View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11840_low_14 (Length: 279)

Name: NF11840_low_14
Description: NF11840
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11840_low_14
NF11840_low_14
[»] chr6 (63 HSPs)
chr6 (1-279)||(27187671-27187949)
chr6 (1-279)||(27261291-27261569)
chr6 (1-279)||(24312936-24313214)
chr6 (1-277)||(1542854-1543130)
chr6 (1-279)||(2874571-2874849)
chr6 (1-279)||(25112787-25113065)
chr6 (1-279)||(16626485-16626763)
chr6 (1-259)||(28262985-28263243)
chr6 (1-271)||(28292148-28292418)
chr6 (1-259)||(28341734-28341992)
chr6 (1-279)||(29591688-29591966)
chr6 (3-259)||(17032620-17032876)
chr6 (1-279)||(5838987-5839265)
chr6 (1-277)||(19864922-19865198)
chr6 (1-268)||(25609640-25609907)
chr6 (1-275)||(22434104-22434378)
chr6 (1-271)||(27331209-27331479)
chr6 (1-271)||(27391949-27392219)
chr6 (1-271)||(18407718-18407989)
chr6 (1-271)||(16927416-16927686)
chr6 (1-271)||(22762231-22762501)
chr6 (1-259)||(22078478-22078734)
chr6 (1-259)||(16963155-16963413)
chr6 (1-271)||(23078704-23078974)
chr6 (30-271)||(25768455-25768696)
chr6 (1-271)||(14381243-14381513)
chr6 (1-271)||(19879533-19879803)
chr6 (1-271)||(34645362-34645632)
chr6 (1-206)||(1641007-1641212)
chr6 (55-271)||(15896383-15896599)
chr6 (1-271)||(17415721-17415991)
chr6 (1-271)||(21563908-21564178)
chr6 (1-271)||(21471836-21472106)
chr6 (1-271)||(22796408-22796678)
chr6 (32-271)||(19453686-19453925)
chr6 (1-268)||(24364647-24364914)
chr6 (1-271)||(5296982-5297251)
chr6 (1-271)||(10468625-10468895)
chr6 (52-271)||(21569767-21569986)
chr6 (3-270)||(27559765-27560032)
chr6 (3-270)||(27560394-27560661)
chr6 (1-275)||(11280277-11280551)
chr6 (1-268)||(15459571-15459838)
chr6 (3-270)||(28282590-28282857)
chr6 (1-271)||(18794925-18795195)
chr6 (165-279)||(21836965-21837079)
chr6 (118-271)||(8762709-8762862)
chr6 (180-271)||(20637077-20637168)
chr6 (165-271)||(18197504-18197610)
chr6 (209-275)||(22442710-22442776)
chr6 (1-66)||(12498261-12498326)
chr6 (1-66)||(12505590-12505655)
chr6 (1-66)||(12510575-12510640)
chr6 (69-259)||(16382161-16382351)
chr6 (89-259)||(23996571-23996741)
chr6 (1-84)||(8766111-8766194)
chr6 (69-259)||(18837696-18837886)
chr6 (156-241)||(23027522-23027607)
chr6 (132-259)||(16098416-16098543)
chr6 (138-259)||(21927577-21927698)
chr6 (139-259)||(1648602-1648722)
chr6 (69-217)||(14625068-14625216)
chr6 (117-259)||(25742876-25743018)
[»] chr3 (67 HSPs)
chr3 (1-271)||(15589262-15589532)
chr3 (1-271)||(20061924-20062194)
chr3 (1-271)||(53384888-53385158)
chr3 (1-271)||(16756455-16756725)
chr3 (1-279)||(48425437-48425715)
chr3 (1-271)||(10005590-10005860)
chr3 (1-271)||(10906200-10906470)
chr3 (1-271)||(16635763-16636033)
chr3 (1-271)||(43163087-43163357)
chr3 (1-279)||(15348107-15348385)
chr3 (1-279)||(5424792-5425070)
chr3 (1-271)||(12498238-12498508)
chr3 (1-259)||(14876381-14876639)
chr3 (1-279)||(16806788-16807066)
chr3 (1-279)||(13252680-13252958)
chr3 (1-277)||(16371403-16371679)
chr3 (1-271)||(14126464-14126734)
chr3 (1-279)||(15402372-15402650)
chr3 (1-259)||(15724816-15725074)
chr3 (1-279)||(16412144-16412422)
chr3 (1-279)||(26792261-26792539)
chr3 (1-277)||(11564545-11564821)
chr3 (1-279)||(15339259-15339537)
chr3 (1-271)||(6600737-6600996)
chr3 (1-279)||(16692150-16692432)
chr3 (1-271)||(9522709-9522979)
chr3 (32-277)||(15061777-15062022)
chr3 (1-271)||(17489840-17490110)
chr3 (1-271)||(16492051-16492321)
chr3 (1-271)||(15248137-15248407)
chr3 (1-271)||(15208881-15209151)
chr3 (1-271)||(15227649-15227919)
chr3 (1-263)||(15015634-15015884)
chr3 (1-271)||(13971979-13972249)
chr3 (1-271)||(14086673-14086943)
chr3 (30-271)||(14573958-14574199)
chr3 (30-271)||(15952827-15953068)
chr3 (1-271)||(11303632-11303902)
chr3 (9-271)||(17492638-17492900)
chr3 (1-268)||(28754318-28754585)
chr3 (30-271)||(12850138-12850379)
chr3 (3-270)||(44777249-44777516)
chr3 (33-271)||(13322511-13322749)
chr3 (3-268)||(13942026-13942291)
chr3 (30-270)||(16836370-16836610)
chr3 (3-270)||(8758942-8759209)
chr3 (1-268)||(10383969-10384235)
chr3 (3-270)||(41177524-41177791)
chr3 (1-271)||(12360401-12360671)
chr3 (1-268)||(47123944-47124211)
chr3 (1-268)||(10419907-10420174)
chr3 (1-271)||(16329520-16329788)
chr3 (3-265)||(4678440-4678702)
chr3 (30-270)||(16380788-16381028)
chr3 (1-172)||(11960992-11961163)
chr3 (117-271)||(16828061-16828215)
chr3 (1-261)||(18134215-18134475)
chr3 (51-271)||(16338371-16338591)
chr3 (1-163)||(13001909-13002070)
chr3 (1-175)||(26008948-26009122)
chr3 (69-258)||(15576818-15577007)
chr3 (69-259)||(8274281-8274471)
chr3 (110-259)||(16742585-16742734)
chr3 (69-252)||(18748733-18748916)
chr3 (110-259)||(6152733-6152882)
chr3 (89-259)||(13967222-13967392)
chr3 (132-226)||(17193224-17193318)
[»] chr7 (64 HSPs)
chr7 (1-271)||(10871355-10871625)
chr7 (1-271)||(8198988-8199258)
chr7 (1-271)||(44790991-44791261)
chr7 (1-279)||(14332757-14333035)
chr7 (1-279)||(18178102-18178380)
chr7 (1-279)||(8707965-8708243)
chr7 (1-279)||(18551390-18551668)
chr7 (1-279)||(16948-17226)
chr7 (1-279)||(9596417-9596695)
chr7 (1-279)||(11236845-11237123)
chr7 (1-279)||(13686424-13686702)
chr7 (1-279)||(15160689-15160967)
chr7 (1-277)||(12687861-12688137)
chr7 (1-277)||(11552736-11553012)
chr7 (1-277)||(14954980-14955256)
chr7 (1-274)||(15154294-15154567)
chr7 (1-271)||(14040056-14040326)
chr7 (1-271)||(14350086-14350356)
chr7 (2-271)||(15624913-15625182)
chr7 (1-271)||(11771881-11772151)
chr7 (1-271)||(21662321-21662591)
chr7 (1-271)||(12206418-12206688)
chr7 (1-160)||(23516520-23516679)
chr7 (1-271)||(13021718-13021988)
chr7 (1-271)||(15102221-15102491)
chr7 (1-268)||(8211749-8212016)
chr7 (1-271)||(6413872-6414142)
chr7 (1-271)||(11388046-11388316)
chr7 (1-271)||(14263862-14264132)
chr7 (1-268)||(11305884-11306151)
chr7 (156-279)||(23203245-23203368)
chr7 (156-279)||(23509372-23509495)
chr7 (1-151)||(15204239-15204389)
chr7 (1-271)||(16071912-16072182)
chr7 (3-270)||(18053572-18053839)
chr7 (1-268)||(49152662-49152929)
chr7 (1-271)||(1025-1295)
chr7 (1-271)||(13665898-13666168)
chr7 (1-271)||(14285994-14286264)
chr7 (30-270)||(14130263-14130503)
chr7 (1-271)||(16950089-16950359)
chr7 (3-268)||(23505491-23505756)
chr7 (3-271)||(12456065-12456333)
chr7 (30-270)||(14434081-14434321)
chr7 (1-271)||(19147572-19147842)
chr7 (1-271)||(20746971-20747241)
chr7 (1-268)||(13968289-13968556)
chr7 (1-268)||(26118226-26118493)
chr7 (30-270)||(15340821-15341061)
chr7 (3-214)||(23199418-23199629)
chr7 (1-115)||(35964646-35964760)
chr7 (1-159)||(12457140-12457298)
chr7 (69-259)||(4440356-4440546)
chr7 (70-259)||(21674185-21674374)
chr7 (89-259)||(14936795-14936965)
chr7 (89-259)||(15364388-15364558)
chr7 (69-259)||(7824328-7824518)
chr7 (69-259)||(27107426-27107616)
chr7 (138-259)||(17924148-17924269)
chr7 (144-252)||(23641951-23642059)
chr7 (89-217)||(45147003-45147131)
chr7 (111-233)||(15171642-15171764)
chr7 (188-267)||(40790-40869)
chr7 (177-235)||(17144936-17144994)
[»] chr4 (47 HSPs)
chr4 (1-279)||(8386783-8387061)
chr4 (1-271)||(12476971-12477241)
chr4 (1-279)||(18297576-18297854)
chr4 (1-279)||(27711707-27711985)
chr4 (1-271)||(29038775-29039045)
chr4 (1-279)||(8052986-8053264)
chr4 (1-278)||(19778157-19778434)
chr4 (1-279)||(12524047-12524325)
chr4 (1-259)||(14303361-14303619)
chr4 (1-277)||(14680938-14681214)
chr4 (1-277)||(15147249-15147525)
chr4 (1-279)||(23956118-23956396)
chr4 (1-279)||(40473411-40473689)
chr4 (1-277)||(16251810-16252086)
chr4 (1-279)||(18226809-18227087)
chr4 (2-271)||(16354816-16355085)
chr4 (1-274)||(1639793-1640066)
chr4 (2-274)||(7090804-7091076)
chr4 (3-271)||(8706291-8706559)
chr4 (1-271)||(14850737-14851007)
chr4 (1-173)||(14266368-14266540)
chr4 (81-271)||(14691353-14691543)
chr4 (1-271)||(15414657-15414927)
chr4 (1-271)||(15078006-15078276)
chr4 (1-271)||(1648908-1649178)
chr4 (33-271)||(15246327-15246565)
chr4 (1-268)||(3264428-3264695)
chr4 (1-268)||(29453171-29453438)
chr4 (1-271)||(15002995-15003265)
chr4 (1-271)||(20891353-20891623)
chr4 (1-268)||(11206865-11207132)
chr4 (30-271)||(15358721-15358962)
chr4 (30-271)||(33223318-33223564)
chr4 (130-271)||(14159970-14160111)
chr4 (120-271)||(15319641-15319792)
chr4 (1-271)||(27900757-27901027)
chr4 (1-268)||(44661500-44661767)
chr4 (1-175)||(16146283-16146459)
chr4 (1-93)||(14159863-14159955)
chr4 (69-259)||(14997755-14997945)
chr4 (89-217)||(13248104-13248232)
chr4 (128-268)||(18549694-18549834)
chr4 (1-76)||(14652679-14652754)
chr4 (117-259)||(9291322-9291464)
chr4 (1-79)||(15070784-15070862)
chr4 (132-171)||(15423974-15424013)
chr4 (69-217)||(12342548-12342696)
[»] chr2 (52 HSPs)
chr2 (1-271)||(10868852-10869122)
chr2 (1-279)||(16982154-16982432)
chr2 (1-271)||(16999002-16999272)
chr2 (1-279)||(17063719-17063997)
chr2 (1-279)||(17067377-17067655)
chr2 (1-271)||(9610138-9610408)
chr2 (1-279)||(24710035-24710313)
chr2 (1-271)||(44385740-44386010)
chr2 (1-279)||(27371271-27371549)
chr2 (1-279)||(22325019-22325297)
chr2 (1-271)||(27218018-27218288)
chr2 (1-271)||(41608556-41608826)
chr2 (5-271)||(23189013-23189279)
chr2 (1-279)||(24262372-24262650)
chr2 (1-277)||(21325431-21325707)
chr2 (1-277)||(24707647-24707923)
chr2 (1-277)||(24675491-24675767)
chr2 (1-277)||(21145206-21145471)
chr2 (1-277)||(22756630-22756906)
chr2 (1-268)||(23064079-23064346)
chr2 (1-271)||(30211088-30211358)
chr2 (21-271)||(45529533-45529783)
chr2 (1-252)||(24825472-24825723)
chr2 (120-279)||(16923010-16923169)
chr2 (125-279)||(20442676-20442830)
chr2 (113-279)||(24876912-24877078)
chr2 (118-271)||(16925479-16925632)
chr2 (1-271)||(27365250-27365520)
chr2 (1-271)||(23293960-23294230)
chr2 (1-117)||(16925262-16925378)
chr2 (1-271)||(23276778-23277048)
chr2 (30-271)||(19652223-19652464)
chr2 (1-268)||(20828261-20828528)
chr2 (1-268)||(20832987-20833254)
chr2 (1-271)||(24948591-24948861)
chr2 (1-118)||(24878319-24878436)
chr2 (3-270)||(12574357-12574624)
chr2 (1-268)||(31830660-31830927)
chr2 (90-268)||(21125331-21125509)
chr2 (1-268)||(1063753-1064020)
chr2 (1-259)||(11358057-11358315)
chr2 (30-270)||(27787772-27788012)
chr2 (183-271)||(23107901-23107989)
chr2 (156-271)||(23110892-23111007)
chr2 (117-271)||(24641860-24642014)
chr2 (30-160)||(23087481-23087611)
chr2 (110-259)||(25128758-25128907)
chr2 (69-259)||(24569851-24570041)
chr2 (69-259)||(22276349-22276538)
chr2 (128-204)||(23817291-23817367)
chr2 (117-259)||(22761752-22761894)
chr2 (89-259)||(24831370-24831540)
[»] chr1 (34 HSPs)
chr1 (1-279)||(51333188-51333466)
chr1 (1-279)||(16350294-16350572)
chr1 (1-279)||(21837336-21837614)
chr1 (1-279)||(19106753-19107031)
chr1 (1-279)||(33390724-33391002)
chr1 (1-279)||(17044710-17044988)
chr1 (1-259)||(21830689-21830947)
chr1 (1-241)||(41354202-41354442)
chr1 (1-279)||(16078351-16078625)
chr1 (22-271)||(21749348-21749597)
chr1 (1-271)||(16369683-16369953)
chr1 (1-259)||(50619959-50620217)
chr1 (51-271)||(22361947-22362167)
chr1 (1-271)||(19760569-19760839)
chr1 (1-271)||(24099306-24099576)
chr1 (1-268)||(37677466-37677733)
chr1 (3-153)||(20137166-20137316)
chr1 (1-268)||(19854700-19854966)
chr1 (1-267)||(20939770-20940036)
chr1 (1-143)||(20250236-20250378)
chr1 (3-273)||(22432817-22433087)
chr1 (1-268)||(20294798-20295065)
chr1 (24-268)||(31539703-31539947)
chr1 (30-201)||(41308240-41308411)
chr1 (117-271)||(19662844-19662998)
chr1 (1-271)||(20835591-20835861)
chr1 (146-271)||(20139361-20139486)
chr1 (51-259)||(20856476-20856684)
chr1 (189-259)||(20250376-20250446)
chr1 (69-259)||(20831107-20831297)
chr1 (110-259)||(22135272-22135421)
chr1 (234-279)||(41353357-41353402)
chr1 (117-259)||(20914712-20914854)
chr1 (117-226)||(20184683-20184792)
[»] scaffold0459 (1 HSPs)
scaffold0459 (1-271)||(816-1086)
[»] chr5 (60 HSPs)
chr5 (1-279)||(19770263-19770541)
chr5 (1-271)||(34566797-34567067)
chr5 (1-271)||(16356805-16357075)
chr5 (1-271)||(27518710-27518980)
chr5 (1-279)||(27668295-27668573)
chr5 (1-279)||(37291301-37291579)
chr5 (1-279)||(40709083-40709361)
chr5 (1-279)||(27610657-27610935)
chr5 (1-279)||(27685205-27685483)
chr5 (1-279)||(41771145-41771423)
chr5 (1-259)||(22332712-22332970)
chr5 (1-279)||(14999544-14999822)
chr5 (1-259)||(22134971-22135229)
chr5 (1-259)||(29475898-29476156)
chr5 (1-279)||(22348726-22349004)
chr5 (1-277)||(23574045-23574321)
chr5 (1-259)||(23516844-23517102)
chr5 (2-279)||(18776081-18776351)
chr5 (1-252)||(20799063-20799314)
chr5 (1-271)||(21339099-21339369)
chr5 (1-239)||(23440528-23440766)
chr5 (1-268)||(25423492-25423759)
chr5 (1-271)||(21497850-21498119)
chr5 (1-271)||(20467909-20468179)
chr5 (1-271)||(23471532-23471802)
chr5 (1-271)||(21563786-21564056)
chr5 (4-271)||(26738540-26738785)
chr5 (1-268)||(22502964-22503231)
chr5 (1-268)||(14886807-14887074)
chr5 (1-271)||(22235733-22236003)
chr5 (33-268)||(24716342-24716577)
chr5 (1-271)||(21890572-21890842)
chr5 (3-271)||(22381486-22381754)
chr5 (1-268)||(24749370-24749637)
chr5 (39-268)||(24620111-24620340)
chr5 (1-161)||(21405125-21405285)
chr5 (30-271)||(21831574-21831797)
chr5 (1-271)||(23079902-23080172)
chr5 (1-268)||(20342567-20342834)
chr5 (1-268)||(25848360-25848627)
chr5 (1-141)||(21984248-21984388)
chr5 (1-244)||(37545336-37545579)
chr5 (1-268)||(24798213-24798480)
chr5 (1-271)||(20821738-20822008)
chr5 (1-271)||(28916226-28916496)
chr5 (1-271)||(28923581-28923851)
chr5 (1-193)||(919-1111)
chr5 (39-271)||(21496481-21496713)
chr5 (51-235)||(22462287-22462471)
chr5 (1-259)||(20774045-20774302)
chr5 (157-271)||(21407597-21407711)
chr5 (1-271)||(28894755-28895025)
chr5 (30-270)||(17269148-17269387)
chr5 (111-259)||(25244175-25244323)
chr5 (111-259)||(25308327-25308475)
chr5 (69-259)||(21937013-21937203)
chr5 (89-259)||(27011457-27011627)
chr5 (89-259)||(24581584-24581753)
chr5 (111-172)||(16065604-16065665)
chr5 (110-226)||(23503837-23503952)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (1-279)||(109437-109715)
scaffold0029 (1-271)||(95636-95906)
scaffold0029 (1-271)||(112961-113231)
[»] chr8 (58 HSPs)
chr8 (1-279)||(19113127-19113405)
chr8 (1-279)||(30313210-30313488)
chr8 (1-278)||(17674090-17674367)
chr8 (1-259)||(18857014-18857272)
chr8 (1-259)||(22133127-22133385)
chr8 (1-279)||(32600581-32600859)
chr8 (1-261)||(15533817-15534077)
chr8 (1-259)||(16408131-16408389)
chr8 (1-279)||(22046810-22047088)
chr8 (1-259)||(22120260-22120518)
chr8 (1-241)||(19484974-19485214)
chr8 (1-230)||(20017865-20018094)
chr8 (2-279)||(22040297-22040574)
chr8 (1-277)||(21166606-21166881)
chr8 (1-259)||(22164278-22164535)
chr8 (1-271)||(21921809-21922079)
chr8 (1-279)||(19978404-19978682)
chr8 (1-271)||(21251378-21251648)
chr8 (1-271)||(23650478-23650748)
chr8 (1-271)||(21393939-21394209)
chr8 (1-271)||(21788433-21788703)
chr8 (1-271)||(22377528-22377798)
chr8 (1-271)||(22383703-22383973)
chr8 (1-269)||(23949356-23949624)
chr8 (31-259)||(20388566-20388794)
chr8 (1-271)||(20396199-20396469)
chr8 (1-271)||(22987638-22987903)
chr8 (30-271)||(31416548-31416789)
chr8 (1-271)||(20975725-20975995)
chr8 (1-259)||(19851848-19852106)
chr8 (1-259)||(19857884-19858142)
chr8 (1-268)||(14565579-14565846)
chr8 (1-268)||(16271301-16271568)
chr8 (2-271)||(23655365-23655634)
chr8 (12-268)||(12305206-12305462)
chr8 (3-271)||(29303500-29303768)
chr8 (1-268)||(803750-804017)
chr8 (1-271)||(1266675-1266945)
chr8 (1-268)||(6679548-6679815)
chr8 (1-271)||(22061507-22061777)
chr8 (30-270)||(22051329-22051569)
chr8 (1-268)||(6604095-6604362)
chr8 (1-271)||(20009974-20010244)
chr8 (1-271)||(22371377-22371647)
chr8 (51-268)||(27355035-27355252)
chr8 (3-270)||(31570917-31571184)
chr8 (1-271)||(21840854-21841124)
chr8 (153-259)||(22129026-22129132)
chr8 (69-259)||(21850423-21850613)
chr8 (69-259)||(16877181-16877371)
chr8 (234-279)||(19484130-19484175)
chr8 (110-259)||(23900822-23900971)
chr8 (80-259)||(23157098-23157277)
chr8 (147-273)||(19863639-19863765)
chr8 (147-273)||(19868276-19868402)
chr8 (69-259)||(21196588-21196778)
chr8 (117-259)||(22315744-22315886)
chr8 (89-259)||(22982959-22983128)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (1-277)||(43556-43832)
scaffold0028 (1-279)||(15349-15616)
scaffold0028 (1-279)||(8887-9154)
scaffold0028 (1-271)||(50148-50418)
scaffold0028 (117-252)||(106226-106361)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (1-279)||(14762-15040)
scaffold0044 (1-259)||(1022-1280)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (1-279)||(12889-13167)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (1-279)||(17843-18121)
scaffold0106 (1-271)||(14441-14711)
scaffold0106 (1-271)||(31812-32082)
scaffold0106 (203-271)||(18489-18557)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (1-271)||(8192-8462)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-279)||(7799-8077)
[»] scaffold0546 (1 HSPs)
scaffold0546 (1-259)||(4051-4309)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (1-259)||(8998-9256)
scaffold0109 (1-259)||(33219-33477)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (1-259)||(7341-7599)
[»] scaffold0284 (1 HSPs)
scaffold0284 (1-279)||(22269-22547)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (1-279)||(65807-66085)
scaffold0042 (1-259)||(39466-39723)
[»] scaffold0403 (2 HSPs)
scaffold0403 (1-271)||(6774-7044)
scaffold0403 (1-266)||(3193-3458)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (1-277)||(278458-278734)
scaffold0005 (30-270)||(260739-260979)
scaffold0005 (1-76)||(164538-164613)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (1-277)||(197106-197382)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (39-277)||(4727-4965)
scaffold0761 (69-259)||(32-222)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (1-271)||(98-368)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (1-271)||(6425-6695)
scaffold0120 (1-271)||(1158-1428)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (1-279)||(7779-8046)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (1-277)||(451-727)
[»] scaffold0031 (1 HSPs)
scaffold0031 (1-277)||(63659-63935)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (1-271)||(130550-130820)
scaffold0023 (1-274)||(4085-4358)
scaffold0023 (1-271)||(59156-59426)
scaffold0023 (121-277)||(29008-29163)
scaffold0023 (1-85)||(134644-134728)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (1-276)||(6416-6691)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (1-259)||(6451-6709)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (1-271)||(16057-16327)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (3-271)||(5625-5893)
[»] scaffold1355 (1 HSPs)
scaffold1355 (1-273)||(1078-1350)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (30-277)||(3442-3689)
[»] scaffold0081 (3 HSPs)
scaffold0081 (1-271)||(49895-50165)
scaffold0081 (118-277)||(19121-19280)
scaffold0081 (177-277)||(34604-34704)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (31-271)||(19636-19876)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (1-271)||(7963-8232)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (1-271)||(14713-14983)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (1-271)||(229445-229715)
scaffold0012 (1-271)||(219051-219321)
scaffold0012 (111-235)||(32667-32791)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (39-271)||(390834-391066)
scaffold0001 (1-271)||(90566-90836)
scaffold0001 (21-214)||(114602-114795)
scaffold0001 (186-271)||(89888-89973)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-271)||(9372-9642)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (1-271)||(328-598)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (1-271)||(25353-25623)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (1-271)||(16050-16320)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (1-271)||(15279-15549)
scaffold0040 (39-271)||(113121-113353)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (1-271)||(116539-116809)
scaffold0037 (69-196)||(98485-98612)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (1-271)||(112423-112693)
scaffold0004 (3-271)||(203102-203370)
scaffold0004 (1-271)||(117970-118240)
scaffold0004 (1-271)||(386221-386491)
scaffold0004 (1-271)||(323106-323376)
[»] scaffold0010 (3 HSPs)
scaffold0010 (18-267)||(2340-2589)
scaffold0010 (1-268)||(41970-42237)
scaffold0010 (1-271)||(47033-47303)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (2-274)||(24702-24974)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-271)||(9745-10015)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-271)||(18839-19109)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (1-271)||(26167-26437)
scaffold0011 (30-271)||(195338-195578)
scaffold0011 (30-267)||(149001-149238)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (1-271)||(5225-5495)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (1-271)||(1310-1580)
[»] scaffold0396 (1 HSPs)
scaffold0396 (1-267)||(4433-4699)
[»] scaffold0180 (1 HSPs)
scaffold0180 (1-271)||(32387-32656)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-277)||(180619-180877)
scaffold0020 (1-271)||(101186-101456)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-259)||(1401-1659)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (89-271)||(25464-25646)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (9-271)||(1675-1937)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (1-271)||(3542-3812)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (80-271)||(80128-80319)
scaffold0022 (1-193)||(126911-127103)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (1-151)||(46630-46780)
scaffold0007 (1-261)||(86154-86408)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (1-249)||(12633-12881)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (1-271)||(40140-40410)
[»] scaffold0064 (2 HSPs)
scaffold0064 (1-271)||(28402-28672)
scaffold0064 (1-271)||(40393-40663)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (42-271)||(11302-11531)
scaffold0149 (51-271)||(6871-7091)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (1-271)||(27627-27897)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-271)||(33311-33581)
scaffold0076 (69-259)||(40728-40918)
[»] scaffold0232 (1 HSPs)
scaffold0232 (30-271)||(2509-2750)
[»] scaffold1001 (1 HSPs)
scaffold1001 (1-195)||(73-267)
[»] scaffold0298 (3 HSPs)
scaffold0298 (1-271)||(20385-20655)
scaffold0298 (30-271)||(12995-13236)
scaffold0298 (30-271)||(16765-17006)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (1-271)||(43185-43455)
[»] scaffold0600 (1 HSPs)
scaffold0600 (30-271)||(4306-4547)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (3-271)||(249017-249285)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (1-271)||(271-541)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (1-271)||(10195-10465)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (1-271)||(51497-51767)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (120-271)||(1988-2139)
[»] scaffold0326 (1 HSPs)
scaffold0326 (1-271)||(18171-18441)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (1-271)||(47526-47796)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-271)||(19522-19792)
[»] scaffold0894 (2 HSPs)
scaffold0894 (139-271)||(2914-3046)
scaffold0894 (1-148)||(1541-1688)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (24-271)||(6670-6917)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-268)||(16350-16617)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (1-271)||(5152-5422)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (1-271)||(6872-7142)
[»] scaffold0192 (2 HSPs)
scaffold0192 (1-271)||(26544-26814)
scaffold0192 (1-271)||(26926-27196)
[»] scaffold0139 (3 HSPs)
scaffold0139 (1-267)||(787-1053)
scaffold0139 (1-241)||(27921-28161)
scaffold0139 (117-241)||(34290-34414)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (30-271)||(41350-41589)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (30-271)||(2225-2466)
[»] scaffold0518 (1 HSPs)
scaffold0518 (30-271)||(11200-11441)
[»] scaffold0323 (1 HSPs)
scaffold0323 (1-258)||(4945-5202)
[»] scaffold0071 (1 HSPs)
scaffold0071 (30-271)||(48841-49082)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (30-271)||(13535-13776)
scaffold0034 (30-271)||(4587-4828)
scaffold0034 (126-271)||(67897-68042)
[»] scaffold0348 (1 HSPs)
scaffold0348 (1-271)||(6586-6856)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (1-271)||(48668-48937)
scaffold0053 (1-211)||(57511-57721)
[»] scaffold0067 (3 HSPs)
scaffold0067 (30-271)||(51814-52054)
scaffold0067 (30-271)||(60848-61088)
scaffold0067 (30-271)||(67236-67476)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (30-258)||(37633-37861)
[»] scaffold0235 (3 HSPs)
scaffold0235 (1-271)||(21305-21575)
scaffold0235 (89-217)||(26296-26424)
scaffold0235 (198-271)||(11091-11164)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (1-271)||(930-1200)
scaffold0104 (204-271)||(12582-12649)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (30-271)||(529-770)
[»] scaffold0574 (1 HSPs)
scaffold0574 (117-270)||(844-997)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (51-220)||(10425-10594)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (30-271)||(5086-5327)
[»] scaffold0222 (1 HSPs)
scaffold0222 (1-268)||(2992-3259)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (1-271)||(26663-26933)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (1-271)||(3153-3423)
scaffold0035 (147-268)||(12833-12954)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (30-259)||(1618-1847)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (51-271)||(43957-44177)
scaffold0114 (51-271)||(44969-45189)
scaffold0114 (3-214)||(20526-20737)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (75-270)||(12420-12615)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (3-271)||(5969-6239)
[»] scaffold0124 (3 HSPs)
scaffold0124 (117-271)||(38-192)
scaffold0124 (30-271)||(11319-11560)
scaffold0124 (69-259)||(7456-7646)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (1-259)||(25511-25769)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (1-259)||(19251-19509)
scaffold0090 (1-259)||(23413-23671)
[»] scaffold0742 (1 HSPs)
scaffold0742 (30-271)||(5644-5885)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (165-271)||(12060-12166)
scaffold0483 (1-206)||(9782-9987)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (53-271)||(4884-5102)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (153-271)||(4425-4543)
scaffold0270 (153-271)||(11555-11673)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (69-271)||(68225-68427)
scaffold0066 (69-259)||(46624-46814)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (31-271)||(32953-33193)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (117-232)||(17877-17992)
[»] scaffold0145 (1 HSPs)
scaffold0145 (186-271)||(39645-39730)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-259)||(880-1138)
[»] scaffold1710 (1 HSPs)
scaffold1710 (30-233)||(320-523)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (198-271)||(8721-8794)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (198-277)||(24097-24176)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (144-267)||(81470-81593)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (1-162)||(13994-14155)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (69-259)||(3521-3711)
[»] scaffold0305 (1 HSPs)
scaffold0305 (110-252)||(11167-11309)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (69-259)||(23864-24054)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (117-259)||(5693-5835)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (69-259)||(9507-9697)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (89-259)||(18541-18711)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (110-259)||(7679-7828)
[»] scaffold0216 (1 HSPs)
scaffold0216 (1-57)||(628-684)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (144-259)||(33059-33174)
scaffold0021 (165-259)||(24529-24623)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (89-259)||(13398-13568)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (132-259)||(700-827)
[»] scaffold0111 (1 HSPs)
scaffold0111 (80-259)||(3565-3744)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (69-259)||(3629-3818)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (117-259)||(24398-24540)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (1-62)||(17389-17450)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (132-259)||(14670-14798)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (1-72)||(404-475)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (80-259)||(44019-44198)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (80-259)||(27912-28091)
[»] scaffold1061 (1 HSPs)
scaffold1061 (198-271)||(2187-2260)
[»] scaffold0682 (1 HSPs)
scaffold0682 (186-271)||(470-555)
[»] scaffold0019 (1 HSPs)
scaffold0019 (30-79)||(136341-136390)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (156-252)||(19-115)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (89-217)||(1112-1240)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 63)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 27187671 - 27187949
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27187671 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 27187770  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27187771 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 27187870  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27187871 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 27187949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27261569 - 27261291
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27261569 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 27261470  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27261469 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 27261370  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  27261369 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 27261291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24313214 - 24312936
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24313214 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatc 24313115  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24313114 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 24313015  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  24313014 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 24312936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 1543130 - 1542854
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1543130 caatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 1543031  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1543030 ctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 1542931  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  1542930 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 1542854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 2874849 - 2874571
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2874849 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 2874750  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2874749 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 2874650  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||    
T  2874649 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaagttcacaatctccttga 2874571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 25112787 - 25113065
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25112787 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatc 25112886  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  25112887 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataggccgaacttaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttc 25112986  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  25112987 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 25113065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16626763 - 16626485
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16626763 caatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattttcaacaaatc 16626664  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  16626663 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcatctttgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 16626564  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16626563 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 16626485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28263243 - 28262985
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28263243 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatc 28263144  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28263143 ctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 28263044  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28263043 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 28262985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28292418 - 28292148
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28292418 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactgtccgaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatc 28292319  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  28292318 ctctagtgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 28292219  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28292218 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 28292148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28341992 - 28341734
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28341992 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatc 28341893  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28341892 ctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 28341793  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28341792 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 28341734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 29591966 - 29591688
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29591966 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaattctcaacaaatc 29591867  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29591866 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcactctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 29591767  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||    
T  29591766 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaagggacaccatgcaacttcacaatctccttga 29591688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 3 - 259
Target Start/End: Original strand, 17032620 - 17032876
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  17032620 atactagaatgataactattagtgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatctt 17032719  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17032720 ctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttcca 17032819  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17032820 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 17032876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5839265 - 5838987
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5839265 caatgctagaatgataactattattatacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 5839166  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  5839165 ctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttc 5839066  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  5839065 caaaatctagaagtaaatcttggatctctaactgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttccttga 5838987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 19864922 - 19865198
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  19864922 caataccaaaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactagcccaggttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 19865021  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  19865022 ctctagcgactgaatcgtcctatccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttc 19865121  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19865122 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgtaggaacaccatgaaacttcacaatctcctt 19865198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25609907 - 25609640
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25609907 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 25609808  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  25609807 ttctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttc 25609708  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||    
T  25609707 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatggtcgaaggaacaccatgcaacttcac 25609640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Original strand, 22434104 - 22434378
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  22434104 caatactagaatgataactgttattgtaagtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatc 22434203  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  22434204 ttctaacgacttaatcgtcctctccgactaatcatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttc 22434303  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 275  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22434304 caaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22434378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27331479 - 27331209
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  27331479 caatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaagtc 27331380  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  27331379 ctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttc 27331280  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27331279 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27331209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27392219 - 27391949
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  27392219 caatactagaatgataactattattgtacatgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaaccctcaacaagtc 27392120  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  27392119 ctctagcgactgaatcgtcctctctgacagaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaactcaaagcctcttgcaaacttttc 27392020  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  27392019 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 27391949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18407989 - 18407718
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattatta-taagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 99  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||  || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  18407989 caatactagaatgataactagtatttgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaat 18407890  T
Q  100 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 199  Q
    | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  18407889 cttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccctctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactttt 18407790  T
Q  200 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18407789 ccaaaatctagacgtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18407718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16927686 - 16927416
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| |||||||||||    
T  16927686 caatactagaatgatagctattgttatacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagttccagcttgctctagcacacaaatcctcaacaaatc 16927587  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  16927586 ctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttc 16927487  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  16927486 caaaatctagaagtaaatctcgggtctctatttgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 16927416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22762501 - 22762231
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||    
T  22762501 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatctcaagttcctccttcctcaagtacacaaactctcaacaaatc 22762402  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||| |||||||||||    
T  22762401 ttctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatcagtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctctggcaaacttttc 22762302  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22762301 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22762231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22078734 - 22078478
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||  ||| |||||||| || |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||| | ||||||||||    
T  22078734 caatactagaa--ataactattattgtacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagttcacaaactttcaacaaatc 22078637  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22078636 ttccagcgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagagcctaaagcctcttgcaaacttttc 22078537  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22078536 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatg 22078478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16963413 - 16963155
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| | |||||||| || ||||| |||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| || |||||||     
T  16963413 caatactagaatgatagctattgttagacgtgaactctattaacgggagatgactgtcccaagtttcaccttgctctagcacacaaatccttaacaaatt 16963314  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  16963313 ctctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttggtacctaaagcctcttgcaaacttttc 16963214  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16963213 caaaatctagaagtaaatctcgggtctctatctgatataatgctcgaaggaacaccatg 16963155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 23078704 - 23078974
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |     
T  23078704 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctataaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagta 23078803  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || | ||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||  | || |||| |||||| ||||| |||    
T  23078804 ttccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctctctgcggacgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagactcttgtaaactcttc 23078903  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23078904 aaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 23078974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Original strand, 25768455 - 25768696
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||| |  |||||||| ||  |||||||||    
T  25768455 gtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttagcaaatcctcgaatgactgaatcgttttctccgact 25768554  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||| || ||||||||    
T  25768555 gaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttggaaactcttccaaaatcttgaattaaacctcggatctct 25768654  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  25768655 atcggacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 25768696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14381513 - 14381243
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  14381513 caatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaagttccaccttgcttaagcacacacactctcaacaaatc 14381414  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || |  || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  14381413 ctccaatgatttgatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagctgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttc 14381314  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  14381313 cagaatctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 14381243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 19879533 - 19879803
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |||    
T  19879533 caatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatc 19879632  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  19879633 ctctaaggattgtatcgtcctctctgactgtccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttc 19879732  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  19879733 cagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 19879803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 34645632 - 34645362
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| |||||||| || || |||||||| |  || |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||    
T  34645632 caatactcgaatggtaactattgttataagtaaattctatcaacggtaagtggctatcccacgctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatc 34645533  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  34645532 ctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaactcttc 34645433  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  34645432 caaaatcttgaagtaaaccttggatccctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 34645362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Original strand, 1641007 - 1641212
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  1641007 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 1641106  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  1641107 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttc 1641206  T
Q  201 caaaat 206  Q
    ||||||    
T  1641207 caaaat 1641212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 55 - 271
Target Start/End: Original strand, 15896383 - 15896599
Alignment:
Q  55 tatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgc 154  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || | |||||||||  | || |||||||||  |||||||||||||||||| ||    
T  15896383 tatcccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtcttccaacgactgaatcattctttccgactgattatctgtctgcggatgatacgc 15896482  T
Q  155 cgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaca 254  Q
    |||||||||  ||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||| |||||||| | ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15896483 cgaactcaacttcaacttagaacctacagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtatacctcacatctctatctgatacaatgctcgacggaaca 15896582  T
Q  255 ccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||    
T  15896583 ccatgtagcttcacaat 15896599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 17415721 - 17415991
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||| |||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||| ||||||    
T  17415721 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcgacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcagcaaatc 17415820  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||    
T  17415821 ctccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttc 17415920  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  17415921 caaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 17415991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21564178 - 21563908
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||||  | || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  21564178 caatactcgaatggtaactattgatgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatc 21564079  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  21564078 ctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 21563979  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  | |||||||| ||||| |||||    
T  21563978 caaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgtacaccatgaagcttaacaat 21563908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 21471836 - 21472106
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| |  || ||    
T  21471836 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaaatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagaaagtc 21471935  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  21471936 ctctaatgactgaatagttctctcccactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 21472035  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21472036 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgaaacttcacaat 21472106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22796678 - 22796408
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  22796678 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaatctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 22796579  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||  ||| ||||| || |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  22796578 ctctgacgattgaatcgttctctccgactgaccatatgtttgcgaatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaatgcatcttgcaaactcttc 22796479  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  22796478 caaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 22796408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 32 - 271
Target Start/End: Original strand, 19453686 - 19453925
Alignment:
Q  32 gaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 131  Q
    |||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||||| |  || |  || |||||||||||||||    
T  19453686 gaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatcctccaatgattagatcgtcctctccgactga 19453785  T
Q  132 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||    
T  19453786 ccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaggtgaacctcggatccctat 19453885  T
Q  232 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    | || | ||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19453886 ccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 19453925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 24364647 - 24364914
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  24364647 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatc 24364746  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || | ||| ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  24364747 ttccaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 24364846  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  24364847 cagaacctagaagtgaacctcggatctctattcgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 24364914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5297251 - 5296982
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  5297251 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatccca-gctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 5297153  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  5297152 ctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaacccaacctcaatttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttc 5297053  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5297052 cagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5296982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 10468895 - 10468625
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | |||||||| || ||||| |  |||||||||||    
T  10468895 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcgagcacacacaccctcaacaaatc 10468796  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  10468795 ttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttc 10468696  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  10468695 caaaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 10468625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21569986 - 21569767
Alignment:
Q  52 gactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 151  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21569986 gactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 21569887  T
Q  152 tgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagga 251  Q
     | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || | |||||||||  | ||||| |||||  |     
T  21569886 agtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcgaatctctatcctacacaatactcgaccgt 21569787  T
Q  252 acaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| |||||    
T  21569786 acaccatgaagcttaacaat 21569767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27560032 - 27559765
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || |    
T  27560032 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtctt 27559933  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  27559932 ccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 27559833  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27559832 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27559765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 27560661 - 27560394
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || |    
T  27560661 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtctt 27560562  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  27560561 ccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 27560462  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27560461 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27560394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 275
Target Start/End: Complemental strand, 11280551 - 11280277
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |||    
T  11280551 caatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaattctgtcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaaaagatc 11280452  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     ||||  || || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  11280451 ttctaaggattgcattgtcctctctgactggccatcggtctgaggatggtaagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttc 11280352  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 275  Q
    || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||| | || |||||| | |||||||||||||    
T  11280351 cagaatctagatgtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgatgtaataccatgcaacttcacaatttcc 11280277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 15459571 - 15459838
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  |||||    
T  15459571 caatacttgaatgataactgttattgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatc 15459670  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| || || ||||| || || || |||||  ||    
T  15459671 ctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacttcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctc 15459770  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  15459771 caaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcac 15459838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 28282857 - 28282590
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || |    
T  28282857 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtctt 28282758  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  28282757 ccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 28282658  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28282657 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 28282590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 18794925 - 18795195
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | |||    
T  18794925 caatactcgaatggtaactattgttgtaggtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatc 18795024  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || ||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||  |||    
T  18795025 ctctaaagattgtatcgtcctctccgattgaccatccgtatgaggatgataagccaaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaacgcttc 18795124  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  18795125 cataatctagaagtgaacctcggatctctatctgacacagtactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 18795195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 165 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 21837079 - 21836965
Alignment:
Q  165 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 264  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  21837079 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaact 21836980  T
Q  265 tcacaatttccttga 279  Q
    ||||||| |||||||    
T  21836979 tcacaatctccttga 21836965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 118 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8762862 - 8762709
Alignment:
Q  118 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  8762862 tcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctagaagtgaa 8762763  T
Q  218 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  8762762 cctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacgccatgtagcttcacaat 8762709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 180 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20637168 - 20637077
Alignment:
Q  180 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  20637168 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 20637077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18197610 - 18197504
Alignment:
Q  165 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 264  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18197610 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgatggaacaccatgtagct 18197511  T
Q  265 tcacaat 271  Q
    |||||||    
T  18197510 tcacaat 18197504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 275
Target Start/End: Original strand, 22442710 - 22442776
Alignment:
Q  209 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcc 275  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    
T  22442710 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcactatttcc 22442776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 12498261 - 12498326
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 66  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498261 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12498326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 12505590 - 12505655
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 66  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12505590 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12505655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 12510640 - 12510575
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 66  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12510640 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttc 12510575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16382351 - 16382161
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  16382351 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 16382252  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16382251 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16382161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Original strand, 23996571 - 23996741
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  23996571 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 23996670  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| ||  |||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  23996671 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 23996741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 8766194 - 8766111
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacac 84  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8766194 caatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacac 8766111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 18837886 - 18837696
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||||    
T  18837886 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaaactca 18837787  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18837786 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18837696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 23027607 - 23027522
Alignment:
Q  156 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 241  Q
    |||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  23027607 gaactcaacctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatccctatctgacacaat 23027522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 259
Target Start/End: Original strand, 16098416 - 16098543
Alignment:
Q  132 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 231  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  16098416 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 16098515  T
Q  232 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| ||||| || ||||| | ||||||    
T  16098516 ctgacacaatactagaaggtataccatg 16098543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Original strand, 21927577 - 21927698
Alignment:
Q  138 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 237  Q
    ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  21927577 gtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaatgcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 21927676  T
Q  238 caatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  21927677 caatactagaaggaataccatg 21927698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 139 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1648722 - 1648602
Alignment:
Q  139 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 238  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||    
T  1648722 tctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacac 1648623  T
Q  239 aatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||| || ||||||| ||||||    
T  1648622 aatactagaaggaataccatg 1648602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 14625216 - 14625068
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||| |||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14625216 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcatctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14625117  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 217  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  14625116 atttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 14625068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25743018 - 25742876
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |  || |||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  25743018 gtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagtagatctcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgtaaactctcccaaaacgtagaagtaa 25742919  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    | ||  |||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25742918 acctcagatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25742876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 67)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15589532 - 15589262
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15589532 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatc 15589433  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15589432 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 15589333  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15589332 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 15589262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20062194 - 20061924
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20062194 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 20062095  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20062094 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 20061995  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20061994 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 20061924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 53385158 - 53384888
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53385158 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 53385059  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  53385058 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 53384959  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53384958 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 53384888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16756725 - 16756455
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16756725 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatc 16756626  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16756625 ctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 16756526  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16756525 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 16756455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 48425437 - 48425715
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48425437 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 48425536  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  48425537 ctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 48425636  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  48425637 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 48425715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 10005590 - 10005860
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10005590 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatc 10005689  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10005690 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgtaaacttttc 10005789  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10005790 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 10005860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 10906200 - 10906470
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  10906200 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctcgttcaagaacacaaattctcaacaaatc 10906299  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10906300 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 10906399  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  10906400 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 10906470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 16635763 - 16636033
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16635763 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 16635862  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16635863 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 16635962  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16635963 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16636033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 43163087 - 43163357
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43163087 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 43163186  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  43163187 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 43163286  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  43163287 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 43163357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15348385 - 15348107
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15348385 caatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 15348286  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15348285 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 15348186  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  15348185 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatctccttga 15348107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 5425070 - 5424792
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5425070 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatc 5424971  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  5424970 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 5424871  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  5424870 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctccttga 5424792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 12498238 - 12498508
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12498238 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 12498337  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12498338 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 12498437  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12498438 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 12498508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14876639 - 14876381
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14876639 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaatatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 14876540  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14876539 ttctagcgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 14876440  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14876439 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 14876381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16807066 - 16806788
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16807066 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 16806967  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||    
T  16806966 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcctcttgctaacttttc 16806867  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  16806866 caaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttga 16806788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 13252680 - 13252958
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13252680 caatactagaatggtaactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatc 13252779  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  13252780 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 13252879  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  13252880 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 13252958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 16371403 - 16371679
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16371403 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatgaaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 16371502  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16371503 ctctagcgactgaatcgtcctttccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttc 16371602  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16371603 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 16371679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14126734 - 14126464
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14126734 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 14126635  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  14126634 ctctagcgactgaatcctcctcaccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaacttttc 14126535  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14126534 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14126464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15402650 - 15402372
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15402650 caatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatc 15402551  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15402550 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccagctgtctatggatgatacgccgaactcaatctcagcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 15402451  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  15402450 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 15402372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 15725074 - 15724816
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15725074 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 15724975  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15724974 ctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 15724875  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||    
T  15724874 caaaatctacaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcctgaaggaacaccatg 15724816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16412422 - 16412144
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16412422 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaatc 16412323  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || || |||||  |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16412322 ctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggttgatactccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 16412223  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16412222 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 16412144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26792539 - 26792261
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26792539 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatc 26792440  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  26792439 ctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 26792340  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  26792339 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctggaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 26792261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11564821 - 11564545
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||    
T  11564821 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctttctcaagaacacacactctcagcaaatc 11564722  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  11564721 ctctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatttcaacttcgaacccaaagcctcttgctaacttttc 11564622  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11564621 caaaatctagaagaaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatctcctt 11564545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 15339259 - 15339537
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  15339259 caatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatc 15339358  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15339359 ctctagcgactgaattgtcctcttcgactgaccatctgtctgtcgatgatacgccgaactcaatctcagctacgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 15339458  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  15339459 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgagggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 15339537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 6600737 - 6600996
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  6600737 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaa-----------atc 6600825  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  6600826 ctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 6600925  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6600926 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 6600996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 16692150 - 16692432
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16692150 caatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 16692249  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcct----cttgcaaact 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    ||||||||||    
T  16692250 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatccgtctgtggatgataagctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctctagcttgcaaact 16692349  T
Q  197 tttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||    
T  16692350 tttccaaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttga 16692432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 9522709 - 9522979
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  9522709 caatactagaatgataaatattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 9522808  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  9522809 ttctagcgactgaaacgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 9522908  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9522909 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 9522979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 32 - 277
Target Start/End: Original strand, 15061777 - 15062022
Alignment:
Q  32 gaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactga 131  Q
    |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15061777 gaactcaatcaatggaaaatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacataaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctttccgactga 15061876  T
Q  132 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 231  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15061877 ccatctgtctgcgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactattccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 15061976  T
Q  232 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15061977 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatttcctt 15062022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 17489840 - 17490110
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||    
T  17489840 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacagatc 17489939  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  17489940 ttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 17490039  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  17490040 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 17490110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16492321 - 16492051
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  16492321 caatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagaacacaaacccttaacaaatc 16492222  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  16492221 ttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacaccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 16492122  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16492121 cataatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16492051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 15248137 - 15248407
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  15248137 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaattacacaaactctcaacaaatc 15248236  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  15248237 ctctaacgactaaatcgttctctccaactgaccatctgtctgctgatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 15248336  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  15248337 caaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 15248407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 15208881 - 15209151
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  15208881 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaatacacaaactctcaacaaatc 15208980  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| |||||||||  | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || | | ||||||||||| | |||    
T  15208981 ttctaacgactgaatcattctctcagactgaccatctgtctgcggatgatacgccgagctcaacctcaacttagaacctacaacctcttgcaaaatcttc 15209080  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  15209081 caaaatctagaagtaaatctcatatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 15209151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 15227649 - 15227919
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||||||||||    
T  15227649 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcaacaaatc 15227748  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||| || |||||| | |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  15227749 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccaattgtttgcggatgataagctgaactccacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttc 15227848  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  15227849 caaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgatacaatactcgatggaacaccatgcagcttcgcaat 15227919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15015884 - 15015634
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||| |||||||| || || |||||  |||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  15015884 caatgctagaatggtaactgttattgcaagtgaactcgatcaatgagagatgactatcccaagttccgccttgctcaagtacacaaattctcaacaagtc 15015785  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | || |||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  15015784 ctccaacgtctgaattgtcctctccgactg------------cggatgatatgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttc 15015697  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagc 263  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15015696 ctaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagc 15015634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13972249 - 13971979
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |||    
T  13972249 caatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatc 13972150  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  13972149 ctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttc 13972050  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  13972049 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 13971979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 14086673 - 14086943
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |||    
T  14086673 caatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatc 14086772  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  14086773 ctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttc 14086872  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  14086873 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 14086943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Original strand, 14573958 - 14574199
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| | ||| |   ||| ||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||    
T  14573958 gtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtatacacaccatcagcaaatcctctaacgactgaatcgtactctctgact 14574057  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||   ||||||    
T  14574058 gaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctgaaatctct 14574157  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||| ||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  14574158 atctgacacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaat 14574199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15953068 - 15952827
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||  || || || |||||||||||||    
T  15953068 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaactcctctaatgattggatcgtcctctccgact 15952969  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  15952968 gaccatatgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctct 15952869  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  15952868 atccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaat 15952827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11303902 - 11303632
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| || |||||||  |||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  11303902 caatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactatatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgctcaagtacacacactcttaacaaatc 11303803  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||    
T  11303802 ctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaggcgtcctgcaaactcttc 11303703  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11303702 caaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 11303632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Original strand, 17492638 - 17492900
Alignment:
Q  9 gaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcg 108  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  |    
T  17492638 gaatgataactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagatccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatg 17492737  T
Q  109 actgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatct 208  Q
    | || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  17492738 attggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaagttcgaccccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatct 17492837  T
Q  209 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||| || || ||||||||||| || ||||  | | | ||||||||||| | |||||||||    
T  17492838 agaagtgaacctcggatctctatccgaaacaacacacaacggaacaccatgcaacttcacaat 17492900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 28754318 - 28754585
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  28754318 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 28754417  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  28754418 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 28754517  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||||||    
T  28754518 cagaacctagaagtaaacctcggatctctatctgacacaatactagacggaacaccatgaagcttcac 28754585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12850379 - 12850138
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  12850379 gtgaactctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacaatctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgact 12850280  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||    
T  12850279 gaccatctgtctacggattataagccgaactcaacctcaactttgaatccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctct 12850180  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || |||||||| || || |||||||| | |||||||||    
T  12850179 atccgacacaatgcttgatgggacaccatgcaacttcacaat 12850138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Original strand, 44777249 - 44777516
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || |    
T  44777249 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtctt 44777348  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||    
T  44777349 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgagcccaaagcatcctgtaaactcttcca 44777448  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
     || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  44777449 gaacctagaagtaaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgtagcttcacaa 44777516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 33 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13322749 - 13322511
Alignment:
Q  33 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 132  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||    
T  13322749 aactctatcaaaggtaggtgactatcccaagcttcaccttgctcaagcacacatactcttaggaaatcctctaaggattgaatcgtcctctccgactgac 13322650  T
Q  133 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 232  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||  |||| |||||    
T  13322649 catctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacctcgaacccaaaacatcttgcaaactcttccagaatctagaagtaaacctcagatccctatc 13322550  T
Q  233 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13322549 tgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 13322511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 3 - 268
Target Start/End: Original strand, 13942026 - 13942291
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  13942026 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcct 13942125  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  13942126 ccattgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 13942225  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13942226 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcac 13942291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16836610 - 16836370
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| | ||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||  | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  16836610 gtgaactctaccaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacgcactctcaacaaatcctccaaggattggatcgtcctctccgact 16836511  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  16836510 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaatctagatgtgaacctcggatctct 16836411  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    ||| ||| |||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  16836410 atccgatgcaatactcgacggaactccatgaagcttcacaa 16836370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 8759209 - 8758942
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  8759209 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcct 8759110  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  8759109 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 8759010  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8759009 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 8758942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 10383969 - 10384235
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  10383969 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 10384068  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||| ||||    
T  10384069 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgcaaacatttc 10384168  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||  | ||||||||||| ||||||||    
T  10384169 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatact-aacggaacaccatgaagcttcac 10384235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Original strand, 41177524 - 41177791
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  41177524 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccatgttcaagcacacacactctcaacaagtcct 41177623  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  41177624 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 41177723  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41177724 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 41177791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12360671 - 12360401
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | | |||| |||||    
T  12360671 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatccgaagctccaccttgctcaagtacacacactttcaataaatc 12360572  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||    
T  12360571 ctccaaagattgtatggtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaatctcttc 12360472  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || |||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||| | || ||||||||||||||||||||    
T  12360471 cataatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactctacggtacaccatgtagcttcacaat 12360401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 47123944 - 47124211
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  47123944 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 47124043  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  47124044 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttc 47124143  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  47124144 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 47124211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 10420174 - 10419907
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || |  |||||    
T  10420174 caatacttgaatgataactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagtaaatc 10420075  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  ||    
T  10420074 ctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctc 10419975  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| | ||||||    
T  10419974 caaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcac 10419907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16329788 - 16329520
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||    |||||||||||    
T  16329788 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacc--ctcaacaaatc 16329691  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  16329690 ttccaatgattgaattgtcctctccgactaaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaactcttc 16329591  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  16329590 cagaacctagaaatgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 16329520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 265
Target Start/End: Original strand, 4678440 - 4678702
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  4678440 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcct 4678539  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  4678540 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 4678639  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagctt 265  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4678640 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctt 4678702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 16381028 - 16380788
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||| ||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || ||  ||||||||||||    
T  16381028 gtgaactctatcaatggtaggtgattatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcatcctctccgact 16380929  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || ||  | ||||| ||    
T  16380928 gaccatctgtctgagaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacatcggatccct 16380829  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  16380828 atccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaa 16380788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 11961163 - 11960992
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||    
T  11961163 caatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatc 11961064  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 172  Q
    ||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11961063 ctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactt 11960992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16828215 - 16828061
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||| |    
T  16828215 gtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaaattcttccaaaatctagaagtga 16828116  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    | || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  16828115 acctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 16828061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 18134475 - 18134215
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||    
T  18134475 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatc 18134376  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || |||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| ||||||||||| |||||||  || |||||||| |||    
T  18134375 ctccaatgattggatcgtccgctccgactgaccatctgtctgaggatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaaagtgtcctgcaaactcttc 18134276  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 261  Q
    || |||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||    
T  18134275 cagaatctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgta 18134215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 51 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16338591 - 16338371
Alignment:
Q  51 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 150  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  || |||||||| || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16338591 tgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctaaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgat 16338492  T
Q  151 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 250  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||| | || || ||||| ||||| || ||||| || || ||    
T  16338491 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaactgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacgg 16338392  T
Q  251 aacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     ||||| || |||||||||||    
T  16338391 tacaccgtgcagcttcacaat 16338371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Original strand, 13001909 - 13002070
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| | |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  13001909 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctattaacggtaaatgactatcccaagctcc-ccttgctcaagtacacacactctcatcaaatc 13002007  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaa 163  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  13002008 ctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgtttgcgggtgataagccgaactcaa 13002070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 26009122 - 26008948
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||  ||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | |||    
T  26009122 caatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctctcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatc 26009023  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 175  Q
    |||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  26009022 ctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcga 26008948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 69 - 258
Target Start/End: Original strand, 15576818 - 15577007
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  15576818 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 15576917  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 258  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| |||||    
T  15576918 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccat 15577007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 8274471 - 8274281
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |     ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  8274471 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactttgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 8274372  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  8274371 acttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 8274281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16742734 - 16742585
Alignment:
Q  110 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 209  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  16742734 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 16742635  T
Q  210 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16742634 gaagtaaacctgggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16742585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 252
Target Start/End: Original strand, 18748733 - 18748916
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||| ||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  18748733 ccttgctccaaaacacaagctcttaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctca 18748832  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 252  Q
    | || |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || |||||   |||||| ||||| || |||||||    
T  18748833 atttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcctgatctgacacaatactagaaggaa 18748916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 6152882 - 6152733
Alignment:
Q  110 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 209  Q
    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||  || || ||||||||||||||||| |  | ||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  6152882 ctgaatagtcctctctgtttgcccatcagtctgaggatagtaagcagaactcaatctcaacttagttctcaaagcagcttgcaaactttcccaaaactta 6152783  T
Q  210 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
     |||||||||| ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  6152782 taagtaaatctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 6152733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 13967392 - 13967222
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| ||   |||||| ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  13967392 tctcaacaaatcctccagactctgaatagtcctcttcgtctgcccatccgtctgaggatggttagcagaactcaatctcaacttagttccaaaagcagct 13967293  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || || || | ||  || |||||||| ||||||| ||||||    
T  13967292 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggttcccgatacgacacaatgctagaaggaataccatg 13967222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 226
Target Start/End: Original strand, 17193224 - 17193318
Alignment:
Q  132 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatc 226  Q
    ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||||   |||||||||||| || |||  |||||||||| ||||||||    
T  17193224 ccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagaagcttgcaaactttccctaaacttagaagtaaaccttggatc 17193318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 64)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 10871355 - 10871625
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10871355 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 10871454  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10871455 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 10871554  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10871555 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgcagcttcacaat 10871625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 8198988 - 8199258
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8198988 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 8199087  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8199088 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 8199187  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8199188 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 8199258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44791261 - 44790991
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44791261 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 44791162  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  44791161 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 44791062  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44791061 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 44790991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 14332757 - 14333035
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14332757 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaataaatc 14332856  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  14332857 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 14332956  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  14332957 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 14333035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 18178102 - 18178380
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  18178102 caatactagaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacagatc 18178201  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18178202 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 18178301  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18178302 caaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgttcgaaggaacaccatgtagcttcacaatctccttga 18178380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 8707965 - 8708243
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8707965 caatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 8708064  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8708065 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 8708164  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  8708165 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 8708243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18551668 - 18551390
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18551668 caatactagaatggtaactattattataagtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 18551569  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18551568 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 18551469  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  18551468 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 18551390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17226 - 16948
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17226 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaaactgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 17127  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  17126 ctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttc 17027  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  17026 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcctcacaatctccttga 16948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 9596417 - 9596695
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||| |||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9596417 caataatagaatgatgactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 9596516  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9596517 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 9596616  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  9596617 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagggacaccatgtaacctcacaatctccttga 9596695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 11237123 - 11236845
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11237123 caatacttgaatggtaactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 11237024  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11237023 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 11236924  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||    
T  11236923 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctccttga 11236845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 13686424 - 13686702
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13686424 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 13686523  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13686524 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 13686623  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  13686624 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 13686702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 15160967 - 15160689
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15160967 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 15160868  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15160867 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 15160768  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  15160767 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 15160689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 12687861 - 12688137
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  12687861 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatc 12687960  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12687961 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 12688060  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  12688061 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctcctt 12688137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 11553012 - 11552736
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||    
T  11553012 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacggatcctcaacaaatc 11552913  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11552912 ctctagcaactgaattgtcctctccgactgtccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 11552813  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  11552812 caaaatctagaaggaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 11552736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 14954980 - 14955256
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14954980 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaattctcaacaaatc 14955079  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||     
T  14955080 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctgttgcaaacttttg 14955179  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
     |||  ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| | | ||||||| |||||    
T  14955180 aaaatcctagaagtaaatcttggatctctatccaatacaatgctcgaaggaataccatgcaacgtcacaatctcctt 14955256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 15154567 - 15154294
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  15154567 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 15154468  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||  ||||||||||||    
T  15154467 ctctagcgattgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctgctgcaaacttttc 15154368  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 274  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15154367 caaaatctagaagtgaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 15154294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 14040056 - 14040326
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  14040056 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatc 14040155  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| |||||    
T  14040156 ctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttc 14040255  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14040256 caaaatgtagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14040326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 14350086 - 14350356
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  14350086 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatc 14350185  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || | ||||||||||||| |||||    
T  14350186 ctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctagagcctcttgcaaaattttc 14350285  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14350286 caaaatgtagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14350356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 2 - 271
Target Start/End: Original strand, 15624913 - 15625182
Alignment:
Q  2 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 101  Q
    ||||||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||| |||    
T  15624913 aatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacagaagatgactatcccaagttcctccatgctcaagtacataaactctcaacaagtcc 15625012  T
Q  102 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 201  Q
    || | |||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||    
T  15625013 tccaacgactggattgttctttccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaactcttcc 15625112  T
Q  202 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15625113 aaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcggaacaccatgtagcttcacaat 15625182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11772151 - 11771881
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11772151 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 11772052  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  |||||||| ||  | ||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||  ||    
T  11772051 ttccaatgactgaatcgttttttccgactaaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcctc 11771952  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11771951 caaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 11771881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 21662321 - 21662591
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  21662321 caatgctagaatggtaactattattgtaagtgaactcgattaatggaagatgactatcccaagatcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 21662420  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| || ||||| ||||| | |||||| |||    
T  21662421 ctccaacgactgaattgtcctctccgtctatccatctgtctgcggatgatacgcctaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctacaaactcttc 21662520  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  21662521 caaaatctagaagtaaatcttggatccctatctaatacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaat 21662591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 12206688 - 12206418
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||    
T  12206688 caatactcgaatggtaactattgttgtacgtgaactctatcaacggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaaatc 12206589  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  12206588 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttc 12206489  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  12206488 caaaatctcgatgtaaatcttggatctctatccaacacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaat 12206418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23516679 - 23516520
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  23516679 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatg 23516580  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 160  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||    
T  23516579 ctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgtggatgatacgccgaact 23516520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 13021718 - 13021988
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| |||||| | || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  13021718 caatactcgaatgatagctgttgttataagtgaactctatcaacagtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 13021817  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13021818 ctccaatgattggatagtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaacttttc 13021917  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || ||||| || || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  13021918 cagaacctagaggtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 13021988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15102491 - 15102221
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  15102491 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 15102392  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  15102391 ctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 15102292  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || |||||  |||| || | ||||||||||||||||||    
T  15102291 caaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatattcgatggtaaaccatgtagcttcacaat 15102221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8212016 - 8211749
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  8212016 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 8211917  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||    
T  8211916 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcttgtaaacttttc 8211817  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  8211816 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 8211749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 6413872 - 6414142
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  6413872 caatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagccccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 6413971  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||    
T  6413972 ctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccttctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcatcttgcaaactcttc 6414071  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6414072 caaaatcttgaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 6414142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11388316 - 11388046
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  | |||    
T  11388316 caatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtagatc 11388217  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  11388216 ctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttc 11388117  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  11388116 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 11388046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14264132 - 14263862
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||| | | ||||| ||||||    
T  14264132 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacagtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacagacactctcatcaaatc 14264033  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  14264032 ctctaacgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttc 14263933  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || |||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  14263932 caaaatctagaagtgaacctcggatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 14263862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11306151 - 11305884
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  11306151 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 11306052  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  11306051 ttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 11305952  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  11305951 caaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 11305884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23203368 - 23203245
Alignment:
Q  156 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23203368 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23203269  T
Q  256 catgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  23203268 catgcagcttcacaatctccttga 23203245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 156 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 23509495 - 23509372
Alignment:
Q  156 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 255  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23509495 gaactcaatctcaacttcgaccccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 23509396  T
Q  256 catgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  23509395 catgcagcttcacaatctccttga 23509372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 15204239 - 15204389
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15204239 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactattccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 15204338  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 151  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15204339 ctccaacgactgaattgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgata 15204389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16072182 - 16071912
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||||   || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  16072182 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaccataggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 16072083  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  16072082 ctctaacgattgaatcgtcctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttc 16071983  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||| | || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  16071982 caaaatctagaactgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgtaacttcacaat 16071912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 18053839 - 18053572
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| ||||    
T  18053839 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcct 18053740  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  18053739 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 18053640  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
     || |||||||| || || ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18053639 gaacctagaagtgaacctcggatccctatctgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 18053572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 49152662 - 49152929
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  49152662 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatc 49152761  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  49152762 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttc 49152861  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  49152862 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 49152929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1295 - 1025
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  1295 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 1196  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||| | ||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  1195 ctccaatgattggatcgtcttttccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttc 1096  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || |||| ||| ||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1095 cagaatctagaagtgaaccttgtatccctatccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 1025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 13665898 - 13666168
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||    
T  13665898 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatc 13665997  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| || || |||    
T  13665998 ctctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtaagctcttc 13666097  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  13666098 cagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacgatacaccatgtagcttcacaat 13666168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14286264 - 14285994
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  14286264 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatc 14286165  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |||    
T  14286164 ctctaaagattgtatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaaagcatcttgcaagctcttc 14286065  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    | ||||||||| || || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14286064 cgaaatctagatgtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 14285994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Original strand, 14130263 - 14130503
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || || |||||||||||||    
T  14130263 gtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcctctccgact 14130362  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||    
T  14130363 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccct 14130462  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14130463 atccgacacaatacttgaaggaactccatgtagcttcacaa 14130503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16950359 - 16950089
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||| |||   ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  16950359 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactattccatactccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 16950260  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  16950259 ctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataatccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttc 16950160  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| |||||  | || |||||||||||||||||    
T  16950159 cagaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacagtactccatgtagcttcacaat 16950089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 23505756 - 23505491
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||||| || |    
T  23505756 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtctt 23505657  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  23505656 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 23505557  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| ||||||||||||||    
T  23505556 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacacgaaggaactccatgtagcttcac 23505491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Original strand, 12456065 - 12456333
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||| ||||    
T  12456065 atactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactgtcaacaattcct 12456164  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||| | |||||    
T  12456165 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctggggatgataagccgagctcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgtaaattcttcca 12456264  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  12456265 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 12456333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Original strand, 14434081 - 14434321
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| |  || || || |||||||||||||    
T  14434081 gtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaatgattggatcgtcctctccgact 14434180  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||    
T  14434181 gaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaactcaaagcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccct 14434280  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  14434281 atccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaa 14434321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 19147572 - 19147842
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||    
T  19147572 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaatc 19147671  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  19147672 ctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttc 19147771  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  19147772 caaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 19147842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 20746971 - 20747241
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||    
T  20746971 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactattccaagctccaccttgcttaagtacacacactctcagcaaatc 20747070  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||| ||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  20747071 ctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagttgaactcaacctcatcttagaacccaaggcatcttgcaaactcttc 20747170  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  20747171 caaaatcttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 20747241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 13968556 - 13968289
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  13968556 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaacccaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatc 13968457  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  13968456 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 13968357  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  13968356 cagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 13968289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 26118493 - 26118226
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26118493 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatc 26118394  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||  |||    
T  26118393 ttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacgcttc 26118294  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||  ||||||||||| || |||||    
T  26118293 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgccggaacaccatgaagtttcac 26118226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Original strand, 15340821 - 15341061
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |   | |  || ||||| |||||||    
T  15340821 gtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaattatttgatcgtcctttccgact 15340920  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||    
T  15340921 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcatcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagatgtgaacctcggatccct 15341020  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    ||| || ||||| || |||||||| | ||||||||||||||    
T  15341021 atccgacacaatactagaaggaactctatgtagcttcacaa 15341061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 23199629 - 23199418
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||||||||| | ||||||||| || |    
T  23199629 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagaacacacactctcaacaagtctt 23199530  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  23199529 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagtctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 23199430  T
Q  203 aaatctagaagt 214  Q
     || ||||||||    
T  23199429 gaacctagaagt 23199418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 35964760 - 35964646
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  35964760 caatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatagaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 35964661  T
Q  101 ctctagcgactgaat 115  Q
    ||| | |||||||||    
T  35964660 ctccaacgactgaat 35964646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 159
Target Start/End: Original strand, 12457140 - 12457298
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||| ||| | | |||||| |||||    
T  12457140 caatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatctcaagttccaccttgctcaagcacagacactctcaataaatc 12457239  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaac 159  Q
     || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  12457240 ttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaac 12457298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 4440356 - 4440546
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  |||||| |||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||||    
T  4440356 ccttgctccaaaacacaagctctcaataaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctca 4440455  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  4440456 acttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 4440546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 70 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21674374 - 21674185
Alignment:
Q  70 cttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaa 169  Q
    ||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| | |||||| ||  |||||||||||||    
T  21674374 cttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctcagtctggccatcggtctgggcatgataagcataactcaatctcaa 21674275  T
Q  170 cttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21674274 cttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21674185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Original strand, 14936795 - 14936965
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  14936795 tctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagaagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagct 14936894  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  14936895 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgatacaatactagaaggaataccatg 14936965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Original strand, 15364388 - 15364558
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    |||||||||||||||||    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  15364388 tctcaacaaatcctctaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcctaaagcagct 15364487  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| |||||||| || ||||||| ||||||    
T  15364488 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgatacaatactagaaggaataccatg 15364558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 7824328 - 7824518
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  7824328 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 7824427  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  || |||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7824428 acttagttcctaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7824518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 27107616 - 27107426
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  27107616 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 27107517  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27107516 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27107426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 138 - 259
Target Start/End: Original strand, 17924148 - 17924269
Alignment:
Q  138 gtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata 237  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||    ||||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||||| || ||||| | ||| || |    
T  17924148 gtctggggatgataagccgaactcaacctcaacttatttcccaaagcagcttgcaaactttttcaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgaca 17924247  T
Q  238 caatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| || ||||||| ||||||    
T  17924248 caatactagaaggaataccatg 17924269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 144 - 252
Target Start/End: Original strand, 23641951 - 23642059
Alignment:
Q  144 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 243  Q
    |||||||| || |||||||| || ||||| |  ||||| ||| |||||||||| | ||||||| | | ||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  23641951 ggatgataagcagaactcaaccttaacttagtccccaacgccgcttgcaaactctcccaaaatgtcggagtaaactttggatctctatctgacacaatgc 23642050  T
Q  244 tcgaaggaa 252  Q
    | |||||||    
T  23642051 tagaaggaa 23642059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 217
Target Start/End: Original strand, 45147003 - 45147131
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  ||    
T  45147003 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatccgtctgaggatgataagcagaactcaacctcaacttggttccaaaagcagct 45147102  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 217  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  45147103 tgcaaactttcccaaaacttagaagtaaa 45147131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 15171764 - 15171642
Alignment:
Q  111 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 210  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||  |||| || ||||| ||  |||||||||||||||| |   |||||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  15171764 tgaatagtcctcttcgtctgaccatcgatctgaggctgataagcaaaactcaatctcaacttagtttccaaagccgcttgaaaacttttccgaaacatag 15171665  T
Q  211 aagtaaatcttggatctctatct 233  Q
    ||||||| ||  |||||||||||    
T  15171664 aagtaaacctcagatctctatct 15171642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 188 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 40869 - 40790
Alignment:
Q  188 ttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 267  Q
    ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  40869 ttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcgaaggaagaccatgcagcttca 40790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 177 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17144994 - 17144936
Alignment:
Q  177 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 235  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||  | |||||||| || ||||||||||||||    
T  17144994 cccaaagcctcttgcatactcttccaaaactttgaagtaaacctcggatctctatctga 17144936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 47)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 8386783 - 8387061
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8386783 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 8386882  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8386883 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 8386982  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  8386983 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 8387061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 12476971 - 12477241
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12476971 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 12477070  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  12477071 ctcttgcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 12477170  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  12477171 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 12477241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 18297576 - 18297854
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18297576 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 18297675  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18297676 ctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 18297775  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  18297776 cgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 18297854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 27711707 - 27711985
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27711707 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 27711806  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27711807 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 27711906  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  27711907 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 27711985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29039045 - 29038775
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29039045 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 29038946  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  29038945 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 29038846  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  29038845 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 29038775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 8053264 - 8052986
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8053264 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctgaagaacacaaattctcaacaaatc 8053165  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  8053164 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 8053065  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  8053064 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 8052986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 19778434 - 19778157
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19778434 caatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 19778335  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19778334 ctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 19778235  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  19778234 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttg 19778157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 12524047 - 12524325
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12524047 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatc 12524146  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12524147 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 12524246  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  12524247 caaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 12524325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 14303619 - 14303361
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||| |||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303619 caatactagcatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 14303520  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14303519 ttctagcgactgaattgtcctctccgactaaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 14303420  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14303419 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 14303361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 14680938 - 14681214
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  14680938 caatactagaatgataactattattgtatatgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatc 14681037  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14681038 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 14681137  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||    
T  14681138 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaatctcctt 14681214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 15147525 - 15147249
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  15147525 caatactagaatgataactattattatacgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 15147426  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  15147425 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttc 15147326  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  15147325 caaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 15147249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 23956118 - 23956396
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  23956118 caatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgacggtcctaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatc 23956217  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  23956218 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaacttaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 23956317  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  23956318 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 23956396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 40473411 - 40473689
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40473411 caatactagaataataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatc 40473510  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  40473511 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttc 40473610  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  40473611 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 40473689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16252086 - 16251810
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  16252086 caataatagaatgataactattattgtacgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaacttacaacaaatc 16251987  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16251986 ctctagtgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcgaatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 16251887  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||    
T  16251886 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctcctt 16251810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 18227087 - 18226809
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18227087 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 18226988  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||    
T  18226987 ctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcctc 18226888  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| |||||||    
T  18226887 caaaatctagaagtaaatcttggatctcgatctgatacaatgctcgaaggcacaccatgtaacctcacaatctccttga 18226809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 2 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16355085 - 16354816
Alignment:
Q  2 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16355085 aatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgcttaagaacacaaattctcaacaaatcc 16354986  T
Q  102 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 201  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||    
T  16354985 tctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttcc 16354886  T
Q  202 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16354885 aaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 16354816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 1640066 - 1639793
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  1640066 caatactagaatgataaatattattgtaagtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 1639967  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| ||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  1639966 ctccagcgactgaatcgttctttccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccaaactccacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttc 1639867  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 274  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1639866 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatttc 1639793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Original strand, 7090804 - 7091076
Alignment:
Q  2 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 101  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||||||||||     
T  7090804 aatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctaaagaacccaaaccctcaacaaatct 7090903  T
Q  102 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 201  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||     
T  7090904 tctaacgactaaatcgtcctctccgactgactatctgtctgcggatgatatgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttct 7091003  T
Q  202 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 274  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  7091004 aaaatctagaagtaaattttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttc 7091076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Original strand, 8706291 - 8706559
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  8706291 atactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcct 8706390  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| ||||||||||||||||||||    
T  8706391 ctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaactcaacgcctcttgcaaacttttcca 8706490  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8706491 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcagcttcacaat 8706559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14851007 - 14850737
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  14851007 caatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 14850908  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || | |||||||||  | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  14850907 ttccaacgactgaatcattctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 14850808  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14850807 caaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 14850737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 14266540 - 14266368
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14266540 caatactggaatgatagctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatc 14266441  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttc 173  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14266440 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttc 14266368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 81 - 271
Target Start/End: Original strand, 14691353 - 14691543
Alignment:
Q  81 acacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccca 180  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || |    
T  14691353 acacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaaccta 14691452  T
Q  181 aagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14691453 aagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 14691543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15414927 - 15414657
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  15414927 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggcagatgactatcccaaactccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 15414828  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||| ||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  15414827 atctaacgattgaatcgttctctccgactggctatctgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttc 15414728  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| |||||||||||    
T  15414727 caaaatctagatgtaaatcttggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgcagcttcacaat 15414657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 15078006 - 15078276
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  15078006 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 15078105  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  15078106 ctctaacgactgaatcgttctcttcgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 15078205  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15078206 caaaatcttgaagtaaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcacaat 15078276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1649178 - 1648908
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  1649178 caatactcgaatggtaactgttgttgtaagtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcaacaaatc 1649079  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  1649078 ctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttc 1648979  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     ||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  1648978 taaaatctggaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgaagcttcacaat 1648908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 33 - 271
Target Start/End: Original strand, 15246327 - 15246565
Alignment:
Q  33 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 132  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||  ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || || |||||||||||||    
T  15246327 aactctatcaacggtagttgactatcccaacctccaccttgctcaagtacacacactctcaccaaatcctctaatgattggatcgttctctccgactgac 15246426  T
Q  133 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 232  Q
    |||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||    
T  15246427 catctgtctggggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcgaatctctatc 15246526  T
Q  233 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     |||||||| ||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  15246527 cgatacaatactcgacgaaactccatgtaacttcacaat 15246565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3264695 - 3264428
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  3264695 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 3264596  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  3264595 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttc 3264496  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  3264495 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 3264428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29453438 - 29453171
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  29453438 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 29453339  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  29453338 ttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttc 29453239  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  29453238 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 29453171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15003265 - 15002995
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||    
T  15003265 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacgcttagcaaatc 15003166  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  15003165 ctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttc 15003066  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || || || ||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  15003065 caaaatcttgaagtgaacctcgggtctctttccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 15002995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 20891353 - 20891623
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  20891353 caatacttgaatgatagctattgttatatgtgaactcaatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatc 20891452  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  20891453 ttccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttc 20891552  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || |||||||| || || |||||| |||| || ||||| || || || ||||| || | |||||||||    
T  20891553 cagaacctagaagtgaacctcggatctttatccgacacaatacttgacggtacaccgtgcaacttcacaat 20891623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11207132 - 11206865
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| | ||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  11207132 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaaccaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatc 11207033  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  11207032 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 11206933  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
     | || |||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  11206932 aagaacctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 11206865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 15358962 - 15358721
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| | | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  15358962 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacagacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgact 15358863  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||| |||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||| |||| |||||| ||||| || || ||||||||    
T  15358862 gaccatctctctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttcccaaatcttgaagtgaacctcggatctct 15358763  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  15358762 atccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 15358721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Original strand, 33223318 - 33223564
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct-----ctc 124  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  ||||| || |  || || || |||||     |||    
T  33223318 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcttccaatgattggatcgtcctctcctctc 33223417  T
Q  125 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || |||    
T  33223418 cgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcgga 33223517  T
Q  225 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  33223518 tctctatccgacacaatactcgacgggacaccatgtagcttcacaat 33223564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 130 - 271
Target Start/End: Original strand, 14159970 - 14160111
Alignment:
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14159970 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctct 14160069  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     ||| |||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  14160070 gtctaatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 14160111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Original strand, 15319641 - 15319792
Alignment:
Q  120 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || |    
T  15319641 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacc 15319740  T
Q  220 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    | |||||||||||||| ||||||||||| || |||||||| | |||||||||    
T  15319741 tcggatctctatctgacacaatgctcgatgggacaccatgcaacttcacaat 15319792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 27900757 - 27901027
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| || ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||    
T  27900757 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatgaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatacccttagcaaatc 27900856  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| |||    
T  27900857 ctctaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttc 27900956  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| |||||||| |  || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27900957 caaaatcttgaagtaaaccccgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 27901027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 44661767 - 44661500
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacgg-aagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaat 99  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| |  |||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||||    
T  44661767 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaagacaaga-gactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaat 44661669  T
Q  100 cctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaactttt 199  Q
    | || | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || || || ||||| ||    
T  44661668 cttccaacgattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcgtcctgtaaactctt 44661569  T
Q  200 ccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    ||| || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  44661568 ccagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 44661500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Original strand, 16146283 - 16146459
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctc--aacaaa 98  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||  |  |||    
T  16146283 caatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactcttagtaaa 16146382  T
Q  99 tcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcga 175  Q
    ||||| |  || ||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  16146383 tcctccaaagattgaatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccccaacttcga 16146459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 14159863 - 14159955
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctca 93  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||    
T  14159863 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaaggtgactatcccaagttccaccttgctcaagtacataaactctca 14159955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 14997755 - 14997945
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  14997755 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 14997854  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||| | ||||||    
T  14997855 actttgttgccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggtataccatg 14997945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 89 - 217
Target Start/End: Original strand, 13248104 - 13248232
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  13248104 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 13248203  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 217  Q
    |||||||| | ||| ||  ||||||||||    
T  13248204 tgcaaactctcccagaacttagaagtaaa 13248232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 128 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18549834 - 18549694
Alignment:
Q  128 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatct 227  Q
    ||||||||| || || || |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||    
T  18549834 ctgaccatcagtttgtgggtgatatgcagaactcagttttaacttagttcccaaagcacattgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatct 18549735  T
Q  228 ctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| | ||||||    
T  18549734 ctatccgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcac 18549694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Original strand, 14652679 - 14652754
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 76  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  14652679 caatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttcatctttgctc 14652754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Original strand, 9291322 - 9291464
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  9291322 gtcctctccgtctgtccatcggtctgaggatggtaagcagtactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 9291421  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  9291422 acctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 9291464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 79
Target Start/End: Original strand, 15070784 - 15070862
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 79  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15070784 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaag 15070862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 132 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 15424013 - 15423974
Alignment:
Q  132 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaact 171  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15424013 ccatctgtctgtggatggtatgccgaactcaatctcaact 15423974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 12342696 - 12342548
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||| || |    ||||||  ||||||||| ||| ||||| || || |||||||| ||  ||||||| || |    
T  12342696 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcttcaaaactctgaatattcctctccgtctgcccatcagtatggggatgataagcataactcaacctta 12342597  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 217  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  12342596 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaa 12342548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 52)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 10868852 - 10869122
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10868852 caatactagaatgataactattgttataagtgaactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 10868951  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10868952 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 10869051  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10869052 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 10869122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 16982154 - 16982432
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16982154 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 16982253  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16982254 ctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 16982353  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16982354 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 16982432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 16999002 - 16999272
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16999002 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 16999101  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16999102 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 16999201  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16999202 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16999272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 17063719 - 17063997
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17063719 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 17063818  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17063819 ctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 17063918  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  17063919 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 17063997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 17067377 - 17067655
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17067377 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 17067476  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17067477 ctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 17067576  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  17067577 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 17067655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 9610138 - 9610408
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9610138 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 9610237  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  9610238 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 9610337  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9610338 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 9610408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 24710035 - 24710313
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24710035 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 24710134  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  24710135 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 24710234  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  24710235 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 24710313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 44386010 - 44385740
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44386010 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 44385911  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44385910 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 44385811  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  44385810 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 44385740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 27371271 - 27371549
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27371271 caatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 27371370  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27371371 ctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 27371470  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  27371471 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 27371549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 22325297 - 22325019
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  22325297 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatc 22325198  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  22325197 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 22325098  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  22325097 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 22325019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 27218018 - 27218288
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27218018 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 27218117  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27218118 ctctagcgactgaattgttctgtccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 27218217  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27218218 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 27218288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 41608826 - 41608556
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41608826 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 41608727  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41608726 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 41608627  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  41608626 caaaatctagaagtaaatcttggatctctgtctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 41608556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 5 - 271
Target Start/End: Original strand, 23189013 - 23189279
Alignment:
Q  5 actagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctct 104  Q
    |||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  23189013 actagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaaaaacacaaactctcaataaatcctct 23189112  T
Q  105 agcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaa 204  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23189113 agcgactgaactgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaa 23189212  T
Q  205 atctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  23189213 atctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaat 23189279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 24262372 - 24262650
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24262372 caatacttgaatgataactattattgtatgtggactcgatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 24262471  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24262472 ctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 24262571  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  24262572 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 24262650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21325707 - 21325431
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21325707 caatactagaataataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagcacacaaactctcaacaaatc 21325608  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21325607 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccggactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 21325508  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  21325507 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatataatgctcgacagaacaccatgcaacttcacaatttcctt 21325431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24707923 - 24707647
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||    
T  24707923 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaataaatc 24707824  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  24707823 ttctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttc 24707724  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||    
T  24707723 caaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcataatttcctt 24707647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 24675491 - 24675767
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  24675491 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacagactctcagcaaatc 24675590  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  24675591 ctctagcgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttc 24675690  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24675691 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgctcgaaagaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24675767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21145471 - 21145206
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||           |    
T  21145471 caatactagaatgataactattgttgtatgtgaactcgatcaacggaagatggctatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat-----------c 21145383  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  21145382 ctctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaacttttc 21145283  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  21145282 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 21145206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 22756906 - 22756630
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||| | || || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||| |||||||  |||||||||||    
T  22756906 caatactagaacggtaactgttattgtacgtgaagtctatcaacggaagatgactatccgaagtccctcctttctcaagtacacaaaccctcaacaaatc 22756807  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||    
T  22756806 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtgtatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgaaaactcttc 22756707  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  22756706 caaaatctagaggtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 22756630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 23064079 - 23064346
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23064079 caatacttgaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtacctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 23064178  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  23064179 ttcaaaagactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 23064278  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23064279 caaaatctagaagtaaaacttggatctctatctgacacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcac 23064346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 30211358 - 30211088
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  30211358 caatgctagaatggtaactgttattgtaagtgaactcgaccaatggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 30211259  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||    
T  30211258 ctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttc 30211159  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  30211158 caaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgatggaacaccatgtagcttcacaat 30211088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 21 - 271
Target Start/End: Original strand, 45529533 - 45529783
Alignment:
Q  21 ttattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 120  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  45529533 ttattataaatgaactcgatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaagtcctccaacgactgaattgtcc 45529632  T
Q  121 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 220  Q
    ||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45529633 tctacgtctgtccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatct 45529732  T
Q  221 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45529733 tggatccctatctgatacaatactcgatgcaacaccatgtagcttcacaat 45529783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 24825723 - 24825472
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  24825723 caatactagaatgttaactattattatacgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 24825624  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  24825623 ttccagcgactgaatcgttctttccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 24825524  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 252  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24825523 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 24825472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 120 - 279
Target Start/End: Original strand, 16923010 - 16923169
Alignment:
Q  120 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 219  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16923010 ctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 16923109  T
Q  220 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16923110 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 16923169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 125 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 20442830 - 20442676
Alignment:
Q  125 cgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 224  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20442830 cgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgga 20442731  T
Q  225 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  20442730 tctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacatcacaatctccttga 20442676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 113 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 24877078 - 24876912
Alignment:
Q  113 aattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaa 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24877078 aattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatgtagaa 24876979  T
Q  213 gtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  24876978 gtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 24876912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 118 - 271
Target Start/End: Original strand, 16925479 - 16925632
Alignment:
Q  118 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925479 tcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 16925578  T
Q  218 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16925579 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16925632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 27365520 - 27365250
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |||    
T  27365520 caatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatc 27365421  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  27365420 ctctaaggattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttc 27365321  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  27365320 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 27365250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 23293960 - 23294230
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||| |    
T  23293960 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagcaaacc 23294059  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||    
T  23294060 ctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaagctcttc 23294159  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  23294160 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 23294230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Original strand, 16925262 - 16925378
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925262 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 16925361  T
Q  101 ctctagcgactgaattg 117  Q
    |||||||||||||||||    
T  16925362 ctctagcgactgaattg 16925378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 23276778 - 23277048
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||| | | | ||| ||||||    
T  23276778 caatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacaaacactttcagcaaatc 23276877  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  23276878 ctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaatgcatcttgcaaactcttc 23276977  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || | ||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  23276978 cagaatctagaagtgaacctcgaatcactatccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 23277048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19652464 - 19652223
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  19652464 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaaagattgtatcgtcctctccgact 19652365  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||  |    
T  19652364 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatcctt 19652265  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| || || |||| || |||||||||    
T  19652264 atccgacacaatactcgacggtactccatataacttcacaat 19652223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20828261 - 20828528
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  20828261 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 20828360  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  20828361 ttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttc 20828460  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  20828461 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 20828528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20832987 - 20833254
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  20832987 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 20833086  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  20833087 ttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttc 20833186  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  20833187 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 20833254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 24948591 - 24948861
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||    
T  24948591 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctctgtaaatc 24948690  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || |  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||  |||| || ||||||||||| |||    
T  24948691 ctccaatgattagatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacatcgaaaccaatgcatcttgcaaactcttc 24948790  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || |||||| |||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  24948791 cagaatctataagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 24948861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 24878436 - 24878319
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24878436 caatactataatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatc 24878337  T
Q  101 ctctagcgactgaattgt 118  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  24878336 ctcgagcgactgaattgt 24878319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Original strand, 12574357 - 12574624
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| || || || || |||||||| ||||| || || ||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || |    
T  12574357 atactcgaatgataactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtctt 12574456  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  12574457 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 12574556  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
     || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12574557 gaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 12574624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 31830660 - 31830927
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| || || ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  31830660 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaattcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 31830759  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  31830760 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttc 31830859  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31830860 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31830927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 90 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21125509 - 21125331
Alignment:
Q  90 ctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctctt 189  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||    
T  21125509 ctcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatctt 21125410  T
Q  190 gcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  21125409 gcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaaccccatgtaacttcac 21125331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 1063753 - 1064020
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  1063753 caatacttgaatgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 1063852  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     ||    || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  1063853 ttcccatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaatttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 1063952  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||| || |||||    
T  1063953 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactagacggaacaccatgaagtttcac 1064020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 11358315 - 11358057
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| |  |||||||||||    
T  11358315 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctctagcacacacaccctcaacaaatc 11358216  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  11358215 ttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 11358116  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||    
T  11358115 cagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatg 11358057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Original strand, 27787772 - 27788012
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || || ||||||||||    
T  27787772 gtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgttctctccgact 27787871  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||    
T  27787872 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccct 27787971  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27787972 atccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 27788012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 183 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23107989 - 23107901
Alignment:
Q  183 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23107989 gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatcggacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23107901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 156 - 271
Target Start/End: Original strand, 23110892 - 23111007
Alignment:
Q  156 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacac 255  Q
    |||||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  23110892 gaactcaaccttaactttgaacccaatgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacac 23110991  T
Q  256 catgtagcttcacaat 271  Q
     ||| | |||||||||    
T  23110992 aatgcaacttcacaat 23111007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Original strand, 24641860 - 24642014
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  24641860 gtcctatccgactaaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaagtcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 24641959  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    | || ||| ||||||| || | ||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  24641960 acctcggacctctatccgacataatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 24642014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 30 - 160
Target Start/End: Original strand, 23087481 - 23087611
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  23087481 gtgaactctatcaacgataggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactgaatcgttctctccgact 23087580  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaact 160  Q
    |||||||||| ||| ||||||| || |||||    
T  23087581 gaccatctgtttgccgatgataagctgaact 23087611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Original strand, 25128758 - 25128907
Alignment:
Q  110 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 209  Q
    |||||| ||||||||   ||| ||||| || || |||||||| || ||||||||||||||||| |  |||||||| ||||||||||||| ||||||  ||    
T  25128758 ctgaatagtcctctctatctgcccatcggtatggggatgataagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcatcttgcaaactttcccaaaactta 25128857  T
Q  210 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  25128858 gaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 25128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24570041 - 24569851
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||| |||||||||||| || |    |||||| ||||| || |  || ||||| || || ||||| || || |||||||||||||    
T  24570041 ccttgctccaaaacacaaactctcaacaaatcttccaaactctgaatagtcctttctgtttgcccatcggtgtgaggatggtaagcagaactcaatctca 24569942  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24569941 acttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24569851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 22276349 - 22276538
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  22276349 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctacccatcagtctggggatggtaagcagaactcaatctca 22276448  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22276449 acttagtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatc-gacacaatactagaaggaataccatg 22276538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 128 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23817367 - 23817291
Alignment:
Q  128 ctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaa 204  Q
    ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||||| |||||    
T  23817367 ctgaccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaa 23817291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22761894 - 22761752
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  22761894 gtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagaagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaa 22761795  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22761794 acctcggatcccgatccgacacaatactaaaaggaataccatg 22761752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 24831540 - 24831370
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| | ||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||||||   ||    
T  24831540 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggactgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaaggagct 24831441  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| ||  |||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24831440 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcagatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24831370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 243; Significance: 1e-135; HSPs: 34)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 51333466 - 51333188
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51333466 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 51333367  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  51333366 ctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 51333267  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  51333266 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 51333188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16350572 - 16350294
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16350572 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 16350473  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16350472 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 16350373  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  16350372 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 16350294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 21837336 - 21837614
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21837336 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 21837435  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  21837436 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 21837535  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  21837536 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 21837614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 19106753 - 19107031
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19106753 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 19106852  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19106853 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 19106952  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  19106953 caaaatctagaagtaaatattggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 19107031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 33391002 - 33390724
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33391002 caatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 33390903  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  33390902 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 33390803  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  33390802 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 33390724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 17044988 - 17044710
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17044988 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 17044889  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  17044888 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 17044789  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  17044788 caaaacctagaagtaaatcttggatctctgtctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttga 17044710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 21830689 - 21830947
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21830689 caatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatc 21830788  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  21830789 ctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 21830888  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21830889 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 21830947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 41354442 - 41354202
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  41354442 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaatc 41354343  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  41354342 ctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttc 41354243  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41354242 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 41354202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16078625 - 16078351
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16078625 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 16078526  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  16078525 ctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaagccaaagcctcttgcaaactcttc 16078426  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||| | ||||||| |||||||    
T  16078425 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag----accatgtaacctcacaatctccttga 16078351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 22 - 271
Target Start/End: Original strand, 21749348 - 21749597
Alignment:
Q  22 tattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcct 121  Q
    ||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  21749348 tattatacgtgaactttatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcttctaacgactgaatcgtcct 21749447  T
Q  122 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21749448 ctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatctt 21749547  T
Q  222 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21749548 ggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21749597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 16369683 - 16369953
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  16369683 caatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccacgttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 16369782  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || | ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||  |||    
T  16369783 ttccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttatagcctaaagcctcttgcaaacccttc 16369882  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16369883 caaaatctagaagtaaatctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 16369953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 50620217 - 50619959
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  50620217 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaatttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaaatc 50620118  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  50620117 ctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 50620018  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50620017 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 50619959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 51 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22362167 - 22361947
Alignment:
Q  51 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 150  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || | | ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362167 tgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctgaacaaatcttccaacaactaaatcgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgat 22362068  T
Q  151 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 250  Q
    | ||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  22362067 acgccgaactcaacctcaacttagatcttaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatctgacacaatgctcgaagg 22361968  T
Q  251 aacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||| | |||||||||    
T  22361967 aacaccatgcaacttcacaat 22361947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19760839 - 19760569
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||    
T  19760839 caatactagaatgataactgttattgtacatgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaagtc 19760740  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  19760739 ttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacttaacttcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttc 19760640  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     |||||||||| ||||| || |||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19760639 taaaatctagaggtaaacctcggatttctatccgatacaatgttcgatggaacaccatgtagcttcacaat 19760569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 24099576 - 24099306
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  24099576 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 24099477  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  24099476 ctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgatcccaaagcatcttgcaaactcttc 24099377  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  24099376 cagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 24099306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 37677466 - 37677733
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| || || | ||||||||||||    
T  37677466 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacgcacactctcaacaaatc 37677565  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  37677566 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 37677665  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  37677666 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 37677733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 3 - 153
Target Start/End: Original strand, 20137166 - 20137316
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  20137166 atactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcct 20137265  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatg 153  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  20137266 ctagcgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctacggatgatatg 20137316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 19854700 - 19854966
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| || || | |||||  |||||    
T  19854700 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactc-atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacgcacactctcagtaaatc 19854798  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| || || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  19854799 ctccagtgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 19854898  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  19854899 caaaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcac 19854966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 20940036 - 20939770
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||    
T  20940036 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaataaatc 20939937  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||   ||||||||| | |||||| | ||||||||||| |||    
T  20939936 ctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagtcgaactcggcctcaacttctaacccaaaacgtcttgcaaactcttc 20939837  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 267  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  20939836 caaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttca 20939770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Original strand, 20250236 - 20250378
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  20250236 caatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagtacataaactctcaacaaatc 20250335  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgc 143  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  20250336 ctccaacgactgaatcgtcctctccaactgaccatctgtctgc 20250378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 3 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 22433087 - 22432817
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||  ||||| |  ||||||||||| |    
T  22433087 atactcgaatggtaactgttgttatatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaaccacacacaccctcaacaaatctt 22432988  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  22432987 ccaatgattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttcca 22432888  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 273  Q
     || ||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  22432887 gaacctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaacttcatgcagcttcacaattt 22432817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20294798 - 20295065
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| ||| || |||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  20294798 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggaaggtgactatccgaagctccaccctgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 20294897  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || | ||| |||    
T  20294898 ttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtagactcttc 20294997  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||| ||||||||    
T  20294998 cagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgaagcttcac 20295065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 24 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 31539947 - 31539703
Alignment:
Q  24 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 123  Q
    |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |  || |||||||||||||    
T  31539947 ttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcttccaatgattgaattgtcctct 31539848  T
Q  124 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||||||||| || |||||||| || || ||    
T  31539847 ccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacttcattttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttccagaacctagaagtgaacctcgg 31539748  T
Q  224 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    ||||||||| || |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  31539747 atctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagtttcac 31539703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 30 - 201
Target Start/End: Original strand, 41308240 - 41308411
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||    
T  41308240 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgact 41308339  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 201  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||    
T  41308340 gaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttcc 41308411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19662998 - 19662844
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  19662998 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtga 19662899  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  19662898 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 19662844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20835861 - 20835591
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  20835861 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 20835762  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  ||  | || || |||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||  | || |||    
T  20835761 ctccaaggatggtatcgttctctccgattgaccgtctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgtcagctcttc 20835662  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20835661 cagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaattctcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20835591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 271
Target Start/End: Original strand, 20139361 - 20139486
Alignment:
Q  146 atgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 245  Q
    |||||| ||| ||||||| |||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20139361 atgatacgccaaactcaacctcaactcagaacctaaagcttcttgtaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctc 20139460  T
Q  246 gaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| | |||||||||    
T  20139461 gaaggaacaccatgcaacttcacaat 20139486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20856684 - 20856476
Alignment:
Q  51 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 150  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  20856684 tgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaatcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatatgtctgcggatgat 20856585  T
Q  151 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 250  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || || || ||    
T  20856584 aagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatacttgacgg 20856485  T
Q  251 aacaccatg 259  Q
    |||||||||    
T  20856484 aacaccatg 20856476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 189 - 259
Target Start/End: Original strand, 20250376 - 20250446
Alignment:
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20250376 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatttctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 20250446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 20831297 - 20831107
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  20831297 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 20831198  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20831197 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20831107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22135421 - 22135272
Alignment:
Q  110 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 209  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  || |||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  22135421 ctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcctaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 22135322  T
Q  210 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| || ||||| | ||| || ||||| ||  |||||| ||||||    
T  22135321 gaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactataaggaataccatg 22135272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 41353402 - 41353357
Alignment:
Q  234 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  41353402 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 41353357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Original strand, 20914712 - 20914854
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||| ||  |||||||||    
T  20914712 gtcctctcagtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccagaacttagaagtaa 20914811  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  20914812 acctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 20914854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 226
Target Start/End: Original strand, 20184683 - 20184792
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    |||||||| | ||| | ||| ||||| | |||||| || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||| ||||| | ||||||  |||||||||    
T  20184683 gtcctctctgtctgcctatcagtctgggaatgataagcagaactcaatctcaacttggttcccaaagctacttgtaaactctcccaaaacatagaagtaa 20184782  T
Q  217 atcttggatc 226  Q
    |||| |||||    
T  20184783 atctcggatc 20184792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0459 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0459
Description:

Target: scaffold0459; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 816 - 1086
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  816 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 915  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  916 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgatcatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 1015  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  1016 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 1086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 60)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 19770263 - 19770541
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19770263 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 19770362  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19770363 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 19770462  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  19770463 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 19770541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 34566797 - 34567067
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34566797 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 34566896  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  34566897 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 34566996  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  34566997 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 34567067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 16356805 - 16357075
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16356805 caatactagaatgataactattattatatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 16356904  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16356905 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 16357004  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16357005 caaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16357075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 27518710 - 27518980
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27518710 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcccccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 27518809  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27518810 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgtcgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 27518909  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  27518910 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 27518980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27668573 - 27668295
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27668573 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatc 27668474  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27668473 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 27668374  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  27668373 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 27668295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 37291579 - 37291301
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37291579 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 37291480  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37291479 ctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 37291380  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  37291379 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 37291301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 40709083 - 40709361
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40709083 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 40709182  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  40709183 ctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 40709282  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||    
T  40709283 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttaacaatctccttga 40709361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 27610657 - 27610935
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27610657 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactgtcccaagtccctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 27610756  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  27610757 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacaccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 27610856  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  27610857 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 27610935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 27685483 - 27685205
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27685483 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 27685384  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27685383 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 27685284  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  27685283 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 27685205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 41771145 - 41771423
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41771145 caatactagaatgataactattattataagtgagctcgatcaacggaagatgactgtcccaagttcctccttgttcaagaacacaaattctcaacaaatc 41771244  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  41771245 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctgaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 41771344  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  41771345 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 41771423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22332970 - 22332712
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22332970 caatacttgaatgataactattattgtctgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctgaacaaatc 22332871  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22332870 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctttctgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 22332771  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22332770 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 22332712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 14999822 - 14999544
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14999822 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaaattcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 14999723  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  14999722 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatatgtttgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacctcttgcaaacttttc 14999623  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  14999622 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 14999544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 22134971 - 22135229
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  22134971 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaaaaattctcaacaaatt 22135070  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22135071 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 22135170  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22135171 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 22135229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 29476156 - 29475898
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29476156 caatacttgaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaaaaaatc 29476057  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  29476056 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttcgaaccccaagcctcttgcaaacttttc 29475957  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29475956 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 29475898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 22348726 - 22349004
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22348726 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatccccaacaaatc 22348825  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22348826 attgagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctctgcttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 22348925  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  22348926 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 22349004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 23574045 - 23574321
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23574045 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 23574144  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  23574145 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttc 23574244  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  23574245 caaaatctagaagtaaatcttggatcaataaatgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcctt 23574321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 23516844 - 23517102
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23516844 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 23516943  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||     
T  23516944 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaaccctcttgcaaactcttt 23517043  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23517044 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 23517102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 18776081 - 18776351
Alignment:
Q  2 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 101  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  18776081 aatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaa-------tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaagtttcaacaaatcc 18776173  T
Q  102 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 201  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  18776174 tctagcgactgaattgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacctaaggcctcttgcaaactcttcc 18776273  T
Q  202 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||    
T  18776274 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcataatctccttga 18776351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 252
Target Start/End: Original strand, 20799063 - 20799314
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20799063 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactcgcaacaaatc 20799162  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||    
T  20799163 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtccgcggataataagccaaactcaatctcaacttagaacccaaaacctcttgcaaacttttc 20799262  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 252  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20799263 caaaatctaaaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 20799314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21339369 - 21339099
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |     
T  21339369 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtt 21339270  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| ||||||||||||| |||    
T  21339269 ctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctcttgcaaactcttc 21339170  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21339169 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21339099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 239
Target Start/End: Original strand, 23440528 - 23440766
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23440528 caatactagaatgataactattattgtatgtaaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 23440627  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  23440628 ctctagcgactgaatttttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttc 23440727  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 239  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23440728 caaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgataca 23440766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 7e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 25423492 - 25423759
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  25423492 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatccctagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 25423591  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  25423592 ttctaacgactgaatcgtcttctctgtctgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 25423691  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||    
T  25423692 caaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcac 25423759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21498119 - 21497850
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  21498119 caatactagaatgataacttttattttacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatc 21498020  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||| |||||    
T  21498019 ctctagcgactgaatcgttctctccggctgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaaattttc 21497920  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  21497919 caaaatccagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaa-gaacaccatgcaacttcacaat 21497850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20468179 - 20467909
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  20468179 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaatctcaacaagtc 20468080  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | |||||||||  |||| || ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  20468079 ctccaacgactgaatcatcctttcagactggccatctgtctgcggataatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 20467980  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  20467979 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgacagaacaccatgtagcttcacaat 20467909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 23471532 - 23471802
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| || || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  23471532 caatactagaatgatagctgttattgtacgtgaactctattaatgggagatgactatcccaagttcccccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 23471631  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||| || |||||||| || || |||||||||| |||||| |||    
T  23471632 ctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctacggatgatacgcctaactaaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaactcttc 23471731  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  23471732 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgcttgaaggaaaaccatgtagcttcacaat 23471802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21564056 - 21563786
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  21564056 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 21563957  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| |   ||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||    
T  21563956 ctctaacgactgaatcgctttctccgactgaccatatgtttgcggatgataagctgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttc 21563857  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21563856 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgcagcttcacaat 21563786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 4 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26738785 - 26738540
Alignment:
Q  4 tactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctc 103  Q
    |||| |||| ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  26738785 tactggaataataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaaatcctc 26738686  T
Q  104 tagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaa 203  Q
    || ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||                      
T  26738685 taacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcc------------------ 26738604  T
Q  204 aatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
        || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  26738603 ----tataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 26738540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 22502964 - 22503231
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  22502964 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 22503063  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  22503064 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgcgtcctgtaaactcttc 22503163  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  22503164 cagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgatggaacaccatgaagcttcac 22503231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 14887074 - 14886807
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  14887074 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 14886975  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||| || || |||||||||    
T  14886974 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaactttgaacccaaagcgtcctgtaaacttttc 14886875  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14886874 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatctgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 14886807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22236003 - 22235733
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||    
T  22236003 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatc 22235904  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||| |||    
T  22235903 ctccaaagattgtatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaagcgtcttgcaaactcttc 22235804  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  22235803 cagaatctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 22235733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 33 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24716577 - 24716342
Alignment:
Q  33 aactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgac 132  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||    
T  24716577 aactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgac 24716478  T
Q  133 catctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatc 232  Q
    |||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | |||||||||    
T  24716477 catctgtctgaggatgctaagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatc 24716378  T
Q  233 tgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
     || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24716377 cgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24716342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21890842 - 21890572
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| | |||||||||  |||| ||||||| ||||||    
T  21890842 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgagtatcccaagctccacgttgctcaagtgcacacattctcagcaaatc 21890743  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  21890742 ctctaacgactgaatcgttctctctgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttc 21890643  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21890642 caaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatggaacttcacaat 21890572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Original strand, 22381486 - 22381754
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| |    
T  22381486 atactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactcaatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatctt 22381585  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  22381586 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgcctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcctgcaaactcttcca 22381685  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     || ||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22381686 gaacctagaggtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 22381754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24749637 - 24749370
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  24749637 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 24749538  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  24749537 ctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttc 24749438  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24749437 cagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24749370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24620340 - 24620111
Alignment:
Q  39 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 138  Q
    |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||    
T  24620340 atcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctg 24620241  T
Q  139 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 238  Q
    |||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || || | ||||||||| || ||    
T  24620240 tctgaggatgctaagtcgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatcttgaagtgaacctcgaatctctatccgacac 24620141  T
Q  239 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    ||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  24620140 aatactcgacggaacaccatgaagcttcac 24620111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 161
Target Start/End: Original strand, 21405125 - 21405285
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  21405125 caatactagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacataaactctcaacaagtc 21405224  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactc 161  Q
    ||| | |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  21405225 ctccaacgactgaattgtcctctccgtctgtccatctgtctgtggatgatacgccgaactc 21405285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21831797 - 21831574
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||||                    
T  21831797 gtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactga---------------- 21831714  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
      |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21831713 --ccatgtgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttcgatctct 21831616  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||| |||||||||||  ||||||  || |||||||||||    
T  21831615 atctgacacaatgctcgacagaacacggtgcagcttcacaat 21831574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 23080172 - 23079902
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  23080172 caatactcgagtgatagctgttgttatatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 23080073  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || || || ||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| || |||||||| |||    
T  23080072 ttccaatgattggatcgtcctctccgactaaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcatcctgcaaactcttc 23079973  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || ||||| || || || | ||| ||||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  23079972 cagaacctagaggtgaacctcgaatccctatccgatacaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 23079902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 20342567 - 20342834
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||    
T  20342567 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacaccctcaacaaatc 20342666  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  20342667 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 20342766  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || |||||||| ||||||||    
T  20342767 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgaagcttcac 20342834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 25848360 - 25848627
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| | ||| || |||||||||||    
T  25848360 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcatacacatcctcaacaaatc 25848459  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||| | |||    
T  25848460 ttccaatgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaattcttc 25848559  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  25848560 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 25848627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21984388 - 21984248
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21984388 caatactagaatgattactattattgtacgtgaactctatcaatgaaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 21984289  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 141  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21984288 ttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtct 21984248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 37545579 - 37545336
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  37545579 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 37545480  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || ||| |||||    
T  37545479 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaaattttc 37545380  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgct 244  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||||||    
T  37545379 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgct 37545336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 24798480 - 24798213
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  24798480 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctcctccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 24798381  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||  ||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  24798380 ttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcagtttcgaccccaaggcgtcctgtaaactcttc 24798281  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  24798280 cagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 24798213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 20821738 - 20822008
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| || || || || ||||  || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||||    
T  20821738 caatacttgaatgataactgttgttgtatgtgagttctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatc 20821837  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || || || |||||  ||    
T  20821838 ctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaacgcgtcctgtaaactcctc 20821937  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  20821938 caaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 20822008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28916496 - 28916226
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||||    
T  28916496 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatc 28916397  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||    
T  28916396 ctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctc 28916297  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28916296 caaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28916226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28923851 - 28923581
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||||    
T  28923851 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatc 28923752  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||    
T  28923751 ctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacgcatcttgtaaacttctc 28923652  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28923651 caaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28923581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 1111 - 919
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||    
T  1111 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatc 1012  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 193  Q
    |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  1011 ctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaa 919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 271
Target Start/End: Original strand, 21496481 - 21496713
Alignment:
Q  39 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 138  Q
    |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || ||||| || |||||| |||||||||||     
T  21496481 atcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattgaatcgttctctcctactgaccatcta 21496580  T
Q  139 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 238  Q
    | |||| |||||| ||||||||||| || ||||| || ||||  || | ||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| || ||    
T  21496581 tttgcgaatgataagccgaactcaaccttaacttagaacccagggcattttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacac 21496680  T
Q  239 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || || ||||| ||||| | |||||||||    
T  21496681 aatacttgatggaaccccatgcaacttcacaat 21496713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 51 - 235
Target Start/End: Original strand, 22462287 - 22462471
Alignment:
Q  51 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 150  Q
    ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| ||||| |  ||||||||||  || || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22462287 tgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatattcttagtaaatcctctaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgat 22462386  T
Q  151 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctga 235  Q
    | |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||    
T  22462387 aagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaaccttgggtctctatctga 22462471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 20774045 - 20774302
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||||    
T  20774045 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatc 20774144  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||    
T  20774145 ctctaaagattggat-gtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctc 20774243  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| |||||    
T  20774244 caaaatctcgaagtaaaccttgggtctctgtctgacactatactcgacggaaccccatg 20774302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 157 - 271
Target Start/End: Original strand, 21407597 - 21407711
Alignment:
Q  157 aactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacacc 256  Q
    ||||||| |||||||| |  ||||| ||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21407597 aactcaaactcaacttaggacccaacgcctcctgcaaactcttccgaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacacc 21407696  T
Q  257 atgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||    
T  21407697 atgtagcttcacaat 21407711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28895025 - 28894755
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | |||||     
T  28895025 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatt 28894926  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    | |||  || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||  | ||||| |||||| ||    
T  28894925 cactaaagattggattgtcctctccgactgaccatcagtctgcggatgataagctgaactcaatttcaatttcgatcccaacacatcttgtaaacttctc 28894826  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  28894825 caaaacctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaatcccatgcaacttcacaat 28894755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 17269387 - 17269148
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || || |  || || || |||||||||||||    
T  17269387 gtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtcttccaatgattggatcgtcctctccgact 17269288  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||| | | |||||| ||||| |||| ||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||    
T  17269287 gaccatctgtctgaggatgataagccgaatt-agtctcaatttcgaacccagagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccct 17269189  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17269188 atccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 17269148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25244323 - 25244175
Alignment:
Q  111 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 210  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25244323 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25244224  T
Q  211 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25244223 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25244175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25308475 - 25308327
Alignment:
Q  111 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 210  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||| |||||||| |  |||||||||  ||||||||| | | ||||  |||    
T  25308475 tgaatagtcctctcggtctgaccatcagtctgaggatgataaggagaattcaacctcaacttagttcccaaagccgattgcaaactctcctaaaacttag 25308376  T
Q  211 aagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  25308375 aagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 25308327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21937203 - 21937013
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  21937203 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 21937104  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21937103 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21937013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Original strand, 27011457 - 27011627
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  27011457 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcaaaactcaatctcaacttagttcccaaagcaact 27011556  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27011557 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27011627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Original strand, 24581584 - 24581753
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  24581584 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctg-ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 24581682  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  24581683 tgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccaatccgacacaatactagaaggaataccatg 24581753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 16065665 - 16065604
Alignment:
Q  111 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaactt 172  Q
    |||||||| |||||||  |||||||| ||||| |||| ||| || |||||||||||||||||    
T  16065665 tgaattgttctctccgcatgaccatcagtctgaggataataagcagaactcaatctcaactt 16065604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 110 - 226
Target Start/End: Original strand, 23503837 - 23503952
Alignment:
Q  110 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 209  Q
    |||||| |||||||||| ||| | ||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  23503837 ctgaatagtcctctccgtctgcctatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttag-ttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactta 23503935  T
Q  210 gaagtaaatcttggatc 226  Q
    |||||||| || |||||    
T  23503936 gaagtaaacctcggatc 23503952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 109715 - 109437
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109715 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctctttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 109616  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  109615 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaacttttc 109516  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  109515 caaaatctagaagtaaatcttggttctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 109437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 95906 - 95636
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| |  || | ||||||    
T  95906 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaatggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacatacccttagcaaatc 95807  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||| |||||| ||    
T  95806 ctctaaagattggattgtcctttccgactgaccatcagtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaacttctc 95707  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  95706 caaaatctcgaagtaaaccttgggtctctatctgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 95636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 112961 - 113231
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||| |||| ||||| |  ||||||| |||    
T  112961 caatactcgaatggtaactgttgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgcacaagtacacacaccctcaacagatc 113060  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     ||||  || || || ||||||||  ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  113061 ttctaaggattgtatcgtcctctctaactgaccatctttctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttc 113160  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || |||||||| || || || | |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  113161 cagaatctagatgtgaacctcgaatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcagcttcacaat 113231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 235; Significance: 1e-130; HSPs: 58)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 19113127 - 19113405
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19113127 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccctgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 19113226  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  19113227 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 19113326  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  19113327 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 19113405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 30313488 - 30313210
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  30313488 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaactaatc 30313389  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30313388 ctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 30313289  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  30313288 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttga 30313210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 278
Target Start/End: Complemental strand, 17674367 - 17674090
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17674367 caatactagaatggtaactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 17674268  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  17674267 ctctagcaactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 17674168  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttg 278  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||    
T  17674167 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttg 17674090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 18857014 - 18857272
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18857014 caatactagaatgatacctattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatc 18857113  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  18857114 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcgggtgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 18857213  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18857214 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 18857272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22133385 - 22133127
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22133385 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 22133286  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22133285 ttctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 22133186  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22133185 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatg 22133127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 32600581 - 32600859
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32600581 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 32600680  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32600681 ctataacgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 32600780  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  32600781 caaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttga 32600859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Original strand, 15533817 - 15534077
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15533817 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 15533916  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15533917 ctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctttctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 15534016  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 261  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15534017 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgta 15534077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16408389 - 16408131
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16408389 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 16408290  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  16408289 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttc 16408190  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16408189 caaaatctataagtaaatcttgggtctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 16408131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 22046810 - 22047088
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22046810 caatactagaatgataaccattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 22046909  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22046910 ctctagcgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttc 22047009  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  22047010 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatatgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttga 22047088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22120518 - 22120260
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22120518 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 22120419  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22120418 ctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttc 22120319  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22120318 caaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaataccatg 22120260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 19485214 - 19484974
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19485214 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttactcaagaacacaaattctcaacaaatc 19485115  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  19485114 ctctagcgactgaattgtcctctccgattgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcagacttttc 19485015  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 241  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19485014 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 19484974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 20018094 - 20017865
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20018094 caatactagaatgataactattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 20017995  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  20017994 ctctaacgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaggcctcttgcaaacttttc 20017895  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctcta 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017894 caaaatctagaagtaaatcttggatctcta 20017865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 206; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 2 - 279
Target Start/End: Original strand, 22040297 - 22040574
Alignment:
Q  2 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 101  Q
    ||||||||||||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22040297 aatactagaatgataactaatattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcc 22040396  T
Q  102 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||    
T  22040397 tctagcgattgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttcc 22040496  T
Q  202 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  22040497 aaaatctagaagtaaatgttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgtaacctcacaatctccttga 22040574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21166881 - 21166606
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21166881 caatactagaatgataactgttattgtacgtaaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 21166782  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  21166781 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttc 21166682  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||    
T  21166681 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgata-aatgctcgaaggaacaccatgcaactttacaatctcctt 21166606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22164535 - 22164278
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22164535 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 22164436  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22164435 ttc-agcgactgaattgtcctctctgactgaccatatgtctgcggatgacacgctgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 22164337  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22164336 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatg 22164278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21922079 - 21921809
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  21922079 caatagtagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 21921980  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||| | ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21921979 ctctagctattgaatcgtcctctacgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 21921880  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21921879 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21921809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 19978404 - 19978682
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||    
T  19978404 caatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacactaaatctcaacaaatc 19978503  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||    
T  19978504 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgtcgagctcaatctcaacttagaacccaaagcctcctgcaaactcttc 19978603  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||    
T  19978604 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgttacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatttcattga 19978682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 21251378 - 21251648
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21251378 caatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatc 21251477  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21251478 ttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 21251577  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21251578 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21251648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 183; E-Value: 5e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 23650478 - 23650748
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||    
T  23650478 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtc 23650577  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  23650578 ctctagcgactgaatcgttctctccgattgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 23650677  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  23650678 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgaaacaatactcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 23650748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21394209 - 21393939
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21394209 caatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatc 21394110  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||    
T  21394109 ttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttc 21394010  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21394009 caaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21393939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21788703 - 21788433
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  21788703 caatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatc 21788604  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     ||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || |||||||||||||||||||||    
T  21788603 ttctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttaaaacctaaagcctcttgcaaacttttc 21788504  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21788503 caaaatctggaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 21788433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22377798 - 22377528
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  22377798 caatactagaatgataactattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 22377699  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  22377698 ttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttc 22377599  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22377598 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22377528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22383973 - 22383703
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  22383973 caatactagaatgataactattgttgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 22383874  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  22383873 ttccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaaccaaaagcctcttgcaaactcttc 22383774  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22383773 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 22383703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 269
Target Start/End: Original strand, 23949356 - 23949624
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  23949356 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 23949455  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || | ||||||||| ||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| ||| ||||| ||| |||    
T  23949456 ttccaacgactgaatcgttatttccgactgaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaacctattgcatactcttc 23949555  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcaca 269  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23949556 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcaca 23949624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 259
Target Start/End: Original strand, 20388566 - 20388794
Alignment:
Q  31 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 130  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||| |||||||||  | |||||||||||    
T  20388566 tgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaaaaaatcctctaacgactgaatctttctctccgactg 20388665  T
Q  131 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 230  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20388666 accatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttacaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 20388765  T
Q  231 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||||||  |||| |||||||||||    
T  20388766 tctgatacaattatcgacggaacaccatg 20388794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20396469 - 20396199
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  20396469 caatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagtcgcaccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 20396370  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | ||||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| | || ||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  20396369 ctccaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcagatgatacgccgaactcaaccacagcttagaacccaaagcctcttgcaaactcttc 20396270  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||   | |||||||| | |||||||||    
T  20396269 caaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcggcaggacaccatgcaacttcacaat 20396199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 22987638 - 22987903
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  22987638 caatactagaatgataattgttattgtacatgaactctattaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 22987737  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || || |||||||||| |||||| |||    
T  22987738 ctctaacgactgaatcgtcctttccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcaacctcaacttagaacctaaagcctcttacaaactcttc 22987837  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||     ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22987838 caaaatct-----taaatctcgaatctctatctcatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 22987903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 31416789 - 31416548
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  31416789 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgact 31416690  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  31416689 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccct 31416590  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  31416589 atccgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 31416548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20975995 - 20975725
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| | |||||  |||||    
T  20975995 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctaaagtacacacactctcagtaaatc 20975896  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  20975895 ctccaatgattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcatgcaaactcttc 20975796  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || ||||||| |||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  20975795 cagaatctagaagtgaacctcggatctccatctgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 20975725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 19851848 - 19852106
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  19851848 caatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 19851947  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||    
T  19851948 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttc 19852047  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19852048 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19852106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 19857884 - 19858142
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  19857884 caatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 19857983  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || |||||| |||| |||    
T  19857984 ctctaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgcgaactcttc 19858083  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19858084 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatg 19858142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 14565579 - 14565846
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  14565579 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 14565678  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  14565679 ttccaatgattgaattgtcctttccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttc 14565778  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| ||||||||    
T  14565779 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctagacggaacaccatgaagcttcac 14565846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16271568 - 16271301
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  16271568 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaattcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 16271469  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  16271468 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 16271369  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16271368 cataacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 16271301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 2 - 271
Target Start/End: Original strand, 23655365 - 23655634
Alignment:
Q  2 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 101  Q
    |||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||||| || ||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||    
T  23655365 aatactcgaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactgtcccaggctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcc 23655464  T
Q  102 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 201  Q
    ||||  || || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  23655465 tctaatgattggatcgtcctctctgactgaccatctgtctgcggatgataacccgaactcaacctcaactccgaacccaaggcgtcttgcaaactcttcc 23655564  T
Q  202 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  23655565 aaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaat 23655634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 268
Target Start/End: Original strand, 12305206 - 12305462
Alignment:
Q  12 tgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgact 111  Q
    |||||||| || |||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || |    
T  12305206 tgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcatgtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgatt 12305305  T
Q  112 gaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctaga 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |  || || ||||| ||||| ||  ||||    
T  12305306 gaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaatgtgtcctgtaaactcttccagaacataga 12305405  T
Q  212 agtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    ||| || || ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12305406 agtgaacctcggatccctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgaagcttcac 12305462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 29303768 - 29303500
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| ||||||||| | || |||||||||||||| |||||||| || || |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || |||||||| |    
T  29303768 atactcgaatgatagttgttgttataagtgaactctatcaacggtaggtggctatcccaagctccaccttgctcaagtacacacacccttaacaaatcat 29303669  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  29303668 ccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacctcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 29303569  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29303568 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaaccccatgtagcttcacaat 29303500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 804017 - 803750
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  804017 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggtaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatc 803918  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| || || || ||||| |||    
T  803917 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccaaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaactcttc 803818  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  803817 caaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 803750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 1266675 - 1266945
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||    
T  1266675 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatc 1266774  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || |||    
T  1266775 ctctaaagattggatcgtcctctccgaccgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaatctcaactttgaacccaaagcatcttgcaagctcttc 1266874  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||| || |||||||| ||||| |||||    
T  1266875 cataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatgctcgacggtacaccatgcagcttaacaat 1266945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 6679548 - 6679815
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  6679548 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 6679647  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  6679648 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacttcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttc 6679747  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6679748 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 6679815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 22061777 - 22061507
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||||||||     
T  22061777 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttcctcaagcacacacactctcaacaaata 22061678  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||| ||| |||    
T  22061677 ctccaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcagactcttc 22061578  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  22061577 cagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagtttcacaat 22061507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Original strand, 22051329 - 22051569
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| || || || || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||||| |||||| | ||| || || |||||||||||||    
T  22051329 gtgaactctataaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacagatcctccaacgattggatcgtcctctccgact 22051428  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||    
T  22051429 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaatctcaacttggaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccct 22051528  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||| |||||||||||    
T  22051529 atccgacacaatactcgaaggaactccatttagcttcacaa 22051569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 6604095 - 6604362
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || |  ||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  6604095 caatactcgagtgatagctgttgttatacgtaaactcaatcaaaggtaagtgactgtcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatc 6604194  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || || || |||||||||    
T  6604195 ttccaatgattgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcgtcctgtaaacttttc 6604294  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  6604295 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 6604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 20010244 - 20009974
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  20010244 caatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 20010145  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||||  || ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||    
T  20010144 ctctaacgactgaatcgttctctccgaatgaccatctgcctgcggatgataagccgaactcacccttaactttgaacccaaggcatcttgtaaactcttc 20010045  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| || ||||| || ||   || |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  20010044 caaaaccttgaagtgaacctgaaatttctatccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 20009974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 22371377 - 22371647
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  22371377 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaaatctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacgttgctcaagtacacacattctcagcaaatc 22371476  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  22371477 ctctaacgactgaatcgttctctccgactcaccatctgtttgcggattataagccgaacccaacctcaactttgaacccaacgcatcttgcaaactcttc 22371576  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| || |||||||| || ||||||||||  || ||||| ||||| ||||  ||||| | |||||||||    
T  22371577 caaaaccttgaagtaaacctcggatctctattcgacacaatactcgatggaagcccatgaaacttcacaat 22371647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 268
Target Start/End: Original strand, 27355035 - 27355252
Alignment:
Q  51 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 150  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  27355035 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacaccctcaacaaatcttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatccgtttgaggatgat 27355134  T
Q  151 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 250  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  27355135 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacgg 27355234  T
Q  251 aacaccatgtagcttcac 268  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  27355235 aacaccatgaagcttcac 27355252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 3 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 31571184 - 31570917
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| || || ||||| ||||| | ||||||||| || |    
T  31571184 atactcgaatgataactattgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccctgttcaagcacacacactctcaacaagtctt 31571085  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||    
T  31571084 ccaatgattggatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttcca 31570985  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
     || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31570984 gaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaa 31570917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 21840854 - 21841124
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  21840854 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaattctatcaacgatagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 21840953  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || ||||| || |||||||||||||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||||| |||    
T  21840954 ctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatttgtttgcagatgatgagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttttaaactcttc 21841053  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  21841054 caaaatcttgaagtgaacctcggatctctatctgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 21841124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 22129132 - 22129026
Alignment:
Q  153 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 252  Q
    ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22129132 gccgaactcaacctcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaa 22129033  T
Q  253 caccatg 259  Q
     ||||||    
T  22129032 taccatg 22129026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21850613 - 21850423
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  21850613 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 21850514  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  21850513 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 21850423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 16877371 - 16877181
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||| |    
T  16877371 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctta 16877272  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  16877271 acttagttcccaaagcagcttgcaaaccttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 16877181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 234 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 19484175 - 19484130
Alignment:
Q  234 gatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  19484175 gatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaatctccttga 19484130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Original strand, 23900822 - 23900971
Alignment:
Q  110 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 209  Q
    |||||| |||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||  |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  ||    
T  23900822 ctgaatagtcctctctgtctgaccatcggtctggggatgataagtagaactcagcctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacata 23900921  T
Q  210 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| ||  |||| | |||||| |||||  | ||||||| ||||||    
T  23900922 gaagtaaacctcagatcccgatctgacacaatattagaaggaataccatg 23900971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 23157277 - 23157098
Alignment:
Q  80 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 179  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||    ||||||  || |||||| | | ||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||| |||| |  |||    
T  23157277 aacacaagttctcaacaaatcctctaaactctgaataatcttctccgtcggcccatcagtctgggggtgataagtagaactcaatctctacttagttccc 23157178  T
Q  180 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || | ||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23157177 aaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcgaatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 23157098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 273
Target Start/End: Original strand, 19863639 - 19863765
Alignment:
Q  147 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 246  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19863639 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19863738  T
Q  247 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 273  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19863739 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19863765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 273
Target Start/End: Original strand, 19868276 - 19868402
Alignment:
Q  147 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 246  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| ||||    
T  19868276 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatactcg 19868375  T
Q  247 aaggaacaccatgtagcttcacaattt 273  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  19868376 aaggaacaccatgcaacttcactattt 19868402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 21196778 - 21196588
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    || ||| |||||||  | ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  21196778 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactctaaatagtcctctatgtctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaatctca 21196679  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |   |||||||   |||||| || | ||||||  |||||||||| || ||||  | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  21196678 acttagtttccaaagcagtttgcaagctctcccaaaacgtagaagtaaacctcggattccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 21196588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Original strand, 22315744 - 22315886
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    |||||||||| ||| |||||  |||| |||||||| || | |||||| |||||||| |  ||||||||   ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  22315744 gtcctctccgtctgcccatcactctggggatgataagcaggactcaacctcaacttagttcccaaagcagtttgcaaactttcccaaaacctaaaagtaa 22315843  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    | || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22315844 acctcggatcccgatccgacacaatactggaaggaataccatg 22315886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Original strand, 22982959 - 22983128
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |  || ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  22982959 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtttgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagct 22983058  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||| |||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  22983059 tgc-aactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 22983128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 233; Significance: 1e-129; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 233; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 43556 - 43832
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43556 caatactagaatgatagctattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagctcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 43655  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43656 ctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 43755  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  43756 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 43832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 15349 - 15616
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  15349 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaa-----------atc 15437  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15438 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgatcccaaagcctcttgcaaacttttc 15537  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  15538 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 15616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 8887 - 9154
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |    
T  8887 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat-----------c 8975  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8976 ctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 9075  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  9076 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 9154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 50418 - 50148
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |||    
T  50418 caatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatc 50319  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    || ||  || || || || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  50318 ctttaaggattgtatcgttctctccgactgaccatccgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttggaaactcttc 50219  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  50218 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 50148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 106361 - 106226
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    ||||||| || ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||| ||| | ||||||  |||||||||    
T  106361 gtcctcttcgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcagactctcccaaaacttagaagtaa 106262  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 252  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || |||||||    
T  106261 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaa 106226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 14762 - 15040
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14762 caatactagaatgatgactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 14861  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  14862 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcaaacccaaagcctcttgcaaacttttc 14961  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||||    
T  14962 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaaccccatgtaacctcacaatctccttga 15040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 1022 - 1280
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||  ||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1022 caatactttaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 1121  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  1122 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaattcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 1221  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1222 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 1280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 12889 - 13167
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  12889 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcaatcaacggaagatgtctatcccaagttcctccttgctcaagaacacacactctcagcaaatc 12988  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12989 ctctagtgactaaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 13088  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  13089 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatctccttga 13167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 17843 - 18121
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17843 caatactagaatgataactattattttatgtgaactcgatcagtggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 17942  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  17943 ctctagtgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaactcttc 18042  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| |||||||    
T  18043 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccgtgtaacctcacaatctccttga 18121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 14441 - 14711
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  14441 caatactagaatgataactattattatacgtgaactatatcaatggaagatgactttcccaagttcctccttactcaagaacacaaaccctcaacaaatc 14540  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  14541 ttctaacgactgaatcgtcctctccgactgagcatctgtttgcggctgatacgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttc 14640  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| | |||||||||    
T  14641 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaatgaacaccatgcaacttcacaat 14711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 31812 - 32082
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  31812 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 31911  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||| | ||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  31912 ctctaatgattggatcgtcctctccgactgacaatctgtttgcggatgataagctgaactcaaccccaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 32011  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  32012 caaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 32082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 203 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18557 - 18489
Alignment:
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||    
T  18557 aaatctagaagtaaatcttggatctctatatgatacaatgcttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 18489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 8192 - 8462
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8192 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 8291  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8292 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaatctcaacatcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 8391  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||    
T  8392 caaaaactagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaataccatgtaacctcacaat 8462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 7799 - 8077
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7799 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatc 7898  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7899 ctctagcgattgaattgttctctccgactgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 7998  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| |||||||    
T  7999 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatacaacttcacaatctccttga 8077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 1)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 4309 - 4051
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4309 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 4210  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4209 ttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 4110  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4109 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatg 4051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 8998 - 9256
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8998 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 9097  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9098 ttctagcgactgaattttcgtttccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 9197  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9198 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatg 9256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33477 - 33219
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33477 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 33378  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     ||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33377 ttctagcgactgaattttcgtttccggctgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 33278  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33277 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaattctcgaaggaacaccatg 33219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 7341 - 7599
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  7341 caatacttgaatgataactattattatatgtgaactcgattaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcgagaacacaaatcctcaacaaatc 7440  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7441 ctccagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 7540  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7541 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatg 7599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 22269 - 22547
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||    
T  22269 caatactagaatgataactgttattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaaggacacaaactcgcaacaaatc 22368  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||| |||    
T  22369 ctctagcgactgaattgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaacttcgaacctaaagcctcttgcaaactcttc 22468  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||    
T  22469 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagaaacaccatgtaacctcacaatctccttga 22547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 65807 - 66085
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  65807 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcttccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 65906  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  65907 ttctagcgactgaattgtcctttctaactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatctcaatttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 66006  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  66007 caaaatctagaagtaaatcttggatccctatctgatacaatactcgaaggaacaccatgtaacctcacgatctccttga 66085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 39723 - 39466
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  39723 caatactagaatgataactgttattgtatgtgaaatctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 39624  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  39623 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgac-atctgtctgtggatgatacgccgaactcaatcttaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttc 39525  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39524 gaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 39466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 2)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 6774 - 7044
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6774 caatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatc 6873  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  6874 ttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 6973  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6974 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 7044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 266
Target Start/End: Original strand, 3193 - 3458
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  3193 caatactcgaatggtaactgttcttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 3292  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  3293 ctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagacgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 3392  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttc 266  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||||||||||||| ||||    
T  3393 caaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggaacaccatgtaacttc 3458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 278734 - 278458
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  278734 caatactagaatgataactattattgtatgcgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 278635  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || || || || |||||||||||||| |||    
T  278634 ctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaatttagaaccgaaggcctcttgcaaactcttc 278535  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  278534 caaaacctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 278458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 30 - 270
Target Start/End: Original strand, 260739 - 260979
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||  || || ||||| ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || |  || ||||| |||||||    
T  260739 gtgaactctatcagtggtaggtgactgtcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattagatcgtcctttccgact 260838  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| ||    
T  260839 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatccct 260938  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    ||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  260939 atccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaa 260979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 164613 - 164538
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctc 76  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||    
T  164613 caatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgaatatcccaagttcatctttgctc 164538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 197382 - 197106
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  197382 caatactagaatgataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcagcaaatc 197283  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  197282 ctctagcgactgaattgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 197183  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||||    
T  197182 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacgccatacaacttcacaatctcctt 197106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 39 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 4965 - 4727
Alignment:
Q  39 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4965 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctg 4866  T
Q  139 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 238  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4865 tctgtggatgatacgccgaactcaatcccaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 4766  T
Q  239 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  4765 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 4727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 222 - 32
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  222 ccttgctccaaaacacaagttctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 123  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||||| |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  122 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatctcgatctgacacaatactagaaggaataccatg 32  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 98 - 368
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  98 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 197  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||| |||||||||||| |||    
T  198 ttcaagagactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaaggctcttgcaaactcttc 297  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  298 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 191; Significance: 1e-104; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 6425 - 6695
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  6425 caatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 6524  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  6525 ctctagtgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcatgcaaacttttc 6624  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  6625 caaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 1428 - 1158
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||    
T  1428 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatc 1329  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| |||||||| |||||||| || |||    
T  1328 ctccaaagattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaaccacaacttcgaacccaaagcatcttgcaagctcttc 1229  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || ||||| || || || || || ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  1228 caaaatctagaagtgaacctcggatccctgtccgacacgatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 279
Target Start/End: Original strand, 7779 - 8046
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           |||    
T  7779 caatactagaatgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaa-----------atc 7867  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  7868 ctctagcgactgaattgtcctctccgcctgaccatctgtttgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttcgaacccaaagcctcttgcaaacttttc 7967  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttccttga 279  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||    
T  7968 caaaatctagaagtaaatcttggacctctatctgatacgatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctccttga 8046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 727 - 451
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||||||  | ||||| || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  727 caatactggaatgataattgttattgtacgtgaactctatccatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaacactcaacaaatc 628  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  627 ctctagcaactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctctttcaaacttttc 528  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  527 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 63935 - 63659
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  63935 caatactagaatgttaattgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgattatcccaagttcctctttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 63836  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||| |||    
T  63835 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccagagcctcttgcaaactcttc 63736  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  63735 caaaatctagaagtaaatcttggatctttttctgatataatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 63659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 130550 - 130820
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  |||| ||||||    
T  130550 caatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacacataccctcagcaaatc 130649  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  130650 ttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 130749  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  130750 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 130820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 4358 - 4085
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||  ||||| ||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||    
T  4358 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactatatcaatggatgatgactagcccaagttactccttgctgaagtaaacaaactctcaacaaatc 4259  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  4258 ctctaacgactgaatcgttctctccaactgaccatctgtgtgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 4159  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 274  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4158 caaaatctataagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaatttc 4085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 59156 - 59426
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||| |||||||| || || ||||| ||  ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  59156 caatgctagaatggtaactgttattgtacatgaactcgatcaatgagagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 59255  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||| | |    
T  59256 ctccaacgactgaattgtcctctctgtctgcccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaaactcaacttagaacccaacgcctcctgcaaactctcc 59355  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| || |||||    
T  59356 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatacttgacggaacaccatatagttttacaat 59426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 121 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29163 - 29008
Alignment:
Q  121 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29163 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaag-aaatct 29065  T
Q  221 tggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  29064 tggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 29008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 85
Target Start/End: Original strand, 134644 - 134728
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacaca 85  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  134644 caatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcatccttgctcaagaacaca 134728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 276
Target Start/End: Original strand, 6416 - 6691
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  6416 caatactagaatgataaatgttattgtatgtgaactcaatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgatcaagaacataaactctcaacaaatc 6515  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  6516 ctctaacgactgaatcgtcctctccgactaaccatctgtctacggatgatacgccgaacacaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttc 6615  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 276  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  6616 caaattctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 6691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 6451 - 6709
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  6451 caatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatc 6550  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||    
T  6551 ttctaacgactgaatcgtcctctccgactgactatctatttgcggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaatctaaagcctcttgcaaacttttc 6650  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6651 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatggtcgaaggaacaccatg 6709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 179; Significance: 1e-96; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 16057 - 16327
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || |||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  16057 caatactagaatgataaatattattgtacgtgaacactatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 16156  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  16157 ctctagcgactgaattgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 16256  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||||||||    
T  16257 caaaatctagaagtatatcttggatctctatatgatgcaattctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 16327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Original strand, 5625 - 5893
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| || |    
T  5625 atactggaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtctt 5724  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  5725 ctagcgactgaatcgtcctctccgactaacaatctgtctacagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttcca 5824  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  5825 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 5893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1355 (Bit Score: 173; Significance: 4e-93; HSPs: 1)
Name: scaffold1355
Description:

Target: scaffold1355; HSP #1
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 273
Target Start/End: Original strand, 1078 - 1350
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||  |||||||| ||    
T  1078 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatagaagatgactatcccaagttccttcttgctcaagtacgcaaaccctcaacaagtc 1177  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||    
T  1178 ctctagcgactgaatcgtcctttcggactgaccatatgtctgaggatgatacgccaaactcaatctcaacttagaacctaaagcctcctgcaaacttttc 1277  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaattt 273  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1278 caaaatctagaagtaaatcttagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaattt 1350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 3689 - 3442
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3689 gtgaactctatgaacggaagatgactatccgaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgact 3590  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||    
T  3589 gaccatctgtctgtggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgtaaacttttccaaaatctttatgtaaatcttggatctct 3490  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||    
T  3489 atttgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacctcacaatctcctt 3442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 171; Significance: 7e-92; HSPs: 3)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 7e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 49895 - 50165
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||| | ||||| ||| ||| ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  49895 caatactagaatgataactattattgtacgtgaacactatcaatggaggataactatcgaaagttcctccttgctcaagtacacaaactcttaacaaatc 49994  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  49995 ttcttacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 50094  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  50095 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcaaaggaacaccatgcaacttcacaat 50165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 118 - 277
Target Start/End: Original strand, 19121 - 19280
Alignment:
Q  118 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19121 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaa 19220  T
Q  218 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  19221 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 19280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 177 - 277
Target Start/End: Original strand, 34604 - 34704
Alignment:
Q  177 cccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcct 276  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||    
T  34604 cccaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcct 34703  T
Q  277 t 277  Q
    |    
T  34704 t 34704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 31 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19876 - 19636
Alignment:
Q  31 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 130  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||    
T  19876 tgaactctatcaatgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatcctctaacgactgaattgtcttcaccgactg 19777  T
Q  131 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 230  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19776 accatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctctttcaaacttttccataatctagaagtaaatcttggatctcta 19677  T
Q  231 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  19676 tctgacacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 19636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8232 - 7963
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  8232 caatactagaatgataactgttattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacataccctcaacaaatc 8133  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  8132 ttctaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatttttctttggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgc-aacttttc 8034  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  8033 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 7963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 14983 - 14713
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  14983 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 14884  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    | |  |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  14883 ccccggcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtccgcgggtgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttc 14784  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||||||||||||||    
T  14783 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgataaaatgtttgacggaacaccatgtagcttcacaat 14713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 229445 - 229715
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  229445 caatactagaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgaatatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 229544  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| || || ||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| || || ||| |||||||||||||||||    
T  229545 ctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcgaatgatacgccgaactcaaccttaacttagaacctaaatcctcttgcaaacttttc 229644  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  229645 caaactctataagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 229715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 219321 - 219051
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  219321 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaattctataaacggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 219222  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  219221 ctctaacgaatgaatcgttctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataccccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 219122  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  219121 caaaatctagaagtaaaccttggatctctatttgatacaatgctcgaaggaacaccatgtcacttcacaat 219051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 111 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 32791 - 32667
Alignment:
Q  111 tgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctag 210  Q
    ||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||    
T  32791 tgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaactttgttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttag 32692  T
Q  211 aagtaaatcttggatctctatctga 235  Q
    ||||||| || ||||| | ||||||    
T  32691 aagtaaacctcggatcccgatctga 32667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 39 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 391066 - 390834
Alignment:
Q  39 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||    
T  391066 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtcctctaacgactgaatcgttctttccgactgaccatctg 390967  T
Q  139 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  390966 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctttatctgatac 390867  T
Q  239 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  390866 aatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 390834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 90836 - 90566
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| | ||||| ||||||    
T  90836 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacacactctcagcaaatc 90737  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||   |||||  | ||||||||||| |||    
T  90736 ctctaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcacacccaagccatcttgcaaactcttc 90637  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  90636 caaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 90566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 21 - 214
Target Start/End: Original strand, 114602 - 114795
Alignment:
Q  21 ttattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcc 120  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||    
T  114602 ttattgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcc 114701  T
Q  121 tctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagt 214  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||    
T  114702 actccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagt 114795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 186 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 89973 - 89888
Alignment:
Q  186 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  89973 tcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgatacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 89888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 9372 - 9642
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||    
T  9372 caatactagaatgataactgttattgtatgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaaccctcaacaagtc 9471  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || | ||| ||||| || || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  9472 ttccaacgattgaatcgttctttccgactgacaatctgtctgcggatgatatgccgaacttaacctaaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 9571  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9572 caaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgatacaatgctcgaatgaacaccatgtagcttcacaat 9642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 598 - 328
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| || |||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  598 caatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatgggagatgattatctcaagttccttcttgctcaagaacacaaaccctcaacaaatc 499  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||    
T  498 ttctaacgactgaatcatcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacctcagcttagaacctaaagcctcttgcaaacttttc 399  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| |||||| | |||||||||    
T  398 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatcacacacaatgctcgaaggaataccatgcaacttcacaat 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 163; Significance: 4e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 25623 - 25353
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||    
T  25623 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttccaccttgctaaagtacacaaactctcaacaagtc 25524  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | |||||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  25523 ctccaacgactgaattgttctttcagactgaccatctgtctccggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 25424  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25423 caaaatctagaagtaaaccatggaactctatctgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaat 25353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 16320 - 16050
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||| ||    
T  16320 caatactagaatgataactattattgtacgtgaattctattaatggaagatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaagtc 16221  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||| ||||||||| |||    
T  16220 ctccaacgactgaatcgttctctccgactgaccatttgtctgcggatgatacgccgaacttaacctcaacttagaacctaaagcctattgcaaactcttc 16121  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16120 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 16050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 15279 - 15549
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  15279 caatactggaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgattatcccaagttcctccttgctcaagtacacaacctctcaacaagtc 15378  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||  | ||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  15379 cttcaacgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgatatgtcgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 15478  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  15479 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaactttacaat 15549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 39 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 113353 - 113121
Alignment:
Q  39 atcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctg 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| ||||| ||| |||| || ||||| |||||||||||||    
T  113353 atcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacgcaaactctcaacaaatcttctagagaccgaatcgttctctctgactgaccatctg 113254  T
Q  139 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 238  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  113253 tctgcggatgacacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaattaaatcttggatctctatctgatac 113154  T
Q  239 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  113153 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 113121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 116809 - 116539
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||    
T  116809 caatactagaatgataactgttattgtacgtcaactctatcaacggaagatgactaacccaagttcctccttgctctagtacacaaactctcaacaagtc 116710  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | |||| |||| || || | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  116709 ctccaacgacggaatcgttcttttcgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 116610  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  116609 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgacgaaacaccatgtagcttcacaat 116539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 69 - 196
Target Start/End: Original strand, 98485 - 98612
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  98485 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 98584  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaact 196  Q
    |||| |  ||||||||  ||||||||||    
T  98585 acttagttcccaaagcagcttgcaaact 98612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 159; Significance: 1e-84; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 112423 - 112693
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || |||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  112423 caatactagaatgataactgttattgcatgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 112522  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||  ||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  112523 ctccaacgactgaatcgtccttttcgactgaccatctgtctacggatgatacgccgaactcaacttcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 112622  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  112623 caaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgcttggcggaacaccatgtagcttcacaat 112693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 203370 - 203102
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||||||||| || || || || || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  203370 atactagaatggtaacttttgttgtacgtgaactctatcagcggtagatgactatcccaagtcccaccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcct 203271  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    |||  | | |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  203270 ctaatggcagaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaacgcctcttgcaaacttttcca 203171  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  203170 aaatctacaagtaaatcttggatctctatttgacacaatgctcgacggaacaccatgtagcttcacaat 203102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 117970 - 118240
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| || ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  117970 caatactcgaatggtaactattgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactataccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 118069  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  118070 ctctaatgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttc 118169  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  118170 caaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgtagcttcacaat 118240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 386221 - 386491
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  386221 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 386320  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  386321 ctctaacgactgaatcgttatctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttc 386420  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  386421 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaaccccatgcaacttcacaat 386491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 323106 - 323376
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||    
T  323106 caatactggaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatc 323205  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  323206 ctccaaagattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccaaactcagcctcaacttcgaacccaaggcgtcttgcaaactcttc 323305  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  323306 cagaatctagaagtgaacctcggatccctatccgacaaaatactcgacggtacaccatgcaacttcacaat 323376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 158; Significance: 4e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 4e-84
Query Start/End: Original strand, 18 - 267
Target Start/End: Original strand, 2340 - 2589
Alignment:
Q  18 ctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattg 117  Q
    |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |    
T  2340 ctattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactaccccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatcctctaacgactgaatcg 2439  T
Q  118 tcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 217  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  2440 ttctctccgactgaccatctgtttgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttacaacctaaagcctcttgcacactcttccaaaatctagaggtaaa 2539  T
Q  218 tcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 267  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2540 cctcggatctctatctgatacattgctcgaaggaacaccatgtagcttca 2589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 42237 - 41970
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  42237 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 42138  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  42137 ctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttc 42038  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| || |||||    
T  42037 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagtttcac 41970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 47303 - 47033
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||    
T  47303 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcttaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatc 47204  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  47203 ctctaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttc 47104  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || |||||||| || |||||||| ||||| || ||||| || || || |||||||| |||||||||||    
T  47103 cagaacctagaagtgaaccttggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgcagcttcacaat 47033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 2 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 24974 - 24702
Alignment:
Q  2 aatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcc 101  Q
    ||||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  24974 aatactagaatgataactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagtcccaccttgcttaagtacacaaactctcaacaaatcc 24875  T
Q  102 tctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcc 201  Q
    |||| |||||||||  | |||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||    
T  24874 tctaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtttacggatgataagccgaactcaacctcaacttagatcccaacgcctcttgcaaacttttcc 24775  T
Q  202 aaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttc 274  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||    
T  24774 aaaatctagaagtaaatcttggatctcaatctgacacaatgctcgacggaacaccatgcaactacacaatttc 24702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 9745 - 10015
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||| ||| || |||||||  ||||| || |||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| ||    
T  9745 caatactagaatgataactatcattgtacgtgaactttatcaatggtagatgattaaccctagttcctccttgctcaagtacacaagctctcaacaagtc 9844  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||||| |||    
T  9845 ttctagcgactgaatcgtcctctccgactgatcatctgtttgcggatgatacgctgaactcaacctcaacttagaacgtaaagcctcttgcaaactcttc 9944  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9945 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 10015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 19109 - 18839
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||| || ||    
T  19109 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaaaggaagatgactatcctaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaataagtc 19010  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | |||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || |  |||||||||| |||||| |||    
T  19009 ctccaacgactgaatcattctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaacgcaacctcaacttagaacttaaagcctctttcaaactcttc 18910  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18909 caaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttcacaat 18839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 26437 - 26167
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  26437 caatgctagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacagaacatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 26338  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |   ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  26337 ttccaataactgaatcgttttttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 26238  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26237 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcagcttcacaat 26167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 195578 - 195338
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | |||||  |||||||  |  || || || ||||||||||||     
T  195578 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaggtacacacactctcagtaaatccttcaaagattgtatcgtcctctccgac- 195480  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  195479 gaccatctgtctgaggatggtaagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatgttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctcggatctct 195380  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| || |||||||| |||||||||||    
T  195379 atccgacacaatactcgacggtacaccatgcagcttcacaat 195338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 30 - 267
Target Start/End: Original strand, 149001 - 149238
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||  ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || ||||| |||||||    
T  149001 gtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaacctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgact 149100  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||||||||||   ||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||||||||||||| || || ||||| ||    
T  149101 gaccatctttctgaggatgataagccgaactcaactccaacttcgaacccaatgcatcttgcagactcttccaaaatctagaagtgaacctcggatccct 149200  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 267  Q
    ||| || | ||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  149201 atccgacataatactcgacggtacaccatgtagcttca 149238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5495 - 5225
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||    
T  5495 caatgctagaatggtaactgttattatacgtgaactcaatcaatggaagattactatcccaagttcctccttgctcgagtacacaaactctcaacaaatc 5396  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | ||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||| ||| || ||||| ||||| |||||||  |||    
T  5395 ctcgaacgaatgaattgtcctctctgtctgtccatcggtctgcggatgatacgtcgaactcaaactcagcttagaacccaacgcctcctgcaaacccttc 5296  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5295 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgtagcttcacaat 5225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 1310 - 1580
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||| ||||||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1310 caatactaaaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatctcaagttccaccttattcaagtacacaaactctcaacaaatc 1409  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| | |||||||||||| || | ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  1410 ctccaacgactgaattgttcttttcgactaaccatctgtctgcggatgatacaccgaactcaacttcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactcttc 1509  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1510 caaaatctagaagtaaaccttggatctctatctgacacaatgttcgatggaacaccttgtagcttcacaat 1580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Original strand, 4433 - 4699
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||| |||||| || ||    
T  4433 caatactagaatgataattgttattgtacgtgaactctattaatggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtaaacaaactctcaagaagtc 4532  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||  | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | || ||||||||||||||||| |||    
T  4533 cttcaacgactgaatcgtcctctccgaccgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttataacctaaagcctcttgcaaactcttc 4632  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 267  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  4633 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtaacttca 4699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 151; Significance: 6e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 6e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 32656 - 32387
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  32656 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 32557  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| |||||| || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| |||    
T  32556 ttctaacgactggatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgatacgccaaactcaacctcaacttagaacctaaagcttcttgcaaactcttc 32457  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||| | |||||||||    
T  32456 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatttgatac-attctcgaaagaacaccatgcaacttcacaat 32387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 150; Significance: 2e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 277
Target Start/End: Original strand, 180619 - 180877
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  180619 caatactagaatgataactgttattgtacgtgaactctatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacccaaactctcaacaaatc 180718  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||                  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  180719 ctctagcgac------------------tgaccatctgtctgctgatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctcttgcaaactgttc 180800  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  180801 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 180877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 101456 - 101186
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  101456 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatc 101357  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || ||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  101356 ctctaatgattggatcatcctctctgactgaccatctatctgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttc 101257  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  101256 caaaatcttgaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 101186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 1401 - 1659
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||||||  | ||||  || |||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| ||| ||||||||    
T  1401 caatactagaatgataaatgttatagtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaaattcctcctttctcaagtacacaaactcttaacaaatc 1500  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  1501 ttctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgcggatgatacgccgaactaaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 1600  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1601 caaaatctagaagtaaaactaagatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 89 - 271
Target Start/End: Original strand, 25464 - 25646
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25464 tctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgactgaccatctgcctgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaacccaaagcctct 25563  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25564 tgcaaactcttccaaaatctagaagtaaatcttggatatctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgaaacttcacaat 25646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 9 - 271
Target Start/End: Original strand, 1675 - 1937
Alignment:
Q  9 gaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcg 108  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||| || |       
T  1675 gaatgataactattattgtacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaaaaaatcatcaaaaa 1774  T
Q  109 actgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatct 208  Q
    | |||||  |||||  |||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1775 aatgaatcatcctcaacgacagaccatctatctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttacaaaatct 1874  T
Q  209 agaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||||    
T  1875 agaagtaaatcttggatctatatctgatacaatgtttgaaggaacaccatgcaacttcacaat 1937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 139; Significance: 9e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 9e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 3542 - 3812
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || || ||||| ||  ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||    
T  3542 caatactagaatggtaactgttattgtacatgaactctattaacggaagatgactatcccaagtttctccttgctcaagtacagaaactctcaacaagtc 3641  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     |  | ||||| ||| || || ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  3642 tttcaacgactaaatcgttctttccgactgaccatttgtctgcagatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 3741  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3742 caaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 80 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 80319 - 80128
Alignment:
Q  80 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 179  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  80319 aacacaaactctcaacaaatcctctagcgactgaatcgtcctctccgaatgaccatctgtccgcggatgatacgccgaactcaatctcaacttagaaccc 80220  T
Q  180 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||    
T  80219 aaagcctctttcaaactcttccaaaatctttaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctctaaggaacaccatgcaacttcacaat 80128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 127103 - 126911
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  127103 caatactagaatgataactgttattgtacgcgaactctatcaatggacgatgactatcccaagtccctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 127004  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaa 193  Q
    || || ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||| || |  ||||||||||||||    
T  127003 ctataacgactgaatcgttctttccgactgaccatctgtctgcggatgatacgttgaactcaacctcaacttagaacataaagcctcttgcaa 126911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 46630 - 46780
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  46630 caatactagaatgataactattattgtaagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaatcctcaacaaatc 46729  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgata 151  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  46730 ctctagcgactgaattgtcctctccaactgaccatctgtctgtggatgata 46780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 86408 - 86154
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  86408 caatgctagaatggtaactgttattataagtgaactcgatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 86309  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || |||||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||||||     | |||    |||||||  | ||||| ||||| |||||||| |||    
T  86308 ctccaatgattgaattgtcctctccgcctgtccacccgtctgtggatgata----cacctc--cgtcaacttataacccaacgcctcctgcaaactcttc 86215  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgta 261  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  86214 aaaaatctagaagtaaatcttgggtctctatttgatacaatactcgacggaacaccatgta 86154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 129; Significance: 8e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 12881 - 12633
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||    
T  12881 caatactagaatggtaactgttattatatgtgaactctatcaacgggagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaagtc 12782  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || | |||||| || || || ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||| ||  ||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  12781 ttccaacgactgtatcgttctttccgactgaccatctatctgcggatgatacgctgaactgaacatcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttc 12682  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaag 249  Q
    ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12681 caaaatctagaagtaaacctcagatctctatctgatacgatgctcgaag 12633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 40140 - 40410
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  40140 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaaaggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatc 40239  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  40240 ctccaatgactgaatcgtcctctccgactgaccatctctttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 40339  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  40340 caaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaactccatgtaacttcacaat 40410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 28672 - 28402
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  28672 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatc 28573  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| ||||     
T  28572 ctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagttttt 28473  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  28472 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 28402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 40663 - 40393
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  40663 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagcttcaccttgctcaagtacacatactctcagcaaatc 40564  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  ||||| || || |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||| || ||||| |||||||||||| ||||     
T  40563 ctctaatgactggatcgttctctccaactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccccaacttagaacccaacgcctcttgcaaagttttt 40464  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  40463 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatccgacacaatgctcgacggaacaccatgcaacttcacaat 40393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 126; Significance: 5e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 42 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11531 - 11302
Alignment:
Q  42 aacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtct 141  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || |||||||||||||||||||||||||    
T  11531 aacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtct 11432  T
Q  142 gcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 241  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| |||||    
T  11431 gcggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaat 11332  T
Q  242 gctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  11331 actcgatggaactccatgtaacttcacaat 11302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 51 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7091 - 6871
Alignment:
Q  51 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 150  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7091 tgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcaacaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 6992  T
Q  151 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 250  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||  ||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  6991 aagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtgaacctcagatctctatctgacacaatactcgatgg 6892  T
Q  251 aacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| ||||||| |||||||||    
T  6891 aactccatgtaacttcacaat 6871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 27627 - 27897
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  27627 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 27726  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  27727 ctccaatgattgtatagtcctctccgactgaccatctgtctacggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 27826  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  27827 caaaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 27897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33581 - 33311
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||| | |||    
T  33581 caatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaatagatc 33482  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  33481 ctctaaggattgtatcgttctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaatttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttc 33382  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  33381 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatctgatacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 33311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 40728 - 40918
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  40728 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 40827  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  40828 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 40918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0232 (Bit Score: 122; Significance: 1e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0232
Description:

Target: scaffold0232; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 2750 - 2509
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || || || |||||||||||||    
T  2750 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattggatcgtcctctccgact 2651  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||    
T  2650 gaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggaatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaaccttggatctct 2551  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| |||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||    
T  2550 atccgatacaatactcgacggtacaccatgtaacttcacaat 2509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1001 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold1001
Description:

Target: scaffold1001; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 73 - 267
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  73 caatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 172  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaac 195  Q
     || |  |||||||  || || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||    
T  173 atcaaaagactgaaacgtactatccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaac 267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 20385 - 20655
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20385 caatactcgaatggtaacttttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagaacacaaactctcaacaaatc 20484  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  20485 ctccaatgattggatcgtcctctccgactaaacatctgtctgcggatgataaaccgaactcaacctcaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 20584  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  20585 caaaatctagaagtgaacctcggatcgctatccgacacaatactcgacggaactccatgcaacttcacaat 20655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13236 - 12995
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  13236 gtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgact 13137  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||    
T  13136 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccct 13037  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13036 atccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 12995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 17006 - 16765
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||    
T  17006 gtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgact 16907  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||    
T  16906 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccct 16807  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  16806 atccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 16765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 43185 - 43455
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  43185 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 43284  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  43285 ctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaaattcagcttcgatcccaaagcatcttgcaaactcttc 43384  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  43385 cagaacctagaagtgaacctcggatccctatctgatacaatactcgacggtacaccgtgtagcttcacaat 43455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0600 (Bit Score: 114; Significance: 7e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0600
Description:

Target: scaffold0600; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Original strand, 4306 - 4547
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||| ||| ||||| || ||||||||||    
T  4306 gtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactatcaacaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgact 4405  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  4406 gaccatctctctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctct 4505  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     || || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  4506 ttccgacacaatactcgatggaacaccatgcaacttcacaat 4547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Original strand, 249017 - 249285
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||| ||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  249017 atactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcct 249116  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | | ||| || || |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||    
T  249117 ccaacgattggatcgtcctctcagactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttcca 249216  T
Q  203 aaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
     || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  249217 gaacctagaggtaaacctcggatccctatctgacacaatactcgacggtactccatgtagcttcacaat 249285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 271 - 541
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  271 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcatcggtagatgactatcccaagctccaccttggtcaagtacacacactctcagcaaatc 370  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  371 ctctagcgactgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 470  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || ||| |||| | |||||||||    
T  471 caaaatcttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatggtacatcatgcaacttcacaat 541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 10195 - 10465
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| | ||| | ||||| ||||||    
T  10195 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgttcaagtagacacactctcagcaaatc 10294  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |||    
T  10295 ctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgaaaactcttc 10394  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  10395 caaaatcttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 10465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 111; Significance: 4e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 51767 - 51497
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  51767 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccctgctcaagtacacacactctcagcaaatc 51668  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || |||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  51667 ctctactgattgaattgttctctccgactaaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttc 51568  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||| |||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  51567 caaaatctaaaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaacaccatgtaacttcacaat 51497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 108; Significance: 3e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 120 - 271
Target Start/End: Original strand, 1988 - 2139
Alignment:
Q  120 ctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1988 ctctccgactaaccatctgtctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatc 2087  T
Q  220 ttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | |||||||||    
T  2088 ttgggtctctatctgatacaatgctcgacggaacacgatgcaacttcacaat 2139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0326 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0326
Description:

Target: scaffold0326; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 18441 - 18171
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||||| | | | | ||||||    
T  18441 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcatgtacacacacttttagcaaatc 18342  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  18341 ctctaatgattggatcgtcctcttcgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 18242  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  18241 caaaatctagaagtgaaccttggatctctatacgacacaatactcgacggaactccatgaaacttcacaat 18171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 47526 - 47796
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  47526 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 47625  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || ||||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  47626 ctctaatgattgaatcgttctctctgactgaccatttgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttc 47725  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | |||||||||    
T  47726 caaaatctagaagtgaacctcgggtctctatccgacacaatactcgatggaactccatgcaacttcacaat 47796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 19522 - 19792
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| |||||||| || || || || |||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  19522 caatactcgaatgataactgttgttgtatgtgaactctatcaacagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatc 19621  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  19622 ctccaatgattggatcgtcgtctccgactgaccatctgtctgaggatcataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttc 19721  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19722 cagaacctagaagtgaacctcggatccctatcagacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaat 19792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 139 - 271
Target Start/End: Original strand, 2914 - 3046
Alignment:
Q  139 tctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 238  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2914 tctgcggatgatacgccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatac 3013  T
Q  239 aatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  3014 aatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 3046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 1541 - 1688
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  1541 caatactagaatgataactattattatacgtgaactctatcaatggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagtacacaaactctcaacaaatc 1640  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatg 148  Q
     || | ||| || || ||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1641 ttccaacgagtgcatcgtcctctccaactgaccatctgtctgctgatg 1688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 24 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6917 - 6670
Alignment:
Q  24 ttataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctct 123  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| || |||||| || ||||    
T  6917 ttatacgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacggctgaatcgttctct 6818  T
Q  124 ccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttgg 223  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||  |    
T  6817 ccgactgaccatttgtttgcggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcctcttgtaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcag 6718  T
Q  224 atctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  6717 atctctatccgacacaatgttcgatggaaccccatgtaacttcacaat 6670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 104; Significance: 7e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16617 - 16350
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  16617 caatactcgagtgatagctgttgttataagtaaactcaatcaaaggcaagtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcaacaaatc 16518  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  16517 ttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttc 16418  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || || |||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16417 cagaacctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatgaagcttcac 16350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 5152 - 5422
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||   |||||    
T  5152 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcggaaaatc 5251  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |  |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||    
T  5252 ctctaacgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcagatgataagttgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttc 5351  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || || | ||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  5352 caaaatctagaagtgaacctcgaatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 5422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 7142 - 6872
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||    
T  7142 caatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacgttagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatc 7043  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||     
T  7042 ctccaaagattgtatcgtccactccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacgcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttt 6943  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||||||    
T  6942 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcacaat 6872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 26544 - 26814
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||||||||| || || || || || |||||||| |||||||| ||||||||||   ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  26544 caatactagaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactataaaaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 26643  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |||    
T  26644 ctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttc 26743  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  26744 caaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 26814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 26926 - 27196
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  26926 caatacttgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatctgaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 27025  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| || || |||    
T  27026 ctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttc 27125  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  27126 caaaaccttgaagtgaaccttggatctctatccgacacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 27196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 3)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 1053 - 787
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||  ||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||| | ||||| || |||    
T  1053 caatactcgaatggtaactattgttgtacatgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcgagtacacacactctcagcagatc 954  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||    
T  953 ctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggacgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 854  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttca 267  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||| |||||    
T  853 caaaaccttgaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgatgaaacaccatgtaacttca 787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 27921 - 28161
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || ||||| || |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||    
T  27921 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaattctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatc 28020  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  28021 ctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttc 28120  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaat 241  Q
    ||||||||| |||| || || |||||||||||||| |||||    
T  28121 caaaatctataagtgaacctcggatctctatctgacacaat 28161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 117 - 241
Target Start/End: Original strand, 34290 - 34414
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||||||| |||| |    
T  34290 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcccaaggcgtcttgcaaactcttccaaaatctataagtga 34389  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaat 241  Q
    | || |||||||||||||| |||||    
T  34390 acctcggatctctatctgacacaat 34414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 103; Significance: 3e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Original strand, 41350 - 41589
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  41350 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaaagattggatcgtcctctccgact 41449  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| || |  ||||||||    
T  41450 gaccatctgtctgcggatgataagccgaa--caacctcaacttcgaacccaaagcgtcttgcaaactcttccagaatctagaagtgaaccccggatctct 41547  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||  || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  41548 attcgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 41589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Original strand, 2225 - 2466
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||  || | ||| |||||||||||||    
T  2225 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctacaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaatgattaaatcgtcctctccgact 2324  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||  ||||| || || |||| |||    
T  2325 gaccatctgtctacggatgatatgccgaactcaacctcaacttagaacccaaggcatcttgcaaactcttccaaaatcgtgaagtgaacctcggatgtct 2424  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| ||||  ||||||| |||||||||    
T  2425 atccgacacaatactcgatggaagtccatgtaacttcacaat 2466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0518 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0518
Description:

Target: scaffold0518; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Original strand, 11200 - 11441
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  11200 gtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgact 11299  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||| ||||| || || ||||| || || |||||||     
T  11300 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactgaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaaactcttccagaacctcgaagtgaacctcggatctcc 11399  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11400 atccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 11441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0323 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0323
Description:

Target: scaffold0323; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 5202 - 4945
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||  |||||||||||||||| | |||||  ||||     
T  5202 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaacttgctcaagaacacacactctcagtaaata 5103  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || ||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  5102 ctctaaagattgaatcgtcatctcagactgaccatctgtctgcggatgataagccgaacttaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgcaaactcttc 5003  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccat 258  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || |||||||    
T  5002 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtacaccat 4945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0071 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0071
Description:

Target: scaffold0071; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 49082 - 48841
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||  || || || |||||||||||||    
T  49082 gtgaactctatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataaatcctctaaagattgtatcgtcctctccgact 48983  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||  ||    
T  48982 gaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggattcct 48883  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  48882 atccgacacaatactcgaaggaactccatgtagctttacaat 48841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 102; Significance: 1e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 13776 - 13535
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||||||||||||||| | ||| || || || ||||||||||    
T  13776 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccactttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaacgattggatcgttctctccgact 13677  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  |||  ||    
T  13676 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaatgcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtgaacctctgattcct 13577  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13576 atccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 13535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 4828 - 4587
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  4828 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacctttctcaagtacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgact 4729  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || ||||| |||||| |||| || || ||||| ||    
T  4728 gaccatctgtctgaggacgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttccagaatctaaaagtgaacctcggatccct 4629  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || | ||| ||||| || |||||||||||||| |||||    
T  4628 atccgacataatactcgacggtacaccatgtagctttacaat 4587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 126 - 271
Target Start/End: Original strand, 67897 - 68042
Alignment:
Q  126 gactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggat 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || || |    
T  67897 gactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttccaaaatcttgaagtaaacctcgggt 67996  T
Q  226 ctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  67997 ctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 68042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 6586 - 6856
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || || ||||| || ||||| || || ||||||||||||  |||||| |||||||| ||||| || |||| ||||||    
T  6586 caatacttgaatggtaactattgttgtatgtgaattctatcaatggtaggtgactatcccaaactcctccctgctcaagtacacatatcctcagcaaatc 6685  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||  |||| |||    
T  6686 ctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaacctcaatttcgaacccaacgcatcttgtgaactcttc 6785  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||| || || || ||||| || | |||||| | |||||||||    
T  6786 caaaatctagaagtgaaccttgggtctctatcggacactatactcgaggggataccatgcaacttcacaat 6856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 99; Significance: 6e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 48937 - 48668
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||| ||    
T  48937 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctaagcaa-tc 48839  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  48838 ctctaatgattgaatcgtcctttccgactgaccatctgtttgcggatgataagccgaactcaaccttaacttcgaacccaaggcatcttgcaaactcttc 48739  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| |||| ||||| || || |||||| |||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||    
T  48738 caacatcttgaagtgaacctcggatctttatccgacacaatactcgacggaaccccatgtaacttcacaat 48668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 57721 - 57511
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||| | ||||| ||||| | ||||||||||||    
T  57721 caatactcgaatggtaactgttgttgtaggtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccacctcgttcaagcacacacactctcaacaaatc 57622  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||    
T  57621 ctccaatgattggatcgtcttctccgactgaccatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgttctgcaaactcttc 57522  T
Q  201 caaaatctaga 211  Q
    || || |||||    
T  57521 cagaacctaga 57511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 52054 - 51814
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||    
T  52054 gtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgact 51956  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  51955 gaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccct 51856  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51855 atccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 51814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 61088 - 60848
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||    
T  61088 gtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgact 60990  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  60989 gaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccct 60890  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  60889 atccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 60848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 67476 - 67236
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||| || ||||| |  || || || |||||||||||||    
T  67476 gtgaactctatcaaaggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaataa-tcctccaatgattggatcgtcctctccgact 67378  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||| || || ||||| ||    
T  67377 gaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttccagaatctagaagtgaacctcggatccct 67278  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  67277 atccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 67236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 258
Target Start/End: Original strand, 37633 - 37861
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||    
T  37633 gtgaactccatcaacggtagatgactatctcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctagtgattgaatcgtcctctccgact 37732  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  37733 gaccatctgtttgcggatgataggctgaactgaacctcaactttgaacccaaggcatcttgtaagctcttccaaaaccttgaagtgaacctcggatctct 37832  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccat 258  Q
    ||| || ||||||||||| ||||| ||||    
T  37833 atccgacacaatgctcgatggaaccccat 37861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 21575 - 21305
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||    
T  21575 caatactcgaatggtaactgttgttgtacgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatc 21476  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||| ||||||||||||| ||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||    
T  21475 ctccaaagattgtatcgtcgtctccgactgaccgtctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttc 21376  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  21375 cagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 21305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 217
Target Start/End: Original strand, 26296 - 26424
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| || |  ||||||||  ||    
T  26296 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaagttagttcccaaagcagct 26395  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 217  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||    
T  26396 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 26424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 11164 - 11091
Alignment:
Q  198 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| || ||  | ||||||||||||||||||||    
T  11164 ttccagaatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatacttgacagcacaccatgtagcttcacaat 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 930 - 1200
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||    
T  930 caatactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcgcaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatc 1029  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||| || |||    
T  1030 ctccaaagattgtatcgtcctctccgactgaccatctgtctaaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcatcttgcaagctcttc 1129  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |  ||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  1130 ctgaatctagaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 1200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 204 - 271
Target Start/End: Original strand, 12582 - 12649
Alignment:
Q  204 aatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||    
T  12582 aatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggtaccccatgtagcttcacaat 12649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Original strand, 529 - 770
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| |  || || ||  ||||||||| ||    
T  529 gtgaactctatcaacggtagatgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcttaacaaatcctccaaagattggatcatcctctccgtct 628  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||    
T  629 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaactttgaacccaaggcatcttgcaagctcttccaaaatctagaagtgaacctcggatctct 728  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||    ||||| ||||| || |||||||| | |||||||||    
T  729 atccaccacaatactcgatggtacaccatgcaacttcacaat 770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0574 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0574
Description:

Target: scaffold0574; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 117 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 997 - 844
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  997 gtcctctccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgagcccaaagcatcttgcaaactcttccaaaatcttgaagtga 898  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  897 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaa 844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 51 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 10594 - 10425
Alignment:
Q  51 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 150  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||| ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10594 tgactattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctctaacgactaaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgat 10495  T
Q  151 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatct 220  Q
    | || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  10494 aagctgaactcaatctcaactttgaacccaacgcctcttgcaaacttttcgaaaatctagatgtaaatct 10425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 5327 - 5086
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || |||||||||||||    
T  5327 gtgaactctatcattggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctctccgact 5228  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || |||||||| || ||   ||| ||    
T  5227 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaaacatcctgcaaactcttccagaacctagaagtgaacctcaaatccct 5128  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| |||||| |||| |||||||||||||||||    
T  5127 atccgacacaatactcgaaagaactccatgtagcttcacaat 5086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3259 - 2992
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||    
T  3259 caatactcgaatggtaactgttgttctatgtgaactctatcaatggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactcgcaacaaatc 3160  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||    
T  3159 ctccaaagattggatcgtgccctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgaacccaaagcgtcatgcaaactcttc 3060  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    || |||||| |||| || || ||||| ||||| || ||||| || || || |||||||||||||||||    
T  3059 cagaatctataagtgaacctcggatccctatccgacacaatacttgacggtacaccatgtagcttcac 2992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 26663 - 26933
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| || |||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  |||||||||||    
T  26663 caatactcgagtgatagctgttgttataagtgaactcaatcaatggcaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacaccctcaacaaatc 26762  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
     || |  || ||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| |||    
T  26763 ttccaatgattgaatcgtcctctccgactgaccatctgtttgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcttc 26862  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| || || |  ||||| || |||||||||||    
T  26863 cagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatacttgacgatacaccgtgcagcttcacaat 26933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 91; Significance: 4e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 271
Target Start/End: Original strand, 3153 - 3423
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || |||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| | |||||  |||||    
T  3153 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagcaccaccttgttcaagcacacacactctcagtaaatc 3252  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||| ||| |||    
T  3253 ctccaatgattggattgtcctcttcgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaatgcattttgcagactcttc 3352  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  3353 caaaatctagaagtgaacctcagatcactatccgacacaatactcgacggaacaccatgcaacttcacaat 3423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 147 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 12954 - 12833
Alignment:
Q  147 tgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcg 246  Q
    |||||||| ||||||| | | ||||| |  ||||||||   ||||||||||  |||||| || || || || |||||||||||||| || ||||| | ||    
T  12954 tgatatgcagaactcagttttaacttagtacccaaagcactttgcaaacttccccaaaaccttgatgtgaaccttggatctctatccgaaacaatacacg 12855  T
Q  247 aaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    ||||||||||||| | ||||||    
T  12854 aaggaacaccatgcaacttcac 12833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 30 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1847 - 1618
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||  |||||||  || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||| | ||||||||||| ||  | ||| || ||||||||||    
T  1847 gtgaactttatcaacgacaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacactcttagcaaatcctctaacggttaaatcgttctctccgact 1748  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || | ||| || ||||||||||| |||||||| || ||||| || || ||||||||    
T  1747 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaacttcaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaacctcgaagtgaacctcggatctct 1648  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| |||||    
T  1647 atctgacacaatactcgatggaactccatg 1618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 271
Target Start/End: Original strand, 43957 - 44177
Alignment:
Q  51 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 150  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  43957 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgat 44056  T
Q  151 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 250  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  44057 aagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 44156  T
Q  251 aacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  44157 aactccatgtagcttcacaat 44177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 51 - 271
Target Start/End: Original strand, 44969 - 45189
Alignment:
Q  51 tgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgat 150  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || |   |||||||||||||||||| | |||| |||||||    
T  44969 tgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacatactctcaacaaatcctccaatgattggaccatcctctccgactgaccatgtatctgaggatgat 45068  T
Q  151 atgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaagg 250  Q
    | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||| || |||||||| || || ||||| ||||| || ||||| ||||||||    
T  45069 aagccgaactcaacctcaacttcgaccccaaagcgtcctgtaaactcttccagaacctagaagtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgaagg 45168  T
Q  251 aacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  45169 aactccatgtagcttcacaat 45189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 3 - 214
Target Start/End: Original strand, 20526 - 20737
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcct 102  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| ||||  || || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  20526 atactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagtggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacactctcaacaaatcct 20625  T
Q  103 ctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttcca 202  Q
    | |  || || || ||||||||||| |||||| |||||||   |||||| ||||||||||| ||||||||| | |||||||| |  || ||||| |||||    
T  20626 ccaatgattggatcgtcctctccgattgaccacctgtctgacaatgataagccgaactcaacctcaacttcaaacccaaagcgttctgtaaactcttcca 20725  T
Q  203 aaatctagaagt 214  Q
     || ||||||||    
T  20726 gaaactagaagt 20737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 75 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 12615 - 12420
Alignment:
Q  75 tcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcg 174  Q
    ||||| ||||| | ||||||||||||||| |  || || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  12615 tcaagcacacacactctcaacaaatcctccaatgattggatcgtcctttccgactgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcg 12516  T
Q  175 agcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaa 270  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  12515 aacccaaagcgtcctgcaaactcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatactcgacggaactccatgtagcttcacaa 12420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 3 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 6239 - 5969
Alignment:
Q  3 atactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaat--tctcaacaaatc 100  Q
    ||||| ||||| || || ||||| || |||||||| |||| | | || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |   ||||||||||||    
T  6239 atactcgaatggtaactgttattgtatgtgaactctatcagcagtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacacactctcaacaaatc 6140  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || || ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || || |||||  ||    
T  6139 ctccaatgattggatcgtcctctccgactgaccatctatctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgtaaactcatc 6040  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || || |||||||| || ||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6039 cagaacctagaagtgaacctcagatccctatccgacacaatactcgaaggaactccatgtagcttcacaat 5969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 3)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 117 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 192 - 38
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || |    
T  192 gtcctctccgactgaccatctgtctgtggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcatcttgtaaactcttccaaaatctagaggtga 93  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    | || ||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  92 acctcggatccctatccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 38  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Original strand, 11319 - 11560
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| ||| |||| || ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||| |  || || || |||| ||||||||    
T  11319 gtgaactctatctacggtaggtgactatcctaagctccaccttgctcaagcacacacactctcagtaaatcctccaatgattggatcgtccgctccgact 11418  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || ||||| || || ||||||||| ||||| | || || ||||| ||    
T  11419 gaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaatccaatgcatcttgtaagctcttccaaaatttagaaatgaacctcggatccct 11518  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11519 atccgacacaatactcgacggtacaccatgtagcttcacaat 11560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 7646 - 7456
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  7646 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 7547  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||||| ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7546 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatctcgatccgacacaatactagaaggaataccatg 7456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 25769 - 25511
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||| | || || | |||||  |||||    
T  25769 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcatgtacccacactctcagtaaatc 25670  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    ||| |  || || ||  ||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||    
T  25669 ctccaatgattggatcatcctctctgaccgaccatctgtctgaggatgataagccgaactcaacctcaacttcgatcccaaagcatcttgcaatctcttc 25570  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    || ||||||||||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  25569 cataatctagaagtgaacctcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 25511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 19251 - 19509
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  19251 caatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatc 19350  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||    
T  19351 ctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttc 19450  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
     | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  19451 tagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 19509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Original strand, 23413 - 23671
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || ||||| || ||||| |||||   |||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  23413 caatactcgaatggtaactattgttgtaagtaaactcttccaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacacattctcagtaaatc 23512  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||| || || || ||||||| ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |||| ||| ||||||||||| |||    
T  23513 ctctagagattgtatcgtcctcttcgactgatcatctgtctgaggatgataagccgaactcagcctcaatttcgaacccagagcatcttgcaaactcttc 23612  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
     | ||||||||||| ||    ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  23613 tagaatctagaagtgaactgcggatctctatccgacacaatactcgacggaacaccatg 23671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0742 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0742
Description:

Target: scaffold0742; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 30 - 271
Target Start/End: Original strand, 5644 - 5885
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||   ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| ||| || || ||||| |||||||    
T  5644 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaagttgctcaagcacacacactctcaacaaatcctctaacgattggatcgtcctttccgact 5743  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
     ||||||| ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||  |||| || ||| | || ||||| || || |||||||| ||    
T  5744 aaccatctttctgacgatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtccagcaagctcttcaagaacctagaggtgaaccttggatccct 5843  T
Q  230 atctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||| || ||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  5844 atccgacacaatactagaaggaactccatgtagcttcacaat 5885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 165 - 271
Target Start/End: Original strand, 12060 - 12166
Alignment:
Q  165 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 264  Q
    |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12060 ctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatctagaagtaaacctcggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagct 12159  T
Q  265 tcacaat 271  Q
    |||||||    
T  12160 tcacaat 12166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 9987 - 9782
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  || | ||||||    
T  9987 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagtacacatacccttagcaaatc 9888  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || || || || ||||| || ||||| ||||| |||    
T  9887 ctctaaagattggattgtcctctccgactgaccatatgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaattttgaacccaatgcatcttgtaaactcttc 9788  T
Q  201 caaaat 206  Q
    ||||||    
T  9787 caaaat 9782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 271
Target Start/End: Original strand, 4884 - 5102
Alignment:
Q  53 actatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatat 152  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| | |||||  |||||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  4884 actattccaagctccaccttgctcaagtacacacactctcagtaaatcctctaacgattgaatcgttctctccgactgaccatctgtttgcggatgataa 4983  T
Q  153 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 252  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||| | |  ||||||||||| |||||||| || |||||||| || | ||||||||| || || |||||||| ||||    
T  4984 gccgaactcaacctcaacttagaacccgaggaatcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtaaacctcgaatctctatccgacacgatgctcgatggaa 5083  T
Q  253 caccatgtagcttcacaat 271  Q
    | ||||| | |||||||||    
T  5084 ccccatgcaacttcacaat 5102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 271
Target Start/End: Original strand, 4425 - 4543
Alignment:
Q  153 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 252  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4425 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 4524  T
Q  253 caccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  4525 caccatgtaacttcacaat 4543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 153 - 271
Target Start/End: Original strand, 11555 - 11673
Alignment:
Q  153 gccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 252  Q
    ||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555 gccgaactcaacctcaacttagaacctaaagcctcttgcaaactcttccaaaatatagaagtaaacctcagatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 11654  T
Q  253 caccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  11655 caccatgtaacttcacaat 11673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 69 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 68427 - 68225
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    ||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| | || || ||||| |||||| |||||||||    
T  68427 ccttgctcaagtacacacactctcagcaaatcctttaacgactgaatcgtcctctccgactgaccatctatttgtgggtgataagccgaagtcaatctca 68328  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcac 268  Q
    |||| || |||||   |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||  |||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||    
T  68327 actttgaacccaagttctcttgcaaactcttccaaaaccttgaagtgaacctcagatctctatccgacacaatactcgatggaaccccatgcaacttcac 68228  T
Q  269 aat 271  Q
    |||    
T  68227 aat 68225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 46624 - 46814
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| |  |||||||| || || ||||| || || |||||||||||||    
T  46624 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctctgtatgaccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctca 46723  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||||| |||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  46724 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaaattagaaataaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 46814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 33193 - 32953
Alignment:
Q  31 tgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactg 130  Q
    ||||||| |||||||| || ||| ||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |  ||||||||||| || |  || || || ||||||||||||||    
T  33193 tgaactctatcaacggtaggtgattatcccaagctccaccttgctcaagcacacataccctcaacaaatcttccaatgattggatcgtcctctccgactg 33094  T
Q  131 accatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 230  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||| || || || ||||| |||    
T  33093 accatctgtctgaggatgataagtcgaactcaacctcaacttcgaacccaaatcatcctgcaaactcttccagaacctagaggtgaacctcggatcccta 32994  T
Q  231 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    || ||   ||| ||||| || ||||| || |||||||||||    
T  32993 tccgacgaaatactcgacggtacaccgtgcagcttcacaat 32953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 117 - 232
Target Start/End: Original strand, 17877 - 17992
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| || | ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  17877 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaaccttaactttgaactcaatgcatcttgcaaactcttccaaaatctagaagtga 17976  T
Q  217 atcttggatctctatc 232  Q
    |||| |||||||||||    
T  17977 atctcggatctctatc 17992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 186 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 39730 - 39645
Alignment:
Q  186 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  39730 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgacacaatgctcgatggaacaccatgcaacttcacaat 39645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 1138 - 880
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || ||||| || || || || ||||| || || ||||| ||||||| ||| || |||||||| ||||| | ||| |  |||||    
T  1138 caatactcgaatggtaactgttattgtatgtaaattctatcaatggtaggtgactgtcccaagctccaccctgctcaagtacacatactcttagtaaatc 1039  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttc 200  Q
    |||||  || || || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||||| ||||| |||    
T  1038 ctctaaagattggatcgtcctttccgaatgaccatctgtctgcggatgataagccgaactcaatttcaatttcgaacccaacgcatcttgtaaactcttc 939  T
Q  201 caaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||||||||  |||||||  |||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| |||||    
T  938 caaaatcttcaagtaaactttgggtctctatttgacactatactcgacggaaccccatg 880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1710 (Bit Score: 64; Significance: 5e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold1710
Description:

Target: scaffold1710; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 30 - 233
Target Start/End: Original strand, 320 - 523
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgact 129  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||| | ||| |  ||||||||||  || || || |||||||||   |    
T  320 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccacattgctcaagcacacacactcttactaaatcctctaaagattgtatcgtcctctccattt 419  T
Q  130 gaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctct 229  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || || || ||||||||||| ||||| |||||| |||| || || ||||| ||    
T  420 gaccatctgtgtgcggatgataagccgaactcagcctcaacttcgatcctaaggcgtcttgcaaactcttccagaatctataagtgaacctcggatccct 519  T
Q  230 atct 233  Q
    ||||    
T  520 atct 523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 62; Significance: 8e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 8794 - 8721
Alignment:
Q  198 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  8794 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctaatacaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaat 8721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 198 - 277
Target Start/End: Original strand, 24097 - 24176
Alignment:
Q  198 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaatttcctt 277  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24097 ttccaaaatctagaagttaatcttggatctctatccgatccaatgctcgaaggaacaccatgcaacttcacaatctcctt 24176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 144 - 267
Target Start/End: Complemental strand, 81593 - 81470
Alignment:
Q  144 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 243  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||||||||| || || || ||||| ||||| || ||||| |    
T  81593 ggatgataagccgaactcaacctcaacttcgaacccaaagcgtcctgcaagctcttccaaaatctagatgtgaacctcggatccctatccgacacaatac 81494  T
Q  244 tcgaaggaacaccatgtagcttca 267  Q
    |||| || ||||||||||||||||    
T  81493 tcgacggtacaccatgtagcttca 81470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 54; Significance: 5e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 14155 - 13994
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatc 100  Q
    ||||||| ||||| || || || || || |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||  |||||    
T  14155 caatactcgaatggtaactgttgttgtatgtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaagcacacacattctcagtaaatc 14056  T
Q  101 ctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactca 162  Q
    ||| |  || || || || |||| ||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||    
T  14055 ctccaaagattggatcgttctcttcgactgaccatctgtctacggatgataagctgaactca 13994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3711 - 3521
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| ||||| || | ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  3711 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctttctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 3612  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  3611 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaatttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 3521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0305 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0305
Description:

Target: scaffold0305; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 252
Target Start/End: Original strand, 11167 - 11309
Alignment:
Q  110 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 209  Q
    |||||| |||||||||  ||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  ||| |||||| | ||||||  ||    
T  11167 ctgaatggtcctctccatctgcccatcggtctggggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttacaaactctcccaaaactta 11266  T
Q  210 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 252  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | ||| || |||||||    
T  11267 gaagtaaatcttggatctcgatctgacataatactagaaggaa 11309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 23864 - 24054
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||| ||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||    
T  23864 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatactccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctca 23963  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  23964 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 24054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Original strand, 5693 - 5835
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    ||||| |||| ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||    
T  5693 gtcctatccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacatagaagtaa 5792  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    | || ||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  5793 acctcggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 5835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 9697 - 9507
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| || || || || |||||||||||||    
T  9697 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctgtggttggtaagcagaactcaatctca 9598  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |   |||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  9597 actttgtttccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 9507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Original strand, 18541 - 18711
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    |||||||||||| |||| |  |||||| |||||||| | ||| ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  || |||||  ||    
T  18541 tctcaacaaatcttctaacctctgaatagtcctctctgtctgcccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccgaaagcagct 18640  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||  ||||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  18641 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacgttggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 18711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 110 - 259
Target Start/End: Original strand, 7679 - 7828
Alignment:
Q  110 ctgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatcta 209  Q
    |||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| || |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  ||    
T  7679 ctgaatagtcctctcggtctgcccatctgtctggggatgataagcagaactcaatctcaaattagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacata 7778  T
Q  210 gaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  7779 gaagtaaacctcggatccggatccgacacaatactagaaggaataccatg 7828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 684 - 628
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactat 57  Q
    ||||||||||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  684 caatactagaacgataactattattgtatgtgaactcgatcaacggaagatgactat 628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 144 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 33174 - 33059
Alignment:
Q  144 ggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgc 243  Q
    |||||||| || |||||||| |||||||| |  ||||||||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| || ||||| | |||||| ||||| |    
T  33174 ggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatctgacacaatac 33075  T
Q  244 tcgaaggaacaccatg 259  Q
    | ||||||| ||||||    
T  33074 tagaaggaataccatg 33059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 165 - 259
Target Start/End: Original strand, 24529 - 24623
Alignment:
Q  165 ctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| | |||||||||  |||||||||| | ||||||| |||||||||||||||| | || |||||| ||||| || || |||| ||||||    
T  24529 ctcaacttagtgcccaaagcaacttgcaaactctcccaaaatatagaagtaaatcttgggtgtcgatctgacacaatactagatggaataccatg 24623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 259
Target Start/End: Original strand, 13398 - 13568
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| ||||||||||  || ||||| || || ||||| || || ||||||||||| ||||| |  ||||||||  ||    
T  13398 tctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtttgcccatcggtatgaggatggtaagcagaactcaatctgaacttagttcccaaagcagct 13497  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||||| | ||||||  ||||||||||||| ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  13498 tgcaaactctcccaaaacttagaagtaaatctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 132 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 827 - 700
Alignment:
Q  132 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctat 231  Q
    ||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||    
T  827 ccatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgat 728  T
Q  232 ctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| ||||| || |||| || ||||||    
T  727 ctgacacaatactagaagaaataccatg 700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 80 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3744 - 3565
Alignment:
Q  80 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 179  Q
    |||||||  |||||||||||| || |  || | |||||||||||  |  |||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||  |||||||| |  |||    
T  3744 aacacaagctctcaacaaatcttccaaagatttaattgtcctcttggtttgaccatcagtctgaggatgataagcaaaactcagcctcaacttagttccc 3645  T
Q  180 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |  ||||||| || |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||    
T  3644 aaagctgcttgcaaactctcccaaaactttaaagtaaacctcggatctctatctgacacaatgctagatggaataccatg 3565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 69 - 259
Target Start/End: Original strand, 3629 - 3818
Alignment:
Q  69 ccttgctcaagaacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctca 168  Q
    |||||||| | |||||||  |||||||||||||||||    | |||| |||||||| |  || ||||| ||||| |||||||| || ||||||||  |||    
T  3629 ccttgctccaaaacacaagctctcaacaaatcctctaaactcggaatagtcctctctgtttgcccatcggtctg-ggatgataagcagaactcaacgtca 3727  T
Q  169 acttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | |||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  3728 acttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatcttacacaatactagaaggaataccatg 3818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 259
Target Start/End: Original strand, 24398 - 24540
Alignment:
Q  117 gtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaa 216  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||||||||| ||    ||||||||  |||||||||| | ||||||   |||||| |    
T  24398 gtcctctccgtctgcccatcagtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaaattaattcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaactgagaagtga 24497  T
Q  217 atcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    | |||||||| | |||||| ||||| || ||||||| ||||||    
T  24498 accttggatcccgatctgacacaatactagaaggaataccatg 24540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 17389 - 17450
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaa 62  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  17389 caatgctagaatgataactgttattgtacgtgaattctatcaacggaagatgactatcccaa 17450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 259
Target Start/End: Original strand, 14670 - 14798
Alignment:
Q  132 ccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaa-gcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctcta 230  Q
    ||||||||||  |||||||| || |||||||| |||||||| |  |||||| ||  |||||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||| | |    
T  14670 ccatctgtcttgggatgataagcagaactcaacctcaacttagttcccaaaagcagcttgcaaactttcccaaaacttagaagtaaaccttgaatcccga 14769  T
Q  231 tctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    ||| | ||||| || ||||||| ||||||    
T  14770 tctaacacaatactagaaggaataccatg 14798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Original strand, 404 - 475
Alignment:
Q  1 caatactagaatgatagctattattataagtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctcctt 72  Q
    |||||||||||| |||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||    
T  404 caatactagaattataattgttattgtatgtgaactctatcaacggaagatggctatcacaagttccacctt 475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 259
Target Start/End: Original strand, 44019 - 44198
Alignment:
Q  80 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 179  Q
    |||||||  |||||||||||| ||||    |||||| |||||||||  ||| ||||| || |  ||||| || || ||||||||||||||||| |  |||    
T  44019 aacacaagctctcaacaaatcttctaaactctgaatagtcctctccatctgcccatcggtataaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagttccc 44118  T
Q  180 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || |||||   ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  44119 aaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatccagatccgacacaatactagaaggaataccatg 44198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 80 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 28091 - 27912
Alignment:
Q  80 aacacaaattctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagccc 179  Q
    |||||||  ||||||||||||||| |    |||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| |  |||    
T  28091 aacacaagctctcaacaaatcctccaaactctgaatagtcctctccgtctgcccatcggtctggggatggtaagcagaactcaacctcaacttagttccc 27992  T
Q  180 aaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatg 259  Q
    |||||  |||| ||||| | ||| ||  ||||||||||  | ||||| | ||| || ||||| || ||||||| ||||||    
T  27991 aaagcagcttgtaaactctcccagaacttagaagtaaacatcggatcccgatccgacacaatactagaaggaataccatg 27912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1061 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1061
Description:

Target: scaffold1061; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 271
Target Start/End: Original strand, 2187 - 2260
Alignment:
Q  198 ttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||||||||||||||| || || |||||||||| ||| ||||| ||||| || || ||||| | |||||||||    
T  2187 ttccaaaatctagaagtgaacctcggatctctatttgaaacaatactcgacgggactccatgcaacttcacaat 2260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0682 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0682
Description:

Target: scaffold0682; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 186 - 271
Target Start/End: Original strand, 470 - 555
Alignment:
Q  186 tcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaacaccatgtagcttcacaat 271  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| || || |||||||| || || || ||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  470 tcttgtaaactctttcaaaatcttgaagtaaacctcgggtctctatccgacactatactcgacggaacaccatgcatcttcacaat 555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0019 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0019
Description:

Target: scaffold0019; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 79
Target Start/End: Original strand, 136341 - 136390
Alignment:
Q  30 gtgaactcgatcaacggaagatgactatcccaagttcctccttgctcaag 79  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  136341 gtgaactctatcaacggtaggtgactatcccaagctccaccttgctcaag 136390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 252
Target Start/End: Original strand, 19 - 115
Alignment:
Q  156 gaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctcttgcaaacttttccaaaatctagaagtaaatcttggatctctatctgatacaatgctcgaaggaa 252  Q
    ||||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||| | ||||||  |||||||||| || ||||| | ||| || ||||| || |||||||    
T  19 gaactcaatctcaacttagttcccaaagcagcttgcaaactctcccaaaacttagaagtaaacctcggatcccgatccgacacaatactagaaggaa 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0117 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 89 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 1240 - 1112
Alignment:
Q  89 tctcaacaaatcctctagcgactgaattgtcctctccgactgaccatctgtctgcggatgatatgccgaactcaatctcaacttcgagcccaaagcctct 188  Q
    ||||||||||||||| |    |||||| |||||||| | |||  |||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |  ||||||||  ||    
T  1240 tctcaacaaatcctccaaactctgaatcgtcctctctgtctgctcatcggtctgaggatggtaagcagaactcaatctcaacttagtccccaaagcagct 1141  T
Q  189 tgcaaacttttccaaaatctagaagtaaa 217  Q
    | |||||| | ||||||  ||||||||||    
T  1140 ttcaaactctcccaaaacttagaagtaaa 1112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University