View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11858_low_16 (Length: 257)

Name: NF11858_low_16
Description: NF11858
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11858_low_16
NF11858_low_16
[»] chr3 (52 HSPs)
chr3 (1-251)||(23492574-23492824)
chr3 (1-241)||(53771242-53771484)
chr3 (1-223)||(30153143-30153367)
chr3 (1-198)||(38168115-38168312)
chr3 (1-167)||(54685189-54685355)
chr3 (1-198)||(33342082-33342279)
chr3 (1-241)||(16261654-16261896)
chr3 (1-155)||(7854183-7854337)
chr3 (1-155)||(17955884-17956038)
chr3 (1-155)||(45581832-45581987)
chr3 (4-155)||(55513074-55513225)
chr3 (1-167)||(28558372-28558538)
chr3 (1-155)||(3992751-3992905)
chr3 (1-155)||(54038024-54038178)
chr3 (1-155)||(2844392-2844546)
chr3 (123-251)||(14842391-14842519)
chr3 (123-251)||(18911300-18911428)
chr3 (123-251)||(18896865-18896993)
chr3 (123-251)||(5228619-5228747)
chr3 (123-251)||(15468161-15468289)
chr3 (123-249)||(16821443-16821568)
chr3 (123-249)||(25059046-25059172)
chr3 (1-156)||(18970122-18970278)
chr3 (123-251)||(54651764-54651892)
chr3 (123-251)||(22275516-22275642)
chr3 (123-241)||(8268563-8268682)
chr3 (123-241)||(8275663-8275782)
chr3 (123-223)||(17912328-17912430)
chr3 (123-221)||(2449087-2449184)
chr3 (123-220)||(11986014-11986112)
chr3 (1-155)||(15550799-15550953)
chr3 (1-78)||(48421778-48421855)
chr3 (123-227)||(15615137-15615241)
chr3 (123-223)||(2050115-2050217)
chr3 (123-221)||(13954738-13954836)
chr3 (123-221)||(45861122-45861220)
chr3 (123-251)||(12264614-12264741)
chr3 (123-251)||(1467562-1467688)
chr3 (123-167)||(19260737-19260781)
chr3 (123-198)||(41270380-41270455)
chr3 (123-209)||(12030019-12030105)
chr3 (123-209)||(13839200-13839286)
chr3 (121-175)||(51961011-51961065)
chr3 (123-251)||(12812148-12812274)
chr3 (123-175)||(14285289-14285341)
chr3 (123-251)||(49232743-49232869)
chr3 (123-198)||(55316524-55316599)
chr3 (123-156)||(16933868-16933901)
chr3 (123-175)||(19947026-19947078)
chr3 (2-100)||(17393636-17393735)
chr3 (123-155)||(15857163-15857195)
chr3 (123-155)||(19232089-19232121)
[»] chr5 (40 HSPs)
chr5 (4-251)||(16105847-16106093)
chr5 (1-251)||(11342886-11343134)
chr5 (1-210)||(2032011-2032220)
chr5 (1-223)||(21205127-21205350)
chr5 (1-209)||(21650896-21651104)
chr5 (123-251)||(23514868-23514996)
chr5 (123-251)||(35790919-35791047)
chr5 (123-252)||(11211884-11212014)
chr5 (123-251)||(17471411-17471537)
chr5 (123-241)||(1219351-1219469)
chr5 (124-241)||(23328865-23328982)
chr5 (124-241)||(24616469-24616586)
chr5 (124-241)||(24712845-24712962)
chr5 (124-241)||(24745863-24745980)
chr5 (123-198)||(7425631-7425706)
chr5 (3-175)||(25005019-25005189)
chr5 (123-198)||(27010146-27010221)
chr5 (1-77)||(22662653-22662729)
chr5 (123-221)||(20623286-20623384)
chr5 (123-221)||(21233376-21233474)
chr5 (123-221)||(37053061-37053159)
chr5 (123-251)||(23981307-23981437)
chr5 (123-221)||(16536514-16536612)
chr5 (123-221)||(25900254-25900352)
chr5 (123-251)||(21932204-21932330)
chr5 (123-251)||(21938374-21938500)
chr5 (127-223)||(32951016-32951113)
chr5 (123-167)||(23507270-23507314)
chr5 (123-251)||(35582343-35582469)
chr5 (123-251)||(36989593-36989719)
chr5 (123-210)||(27182416-27182503)
chr5 (123-167)||(108716-108760)
chr5 (123-251)||(10777793-10777919)
chr5 (123-251)||(22882907-22883033)
chr5 (123-169)||(22053739-22053785)
chr5 (125-210)||(18530933-18531018)
chr5 (123-175)||(7529228-7529280)
chr5 (123-156)||(9730277-9730310)
chr5 (123-192)||(19500205-19500274)
chr5 (123-192)||(43443274-43443343)
[»] chr1 (27 HSPs)
chr1 (1-231)||(15861250-15861480)
chr1 (1-155)||(21860212-21860366)
chr1 (1-155)||(44034871-44035025)
chr1 (123-251)||(22228115-22228243)
chr1 (123-251)||(22232812-22232940)
chr1 (124-241)||(22035755-22035872)
chr1 (1-78)||(22367219-22367296)
chr1 (124-241)||(7640765-7640882)
chr1 (62-155)||(41218667-41218760)
chr1 (123-251)||(46523695-46523825)
chr1 (123-251)||(18059581-18059707)
chr1 (123-221)||(45051726-45051824)
chr1 (123-221)||(51452809-51452906)
chr1 (138-198)||(18598849-18598908)
chr1 (123-223)||(20931650-20931752)
chr1 (123-209)||(37844320-37844406)
chr1 (123-251)||(17004945-17005071)
chr1 (123-220)||(20913335-20913434)
chr1 (123-251)||(38054914-38055040)
chr1 (123-210)||(20893496-20893583)
chr1 (123-209)||(20445987-20446073)
chr1 (123-251)||(17148874-17149001)
chr1 (123-198)||(5072260-5072335)
chr1 (123-251)||(19962322-19962448)
chr1 (123-155)||(41394527-41394559)
chr1 (123-221)||(2116558-2116656)
chr1 (123-209)||(20531751-20531837)
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-198)||(14951963-14952160)
chr4 (1-241)||(15272124-15272366)
chr4 (1-155)||(25119107-25119261)
chr4 (1-155)||(5682428-5682581)
chr4 (53-238)||(15135823-15136010)
chr4 (123-251)||(7131886-7132014)
chr4 (123-251)||(14996445-14996573)
chr4 (123-251)||(17145478-17145606)
chr4 (123-251)||(18169277-18169403)
chr4 (123-246)||(20001030-20001153)
chr4 (123-241)||(47357958-47358075)
chr4 (124-221)||(26339327-26339424)
chr4 (123-198)||(15287119-15287194)
chr4 (123-198)||(15294228-15294303)
chr4 (124-198)||(22351938-22352012)
chr4 (123-221)||(26680517-26680615)
chr4 (123-221)||(16608947-16609045)
chr4 (1-131)||(19559560-19559690)
chr4 (123-210)||(13246737-13246824)
chr4 (123-221)||(16327774-16327872)
chr4 (1-107)||(49071888-49071994)
chr4 (124-205)||(55376444-55376525)
chr4 (123-223)||(122194-122296)
chr4 (130-221)||(13048069-13048160)
chr4 (123-221)||(10488879-10488977)
chr4 (4-78)||(34177617-34177691)
chr4 (123-210)||(15674954-15675041)
chr4 (123-169)||(10104156-10104202)
chr4 (123-169)||(33241011-33241057)
chr4 (123-175)||(14500092-14500144)
chr4 (123-175)||(32460583-32460635)
chr4 (126-169)||(31132628-31132671)
chr4 (125-167)||(18248527-18248569)
chr4 (123-156)||(8045272-8045305)
chr4 (123-156)||(16523146-16523179)
chr4 (124-160)||(22738577-22738613)
chr4 (123-175)||(40885439-40885491)
chr4 (123-155)||(54118168-54118200)
[»] chr2 (40 HSPs)
chr2 (4-251)||(25213252-25213500)
chr2 (1-167)||(9652784-9652950)
chr2 (1-246)||(21273857-21274103)
chr2 (1-155)||(22274923-22275077)
chr2 (3-155)||(22284158-22284310)
chr2 (123-251)||(16935900-16936028)
chr2 (123-251)||(17006560-17006688)
chr2 (123-251)||(42177790-42177918)
chr2 (4-155)||(15633418-15633569)
chr2 (123-246)||(12641468-12641591)
chr2 (123-246)||(12635694-12635817)
chr2 (123-246)||(12728699-12728822)
chr2 (123-246)||(34824782-34824905)
chr2 (124-241)||(23774444-23774561)
chr2 (123-246)||(3798429-3798552)
chr2 (123-246)||(8944153-8944276)
chr2 (1-156)||(7321718-7321873)
chr2 (123-221)||(14906288-14906386)
chr2 (123-221)||(23820388-23820486)
chr2 (123-221)||(22863235-22863336)
chr2 (123-233)||(25265224-25265335)
chr2 (123-221)||(19689249-19689347)
chr2 (123-200)||(463043-463120)
chr2 (123-235)||(17396487-17396599)
chr2 (123-221)||(20015328-20015426)
chr2 (123-251)||(11231161-11231287)
chr2 (123-251)||(22513008-22513134)
chr2 (123-251)||(28775630-28775756)
chr2 (123-209)||(8891549-8891635)
chr2 (123-251)||(24685604-24685730)
chr2 (123-163)||(36982356-36982396)
chr2 (123-210)||(24341254-24341341)
chr2 (124-205)||(32466177-32466257)
chr2 (123-175)||(33128372-33128424)
chr2 (123-156)||(7507756-7507789)
chr2 (16-77)||(20279627-20279688)
chr2 (123-156)||(28031133-28031166)
chr2 (123-175)||(17204659-17204711)
chr2 (123-155)||(19794629-19794661)
chr2 (123-155)||(20627238-20627270)
[»] chr6 (39 HSPs)
chr6 (7-250)||(4991279-4991523)
chr6 (1-241)||(23995124-23995366)
chr6 (1-156)||(26089936-26090092)
chr6 (1-175)||(15742100-15742273)
chr6 (1-155)||(19983192-19983346)
chr6 (1-155)||(35015057-35015211)
chr6 (1-156)||(18002394-18002550)
chr6 (1-155)||(18583518-18583672)
chr6 (123-251)||(1657565-1657693)
chr6 (123-251)||(15862789-15862917)
chr6 (123-247)||(1556312-1556436)
chr6 (123-251)||(19610325-19610453)
chr6 (123-246)||(23978076-23978199)
chr6 (1-153)||(15889607-15889760)
chr6 (123-198)||(16232199-16232274)
chr6 (1-156)||(25640455-25640609)
chr6 (1-107)||(22585494-22585600)
chr6 (1-107)||(22590325-22590431)
chr6 (183-251)||(16240401-16240469)
chr6 (124-198)||(29869650-29869724)
chr6 (138-198)||(18086697-18086757)
chr6 (123-210)||(27751742-27751829)
chr6 (9-107)||(15004855-15004953)
chr6 (123-221)||(1649955-1650053)
chr6 (123-251)||(16376196-16376322)
chr6 (123-251)||(16383520-16383646)
chr6 (123-223)||(29666181-29666282)
chr6 (123-251)||(10489006-10489132)
chr6 (123-251)||(22225561-22225687)
chr6 (123-251)||(22251389-22251515)
chr6 (123-210)||(23148303-23148390)
chr6 (123-210)||(23153754-23153841)
chr6 (123-175)||(32276639-32276691)
chr6 (123-184)||(35009323-35009384)
chr6 (123-175)||(18823263-18823315)
chr6 (123-175)||(18839118-18839170)
chr6 (123-251)||(19299544-19299670)
chr6 (123-234)||(16555979-16556088)
chr6 (123-234)||(16632535-16632644)
[»] chr7 (42 HSPs)
chr7 (16-223)||(15516691-15516901)
chr7 (1-241)||(42056101-42056343)
chr7 (1-167)||(2029122-2029288)
chr7 (1-192)||(3049783-3049974)
chr7 (1-241)||(2189998-2190240)
chr7 (1-155)||(126616-126770)
chr7 (1-155)||(1936917-1937071)
chr7 (1-155)||(32493946-32494100)
chr7 (1-155)||(111169-111323)
chr7 (123-247)||(15759939-15760063)
chr7 (123-251)||(15950613-15950740)
chr7 (138-251)||(14250720-14250832)
chr7 (123-246)||(13758677-13758800)
chr7 (123-198)||(15927875-15927950)
chr7 (123-198)||(18979895-18979970)
chr7 (123-235)||(14113823-14113935)
chr7 (123-198)||(13572981-13573056)
chr7 (123-221)||(7293333-7293431)
chr7 (123-220)||(16212071-16212170)
chr7 (124-235)||(25292173-25292283)
chr7 (123-221)||(11516544-11516641)
chr7 (1-107)||(13352153-13352259)
chr7 (123-221)||(15441412-15441510)
chr7 (123-221)||(30261977-30262075)
chr7 (123-223)||(13321334-13321435)
chr7 (123-251)||(2437763-2437889)
chr7 (123-235)||(14423474-14423585)
chr7 (123-223)||(36052971-36053073)
chr7 (1-107)||(39291457-39291563)
chr7 (123-251)||(7823035-7823161)
chr7 (123-251)||(7830346-7830472)
chr7 (123-251)||(27176740-27176866)
chr7 (123-221)||(11580592-11580693)
chr7 (123-221)||(13036869-13036970)
chr7 (121-223)||(25124448-25124552)
chr7 (123-251)||(27101460-27101586)
chr7 (123-251)||(27108808-27108934)
chr7 (123-251)||(38783552-38783678)
chr7 (123-175)||(47480924-47480976)
chr7 (2-76)||(15977820-15977894)
chr7 (123-156)||(371417-371450)
chr7 (124-160)||(10000282-10000318)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (1-198)||(9839-10037)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (1-241)||(13198-13440)
[»] chr8 (40 HSPs)
chr8 (1-223)||(24385582-24385806)
chr8 (1-210)||(41506654-41506863)
chr8 (1-155)||(24716762-24716916)
chr8 (1-155)||(274644-274798)
chr8 (1-155)||(641051-641205)
chr8 (1-155)||(826857-827011)
chr8 (1-155)||(39115476-39115630)
chr8 (123-251)||(13662086-13662214)
chr8 (123-251)||(13720749-13720877)
chr8 (123-247)||(17345887-17346011)
chr8 (123-251)||(22006079-22006207)
chr8 (123-251)||(16195538-16195666)
chr8 (123-246)||(16872877-16873000)
chr8 (1-156)||(21259390-21259545)
chr8 (1-107)||(17502362-17502468)
chr8 (1-107)||(4234056-4234162)
chr8 (123-221)||(22907062-22907160)
chr8 (1-107)||(23218078-23218184)
chr8 (1-64)||(22321437-22321500)
chr8 (123-221)||(5238404-5238502)
chr8 (123-221)||(24661096-24661194)
chr8 (123-221)||(43685863-43685961)
chr8 (123-223)||(43373322-43373424)
chr8 (124-210)||(7000465-7000551)
chr8 (123-192)||(16674271-16674339)
chr8 (123-221)||(24928648-24928748)
chr8 (123-251)||(271183-271309)
chr8 (123-251)||(644611-644737)
chr8 (123-251)||(830346-830472)
chr8 (123-251)||(15318982-15319108)
chr8 (123-251)||(15499351-15499477)
chr8 (123-251)||(22088617-22088743)
chr8 (123-223)||(16193573-16193674)
chr8 (123-175)||(21494336-21494388)
chr8 (123-175)||(22886654-22886706)
chr8 (123-156)||(2545265-2545298)
chr8 (123-156)||(3431175-3431208)
chr8 (123-192)||(6774137-6774206)
chr8 (123-192)||(30121029-30121098)
chr8 (123-155)||(16404900-16404932)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (4-251)||(130760-131006)
scaffold0028 (123-251)||(89281-89410)
scaffold0028 (123-210)||(107653-107740)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-200)||(55782-55981)
scaffold0032 (52-251)||(107979-108179)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (1-223)||(6373-6597)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (1-198)||(835-1032)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-155)||(80065-80219)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (1-198)||(17261-17458)
[»] scaffold0303 (2 HSPs)
scaffold0303 (1-197)||(4304-4501)
scaffold0303 (1-78)||(5-82)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1-223)||(12348-12572)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (1-155)||(5983-6137)
scaffold0686 (9-155)||(5777-5923)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (1-155)||(162078-162232)
scaffold0016 (1-155)||(166164-166318)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-223)||(193327-193542)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-155)||(31180-31334)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (1-155)||(41510-41664)
scaffold0078 (123-221)||(36914-37012)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (14-154)||(42568-42708)
scaffold0132 (123-175)||(13824-13876)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (1-155)||(30295-30449)
scaffold0116 (123-241)||(338-456)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (1-155)||(352-505)
[»] scaffold0175 (2 HSPs)
scaffold0175 (123-251)||(786-914)
scaffold0175 (1-87)||(15150-15236)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (123-251)||(33979-34107)
scaffold0012 (123-200)||(247321-247398)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (126-251)||(3271-3396)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (123-251)||(153828-153956)
scaffold0023 (123-156)||(48903-48936)
scaffold0023 (123-192)||(36399-36468)
scaffold0023 (123-156)||(61121-61154)
scaffold0023 (123-192)||(169789-169858)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (123-251)||(1335-1463)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (123-251)||(5033-5161)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (123-251)||(1397-1524)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (123-251)||(2700-2826)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (123-251)||(4029-4157)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (123-251)||(7278-7405)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (123-251)||(10569-10697)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (121-233)||(5912-6024)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (123-251)||(13882-14008)
scaffold0139 (123-251)||(20936-21062)
[»] scaffold0063 (1 HSPs)
scaffold0063 (1-133)||(44036-44168)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (124-198)||(6905-6979)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (123-198)||(64395-64470)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (123-219)||(12063-12160)
scaffold0162 (123-209)||(26286-26372)
scaffold0162 (123-175)||(8072-8125)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (123-251)||(10160-10288)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (138-198)||(154305-154365)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (123-223)||(146906-147008)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (123-221)||(5846-5943)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (123-221)||(22857-22955)
scaffold0141 (123-221)||(27112-27210)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (120-241)||(57305-57427)
[»] scaffold1295 (1 HSPs)
scaffold1295 (1-78)||(307-384)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (1-78)||(1478-1555)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (123-223)||(9183-9285)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (123-223)||(172210-172312)
scaffold0001 (123-223)||(177913-178015)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (197-251)||(17696-17750)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (128-190)||(23631-23693)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (123-201)||(1450-1528)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (123-223)||(17142-17241)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (124-200)||(25532-25608)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (123-223)||(1430-1532)
scaffold0266 (123-223)||(3438-3540)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (123-223)||(12418-12521)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (123-251)||(31616-31742)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (123-251)||(39410-39536)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (123-167)||(272330-272374)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (123-167)||(128083-128127)
[»] scaffold0160 (1 HSPs)
scaffold0160 (124-198)||(339-413)
[»] scaffold0079 (1 HSPs)
scaffold0079 (1-107)||(3785-3895)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (123-200)||(45338-45415)
scaffold0066 (123-200)||(54724-54801)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (123-175)||(18026-18078)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (123-175)||(34288-34340)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (123-167)||(36825-36869)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (123-198)||(1176-1251)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (123-210)||(123032-123119)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (123-209)||(51054-51140)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (123-223)||(55944-56045)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (123-175)||(5549-5601)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (123-175)||(41965-42017)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (123-167)||(42034-42078)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (123-156)||(5475-5508)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (124-160)||(12039-12075)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (123-175)||(49732-49784)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 52)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 23492574 - 23492824
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23492574 tcaaattaacacattcaaacatatctctacaacataagcaagaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 23492673  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23492674 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagct 23492773  T
Q  201 taccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23492774 tacccaaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctct 23492824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 53771242 - 53771484
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771242 tcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 53771341  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagc 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||    
T  53771342 tcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagc 53771441  T
Q  200 ttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 241  Q
    | |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  53771442 tcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 53771484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 30153143 - 30153367
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30153143 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 30153242  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    ||||  || |||| |||||||    
T  30153243 caagagaaaaagaattaattaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagacttctctttagctcctaagct 30153342  T
Q  201 taccccaa--ttgattcttcaagct 223  Q
     |||||||  |||||||||||||||    
T  30153343 caccccaatcttgattcttcaagct 30153367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 38168115 - 38168312
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38168115 tcaaattaacatattcaaacatatttctacaacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 38168214  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||    
T  38168215 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaag 38168312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 54685355 - 54685189
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54685355 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 54685256  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  54685255 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatcataaagactaacccacttaccttggatgaagattaa 54685189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 33342082 - 33342279
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  33342082 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacattagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 33342181  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||    
T  33342182 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccctcttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaag 33342279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 16261654 - 16261896
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16261654 tcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattacgcatagaa 16261753  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagc 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||   |||||| || |||| ||||||    
T  16261754 tcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaattccaacttaggcttcactttagctcctaagc 16261853  T
Q  200 ttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 241  Q
    | |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  16261854 tcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 16261896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 7854183 - 7854337
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7854183 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 7854282  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  7854283 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 7854337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 17956038 - 17955884
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17956038 tcaaattaacatattcagacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcgattatgcatagaa 17955939  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955938 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 17955884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 45581832 - 45581987
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45581832 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 45581931  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaa-cccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45581932 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccccccttacctta 45581987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 55513074 - 55513225
Alignment:
Q  4 aattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaa 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  55513074 aattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatttccataatcaattatgcatagaacaa 55513173  T
Q  104 gagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  55513174 gagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 55513225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 28558372 - 28558538
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  28558372 tcaaattaacatattcaaacatatctctatcacataagcacgaatttcaaagattaggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatggaa 28558471  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  28558472 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaaccctcttaccttagataaagattaa 28558538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 3992751 - 3992905
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3992751 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaaggttgagttcatgataattacttattctcataatcaattatgcatagaa 3992850  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  3992851 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 3992905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 54038178 - 54038024
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54038178 tcaaattaacatattcaaacatatatctacaatataagcacgaatgtcaaacattgagttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 54038079  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  54038078 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 54038024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 2844392 - 2844546
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2844392 tcaaattaacatattaaaacaaaaatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcgcttattcccataatcaattatgcatagaa 2844491  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
     |||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2844492 taagagaaaaagaatcaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 2844546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14842519 - 14842391
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  14842519 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgatccctcaagc 14842420  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842419 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 14842391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 18911300 - 18911428
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  18911300 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc 18911399  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18911400 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 18911428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18896993 - 18896865
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18896993 atgattatgataataactaacccccttaccttggaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 18896894  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  18896893 tattctcttcaaaacccttgttctcctct 18896865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 5228619 - 5228747
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5228619 atgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 5228718  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  5228719 tattctcttcaaaacctttgttcttctct 5228747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15468289 - 15468161
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15468289 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 15468190  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15468189 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 15468161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 249
Target Start/End: Original strand, 16821443 - 16821568
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||     
T  16821443 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctccta-gcttaccccaattgattcttcaagt 16821541  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttct 249  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  16821542 tattcccttcaaaacccttgttcttct 16821568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 123 - 249
Target Start/End: Original strand, 25059046 - 25059172
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| || | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25059046 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatttttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 25059145  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttct 249  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||    
T  25059146 tattctcttcaaaacccttgttcttct 25059172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 18970122 - 18970278
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  18970122 tcaaattaacatacttaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataatcacttatgcatagaa 18970221  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatga-taaagactaacccccttaccttag 156  Q
     |||||||||  || |||| || || |||||| | ||  ||||||||||||||||||    
T  18970222 aaagagaaaagaaactaactaagtggttatgattgaaatctaacccccttaccttag 18970278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 54651764 - 54651892
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  54651764 atgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatgatgattaacccaaacttttgcttcaattaagctcctaagctcaccccaatttgattcatcaag 54651863  T
Q  222 ctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    || ||| || |||||||||| |||||||||    
T  54651864 ctcttctctccaaaaccctt-ttcttctct 54651892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 22275516 - 22275642
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||  |||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  22275516 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccttaacttttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 22275614  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  22275615 tattcccttc-aaatccttgttcttctct 22275642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8268682 - 8268563
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattga-ttcttcaag 221  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | || |||||||||    
T  8268682 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggatttcttcaag 8268583  T
Q  222 ctattcccttcaaaaccctt 241  Q
     | ||| || ||||||||||    
T  8268582 ttcttctctccaaaaccctt 8268563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 8275782 - 8275663
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattga-ttcttcaag 221  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | || |||||||||    
T  8275782 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggatttcttcaag 8275683  T
Q  222 ctattcccttcaaaaccctt 241  Q
     | ||| || ||||||||||    
T  8275682 ttcttctctccaaaaccctt 8275663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17912430 - 17912328
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||  ||||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  17912430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccacctcaggcttcaatttagctcctaagctcactccaaccttgattcttcaa 17912331  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  17912330 gct 17912328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 2449184 - 2449087
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  2449184 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctt-tcccaatggattcttcaag 2449087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 11986112 - 11986014
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaa 220  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  11986112 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaatttgattcttcaa 11986014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 15550799 - 15550953
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  || | || ||||||||| ||    
T  15550799 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaattagcacttatgcataaaa 15550898  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
      |||||  |  ||||||| || |||||||||| ||  |||||||||||| ||||    
T  15550899 agagagagtagaaattaactaagtgattatgatgaattctaacccccttatctta 15550953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 48421778 - 48421855
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 78  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  48421778 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcatgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 48421855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 227
Target Start/End: Original strand, 15615137 - 15615241
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||     
T  15615137 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaagt 15615236  T
Q  223 tattc 227  Q
    |||||    
T  15615237 tattc 15615241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 2050115 - 2050217
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||| || || ||||  ||||||||||||    
T  2050115 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaaactcactccaatcttgattcttcaa 2050214  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  2050215 gct 2050217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13954836 - 13954738
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||| |||| | | |||||||||||    
T  13954836 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaag 13954738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 45861122 - 45861220
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||| |||| | | |||||||||||    
T  45861122 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaag 45861220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 12264741 - 12264614
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttacccc-aattgattcttcaag 221  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| || |||  |||||||||||||||| || || | ||||| ||||||||| |||||    
T  12264741 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcccaacctttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaaattgattcctcaag 12264643  T
Q  222 ctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    || |||||||||| || |||||||||||||    
T  12264642 ct-ttcccttcaacactcttgttcttctct 12264614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1467688 - 1467562
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  1467688 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 1467590  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  1467589 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 1467562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 19260781 - 19260737
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19260781 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 19260737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Original strand, 41270380 - 41270455
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  41270380 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaag 41270455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12030105 - 12030019
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 209  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  12030105 atgattatgataatgattaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaat 12030019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Original strand, 13839200 - 13839286
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 209  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||   ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  13839200 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagagtaatccctacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaat 13839286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 121 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 51961065 - 51961011
Alignment:
Q  121 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  51961065 aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 51961011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 12812148 - 12812274
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||  | |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  12812148 atgattatgataataactaacccccttacctttaaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 12812246  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  12812247 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 12812274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 14285289 - 14285341
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  14285289 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 14285341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 49232743 - 49232869
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| |  || | |||| |||||||||  |||||    
T  49232743 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagct-cataggtcacccaaattgattccccaagc 49232841  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  49232842 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 49232869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Original strand, 55316524 - 55316599
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||| ||||||  ||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  55316524 atgattgtgataataactaacccctttacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaag 55316599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16933901 - 16933868
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933901 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 16933868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 19947026 - 19947078
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  19947026 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaact 19947078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 2 - 100
Target Start/End: Original strand, 17393636 - 17393735
Alignment:
Q  2 caaattaacatattcaaacatatctctacaacatag-gcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctca--taatcaattatgcatag 98  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||  |||  |||||| ||||||||||| |||||  ||| |||||||||||||    
T  17393636 caaattaacatacccaaacatatcactacaac-tagagcacgaatttcaacaattaagttcataataatcactta-tctcaattaagcaattatgcatag 17393733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15857195 - 15857163
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15857195 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 15857163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Original strand, 19232089 - 19232121
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19232089 atgattaagataaagactaacccccttacctta 19232121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 40)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 16105847 - 16106093
Alignment:
Q  4 aattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-ca 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16105847 aattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 16105946  T
Q  103 agagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagctta 202  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  16105947 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcct-agctta 16106045  T
Q  203 ccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  16106046 ccccaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcttctct 16106093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 251
Target Start/End: Original strand, 11342886 - 11343134
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342886 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 11342985  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| |||   ||||||||||||||| || || |    
T  11342986 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaacctctgcttcaattcagctcct-aggt 11343084  T
Q  201 taccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
     |||||| ||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  11343085 caccccacttgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcttctct 11343134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Original strand, 2032011 - 2032220
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2032011 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 2032110  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  2032111 caagagaaaaagaattaactaaacgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagct 2032210  T
Q  201 taccccaatt 210  Q
     |||||||||    
T  2032211 caccccaatt 2032220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Original strand, 21205127 - 21205350
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21205127 tcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 21205226  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  | ||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  21205227 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaa-tcccttatcttagatgaagattaattccaacttaggcttcaatttagctcctaagct 21205325  T
Q  201 taccccaa--ttgattcttcaagct 223  Q
     || ||||  |||||||||||||||    
T  21205326 cactccaatcttgattcttcaagct 21205350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21650896 - 21651104
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  21650896 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaactatgcacagaa 21650995  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || ||||    |||||||| |||| |||||||    
T  21650996 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaatattaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcctaagct 21651095  T
Q  201 taccccaat 209  Q
     || |||||    
T  21651096 cactccaat 21651104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 23514868 - 23514996
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  23514868 atgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagt 23514967  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23514968 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 23514996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 35791047 - 35790919
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  35791047 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 35790948  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | ||| || ||||||| || |||||||||    
T  35790947 tcttctctccaaaaccttttttcttctct 35790919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 11212014 - 11211884
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||  ||||||||||||    
T  11212014 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattttgattcttcaa 11211916  T
Q  221 gctattcccttcaaaacccttgttcttctctc 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11211915 gctattcccttcaaaacccttgttcttctctc 11211884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17471537 - 17471411
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  17471537 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaactcaaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 17471439  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  17471438 tattcccttc-aaatccttgttcttctct 17471411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 1219469 - 1219351
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  1219469 atgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 1219370  T
Q  223 tattcccttcaaaaccctt 241  Q
    | ||| || ||||||||||    
T  1219369 tcttctctccaaaaccctt 1219351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Original strand, 23328865 - 23328982
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 223  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  23328865 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 23328964  T
Q  224 attcccttcaaaaccctt 241  Q
     ||| || ||||||||||    
T  23328965 cttctctccaaaaccctt 23328982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Original strand, 24616469 - 24616586
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 223  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  24616469 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 24616568  T
Q  224 attcccttcaaaaccctt 241  Q
     ||| || ||||||||||    
T  24616569 cttctctccaaaaccctt 24616586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Original strand, 24712845 - 24712962
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 223  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  24712845 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 24712944  T
Q  224 attcccttcaaaaccctt 241  Q
     ||| || ||||||||||    
T  24712945 cttctctccaaaaccctt 24712962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Original strand, 24745863 - 24745980
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 223  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  24745863 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 24745962  T
Q  224 attcccttcaaaaccctt 241  Q
     ||| || ||||||||||    
T  24745963 cttctctccaaaaccctt 24745980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Original strand, 7425631 - 7425706
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7425631 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 7425706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 175
Target Start/End: Original strand, 25005019 - 25005189
Alignment:
Q  3 aaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaaca 102  Q
    ||||||||| | ||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||   | | || |||| |||| ||||    
T  25005019 aaattaacacactcaaacatatcacttcaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaattgagcacttattcatacaaca 25005118  T
Q  103 agagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    |  |||||  | | ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| |||||||    
T  25005119 attgaaaa--actaaactaaatgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaact 25005189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Original strand, 27010146 - 27010221
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27010146 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 27010221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 22662729 - 22662653
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 77  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  22662729 tcaaattaacatattcaaatatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcacttatt 22662653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 20623286 - 20623384
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  20623286 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 20623384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 21233474 - 21233376
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  21233474 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 21233376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 37053061 - 37053159
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  37053061 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 37053159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 23981437 - 23981307
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 219  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||   |||||||||||    
T  23981437 atgattttgatgaagactaacccccttacctaagatgaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaattcttgattcttca 23981338  T
Q  220 agctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    || | | | ||||  |||||||||||||||||    
T  23981337 agatctcctcttc-taacccttgttcttctct 23981307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 16536514 - 16536612
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  16536514 atgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 16536612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 25900352 - 25900254
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  25900352 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggctttaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 25900254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21932330 - 21932204
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  21932330 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 21932232  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  21932231 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 21932204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21938500 - 21938374
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  21938500 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 21938402  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  21938401 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 21938374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 127 - 223
Target Start/End: Original strand, 32951016 - 32951113
Alignment:
Q  127 ttatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaagct 223  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| || | ||||||  ||||||    |||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32951016 ttatgatgaagactaacccccttaccttaaataatgattaattcaaacttagacttcaatttagctcctaagcttaccccaatttgattcttcaagct 32951113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Original strand, 23507270 - 23507314
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23507270 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 23507314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 35582343 - 35582469
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  35582343 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 35582441  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  35582442 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 35582469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 36989719 - 36989593
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  36989719 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 36989621  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  36989620 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 36989593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 27182503 - 27182416
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  27182503 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 27182416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 108760 - 108716
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  108760 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaa 108716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10777919 - 10777793
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||| |||||||||||| || || ||||| ||  ||| ||||||||||||||||| || || | |||||| ||||||| ||||||    
T  10777919 atgattatgataatcactaccccccttacctttgaagatgattatccttaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccacttgattcctcaagc 10777821  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | | ||||||||  | |||||||||||||    
T  10777820 t-tccccttcaactctcttgttcttctct 10777793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22883033 - 22882907
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||| ||| || |  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||   |||||    
T  22883033 atgattatgataataactaacccccttatctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgatttcccaagc 22882935  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  22882934 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 22882907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 22053785 - 22053739
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacc 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  22053785 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacc 22053739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 125 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 18531018 - 18530933
Alignment:
Q  125 gattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||||    
T  18531018 gattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatt 18530933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 7529228 - 7529280
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  7529228 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 7529280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9730310 - 9730277
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9730310 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 9730277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Original strand, 19500205 - 19500274
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 192  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  19500205 atgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagct 19500274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43443343 - 43443274
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 192  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  43443343 atgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagct 43443274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 27)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15861480 - 15861250
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15861480 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 15861381  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||    
T  15861380 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagact 15861281  T
Q  201 taccccaattgattcttcaagctattccctt 231  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15861280 tatcccaattgattcctcaagctattccctt 15861250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 21860212 - 21860366
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21860212 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagtacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 21860311  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21860312 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 21860366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44035025 - 44034871
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44035025 tcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataaacaagaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 44034926  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44034925 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 44034871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 22228115 - 22228243
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||     
T  22228115 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcttaagcttaccccaattgattcttcaagt 22228214  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22228215 tattcccttcaaaacccttgttattctct 22228243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 22232812 - 22232940
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||     
T  22232812 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcataaacttaccccaattgattcatcaaga 22232911  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  22232912 tattcacttcaaaacccttgttattctct 22232940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Original strand, 22035755 - 22035872
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 223  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  22035755 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 22035854  T
Q  224 attcccttcaaaaccctt 241  Q
     ||| || ||||||||||    
T  22035855 cttctctccaaaaccctt 22035872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 22367219 - 22367296
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22367219 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 22367296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 7640882 - 7640765
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 223  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  7640882 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 7640783  T
Q  224 attcccttcaaaaccctt 241  Q
     ||| || ||||||||||    
T  7640782 cttctctccaaaaccctt 7640765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 62 - 155
Target Start/End: Original strand, 41218667 - 41218760
Alignment:
Q  62 atgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  41218667 atgagaatcacttattcccataatcaattatgcatagaacaagagaaaaagaattaactaaatgatcatgatgaaaactaacccccttacctta 41218760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 46523695 - 46523825
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| | || |||||||||||| | | |||||||||||     
T  46523695 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgctttaatttatctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 46523794  T
Q  223 tattcccttcaaaaccc--ttgttcttctct 251  Q
    | ||| || ||||||||  ||||||||||||    
T  46523795 tcttctctccaaaacccttttgttcttctct 46523825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 18059707 - 18059581
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||    
T  18059707 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaattgattcctcaagc 18059609  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  18059608 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 18059581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 45051726 - 45051824
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  45051726 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 45051824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 51452809 - 51452906
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  51452809 atgattaagataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctt-tcccaatggattcttcaag 51452906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 138 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18598908 - 18598849
Alignment:
Q  138 actaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  18598908 actaacccccttaccttagaagaagattaaccc-aactcttgcttcaattcagctcctaag 18598849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 20931650 - 20931752
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||||||||||| || ||||  |||||| |||||    
T  20931650 atgattatgataaaggctaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctgctaagctcactccaatcttgattattcaa 20931749  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  20931750 gct 20931752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 37844406 - 37844320
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  37844406 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaaaattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaat 37844320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 17004945 - 17005071
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  17004945 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 17005043  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  17005044 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 17005071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Original strand, 20913335 - 20913434
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  20913335 atgattacgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 20913434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38055040 - 38054914
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  38055040 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 38054942  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  38054941 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 38054914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 20893583 - 20893496
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  20893583 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 20893496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Original strand, 20445987 - 20446073
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| | || ||||||| || |||||    
T  20445987 atgattatgataaagactaactcccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaat 20446073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 17148874 - 17149001
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccc-cttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| || |  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| | | |||||| ||||||| |||||    
T  17148874 atgattatgataataactaaccccccttacctttgaagttgattatccccaacccttgcttcaattcagctcctatg-tcaccccacttgattcctcaag 17148972  T
Q  222 ctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||||    
T  17148973 ct-ttcccttcaaccctcttgttcttctct 17149001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 5072335 - 5072260
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||   |||||||||||||||| |||||    
T  5072335 atgattgtgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaatctttgcttcaattcagctcctaag 5072260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19962448 - 19962322
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || |  ||| |||||| ||  |||||    
T  19962448 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcgcccaaattgaatccccaagc 19962350  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  19962349 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 19962322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Original strand, 41394527 - 41394559
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394527 atgattatgataaagactaacccccttacctta 41394559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 2116558 - 2116656
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| ||||  ||||||| ||| | | |||||||||||    
T  2116558 atgattatgataatcactaacccctttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcataagctttcccaattggattcttcaag 2116656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Original strand, 20531751 - 20531837
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| | || ||||||| || |||||    
T  20531751 atgattatgataaagactaatttccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttatctcctaagctcactccaat 20531837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 182; Significance: 2e-98; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 14951963 - 14952160
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14951963 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 14952062  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  14952063 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 14952160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 15272366 - 15272124
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272366 tcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 15272267  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagc 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||    
T  15272266 tcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagc 15272167  T
Q  200 ttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 241  Q
    | |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  15272166 tcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 15272124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 25119261 - 25119107
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25119261 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaattttcaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 25119162  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  25119161 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaactcccttacctta 25119107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5682581 - 5682428
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5682581 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 5682482  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||| |||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5682481 caagaggaaaa-aattaactaaatgattatgataaaaactaacccacttacctta 5682428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 53 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15136010 - 15135823
Alignment:
Q  53 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttac 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15136010 attgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttac 15135911  T
Q  152 cttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaacc 238  Q
    ||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| |||| |  ||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15135910 cttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaacc 15135823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7132014 - 7131886
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7132014 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc 7131915  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7131914 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 7131886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 14996445 - 14996573
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  14996445 atgattatgataataactaacccccttaccttaaaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaaacttaccccaattgattcctcaagc 14996544  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14996545 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 14996573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17145606 - 17145478
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17145606 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttacttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 17145507  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17145506 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 17145478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 18169277 - 18169403
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  18169277 atgattatgataataactaacccccttacctt-gaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctccta-gcttaccccaattgattcctcaagc 18169374  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18169375 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 18169403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Original strand, 20001030 - 20001153
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  20001030 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 20001129  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  20001130 tcttctctccaaaaccctttttct 20001153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Original strand, 47357958 - 47358075
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||    
T  47357958 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaa-ctcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattccttaagc 47358056  T
Q  223 tattcccttcaaaaccctt 241  Q
    | ||| || ||||||||||    
T  47358057 tcttctctccaaaaccctt 47358075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 221
Target Start/End: Original strand, 26339327 - 26339424
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  26339327 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaag 26339424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15287194 - 15287119
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15287194 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 15287119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15294303 - 15294228
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15294303 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 15294228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 22352012 - 22351938
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  22352012 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 22351938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 26680517 - 26680615
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  26680517 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaag 26680615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16609045 - 16608947
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  16609045 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 16608947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 131
Target Start/End: Original strand, 19559560 - 19559690
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  19559560 tcaaattaacatgctcaaacatatcactacaacatgagcaggaatttcaaaagttgggtacataataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaa 19559659  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatg 131  Q
     |||||| ||  ||||||| || ||||||||    
T  19559660 aaagagagaagaaattaactaattgattatg 19559690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Original strand, 13246737 - 13246824
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  13246737 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 13246824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 16327872 - 16327774
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  16327872 atgattatgataaagactaacccccttaccttatatgaagattaggccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 16327774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 49071888 - 49071994
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||  ||||||||||||| | |||||||||  || |||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  49071888 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaatatgagcacgaatttcaacggttgggttcacaatgatcacttattcaaataagcacttatgcatagaa 49071987  T
Q  101 caagaga 107  Q
     ||||||    
T  49071988 aaagaga 49071994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 55376525 - 55376444
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccc 205  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  55376525 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccc 55376444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 122194 - 122296
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||    |||||||| ||||  |||||| || ||||  ||||||||||||    
T  122194 atgattatgataaagactaatccccttaccttagataaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcttaagctcactccaatcttgattcttcaa 122293  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  122294 gct 122296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 130 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13048160 - 13048069
Alignment:
Q  130 tgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    ||||||||| | || |||||||||||| | | |||||||||||    
T  13048160 tgataaagactaacccccttaacttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttaactcctaagcttacccaattggattcttcaag 13048069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 10488879 - 10488977
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  10488879 atgattaagataaagaccaaccaccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 10488977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 34177691 - 34177617
Alignment:
Q  4 aattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 78  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  34177691 aattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaattttcaagattggattcacaataatcacttattc 34177617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 15675041 - 15674954
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||||    
T  15675041 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatt 15674954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 10104202 - 10104156
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacc 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10104202 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacc 10104156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 169
Target Start/End: Original strand, 33241011 - 33241057
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacc 169  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  33241011 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacc 33241057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 14500144 - 14500092
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  14500144 atgattatgatgaagcctaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 14500092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32460635 - 32460583
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  32460635 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 32460583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 169
Target Start/End: Original strand, 31132628 - 31132671
Alignment:
Q  126 attatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacc 169  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  31132628 attatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacc 31132671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 125 - 167
Target Start/End: Original strand, 18248527 - 18248569
Alignment:
Q  125 gattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18248527 gattatgataataactaacccccttaccttagatgatgattaa 18248569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Original strand, 8045272 - 8045305
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8045272 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 8045305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Original strand, 16523146 - 16523179
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16523146 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 16523179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 160
Target Start/End: Original strand, 22738577 - 22738613
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 160  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22738577 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatga 22738613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 40885491 - 40885439
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  40885491 atgattatgatgaattctaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 40885439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 54118200 - 54118168
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  54118200 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 54118168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 174; Significance: 1e-93; HSPs: 40)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 25213252 - 25213500
Alignment:
Q  4 aattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-ca 102  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25213252 aattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 25213351  T
Q  103 agagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta-acccaaactcttgcttcaattcagctgctaagctt 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || |||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  25213352 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctcctaatctt 25213451  T
Q  202 accccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25213452 accccaatt-attcctcaatctattctcttcaaaacccttgttcttctct 25213500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 9652950 - 9652784
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9652950 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaccacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 9652851  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652850 caagaaaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 9652784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 21274103 - 21273857
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21274103 tcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 21274004  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagc 199  Q
     |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || ||||  |||||    
T  21274003 tcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaa-ccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcataagc 21273905  T
Q  200 ttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | |||| |  ||||||| ||||||| ||| || |||||||||| ||||    
T  21273904 tcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctttttct 21273857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 22274923 - 22275077
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22274923 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 22275022  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22275023 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaggctaacccccttacctta 22275077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 3 - 155
Target Start/End: Original strand, 22284158 - 22284310
Alignment:
Q  3 aaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaaca 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22284158 aaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgagttcatgataatcacttattctcataatcaaatatgcatagaaca 22284257  T
Q  103 agagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284258 agagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 22284310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 16935900 - 16936028
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16935900 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 16935999  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16936000 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 16936028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 17006560 - 17006688
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  17006560 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactctttcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 17006659  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17006660 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 17006688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 42177918 - 42177790
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  42177918 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagcccctaatcttaccccaattgattcctcaagc 42177819  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42177818 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 42177790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 4 - 155
Target Start/End: Original strand, 15633418 - 15633569
Alignment:
Q  4 aattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaa 103  Q
    |||||||||| |||||| |||| | | ||||   ||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15633418 aattaacatactcaaacttatcaccaaaacaagagcacgaaattcaagaattgggttcattataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaa 15633517  T
Q  104 gagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15633518 gagaaaaagaattaactaagtgattatgataaagactaacctccttacctta 15633569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12641591 - 12641468
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  12641591 atgattatgataataactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 12641492  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  12641491 tcttctctccaaaaccctttttct 12641468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 12635817 - 12635694
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  12635817 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 12635718  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  12635717 tcttctctccaaaaccctttttct 12635694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Original strand, 12728699 - 12728822
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  12728699 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 12728798  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  12728799 tcttctctccaaaaccctttttct 12728822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Original strand, 34824782 - 34824905
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  34824782 atgattatgataatcactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 34824881  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  34824882 tcttctctccaaaaccctttttct 34824905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 124 - 241
Target Start/End: Original strand, 23774444 - 23774561
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 223  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | ||||||||||| |    
T  23774444 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagtt 23774543  T
Q  224 attcccttcaaaaccctt 241  Q
     ||| || ||||||||||    
T  23774544 cttctctccaaaaccctt 23774561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 3798552 - 3798429
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| | | |||||||||||     
T  3798552 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcataagcttacccaattggattcttcaagt 3798453  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  3798452 tcttctctccaaaaccctttttct 3798429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Original strand, 8944153 - 8944276
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  8944153 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 8944252  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | | | || |||||||||| ||||    
T  8944253 tctactctccaaaaccctttttct 8944276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 7321718 - 7321873
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||  ||| ||||||||||  |||| ||  ||||||||| |    
T  7321718 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaatagtcacttattcaaataagcacgtatgcatagga 7321817  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
     ||||||  |  ||||||| || ||||||| || ||  ||||||||||||||||||    
T  7321818 aaagagagtagaaattaactaagtgattataatgaattctaacccccttaccttag 7321873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 14906386 - 14906288
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  14906386 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 14906288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 23820388 - 23820486
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  23820388 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 23820486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 22863235 - 22863336
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||| ||||| |||| ||||||| |||||||   |||||||||||    
T  22863235 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggctgcaatttagctcctaagctcaccccaatccttgattcttca 22863334  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  22863335 ag 22863336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 25265335 - 25265224
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  25265335 atgattatgatgaagactaacccccttacattagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaagcttaccccaatttgattcttcaag 25265236  T
Q  222 ctattcccttca 233  Q
    || ||| |||||    
T  25265235 ctcttctcttca 25265224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 19689347 - 19689249
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  19689347 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 19689249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 200
Target Start/End: Original strand, 463043 - 463120
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  463043 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagct 463120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 17396599 - 17396487
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    |||| |||| |||| ||||||| |||| | | |||||||||||     
T  17396599 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggctttaatttagctcctaagctcacccaattggattcttcaagt 17396500  T
Q  223 tattcccttcaaa 235  Q
    | ||| |||||||    
T  17396499 tcttctcttcaaa 17396487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 20015328 - 20015426
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||| || ||| | | |||||||||||    
T  20015328 atgatcatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagttttcccaattggattcttcaag 20015426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 11231287 - 11231161
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  11231287 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 11231189  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  11231188 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 11231161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22513134 - 22513008
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  22513134 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 22513036  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  22513035 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 22513008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 28775756 - 28775630
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  28775756 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 28775658  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  28775657 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 28775630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Original strand, 8891549 - 8891635
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| || | ||||||| || |||||    
T  8891549 atgattatgataaagactaacccctttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagttcctaagctcactccaat 8891635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 24685730 - 24685604
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  24685730 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 24685632  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| ||  ||||||||||||    
T  24685631 t-ttcccttcaacacttttgttcttctct 24685604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 36982396 - 36982356
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaaga 163  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36982396 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaaga 36982356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 24341341 - 24341254
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||||    
T  24341341 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagattatgattaacctcaacttaggcttcattttagctcctaagctcactccaatt 24341254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 205
Target Start/End: Original strand, 32466177 - 32466257
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccc 205  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||    
T  32466177 tgattatgatgaagactaacccc-ttaccttagataaggatcaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccc 32466257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 33128372 - 33128424
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  33128372 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaact 33128424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7507789 - 7507756
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7507789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 7507756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 77
Target Start/End: Original strand, 20279627 - 20279688
Alignment:
Q  16 caaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatt 77  Q
    |||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||  |||||  |||||||||||||    
T  20279627 caaacatatctctataacatgagcacgaatttcaacgattaagttcaccataatcacttatt 20279688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28031166 - 28031133
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28031166 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 28031133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 17204659 - 17204711
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | | |||||| |||||||    
T  17204659 atgattatgatgaagactaacccccttactttaggttatgattaatccaaact 17204711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19794661 - 19794629
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19794661 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 19794629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 20627270 - 20627238
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20627270 atgattatgataaagactaaccccgttacctta 20627238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 170; Significance: 2e-91; HSPs: 39)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 250
Target Start/End: Original strand, 4991279 - 4991523
Alignment:
Q  7 taacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caaga 105  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  4991279 taacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcataaaatcaaga 4991378  T
Q  106 gaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagatta-acccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttacc 204  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  4991379 gaaaaagaattaaacaaatgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattattcctaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttacc 4991478  T
Q  205 ccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 250  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4991479 ccaatt-attcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctc 4991523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Original strand, 23995124 - 23995366
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995124 tcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaattccaaatattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 23995223  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagc 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||    
T  23995224 tcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagc 23995323  T
Q  200 ttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 241  Q
    | |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  23995324 tcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 23995366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 26089936 - 26090092
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26089936 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 26090035  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090036 tcaagagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 26090092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15742273 - 15742100
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15742273 tcaaattaacataatcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcat-gaa 15742175  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  15742174 caagagaaaaagaattaaccaaaggattatgataaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaact 15742100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 19983346 - 19983192
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19983346 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattggattcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 19983247  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19983246 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 19983192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 35015211 - 35015057
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35015211 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 35015112  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  35015111 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 35015057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 18002550 - 18002394
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18002550 tcaaatgaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttatgcccataatcaattatgcatagaa 18002451  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002450 tcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 18002394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 18583518 - 18583672
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18583518 tcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaatgatgcatagaa 18583617  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    || |||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18583618 caggagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 18583672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1657693 - 1657565
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1657693 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgtttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 1657594  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1657593 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 1657565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 15862789 - 15862917
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15862789 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcacctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 15862888  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  15862889 tattctcttcaaaactcttgttcttctct 15862917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 247
Target Start/End: Original strand, 1556312 - 1556436
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1556312 atgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 1556411  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttctt 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  1556412 tattctcttcaaaacccttgttctt 1556436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 19610325 - 19610453
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19610325 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 19610424  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | ||| || |||||||||| |||||||||    
T  19610425 tcttctctccaaaaccctttttcttctct 19610453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Original strand, 23978076 - 23978199
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  23978076 atgattatgataataactaacgcccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 23978175  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  23978176 tcttctctccaaaaccctttttct 23978199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15889760 - 15889607
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||  |||| || ||||||||||||    
T  15889760 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaggttgggttcacaataatcacgtattcaaataaacacttatgcatagaa 15889661  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatga-taaagactaacccccttacct 153  Q
     |||||| ||  ||||||| || ||||||||| | ||  |||||||||||||||    
T  15889660 aaagagagaagaaattaactaagtgattatgattgaaatctaacccccttacct 15889607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Original strand, 16232199 - 16232274
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16232199 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 16232274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25640609 - 25640455
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  25640609 tcaaattaacatactcaaacatatc-ctacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaa 25640511  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
     ||||||  |  ||||| | || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  25640510 aaagagagtagaaattacctaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag 25640455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22585600 - 22585494
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  22585600 tcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaa 22585501  T
Q  101 caagaga 107  Q
     ||||||    
T  22585500 aaagaga 22585494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22590431 - 22590325
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  22590431 tcaaattaaaatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcaaaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaa 22590332  T
Q  101 caagaga 107  Q
     ||||||    
T  22590331 aaagaga 22590325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 183 - 251
Target Start/End: Original strand, 16240401 - 16240469
Alignment:
Q  183 caattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16240401 caattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctct 16240469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 29869724 - 29869650
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29869724 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagatcaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 29869650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18086757 - 18086697
Alignment:
Q  138 actaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18086757 actaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 18086697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Original strand, 27751742 - 27751829
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  27751742 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaatt 27751829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 9 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15004953 - 15004855
Alignment:
Q  9 acatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagaga 107  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  |||| || |||||||||||| ||||||    
T  15004953 acatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatctcttattcaaataagcacttatgcatagaaaaagaga 15004855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 1650053 - 1649955
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  1650053 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 1649955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16376322 - 16376196
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  16376322 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 16376224  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  16376223 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 16376196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16383646 - 16383520
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  16383646 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 16383548  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  16383547 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 16383520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 29666181 - 29666282
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||  |||||| | |||||| |||||||   ||||||||| |||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  29666181 atgattatgatgaagactaacccacttatgttagataatgattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaatttgattcttcaag 29666280  T
Q  222 ct 223  Q
    ||    
T  29666281 ct 29666282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 10489006 - 10489132
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  10489006 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 10489104  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  10489105 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 10489132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22225687 - 22225561
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  22225687 atgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 22225589  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||| ||||| || |||||||||||||    
T  22225588 t-ttccattcaacactcttgttcttctct 22225561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22251515 - 22251389
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  22251515 atgattatgataataactaacccccatacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 22251417  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||| ||||| || |||||||||||||    
T  22251416 t-ttccattcaacactcttgttcttctct 22251389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Original strand, 23148303 - 23148390
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  23148303 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 23148390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Original strand, 23153754 - 23153841
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  23153754 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 23153841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 32276691 - 32276639
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  32276691 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 32276639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 35009384 - 35009323
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttca 184  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| | ||||||    
T  35009384 atgattatgatgaagactaacccccttactttagataatgattaatccaaactttggcttca 35009323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18823315 - 18823263
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  18823315 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaact 18823263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 18839170 - 18839118
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  18839170 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggttatgattaatccaaact 18839118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 19299544 - 19299670
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || |  ||| |||||| ||  |||||    
T  19299544 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcgcccaaattgaatccccaagc 19299642  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  19299643 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 19299670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16556088 - 16555979
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  16556088 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 16555990  T
Q  223 tattcccttcaa 234  Q
    | ||||||||||    
T  16555989 t-ttcccttcaa 16555979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 16632644 - 16632535
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  16632644 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 16632546  T
Q  223 tattcccttcaa 234  Q
    | ||||||||||    
T  16632545 t-ttcccttcaa 16632535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 156; Significance: 6e-83; HSPs: 42)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 6e-83
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15516901 - 15516691
Alignment:
Q  16 caaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-caagagaaaaagaa 114  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15516901 caaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatcaagagaaaaagaa 15516802  T
Q  115 ttaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttga 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  ||||    
T  15516801 ttaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacatttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctagacttaccccaatcttga 15516702  T
Q  213 ttcttcaagct 223  Q
    |||||||||||    
T  15516701 ttcttcaagct 15516691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 42056343 - 42056101
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056343 tcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 42056244  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagc 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||    
T  42056243 tcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagc 42056144  T
Q  200 ttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 241  Q
    | |||| |  ||||||  ||||||| ||| || ||||||||||    
T  42056143 tcacccaatcttgattactcaagctcttctctccaaaaccctt 42056101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 167
Target Start/End: Original strand, 2029122 - 2029288
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029122 tcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 2029221  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2029222 caagagaaaaaaaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 2029288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 8e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 192
Target Start/End: Original strand, 3049783 - 3049974
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3049783 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaatataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 3049882  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 192  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| ||||    
T  3049883 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagct 3049974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 2190240 - 2189998
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2190240 tcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggtacatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 2190141  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagc 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || | || ||||||    
T  2190140 tcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaaaactaaccgccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttaactcctaagc 2190041  T
Q  200 ttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 241  Q
    | |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  2190040 tcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 2189998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 126616 - 126770
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  126616 tcaaattaacatattcaaacatatctctgcaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 126715  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  126716 caatagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 126770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 1937071 - 1936917
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1937071 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 1936972  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1936971 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacctccttacctta 1936917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 32494100 - 32493946
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  32494100 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataaacacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 32494001  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32494000 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 32493946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 111323 - 111169
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  111323 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaatattgggttcatgataatcacttattttcataatcaattatgcatagaa 111224  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  111223 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 111169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15760063 - 15759939
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15760063 atgattatgatgataactaacccccttaccttagaagaagattaacacaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 15759964  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttctt 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||    
T  15759963 tattctcttcaaaacccttgttctt 15759939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15950740 - 15950613
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  15950740 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 15950642  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15950641 tatttccttcaaaacccttgttcttctct 15950613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 138 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14250832 - 14250720
Alignment:
Q  138 actaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaac 237  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  14250832 actaacccccttaccttagaagaagat-aactcaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaac 14250734  T
Q  238 ccttgttcttctct 251  Q
    ||||||||||||||    
T  14250733 ccttgttcttctct 14250720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Original strand, 13758677 - 13758800
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  13758677 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 13758776  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  13758777 tcttctctccaaaaccctttttct 13758800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Original strand, 15927875 - 15927950
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15927875 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 15927950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 18979970 - 18979895
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  18979970 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 18979895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14113935 - 14113823
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  14113935 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagcttctaagcttacccaattggattcttcaagt 14113836  T
Q  223 tattcccttcaaa 235  Q
    | ||| |||||||    
T  14113835 tcttctcttcaaa 14113823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Original strand, 13572981 - 13573056
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13572981 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 13573056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 7293333 - 7293431
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  7293333 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaag 7293431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 220
Target Start/End: Original strand, 16212071 - 16212170
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  16212071 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 16212170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 124 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 25292283 - 25292173
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagct 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |    
T  25292283 tgattatgataaagactaacccccttatcttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctta-cccaattgattcctcaagtt 25292185  T
Q  224 attcccttcaaa 235  Q
     ||| |||||||    
T  25292184 cttctcttcaaa 25292173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 11516544 - 11516641
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||||||||||    
T  11516544 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctt-tcccaatggattcttcaag 11516641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 13352153 - 13352259
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  13352153 tcaaattaacatactgaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaagggttgggttcacaataatcacttattcaaataaacacttatgcatagaa 13352252  T
Q  101 caagaga 107  Q
     ||||||    
T  13352253 aaagaga 13352259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15441510 - 15441412
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  15441510 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 15441412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 30262075 - 30261977
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  30262075 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 30261977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 13321334 - 13321435
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||    |||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  13321334 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaacctaggcttcactttagctcctaagcttaccccaatttgattcttcaag 13321433  T
Q  222 ct 223  Q
    ||    
T  13321434 ct 13321435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 2437763 - 2437889
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||    
T  2437763 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaattgattcctcaagc 2437861  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || | |||||||||||    
T  2437862 t-ttcccttcaacactcctgttcttctct 2437889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 123 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 14423585 - 14423474
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  14423585 atgattatgataa-gactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagcttctaagcttacccaattggattcttcaagt 14423487  T
Q  223 tattcccttcaaa 235  Q
    | ||| |||||||    
T  14423486 tcttctcttcaaa 14423474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 36052971 - 36053073
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  36052971 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 36053070  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  36053071 gct 36053073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 39291563 - 39291457
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  || ||||||  ||||||||||||||  ||||  | ||||||||||||    
T  39291563 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttaggttcacaataatcacttattcaaataagtacttatgcatagaa 39291464  T
Q  101 caagaga 107  Q
     ||||||    
T  39291463 aaagaga 39291457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 7823035 - 7823161
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  7823035 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 7823133  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  7823134 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 7823161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 7830346 - 7830472
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  7830346 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 7830444  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  7830445 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 7830472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 27176740 - 27176866
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| ||||||||| ||||||    
T  27176740 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattcctcaagc 27176838  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  27176839 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 27176866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 11580693 - 11580592
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 219  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||   |||||||||||    
T  11580693 atgattatgataaagactaatccccttaccttagattaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatccttgattcttca 11580594  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  11580593 ag 11580592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 13036970 - 13036869
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 219  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||||||| ||||   |||||||||||    
T  13036970 atgattatggtgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagcttactccaatccttgattcttca 13036871  T
Q  220 ag 221  Q
    ||    
T  13036870 ag 13036869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 121 - 223
Target Start/End: Original strand, 25124448 - 25124552
Alignment:
Q  121 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttc 218  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| | |||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||    
T  25124448 aaatgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatctaaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttc 25124547  T
Q  219 aagct 223  Q
    |||||    
T  25124548 aagct 25124552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27101586 - 27101460
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  27101586 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 27101488  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  27101487 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 27101460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 27108934 - 27108808
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  27108934 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 27108836  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  27108835 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 27108808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38783678 - 38783552
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  38783678 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 38783580  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  38783579 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 38783552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 47480976 - 47480924
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  47480976 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 47480924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 2 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 15977894 - 15977820
Alignment:
Q  2 caaattaacatattcaaacatatctctacaacatag-gcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttat 76  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||| |||||||||| |||  |||||| ||||||||||||    
T  15977894 caaattaacatactcaaacatatcactacaac-tagagcatgaatttcaaacatttagttcataataatcacttat 15977820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Original strand, 371417 - 371450
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  371417 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 371450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 10000318 - 10000282
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 160  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  10000318 tgattatgatgaagacaaacccccttaccttagatga 10000282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 10037 - 9839
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaatt-atgcataga 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  10037 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattttcataatcaatttatgcataga 9938  T
Q  100 acaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||    
T  9937 acaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaag 9839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 155; Significance: 2e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13440 - 13198
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13440 tcaaattaacatatccaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 13341  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagc 199  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||    
T  13340 tcaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagc 13241  T
Q  200 ttacccca-attgattcttcaagctattcccttcaaaaccctt 241  Q
    | |||| |  ||||||| ||||||| ||| || ||||||||||    
T  13240 tcacccaatcttgattcctcaagctcttctctccaaaaccctt 13198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 154; Significance: 9e-82; HSPs: 40)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 24385806 - 24385582
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385806 tcaaattatcatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcataataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 24385707  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||| || |||| |||||||    
T  24385706 caagagaaaaggaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagct 24385607  T
Q  201 taccccaa--ttgattcttcaagct 223  Q
     || ||||  |||||||||||||||    
T  24385606 cactccaatcttgattcttcaagct 24385582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 41506863 - 41506654
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41506863 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacggatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 41506764  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| ||||  ||||||    
T  41506763 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcttaagct 41506664  T
Q  201 taccccaatt 210  Q
     |||||||||    
T  41506663 caccccaatt 41506654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24716916 - 24716762
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716916 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccatataaccacgaatttcaaagatcgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 24716817  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716816 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 24716762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 274644 - 274798
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  274644 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatagga 274743  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  274744 caagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 274798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 641205 - 641051
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  641205 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatagga 641106  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  641105 caagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 641051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 827011 - 826857
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  827011 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacatacgcacgaatttcaaagattgggttcatgataataacttattctcataatcaattatgcatagga 826912  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  826911 caagagaaaatggattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctta 826857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 39115476 - 39115630
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39115476 tcaaattaacatattcaaacatatctttacaacataagcacgaatgtcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 39115575  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  39115576 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgatgaaaactaacacccttacctta 39115630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13662214 - 13662086
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13662214 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc 13662115  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13662114 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 13662086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 13720877 - 13720749
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  13720877 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc 13720778  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13720777 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 13720749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 247
Target Start/End: Original strand, 17345887 - 17346011
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  17345887 atgattatgatgaagactaacccccttacctaagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagt 17345986  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttctt 247  Q
    ||||| || ||||||||||||||||    
T  17345987 tattctctccaaaacccttgttctt 17346011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22006207 - 22006079
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22006207 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 22006108  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  22006107 tattctcttcaaaacctttgttcttctct 22006079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 16195538 - 16195666
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  | |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  16195538 atgattatgataataattaacccccttaccttagaagatgattaacccaaactcttgcttcaattcaactcctaatcttaccccatttgatttctcaagc 16195637  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16195638 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 16195666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 123 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16873000 - 16872877
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||     
T  16873000 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaagt 16872901  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttct 246  Q
    | ||| || |||||||||| ||||    
T  16872900 tcttctctccaaaaccctttttct 16872877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21259545 - 21259390
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  21259545 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaa 21259446  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
     ||||||  |  ||||||| || |||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  21259445 aaagagagtagaaattaactaagtgattatgatgaattctaacccccttaccttag 21259390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 17502362 - 17502468
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  17502362 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcataataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaa 17502461  T
Q  101 caagaga 107  Q
     ||||||    
T  17502462 aaagaga 17502468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 4234056 - 4234162
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||||||  |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  4234056 tcaaattaacatactcaaacatatcactgcaacatgagcacaaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaa 4234155  T
Q  101 caagaga 107  Q
     ||||||    
T  4234156 aaagaga 4234162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 22907160 - 22907062
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  22907160 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaag 22907062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Original strand, 23218078 - 23218184
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||||||    
T  23218078 tcaaattaacatactcaaacatatcactaccacataagcacgaatttcaaaagttgggttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcatagaa 23218177  T
Q  101 caagaga 107  Q
     ||||||    
T  23218178 aaagaga 23218184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 22321500 - 22321437
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatg 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  22321500 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacctgagcacgaatttcaaagattgggttcatg 22321437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 5238404 - 5238502
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  5238404 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 5238502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24661194 - 24661096
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  24661194 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 24661096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 43685863 - 43685961
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  43685863 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 43685961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 43373424 - 43373322
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  43373424 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 43373325  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  43373324 gct 43373322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 124 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 7000551 - 7000465
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    |||||||||| || |||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||| |||||||||    
T  7000551 tgattatgatgaaaactaacccccttactttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagctcaccccaatt 7000465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 16674339 - 16674271
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 192  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  16674339 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactc-aactcttgcttcaattcagct 16674271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 24928748 - 24928648
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||    |||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  24928748 atgattatgataaagactaaccccattaccttagataaagattaatcccaacttagacttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 24928649  T
Q  221 g 221  Q
    |    
T  24928648 g 24928648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 271309 - 271183
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  271309 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 271211  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  271210 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 271183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 644611 - 644737
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  644611 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 644709  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  644710 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 644737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 830346 - 830472
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  830346 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 830444  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  830445 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 830472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15319108 - 15318982
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  15319108 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 15319010  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | || ||||||| || |||||||||||||    
T  15319009 t-tttccttcaacactcttgttcttctct 15318982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 15499477 - 15499351
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  15499477 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 15499379  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | || ||||||| || |||||||||||||    
T  15499378 t-tttccttcaacactcttgttcttctct 15499351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22088743 - 22088617
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||| |  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  22088743 atgattatgatgataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 22088645  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  22088644 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 22088617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 16193674 - 16193573
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||| ||    
T  16193674 atgattatgataaagactaa-ccccttaccttagataaagatgaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattctttaa 16193576  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  16193575 gct 16193573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 21494388 - 21494336
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  21494388 atgattatgaagaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 21494336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 22886654 - 22886706
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  22886654 atgattatgattaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaact 22886706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Original strand, 2545265 - 2545298
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2545265 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 2545298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3431208 - 3431175
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3431208 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 3431175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 6774206 - 6774137
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 192  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  6774206 atgattatgataatcactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagct 6774137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Original strand, 30121029 - 30121098
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 192  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||| | | ||| ||| |||||||||||||    
T  30121029 atgattatgataatcactaacccccttacctttgaagatgattatctctaacccttacttcaattcagct 30121098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16404932 - 16404900
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16404932 atgattatgatgaagactaacccccttacctta 16404900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 4 - 251
Target Start/End: Original strand, 130760 - 131006
Alignment:
Q  4 aattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa-ca 102  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  130760 aattaacgtatccaaacatatctctacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatca 130859  T
Q  103 agagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagctta 202  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |    
T  130860 agagaaaaagaattaatcaaatgattatgataaagactaacccccttacctttgaagatgattatgcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtca 130958  T
Q  203 ccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  130959 ccccaattgattcctcaagct-ttcccttcaacactcttgttcttctct 131006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 89410 - 89281
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 219  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| | || ||||||| || ||||   |||||||||||    
T  89410 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaattcttgattcttca 89311  T
Q  220 agctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    || | |  |||||  |||||||||||||||||    
T  89310 agttct--ccttctcaacccttgttcttctct 89281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 107740 - 107653
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| | || ||||||| || ||||||    
T  107740 atgatcatgatgaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttaactcctaagctcactccaatt 107653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 55782 - 55981
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55782 tcaaattaacatattcaaacatatatctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 55881  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |   ||||||||| |||| |||||||    
T  55882 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaatttaggcttcaatttagctcctaagct 55981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 52 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 108179 - 107979
Alignment:
Q  52 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaac-aagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccccctta 150  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108179 gattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaatgaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaaccccctta 108080  T
Q  151 ccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctc 250  Q
    |||||||||||||||||  | ||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  108079 ccttagatgaagattaattccaacttaggcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcacgctattctcttcaaaacccttgttcttctc 107980  T
Q  251 t 251  Q
    |    
T  107979 t 107979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 6597 - 6373
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  6597 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataagcacctattatcataatcaattatgcatagaa 6498  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  6497 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaggaataatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagct 6398  T
Q  201 taccccaa--ttgattcttcaagct 223  Q
     || ||||  |||||||||||||||    
T  6397 cactccaatcttgattcttcaagct 6373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1032 - 835
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1032 tcaaattaacatattaaaacaaacctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 933  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||    
T  932 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaag 835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 139; Significance: 8e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 80065 - 80219
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80065 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 80164  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80165 caagagaaaaagaattaactaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 80219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 17458 - 17261
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17458 tcaaattaacatattcaaacatatctctaccacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcaattattctcataatcaattatgcatagaa 17359  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||    
T  17358 caagagaaaaagaattacctaaatgattatgataaagactaacccgcttaccttagatggagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaag 17261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4501 - 4304
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4501 tcaaattaacatatttaaacatatctctacaacataagcactaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 4402  T
Q  101 -caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaa 197  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | | |||||| ||||||| |||||||| || |||| ||||    
T  4401 tgaagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagtctaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaacttttgcttcactttagctcctaa 4304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 82 - 5
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 78  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  82 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 5  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 134; Significance: 8e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 8e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 12572 - 12348
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12572 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcacaaatttcaaagattgggttcatgataataacttattcccataatcaattatgcatagaa 12473  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||    |||||||| |||| |||||||    
T  12472 caaaagaaaaagaattaactaaatgattatgataaaaactaacccccttaccttagataaagattcatcccaacttagacttcaatttagctcctaagct 12373  T
Q  201 taccccaa--ttgattcttcaagct 223  Q
     |  ||||  |||||||||||||||    
T  12372 caatccaatcttgattcttcaagct 12348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 6137 - 5983
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6137 tcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 6038  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6037 caagagaaaaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5923 - 5777
Alignment:
Q  9 acatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 108  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5923 acatattcaaacacatctctacaacagaagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaa 5824  T
Q  109 aaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  5823 aaagaattaactatatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 5777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 131; Significance: 5e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 162232 - 162078
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  162232 tcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 162133  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  162132 caagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 162078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 166318 - 166164
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  166318 tcaaattaacatattcaaacacatctctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 166219  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  166218 caagagaaaaagaattaactagatgattatgatgaaaactaacccccttacctta 166164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 193542 - 193327
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193542 tcaaattaacatattcaaacatatctct---------gcacgaatttcaatgattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 193452  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||   |||||| || |||| |||||||    
T  193451 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttaccttaaatgaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagct 193352  T
Q  201 taccccaa--ttgattcttcaagct 223  Q
     || ||||  || ||||||||||||    
T  193351 cactccaatcttaattcttcaagct 193327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 31334 - 31180
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31334 tcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 31235  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  31234 caagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttacctta 31180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 127; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 41510 - 41664
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41510 tcaaattaacatattcaaacacatgtctacaacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 41609  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  41610 caagagaaaatgaattaactaaatgattgtgataaaaactaacccccttacctta 41664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 37012 - 36914
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||||||| | | |||||||||||    
T  37012 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagcttacccaattggattcttcaag 36914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 154
Target Start/End: Original strand, 42568 - 42708
Alignment:
Q  14 ttcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaaga 113  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42568 ttcaaccatatctctaccacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaacaagagaaaaaga 42667  T
Q  114 attaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctt 154  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  42668 attaactaaatgattatgataaaaactaacccccttacctt 42708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 13824 - 13876
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  13824 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 13876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 119; Significance: 7e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 30295 - 30449
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30295 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataagcatgaatttcaaagatagggttcatgataatcacttattcccataatcaattatgcatagaa 30394  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  30395 caagagaaaaataattaactaaatgattatgatgaaaaataacccccttacctta 30449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 123 - 241
Target Start/End: Original strand, 338 - 456
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  338 atgattttgataataactaacccccttaccttagaagaagattaatccaaactctcgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 437  T
Q  223 tattcccttcaaaaccctt 241  Q
    | | | || ||||||||||    
T  438 tctcctctccaaaaccctt 456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 505 - 352
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  505 tcaaattaacatattcaaatatatctctacaacataagcacaaatttcaaatattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 406  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 155  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  405 caagag-aaaagaattaactagatgattatgataaagaataaccccgttacctta 352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 914 - 786
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  914 atgattatgataaagactaacccccttaccttagaagaagattaaccccaactcttgattcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 815  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  814 tattcccttcaaaatccttgttcttctct 786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Original strand, 15150 - 15236
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatca 87  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15150 tcaaattaacatattcaaacatatctctacgacataagcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattcccataatca 15236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 34107 - 33979
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  34107 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaatttagctcctaagcttacgccaattgattcctcaagc 34008  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34007 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 33979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 123 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 247398 - 247321
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  247398 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagct 247321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 126 - 251
Target Start/End: Original strand, 3271 - 3396
Alignment:
Q  126 attatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagctat 225  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3271 attatgataataattaacccccttaccttagaagaagattaaccgaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagctat 3370  T
Q  226 tcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  3371 tcccttcaaaacccttgttcttctct 3396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 101; Significance: 4e-50; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 153956 - 153828
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  153956 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaactcaaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 153857  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  153856 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 153828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Original strand, 48903 - 48936
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48903 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 48936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Original strand, 36399 - 36468
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 192  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||| || |  ||||| ||| ||| |||||||||||||||||    
T  36399 atgattatgataatcattaacccccttacctttgaagttgattatccctaacccttgcttcaattcagct 36468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 61154 - 61121
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  61154 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 61121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 169858 - 169789
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagct 192  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| || || || ||||| | | ||| |||||||||||||||||    
T  169858 atgattatgataatcactaacccccttacttttgaagatgattatcactaacccttgcttcaattcagct 169789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1463 - 1335
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  1463 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacctaaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccccaattgattcctcaagc 1364  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1363 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 1335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5161 - 5033
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||| |||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5161 atgattatgataataactaactcccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcttcaagc 5062  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5061 tattcccttaaaaacccttgttcttctct 5033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 1524 - 1397
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1524 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaacccttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 1425  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||| |||||||| |||||||||    
T  1424 tattctcttc-aaaccctttttcttctct 1397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 2700 - 2826
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2700 atgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 2798  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2799 tattcccttc-aaatccttgttcttctct 2826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 4029 - 4157
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4029 atgattatgataataactaaaccccttaccttagaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttaccccaattgattcctcaagc 4128  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4129 tattgccttcaaaacccttgtccttctct 4157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 7405 - 7278
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  7405 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagaagattaaccctaattcttgcttcaattcagctccta-gcttaccccaattgattcctcaagc 7307  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7306 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 7278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10697 - 10569
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||| ||||||    
T  10697 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaaccctaactcttgcttcaattcagctcctaatcttaccacaattgattcctcaagc 10598  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10597 tattctcttcaaaacccttgttcttctct 10569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 77; Significance: 8e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 121 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6024 - 5912
Alignment:
Q  121 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||||    
T  6024 aaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaactcttgcttcaattcagctcctaagcttactctaattgattcctcaa 5925  T
Q  221 gctattcccttca 233  Q
    ||||||| |||||    
T  5924 gctattctcttca 5912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 14008 - 13882
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  14008 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 13910  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13909 t-ttcccttcaaaactcttgttcttctct 13882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 21062 - 20936
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || || |||||| || ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21062 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagatgattaatcctaacccttgcttcaattcagctcct-agcttaccccaattgattcctcaagc 20964  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20963 t-ttcccttcaaaactcttgttcttctct 20936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0063 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0063
Description:

Target: scaffold0063; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 44168 - 44036
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcatagaa 100  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |    
T  44168 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattaggttcacaataatcacttattcaaataatcacttatgcatagca 44069  T
Q  101 caagagaaaaagaattaaccaaatgattatgat 133  Q
     |||||| ||  ||||||| || ||||||||||    
T  44068 aaagagagaagaaattaactaagtgattatgat 44036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Original strand, 6905 - 6979
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6905 tgattatgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 6979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 56; Significance: 3e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 64470 - 64395
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  64470 atgattgtgataataactaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 64395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 123 - 219
Target Start/End: Original strand, 12063 - 12160
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttca 219  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  12063 atgattatgatgaagactaacccccttatcttagataatgattaatccaaactttggcttcaatttagctcctaagcttaccccaatttgattcttca 12160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 26372 - 26286
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||   ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  26372 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaatcccatcttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaat 26286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 8125 - 8072
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaaccccc-ttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |||||||    
T  8125 atgattatgatgaagactaaccccccttaccttagataatgattaatccaaact 8072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 10288 - 10160
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||   |||||| || ||||  ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10288 atgattatgaagaagacaaacccccttaccttagatgatgattaaccccaacttaggcttcactttagctcataagcttaccccaattgattcctcaagc 10189  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | | | ||  |||||||||||||| ||||    
T  10188 tttcctctctaaaacccttgttctgctct 10160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 138 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 154365 - 154305
Alignment:
Q  138 actaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  154365 actaacccccttaccttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctcctaag 154305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 146906 - 147008
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  146906 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 147005  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  147006 gct 147008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 5846 - 5943
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  5846 atgattatggtaaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctta-cccaattgattcctcaag 5943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 22857 - 22955
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  22857 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 22955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 123 - 221
Target Start/End: Original strand, 27112 - 27210
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| |||||||| ||| | | |||||||||||    
T  27112 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctttcccaattggattcttcaag 27210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 120 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 57427 - 57305
Alignment:
Q  120 caaatgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttacccca-attgattcttc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| |||| |  ||||||| ||    
T  57427 caaatgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctactaagctcacccaatcttgattcctc 57328  T
Q  219 aagctattcccttcaaaaccctt 241  Q
    ||||| ||| || ||||||||||    
T  57327 aagctcttctctccaaaaccctt 57305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1295 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1295
Description:

Target: scaffold1295; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Original strand, 307 - 384
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 78  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  307 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcaagaatttcaaagattgggttcacaataatcacttattc 384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 1555 - 1478
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatctctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattc 78  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  1555 tcaaattaacatactcaaacatatcactacaacatgagcacgaatttcaaagattgggttcacaataatcatttattc 1478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 9183 - 9285
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  9183 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 9282  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  9283 gct 9285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 172210 - 172312
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  172210 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 172309  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  172310 gct 172312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 177913 - 178015
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  177913 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 178012  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  178013 gct 178015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 17750 - 17696
Alignment:
Q  197 agcttaccccaattgattcttcaagctattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17750 agcttaccccaattgattcctcaagctattctcttcaaaacccttgttcttctct 17696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 128 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 23693 - 23631
Alignment:
Q  128 tatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcag 190  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23693 tatgataataactaacccccttaacttagaagaagattaacccaaactcttgcttcaattcag 23631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 123 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1528 - 1450
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagctt 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    ||||||||| |||| ||||||||    
T  1528 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattagaccaaacctaggcttcaatttagctcctaagctt 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17241 - 17142
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||  || ||| ||||||||||||||||| || || | |||||||||||||| ||||||    
T  17241 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagaagattattattcctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcaccccaattgattcctcaagc 17143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 124 - 200
Target Start/End: Original strand, 25532 - 25608
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  25532 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaacccaaacttaggcttcaatttagctcctaagct 25608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 1430 - 1532
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  1430 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaatcacaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 1529  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  1530 gct 1532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3540 - 3438
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa--ttgattcttcaa 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||  ||||||||||||    
T  3540 atgattatgacaaagactaacccccttaccttagataaagattaatcccaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatcttgattcttcaa 3441  T
Q  221 gct 223  Q
    |||    
T  3440 gct 3438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12521
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa---ttgattcttca 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| || ||||   |||||| || |||| ||||||| || ||||   |||||||||||    
T  12418 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatagagattaatcctaacttaggcttcactttagctcctaagctcactccaatttttgattcttca 12517  T
Q  220 agct 223  Q
    ||||    
T  12518 agct 12521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 31616 - 31742
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  31616 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 31714  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  31715 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 31742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 251
Target Start/End: Original strand, 39410 - 39536
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaattgattcttcaagc 222  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| || |  ||||| | | ||| ||||||||||||||||| || || | |||| |||||||||  |||||    
T  39410 atgattatgataataactaacccccttacctttgaagttgattatctctaacccttgcttcaattcagctcct-aggtcacccaaattgattccccaagc 39508  T
Q  223 tattcccttcaaaacccttgttcttctct 251  Q
    | |||||||||| || |||||||||||||    
T  39509 t-ttcccttcaacactcttgttcttctct 39536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Original strand, 272330 - 272374
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  272330 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 272374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 128127 - 128083
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  128127 atgattatgataaagactaacccccttaccttagataaagattaa 128083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0160 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 124 - 198
Target Start/End: Original strand, 339 - 413
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||   ||||||||| |||| |||||    
T  339 tgattatgatgaagactaacccccttaccttagataaggattaatccaaacttaggcttcaatttagctcctaag 413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3895 - 3785
Alignment:
Q  1 tcaaattaacatattcaaacatatct----ctacaacataggcacgaatttcaaagattgggttcatgataatcacttattctcataatcaattatgcat 96  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |    |||||||||  ||||||||||||||  |||| ||||  ||||||||||||||  |||| || ||||||||    
T  3895 tcaaattaacatactcaaacatatatatcactacaacatgagcacgaatttcaaaagttggtttcacaataatcacttattcaaataagcacttatgcat 3796  T
Q  97 agaacaagaga 107  Q
    |||| ||||||    
T  3795 agaaaaagaga 3785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 200
Target Start/End: Original strand, 45338 - 45415
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | |||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  45338 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatggttaatccaaacttaggcttcaattaagctcctaagct 45415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 200
Target Start/End: Original strand, 54724 - 54801
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagct 200  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | |||| |||||||   ||||||||| |||| |||||||    
T  54724 atgattatgatgaagactaaccaccttaccttagataatggttaatccaaacttaagcttcaattaagctcctaagct 54801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 18026 - 18078
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  18026 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 18078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 34340 - 34288
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||    
T  34340 atgattatgatgaagactaacccccttaccttagataatgattaatccaaact 34288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 36869 - 36825
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36869 atgattatgataaagactaacccccttaccttaaataaagattaa 36825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 1251 - 1176
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaag 198  Q
    |||||| ||||||  |||||||||| |||||| || |||||||||||| ||  ||||||||||||||||| |||||    
T  1251 atgattgtgataataactaacccccctacctttgaagaagattaaccctaatccttgcttcaattcagctcctaag 1176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 123 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 123119 - 123032
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaatt 210  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| | |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || ||||||    
T  123119 atgattatggtgaagactaacccccttaccttaggtaaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaatt 123032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 51140 - 51054
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaat 209  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||| || ||||   ||||||||| |||| ||||||| || |||||    
T  51140 atgattatgataaagactaatctccttacctaagataaagattaatcccaacttaggcttcaatttagctcctaagctcactccaat 51054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 123 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 56045 - 55944
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaactcttgcttcaattcagctgctaagcttaccccaa-ttgattcttcaag 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||| | |||||| |||||||   |||| |||| | || ||||| | ||||||| |||||||||||||    
T  56045 atgattatgatgaagactaaccccctgaccgtagataatgattaatccaaacttaggctttaatttatctcctaagttcaccccaatttgattcttcaag 55946  T
Q  222 ct 223  Q
    ||    
T  55945 ct 55944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 5549 - 5601
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  5549 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaact 5601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Original strand, 41965 - 42017
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  41965 atgattatgatgaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaact 42017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 167
Target Start/End: Original strand, 42034 - 42078
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaa 167  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||    
T  42034 atgattatgataaagaccaacccccttaccttagataaatattaa 42078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5508 - 5475
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttag 156  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5508 atgattatgatgaagactaacccccttaccttag 5475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 124 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 12075 - 12039
Alignment:
Q  124 tgattatgataaagactaacccccttaccttagatga 160  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  12075 tgattatgataataactaacccccttaccttagatga 12039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 123 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 49784 - 49732
Alignment:
Q  123 atgattatgataaagactaacccccttaccttagatgaagattaacccaaact 175  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||    
T  49784 atgattatgaagaagactaacccccttaccttaggtaatgattaatccaaact 49732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University