View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11819_low_33 (Length: 233)

Name: NF11819_low_33
Description: NF11819
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11819_low_33
NF11819_low_33
[»] chr5 (21 HSPs)
chr5 (10-233)||(25426628-25426851)
chr5 (10-233)||(12374-12597)
chr5 (10-233)||(18778021-18778244)
chr5 (10-233)||(19499899-19500122)
chr5 (10-233)||(22366510-22366733)
chr5 (10-233)||(21073624-21073847)
chr5 (10-233)||(43443424-43443647)
chr5 (10-233)||(4200014-4200237)
chr5 (10-233)||(27009841-27010064)
chr5 (10-233)||(23506965-23507187)
chr5 (10-233)||(27182588-27182810)
chr5 (10-233)||(22053874-22054096)
chr5 (62-233)||(29188313-29188483)
chr5 (10-233)||(18531108-18531330)
chr5 (21-233)||(34939289-34939499)
chr5 (127-233)||(20623085-20623191)
chr5 (127-233)||(21233569-21233675)
chr5 (128-233)||(25900447-25900552)
chr5 (127-233)||(16536313-16536419)
chr5 (127-233)||(37052860-37052966)
chr5 (14-54)||(29190482-29190522)
[»] chr6 (11 HSPs)
chr6 (10-233)||(25175563-25175786)
chr6 (10-229)||(27654016-27654235)
chr6 (10-233)||(16825781-16826006)
chr6 (14-233)||(14626159-14626377)
chr6 (14-231)||(1650136-1650352)
chr6 (21-233)||(23153458-23153669)
chr6 (10-231)||(35009482-35009702)
chr6 (21-233)||(1657789-1657999)
chr6 (21-233)||(15862484-15862693)
chr6 (78-226)||(29665941-29666089)
chr6 (189-233)||(27751603-27751647)
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (10-233)||(19886690-19886913)
chr2 (10-229)||(17396697-17396916)
chr2 (15-230)||(462743-462957)
chr2 (10-233)||(19794745-19794967)
chr2 (10-233)||(8891242-8891464)
chr2 (10-233)||(20627354-20627576)
chr2 (10-233)||(36982482-36982704)
chr2 (10-233)||(43642998-43643220)
chr2 (10-224)||(7507894-7508107)
chr2 (10-233)||(24341430-24341652)
chr2 (10-233)||(25265431-25265653)
chr2 (127-233)||(19689442-19689548)
chr2 (127-233)||(23820187-23820293)
chr2 (127-233)||(14906481-14906587)
chr2 (127-233)||(20015127-20015233)
[»] chr4 (15 HSPs)
chr4 (10-233)||(47357654-47357877)
chr4 (10-233)||(10644219-10644442)
chr4 (18-233)||(13048262-13048477)
chr4 (10-233)||(13246430-13246652)
chr4 (10-233)||(54118285-54118507)
chr4 (10-233)||(15675130-15675352)
chr4 (10-233)||(31115629-31115851)
chr4 (110-233)||(121989-122111)
chr4 (78-233)||(10104291-10104445)
chr4 (10-233)||(26680201-26680422)
chr4 (10-107)||(111395-111492)
chr4 (127-233)||(10488678-10488784)
chr4 (127-233)||(16327967-16328073)
chr4 (78-233)||(40885595-40885749)
chr4 (10-54)||(10104450-10104494)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (10-233)||(10989410-10989632)
chr7 (10-233)||(2437457-2437680)
chr7 (10-233)||(13911053-13911277)
chr7 (10-233)||(13572676-13572899)
chr7 (10-233)||(18253876-18254098)
chr7 (16-233)||(25292379-25292595)
chr7 (10-233)||(16478991-16479213)
chr7 (15-233)||(11580780-11580997)
chr7 (10-233)||(13037055-13037277)
chr7 (10-231)||(36052667-36052884)
chr7 (10-233)||(47481072-47481294)
chr7 (12-233)||(16211768-16211988)
chr7 (10-230)||(3059966-3060185)
chr7 (10-233)||(7293017-7293238)
chr7 (10-233)||(13321014-13321238)
chr7 (127-233)||(11516343-11516449)
chr7 (127-233)||(15441605-15441711)
chr7 (127-233)||(30262170-30262276)
chr7 (153-233)||(296007-296087)
[»] chr8 (19 HSPs)
chr8 (10-200)||(222753-222943)
chr8 (10-200)||(736376-736566)
chr8 (10-200)||(860271-860461)
chr8 (10-233)||(30120722-30120945)
chr8 (10-233)||(16674421-16674644)
chr8 (10-233)||(21844601-21844824)
chr8 (10-233)||(21851994-21852217)
chr8 (10-231)||(43373511-43373731)
chr8 (9-233)||(16193757-16193980)
chr8 (14-233)||(6774287-6774505)
chr8 (14-233)||(24548986-24549204)
chr8 (21-233)||(24928832-24929043)
chr8 (10-233)||(16405016-16405235)
chr8 (10-233)||(22907255-22907476)
chr8 (138-200)||(691908-691970)
chr8 (21-233)||(17345581-17345791)
chr8 (127-233)||(5238203-5238309)
chr8 (127-233)||(24661289-24661395)
chr8 (127-233)||(43685662-43685768)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (10-233)||(36093-36316)
scaffold0023 (10-233)||(48598-48820)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (10-233)||(55316219-55316442)
chr3 (10-233)||(41270075-41270298)
chr3 (10-233)||(16821139-16821362)
chr3 (10-229)||(13975766-13975985)
chr3 (10-233)||(14842602-14842824)
chr3 (10-229)||(45860805-45861024)
chr3 (10-233)||(15936668-15936890)
chr3 (10-229)||(13954934-13955153)
chr3 (9-233)||(51158059-51158282)
chr3 (10-233)||(15859065-15859287)
chr3 (13-233)||(15938510-15938729)
chr3 (10-233)||(12030188-12030410)
chr3 (10-233)||(2049810-2050032)
chr3 (14-230)||(15614838-15615053)
chr3 (21-233)||(13838905-13839116)
chr3 (10-233)||(17912523-17912744)
chr3 (127-233)||(2449279-2449385)
chr3 (10-233)||(16744156-16744377)
chr3 (10-123)||(47984650-47984763)
chr3 (10-123)||(47993937-47994050)
chr3 (10-123)||(48003224-48003337)
chr3 (10-123)||(48012510-48012623)
chr3 (10-49)||(15468557-15468596)
[»] chr1 (14 HSPs)
chr1 (10-233)||(18601147-18601370)
chr1 (10-233)||(5072417-5072640)
chr1 (10-233)||(20931345-20931567)
chr1 (10-224)||(22227809-22228022)
chr1 (10-224)||(22232506-22232719)
chr1 (10-233)||(20913037-20913252)
chr1 (10-233)||(20893667-20893889)
chr1 (14-233)||(2116258-2116477)
chr1 (10-233)||(41394222-41394444)
chr1 (10-233)||(20445679-20445901)
chr1 (10-233)||(20531444-20531666)
chr1 (10-233)||(37844491-37844714)
chr1 (76-231)||(45051489-45051643)
chr1 (127-233)||(51452608-51452714)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (10-233)||(42997-43220)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (10-233)||(31704-31928)
scaffold0008 (10-233)||(128210-128431)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (10-233)||(35-258)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (10-206)||(64584-64780)
scaffold0026 (10-233)||(107747-107969)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (34-233)||(5552-5751)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (12-233)||(3623-3843)
scaffold0266 (10-233)||(1124-1346)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (10-233)||(21145-21367)
scaffold0139 (10-233)||(14090-14312)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (10-233)||(48187-48409)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (10-233)||(6105-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (10-233)||(997-1218)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (10-224)||(5254-5466)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (10-233)||(12115-12335)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (10-233)||(8878-9100)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (10-224)||(3722-3936)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (10-233)||(148721-148943)
scaffold0025 (10-233)||(8849-9071)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (14-233)||(9378-9596)
scaffold0215 (14-233)||(16276-16494)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (10-233)||(19206-19428)
scaffold0195 (10-233)||(21290-21512)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (10-233)||(123205-123427)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (10-233)||(5102-5324)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (10-233)||(36954-37176)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (116-233)||(1333-1450)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (21-233)||(247483-247694)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (10-233)||(26456-26678)
scaffold0162 (127-233)||(8221-8327)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (21-233)||(171916-172127)
scaffold0001 (21-233)||(177619-177830)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (16-233)||(272031-272247)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (14-233)||(41733-41951)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (10-233)||(575-797)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (10-116)||(9-115)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (10-116)||(48514-48620)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (14-233)||(2966-3185)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (10-233)||(34501-34724)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (106-233)||(13354-13480)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (10-233)||(41648-41870)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (10-233)||(37107-37328)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (128-230)||(51226-51328)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (10-107)||(9382-9479)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (141-233)||(13636-13728)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (128-230)||(89498-89600)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (127-233)||(22656-22762)
scaffold0141 (127-233)||(26911-27017)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (127-233)||(1623-1729)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (181-231)||(3360-3410)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (178-224)||(45198-45244)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 216; Significance: 1e-119; HSPs: 21)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 25426628 - 25426851
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426628 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25426727  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426728 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25426827  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25426828 acatcaattcatgcatacaaacat 25426851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 12374 - 12597
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 12473  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12474 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 12573  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12574 acatcaattcatgcatacaaacat 12597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18778244 - 18778021
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778244 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 18778145  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778144 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 18778045  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18778044 acatcaattcatgcatacaaacat 18778021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 19499899 - 19500122
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499899 catcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19499998  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19499999 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19500098  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19500099 acatcaattcatgcatacaaacat 19500122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22366733 - 22366510
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22366733 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacaactcaaat 22366634  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366633 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 22366534  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  22366533 acatcaattcatgcatacaaacat 22366510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21073847 - 21073624
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073847 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattgataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 21073748  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073747 taacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 21073648  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  21073647 acatccattcatgcatacaaacat 21073624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43443647 - 43443424
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  43443647 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagactcacatctcaaat 43443548  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43443547 caacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 43443448  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  43443447 acatcaattcatgcatacaaacat 43443424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4200237 - 4200014
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  4200237 catcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 4200138  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| || ||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200137 caacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 4200038  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4200037 acatcaattcatgcatacaaacat 4200014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 27009841 - 27010064
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  27009841 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 27009940  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| | ||||||  |    
T  27009941 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacactcatacaatca 27010040  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  27010041 tcatcaattcatgcatacaaacat 27010064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 23506965 - 23507187
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  23506965 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 23507064  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  23507065 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 23507163  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  23507164 tcatcaattcatgcatacaaacat 23507187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27182810 - 27182588
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  27182810 catcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 27182711  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  27182710 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaatta 27182612  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     ||||| |||||||||||||||||    
T  27182611 tcatcagttcatgcatacaaacat 27182588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22054096 - 22053874
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| | ||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  22054096 catcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 22053997  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22053996 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 22053898  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     ||||||||||| |||||||||||    
T  22053897 tcatcaattcatacatacaaacat 22053874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 29188483 - 29188313
Alignment:
Q  62 atcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttat 161  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||    
T  29188483 atcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttat 29188385  T
Q  162 catttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29188384 catttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacat 29188313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18531330 - 18531108
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |||| ||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  18531330 catcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 18531231  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18531230 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18531132  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  18531131 tcatcaattcatgcatacaaacat 18531108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 34939289 - 34939499
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || ||||  |||    
T  34939289 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaatgact 34939387  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  34939388 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 34939486  T
Q  221 tgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||||    
T  34939487 tgcatacaaacat 34939499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 20623085 - 20623191
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  20623085 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 20623184  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  20623185 caaacat 20623191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21233675 - 21233569
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  21233675 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 21233576  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  21233575 caaacat 21233569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 128 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25900552 - 25900447
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    |||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   ||||| |||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  25900552 aattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 25900453  T
Q  228 aaacat 233  Q
    ||||||    
T  25900452 aaacat 25900447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 16536313 - 16536419
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  || ||||||||||||    
T  16536313 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattataaattcatgcata 16536412  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  16536413 caaacat 16536419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 37052860 - 37052966
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| ||||||   |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  37052860 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 37052959  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  37052960 caaacat 37052966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 29190522 - 29190482
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaa 54  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29190522 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaa 29190482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 11)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 25175563 - 25175786
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175563 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 25175662  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175663 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 25175762  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  25175763 acatcaattcatgcatacaaacat 25175786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 27654235 - 27654016
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27654235 catcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcattggaacaagaatcacaactcaaat 27654136  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654135 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 27654036  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaa 229  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  27654035 acatcaattcatgcatacaa 27654016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16826006 - 16825781
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16826006 catcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 16825907  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatta--tacaac 207  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  16825906 taacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattaattacaac 16825807  T
Q  208 taacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16825806 taacatcaattcatgcatacaaacat 16825781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14626377 - 14626159
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | ||||| |||||    
T  14626377 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaagttaac 14626278  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    |||||||||| | || ||||||  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  14626277 aacaacttagcataa-ttcaccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 14626179  T
Q  214 caattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14626178 caattcatgcatacaaacat 14626159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 14 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 1650352 - 1650136
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  1650352 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 1650253  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
     | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  1650252 cataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 1650154  T
Q  214 caattcatgcatacaaac 231  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1650153 caattcatgcatacaaac 1650136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 23153458 - 23153669
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||| ||||||||| ||| |||| |||| || || ||||| |||||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  23153458 catgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 23153557  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  23153558 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 23153656  T
Q  221 tgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||||    
T  23153657 tgcatacaaacat 23153669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 35009702 - 35009482
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  35009702 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 35009603  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  35009602 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 35009504  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaac 231  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  35009503 tcatcaattcatgcatacaaac 35009482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1657999 - 1657789
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || ||||| |||||   |||||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  1657999 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 1657901  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  1657900 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 1657802  T
Q  221 tgcatacaaacat 233  Q
    ||||| |||||||    
T  1657801 tgcatccaaacat 1657789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 15862484 - 15862693
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || ||||| || ||   ||||||| | | |||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  15862484 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataacataaat-gaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 15862581  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||| | ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  15862582 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 15862680  T
Q  221 tgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||||    
T  15862681 tgcatacaaacat 15862693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 78 - 226
Target Start/End: Original strand, 29665941 - 29666089
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||  | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| ||||||||||  ||||| |||||| | |    
T  29665941 aacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagtacaat-ttcataacttgacatttatgcatacttt 29666038  T
Q  177 gaa-catgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||| |||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||| ||||    
T  29666039 gaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacata 29666089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 233
Target Start/End: Original strand, 27751603 - 27751647
Alignment:
Q  189 tcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  27751603 tcaccaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacat 27751647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19886913 - 19886690
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886913 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 19886814  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886813 taacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 19886714  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19886713 acatcaattcatgcatacaaacat 19886690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 17396916 - 17396697
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  17396916 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 17396817  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  17396816 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 17396717  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaa 229  Q
     || ||||||||||||||||    
T  17396716 tcaacaattcatgcatacaa 17396697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Original strand, 462743 - 462957
Alignment:
Q  15 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 114  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  | ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  462743 tcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 462842  T
Q  115 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 214  Q
    ||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||    
T  462843 acaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatc 462941  T
Q  215 aattcatgcatacaaa 230  Q
    ||||||||||||||||    
T  462942 aattcatgcatacaaa 462957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19794967 - 19794745
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||| ||||| ||||    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  19794967 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatcaattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 19794868  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  19794867 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 19794769  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  19794768 ttatcaattcatgcatacaaacat 19794745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 8891242 - 8891464
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  8891242 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 8891341  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| ||    
T  8891342 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcgccaacaatcatacaatta 8891440  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  8891441 tcatcaattcatgcatacaaacat 8891464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20627576 - 20627354
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || || | ||| |||||  ||||| |||| |||||||||||| | | |||||||    
T  20627576 catcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaaccataaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaat 20627477  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20627476 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttggacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20627378  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     ||||||||| |||||||||||||    
T  20627377 tcatcaattcgtgcatacaaacat 20627354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 36982704 - 36982482
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  36982704 catcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 36982605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||    
T  36982604 caacaacaacttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccagcaatcttacaatta 36982506  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||| ||||||||||    
T  36982505 tcatcaattcatgaatacaaacat 36982482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 43643220 - 43642998
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || ||||| |||||   ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43643220 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaatagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaat 43643121  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||| ||||||| || | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43643120 taataacaactaagaa-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43643022  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  43643021 tcatcaattcatgcatacaaacat 43642998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 7508107 - 7507894
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  7508107 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaa- 7508009  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||||   |||||||||  || | |||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  7508008 ttaacaacaacttagcc-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 7507910  T
Q  209 aacatcaattcatgca 224  Q
    | ||||||||||||||    
T  7507909 atcatcaattcatgca 7507894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24341652 - 24341430
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  24341652 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 24341553  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  24341552 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatataatttcaccaacaatcatacaatta 24341454  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  24341453 tcatcaattcatgcatacaaacat 24341430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25265653 - 25265431
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||| | ||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  25265653 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 25265554  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  25265553 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 25265455  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  25265454 tcatcaattcatgcatacaaacat 25265431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 19689548 - 19689442
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  19689548 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 19689449  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  19689448 caaacat 19689442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 23820187 - 23820293
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  23820187 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 23820286  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  23820287 caaacat 23820293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14906587 - 14906481
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  14906587 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 14906488  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  14906487 caaacat 14906481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 20015127 - 20015233
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| | |||| ||  ||||||||||||||     
T  20015127 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaattattatcaattcatgcatg 20015226  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  20015227 caaacat 20015233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 15)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 47357654 - 47357877
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357654 catcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 47357753  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357754 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 47357853  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  47357854 acatcaatccatgcatacaaacat 47357877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 10644219 - 10644442
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  10644219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 10644318  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  10644319 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 10644418  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  10644419 tcatcaattcatgcatacaaacat 10644442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 18 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13048477 - 13048262
Alignment:
Q  18 atccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaaca 117  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||    
T  13048477 atccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaaca 13048378  T
Q  118 acttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaat 217  Q
    |||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||     
T  13048377 acttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaa 13048278  T
Q  218 tcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||    
T  13048277 tcatgcatacaaacat 13048262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 13246430 - 13246652
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  13246430 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 13246529  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  13246530 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 13246628  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     ||| |||||||||||||||||||    
T  13246629 tcattaattcatgcatacaaacat 13246652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 54118507 - 54118285
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  54118507 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatc 54118408  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| ||||||||| || | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  54118407 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaattgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 54118309  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  54118308 tcatcaattcatgcatacaaacat 54118285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15675352 - 15675130
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  15675352 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 15675253  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15675252 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15675154  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  15675153 tcatcaattcatgcatacaaacat 15675130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 31115629 - 31115851
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  31115629 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 31115728  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||||| |||||||||  || |||| ||| |||| |||||  ||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  31115729 caacaacaacttagga-aaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 31115827  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  31115828 tcatcaattcatgcatacaaacat 31115851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 233
Target Start/End: Original strand, 121989 - 122111
Alignment:
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  121989 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 122087  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  122088 tcatcaattcatgcatacaaacat 122111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 10104445 - 10104291
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatg 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||    
T  10104445 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattg 10104347  T
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  10104346 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacat 10104291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 26680201 - 26680422
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  26680201 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 26680300  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  26680301 caactacaacat--gtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 26680398  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  26680399 ttatcaattcatgcatacaaacat 26680422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 111395 - 111492
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 107  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  111395 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 111492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 10488678 - 10488784
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  10488678 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 10488777  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  10488778 caaacat 10488784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16328073 - 16327967
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  16328073 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 16327974  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  16327973 caaacat 16327967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 78 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 40885749 - 40885595
Alignment:
Q  78 aacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tat 176  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| | ||||| ||||||| | || ||||||  || |||| ||| ||||||||||  ||||| | |||| | |    
T  40885749 aacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagca-aagttcaccaattgagcataat-ttcataacttgacatttatacatacttt 40885652  T
Q  177 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||  || ||| || || ||||||||||||||||||||    
T  40885651 gaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacat 40885595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 54
Target Start/End: Complemental strand, 10104494 - 10104450
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaa 54  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||    
T  10104494 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaa 10104450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 10989410 - 10989632
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989410 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 10989509  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || |||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10989510 ta-caacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 10989608  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10989609 acatcaattcatgcatacaaacat 10989632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 2437457 - 2437680
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||    
T  2437457 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcaaatctcatat 2437556  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2437557 taacaacaacttaggaaaaattcaccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 2437656  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  2437657 acatcaattcatgcatacaaacat 2437680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13911277 - 13911053
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  13911277 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 13911178  T
Q  110 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  13911177 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 13911078  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  13911077 aacatcaattcatgcatacaaacat 13911053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 13572676 - 13572899
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13572676 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13572775  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | ||||  |    
T  13572776 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatca 13572875  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  13572876 tcatcaattcatgcatacaaacat 13572899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18254098 - 18253876
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  18254098 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 18253999  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  18253998 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 18253900  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  18253899 tcatcaattcatgcatacaaacat 18253876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25292595 - 25292379
Alignment:
Q  16 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 115  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |    
T  25292595 caatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacga 25292496  T
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||| |||||| ||||||||  || |||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | || ||    
T  25292495 caacctaggag-aattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaaca 25292397  T
Q  216 attcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||| |||||||||||    
T  25292396 attcatacatacaaacat 25292379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16479213 - 16478991
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||    
T  16479213 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaat 16479114  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||| || ||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16479113 taaaaataacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16479015  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  16479014 tcatcaattcatgcatacaaacat 16478991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 15 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 11580997 - 11580780
Alignment:
Q  15 tcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaaca 114  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||    
T  11580997 tcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaaca 11580898  T
Q  115 acaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatc 214  Q
    ||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||    
T  11580897 acaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatc 11580799  T
Q  215 aattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||||||||||    
T  11580798 aattcatgcatacaaacat 11580780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13037277 - 13037055
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||| ||||||||||| | |||||||||||||| |||||||      
T  13037277 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatc 13037178  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| ||||||| ||||||| |||||| ||    
T  13037177 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaatta 13037079  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  13037078 tcatcaattcatgcatacaaacat 13037055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Original strand, 36052667 - 36052884
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||  || ||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  36052667 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccacaacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 36052766  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  36052767 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaattttaccaacaatcatataatta 36052862  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaac 231  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  36052863 tcatcaattcatgcatacaaac 36052884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 47481294 - 47481072
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  47481294 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 47481195  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  47481194 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 47481096  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  47481095 tcatcaattcatgcatacaaacat 47481072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Original strand, 16211768 - 16211988
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 111  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| || || ||||| |||||  |||||||||| || ||||||||||| | |||||||||    
T  16211768 tcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaatta 16211867  T
Q  112 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 211  Q
    |||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||| || |    
T  16211868 acaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatc 16211966  T
Q  212 atcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  16211967 atcaattcatgcatacaaacat 16211988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 230
Target Start/End: Original strand, 3059966 - 3060185
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  3059966 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 3060065  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||| ||| |||| || ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |  ||||| ||    
T  3060066 taacaacaacttaaca-aaattcaccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacagtattacaatta 3060164  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaa 230  Q
     |||||||| |||||||||||    
T  3060165 tcatcaattaatgcatacaaa 3060185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 7293017 - 7293238
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  7293017 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 7293116  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  7293117 caacaacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 7293214  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
      || |||||||||||||||||||    
T  7293215 ttattaattcatgcatacaaacat 7293238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 13321014 - 13321238
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||| |||||||  || |||| ||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| | ||||| |    
T  13321014 catcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacatgaatcatatctcaatt 13321113  T
Q  110 taacaa-caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcata-tatgaa-catgtaatttcaccaacaattatacaa 206  Q
     ||||| |||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||  ||||| | |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  13321114 caacaatcaacttagca-aaattcaccaattgagcacaat-ttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 13321211  T
Q  207 ctaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     || |||||||||||||||||||||||    
T  13321212 ttatcatcaattcatgcatacaaacat 13321238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 11516343 - 11516449
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  11516343 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 11516442  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  11516443 caaacat 11516449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15441711 - 15441605
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  15441711 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 15441612  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  15441611 caaacat 15441605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30262276 - 30262170
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  30262276 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 30262177  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  30262176 caaacat 30262170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 296087 - 296007
Alignment:
Q  153 ataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||| |||||||| ||||  | |||||| ||||||||||||||| |||  | || |||| ||||||||| ||||||||    
T  296087 ataacttctcatttttacataattcaacatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacat 296007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 19)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 222943 - 222753
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222943 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 222844  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222843 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 222753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 736566 - 736376
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736566 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 736467  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736466 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 736376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 860461 - 860271
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860461 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 860362  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860361 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 860271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 30120722 - 30120945
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  30120722 catcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 30120821  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30120822 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 30120921  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||| |||||||||||||||||||    
T  30120922 acataaattcatgcatacaaacat 30120945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16674644 - 16674421
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  16674644 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 16674545  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16674544 taacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 16674445  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||| |||||||||||| ||||||    
T  16674444 acataaattcatgcataaaaacat 16674421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21844824 - 21844601
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  21844824 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaat 21844725  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  21844724 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 21844625  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  21844624 tcatcaattcatgcatacaaacat 21844601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21852217 - 21851994
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21852217 catcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacatctcaaat 21852118  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||| ||||||  |    
T  21852117 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatttaatttcaccaacaatcatacaatca 21852018  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  21852017 tcatcaattcatgcatacaaacat 21851994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 43373731 - 43373511
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  43373731 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 43373632  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||    
T  43373631 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatataatta 43373533  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaac 231  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  43373532 tcatcaattcatgcatacaaac 43373511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16193980 - 16193757
Alignment:
Q  9 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  16193980 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaa 16193881  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||| || | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||| |    
T  16193880 ttaacaacaatttggca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttccccaacaatcatacaatt 16193782  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  16193781 atcatcaattcatgcatacaaacat 16193757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6774505 - 6774287
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||||||    
T  6774505 atcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaac 6774406  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  6774405 aataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 6774307  T
Q  214 caattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6774306 caattcatgcatacaaacat 6774287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Original strand, 24548986 - 24549204
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  24548986 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 24549085  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  24549086 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 24549184  T
Q  214 caattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24549185 caattcatgcatacaaacat 24549204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24929043 - 24928832
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| |||||  |||||| ||| ||||||||||  || |||||||   ||| ||||||    
T  24929043 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaaccataacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaact 24928944  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    |||  ||||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  24928943 tagc-gaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 24928845  T
Q  221 tgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||||    
T  24928844 tgcatacaaacat 24928832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16405235 - 16405016
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | |||| ||||  | || ||||| |||||   ||||||||| |||||||||||||| |  |||| |    
T  16405235 catcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaataacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatt 16405136  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||   |||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16405135 taacaac---ttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16405040  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  16405039 tcatcaattcatgcatacaaacat 16405016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 22907476 - 22907255
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  22907476 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 22907377  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  22907376 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 22907279  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  22907278 ttatcaattcatgcatacaaacat 22907255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 138 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 691970 - 691908
Alignment:
Q  138 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691970 tttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatt 691908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 17345581 - 17345791
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || ||||| |||||   |||| ||||  ||||||||||||| ||||||| || |||| ||||    
T  17345581 catgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataatatcaactgaacaagaatcataactcaa-ttcacaataact 17345679  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||| || |  || |||||||| ||||||||||  ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||||||||    
T  17345680 tagca-aaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaacatgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattca 17345778  T
Q  221 tgcatacaaacat 233  Q
    |||||| ||||||    
T  17345779 tgcatataaacat 17345791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 5238203 - 5238309
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  5238203 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 5238302  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  5238303 caaacat 5238309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24661395 - 24661289
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  24661395 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 24661296  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  24661295 caaacat 24661289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 43685662 - 43685768
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  43685662 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 43685761  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  43685762 caaacat 43685768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 36093 - 36316
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||    
T  36093 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataacatctattgaacatgaatcacatctcaaat 36192  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36193 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 36292  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  36293 acatcaattcatacatacaaacat 36316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 48598 - 48820
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  48598 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 48697  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||| | |||||||||   | |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48698 tagcaacaacttagca-aaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48796  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  48797 tcatcaattcatgcatacaaacat 48820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 55316219 - 55316442
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  55316219 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 55316318  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  55316319 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 55316418  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  55316419 acatcaattcatgcatacaaacat 55316442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 41270075 - 41270298
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  41270075 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 41270174  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  41270175 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaattccaccaacaatcatacaacta 41270274  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  41270275 acatcaattcatgcatacaaacat 41270298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 16821139 - 16821362
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  16821139 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 16821238  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  16821239 caacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 16821338  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  16821339 tcatcaatttatgcatacaaacat 16821362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13975985 - 13975766
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13975985 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13975886  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13975885 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13975786  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaa 229  Q
     || ||||||||||||||||    
T  13975785 tcaacaattcatgcatacaa 13975766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14842824 - 14842602
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  14842824 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 14842725  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||    
T  14842724 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttgaacatgcaatttcaccaacaatcatacaatta 14842626  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     | |||||||||||||||||||||    
T  14842625 tcttcaattcatgcatacaaacat 14842602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 45860805 - 45861024
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  45860805 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 45860904  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  45860905 taatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 45861004  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaa 229  Q
     || ||||||||||||||||    
T  45861005 tcaacaattcatgcatacaa 45861024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15936890 - 15936668
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  15936890 catcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 15936791  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15936790 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15936692  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  15936691 tcatcaattcatgcatacaaacat 15936668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 13955153 - 13954934
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  13955153 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 13955054  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||  ||||||||||||||||||| |  || |||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||  |    
T  13955053 taatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttatttaaacatgtaattccaccaacaatcatacaatca 13954954  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaa 229  Q
     || ||||||||||||||||    
T  13954953 tcaacaattcatgcatacaa 13954934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 9 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 51158282 - 51158059
Alignment:
Q  9 acatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||     
T  51158282 acatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 51158183  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  51158182 ctaacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 51158084  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  51158083 atcatcaattcatgcatacaaacat 51158059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15859287 - 15859065
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |    
T  15859287 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatt 15859188  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  15859187 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 15859089  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  15859088 tcatcaattcatgcatacaaacat 15859065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15938729 - 15938510
Alignment:
Q  13 catcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||    
T  15938729 catcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaa 15938630  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  15938629 caacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 15938531  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||  |||||||||    
T  15938530 tcaattcatgattacaaacat 15938510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 12030410 - 12030188
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |  ||||||    
T  12030410 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaat 12030311  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||  |||| ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  12030310 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 12030212  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  12030211 tcatcaattcatgcatacaaacat 12030188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 2049810 - 2050032
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||| ||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  2049810 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccatagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaat 2049909  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  2049910 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 2050008  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  2050009 tcatcaattcaggcatacaaacat 2050032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 230
Target Start/End: Original strand, 15614838 - 15615053
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| | | |||||||||    
T  15614838 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaatcccaaattaac 15614937  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||    
T  15614938 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcctacaattatcat 15615036  T
Q  214 caattcatgcatacaaa 230  Q
    |||||||||||||||||    
T  15615037 caattcatgcatacaaa 15615053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 13838905 - 13839116
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||   ||| ||||||    
T  13838905 catgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaact 13839004  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  13839005 tagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 13839103  T
Q  221 tgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||||    
T  13839104 tgcatacaaacat 13839116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 17912744 - 17912523
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||| ||||  | || ||||| |||||   ||||||||  ||||||| |||||| | ||||| |    
T  17912744 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatcgattgaacatgaatcatagctcaatt 17912645  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| ||  |  |||||| |  ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17912644 caactacaacatatca--aattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 17912547  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  17912546 tcatcaattcatgcatacaaacat 17912523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2449385 - 2449279
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  2449385 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 2449286  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  2449285 caaacat 2449279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16744377 - 16744156
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||  | || ||  | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |    
T  16744377 catcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatt 16744278  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| | ||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||| | || ||||||||| ||||||||| |||||  ||    
T  16744277 caactataacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaaatgtaatttaaccaacaatcatacactta 16744180  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
      ||||||||||| ||||||||||    
T  16744179 ttatcaattcatggatacaaacat 16744156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 47984650 - 47984763
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47984650 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47984749  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  47984750 caacaacaacttag 47984763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 47993937 - 47994050
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  47993937 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 47994036  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  47994037 caacaacaacttag 47994050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 48003224 - 48003337
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48003224 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48003323  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  48003324 caacaacaacttag 48003337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 123
Target Start/End: Original strand, 48012510 - 48012623
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||| ||||  | || ||||| |||||   | ||||||| ||||||| |||||||| |||||      
T  48012510 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatcaattgaacatgaatcacatctcaatc 48012609  T
Q  110 taacaacaacttag 123  Q
     |||||||||||||    
T  48012610 caacaacaacttag 48012623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 49
Target Start/End: Complemental strand, 15468596 - 15468557
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattc 49  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15468596 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattc 15468557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 176; Significance: 6e-95; HSPs: 14)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18601370 - 18601147
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  18601370 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 18601271  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18601270 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 18601171  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  18601170 acatcaattcatgcatacaaacat 18601147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5072640 - 5072417
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |    
T  5072640 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaact 5072541  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5072540 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaacta 5072441  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  5072440 acatcaattcatgcatataaacat 5072417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 20931345 - 20931567
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  20931345 catcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 20931444  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20931445 taacaacaatttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20931543  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  20931544 tcatcaattcatgcatacaaacat 20931567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 22227809 - 22228022
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22227809 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22227908  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22227909 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22228007  T
Q  210 acatcaattcatgca 224  Q
     ||||||||||||||    
T  22228008 tcatcaattcatgca 22228022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 22232506 - 22232719
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  22232506 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 22232605  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  ||   |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||    
T  22232606 taacaacaacttagca-aaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatacaatta 22232704  T
Q  210 acatcaattcatgca 224  Q
     ||||||||||||||    
T  22232705 tcatcaattcatgca 22232719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 20913037 - 20913252
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||       |||    
T  20913037 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatca-------aat 20913129  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  20913130 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 20913228  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  20913229 tcatcaattcatgcatacaaacat 20913252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 20893889 - 20893667
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||      
T  20893889 catcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatc 20893790  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
T  20893789 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaatta 20893691  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  20893690 tcatcaattcatgcatacaaacat 20893667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Original strand, 2116258 - 2116477
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaac-tcaaattaa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||||    
T  2116258 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcaattgagcaagaatcaaaatatcaaattaa 2116357  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  2116358 caataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 2116456  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  2116457 tcaattcatgcatacaaacat 2116477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 41394222 - 41394444
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||  | || |||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||| | |||||      
T  41394222 catcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaca 41394321  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||| ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  41394322 taacaataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaacttcaccaacaatcatacaatta 41394420  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||| ||||||||||||||    
T  41394421 tcatcaatttatgcatacaaacat 41394444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 20445679 - 20445901
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20445679 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20445778  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20445779 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20445877  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  20445878 tcatcaattcatgcatacaaacat 20445901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 20531444 - 20531666
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||| |    
T  20531444 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagccataacatcaattgatcaagaatcataacacaatt 20531543  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| ||||  ||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  20531544 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 20531642  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  20531643 tcatcaattcatgcatacaaacat 20531666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37844714 - 37844491
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| | || |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||      
T  37844714 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatc 37844615  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttca-taacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||    || |||||||| |||| ||  ||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37844614 taacaacaacttagca-aaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctacttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 37844516  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  37844515 atcatcaattcatgcatacaaacat 37844491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 76 - 231
Target Start/End: Original strand, 45051489 - 45051643
Alignment:
Q  76 ataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatata 175  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| |||||     
T  45051489 ataacatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatt 45051587  T
Q  176 tgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaac 231  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||    
T  45051588 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaac 45051643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 51452608 - 51452714
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  51452608 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 51452707  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  51452708 caaacat 51452714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 42997 - 43220
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  42997 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcacttgaacacgaatcacatctcaaat 43096  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  43097 taacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 43196  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||| ||||||    
T  43197 tcatcaattcatgcatagaaacat 43220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 31928 - 31704
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  31928 catcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaat 31829  T
Q  110 taacaacaactt-aggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  || |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31828 caacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcaccaacaatcatacaact 31729  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||    
T  31728 aacatcaattcatgcattcaaacat 31704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 128431 - 128210
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || ||| | |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  128431 catcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctc-aat 128333  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||| ||  | |||||| ||  || |||||||| |||| |||||| ||  ||| || || ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  128332 taacaacaacctaaca-aaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 128234  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  128233 tcatcaattcatgcatacaaacat 128210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 148; Significance: 3e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 35 - 258
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  35 catcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 134  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| | ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  |    
T  135 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatca 234  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  235 tcatcaattcatgcatacaaacat 258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 141; Significance: 5e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 64780 - 64584
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  64780 catcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaat 64681  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaa 206  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  64680 taacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaa 64584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 107747 - 107969
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  107747 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 107846  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| || | ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  107847 taacaacaacttatca-aaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 107945  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  107946 tcatcaattcatgcatacaaacat 107969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 233
Target Start/End: Original strand, 5552 - 5751
Alignment:
Q  34 acccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattca 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5552 acccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattca 5651  T
Q  134 cccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||  || |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  5652 ccaattgagcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacat 5751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 3843 - 3623
Alignment:
Q  12 tcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaatta 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  3843 tcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaatta 3744  T
Q  112 acaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaac 211  Q
    |||||||||||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |    
T  3743 acaacaacttagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatc 3645  T
Q  212 atcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  3644 atcaattcatgcatacaaacat 3623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 1124 - 1346
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  1124 catcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 1223  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1224 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1322  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
      |||||||||||||||| |||||    
T  1323 ttatcaattcatgcatactaacat 1346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 128; Significance: 3e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 21367 - 21145
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  | |||||||    
T  21367 catcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattcataacatcaattgaacaagaatccaatctcaaat 21268  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  21267 taacaacaacttagga-aaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 21169  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||| ||| ||||||||||    
T  21168 tcatcaattaatggatacaaacat 21145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14312 - 14090
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||  | |||||||    
T  14312 catcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattcataacattaattgaacaagaatccaatctcaaat 14213  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    || ||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  14212 tatcaacaacttagga-aaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttcaacatgtaatttcactaacaatcatataatta 14114  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||| ||||    
T  14113 tcatcaattcatgcatacagacat 14090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 124; Significance: 6e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 48187 - 48409
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||| ||||||  ||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  48187 catcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatctataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 48286  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  48287 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 48385  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  48386 tcatcaattcatgcatacaaacat 48409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6326 - 6105
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  || |||||| |||||||||| |||||||||||||| | ||| |||    
T  6326 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatccataacatcacttgaacaagaatcaaatctc-aat 6228  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| || | ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  6227 taacaacaacttagca-aaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 6129  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  6128 tcatcaattcatgcatacaaacat 6105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1218 - 997
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || || |||||| |||||||||| |||||||||||| | | ||| |||    
T  1218 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatccataacatcacttgaacaagaataaaatctc-aat 1120  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | ||||||| |  || |||||||| |||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  1119 taacaacaacttagca-aaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 1021  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  1020 tcatcaattcatgcatacaaacat 997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 5466 - 5254
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  5466 catcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 5368  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    ||||||||||| || | |||||||||  || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  5367 taacaacaactcagca-aaattcaccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 5269  T
Q  210 acatcaattcatgca 224  Q
     ||||||||||||||    
T  5268 tcatcaattcatgca 5254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 117; Significance: 9e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 12115 - 12335
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||      
T  12115 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaa-- 12212  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    | |||||||||||  | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || || | |||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  12213 ttacaacaacttaaca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttaaacatgtattttcaccaacaatcatacaatta 12311  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  12312 tcatcaattcatgcatacaaacat 12335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 8878 - 9100
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  8878 catcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 8977  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||  | |||||||||  || |||||||| |||| |||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  8978 taacaacaacttaaca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 9076  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||| ||||||||||||||||||    
T  9077 tcatcgattcatgcatacaaacat 9100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 116; Significance: 4e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 3722 - 3936
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  3722 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 3821  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatca-tttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  ||   |||||| | |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  3822 taacaacaacttagca-aaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 3920  T
Q  209 aacatcaattcatgca 224  Q
    | ||||||||||||||    
T  3921 atcatcaattcatgca 3936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 112; Significance: 9e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 148721 - 148943
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||| |||| || ||  |||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  148721 catcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaat 148820  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  148821 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 148919  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  148920 tcatcaattcatgcatacaaacat 148943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 8849 - 9071
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| ||| |   ||||||||| |||||||  ||||| | ||||| |    
T  8849 catcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataacatcaattgaacattaatcatatctcaatt 8948  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8949 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 9047  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  9048 tcatcaattcatgcatacaaacat 9071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 9596 - 9378
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  9596 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 9497  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  9496 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 9398  T
Q  214 caattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  9397 caattcatgcatacaaacat 9378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 16494 - 16276
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||  ||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  16494 atcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatcatttgagcaagaatcaaatctcaaattaac 16395  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    || ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||    
T  16394 aataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcat 16296  T
Q  214 caattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  16295 caattcatgcatacaaacat 16276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 19206 - 19428
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  19206 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 19305  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  19306 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 19404  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  19405 tcatcaattcatgcatacaaacat 19428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 21290 - 21512
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||| |||||   ||||||||| ||||||| |||||| ||||||| |    
T  21290 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatcaattgaacaggaatcataactcaatt 21389  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  21390 caacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaatta 21488  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  21489 tcatcaattcatgcatacaaacat 21512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 104; Significance: 5e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 123427 - 123205
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||| ||      
T  123427 catcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatcaattgaacaagaatcataacttaatc 123328  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  123327 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 123229  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  123228 tcatcaattcatgcatacaaacat 123205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5324 - 5102
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  5324 catcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 5225  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||| | | |||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  5224 taacaacaactttgca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaacaatcttacaatta 5126  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  5125 tcatcaattcacgcatacaaacat 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37176 - 36954
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||| ||| |||||||||| ||| |||||||      
T  37176 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacgtcaattgaacaagattcataactcaatc 37077  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  37076 caaccacaacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaagcttacaatta 36978  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  36977 tcatcaattcatgcatacaaacat 36954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 116 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1450 - 1333
Alignment:
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1450 caacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatca 1351  T
Q  216 attcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||    
T  1350 attcatgcatacaaacat 1333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 247694 - 247483
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  247694 catgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaact 247595  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | ||||| |||  || |||||||| |||| |||||||||||| | | ||| |||||||| |||||||||  |||| |||||| || ||||||||||    
T  247594 tagca-aaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattca 247496  T
Q  221 tgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||||||    
T  247495 tgcatacaaacat 247483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 92; Significance: 8e-45; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26678 - 26456
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||       
T  26678 catcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcattc 26579  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||  ||||| ||    
T  26578 taacaacaacttagca-aaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtactttcaccaataatcttacaatta 26480  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||| ||||||||||||    
T  26479 tcatcaattcacgcatacaaacat 26456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 8327 - 8221
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8327 aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgtaatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcata 8228  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  8227 caaacat 8221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 171916 - 172127
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  171916 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 172015  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  172016 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 172114  T
Q  221 tgcatacaaacat 233  Q
    | |||||||||||    
T  172115 tccatacaaacat 172127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 233
Target Start/End: Original strand, 177619 - 177830
Alignment:
Q  21 catgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaact 120  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||  ||||||| | ||| ||||||    
T  177619 catgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaact 177718  T
Q  121 taggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattca 220  Q
    ||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||    
T  177719 tagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattca 177817  T
Q  221 tgcatacaaacat 233  Q
    | |||||||||||    
T  177818 tccatacaaacat 177830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 272031 - 272247
Alignment:
Q  16 caatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaa 115  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||   |||||| || |||||||||||||| |||||||   ||| |    
T  272031 caattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagctataacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaacca 272130  T
Q  116 caacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatca 215  Q
    |||||||| | |||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||| ||||||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||    
T  272131 caacttagca-aaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttgaacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatca 272229  T
Q  216 attcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||| |||||||||||    
T  272230 attcattcatacaaacat 272247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Original strand, 41733 - 41951
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaac 113  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||   | || | ||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||  ||||    
T  41733 atcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaacaattaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaac 41832  T
Q  114 aacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacat 213  Q
    |||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| || ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||   |||| || |||    
T  41833 aacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcatttttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcat 41931  T
Q  214 caattcatgcatacaaacat 233  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  41932 caattcatgcatacaaacat 41951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 797 - 575
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| || ||  |||||||||| || ||||||||||| |||| ||      
T  797 catcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccataacatcaattaaacaagaatcataacttaatc 698  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
    |||||  ||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||| ||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  697 taacagtaacttagca-aaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 599  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  598 tcatcaattcatgcatacaaacat 575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 115 - 9
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  115 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattcataatatcatttgaacaagaatcaaatatcaaat 16  T
Q  110 taacaac 116  Q
    |||||||    
T  15 taacaac 9  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 116
Target Start/End: Original strand, 48514 - 48620
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||| | |||||||    
T  48514 catcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatccataacatcaagtgaacaagaatcaaatctcaaat 48613  T
Q  110 taacaac 116  Q
    |||||||    
T  48614 taacaac 48620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Original strand, 2966 - 3185
Alignment:
Q  14 atcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaattaa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||||| | |||| ||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | ||||| | ||    
T  2966 atcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaa 3065  T
Q  113 caacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaaca 212  Q
    ||||||||||| | |||||||||  || |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  3066 caacaacttagca-aaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatca 3164  T
Q  213 tcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||||||| ||||||||||    
T  3165 tcaattcatggatacaaacat 3185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34724 - 34501
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaa-caagaatcacaactcaaa 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||| ||||  | || |||||||||||   ||||||||| || || || |||||| | |||||     
T  34724 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatcaattaaaacatgaatcatatctcaat 34625  T
Q  109 ttaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaact 208  Q
    | ||||||||||||| | |||||||||  || || ||||| |||| |||||   |||||| || |  |||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  34624 tcaacaacaacttagca-aaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatt 34526  T
Q  209 aacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||    
T  34525 atcatcaattcatgcatacaaacat 34501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 13480 - 13354
Alignment:
Q  106 aaattaacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattataca 205  Q
    |||||||||| ||||||| | |||||||||  || ||||| || |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13480 aaattaacaataacttagca-aaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcataca 13382  T
Q  206 actaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  13381 attatcatcaattcatgcatacaaacat 13354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Original strand, 41648 - 41870
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||  | || ||||  |||||   | ||||||| ||||||| |  || || |  || |    
T  41648 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatcaattgaacatggttctcatcataatt 41747  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||||||||| ||| | |||||||||  || | |||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  41748 caacaacaacatagca-aaattcaccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatta 41846  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  41847 tcatcaattcatgcatacaaacat 41870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 10 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37328 - 37107
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat 109  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||  | || ||| | || |||  | ||||||| ||| |||||||||| | |||||      
T  37328 catcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaatc 37229  T
Q  110 taacaacaacttaggagaaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaacta 209  Q
     ||| ||||| |  |  ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||    
T  37228 caactacaacat--gtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaatta 37131  T
Q  210 acatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  37130 ttatcaattcatgcatacaaacat 37107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 51328 - 51226
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||||||||||||    
T  51328 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatac 51229  T
Q  228 aaa 230  Q
    |||    
T  51228 aaa 51226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 107
Target Start/End: Original strand, 9382 - 9479
Alignment:
Q  10 catcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcgtcaatcataatatcaaataacattcataacatcatttgaacaagaatcacaactcaa 107  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||| |||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  9382 catcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaa 9479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 233
Target Start/End: Original strand, 13636 - 13728
Alignment:
Q  141 agcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacat 233  Q
    |||||||| |||| |||||  ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  13636 agcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacat 13728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 128 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 89600 - 89498
Alignment:
Q  128 aattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatac 227  Q
    ||||||||  || |||||||| |||| ||||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  89600 aattcaccaattgagcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatac 89501  T
Q  228 aaa 230  Q
    |||    
T  89500 aaa 89498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 22656 - 22762
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  22656 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 22755  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  22756 caaacat 22762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Original strand, 26911 - 27017
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  26911 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 27010  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  27011 caaacat 27017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 127 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1729 - 1623
Alignment:
Q  127 aaattcacccctttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcata 226  Q
    ||||||| || ||| ||||||| |||||||||| |||||||  |||||   |||||||||||| ||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||    
T  1729 aaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcata 1630  T
Q  227 caaacat 233  Q
    |||||||    
T  1629 caaacat 1623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 181 - 231
Target Start/End: Original strand, 3360 - 3410
Alignment:
Q  181 atgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaac 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||    
T  3360 atgtaatttcaccaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaac 3410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Original strand, 45198 - 45244
Alignment:
Q  178 aacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgca 224  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45198 aacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatgca 45244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University