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This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF11819_low_3 (Length: 731)
Name: NF11819_low_3
Description: NF11819
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF11819_low_3 |
 |  |
|
| [»] scaffold0031 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0006 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0466 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0264 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0001 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0028 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0378 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0376 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0086 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0112 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0099 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0393 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0063 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0111 (2 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0136 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0037 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0034 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0297 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0019 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0139 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0061 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold2089 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0454 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold1948 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0611 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0059 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0496 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0390 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0234 (2 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0433 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0220 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0186 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
| [»] scaffold0008 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0657 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0783 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold1400 (1 HSPs) |
 |  |  |
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| [»] scaffold0118 (1 HSPs) |
 |  |  |
|
Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 595; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 595; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 714
Target Start/End: Original strand, 26129744 - 26130450
Alignment:
| Q |
8 |
caatgttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatct |
107 |
Q |
| |
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|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26129744 |
caatgttagaatggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatatacaccattatcaatgtgagaatatct |
26129843 |
T |
 |
| Q |
108 |
tattacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatct |
207 |
Q |
| |
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|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26129844 |
tattacattttcataacatactatgtggtattttcacggtgggtcaatccagtataaatattactcataatatttgtatatatgtatagacttaatatct |
26129943 |
T |
 |
| Q |
208 |
catatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
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||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
26129944 |
aatatccataacccatgagatatggtaattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagcttgactacggatac |
26130043 |
T |
 |
| Q |
308 |
atttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatt |
407 |
Q |
| |
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|||||| || |||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
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| T |
26130044 |
atttaagaagagcgttcttaatgttaaagtaatattaggattaagtcacactaaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatt |
26130143 |
T |
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| Q |
408 |
acaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttaca |
507 |
Q |
| |
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|
| T |
26130144 |
acaacaagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttatcataaactattggcctctagggcttaca |
26130243 |
T |
 |
| Q |
508 |
ctaacacaaggcaacaacaattaacaaagaggaaacaatgccaactatggtcaaggagtaaactatggccaaggttggagaccatatgcaggtccttcaa |
607 |
Q |
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| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
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| T |
26130244 |
ccaacacaaggaaacaacaattatcaaagaggaaacaatgccaacgatggtcaaggagtaaacaatggccaaggttggagaccatatgcaggtccttcca |
26130343 |
T |
 |
| Q |
608 |
tccaacaacaaccatatcaaaacgtcaatcaatatcctcctcaacaggatcgcacacaaaagttggaagatacattgaatcaattcatggaaatgtcaat |
707 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
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| T |
26130344 |
tccgacaacaaccatatcaaaacgtcaatcaatatcctccttaacaggatcgcacacaaaagttggaagatacattgaatcaattcatgaaaatgtcaat |
26130443 |
T |
 |
| Q |
708 |
cgcaacc |
714 |
Q |
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|
||||||| |
|
|
| T |
26130444 |
cgcaacc |
26130450 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 12 - 508
Target Start/End: Original strand, 12765045 - 12765542
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
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| T |
12765045 |
gttagaatggaaacaaagtacttgagtccacatcaagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatgtcttatg |
12765144 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattt----tcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatct |
207 |
Q |
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| T |
12765145 |
acaattaatctcataacttactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct |
12765244 |
T |
 |
| Q |
208 |
catatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
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| T |
12765245 |
catatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaa-ttatattaaagcttgactacggatac |
12765343 |
T |
 |
| Q |
308 |
atttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatt |
407 |
Q |
| |
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| T |
12765344 |
atttaagaatagtgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattttaaggactttattaacatt |
12765443 |
T |
 |
| Q |
408 |
acaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttaca |
507 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
12765444 |
actataaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttaca |
12765541 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 19 - 508
Target Start/End: Original strand, 20100305 - 20100790
Alignment:
| Q |
19 |
tggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacatttt |
118 |
Q |
| |
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|
|
| T |
20100305 |
tggcaataaagcacttgagtccacatcttgggatcatagtggtttcatgtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttt |
20100404 |
T |
 |
| Q |
119 |
cataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataa |
218 |
Q |
| |
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| T |
20100405 |
cataacatactatgtagttttctcacgttgggtcaagccagtataagtattactcctaatattgatacctatctatagacttaatatctcatattcatga |
20100504 |
T |
 |
| Q |
219 |
cccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataata |
318 |
Q |
| |
|
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|
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| T |
20100505 |
cccatgagatgtgatcatcagtctacatacataatagtcgtgacgctttattattatcccaatttatattaaagtttaactacgaatacatttaagaata |
20100604 |
T |
 |
| Q |
319 |
gcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtat |
418 |
Q |
| |
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|||| || | ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| || ||| |
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| T |
20100605 |
acgttatttacgttaatgtaatctcatgattaagtcacacttaatattccattatatgaactatctattctatggactttattaatcttacaacaaatat |
20100704 |
T |
 |
| Q |
419 |
taaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacac |
508 |
Q |
| |
|
|||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
20100705 |
--aataaagaatgtc--atattattgaataataaaagtcatgatacataacataagtctgacataaactattggcctctagggcttacac |
20100790 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 31 - 505
Target Start/End: Original strand, 7865504 - 7865979
Alignment:
| Q |
31 |
acttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattt----tcataacat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| | |
|
|
| T |
7865504 |
acttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt |
7865603 |
T |
 |
| Q |
127 |
actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgag |
226 |
Q |
| |
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||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
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| T |
7865604 |
actatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcatatctataacccatgag |
7865703 |
T |
 |
| Q |
227 |
atatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgttttt |
326 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
7865704 |
atgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaa-ttatattaaagcttgactacggatacatttaagaatagtgttctt |
7865802 |
T |
 |
| Q |
327 |
gatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaa |
426 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||| |
|
|
| T |
7865803 |
tatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactatgaatat--aataaa |
7865900 |
T |
 |
| Q |
427 |
gagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggctta |
505 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
7865901 |
gagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggctta |
7865979 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 12 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 5097898 - 5097427
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5097898 |
gttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctcgggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaataacttatg |
5097799 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5097798 |
acaatttcataacatactatgtagtattctcacggtgggttaatccaatataaatattactcataatatttatacttatgtatagacttaatatctcata |
5097699 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattt |
311 |
Q |
| |
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|| || ||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| |||||||| |
|
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| T |
5097698 |
tctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaaacttgactacaaatacattt |
5097599 |
T |
 |
| Q |
312 |
aataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaa |
411 |
Q |
| |
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|
| T |
5097598 |
aagaataacgttctttatgttaatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacatgaactatctattccagggactttattaacattacta |
5097499 |
T |
 |
| Q |
412 |
taagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaa |
485 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| | || ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
5097498 |
taaatat--aataaaaattgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaa |
5097427 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 508
Target Start/End: Original strand, 9811788 - 9812285
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
9811788 |
gttagaatggaaacaaagtacttgagtccacatcaagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatg |
9811887 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattt----tcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatct |
207 |
Q |
| |
|
||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9811888 |
acaattaatctcataacgtactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct |
9811987 |
T |
 |
| Q |
208 |
catatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9811988 |
catatctataacccatgagatgtggtcatcagtctacatacatagtagtctcgacgctttattattatcctaa-ttatattaaagcttgactacggatac |
9812086 |
T |
 |
| Q |
308 |
atttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatt |
407 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||| || ||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||| |
|
|
| T |
9812087 |
atttaataatagtgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacaattaatatattattacacgaactatctattttaaggactttattagcatt |
9812186 |
T |
 |
| Q |
408 |
acaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttaca |
507 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
9812187 |
actataaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttaca |
9812284 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 508
Target Start/End: Original strand, 12703929 - 12704426
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||| ||||||| |
|
|
| T |
12703929 |
gttagaatggaaacaaagtacttgagtccacatcaagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaaaatcttatg |
12704028 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattt----tcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatct |
207 |
Q |
| |
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|
| T |
12704029 |
acaattaatctcataacgtactatgtagtattctcacggtgggtctatccaatataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct |
12704128 |
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Target: chr5; HSP #8
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Target: chr5; HSP #9
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Target: chr5; HSP #11
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tctaaatat--aataaagagtgccatatattaatcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggctcacacc |
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T |
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aacac |
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Target: chr5; HSP #12
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tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
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T |
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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
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T |
 |
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212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
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Q |
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| T |
31096664 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataagagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
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T |
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aaca |
513 |
Q |
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31096566 |
aaca |
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Target: chr5; HSP #14
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 |
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tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
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| |
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tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
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 |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
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410 |
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509 |
Q |
| |
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||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |
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| T |
20940875 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctttagggcttacaca |
20940778 |
T |
 |
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510 |
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513 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
20940777 |
aaca |
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T |
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Target: chr5; HSP #15
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Target Start/End: Original strand, 12789718 - 12790218
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Q |
| |
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|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
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T |
 |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
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| T |
12789818 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
12789917 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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| T |
12789918 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
12790017 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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| T |
12790018 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaaatta- |
12790116 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
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| T |
12790117 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctttagggcttacacc |
12790214 |
T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
|
|||| |
|
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12790215 |
aaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 26245349 - 26244850
Alignment:
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Q |
| |
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T |
 |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
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||| ||||||||||||||||| |||||| | || |||| |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |
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| T |
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acaatttcataacatactatgcagtattctgacagtggatcaatcaagtataaatattactcctaatatttatacctatgtataaacttaatatctcata |
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T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattt |
311 |
Q |
| |
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| T |
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tctatgacccatgagatgcaatcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttattcatattaaagcttgattacagatacattt |
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T |
 |
| Q |
312 |
aataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaa |
411 |
Q |
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| T |
26245049 |
aagaataacattctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattcgagggactttattaacattacta |
26244950 |
T |
 |
| Q |
412 |
taagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaa |
511 |
Q |
| |
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| T |
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taaatat--aaaaaagagtatcatatattattcaataataaaagtcatgatatataagataagtttaacataaactattggcctccagagcttacaccaa |
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T |
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Target: chr5; HSP #17
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Q |
| |
|
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| T |
39535501 |
atgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtcttgacgctttattattatcccaattcatattaaagtttgagtacggatacatttaagaatatcg |
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T |
 |
| Q |
322 |
tttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaa |
421 |
Q |
| |
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|
| T |
39535401 |
ttctttaaggtaatgtaatctcatgattaagtcacacttaatataccattatatgaactatctattccagggactttattaacattataacaaatat--a |
39535304 |
T |
 |
| Q |
422 |
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513 |
Q |
| |
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| T |
39535303 |
ataaagagtgtcatatattatttaataaaaaaaattcatgatacataacgtaaatttaacataaactattgacctctagggcatacaccaaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #18
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Q |
| |
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gatcatggtggtttcaagtctaagagtggcgtgcactattatcactatgagaatatcttatgatactt-cataacatactatgtaatattctcatagtag |
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T |
 |
| Q |
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gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacataca |
249 |
Q |
| |
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|
| T |
31651977 |
gtcaatccattattaatgttactcctaatatttttaccaatgtataaacttaatatctcatatctatgacccgtgagacttagtcatcagtctacataca |
31652076 |
T |
 |
| Q |
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taatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggatt |
349 |
Q |
| |
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| T |
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tagtagtctctatgttttactattgtctcaatttataataaagctcgaccatggaaacttttaagaataatattctttatgttaatgtaatcttacgatt |
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T |
 |
| Q |
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aagtcacacttaata---ttccattaca-cgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattattta |
445 |
Q |
| |
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| T |
31652177 |
aagtctcacttaatgatgttccatcacaacaaactatctattctagggactttattaatcttacaacaaatat--aataaagaatgctttattttattta |
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T |
 |
| Q |
446 |
ataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacac |
508 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||| | | ||||||||||||||| |||||| || || ||||||||| |
|
|
| T |
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Target: chr5; HSP #19
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Target Start/End: Original strand, 31267825 - 31267984
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||| || |
|
|
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tttcataacatacaatgtagtgttctcacggttagtcaatccagtataaatattactcctaatat----acatatgtatagacttaatatctcatattca |
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T |
 |
| Q |
216 |
taacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatccca |
279 |
Q |
| |
|
| || ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |
|
|
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Target: chr5; HSP #20
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|
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|
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T |
 |
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gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
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atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
24695482 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattta |
312 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||| |||| || || | ||||| |||||||||||||| |||| |
|
|
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24695483 |
ataatagtctctatgctttattgatatctcacttctcaataaagcttgactacggatactttta |
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Q |
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|
|||||| | |||||||| ||||| |||||| |||||| | ||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |
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|
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ttatcactatgagaataacttatgacatttacataactttctacgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcttaatatttatatc |
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T |
 |
| Q |
188 |
tatgt |
192 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
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tatgt |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | ||| |||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
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18569678 |
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc |
208 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18569778 |
gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgatatctc |
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Target: chr5; HSP #23
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Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
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tgagaatattttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
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T |
 |
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gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| || |
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|
| T |
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atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac |
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T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
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ataatagtctct |
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Target: chr5; HSP #25
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Q |
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|
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|
|
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Target: chr5; HSP #26
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Q |
| |
|
||||||| | ||| |||| ||||| | |||| |||||| | ||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #27
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Target Start/End: Original strand, 19707069 - 19707177
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|
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 |
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tacctatgt |
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Q |
| |
|
|| |||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0031 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
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Target: scaffold0031; HSP #1
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Q |
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Q |
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T |
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311 |
Q |
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| T |
40243 |
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40342 |
T |
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| Q |
312 |
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411 |
Q |
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| T |
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40442 |
T |
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511 |
Q |
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40540 |
T |
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| Q |
512 |
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516 |
Q |
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40541 |
cacaa |
40545 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 42)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 12 - 515
Target Start/End: Original strand, 25978783 - 25979284
Alignment:
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111 |
Q |
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gttagaatggcaacaaagtacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatg |
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T |
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| Q |
112 |
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211 |
Q |
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| T |
25978883 |
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25978982 |
T |
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| Q |
212 |
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311 |
Q |
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| T |
25978983 |
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25979082 |
T |
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| Q |
312 |
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411 |
Q |
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| T |
25979083 |
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25979182 |
T |
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| Q |
412 |
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511 |
Q |
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| T |
25979183 |
taaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctaggacttacaccaa |
25979280 |
T |
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| Q |
512 |
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515 |
Q |
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| T |
25979281 |
caca |
25979284 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 287; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14147268 - 14146769
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
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| T |
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14147169 |
T |
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| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
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| T |
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14147069 |
T |
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| Q |
212 |
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311 |
Q |
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| T |
14147068 |
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14146969 |
T |
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| Q |
312 |
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411 |
Q |
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| T |
14146968 |
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14146869 |
T |
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412 |
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511 |
Q |
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| T |
14146868 |
caaatat--aataaagagtgccatatattatttaataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
14146771 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21034485 - 21033985
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
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| T |
21034485 |
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T |
 |
| Q |
112 |
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211 |
Q |
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| T |
21034385 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
21034286 |
T |
 |
| Q |
212 |
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309 |
Q |
| |
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| T |
21034285 |
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21034186 |
T |
 |
| Q |
310 |
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409 |
Q |
| |
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| T |
21034185 |
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21034087 |
T |
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| Q |
410 |
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509 |
Q |
| |
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| T |
21034086 |
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21033989 |
T |
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| Q |
510 |
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513 |
Q |
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| T |
21033988 |
aaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21399039 - 21398539
Alignment:
| Q |
12 |
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111 |
Q |
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| T |
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gttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtaagaatatcttatg |
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T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
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| T |
21398939 |
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21398840 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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| T |
21398839 |
tctatgacccatgagatgaggtcataagtctacatacataatagtctcgacactttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
21398740 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
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| T |
21398739 |
ttaagaatagcgttctttaagataatgtaatctcatgattaagtcacaattaatatataattacatgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
21398641 |
T |
 |
| Q |
410 |
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509 |
Q |
| |
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| T |
21398640 |
tctaaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
21398543 |
T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
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| T |
21398542 |
aaca |
21398539 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 514
Target Start/End: Original strand, 15846591 - 15847092
Alignment:
| Q |
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111 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
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| T |
15846691 |
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15846790 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
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| T |
15846791 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
15846890 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
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| T |
15846891 |
ttaagaatagcgttctttaagaaaatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggaatttattaacatta- |
15846989 |
T |
 |
| Q |
410 |
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509 |
Q |
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| T |
15846990 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagcgcttacacc |
15847087 |
T |
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| Q |
510 |
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514 |
Q |
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| T |
15847088 |
aacac |
15847092 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 55427268 - 55426767
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
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T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
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| T |
55427168 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctcata |
55427069 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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| T |
55427068 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
55426969 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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| T |
55426968 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcatacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
55426870 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
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| T |
55426869 |
tctaaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcataatacataagatagatttaacataaactattggtctctagggcttacacc |
55426772 |
T |
 |
| Q |
510 |
aacac |
514 |
Q |
| |
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| T |
55426771 |
aacac |
55426767 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 12 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 14890638 - 14890137
Alignment:
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12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
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| T |
14890538 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
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T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |
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| T |
14890438 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcaacactttattattatcctttattcatattaaagctttgaatacggatacat |
14890339 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
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| T |
14890338 |
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14890240 |
T |
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410 |
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509 |
Q |
| |
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| T |
14890239 |
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14890142 |
T |
 |
| Q |
510 |
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514 |
Q |
| |
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||||| |
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| T |
14890141 |
aacac |
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T |
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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
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Target Start/End: Original strand, 20147609 - 20148110
Alignment:
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111 |
Q |
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| T |
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20147708 |
T |
 |
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211 |
Q |
| |
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| T |
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20147808 |
T |
 |
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308 |
Q |
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| T |
20147809 |
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20147908 |
T |
 |
| Q |
309 |
tttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatta |
408 |
Q |
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| T |
20147909 |
tttaagaatagtgttctataagataatgtaatctcatgattaagttacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta |
20148008 |
T |
 |
| Q |
409 |
caataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacac |
508 |
Q |
| |
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| T |
20148009 |
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20148105 |
T |
 |
| Q |
509 |
taaca |
513 |
Q |
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|||| |
|
|
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20148106 |
caaca |
20148110 |
T |
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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 12300157 - 12299664
Alignment:
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111 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
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acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaacatttatatctatg-atagacttgatatctcata |
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T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatc-ccaatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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| T |
12299958 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcatttattcatattaaagctttgactacggatacat |
12299859 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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| T |
12299858 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
12299760 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttaca |
507 |
Q |
| |
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||| ||| ||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
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| T |
12299759 |
tctaaatat--aataaagagcgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctaggacttaca |
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T |
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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 12 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11787834 - 11787382
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111 |
Q |
| |
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| T |
11787834 |
gttagaatggcaacaaagtacttgattatagatctagggatcataatggtttcaggtctaagagcgatatacaatattatcattgtgagaatatcttatg |
11787735 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
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| | | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
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|
| T |
11787734 |
aaaatatcataacttactatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcata |
11787635 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattt |
311 |
Q |
| |
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| T |
11787634 |
tctataaccaatgagatgcggttatcagtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaagcttgactacagatacattt |
11787535 |
T |
 |
| Q |
312 |
aataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaa |
411 |
Q |
| |
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| T |
11787534 |
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11787435 |
T |
 |
| Q |
412 |
taagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacat |
466 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
11787434 |
taaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataagaaaagtcatgatacat |
11787382 |
T |
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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
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Target Start/End: Complemental strand, 15526988 - 15526503
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || |||| || ||| |||||||||||| ||||||||||| |
|
|
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ataaagcacttgagtccacatgtatggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatacaccattaacattgtaagaatatcttatgacattttcatag |
15526889 |
T |
 |
| Q |
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catactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccat |
223 |
Q |
| |
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|||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |
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|
| T |
15526888 |
catactatttagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaagatttatacttatgtataaacttaatatctcatattcatgacctac |
15526789 |
T |
 |
| Q |
224 |
gagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgtt |
323 |
Q |
| |
|
|||| ||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| |
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|
| T |
15526788 |
cagatgcggttatcagtctacaaacataatagtctctacgctttattattatctc-atttatattaaagcttgactacatatgcatttaagaatagtgtt |
15526690 |
T |
 |
| Q |
324 |
tttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaat |
423 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| ||| || || ||| ||| |
|
|
| T |
15526689 |
ctttatgttaatgtaatctcatgattaagtcacccttaatattccattacacgaactatatattctaggga-tttattaatcttataacaaatat--aat |
15526593 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| || ||| || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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T |
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Target: chr3; HSP #12
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Target Start/End: Original strand, 15317242 - 15317470
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Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| |
|
|
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aaagtacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatttacactattatcattgtgagaatatcttatgacaatctcataacg |
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T |
 |
| Q |
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tactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatga |
225 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
15317342 |
tactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcatatctataacccatga |
15317441 |
T |
 |
| Q |
226 |
gatatggtcattagtctacatacataata |
254 |
Q |
| |
|
||| |||||| | ||||||||||||||| |
|
|
| T |
15317442 |
gatgcggtcatcaatctacatacataata |
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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 7e-51
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||| || ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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atattaaagctttgactacggatctatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactat |
28088093 |
T |
 |
| Q |
383 |
ctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacat |
482 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28088092 |
ctattctaagaactttattaatattatc-taaatat--aataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacat |
28087996 |
T |
 |
| Q |
483 |
aaactattggtctctagggcttacac |
508 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||| |||||| |
|
|
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28087995 |
aaactattggcctttagggattacac |
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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
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Target Start/End: Complemental strand, 28088353 - 28088227
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Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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T |
 |
| Q |
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acattttcataacatactatgtagtat |
138 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
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acaatttcataacttactatgtagtat |
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Target: chr3; HSP #15
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Target Start/End: Complemental strand, 27432681 - 27432525
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| || |||| | ||||||||||||||| || |
|
|
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atataaatattactcataatatttatacttatgtatagagttaatatctcatatccgta----gtgagatgtgatcatcaatctacatacataataacct |
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T |
 |
| Q |
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ctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatag |
319 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
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ccacgctttattattatcccaatttataataaaactcgactacggatacttttaagaatag |
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Target: chr3; HSP #16
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catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| |||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||||| || || |
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|
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catagtggtttcaggtcgaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattttcatggcgg |
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T |
 |
| Q |
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gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
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|
| T |
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atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
18522854 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
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ataatagtctct |
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Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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agtat |
138 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
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agtat |
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Q |
| |
|
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|
|
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T |
 |
| Q |
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gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
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|
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atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
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 |
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ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
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Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #19
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Target Start/End: Complemental strand, 30464234 - 30464147
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| Q |
22 |
caataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatctta |
109 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
30464234 |
caataaaacacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtggtatagaccattatcattatgagaatatctta |
30464147 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 6110454 - 6110243
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
6110454 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
6110355 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
6110354 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
6110255 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
6110254 |
ataatagtctct |
6110243 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 10572409 - 10572620
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
10572409 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacagttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
10572508 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
10572509 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
10572608 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
10572609 |
ataatagtctct |
10572620 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 15600701 - 15600912
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
15600701 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
15600800 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15600801 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
15600900 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
15600901 |
ataatagtctct |
15600912 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 15607246 - 15607457
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
15607246 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
15607345 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15607346 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
15607445 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
15607446 |
ataatagtctct |
15607457 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 53 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 8490885 - 8490681
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| Q |
53 |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
8490885 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
8490786 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
8490785 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
8490686 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataat |
253 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
8490685 |
ataat |
8490681 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 97 - 304
Target Start/End: Original strand, 32056760 - 32056972
Alignment:
| Q |
97 |
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192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
32056760 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatattttatatctatgt |
32056859 |
T |
 |
| Q |
193 |
atagacttaatatctcat-atccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaa |
291 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| | |||||| | | |||||| || |||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| || | |||| |
|
|
| T |
32056860 |
gaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcattagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaa |
32056959 |
T |
 |
| Q |
292 |
gtttgactacgga |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |
|
|
| T |
32056960 |
gtttgactacgga |
32056972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 10579172 - 10579383
Alignment:
| Q |
53 |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
10579172 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgg |
10579271 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
10579272 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
10579371 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
10579372 |
ataatagtctct |
10579383 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 439 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 14226029 - 14225953
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| Q |
439 |
ttatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacat-aaactattggtctctagggcttacactaacac |
514 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
14226029 |
ttatttaataataaaagtcatgatacataacataaatttaacataaaaatattggtctctagagcttacaccaacac |
14225953 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 17136743 - 17136613
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttca-taacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| ||||| |||| | ||||||||||||| ||| ||||| |
|
|
| T |
17136743 |
catagtggtttcaagtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacactttcaataacttttactatgtagtattctcatggtgg |
17136644 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatat |
180 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
17136643 |
gtcaatccaatataaatattactcctaatat |
17136613 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29925317 - 29925208
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| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
29925317 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg |
29925218 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaat |
203 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
29925217 |
aagacttaat |
29925208 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 29974470 - 29974361
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
29974470 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgcagtattctctaggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg |
29974371 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaat |
203 |
Q |
| |
|
||||||||| |
|
|
| T |
29974370 |
aagacttaat |
29974361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 97 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 18520321 - 18520109
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
18520321 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatcaaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg |
18520222 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaag |
292 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
18520221 |
aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaag |
18520122 |
T |
 |
| Q |
293 |
tttgactacggat |
305 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |
|
|
| T |
18520121 |
cttgactacggat |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13517157 - 13516982
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13517157 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatttagtattctcatggaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg |
13517058 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgcttta |
268 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| |||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
13517057 |
aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctgtgcttta |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #33
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Target Start/End: Original strand, 17780935 - 17781077
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catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
17780935 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatggcgg |
17781034 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
17781035 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
17781077 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #34
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167 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| |||| ||| ||||||| || |||||| |||| ||| | | ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
4189336 |
tctaagagtggtataaaccataatcaatatgagaatattttatgacaccttcataatattttatgtaatattctcatgacagatcaatatagtataaata |
4189237 |
T |
 |
| Q |
168 |
ttactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatat |
212 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
4189236 |
ttactcataatattaacacttatgtataaacttaatatctcatat |
4189192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 15357403 - 15357614
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
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T |
 |
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gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
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T |
 |
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ataatattctct |
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Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
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ataatagtctct |
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T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 13248997 - 13248767
Alignment:
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53 |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | ||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||| |||| ||| || | |
|
|
| T |
13248997 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcga |
13248898 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
13248897 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctac |
13248798 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatccca |
279 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | |||||||| |
|
|
| T |
13248797 |
ataatagtctctatgctttaatgttatccca |
13248767 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #37
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Query Start/End: Original strand, 127 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 16200743 - 16200680
Alignment:
| Q |
127 |
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190 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||| |
|
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| T |
16200743 |
actatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatatgaatattacacctaatatttgtatctat |
16200680 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 192
Target Start/End: Original strand, 17200001 - 17200143
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| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
17200001 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagcgg |
17200100 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
17200101 |
gtcaatccaatacaaatactactcctaatatttatatctatgt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 13211648 - 13211481
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| |||||||||| | |||||||| |||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
13211648 |
tgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtaatattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg |
13211549 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| | | |||| | || |||| ||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13211548 |
aagacttgataactctttatccatgatctgtgagttgtgatcatcagtctacctacataatagtctct |
13211481 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 15342036 - 15342247
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| | || |
|
|
| T |
15342036 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataatttttactatgtagtattctcatgacgg |
15342135 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
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|
|
| T |
15342136 |
atcaatccaatataaatattactcctaatttttatatctatgtgaagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
15342235 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
15342236 |
ataatagtctct |
15342247 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 200
Target Start/End: Original strand, 1647417 - 1647488
Alignment:
| Q |
129 |
tatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagactt |
200 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| || | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
1647417 |
tatgtagtattctcatggcgagtcaatcaaatataaacattactcctaatatttatatctatgtgtagactt |
1647488 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 120 - 260
Target Start/End: Original strand, 24253275 - 24253416
Alignment:
| Q |
120 |
ataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataa |
218 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| | |||| ||| || ||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| || ||||| | |||| ||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
24253275 |
ataacattctatgcattattctcatggagggtcaaaccaatataaatataactcttaatgtttataagtatgtgaaaacttgataactctttatccataa |
24253374 |
T |
 |
| Q |
219 |
cccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
24253375 |
ttcgtgagatatgatcattagtctaccgacataatagtctct |
24253416 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0006 (Bit Score: 283; Significance: 1e-158; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:
Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 67429 - 67928
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || |
|
|
| T |
67429 |
gttagaatggaaacaaagtacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatg |
67528 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
67529 |
acaatctcataacttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcata |
67628 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattt |
311 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
67629 |
tctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaagcttgactacgaatacattt |
67728 |
T |
 |
| Q |
312 |
aataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaa |
411 |
Q |
| |
|
|| |||| |||| || ||| || |||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
67729 |
aagaataacgttctttatgatactgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattacta |
67828 |
T |
 |
| Q |
412 |
taagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaa |
511 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
|
|
| T |
67829 |
taaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatacataaaataagtttaacataaactattgacctctagggcttacaccaa |
67926 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 282; Significance: 1e-157; HSPs: 52)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 13 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1941970 - 1941472
Alignment:
| Q |
13 |
ttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatta |
112 |
Q |
| |
|
||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| || | |
|
|
| T |
1941970 |
ttagaatggcaacaaagtacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatctcatga |
1941871 |
T |
 |
| Q |
113 |
cattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatat |
212 |
Q |
| |
|
|| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1941870 |
caatctcataacttactatgtagtattctcacggtgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcatat |
1941771 |
T |
 |
| Q |
213 |
ccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattta |
312 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
1941770 |
ctataacccatgagatgcggtcatcagtctatatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaagcttgactacgaatacattta |
1941671 |
T |
 |
| Q |
313 |
ataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaat |
412 |
Q |
| |
|
| |||| |||| || ||| || |||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |
|
|
| T |
1941670 |
agaataacgttctttatgatactgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactat |
1941571 |
T |
 |
| Q |
413 |
aagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaac |
512 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
1941570 |
aaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatacataaaataagtttaacataaactattgacctctagggcttacaccaac |
1941473 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 12 - 504
Target Start/End: Complemental strand, 11421254 - 11420773
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||| |
|
|
| T |
11421254 |
gttagaatgacaataaagcacttgagtacacatctacggatcatagtggtttcaggtctatgagtgatatacattattatccctgtgataatatcttatg |
11421155 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11421154 |
acattttcataacatactatgtagtattctaacggtgggtcaatccaatataaatatta---------tttatacctatgtatagacttaatatctcata |
11421064 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattt |
311 |
Q |
| |
|
|| || || |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11421063 |
tctatgactcatgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctcgaagctttattattatcctaattcatattaaagtttgactacggatacattt |
11420964 |
T |
 |
| Q |
312 |
aataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaa |
411 |
Q |
| |
|
|| ||||||||| || ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
11420963 |
aagaatagcgttctttatgttaatgtaatctaatgattaaatcacacttaatatatcattgcacgaactatctattttagggactttattaacattacaa |
11420864 |
T |
 |
| Q |
412 |
taagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggctt |
504 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
11420863 |
aaaatat--aataaagagtgccatatattatttaataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaaccattggcctctagggctt |
11420773 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 15461744 - 15461244
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15461744 |
gttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatg |
15461645 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
15461644 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
15461545 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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|| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
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| T |
15461544 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
15461445 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
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|
| T |
15461444 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
15461346 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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|
| T |
15461345 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
15461248 |
T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
15461247 |
aaca |
15461244 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 2677260 - 2676760
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
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|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2677260 |
gttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatg |
2677161 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
2677160 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
2677061 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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|| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
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|
| T |
2677060 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
2676961 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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|||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
2676960 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
2676862 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
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| T |
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T |
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Q |
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aaca |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 15815268 - 15814767
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211 |
Q |
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T |
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309 |
Q |
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T |
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409 |
Q |
| |
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T |
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509 |
Q |
| |
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| T |
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T |
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510 |
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514 |
Q |
| |
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aacac |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 18111098 - 18111598
Alignment:
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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T |
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Q |
| |
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T |
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aaca |
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aaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 31 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 9487779 - 9487304
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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 19 - 513
Target Start/End: Original strand, 4676045 - 4676538
Alignment:
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 |
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cataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataa |
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Q |
| |
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cataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctcatatctatga |
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 |
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Q |
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cccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaa |
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T |
 |
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tagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagt |
416 |
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| |
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tagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaat |
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513 |
Q |
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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 20244184 - 20243684
Alignment:
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Q |
| |
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 |
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211 |
Q |
| |
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T |
 |
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309 |
Q |
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tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
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T |
 |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
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Q |
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| T |
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T |
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509 |
Q |
| |
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tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
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T |
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513 |
Q |
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| T |
20243687 |
aaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 34975798 - 34975298
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
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Q |
| |
|
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|
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T |
 |
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tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatatt-aaagtttgactacggatacat |
309 |
Q |
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tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaaactttgactacaaatacat |
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T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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| T |
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ttaagaatagcgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaaccatctattctaaggactttattaacatta- |
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T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
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||| ||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
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tctaaatat--aataaagagtgtcatatattaatcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
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T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
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| T |
34975301 |
aaca |
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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
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tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
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T |
 |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
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Q |
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| T |
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Q |
| |
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T |
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| Q |
510 |
aacaca |
515 |
Q |
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aacaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 17300014 - 17300514
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acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
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T |
 |
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212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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| T |
17300214 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactatggatacat |
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T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
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ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattatttcacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
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T |
 |
| Q |
410 |
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509 |
Q |
| |
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| T |
17300413 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcaagatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
17300510 |
T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
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aaca |
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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
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Target Start/End: Original strand, 30040545 - 30041028
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T |
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Q |
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T |
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ccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattta |
312 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
313 |
ataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaat |
412 |
Q |
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T |
 |
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aagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaac |
512 |
Q |
| |
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aaatat--aataaagagtatcatatattaattgataataaaagtcatgatacataacataagtttaacataaattattggcctctagggcttacaccaac |
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T |
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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 3369078 - 3369578
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 |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
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| T |
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acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
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T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatc-ccaatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcttttattcatattaaagctttgactacggatatat |
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T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
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| T |
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ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
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T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
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| T |
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tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
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T |
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| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
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|||| |
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aaca |
3369578 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18163409 - 18162909
Alignment:
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T |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
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| T |
18163309 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtgaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctcata |
18163210 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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| T |
18163209 |
tctatgacccatgagatgcgatcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
18163110 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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| T |
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ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
18163011 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
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| T |
18163010 |
tctaa--atgtaataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
18162913 |
T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
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| T |
18162912 |
aaca |
18162909 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 5870665 - 5870159
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Q |
| |
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5870665 |
gttagaatgacaacaaaacacttgagtccacatctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcatatg |
5870566 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
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| T |
5870565 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
5870466 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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| T |
5870465 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtcttgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacat |
5870366 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatta- |
408 |
Q |
| |
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| T |
5870365 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattat |
5870266 |
T |
 |
| Q |
409 |
caataagtatt--aaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttac |
506 |
Q |
| |
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| | | || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
5870265 |
ctaaatataataaaaataaagagtgtcatatattattcaataataaaggtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttac |
5870166 |
T |
 |
| Q |
507 |
actaaca |
513 |
Q |
| |
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|| |||| |
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| T |
5870165 |
accaaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 22 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 19365757 - 19365389
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| || |||||||||||||| ||| ||||| |
|
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caataaagcacttgagtccacatctagggatcataatggtttcaggtctaagagtggtatacaccattatcattggtgagaatatcttatgacactttca |
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T |
 |
| Q |
121 |
taacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacc |
220 |
Q |
| |
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| T |
19365657 |
taacatactatgtagtactctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagatttaatatctcatactcatgacc |
19365558 |
T |
 |
| Q |
221 |
catgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagc |
320 |
Q |
| |
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| T |
19365557 |
catgagatgtggtcatcagtctacgtatataatagtctcaacactttattattaccccaatttatattaaagcttgactacggatacatttaagaatagc |
19365458 |
T |
 |
| Q |
321 |
gtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattct |
389 |
Q |
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|
| T |
19365457 |
gttctttacgttaatgtaatctcatgattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattct |
19365389 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 8 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 9538209 - 9537710
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Q |
| |
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T |
 |
| Q |
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tattacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatct |
207 |
Q |
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| T |
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tatgacactttcataacatgctatgtagtattctcacgctgggtcaatccagtataaatattactcctaacatttatacttatgtatagacttaatatct |
9538011 |
T |
 |
| Q |
208 |
catatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
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| T |
9538010 |
catatccatgactcatgagatgtggtcatca--atgcatacataatagtctatgcgttttattgttatcccaaattatattaaatattgactacatatac |
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T |
 |
| Q |
308 |
atttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattcta-gagactttattaatat |
406 |
Q |
| |
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| T |
9537912 |
atttaagaatagcgttctttatgttaatgtaaactctttatagagtcacacttgatattccattgcacgaactatctattctaggggactttattaatct |
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T |
 |
| Q |
407 |
tacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttac |
506 |
Q |
| |
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| T |
9537812 |
tacaacaattat--aataaa-aatgacatatattatttaataat-aaagtcatgatacataacataaatttaacataaactattggcctctggggcttac |
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Target: chr4; HSP #19
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Query Start/End: Original strand, 14 - 390
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Q |
| |
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tagaatggcaacaaagtacttgagtccacatctagggatcatagtggttttaggtcaaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgac |
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T |
 |
| Q |
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attttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatc |
213 |
Q |
| |
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aatctcataacttactatgtagtattctcacggtgggtctgtccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcatatc |
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T |
 |
| Q |
214 |
cataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaa |
313 |
Q |
| |
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4546125 |
tataacccatgagatgcgattatcagtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaagcttaactacggatacatttaa |
4546026 |
T |
 |
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314 |
taatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattcta |
390 |
Q |
| |
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| T |
4546025 |
gaataacgttctttatgataaagtattctcatgactaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattcta |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 22 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 19362647 - 19362229
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| |
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caataaagcatttaagtccacatctaaggatcatagtggtttcaggtttaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacactttgat |
19362548 |
T |
 |
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aacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataaccc |
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aacatactatgtagtactctcacgatgggtcaatccagtataaatattactcctaatattaatacctatgtatagatttaatatctcatattcatgaccc |
19362448 |
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321 |
Q |
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19362447 |
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19362354 |
T |
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421 |
Q |
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Q |
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| T |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 8e-94
Query Start/End: Original strand, 23 - 492
Target Start/End: Original strand, 5528545 - 5529012
Alignment:
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Q |
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T |
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| Q |
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222 |
Q |
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| T |
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T |
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322 |
Q |
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T |
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Q |
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| T |
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492 |
Q |
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| T |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 22 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 32636720 - 32636446
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Q |
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32636720 |
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32636622 |
T |
 |
| Q |
122 |
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221 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
222 |
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298 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 291
Target Start/End: Complemental strand, 5616635 - 5616363
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118 |
Q |
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| T |
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5616536 |
T |
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| Q |
119 |
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218 |
Q |
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| T |
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5616436 |
T |
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| Q |
219 |
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291 |
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| T |
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T |
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Back To:
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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Original strand, 23056128 - 23056586
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| Q |
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caataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcat |
121 |
Q |
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| T |
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23056227 |
T |
 |
| Q |
122 |
aacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataaccc |
221 |
Q |
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| T |
23056228 |
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23056325 |
T |
 |
| Q |
222 |
atgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcg |
321 |
Q |
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| T |
23056326 |
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23056425 |
T |
 |
| Q |
322 |
tttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaa |
421 |
Q |
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| T |
23056426 |
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23056523 |
T |
 |
| Q |
422 |
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485 |
Q |
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| T |
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T |
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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 284 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 38816687 - 38816460
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T |
 |
| Q |
383 |
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482 |
Q |
| |
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| T |
38816587 |
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38816491 |
T |
 |
| Q |
483 |
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513 |
Q |
| |
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|||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
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| T |
38816490 |
aaactattggcctctagggcttacaccaaca |
38816460 |
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Target: chr4; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 303 - 513
Target Start/End: Original strand, 11484265 - 11484472
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303 |
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402 |
Q |
| |
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||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |
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11484364 |
T |
 |
| Q |
403 |
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502 |
Q |
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| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |
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| T |
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11484461 |
T |
 |
| Q |
503 |
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513 |
Q |
| |
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| T |
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ttacaccaaca |
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T |
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Query Start/End: Original strand, 423 - 514
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taaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaacac |
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Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
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4545950 |
taaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacac |
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T |
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Q |
| |
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10628328 |
T |
 |
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248 |
Q |
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T |
 |
| Q |
249 |
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279 |
Q |
| |
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| T |
10628429 |
ataatagtctctatgctttaataatatccca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #29
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Query Start/End: Original strand, 53 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18262602 - 18262344
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149 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
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|
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18262602 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
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| T |
18262502 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
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T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
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18262402 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #30
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Query Start/End: Original strand, 53 - 307
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catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
18269463 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
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| T |
18269363 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
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T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
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| T |
18269263 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatac |
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157 |
Q |
| |
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|||||| | |||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||| | | |||||| ||| | |
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21798328 |
tggttttaggtctaacggtgatatacacaattatcaatgtgagaataacttatgacgcatttataacctactatgtagtattctgatcgtgggtaaattc |
21798229 |
T |
 |
| Q |
158 |
aatataaatattact-cataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataa |
252 |
Q |
| |
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| ||||||| ||||| | |||||| | ||| ||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||| |
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| T |
21798228 |
agtataaatgttacttcctaatatgtatacgcatgtatagaattgatatctcatatccataacatatgagatgtagtcatcagtctacatacataa |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #32
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Query Start/End: Original strand, 53 - 307
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53 |
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Q |
| |
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||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
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|
| T |
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catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
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| T |
55612973 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
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T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
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| T |
55612873 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
55612815 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Original strand, 10677399 - 10677540
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacatttt-cataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| |||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
10677399 |
catagtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgg |
10677498 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatg |
191 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
10677499 |
gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacatatg |
10677540 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Original strand, 10891039 - 10891180
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacatttt-cataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| |||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
10891039 |
catagtggtttcaagtcaaagggtgaaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacatttactatgtagtattctcatagtgg |
10891138 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatg |
191 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||| |
|
|
| T |
10891139 |
gtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacatatg |
10891180 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 868987 - 868776
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
868987 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
868888 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatc-tcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
868887 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactttttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
868788 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
868787 |
ataatagtctct |
868776 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 189
Target Start/End: Original strand, 5667944 - 5668083
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| |||| |
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|
| T |
5667944 |
catagtggtttcaggtctaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggtga |
5668043 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtaccta |
189 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
5668044 |
gtcaatccagtataaatattactcctaatatttataccta |
5668083 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5707666 - 5707499
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
5707666 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg |
5707567 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5707566 |
aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct |
5707499 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 97 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 5714294 - 5714127
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
5714294 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtg |
5714195 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
5714194 |
aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct |
5714127 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 223 - 513
Target Start/End: Original strand, 39422405 - 39422694
Alignment:
| Q |
223 |
tgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgt |
322 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| | | | |||| |||||| ||| | |||||||||| || | |||| ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||| || |
|
|
| T |
39422405 |
tgagatgtggtcatcaatgtgcataaataatagtctatacgctttattactaccttaattcatattaaagtttgtctacaaatacttttaagaataatgt |
39422504 |
T |
 |
| Q |
323 |
ttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaa |
422 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||| | | ||||||||| | ||||| |||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||| |||||| || ||| || |
|
|
| T |
39422505 |
cttatatgttaatgtaatctcacgattaagtctcgtttaattttccattacatgaactatttattttagggacattattaatcttacaacaaatat--aa |
39422602 |
T |
 |
| Q |
423 |
taaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacat-aaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||| |||| || |||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||| |||| |
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|
| T |
39422603 |
taaatagtgcgtcattttatttaataataacaatcatgatatgtaacataagtttaacataaaactattgacctctacgacttacaccaaca |
39422694 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 307
Target Start/End: Original strand, 19926577 - 19926835
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacatttt-cataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
19926577 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacatttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
19926676 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
19926677 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatttgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
19926776 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19926777 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
19926835 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26964030 - 26963819
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
26964030 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
26963931 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
26963930 |
atcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
26963831 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
26963830 |
ataatagtctct |
26963819 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 26970853 - 26970642
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
26970853 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
26970754 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
26970753 |
atcaatccaatataaatattactgctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
26970654 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
26970653 |
ataatagtctct |
26970642 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 53 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8858557 - 8858425
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
8858557 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
8858458 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatattt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
8858457 |
atcaatccaatataaatattactcctaatattt |
8858425 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 97 - 260
Target Start/End: Original strand, 10621194 - 10621361
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||| |
|
|
| T |
10621194 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaaaatttatatctatgtg |
10621293 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
10621294 |
aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctct |
10621361 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 126 - 307
Target Start/End: Original strand, 4426497 - 4426679
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| Q |
126 |
tactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatg |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | || |
|
|
| T |
4426497 |
tactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg |
4426596 |
T |
 |
| Q |
225 |
agatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||||||| |||||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
4426597 |
agatgtgatcatcagtctacccacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
4426679 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 35223906 - 35223802
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| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||| ||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
35223906 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggtggttcaatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgta |
35223807 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagac |
198 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
35223806 |
aagac |
35223802 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 28392995 - 28393093
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| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
28392995 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattacttctaatatttatatctatgt |
28393093 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 150 - 508
Target Start/End: Complemental strand, 56516346 - 56515991
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150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||||| ||||| ||| |
|
|
| T |
56516346 |
gtcaatccaatataaatattactcatgatatttatacgtatgtgaagacttgataactctttatccattatctgtgagatttgatcattaatctacctac |
56516247 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggat |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| | |||| || |||| ||| | | ||||| ||||||| ||||| || || |||| ||| | ||||||||| | | | | || |
|
|
| T |
56516246 |
ataatagtctctatgttttaatactatcgttattcacaataaagcttgactatagatac-ttcaagaataatgttctatatgttaatgaagtctcacaat |
56516148 |
T |
 |
| Q |
349 |
taagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaata |
448 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| || |||||| | ||| |||||||||| |||||||||||| ||| || || ||| |||||||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
56516147 |
taagtcacaattaatgtttcattactctaaccatctattctaaggactttattaatcttaaaacaaatat--aataaagaaagtc--tcattatttaata |
56516052 |
T |
 |
| Q |
449 |
ataaaagtcatgttacataacataagtttaacat-aaactattggtctctagggcttacac |
508 |
Q |
| |
|
|||||||| ||| |||| || |||| |||||| | ||||||||| |||||||||| |||| |
|
|
| T |
56516051 |
ataaaagtaatgatacaaaatataactttaacttaaaactattgacctctagggctgacac |
56515991 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 97 - 182
Target Start/End: Complemental strand, 8845549 - 8845461
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97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatattt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
8845549 |
tgagaatatattatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatattt |
8845461 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 182
Target Start/End: Original strand, 21454035 - 21454088
Alignment:
| Q |
129 |
tatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatattt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
21454035 |
tatgtagtattctcatggtgggtcaattcaatataaatattactcctaatattt |
21454088 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 449 - 505
Target Start/End: Complemental strand, 19361661 - 19361605
Alignment:
| Q |
449 |
ataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggctta |
505 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
19361661 |
ataaaattcatgatacatagcataagtttaacataaacaattggcctatagggctta |
19361605 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33888666 - 33888582
Alignment:
| Q |
129 |
tatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccat |
216 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||| ||||||||||| || |||||||||| |||||||||| || |||||| | |||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
33888666 |
tatgtggtattatcatggtgggtcaattca---taaatattacacataatatttatatctatgtgaaaacttgatatctcatatccat |
33888582 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 47166914 - 47167413
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
47166914 |
gttagaatgacaacaaagtacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatg |
47167013 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
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||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
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| T |
47167014 |
acaatctcataacttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatattactcataatatttatacctatgtatagacttaatatctcata |
47167113 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattt |
311 |
Q |
| |
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| T |
47167114 |
tctataacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaagcttgactacaaatacattt |
47167213 |
T |
 |
| Q |
312 |
aataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaa |
411 |
Q |
| |
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| T |
47167214 |
aagaataacgttctttatgataatgtaatctcatgataaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattacta |
47167313 |
T |
 |
| Q |
412 |
taagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaa |
511 |
Q |
| |
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||| ||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |
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|
| T |
47167314 |
taaatat--aataaagagtgtcacatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaa |
47167411 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 26 - 498
Target Start/End: Original strand, 19393493 - 19393963
Alignment:
| Q |
26 |
aaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcataaca |
125 |
Q |
| |
|
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|
| T |
19393493 |
aaagcacttgagtcaacatctagggatcatactggattcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgagattttcataaca |
19393592 |
T |
 |
| Q |
126 |
tactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatga |
225 |
Q |
| |
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| T |
19393593 |
tactatgtagtattctcacggtcggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcatatttatgacccatga |
19393692 |
T |
 |
| Q |
226 |
gatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgtttt |
325 |
Q |
| |
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| T |
19393693 |
aatgtggtcattagtctacatacataatagtctcgacgctttataattatcccaactcatattaaagcttgactacagatacatttaagaatagcattct |
19393792 |
T |
 |
| Q |
326 |
tgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataa |
425 |
Q |
| |
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| ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||| |
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| T |
19393793 |
ttatgttaatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacatgaactatctattatagagactttattaacattactacagatat--aataa |
19393890 |
T |
 |
| Q |
426 |
agagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctcta |
498 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19393891 |
agagtatcatatattatttaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctcta |
19393963 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19231135 - 19230634
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
19231135 |
gttagaatggcaacaaaacacttgagtccacatttagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatg |
19231036 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
19231035 |
acaatttcataacttattatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
19230936 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||||||||| |
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|
| T |
19230935 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaatgttttgactacggatacat |
19230836 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| || ||| ||||||||| | | |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
19230835 |
ttaagaatagcgttctttatgataatgtaatctcatgattaagttacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattac |
19230736 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||||| |
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|
| T |
19230735 |
tataaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacattaactattggcctctagggcgtacacc |
19230638 |
T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
19230637 |
aaca |
19230634 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 10668956 - 10669456
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaat-gtgagaatatcttat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
10668956 |
gttagaatggcaacaaagcatttgagtccacatttacggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcaattgcgagaatatcttat |
10669055 |
T |
 |
| Q |
111 |
tacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcat |
210 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
10669056 |
gacaatttcataacttactatgtagtattctcacggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcat |
10669155 |
T |
 |
| Q |
211 |
atccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttat--at-taaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10669156 |
atctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatc---atttattaatataaagattgactacggatac |
10669252 |
T |
 |
| Q |
308 |
atttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatt |
407 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||| || ||| ||||||||| | | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
10669253 |
atttaagaataacgttctttatgataatgtaatctgatgattaagtcacacttattatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatt |
10669352 |
T |
 |
| Q |
408 |
acaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttaca |
507 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
10669353 |
actataaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttaca |
10669450 |
T |
 |
| Q |
508 |
ctaaca |
513 |
Q |
| |
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| |||| |
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| T |
10669451 |
ccaaca |
10669456 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 8 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8465250 - 8464746
Alignment:
| Q |
8 |
caatgttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatct |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
8465250 |
caatgttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctaaggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatct |
8465151 |
T |
 |
| Q |
108 |
tattacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatct |
207 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
8465150 |
tatgacaatttcataacttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatct |
8465051 |
T |
 |
| Q |
208 |
catatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggat |
305 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8465050 |
catatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgtcgctttattattatcctttattcatattaaagcttcgactacggat |
8464951 |
T |
 |
| Q |
306 |
acatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaata |
405 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||| || | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |
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|
| T |
8464950 |
acatttaagaatagcgttctttaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaaca |
8464851 |
T |
 |
| Q |
406 |
ttacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggctta |
505 |
Q |
| |
|
||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
8464850 |
tta-tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgattcataagataggtttaacataaactattggcctctaggactta |
8464754 |
T |
 |
| Q |
506 |
cactaaca |
513 |
Q |
| |
|
||| |||| |
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|
| T |
8464753 |
caccaaca |
8464746 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18400351 - 18399851
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18400351 |
gttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctagagatcatagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatg |
18400252 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18400251 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
18400152 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18400151 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
18400052 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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| T |
18400051 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
18399953 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18399952 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
18399855 |
T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
18399854 |
aaca |
18399851 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 18407335 - 18406835
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
18407335 |
gttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctagagatcatagtggtttcaggtccaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatg |
18407236 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
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||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18407235 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
18407136 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
18407135 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
18407036 |
T |
 |
| Q |
310 |
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Q |
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T |
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T |
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Target: chr7; HSP #8
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T |
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Target: chr7; HSP #9
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Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 48808551 - 48809051
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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Target: chr7; HSP #10
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Target Start/End: Complemental strand, 2204799 - 2204298
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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T |
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aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
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Q |
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T |
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aaca |
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Target: chr7; HSP #14
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T |
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Q |
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taaatat--aataaagagtgtcacatactattcaataataaaagttatgatacataagataagttcaacataaactattggcatatagggcttacaccaa |
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Target: chr7; HSP #15
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Q |
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T |
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211 |
Q |
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18139592 |
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309 |
Q |
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| T |
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T |
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310 |
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407 |
Q |
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507 |
Q |
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T |
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513 |
Q |
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Target: chr7; HSP #16
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Q |
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T |
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221 |
Q |
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T |
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321 |
Q |
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T |
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322 |
tttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaata |
405 |
Q |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 8 - 487
Target Start/End: Original strand, 41681019 - 41681502
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T |
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202 |
Q |
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T |
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300 |
Q |
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T |
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301 |
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400 |
Q |
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T |
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Q |
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Target: chr7; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 42 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 3588129 - 3587657
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Q |
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T |
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Q |
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T |
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437 |
Q |
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T |
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513 |
Q |
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Target: chr7; HSP #19
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Q |
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T |
 |
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Q |
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T |
 |
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Q |
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T |
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Q |
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Target: chr7; HSP #20
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Target Start/End: Original strand, 31190490 - 31190929
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tattacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataata----tttgtacctatgtatagacttaat |
203 |
Q |
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 |
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204 |
atctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacgg |
303 |
Q |
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T |
 |
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304 |
atacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaa |
403 |
Q |
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T |
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404 |
tattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaa |
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Q |
| |
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Target: chr7; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 56 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 22969153 - 22968697
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ccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatat |
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cttgtataaacattactcctaatatttatacctacatataaacttaatttctcatatacatgacccatgggatgtggtcatcggtctacataaataatag |
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T |
 |
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tctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtca |
355 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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356 |
cacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtc--atatattatttaataataaa |
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Q |
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| T |
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cacttaatattccatcacacgaactatctattctctggactttatttatcttacaacaaatat--aataaa-aatgccatatatattattcaataataaa |
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T |
 |
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agtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
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Target: chr7; HSP #22
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Query Start/End: Original strand, 160 - 516
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cttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtc |
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atgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaacacaa |
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19858924 |
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Target: chr7; HSP #23
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Query Start/End: Original strand, 189 - 511
Target Start/End: Complemental strand, 14586236 - 14585910
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14586136 |
aaagtttgactaaggatacatttaataatagcgttcattaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatataccattatacgaactatctattt |
14586037 |
T |
 |
| Q |
389 |
tagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaa------taataaaagtcatgttacataacataagtttaacat |
482 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| | |
|
|
| T |
14586036 |
tagggactttattaacattacaacaaatat--aataaagagtgacatatattatttaataatagtaataaaagtcatgatacataacataaatttaactt |
14585939 |
T |
 |
| Q |
483 |
aaactattggtctctagggcttacactaa |
511 |
Q |
| |
|
|||||||||| | || |||||||||||| |
|
|
| T |
14585938 |
aaactattggcatttacggcttacactaa |
14585910 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 23 - 297
Target Start/End: Original strand, 25845542 - 25845816
Alignment:
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23 |
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122 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | ||||| | | |||||||||||||| | ||||||||| |
|
|
| T |
25845542 |
aataaagcacttgagtccacatctagggatcataatggtttcaggtctaagagtggtatacatcattattattttgagaatatcttatgatattttcata |
25845641 |
T |
 |
| Q |
123 |
acatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataaccca |
222 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||||||||| ||| | | | |
|
|
| T |
25845642 |
acatactatgtagtattctcacggtgtgtcaatccagtataaatattactcctaatattgacacatacgtatagacttaatatctcatattcatgagcaa |
25845741 |
T |
 |
| Q |
223 |
tgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttga |
297 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
25845742 |
tgagatgtggtcatcagtctacatgcataatagtctctacgatttattattatccggacttatattaaagcttga |
25845816 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 189 - 452
Target Start/End: Complemental strand, 16000052 - 15999791
Alignment:
| Q |
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288 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||| || |||||||| || ||||||| ||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||| ||||| |
|
|
| T |
16000052 |
atgtatggacttaatatctcatatctatgacccatgatatgtggtcatcagtctgcatacataaaagtctcgacgctttattattatcctaattcatatt |
15999953 |
T |
 |
| Q |
289 |
aaagtttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattc |
388 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| || | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15999952 |
aaagtttgactaaggatacatttaataatagcgttctttaaggtaatgtaatctcatgattaagtcacacttaatataccattatacgaactatctattt |
15999853 |
T |
 |
| Q |
389 |
tagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataa |
452 |
Q |
| |
|
||| |||| ||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
15999852 |
taggtacttaattaacattacaacaaatat--aataaagagtgacatatattatttaataataa |
15999791 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 22 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 19388793 - 19388452
Alignment:
| Q |
22 |
caataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcat |
121 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||| || | |||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
19388793 |
caataaaacacttaagtccacatctagggctcataatggtttcaggtctaagagtggtatacactattaccactatgagaatatcttatgacactttcat |
19388694 |
T |
 |
| Q |
122 |
aacatactat----gtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccata |
217 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||| ||| | | || ||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |
|
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| T |
19388693 |
aacatactatatatgtagtattctcatgattgggcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctttgtacaaacttaatatctcatattcatg |
19388594 |
T |
 |
| Q |
218 |
acccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataat |
317 |
Q |
| |
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| T |
19388593 |
acccgtgagatatggtcatcaatctatatacataataatctctatgcttttttattatcccaatttatatttaagcttgactacagatactattaaaaat |
19388494 |
T |
 |
| Q |
318 |
agcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacact |
359 |
Q |
| |
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|| ||| || || || ||||||| | | ||||||||| |||| |
|
|
| T |
19388493 |
agtgttctttatattgatgtaatctcacgattaagtctcact |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 175 - 490
Target Start/End: Original strand, 15170247 - 15170561
Alignment:
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274 |
Q |
| |
|
|||||||| | | |||||||||||||||||| ||||||||| ||| || |||| |||| || |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
15170247 |
taatatttatgcatatgtatagacttaatatgacatatccatgacctataagatgtggtgatcagtctacatatataatagtctctacgctttattatta |
15170346 |
T |
 |
| Q |
275 |
tcccaatt--tatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccatta |
372 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||| |||||||| ||| |||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |
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| T |
15170347 |
tcccaatttatatattaaagcttgactacaaatatatttaagaataacgttttttatgttaatgtaatctcatgattaagtcccacttaatattccatta |
15170446 |
T |
 |
| Q |
373 |
cacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacata |
472 |
Q |
| |
|
|| |||| ||||||| || |||||||||||| |||||| || ||| |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||| | |||||| ||| |
|
|
| T |
15170447 |
catgaac-atctattttatggactttattaattttacaacaattat--aataaagaatgtcgtatattatttaatattaaaactcacgatacatagaata |
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T |
 |
| Q |
473 |
agtttaacataaactatt |
490 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
15170544 |
aatttaacataaactatt |
15170561 |
T |
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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 7e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 2936099 - 2935846
Alignment:
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290 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| | ||||| |||||||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||||| ||||||| |
|
|
| T |
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gtatagacttaatatctcatatctatgacccatgagatgtagtcatcagtctacataaataacagtctcgatgctttattattatcgcaattcatattaa |
2936000 |
T |
 |
| Q |
291 |
agtttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattcta |
390 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||||||||||| | | |||||||| |||||||||| |||||| ||||||| ||||||| |
|
|
| T |
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agcttgactacggatacatttaagaataacgttctttatgttaatgtaatctcatgattaagt--cacttaatatataattacatgaactatttattcta |
2935902 |
T |
 |
| Q |
391 |
gagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaata |
448 |
Q |
| |
|
| ||||||||||| ||||||| || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
2935901 |
gggactttattaacattacaacaaatat--aatgaagagtgacatatattatttaata |
2935846 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 14592098 - 14591920
Alignment:
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110 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| | | | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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14591999 |
T |
 |
| Q |
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tacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtaccta |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
14591998 |
gacattttcataacaaactgtgtagtattctcacggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttataccta |
14591920 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 18257627 - 18257801
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117 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
18257627 |
tggcaacaaagcacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttt |
18257726 |
T |
 |
| Q |
118 |
tcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
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tcatgacatactatgtaatattctgacggtgggttaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
18257801 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16011689 - 16011511
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| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcact-tgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttat |
110 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||| | | | ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16011689 |
gttagaatggcaataaagaaatgtaagtccacatatagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattatcaatgtgagaatatcttat |
16011590 |
T |
 |
| Q |
111 |
tacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtaccta |
189 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
16011589 |
gacattttcataacaaactgtatagtattctcatggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttataccta |
16011511 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 170 - 505
Target Start/End: Original strand, 42150288 - 42150618
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170 |
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264 |
Q |
| |
|
|||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||| || | | |||||||||||| | |||| ||| |
|
|
| T |
42150288 |
actcctaatatttatacctatgtatagtagacttaatatctcatatctatgacccatgagatgtggttatcaatttacatacataatttagtctcgacgc |
42150387 |
T |
 |
| Q |
265 |
tttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaata |
364 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| | |||| |||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||| |
|
|
| T |
42150388 |
tttattattatcccaattcatattaaagcttgactacggatacattt-agaataacgttctttatgttaatgtaatctcatgattaagtcacac------ |
42150480 |
T |
 |
| Q |
365 |
ttccattacacgaactatctattc--tagagactttattaatattacaa--taagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatg |
460 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |
|
|
| T |
42150481 |
-------aca-gaactatctattctataggggctttattaacattactacctacaaatataacaaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcacg |
42150572 |
T |
 |
| Q |
461 |
ttacat-aacataagtttaacataaactattggtctctagggctta |
505 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
42150573 |
atacataaagataagtttaacataaactattggcctctagggctta |
42150618 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 393 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 22994173 - 22994055
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393 |
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492 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22994173 |
gactttattaacattactataaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattgg |
22994076 |
T |
 |
| Q |
493 |
tctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22994075 |
tctctagggcttacaccaaca |
22994055 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 513
Target Start/End: Original strand, 24443788 - 24444074
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308 |
Q |
| |
|
|||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||| | |||| ||| || ||| ||| |||||||| |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
24443788 |
atattcatgacccatgagatgtggtcattagtctacatacatgacagtctctacattttactatcattcca-tttgtattaaagcttgattacggacaca |
24443886 |
T |
 |
| Q |
309 |
tttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatta |
408 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |
|
|
| T |
24443887 |
tttaagaatatcgttttttatgttaatgtaatct---------------cttaatattccattacacgaactatctattctatgaattttattaatctta |
24443971 |
T |
 |
| Q |
409 |
caataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacac |
508 |
Q |
| |
|
|| || ||| |||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| | ||||||| |
|
|
| T |
24443972 |
taacaaatat--aataaagaatgcaatatattattcaataataaaaatcatgatagataacataagtttaacataagctattgacctctaagacttacac |
24444069 |
T |
 |
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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 149
Target Start/End: Original strand, 15169352 - 15169482
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19 |
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118 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||||||||||| | |||||||||||||| | | |||||||| ||| || ||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
15169352 |
tggcaataaagcatttaagtccacatcttgggatcatagtggttttaggactaagagtagcatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacatttt |
15169451 |
T |
 |
| Q |
119 |
cataacatactatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
15169452 |
cataacatactatgtagtattctaacggtgg |
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Target: chr7; HSP #36
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caataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcat |
121 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| || |||||||| | |||| ||||| | ||| ||||| |
|
|
| T |
5982778 |
caataaaacactttagtccatatctaagaatcatggtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcaa--taagaagatcttgtgacaccttcat |
5982875 |
T |
 |
| Q |
122 |
aacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataaccc |
221 |
Q |
| |
|
||| ||| |||||| ||| ||| ||||||| |||| | ||||||| |||||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||| || |||| |
|
|
| T |
5982876 |
aacttaccatgtagcattctcatggtgggttaatcaagtataaatgttactccaaatatttacacgcatgtatagatgtcatatctcatatatatgaccc |
5982975 |
T |
 |
| Q |
222 |
atgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcg |
321 |
Q |
| |
|
||| | || |||| | ||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||| |
|
|
| T |
5982976 |
gtgacacgtgatcatcaatctacatacataatagtctacacactttattactatcccaatttatattaaatcttgactacaactacttttaagaatatta |
5983075 |
T |
 |
| Q |
322 |
tttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaat |
404 |
Q |
| |
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|| || || |||| || || | | ||||||||| |||||||| || |||||| ||| |||| ||||||| ||||||||||| |
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| T |
5983076 |
ttctttatattaaagttatctcacgattaagtctcacttaatgtttcattacttgaaatatcaattctaggaactttattaat |
5983158 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 15152833 - 15152575
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
15152833 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
15152734 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
15152733 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
15152634 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
15152633 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
15152575 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29328174 - 29327916
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
29328174 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
29328075 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
29328074 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
29327975 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29327974 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
29327916 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 437 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 48813825 - 48813748
Alignment:
| Q |
437 |
tattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaacac |
514 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
48813825 |
tattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacac |
48813748 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 307
Target Start/End: Original strand, 11542841 - 11543055
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
11542841 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacatttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg |
11542940 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaag |
292 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
11542941 |
aagactagataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaag |
11543040 |
T |
 |
| Q |
293 |
tttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
11543041 |
cttgactacggatac |
11543055 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 22 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 12409777 - 12409650
Alignment:
| Q |
22 |
caataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcat |
121 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| | | | ||| ||||| |||| ||| |||||| |
|
|
| T |
12409777 |
caataaaacacttgagtccacatctacggatcatagtggtttcatgtttaagagtggtatacaatattctaactatgataatattttatgacactttcat |
12409678 |
T |
 |
| Q |
122 |
aacatactatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
12409677 |
aacatactgtgtagcattctcatggtgg |
12409650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 97 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 2365265 - 2365181
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatt |
181 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| |||||| |||||| | |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2365265 |
tgagaataacttatgacatttacataacttcctatgtagcattttcatggtgggtcaatccaatgtaaatattactcctaatatt |
2365181 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 55 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 12751214 - 12751075
Alignment:
| Q |
55 |
tagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggt |
151 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || | |
|
|
| T |
12751214 |
tagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggat |
12751115 |
T |
 |
| Q |
152 |
caatccaatataaatattactcataatatttgtacctatg |
191 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
12751114 |
caatccaatataaatattactcataatatttatatctatg |
12751075 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 460
Target Start/End: Original strand, 14073105 - 14073193
Alignment:
| Q |
370 |
ttacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatg |
460 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14073105 |
ttacatgaactatctattcaagagactttattaatattacaacaagtat--aataaagaatgccttattttatttaatattaaaagtcatg |
14073193 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 370 - 460
Target Start/End: Original strand, 14383133 - 14383221
Alignment:
| Q |
370 |
ttacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatg |
460 |
Q |
| |
|
||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || | ||| |||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
14383133 |
ttacatgaactatctattcaagagactttattaatattacaacaagtat--aataaagaatgccttattttatttaatattaaaagtcatg |
14383221 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 307
Target Start/End: Original strand, 11535923 - 11536137
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |
|
|
| T |
11535923 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtg |
11536022 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaag |
292 |
Q |
| |
|
||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
11536023 |
aagactggataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaag |
11536122 |
T |
 |
| Q |
293 |
tttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |
|
|
| T |
11536123 |
cttgactacggatac |
11536137 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 126 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18561321 - 18561186
Alignment:
| Q |
126 |
tactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatg |
224 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | || |
|
|
| T |
18561321 |
tactatgtagtattctcatagagggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtg |
18561222 |
T |
 |
| Q |
225 |
agatatggtcattagtctacatacataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||| || |||| ||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
18561221 |
agatgtgatcatcagtctacccacataatagtctct |
18561186 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 439 - 485
Target Start/End: Original strand, 5983251 - 5983297
Alignment:
| Q |
439 |
ttatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaa |
485 |
Q |
| |
|
||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5983251 |
ttatttagtaataaaagtcatgatacatatcataagtttaacataaa |
5983297 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 12738882 - 12738806
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatatta |
170 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12738882 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatta |
12738806 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 13392496 - 13392398
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
13392496 |
tgagaatatcttatgacacttttcataaattttactatgtaatattcgcatggtgggtcaatccagtataaatatttctcctaatatttattcctatgt |
13392398 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Original strand, 19393966 - 19394019
Alignment:
| Q |
50 |
gatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaat |
103 |
Q |
| |
|
||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| |
|
|
| T |
19393966 |
gatcacagtgttttcaggtctaagagtgatatacactgttatcattgtgagaat |
19394019 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 464 - 513
Target Start/End: Original strand, 31190951 - 31191000
Alignment:
| Q |
464 |
cataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
31190951 |
catagcataagtttaacataaattattggcctctaaggcttacaccaaca |
31191000 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 273; Significance: 1e-152; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 513
Target Start/End: Original strand, 20736394 - 20736882
Alignment:
| Q |
22 |
caataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcat |
121 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
20736394 |
caataaagcacttgagtccacatctagggatcatagtagttttaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgacattttcat |
20736493 |
T |
 |
| Q |
122 |
aacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataaccc |
221 |
Q |
| |
|
| |||| ||||||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
20736494 |
agcataatatgtagtattctcacgatggatcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctat-tataaacttaatatctcatatctataacac |
20736592 |
T |
 |
| Q |
222 |
atgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcg |
321 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| | |
|
|
| T |
20736593 |
atgagatgtggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcccagttcttattaaagcttgactacagatacatttaagaataatg |
20736692 |
T |
 |
| Q |
322 |
tttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaa |
421 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||||| | | |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||| | |
|
|
| T |
20736693 |
ttctttatgttaatgtaatctcatgattaagtcaaacttaatataccattacacgaactatctattctaggaactttattaacattacaacaaatat--a |
20736790 |
T |
 |
| Q |
422 |
ataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||| |
|
|
| T |
20736791 |
ataaagagtggcatatattatttaataataaaagtcatgatacataacataagattaacataacctattggcctctagggcatacaccaaca |
20736882 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 31 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8613147 - 8612664
Alignment:
| Q |
31 |
acttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattt----tcataacat |
126 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||| | |
|
|
| T |
8613147 |
acttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatgacaattaatctcataacgt |
8613048 |
T |
 |
| Q |
127 |
actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgag |
226 |
Q |
| |
|
||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
8613047 |
actatgtagtattctcacggtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcatatctataacccatgag |
8612948 |
T |
 |
| Q |
227 |
atatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgttttt |
326 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| || |
|
|
| T |
8612947 |
atgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaa-ttatattaaagcttgactacggatacatttaagaatagtgttctt |
8612849 |
T |
 |
| Q |
327 |
gatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaa |
426 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||| |||||| |
|
|
| T |
8612848 |
tatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattactatgaatat--aataaa |
8612751 |
T |
 |
| Q |
427 |
gagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8612750 |
gagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
8612664 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #3
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Target Start/End: Complemental strand, 16789318 - 16788818
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T |
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211 |
Q |
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acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
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T |
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tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
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T |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
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T |
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Q |
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T |
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aaca |
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T |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #4
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Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 18019896 - 18020396
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T |
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Q |
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T |
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309 |
Q |
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T |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
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Q |
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T |
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509 |
Q |
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T |
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Q |
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aaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 1586163 - 1586663
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Q |
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T |
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aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
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T |
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aaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 22859943 - 22860443
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T |
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309 |
Q |
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T |
 |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
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| |
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 |
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509 |
Q |
| |
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aaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
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Target Start/End: Original strand, 5758555 - 5759034
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agtcatcagtctacatacataatattctcgacgctttattattatcctaa-ttatattaaagctttactacggatacatttaataatattgttctttatg |
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T |
 |
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ttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagt |
430 |
Q |
| |
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ataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagaactttattaacattactataaatat--aataaagagt |
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 |
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gtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
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Q |
| |
|
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|
|
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atcatatattattcaataataaaagtcatcatacataagataagtttaacataaattattggcctctagggcttacaccaaca |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #8
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Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 27508402 - 27508903
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
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Q |
| |
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T |
 |
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309 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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| T |
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ttaagaatagcgttctataatataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
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T |
 |
| Q |
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aataagtattaaataaagagtgtcatatattatt-taataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacac |
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Q |
| |
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|
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tctaaatat--aataaagagtgtcatatattattacaataataaaagtcatgatacataaaataggtttaacataaactattggcctctagggcttacac |
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T |
 |
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509 |
taaca |
513 |
Q |
| |
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| T |
27508899 |
caaca |
27508903 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 27527988 - 27528489
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| |
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|
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Q |
| |
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|
| T |
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acattttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatacaaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
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T |
 |
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tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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T |
 |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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| T |
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ttaagaatagcgttctataatataatgtaatttcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
27528386 |
T |
 |
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aataagtattaaataaagagtgtcatatattatt-taataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacac |
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Q |
| |
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tctaaatat--aataaagagtgtcatatattattacaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctttagggcttacac |
27528484 |
T |
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taaca |
513 |
Q |
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27528485 |
caaca |
27528489 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 19218661 - 19218179
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222 |
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321 |
Q |
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19218369 |
T |
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421 |
Q |
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T |
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513 |
Q |
| |
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| T |
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19218179 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 225; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 8 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14074731 - 14074227
Alignment:
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Q |
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| T |
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T |
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| Q |
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207 |
Q |
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| T |
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14074532 |
T |
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305 |
Q |
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| T |
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405 |
Q |
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| T |
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14074332 |
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Q |
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| T |
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14074235 |
T |
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506 |
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513 |
Q |
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| T |
14074234 |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 22560249 - 22560740
Alignment:
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T |
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211 |
Q |
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| T |
22560339 |
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22560438 |
T |
 |
| Q |
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311 |
Q |
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| T |
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22560538 |
T |
 |
| Q |
312 |
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409 |
Q |
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| T |
22560539 |
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T |
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| Q |
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509 |
Q |
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| T |
22560639 |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 8 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 21994839 - 21994404
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Q |
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| T |
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T |
 |
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207 |
Q |
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| T |
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T |
 |
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307 |
Q |
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| T |
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catatccatgataaataagttgtggtcatcagtctacatatataatagtctttgcgctttattattattccaatttatattaaagctcgactatggatac |
21994540 |
T |
 |
| Q |
308 |
atttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatt |
407 |
Q |
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| T |
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21994440 |
T |
 |
| Q |
408 |
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445 |
Q |
| |
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| T |
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acaacaagtat--aataaagagtatcatatattattta |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 178; E-Value: 1e-95
Query Start/End: Original strand, 8 - 491
Target Start/End: Original strand, 10359102 - 10359567
Alignment:
| Q |
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Q |
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T |
 |
| Q |
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tattacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatct |
207 |
Q |
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| T |
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tatgacactt-cataacatactatgtagtattttcacggtgggtcgatccagtataaatattacctataatatttatatctatgtatagacttaatatct |
10359300 |
T |
 |
| Q |
208 |
catatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
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| T |
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cacattcatga-ccatgagatgtggtcatcactctacatatataatagtctctacgctttattattatctcaatttatattaaagctcgactacagaaac |
10359399 |
T |
 |
| Q |
308 |
atttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatt |
407 |
Q |
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| T |
10359400 |
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10359485 |
T |
 |
| Q |
408 |
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491 |
Q |
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| || || ||| ||||| | |||||||| |||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |
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Target: chr6; HSP #15
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Query Start/End: Original strand, 23 - 513
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T |
 |
| Q |
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acatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataaccca |
222 |
Q |
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| T |
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T |
 |
| Q |
223 |
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322 |
Q |
| |
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| T |
4073612 |
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T |
 |
| Q |
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420 |
Q |
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| T |
4073512 |
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4073413 |
T |
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| Q |
421 |
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513 |
Q |
| |
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Back To:
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Target: chr6; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 165 - 505
Target Start/End: Original strand, 13995151 - 13995490
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T |
 |
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tttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaa |
362 |
Q |
| |
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| T |
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tttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcattctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaa |
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T |
 |
| Q |
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tattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgtt |
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Q |
| |
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| T |
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tatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tctaaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgat |
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T |
 |
| Q |
463 |
acataacataagtttaacataaactattggtctctagggctta |
505 |
Q |
| |
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acataagataggtttaacataaactattggcctctagggctta |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #17
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Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Original strand, 17120560 - 17120743
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Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |
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 |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtata |
195 |
Q |
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|
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acaatttcataacatactatttagcattctcacagtgggtcaatccagtataaatactactcctagtatttatacctatgtata |
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Target: chr6; HSP #18
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Query Start/End: Original strand, 249 - 514
Target Start/End: Original strand, 17120741 - 17121003
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|
|||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||| || ||| |||| |||| | | || |
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 |
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448 |
Q |
| |
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T |
 |
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ataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctcta-gggcttacactaacac |
514 |
Q |
| |
|
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|
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Target: chr6; HSP #19
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T |
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tcatatattattt-aataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
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Q |
| |
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Target: chr6; HSP #20
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369 |
attacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataa |
468 |
Q |
| |
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| T |
14997000 |
attacacgaactatctattctaaggactttattaaaattata-taaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataattaaagtcataatacataa |
14996904 |
T |
 |
| Q |
469 |
cataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
14996903 |
gataagtttaacataaaatattggcctctagatcttacaccaaca |
14996859 |
T |
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Target: chr6; HSP #21
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317 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| |
|
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23846648 |
acccatgagatgcagtcattagtctacatacataatagtctctgtactatattattatcccaatttatattaaagtttgactacagatacttttaagaat |
23846747 |
T |
 |
| Q |
318 |
agcgtttttgatgttaatgt |
337 |
Q |
| |
|
|| ||| || |||| ||||| |
|
|
| T |
23846748 |
agtgttctttatgtaaatgt |
23846767 |
T |
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Target: chr6; HSP #22
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Target Start/End: Original strand, 17684286 - 17684544
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149 |
Q |
| |
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
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| T |
17684386 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
17684485 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
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|
|
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ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcatcaaagcttgactacggatac |
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T |
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Target: chr6; HSP #23
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149 |
Q |
| |
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||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
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|
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
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| T |
27381169 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
27381268 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
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|||||| ||||| |
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| T |
27381269 |
ataatagtctct |
27381280 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #24
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Query Start/End: Original strand, 53 - 260
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149 |
Q |
| |
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| T |
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
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| T |
27471552 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
27471651 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
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|||||| ||||| |
|
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27471652 |
ataatagtctct |
27471663 |
T |
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Target: chr6; HSP #25
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Query Start/End: Original strand, 53 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29309280 - 29309022
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149 |
Q |
| |
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|
| T |
29309280 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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| T |
29309180 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
29309081 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
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|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29309080 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
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T |
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Target: chr6; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 53 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 29316240 - 29315982
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53 |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
29316240 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
29316141 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
29316140 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatatgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
29316041 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
29316040 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
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Target: chr6; HSP #27
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Target Start/End: Complemental strand, 11652113 - 11651902
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
| T |
11652013 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac |
11651914 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
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ataatagtctct |
11651902 |
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Target: chr6; HSP #28
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Q |
| |
|
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|
|
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188794 |
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
188894 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
188936 |
T |
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Target: chr6; HSP #29
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Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | | |||||||||||| ||| |||||||||| | |||| |||||||| ||| ||||| |
|
|
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T |
 |
| Q |
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gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
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Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
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gtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
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T |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
17691257 |
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T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
17691357 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
17691399 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
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catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
27297019 |
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T |
 |
| Q |
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gtcaatccaatataaatattactcataatattt |
182 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
27296919 |
atcaatccaatataaatattactcctaatattt |
27296887 |
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Target: chr6; HSP #32
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Q |
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|||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||| |
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|
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tattatttaataataaaagtcatgatacatatcataggtttaacataaattattgg-ctatagggcttacaccaaca |
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T |
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Target: chr6; HSP #33
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Q |
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|
|
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| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
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Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
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Target: chr6; HSP #36
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Q |
| |
|
|||||||||| | | || |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |
|
|
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T |
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192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||| || | |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
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tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatatgacacctaatatttatatctatgt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6; HSP #38
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| |
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T |
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Target: chr6; HSP #39
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| |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 36)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
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T |
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211 |
Q |
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T |
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tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
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T |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
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T |
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410 |
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509 |
Q |
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T |
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aaca |
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Target: chr1; HSP #2
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Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 43802420 - 43802920
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T |
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Q |
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T |
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309 |
Q |
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T |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
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Q |
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T |
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410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
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tctaaatat--aataaagagtgtcatatattattcaatattaaaagtcatgatacataagatatgtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
43802916 |
T |
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510 |
aaca |
513 |
Q |
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aaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #3
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Target Start/End: Complemental strand, 9456363 - 9455862
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T |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
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Q |
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| |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 42817044 - 42817544
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T |
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309 |
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| |
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T |
 |
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310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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 |
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410 |
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509 |
Q |
| |
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tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
42817540 |
T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
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|||| |
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aaca |
42817544 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 28134778 - 28135278
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T |
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211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
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|
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T |
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tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
|
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|
|
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28134978 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataattgtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagatacat |
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T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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T |
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| Q |
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aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
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|
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T |
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aaca |
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| |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #6
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Q |
| |
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T |
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tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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20779900 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
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T |
 |
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310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
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Q |
| |
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 |
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aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
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Q |
| |
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|
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20780099 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattatacaataataaaagtcatgatacataagataaatataacataaactattggcctctagggcttacacc |
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T |
 |
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aaca |
513 |
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| |
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|||| |
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aaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 22670312 - 22670812
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Q |
| |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
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acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
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T |
 |
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212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
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Q |
| |
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| T |
22670512 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggattcat |
22670611 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
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| T |
22670612 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
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 |
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aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
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| |
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| T |
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T |
 |
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510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
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|||| |
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aaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #8
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309 |
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T |
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409 |
Q |
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| T |
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T |
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509 |
Q |
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20391790 |
T |
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513 |
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20391791 |
aaca |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 47667540 - 47668029
Alignment:
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Q |
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T |
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211 |
Q |
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T |
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309 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
310 |
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409 |
Q |
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ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
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T |
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410 |
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509 |
Q |
| |
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tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 12 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 22612739 - 22612233
Alignment:
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Q |
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T |
 |
| Q |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
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| T |
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acaatttcataacttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaataaaaatattactcccaatatttatatctatgtatagacttgatatatcata |
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T |
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| Q |
212 |
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305 |
Q |
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22612440 |
T |
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| Q |
306 |
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405 |
Q |
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| T |
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22612340 |
T |
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| Q |
406 |
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504 |
Q |
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| T |
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22612243 |
T |
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| Q |
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514 |
Q |
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T |
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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8727914 - 8727412
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Q |
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T |
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211 |
Q |
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| T |
8727814 |
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8727715 |
T |
 |
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212 |
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308 |
Q |
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| T |
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8727615 |
T |
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| Q |
309 |
tttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatta |
408 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
409 |
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507 |
Q |
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| T |
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8727418 |
T |
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513 |
Q |
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ccaaca |
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Target: chr1; HSP #12
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Target Start/End: Complemental strand, 35930713 - 35930329
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T |
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tatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacatttaataatagcgtttt |
325 |
Q |
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T |
 |
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326 |
tgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataa |
425 |
Q |
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T |
 |
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agagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
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T |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 12 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 634181 - 633814
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Q |
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T |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
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acaatctcataacttactatgtagtattctcacggtgggttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcata |
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T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattt |
311 |
Q |
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| T |
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gctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttgttattatccttattcatattaaagcttgactacggatacattt |
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T |
 |
| Q |
312 |
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379 |
Q |
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633881 |
aaaaataatgttctttatgataatttaatctcatgattaagttacacttaatatattattacacgaac |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 172; E-Value: 5e-92
Query Start/End: Original strand, 23 - 437
Target Start/End: Complemental strand, 29096958 - 29096548
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T |
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Q |
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acatgctatgtagtattcacacggtggatcaatctagtataaatattattcctaatatgtatacctatgtatagacttagtatctcatattcatgaccca |
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 |
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322 |
Q |
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| T |
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 |
| Q |
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ttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaa |
422 |
Q |
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Q |
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29096562 |
taaagaatgtcatat |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 162; E-Value: 4e-86
Query Start/End: Original strand, 56 - 513
Target Start/End: Original strand, 21881475 - 21881931
Alignment:
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T |
 |
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ccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatat |
255 |
Q |
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cttgtataaacattactcctaatatttatacctacatataaacttaatttctcatatacatgacccatgggatgtggtcatcggtctacataaataatag |
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T |
 |
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tctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtca |
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Q |
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| T |
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tcttgacactttatcattatcctaatttatattaaagattgactacggatacatttaagaattgcattctttacattaatgtaatctcatgattaattaa |
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T |
 |
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356 |
cacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtc--atatattatttaataataaa |
453 |
Q |
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 |
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agtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
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Q |
| |
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Back To:
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Target: chr1; HSP #16
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Query Start/End: Original strand, 284 - 513
Target Start/End: Original strand, 26923676 - 26923900
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 251
Target Start/End: Original strand, 26923539 - 26923678
Alignment:
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26923539 |
acattttcataacatactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagtataaatattactcctaatattcataccaatgtatagacttaatatctcata |
26923638 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacata |
251 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26923639 |
tctatgacccatgagatgtggtcatcagtctacatacata |
26923678 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 6e-39
Query Start/End: Original strand, 332 - 513
Target Start/End: Original strand, 22234851 - 22235029
Alignment:
| Q |
332 |
taatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtg |
431 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
22234851 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatc-taaatat--aataaagagtg |
22234947 |
T |
 |
| Q |
432 |
tcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
22234948 |
ccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
22235029 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 18252420 - 18252162
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
18252420 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
18252321 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
18252320 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
18252221 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
18252220 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
18252162 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 12 - 91
Target Start/End: Original strand, 28145778 - 28145857
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattat |
91 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
28145778 |
gttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacattattat |
28145857 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 51997505 - 51997341
Alignment:
| Q |
33 |
ttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcataacatactatg |
132 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||| |||| | ||||||||| |||||||| ||||| | | ||||||| || || | |
|
|
| T |
51997505 |
ttgagtccaaatctaaggatcatagtagtttctggtctaagcgtggtatatatcattatcaatatgagaataacttatgatacattcataatattttacg |
51997406 |
T |
 |
| Q |
133 |
tagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtataga |
197 |
Q |
| |
|
||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |
|
|
| T |
51997405 |
tagtattctcatggtgggtcaatctaatataaatattactcctaatatttataaatatgtataga |
51997341 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 89 - 192
Target Start/End: Original strand, 3855772 - 3855878
Alignment:
| Q |
89 |
tatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgta |
185 |
Q |
| |
|
||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |
|
|
| T |
3855772 |
tatcactgtgagaatatcttatgacacttttcataacctttactatgtagtattctcattgcgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttata |
3855871 |
T |
 |
| Q |
186 |
cctatgt |
192 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
3855872 |
cctatgt |
3855878 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 19817819 - 19817619
Alignment:
| Q |
9 |
aatgttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatctt |
108 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||| ||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||| || |
|
|
| T |
19817819 |
aatgttcgattgacaaaaaaacacttgagtccgcatataggaatcatagtcgtttcaattctaagagtgacatataccattatcattatgagaatatttt |
19817720 |
T |
 |
| Q |
109 |
attacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc |
208 |
Q |
| |
|
|| | | ||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||| ||||||||||||| || |||||||| || | ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19817719 |
ataaaagttttataacatgctatgtaatattttca-tgtgggttaatctaatataaatattattcctaatatttacac---tatatagacttaatatctc |
19817624 |
T |
 |
| Q |
209 |
atatc |
213 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
19817623 |
gtatc |
19817619 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 254
Target Start/End: Original strand, 27131226 - 27131431
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
27131226 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
27131325 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
27131326 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
27131425 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataata |
254 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
27131426 |
ataata |
27131431 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 126 - 200
Target Start/End: Original strand, 36816526 - 36816600
Alignment:
| Q |
126 |
tactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagactt |
200 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||| |
|
|
| T |
36816526 |
tactatgtagtattctcatggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgtagactt |
36816600 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 18532331 - 18532542
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
18532331 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
18532430 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| |||||| ||| |
|
|
| T |
18532431 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctatctac |
18532530 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
18532531 |
ataatagtctct |
18532542 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 22657114 - 22657192
Alignment:
| Q |
126 |
tactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaata |
204 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |
|
|
| T |
22657114 |
tactatgtagtattcacatggtgggtcaatctaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttaata |
22657192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Original strand, 27310394 - 27310605
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | | |||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
27310394 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactataagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
27310493 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||| ||| ||||||||| | |||||| || |||| ||||||| || |
|
|
| T |
27310494 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccataatctgtgagatgtgatcatcagtctacccac |
27310593 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
27310594 |
ataatagtctct |
27310605 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 16358896 - 16358994
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattacattt-tcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |
|
|
| T |
16358896 |
tgagaatatcttatgacacttctcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgt |
16358994 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 21171094 - 21171192
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
21171094 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
21171192 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 159 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 24241452 - 24241328
Alignment:
| Q |
159 |
atataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctac-atacataatattc |
257 |
Q |
| |
|
|||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| || ||||| |||| |||||| ||| ||||| ||| | | |||||| || |
|
|
| T |
24241452 |
atataaatattagtcataatatttatacatatgtatagacttgatatctaatgtccatgacccgtgagatttgg---ttagtgtacaaaatataataatc |
24241356 |
T |
 |
| Q |
258 |
tctgcgctttattattatcccaatttat |
285 |
Q |
| |
|
||| ||||||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
24241355 |
tctacgctttactattatctcaatttat |
24241328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 14482337 - 14482299
Alignment:
| Q |
475 |
tttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
14482337 |
tttaacataaactattggcctctagggcttacactaaca |
14482299 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 16435889 - 16435650
Alignment:
| Q |
223 |
tgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattatta---tcccaatttatattaaagtttgactacggatacattt---aataa |
316 |
Q |
| |
|
||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||| ||||| |
|
|
| T |
16435889 |
tgagacatggttatcagtctacatacatattagtctctacgctttattattattttctcaatttataataaagttcgactatggttacttttcaaaataa |
16435790 |
T |
 |
| Q |
317 |
tagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagt |
416 |
Q |
| |
|
|| ||||| |||| |||||||| | | |||||||| || ||||| | |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||| | || | |
|
|
| T |
16435789 |
ta--tttttttatgtgaatgtaatctcacaattaagtctcatttaatgtcgcattacttaaaatatctattctaagaactttattaatcttatataaaat |
16435692 |
T |
 |
| Q |
417 |
attaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatg |
460 |
Q |
| |
|
|| |||||||| |||| || |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
16435691 |
at--aataaagaatgtctcattttatttaataataaaagtcatg |
16435650 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 402
Target Start/End: Original strand, 12014397 - 12014453
Alignment:
| Q |
346 |
gattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttatta |
402 |
Q |
| |
|
|||||| | |||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12014397 |
gattaatttacacttaatattccattaaacggactatgtattctagtgactttatta |
12014453 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 192
Target Start/End: Original strand, 27277469 - 27277516
Alignment:
| Q |
145 |
ggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
27277469 |
ggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt |
27277516 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 53 - 170
Target Start/End: Original strand, 22641691 - 22641810
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataac--atactatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| |||||||||||||||| ||| |||| ||||| ||||||||||| || ||| ||||| |
|
|
| T |
22641691 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactgtgagaatatcttatgacactttttataacttttactatgtagt-ttctcatggtgg |
22641789 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatatta |
170 |
Q |
| |
|
||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
22641790 |
gtcaatctagtataaatatta |
22641810 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 23)
Name: chr2
Description:
Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
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Target Start/End: Complemental strand, 19616686 - 19616205
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Q |
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19616686 |
caatgttagaatgacaataaaacactcaagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatca |
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T |
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207 |
Q |
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tatgacattttcataaaatactatgtagtattctcacggtgggtcaattcagaataaatgttactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct |
19616487 |
T |
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catatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
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| T |
19616486 |
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19616388 |
T |
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407 |
Q |
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19616387 |
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19616288 |
T |
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Q |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 30174624 - 30174124
Alignment:
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T |
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Q |
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T |
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tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
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T |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
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ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
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T |
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410 |
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Q |
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tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
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T |
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513 |
Q |
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30174127 |
aaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 21 - 504
Target Start/End: Original strand, 15342066 - 15342548
Alignment:
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T |
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219 |
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taacatactatgtagtattttcacggtgggttaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtataaaacttaatatctcatatcaatgac |
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T |
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319 |
Q |
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15342365 |
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419 |
Q |
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| T |
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T |
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420 |
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504 |
Q |
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15342465 |
-aataacgaatgtcatatattatttaacaataaaagtcatgatacataatataagtttaacataaactattggcctctaaggctt |
15342548 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 24229270 - 24229770
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T |
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211 |
Q |
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T |
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309 |
Q |
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| T |
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T |
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| Q |
310 |
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409 |
Q |
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| T |
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509 |
Q |
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| T |
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T |
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513 |
Q |
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24229767 |
aaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 24250087 - 24250587
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T |
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Q |
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| T |
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T |
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409 |
Q |
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| T |
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ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcgcacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
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T |
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410 |
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Q |
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T |
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510 |
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513 |
Q |
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| T |
24250584 |
aaca |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 5e-89
Query Start/End: Original strand, 150 - 507
Target Start/End: Original strand, 24763750 - 24764105
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T |
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Q |
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T |
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Q |
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| T |
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aagtcacgcttaatatactattacatgaactatctattcttgggactttattaacattataacaaatat--aataaagatttccatgtattatttaataa |
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T |
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taaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttaca |
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Q |
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taaaagtcattatacataacataagtttaacataaactattggcctccagggcttaca |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 8 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 29800722 - 29800429
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T |
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tattacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagac----ttaat |
203 |
Q |
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| T |
29800622 |
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T |
 |
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204 |
atctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttga |
297 |
Q |
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29800522 |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 98 - 479
Target Start/End: Original strand, 28718915 - 28719316
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gagaatattttatgaaacttttataacatactgtgtagtattctcacgatgagtcaatcaagtataaatattactcctaatatttatatctacgtacaga |
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T |
 |
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cttaatatctcatatccataacccatg-------agatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaa |
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Q |
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cttaatatttcatattcataactcctgtctcttgagatatggtcatcagtctacatacataatagtctctacgttttattattatctcaatttatactaa |
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T |
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T |
 |
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aactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtt |
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aactatatattctaaggactttattaattttacaataagta-taataaaagaatgtcttattttgtttaataataaaagtcatgatacatataataagtt |
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T |
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477 |
taa |
479 |
Q |
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| T |
28719314 |
taa |
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T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 266 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21626674 - 21626429
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ttattattatcccattttatattaaaatttgacttcggatacttttaagaatattgttctttatgttaatgtaatgtcatgattaagtcttacttaatgt |
21626575 |
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tccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttaca |
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| T |
21626574 |
tccatcacatgaactatctattcgagggactttattaatcttataacaaatat--aataaagaatgccttattttattcaataataaatgtcatgatgca |
21626477 |
T |
 |
| Q |
466 |
taacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |
|
|
| T |
21626476 |
tatcataagtttaacataaactattgacatctaggacttacaccaaca |
21626429 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 367 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 29800319 - 29800175
Alignment:
| Q |
367 |
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466 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |
|
|
| T |
29800319 |
ccattacacgaactatctattctagggactttattaatcttacaataattat--aataaagaatgacatatattattcaataataaaagtcatgatacgt |
29800222 |
T |
 |
| Q |
467 |
aacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
29800221 |
agtataagtttaacataaaatattgtcctctagggcttacaccaaca |
29800175 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 150 - 300
Target Start/End: Original strand, 28741219 - 28741369
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150 |
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249 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| ||| || |||||||| || |||| |||||||||||| |
|
|
| T |
28741219 |
gtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtacatacttaatatctcatattcatgacgcatgagatgtgatcatcagtctacataca |
28741318 |
T |
 |
| Q |
250 |
taatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgacta |
300 |
Q |
| |
|
||||| || | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
28741319 |
taatagtcaatacgtttttatattatcccaatttatattaaagtttgacta |
28741369 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 21626958 - 21626735
Alignment:
| Q |
50 |
gatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||| |||||| |||| || | |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||| ||| | |
|
|
| T |
21626958 |
gatcatagtgatttcaggtctaacagtggtagacactattatcactatgagaatatcttatgacactttcataacatagcgtgtagtattctcatggt-g |
21626860 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacataca |
249 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| | |||| ||||| ||| ||| || |||||||| || ||| | |||| |||| |
|
|
| T |
21626859 |
gtcaattcaatataaatattactcatattatttatacttatgtatatagttaacatctcctat-cattactcatgagatgtgatcaccaatctaagtaca |
21626761 |
T |
 |
| Q |
250 |
taatattctctgcgctttattattat |
275 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21626760 |
taatagtctctacgctttattattat |
21626735 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 23 - 172
Target Start/End: Original strand, 40301003 - 40301151
Alignment:
| Q |
23 |
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122 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
40301003 |
aataaagcacttgagtccacatctactcatgatagtggtttcatgtctaagagtggtatacatcattatcactatgagactatcttatgaca-cttcata |
40301101 |
T |
 |
| Q |
123 |
acatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattact |
172 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
40301102 |
acatgttatgtagtattctcatggtgggtcaatctggtataaatattact |
40301151 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 182
Target Start/End: Original strand, 41316345 - 41316505
Alignment:
| Q |
22 |
caataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcat |
121 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| || ||| | |||||| | |||||||||||||| ||| |||||| |
|
|
| T |
41316345 |
caataaagcccttaagtccacatctagggatcatagtggattcaggtctaagaatggtattctccgttatcagtatgagaatatcttatgacactttcat |
41316444 |
T |
 |
| Q |
122 |
aacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatattt |
182 |
Q |
| |
|
|||||||||| || |||| ||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41316445 |
aacatactatataatattctcatggtgggtcgattaagtataaatattactcataatattt |
41316505 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 307
Target Start/End: Original strand, 21330065 - 21330323
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
21330065 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
21330164 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| |||| || ||| |
|
|
| T |
21330165 |
atcaatccaatataaatattactcataatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtccacctac |
21330264 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21330265 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
21330323 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 150 - 514
Target Start/End: Original strand, 18851976 - 18852338
Alignment:
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcat-atccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| | |||||| ||| ||| | || ||| | || |||||| | |||||||||||| || |
|
|
| T |
18851976 |
gtcaatccaatataaatattactcttaatatttatacatatttgaagacttgataactctttattcatgatccgtgagatgggatcattagtctaccgac |
18852075 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggat |
348 |
Q |
| |
|
|||||| ||| | | |||| | |||||| | || | | ||||||| |||||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||| | | | | ||| |
|
|
| T |
18852076 |
ataatagtctatacaatttaatgttatcctacttcacaataaagttggactacatatac-tttaagaatagtgttttatatgttaacgcggt-tcatgat |
18852173 |
T |
 |
| Q |
349 |
taagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaata |
448 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| || |||||||||||| |||||| || ||| |||||||| || | ||||||||| || |
|
|
| T |
18852174 |
taagtcacacttaacgtttcattactcgaactatctattatatggactttattaatcttacaaaaaatat--aataaagaatgcctcgtattatttatta |
18852271 |
T |
 |
| Q |
449 |
ataaaagtcatgttacataacataagtttaacat-aaactattggtctctagggcttacactaacac |
514 |
Q |
| |
|
|||||||||||| || | |||||||||||||| | ||| ||||||| | || ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
18852272 |
ataaaagtcatgatagaaaacataagtttaacttaaaattattggtttttatggcttacaccaacac |
18852338 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18620149 - 18620052
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattacattttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |
|
|
| T |
18620149 |
tgagaatatcttatgacactttcataacttttactatgtagtattctcatggtgggtcaatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgt |
18620052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 7e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 132
Target Start/End: Original strand, 28740904 - 28741001
Alignment:
| Q |
35 |
gagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcataacatactatg |
132 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || |||| || ||||||| | ||||||| |||||| ||| || |||||||||||||| |
|
|
| T |
28740904 |
gagtccacatctagggatcatagtggtttcagatctaagaatggtatacaccattatcattatgagaatgtcttatgacacttccataacatactatg |
28741001 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18796852 - 18796754
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
18796852 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatagaggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
18796754 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 185 - 291
Target Start/End: Original strand, 41316534 - 41316640
Alignment:
| Q |
185 |
acctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaattta |
284 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| |||||| || ||| ||||| ||||||| | || |||||||||||| ||| | | |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
41316534 |
acctatgtatagatttaatatatcatatttattacctgtgagacgtggtcatcaatcaacatacataatagtctatacactttattactatcccaattta |
41316633 |
T |
 |
| Q |
285 |
tattaaa |
291 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
41316634 |
tattaaa |
41316640 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 176 - 307
Target Start/End: Original strand, 12098562 - 12098693
Alignment:
| Q |
176 |
aatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattat |
275 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| |||| | |||| | |||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||| ||| |
|
|
| T |
12098562 |
aatatttatacctatatataaaactaatgtatcatatttatgacccatgagatctgatcatcagtctacatacataatagtctctatgttttattactat |
12098661 |
T |
 |
| Q |
276 |
cccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|| | || |||||||| ||||||||| |||| |
|
|
| T |
12098662 |
ccaatttcatattaaaacttgactacgaatac |
12098693 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 98 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20978217 - 20978136
Alignment:
| Q |
98 |
gagaatatcttattacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataata |
179 |
Q |
| |
|
||||||| ||||| |||||||||||| | | || || ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
20978217 |
gagaataacttatgacattttcataattttccatataaaattctcatggcgggtcaatccaatataaatattactcataata |
20978136 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 395 - 481
Target Start/End: Original strand, 28741394 - 28741478
Alignment:
| Q |
395 |
ctttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaaca |
481 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| |||||| ||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
28741394 |
ctttattaatcttacaacaagtat--aataatgaataccttattttatttaataataaaagtcatgatatatatcataagtttaaca |
28741478 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 38)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 8 - 515
Target Start/End: Original strand, 22659545 - 22660051
Alignment:
| Q |
8 |
caatgttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatct |
107 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22659545 |
caatgttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacactattatcattgtgagaatatct |
22659644 |
T |
 |
| Q |
108 |
tattacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatct |
207 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
22659645 |
tatgacaatttcataacttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccagtatacatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatct |
22659744 |
T |
 |
| Q |
208 |
catatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggat |
305 |
Q |
| |
|
|||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
22659745 |
catatctatgacccatgagatgcagtcatcagtctacatacataatagtcttgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggat |
22659844 |
T |
 |
| Q |
306 |
acatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaata |
405 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |
|
|
| T |
22659845 |
acatttaagaatagtgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacaaactatctattctaaggactttattaaca |
22659944 |
T |
 |
| Q |
406 |
ttacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggctta |
505 |
Q |
| |
|
||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || | || |||| |
|
|
| T |
22659945 |
tta-tataaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggccttttggactta |
22660041 |
T |
 |
| Q |
506 |
cactaacaca |
515 |
Q |
| |
|
||| |||||| |
|
|
| T |
22660042 |
caccaacaca |
22660051 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 12 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 12562370 - 12561877
Alignment:
| Q |
12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562370 |
gttagaatgacaacaaagcacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatg |
12562271 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
12562270 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
12562171 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
12562170 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
12562071 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
12562070 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
12561972 |
T |
 |
| Q |
410 |
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506 |
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T |
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309 |
Q |
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Target: chr8; HSP #4
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T |
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Q |
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aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
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Q |
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tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
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T |
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aaca |
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T |
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308 |
Q |
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T |
 |
| Q |
309 |
tttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatta |
408 |
Q |
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| T |
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tttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta |
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T |
 |
| Q |
409 |
caataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacac |
508 |
Q |
| |
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| T |
27880942 |
-tctaaatat--aataaagagtgccatatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacac |
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T |
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| Q |
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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 12 - 516
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211 |
Q |
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| T |
28020823 |
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28020922 |
T |
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| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc--caatttatattaaag-tttgactacggataca |
308 |
Q |
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| T |
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tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatccttttattcatattaaagctttgactacggattca |
28021022 |
T |
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| Q |
309 |
tttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatta |
408 |
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28021023 |
tttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatatcattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta |
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T |
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caataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacac |
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Q |
| |
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| T |
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-tctaaatat--aataaagagtgccatatattatccaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacac |
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T |
 |
| Q |
509 |
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Q |
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Q |
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Q |
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tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacagacacat |
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T |
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310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
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ttaagaatagtgttatttaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaattatctattctaaggactttattaacatta- |
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T |
 |
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410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
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| T |
8371707 |
tctaaatat--aataaagagtgtcatacattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
8371804 |
T |
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510 |
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513 |
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8371805 |
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8371808 |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
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Q |
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T |
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tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatc-ccaatttatattaaag-tttgactacggatacat |
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Q |
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tctatgacccatgagatgcggtcatcagtcttcatacataatagtctcgacgctttattattatcttttattcatattaaagctttgactacggatacat |
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ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
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aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
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tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
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510 |
aaca |
513 |
Q |
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aaca |
26240231 |
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Target: chr8; HSP #10
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Target: chr8; HSP #12
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Target: chr8; HSP #13
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Target Start/End: Complemental strand, 25611442 - 25610941
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21916623 |
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Target: chr8; HSP #16
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Target: chr8; HSP #18
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| T |
28498555 |
acttgatatctcatatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctt |
28498456 |
T |
 |
| Q |
295 |
tgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagaga |
394 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |
|
|
| T |
28498455 |
tgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaagga |
28498356 |
T |
 |
| Q |
395 |
ctttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtc |
494 |
Q |
| |
|
||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
28498355 |
ctttattaacatta-tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcc |
28498259 |
T |
 |
| Q |
495 |
tctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
28498258 |
tctagggcttacaccaaca |
28498240 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
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Target Start/End: Original strand, 8781940 - 8782165
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22 |
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121 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8781940 |
caataaaacacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaagtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacattttcat |
8782039 |
T |
 |
| Q |
122 |
aacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataaccc |
221 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||||||||| || |||||||| | | |||||||||||| |||||||||||||||| ||| |
|
|
| T |
8782040 |
aacagactatgtagtattctcacggtggatcaatcaagtataaatattagtcctaatatttatgcttatgtatagactaaatatctcatatccatgacct |
8782139 |
T |
 |
| Q |
222 |
atgagatatggtcattagtctacata |
247 |
Q |
| |
|
|| ||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8782140 |
ataagacgtggtcatcagtctacata |
8782165 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 113; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 249 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 6430952 - 6430692
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| Q |
249 |
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348 |
Q |
| |
|
|||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||| || ||| ||||||||| | || |
|
|
| T |
6430952 |
ataatagtctcgacgctttattattatcctaattcatattaaagcttgactacgaatacatttaagaatagtgttatttatgataatgtaatct---cat |
6430856 |
T |
 |
| Q |
349 |
taagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaat- |
447 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6430855 |
taagtcacacttaatatattattacacgaactatctattataaggactttattaacattactataaatat--aataaagagtgtcatatattatttaata |
6430758 |
T |
 |
| Q |
448 |
aataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||| |
|
|
| T |
6430757 |
aataaaagttatgatacataagataaatttaacgtaaactattggtctctagagcttacaccaaca |
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T |
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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 4e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 6431133 - 6430950
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| Q |
12 |
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111 |
Q |
| |
|
|||||| || ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
6431133 |
gttagaatgacaacaaagtacttgagtccacatctagggatcatagtgatttcaggtcttagagcgatatacactattatcattgtgagaatatcttatg |
6431034 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtata |
195 |
Q |
| |
|
||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |
|
|
| T |
6431033 |
acaatctcataacttactatgtagtattctcacggtgggtctatctagtataaatattactcctaatatttatacctatgtata |
6430950 |
T |
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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 20535272 - 20535409
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| Q |
19 |
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118 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||| || ||||||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
20535272 |
tggcaataaagcacttgagtccatatttaaggatcatagtggttccaggtctaagagtggtatacaccattatcattgtgagaatatcttatgacacttt |
20535371 |
T |
 |
| Q |
119 |
cataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatc |
156 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| | |||| ||| |||||||||||| |
|
|
| T |
20535372 |
cataacatactatgcaatattctcatggtgggtcaatc |
20535409 |
T |
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Target: chr8; HSP #23
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Target Start/End: Original strand, 27677431 - 27677637
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| Q |
9 |
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108 |
Q |
| |
|
|||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| | || || ||||||| | | |||| ||| |
|
|
| T |
27677431 |
aatgtttgaatgacaataaagcgcttgagtccacatctagggatcggagtggtttcctgtctaagagtggtttacaccattatcactattctaataactt |
27677530 |
T |
 |
| Q |
109 |
attacattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc |
208 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| ||||||| ||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||| || ||| ||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
27677531 |
ataacatcttcgtaacataatatgtagtattctcgtagtgtgtcaatcaaatataaatatcactcctaataattatacttatgtatagacttgatatctc |
27677630 |
T |
 |
| Q |
209 |
atatcca |
215 |
Q |
| |
|
||||||| |
|
|
| T |
27677631 |
atatcca |
27677637 |
T |
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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
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Target Start/End: Original strand, 8782185 - 8782365
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329 |
tgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaaga |
428 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||| |||||| || ||| |||||||| |
|
|
| T |
8782185 |
tgttaatgtaatcccatgattaagtcacatttaatattccatcacattaactatctattttaaggactttattaatcttacaacaattat--aataaaga |
8782282 |
T |
 |
| Q |
429 |
gtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||| |||| ||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8782283 |
atgacatatttta-ttaaaaat-aaagtaatgatacataatataagtttaacataaactattgacctatagggcttacaccaaca |
8782365 |
T |
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Target: chr8; HSP #25
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Target Start/End: Complemental strand, 21862227 - 21862146
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catatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaacac |
514 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
21862227 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacac |
21862146 |
T |
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Target: chr8; HSP #26
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Query Start/End: Original strand, 433 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 21914390 - 21914310
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| Q |
433 |
catatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
21914390 |
catatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
21914310 |
T |
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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
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53 |
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
22171877 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
22171778 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | ||||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
22171777 |
atcaatccaatataaatattactcataatatttatatttatgtgaagacttgataactctttatccatgatctatgagatgtgatcatcagtctacctac |
22171678 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
22171677 |
ataatagtctct |
22171666 |
T |
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Target: chr8; HSP #28
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Target Start/End: Complemental strand, 21941055 - 21940797
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| Q |
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catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
21941055 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
21940956 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
21940955 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
21940856 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
21940855 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
21940797 |
T |
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Target Start/End: Original strand, 24797249 - 24797383
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193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| || |
|
|
| T |
24797249 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgggtcaatccagtataaattttactcataatatttatacctacgtg |
24797348 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaatatctcatatccataacccatgagat |
228 |
Q |
| |
|
|||| | ||||| |||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
24797349 |
aagacatgatatcctatatccatgacccatgagat |
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Target: chr8; HSP #30
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149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
15326588 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
15326489 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
15326488 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
15326446 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 192
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catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
15506957 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
15506858 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
15506857 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
15506815 |
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Target: chr8; HSP #32
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catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat-actatgtagtattttcacggtggg |
150 |
Q |
| |
|
||||||||||||| || ||| ||| ||| || ||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
24643038 |
catagtggtttcagttcgaagggtggaatacaccattatcactatgagaatatcttatgacacttttcataattttactatgtagtattctcatggagga |
24642939 |
T |
 |
| Q |
151 |
tcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacataca |
249 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
24642938 |
tcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacccaca |
24642839 |
T |
 |
| Q |
250 |
taatattctct |
260 |
Q |
| |
|
||||| ||||| |
|
|
| T |
24642838 |
taatagtctct |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #33
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122 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||||||||| ||||||| | |||| ||||| ||||||| |||| || ||||||| |||| ||||||||| | | |||||| |
|
|
| T |
27099062 |
aataaaacacttaagtccacatctatagatcatattagttttatgtcaaagagtggtatacacaattatcaccatgaggatatcttataataccttcata |
27099161 |
T |
 |
| Q |
123 |
acatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagactta |
201 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| ||| | ||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
27099162 |
acatactatgtaatattctcatcataggttaatccggtataaatattacttctaatatttatacacatgtatagactta |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #34
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112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| | |||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| |
|
|
| T |
38232256 |
acatttacataactttctatgtagcattctcacggcggatcaatccaatataaatattacccataatatgtgtatctatgt |
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T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #35
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97 |
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Q |
| |
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|
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6094469 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatatagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
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T |
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Target: chr8; HSP #36
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513 |
Q |
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|
|
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12642210 |
T |
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180 |
Q |
| |
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ttatcactatgagaataacttatgacatttacataactttctatgtagtattctcatggcgggtcattctaatat-aatattactcctaatat |
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T |
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gggtcaatccaatatacatattactcataatattt |
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T |
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Target: scaffold0466 (Bit Score: 261; Significance: 1e-145; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
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Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
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Target Start/End: Original strand, 13004 - 13489
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111 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||| |
|
|
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gttagaatggcaacaaagcaattgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattatgagaatatcttatg |
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T |
 |
| Q |
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acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13104 |
acaatttcataacatactatgtagtattctcacggtgggtcaatccggtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagacttaatatctcata |
13203 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacattt |
311 |
Q |
| |
|
| || ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
13204 |
tatatgacccatgagatgtggtcatcggtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcccaattaatattaaagcttgactatggatacattt |
13303 |
T |
 |
| Q |
312 |
aataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatat-tccattacacgaactatctattctagagactttattaatattaca |
410 |
Q |
| |
|
|| |||| |||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13304 |
aagaatactgttttttatgttaatgtaatctcatgattaaatcacacttaatatatcatttacatgaactatctattctagggactttattagcattact |
13403 |
T |
 |
| Q |
411 |
ataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctcta |
498 |
Q |
| |
|
| || ||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
13404 |
acaaatat--aattaagagagccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataaatttaacataaactattggcctcta |
13489 |
T |
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Target: scaffold0264 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
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Target: scaffold0264; HSP #1
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111 |
Q |
| |
|
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|
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T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
3830 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
3929 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3930 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
4029 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
4030 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
4128 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
4129 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
4226 |
T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
4227 |
aaca |
4230 |
T |
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |
|
|
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atattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacaaactat |
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T |
 |
| Q |
383 |
ctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacat |
482 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |
|
|
| T |
10958 |
ctattctaaggactttattaacattatc-taaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacat |
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T |
 |
| Q |
483 |
aaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
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aaactattggcctctagggcttacaccaaca |
11085 |
T |
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Target: scaffold0001 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
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Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
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111 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
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gttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatg |
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T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
130379 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
130478 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
130479 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
130578 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
130579 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
130677 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
130678 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
130775 |
T |
 |
| Q |
510 |
aaca |
513 |
Q |
| |
|
|||| |
|
|
| T |
130776 |
aaca |
130779 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 293 - 468
Target Start/End: Original strand, 138473 - 138645
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392 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||| ||||| ||| || | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
138473 |
tttgactacggatacatttaagaatagtgttctttaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacaaactatctattctaag |
138572 |
T |
 |
| Q |
393 |
gactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataa |
468 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
138573 |
gactttattaacatta-tataaatat--aataaagagtgacatatattattcaataataaaagtcatgatacataa |
138645 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0028 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:
Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
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Target Start/End: Complemental strand, 119977 - 119476
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gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
119977 |
gttagaatggcaacaaagcacttgagtccacatctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatg |
119878 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcata |
211 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
119877 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacagtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
119778 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
|
|| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
119777 |
tctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacgtacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatacat |
119678 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattac |
409 |
Q |
| |
|
|||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
119677 |
ttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta- |
119579 |
T |
 |
| Q |
410 |
aataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacact |
509 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
119578 |
tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacacc |
119481 |
T |
 |
| Q |
510 |
aacac |
514 |
Q |
| |
|
||||| |
|
|
| T |
119480 |
aacac |
119476 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0378 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 1)
Name: scaffold0378
Description:
Target: scaffold0378; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 31 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 8533 - 8052
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31 |
acttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcataacatacta |
130 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |
|
|
| T |
8533 |
acttgagtccacatctagagatcatagtggtttcaggtctaagagcgatatacattattatcattgtgagaatatcttatgacaatttcataacttacta |
8434 |
T |
 |
| Q |
131 |
tgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgagatat |
230 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
8433 |
tgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcatatctatgacccatgagatgc |
8334 |
T |
 |
| Q |
231 |
ggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacatttaataatagcgtttttga |
328 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| | | |
|
|
| T |
8333 |
ggtcatcagtctacatacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactatggatacatttaagaatagcgttctata |
8234 |
T |
 |
| Q |
329 |
tgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaaga |
428 |
Q |
| |
|
| ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
8233 |
agataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatta-tataaatat--aataaaga |
8137 |
T |
 |
| Q |
429 |
gtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
8136 |
gtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
8052 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0376 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 1)
Name: scaffold0376
Description:
Target: scaffold0376; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 12 - 513
Target Start/End: Original strand, 11581 - 12083
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12 |
gttagactggcaataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttatt |
111 |
Q |
| |
|
|||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| ||| || ||| |||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
11581 |
gttagaatggaaacaaagtacttgagtccacatctagggatcaaagtggtttcaggtctaagagcgatgtacactgttatcattgtgagaatatcttatg |
11680 |
T |
 |
| Q |
112 |
acatttt----cataacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatct |
207 |
Q |
| |
|
||| || |||||| |||||||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
11681 |
acaattaatcacataacgtactatgtagtattctcacagtgggtctatccagtataaatattactcctaatatttatacatatgtatagacttaatatct |
11780 |
T |
 |
| Q |
208 |
catatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| | || |||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
11781 |
catatctataacccatgagatgcggtcatcaatctacatacataatagtttcgacgctttattattatcctaa-ttatattaaagattgactacagatac |
11879 |
T |
 |
| Q |
308 |
atttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatt |
407 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| ||| || ||| ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |
|
|
| T |
11880 |
atttaagaatagtgttctttatgataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacatt |
11979 |
T |
 |
| Q |
408 |
acaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttaca |
507 |
Q |
| |
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|| |||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
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| T |
11980 |
actataa--atacaataaagaatgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttaca |
12077 |
T |
 |
| Q |
508 |
ctaaca |
513 |
Q |
| |
|
| |||| |
|
|
| T |
12078 |
ccaaca |
12083 |
T |
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Name: scaffold0086
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Target: scaffold0086; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
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Target Start/End: Complemental strand, 54000 - 53521
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123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||| |
|
|
| T |
54000 |
ataaagcacttgagtccacacctagggatcatagtggtttcaggtctaagagcaatataaactattaacatgttgagaatatcttatgacaatttcataa |
53901 |
T |
 |
| Q |
124 |
catactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccat |
223 |
Q |
| |
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|
|
| T |
53900 |
catactatgtagtattctcacggtgggtcaacccagtgtgaatattactcttaatatttatacctatgtatagaattaatacctcatatctatgacccat |
53801 |
T |
 |
| Q |
224 |
gagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcgtt |
323 |
Q |
| |
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| T |
53800 |
gagatgcggtcatcaatctacatacataatagtcttgacactttattattatcctaattcatattaaagcttgaatacggatacatttaagaatagtgtt |
53701 |
T |
 |
| Q |
324 |
tttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaat |
423 |
Q |
| |
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|
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| T |
53700 |
ctttatgttaatgtaatctca--------tcacacttaatatatcattacatgaactatttactctagggactttattaacattac--tatgaatcgaat |
53611 |
T |
 |
| Q |
424 |
aaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
53610 |
aaagagtgtcatatattattcaataataaaagtcatgatatataagataagtttaacataaactattgacctctagggcttacaccaaca |
53521 |
T |
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Name: scaffold0112
Description:
Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 12 - 408
Target Start/End: Complemental strand, 430 - 32
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111 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
430 |
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T |
 |
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211 |
Q |
| |
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||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
330 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacggtgggtcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtatagacttgatatctcata |
231 |
T |
 |
| Q |
212 |
tccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcc-caatttatattaaag-tttgactacggatacat |
309 |
Q |
| |
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|
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| T |
230 |
tctatgacccatgagatgtggtcatcagtcgacatacataatagtctcgacgctttattattatccattattcatattaaagctttgactacagatacat |
131 |
T |
 |
| Q |
310 |
ttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatatta |
408 |
Q |
| |
|
|||| || |||||| | | | ||||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |
|
|
| T |
130 |
ttaagaacagcgttctataagataatgtaatctcattattaagtcacacttaatatattattacatgaactatctattctaaggactttattaacatta |
32 |
T |
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Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0099 (Bit Score: 143; Significance: 1e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:
Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
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Target Start/End: Complemental strand, 9350 - 8847
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Q |
| |
|
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| T |
9350 |
aaagcacttgagtccacatctagagatcatagtggtttctaggtctaagagcaatatacattatttatcattgtgagaatatcttatgacaatttcataa |
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T |
 |
| Q |
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catactatgtagtattttcacggt-gggtc-aatcc-aatat-aaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccat-aa |
218 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||| |||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || | |
|
|
| T |
9250 |
cttactatgtagtattctcacagtggggtcaaatccaaatataaaatattacttctaatatttatatctatgtatagacttaatatctcatatctatgta |
9151 |
T |
 |
| Q |
219 |
cccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctc-tgcgcttta-ttattatcc--caatttatattaaa---gtttgactacggataca-tt |
310 |
Q |
| |
|
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| T |
9150 |
cccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgtacgctttatttattatccttttattcatattaaaagcttttgactacggatacattt |
9051 |
T |
 |
| Q |
311 |
taataatagcgtt-tttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattct-agagactttattaatatta |
408 |
Q |
| |
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||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||| |
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| T |
9050 |
taagaatagcgttactataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggtactttattaacatta |
8951 |
T |
 |
| Q |
409 |
caataagtattaaataaagagtgtcatatattatt-taataataaaagt-catgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttac |
506 |
Q |
| |
|
||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |
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| T |
8950 |
-tctaaatat--aataaagagtgccatatattattctaataataaaagtacatgatacataagatagatttaacataaactattggcctctagggcttac |
8854 |
T |
 |
| Q |
507 |
actaaca |
513 |
Q |
| |
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|| |||| |
|
|
| T |
8853 |
accaaca |
8847 |
T |
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Description:
Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
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Target Start/End: Original strand, 15053 - 15373
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Q |
| |
|
|||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||| || |
|
|
| T |
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ctatgtatagacttgatatcttatatctatgacccatgagatgcggtcatcagtctacatacataatagtctcgatgctttattattatcctttattcat |
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T |
 |
| Q |
286 |
attaaag-tttgactacggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatct |
384 |
Q |
| |
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| T |
15153 |
attaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctttaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatct |
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T |
 |
| Q |
385 |
attctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataa |
484 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
15253 |
attctaaggactttattaacatta-tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataa |
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T |
 |
| Q |
485 |
actattggtctctagggcttacac |
508 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
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actattggcctctagggcttacac |
15373 |
T |
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Target: scaffold0063 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0063
Description:
Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
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Target Start/End: Original strand, 45229 - 45503
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337 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || ||| |||||| |
|
|
| T |
45229 |
agtcaacatacataatagtctcgacgctttattattatcctaattaatattaaagcttgactacggatacatttaagaatagcgttctttatgataatgt |
45328 |
T |
 |
| Q |
338 |
aatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatat |
437 |
Q |
| |
|
||| | | |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
45329 |
aatctcatgattaagtcacacttaatatattattacaagaactatctattgtaaggactttattaacattactataaatat--aataaagagtgtcatat |
45426 |
T |
 |
| Q |
438 |
attatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaacac |
514 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||| |||||||||| || | |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
45427 |
attattcaataataaaagtcatgatgcataagataagtttaacagaaactattggccttttgggcttacaccaacac |
45503 |
T |
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Target: scaffold0063; HSP #2
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Target Start/End: Complemental strand, 5876 - 5714
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Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
5876 |
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5777 |
T |
 |
| Q |
193 |
atagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataata |
254 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| |||||||| |
|
|
| T |
5776 |
gaagacttgataactctttatccatgacctgtgagatgtgatcatcagtctacccacataata |
5714 |
T |
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Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
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121 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
26779 |
caataaagcactcgagtccacatatagggatcatagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcactgtgagaatatcttatgacattttcat |
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T |
 |
| Q |
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aacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagact |
199 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
26679 |
aacatactatatagtattctcaaggtgggtcaatccagtataaatattactcctaatatttatacctatgtatagact |
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T |
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Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 264 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 26601 - 26413
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363 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||| |||| || || ||||||||| | | |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26601 |
ctttattattatcccaatttatattaaatcttgtctactgatacatttaagaataacgttctttattataatgtaatctcatgattaagtcacacttaat |
26502 |
T |
 |
| Q |
364 |
attccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaa |
454 |
Q |
| |
|
|| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
26501 |
atacgattacacgaactatctattctagggactttattaacattacaacgaatat--aataaagagtgccatatattatttaataataaaa |
26413 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0136 (Bit Score: 125; Significance: 5e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0136
Description:
Target: scaffold0136; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 5e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 8968 - 8508
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22 |
caataaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcat |
121 |
Q |
| |
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||||||| ||||||| ||||||| || |||||| ||||||||| ||||| ||||| |||| || ||||||| | |||||||||||||| |||| ||||| |
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|
| T |
8968 |
caataaaacacttgactccacatttaaggatcattgtggtttcaggtctaggagtggtatacaccattatcactatgagaatatcttatgacatcttcat |
8869 |
T |
 |
| Q |
122 |
aacatactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataaccc |
221 |
Q |
| |
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|
|
| T |
8868 |
aacatactaagtagtattctcattgggggtcaatctagtataaatattactcctaatatttacacatatgcatatccttaatatctcatatctatgacat |
8769 |
T |
 |
| Q |
222 |
atgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatagcg |
321 |
Q |
| |
|
||||| || |||| | |||||||||||| || ||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| | |
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|
| T |
8768 |
gtgagacgtgatcatcaatctacatacatattagtctctacgctttattactatctcaatttatattaaaacttgactacaaatacttttaagaatagtg |
8669 |
T |
 |
| Q |
322 |
tttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaa |
421 |
Q |
| |
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|| || ||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || ||| |
|
|
| T |
8668 |
ttctttatgttaatgtaatctcatgattaagtctcacataat-gtccattacttgaactatatattctaaggactttattaatattatatcaa--atttc |
8572 |
T |
 |
| Q |
422 |
ataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaa |
485 |
Q |
| |
|
||||||| | | || |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||| ||||||||||| |
|
|
| T |
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ataaagaatacctcattttatttaataataaaaatcacgatacataaaataattttaacataaa |
8508 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0037 (Bit Score: 100; Significance: 4e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
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Target: scaffold0037; HSP #1
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Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| || | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
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40022 |
atattaaagctttgactacggatacatttaagaataacgttctttaagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactat |
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T |
 |
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ctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacat |
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Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |
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|
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T |
 |
| Q |
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aaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
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aaactattgacctctagggcttacaccaaca |
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 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0034 (Bit Score: 98; Significance: 7e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
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Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 50 - 319
Target Start/End: Original strand, 83108 - 83377
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 |
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gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctcatatccataacccatgagatatggtcattagtctacataca |
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| |
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| T |
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gtcaatccagtataaatattacttctgatatttatacttgtgtataaacttaatatttcatatttatgacccatgagacgtggtcatcagtctacataca |
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T |
 |
| Q |
250 |
taatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatacatttaataatag |
319 |
Q |
| |
|
||||| ||| | | ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||| ||||| |
|
|
| T |
83308 |
taatagtctatacactttattattatctcaatttatattaaatttcgactacggatacttttaagaatag |
83377 |
T |
 |
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Target: scaffold0297 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
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Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
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Target Start/End: Complemental strand, 233 - 94
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111 |
Q |
| |
|
|||||| |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
233 |
gttagaatggcaacaaagtacttgagtccacatctagggatcagagtggtttcaggtctaagagtgatatacactattatcattgtgagaatatcttatg |
134 |
T |
 |
| Q |
112 |
acattttcataacatactatgtagtattttcacggtgggt |
151 |
Q |
| |
|
||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
133 |
acaatttcataacttactatgtagtattctcacggtgggt |
94 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
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Target: scaffold0019; HSP #1
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Target Start/End: Original strand, 19162 - 19389
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382 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | | | ||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
19162 |
atattaaagctttgactacggatacatttaagaatagcgttctataagataatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactat |
19261 |
T |
 |
| Q |
383 |
ctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacat |
482 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| || |
|
|
| T |
19262 |
ctattctaaggactttattaacatta-tctaaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagatattttttttat |
19358 |
T |
 |
| Q |
483 |
aaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
19359 |
aaactattggcctctagggcttacaccaaca |
19389 |
T |
 |
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Target: scaffold0139 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:
Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 332 - 513
Target Start/End: Original strand, 18791 - 18969
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332 |
taatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtg |
431 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
18791 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatc-taaatat--aataaagagtg |
18887 |
T |
 |
| Q |
432 |
tcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
18888 |
ccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
18969 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0061 (Bit Score: 87; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0061
Description:
Target: scaffold0061; HSP #1
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Query Start/End: Original strand, 332 - 513
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taatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtg |
431 |
Q |
| |
|
||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |
|
|
| T |
76485 |
taatgtaatctcatgattaagtcacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatc-taaatat--aataaagagtg |
76389 |
T |
 |
| Q |
432 |
tcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
76388 |
tcatattttattcaatattaaaagtcatgatacataagataagtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
76307 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold2089 (Bit Score: 84; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold2089
Description:
Target: scaffold2089; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 244 - 513
Target Start/End: Original strand, 1 - 273
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| Q |
244 |
catacataatattctctgcgctttattattatccca-atttatattaaag-tttgactacggatacat----ttaataatagcgtttttgatgttaatgt |
337 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| | | | |||||| |
|
|
| T |
1 |
catacataatagtctcgacgctttattattatcctttattcatattaaagctttgactacggatatatatatttaagaatagcgttctataagataatgt |
100 |
T |
 |
| Q |
338 |
aatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatat |
437 |
Q |
| |
|
||| | | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
101 |
aatctcatgattaagtcgcacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatc-taaatat--aataaagagtgccatat |
197 |
T |
 |
| Q |
438 |
attatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
198 |
attattcaataataaaggtcatgatacataagataggtttaacaaaaactattggcctctagggcttacaccaaca |
273 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0454 (Bit Score: 78; Significance: 6e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:
Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 393 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 13858 - 13740
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393 |
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492 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
13858 |
gactttattaacattactataaatat--aataaagagtgtcatatattattcaataataaaaatcatgatacataagataagtttaacataaactattgg |
13761 |
T |
 |
| Q |
493 |
tctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
13760 |
tctctagggcttacaccaaca |
13740 |
T |
 |
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Target: scaffold1948 (Bit Score: 73; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1948
Description:
Target: scaffold1948; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 6e-33
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Target Start/End: Original strand, 961 - 1169
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| Q |
302 |
ggatacatttaataatagcgtttttgatgttaatgtaatattaggattaagtcacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttatt |
401 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||| |||| || | | ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| || ||||||||| |
|
|
| T |
961 |
ggatacatttaagaataacgttctttaagataatgtaatcacatgattaagtcacacttaatatattattaaaaaaactatctattataaggactttatt |
1060 |
T |
 |
| Q |
402 |
aatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaaagtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctaggg |
501 |
Q |
| |
|
|| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
1061 |
aacattatc-taaatat--aataaagagtgccatatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctaggg |
1157 |
T |
 |
| Q |
502 |
cttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
||||||| |||| |
|
|
| T |
1158 |
cttacaccaaca |
1169 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0611 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0611
Description:
Target: scaffold0611; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 354 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 9672 - 9515
Alignment:
| Q |
354 |
cacacttaatattccattacacgaactatctattctagagactttattaatattacaataagtattaaataaagagtgtcatatattatttaataataaa |
453 |
Q |
| |
|
|||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||| |
|
|
| T |
9672 |
cacacttaatatattattacacgaactatctattctaaggactttattaacattatc-taaatatta--taaagagtgccacatattattccataataaa |
9576 |
T |
 |
| Q |
454 |
agtcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaacac |
514 |
Q |
| |
|
||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9575 |
agtcatgatacataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaacac |
9515 |
T |
 |
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Target: scaffold0059 (Bit Score: 62; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0059
Description:
Target: scaffold0059; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 377 - 513
Target Start/End: Original strand, 33927 - 34060
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377 |
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476 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||| |
|
|
| T |
33927 |
aactatctattctaaggactttattaacattatc-taaatat--aataaagagtgccacatattattcaataataaaagtcatgatacataagataggtt |
34023 |
T |
 |
| Q |
477 |
taacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
34024 |
taacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
34060 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0496 (Bit Score: 59; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0496
Description:
Target: scaffold0496; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 11477 - 11328
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| Q |
26 |
aaagcacttgagtccacatctagtgatcatagtggtttcatgtct--aagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattacattttcataa |
123 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||| | |||||| |||| || ||||||| | | |||||| ||||| |||| ||||||| |
|
|
| T |
11477 |
aaagcacttgagtccatatctaggaatcatagtagtttcatgtgtttaagagttgtatacaccattatcactattagaataacttataacatcttcataa |
11378 |
T |
 |
| Q |
124 |
catactatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactc |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
11377 |
catactatgtagtattctcatggtgggtaaatccatcataaatattactc |
11328 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0390 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0390
Description:
Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
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Target Start/End: Original strand, 6751 - 7009
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| Q |
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catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
6751 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
6850 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
6851 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
6950 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
6951 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
7009 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0390; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 53 - 254
Target Start/End: Original strand, 13767 - 13972
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| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | | ||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
13767 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttattatgtagtattctcatggcgg |
13866 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
13867 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctttgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
13966 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataata |
254 |
Q |
| |
|
|||||| |
|
|
| T |
13967 |
ataata |
13972 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234 (Bit Score: 56; Significance: 8e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
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Target: scaffold0234; HSP #1
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| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
2138 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
2237 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
2238 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
2337 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
2338 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
2396 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 53 - 307
Target Start/End: Original strand, 11029 - 11287
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53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
11029 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
11128 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||| |
|
|
| T |
11129 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
11228 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
11229 |
ataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaagcttgactacggatac |
11287 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0433 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0433
Description:
Target: scaffold0433; HSP #1
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97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgta |
193 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |
|
|
| T |
7453 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcggatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtg |
7354 |
T |
 |
| Q |
194 |
tagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatacataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaag |
292 |
Q |
| |
|
|||||| ||| ||| ||||||| | | |||||| || |||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||| | ||||||| || | ||||| |
|
|
| T |
7353 |
aagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctacataatagtctctatgctttaatgatatcccacttctcaataaag |
7254 |
T |
 |
| Q |
293 |
tttgactacggatacattta |
312 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
7253 |
cttgactacggatactttta |
7234 |
T |
 |
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0220 (Bit Score: 53; Significance: 5e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:
Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 18678 - 18467
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18678 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
18579 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
18578 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagacttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
18479 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctct |
260 |
Q |
| |
|
|||||| ||||| |
|
|
| T |
18478 |
ataatagtctct |
18467 |
T |
 |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0186 (Bit Score: 52; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0186
Description:
Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 53 - 307
Target Start/End: Original strand, 25807 - 26065
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||| ||| ||| ||| || | ||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||| ||| || || |
|
|
| T |
25807 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcgg |
25906 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgtatagacttaatatctc-atatccataacccatgagatatggtcattagtctacatac |
248 |
Q |
| |
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|
| T |
25907 |
atcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgtgaagtcttgataactctttatccatgatctgtgagatgtgatcatcagtctacctac |
26006 |
T |
 |
| Q |
249 |
ataatattctctgcgctttattattatcccaatttatattaaagtttgactacggatac |
307 |
Q |
| |
|
|||||| || || |||||| | ||||||| ||| | ||||| |||||||||||||| |
|
|
| T |
26007 |
ataatagtcgctatgctttaatgatatcccacttttcaataaagcttgactacggatac |
26065 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0008 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:
Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 97 - 192
Target Start/End: Original strand, 230252 - 230350
Alignment:
| Q |
97 |
tgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgggtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatgt |
192 |
Q |
| |
|
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|
|
| T |
230252 |
tgagaatatcttatgacacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcagatcaatccaatataaatattactcctaatatttatatctatgt |
230350 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0657 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0657
Description:
Target: scaffold0657; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 53 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 1383 - 1242
Alignment:
| Q |
53 |
catagtggtttcatgtctaagagtgatataaactattatcaatgtgagaatatcttattaca-ttttcataacat--actatgtagtattttcacggtgg |
149 |
Q |
| |
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|
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| T |
1383 |
catagtggtttcaggtcgaagggtggaatacaccactatcactatgagaatatcttatgatacttttcataacttttactatgtagtattctcatggcag |
1284 |
T |
 |
| Q |
150 |
gtcaatccaatataaatattactcataatatttgtacctatg |
191 |
Q |
| |
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| T |
1283 |
atcaatccaatataaatattactcttaatatttatatctatg |
1242 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0783 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0783
Description:
Target: scaffold0783; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 456 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6284 - 6225
Alignment:
| Q |
456 |
tcatgttacataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaacaca |
515 |
Q |
| |
|
||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |
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| T |
6284 |
tcatgatacataagataggtttaacataaactattggcttctagggcttacaccaacaca |
6225 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold1400 (Bit Score: 34; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1400
Description:
Target: scaffold1400; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 464 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 1875 - 1826
Alignment:
| Q |
464 |
cataacataagtttaacataaactattggtctctagggcttacactaaca |
513 |
Q |
| |
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||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |
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|
| T |
1875 |
cataagataggtttaacataaactattggcctctagggcttacaccaaca |
1826 |
T |
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[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0118 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:
Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 46036 - 46001
Alignment:
| Q |
145 |
ggtgggtcaatccaatataaatattactcataatat |
180 |
Q |
| |
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||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |
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| T |
46036 |
ggtgggtcaattcaatataaatattactcataatat |
46001 |
T |
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