View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11856_high_5 (Length: 687)

Name: NF11856_high_5
Description: NF11856
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11856_high_5
NF11856_high_5
[»] chr2 (3 HSPs)
chr2 (10-671)||(32145788-32146455)
chr2 (294-671)||(1138-1511)
chr2 (294-671)||(21333021-21333395)
[»] scaffold0005 (3 HSPs)
scaffold0005 (151-368)||(19472-19689)
scaffold0005 (452-671)||(19175-19392)
scaffold0005 (17-130)||(19826-19940)
[»] chr4 (4 HSPs)
chr4 (151-368)||(14820023-14820240)
chr4 (452-671)||(14820320-14820537)
chr4 (547-632)||(14278194-14278278)
chr4 (17-130)||(14819772-14819886)
[»] chr1 (3 HSPs)
chr1 (460-671)||(12058693-12058900)
chr1 (14-73)||(23457799-23457858)
chr1 (523-660)||(23457286-23457423)
[»] chr7 (1 HSPs)
chr7 (441-671)||(15559479-15559707)
[»] scaffold0290 (2 HSPs)
scaffold0290 (20-95)||(2570-2645)
scaffold0290 (455-626)||(2736-2904)
[»] chr6 (1 HSPs)
chr6 (600-671)||(15593219-15593290)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 580; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 580; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 10 - 671
Target Start/End: Original strand, 32145788 - 32146455
Alignment:
Q  10 atgagaagagtaagaagtttgaagcatcaaattcaaggaagaaaaactcggatagtcgatgaaaagcatggtaagaataggatggacgtatctttacata 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32145788 atgagaagagtaagaagtttgaagcatcatattcaaggaagaaaaactcggatagtcgatgaaaagcatggtaagaataggatggacgtatctttacata 32145887  T
Q  110 agtaagttatgagagattggaattcgcctctagtatggtaatcagggtaacgttcaagtcatcaagtgtaataaccgatgttcgaagaaataggtactgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32145888 agtaagttatgagagattggaattcgcctctagtatggtaatcagggtaacgttcaagtcgtcaagtgtaataaccgatgttcgaataaataggtactgc 32145987  T
Q  210 tcaagagaagatggcaatactcaggctttatgcggatatgaagctctgaagattcaagttcagtattcttggaaatgagggaaaagatgttgtcatgtgg 309  Q
    ||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32145988 tcaggagaagatggcaatacttaggctttatccggatatgaagctctgaagattcaagttcagtattcttggaaatgagggagaagatgttgtcatgtgg 32146087  T
Q  310 gtcaagaatccttcatgatttatgttatgcaataatgtatgt----ctaa--gatatacatataagttaaagaggaaattgaaagaatccacccttgaag 403  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32146088 gtcaagaatccttcatgatttatgttatgcaataatgtatgtatgtctaatcgatatacatataagttaaagaggaaattgaaagaatccacccttgaag 32146187  T
Q  404 ttagcagtgttgctacgaaggaagacacaattatcaagttttacacgatgtgatttatgccctcttatgccatgcttgttaagtgataacgatacttgct 503  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32146188 ttagcagtgttgttatgaaggaagacacaattatcaagttttacacgatgtgattcatgccctcttatgccatgcttgttaagtgataacgatacttgct 32146287  T
Q  504 ataatattgttgaaccatgtttttatgactcctagagttaatgtatgtattaagggacttggaaacgaagttattttttaaaacatgatatttccacatt 603  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32146288 ataatattgttgaaccatgtttttatgactcctagagttaaggtatgtattaagggacttggaaacgaagttattttttaaaacatgatatttccacatt 32146387  T
Q  604 tctgaaactgatgaaacacgccataagcgagtaaactcacttaaggcatgcaaacttcagagccaact 671  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32146388 tctgaaactgatgaaacacgctataagcgagtatactcatttaaggcgtgcaaacttcagagccaact 32146455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 294 - 671
Target Start/End: Original strand, 1138 - 1511
Alignment:
Q  294 agatgttgtcatgtgggtcaagaatccttcatgatttatgttatgcaataatgtatgtctaagatatacatataagttaaagaggaaattgaaagaatcc 393  Q
    |||||| |||||||| |||||  || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| | | || ||| || |||    
T  1138 agatgtcgtcatgtgagtcaacgattccacatgatttatgttatgcagtaatgtctgtctgaggtatacatataagttaaagtgaatatggaa-gactcc 1236  T
Q  394 acccttgaagttagcagtgttgctacgaaggaagacacaattatcaagttttacacgatgtgatttatgccctcttatgccatgcttgttaagtgataac 493  Q
    || |  ||||||   |||  |   ||||||||||||||  | |  ||||||  ||||||| |||| || | |||||||||||| |||||||||||||||     
T  1237 actcc-gaagttgagagttgtatcacgaaggaagacacggtcagtaagtttcgcacgatgcgattcatactctcttatgccatacttgttaagtgataat 1335  T
Q  494 gatacttgctataatattgttgaaccatgttt-ttatgactcctagagttaatgtatgtattaagggacttggaaacgaagttattttttaaaacatgat 592  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||  ||   |||| |||||||||||  ||| || | | |||| ||| |||    
T  1336 gatacttgccatgatattgttgaaccatgcttcttatgacttctagagttaagatacacattaggggacttggaattgaaatt-tatgttaagacacgat 1434  T
Q  593 atttccacatttctgaaactgatgaaacacgccataagcgagtaaactcacttaaggcatgcaaacttcagagccaact 671  Q
     |||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  1435 tttt--acatttctgaaactgaggaaacacgccataagcgagtacactcacttaaggcgtgcaaacttcagagtcaact 1511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 73; E-Value: 5e-33
Query Start/End: Original strand, 294 - 671
Target Start/End: Original strand, 21333021 - 21333395
Alignment:
Q  294 agatgttgtcatgtgggtcaagaatccttcatgatttatgttatgcaataatgtatgtctaagatatacatataagttaaagaggaaattgaaagaatcc 393  Q
    |||||| |||||||| |||||| || |  |||||||||||||| ||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| | | || ||| || |||    
T  21333021 agatgtcgtcatgtgagtcaaggattccacatgatttatgttacgcagtaatgtctgtctgaggtatacatataagttaaagtgaatatggaa-gactcc 21333119  T
Q  394 acccttgaagttagcagtgttgctacgaaggaagacacaattatcaagttttacacgatgtgatttatgccctcttatgccatgcttgtt-aagtgataa 492  Q
    || |  ||||||   |||  |   |||||||||||||| || || ||||||    ||||| ||||  | | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  21333120 actcc-gaagttgagagttgtatcacgaaggaagacacgatcattaagtttcgtgcgatgcgattcgtactctcttatgccatacttgtttaagtgataa 21333218  T
Q  493 cgatacttgctataatattgttgaaccatg-tttttatgactcctagagttaatgtatgtattaagggacttggaaacgaagttattttttaaaacatga 591  Q
     |||||||   || |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||  || | |||| |||||||||||  ||| || | | |||| ||| ||    
T  21333219 tgatactttacatgatattgttgaactatgctttttatgactcctagagttaagatacgcattaggggacttggaattgaaatt-tatgttaagacacga 21333317  T
Q  592 tatttccacatttctgaaactgatgaaacacgccataagcgagtaaactcacttaaggcatgcaaacttcagagccaact 671  Q
    | ||   |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  21333318 ttttg--acatttctaaaattgaggaaacacgccataagcgagtaaactcacttaaggcgtgcaaacttcagagtcaact 21333395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 3)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 368
Target Start/End: Complemental strand, 19689 - 19472
Alignment:
Q  151 tcagggtaacgttcaagtcatcaagtgtaataaccgatgttcgaagaaataggtactgctcaagagaagatggcaatactcaggctttatgcggatatga 250  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||| | | | |||| ||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||  || |||| || ||||||    
T  19689 tcagggtaatgatcgagtcatcaagtgtaataactggtatccgaataaagaggtactagtcaggagaagatgacaatactcgagccttatccgaatatga 19590  T
Q  251 agctctgaagattcaagttcagtattcttggaaatgagggaaa-agatgttgtcatgtgggtcaagaatccttcatgatttatgttatgcaataatgtat 349  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19589 agttctgaagattcaagttcagtacttttg-aaacaaggaaaagagatgtcgtcatgtgggacaaggatccttcatgatttatgttatgcaataatgtat 19491  T
Q  350 gtctaagatatacatataa 368  Q
    || ||||||||||||||||    
T  19490 gtttaagatatacatataa 19472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 452 - 671
Target Start/End: Complemental strand, 19392 - 19175
Alignment:
Q  452 tgtgatttatgccctcttatgccatgcttgttaagtgataacgatacttgctataatattgttgaaccatg-tttttatgactcctagagttaatgtatg 550  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  19392 tgtgattcataccctcttatgttatgcttgttaagtgataatgatacttgccataatattgttgaaccatgatttttatgactcctagagttaagatatg 19293  T
Q  551 tattaagggacttggaaacgaagttattttttaaaacatgatatttccacatttctgaaactgatgaaacacgccataagcgagtaaactcacttaaggc 650  Q
     ||||  | ||||| ||  |||||| | |  ||||||| ||| |||  | |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  19292 cattagagaacttgtaattgaagtt-tatgataaaacacgattttt--atatttctcaaactgaagaaatacgccgtaagcgagtaaactcgcttaaagc 19196  T
Q  651 atgcaaacttcagagccaact 671  Q
     || | ||| |||||||||||    
T  19195 gtgtatactccagagccaact 19175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 19940 - 19826
Alignment:
Q  17 gagtaagaagt-ttgaagcatcaaattcaaggaagaaaaactcggatagtcgatgaaaagcatggtaagaataggatggacgtatctttacataagtaag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||  ||||||||||||||||| ||| || || ||||| | ||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  19940 gagtaagaagtcttgaagcatcaggttcaaagtagtgaaactcggatagtcgataaaaggcgtgataagagtgggatggatgtgcctttacctaagtaag 19841  T
Q  116 ttatgagagattgga 130  Q
    | | |||||||||||    
T  19840 tcaagagagattgga 19826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 91; Significance: 1e-43; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 151 - 368
Target Start/End: Original strand, 14820023 - 14820240
Alignment:
Q  151 tcagggtaacgttcaagtcatcaagtgtaataaccgatgttcgaagaaataggtactgctcaagagaagatggcaatactcaggctttatgcggatatga 250  Q
    ||||||||| | || ||||||||||||||||||| | | | |||| ||| |||||||  ||| ||||||||| ||||||||  || |||| || ||||||    
T  14820023 tcagggtaatgatcgagtcatcaagtgtaataactggtatccgaataaagaggtactagtcaggagaagatgacaatactcgagccttatccgaatatga 14820122  T
Q  251 agctctgaagattcaagttcagtattcttggaaatgagggaaa-agatgttgtcatgtgggtcaagaatccttcatgatttatgttatgcaataatgtat 349  Q
    || ||||||||||||||||||||| | ||| |||  ||| ||| |||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14820123 agttctgaagattcaagttcagtacttttg-aaacaaggaaaagagatgtcgtcatgtgggacaaggatccttcatgatttatgttatgcaataatgtat 14820221  T
Q  350 gtctaagatatacatataa 368  Q
    || ||||||||||||||||    
T  14820222 gtttaagatatacatataa 14820240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 452 - 671
Target Start/End: Original strand, 14820320 - 14820537
Alignment:
Q  452 tgtgatttatgccctcttatgccatgcttgttaagtgataacgatacttgctataatattgttgaaccatg-tttttatgactcctagagttaatgtatg 550  Q
    ||||||| || ||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  14820320 tgtgattcataccctcttatgttatgcttgttaagtgataatgatacttgccataatattgttgaaccatgatttttatgactcctagagttaagatatg 14820419  T
Q  551 tattaagggacttggaaacgaagttattttttaaaacatgatatttccacatttctgaaactgatgaaacacgccataagcgagtaaactcacttaaggc 650  Q
     ||||  | ||||| ||  |||||| | |  ||||||| ||| |||  | |||||| ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| ||||| ||    
T  14820420 cattagagaacttgtaattgaagtt-tatgataaaacacgattttt--atatttctcaaactgaagaaatacgccgtaagcgagtaaactcgcttaaagc 14820516  T
Q  651 atgcaaacttcagagccaact 671  Q
     || | ||| |||||||||||    
T  14820517 gtgtatactccagagccaact 14820537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 547 - 632
Target Start/End: Original strand, 14278194 - 14278278
Alignment:
Q  547 tatgtattaagggacttggaaacgaagttattttttaaaacatgatatttccacatttctgaaactgatgaaacacgccataagcg 632  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  14278194 tatgtagtaggggacttggaaacgaagttttctttaaaaacatgatattt-tacattcctgaaaccgatgaaacacgtcgtaagcg 14278278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 17 - 130
Target Start/End: Original strand, 14819772 - 14819886
Alignment:
Q  17 gagtaagaagt-ttgaagcatcaaattcaaggaagaaaaactcggatagtcgatgaaaagcatggtaagaataggatggacgtatctttacataagtaag 115  Q
    ||||||||||| |||||||||||  ||||| | ||  ||||||||||||||||| ||| || || ||||| | ||||||| ||  |||||| ||||||||    
T  14819772 gagtaagaagtcttgaagcatcaggttcaaagtagtgaaactcggatagtcgataaaaggcgtgataagagtgggatggatgtgcctttacctaagtaag 14819871  T
Q  116 ttatgagagattgga 130  Q
    | | |||||||||||    
T  14819872 tcaagagagattgga 14819886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 85; Significance: 4e-40; HSPs: 3)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 460 - 671
Target Start/End: Original strand, 12058693 - 12058900
Alignment:
Q  460 atgccctcttatgccatgcttgttaagtgataacgatacttgctataatattgttgaaccatgtttttatgactcctagagttaatgtatgtattaaggg 559  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||||||||  ||  ||||  |||    
T  12058693 atgccctcttatgtcatgcttgttaagtgataacgatacttgctataatattgtcggaccatgattttatgagtcctagagttaagatacatatt-gggg 12058791  T
Q  560 acttggaaacgaagttattttttaaaacatgatatttccacatttctgaaactgatgaaacacgccataagcgagtaaactcacttaaggcatgcaaact 659  Q
    ||||||||  |||  | | | |||| ||| |||  ||   ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12058792 acttggaattgaaaat-tatgttaagacacgattctt--gcatctctgaaactgatgcaacacgccataagcgagtaaactcacttaaggcgtgcaaact 12058888  T
Q  660 tcagagccaact 671  Q
     |||||||||||    
T  12058889 ccagagccaact 12058900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23457858 - 23457799
Alignment:
Q  14 gaagagtaagaagtttgaagcatcaaattcaaggaagaaaaactcggatagtcgatgaaa 73  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  23457858 gaagagtaagaagtttgaagcatcaaattcaaggtagcaaagctcggataatcgatgaaa 23457799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000006
Query Start/End: Original strand, 523 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 23457423 - 23457286
Alignment:
Q  523 tttttatgactcctagagttaatgtatgtattaagggacttggaaacgaagttattttttaaaacatgata-tttccacatttctgaaactgatgaaaca 621  Q
    ||||||| ||||||||||| ||  | ||||||  |||||||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||  | | ||| |||||  ||||||||    
T  23457423 tttttataactcctagagtcaagatgtgtattgtgggacttggaaaagaagtt-tattttaaaacatgatattttttataattccgaaacccatgaaaca 23457325  T
Q  622 cgccataagcgagtaaactcacttaaggcatgcaaactt 660  Q
    ||   |||||||| || |||||||||| | |||||||||    
T  23457324 cgttgtaagcgagcaagctcacttaagacgtgcaaactt 23457286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 441 - 671
Target Start/End: Original strand, 15559479 - 15559707
Alignment:
Q  441 gttttacacgatgtgatttatgccctcttatgccatgcttgttaagtgataacgatacttgctataatattgttgaaccatg-tttttatgactcctaga 539  Q
    ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||||  ||  | ||| |||||| | |||| |||    
T  15559479 gttttgcaagatgtgattcataccctcttatgccatgctcgttaaatgataatgatacttgccataatattaatgcgcaatgatttttagggctccaaga 15559578  T
Q  540 gttaatgtatgtattaagggacttggaaacgaagttattttttaaaacatgatatttccacatttctgaaactgatgaaacacgccataagcgagtaaac 639  Q
     |||| ||| | |||| ||||| |||||  ||  || | | |||||||  ||  ||| ||  ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  15559579 tttaaggtaggcattaggggacatggaattgagatt-tatgttaaaactcgacttttgca--tttctgaaactgatggaacacgccgtaagcgagtaaac 15559675  T
Q  640 tcacttaaggcatgcaaacttcagagccaact 671  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  15559676 tcacttaaggcgtgcaaactccagagccaact 15559707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 20 - 95
Target Start/End: Original strand, 2570 - 2645
Alignment:
Q  20 taagaagtttgaagcatcaaattcaaggaagaaaaactcggatagtcgatgaaaagcatggtaagaataggatgga 95  Q
    ||||||| |||||| || || ||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  2570 taagaaggttgaagtattaagttcaaggtagcaaaactcggatagtcgatgaaaggcgtggtaagaatatgatgga 2645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 455 - 626
Target Start/End: Original strand, 2736 - 2904
Alignment:
Q  455 gatttatgccctcttatgccatgcttgttaagtgataacgatacttgctataatattgttgaaccatgtttttatgactcctagagttaatgtatgtatt 554  Q
    ||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| ||  || |||||| |||||||| | |||  |||| |||    
T  2736 gatttataccttcttatgccatgctttttaagtgataatgatacttgccacaatgttgttgtacggtgattttataactcctagcggtaagatatgcatt 2835  T
Q  555 aagggacttggaaacgaagttattttttaaaacatgatatttccacatttctgaaactgatgaaacacgcca 626  Q
    |  | ||||||||  ||| |||  | ||||||| |||| |||   ||||| |||||||||||||||||||||    
T  2836 agagaacttggaattgaattta-atgttaaaacctgattttt--gcatttttgaaactgatgaaacacgcca 2904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 600 - 671
Target Start/End: Original strand, 15593219 - 15593290
Alignment:
Q  600 catttctgaaactgatgaaacacgccataagcgagtaaactcacttaaggcatgcaaacttcagagccaact 671  Q
    |||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| || || ||||| || ||||||||    
T  15593219 catttctggaactaaagaaacacgccataagcaagtaaactcgcttaaagcgtgtaaactccaaagccaact 15593290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University