View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11835_low_2 (Length: 874)

Name: NF11835_low_2
Description: NF11835
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11835_low_2
NF11835_low_2
[»] chr2 (77 HSPs)
chr2 (297-858)||(42132054-42132615)
chr2 (1-266)||(42132612-42132869)
chr2 (1-165)||(26911556-26911720)
chr2 (1-221)||(8070552-8070771)
chr2 (1-160)||(2047253-2047411)
chr2 (28-167)||(4453482-4453621)
chr2 (28-213)||(39167749-39167933)
chr2 (28-167)||(2266111-2266250)
chr2 (28-167)||(3377435-3377574)
chr2 (28-167)||(16486925-16487064)
chr2 (28-167)||(28382639-28382778)
chr2 (28-167)||(36712495-36712634)
chr2 (28-167)||(37356212-37356351)
chr2 (28-167)||(41322799-41322938)
chr2 (28-165)||(13111701-13111838)
chr2 (28-167)||(650739-650878)
chr2 (28-167)||(24402012-24402150)
chr2 (28-167)||(29514876-29515015)
chr2 (28-167)||(36999532-36999671)
chr2 (28-167)||(40024901-40025040)
chr2 (28-167)||(43507521-43507660)
chr2 (28-167)||(9887035-9887174)
chr2 (28-167)||(10839539-10839678)
chr2 (28-167)||(21865290-21865429)
chr2 (52-167)||(8688945-8689060)
chr2 (28-167)||(10392994-10393133)
chr2 (28-167)||(15521522-15521661)
chr2 (38-167)||(6232249-6232378)
chr2 (28-167)||(17263712-17263851)
chr2 (8-165)||(9053069-9053226)
chr2 (28-167)||(8815256-8815402)
chr2 (28-167)||(38578960-38579106)
chr2 (28-167)||(2546283-2546422)
chr2 (28-167)||(10727873-10728012)
chr2 (61-167)||(7400383-7400489)
chr2 (30-167)||(8340022-8340159)
chr2 (28-167)||(13527863-13528002)
chr2 (52-167)||(38880765-38880880)
chr2 (19-167)||(38842878-38843026)
chr2 (68-167)||(6760603-6760702)
chr2 (28-169)||(31616352-31616486)
chr2 (68-167)||(43135660-43135759)
chr2 (28-167)||(4038306-4038438)
chr2 (28-167)||(4385491-4385623)
chr2 (28-167)||(5039818-5039950)
chr2 (68-167)||(40869358-40869457)
chr2 (19-136)||(7823497-7823614)
chr2 (68-167)||(41796741-41796840)
chr2 (52-167)||(44275705-44275820)
chr2 (30-164)||(598937-599071)
chr2 (68-167)||(43285661-43285760)
chr2 (19-139)||(25071441-25071561)
chr2 (9-170)||(2221429-2221590)
chr2 (66-139)||(24019957-24020030)
chr2 (28-167)||(18212163-18212288)
chr2 (19-139)||(23356934-23357054)
chr2 (72-167)||(7213664-7213759)
chr2 (19-152)||(15250163-15250296)
chr2 (66-139)||(16669123-16669196)
chr2 (19-139)||(4055961-4056081)
chr2 (19-122)||(7511660-7511763)
chr2 (19-122)||(7515944-7516047)
chr2 (68-122)||(6153461-6153515)
chr2 (66-128)||(41877821-41877883)
chr2 (66-138)||(6222636-6222708)
chr2 (28-122)||(18710258-18710345)
chr2 (68-143)||(34884877-34884952)
chr2 (38-165)||(39675064-39675191)
chr2 (33-139)||(5520032-5520138)
chr2 (72-169)||(2758872-2758969)
chr2 (1-122)||(7569854-7569962)
chr2 (66-122)||(13761846-13761900)
chr2 (68-143)||(37674486-37674561)
chr2 (66-111)||(6807492-6807537)
chr2 (68-112)||(13351603-13351647)
chr2 (61-109)||(44525925-44525973)
chr2 (69-135)||(10361481-10361546)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (1-233)||(63824-64055)
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (1-233)||(33540661-33540892)
chr6 (5-234)||(5681499-5681727)
chr6 (28-167)||(558406-558545)
chr6 (28-167)||(5943037-5943176)
chr6 (28-167)||(32731804-32731943)
chr6 (28-213)||(12432583-12432767)
chr6 (28-167)||(2442470-2442609)
chr6 (28-167)||(30811111-30811250)
chr6 (28-167)||(12297410-12297549)
chr6 (28-167)||(20805035-20805174)
chr6 (28-167)||(34232877-34233016)
chr6 (52-169)||(14227522-14227639)
chr6 (1-122)||(29414859-29414980)
chr6 (28-167)||(34684978-34685116)
chr6 (28-165)||(2970722-2970858)
chr6 (20-167)||(33453781-33453921)
chr6 (28-167)||(6709658-6709797)
chr6 (19-233)||(7292502-7292715)
chr6 (19-167)||(3636601-3636742)
chr6 (28-167)||(29822998-29823137)
chr6 (9-167)||(34439728-34439886)
chr6 (28-167)||(31099984-31100116)
chr6 (61-169)||(31049377-31049485)
chr6 (52-167)||(7317597-7317712)
chr6 (68-167)||(10856178-10856277)
chr6 (9-167)||(5301545-5301703)
chr6 (28-167)||(31451924-31452055)
chr6 (28-167)||(28076468-28076607)
chr6 (19-139)||(15591104-15591224)
chr6 (19-169)||(12140832-12140982)
chr6 (28-122)||(34904037-34904130)
chr6 (28-167)||(11015635-11015774)
chr6 (19-153)||(21894311-21894445)
chr6 (61-165)||(3108001-3108106)
chr6 (94-167)||(1806343-1806416)
chr6 (71-167)||(1225477-1225573)
chr6 (19-139)||(20563467-20563587)
chr6 (31-152)||(9896766-9896885)
chr6 (68-139)||(23648267-23648338)
chr6 (66-152)||(6104671-6104757)
chr6 (32-139)||(32563209-32563317)
chr6 (66-136)||(5893894-5893964)
chr6 (34-109)||(13866368-13866443)
chr6 (28-111)||(19415382-19415465)
chr6 (129-167)||(29414974-29415012)
chr6 (196-233)||(3108143-3108180)
[»] chr3 (96 HSPs)
chr3 (1-167)||(2121873-2122039)
chr3 (1-160)||(42497047-42497205)
chr3 (1-167)||(51709057-51709223)
chr3 (8-232)||(41246231-41246447)
chr3 (28-167)||(16127106-16127245)
chr3 (28-167)||(25570425-25570564)
chr3 (28-167)||(28676857-28676996)
chr3 (28-167)||(29081248-29081387)
chr3 (28-167)||(35499647-35499786)
chr3 (28-167)||(37528690-37528829)
chr3 (28-167)||(40563330-40563469)
chr3 (28-167)||(44845670-44845809)
chr3 (1-139)||(45693326-45693464)
chr3 (1-167)||(52225331-52225501)
chr3 (28-167)||(2579894-2580033)
chr3 (28-167)||(2851863-2852002)
chr3 (28-167)||(19948285-19948424)
chr3 (28-167)||(24536521-24536660)
chr3 (28-167)||(26541006-26541145)
chr3 (28-167)||(29718168-29718306)
chr3 (28-167)||(37088330-37088469)
chr3 (28-167)||(38185816-38185955)
chr3 (28-167)||(45344975-45345114)
chr3 (28-167)||(53779077-53779216)
chr3 (28-167)||(55305076-55305215)
chr3 (28-165)||(21603846-21603983)
chr3 (8-167)||(39876660-39876812)
chr3 (28-167)||(4240324-4240463)
chr3 (28-167)||(52794941-52795080)
chr3 (28-167)||(54672147-54672286)
chr3 (28-170)||(50499805-50499947)
chr3 (28-165)||(49853010-49853147)
chr3 (1-167)||(46318706-46318865)
chr3 (1-167)||(27446473-27446639)
chr3 (28-167)||(30864472-30864611)
chr3 (9-206)||(46627445-46627642)
chr3 (28-167)||(30548790-30548929)
chr3 (52-167)||(47897597-47897712)
chr3 (28-167)||(50316996-50317135)
chr3 (1-167)||(48378272-48378431)
chr3 (28-167)||(24628166-24628305)
chr3 (28-167)||(33391949-33392088)
chr3 (28-167)||(38891953-38892092)
chr3 (52-167)||(46972079-46972194)
chr3 (32-167)||(52166061-52166196)
chr3 (52-167)||(52857942-52858057)
chr3 (28-167)||(44748760-44748892)
chr3 (1-170)||(30814197-30814359)
chr3 (30-165)||(41518409-41518544)
chr3 (28-167)||(21707197-21707329)
chr3 (28-167)||(40479995-40480127)
chr3 (28-167)||(46247938-46248070)
chr3 (52-167)||(12063719-12063834)
chr3 (68-167)||(37713972-37714071)
chr3 (68-167)||(43525789-43525888)
chr3 (68-167)||(48943035-48943134)
chr3 (19-153)||(44947159-44947293)
chr3 (68-167)||(8872919-8873018)
chr3 (68-167)||(42217709-42217808)
chr3 (28-170)||(54541909-54542044)
chr3 (1-170)||(35100232-35100386)
chr3 (30-167)||(7041107-7041244)
chr3 (63-167)||(42465029-42465133)
chr3 (30-139)||(45368684-45368793)
chr3 (28-153)||(51003307-51003432)
chr3 (72-167)||(52595345-52595440)
chr3 (61-154)||(32026409-32026502)
chr3 (28-167)||(39469959-39470084)
chr3 (1-83)||(41785943-41786025)
chr3 (66-139)||(2598669-2598742)
chr3 (8-168)||(32982866-32983012)
chr3 (66-146)||(52868184-52868264)
chr3 (8-89)||(47174486-47174567)
chr3 (19-167)||(20450504-20450652)
chr3 (66-153)||(33897898-33897985)
chr3 (68-139)||(37489931-37490002)
chr3 (61-167)||(29203027-29203133)
chr3 (93-167)||(47173614-47173688)
chr3 (66-167)||(193443-193544)
chr3 (33-138)||(5506704-5506809)
chr3 (8-72)||(42464067-42464131)
chr3 (108-168)||(43740325-43740385)
chr3 (28-167)||(44545276-44545401)
chr3 (19-148)||(25146378-25146507)
chr3 (30-139)||(37713107-37713218)
chr3 (52-139)||(22257727-22257814)
chr3 (68-122)||(52931152-52931206)
chr3 (1-65)||(51951395-51951459)
chr3 (68-139)||(39719427-39719498)
chr3 (28-101)||(43740260-43740332)
chr3 (19-111)||(41538407-41538498)
chr3 (107-167)||(41785855-41785915)
chr3 (80-139)||(9338785-9338844)
chr3 (198-233)||(41518328-41518363)
chr3 (129-167)||(52931200-52931238)
chr3 (196-233)||(45368577-45368614)
[»] chr1 (89 HSPs)
chr1 (1-233)||(49185105-49185336)
chr1 (5-167)||(37672274-37672436)
chr1 (5-167)||(37703719-37703881)
chr1 (1-167)||(15348873-15349039)
chr1 (4-167)||(36043223-36043386)
chr1 (1-167)||(42614055-42614221)
chr1 (28-167)||(1918074-1918213)
chr1 (28-167)||(19898855-19898994)
chr1 (28-167)||(42064264-42064403)
chr1 (28-167)||(1507690-1507829)
chr1 (28-167)||(26204323-26204462)
chr1 (28-167)||(29586207-29586346)
chr1 (28-167)||(30721570-30721709)
chr1 (28-167)||(30774130-30774269)
chr1 (28-167)||(31150372-31150511)
chr1 (28-167)||(33524577-33524716)
chr1 (28-167)||(36301052-36301191)
chr1 (28-167)||(36838642-36838781)
chr1 (28-167)||(44909889-44910028)
chr1 (1-167)||(51422904-51423070)
chr1 (30-167)||(29704033-29704170)
chr1 (28-167)||(322914-323053)
chr1 (28-167)||(2497971-2498110)
chr1 (28-167)||(3270707-3270846)
chr1 (28-167)||(15313293-15313431)
chr1 (28-167)||(17499832-17499971)
chr1 (28-167)||(32368286-32368425)
chr1 (28-167)||(50171244-50171383)
chr1 (28-167)||(3660994-3661133)
chr1 (28-167)||(22098967-22099106)
chr1 (1-160)||(36379066-36379225)
chr1 (28-167)||(50351081-50351220)
chr1 (28-167)||(46369856-46369992)
chr1 (19-139)||(46928922-46929042)
chr1 (28-167)||(38676538-38676676)
chr1 (28-167)||(49220419-49220559)
chr1 (28-163)||(43727074-43727209)
chr1 (28-167)||(7710908-7711040)
chr1 (28-165)||(26843802-26843939)
chr1 (28-167)||(40887930-40888063)
chr1 (28-169)||(17046776-17046910)
chr1 (66-167)||(13121569-13121670)
chr1 (1-167)||(28429078-28429231)
chr1 (28-167)||(38967418-38967550)
chr1 (34-167)||(39583145-39583278)
chr1 (1-122)||(7024917-7025031)
chr1 (52-167)||(34319438-34319553)
chr1 (68-167)||(39826649-39826748)
chr1 (2-167)||(29374379-29374543)
chr1 (19-167)||(3391169-3391317)
chr1 (19-153)||(7781102-7781236)
chr1 (8-167)||(30495129-30495281)
chr1 (66-167)||(47134516-47134617)
chr1 (1-120)||(6814123-6814242)
chr1 (61-167)||(34318455-34318561)
chr1 (19-145)||(41004931-41005057)
chr1 (28-167)||(25602035-25602167)
chr1 (66-167)||(34087015-34087116)
chr1 (1-136)||(40719554-40719682)
chr1 (19-139)||(52703049-52703169)
chr1 (28-167)||(8221182-8221321)
chr1 (28-153)||(18347370-18347488)
chr1 (19-165)||(5697528-5697673)
chr1 (2-156)||(49822089-49822242)
chr1 (61-166)||(9769953-9770058)
chr1 (32-167)||(2479209-2479330)
chr1 (19-135)||(33151975-33152091)
chr1 (28-167)||(33561856-33561981)
chr1 (1-96)||(12891644-12891739)
chr1 (68-167)||(50540821-50540920)
chr1 (66-167)||(25134897-25134998)
chr1 (19-131)||(16085549-16085661)
chr1 (9-139)||(13570721-13570851)
chr1 (28-125)||(9894928-9895025)
chr1 (68-167)||(49240268-49240367)
chr1 (31-139)||(46087950-46088058)
chr1 (68-129)||(9169142-9169203)
chr1 (66-146)||(44956348-44956428)
chr1 (66-169)||(42963875-42963978)
chr1 (59-122)||(33632332-33632395)
chr1 (57-143)||(28868987-28869073)
chr1 (72-153)||(44718962-44719043)
chr1 (66-139)||(46056411-46056484)
chr1 (67-119)||(40935893-40935945)
chr1 (2-88)||(19715368-19715453)
chr1 (196-232)||(36043429-36043465)
chr1 (2-139)||(10628757-10628887)
chr1 (94-167)||(1711191-1711265)
chr1 (73-119)||(31434449-31434495)
[»] chr5 (76 HSPs)
chr5 (8-233)||(36027924-36028148)
chr5 (19-167)||(4379303-4379451)
chr5 (28-167)||(1711156-1711295)
chr5 (28-167)||(8023937-8024076)
chr5 (28-167)||(14647310-14647449)
chr5 (28-167)||(30299743-30299882)
chr5 (28-167)||(30412565-30412704)
chr5 (28-167)||(32381627-32381766)
chr5 (28-167)||(32382894-32383033)
chr5 (28-167)||(35235680-35235819)
chr5 (28-167)||(36685861-36686000)
chr5 (28-213)||(15530435-15530619)
chr5 (28-216)||(43402441-43402628)
chr5 (28-167)||(2178805-2178944)
chr5 (28-167)||(2236469-2236608)
chr5 (28-167)||(5591633-5591772)
chr5 (28-167)||(7651685-7651824)
chr5 (28-167)||(9160645-9160784)
chr5 (28-206)||(12363565-12363743)
chr5 (28-167)||(12774621-12774760)
chr5 (28-167)||(31168940-31169079)
chr5 (30-167)||(27130378-27130515)
chr5 (62-233)||(5521278-5521448)
chr5 (28-167)||(12713357-12713496)
chr5 (28-167)||(13228426-13228565)
chr5 (28-167)||(19525794-19525933)
chr5 (28-167)||(26699059-26699198)
chr5 (28-167)||(26968792-26968931)
chr5 (28-167)||(35639985-35640124)
chr5 (28-167)||(39275468-39275607)
chr5 (28-167)||(39744495-39744634)
chr5 (28-170)||(15443498-15443640)
chr5 (28-167)||(3037378-3037517)
chr5 (28-167)||(5381897-5382036)
chr5 (28-167)||(6603863-6604002)
chr5 (37-167)||(5997856-5997986)
chr5 (52-167)||(10697314-10697429)
chr5 (28-167)||(22977158-22977297)
chr5 (28-167)||(24794017-24794163)
chr5 (52-167)||(1174829-1174944)
chr5 (28-206)||(9587146-9587317)
chr5 (39-167)||(11062871-11062999)
chr5 (68-167)||(2671459-2671558)
chr5 (52-167)||(3670323-3670438)
chr5 (1-168)||(4875688-4875855)
chr5 (52-167)||(35236644-35236759)
chr5 (28-167)||(4221433-4221565)
chr5 (2-167)||(19347751-19347915)
chr5 (1-167)||(6893312-6893471)
chr5 (19-167)||(9627098-9627246)
chr5 (28-167)||(19956254-19956399)
chr5 (52-167)||(30774169-30774284)
chr5 (66-167)||(648576-648677)
chr5 (52-167)||(11663868-11663983)
chr5 (68-167)||(39246830-39246928)
chr5 (28-167)||(13156846-13156978)
chr5 (28-167)||(29392067-29392199)
chr5 (19-139)||(16474844-16474964)
chr5 (28-167)||(3669586-3669718)
chr5 (66-139)||(11100753-11100826)
chr5 (61-167)||(23920502-23920608)
chr5 (66-165)||(2497610-2497709)
chr5 (19-167)||(13936237-13936378)
chr5 (28-139)||(27005807-27005918)
chr5 (64-119)||(42323596-42323651)
chr5 (52-122)||(4657578-4657648)
chr5 (57-155)||(6280437-6280535)
chr5 (52-122)||(6349430-6349500)
chr5 (66-139)||(13921798-13921871)
chr5 (68-120)||(25872221-25872273)
chr5 (72-154)||(31407980-31408062)
chr5 (28-139)||(18480522-18480626)
chr5 (196-236)||(41826359-41826399)
chr5 (65-139)||(32321652-32321726)
chr5 (66-136)||(41471900-41471970)
chr5 (196-233)||(25872342-25872379)
[»] chr4 (113 HSPs)
chr4 (2-167)||(30366083-30366248)
chr4 (28-167)||(7706414-7706553)
chr4 (28-167)||(9031958-9032097)
chr4 (28-167)||(11600725-11600864)
chr4 (8-167)||(23162643-23162803)
chr4 (28-167)||(12233930-12234069)
chr4 (28-167)||(25440447-25440586)
chr4 (28-167)||(45906181-45906320)
chr4 (28-167)||(53407231-53407370)
chr4 (28-167)||(8829778-8829917)
chr4 (28-167)||(11151902-11152041)
chr4 (28-167)||(18582886-18583025)
chr4 (28-167)||(19513845-19513984)
chr4 (28-167)||(21369922-21370061)
chr4 (28-167)||(27397729-27397868)
chr4 (28-167)||(42116938-42117077)
chr4 (28-167)||(46895325-46895464)
chr4 (28-167)||(52670036-52670175)
chr4 (28-167)||(56372477-56372616)
chr4 (28-166)||(28307298-28307436)
chr4 (28-165)||(51011028-51011165)
chr4 (28-167)||(4939349-4939487)
chr4 (28-167)||(8941946-8942085)
chr4 (28-167)||(23867832-23867971)
chr4 (28-167)||(29413573-29413712)
chr4 (28-167)||(55856490-55856629)
chr4 (34-167)||(4517160-4517293)
chr4 (28-169)||(15635982-15636123)
chr4 (28-167)||(3009753-3009892)
chr4 (28-167)||(4355555-4355694)
chr4 (28-167)||(4392689-4392827)
chr4 (28-167)||(22038320-22038459)
chr4 (28-167)||(26826563-26826702)
chr4 (28-167)||(35468057-35468196)
chr4 (28-167)||(39087521-39087660)
chr4 (28-167)||(55358301-55358440)
chr4 (28-167)||(9043573-9043713)
chr4 (30-154)||(31338465-31338589)
chr4 (28-160)||(27185595-27185728)
chr4 (28-216)||(33114969-33115156)
chr4 (52-167)||(22892570-22892685)
chr4 (52-167)||(22944234-22944349)
chr4 (52-167)||(55764601-55764716)
chr4 (1-101)||(35842545-35842645)
chr4 (28-167)||(35822262-35822401)
chr4 (52-167)||(37970336-37970451)
chr4 (30-167)||(4391673-4391810)
chr4 (28-167)||(37115253-37115385)
chr4 (28-167)||(55495850-55495982)
chr4 (68-167)||(29663971-29664070)
chr4 (28-167)||(44442124-44442262)
chr4 (61-167)||(5465406-5465512)
chr4 (1-139)||(43078132-43078270)
chr4 (52-233)||(56270078-56270258)
chr4 (30-167)||(25235187-25235324)
chr4 (28-167)||(31679011-31679143)
chr4 (28-167)||(43225647-43225779)
chr4 (19-167)||(36486339-36486487)
chr4 (19-145)||(44525701-44525820)
chr4 (72-167)||(35777393-35777488)
chr4 (30-169)||(55684735-55684874)
chr4 (19-169)||(23113430-23113580)
chr4 (71-167)||(37831964-37832060)
chr4 (19-139)||(21633770-21633890)
chr4 (7-233)||(53224214-53224422)
chr4 (68-167)||(55829046-55829145)
chr4 (28-122)||(36007981-36008075)
chr4 (61-154)||(22430690-22430783)
chr4 (28-167)||(47417445-47417577)
chr4 (68-167)||(11050359-11050458)
chr4 (28-122)||(42124642-42124736)
chr4 (31-167)||(35190582-35190718)
chr4 (68-167)||(35580948-35581047)
chr4 (73-143)||(50502306-50502376)
chr4 (66-139)||(36196944-36197017)
chr4 (30-167)||(37337681-37337818)
chr4 (66-146)||(20148803-20148883)
chr4 (19-122)||(24954175-24954278)
chr4 (28-139)||(33005078-33005182)
chr4 (19-139)||(52713564-52713684)
chr4 (89-165)||(53273162-53273238)
chr4 (68-139)||(40497399-40497470)
chr4 (66-139)||(20511479-20511552)
chr4 (66-139)||(42085723-42085796)
chr4 (66-145)||(4465472-4465551)
chr4 (68-122)||(45780760-45780814)
chr4 (66-139)||(48056607-48056680)
chr4 (28-93)||(53274812-53274877)
chr4 (66-233)||(37047006-37047172)
chr4 (66-122)||(17715651-17715707)
chr4 (19-122)||(26443392-26443495)
chr4 (92-167)||(29656720-29656795)
chr4 (61-156)||(32948179-32948274)
chr4 (28-122)||(40119907-40120001)
chr4 (33-167)||(52707967-52708100)
chr4 (66-139)||(8716919-8716992)
chr4 (66-139)||(31435076-31435149)
chr4 (66-139)||(32101736-32101809)
chr4 (66-169)||(38048878-38048981)
chr4 (108-166)||(35842638-35842696)
chr4 (68-138)||(41864083-41864153)
chr4 (115-167)||(33005178-33005230)
chr4 (19-122)||(3932203-3932306)
chr4 (66-117)||(30562850-30562901)
chr4 (199-233)||(30366293-30366327)
chr4 (61-109)||(20530799-20530847)
chr4 (124-164)||(44525659-44525699)
chr4 (124-167)||(29656597-29656640)
chr4 (68-139)||(31953225-31953296)
chr4 (196-234)||(29656682-29656720)
chr4 (129-167)||(36008069-36008107)
chr4 (196-233)||(26443288-26443325)
chr4 (65-126)||(49239219-49239280)
[»] chr8 (71 HSPs)
chr8 (1-167)||(11297976-11298142)
chr8 (1-167)||(22877860-22878026)
chr8 (1-167)||(24652313-24652478)
chr8 (28-170)||(10618848-10618990)
chr8 (28-167)||(28716709-28716848)
chr8 (28-167)||(31581739-31581878)
chr8 (28-167)||(36681409-36681548)
chr8 (28-167)||(39702351-39702490)
chr8 (1-167)||(36590182-36590347)
chr8 (28-167)||(6338363-6338502)
chr8 (28-167)||(8270951-8271090)
chr8 (28-167)||(16422874-16423013)
chr8 (28-167)||(17115583-17115722)
chr8 (1-168)||(22957353-22957520)
chr8 (28-167)||(25023351-25023490)
chr8 (28-167)||(27781147-27781286)
chr8 (28-167)||(32541268-32541407)
chr8 (28-167)||(45141417-45141556)
chr8 (28-165)||(23676919-23677056)
chr8 (34-167)||(44827285-44827418)
chr8 (8-167)||(40223027-40223182)
chr8 (28-167)||(31478121-31478260)
chr8 (28-167)||(39320028-39320167)
chr8 (28-167)||(42142697-42142836)
chr8 (28-165)||(39871311-39871448)
chr8 (28-167)||(38171389-38171528)
chr8 (28-167)||(41693868-41694007)
chr8 (19-167)||(32099582-32099723)
chr8 (28-161)||(11741065-11741198)
chr8 (28-233)||(31688019-31688216)
chr8 (58-167)||(37560521-37560630)
chr8 (28-167)||(36112810-36112942)
chr8 (52-167)||(2642404-2642519)
chr8 (68-167)||(17081699-17081798)
chr8 (68-167)||(28709352-28709451)
chr8 (28-167)||(44157242-44157381)
chr8 (28-167)||(1893810-1893942)
chr8 (28-167)||(41313420-41313552)
chr8 (28-167)||(43276740-43276872)
chr8 (1-125)||(10651112-10651236)
chr8 (19-232)||(40551788-40552001)
chr8 (30-167)||(7378893-7379030)
chr8 (28-153)||(35243314-35243439)
chr8 (68-167)||(37587720-37587819)
chr8 (19-139)||(29189679-29189799)
chr8 (68-167)||(3427623-3427722)
chr8 (28-146)||(3511284-3511402)
chr8 (30-131)||(44263388-44263489)
chr8 (19-122)||(39677446-39677549)
chr8 (68-166)||(9211032-9211130)
chr8 (65-167)||(39746938-39747040)
chr8 (33-167)||(43849174-43849308)
chr8 (68-167)||(34395348-34395448)
chr8 (28-167)||(40045445-40045584)
chr8 (66-153)||(13970034-13970121)
chr8 (1-166)||(16831580-16831730)
chr8 (61-139)||(38780734-38780812)
chr8 (66-139)||(2855155-2855228)
chr8 (19-93)||(5320490-5320564)
chr8 (67-167)||(1363793-1363893)
chr8 (65-132)||(9370315-9370382)
chr8 (68-122)||(42203405-42203459)
chr8 (33-139)||(8436491-8436597)
chr8 (65-127)||(13888326-13888388)
chr8 (78-139)||(26293840-26293901)
chr8 (78-139)||(26307097-26307158)
chr8 (180-233)||(42203496-42203549)
chr8 (65-143)||(26036979-26037057)
chr8 (196-233)||(22878068-22878105)
chr8 (71-122)||(44318320-44318371)
chr8 (196-233)||(40223226-40223263)
[»] chr7 (68 HSPs)
chr7 (1-167)||(44743763-44743929)
chr7 (1-170)||(28425554-28425723)
chr7 (8-167)||(12345017-12345176)
chr7 (28-167)||(21374679-21374818)
chr7 (28-167)||(33026922-33027061)
chr7 (28-167)||(36246346-36246485)
chr7 (8-167)||(38531133-38531291)
chr7 (28-167)||(42587353-42587492)
chr7 (28-167)||(43254149-43254288)
chr7 (28-167)||(45686886-45687025)
chr7 (8-167)||(49148378-49148537)
chr7 (28-167)||(10311999-10312138)
chr7 (28-167)||(27089626-27089765)
chr7 (28-167)||(27188536-27188675)
chr7 (28-167)||(31511346-31511485)
chr7 (28-167)||(35587625-35587764)
chr7 (28-167)||(33203638-33203777)
chr7 (28-167)||(40258903-40259042)
chr7 (28-167)||(40637130-40637269)
chr7 (28-167)||(45222043-45222182)
chr7 (1-169)||(48620502-48620669)
chr7 (28-167)||(21254667-21254806)
chr7 (28-163)||(34709283-34709418)
chr7 (28-167)||(48590760-48590899)
chr7 (28-167)||(48832023-48832162)
chr7 (52-164)||(48313418-48313530)
chr7 (28-167)||(9487453-9487592)
chr7 (52-206)||(21741979-21742133)
chr7 (32-167)||(44596656-44596791)
chr7 (28-167)||(47470932-47471071)
chr7 (52-169)||(482976-483093)
chr7 (1-167)||(38481326-38481485)
chr7 (19-165)||(9485764-9485908)
chr7 (28-167)||(40105975-40106114)
chr7 (9-169)||(23029834-23029994)
chr7 (52-167)||(36407274-36407389)
chr7 (52-167)||(43134450-43134565)
chr7 (28-167)||(21313766-21313898)
chr7 (28-167)||(42375760-42375892)
chr7 (9-167)||(17844590-17844748)
chr7 (2-167)||(27655618-27655782)
chr7 (28-167)||(17192419-17192550)
chr7 (28-167)||(19831967-19832099)
chr7 (28-167)||(36436199-36436331)
chr7 (30-139)||(46879496-46879605)
chr7 (28-167)||(47587082-47587213)
chr7 (66-167)||(11466047-11466148)
chr7 (31-167)||(1342822-1342958)
chr7 (86-167)||(21316612-21316693)
chr7 (34-139)||(40893446-40893551)
chr7 (66-152)||(35000773-35000859)
chr7 (29-217)||(36612082-36612267)
chr7 (19-122)||(39698930-39699026)
chr7 (66-233)||(46757691-46757857)
chr7 (38-230)||(21740126-21740316)
chr7 (61-139)||(791336-791414)
chr7 (61-139)||(19757519-19757597)
chr7 (66-167)||(22642259-22642360)
chr7 (30-122)||(24170867-24170959)
chr7 (108-167)||(32168879-32168938)
chr7 (66-139)||(27869570-27869643)
chr7 (101-154)||(24170803-24170856)
chr7 (181-234)||(38531312-38531365)
chr7 (66-120)||(45672387-45672441)
chr7 (66-167)||(7884691-7884788)
chr7 (28-72)||(32168953-32168997)
chr7 (68-120)||(47584185-47584237)
chr7 (199-233)||(19757670-19757704)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (28-167)||(22640-22779)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (28-167)||(126722-126861)
[»] scaffold0122 (1 HSPs)
scaffold0122 (28-167)||(12679-12818)
[»] scaffold0246 (1 HSPs)
scaffold0246 (28-167)||(7102-7241)
[»] scaffold0002 (2 HSPs)
scaffold0002 (28-167)||(431303-431442)
scaffold0002 (65-169)||(119238-119342)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (28-217)||(93348-93536)
scaffold0016 (66-148)||(84320-84402)
[»] scaffold1632 (1 HSPs)
scaffold1632 (52-167)||(23-138)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (28-167)||(28038-28186)
scaffold0197 (68-167)||(30179-30278)
[»] scaffold0087 (1 HSPs)
scaffold0087 (28-167)||(52990-53122)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (28-167)||(192058-192197)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (28-122)||(41727-41821)
[»] scaffold0362 (1 HSPs)
scaffold0362 (28-167)||(5454-5585)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (90-167)||(27158-27235)
[»] scaffold0041 (1 HSPs)
scaffold0041 (34-139)||(72733-72838)
[»] scaffold0343 (1 HSPs)
scaffold0343 (66-137)||(9305-9376)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (68-139)||(4565-4636)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (61-139)||(10836-10914)
[»] scaffold1360 (1 HSPs)
scaffold1360 (19-122)||(1198-1301)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (101-153)||(8997-9049)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (34-101)||(76365-76432)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (180-233)||(50373-50426)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 513; Significance: 0; HSPs: 77)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 297 - 858
Target Start/End: Complemental strand, 42132615 - 42132054
Alignment:
Q  297 caatatcacaatgtgatttagttgcatgtgtttgtacttgtagaaaagattttgatctaacaacgttaatgatcacaaagatgatnnnnnnnntgtcagc 396  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||    
T  42132615 caatatcacaatgtgatttagttgcatgtgtttgtacttgtagaaaagattttgatctaacaacgttaatgatcacaaagatgataaaaaaaatgtcagc 42132516  T
Q  397 atcagacggattcttccaaggtaatattccttagataattctatgttggcatctgttggatacacagtaaaattctagtagttatcgaggactaggtaaa 496  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42132515 atcagacggattcttccaaggtaatattccttagataattctatgttggcatctgttggatacacagtaaaattctagtagttatcgaggactaggtaaa 42132416  T
Q  497 caatattttcatcttgtcactactatatgaattttataatcttaattgaaccctttcatttatattatatatatcactccagtgagctcagcagtttcat 596  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42132415 caatattttcatcttgtcactactatatgaattttataatcttaattgaaccctttcatttatattatatatatcactccagtgagctcagcagtttcat 42132316  T
Q  597 tcatatttccttacatatgccatttggcattcactaagaataaccaaattaatgtgtttcatcatcactcaggtaactataatacaagttactacttttc 696  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42132315 tcatatttccttacatatgccatttggcattcactaagaataaccaaattaatgtgtttcatcatcactcaggtaactataatacaagttactacttttc 42132216  T
Q  697 ttctctttactacannnnnnncttgcttactattttttgctagctttataccaacatgtttcatatttggtacgagaaattgtctgatattttcccacaa 796  Q
    ||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42132215 ttctctttactacatttttttcttgcttactattttttgctagctttataccaacatgtttcatatttggtacgagaaattgtctgatattttcccacaa 42132116  T
Q  797 cataaacatgtgtatggaactatatgtcatgcattattcacttcaaagtatcaagagtttat 858  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42132115 cataaacatgtgtatggaactatatgtcatgcattattcacttcaaaatatcaagagtttat 42132054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 42132869 - 42132612
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||| ||| |||||||||||    
T  42132869 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactgtaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctatttggaatagct 42132777  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagcta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||          |||||| || |||| |||||    
T  42132776 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaaggtgttaccaaacagaacttttttttatcaaacaagtttataagcta 42132677  T
Q  201 taagctcttttttgggtgttatcaaacagacccgaaccacatctctaatataactttctagtcaat 266  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42132676 taagctcttttttggatgtta-caatcagacccgaaccacatctctaatataactttctagtcaat 42132612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26911720 - 26911556
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  26911720 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagct 26911621  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  26911620 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 26911556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 8070552 - 8070771
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  8070552 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactgaaattaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctacttagaatagct 8070651  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagcta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||         |||||||||| |||| |||||    
T  8070652 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac-aaagttttttttgtcaaacgagtttataagcta 8070750  T
Q  201 taagctcttttttgggtgtta 221  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  8070751 gaagctcttttttggatgtta 8070771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 2047253 - 2047411
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    |||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  2047253 taagagtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaataact 2047352  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgtta 160  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  2047353 tctgaaaaatagcttataaactcatgaaataagctataaactcatg-tgaaaaagtgtta 2047411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 4453482 - 4453621
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4453482 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 4453581  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4453582 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 4453621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 39167933 - 39167749
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39167933 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 39167834  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctctttttt 213  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  39167833 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac-agagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctctttttt 39167749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 2266111 - 2266250
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2266111 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 2266210  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2266211 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 2266250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3377574 - 3377435
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3377574 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 3377475  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3377474 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 3377435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16487064 - 16486925
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16487064 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 16486965  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16486964 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 16486925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 28382639 - 28382778
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28382639 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 28382738  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28382739 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 28382778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 36712495 - 36712634
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36712495 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 36712594  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36712595 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 36712634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37356351 - 37356212
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37356351 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 37356252  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37356251 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 37356212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41322938 - 41322799
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41322938 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 41322839  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41322838 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 41322799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Original strand, 13111701 - 13111838
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13111701 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 13111800  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13111801 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 13111838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 650739 - 650878
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  650739 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 650838  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  650839 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 650878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 24402012 - 24402150
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24402012 aataataagggtaaaattggaaa-aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 24402110  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24402111 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 24402150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29515015 - 29514876
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29515015 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 29514916  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  29514915 aataagctataagctcttggtgaaaaagtgttaccaaaca 29514876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36999671 - 36999532
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36999671 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 36999572  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36999571 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 36999532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 40024901 - 40025040
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40024901 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaaggctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 40025000  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40025001 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 40025040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 43507521 - 43507660
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43507521 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 43507620  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43507621 aataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 43507660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9887174 - 9887035
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  9887174 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgtga 9887075  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9887074 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 9887035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 10839539 - 10839678
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  10839539 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctagtga 10839638  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10839639 aataagatataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 10839678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21865429 - 21865290
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21865429 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtga 21865330  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21865329 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 21865290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 8688945 - 8689060
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8688945 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaa 8689044  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  8689045 aaagtgttaccaaaca 8689060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 10392994 - 10393133
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  10392994 aataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaaactataagctataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatga 10393093  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10393094 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 10393133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15521661 - 15521522
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15521661 aataataagggtaaaatttgaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 15521562  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  15521561 aataagctataagctcatggtgaaaaagttttaccaaaca 15521522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 167
Target Start/End: Original strand, 6232249 - 6232378
Alignment:
Q  38 gtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  6232249 gtaaaactggaattaaaagtgagaaactataagctataagctcaaacgctacttgaaatatcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactat 6232348  T
Q  138 aaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6232349 aagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 6232378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 17263712 - 17263851
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||| ||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17263712 aatagtaagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 17263811  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||    
T  17263812 aataagctataagctcatggtgaaaacatgttaccaaaca 17263851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 8 - 165
Target Start/End: Original strand, 9053069 - 9053226
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaa 107  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||     
T  9053069 aaaaaatggaatttagttagaataataagagtaaaactgaaattaaaagtgagaagctgtaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaag 9053168  T
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||| |  ||||| |||| |||||||||||||    
T  9053169 aatagtttataagctcgtgaaataaactattagttcatggtgaataagtgttaccaaa 9053226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8815402 - 8815256
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagct-------caaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 120  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8815402 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 8815303  T
Q  121 cttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8815302 ctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 8815256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 38578960 - 38579106
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagc-------tataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 120  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38578960 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 38579059  T
Q  121 cttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38579060 ctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 38579106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 2546283 - 2546422
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2546283 aataataaaggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 2546382  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||  ||||||||||||    
T  2546383 aataagctataagctcatggttaaaatttgttaccaaaca 2546422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10728012 - 10727873
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||||    
T  10728012 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagtttttgaaaaatagcttataagttcgtga 10727913  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||    
T  10727912 aataagctataagcttatgatgaaaaagtgttatcaaaca 10727873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Original strand, 7400383 - 7400489
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgtta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7400383 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 7400482  T
Q  161 ccaaaca 167  Q
    |||||||    
T  7400483 ccaaaca 7400489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8340159 - 8340022
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  | || |||    
T  8340159 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctttaagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataaattcgtaaaa 8340060  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8340059 taaactataagctcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 8340022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 13527863 - 13528002
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13527863 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagttcaaacgttacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataaacttgtga 13527962  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| ||||    
T  13527963 aataagttataaactcatggtgaaaaggtgttaccgaaca 13528002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 38880765 - 38880880
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  38880765 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 38880864  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  38880865 aaagtgttaccaaaca 38880880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38843026 - 38842878
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||| ||| || |||  ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38843026 tttaattaaaataatatgggtaaaaatgggataaaatatgagaagttataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagtttata 38842927  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  38842926 agctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaagtattaccaaaca 38842878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 6760603 - 6760702
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  6760603 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaaca 6760702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Original strand, 31616352 - 31616486
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31616352 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 31616444  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31616445 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaa 31616486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43135759 - 43135660
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  43135759 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgttatcaaaca 43135660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 4038306 - 4038438
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4038306 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtga 4038398  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4038399 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 4038438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 4385491 - 4385623
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4385491 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtga 4385583  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4385584 aataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 4385623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5039950 - 5039818
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5039950 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 5039858  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  5039857 aataagctataagctcacggtgaaaaagtgttaccaaaca 5039818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 40869358 - 40869457
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40869358 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 40869457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Original strand, 7823497 - 7823614
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| | ||||||||||||||    
T  7823497 tttaattaaaataataagggtaaaactagaattaaaagtgagatgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttataaaaaatagcttata 7823596  T
Q  119 agcttgtgaaataagcta 136  Q
    |||| |||||||||||||    
T  7823597 agctcgtgaaataagcta 7823614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 41796741 - 41796840
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||    
T  41796741 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttacgaaaca 41796840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44275820 - 44275705
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| || | ||    
T  44275820 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctaattggaataacttctgaaaaatagattataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtcaa 44275721  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  44275720 aaagtgttaccaaaca 44275705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 599071 - 598937
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  599071 taataagggtaaaattaaaattaaaagtgagacgctataaactataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagcttttgaaa 598972  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaa 164  Q
    ||| |||||||||| |  | |||||| ||||||||    
T  598971 taaactataaactcgttgtaaaaaagcgttaccaa 598937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43285760 - 43285661
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43285760 aagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 43285661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 25071561 - 25071441
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || ||||||||||||| || |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25071561 tttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttata 25071462  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||| ||||||||| ||||||    
T  25071461 agctcgtgaaataaactataa 25071441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 9 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 2221590 - 2221429
Alignment:
Q  9 aaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaa 108  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||  |||| ||| ||| |||||| |||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  2221590 aaaaatggattttagataaaataataagggtaaaataggaagaaaaaatgataagttataagttataagttcaaacgttacttggaatagcgtctgaaaa 2221491  T
Q  109 atagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaa 170  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||    |||||||||||||    
T  2221490 atagcttagaagctcgtgaaataaactataaactcatggtgaaaagacattaccaaacaaaa 2221429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 24020030 - 24019957
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24020030 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 24019957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18212288 - 18212163
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||              |||||||||||||||| ||||    
T  18212288 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttg--------------aaatagcttataagctcgtga 18212203  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18212202 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 18212163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 23356934 - 23357054
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||  | | |||||| |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  23356934 tttagttaaaataataagggtaaaaatggaacaaaagataaaaagctaaaagctataagctcagacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcatata 23357033  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  23357034 agctcgtgaaataagctataa 23357054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 167
Target Start/End: Original strand, 7213664 - 7213759
Alignment:
Q  72 tataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||| ||||||    
T  7213664 tataagcacaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtattatcaaaca 7213759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 15250296 - 15250163
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||| ||||||||| || |||||  |||  ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  15250296 tttaattaaaatgataagggtagaaatggaacaaaacatgacaagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttata 15250197  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaa 152  Q
    |||| | |||||||||||||| ||| || |||||    
T  15250196 agctcgagaaataagctataagctcgtggtgaaa 15250163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16669196 - 16669123
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  16669196 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcctgaaataagctataa 16669123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4056081 - 4055961
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||| |||| ||||||| || ||| |||  ||| ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  |||||||||||||| |||    
T  4056081 tttaattaaaatgataaaggtaaaaatgaaataaaacatgataagctataagctataagttcaaacgctatttggaatagtgtctgaaaaatagctaata 4055982  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  4055981 agctcgtgaaataagctataa 4055961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 7511660 - 7511763
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||   | |||||| ||||||||||||||||    
T  7511660 tttaattaaaataataagagtaaaactgaaattaaaagtgtgacgctataagctataagctcaaatgctactctaagtagcttttgaaaaatagcttata 7511759  T
Q  119 agct 122  Q
    ||||    
T  7511760 agct 7511763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 7515944 - 7516047
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||  |||||   | |||||| ||||||||||||||||    
T  7515944 tttaattaaaataataagagtaaaactgaaattaaaagtgtgacgctataagctataagctcaaatgctactctaagtagcttttgaaaaatagcttata 7516043  T
Q  119 agct 122  Q
    ||||    
T  7516044 agct 7516047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Original strand, 6153461 - 6153515
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6153461 aagctataagctcaaacactacttggaataacttctgaaaaatagcttataagct 6153515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41877883 - 41877821
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41877883 ataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaa 41877821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 138
Target Start/End: Original strand, 6222636 - 6222708
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctata 138  Q
    |||||||||||| |||||  || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6222636 ataagctataagttcaaatgctgcttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctata 6222708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 18710345 - 18710258
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18710345 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagct 18710258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 34884952 - 34884877
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactc 143  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34884952 aagctataagctgaaacactacttggaatagagtctgaaaaataggctataagctcgtgaaataaactataaactc 34884877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 38 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39675191 - 39675064
Alignment:
Q  38 gtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctat 137  Q
    ||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |  ||||| ||||||||| ||||||| ||  ||||||||| |||    
T  39675191 gtaaaactgaaattaaaagtaagacgctataagttataagctcaaacgctacttgaagcagcttttgaaaaatatcttataaactcttgaaataagttat 39675092  T
Q  138 aaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||  ||||  | ||||||| ||||||||    
T  39675091 aagttcattgtaaaaaagttttaccaaa 39675064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 139
Target Start/End: Original strand, 5520032 - 5520138
Alignment:
Q  33 taagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataa 132  Q
    |||||||| || |||||| |||  ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||| ||  | ||||||    
T  5520032 taagggtataaatggaataaaatatgataagctatatgctataagctcaaacgctatttgtaatagcatctgaaaaatagcttataaactcataaaataa 5520131  T
Q  133 gctataa 139  Q
    |||||||    
T  5520132 gctataa 5520138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 72 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2758969 - 2758872
Alignment:
Q  72 tataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| |  | ||||| ||| ||||||||||    
T  2758969 tataagctcaaacgctacttggaatagcgtctaaaaaatagcttataagctcatgaaataagttataagctcgttgtaaaaaactgtcaccaaacaaa 2758872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7569962 - 7569854
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||             | |||||||||||||||||  |||||  |||| ||    
T  7569962 taagggttaaaaatggaatttagttaaaataataagggtaaaactggaatta-------------agaagctataagctcaaacgttacttaaaataact 7569876  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7569875 tctgaaaaatagcttataagct 7569854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13761900 - 13761846
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||    
T  13761900 ataagctataagctcaaacgctacttgg--taacttctgaaaaatagcttataagct 13761846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 68 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 37674561 - 37674486
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactc 143  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||  |||||||||    
T  37674561 aagctataaactcaaacgctacttggaatagcgtctaaaatatagtttacaagctcgtgaaataaattataaactc 37674486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 6807537 - 6807492
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  6807537 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaata 6807492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 112
Target Start/End: Original strand, 13351603 - 13351647
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatag 112  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  13351603 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatag 13351647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 109
Target Start/End: Original strand, 44525925 - 44525973
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  44525925 aagctataagctataagctcaaaagctacttgaaatagcttctcaaaaa 44525973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 69 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 10361546 - 10361481
Alignment:
Q  69 agctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagct 135  Q
    ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||    
T  10361546 agctataagctaaaaaactacttgaaatagcttcttaaaaaaag-ttataagctcgtgaaaaaagct 10361481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 150; Significance: 8e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 64055 - 63824
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  64055 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagct 63956  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagcta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |         ||||||||||||||  |||||    
T  63955 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac-agatctttttttgtcaaacgagcttaagagcta 63857  T
Q  201 taagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  63856 taagctcttttttgagtgttaccaaacagaccc 63824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 146; Significance: 2e-76; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 33540661 - 33540892
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33540661 taagggtaaaaaatgaaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagct 33540760  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagcta 200  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| | |         ||||||||||||||| |||||    
T  33540761 tctgaaaaatagattataagctcgtgaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaac-agagttttttttgtcaaacgagcttataagcta 33540859  T
Q  201 taagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  33540860 taagctcttttttggatgttaccaaacagaccc 33540892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 5681727 - 5681499
Alignment:
Q  5 ggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctg 104  Q
    ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5681727 ggtaaaaaatgaaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctg 5681628  T
Q  105 aaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataag 204  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||| | |         |||||| || ||||| || ||||||    
T  5681627 aaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttgccaaac-agagctttttttgtcaaaagaacttataagttataag 5681529  T
Q  205 ctcttttttgggtgttatcaaacagacccg 234  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5681528 ctcttttttggatgttaccaaacagacccg 5681499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 558545 - 558406
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  558545 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 558446  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  558445 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 558406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5943176 - 5943037
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  5943176 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 5943077  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  5943076 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 5943037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32731943 - 32731804
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32731943 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 32731844  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32731843 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 32731804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Original strand, 12432583 - 12432767
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12432583 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatggcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 12432682  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctctttttt 213  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12432683 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac-agagatttttttgtcaaacgagcttataagctataagctctttttt 12432767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2442609 - 2442470
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2442609 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 2442510  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2442509 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 2442470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 30811111 - 30811250
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30811111 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 30811210  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  30811211 aataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 30811250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12297549 - 12297410
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12297549 aataataagggtaaaattgaaagaaaatgtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 12297450  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12297449 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 12297410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20805174 - 20805035
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||||||| |||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20805174 aataataagagtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 20805075  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20805074 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 20805035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 34232877 - 34233016
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34232877 aataataagggtaaaattggaagaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 34232976  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  34232977 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 34233016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 14227522 - 14227639
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14227522 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaa 14227621  T
Q  152 aaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||    
T  14227622 aaagtgttaccaaacaaa 14227639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Original strand, 29414859 - 29414980
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29414859 taagggtaagaaatagaatttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 29414958  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  29414959 tctgaaaaatagcttataagct 29414980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 34684978 - 34685116
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34684978 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 34685077  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  34685078 aataagctataagctcatg-tgaaaatgtgttaccaaaca 34685116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2970858 - 2970722
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  2970858 aataataagggtaaag-tggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagattataagctcgtga 2970760  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  2970759 aataagctataaactcatggtaaaaaagtgttaccaaa 2970722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 20 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33453921 - 33453781
Alignment:
Q  20 ttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataa 119  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33453921 ttagttagaataataacggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataa 33453829  T
Q  120 gcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33453828 gctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 33453781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 6709658 - 6709797
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| | |||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||    
T  6709658 aataataagggtaaaattagaagaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataatttcgtga 6709757  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6709758 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 6709797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 233
Target Start/End: Original strand, 7292502 - 7292715
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||||| ||||||||||||||||    
T  7292502 tttaattaaaataataagagtaaaactggaattaaaagtgagacgctataagctataagctcaaacgttacttgaagtagcttatgaaaaatagcttata 7292601  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggtg 218  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  | |||||| |||| ||||| | |          ||  |||||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  7292602 agcttctgaaataagctataagctcattgtaaaaaagcgttatcaaac-agagctttttttatccgacgagcttataagctataagctcttttttggatg 7292700  T
Q  219 ttatcaaacagaccc 233  Q
    |||||||||||||||    
T  7292701 ttatcaaacagaccc 7292715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 3636601 - 3636742
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |       ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3636601 tttagttagaataataagggtaaaactagaattaaaagtgagaagctataagtt-------caaaggctacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 3636693  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  3636694 agctcgtgaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaaca 3636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 29822998 - 29823137
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |  |    
T  29822998 aataataagggtaaaaccggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttgaaaaataacttataagctcgcaa 29823097  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  29823098 aataagctattagctcatggtgaaaaaatgttatcaaaca 29823137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34439886 - 34439728
Alignment:
Q  9 aaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaa 108  Q
    ||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  ||   ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  34439886 aaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctgtaagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaa 34439787  T
Q  109 atagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34439786 atagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 34439728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 31099984 - 31100116
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31099984 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 31100076  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31100077 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 31100116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 61 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 31049485 - 31049377
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgtta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||    
T  31049485 aagctataagctataagctcaaacactatttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtatta 31049386  T
Q  161 ccaaacaaa 169  Q
    |||||||||    
T  31049385 ccaaacaaa 31049377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 7317597 - 7317712
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  7317597 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 7317696  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||| ||||||||||||    
T  7317697 aaaatgttaccaaaca 7317712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10856277 - 10856178
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10856277 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 10856178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Original strand, 5301545 - 5301703
Alignment:
Q  9 aaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaa 108  Q
    ||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5301545 aaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctataagctataagcttaaacgctacttggaatagcttctgaaaa 5301644  T
Q  109 atagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||   ||||||||||    
T  5301645 atagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaacattaccaaaca 5301703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 31451924 - 31452055
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  31451924 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagct--------taagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaacagcttataagctcgtga 31452015  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31452016 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 31452055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28076607 - 28076468
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||| |||||||||| |||||  ||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  28076607 aataacaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtga 28076508  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  28076507 aataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaaca 28076468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 15591104 - 15591224
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||    
T  15591104 tttaattaaaataataagggtaaaattggaattaaaagtgacacgctataagttataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagtttata 15591203  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  15591204 agctcgtgaaataagctataa 15591224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Original strand, 12140832 - 12140982
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||||||| ||||||||||||||||  ||||  |||  | | ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12140832 tttagttaaaataataagggtaaaaaaggaacaaaagataataagctataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttata 12140931  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||  |||| |||||||    
T  12140932 agctcgtgaaataaactataagctcatggtgaaaaagcattactaaacaaa 12140982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 34904130 - 34904037
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34904130 aataataagggtaaaa-tggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 34904037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11015774 - 11015635
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||| |||||||||| |||||  ||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  11015774 aataacaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctcaaaaatagcttgtaagctcgtga 11015675  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  11015674 aataagttataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 11015635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 21894445 - 21894311
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||| ||||| |||||| |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21894445 tttaattaaaatgataagcgtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttata 21894346  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaa 153  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  21894345 agctcgtgaaataagctataatctcgtggtgaaaa 21894311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 165
Target Start/End: Original strand, 3108001 - 3108106
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa-taagctataaactcatgatgaaaaagtgtt 159  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  3108001 aagctataagctataagctcaaacgctatttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaattaagttataagctcatggtgaaaaagtgtt 3108100  T
Q  160 accaaa 165  Q
    ||||||    
T  3108101 accaaa 3108106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 94 - 167
Target Start/End: Original strand, 1806343 - 1806416
Alignment:
Q  94 aatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1806343 aatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 1806416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 71 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1225573 - 1225477
Alignment:
Q  71 ctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1225573 ctataagctcaaacgctacttgaaataacttctaaaaaatagcttataaacttgtgaaataaaatataagctcttgatgaaaaagtgttatcaaaca 1225477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20563587 - 20563467
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||  |||  | | || ||| |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20563587 tttagttaaaataataagggtaaaaatggaacaaaagataaaaaactaaaagctataagctcagatgctacttgaaatagcttctgaaaaatagtttata 20563488  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  20563487 agctcgtgaaataagctataa 20563467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 9896885 - 9896766
Alignment:
Q  31 aataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaat 130  Q
    |||| |||||||| |||||  |||| ||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9896885 aatatgggtaaaattggaa--aaaaatgataagctataagctattaactcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagcttgtgaaat 9896788  T
Q  131 aagctataaactcatgatgaaa 152  Q
    || |||||| ||| || |||||    
T  9896787 aaactataagctcgtggtgaaa 9896766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 23648338 - 23648267
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||||||||||||| |  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23648338 aagctataagctcagaagctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 23648267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 152
Target Start/End: Original strand, 6104671 - 6104757
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||| || |||||    
T  6104671 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagtatctgaaaaatagcttataagctcgcgaaataagctataagctcgtggtgaaa 6104757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 139
Target Start/End: Original strand, 32563209 - 32563317
Alignment:
Q  32 ataagggtaaaactggaatta-aaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaat 130  Q
    |||||||||||| |||||| | ||| ||| || ||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  32563209 ataagggtaaaaatggaataagaaaatgataaactataagttataatctcaaacactatttgaaatagcgtctgaaaaataaattataagcttctgaaat 32563308  T
Q  131 aagctataa 139  Q
    ||| |||||    
T  32563309 aagttataa 32563317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Original strand, 5893894 - 5893964
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagcta 136  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||  ||||||||| || ||||||||||    
T  5893894 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctggaaaataagttataagctagtaaaataagcta 5893964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 13866443 - 13866368
Alignment:
Q  34 aagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaa 109  Q
    |||| ||||| |||||| ||| || | || ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||    
T  13866443 aaggttaaaaatggaataaaatgtaaaaaactacaagctataagctcaaaaactacttggattagcttcttaaaaa 13866368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 19415465 - 19415382
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaata 111  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||||   | ||||| |||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  19415465 aatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctgtaagctataaactcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaata 19415382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 29414974 - 29415012
Alignment:
Q  129 ataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29414974 ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 29415012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Original strand, 3108143 - 3108180
Alignment:
Q  196 agctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  3108143 agctataagctcttttctgggtgttaccaaacagaccc 3108180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 96)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2122039 - 2121873
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  2122039 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagct 2121940  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  2121939 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 2121873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 42497205 - 42497047
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  42497205 taagggtaaaaaaggaa-tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaaactataagctataagctcaaacgctacttggaatagct 42497107  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgtta 160  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  42497106 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatgatgaaaaagtgtta 42497047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 51709223 - 51709057
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  51709223 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaaatggaattaaaagtgagaaactataagctataagctcaaacgctacttggaatagtt 51709124  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  51709123 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 51709057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 8 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41246447 - 41246231
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaa 107  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41246447 aaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaa 41246355  T
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctc 207  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||         |||||||||| |||| ||||||||||||    
T  41246354 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaatagaa-ctttttttgtcaaacgagtttataagctataagctc 41246256  T
Q  208 ttttttgggtgttatcaaacagacc 232  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  41246255 ttttttgggtgttaccaaacagacc 41246231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 16127106 - 16127245
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16127106 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 16127205  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  16127206 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 16127245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25570564 - 25570425
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25570564 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagcttgtga 25570465  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25570464 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 25570425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 28676857 - 28676996
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28676857 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 28676956  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28676957 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 28676996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 29081248 - 29081387
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29081248 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 29081347  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29081348 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 29081387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35499786 - 35499647
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35499786 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 35499687  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35499686 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 35499647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 37528690 - 37528829
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37528690 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 37528789  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37528790 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 37528829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 40563330 - 40563469
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40563330 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 40563429  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40563430 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 40563469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44845809 - 44845670
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44845809 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 44845710  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44845709 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 44845670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 45693326 - 45693464
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45693326 taagtgtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagct 45693425  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  45693426 tctgaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataa 45693464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52225501 - 52225331
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaa----aagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaat 96  Q
    ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  52225501 taagggtaaaaaatggaatctagttagaataataagggtaaaattggaattaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctactttgaat 52225402  T
Q  97 agcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  52225401 agcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 52225331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 2579894 - 2580033
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2579894 aataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 2579993  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2579994 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 2580033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2852002 - 2851863
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  2852002 aataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatga 2851903  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2851902 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 2851863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 19948285 - 19948424
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19948285 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 19948384  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  19948385 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 19948424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 24536521 - 24536660
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24536521 aataataagggtaaagttggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 24536620  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24536621 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 24536660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26541145 - 26541006
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26541145 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctgtaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 26541046  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26541045 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 26541006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 29718168 - 29718306
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29718168 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 29718267  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  29718268 aataagctataagctcatgatg-aaaagtgttaccaaaca 29718306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37088469 - 37088330
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37088469 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 37088370  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  37088369 aataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 37088330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38185955 - 38185816
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38185955 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagttcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 38185856  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38185855 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 38185816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 45344975 - 45345114
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45344975 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtga 45345074  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45345075 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 45345114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53779216 - 53779077
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53779216 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 53779117  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53779116 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 53779077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 55305076 - 55305215
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55305076 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtga 55305175  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  55305176 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 55305215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 21603983 - 21603846
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21603983 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaagtagcttataagctcgtga 21603884  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  21603883 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 21603846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39876812 - 39876660
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaa 107  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39876812 aaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaa 39876720  T
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  39876719 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatgatgaaaaagtgttatcaaaca 39876660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4240463 - 4240324
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4240463 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 4240364  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4240363 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 4240324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52795080 - 52794941
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52795080 aataataagggtaaaattggaagaaaacgtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 52794981  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  52794980 aataagctataagctcatggggaaaaagtgttaccaaaca 52794941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 54672147 - 54672286
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54672147 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataaggtataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 54672246  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  54672247 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 54672286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 50499947 - 50499805
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50499947 aataataagggtaaaataggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 50499848  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaa 170  Q
    ||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||    
T  50499847 aataaactataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaacaaaa 50499805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Original strand, 49853010 - 49853147
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  49853010 aataataagggtaaaattagaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 49853109  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  49853110 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 49853147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 46318706 - 46318865
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  46318706 taagggtaaaaaatgaaatttagttagaataataagggtaaaattggagttaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagct 46318798  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  46318799 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 46318865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27446639 - 27446473
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || ||| ||| |||||||    
T  27446639 taagagtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagatataagttataaactcagacgctatttgaaatagct 27446540  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaa-ctcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27446539 tctgaaaaatagcatataaactcgtgaaataagctataaagctcatg-tgaaaaagtgttaccaaaca 27446473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30864611 - 30864472
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||||| |||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30864611 aataatatgggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 30864512  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  30864511 aataagctataagctaatggtgaaaaagtgttaccaaaca 30864472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 206
Target Start/End: Original strand, 46627445 - 46627642
Alignment:
Q  9 aaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaa 108  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  46627445 aaaaatggaatttagatataataataagggtaaaagtgatagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaa 46627544  T
Q  109 atagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagct 206  Q
     |||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||| ||         ||||||||||||||| |||||||||||    
T  46627545 ttagcttataacctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaacagaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 46627642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30548929 - 30548790
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  30548929 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaaactgtaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtga 30548830  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  30548829 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 30548790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 47897597 - 47897712
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  47897597 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaa 47897696  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||| |||||    
T  47897697 aaagtgttactaaaca 47897712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 50316996 - 50317135
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||| ||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  50316996 aataataaaggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtga 50317095  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  50317096 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttgccaaaca 50317135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 48378431 - 48378272
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||       ||||| |||||||||||||||    
T  48378431 taagggtaaaaaatagaatttagttagaataataagagtaaaactgtaattaaaagtgcgaagctataagct-------caaacgctacttggaatagct 48378339  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||    
T  48378338 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctatagactcgtggtgaaaaaatgttaccaaaca 48378272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 24628166 - 24628305
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24628166 aataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagttcaaatgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatga 24628265  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  24628266 aataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 24628305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33392088 - 33391949
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  33392088 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgaaaaactataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatga 33391989  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33391988 aataaactataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 33391949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 38891953 - 38892092
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  38891953 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagatataagctataagctcaaatgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataggctcgtga 38892052  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38892053 aataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 38892092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46972194 - 46972079
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  46972194 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 46972095  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  46972094 aaagtgttaccaaaca 46972079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 167
Target Start/End: Original strand, 52166061 - 52166196
Alignment:
Q  32 ataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaata 131  Q
    |||||||||||| ||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  52166061 ataagggtaaaaatgagataaaaaatgagaagctataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 52166160  T
Q  132 agctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||| |||||| | |||||||||| |||||||    
T  52166161 agctataagctcatggtcaaaaagtgttgccaaaca 52166196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52858057 - 52857942
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  52858057 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgatacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 52857958  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  52857957 aaagtgttaccaaaca 52857942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 44748760 - 44748892
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44748760 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 44748852  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44748853 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 44748892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 30814197 - 30814359
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| |||||| |       ||||| ||||||||||||| |    
T  30814197 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagagtaaaattggaattaaaagtgaaaagttataagtt-------caaacgctacttggaatagtt 30814289  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaa 170  Q
    || |||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30814290 tccgaaaaatatcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaaa 30814359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 41518544 - 41518409
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||  |||||    
T  41518544 taataagggtaaaactggaatcaaaagtgagacgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagtttataagctcttgaaa 41518445  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||||||||| |||||  | |||||| |||||||||    
T  41518444 taagctataagctcattgtaaaaaagcgttaccaaa 41518409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21707329 - 21707197
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21707329 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 21707237  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21707236 aataagctataatctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 21707197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 40479995 - 40480127
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40479995 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaa 40480087  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40480088 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 40480127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 46247938 - 46248070
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46247938 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 46248030  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  46248031 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 46248070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 12063719 - 12063834
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||    
T  12063719 aaaaatgagaagctataagatataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcttatggtcaa 12063818  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  12063819 aaagtgttaccaaaca 12063834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 37713972 - 37714071
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37713972 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 37714071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43525888 - 43525789
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  43525888 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 43525789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 48943134 - 48943035
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  48943134 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 48943035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 44947159 - 44947293
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44947159 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacactgcttggaatagcttctgaaaaatagcttata 44947258  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaa 153  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  44947259 agctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 44947293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8873018 - 8872919
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  8873018 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 8872919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42217808 - 42217709
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  42217808 aagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 42217709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Original strand, 54541909 - 54542044
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||   ||    ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  54541909 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaa---at----tataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtga 54542001  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaa 170  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  54542002 aataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaacaaaa 54542044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 35100386 - 35100232
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||       ||||||||| |||||||||||||||    
T  35100386 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaaatgataagctata-------agctcaaacgctacttggaatagct 35100294  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaa 170  Q
    ||||||||||         ||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  35100293 tctgaaaaat--------ggctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaaa 35100232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7041244 - 7041107
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7041244 taataagggtaaagttggaattaaaagtgagacgctataaactataagcttaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 7041145  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||| ||| |  | |||||| |||||||||||    
T  7041144 taagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaaca 7041107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 167
Target Start/End: Original strand, 42465029 - 42465133
Alignment:
Q  63 gctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttacc 162  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||    
T  42465029 gctataagctataatctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataaacttgtgaaataagctataagctcatgccgaaaaaatgttacc 42465128  T
Q  163 aaaca 167  Q
    |||||    
T  42465129 aaaca 42465133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 45368793 - 45368684
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  45368793 taataaggataaaattggaattaaaagtaagatgttataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 45368694  T
Q  130 taagctataa 139  Q
    ||||||||||    
T  45368693 taagctataa 45368684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 51003432 - 51003307
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||| ||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51003432 aataataaggataaaattagaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagctcgtga 51003333  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaa 153  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||    
T  51003332 aataagctataagctcgtggtgaaaa 51003307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 72 - 167
Target Start/End: Original strand, 52595345 - 52595440
Alignment:
Q  72 tataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||   ||||||||||    
T  52595345 tataagctccaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataatcttgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaaacattaccaaaca 52595440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Original strand, 32026409 - 32026502
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaa 154  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||||    
T  32026409 aagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataaactataagctcgtggtgaaaaa 32026502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39470084 - 39469959
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||              ||||||||||||||||    
T  39470084 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataaactcaaacgctacttggaata--------------gcttataagcttgtga 39469999  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39469998 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 39469959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 83
Target Start/End: Complemental strand, 41786025 - 41785943
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaa 83  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41786025 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaagctggaattaaaagtgaaaagctataagctataagttcaaa 41785943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2598742 - 2598669
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2598742 ataagttataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 2598669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 8 - 168
Target Start/End: Original strand, 32982866 - 32983012
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaa 107  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||       | ||||||||||||| || |||||| ||||||||| ||||    
T  32982866 aaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaatttgaattaaaagtgag-------acgctataagctcaagcattacttgaaatagcttccgaaa 32982958  T
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaa 168  Q
    ||||||||||||||| || |||||||       |||||| |||||||||||||||||||||    
T  32982959 aatagcttataagctcgtaaaataag-------ctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaa 32983012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 52868184 - 52868264
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatg 146  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  52868184 ataagttataagctcaaacactacttgaaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatg 52868264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 8 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 47174567 - 47174486
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactac 89  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||    
T  47174567 aaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagttataagctatatgctccaacgctac 47174486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 20450652 - 20450504
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||||||||||||| || |||||| |||  ||| || ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
T  20450652 tttaattaaaataataagggtagaaatggaataaaagatgataaactataagttataagcacaaacgctacttgcaatagcgtctgaaaaataacttata 20450553  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||| |||||||||| ||||||||  |  | ||||| ||||||||||||    
T  20450552 agctcgtgaaataagttataaacttgttgtaaaaaactgttaccaaaca 20450504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Original strand, 33897898 - 33897985
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaa 153  Q
    ||||| |||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  33897898 ataagttataagttcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 33897985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 139
Target Start/End: Original strand, 37489931 - 37490002
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37489931 aagctataagctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 37490002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Original strand, 29203027 - 29203133
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgtta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| |  | |||||  ||||    
T  29203027 aagctataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcgttgtaaaaaaccgtta 29203126  T
Q  161 ccaaaca 167  Q
    |||||||    
T  29203127 ccaaaca 29203133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 93 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 47173688 - 47173614
Alignment:
Q  93 gaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||    
T  47173688 gaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagcgttatcaaaca 47173614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 193544 - 193443
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||    
T  193544 ataagctataagctcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttataagctcataaaataagctataagctcgttgtaaaaaattgttaccaaa 193445  T
Q  166 ca 167  Q
    ||    
T  193444 ca 193443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 138
Target Start/End: Complemental strand, 5506809 - 5506704
Alignment:
Q  33 taagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataa 132  Q
    |||||||| || |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  5506809 taagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagtatctgaaaaatagcttataagctcataaaataa 5506710  T
Q  133 gctata 138  Q
    ||||||    
T  5506709 gctata 5506704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 72
Target Start/End: Original strand, 42464067 - 42464131
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagct 72  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  42464067 aaaaaatggaatttatttagaataataagggtaaaactagaattaaaagtgagaagctataagct 42464131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 168
Target Start/End: Original strand, 43740325 - 43740385
Alignment:
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaa 168  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  43740325 aatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtgaaaaactgttaccaaacaa 43740385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44545401 - 44545276
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||              ||||||||||| ||||    
T  44545401 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgttacttggaata--------------gcttataagctcgtga 44545316  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44545315 aataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 44545276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 25146507 - 25146378
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||| ||||||  |||||| |||||| || ||||||||  |||||    
T  25146507 tttaattaaaatagtaagggtaaaaatggaattaaaagtgaaaaattataagttataagttcaaacgttacttgaaatagcgtcagaaaaataagttata 25146408  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgat 148  Q
    || | |||||||||| ||||| ||| ||||    
T  25146407 agttggtgaaataagttataagctcgtgat 25146378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 139
Target Start/End: Original strand, 37713107 - 37713218
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctata--agctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||| || |    
T  37713107 taataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagttatataagctcaaacgctacttagaataacttcttaaaaatagtttataagctcgtaa 37713206  T
Q  128 aataagctataa 139  Q
    ||||| ||||||    
T  37713207 aataaactataa 37713218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 22257814 - 22257727
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||    |||||||| |||||||||||||||    
T  22257814 aaaagtaagaagatataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcatttgaaaaataagcaataagcttatgaaataagctataa 22257727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Original strand, 52931152 - 52931206
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  52931152 aagctataagcttaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagct 52931206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 51951459 - 51951395
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagct 65  Q
    ||||| |||||||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51951459 taaggataaaaaatagaatttagttagaataacaagggtaaaactggaagtaaaagtgagaagct 51951395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 68 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 39719498 - 39719427
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||  | |||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39719498 aagctataaactcaaacgctatttggaatagcttcttcataataacttataagctcgtgaaataagctataa 39719427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 101
Target Start/End: Original strand, 43740260 - 43740332
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagctt 101  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  43740260 aataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaaactataagctataa-ttcaaacgctacttggaatagctt 43740332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 41538498 - 41538407
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaata 111  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||  |||| ||| |||||| ||| || |||||||||||||||||| |||| | |||| ||||||    
T  41538498 tttagataaaataataagggtaaaattggaagaaaaaatgataagctacaagtta-aagctcaaacactacttgaaataacgtctggaaaata 41538407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41785915 - 41785855
Alignment:
Q  107 aaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  41785915 aaatagcctataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtattatcaaaca 41785855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 80 - 139
Target Start/End: Original strand, 9338785 - 9338844
Alignment:
Q  80 caaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||| |||||| | | |||||||  |||||||||| |||||||||||||||    
T  9338785 caaacactacttgaaatagcatttaaaaaataagttataagcttatgaaataagctataa 9338844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 198 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 41518363 - 41518328
Alignment:
Q  198 ctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41518363 ctataagctcttttttaggtgttatcaaacagaccc 41518328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 52931200 - 52931238
Alignment:
Q  129 ataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52931200 ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 52931238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 45368614 - 45368577
Alignment:
Q  196 agctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  45368614 agctataagctcctttttgggtgttaccaaacagaccc 45368577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 137; Significance: 4e-71; HSPs: 89)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 4e-71
Query Start/End: Original strand, 1 - 233
Target Start/End: Original strand, 49185105 - 49185336
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  49185105 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaattgaaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgttacttggaatagct 49185204  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagcta 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||         |||||||||| |||| | |||    
T  49185205 tctgaaaaatagtttataagcttgtgaaataagctataagcttatggtgaaaaagtgttaccaaacagaa-ctttttttgtcaaacgagtttataaacta 49185303  T
Q  201 taagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  49185304 taaactcttttttaggtgttatcaaacagaccc 49185336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Original strand, 37672274 - 37672436
Alignment:
Q  5 ggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctg 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37672274 ggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgttacttggaatagcttctg 37672373  T
Q  105 aaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37672374 aaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 37672436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 5 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37703881 - 37703719
Alignment:
Q  5 ggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctg 104  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  37703881 ggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactgtaattaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgttacttggaatagcttctg 37703782  T
Q  105 aaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37703781 aaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 37703719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15349039 - 15348873
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15349039 taagggtaaaaaacgaaatttagtaagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagct 15348940  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  15348939 tctgaaaaataatttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 15348873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 167
Target Start/End: Original strand, 36043223 - 36043386
Alignment:
Q  4 gggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttct 103  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||    
T  36043223 gggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagcatct 36043322  T
Q  104 gaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36043323 gaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtgaaaaactgttaccaaaca 36043386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 42614055 - 42614221
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||| ||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  42614055 taaggctaaaaaatgaaatttagttagaataataaaggtaaaactgaaattaaaagtgagatgctataagctataacctcaaacgctacttggaatagct 42614154  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  42614155 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctagaagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 42614221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1918213 - 1918074
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1918213 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 1918114  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1918113 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 1918074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 19898855 - 19898994
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19898855 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 19898954  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19898955 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 19898994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 42064264 - 42064403
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42064264 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 42064363  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42064364 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 42064403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 1507690 - 1507829
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1507690 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 1507789  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  1507790 aataagctataaactaatggtgaaaaagtgttaccaaaca 1507829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26204462 - 26204323
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26204462 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 26204363  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26204362 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 26204323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29586346 - 29586207
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29586346 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 29586247  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  29586246 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 29586207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 30721570 - 30721709
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30721570 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 30721669  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  30721670 aataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 30721709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30774269 - 30774130
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30774269 aataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 30774170  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  30774169 aataagctataaacttatggtgaaaaagtgttaccaaaca 30774130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 31150372 - 31150511
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31150372 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 31150471  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  31150472 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttacccaaca 31150511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33524716 - 33524577
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33524716 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 33524617  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33524616 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 33524577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 36301052 - 36301191
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36301052 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 36301151  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  36301152 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 36301191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 36838642 - 36838781
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36838642 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 36838741  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  36838742 aataagctataagctcatggagaaaaagtgttaccaaaca 36838781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44910028 - 44909889
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  44910028 aataataagggtaagattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 44909929  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44909928 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 44909889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 51422904 - 51423070
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51422904 taagggtaaaaaatgaaatttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaagtgggaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagct 51423003  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||| ||||||    
T  51423004 tctaaaaaatagtttataaactcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 51423070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 167
Target Start/End: Original strand, 29704033 - 29704170
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29704033 taataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 29704132  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29704133 taagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 29704170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 323053 - 322914
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  323053 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtga 322954  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  322953 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 322914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2498110 - 2497971
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2498110 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 2498011  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  2498010 aataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaaca 2497971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3270846 - 3270707
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3270846 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 3270747  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3270746 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 3270707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 15313431 - 15313293
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15313431 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 15313332  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  15313331 aataagctataagctcatggtg-aaaagtgttaccaaaca 15313293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 17499832 - 17499971
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17499832 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagatataagctataagcttaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 17499931  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17499932 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 17499971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 32368286 - 32368425
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  32368286 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcatataagctcgtga 32368385  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32368386 aataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 32368425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 50171244 - 50171383
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50171244 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 50171343  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||    
T  50171344 aataagctataagctcatggtaaaaaggtgttaccaaaca 50171383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3661133 - 3660994
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3661133 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtga 3661034  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3661033 aataagatataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 3660994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22099106 - 22098967
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||    
T  22099106 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataaactcgtga 22099007  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22099006 aataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 22098967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 36379066 - 36379225
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36379066 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactaaaattaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagct 36379165  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgtta 160  Q
    | ||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||||  | |||||||||||    
T  36379166 tttgaaaaataacttataaactcatgaaataaactataaactcatcgtaaaaaagtgtta 36379225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 50351220 - 50351081
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50351220 aataataagggtaaaatttgaagaaaaagtgagaagctataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 50351121  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  50351120 aataagctataagctcatggttaaaaagtgttaccaaaca 50351081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 98; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46369992 - 46369856
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |||| ||||    
T  46369992 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagctt---agctcgtga 46369896  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  46369895 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 46369856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 46928922 - 46929042
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  46928922 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagcacaaacgctaattagaatagcttctgaaaaatagcttata 46929021  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||| || |||||||||||||    
T  46929022 agctcgtaaaataagctataa 46929042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38676676 - 38676538
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  38676676 aataataagg-taaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtga 38676578  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38676577 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 38676538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 49220419 - 49220559
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagt-gagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtg 126  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  49220419 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtagagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtg 49220518  T
Q  127 aaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  49220519 aaataagctgtaagctcacggtgaaaaagtgttaccaaaca 49220559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 43727209 - 43727074
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||  |||    
T  43727209 aataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagttcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagtttataagctcatga 43727110  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttacca 163  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  43727109 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttacca 43727074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 7710908 - 7711040
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7710908 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 7711000  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  7711001 aataagctataagctcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 7711040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 26843939 - 26843802
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26843939 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataaactcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 26843840  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||||    
T  26843839 aataagctataagctcatggtgaaaaagtattatcaaa 26843802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40888063 - 40887930
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  40888063 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaa 40887964  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||      | ||||||||||||||||||||    
T  40887963 aataagctataa------gctgaaaaagtgttaccaaaca 40887930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 17046910 - 17046776
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17046910 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 17046818  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17046817 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaa 17046776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 13121569 - 13121670
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13121569 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 13121668  T
Q  166 ca 167  Q
    ||    
T  13121669 ca 13121670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28429231 - 28429078
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||| |||||||      ||    
T  28429231 taagggtaaaaaatggaatttatttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctatacgct-------caaacgctacttg------ct 28429145  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28429144 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 28429078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 38967418 - 38967550
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  38967418 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 38967510  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  38967511 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 38967550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 34 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39583278 - 39583145
Alignment:
Q  34 aagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 133  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  39583278 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataaggtataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgttaaataag 39583179  T
Q  134 ctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
     ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39583178 ttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 39583145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 7025031 - 7024917
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||    
T  7025031 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctata-------agctcaaacgctacttggaatagct 7024939  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  7024938 tctgaaaaatagcttataagct 7024917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34319553 - 34319438
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  34319553 aaaaatgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaggtcatggtcaa 34319454  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  34319453 aaagtgttaccaaaca 34319438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39826748 - 39826649
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39826748 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 39826649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29374543 - 29374379
Alignment:
Q  2 aagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagctt 101  Q
    |||||||||||||| | |||||  | |||| ||||||||||| |||||  ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29374543 aagggtaaaaaagg-attttagaaaaaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaactctacttggaatagctt 29374445  T
Q  102 ctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  29374444 ctgaaaaatagcttataagctcttgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaaca 29374379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3391317 - 3391169
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3391317 tttaattaaaataataagggtaaaaatgggataaaatatgagaagctataagctataagcttaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagtttata 3391218  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||| ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  3391217 agctcgtgaaataaactataagttcatggtgaaaaagtattaccaaaca 3391169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 153
Target Start/End: Original strand, 7781102 - 7781236
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| || ||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781102 tttaattaaaatgataagggtaaaaatgaaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 7781201  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaa 153  Q
    |||| |||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  7781202 agctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 7781236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 30495129 - 30495281
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaa 107  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  30495129 aaaaaatggaatttagatagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagc-------tataagctgaaacgctacttgaaatagcttctgaaa 30495221  T
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  30495222 aatagcttataaactctagaaataagctataagctcatggtcaaaaagtattaccaaaca 30495281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 47134516 - 47134617
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  47134516 ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 47134615  T
Q  166 ca 167  Q
    ||    
T  47134616 ca 47134617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 6814242 - 6814123
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||     
T  6814242 taagggttaaaaatggaatttagttagactaataagggtaaaattggaattaaaagtgaaaagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcg 6814143  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataag 120  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  6814142 tctgaaaaataacttataag 6814123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34318561 - 34318455
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgtta 160  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||| || |||||||   |||    
T  34318561 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtaaaataagctataagctcgtggtgaaaaaccatta 34318462  T
Q  161 ccaaaca 167  Q
    |||||||    
T  34318461 ccaaaca 34318455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Original strand, 41004931 - 41005057
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||  |||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||    
T  41004931 tttagataaaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttcttaaaaataacttata 41005030  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcat 145  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||    
T  41005031 agctcatgaaataagctataaactcat 41005057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25602167 - 25602035
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25602167 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 25602075  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||  ||||| | |||||||| |||||||||    
T  25602074 aataagctataaggtcatggtaaaaaagtgataccaaaca 25602035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 34087116 - 34087015
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  34087116 ataagctataagctcaaacgctacctggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtgaaattagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaa 34087017  T
Q  166 ca 167  Q
    ||    
T  34087016 ca 34087015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 40719682 - 40719554
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||       |||| ||||||| ||||||| |||| ||    
T  40719682 taaggctaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactgaaattaaaagtgagaagct-------ataaactcaaacgctacttgaaataact 40719590  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagcta 136  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  40719589 tctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagcta 40719554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 52703049 - 52703169
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||| || ||| |||  | | |||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  52703049 tttagttaaaataataagggtaaaaatgaaataaaagataaaaagctaaaagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaataacttata 52703148  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  52703149 agctcgtgaaataagctataa 52703169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 8221182 - 8221321
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  8221182 aatattaagggtaaaaatggaagaaaaagtgagaagctataagctataaattcaaacgctatttggaatagtttttgaaaaatagcttataagctcgtga 8221281  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| ||| |  | |||||  |||||||||||    
T  8221282 aataagctataagctcgttgtaaaaaaccgttaccaaaca 8221321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 153
Target Start/End: Original strand, 18347370 - 18347488
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  18347370 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacactacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataagcttgtga 18347462  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaa 153  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||    
T  18347463 aataagctataagctcgtggtgaaaa 18347488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 5697673 - 5697528
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || |||||||| ||||||  |||||  |||| ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5697673 tttagataaaataataaaggtaaatttggaagaaaaa-tgataagttataaggtataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttata 5697575  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||  | ||||| ||||||||||    
T  5697574 agctcgtgaaataagctataagctcattgtaaaaaactgttaccaaa 5697528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 156
Target Start/End: Original strand, 49822089 - 49822242
Alignment:
Q  2 aagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagctt 101  Q
    |||||||||||||| | |||||  | |||| ||||||||||| |||||  ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||    
T  49822089 aagggtaaaaaagg-attttagaaaaaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttgaaataactt 49822187  T
Q  102 ctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagt 156  Q
    || |||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  49822188 ctaaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagt 49822242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 61 - 166
Target Start/End: Original strand, 9769953 - 9770058
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgtta 160  Q
    |||||| ||| |||||||||||||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  9769953 aagctagaagttataagctcaaacgttatttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgtta 9770052  T
Q  161 ccaaac 166  Q
     |||||    
T  9770053 tcaaac 9770058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2479330 - 2479209
Alignment:
Q  32 ataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaata 131  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||              ||||||||||| ||||||||    
T  2479330 ataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaata--------------gcttataagctcgtgaaata 2479245  T
Q  132 agctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2479244 agctataaactcatgataaaaaagtgttaccaaaca 2479209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 33152091 - 33151975
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  33152091 tttagataaaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagttacaagctcaaacgctacttgaaatagcttcttaaaaatagcttata 33151992  T
Q  119 agcttgtgaaataagct 135  Q
    |||| ||||||||||||    
T  33151991 agctcgtgaaataagct 33151975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 33561856 - 33561981
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||              ||||||||||||||| ||||    
T  33561856 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgg--------------aatagcttataagctcgtga 33561941  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33561942 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 33561981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 12891739 - 12891644
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaat 96  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12891739 taagggtaaaaaatggaatttagttagactaataagcgtaaaaatggaaataaaagtgagaagctataagctataaactcaaacgctacttggaat 12891644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 50540920 - 50540821
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| ||||||||||    
T  50540920 aagctataagctcaaacgctacttgtaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagtttatggtgaaaaagtattaccaaaca 50540821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25134998 - 25134897
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||    
T  25134998 ataagctataagctcaaacactacttaaaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgttgtaaaaaactgttaccaaa 25134899  T
Q  166 ca 167  Q
    ||    
T  25134898 ca 25134897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 131
Target Start/End: Original strand, 16085549 - 16085661
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||| |||| | | ||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  16085549 tttagataaaataataagggtaaaattggaataaaaaataataagttataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcatctgaaaaatagcttata 16085648  T
Q  119 agcttgtgaaata 131  Q
    |||| || |||||    
T  16085649 agctcgtaaaata 16085661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 9 - 139
Target Start/End: Original strand, 13570721 - 13570851
Alignment:
Q  9 aaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaa 108  Q
    ||||||||| ||||| || |||| ||| ||||||| |||||  ||||   | ||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  13570721 aaaaagggattttagataaaatagtaaaggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagttcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaa 13570820  T
Q  109 atagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  13570821 atagcttataagttcgtgaaataagctataa 13570851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 9895025 - 9894928
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgt 125  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9895025 aataataagggtaaaattgaaagaaaaaatgacaagctataaactataagctcaaacgctactttgaatagcgtctgaaaaatagcttataagcttgt 9894928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 49240268 - 49240367
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||  ||||||||  ||||||||||    
T  49240268 aagctataagctcaaacgctatttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagttcatagtgaaaaagcattaccaaaca 49240367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 139
Target Start/End: Original strand, 46087950 - 46088058
Alignment:
Q  31 aataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaat 130  Q
    |||||| |||||| |||||  |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||||||| || |||||||    
T  46087950 aataagagtaaaattggaagaaaaaatgataagctataagctacaagctcaaatattacttggaataacgtctgaaaaatagcttataaactcgtgaaat 46088049  T
Q  131 aagctataa 139  Q
    ||| |||||    
T  46088050 aagttataa 46088058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 68 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 9169203 - 9169142
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  9169203 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttggtgaaa 9169142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 44956428 - 44956348
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatg 146  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || || ||||||||||||| ||||||    
T  44956428 ataagttataagctcaaactctacttggaatagcatctgaaaaataacttataatctcgttaaataagctataagctcatg 44956348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 42963978 - 42963875
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || || ||||||  ||||| |||||  ||||||||| ||| ||||    
T  42963978 ataagctgtaagctcaaacgctacttgaaatagcttctcaaaaatagcttataaactcgtaaaataaattataagctcatagtgaaaaagtattatcaaa 42963879  T
Q  166 caaa 169  Q
    ||||    
T  42963878 caaa 42963875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33632395 - 33632332
Alignment:
Q  59 agaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33632395 agaagctatcagcaataagctcaaacgctgtttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 33632332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #81
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 57 - 143
Target Start/End: Original strand, 28868987 - 28869073
Alignment:
Q  57 tgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactc 143  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||  |||| |||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  28868987 tgagaaactataagctataagctcaaacgttacttgaaataatttcttaaaaataatttataagctcgtgaaataaactataaactc 28869073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 153
Target Start/End: Original strand, 44718962 - 44719043
Alignment:
Q  72 tataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaa 153  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||| || ||||||    
T  44718962 tataagcttaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtaaaataagctataagctcgtggtgaaaa 44719043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #83
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Original strand, 46056411 - 46056484
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||||||||||||| |||  ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||    
T  46056411 ataagctataagcttaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatatcttataagctcgtgaaataaactataa 46056484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 67 - 119
Target Start/End: Original strand, 40935893 - 40935945
Alignment:
Q  67 taagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataa 119  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  40935893 taagctataagctcaaacgctacttggaatagtttctgaaaaatagtttataa 40935945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 19715453 - 19715368
Alignment:
Q  2 aagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacacta 88  Q
    |||||||||||||  | ||||| || |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19715453 aagggtaaaaaaga-attttagataaaataataagggtgaaattggaagtaaaaatgataagctataagttataagctcaaacacta 19715368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 232
Target Start/End: Original strand, 36043429 - 36043465
Alignment:
Q  196 agctataagctcttttttgggtgttatcaaacagacc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36043429 agctataagctcttttttgggtgttaccaaacagacc 36043465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #87
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 139
Target Start/End: Original strand, 10628757 - 10628887
Alignment:
Q  2 aagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagctt 101  Q
    ||||||| |||||| | |||||||||| |||||| ||||||| | |||| ||| ||||       |||| ||||||||||||| ||||||| ||||   |    
T  10628757 aagggtagaaaaggaaatttagttagactaataaaggtaaaaatagaataaaaggtga-------taagttataagctcaaacgctacttgaaataatgt 10628849  T
Q  102 ctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||  ||||||||| || |||||| ||||||    
T  10628850 ctgaaaaataagttataagctagtaaaataaactataa 10628887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 94 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1711265 - 1711191
Alignment:
Q  94 aatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaag-tgttaccaaaca 167  Q
    |||||| | |||||||||  ||||| |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  1711265 aatagcgtttgaaaaataagttatatgcttgtaaaataagctataagcacataatgaaaaagttgttaccaaaca 1711191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 73 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 31434495 - 31434449
Alignment:
Q  73 ataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataa 119  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31434495 ataagcttaaatcctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataa 31434449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 131; Significance: 2e-67; HSPs: 76)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 8 - 233
Target Start/End: Original strand, 36027924 - 36028148
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaa 107  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  36027924 aaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactgaaattaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaa 36028023  T
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctc 207  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |         ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  36028024 aatagcttataagctcgtaaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac-agagttttttttgtcaaacaagcttataagctataagctc 36028122  T
Q  208 ttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||    
T  36028123 ttttttaggtgttaccaaacagaccc 36028148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 4379451 - 4379303
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4379451 tttagttagaataataagggtaaaactgaaattaaaagtgagaaactataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttata 4379352  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4379351 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 4379303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 1711156 - 1711295
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1711156 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 1711255  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1711256 aataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 1711295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 8023937 - 8024076
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8023937 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 8024036  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8024037 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 8024076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 14647310 - 14647449
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14647310 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 14647409  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  14647410 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 14647449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 30299882 - 30299743
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30299882 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 30299783  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30299782 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 30299743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 30412565 - 30412704
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30412565 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagatataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 30412664  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30412665 aataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 30412704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 32381627 - 32381766
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32381627 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 32381726  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32381727 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 32381766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32383033 - 32382894
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32383033 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 32382934  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32382933 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 32382894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 35235680 - 35235819
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35235680 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 35235779  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35235780 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 35235819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36686000 - 36685861
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36686000 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 36685901  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36685900 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 36685861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 15530619 - 15530435
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15530619 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtga 15530520  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctctttttt 213  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |         ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15530519 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac-atagttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctctttttt 15530435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 43402628 - 43402441
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  43402628 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtga 43402529  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttggg 216  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43402528 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac-agagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctcttttttggg 43402441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2178944 - 2178805
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  2178944 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtga 2178845  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2178844 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 2178805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 2236469 - 2236608
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2236469 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 2236568  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2236569 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 2236608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5591772 - 5591633
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5591772 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtga 5591673  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  5591672 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 5591633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7651824 - 7651685
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  7651824 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagattataagctcgtga 7651725  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  7651724 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 7651685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 9160645 - 9160784
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9160645 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 9160744  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9160745 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 9160784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 12363565 - 12363743
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12363565 aataataagtgtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 12363664  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagct 206  Q
    |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||         ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12363665 aataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacagaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 12363743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12774760 - 12774621
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12774760 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagatataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 12774661  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12774660 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 12774621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 31168940 - 31169079
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31168940 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 31169039  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  31169040 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 31169079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 30 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27130515 - 27130378
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27130515 taataagggtaaaattggaagaaaaggtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaa 27130416  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27130415 taagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 27130378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 62 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 5521448 - 5521278
Alignment:
Q  62 agctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttac 161  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  5521448 agctataagctataaactcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttac 5521349  T
Q  162 caaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    |||||| ||         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5521348 caaacagaa-ttttttttgtcaaacgagcttataagctataagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 5521278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 12713496 - 12713357
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12713496 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagatataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 12713397  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12713396 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 12713357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 13228426 - 13228565
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13228426 aataataaaggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 13228525  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  13228526 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 13228565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19525933 - 19525794
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19525933 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 19525834  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  19525833 aataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaaca 19525794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 26699059 - 26699198
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  26699059 aataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcctctgaaaaatagcttataagctcatga 26699158  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26699159 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 26699198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 26968792 - 26968931
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  26968792 aataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcctctgaaaaatagcttataagctcatga 26968891  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  26968892 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 26968931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35640124 - 35639985
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35640124 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 35640025  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  35640024 aataagctataaactcatggtgaaaaagtattatcaaaca 35639985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39275607 - 39275468
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  39275607 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtga 39275508  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  39275507 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 39275468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 39744495 - 39744634
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39744495 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 39744594  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| |||||| |||||    
T  39744595 aataagctataagctcatggtgaaaaaatgttacaaaaca 39744634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 15443640 - 15443498
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15443640 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtga 15443541  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaa 170  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15443540 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaccaaaa 15443498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 3037378 - 3037517
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  3037378 aataataaggataaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtga 3037477  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  3037478 aataagctataaactcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 3037517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 5381897 - 5382036
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  5381897 aataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatga 5381996  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  5381997 aataagttataagctcgtggtgaaaaagtgttaccaaaca 5382036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 6603863 - 6604002
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6603863 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 6603962  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  6603963 aataagctataagctcacggtgaaaaaatgttaccaaaca 6604002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 167
Target Start/End: Original strand, 5997856 - 5997986
Alignment:
Q  37 ggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagcta 136  Q
    ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  5997856 ggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagcta 5997955  T
Q  137 taaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  5997956 taagctcacggtgaaaaagtgttaccaaaca 5997986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 10697429 - 10697314
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  10697429 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 10697330  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  10697329 aaagtgttaccaaaca 10697314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 22977158 - 22977297
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||  |||    
T  22977158 aataataagggtaaaagtggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagtttataagctcatga 22977257  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  22977258 aataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaaca 22977297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24794163 - 24794017
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaag-------ctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 120  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||       ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24794163 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 24794064  T
Q  121 cttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  24794063 ctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 24794017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1174944 - 1174829
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  1174944 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 1174845  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  1174844 aaagtgttaccaaaca 1174829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 206
Target Start/End: Original strand, 9587146 - 9587317
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9587146 aataataagggtaaaattggaataaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 9587238  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagct 206  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||         ||||||||||||||| |||||||||||    
T  9587239 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaacagaacttttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 9587317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 167
Target Start/End: Original strand, 11062871 - 11062999
Alignment:
Q  39 taaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctata 138  Q
    ||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||    
T  11062871 taaaaatggaagaaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagttata 11062970  T
Q  139 aactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11062971 agctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 11062999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 2671558 - 2671459
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  2671558 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 2671459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3670438 - 3670323
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| | ||    
T  3670438 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcgcatggtcaa 3670339  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  3670338 aaagtgttaccaaaca 3670323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 4875855 - 4875688
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    |||||||||||||   | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  4875855 taagggtaaaaaataaaatttagttagaataataagggtaaaactgaaattaaaagtgaaaagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagct 4875756  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaa 168  Q
    | | ||||||||||||||| ||  | |||||| |||||||||| |  | ||||| |||||||||||||    
T  4875755 tttaaaaaatagcttataaactcctaaaataaactataaactcgtagtaaaaaaatgttaccaaacaa 4875688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 35236644 - 35236759
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  35236644 aaaaatgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 35236743  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  35236744 aaagtgttaccaaaca 35236759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 4221433 - 4221565
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4221433 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 4221525  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4221526 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 4221565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19347915 - 19347751
Alignment:
Q  2 aagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagctt 101  Q
    |||||||||||||| | |||||  | |||| ||||||||||| |||||  ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19347915 aagggtaaaaaagg-attttagaaaaaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 19347817  T
Q  102 ctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  19347816 ctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaaca 19347751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 6893312 - 6893471
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||       ||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  6893312 taagggtaaaaaatgaaatttagctagaataataagggtaaaactagaattaaaaatgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaataact 6893404  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  6893405 tctgaaaactagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 6893471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 9627098 - 9627246
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  9627098 tttaattaaaataataagagtaaaattggaattaaaagtgagacactataagttataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttata 9627197  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||    
T  9627198 agcttctgaaataagctataagctcattgtaaaaaagtgttatcaaaca 9627246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 19956254 - 19956399
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagct-------caaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 120  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19956254 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaa-tagcttataag 19956352  T
Q  121 cttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19956353 ctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 19956399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 30774169 - 30774284
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| | ||    
T  30774169 aaaaatgagaagctaaaagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagcttatggtcaa 30774268  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  30774269 aaagtgttaccaaaca 30774284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 648677 - 648576
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  648677 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagcattaccaaa 648578  T
Q  166 ca 167  Q
    ||    
T  648577 ca 648576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 11663868 - 11663983
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||    
T  11663868 aaaaatgagaatttataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataaacttatggtcaa 11663967  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  11663968 aaagtgttaccaaaca 11663983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 39246830 - 39246928
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  39246830 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtg-aaaagtgttaccaaaca 39246928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 13156846 - 13156978
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  13156846 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtga 13156938  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||    
T  13156939 aataagctataagttaatggtgaaaaagtgttaccaaaca 13156978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 29392067 - 29392199
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||    
T  29392067 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctatttggaatagcttttaaaaaatagcttataagctcgtga 29392159  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  29392160 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 29392199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16474964 - 16474844
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || ||||||||||||| || |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16474964 tttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttata 16474865  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    | || ||||||||| ||||||    
T  16474864 atctcgtgaaataaactataa 16474844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3669718 - 3669586
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  3669718 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctactttgaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatga 3669626  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||| ||  | ||| | ||||||||||||||||||    
T  3669625 aataagctacaagtttatggtaaaaaagtgttaccaaaca 3669586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Original strand, 11100753 - 11100826
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11100753 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 11100826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23920608 - 23920502
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgtta 160  Q
    ||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||| || ||||| |  ||||    
T  23920608 aagctataaactctaagttcaaacactacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataaactataagctcctggtgaaagatagtta 23920509  T
Q  161 ccaaaca 167  Q
    |||||||    
T  23920508 ccaaaca 23920502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 2497709 - 2497610
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||||| ||||||||  ||||||||    
T  2497709 ataagttataagctcaaacgctatttagaatagcttttgaaaaataacttataagctcgtgaaataagttataatctcatggtgaaaaagcattaccaaa 2497610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 13936378 - 13936237
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||| | |||||| ||||||||       |||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  13936378 tttaattaaaataataagggtaataatggaataaaaagtga-------taagctataagctcaaatgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttata 13936286  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||  ||||||||||||||| ||| |  | |||||  |||||||||||    
T  13936285 agctcatgaaataagctataagctcgttgtaaaaaaccgttaccaaaca 13936237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 139
Target Start/End: Original strand, 27005807 - 27005918
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||| |||||| | || ||||||  |||||||||  |||    
T  27005807 aataataaaggtaaaaagggaattaaaagtgaaaatttataagctataagctcaaacgttacttgaaatagcgtttggaaaataagttataagctcttga 27005906  T
Q  128 aataagctataa 139  Q
    ||||||||||||    
T  27005907 aataagctataa 27005918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 64 - 119
Target Start/End: Original strand, 42323596 - 42323651
Alignment:
Q  64 ctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataa 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  42323596 ctataagctataagctcaaacactacttagaatagcgtctgaaaaatagcttataa 42323651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Original strand, 4657578 - 4657648
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  4657578 aaaaatgataagttataagctataagctcaaactctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttataagct 4657648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 57 - 155
Target Start/End: Original strand, 6280437 - 6280535
Alignment:
Q  57 tgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaag 155  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||  ||||||| |||| ||| |||||||||| |||||| |  ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  6280437 tgagaagttataagctataagcttaaatgctacttgaaataacttatgaaaaatagtttataaacccgtgaaataaactataagctcatgatgaaaaag 6280535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 6349500 - 6349430
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  6349500 aaaagtgataagttataagctataagctcaaacgctacttagaatagcgtctgaaaaatagtttataagct 6349430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13921871 - 13921798
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  13921871 ataagttataagttcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaatagcttttaagctcgtgaaataagttataa 13921798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 68 - 120
Target Start/End: Original strand, 25872221 - 25872273
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 120  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25872221 aagctataagctcaaactctacttggaatagcttctgaaaaataaattataag 25872273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 72 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 31408062 - 31407980
Alignment:
Q  72 tataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaa 154  Q
    ||||| || |||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  31408062 tataatcttaaacgctaattggaatagcgtctgacaaatagcttataagctcgtgaaataagttattaactcgtgctgaaaaa 31407980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 139
Target Start/End: Original strand, 18480522 - 18480626
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||       | ||||||||||||||  |||||||  ||||| ||| |||||||   |||||||||||||    
T  18480522 aataataaggataaaactgaaattaaaagtgag-------acgctataagctcaaatgctacttgagatagcgtctaaaaaataaactataagcttgtga 18480614  T
Q  128 aataagctataa 139  Q
    |||||| |||||    
T  18480615 aataagatataa 18480626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 196 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41826399 - 41826359
Alignment:
Q  196 agctataagctcttttttgggtgttatcaaacagacccgaa 236  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  41826399 agctataagctcctttttgtgtgttatcaaacagacccgaa 41826359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 65 - 139
Target Start/End: Original strand, 32321652 - 32321726
Alignment:
Q  65 tataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||||||  || ||| |||||  |||||||||||  || |||| | ||||||||||||||||    
T  32321652 tataagctataagctcaaacgttatttgaaatagagtctgaaaaataagttgtaagttcgtgaaataagctataa 32321726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 136
Target Start/End: Original strand, 41471900 - 41471970
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagcta 136  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||||   || |||||  ||||||||||||    
T  41471900 ataagctataagctcaaacactatttgaaatagcgtctggaaaataagctaaaagctcctgaaataagcta 41471970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Original strand, 25872342 - 25872379
Alignment:
Q  196 agctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25872342 agctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 25872379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 130; Significance: 7e-67; HSPs: 113)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Original strand, 30366083 - 30366248
Alignment:
Q  2 aagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagctt 101  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30366083 aagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagtgtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagctt 30366182  T
Q  102 ctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30366183 ctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagatataagctcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 30366248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7706553 - 7706414
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  7706553 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 7706454  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  7706453 aataagctataaactcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 7706414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 9031958 - 9032097
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9031958 aataataagggtaaaattgtaataaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 9032057  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  9032058 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 9032097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11600864 - 11600725
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11600864 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 11600765  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11600764 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 11600725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 23162803 - 23162643
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagct-caaacactacttggaatagcttctgaa 106  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||    
T  23162803 aaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaatctataagctataagcttcaaaagctacttggaatagcttctgaa 23162704  T
Q  107 aaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||    
T  23162703 aaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggggaaaaagtgttaccaaaca 23162643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 12233930 - 12234069
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12233930 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 12234029  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12234030 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 12234069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 25440447 - 25440586
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25440447 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 25440546  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25440547 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 25440586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 45906320 - 45906181
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45906320 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 45906221  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45906220 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 45906181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 53407370 - 53407231
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  53407370 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 53407271  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53407270 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 53407231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 8829778 - 8829917
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8829778 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 8829877  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8829878 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 8829917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 11151902 - 11152041
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11151902 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 11152001  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  11152002 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 11152041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 18583025 - 18582886
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18583025 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 18582926  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  18582925 aataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 18582886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 19513845 - 19513984
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  19513845 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctaaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 19513944  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  19513945 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 19513984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21370061 - 21369922
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21370061 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 21369962  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  21369961 aataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 21369922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 27397729 - 27397868
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  27397729 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgtga 27397828  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27397829 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 27397868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 42117077 - 42116938
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42117077 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 42116978  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42116977 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 42116938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 46895464 - 46895325
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  46895464 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 46895365  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  46895364 aataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 46895325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 52670175 - 52670036
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52670175 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 52670076  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  52670075 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 52670036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 56372616 - 56372477
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  56372616 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 56372517  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  56372516 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 56372477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 107; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 28307436 - 28307298
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28307436 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 28307337  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaac 166  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||    
T  28307336 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaac 28307298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Original strand, 51011028 - 51011165
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51011028 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 51011127  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||| |||||    
T  51011128 aataagctataagcttatggtgaaaaagtgttgccaaa 51011165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 4939349 - 4939487
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4939349 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 4939448  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  4939449 aataagctataagctcatggt-aaaaagtgttaccaaaca 4939487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8942085 - 8941946
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  8942085 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgaaaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtaa 8941986  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  8941985 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 8941946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 23867832 - 23867971
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  23867832 aataataagggtaaaattagaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtga 23867931  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  23867932 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 23867971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29413712 - 29413573
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29413712 aataataagggtaaaattggaagaaaacgtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 29413613  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  29413612 aataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 29413573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 55856490 - 55856629
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  55856490 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtga 55856589  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  55856590 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 55856629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 167
Target Start/End: Original strand, 4517160 - 4517293
Alignment:
Q  34 aagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 133  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4517160 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 4517259  T
Q  134 ctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  4517260 ctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaaca 4517293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 15636123 - 15635982
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  15636123 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataaaatcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtga 15636024  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  15636023 aataagctataaactcatagtgaaaaagtgttaccaaacaaa 15635982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 3009892 - 3009753
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3009892 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 3009793  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||| ||||||||||||    
T  3009792 aataagctataagctcaaggtaaaaaaatgttaccaaaca 3009753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 4355555 - 4355694
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4355555 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 4355654  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  4355655 aataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 4355694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 4392689 - 4392827
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  4392689 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatg-aaaatagcttataagctcgtga 4392787  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  4392788 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 4392827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 22038320 - 22038459
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||    
T  22038320 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcctataagctcgaga 22038419  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22038420 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 22038459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 26826702 - 26826563
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26826702 aataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 26826603  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  26826602 aataagttataagctcatcgtgaaaaagtgttaccaaaca 26826563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35468196 - 35468057
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35468196 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctatatgttataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 35468097  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35468096 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 35468057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 39087521 - 39087660
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||    
T  39087521 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataaactcgtga 39087620  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39087621 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 39087660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 55358301 - 55358440
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55358301 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 55358400  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  55358401 aataagttataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 55358440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 9043573 - 9043713
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9043573 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 9043672  T
Q  128 aataagctataaactcatgat-gaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||| | |||||||||||||||||||    
T  9043673 aataagttataagctcatggtggaaaaagtgttaccaaaca 9043713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 154
Target Start/End: Original strand, 31338465 - 31338589
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  31338465 taataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagcccgtgaaa 31338564  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaa 154  Q
    |||||||||| |||||| |||||||    
T  31338565 taagctataagctcatggtgaaaaa 31338589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 160
Target Start/End: Original strand, 27185595 - 27185728
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27185595 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 27185694  T
Q  128 aataagctataaactcatgat-gaaaaagtgtta 160  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  27185695 aataagctataagctcatggtagaaaaagtgtta 27185728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 33115156 - 33114969
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33115156 aataataagggtaaaattggaagaaaaggtgagaagctataagctataagctcaaacgatacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 33115057  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttggg 216  Q
    |||||||||||| |||| | | ||||||||||||||||| | |         ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  33115056 aataagctataagctcacggtaaaaaagtgttaccaaac-agagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagctcttttttggg 33114969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22892685 - 22892570
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  22892685 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 22892586  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  22892585 aaagtgttaccaaaca 22892570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22944349 - 22944234
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  22944349 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 22944250  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  22944249 aaagtgttaccaaaca 22944234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 55764716 - 55764601
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  55764716 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 55764617  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  55764616 aaagtgttaccaaaca 55764601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 101
Target Start/End: Original strand, 35842545 - 35842645
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  35842545 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagct 35842644  T
Q  101 t 101  Q
    |    
T  35842645 t 35842645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 35822262 - 35822401
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||||| |||||||| || ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  35822262 aataatacgggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataatctcgtga 35822361  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| | ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35822362 aataagttgtaagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 35822401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37970451 - 37970336
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||    
T  37970451 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataagctcatggtcaa 37970352  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  37970351 aaagtgttaccaaaca 37970336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 167
Target Start/End: Original strand, 4391673 - 4391810
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  4391673 taataagggtaaaattggaattaaaagtaagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 4391772  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||| ||| |  | |||||| |||||||||||    
T  4391773 taagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaaca 4391810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 37115253 - 37115385
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37115253 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 37115345  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37115346 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 37115385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 55495850 - 55495982
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  55495850 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 55495942  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  55495943 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 55495982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 29664070 - 29663971
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  29664070 aagctataagctcaaacgctacctggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 29663971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44442262 - 44442124
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||    
T  44442262 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatag-ttttaagctcgtga 44442164  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
     |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44442163 gataagcaataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 44442124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 61 - 167
Target Start/End: Original strand, 5465406 - 5465512
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgtta 160  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||    
T  5465406 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtatta 5465505  T
Q  161 ccaaaca 167  Q
    |||||||    
T  5465506 ccaaaca 5465512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Original strand, 43078132 - 43078270
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||     
T  43078132 taagggtgaaaaatggaatttagttaaactaataagggtaaaactggaattaaaaatgagaagttataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcg 43078231  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  43078232 tctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagttataa 43078270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 233
Target Start/End: Original strand, 56270078 - 56270258
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  56270078 aaaaatgagaagctataagctaaaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 56270177  T
Q  152 aaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    ||| ||||||||||| | |         || |||||||||||| |||||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||    
T  56270178 aaaatgttaccaaac-agagttttttttgtgaaacgagcttataagctataagctctttttttggatttaccaaacagaccc 56270258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25235324 - 25235187
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  25235324 taataagggtaaaattggaattaaaagtaagatgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 25235225  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||| ||| |  | |||||| |||||||||||    
T  25235224 taagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaaca 25235187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31679143 - 31679011
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  31679143 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtga 31679051  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31679050 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 31679011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 43225647 - 43225779
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43225647 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 43225739  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43225740 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 43225779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Original strand, 36486339 - 36486487
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  36486339 tttaattagaataataaggataaaactggaattaaaagtgagaagttataagctataagttcaaacgttacttaaaatagcttatgaaaaatagtttata 36486438  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||  | |||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||    
T  36486439 agctcataaaataaactataaattcatggtgaaaaagtattaccaaaca 36486487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 44525820 - 44525701
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||       ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  44525820 tttagttagaataataagggtaaaattggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttgaaatagtttctgaaaaatagcttata 44525728  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcat 145  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||    
T  44525727 agctcgtgaaataagctataaactcat 44525701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 72 - 167
Target Start/End: Original strand, 35777393 - 35777488
Alignment:
Q  72 tataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  35777393 tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 35777488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 55684874 - 55684735
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  55684874 taataagggtaaaattggaattaaaagtgagacgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 55684775  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    ||||||| || ||| |  | ||||||  ||||||||||||    
T  55684774 taagctagaagctcgttgtaaaaaagcattaccaaacaaa 55684735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 169
Target Start/End: Original strand, 23113430 - 23113580
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| ||| || |||  ||||||| |||||| ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23113430 tttaattaaaataataagggtaaaaatgggataaaatatgagaagttataagttataaactcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttata 23113529  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||    
T  23113530 agctcgtgaaataagctataagctcatggcgaaaaagtattaccaatcaaa 23113580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 71 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37832060 - 37831964
Alignment:
Q  71 ctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  37832060 ctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 37831964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 21633770 - 21633890
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || ||||||||||||| || |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21633770 tttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttata 21633869  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  21633870 agctcgtgaaataagctataa 21633890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 7 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 53224422 - 53224214
Alignment:
Q  7 taaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaa 106  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53224422 taaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaatctggaattaaaagtgagaagctata-------agctcaaacgctacttggaatagcttttgaa 53224330  T
Q  107 aaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagct 206  Q
    ||||||||||||| || ||||         ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |          ||||||||||||||| |||||||| ||    
T  53224329 aaatagcttataaactcgtga--------gtaagctcatgatg-aaaagtgttaccaaacata--gcttttttgtcaaacgagcttataagctataaact 53224241  T
Q  207 cttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53224240 cttttttgggtgttaccaaacataccc 53224214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 55829145 - 55829046
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  55829145 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaaca 55829046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Original strand, 36007981 - 36008075
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36007981 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataaactcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaacagcttataagct 36008075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 61 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 22430783 - 22430690
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaa 154  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||    
T  22430783 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaa 22430690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 47417445 - 47417577
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||       ||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  47417445 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttata-------agctcaaacgctgcttggaatagcttatgaaagatagcttataagctcgtga 47417537  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47417538 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 47417577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 11050458 - 11050359
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  11050458 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagcattaccaaaca 11050359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Original strand, 42124642 - 42124736
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  42124642 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaagatagtttataagct 42124736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 167
Target Start/End: Original strand, 35190582 - 35190718
Alignment:
Q  31 aataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaat 130  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  35190582 aataaggataaaaatggaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaat 35190681  T
Q  131 aagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| |||||| |  | |||||| |||||||||||    
T  35190682 aagctacaaactcgttgtaaaaaagcgttaccaaaca 35190718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 35580948 - 35581047
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  35580948 aagctataagctcaaacgctacttgaaatagcctctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataaactataagctcatggtcaaaaagtgttaccaaaca 35581047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 73 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 50502376 - 50502306
Alignment:
Q  73 ataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactc 143  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  50502376 ataagctcaaacactacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaactc 50502306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 36197017 - 36196944
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36197017 ataagctataagctcaaacactacttagaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataa 36196944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 30 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 37337818 - 37337681
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    |||||    
T  37337818 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagacactataaactataagttcaaacgctacttgaagtagcttatgaaaaatagcttataagtacctgaaa 37337719  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||  || || || |||||  |||||||||||    
T  37337718 taagctatatgcttattataaaaaaccgttaccaaaca 37337681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 146
Target Start/End: Original strand, 20148803 - 20148883
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatg 146  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  20148803 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatg 20148883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 24954175 - 24954278
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||| |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24954175 tttaattaaaatgataagggtaaaaatggaacaaaagatgataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttata 24954274  T
Q  119 agct 122  Q
    ||||    
T  24954275 agct 24954278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 139
Target Start/End: Original strand, 33005078 - 33005182
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  33005078 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataaactcgtga 33005170  T
Q  128 aataagctataa 139  Q
    ||||||||||||    
T  33005171 aataagctataa 33005182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 52713684 - 52713564
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||  |||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||| ||||||    
T  52713684 tttagataaaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagttataagctataagctcaaacgctacttagaatagtgtcttaaaaataacttata 52713585  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    || |||||||||||| |||||    
T  52713584 agtttgtgaaataagttataa 52713564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 53273238 - 53273162
Alignment:
Q  89 cttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  53273238 cttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaa 53273162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 139
Target Start/End: Original strand, 40497399 - 40497470
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  40497399 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataa 40497470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 20511552 - 20511479
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  20511552 ataagttataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataa 20511479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Original strand, 42085723 - 42085796
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42085723 ataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaaaagcttataagctcgtgaaataagctataa 42085796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 66 - 145
Target Start/End: Original strand, 4465472 - 4465551
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcat 145  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  4465472 ataagctacaagctcaaacgctacttggaacagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcat 4465551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Original strand, 45780760 - 45780814
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45780760 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 45780814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Original strand, 48056607 - 48056680
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||    
T  48056607 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttataagttcgtgaaataaactataa 48056680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 53274877 - 53274812
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttgg 93  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  53274877 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttgg 53274812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 37047172 - 37047006
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||| |  | |||||| |||| ||||    
T  37047172 ataagctataagctcaaacgctatttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctaaaataagctataagctcgttgtaaaaaagcgttatcaaa 37047073  T
Q  166 caaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    || ||         |||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||| ||||||    
T  37047072 cagaacttttttttgtcagacgagcttataagctatatgctc-tttttgggagttaccaaatagaccc 37047006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 17715707 - 17715651
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17715707 ataagctataatctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagcttataagct 17715651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26443495 - 26443392
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | | |||| |||||||| ||||  |||||| | |||||| |||||||||| |||||    
T  26443495 tttaattaaaataataaaggtaaaattggaattaaaagtgagacgttgtaagttataagcttaaacgttacttgaagtagcttttgaaaaatagtttata 26443396  T
Q  119 agct 122  Q
    ||||    
T  26443395 agct 26443392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 92 - 167
Target Start/End: Original strand, 29656720 - 29656795
Alignment:
Q  92 ggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||||||||| ||||||    
T  29656720 ggaatagcttctgaaaaataaattattagctcgtgaaataagctataagctcatggcgaaaaagtgttaacaaaca 29656795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 156
Target Start/End: Original strand, 32948179 - 32948274
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagt 156  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| || ||||||| |||||||||||  ||||||  |  | ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32948179 aagctataaactataagctcaaacgctatttagaatagcgtctgaaaaatactttataatatcataaaataagatataaactcatgatgaaaaagt 32948274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 40120001 - 40119907
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||| ||||||||||| |||||  |||  ||| |||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  40120001 aatagtaagggtaaaagtggaagaaaatatgataagctataggctacaagctcaaatgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagct 40119907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Original strand, 52707967 - 52708100
Alignment:
Q  33 taagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataa 132  Q
    |||||||| || |||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||| |  |||||| |||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  52707967 taagggtataaatggaataaaacatgataagatataagctataagctcaa-cgttacttgtaataacatctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataa 52708065  T
Q  133 gctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||| ||| |  | |||||  |||||||||||    
T  52708066 gctataagctcgttgtaaaaaatcgttaccaaaca 52708100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Original strand, 8716919 - 8716992
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||   ||||||||| |||||||||||||||    
T  8716919 ataaactataagctcaaacactacttgaaatagcctctggaaaataaactataagcttttgaaataagctataa 8716992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 31435149 - 31435076
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||    
T  31435149 ataagttataacctcaaacgctacttggaatagcgtatgaaaaataacttataaactcgtgaaataagctataa 31435076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Original strand, 32101736 - 32101809
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| | |||||| ||||||||| |||||||||| |||||    
T  32101736 ataagctataagctcaaacgctacttggaataacgtcttagaaatagtttataagctcgtgaaataagttataa 32101809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #99
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 169
Target Start/End: Original strand, 38048878 - 38048981
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||||| |||||| || |||||||||  |||||  || ||||||||||  |||| ||||    
T  38048878 ataagctataaactcaaatgctatttggaatagcgtctgaaaaatagtttataaactcgtgaaataaattataagttcgtgatgaaaaaacgttaacaaa 38048977  T
Q  166 caaa 169  Q
    ||||    
T  38048978 caaa 38048981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #100
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 166
Target Start/End: Original strand, 35842638 - 35842696
Alignment:
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaac 166  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  35842638 aatagcttataagctcgcgaaataatctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac 35842696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #101
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 68 - 138
Target Start/End: Original strand, 41864083 - 41864153
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctata 138  Q
    ||||||||| || |||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  41864083 aagctataaacttaaacgctatttggaatagcttcttaaaaatagcttataagttcgtaaaataagctata 41864153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 115 - 167
Target Start/End: Original strand, 33005178 - 33005230
Alignment:
Q  115 tataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  33005178 tataagctcgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 33005230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #103
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 3932203 - 3932306
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || ||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | | |||||||| ||| |||    
T  3932203 tttagataaaataataagggtaaaaatgaaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaatgctacttgaaataacgtttgaaaaatggctcata 3932302  T
Q  119 agct 122  Q
    ||||    
T  3932303 agct 3932306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #104
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 117
Target Start/End: Original strand, 30562850 - 30562901
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttat 117  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  30562850 ataagctataagcttaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttat 30562901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #105
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 233
Target Start/End: Original strand, 30366293 - 30366327
Alignment:
Q  199 tataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30366293 tataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 30366327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #106
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 61 - 109
Target Start/End: Original strand, 20530799 - 20530847
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||| |||||    
T  20530799 aagctataagctataagctcaaaagctacttggaataacttctcaaaaa 20530847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #107
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 124 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 44525699 - 44525659
Alignment:
Q  124 gtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaa 164  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44525699 gtgaaataagctataaactcatagtgaaaaagtgttaccaa 44525659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #108
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 167
Target Start/End: Original strand, 29656597 - 29656640
Alignment:
Q  124 gtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||    
T  29656597 gtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaagtgttaccaaaca 29656640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #109
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 68 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 31953296 - 31953225
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||   ||| |||||||| ||||||  | ||||||||||||||||    
T  31953296 aagctataagctcaaacgctacttgaaataatgtctaaaaaatagtttataaagtcgtgaaataagctataa 31953225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #110
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 196 - 234
Target Start/End: Original strand, 29656682 - 29656720
Alignment:
Q  196 agctataagctcttttttgggtgttatcaaacagacccg 234  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29656682 agctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagacccg 29656720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #111
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 129 - 167
Target Start/End: Original strand, 36008069 - 36008107
Alignment:
Q  129 ataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36008069 ataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 36008107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26443325 - 26443288
Alignment:
Q  196 agctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26443325 agctataagctcttttttggatgttaccaaacagaccc 26443288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Original strand, 49239219 - 49239280
Alignment:
Q  65 tataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtg 126  Q
    ||||| ||||||| ||||||  |||||  |||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  49239219 tataaactataagttcaaacgttacttataatagcgtctgaaaaatagtttataagcttgtg 49239280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 71)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 11297976 - 11298142
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  11297976 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgttatttggaatagct 11298075  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||    
T  11298076 tctgaaaaatatcttataagctcgtgaaataagctataagctgatgatgaaaaaatgttaccaaaca 11298142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 22877860 - 22878026
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  22877860 taagggtaaaaaatgaaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtaagaaactataagctataagctcaaacgctactgagaatagct 22877959  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22877960 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 22878026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 24652478 - 24652313
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||    
T  24652478 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaatgctacttgaaatagct 24652379  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  24652378 tctaaaaaatggcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtg-aaaagtgttaccaaaca 24652313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 10618990 - 10618848
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10618990 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 10618891  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaa 170  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10618890 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaacaaaa 10618848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28716848 - 28716709
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28716848 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 28716749  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28716748 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 28716709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31581878 - 31581739
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31581878 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 31581779  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31581778 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 31581739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 36681409 - 36681548
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36681409 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 36681508  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36681509 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 36681548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 39702490 - 39702351
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39702490 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 39702391  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39702390 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 39702351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36590347 - 36590182
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    |||| |||||||| | | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  36590347 taagagtaaaaaatgcaatttagatagaataataagggtaaaactggaattaatagtgagaagctataagcta-aagctcaaacgctacttggaatagct 36590249  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  36590248 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 36590182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 6338502 - 6338363
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6338502 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 6338403  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  6338402 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 6338363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 8271090 - 8270951
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  8271090 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 8270991  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  8270990 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 8270951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 16423013 - 16422874
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16423013 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtga 16422914  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16422913 aataagctataagctcatgatgaaaaagtgttactaaaca 16422874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17115722 - 17115583
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17115722 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 17115623  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17115622 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 17115583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 22957520 - 22957353
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22957520 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaattgaaattgaaagtaagaagctataaactataaactcaaacactacttagaatagct 22957421  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaa 168  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||| |||||| ||||||    
T  22957420 tctgaaaaataacttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtaaaaaaatgttacgaaacaa 22957353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 25023490 - 25023351
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  25023490 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtga 25023391  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25023390 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 25023351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27781286 - 27781147
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27781286 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtga 27781187  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27781186 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 27781147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32541407 - 32541268
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32541407 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtga 32541308  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32541307 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 32541268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 45141417 - 45141556
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45141417 aataataagggtaaaattggaagaaaaggtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 45141516  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45141517 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 45141556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 23677056 - 23676919
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  23677056 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagttcgtga 23676957  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  23676956 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 23676919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 34 - 167
Target Start/End: Original strand, 44827285 - 44827418
Alignment:
Q  34 aagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 133  Q
    |||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44827285 aagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataag 44827384  T
Q  134 ctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44827385 ctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 44827418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 40223027 - 40223182
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaa 107  Q
    |||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40223027 aaaaaatggaatttcgttaga-taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaa 40223125  T
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||||||    
T  40223126 aatag-ttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtg--aaagtgttaccaaaca 40223182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31478260 - 31478121
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31478260 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtga 31478161  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31478160 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 31478121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 39320028 - 39320167
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39320028 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcgaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 39320127  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39320128 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 39320167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 42142697 - 42142836
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42142697 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagcgagaagctataagctataagctcaaacactatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 42142796  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42142797 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 42142836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 39871448 - 39871311
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39871448 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 39871349  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  39871348 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaa 39871311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 38171389 - 38171528
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||    
T  38171389 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaacaacttataagctcgtga 38171488  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||    
T  38171489 aataagctataagctcatggtgaacaagtgttaccaaaca 38171528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 41693868 - 41694007
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41693868 aataataagggtaaaattggaagaaaacgtgagaaactataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 41693967  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  41693968 aataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 41694007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 19 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32099723 - 32099582
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32099723 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttata 32099631  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  32099630 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 32099582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 161
Target Start/End: Original strand, 11741065 - 11741198
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11741065 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagattctgaaaaatagcttataagctcgtga 11741164  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttac 161  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||| ||||    
T  11741165 aataagctataagctcatggtaaaaaagtattac 11741198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 233
Target Start/End: Original strand, 31688019 - 31688216
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31688019 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 31688111  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggtgttatcaaac 227  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| | |         ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  | | |||||    
T  31688112 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac-agagctttttttgtcaaacgagcttataagctataagctcttttttggggttaaccaaac 31688210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 90; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 167
Target Start/End: Original strand, 37560521 - 37560630
Alignment:
Q  58 gagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtg 157  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  37560521 gagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagttcatgatcaaaaagtg 37560620  T
Q  158 ttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||    
T  37560621 ttaccaaaca 37560630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 36112810 - 36112942
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36112810 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 36112902  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36112903 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 36112942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 2642404 - 2642519
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  2642404 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 2642503  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||| | ||||||||||    
T  2642504 aaaatattaccaaaca 2642519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17081798 - 17081699
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17081798 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 17081699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 28709451 - 28709352
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28709451 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 28709352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44157381 - 44157242
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||| |||||||||| |||||  ||||   | |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  44157381 aataacaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtga 44157282  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  44157281 aataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 44157242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 1893810 - 1893942
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1893810 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 1893902  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  1893903 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 1893942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 41313552 - 41313420
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  41313552 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 41313460  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  41313459 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 41313420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 43276740 - 43276872
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43276740 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 43276832  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43276833 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 43276872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 10651236 - 10651112
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||    
T  10651236 taagggtaaaaaatagaatttagttagaataataagggtaaaattgaaattaaaagtgagaagctataagctataaactcaaacgctacttaaaattgct 10651137  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgt 125  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  10651136 tctaaaaaatagcttataagcttgt 10651112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40552001 - 40551788
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||||||||||||||||  |||||   |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||  || |||||||||||||||||||| ||||    
T  40552001 tttagttagaataataagtttaaaatatgaattaaaagtgaggagttataaactataagctcaaacgctatctgaaatagcttctgaaaaatagc-tata 40551903  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaa-aannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggt 217  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||            ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  40551902 agctcatgaaataagctataaactcatggtgaaaaaatgttaccaaataattttatttttttgtcaaacgagcttataagctataagctcttttttggat 40551803  T
Q  218 gttatcaaacagacc 232  Q
    ||||  |||||||||    
T  40551802 gttactaaacagacc 40551788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7379030 - 7378893
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||| | ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  7379030 taataagggtaacattggaattaaaaatcagatgctataagctataagctcaaacactacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaa 7378931  T
Q  130 taagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||| ||| |  | |||||| |||||||||||    
T  7378930 taagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaaca 7378893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 153
Target Start/End: Original strand, 35243314 - 35243439
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  35243314 aataataagggtaaaattgggagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaataacttataagctcgtga 35243413  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaa 153  Q
    |||||| ||||| ||| || ||||||    
T  35243414 aataagatataagctcgtggtgaaaa 35243439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 37587720 - 37587819
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  37587720 aagctaaaagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 37587819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 139
Target Start/End: Original strand, 29189679 - 29189799
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||| |||||  |||  |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  29189679 tttagataaaataataagggtaaaaatggaagaaaagatgagaagctataagctgtaagctcaaacgctacttggaatagcttcttaaaaataacatata 29189778  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||| ||||||||||||||||    
T  29189779 agctcgtgaaataagctataa 29189799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 3427623 - 3427722
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||  ||||||||||    
T  3427623 aagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataaggtcatggtgaaaaagcattaccaaaca 3427722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 3511402 - 3511284
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||| ||||||||||| |||||  ||   ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  3511402 aatattaagggtaaaagtggaagaaattttgagaagctataagctataagttcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 3511303  T
Q  128 aataagctataaactcatg 146  Q
    ||||||||| || ||||||    
T  3511302 aataagctacaagctcatg 3511284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 44263489 - 44263388
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  44263489 taataaggataaaattggaattaaaagtaagatgctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 44263390  T
Q  130 ta 131  Q
    ||    
T  44263389 ta 44263388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 39677549 - 39677446
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || ||||||||||||| || |||||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39677549 tttagataaaataataagggtataaatggaagaaaagatgataagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttttgaaaaatagcttata 39677450  T
Q  119 agct 122  Q
    ||||    
T  39677449 agct 39677446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 68 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 9211130 - 9211032
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaac 166  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||||||||||| |||||    
T  9211130 aagctataagctcaaacgctacttgggatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtcaaaaagtgttatcaaac 9211032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 167
Target Start/End: Original strand, 39746938 - 39747040
Alignment:
Q  65 tataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaa 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| || |||||||   |||||||    
T  39746938 tataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcgtggtgaaaaaacattaccaa 39747037  T
Q  165 aca 167  Q
    |||    
T  39747038 aca 39747040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 33 - 167
Target Start/End: Original strand, 43849174 - 43849308
Alignment:
Q  33 taagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataa 132  Q
    |||||||| || |||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||    
T  43849174 taagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttataagctcataaaataa 43849273  T
Q  133 gctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||| ||| |  | ||||| ||||||||||||    
T  43849274 gctataagctcgttgtaaaaaattgttaccaaaca 43849308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 34395348 - 34395448
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaa-atagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaac 166  Q
    |||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||||||||||| |||||    
T  34395348 aagctataagttcaaacgctactttgaatagcttctgaaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaaaaagtgttatcaaac 34395447  T
Q  167 a 167  Q
    |    
T  34395448 a 34395448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40045584 - 40045445
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaat-agcttataagcttgtg 126  Q
    |||||| ||||||||| |||||  |||| | | |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||| ||     
T  40045584 aataatgagggtaaaattggaagaaaaaataaaaagctataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcgtctgaaaaataagcttataagctagt- 40045486  T
Q  127 aaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||| ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||    
T  40045485 aaaaaagctataagctcttgatgaaaaacagttaccaaaca 40045445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 13970121 - 13970034
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  13970121 ataagctataagctcaaacgctacttcgaatagcgtctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaa 13970034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 16831730 - 16831580
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||       ||| ||||||||||||| ||||||  |||||||    
T  16831730 taagggtaaaaaatggaattcatttagaataataagggtaaaactagaattaaaagtgag-------aagttataagctcaaacgctacttaaaatagct 16831638  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaac 166  Q
    | ||||||||||||||||        || | |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  16831637 tatgaaaaatagcttata--------aactcagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaac 16831580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 38780812 - 38780734
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||    
T  38780812 aagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtaaaataagttataa 38780734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 2855228 - 2855155
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2855228 ataagctataagctcaaacgctacttgaaataacttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataa 2855155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Original strand, 5320490 - 5320564
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttgg 93  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5320490 tttagttaaaataataagggtaaaaatggaattaaaagtgatatgttataagctataagctcaaacactgcttgg 5320564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 67 - 167
Target Start/End: Original strand, 1363793 - 1363893
Alignment:
Q  67 taagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaac 166  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||| |||||| | ||||| | |||||||||    
T  1363793 taagctataagttcaaacgctacttagaatagcgtctgaataatagcttataaactcgtgaaataagttataagctcatggtaaaaaaatattaccaaac 1363892  T
Q  167 a 167  Q
    |    
T  1363893 a 1363893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 132
Target Start/End: Original strand, 9370315 - 9370382
Alignment:
Q  65 tataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataa 132  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9370315 tataagctataagctcaaacgctacttgaaataacttttgaaaaatagcttataagctcgtgaaataa 9370382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 68 - 122
Target Start/End: Original strand, 42203405 - 42203459
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42203405 aagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaaatagcttataagct 42203459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 139
Target Start/End: Original strand, 8436491 - 8436597
Alignment:
Q  33 taagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataa 132  Q
    |||||||| || |||||| |||  ||| ||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||| ||||||||||| ||||||||||  | ||||||    
T  8436491 taagggtataaatggaataaaacatgataagctataagctataagttcaaacgatatttgtaatagcatctgaaaaataacttataagctcataaaataa 8436590  T
Q  133 gctataa 139  Q
    |||||||    
T  8436591 gctataa 8436597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 65 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 13888388 - 13888326
Alignment:
Q  65 tataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13888388 tataagctataagcttaaacgctacttggaatagcgtctgaaaaatagtttataagctcgtga 13888326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26293901 - 26293840
Alignment:
Q  78 ctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26293901 ctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataaatttgtgaaataagctataa 26293840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 78 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 26307158 - 26307097
Alignment:
Q  78 ctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  26307158 ctcaaacgctacttggaatagtgtctgaaaaatagcttataaatttgtgaaataagctataa 26307097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Original strand, 42203496 - 42203549
Alignment:
Q  180 gtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  42203496 gtcaaacgagcttataagctaaaagctcttttttgggtgttatgaaacggaccc 42203549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 143
Target Start/End: Original strand, 26036979 - 26037057
Alignment:
Q  65 tataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactc 143  Q
    |||| ||||||| ||||||| | |||||||||| | ||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||||||    
T  26036979 tataggctataaactcaaacgcaacttggaataacatctgaaaaataacttataaactcatgaaataaactataaactc 26037057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Original strand, 22878068 - 22878105
Alignment:
Q  196 agctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22878068 agctataagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 22878105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 71 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 44318371 - 44318320
Alignment:
Q  71 ctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||    
T  44318371 ctataagctcaaatgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataagct 44318320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 196 - 233
Target Start/End: Original strand, 40223226 - 40223263
Alignment:
Q  196 agctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40223226 agctaaaagctcttttttgggtgttaccaaacagaccc 40223263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 127; Significance: 4e-65; HSPs: 68)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44743929 - 44743763
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||||||||    
T  44743929 taagggtaaaaaatggaatttagttagaataataaaggtaaaactggaattaaaagtgagaagttataagctataaactcaaatgctacttggaatagct 44743830  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44743829 tctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 44743763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 170
Target Start/End: Original strand, 28425554 - 28425723
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28425554 taagggtaaaaaatgaaatttagttagaataatatggctaaaactagaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 28425653  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaa 170  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  28425654 tatgaaaaataacttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaaaagttaccaaacaaaa 28425723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 12345017 - 12345176
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaa 107  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  12345017 aaaaaatggaatttagttagattaataagggtaaaactgaaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaatgctacttgaaatagcttctgaaa 12345116  T
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||    
T  12345117 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcttcgtgaaaaagtgttaccaaaca 12345176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 21374818 - 21374679
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21374818 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 21374719  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21374718 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 21374679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 33027061 - 33026922
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33027061 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 33026962  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33026961 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 33026922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 36246346 - 36246485
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36246346 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 36246445  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36246446 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 36246485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Original strand, 38531133 - 38531291
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaa 107  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||    
T  38531133 aaaaaatggaatttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctactt-gaataacttctgaaa 38531231  T
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38531232 aatagcttataagctcgtaaaataagctattagatcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 38531291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 42587353 - 42587492
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42587353 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 42587452  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42587453 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 42587492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43254288 - 43254149
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  43254288 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 43254189  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43254188 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 43254149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 45686886 - 45687025
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45686886 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 45686985  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45686986 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 45687025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 8 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 49148537 - 49148378
Alignment:
Q  8 aaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaa 107  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  49148537 aaaaaatggaatttagttaaaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgctgcttggaatagcttctgaaa 49148438  T
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||    
T  49148437 aatagctcataagctcgtgaaataagctataagctcatggtggaaaagtgttactaaaca 49148378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 10311999 - 10312138
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10311999 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagatataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 10312098  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  10312099 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 10312138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 27089626 - 27089765
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27089626 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 27089725  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27089726 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 27089765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 27188675 - 27188536
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27188675 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 27188576  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27188575 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 27188536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 31511485 - 31511346
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31511485 aataataagggtaaaattggaggaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 31511386  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  31511385 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 31511346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 35587764 - 35587625
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35587764 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 35587665  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  35587664 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 35587625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 33203638 - 33203777
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33203638 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 33203737  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  33203738 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 33203777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 40259042 - 40258903
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40259042 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 40258943  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40258942 aataagttataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 40258903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 40637130 - 40637269
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40637130 aataataagggtaaaatttgaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 40637229  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  40637230 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttgccaaaca 40637269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 45222043 - 45222182
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45222043 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctaaaagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 45222142  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||    
T  45222143 aataagctataagctcatggtgaaaaggtgttaccaaaca 45222182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 48620669 - 48620502
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||  |||| |||||||| ||||||| ||||| |    
T  48620669 taagggtaaaaaatgaaatttagttagaataataagggtaaaactaaaattaaaagtgagaagatataaattatatgctcaaacgctacttgaaatagtt 48620570  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  48620569 tctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataaactataaactcatgatg-aaaagtgttaccaaacaaa 48620502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 21254667 - 21254806
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21254667 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagctataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 21254766  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  21254767 aataagctataagctcatagtgaaaaagtgttaccaaaca 21254806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 34709418 - 34709283
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34709418 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgaaaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 34709319  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttacca 163  Q
    ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34709318 aataaactataagctcatggtgaaaaagtgttacca 34709283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 48590899 - 48590760
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||    
T  48590899 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctactttgaatagcttttgaaaaataacttataagctcgtga 48590800  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  48590799 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 48590760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 48832023 - 48832162
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  48832023 aataataaaggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtga 48832122  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  48832123 aataagctataagctcacggtgaaaaagtgttaccaaaca 48832162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 97; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 164
Target Start/End: Original strand, 48313418 - 48313530
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48313418 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataagctcatggtgaa 48313517  T
Q  152 aaagtgttaccaa 164  Q
    |||||||||||||    
T  48313518 aaagtgttaccaa 48313530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9487592 - 9487453
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| || ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9487592 aataataagggtaaaattgaaagaaaaagtgaaaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 9487493  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||    
T  9487492 aataagctataagctcatagtaaaaaagtgttaccaaaca 9487453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 52 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 21742133 - 21741979
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||||    
T  21742133 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttttaagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaa 21742034  T
Q  152 aaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagct 206  Q
    || ||||||||||||| ||         ||||||||||||||| |||||||||||    
T  21742033 aaggtgttaccaaacagaatttttttttgtcaaacgagcttataagctataagct 21741979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 44596791 - 44596656
Alignment:
Q  32 ataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaata 131  Q
    |||||||||||| || ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44596791 ataagggtaaaaatgaaacaaaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaata 44596692  T
Q  132 agctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  44596691 agctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 44596656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 47470932 - 47471071
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  47470932 aataataaggataaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagtttataagctcgtga 47471031  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  47471032 aataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 47471071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 52 - 169
Target Start/End: Original strand, 482976 - 483093
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  482976 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 483075  T
Q  152 aaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    ||||||||||||||||||    
T  483076 aaagtgttaccaaacaaa 483093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 93; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 38481485 - 38481326
Alignment:
Q  1 taagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagct 100  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||       ||||| |||||||||||||||    
T  38481485 taagggtaaaaaatgaaatttagttagaataataaggataaaactggaattaaaagtgagaagttataagct-------caaacgctacttggaatagct 38481393  T
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    | ||||||||||||||||  || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  38481392 tttgaaaaatagcttatagactcgtgaaataagctataaattcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 38481326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 9485908 - 9485764
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  9485908 tttagttagaataataaggg--aaactggaattaaaaatgagaacctataagctataagctcaaatgatacttgaaatagcttttgaaaaatagcttata 9485811  T
Q  119 agcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||    
T  9485810 agctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaa 9485764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 40105975 - 40106114
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||| ||||||  |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  40105975 aataataaaggtaaagttggaagaaaaagtgagaagctataaactataagctcaaacgttacttggaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtga 40106074  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40106075 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 40106114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 9 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 23029994 - 23029834
Alignment:
Q  9 aaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaa 108  Q
    ||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  23029994 aaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaattggaagaaatattgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaata 23029895  T
Q  109 atagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaa 169  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||  ||||||||||||    
T  23029894 atagtttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagcattaccaaacaaa 23029834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36407389 - 36407274
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||| | ||    
T  36407389 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataagctcatggtcaa 36407290  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  36407289 aaagtgttaccaaaca 36407274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 88; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 43134565 - 43134450
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  43134565 aaaaatgagaagctataagttataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 43134466  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  43134465 aaagtgttaccaaaca 43134450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 21313766 - 21313898
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21313766 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagcttgtga 21313858  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21313859 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 21313898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 42375760 - 42375892
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  42375760 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 42375852  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  42375853 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 42375892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 17844748 - 17844590
Alignment:
Q  9 aaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaa 108  Q
    ||||| ||| ||||| || |||| ||||||||||| |||||  ||   |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17844748 aaaaatggattttagataaaatattaagggtaaaaatggaagaaattttgagaagctataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttctgaaaa 17844649  T
Q  109 atagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| ||  ||||||||||    
T  17844648 atagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaatagcattaccaaaca 17844590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 2 - 167
Target Start/End: Original strand, 27655618 - 27655782
Alignment:
Q  2 aagggtaaaaaagggagtttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagctt 101  Q
    |||||||||||||| | |||||  | |||| ||||||||||| |||||  ||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27655618 aagggtaaaaaagg-attttagaaaaaatagtaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagctt 27655716  T
Q  102 ctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||    
T  27655717 ctgaaaaatagcttataagctcttgaaataagctataagctcatggtaaaaaagtattaccaaaca 27655782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 17192419 - 17192550
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17192419 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 17192511  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  17192512 aataagctataaactcatggtg-aaaagtgttaccaaaca 17192550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 19831967 - 19832099
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  19831967 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttttgaaaaatagcttataagctcgtga 19832059  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19832060 aataagctataagctcatggtgaaaaaatgttaccaaaca 19832099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36436331 - 36436199
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||||||       ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36436331 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagttataagct-------caaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 36436239  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  36436238 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 36436199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 139
Target Start/End: Original strand, 46879496 - 46879605
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaa 129  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  46879496 taataagggtaaaattgaaattaaaagtaagaagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcctgaaa 46879595  T
Q  130 taagctataa 139  Q
    ||||||||||    
T  46879596 taagctataa 46879605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 78; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 47587082 - 47587213
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  47587082 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 47587174  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||    
T  47587175 aataagctataagctcatggtg-aaaagtgttaccaaaca 47587213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 11466047 - 11466148
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||    
T  11466047 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagttcgtgaaataagctataagctcatggttaaaaagtattaccaaa 11466146  T
Q  166 ca 167  Q
    ||    
T  11466147 ca 11466148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 69; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 1342958 - 1342822
Alignment:
Q  31 aataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaat 130  Q
    ||||||| ||||| |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1342958 aataaggataaaaatggaagaaaacatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagcttctgaaat 1342859  T
Q  131 aagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||| ||| |  | |||||| |||||||||||    
T  1342858 aagctataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaaca 1342822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 86 - 167
Target Start/End: Original strand, 21316612 - 21316693
Alignment:
Q  86 ctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  21316612 ctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttatgaaataagctataagctcatagtgaaaaagtgttaccaaaca 21316693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 40893551 - 40893446
Alignment:
Q  34 aagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 133  Q
    |||||||||  |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40893551 aagggtaaagatggaagaaaaaatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaaataggttctaaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 40893452  T
Q  134 ctataa 139  Q
    ||||||    
T  40893451 ctataa 40893446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 66 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 35000859 - 35000773
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaa 152  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  35000859 ataagctataagctcaaacgctacttggaatagcatctgaaaaatagtttataaacttgtgaaataagctataagctcctgatgaaa 35000773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 217
Target Start/End: Original strand, 36612082 - 36612267
Alignment:
Q  29 ataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaa 128  Q
    ||||||||| ||||| |||||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||| ||||||||||||||| ||  ||||    
T  36612082 ataataaggataaaaatggaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctaaaaaatagcttataaactcctgaa 36612181  T
Q  129 ataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggt 217  Q
    |||||||| || ||| |  | |||||| ||||||||||| ||         |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36612182 ataagctaaaagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaacataa---ctttttgtcagacgagcttataagctataagctcttttttgggt 36612267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 39699026 - 39698930
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||       ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39699026 tttagttagaataataagggtaaaattgaaattaaaagtgagaagctata-------agctcaaatgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttgta 39698934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 66 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 46757857 - 46757691
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| ||| |  | |||||| |||||||||    
T  46757857 ataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagttataagctcgttgtaaaaaagcgttaccaaa 46757758  T
Q  166 caaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    || |          |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||    
T  46757757 cagagcttttttttgtcagacgagcttataagctataagctc-tttttgggagttaccaatcagaccc 46757691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 230
Target Start/End: Original strand, 21740126 - 21740316
Alignment:
Q  38 gtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||| ||| ||  | ||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21740126 gtaaaactggaattaaaagtgagacactataagctataag-tcaaacgctatttcaagtagtttctgaaaaatagcttataaacttctgaaataagctat 21740224  T
Q  138 aaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggtgttatcaaacaga 230  Q
    || ||  |  | |||||| ||||||||||| |           ||| | || ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21740225 aagcttgttgtaaaaaagcgttaccaaacagagcttttttta-tcagatgaacttataagctataagttcttttttgggtgttatcaaacaga 21740316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Original strand, 791336 - 791414
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||    
T  791336 aagctataagctataagttcaaacgctacttgtaatagcatctgaaaaatagcttataagctcataaaataagctataa 791414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Original strand, 19757519 - 19757597
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  19757519 aagctataagctataagctcaaacgctacttgaagtagcttttgaaaaatagcttataagctcctgaattaagctataa 19757597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 22642259 - 22642360
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||  |||||| ||||||| | | ||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||  |||||||||    
T  22642259 ataagctataagctcaaatgctacttagaatagcgtttaaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcgtggtgaaaaaccgttaccaaa 22642358  T
Q  166 ca 167  Q
    ||    
T  22642359 ca 22642360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 30 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24170959 - 24170867
Alignment:
Q  30 taataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||||||||||  | |||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  24170959 taataagggtagtattggaagaaaaagtgataagctataagttataagctcaagcactacttggaataatgtctgaaaaatagcttataagct 24170867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 108 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 32168938 - 32168879
Alignment:
Q  108 aatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  32168938 aatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 32168879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 66 - 139
Target Start/End: Original strand, 27869570 - 27869643
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  27869570 ataagctataaactcaaacgctacttggaataacgtccgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataa 27869643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24170856 - 24170803
Alignment:
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaa 154  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24170856 tctgaaaaatagcttataagctcatgaaataagctataaactcatggtgaaaaa 24170803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 181 - 234
Target Start/End: Original strand, 38531312 - 38531365
Alignment:
Q  181 tcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggtgttatcaaacagacccg 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  38531312 tcaaacgagcttataagctataagctcttttttaggtgttaccaaacaaacccg 38531365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 66 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 45672441 - 45672387
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 120  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||    
T  45672441 ataaactataagctcaaacgctacttgaaataacgtctgaaaaatagcttataag 45672387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 66 - 167
Target Start/End: Original strand, 7884691 - 7884788
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaa 165  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| |||    ||| || ||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||| ||||    
T  7884691 ataagctataagctcaaacgctacttagaatagcttcacaaaaataactt----gctcgtaaaatacgctataagttcatggtgaaaaagtattaacaaa 7884786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 32168997 - 32168953
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagct 72  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  32168997 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct 32168953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 68 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 47584237 - 47584185
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataag 120  Q
    ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  47584237 aagctataaactcaaacgctatttggaataacttctgaaaaatagtttataag 47584185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 199 - 233
Target Start/End: Original strand, 19757670 - 19757704
Alignment:
Q  199 tataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19757670 tataagctcttttttggatgttatcaaacagaccc 19757704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 22779 - 22640
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22779 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtga 22680  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  22679 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 22640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 108; Significance: 9e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 126722 - 126861
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  126722 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaagcgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 126821  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  126822 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 126861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 104; Significance: 2e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 12679 - 12818
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |    
T  12679 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataacctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtca 12778  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12779 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 12818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0246 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0246
Description:

Target: scaffold0246; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 7241 - 7102
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||| ||||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  7241 aataataaggataaaattggaagaaatagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctaaaaaatagcttataagctcgtga 7142  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  7141 aataagctataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 7102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 100; Significance: 5e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 431442 - 431303
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||| ||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  431442 aataataaaggtaaaatttgaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctatttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 431343  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  431342 aataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 431303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Original strand, 119238 - 119342
Alignment:
Q  65 tataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaa 164  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |  | ||||| |||||| ||    
T  119238 tataagctataagctcaaactctacttggaataggatctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcgttgtaaaaaactgttactaa 119337  T
Q  165 acaaa 169  Q
    |||||    
T  119338 acaaa 119342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 95; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 217
Target Start/End: Original strand, 93348 - 93536
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  93348 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttatgaaaaatagcttataagctcgtga 93447  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaacaaaannnnnnnnngtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggt 217  Q
    |||||||||||| |||||| |   ||||||||| ||||| | |         ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  93448 aataagctataagctcatggttttaaagtgttatcaaac-agagctttttttgtcaaacgagcttataagctaaaagctcttttttgggt 93536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 84402 - 84320
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgat 148  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||    
T  84402 ataagttataagctcaaacgctacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctataagctcgtgat 84320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1632 (Bit Score: 92; Significance: 3e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1632
Description:

Target: scaffold1632; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 167
Target Start/End: Original strand, 23 - 138
Alignment:
Q  52 aaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaa 151  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| | ||    
T  23 aaaaatgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtcaa 122  T
Q  152 aaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||    
T  123 aaagtgttaccaaaca 138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 28038 - 28186
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28038 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 28137  T
Q  128 a---------ataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |         ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||    
T  28138 aaaatagcttataagctataagctcatggtgaaaaagtgttatcaaaca 28186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 68 - 167
Target Start/End: Original strand, 30179 - 30278
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  30179 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 30278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 82; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Original strand, 52990 - 53122
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||       ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  52990 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagc-------tataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtga 53082  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  53083 aataggctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 53122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 80; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 192197 - 192058
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    ||||| |||||||||| |||||  ||||   | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  192197 aataacaagggtaaaagtggaagaaaaaacaataagctataagctataagctcaaaagctacttggaatagcttctcaaaaatagcttataagctcgtga 192098  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  192097 aataagctataagctcatggtgaaaaagtattaccaaaca 192058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 79; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 122
Target Start/End: Original strand, 41727 - 41821
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 122  Q
    |||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41727 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacgctacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagct 41821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0362 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0362
Description:

Target: scaffold0362; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 5585 - 5454
Alignment:
Q  28 aataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtga 127  Q
    |||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||       ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  5585 aataataagggtaaaattggaagaaaaagtgagaagctataagct-------caaacgctacttggaatagcttctgaaaaataacttataagctcgtga 5493  T
Q  128 aataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    |||||| ||||| |||||| | ||||||||||||||||||    
T  5492 aataag-tataagctcatggtaaaaaagtgttaccaaaca 5454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 90 - 167
Target Start/End: Original strand, 27158 - 27235
Alignment:
Q  90 ttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaaagtgttaccaaaca 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  27158 ttggaatagcttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagctataagctcatggtgaaaaagtgttaccaaaca 27235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0041 (Bit Score: 66; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0041
Description:

Target: scaffold0041; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 34 - 139
Target Start/End: Original strand, 72733 - 72838
Alignment:
Q  34 aagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 133  Q
    |||||||||  |||||  |||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  72733 aagggtaaagatggaagaaaaaatgataagctataagctataagctcaaacgctacttgaaataggttctaaaaaatagcttataagcttgtgaaataag 72832  T
Q  134 ctataa 139  Q
    ||||||    
T  72833 ctataa 72838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0343 (Bit Score: 60; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0343
Description:

Target: scaffold0343; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 66 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 9376 - 9305
Alignment:
Q  66 ataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  9376 ataagctataagctcaaacactacttgaaatagcttctgaaaaatagtttataagctcgtgaaataagctat 9305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 68 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 4636 - 4565
Alignment:
Q  68 aagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  4636 aagctataagctcaaacgctacttggaataacttctgaaaaatagcttataagctcgtgaaataagttataa 4565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 61 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 10914 - 10836
Alignment:
Q  61 aagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataa 139  Q
    ||||||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  10914 aagctataaaccgtaagctcaaacgctatttggaatagcgtctgaaaaatagcttataaactcgtgaaataagctataa 10836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1360 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1360
Description:

Target: scaffold1360; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 122
Target Start/End: Original strand, 1198 - 1301
Alignment:
Q  19 tttagttagaataataagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagcttctgaaaaatagcttata 118  Q
    ||||| || |||||||||||||||| || ||  |||  ||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| | | |||||||| ||| |||    
T  1198 tttagataaaataataagggtaaaaatgaaagaaaatatgataagctataagctataagctcaaatgctacttgaaataacgtttgaaaaatggctcata 1297  T
Q  119 agct 122  Q
    ||||    
T  1298 agct 1301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 153
Target Start/End: Original strand, 8997 - 9049
Alignment:
Q  101 tctgaaaaatagcttataagcttgtgaaataagctataaactcatgatgaaaa 153  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||| || ||||||    
T  8997 tctgaaaaatagcttataaacttgtgaaataaactataagctcgtggtgaaaa 9049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 76432 - 76365
Alignment:
Q  34 aagggtaaaactggaattaaaagtgagaagctataagctataagctcaaacactacttggaatagctt 101  Q
    |||| ||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||| ||||||    
T  76432 aaggttaaaaatggaataaaatgtgaaaagctataagctataagttgaaaaactacttggattagctt 76365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 180 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 50426 - 50373
Alignment:
Q  180 gtcaaacgagcttattagctataagctcttttttgggtgttatcaaacagaccc 233  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||  ||| ||| |||||||||||    
T  50426 gtcaaacgagcttataagctataagctcattttcaggtcttaccaaacagaccc 50373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University