-cgactctttagacgtggtaatcatctcaacgtctctttc 13859  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatt 286  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13860 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaggattggagatagagatatacaagttaaaaagcgccaaaactctgtcaatttgatt 13945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 52157 - 52453
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccac----gctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagcta 96  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||    ||| |||||||||| ||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52157 tacctccactactctgtttttgtctacctacgctgcaagacaagataacagctctgcctgcataa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagcta 52255  T
Q  97 attcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctc 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | || || ||||||||||    
T  52256 attcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactgatgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgttaatcatctcaacgtctc 52355  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52356 tttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagagatatacaagttaaaaagtgtcaaaactctgtcaatttgattctacaaag 52453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0105
Description:

Target: scaffold0105; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8164 - 7869
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  8164 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 8065  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  8064 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgactatctcaacgtctctt 7965  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7964 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 7869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 37011 - 37306
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  37011 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 37110  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  37111 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgactatctcaacgtctctt 37210  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | | ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37211 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatttgatagagatatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 37306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0105; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 47645 - 47785
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgcct-tcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| | ||    
T  47645 tacctccactactctgttttctgtctacgctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacaactcaagatgggaatgaatttgaagtttat 47744  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactgg 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  47745 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggatcactgg 47785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0386 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0386
Description:

Target: scaffold0386; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 12558 - 12265
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttt-tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  12558 tacctccactactctgttttctgtctactctacaagacaaaacaacagccatgcctgcagaatttgtacactcaagatgggaatgaatttgaagcttatt 12459  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12458 cttcaaaggactacacctaaatcaggcaaagaatcactggtggataatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatctcaacgtctcttt 12359  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  | | ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12358 cacgcctctatataaagga-tgaagacttgaagattaaaaacagagatacataagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 12265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 170; Significance: 3e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 3e-91
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 12170 - 12464
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  12170 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcc 12268  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  12269 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactcaaacgactctttagacgtgctaaaaatttcaacgtctctttc 12368  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  12369 acacctctatataaaggagtgaggacttgaagattggccagagacattaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 12464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 16001 - 16092
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 93  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16001 tacctacactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctccgcctgcagaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaag 16092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 166; Significance: 7e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 7e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 5497 - 5204
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5497 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 5399  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  5398 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 5300  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  5299 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattggcaagagacatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctaaaaag 5204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0497 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0497
Description:

Target: scaffold0497; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 10342 - 10635
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||| | ||||    
T  10342 tacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttcctttaagatgggaatgaatttgaagttgattc 10440  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||| ||||| |  || ||||||||||||||    
T  10441 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagatgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 10539  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatat----acaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||    ||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10540 acacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg--ccaagagatatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgccaaatttgattctacaaag 10635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 4)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 56836 - 57130
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  56836 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgattc 56934  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |     
T  56935 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctcta 57033  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    | | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  57034 ctcacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgaaaagagatatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctaaaaag 57130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 8 - 234
Target Start/End: Original strand, 464 - 690
Alignment:
Q  8 actactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaa 106  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||  || |||||| |||||||  | || ||| | |    
T  464 actactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccctcagaataggaatggatttgaacttgatcctttata 562  T
Q  107 ggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctctttcacgc 204  Q
    |||| |||   |||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | |||||||| |   || |||||| ||||||||| |    
T  563 ggacaacaagtaaatcaggcaaacgatcattggtgattgatcaa--gttttcagaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctttcacac 660  T
Q  205 ctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  661 ctctatataaaggagtgaagacttaaagat 690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32322 - 32282
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  32322 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaatactt 32282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 49169 - 49129
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  49169 caacgtctcattcacacctctatgtaaaggagtgaagactt 49129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3000 - 2824
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3000 tacctccactactctgtttt-gtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccctcaagatgggaatgaatttgaagcttattc 2902  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc 178  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2901 ttcaaaggagtacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc 2824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 175526 - 175233
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  175526 tacctccactactctatttatgtctacgctacaggacaagacaacagctttgtttgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctgatcc 175428  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctctttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||||||    
T  175427 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctttc 175329  T
Q  201 acgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagat--atacaagttcaaaagcgccaaaactctgtc-aatttgattctacaaag 294  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||   | ||| ||  | ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  175328 acacctctatataaaggagtgaagactttaagattggcaagagatatcaacacaagtt-aaaagcgccaaaactctgtcaaatttgattctacaaag 175233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 40399 - 40632
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  40399 tacctccacgactctgcttgtgtcttcgctacaagacaagtataacagctttgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatc 40497  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | |   | |||||||||||     
T  40498 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgcttaaaggtctcaacgtctctc 40596  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40597 tacaacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 40632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Original strand, 58988 - 59178
Alignment:
Q  43 aacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgg 142  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| | ||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||      
T  58988 aacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataagacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaa 59086  T
Q  143 atgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| ||||| | || ||||||||||||||||||| | |   | ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  59087 atgatcaaaggttctc-aacgactctttagacgtgcttaaaggtctcaacgtctctctaaaacctctatataaaggagtgaagactttaagat 59178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 35739 - 35505
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |    
T  35739 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttaatcc 35641  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt- 199  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||     
T  35640 ttcacaggactacacccaaatcaggcaaaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctcttta 35542  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35541 gtcacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 35505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 141 - 1
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  141 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatttgtgccttcaagatgggaataaatttgaagctaattc 42  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtg 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 4)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 141007 - 140773
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| | || |    
T  141007 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgagtttgaagttgatcc 140909  T
Q  101 ttc-aaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-t 198  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| |    
T  140908 ttcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctct 140810  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
     | | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  140809 actcacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 140773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 5 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 127844 - 127615
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttca 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || |||||    
T  127844 tccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttca 127746  T
Q  105 aaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacg 203  Q
     ||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | | |     
T  127745 taggacaacatccaaatcaggcaaacgattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactca 127647  T
Q  204 cctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  127646 cctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 127615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Original strand, 7704 - 7938
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| ||||||  | ||||  |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| | ||||||||  |||||||||||||  | ||     
T  7704 tacctccacgactctgagtgtgtctgcgctacaagacaagtataacagctctgcctgcagaa-atgttcattcaagatatgaatgaatttgaacttgatg 7802  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||  ||||| ||||| | |||| ||||||||| |||||||| |   || ||||||||||||    
T  7803 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtaaatgatcaaaggttctcaa-cgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctt 7901  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7902 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 7938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 215769 - 215810
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  215769 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 215810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 147
Target Start/End: Original strand, 6273 - 6419
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6273 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaatttgtgccttaaagatgggaatgaatttgaagctaattc 6372  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgat 147  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6373 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgat 6419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 294
Target Start/End: Original strand, 16989 - 17299
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtcca-cgctacaagacaagacaacagctatgcctg---ca-gaatatgtgccttcaa-gatgggaatgaa--tttgaa 92  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    || |||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||    
T  16989 tacctccactactctgtttttgtccaacgctacaagacaagacaacacctatgcctcgtacacgaatttgtgccttcaaagatgggaatgaaattttgaa 17088  T
Q  93 gctaattcttcaaaggac-tacacccaaatcaggcaaaggatta-ctggtggatgattaaagga-tttcaaacgact-ctttagacgtgctgattatt-t 187  Q
    | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || | | |    
T  17089 gttaattcctcaaaggacctacacccaaatcaggcaaaggattaactggtgaatgatcaaaggaatttcaaacgactactttagacgtgctaatcaatct 17188  T
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgtacatagagatatacaagttcaaaa--gcg-ccaaaactctgtcaa-tttg 283  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||   || ||||||||||||||| ||||    
T  17189 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagacttgaagattgtagatagatatatacaagttaaaaaagacgcccaaaactctgtcaattttg 17288  T
Q  284 attctacaaag 294  Q
    |||||||||||    
T  17289 attctacaaag 17299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 19452 - 19242
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtcc--acgctacaagacaagacaacagct-atgcctgca----gaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 93  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||| || ||||||  |    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19452 tacctccactactctgtttttgttccaacgctacaagacaagacaacaccttatgcctcgacaccgaatttgtgccttcaagatgggaatgaatttgaag 19353  T
Q  94 ctaa-ttcttcaaa-ggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaac 191  Q
     ||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||    
T  19352 ttaaattcctcaaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtgaatgatcaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctaatcatctcaac 19253  T
Q  192 gtctctttcac 202  Q
    |||||||||||    
T  19252 gtctctttcac 19242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 4)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 117300 - 117148
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  117300 tacctccgctactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcaaaat-tgttccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 117202  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaagga 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  117201 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgatcaaagga 117148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 475336 - 475569
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  475336 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaacatgatc 475434  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||     
T  475435 cttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttcttaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctc 475533  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  475534 tcacaccactatataaaggagtgaagacttgaagat 475569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 481856 - 482089
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||  | ||     
T  481856 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaacatgatc 481954  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||     
T  481955 cttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttcttaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctc 482053  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  482054 tcacaccactatataaaggagtgaagacttgaagat 482089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 234
Target Start/End: Original strand, 156741 - 156945
Alignment:
Q  30 tacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 128  Q
    |||||||||||| || ||||| | |||||||||| ||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  156741 tacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaat-tgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatccttcataggacaacatccaaatcaggcaa 156839  T
Q  129 aggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagac 226  Q
    | ||| | |||||  |||| || |  ||||| ||||||||| | |||||||| |   || |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  156840 aagatcattggtgattgatcaagg--tttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactctctcacacctctatataaaggagtgaagac 156937  T
Q  227 ttgaagat 234  Q
    ||||||||    
T  156938 ttgaagat 156945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0481 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0481
Description:

Target: scaffold0481; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 236
Target Start/End: Original strand, 12879 - 13113
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| || | || |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  12879 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctatgcatgaaaaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatac 12977  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  ||  |||||||||| |     
T  12978 ttcaaaggactacaaccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatcccaacgtctctcta 13076  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    | | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13077 ctcacctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 13113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2196 - 1963
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |    
T  2196 tacctccactactctatttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatcc 2098  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctcttt- 199  Q
     ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||     
T  2097 gtcacaggactacacccaaattaggcaaaagattaatggtgaatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctcttta 1999  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1998 ctcacctctatataaaggaatgaagacttgaagatt 1963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 40704 - 40552
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || |    
T  40704 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagatgggaatgaatttgaagttgatcc 40606  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaagga 154  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||    
T  40605 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaagattattggtggatgatcaaagga 40552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 40519 - 40470
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40519 tcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaggacttgaagattg 40470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15931 - 15698
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| |||||||||  |||||||||| |||| | || |    
T  15931 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagacaacatctctgcctgcagaa-atgttccttcaagaaaggaatgaattagaagttgatcc 15833  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-tt 199  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||| || |  || ||||||||||| |     
T  15832 ttcataggactacacccaaatcaagcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgttctaaaaatctcaacgtctctcta 15734  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    | | ||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  15733 ctcacctctatttaaaggagtaaagacttgaagatt 15698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0752
Description:

Target: scaffold0752; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1387 - 1174
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| | |||||    
T  1387 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactatatccaaa 1289  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||    
T  1288 tcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaaaatctcaacgtctctctacacacctctatataaggaag 1190  T
Q  220 tgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  1189 tgaagacttgaagatt 1174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0752; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2002 - 1789
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||| | |||||    
T  2002 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactatatccaaa 1904  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | ||    
T  1903 tcaggcaaaagattactggtagatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgcttaaaatctcaacgtctctctacacacctctatataaggaag 1805  T
Q  220 tgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||||    
T  1804 tgaagacttgaagatt 1789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 28871 - 29084
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||    
T  28871 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcctttaagattggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaa 28969  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaagga 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||||||||||  |  || ||||||||||| | | | |||||||||||||||    
T  28970 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaaatctcaacgtctctctactcacctctatataaagga 29068  T
Q  219 gtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||| ||||||    
T  29069 gtgaagactcgaagat 29084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 58483 - 58271
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||    
T  58483 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacctaaa 58385  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||||| |||||| |  || ||||||| ||| | | | ||||||||||||||||    
T  58384 tcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagtcgtgctaaagatctcaacgtatctctactcacctctatataaaggag 58286  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
     ||||||||||||||    
T  58285 cgaagacttgaagat 58271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 234
Target Start/End: Original strand, 59366 - 59577
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaa 120  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||    
T  59366 tgtcctcgctacaggacaagataacagctctgcctgcagaat-tgt-ccttcaagataggaatgaatttgaagttcatccttcataggactacacctaaa 59463  T
Q  121 tcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggag 219  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||| |  || ||||||||||| | | | ||||||||||||||||    
T  59464 ttaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttagacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcacctctatataaaggag 59562  T
Q  220 tgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||||||    
T  59563 tgaagacttgaagat 59577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 142934 - 142894
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  142934 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 142894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0163 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0163
Description:

Target: scaffold0163; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 21 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29657 - 29441
Alignment:
Q  21 tgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaa-aggactacacccaa 119  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||    
T  29657 tgtcctcgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcaataggactacacccaa 29559  T
Q  120 atcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct-gattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaagg 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||| ||| ||| ||||||||  |  || ||||||||||| | | | ||||||||||||||    
T  29558 atcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacaactgtttggacgtgctaaaaaatctcaacgtctctctactcacctctatataaagg 29460  T
Q  218 agtgaagacttgaagattg 236  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29459 agtgaagacttgaagattg 29441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 70 - 234
Target Start/End: Original strand, 38120 - 38284
Alignment:
Q  70 ttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctt 169  Q
    |||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||    
T  38120 ttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacacccaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctt 38218  T
Q  170 tagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||| |  || ||||||||||| | | | ||| ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  38219 tagacgtgctaaagatctcaacgtctctctactcacctttatataaaggaatgatgacttgaagat 38284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0544 (Bit Score: 72; Significance: 9e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0544
Description:

Target: scaffold0544; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 68 - 234
Target Start/End: Original strand, 9912 - 10078
Alignment:
Q  68 ccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactc 167  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| | || ||||| |||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||    
T  9912 ccttcaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactgcatctaaatcaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactc 10010  T
Q  168 tttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  10011 tttagacgtgcttaagatctcaacgtctctctacacacctctatataaggaagtgaagacttgaagat 10078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 893 - 688
Alignment:
Q  28 gctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggca 127  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||  |||||| ||||||||||||||| | || ||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  893 gctacaagacaagataacagctctgcctgcagaat-tgttcccacaagataggaatgaatttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaggca 795  T
Q  128 aaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtg-ctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggagtgaaga 225  Q
    || ||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| ||||||  | |   | ||||||||||| | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  794 aaagattaatggtggatgatcaaaggaactc-aacgactctttggacgtgtttaaaggtctcaacgtctctctacacacctctata-aaaggagtgaaga 697  T
Q  226 cttgaagat 234  Q
    |||||||||    
T  696 cttgaagat 688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 17892 - 18127
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  17892 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatc 17990  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgct--gattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||| | || ||||||| | ||||||||||   |  || |||||||||||    
T  17991 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcaatggtgaatgatcaaaggttctc-aacgactttatagacgtgcttaaaagatctcaacgtctct 18089  T
Q  198 -ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
     | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18090 ctacacatctctatataaaggagtgaagacttgaagat 18127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 3002 - 3043
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3002 ttcaacgtctctttcacacctctatataaagaagtgaagact 3043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 67; Significance: 9e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 820 - 616
Alignment:
Q  29 ctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 128  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  820 ctacaagacaagatagcagctctgcctgtagaat-tgttccttcaagataggaatgattttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaagcaa 722  T
Q  129 aggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    | ||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||| |||||||   ||||||||||    
T  721 aagattactggtggatgatcaaaggtactc-aacgactctttaaacgtgcttaagatctcaacgtctctctacacacctatatataagaaagtgaagact 623  T
Q  228 tgaagat 234  Q
    |||||||    
T  622 tgaagat 616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 29 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5200 - 4996
Alignment:
Q  29 ctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcaggcaa 128  Q
    ||||||||||||| | ||||| |||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||| ||||||| | || ||||| ||||||||| |||||||| ||||    
T  5200 ctacaagacaagatagcagctctgcctgtagaat-tgttccttcaagataggaatgattttgaagttgatccttcataggactacatccaaatcaagcaa 5102  T
Q  129 aggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    | ||||||||||||||||| |||||   || |||||||||||| ||||||| |  || ||||||||||| | ||| ||| |||||||   ||||||||||    
T  5101 aagattactggtggatgatcaaaggtactc-aacgactctttaaacgtgcttaagatctcaacgtctctctacacacctatatataagaaagtgaagact 5003  T
Q  228 tgaagat 234  Q
    |||||||    
T  5002 tgaagat 4996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 20463 - 20695
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  20463 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgtagaa-atgt-ccttcaagataggaatggatttgaacgtgatc 20560  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| || |  ||||| |||||||||   ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  20561 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaatg--tttcacaacgactctactgacgtgcttaaagatctcaacgactct 20658  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20659 ttcacatctctatataaaggagtgaagacttgaagat 20695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 61246 - 61015
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattc 100  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||  | || |    
T  61246 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagaaaggaatggatttgaacttgatcc 61148  T
Q  101 ttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctcttt 199  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || ||||||||||| |    
T  61147 ttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttt-gacgtgcttaaagatctcaacgtctctct 61050  T
Q  200 cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  61049 cacacctttatataaaggagtgaagacttgaagat 61015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 212379 - 212154
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||| ||||||||    |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  212379 tacctccactactctgtttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca----atgttccttcacaattggaatggatttgaaattgatc 212284  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactct--ttagacgtgctgattattt-caacgtctc 196  Q
    ||||| ||||| | | ||| |||||| ||| ||| | |||||  |||| ||||   |||||||||||||  || || |||||||  |||  |||||||||    
T  212283 cttcataggacaataaccatatcaggaaaaagatcattggtgattgatcaaagc--ttcaaacgactctattttgatgtgctgacaattcacaacgtctc 212186  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  212185 tttcacacctctatataaaggagtgaagactt 212154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0655 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0655
Description:

Target: scaffold0655; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5142 - 4909
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| ||||||  | |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | |||    
T  5142 tacctccacgactctgcgtgtgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatt 5044  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctg-attatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||||| |  || |||||| ||||    
T  5043 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagaccattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacgtgctgaaagatctcaacgactct 4946  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4945 cccacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 4909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0627 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0627
Description:

Target: scaffold0627; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 8117 - 8178
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8117 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaat 8178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 38171 - 38403
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| || |||| || |||||| |||||||  | ||     
T  38171 tacctccactactctg-ttttgtctatgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccatcaaaataggaatggatttgaacgtgatc 38268  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttc-aaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  |||||| ||| |||||| | ||||||| | |  || |||||| ||||    
T  38269 cttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--gatttcaaaaagactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactct 38366  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38367 ttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 38403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 61757 - 61524
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||| ||||| || || |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  61757 tacctccacgactctgcttgtgtctacgctacaagacaagataaacagctctgcctacaaaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacgtgatc 61659  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | ||||   ||| | |||| ||   ||||||||||| ||||||| | |  || |||||||||||     
T  61658 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtatttga-tcaaggtttctcaacgactcttttgacgtgcttaaagatctcaacgtctctc 61560  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61559 tcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 61524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 59; Significance: 5e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 7310 - 7076
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||  | ||    
T  7310 tacctccacttctctgttttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaaaa-gttccttcaagataggaatggatttgaacgtgat 7212  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctc 196  Q
     ||||| ||||| ||| ||||||||||||||  || | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||| | |  || |||||| |||    
T  7211 ccttcataggacaacatccaaatcaggcaaaatatcattggtgattgatgaa--ggtttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactc 7114  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7113 tttcacatctctatataaaggagtgaagacttgaagat 7076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 57; Significance: 8e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 294
Target Start/End: Original strand, 2601 - 2688
Alignment:
Q  209 atataaaggagtgaagacttgaagattgtacata--gagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaatttgattctacaaag 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2601 atataaaggagtgaagacttgaagattaaaaaaacagagatatacaagttcaaaagcgccaaaactctgtcaaattgattctacaaag 2688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1321 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1321
Description:

Target: scaffold1321; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 1021 - 1254
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||| || || |||| || ||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  1021 tacctccactactatgcttatgtctactctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatc 1119  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| || |  ||||| ||||||||| | |||||||| |   || |||||| ||||    
T  1120 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaagg--tttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactct 1217  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1218 ttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1263 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1263
Description:

Target: scaffold1263; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 1214 - 1447
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||| || || |||| || ||||||||||||| || ||| | ||||||||||| |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  1214 tacctccactactatgcttatgtctactctacaagacaagaaaaacagttctgcctgcagaa-atgttccttcataataggaatggatttgaatgtgatc 1312  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| || |  ||||| ||||||||| | |||||||| |   || |||||| ||||    
T  1313 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaagg--tttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgactct 1410  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1411 ttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 1447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16601 - 16481
Alignment:
Q  113 cacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgctgattatttcaacgtctct-ttcacgcctctata 211  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||| |  || ||||||||||| | | | || |||||    
T  16601 cacccaaattaggcaaaagattactggtggatgatcaaaggaactc-aacgactcttttgacgtgctaaaaatctcaacgtctctctactcaccactata 16503  T
Q  212 taaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16502 taaaggagtgaagacttgaaga 16481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 1758 - 1991
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||  | || |||| |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  1758 tacctccactactctgcttttgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcct-aaaaaaatgttccttcaagataggaatggatttgaacatgatc 1856  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttcaaacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctctt 198  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||||||| ||| | || |   ||| | |||| ||   ||||||||| | ||||||| | |  || |||||||||||     
T  1857 cttcataggacaacttccaaatcaggcaaaagatcattgatatttga-tcaaggtttctcaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacgtctctc 1955  T
Q  199 tcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1956 tcacacctctatataaaggagtgaagatttgaagat 1991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 3981 - 4215
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgttttt-gtccacgctacaagacaagacaa-cagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaat 98  Q
    |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||| | ||||||||| | || |||||||||| |||||| |||||||  | ||    
T  3981 tacctccacttctctgtttttcgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctacctgcagaaaa-gttccttcaagataggaatggatttgaacgtgat 4079  T
Q  99 tcttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctc 196  Q
     ||||| | ||| ||| ||||||||||||||  || | || ||  |||| || |  ||||| ||||||| | | |||||||| |   || |||||| |||    
T  4080 ccttcataagacaacatccaaatcaggcaaaatatcattgctgattgatcaagg--tttcacaacgactttattgacgtgcttaaagatctcaacgactc 4177  T
Q  197 tttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4178 tttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 4215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 11785 - 11553
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||  | ||     
T  11785 tacctccactactctg-ttttgtctacgctacaagataagaaaaacagctctgcctgcagaat-tgatccttcaagataggaatggatttgaacgtgatc 11688  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||  |||||||||| ||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||| | |  || |||||  ||||    
T  11687 cttcataggacaactaccaaatcaggtaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaacaactct 11590  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11589 ttcacacctctatacaaaggagtgaagacttaaagat 11553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0201 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0201
Description:

Target: scaffold0201; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 7432 - 7375
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7432 tacctccactactctgtttttgtctgcgctacaagacaagacaacagctctgcctgca 7375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 4)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 189 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 59394 - 59345
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  59394 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 59345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 65677 - 65718
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  65677 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 65718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 144722 - 144763
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  144722 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 144763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 165032 - 165093
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 61  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  165032 tacctccactactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 165093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0443
Description:

Target: scaffold0443; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 129
Target Start/End: Original strand, 1116 - 1218
Alignment:
Q  26 acgctacaagacaagacaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaattcttcaaaggactacacccaaatcagg 125  Q
    |||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||| |||||||||| |||||| |||||||  | || ||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  1116 acgctacaagacaagataacagctctgtctgcagaa-atgttccttcaagataggaatggatttgaacttgatccttcataggacaacatccaaatcagg 1214  T
Q  126 caaa 129  Q
    ||||    
T  1215 caaa 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0443; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Original strand, 1276 - 1324
Alignment:
Q  187 tcaacgtctcttt-cacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||||| | ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1276 tcaacgtctctctacacacctctataaaaaggagtgaagacttgaagat 1324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 268618 - 268571
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  268618 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 268571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 84231 - 84191
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  84231 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 84191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16980 - 16747
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||| || |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  16980 tacctccactactctatttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcataa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatc 16882  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgc-tgattatttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||| ||| | |||||  |||| ||  | ||||| ||||||||| | ||||||| | |  |  ||||||  |||    
T  16881 cttcataggacaacaaccaaatcaagcaaaagatcattggtgattgatcaa--ggtttcacaacgactctattgacgtgcttaaagacctcaacgaatct 16784  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16783 ttcacacctctatataaaggagtgaaaacctgaagat 16747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 6608 - 6736
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaagctaatt 99  Q
    |||||||||||||| | |||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||  || |||||| |||||||  | ||     
T  6608 tacctccactactccgcttttttctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa-atgttccttcagaataggaatggatttgaacgtgatc 6706  T
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaa 129  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  6707 cttcataggacaacatccaaatcaggcaaa 6736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0567 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0567
Description:

Target: scaffold0567; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 9744 - 9696
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9744 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttaaagattg 9696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0352 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0352
Description:

Target: scaffold0352; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 1090 - 1133
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1090 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 1133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 19910 - 19859
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  19910 tcaacgtctctttcacacctctatctaaagaagtgaagacttgaagattgta 19859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20412
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20459 tcaacgactctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 20412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 10645 - 10511
Alignment:
Q  100 cttcaaaggactacacccaaatcaggcaaaggattactggtggatgattaaaggatttca-aacgactctttagacgtgctgatt-atttcaacgtctct 197  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||| | |||||  |||| ||  ||||||| ||||||||| | |||||||| |   || |||| | ||||    
T  10645 cttcataggacaacaaccaaatcaggcaaaagatcattggtgattgatcaa--gatttcacaacgactctattgacgtgcttaaagatctcaatgactct 10548  T
Q  198 ttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10547 ttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagat 10511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 32060 - 32107
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32060 caacgtctctttcacacctctatttaaaggagtgaagacttgaagatt 32107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 5594 - 5637
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5594 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 5637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 35074 - 35117
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35074 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 35117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 222
Target Start/End: Original strand, 25935 - 25973
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtga 222  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25935 atttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtga 25973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Original strand, 36455 - 36502
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  36455 caacgtctctctcacacctctatataaacaagtgaagacttgaagatt 36502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 34890 - 34930
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  34890 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 34930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 29631 - 29584
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29631 caacgtctctttcacacctctatataaaggtgtgaagacttgaagatt 29584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 99477 - 99518
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||    
T  99477 ttcaacgtctctttcacacgtatatataaaggagtgaagact 99518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 189 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 2496 - 2450
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2496 aacgtctttttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 2450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 187 - 235
Target Start/End: Original strand, 3673 - 3721
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3673 tcaacgtatctttcacacatctatataaaggagtgaagacttgaagatt 3721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 1971 - 2012
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1971 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 2012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 92
Target Start/End: Original strand, 1785 - 1876
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaatatgtgccttcaagatgggaatgaatttgaa 92  Q
    ||||| |||| |||||||||||||   ||||||||||||| | |||||||||||||||| |  |||| ||||||  ||||||||| |||||||    
T  1785 taccttcactgctctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctatgcctgca-acaatgttccttcacaatgggaatgcatttgaa 1876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 1153 - 1198
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1153 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagacttgaaga 1198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 5845 - 5804
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5845 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 5804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 7430 - 7471
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7430 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 7471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 22403 - 22444
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22403 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 22444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18868 - 18828
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  18868 caacgtctctttcacacctatatataaaggagtgaagactt 18828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 8994 - 8953
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8994 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 8953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 187 - 228
Target Start/End: Original strand, 1792 - 1833
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1792 tcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 1833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 238
Target Start/End: Original strand, 4285 - 4336
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattgta 238  Q
    ||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4285 tcaacgtatctctcacacctctgtataaaggagtgaagacttgaagattgta 4336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 211239 - 211198
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  211239 ttcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 211198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 220075 - 220035
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  220075 caacatctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 220035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 211423 - 211365
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  211423 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 211365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 244555 - 244595
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  244555 caacgtctctttcaaacctctatataaagaagtgaagactt 244595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Original strand, 1715 - 1755
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1715 tacctccactactctgtttttgtctacgctacaagacaaga 1755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 312 - 272
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  312 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 205 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 6160 - 6131
Alignment:
Q  205 ctctatataaaggagtgaagacttgaagat 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6160 ctctatataaaggagtgaagacttgaagat 6131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 2266 - 2306
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2266 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 2306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9806 - 9766
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9806 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 9766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 9994 - 9954
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  9994 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 9954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 5964 - 6004
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5964 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 6004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14485 - 14445
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14485 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 14445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5426
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5466 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 5426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14954 - 14914
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14954 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 14914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 26249 - 26289
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26249 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 26289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1527 - 1487
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1527 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 1487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7763 - 7723
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  7763 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 7723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 59853 - 59813
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  59853 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 59813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 90329 - 90369
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  90329 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 90369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 1281 - 1234
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1281 caacgtctctttaattcctctatataaaggaatgaagacttgaagatt 1234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 90141 - 90199
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  90141 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaagaaaaacagctttgcctgca 90199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Original strand, 87870 - 87913
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  87870 atttcaacgcctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 87913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37238 - 37199
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37238 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 37199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 135298 - 135259
Alignment:
Q  189 aacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  135298 aacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 135259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 158946 - 158906
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  158946 caacatctctttcatacctctatataaaggagtgaagactt 158906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 60640 - 60601
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  60640 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaagact 60601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 233
Target Start/End: Original strand, 2071 - 2117
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2071 tcaacgactctttcacacctctatataaaggagtgaagacttaaaga 2117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 61
Target Start/End: Original strand, 15711 - 15769
Alignment:
Q  4 ctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgcagaa 61  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||    
T  15711 ctccactactctgtttatgtctacgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgcagaa 15769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Original strand, 2067 - 2112
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2067 caacgtctctttcacacctctatataaatgagtgaagacatgaaga 2112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 7662 - 7617
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7662 caacgtctctttcacacctctgtataaaggagtgaagacttaaaga 7617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 18037 - 18078
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  18037 ttcaacgtctctttcacacctctatataaagaagtgaagact 18078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 192 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13404 - 13368
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13404 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 13368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 1497 - 1457
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  1497 caacgtctctttcacacatctatataaaggagtgaagactt 1457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 27703 - 27743
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  27703 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagactt 27743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 228
Target Start/End: Original strand, 2243 - 2287
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  2243 atttcaacgtctctttcacatctctatataaaggtgtgaagactt 2287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 21245 - 21285
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  21245 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaaaactt 21285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 74418 - 74378
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  74418 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtgaagactt 74378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 227
Target Start/End: Original strand, 929 - 968
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  929 caacgtctctttcacacctcaatataaaggagtgaagact 968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 192 - 235
Target Start/End: Original strand, 3582 - 3625
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3582 gtctctttcatacctctatataaaggaatgaagacttgaagatt 3625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0488 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0488
Description:

Target: scaffold0488; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 184 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 12039 - 11996
Alignment:
Q  184 atttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  12039 atttcaacgtctctctcacacctctatataaaggagtgaggact 11996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9787 - 9752
Alignment:
Q  193 tctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9787 tctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 9752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 193 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3056 - 3021
Alignment:
Q  193 tctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3056 tctctttcacacctctatataaaggagtgaagactt 3021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 188 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40476 - 40441
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaa 223  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40476 caacgtctctttcacacctctatataaaggagtgaa 40441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 7402 - 7348
Alignment:
Q  5 tccactactctgtttttgtccacgctacaagacaag-acaacagctatgcctgca 58  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  7402 tccactactctgtttttgtccctgctacaagacaagaaaaacagctctgcctgca 7348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 192 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 5841 - 5807
Alignment:
Q  192 gtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagac 226  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5841 gtctctttcacacctctatataaaggagtgaagac 5807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 187 - 221
Target Start/End: Original strand, 16410 - 16444
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtg 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16410 tcaacgtctctttcacacctctatataaaggagtg 16444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0859 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0859
Description:

Target: scaffold0859; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3007 - 2951
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaagacaacagctatgcctgca 58  Q
    ||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| | ||||||| ||||||||    
T  3007 tacctccactactctatttttgtccctgctacaagacaa-aaaacagctctgcctgca 2951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0471 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0471
Description:

Target: scaffold0471; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 3144 - 3103
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  3144 ttcaacgtctctttcacacctctatttaaagaagtgaagact 3103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 227
Target Start/End: Original strand, 7013 - 7054
Alignment:
Q  186 ttcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  7013 ttcaacgtctctctcacacctatatataaaggagtgaagact 7054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 187 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 31575 - 31526
Alignment:
Q  187 tcaacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagattg 236  Q
    ||||||| ||| |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  31575 tcaacgtatctctcacacctctatataaatgagtgaagacttaaagattg 31526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 188 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 144743 - 144698
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaaga 233  Q
    ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  144743 caacgtctctttcgcacctctataaaaaggagtgaagacctgaaga 144698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0758 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0758
Description:

Target: scaffold0758; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 195 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 4100 - 4060
Alignment:
Q  195 tctttcacgcctctatataaaggagtgaagacttgaagatt 235  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4100 tctttcacacctctatataaaggagtgaatacttaaagatt 4060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 191 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22509 - 22473
Alignment:
Q  191 cgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagact 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  22509 cgtctctttcacacctctatataaaggaatgaagact 22473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 41
Target Start/End: Complemental strand, 22701 - 22661
Alignment:
Q  1 tacctccactactctgtttttgtccacgctacaagacaaga 41  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  22701 tacctccactactctgtttttgtctctgctacaagacaaga 22661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Original strand, 44193 - 44233
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||    
T  44193 caacgtctctttcacacctttatataaaggagtcaagactt 44233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 188 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 103408 - 103369
Alignment:
Q  188 caacgtctctttcacgcctctatataaaggagtgaagactt 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  103408 caacgtctctttcacacctctatat-aaggagtgaagactt 103369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University