View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11838_low_2 (Length: 245)

Name: NF11838_low_2
Description: NF11838
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11838_low_2
NF11838_low_2
[»] chr3 (61 HSPs)
chr3 (2-227)||(16626470-16626695)
chr3 (2-230)||(18530457-18530685)
chr3 (4-223)||(5652458-5652677)
chr3 (2-232)||(32292821-32293051)
chr3 (2-232)||(31034076-31034306)
chr3 (9-222)||(4626020-4626233)
chr3 (9-222)||(17993753-17993966)
chr3 (2-222)||(5713296-5713516)
chr3 (2-222)||(5724206-5724426)
chr3 (2-222)||(5757051-5757271)
chr3 (2-222)||(5767942-5768162)
chr3 (6-232)||(8296045-8296271)
chr3 (2-232)||(18051331-18051561)
chr3 (2-232)||(18330738-18330968)
chr3 (2-232)||(22387537-22387767)
chr3 (5-232)||(15741053-15741280)
chr3 (2-232)||(4796612-4796842)
chr3 (2-232)||(7073281-7073511)
chr3 (2-232)||(15892665-15892895)
chr3 (2-232)||(29148714-29148944)
chr3 (2-232)||(8301226-8301456)
chr3 (28-232)||(6192411-6192615)
chr3 (2-232)||(4416988-4417218)
chr3 (2-232)||(10396202-10396432)
chr3 (2-232)||(28115913-28116143)
chr3 (2-232)||(4721700-4721930)
chr3 (2-232)||(11110308-11110538)
chr3 (2-232)||(35880835-35881065)
chr3 (2-232)||(5467054-5467284)
chr3 (2-232)||(8211807-8212037)
chr3 (10-232)||(29664929-29665151)
chr3 (2-232)||(48465996-48466226)
chr3 (2-232)||(4346646-4346876)
chr3 (25-232)||(28021367-28021574)
chr3 (6-232)||(18277011-18277237)
chr3 (6-232)||(18292312-18292538)
chr3 (6-232)||(18307613-18307839)
chr3 (10-232)||(20576806-20577028)
chr3 (2-232)||(21674762-21674992)
chr3 (2-232)||(22870815-22871045)
chr3 (2-232)||(22885874-22886104)
chr3 (2-232)||(36997036-36997266)
chr3 (2-232)||(51782092-51782322)
chr3 (2-232)||(31964432-31964662)
chr3 (2-232)||(50134030-50134260)
chr3 (10-201)||(20066120-20066311)
chr3 (10-201)||(32439231-32439422)
chr3 (25-232)||(51797205-51797412)
chr3 (2-232)||(5596316-5596546)
chr3 (2-232)||(5609281-5609511)
chr3 (2-232)||(6542421-6542651)
chr3 (2-232)||(17984915-17985145)
chr3 (2-232)||(28339371-28339601)
chr3 (2-232)||(5013781-5014011)
chr3 (2-232)||(18242808-18243038)
chr3 (2-232)||(47023522-47023752)
chr3 (2-232)||(18225260-18225490)
chr3 (2-232)||(24328228-24328458)
chr3 (2-232)||(7996631-7996861)
chr3 (2-232)||(10643139-10643369)
chr3 (10-98)||(4893287-4893375)
[»] chr4 (25 HSPs)
chr4 (2-227)||(15284851-15285076)
chr4 (2-230)||(15227993-15228221)
chr4 (2-245)||(1900380-1900623)
chr4 (9-222)||(24460533-24460746)
chr4 (7-227)||(14235448-14235668)
chr4 (4-197)||(15391291-15391484)
chr4 (2-232)||(17014123-17014353)
chr4 (2-232)||(24592232-24592462)
chr4 (2-232)||(14665141-14665371)
chr4 (2-232)||(5005996-5006226)
chr4 (2-232)||(36344433-36344663)
chr4 (2-232)||(6569976-6570206)
chr4 (2-232)||(14763222-14763452)
chr4 (2-232)||(18800531-18800761)
chr4 (2-232)||(40105556-40105786)
chr4 (4-232)||(31126436-31126664)
chr4 (4-232)||(33673716-33673944)
chr4 (10-201)||(34188909-34189100)
chr4 (2-232)||(14098664-14098894)
chr4 (4-232)||(54833512-54833740)
chr4 (10-201)||(24112793-24112984)
chr4 (10-232)||(21969832-21970054)
chr4 (2-232)||(27163235-27163465)
chr4 (2-232)||(30753877-30754107)
chr4 (10-232)||(39850769-39850991)
[»] chr2 (42 HSPs)
chr2 (2-227)||(19456333-19456558)
chr2 (2-230)||(21703073-21703301)
chr2 (2-223)||(27118792-27119013)
chr2 (2-232)||(34303210-34303440)
chr2 (9-222)||(3784765-3784978)
chr2 (9-222)||(16163710-16163923)
chr2 (9-222)||(34157122-34157334)
chr2 (4-227)||(27393075-27393298)
chr2 (2-222)||(31891245-31891465)
chr2 (2-232)||(40233615-40233845)
chr2 (10-232)||(9349889-9350111)
chr2 (2-232)||(27434351-27434581)
chr2 (2-232)||(23128473-23128703)
chr2 (2-232)||(28882318-28882548)
chr2 (2-232)||(12655646-12655876)
chr2 (6-232)||(20838026-20838252)
chr2 (2-232)||(22925935-22926165)
chr2 (10-232)||(12586922-12587144)
chr2 (10-232)||(13936451-13936673)
chr2 (2-232)||(37375265-37375495)
chr2 (2-232)||(16829245-16829475)
chr2 (2-232)||(16892006-16892236)
chr2 (10-232)||(27777334-27777556)
chr2 (10-232)||(27817092-27817314)
chr2 (4-232)||(32049904-32050132)
chr2 (4-232)||(37925599-37925827)
chr2 (6-232)||(260660-260886)
chr2 (2-232)||(11635093-11635323)
chr2 (2-232)||(11641282-11641512)
chr2 (10-232)||(12716509-12716731)
chr2 (2-232)||(21677089-21677319)
chr2 (2-232)||(31876385-31876615)
chr2 (2-232)||(34861784-34862014)
chr2 (2-232)||(37685816-37686046)
chr2 (2-232)||(37701081-37701311)
chr2 (10-232)||(39051729-39051951)
chr2 (10-229)||(27803819-27804038)
chr2 (2-197)||(34286458-34286653)
chr2 (2-197)||(34291518-34291713)
chr2 (2-232)||(39890178-39890408)
chr2 (2-113)||(34279553-34279664)
chr2 (2-232)||(19416406-19416636)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (2-232)||(2576-2806)
[»] chr6 (48 HSPs)
chr6 (2-232)||(22456795-22457025)
chr6 (2-232)||(14143146-14143376)
chr6 (2-232)||(26788049-26788279)
chr6 (2-232)||(27196422-27196652)
chr6 (2-232)||(27252588-27252818)
chr6 (9-222)||(28162769-28162982)
chr6 (9-222)||(33374127-33374340)
chr6 (9-227)||(13521939-13522157)
chr6 (9-222)||(8892182-8892394)
chr6 (9-222)||(8903417-8903629)
chr6 (2-232)||(27290231-27290461)
chr6 (2-125)||(22477241-22477364)
chr6 (2-232)||(22934741-22934971)
chr6 (2-232)||(23857186-23857416)
chr6 (2-232)||(27272441-27272671)
chr6 (2-227)||(20160806-20161031)
chr6 (2-227)||(22171800-22172025)
chr6 (2-232)||(26918485-26918715)
chr6 (2-229)||(16749959-16750186)
chr6 (2-232)||(26989106-26989336)
chr6 (2-232)||(13298812-13299042)
chr6 (2-232)||(24304479-24304709)
chr6 (2-232)||(24863822-24864052)
chr6 (2-232)||(29549580-29549810)
chr6 (2-218)||(27000178-27000394)
chr6 (2-232)||(15424178-15424408)
chr6 (2-233)||(27359852-27360083)
chr6 (2-233)||(27450195-27450426)
chr6 (2-232)||(4757869-4758099)
chr6 (2-232)||(4773111-4773341)
chr6 (2-232)||(16674244-16674474)
chr6 (2-232)||(27007832-27008062)
chr6 (2-232)||(29573118-29573348)
chr6 (2-232)||(4545636-4545866)
chr6 (2-232)||(30557877-30558107)
chr6 (2-232)||(34463207-34463437)
chr6 (2-232)||(3696186-3696416)
chr6 (2-232)||(4525391-4525621)
chr6 (2-232)||(4723995-4724225)
chr6 (106-232)||(17092301-17092427)
chr6 (2-232)||(28207559-28207789)
chr6 (2-232)||(16943888-16944118)
chr6 (10-232)||(17025390-17025612)
chr6 (2-232)||(26116271-26116501)
chr6 (2-232)||(29501520-29501750)
chr6 (2-233)||(26777475-26777706)
chr6 (4-232)||(27044494-27044723)
chr6 (2-232)||(27485234-27485464)
[»] chr1 (8 HSPs)
chr1 (2-232)||(20340253-20340483)
chr1 (2-230)||(16207951-16208179)
chr1 (2-230)||(20461188-20461416)
chr1 (10-232)||(28151977-28152199)
chr1 (4-232)||(51638327-51638555)
chr1 (2-232)||(10962777-10963007)
chr1 (2-232)||(28585088-28585318)
chr1 (2-232)||(41793226-41793456)
[»] chr7 (36 HSPs)
chr7 (2-230)||(16041432-16041660)
chr7 (2-224)||(16449810-16450032)
chr7 (2-232)||(26484803-26485033)
chr7 (9-222)||(31088278-31088491)
chr7 (9-222)||(45733576-45733789)
chr7 (2-224)||(2108817-2109039)
chr7 (2-232)||(2775468-2775698)
chr7 (2-232)||(39210827-39211057)
chr7 (28-232)||(26682804-26683008)
chr7 (28-232)||(4200682-4200886)
chr7 (1-234)||(5128100-5128333)
chr7 (2-232)||(2154682-2154912)
chr7 (2-231)||(16518221-16518450)
chr7 (2-232)||(10916672-10916902)
chr7 (2-232)||(11424580-11424810)
chr7 (2-231)||(16503185-16503414)
chr7 (2-232)||(26274898-26275128)
chr7 (2-232)||(3445415-3445645)
chr7 (2-232)||(26435366-26435596)
chr7 (2-232)||(4144927-4145157)
chr7 (2-232)||(5147144-5147374)
chr7 (2-232)||(11441681-11441911)
chr7 (2-232)||(24592345-24592575)
chr7 (2-232)||(31564194-31564424)
chr7 (2-232)||(26319673-26319903)
chr7 (2-232)||(26537674-26537904)
chr7 (2-232)||(9618760-9618990)
chr7 (2-232)||(26669718-26669948)
chr7 (2-232)||(45387452-45387682)
chr7 (10-201)||(18540916-18541107)
chr7 (2-232)||(16736264-16736494)
chr7 (2-232)||(16751318-16751548)
chr7 (2-232)||(17523641-17523871)
chr7 (2-232)||(17529344-17529574)
chr7 (2-232)||(31125029-31125259)
chr7 (10-201)||(5159636-5159827)
[»] chr5 (51 HSPs)
chr5 (2-230)||(22888587-22888815)
chr5 (2-230)||(25199146-25199374)
chr5 (2-232)||(29888897-29889127)
chr5 (9-222)||(13184473-13184686)
chr5 (9-222)||(13440319-13440532)
chr5 (2-232)||(23892323-23892553)
chr5 (9-227)||(33877371-33877589)
chr5 (9-222)||(11325918-11326131)
chr5 (2-232)||(24687972-24688202)
chr5 (2-232)||(9548358-9548588)
chr5 (2-232)||(33777604-33777834)
chr5 (2-232)||(23752265-23752495)
chr5 (2-232)||(22998929-22999159)
chr5 (2-232)||(30934750-30934980)
chr5 (2-232)||(11549471-11549701)
chr5 (2-232)||(15658575-15658805)
chr5 (2-232)||(23717803-23718033)
chr5 (2-232)||(24970135-24970365)
chr5 (2-232)||(28649352-28649582)
chr5 (2-232)||(37671298-37671528)
chr5 (2-232)||(9317568-9317798)
chr5 (2-232)||(12132272-12132502)
chr5 (2-232)||(30152135-30152365)
chr5 (2-232)||(31431557-31431787)
chr5 (2-232)||(31826222-31826452)
chr5 (2-233)||(32599286-32599517)
chr5 (10-232)||(13324644-13324866)
chr5 (2-232)||(18375227-18375457)
chr5 (2-224)||(18500553-18500775)
chr5 (2-232)||(33516473-33516703)
chr5 (2-232)||(37358458-37358688)
chr5 (2-232)||(43078369-43078599)
chr5 (2-232)||(8665290-8665520)
chr5 (2-232)||(15758672-15758902)
chr5 (10-232)||(24681565-24681787)
chr5 (10-232)||(24724092-24724314)
chr5 (2-232)||(26480509-26480739)
chr5 (2-232)||(29966881-29967111)
chr5 (2-232)||(30029532-30029762)
chr5 (10-232)||(40473364-40473586)
chr5 (2-232)||(2511168-2511398)
chr5 (2-232)||(3789658-3789888)
chr5 (2-232)||(6874422-6874652)
chr5 (2-232)||(30168586-30168816)
chr5 (2-232)||(37755097-37755327)
chr5 (2-232)||(37770802-37771032)
chr5 (10-201)||(33292650-33292841)
chr5 (2-201)||(41674826-41675025)
chr5 (2-232)||(5638027-5638257)
chr5 (2-232)||(34616635-34616865)
chr5 (2-233)||(28959600-28959831)
[»] scaffold0415 (2 HSPs)
scaffold0415 (2-230)||(1838-2065)
scaffold0415 (2-224)||(6120-6344)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (2-230)||(20496-20723)
scaffold0124 (2-232)||(30560-30790)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (4-223)||(19658926-19659144)
chr8 (4-223)||(33244775-33244994)
chr8 (9-222)||(44563216-44563427)
chr8 (4-197)||(22080790-22080983)
chr8 (9-232)||(9354737-9354961)
chr8 (2-232)||(16283557-16283787)
chr8 (2-232)||(18710694-18710924)
chr8 (2-232)||(19688206-19688436)
chr8 (2-232)||(27608782-27609012)
chr8 (2-232)||(16277662-16277892)
chr8 (2-232)||(14557732-14557962)
chr8 (2-232)||(2137136-2137366)
chr8 (56-232)||(189256-189432)
chr8 (2-232)||(12092601-12092831)
chr8 (2-232)||(29829430-29829660)
chr8 (2-232)||(3329384-3329614)
chr8 (2-232)||(19674549-19674779)
chr8 (2-232)||(31489627-31489857)
chr8 (2-232)||(19208237-19208467)
chr8 (2-232)||(28361832-28362062)
chr8 (2-232)||(31354632-31354862)
chr8 (4-232)||(19286572-19286800)
chr8 (2-232)||(33258831-33259061)
[»] scaffold0558 (1 HSPs)
scaffold0558 (2-177)||(1-176)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (6-197)||(21673-21864)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (40-232)||(536-728)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (2-232)||(46903-47133)
scaffold0089 (2-232)||(39987-40217)
scaffold0089 (2-232)||(29871-30101)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (2-232)||(47-277)
[»] scaffold0143 (1 HSPs)
scaffold0143 (2-231)||(27400-27629)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (2-232)||(9674-9904)
[»] scaffold0350 (1 HSPs)
scaffold0350 (2-232)||(7157-7387)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (2-232)||(14848-15078)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (2-232)||(8984-9214)
scaffold0159 (2-232)||(20123-20353)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (2-232)||(8057-8287)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (25-232)||(26119-26326)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (133-188)||(46764-46819)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 198; Significance: 1e-108; HSPs: 61)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16626695 - 16626470
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16626695 atccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 16626596  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16626595 aaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtccttgacaatcctcttccgaatcacactgctgtgaacatgattgag 16626496  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  16626495 gtatatgaggaagctcccagacttga 16626470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 18530457 - 18530685
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530457 atccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 18530556  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18530557 aaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcgtgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 18530656  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgt 230  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  18530657 gtatatgagggagctcccagacttaatgt 18530685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 5652458 - 5652677
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  5652458 ccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaa 5652557  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5652558 aaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacatgattgaggt 5652657  T
Q  204 atatgaggaagctcccagac 223  Q
    || |||||||||||||||||    
T  5652658 atgtgaggaagctcccagac 5652677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 32292821 - 32293051
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  32292821 atccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgt 32292920  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32292921 gaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 32293020  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  32293021 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 32293051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31034306 - 31034076
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31034306 atccgttacctcctaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgt 31034207  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31034206 gaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 31034107  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  31034106 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 31034076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 4626020 - 4626233
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  4626020 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 4626119  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4626120 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 4626219  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    || |||||||||||    
T  4626220 agaaagctcccaga 4626233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 17993966 - 17993753
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  17993966 gcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 17993867  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17993866 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 17993767  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  17993766 aggaagctcccaga 17993753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 5713296 - 5713516
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5713296 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5713395  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5713396 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 5713495  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5713496 gtatatgaggaagctcccaga 5713516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Original strand, 5724206 - 5724426
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5724206 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5724305  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5724306 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 5724405  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5724406 gtatatgaggaagctcccaga 5724426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5757271 - 5757051
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5757271 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5757172  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5757171 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 5757072  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5757071 gtatatgaggaagctcccaga 5757051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5768162 - 5767942
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5768162 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5768063  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5768062 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 5767963  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  5767962 gtatatgaggaagctcccaga 5767942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 8296045 - 8296271
Alignment:
Q  6 gttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaa 105  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||     
T  8296045 gttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 8296144  T
Q  106 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 205  Q
    ||||||||  | |||||||| || || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||    
T  8296145 aagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtat 8296244  T
Q  206 atgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     |||||||||||| |||||||||||||    
T  8296245 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8296271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 18051331 - 18051561
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||| ||||||||||||||   || || ||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  18051331 atccgctgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttctatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 18051430  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  18051431 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaa 18051530  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||| ||||||| |||||||||||||    
T  18051531 gtatgtgagaaagctcctagacttgatgtcc 18051561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 18330738 - 18330968
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  18330738 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgt 18330837  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  18330838 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 18330937  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18330938 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18330968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22387767 - 22387537
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  22387767 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 22387668  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  22387667 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 22387568  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22387567 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22387537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15741280 - 15741053
Alignment:
Q  5 cgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaa 104  Q
    |||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || || ||    
T  15741280 cgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgtgaa 15741181  T
Q  105 aaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggta 204  Q
     ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||    
T  15741180 gaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagta 15741081  T
Q  205 tatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15741080 tgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15741053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4796842 - 4796612
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  4796842 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 4796743  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  4796742 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 4796643  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  4796642 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4796612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 7073281 - 7073511
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  7073281 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 7073380  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||     
T  7073381 gaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaa 7073480  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  7073481 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 7073511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15892895 - 15892665
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||| |||||||||||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  15892895 atcctttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 15892796  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  15892795 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 15892696  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15892695 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15892665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29148944 - 29148714
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  29148944 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 29148845  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  29148844 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 29148745  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  29148744 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29148714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8301456 - 8301226
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  8301456 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtagaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 8301357  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  8301356 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 8301257  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  8301256 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8301226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 6192411 - 6192615
Alignment:
Q  28 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 127  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||||||      
T  6192411 gacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggaaagc 6192510  T
Q  128 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 227  Q
    | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| || |||| |||||||||||| ||||||||    
T  6192511 tgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttga 6192610  T
Q  228 tgtcc 232  Q
    |||||    
T  6192611 tgtcc 6192615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 4416988 - 4417218
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  4416988 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 4417087  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  4417088 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 4417187  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4417188 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4417218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 10396202 - 10396432
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  10396202 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 10396301  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  10396302 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacctttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 10396401  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  10396402 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10396432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28116143 - 28115913
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  28116143 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 28116044  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  28116043 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacatttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 28115944  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  28115943 gtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 28115913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 4721700 - 4721930
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||| ||||||| ||||||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||| |||||||||| || ||    
T  4721700 atccgctgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacactttgaagtatatcgt 4721799  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     ||||| |||||  | ||||||||  | || ||| |||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||     
T  4721800 gaaaaatctcattgatcaaggaaagctgactttttagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaa 4721899  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| ||||| |||||||    
T  4721900 gtatgtgaggaagctcctagactcgatgtcc 4721930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11110538 - 11110308
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  11110538 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 11110439  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||     
T  11110438 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaa 11110339  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  11110338 gtgtgtgaggaagctccaagacttgatgtcc 11110308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 35880835 - 35881065
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||| ||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  35880835 atccgctgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 35880934  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  35880935 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 35881034  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  35881035 gtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 35881065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 5467054 - 5467284
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5467054 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5467153  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||| | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  5467154 gaagaagctcattgatcaagggaaactgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 5467253  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  5467254 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5467284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 8211807 - 8212037
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  8211807 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 8211906  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  8211907 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 8212006  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  8212007 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8212037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29665151 - 29664929
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  29665151 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 29665052  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || || | |||    
T  29665051 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 29664952  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  29664951 ggaagctcctagacttgatgtcc 29664929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 48465996 - 48466226
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  48465996 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 48466095  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  48466096 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 48466195  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  48466196 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 48466226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4346876 - 4346646
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  4346876 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 4346777  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  4346776 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 4346677  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4346676 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4346646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 28021367 - 28021574
Alignment:
Q  25 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 124  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||| ||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  28021367 tctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggttatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcattgatcaaggga 28021466  T
Q  125 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 224  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||||||||||| |||||    
T  28021467 agctgacttttgagaataatgtcccccacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagact 28021566  T
Q  225 tgatgtcc 232  Q
    ||||||||    
T  28021567 tgatgtcc 28021574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18277237 - 18277011
Alignment:
Q  6 gttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaa 105  Q
    ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || ||     
T  18277237 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 18277138  T
Q  106 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 205  Q
    ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || |    
T  18277137 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18277038  T
Q  206 atgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     |||||||||||| |||||||||||||    
T  18277037 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18277011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18292538 - 18292312
Alignment:
Q  6 gttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaa 105  Q
    ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || ||     
T  18292538 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 18292439  T
Q  106 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 205  Q
    ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || |    
T  18292438 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18292339  T
Q  206 atgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     |||||||||||| |||||||||||||    
T  18292338 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18292312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18307839 - 18307613
Alignment:
Q  6 gttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaa 105  Q
    ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || ||     
T  18307839 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 18307740  T
Q  106 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 205  Q
    ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || || |    
T  18307739 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 18307640  T
Q  206 atgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     |||||||||||| |||||||||||||    
T  18307639 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18307613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20577028 - 20576806
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  20577028 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 20576929  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  20576928 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 20576829  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  20576828 ggaagctcctagacttgatgtcc 20576806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 21674762 - 21674992
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  21674762 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 21674861  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||    || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  21674862 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgctccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 21674961  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  21674962 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 21674992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22871045 - 22870815
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  22871045 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 22870946  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  22870945 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 22870846  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  22870845 gtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 22870815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22886104 - 22885874
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  22886104 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 22886005  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  22886004 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 22885905  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  22885904 gtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 22885874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36997266 - 36997036
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  36997266 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 36997167  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  ||||  |||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  36997166 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccatatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 36997067  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  36997066 gtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 36997036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 51782092 - 51782322
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  51782092 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 51782191  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  51782192 gaagaagctcatcgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 51782291  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  51782292 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51782322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31964662 - 31964432
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  31964662 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 31964563  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  31964562 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31964463  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  31964462 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31964432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 50134260 - 50134030
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  50134260 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 50134161  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  50134160 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 50134061  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  50134060 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 50134030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 20066120 - 20066311
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||    
T  20066120 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 20066219  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    | ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  20066220 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatatgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 20066311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 32439231 - 32439422
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||    
T  32439231 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 32439330  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    | ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  32439331 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 32439422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Original strand, 51797205 - 51797412
Alignment:
Q  25 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 124  Q
    ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | || ||||    
T  51797205 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcagggaa 51797304  T
Q  125 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 224  Q
    |  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||||||||||| |||||    
T  51797305 agctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtgaggaagctcctagact 51797404  T
Q  225 tgatgtcc 232  Q
    ||||||||    
T  51797405 tgatgtcc 51797412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5596546 - 5596316
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5596546 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5596447  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  5596446 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 5596347  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  5596346 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5596316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5609511 - 5609281
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||    
T  5609511 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaagggtgttatgctttgaagtatatcgt 5609412  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  5609411 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 5609312  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||    
T  5609311 gtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 5609281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 6542651 - 6542421
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  6542651 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 6542552  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  6542551 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 6542452  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | | |||||||||| |||||||||||||    
T  6542451 gtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtcc 6542421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17985145 - 17984915
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  17985145 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgt 17985046  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  17985045 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 17984946  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  17984945 gtgtgtgaagaagctcctagacttgatgtcc 17984915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 28339371 - 28339601
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  28339371 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 28339470  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  28339471 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 28339570  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28339571 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28339601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 5013781 - 5014011
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5013781 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5013880  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  5013881 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 5013980  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  5013981 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5014011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 18242808 - 18243038
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  18242808 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 18242907  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  18242908 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 18243007  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18243008 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18243038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 47023522 - 47023752
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  47023522 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 47023621  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| ||     
T  47023622 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaa 47023721  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  47023722 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 47023752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 18225260 - 18225490
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  18225260 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 18225359  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| ||     
T  18225360 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaa 18225459  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| || ||||||||||    
T  18225460 gtgtgtgaagaagctcctaggcttgatgtcc 18225490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 24328228 - 24328458
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||    
T  24328228 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgt 24328327  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  24328328 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 24328427  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  24328428 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 24328458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 7996631 - 7996861
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||    
T  7996631 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgt 7996730  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  7996731 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 7996830  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| || ||||||||||    
T  7996831 gtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 7996861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 10643139 - 10643369
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||    
T  10643139 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgt 10643238  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  10643239 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 10643338  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| || ||||||||||    
T  10643339 gtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 10643369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 4893287 - 4893375
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacat 98  Q
    ||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  4893287 cctccaaggttccactctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacat 4893375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 25)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15285076 - 15284851
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15285076 atccgttgcctcccaggttccggtctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 15284977  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15284976 aaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgttgctgtgaacatgattgag 15284877  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttga 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  15284876 gtatgtgaggaagctcccagacttga 15284851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 15227993 - 15228221
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15227993 atccattgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcacgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 15228092  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || ||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15228093 gaagaagctcattgatcagggaaagttaacctttgagaataacgtccgtcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattggg 15228192  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgt 230  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||    
T  15228193 gtatatgagatagctcccagacttgatgt 15228221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 245
Target Start/End: Original strand, 1900380 - 1900623
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1900380 atccgttgcttctcaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacactttgaagtacattgt 1900479  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1900480 gaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaataatgtcccttatgtccttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 1900579  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtccatctcattgcaac 245  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||    
T  1900580 gtatatgaggaagctcccagactcgatgttcataacattgcaac 1900623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 24460746 - 24460533
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  24460746 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 24460647  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24460646 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatg 24460547  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  24460546 aggaagctcccaga 24460533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 7 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 14235668 - 14235448
Alignment:
Q  7 ttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaa 106  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |    
T  14235668 ttgcctcccaggttccatttcgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgagggatgttacgctttgaagttcattgtaaaga 14235569  T
Q  107 agctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtata 206  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  14235568 agctcatagaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcacgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagaccta 14235469  T
Q  207 tgaggaagctcccagacttga 227  Q
    ||| ||||||||||| |||||    
T  14235468 tgaagaagctcccagtcttga 14235448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 15391484 - 15391291
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15391484 ccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaa 15391385  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 197  Q
    | ||||||||  || | ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15391384 agaagctcattgactagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtgaacatgat 15391291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 17014123 - 17014353
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  17014123 atccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgt 17014222  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  17014223 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 17014322  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  17014323 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 17014353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24592462 - 24592232
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  24592462 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgt 24592363  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  24592362 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttcccaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 24592263  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24592262 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24592232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 14665141 - 14665371
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  14665141 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 14665240  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  14665241 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatatcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 14665340  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14665341 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14665371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 5005996 - 5006226
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5005996 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5006095  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| || || || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||| ||||| ||     
T  5006096 gaagaagctcatcgatcaagggaagttgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttctgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 5006195  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  5006196 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 5006226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 36344663 - 36344433
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  36344663 atccgttgcctccgaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 36344564  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  36344563 gaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 36344464  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  36344463 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 36344433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 6569976 - 6570206
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  6569976 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 6570075  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  6570076 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 6570175  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  6570176 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6570206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14763452 - 14763222
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  14763452 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 14763353  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  14763352 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 14763253  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  14763252 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14763222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18800761 - 18800531
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  18800761 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 18800662  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  18800661 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 18800562  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18800561 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18800531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40105786 - 40105556
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  40105786 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 40105687  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  40105686 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 40105587  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  40105586 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 40105556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31126664 - 31126436
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |    
T  31126664 ccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtga 31126565  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    | ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  31126564 agaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaggt 31126465  T
Q  204 atatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  31126464 gtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31126436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 33673944 - 33673716
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |    
T  33673944 ccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtga 33673845  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    | ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  33673844 agaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagt 33673745  T
Q  204 atatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  33673744 gtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 33673716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34189100 - 34188909
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||    
T  34189100 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggtgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 34189001  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    | ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  34189000 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 34188909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 14098664 - 14098894
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||    |||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  14098664 atccgttgcctccaaggttcaggactgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 14098763  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  14098764 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 14098863  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  14098864 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 14098894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 54833512 - 54833740
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |    
T  54833512 ccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtga 54833611  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    | || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  54833612 agaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagt 54833711  T
Q  204 atatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||    
T  54833712 gtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 54833740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 24112793 - 24112984
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||    
T  24112793 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 24112892  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    | ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24112893 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 24112984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 21969832 - 21970054
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  21969832 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 21969931  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||  | | |||    
T  21969932 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaaatgtgtga 21970031  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||| ||| |||||||||||||    
T  21970032 ggaagttcctagacttgatgtcc 21970054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27163465 - 27163235
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||    
T  27163465 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgt 27163366  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27163365 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27163266  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27163265 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27163235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 30753877 - 30754107
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  30753877 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30753976  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  30753977 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 30754076  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  30754077 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30754107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 39850769 - 39850991
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  39850769 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 39850868  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    || |  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  39850869 tcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaacccccttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 39850968  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  39850969 ggaagctcctagacttgatgtcc 39850991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 42)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 19456558 - 19456333
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19456558 atccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaagaatgctacgctttgaagtacattgt 19456459  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19456458 aaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgag 19456359  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttga 227  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  19456358 gtatgtgaggaagctcccagacttga 19456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21703301 - 21703073
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21703301 atccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcaaaggatgctacgctttgaagtacattgt 21703202  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21703201 gaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 21703102  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21703101 gtatatgaggaagctcccagactcgatgt 21703073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 223
Target Start/End: Original strand, 27118792 - 27119013
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  27118792 atccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt 27118891  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27118892 aaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtaaacatgattgag 27118991  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagac 223  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  27118992 gtatatgaggaagctcccagac 27119013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34303440 - 34303210
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||    
T  34303440 atccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgt 34303341  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||    
T  34303340 aaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaaacatgctgctataaacatgattgag 34303241  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34303240 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 34303210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 3784765 - 3784978
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  3784765 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 3784864  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3784865 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 3784964  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  3784965 aggaagctcccaga 3784978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 16163710 - 16163923
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  16163710 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatggcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 16163809  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16163810 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 16163909  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  16163910 aggaagctcccaga 16163923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 34157122 - 34157334
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  34157122 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa- 34157220  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34157221 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 34157320  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  34157321 aggaagctcccaga 34157334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 4 - 227
Target Start/End: Original strand, 27393075 - 27393298
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27393075 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaa 27393174  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    | ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||      
T  27393175 agaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgatcgagac 27393274  T
Q  204 atatgaggaagctcccagacttga 227  Q
     ||||| |||| |||||| |||||    
T  27393275 ttatgaagaagttcccagtcttga 27393298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 2 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31891465 - 31891245
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || |||||||| |||| |||||||||    
T  31891465 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgcgttgaggtacattgt 31891366  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31891365 aaaaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttaagaataacgtccctcacgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 31891266  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccaga 222  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31891265 gtatatgaggaagctcccaga 31891245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 40233615 - 40233845
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||    
T  40233615 atccgttgcctccaaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgt 40233714  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  40233715 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaaaatgatcgaa 40233814  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  40233815 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 40233845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9350111 - 9349889
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  9350111 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 9350012  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | ||||| ||  | || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9350011 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 9349912  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||| | ||||| ||||    
T  9349911 ggaagctcccggtcttgacgtcc 9349889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27434581 - 27434351
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  27434581 atccgttgcctcccaagttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 27434482  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  27434481 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 27434382  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27434381 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27434351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23128703 - 23128473
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  23128703 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 23128604  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  23128603 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 23128504  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23128503 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23128473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 28882318 - 28882548
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  28882318 atccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 28882417  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  28882418 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 28882517  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  28882518 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28882548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 12655646 - 12655876
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  12655646 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgt 12655745  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||     
T  12655746 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaa 12655845  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12655846 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12655876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Original strand, 20838026 - 20838252
Alignment:
Q  6 gttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaa 105  Q
    ||||||||||||||||   || ||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||     
T  20838026 gttgcctcccaggttcaggtccgaccttaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgtgaag 20838125  T
Q  106 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 205  Q
    ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| || ||||    
T  20838126 aagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatttgatcgaagtat 20838225  T
Q  206 atgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     |||||||||||| |||||||||||||    
T  20838226 gtgaggaagctcctagacttgatgtcc 20838252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22926165 - 22925935
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  22926165 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 22926066  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  22926065 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 22925966  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  22925965 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 22925935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 12586922 - 12587144
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || || || ||||    
T  12586922 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaaggatgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 12587021  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  12587022 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 12587121  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  12587122 ggaagctcctagacttgatgtcc 12587144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13936673 - 13936451
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || |||||||||||||| || || ||||    
T  13936673 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtacatcgtgaagaagc 13936574  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  13936573 tcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 13936474  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  13936473 ggaagctcctagacttgatgtcc 13936451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 37375265 - 37375495
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  37375265 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 37375364  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  37375365 gaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 37375464  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | || ||||||||| |||||||||||||    
T  37375465 gtgtgtggggaagctcctagacttgatgtcc 37375495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16829475 - 16829245
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  16829475 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16829376  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  16829375 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgag 16829276  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16829275 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16829245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 16892006 - 16892236
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  16892006 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16892105  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  16892106 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgag 16892205  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16892206 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16892236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 27777334 - 27777556
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  27777334 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 27777433  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  27777434 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 27777533  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  27777534 ggaagctcctagacttgatgtcc 27777556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 27817092 - 27817314
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  27817092 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 27817191  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  27817192 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 27817291  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  27817292 ggaagctcctagacttgatgtcc 27817314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 32049904 - 32050132
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |    
T  32049904 ccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtga 32050003  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    | ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||| ||    
T  32050004 agaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaagt 32050103  T
Q  204 atatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  32050104 gtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 32050132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 37925599 - 37925827
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || |||||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |    
T  37925599 ccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgacttccatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtga 37925698  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    | ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  37925699 agaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagt 37925798  T
Q  204 atatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  37925799 gtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37925827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 260886 - 260660
Alignment:
Q  6 gttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaa 105  Q
    ||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || ||     
T  260886 gttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaag 260787  T
Q  106 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 205  Q
    ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || |    
T  260786 aagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcaacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgt 260687  T
Q  206 atgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
      ||||||| ||| |||||||||||||    
T  260686 gcgaggaagttcctagacttgatgtcc 260660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11635323 - 11635093
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||    
T  11635323 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgt 11635224  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||  |  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  11635223 gaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 11635124  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  11635123 gtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11635093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11641512 - 11641282
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | |||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||    
T  11641512 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgttgaggggtgttatgctttgaagtacatcgt 11641413  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||  |  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  11641412 gaagaagcttgttgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 11641313  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  11641312 gtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11641282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12716731 - 12716509
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  12716731 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 12716632  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||    
T  12716631 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtga 12716532  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  12716531 ggaagctcctagacttgatgtcc 12716509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 21677319 - 21677089
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  21677319 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 21677220  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  21677219 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 21677120  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  21677119 gtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 21677089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 31876385 - 31876615
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  31876385 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 31876484  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  31876485 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31876584  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  31876585 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31876615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 34861784 - 34862014
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  34861784 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34861883  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  34861884 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 34861983  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| ||||| |||||||    
T  34861984 gtgtgtgaagaagctccgagactagatgtcc 34862014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37686046 - 37685816
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  37686046 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 37685947  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  37685946 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 37685847  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  37685846 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37685816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37701311 - 37701081
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  37701311 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 37701212  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  37701211 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatccttttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 37701112  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  37701111 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 37701081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39051951 - 39051729
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  39051951 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 39051852  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  39051851 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 39051752  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  39051751 ggaagctcctagacttgatgtcc 39051729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 229
Target Start/End: Original strand, 27803819 - 27804038
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  27803819 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggccatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 27803918  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  27803919 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 27804018  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatg 229  Q
    ||||||||| ||||||||||    
T  27804019 ggaagctcctagacttgatg 27804038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 34286458 - 34286653
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  34286458 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34286557  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 197  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || || ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34286558 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34286653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 197
Target Start/End: Original strand, 34291518 - 34291713
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  34291518 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcacgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34291617  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 197  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || || ||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  34291618 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgactttcgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgccgtgaatatgat 34291713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 39890178 - 39890408
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||    |||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||| ||||||| || ||    
T  39890178 atccgttgcctccaaggttcagggctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctctgaagtatatcgt 39890277  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  39890278 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 39890377  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  39890378 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39890408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 113
Target Start/End: Original strand, 34279553 - 34279664
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  34279553 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34279652  T
Q  102 aaaaaagctcat 113  Q
     || ||||||||    
T  34279653 gaagaagctcat 34279664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19416636 - 19416406
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || |||||||| || || ||    
T  19416636 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaaatatatcgt 19416537  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  19416536 gaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 19416437  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  19416436 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19416406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2806 - 2576
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2806 atccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 2707  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2706 gaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 2607  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2606 gtatatgaggaagctcccagacttgacgtcc 2576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 48)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22457025 - 22456795
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22457025 atccgttgcctcccaggttccgttcttacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgt 22456926  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22456925 gaagaagctcatagaccaaggaaagttaacttttgagaataatttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacgtgattgag 22456826  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22456825 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 22456795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 14143376 - 14143146
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14143376 atccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgt 14143277  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14143276 gaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 14143177  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14143176 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 14143146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 26788049 - 26788279
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26788049 atccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgt 26788148  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26788149 gaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 26788248  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26788249 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 26788279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 27196422 - 27196652
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27196422 atccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgt 27196521  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27196522 gaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 27196621  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27196622 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 27196652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27252818 - 27252588
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27252818 atccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgt 27252719  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  27252718 gaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 27252619  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  27252618 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 27252588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 28162769 - 28162982
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  28162769 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcggaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 28162868  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28162869 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 28162968  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  28162969 aggaagctcccaga 28162982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 33374340 - 33374127
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  33374340 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 33374241  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33374240 ctcatagaccaaggaaaattgacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 33374141  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  33374140 aggaagctcccaga 33374127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13522157 - 13521939
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||    
T  13522157 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaag 13522058  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13522057 ctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 13521958  T
Q  209 aggaagctcccagacttga 227  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  13521957 aggaagctcccggacttga 13521939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8892394 - 8892182
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  8892394 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa- 8892296  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8892295 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatg 8892196  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  8892195 aggaagctcccaga 8892182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 8903629 - 8903417
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  8903629 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa- 8903531  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8903530 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaagtatatg 8903431  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  8903430 aggaagctcccaga 8903417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27290461 - 27290231
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27290461 atccgttacctcccaagttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaagtacattgt 27290362  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| || |||||||||    
T  27290361 gaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcaacaatcttcttccgaatcatgctactgtaaatatgattgag 27290262  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27290261 gtatatgaggaagctcctagacttgatgtcc 27290231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 2 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 22477364 - 22477241
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22477364 atccgttgcctcccaggttccgttctaacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgt 22477265  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaa 125  Q
     || ||||||||| ||||||||||    
T  22477264 gaagaagctcatagaccaaggaaa 22477241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22934971 - 22934741
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  22934971 atccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 22934872  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  22934871 gaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 22934772  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22934771 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22934741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23857416 - 23857186
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  23857416 atccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 23857317  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  |||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  23857316 gaagaagctcattgatcaaggaaagctaacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 23857217  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23857216 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23857186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27272671 - 27272441
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||||| |||||||||||||   || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  27272671 atccgtcgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 27272572  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||  | ||||| ||  | ||||||||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  27272571 gaaaaagctcatcgatcaagggaagctgacctttgagaataatgttccgcatgtcctcgataatcctcttccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaa 27272472  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  27272471 gtatgtgaggtagctcctagacttgatgtcc 27272441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Original strand, 20160806 - 20161031
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  20160806 atccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgt 20160905  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||| ||||| | ||  | || || ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||     
T  20160906 gaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaa 20161005  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttga 227  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  20161006 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 20161031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 2 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22172025 - 22171800
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  22172025 atccgttacctcccaggttctgttccgatctcaagtgtgatttccaccaaggtgccttaggtcatgatgtggaagggtgctatgctttgaagtatattgt 22171926  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||| ||||| | ||  | || || ||||| ||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||     
T  22171925 gaaaaagctcatagaccaatggaagctgactttcgagaataacgtccctcatgttcttgacaatcctcttctgaatcatgctgttgtgaacatgatcgaa 22171826  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttga 227  Q
    || | |||||||||||| ||||||||    
T  22171825 gtgtgtgaggaagctcctagacttga 22171800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 26918485 - 26918715
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  26918485 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgt 26918584  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  26918585 gaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 26918684  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26918685 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26918715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 2 - 229
Target Start/End: Original strand, 16749959 - 16750186
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  16749959 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 16750058  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  16750059 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 16750158  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatg 229  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  16750159 gtatgtgaggaagctcctagacttgatg 16750186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 26989106 - 26989336
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  26989106 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 26989205  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    ||| ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  26989206 aaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 26989305  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  26989306 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26989336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13299042 - 13298812
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||| || ||    
T  13299042 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgacgtcgagggatgctacactttgaagtatatcgt 13298943  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  13298942 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 13298843  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13298842 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 13298812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24304709 - 24304479
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| || ||    
T  24304709 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgatttgaagtatatcgt 24304610  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  24304609 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 24304510  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24304509 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24304479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 24863822 - 24864052
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  24863822 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 24863921  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  24863922 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 24864021  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24864022 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24864052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 29549580 - 29549810
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  29549580 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 29549679  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||     
T  29549680 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgatcgaa 29549779  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||||||||||||  ||||||||||||    
T  29549780 gtgtgtgaggaagctcctggacttgatgtcc 29549810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 218
Target Start/End: Original strand, 27000178 - 27000394
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  27000178 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 27000277  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27000278 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27000377  T
Q  202 gtatatgaggaagctcc 218  Q
    |||| ||||||||||||    
T  27000378 gtatgtgaggaagctcc 27000394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15424408 - 15424178
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  15424408 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 15424309  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||  |     
T  15424308 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcaaa 15424209  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  15424208 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15424178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27360083 - 27359852
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  27360083 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgt 27359984  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27359983 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27359884  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcca 233  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27359883 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 27359852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27450426 - 27450195
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  27450426 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgt 27450327  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27450326 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27450227  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcca 233  Q
    || | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  27450226 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcca 27450195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 4757869 - 4758099
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  4757869 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgt 4757968  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  4757969 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 4758068  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4758069 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4758099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 4773111 - 4773341
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  4773111 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 4773210  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  4773211 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 4773310  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4773311 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4773341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 16674244 - 16674474
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  16674244 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16674343  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  16674344 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 16674443  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  16674444 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16674474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 27007832 - 27008062
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  27007832 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27007931  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  |||| |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27007932 gaagaagctcattgaccagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27008031  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | | |||||||||| |||||||||||||    
T  27008032 gtgtgtaaggaagctcctagacttgatgtcc 27008062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 29573118 - 29573348
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  29573118 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 29573217  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  29573218 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 29573317  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  29573318 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 29573348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4545866 - 4545636
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  4545866 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 4545767  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  4545766 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 4545667  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4545666 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4545636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 30558107 - 30557877
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  30558107 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30558008  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  30558007 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgag 30557908  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  30557907 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30557877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 34463437 - 34463207
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  34463437 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34463338  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  34463337 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 34463238  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  34463237 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 34463207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 3696186 - 3696416
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  3696186 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 3696285  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  3696286 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 3696385  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     | | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  3696386 atgtgtgatgaagctcctagacttgatgtcc 3696416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 4525391 - 4525621
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| | ||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  4525391 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatcccaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 4525490  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  4525491 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 4525590  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4525591 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4525621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4724225 - 4723995
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  4724225 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 4724126  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  4724125 gaagaaactcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 4724026  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  4724025 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 4723995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17092427 - 17092301
Alignment:
Q  106 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtat 205  Q
    ||||||||  |||| ||||| || || |||||||| ||   ||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17092427 aagctcattgaccagggaaagttgacttttgagaataatacccctcatgtcctcgataatccccttccaaaccacgctgctgtgaacatgactgaggtat 17092328  T
Q  206 atgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||    
T  17092327 gtgaggaagctaccaaacttgatgtcc 17092301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 28207559 - 28207789
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  28207559 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 28207658  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  28207659 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 28207758  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  28207759 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28207789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16944118 - 16943888
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  16944118 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16944019  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| ||||| ||     
T  16944018 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaa 16943919  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  16943918 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 16943888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 17025390 - 17025612
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  17025390 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 17025489  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  17025490 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 17025589  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  17025590 ggaagctcctagacttgatgtcc 17025612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26116501 - 26116271
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  26116501 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26116402  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  26116401 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 26116302  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  26116301 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26116271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 29501520 - 29501750
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  29501520 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 29501619  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  29501620 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 29501719  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  29501720 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29501750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 26777706 - 26777475
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  26777706 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26777607  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  26777606 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 26777507  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcca 233  Q
    || | |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  26777506 gtgtgtgaggaaaatcctagacttgatgtcca 26777475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 27044494 - 27044723
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgct-acgctttgaagtacattgta 102  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || | | ||||||||||| || ||     
T  27044494 ccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtggttatgctttgaagtatatcgtg 27044593  T
Q  103 aaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgagg 202  Q
    || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |    
T  27044594 aagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaag 27044693  T
Q  203 tatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  27044694 tgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27044723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 27485234 - 27485464
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  27485234 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 27485333  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27485334 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27485433  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||    
T  27485434 gtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 27485464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 8)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 20340483 - 20340253
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340483 atccgttacctcctaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 20340384  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20340383 gaagaagctcattaaccaaggaaagttaacttttgagaacaatatccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 20340284  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20340283 gtatatgaggaagctcccagacttgacgtcc 20340253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16208179 - 16207951
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16208179 atccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 16208080  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16208079 gaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 16207980  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgt 230  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16207979 gtatatgagaaagctcccagacttgatgt 16207951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 20461188 - 20461416
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461188 atccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgattttcatcaaggtgctctaggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 20461287  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20461288 aaaaaagctcatagaccaaggaaaattgacctttgaaaatatcgtccctcatgtcctcgataatcctcttccgaatcacgctgttgtgaacatgattgag 20461387  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgt 230  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  20461388 gtatatgagcaagctcgcagacttgatgt 20461416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 28151977 - 28152199
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||    
T  28151977 cctcccaggctccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaagc 28152076  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    |||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  28152077 tcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgagatatatga 28152176  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||| ||||||| ||||    
T  28152177 ggaagctcccggacttgacgtcc 28152199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 51638327 - 51638555
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||||| |    
T  51638327 ccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgtga 51638426  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    | ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  51638427 agaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagt 51638526  T
Q  204 atatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||    
T  51638527 gtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 51638555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 10962777 - 10963007
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  10962777 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 10962876  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  10962877 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 10962976  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     | | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  10962977 atgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 10963007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 28585088 - 28585318
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  28585088 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 28585187  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  28585188 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 28585287  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28585288 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28585318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 41793456 - 41793226
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  41793456 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 41793357  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||| |  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  41793356 gaagaagctcgtcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 41793257  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  41793256 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 41793226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 36)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 16041432 - 16041660
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041432 atccgttgcctcccaggttccgttctgacctaaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtagaaggatgctacgctttgaagtacattgt 16041531  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||  | || ||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16041532 gaaaaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 16041631  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgt 230  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16041632 gtatacgaggaagctcccagactcgatgt 16041660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16450032 - 16449810
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16450032 atcctttgcctcccaggtttcgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 16449933  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16449932 gaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgagaataacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 16449833  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagact 224  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  16449832 gtatatgaggaagctcccagact 16449810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 26484803 - 26485033
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  26484803 atccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgt 26484902  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26484903 gaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 26485002  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  26485003 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 26485033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 31088491 - 31088278
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  31088491 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 31088392  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31088391 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 31088292  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  31088291 aggaagctcccaga 31088278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 45733576 - 45733789
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  45733576 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 45733675  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45733676 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 45733775  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  45733776 aggaagctcccaga 45733789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 2109039 - 2108817
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  2109039 atccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgt 2108940  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2108939 gaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 2108840  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagact 224  Q
    |||||||||||||||||| ||||    
T  2108839 gtatatgaggaagctcccggact 2108817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 2775468 - 2775698
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||||||    
T  2775468 atccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgt 2775567  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2775568 gaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 2775667  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  2775668 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 2775698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 39211057 - 39210827
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39211057 atccgttacctcccaggttccggtctgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctttgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgt 39210958  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  39210957 gaagaagctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 39210858  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  39210857 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 39210827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26683008 - 26682804
Alignment:
Q  28 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  26683008 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattttaaaaaaactcatagaccaaggaaaat 26682909  T
Q  128 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 227  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26682908 tgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 26682809  T
Q  228 tgtcc 232  Q
     ||||    
T  26682808 cgtcc 26682804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Original strand, 4200682 - 4200886
Alignment:
Q  28 gacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaat 127  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||||||| ||||||||||| |    
T  4200682 gacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaagctcattaaccaaggaaagt 4200781  T
Q  128 taacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttga 227  Q
    | || |||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4200782 tgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgataaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccggacttga 4200881  T
Q  228 tgtcc 232  Q
     ||||    
T  4200882 cgtcc 4200886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 234
Target Start/End: Original strand, 5128100 - 5128333
Alignment:
Q  1 aatccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattg 100  Q
    |||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |    
T  5128100 aatccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcg 5128199  T
Q  101 taaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattga 200  Q
    | || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||    
T  5128200 tgaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcga 5128299  T
Q  201 ggtatatgaggaagctcccagacttgatgtccat 234  Q
     |||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  5128300 agtatgtgaggaagctcctagacttgatgtccat 5128333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 2154682 - 2154912
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||| || ||    
T  2154682 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctaggtcatgatgtcgagggatgctacgctttgaagtatatcgt 2154781  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  2154782 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 2154881  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  2154882 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 2154912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16518450 - 16518221
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| || ||    
T  16518450 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgt 16518351  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | |||||||| || || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  16518350 gaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 16518251  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtc 231  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16518250 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 16518221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 10916902 - 10916672
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  10916902 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 10916803  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  10916802 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 10916703  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  10916702 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 10916672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 11424810 - 11424580
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  11424810 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 11424711  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  11424710 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 11424611  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  11424610 gtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 11424580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16503414 - 16503185
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| | ||||||||| || ||    
T  16503414 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgttttgaagtatatcgt 16503315  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  16503314 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 16503215  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtc 231  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  16503214 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 16503185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26275128 - 26274898
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  26275128 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgt 26275029  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  26275028 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgag 26274929  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  26274928 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26274898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 3445415 - 3445645
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  3445415 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 3445514  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||     
T  3445515 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgctgctgtgaatatgatcgaa 3445614  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  3445615 gtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 3445645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 26435366 - 26435596
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  26435366 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26435465  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  26435466 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 26435565  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  26435566 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26435596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4145157 - 4144927
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  4145157 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 4145058  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  4145057 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 4144958  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  4144957 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 4144927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 5147374 - 5147144
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  5147374 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5147275  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  5147274 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 5147175  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || |  ||||||||||| |||||||||||||    
T  5147174 gtgtgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 5147144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 11441681 - 11441911
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  11441681 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 11441780  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  11441781 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 11441880  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  11441881 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 11441911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24592575 - 24592345
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  24592575 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 24592476  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||     
T  24592475 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcacgccgctgtgaatatgatcgaa 24592376  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  24592375 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24592345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31564424 - 31564194
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  31564424 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 31564325  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  31564324 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31564225  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  31564224 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31564194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26319903 - 26319673
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  26319903 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26319804  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||     
T  26319803 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaa 26319704  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  26319703 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26319673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26537904 - 26537674
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  26537904 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26537805  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  26537804 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 26537705  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  26537704 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 26537674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 9618760 - 9618990
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  9618760 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 9618859  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  9618860 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 9618959  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  9618960 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9618990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26669948 - 26669718
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  26669948 atccgttgcccccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26669849  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  26669848 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 26669749  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  26669748 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26669718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 45387452 - 45387682
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  45387452 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 45387551  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  45387552 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 45387651  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| || ||||||||||    
T  45387652 gtgtgtgaagaagctccgaggcttgatgtcc 45387682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 18540916 - 18541107
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||    
T  18540916 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 18541015  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    | ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  18541016 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 18541107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16736494 - 16736264
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  16736494 atccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16736395  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||     
T  16736394 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaa 16736295  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||    
T  16736294 gtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 16736264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 16751548 - 16751318
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  16751548 atccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 16751449  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||     
T  16751448 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaa 16751349  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||    
T  16751348 gtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 16751318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 17523641 - 17523871
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  17523641 atccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 17523740  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||     
T  17523741 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaa 17523840  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||    
T  17523841 gtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 17523871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 17529574 - 17529344
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  17529574 atccgttacctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 17529475  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||| ||||| ||     
T  17529474 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgccgtgaatatgatcgaa 17529375  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||    
T  17529374 gtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 17529344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 31125029 - 31125259
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  31125029 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 31125128  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  31125129 gaagaaactcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31125228  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  31125229 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31125259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 5159636 - 5159827
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||| | || ||||| ||| | |||||||| || || ||||    
T  5159636 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttaaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 5159735  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    | ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||| | ||||| ||||| || ||||||    
T  5159736 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatgatgctgccgtgaatataattgag 5159827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 51)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 22888587 - 22888815
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22888587 atccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 22888686  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22888687 gaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 22888786  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  22888787 gtatatgaggaagctcctagactcgatgt 22888815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 25199146 - 25199374
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25199146 atccgttacctcccaggttccgttctgatctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttaaagtacattgt 25199245  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25199246 gaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 25199345  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgt 230  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  25199346 gtatatgagaaagcccccagacttgatgt 25199374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29889127 - 29888897
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||    
T  29889127 atccgttgcctcccaggttccggtctgacctcatatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaagtacatcgt 29889028  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | |||||||| || || |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29889027 gaagaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 29888928  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29888927 gtgtatgaggaagctcccagacttgatgtcc 29888897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13184686 - 13184473
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  13184686 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 13184587  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13184586 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 13184487  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  13184486 aggaagctcccaga 13184473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 13440532 - 13440319
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  13440532 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 13440433  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13440432 ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttctgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggtatatg 13440333  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  13440332 aggaagctcccaga 13440319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 23892323 - 23892553
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||  || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||| ||    
T  23892323 atccgttgcctcccaggttccggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaagatgctatgctctgaagtacatcgt 23892422  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | |||||||| ||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23892423 gaagaagctcattgatcaaggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcatgctgctgtgaacgtgattgag 23892522  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892523 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 23892553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 9 - 227
Target Start/End: Original strand, 33877371 - 33877589
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  ||||||| || |||    
T  33877371 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaacacattgtgaagaag 33877470  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33877471 ctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 33877570  T
Q  209 aggaagctcccagacttga 227  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  33877571 aggaagctcccggacttga 33877589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 11325918 - 11326131
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||    
T  11325918 gcctcccaagttccgttcggacctcaaatgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctatgctttgaaatacattgtgaagaag 11326017  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11326018 ctcattaaccaaggaaagttgacttttgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaaccctcttccgaatcacgttgctgtaaacatgattgaggtatatg 11326117  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  11326118 aggaagctcccaga 11326131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 24688202 - 24687972
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  24688202 atccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgctctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 24688103  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  24688102 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 24688003  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  24688002 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24687972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9548588 - 9548358
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  9548588 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 9548489  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  9548488 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 9548389  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  9548388 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 9548358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 33777604 - 33777834
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  33777604 atccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgt 33777703  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||     
T  33777704 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaa 33777803  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  33777804 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 33777834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23752495 - 23752265
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  23752495 atccgttgcctccaaggttcaggtccgacctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 23752396  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  23752395 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 23752296  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23752295 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23752265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 22999159 - 22998929
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  22999159 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaagtgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 22999060  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||| ||     
T  22999059 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaaccatgccgctgtaaatatgatcgaa 22998960  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  22998959 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 22998929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 30934750 - 30934980
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  30934750 atccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 30934849  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||  | ||||| ||     
T  30934850 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtatatatgatcgaa 30934949  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30934950 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30934980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 11549471 - 11549701
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  11549471 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 11549570  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  11549571 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 11549670  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  11549671 gtatgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 11549701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15658805 - 15658575
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  15658805 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 15658706  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  15658705 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 15658606  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     | | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15658605 atgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15658575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 23718033 - 23717803
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  23718033 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 23717934  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  23717933 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 23717834  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  23717833 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 23717803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 24970135 - 24970365
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  24970135 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 24970234  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||    || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||  |     
T  24970235 gaagaagctcattgatcaaggaaagcggacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgtaaatatgatcaaa 24970334  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  24970335 gtacgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 24970365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 28649352 - 28649582
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  28649352 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 28649451  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  28649452 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 28649551  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  28649552 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 28649582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37671528 - 37671298
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  37671528 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 37671429  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  37671428 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 37671329  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  37671328 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37671298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 9317568 - 9317798
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  9317568 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 9317667  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  9317668 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 9317767  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  9317768 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 9317798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 12132272 - 12132502
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  12132272 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 12132371  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  12132372 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 12132471  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  12132472 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 12132502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 30152135 - 30152365
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  30152135 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30152234  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  30152235 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 30152334  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  30152335 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30152365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 31431557 - 31431787
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  31431557 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgt 31431656  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  31431657 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31431756  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  31431757 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 31431787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31826452 - 31826222
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  31826452 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 31826353  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  31826352 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31826253  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||    
T  31826252 gtatgtgaggaaactcctagacttgatgtcc 31826222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 32599517 - 32599286
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  32599517 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgcattaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 32599418  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||     
T  32599417 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatccgctaccgaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 32599318  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcca 233  Q
    || | ||||||||| || ||||||||||||||    
T  32599317 gtgtgtgaggaagcccctagacttgatgtcca 32599286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 13324866 - 13324644
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  13324866 cctccaaggttccgctctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 13324767  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  13324766 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 13324667  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  13324666 ggaagctcctagacttgatgtcc 13324644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18375457 - 18375227
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  18375457 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 18375358  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||||||     
T  18375357 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgattgaa 18375258  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  18375257 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 18375227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18500775 - 18500553
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  18500775 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 18500676  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  18500675 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 18500576  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagact 224  Q
    || | |||||||||||| |||||    
T  18500575 gtgtgtgaggaagctcctagact 18500553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 33516473 - 33516703
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  33516473 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 33516572  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||    
T  33516573 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgag 33516672  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  33516673 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33516703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37358688 - 37358458
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  37358688 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 37358589  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  37358588 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatattccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 37358489  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  37358488 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37358458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 43078369 - 43078599
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  43078369 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 43078468  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||| |  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  43078469 gaagaagctcgttgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 43078568  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  43078569 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 43078599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 8665520 - 8665290
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  8665520 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 8665421  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  8665420 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 8665321  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  8665320 gtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 8665290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15758902 - 15758672
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  15758902 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 15758803  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  15758802 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 15758703  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  15758702 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 15758672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 24681565 - 24681787
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  24681565 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 24681664  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||    
T  24681665 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtga 24681764  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  24681765 ggaagctcctagacttgatgtcc 24681787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Original strand, 24724092 - 24724314
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  24724092 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 24724191  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || |||| |||    
T  24724192 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtatgtga 24724291  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  24724292 ggaagctcctagacttgatgtcc 24724314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 26480509 - 26480739
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  26480509 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 26480608  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  26480609 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 26480708  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  26480709 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 26480739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 29967111 - 29966881
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  29967111 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 29967012  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  29967011 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 29966912  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  29966911 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 29966881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 30029532 - 30029762
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  30029532 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30029631  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  30029632 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 30029731  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  30029732 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 30029762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40473586 - 40473364
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||    
T  40473586 cctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagc 40473487  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatga 209  Q
    ||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| || || | |||    
T  40473486 tcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatcctctcccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgtga 40473387  T
Q  210 ggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||||| |||||||||||||    
T  40473386 ggaagctcctagacttgatgtcc 40473364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 2511168 - 2511398
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  2511168 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 2511267  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  2511268 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 2511367  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||    
T  2511368 gtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 2511398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 3789658 - 3789888
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  3789658 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 3789757  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  3789758 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 3789857  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  3789858 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 3789888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 6874422 - 6874652
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  6874422 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 6874521  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||| ||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  6874522 gaagaagcttatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 6874621  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  6874622 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 6874652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 30168586 - 30168816
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  30168586 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30168685  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  30168686 gaagaagctcattgatcaagggaagctcacttttgagaataatgtcccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 30168785  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| ||| ||| |||| |||||||||||||    
T  30168786 gtatgtgaagaaactcctagacttgatgtcc 30168816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 37755097 - 37755327
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  37755097 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 37755196  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  37755197 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 37755296  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  37755297 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 37755327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 37771032 - 37770802
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| ||  |    
T  37771032 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcat 37770933  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  37770932 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatccactaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 37770833  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||| | |||||||||||||    
T  37770832 gtgtgtgaggaagcttctagacttgatgtcc 37770802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Original strand, 33292650 - 33292841
Alignment:
Q  10 cctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagc 109  Q
    ||||| |||||||  ||||| || |||||||| ||||||||||| ||| | || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| || || ||||    
T  33292650 cctccaaggttccgctctgatcttaagtgtgacttccatcaaggcgctttagggcatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgtcaagaagc 33292749  T
Q  110 tcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
    | ||| | ||||| || ||||| |||||||||||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| | ||| ||||| |||||||||    
T  33292750 ttatagatcaagggaagttaacttttgagaacaatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgatgccgtgaatatgattgag 33292841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 201
Target Start/End: Original strand, 41674826 - 41675025
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||| | |||||||| ||    
T  41674826 atccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctaggccatgatgttgaggggtgctatgctctaaagtacatcgt 41674925  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||| ||| | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  41674926 caagaagcttatagatcaagggaagctgacttttgagaataatgtgccacatgtcctcgataatccgctcccaaatcatgctgccgtgaatatgattgag 41675025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 5638027 - 5638257
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  5638027 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 5638126  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || ||||| || ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||     
T  5638127 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgaaaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaa 5638226  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  5638227 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 5638257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 34616635 - 34616865
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  34616635 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 34616734  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  34616735 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 34616834  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||| ||| |||||||||||||    
T  34616835 gtgtgtgaggaagttcctagacttgatgtcc 34616865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 2 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 28959831 - 28959600
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  28959831 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 28959732  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  28959731 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 28959632  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcca 233  Q
    || | ||||||  |||| ||||||||||||||    
T  28959631 gtgtgtgaggagactcctagacttgatgtcca 28959600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 2065 - 1838
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2065 atccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 1966  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1965 gaagaagctcattgatcaagg-aaattaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 1867  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgt 230  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1866 gtatatgaagaagctcccagactcgatgt 1838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 2 - 224
Target Start/End: Original strand, 6120 - 6344
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttc-catcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgcttt-gaagtacatt 99  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||||||  |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||| |||||| ||     
T  6120 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgatttttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgcttttgaagtatatc 6219  T
Q  100 gtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattg 199  Q
    || || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| |    
T  6220 gtgaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcg 6319  T
Q  200 aggtatatgaggaagctcccagact 224  Q
    | || | |||||||||||| |||||    
T  6320 aagtgtgtgaggaagctcctagact 6344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 2 - 230
Target Start/End: Original strand, 20496 - 20723
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20496 atccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 20595  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20596 gaagaagctcattgatcaagg-aaattaacttttgagaacaatgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgag 20694  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgt 230  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||    
T  20695 gtatatgaagaagctcccagactcgatgt 20723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 30560 - 30790
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| || || ||||| || |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  30560 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatcttaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 30659  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  30660 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 30759  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  30760 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 30790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19659144 - 19658926
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    |||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  19659144 ccgtcgcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaa 19659045  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19659044 aaaa-ctcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtaaacatgattgaggt 19658946  T
Q  204 atatgaggaagctcccagac 223  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  19658945 atatgaggaagctcccagac 19658926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 4 - 223
Target Start/End: Original strand, 33244775 - 33244994
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    |||| |||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  33244775 ccgtcgcctcctaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgcgctgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaa 33244874  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  33244875 aaaaactcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataacgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccgaaccacgctgctgtaaacatgattgaggt 33244974  T
Q  204 atatgaggaagctcccagac 223  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  33244975 atatgaggaagctctcagac 33244994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 9 - 222
Target Start/End: Original strand, 44563216 - 44563427
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaag 108  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||||     
T  44563216 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgatgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaa- 44563314  T
Q  109 ctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatg 208  Q
    |||||| |||||||||| || || |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44563315 ctcatagaccaaggaaagttgacttttgagaataacgtccctcatgtcgtcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt-aacatgattgaggtatatg 44563413  T
Q  209 aggaagctcccaga 222  Q
    ||||||||||||||    
T  44563414 aggaagctcccaga 44563427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 4 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 22080983 - 22080790
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22080983 ccgttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggtgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaa 22080884  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 197  Q
    | ||||||||  |||| ||||| ||||| |||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080883 agaagctcattgaccagggaaagttaacttttgagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 22080790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 9 - 232
Target Start/End: Original strand, 9354737 - 9354961
Alignment:
Q  9 gcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt-aaaaaa 107  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  9354737 gcctcccaagttccgttcggacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctatgggtcatgacgtcgaaggatgctacgcgttgaggtacattgtaaaaaaa 9354836  T
Q  108 gctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatat 207  Q
     |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || | |    
T  9354837 actcatagaccaaggaaaattgacctttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagtgtgt 9354936  T
Q  208 gaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||    
T  9354937 gaggaagttcctagacttgatgtcc 9354961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 16283557 - 16283787
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||   || |||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||    
T  16283557 atccgttgcctcccaggttcaggtccgacctcaaatgtgatttccatcaaggcaccctgggtcatgatgtcgaagggtgctatgctttgaagtatatcgt 16283656  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||     
T  16283657 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaacatgattgaa 16283756  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  16283757 gtatgtgaggaagctcctagacttgttgtcc 16283787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 18710694 - 18710924
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||| ||||||| ||||||   ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||    
T  18710694 atccgctgcctccaaggttcaggtctgatctcaagtgtgattttcatcagggtgccctaggtcatgatgtcgagggatgttatgctttgaagtatatcgt 18710793  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  18710794 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaaccctcttccaaatcacgctgctgtgaacatgattgag 18710893  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  18710894 gtatatgaggaagctcccggacttgacgtcc 18710924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 19688206 - 19688436
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  19688206 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 19688305  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||  | |||||||| || || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  19688306 gaaaaagctcattgatcaaggaaagttgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 19688405  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    ||||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  19688406 gtatgcgaggaagctcctagacttgatgtcc 19688436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 27609012 - 27608782
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| || ||    
T  27609012 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgagggatgctatgctttgaagtatatcgt 27608913  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  27608912 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 27608813  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  27608812 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 27608782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 16277662 - 16277892
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  16277662 atccgttgcctcccaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgt 16277761  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || || ||||| ||     
T  16277762 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgccgtaaatatgatcgaa 16277861  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  16277862 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 16277892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 14557732 - 14557962
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  14557732 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 14557831  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||  |||| ||     
T  14557832 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatgtgatcgaa 14557931  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  14557932 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14557962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 2137366 - 2137136
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  2137366 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccttgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 2137267  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     |||||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  || | ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  2137266 gaaaaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtctcgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 2137167  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    | || |||| ||||||| |||||||||||||    
T  2137166 gcatgtgagaaagctcctagacttgatgtcc 2137136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 56 - 232
Target Start/End: Original strand, 189256 - 189432
Alignment:
Q  56 ctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgt 155  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| |||||    
T  189256 ctctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgtgaaaaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgt 189355  T
Q  156 cctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  189356 cctcgacaatcctcttccaaatcatgcctctgttaatatgatcgaagtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 189432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12092831 - 12092601
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  12092831 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 12092732  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  12092731 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 12092632  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  12092631 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 12092601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 29829430 - 29829660
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||| || || |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  29829430 atccgttgcctccaaggttccgctctgatcttaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 29829529  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | || |||||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  29829530 gaagaagctcattgatcagggaaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 29829629  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  29829630 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 29829660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 3329614 - 3329384
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||| | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  3329614 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgctttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 3329515  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || |||||| |  | ||||| ||  | || |||||||||||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||     
T  3329514 gaagaagctcgttgatcaagggaagctgacttttgagaacaatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaa 3329415  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  3329414 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 3329384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 19674549 - 19674779
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| ||  | || || ||||||||||| |||||    
T  19674549 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcagggtgccttaggtcatgatgtcgagaggtgttatgctttgaagtatattgt 19674648  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  19674649 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 19674748  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19674749 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 19674779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 31489857 - 31489627
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  31489857 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 31489758  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  31489757 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31489658  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  31489657 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 31489627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 19208467 - 19208237
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  19208467 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 19208368  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  19208367 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 19208268  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  19208267 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 19208237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 28362062 - 28361832
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  28362062 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 28361963  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  28361962 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 28361863  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  28361862 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 28361832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 31354632 - 31354862
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||| |||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  31354632 atcctttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 31354731  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  31354732 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 31354831  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||||    
T  31354832 gtgtgtgaggaagctcccagacttgatgtcc 31354862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 232
Target Start/End: Original strand, 19286572 - 19286800
Alignment:
Q  4 ccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaa 103  Q
    ||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || |    
T  19286572 ccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtga 19286671  T
Q  104 aaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggt 203  Q
    | || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || ||||||||||||||||| || || ||||| || |||||||| ||||| || ||    
T  19286672 agaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaagt 19286771  T
Q  204 atatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
     | |||||||||||| |||||||||||||    
T  19286772 gtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 19286800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 33258831 - 33259061
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  |||||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  33258831 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttgggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 33258930  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||| || || ||||| || | |||||| ||||| ||     
T  33258931 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatccgctaccaaatcatgccgttgtgaatatgatcgaa 33259030  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  33259031 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 33259061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0558 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0558
Description:

Target: scaffold0558; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 2 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 176 - 1
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  176 atccgttgccttccaggttccgttctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 77  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 177  Q
     || ||||||||  | || ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  76 gaagaagctcattgatcagggaaagttaaccttcgagaacaacgtccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 6 - 197
Target Start/End: Original strand, 21673 - 21864
Alignment:
Q  6 gttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaa 105  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  21673 gttgcctcccaggttccgttctgacctcaagtgcgatttccatcaaggggctctgggccaagatgttgaaggatgttacgctttgaagtagattgtaaag 21772  T
Q  106 aagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 197  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| ||| |||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21773 aagctcattgaccagggaaagttaacttttaagaacaatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgat 21864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 40 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 728 - 536
Alignment:
Q  40 gatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgaga 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||  | || ||||| ||||| |||||||    
T  728 gatttccatcaagatgctctgggccatgatgttgaaggatgttacgctttgaagtacattgtaaagaagctcattgatcagggaaagttaacttttgaga 629  T
Q  140 acaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    | ||  |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||| |||| |||||| ||||| ||||    
T  628 ataatgtccctcatgttcttgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgatcgagacttatgaagaagttcccagtcttgacgtcc 536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 47133 - 46903
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  47133 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgt 47034  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  47033 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 46934  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  46933 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 46903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 40217 - 39987
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    |||||||||| |||||||||   || || ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  40217 atccgttgccccccaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 40118  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     ||  |||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  40117 gaaggagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 40018  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  40017 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 39987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 29871 - 30101
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  29871 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgatttccaccaaggcgccctgggtcacgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 29970  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||| || ||||| ||     
T  29971 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtaaatatgatcgaa 30070  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30071 gtatgtgaggaagctcttagacttgatgtcc 30101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 277 - 47
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||   || || ||||| |||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||    
T  277 atccgttgcctcccaagttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgcgttgggtcatgatgtcgaggggtgctacgctttgaagtatatcgt 178  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  177 gaagaagctcattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 78  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  77 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 47  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 231
Target Start/End: Original strand, 27400 - 27629
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   || || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||    
T  27400 atccgttgcctccaaggttcaggtccgatctcaaatgtgattttcatcaaggcgccctgggtcatgatgtcgaggggtgctatgctttgaagtatatcgt 27499  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||| ||  | ||||||||  | || |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||     
T  27500 gaagaagcttattgatcaaggaaagctgacttttgagaataatgtcccacatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtaaatatgatcgaa 27599  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtc 231  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  27600 gtatgtgaggaagctcctagacttgatgtc 27629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 9674 - 9904
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| |||||||| |||||||||||  | ||||||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  9674 atccgttgcctccaaggttcagatctgatctcaaatgtgattttcatcaaggtgccttaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 9773  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  9774 gaagaagctcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 9873  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  9874 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 9904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0350 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0350
Description:

Target: scaffold0350; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 7387 - 7157
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  7387 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 7288  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| ||||| ||     
T  7287 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccactgtgaatatgatcgaa 7188  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | ||| |||||||| |||||||||||||    
T  7187 gtgtgtgaagaagctccgagacttgatgtcc 7157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 15078 - 14848
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | |||||||| || || || || || ||||||||||| || ||    
T  15078 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggtcatgacgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 14979  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||  |||| ||     
T  14978 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatgtgatcgaa 14879  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  14878 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 14848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 9214 - 8984
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  9214 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 9115  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  9114 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 9015  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||    
T  9014 gtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 8984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 20123 - 20353
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || ||    
T  20123 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgcgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgt 20222  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || ||||||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  |||| || ||||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  20223 gaagaagctcatcgatcaagggaagctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctctaccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 20322  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| || ||||||||||    
T  20323 gtgtgtgaggaagctcctaggcttgatgtcc 20353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 232
Target Start/End: Original strand, 8057 - 8287
Alignment:
Q  2 atccgttgcctcccaggttccattctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgt 101  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || |||||||| || || || || ||||||||||| |||||    
T  8057 atccgttgcctccaaggttcaggtctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccttaggacatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatattgt 8156  T
Q  102 aaaaaagctcataaaccaaggaaaattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgag 201  Q
     || || |||||  | ||||| ||  | || |||||||| ||  | || |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||     
T  8157 gaagaaactcattgatcaagggaagctgacttttgagaataatgttccacatgtccttgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaa 8256  T
Q  202 gtatatgaggaagctcccagacttgatgtcc 232  Q
    || | |||||||||||| |||||||||||||    
T  8257 gtgtgtgaggaagctcctagacttgatgtcc 8287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 25 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 26326 - 26119
Alignment:
Q  25 tctgacctcaagtgtgatttccatcaaggtgctctgggtcatgatgttgaaggatgctacgctttgaagtacattgtaaaaaagctcataaaccaaggaa 124  Q
    ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||| || || || || ||||||||||| || || || ||||||||  | ||||| |    
T  26326 tctgatctcaaatgtgactttcatcaaggtgccctaggtcatgatgtcgaggggtgttatgctttgaagtatatcgtgaagaagctcatcgatcaaggga 26227  T
Q  125 aattaacctttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgtgaacatgattgaggtatatgaggaagctcccagact 224  Q
    |  | || |||||||| ||  |||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||| ||  | | ||| |||||||| |||||    
T  26226 agctgacttttgagaataatgtcccacacgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgccgctgtgaatatgatcgaaatgtgtgaagaagctccgagact 26127  T
Q  225 tgatgtcc 232  Q
    ||||||||    
T  26126 tgatgtcc 26119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 133 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 46819 - 46764
Alignment:
Q  133 tttgagaacaacttccctcatgtcctcgacaatcctcttccgaatcacgctgctgt 188  Q
    |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  46819 tttgagaataatgtcccgcatgtcctcgacaatcctcttccaaatcatgctgctgt 46764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University