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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11866_low_25 (Length: 247)

Name: NF11866_low_25
Description: NF11866
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11866_low_25
NF11866_low_25
[»] chr6 (17 HSPs)
chr6 (8-243)||(21846763-21846999)
chr6 (32-240)||(22813053-22813261)
chr6 (15-240)||(20005229-20005454)
chr6 (16-240)||(21841102-21841327)
chr6 (32-240)||(22412369-22412577)
chr6 (95-240)||(11136505-11136650)
chr6 (14-233)||(17382552-17382770)
chr6 (32-240)||(23008721-23008929)
chr6 (32-240)||(23779435-23779643)
chr6 (32-104)||(27123996-27124068)
chr6 (32-102)||(14638154-14638223)
chr6 (32-100)||(17823205-17823272)
chr6 (32-95)||(14722530-14722593)
chr6 (32-103)||(9517318-9517389)
chr6 (32-112)||(24478871-24478950)
chr6 (132-233)||(27123867-27123969)
chr6 (33-82)||(5625239-5625288)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (34-240)||(19007869-19008075)
chr5 (14-240)||(20563442-20563669)
chr5 (14-240)||(20549030-20549257)
chr5 (14-240)||(20859207-20859434)
chr5 (14-240)||(24659340-24659566)
chr5 (9-192)||(24140989-24141173)
chr5 (32-240)||(28665340-28665547)
chr5 (9-236)||(20314813-20315041)
chr5 (32-240)||(16522887-16523090)
chr5 (32-234)||(34129171-34129372)
chr5 (32-103)||(19051934-19052004)
chr5 (177-236)||(23388566-23388625)
chr5 (32-82)||(23338214-23338264)
chr5 (39-92)||(24243475-24243528)
[»] chr1 (20 HSPs)
chr1 (32-240)||(14781178-14781386)
chr1 (9-237)||(728012-728241)
chr1 (14-240)||(16916259-16916486)
chr1 (32-235)||(26612373-26612576)
chr1 (14-232)||(18826205-18826424)
chr1 (14-239)||(25403407-25403632)
chr1 (32-235)||(24054546-24054750)
chr1 (32-240)||(20147055-20147264)
chr1 (24-234)||(18831041-18831252)
chr1 (14-196)||(18735607-18735788)
chr1 (15-232)||(20106697-20106913)
chr1 (14-240)||(21666178-21666401)
chr1 (32-164)||(15159904-15160035)
chr1 (32-112)||(18528679-18528759)
chr1 (36-106)||(21334208-21334278)
chr1 (32-235)||(22623470-22623672)
chr1 (35-112)||(21985445-21985522)
chr1 (33-162)||(29243039-29243167)
chr1 (171-216)||(16069235-16069280)
chr1 (32-80)||(44795965-44796012)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (32-240)||(13288737-13288945)
chr7 (14-240)||(13278017-13278244)
chr7 (33-207)||(17190559-17190733)
chr7 (24-234)||(11803593-11803802)
chr7 (32-235)||(16058239-16058441)
chr7 (10-240)||(1861469-1861700)
chr7 (14-182)||(20582771-20582939)
chr7 (118-235)||(8877954-8878071)
chr7 (14-240)||(4449516-4449742)
chr7 (32-146)||(22066651-22066765)
chr7 (32-105)||(17077641-17077714)
chr7 (168-239)||(8318501-8318572)
chr7 (33-95)||(13759402-13759464)
chr7 (32-82)||(1847760-1847810)
chr7 (33-106)||(18366377-18366450)
chr7 (42-106)||(8053555-8053619)
chr7 (32-103)||(39272602-39272672)
chr7 (207-239)||(9977400-9977432)
chr7 (132-174)||(18366310-18366352)
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (32-240)||(17025669-17025877)
chr4 (32-236)||(25095219-25095422)
chr4 (32-162)||(11253141-11253272)
chr4 (14-103)||(13692177-13692267)
chr4 (32-71)||(17710286-17710325)
chr4 (32-105)||(17672582-17672653)
chr4 (53-95)||(17217464-17217506)
[»] chr3 (11 HSPs)
chr3 (33-236)||(19575553-19575756)
chr3 (9-240)||(8170403-8170637)
chr3 (32-240)||(19532432-19532640)
chr3 (14-240)||(8882443-8882670)
chr3 (14-238)||(16229346-16229570)
chr3 (14-183)||(4657584-4657754)
chr3 (16-223)||(19167957-19168168)
chr3 (54-240)||(20022900-20023086)
chr3 (52-240)||(20122307-20122494)
chr3 (203-240)||(18458165-18458202)
chr3 (211-240)||(19169132-19169161)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (14-240)||(17997070-17997297)
chr8 (32-240)||(18569427-18569635)
chr8 (14-240)||(23892524-23892751)
chr8 (14-240)||(26831681-26831908)
chr8 (32-233)||(24722955-24723156)
chr8 (11-240)||(19264589-19264820)
chr8 (14-240)||(26887349-26887575)
chr8 (56-240)||(17509795-17509978)
chr8 (100-238)||(26138781-26138919)
chr8 (32-100)||(17101438-17101506)
chr8 (32-112)||(18448025-18448108)
chr8 (32-95)||(25226665-25226728)
chr8 (39-95)||(24110176-24110232)
[»] scaffold0756 (1 HSPs)
scaffold0756 (15-232)||(4325-4543)
[»] chr2 (16 HSPs)
chr2 (32-240)||(25536429-25536637)
chr2 (14-236)||(26667857-26668080)
chr2 (14-240)||(22378845-22379071)
chr2 (32-243)||(25531075-25531286)
chr2 (14-240)||(25921132-25921358)
chr2 (9-238)||(17198413-17198642)
chr2 (54-236)||(18121581-18121763)
chr2 (16-227)||(29143465-29143676)
chr2 (32-197)||(25535841-25536006)
chr2 (14-197)||(25536116-25536300)
chr2 (14-241)||(24090249-24090476)
chr2 (8-95)||(17635279-17635365)
chr2 (34-103)||(30412197-30412266)
chr2 (32-86)||(17675142-17675196)
chr2 (35-77)||(27908642-27908684)
chr2 (33-105)||(12950485-12950554)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (14-197)||(76966-77150)
scaffold0034 (208-240)||(80779-80811)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (32-240)||(234723-234930)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (15-237)||(21826-22049)
[»] scaffold0671 (1 HSPs)
scaffold0671 (14-234)||(991-1212)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (177-236)||(3843-3902)
[»] scaffold1156 (1 HSPs)
scaffold1156 (33-82)||(128-177)
[»] scaffold0035 (1 HSPs)
scaffold0035 (32-103)||(70438-70509)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (32-103)||(102840-102910)
[»] scaffold0263 (1 HSPs)
scaffold0263 (42-102)||(16164-16224)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 17)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 8 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 21846999 - 21846763
Alignment:
Q  8 cacactctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggtta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846999 cacactctctctctatgctttcttagtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggtta 21846900  T
Q  107 tagctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccac 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846899 tagctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattcctagtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccac 21846800  T
Q  207 taggtacctacgtctagggtcaacaattcctatgcta 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21846799 taggtacctacgtctagggtcaacaattcctatgcta 21846763  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22813261 - 22813053
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  || || |||||||||||||  | ||||||| |||     
T  22813261 gtagttctacaaatgggcagccctaatctacgtctaccttaataagggtttcaagagaatggtcttactaagttatagctttaattcagacagctgggtg 22813162  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22813161 catgtttccctaattattaactagttaattcctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 22813062  T
Q  232 attcctatg 240  Q
     ||| ||||    
T  22813061 tttcttatg 22813053  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 15 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20005454 - 20005229
Alignment:
Q  15 tctctctatgctttcttgtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagcttta 114  Q
    |||||||| | || || ||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||    
T  20005454 tctctctacgattactagtatttctacaaatgggaaaccctaatctatgtctacctttctaagggtttcaagagaatggtcttattaggttatagcctta 20005355  T
Q  115 aaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacc 214  Q
    |  ||||||||||||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||    
T  20005354 agtcggacagctaggtgcttgtttctgtaattactaactagttaattccttgcttcggtaatgcaccccacgacccaatgggtatcatccattgggtacc 20005255  T
Q  215 tacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    |||||||||||||| |||||||||||    
T  20005254 tacgtctagggtcagcaattcctatg 20005229  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 16 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21841327 - 21841102
Alignment:
Q  16 ctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagcttta 114  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  21841327 ctctctacgctttcttagtagttatacaaacgggcagccctaatctacgtttagcttactaagggtttcaagagaatggttctattaggttatagcttta 21841228  T
Q  115 aaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacc 214  Q
    || |||||| ||| |  | | |||||  | ||| |||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21841227 aatcggacatctaagcgcctttttccagatttactaactagttaattcatagcttcggtaatgcaccacacgacccaatgggtatcatccactaggtacc 21841128  T
Q  215 tacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||| | || |||||||||||| ||||    
T  21841127 tacatataaggtcaacaattcttatg 21841102  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22412577 - 22412369
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||  ||||| ||| |||||||||     
T  22412577 gtagttctacaaatgggcagccctaatctatgccaaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagtcttaaatcggccagctaggtg 22412478  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||   |||| |||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  22412477 cttgtttccctaattactaacaagttaattcctaacttcgctaatgcaccacacgacccaatgggttctagccactgggtacctacgtctaaggtcaaca 22412378  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    |||| ||||    
T  22412377 attcttatg 22412369  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 95 - 240
Target Start/End: Original strand, 11136505 - 11136650
Alignment:
Q  95 tatattaggttatagctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatg 194  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||| ||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||   |||||||| |||||||  |||||||||    
T  11136505 tatattaggttatagctttaagtcggacatctaagtgcttgtttccctaattactaaccatttaattcctaacttcggtaaggcaccacccgacccaatg 11136604  T
Q  195 ggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11136605 ggtatcatccattggatacctacgtctagggtcaacaattcctatg 11136650  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 233
Target Start/End: Original strand, 17382552 - 17382770
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||| ||||||| | |||| |    
T  17382552 ctctctttacgctttcttagtagttctacaaacgggaaatcctaatctacgtctaccttacgaaggggttcaagagaattgttctattaggctgtagc-t 17382650  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    ||||  ||||||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||| |||||||  ||  ||||||  ||||||||||| |||    
T  17382651 taaataggacagctaagtacttgtttccttaattactaaccagttaattcttaggttcggtaaggcaccacccgattcaatggcaatcatccactaagta 17382750  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaat 233  Q
    ||||  |||||||||||||||    
T  17382751 ccta-ttctagggtcaacaat 17382770  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23008929 - 23008721
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |   | ||| ||||||  ||||| |  || |||| ||     
T  23008929 gtagttctacaaatgggttgccctaatgtacgtctaacttactaagagtttcaagagaatgatctaactagcttatagtcttaaatcatacggctaagta 23008830  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |   | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23008829 cttgtttccataattactaaccaattaattcctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatggattctagccaccaggtacctacgtctagggtcaaca 23008730  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    |||||||||    
T  23008729 attcctatg 23008721  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Original strand, 23779435 - 23779643
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||| |||   ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||| ||||| |   | ||| ||||||  ||||| |  || |||| ||     
T  23779435 gtagttctacaaatgggttgccctaatgtacgtctaacttactaagagtttcaagagaatgatctaactagcttatagtcttaaatcatacggctaagta 23779534  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| |   | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23779535 cttgtttccataattactaaccaattaattcctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatggattctagccaccaggtacctacgtctagggtcaaca 23779634  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    |||||||||    
T  23779635 attcctatg 23779643  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 27124068 - 27123996
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggt 104  Q
    |||||||| |||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  27124068 gtagttcttcaaacgagcaaccctattctacgtctgccttactaagggtttcaagagaatggttctattaggt 27123996  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 102
Target Start/End: Original strand, 14638154 - 14638223
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattag 102  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  14638154 gtagttttacaaacgggcaatcctaatctacgtctaccttactaagggttt-aagagaatggttctattag 14638223  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17823272 - 17823205
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatatt 100  Q
    ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  17823272 gtagttcaacaaacaggcagccctaatctacgtctaccttactaagggttt-aagagaatggttatatt 17823205  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Original strand, 14722530 - 14722593
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggtt 95  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  14722530 gtagttctacaaaagggcagccctaatctaggtctaccttactaagagtttcaagagaatggtt 14722593  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Original strand, 9517318 - 9517389
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattagg 103  Q
    ||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||    
T  9517318 gtagttctacaaacgggcagctataatctacgtcaaccttaccaagggttgcaagagaaaggttctattagg 9517389  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Original strand, 24478871 - 24478950
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||| ||||||||||| ||| | || ||||||| ||||||||    
T  24478871 gtagctctacaaacgggcagccctaatcaatgtcta-cttacttagggtttcaagagaacgattctattaggctatagctt 24478950  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 27123969 - 27123867
Alignment:
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccaca-agacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaac 230  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||| | |||||||| | | |||  || |  ||| | | | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  27123969 cttgtttccctaattattaataagttaattcctaggttcggtaaggaaacactcagtcttaatagtttttatccactaagtacctacgtctagggtcaac 27123870  T
Q  231 aat 233  Q
    |||    
T  27123869 aat 27123867  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 5625239 - 5625288
Alignment:
Q  33 tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggttt 82  Q
    |||||||||||| ||||| | |||||||||||| || |||||||||||||    
T  5625239 tagttctacaaatgggcagcgctaatctacgtcgacattactaagggttt 5625288  T

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Target: chr5 (Bit Score: 143; Significance: 3e-75; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 19008075 - 19007869
Alignment:
Q  34 agttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggttct 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||  ||||  ||||||||||||| ||    
T  19008075 agttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagtcttaagtcggacagctaggtgct 19007976  T
Q  134 tgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaat 233  Q
    |  ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19007975 ttcttccctaattactaaccagttaattcctagcttcggtaatgcaccacatgacccaatgggtatcatccactgggtacctacgtctagggtcaacaat 19007876  T
Q  234 tcctatg 240  Q
    |||||||    
T  19007875 tcctatg 19007869  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20563669 - 20563442
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||  || ||||||||||  |    
T  20563669 ctctctctaggctttcctagtagttctaccaacgggcatccctaatctacgtctaccttactatgggtttcaagagaatggtcttactaggttatagtct 20563570  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  ||||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||    
T  20563569 taagtcggacagctaggtgcttgttcccgtaattactaaccagttaattcctagcttcggtattgcactacaagacccaataggtatcatccattgggta 20563470  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20563469 cctacgtctagggtcaagaattcctatg 20563442  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20549257 - 20549030
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||  || ||||||||||| |    
T  20549257 ctctctctacgcttacttagtagttctacaaacggacaaccctaatctacgtctaccttactaaaggtttcaaaagaatggtcttactaggttatagcct 20549158  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  |  |||||||| | |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||| | ||||    
T  20549157 taattcatacagctagatgcttgtttccctaattactaaccaattaattcctagcttcgataatgcaccacacgacctaatgggtatcatccattgggta 20549058  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20549057 cctacgtctagggtcaataattcctatg 20549030  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 20859207 - 20859434
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||  || |||||||||||||    
T  20859207 ctctctctaagcttacttagtagttctacaaacgggcagccctaatctacgtctaccttactaaaggtttcaagataatggtcttactaggttatagctt 20859306  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| |||||| || | ||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||    
T  20859307 taattcggacaactaggtgcttgtttccctaattaataaccacttaatttctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatgggttctagccactaggta 20859406  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  20859407 cctagatctagggtcaacaattcttatg 20859434  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 24659566 - 24659340
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttcttg-tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  24659566 ctctctctacgctttcttaatagttctacaaacgggcatccctaatctacgtctaccttaccaagggtttcaagagaatggttctattaggttatagc-t 24659468  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||| | ||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| | |||||  |||  | |||| |||||| | |  |||    
T  24659467 taaatcagacagctaggtgcttggttccctaattactaaccagttaattcctaggttcggtaaggtaccacccgacttagtgggcatcatcaaatgagta 24659368  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||    
T  24659367 cctacgtctagaatcaacaattcctatg 24659340  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 9 - 192
Target Start/End: Original strand, 24140989 - 24141173
Alignment:
Q  9 acactctctctctatgctttcttg-tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttat 107  Q
    |||| ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| | |    
T  24140989 acacactctctctacgctttcttactagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagagtttcaagagaatggttctattaggatgt 24141088  T
Q  108 agctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaa 192  Q
    |||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||||    
T  24141089 agctctaagtcggacagctaggtgcttgtttcgctaattactaaccagttaattcttgggttcggtaatgcaacacacgacccaa 24141173  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Original strand, 28665340 - 28665547
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||  |||||| ||||||     
T  28665340 gtagttctacaaacgg-caaccctgatctgcatctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagctttaagtcggacaactaggtg 28665438  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| |  |||| ||||||   | ||| | |||||||||||||||||||||||    
T  28665439 cttgtttccctaattactaaccagttaattcctagcttcggtaatgcaccatactaccctatgggttctagccattgggtacctacgtctagggtcaaca 28665538  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    |||| ||||    
T  28665539 attcttatg 28665547  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 9 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 20315041 - 20314813
Alignment:
Q  9 acactctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttat 107  Q
    |||| |||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  20315041 acacactctctttatgcttacttagtagttctacaagcgaaaaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggttctactaggttat 20314942  T
Q  108 agctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatc-atccac 206  Q
    ||||||||  | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||||  ||| ||||||| ||| |||||     
T  20314941 agctttaactcagacaactaggtgcttgtttccctaattactaaccagttaattcctagtttccgtaaggcaccacctgactcaatggg-atctatccat 20314843  T
Q  207 taggtacctacgtctagggtcaacaattcc 236  Q
    || ||||||||  |||| ||||||||||||    
T  20314842 taagtacctacacctagagtcaacaattcc 20314813  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16523090 - 16522887
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||||||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||  |||||| |||||||    
T  16523090 gtagttctacaaacaggcagacctaatctatgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagctttaagtcggacaactaggtt 16522991  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||| |||  || |||||||||||||||| | |||||| ||||||     || |||||||||   | ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  16522990 cttgtttcactatatactaaccagttaattcctagcttcggtgatgcac-----gaaccaatgggttctagccactgggtacctacgtctaaggtcaaca 16522896  T
Q  232 attcctatg 240  Q
     ||||||||    
T  16522895 tttcctatg 16522887  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 32 - 234
Target Start/End: Original strand, 34129171 - 34129372
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| | | |||   ||||||||||||      
T  34129171 gtagttctacaaacggaaaaccctaatctacgtctacctaactaagggtttcaagagaatgattttattaggttacaac-ttatttcggacagctaggca 34129269  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| ||||| |  ||| ||||||| |||||||||    |||||||| ||| ||||||||    
T  34129270 cttgtttccctaattactaaccagttaatccctagcttcggtaaggcaccgcccgactcaatgggcatcatccaccgaatacctacgactatggtcaaca 34129369  T
Q  232 att 234  Q
    |||    
T  34129370 att 34129372  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Original strand, 19051934 - 19052004
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattagg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  19051934 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggttt-aagataatggttctattagg 19052004  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 23388625 - 23388566
Alignment:
Q  177 gcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcc 236  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23388625 gcaccacctgacccaatgggcatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcc 23388566  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Original strand, 23338214 - 23338264
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggttt 82  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  23338214 gtagttctacaaacgggtagccctaatcttcgtctaccttaccaagggttt 23338264  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 24243528 - 24243475
Alignment:
Q  39 tacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatg 92  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||    
T  24243528 tacaaacgagcagccctaatctacgtctaccttactaagggcttcgagagaatg 24243475  T

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Target: chr1 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 20)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 14781386 - 14781178
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||  |||||||||||||     
T  14781386 gtagttcttcaaaagggcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttataactttaagtcggacagctaggtg 14781287  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14781286 cttgtttccctaattactaaccagttaattcctagctttggtaacgcaccacacgacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 14781187  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    ||| |||||    
T  14781186 atttctatg 14781178  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 122; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 9 - 237
Target Start/End: Original strand, 728012 - 728241
Alignment:
Q  9 acactctctctctatgctttcttg-tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttat 107  Q
    |||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||||    
T  728012 acacactctctctacgcttacttaatagttctacaaacaggcaaccctaacctacgtctaccttactgagggtttcaaaagaatggttctatcaggttat 728111  T
Q  108 agctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccact 207  Q
    ||||||||  |||| | |||||| |||||||| ||||||| |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |    
T  728112 agctttaagtcggataactaggtgcttgtttctctaattactaaccagttacttcctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatgggtatcatccatt 728211  T
Q  208 aggtacctacgtctagggtcaacaattcct 237  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  728212 gggtacctacgtctagggacaacaattcct 728241  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 16916486 - 16916259
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  16916486 ctctctctaagcttacttagtagttctacaaacgggcaaccctaatctatgtctatcttactaatggtttcaagagaatggtcttactaggttatagctt 16916387  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||   || |||||||||||||| || |||||||||   | ||||||||||    
T  16916386 taagtcggacagctaggtgcttgtttccctaattactaaacagttaattcctaactttggtaatgcaccacacgatccaatgggttctagccactaggta 16916287  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16916286 cctacgtctagggtcaataattcctatg 16916259  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 26612576 - 26612373
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||  |||||| ||||||     
T  26612576 gtagttctacaaacgagcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagctttaagtcggacaactaggtg 26612477  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||   || |||||||||||||| |||||||| |||   | ||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  26612476 cttgtttccctaattactaaccagttaattcctaactttggtaatgcaccacaggacccaattggttctagccacttggtacctacgtctagggttaaca 26612377  T
Q  232 attc 235  Q
    ||||    
T  26612376 attc 26612373  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 232
Target Start/End: Original strand, 18826205 - 18826424
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||| |||| |||||||| ||| || ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||    
T  18826205 ctctttctacgctttcttagtatttatacaaacaggcagccctaatctaagtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttattaggttatagctt 18826304  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  ||||||||||||| |||| |||| |||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||||  |||||||||||  | | ||||||||||    
T  18826305 taagtcggacagctaggtgcttgcttccttaattactaacaagttaattcctagcttcggtaaggcaccacctgacccaatgggctttagccactaggta 18826404  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaa 232  Q
    ||||||||||||| ||||||    
T  18826405 cctacgtctagggacaacaa 18826424  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 14 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 25403632 - 25403407
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  25403632 ctctctctatgcttttttagtagttctacaaacgggcaaccctaatctatgtctaccttactacgggtttcaagataatggttctattaggttatagctt 25403533  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  ||| || |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||||| ||     ||| ||||    
T  25403532 taagtcgggcaactaggtgcttgtttccctaattactaatctgttaattcctaggttcggtaaggcaccacccgacccaatggg-atttaaaactgggta 25403434  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctat 239  Q
    |||| | ||||||||||||||||||||    
T  25403433 cctaggcctagggtcaacaattcctat 25403407  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 24054546 - 24054750
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaa-tggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggt 130  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  24054546 gtagttctacaaacgggcagccctaatctacgtctaccttactaaggatttcaagataaatggtcttactaggttatagctttaagtcggacagctaggt 24054645  T
Q  131 tcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaac 230  Q
     |||||||||||||||| ||||||||| ||| || | ||||||||||||||||| |||||||| |||   | ||||| ||||||||| |||| |||||||    
T  24054646 gcttgtttccctaattactaaccagttcatttctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatcggttctagccacttggtacctacatctaaggtcaac 24054745  T
Q  231 aattc 235  Q
    |||||    
T  24054746 aattc 24054750  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Original strand, 20147055 - 20147264
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||  |  ||| ||||||     
T  20147055 gtagttctacaaacgggcagccctaatctacatctaacttactacgggtttcaagagaatggttctattaggttataactttaagtcatacatctaggta 20147154  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtc-aac 230  Q
    ||| |||||||||||| | |||  ||| ||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| | |||||||||| |||||||| |||    
T  20147155 cttctttccctaattactcaccgattacttcctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatgagtatcatccattgggtacctacgcctagggtctaac 20147254  T
Q  231 aattcctatg 240  Q
    ||||||||||    
T  20147255 aattcctatg 20147264  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 18831041 - 18831252
Alignment:
Q  24 gctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggac 122  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |  | ||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||   ||||    
T  18831041 gctttcttagtagttctacaaacgggaagtcgtaatctacgtctaacttactaagggttccaagagaatggtgttattaggttatagctttaagttggac 18831140  T
Q  123 agctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtcta 222  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || ||||| ||||| |  ||||||||||||   | ||||| |||  |||||||||    
T  18831141 agctaggtgcttgtttccctaattactaaccagttaattcctagctttggtaaggcaccgcctgacccaatgggttctagccactgggtgtctacgtcta 18831240  T
Q  223 gggtcaacaatt 234  Q
    ||||||||||||    
T  18831241 gggtcaacaatt 18831252  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 18735788 - 18735607
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  18735788 ctctctctacgctttcttagtagttttacaaacgaa-agccctaatctacgtctacctgactaagggtttcaagagaatggttatattaggttatagc-t 18735691  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatggg 196  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||||   ||||||||||    
T  18735690 taaatcggaccgctaggtgcttgtttccctaattactaactagttaattcctaggttcggtaaggcaccacccaacccaatggg 18735607  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Original strand, 20106697 - 20106913
Alignment:
Q  15 tctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagcttt 113  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||| || ||||||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||| |||||||    
T  20106697 tctctctaagcttacttagtagttctacaaacggtcaatcttaatttatgtctaccttactaagggtttcaagaaaatggtcttattaggttgtagcttt 20106796  T
Q  114 aaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtac 213  Q
    ||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||||||  |||||||||||   | ||||| |||||    
T  20106797 aagtcggatagctaggtgcttgtttccctaattactaaccagttaattcctagcttcgctaatgcaccaca--acccaatgggttctagccactgggtac 20106894  T
Q  214 ctacgtctagggtcaacaa 232  Q
    |||| |||||  |||||||    
T  20106895 ctacatctagattcaacaa 20106913  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 21666401 - 21666178
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||| | |||    
T  21666401 ctctctctacgctttcttagtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggttctataaggttacaactt 21666302  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
      |      ||||||||   || |||||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| |||||||  ||| ||||  || ||| | |||| |||    
T  21666301 --atttcctcagctagg-cattttttccctaattactaactagttaattcctaggttcggtaaggcaccacccgactcaat-agtttcaactactaagta 21666206  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21666205 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 21666178  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 15160035 - 15159904
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | |||   |   || ||||||     
T  15160035 gtagttctacaaacggacaaccttaatctacgtctatcttactaagggtttcaagagaatggttatattaggttacaac-ttatttccttcaactaggta 15159937  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattcct 164  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15159936 cttgtttccctaattactaaccagttaattcct 15159904  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18528759 - 18528679
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||    
T  18528759 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccatactaagggtttcaagagaatggttatattgggttacagctt 18528679  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 36 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21334278 - 21334208
Alignment:
Q  36 ttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggtta 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21334278 ttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttcccaagggtttcaagagaatggttatattaggtta 21334208  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Original strand, 22623470 - 22623672
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| |||||||  | |||| || || | ||||| |||||| ||| ||     
T  22623470 gtagttctacaaacagacagccctaatctatgtctaccttacaaagggtttaaagagaatggtcttgttagattttaac-ttaaatcggacatctaagtg 22623568  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatc-atccactaggtacctacgtctagggtcaac 230  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || ||||| |||||||  |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||  ||| |||||||    
T  22623569 cttgtttccctaattactaaccaattaattcctaggttgggtaaggcaccacccgacttaatggg-atctatccactaagtacctacacctaaggtcaac 22623667  T
Q  231 aattc 235  Q
    |||||    
T  22623668 aattc 22623672  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 35 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 21985522 - 21985445
Alignment:
Q  35 gttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  21985522 gttctacaaacgagcagccctaatctacttctaccttactaagggtttcaagagaatggttctattaggttacagctt 21985445  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 29243039 - 29243167
Alignment:
Q  33 tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggttc 132  Q
    |||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||| | | |||   ||||||||||||  |    
T  29243039 tagttctagaaacgagcagtcctaatctacatctaccttactaagggttttaagagaatggttctattaggttacaac-ttatttcggacagctaggcac 29243137  T
Q  133 ttgtttccctaattattaaccagttaattc 162  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29243138 ttgtttccctaattactaacaagttaattc 29243167  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 171 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 16069280 - 16069235
Alignment:
Q  171 ggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtaccta 216  Q
    ||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16069280 ggtaaggcaccacttgacccaatgggcatcatccactaggtaccta 16069235  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 80
Target Start/End: Original strand, 44795965 - 44796012
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggt 80  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||    
T  44795965 gtagttctacaaacgggcaatcct-atcaacgtctaccttaccaagggt 44796012  T

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Target: chr7 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 13288945 - 13288737
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||  |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  13288945 gtagttctacaaacgggcaaccttaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttaccaggttatagctttaagtcggacagctaggtg 13288846  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13288845 cttgtttccctaattactaacgagttaattcctagcttcggtaatgcaccagacgacccaatgggttctagccactgggtacctacgtctagggtcaaca 13288746  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    |||| ||||    
T  13288745 attcatatg 13288737  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 13278017 - 13278244
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  ||||||| |||| |||    
T  13278017 ctctctctacgcttacttagtagttctacaaacgggcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaacagaatggtcttattaggatatatctt 13278116  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  |||||| |||||| | ||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||  |||||| | | |||||||||| ||||    
T  13278117 taagtcggacaactaggtgcctgttttcctaattactaaccagttaattcctagcttcagtaaggcaccacactacccaacgtgcatcatccactgggta 13278216  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||    
T  13278217 actacgtctagggtcaacaatttctatg 13278244  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 33 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17190733 - 17190559
Alignment:
Q  33 tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggttc 132  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||   ||||||  ||||   ||||||||||| |    
T  17190733 tagttctagaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaaactatagccataaataagacagctaggtgc 17190634  T
Q  133 ttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccact 207  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| | ||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17190633 ttgtttccctaattactaacaagttaattcctagcttcagtaatacaccacacgacccaatgggtatcatccact 17190559  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 234
Target Start/End: Original strand, 11803593 - 11803802
Alignment:
Q  24 gctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggac 122  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||    
T  11803593 gctttcttagtagttctacaaacggacaaccctaatctacgccttccttactaaaggtttcaagagaatggttctattagattatagc-ttaaatcggac 11803691  T
Q  123 agctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtcta 222  Q
    ||||| || ||||||||||||| || |||||| ||||||||| | ||| ||||   |||||  ||| ||||||| ||||||||||| |||||||  ||||    
T  11803692 agctaagtgcttgtttccctaaatactaaccaattaattcctaggttctgtaagaaaccacccgactcaatgggcatcatccactaagtaccta-ttcta 11803790  T
Q  223 gggtcaacaatt 234  Q
    ||||||||||||    
T  11803791 gggtcaacaatt 11803802  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 32 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 16058441 - 16058239
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||  || |||||||||   ||||  |||||| ||||||     
T  16058441 gtagttctacaaacgggcatccctaatctacttctaccttactaagagtttcaagagaatggtcttactaggttatattcttaagtcggacaactaggtg 16058342  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||| | || ||||||||||| | |||| |||||||||| | ||||||||||||   | ||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  16058341 cttgtttccctaattactgactagttaattcctagcttcgataatgcaccagacgacccaatgggttctagccact-ggtacctacgtctagagtcaaca 16058243  T
Q  232 attc 235  Q
    ||||    
T  16058242 attc 16058239  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 10 - 240
Target Start/End: Original strand, 1861469 - 1861700
Alignment:
Q  10 cactctctctctatgctttcttg-tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttata 108  Q
    |||||||| |||| ||||||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  | | ||||||||    
T  1861469 cactctctttctacgctttcttactagttctacaaatgggcagccctaatctacgtctaccttactaagagtttcaagagaatggtcttctaaggttata 1861568  T
Q  109 gctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccacta 208  Q
    |||||||  |||||| |||||| |||| ||| ||||||| |||| |||||| |||| | |||| ||| |||||||  ||||||||||||   |  || |     
T  1861569 gctttaagtcggacaactaggtgcttgattctctaattactaactagttaaatcctagcttcgataaggcaccacctgacccaatgggttctagtcattg 1861668  T
Q  209 ggtacctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  1861669 ggtacctacatctagggtaaacaattcctatg 1861700  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 182
Target Start/End: Original strand, 20582771 - 20582939
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||   |    
T  20582771 ctctctctacactttcttagtagttctacaaacaggtaaccctaatctacgtcttccttactaagggtttcaaaagaatggttctattaggttata-tat 20582869  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcacca 182  Q
    |||| | ||||||||||   |||||||||| |||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||    
T  20582870 taaatcagacagctaggcatttgtttcccttattactaaccagttaattcctaggttcggtaaggcacca 20582939  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 118 - 235
Target Start/End: Original strand, 8877954 - 8878071
Alignment:
Q  118 cggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctac 217  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || ||||| |||||||  ||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8877954 cggacagctaggcacttgtttcactaattactaaccagttaattcctagctttggtaaggcaccacccgactcaatgggcatcatccactaagtacctac 8878053  T
Q  218 gtctagggtcaacaattc 235  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8878054 gtctagggtcaacaattc 8878071  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 4449516 - 4449742
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||  | ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||  || || ||||||||||    
T  4449516 ctctctctacgcttacttagtagttctacaaacggagagccctactctacatctaccttactaatggtttcaagagaatggtcttactaagttatagctt 4449615  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
     ||  | | || |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||| || | |||||||| |||||||   |||||||||||   |  |||||||||    
T  4449616 -aagtcaggcatctaggtgcttttttccctaattactaatcagttaatttctagcttcggtaaggcaccacccaacccaatgggttctagtcactaggta 4449714  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  4449715 cctacatttagggtcaaaaattcctatg 4449742  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 22066765 - 22066651
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||| |||  | |||| ||||||     
T  22066765 gtagttctacaaacgggcagccttaatctacgtctaccttactaagggtttcaaaagaatggtcttactaggttatagctctaagtcagacaactaggtg 22066666  T
Q  132 cttgtttccctaatt 146  Q
    ||| |||||||||||    
T  22066665 cttatttccctaatt 22066651  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 32 - 105
Target Start/End: Original strand, 17077641 - 17077714
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggtt 105  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  17077641 gtagttctacaaacgggcatccctaatctacgtctaccttagtaagggtttcaagagaatggttctattaggtt 17077714  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 168 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 8318572 - 8318501
Alignment:
Q  168 ttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcctat 239  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8318572 ttcggtaatgcaccacacgacccaatgggcatcattcactaggtacctacatctatggtcaacaattcctat 8318501  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 13759464 - 13759402
Alignment:
Q  33 tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggtt 95  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  13759464 tagttctacaaatgggcagccctaatctacgtctaccttactaagagtttcaagagaatggtt 13759402  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1847810 - 1847760
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggttt 82  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  1847810 gtagttctacaaacgggcagccctaatctacgtttaccttactaagggttt 1847760  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 33 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18366450 - 18366377
Alignment:
Q  33 tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggtta 106  Q
    ||||||||||||||| || | ||| |||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18366450 tagttctacaaacggacagctctattctacgtccaccttactaagggtttcaagagtatggttctattaggtta 18366377  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 42 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8053619 - 8053555
Alignment:
Q  42 aaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggtta 106  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  8053619 aaacggacaaccctaatatacgtctaccttagtaagggtttcaagagaatggttctattaagtta 8053555  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 39272672 - 39272602
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattagg 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||    
T  39272672 gtagttctacaaacgagcaaccctaatctccatctaccttactaagggttt-aagataatggttctattagg 39272602  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 207 - 239
Target Start/End: Original strand, 9977400 - 9977432
Alignment:
Q  207 taggtacctacgtctagggtcaacaattcctat 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9977400 taggtacctacgtctagggtcaacaattcctat 9977432  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18366352 - 18366310
Alignment:
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggta 174  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  18366352 cttgtttccctaattactaaccagttaattcctaggttcggta 18366310  T

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Target: chr4 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 17025877 - 17025669
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||  |||||| ||||||     
T  17025877 gtagttcttcaaacgtgcaaccctaatctacatctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagctttaagtcggacatctaggtg 17025778  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||| || | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17025777 ctcttttccctaattactaaccagttaatttctagcttaggtaattcaccacacgacccaatgggtatcatccactgggtacctacgtctagggtcaaca 17025678  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    |||||||||    
T  17025677 attcctatg 17025669  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 32 - 236
Target Start/End: Original strand, 25095219 - 25095422
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||  || ||||||||||||||||  |||||| ||||||     
T  25095219 gtagttctacaaacgggaagctctaatgtacgtctaccttactaagagtttcaagagaa-ggtcttactaggttatagctttaagtcggacaactaggtg 25095317  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  25095318 cttgtttccctaattattgaccaattaattcctagattcggtaatgcaccacacgacccaatgggttctagccattgggtacctaagtctagggtcaaca 25095417  T
Q  232 attcc 236  Q
    |||||    
T  25095418 attcc 25095422  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 32 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 11253272 - 11253141
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaaggg-tttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggt 130  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||  || ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11253272 gtagttctacaaacgggaatccctaatctatgtctaccttactaaggggtttcaagagaatggtcttactaggttatagctttaagtcggacagctaggt 11253173  T
Q  131 tcttgtttccctaattattaaccagttaattc 162  Q
     ||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11253172 gcttgtttccctaattacgaaccagttaattc 11253141  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13692267 - 13692177
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattagg 103  Q
    ||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13692267 ctctctccacgctttcttagtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatgattatattagg 13692177  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 71
Target Start/End: Original strand, 17710286 - 17710325
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctacctt 71  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17710286 gtagttctagaaacgggcaaccctaatctacgtctacctt 17710325  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 32 - 105
Target Start/End: Original strand, 17672582 - 17672653
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggtt 105  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  |||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  17672582 gtagttctacaaacgggcagccct-atcagcgtctaccttaccaagggttt-atgagaatggttatattaggtt 17672653  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 53 - 95
Target Start/End: Original strand, 17217464 - 17217506
Alignment:
Q  53 cctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggtt 95  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17217464 cctaatcaacgtctaccttactaagagtttcaagagaatggtt 17217506  T

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Target: chr3 (Bit Score: 124; Significance: 7e-64; HSPs: 11)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 33 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19575756 - 19575553
Alignment:
Q  33 tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggttc 132  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||  |||||| ||||||      
T  19575756 tagttctacaaacgggcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatgatcttattaggttatagccttaagtcggacaactaggtgt 19575657  T
Q  133 ttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaa 232  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||||||||| | || |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19575656 ttgtttcccaaattactaactagttaattcctagcttaggtaatccaccacacgacccaatgggtatcatccactgggtacctacgtctagggtcaacaa 19575557  T
Q  233 ttcc 236  Q
    ||||    
T  19575556 ttcc 19575553  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 9 - 240
Target Start/End: Original strand, 8170403 - 8170637
Alignment:
Q  9 acactctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttat 107  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |  || ||||||||    
T  8170403 acacactctctctacgcttacttagtagttctacaaatgggcaaccataatctacgtataccttactacgggtttcaagagaatgatcttactaggttat 8170502  T
Q  108 agctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgc--accacaagacccaatgggtatcatcca 205  Q
    ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||    
T  8170503 agctttaagtcggacagctaggtgcttgtttccctaattactaaccagttaattcctagattcggtcatgcgtaccacacgacccaatgggtatcgtcca 8170602  T
Q  206 ctaggtacctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    || ||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  8170603 ctgggtacctacgtctagggtcaaaaaatcctatg 8170637  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Original strand, 19532432 - 19532640
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||  || ||||||||| ||||||  | |||||||||||     
T  19532432 gtagttctacaaacggacagtcctaatctacgtctaccttaccaagggtttcaagagaatggtcttactaggttataactttaagtcagacagctaggtg 19532531  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||  | ||||||||||||||||| |||| ||| |||   | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19532532 cttgtttacctaattactaaccagttaattccaagcttcggtaatgcaccacacgacctaattggttctagccactgggtacctacgtctagggtcaaca 19532631  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    ||| |||||    
T  19532632 atttctatg 19532640  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 8882670 - 8882443
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttcttg-tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||| |      
T  8882670 ctctctctatgcttacctggtagttctacaagcgagcaaccgtaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggttttactaggttataacca 8882571  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  | ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||| ||||| | || |   | ||||| ||||    
T  8882570 taagtcagacagctaggtgctcatttccctaattactaaccagttaattcttagcttcggtaatgcaccacacgacccgaaggattctagccactgggta 8882471  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8882470 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 8882443  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16229570 - 16229346
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| |||    
T  16229570 ctctctctaagcttacttagtagttctacaaatgggcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttataactt 16229471  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||| ||   | ||||||||||    
T  16229470 taagtcggacagctaggtgtttgtttccctagttactaactagttaattcctagcttcggtaatgcaatacacgacccaatgagttctagccactaggta 16229371  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattccta 238  Q
    | ||||||| ||||| ||||||||||    
T  16229370 catacgtctcgggtc-acaattccta 16229346  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 14 - 183
Target Start/End: Original strand, 4657584 - 4657754
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||     
T  4657584 ctctctctacactttcttagtagttctacaaacgggcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaatagaatggttatattaggttgtagctc 4657683  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccac 183  Q
    |||  |||||||||||||  ||||||||||||||| |||| ||||||||| | | ||| |||| |||||||    
T  4657684 taagtcggacagctaggtgattgtttccctaattactaacaagttaattcataggttcagtaaggcaccac 4657754  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 223
Target Start/End: Original strand, 19167957 - 19168168
Alignment:
Q  16 ctctctatgctttcttg-tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagcttta 114  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| || ||  |||||||||||    
T  19167957 ctctctatgcttacttaatagttctacaaacgggcagccctaatctacgtctaccatactaagggtttcaagagaacggttttactatattatagcttta 19168056  T
Q  115 aaacggacagc--taggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaag-acccaatgggtatcatccactaggt 211  Q
    |  ||||||||  |||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||   ||||||||||||| ||| | ||||||| || |||||||||| ||     
T  19168057 agtcggacagctataggtgtttgtttccctaattactaaccagttaattcctaacttcggtaatgcactacacgcacccaataggcatcatccactggga 19168156  T
Q  212 acctacgtctag 223  Q
    ||||||||||||    
T  19168157 acctacgtctag 19168168  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 54 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20023086 - 20022900
Alignment:
Q  54 ctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaacc 153  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||||| ||| |||  || ||||||||||  ||||  |||||| || ||| |||||||| ||||||| |||||    
T  20023086 ctaatctacgtctaccttacttggggtttcaagagaacggtcttactaggttatagtattaagtcggacaactgggtgcttgtttcgctaattactaacc 20022987  T
Q  154 agttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||| ||||   | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20022986 agttaattcctaacttcggtaatgcaccacacgacccaacgggttctagccactgggtacctacgtctagggtcaacaattcctatg 20022900  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 52 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 20122494 - 20122307
Alignment:
Q  52 ccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaa 151  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||| || ||||| |||  | ||||    |||||||||| || |   |||||||||||| |||    
T  20122494 ccctaatctacgtccaccttactaagggtttcaggagaatgattctattatgttgcaactttttt-cggacagctaagtacccttttccctaattactaa 20122396  T
Q  152 ccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||| ||||||||| | ||| |||| |||||||  |||| | ||||| | | |||||  || |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20122395 ccaattaattcctaggttccgtaaggcaccacctgaccaagtgggttttagccactgagttcctacgtctatggtcaacaattcctatg 20122307  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 203 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 18458202 - 18458165
Alignment:
Q  203 ccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18458202 ccactaagtacctacgtctagggtcaacaattcttatg 18458165  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 211 - 240
Target Start/End: Original strand, 19169132 - 19169161
Alignment:
Q  211 tacctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19169132 tacctacgtctagggtcaacaattcctatg 19169161  T

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Target: chr8 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 17997070 - 17997297
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||| ||  || ||||||||||| |    
T  17997070 ctctctctacgcttacttagtagttctacaaacgggcaaccctaatctttgtctaccttactaagggtttcaagagaatcgtcttactaggttatagcct 17997169  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||||||| | | ||||| | |     
T  17997170 taagtcggacagctaggtgcttgcttccctaattactaaccagttaattcctagcttctgtaatgcaccacacgacccaatgggttttagccactggatg 17997269  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17997270 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 17997297  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Original strand, 18569427 - 18569635
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||||  | | || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||| |||  |||||||||||||     
T  18569427 gtagttctacaaacaagtagccgtaacctacgtctaccttactacgggtttcaagagaatggttttactaggttatagctctaagtcggacagctaggtg 18569526  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    ||||||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||  |||    
T  18569527 cttgtttccctgattactaaccaattaattcctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatgggtatcatccactggatacctacgtctagggttcaca 18569626  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    |||||||||    
T  18569627 attcctatg 18569635  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 23892751 - 23892524
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  |   | |||||||||||||    
T  23892751 ctctctctacgcttacttagtagttctaaaaacgggcagccctaatctatgtctaccttactaagggtttcaagagaatcatctaactaggttatagctt 23892652  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  ||||||| ||||| |||||||| ||||||| |||| ||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||| ||   | ||||||||||    
T  23892651 taagtcggacagttaggtgcttgtttctctaattactaactagttaattcctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatgtgttctagccactaggta 23892552  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
     |||||||||||||||||||||| ||||    
T  23892551 tctacgtctagggtcaacaattcttatg 23892524  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 26831908 - 26831681
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| || || |||||| || ||||  ||||||||||||||||    
T  26831908 ctctctctaagcttacttagtagttctacaaacgggcagatctaatctacgtctaccttaccaatggattcaagagagtggtcttattaggttatagctt 26831809  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  | |||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | || | ||||| |||||| ||||||||||||   | ||| | ||||    
T  26831808 taagtcagacatctaggtgcttgtttccctaattactaaccagttaattcctagctttgttaatgtaccacacgacccaatgggttctagccattgggta 26831709  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26831708 cctacgtctagggtcaacaattcttatg 26831681  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 24723156 - 24722955
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||| |||| | ||||  |||||| ||||||     
T  24723156 gtagttctacaaacggacaaccctaatatacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggatataaccttaagtcggacatctaggtg 24723057  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||| || |||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||||||   | ||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  24723056 cttgtttccctaattactaactaggtaattcctagcttcggtaaggcaccacccgacccaatgggttctagccactgggtatctacgtctagggtcaaca 24722957  T
Q  232 at 233  Q
    ||    
T  24722956 at 24722955  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 19264589 - 19264820
Alignment:
Q  11 actctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatgg--ttatattaggttat 107  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||||||| | ||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  19264589 actctctctctacgcttacttagtagttcaataaacgggcagccataatctatgtctaccttactaagggtttcaagagaatggttttatactaggttat 19264688  T
Q  108 agctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccact 207  Q
    ||| ||||  | |||| |||||| ||||| |||||||||| |||||| || ||||||   |||| |||||||||||| || |||||||||   | |||||    
T  19264689 agccttaagtcagacaactaggtgcttgtatccctaattactaaccactt-attcctaacttcgataatgcaccacacgatccaatgggttctagccact 19264787  T
Q  208 aggtacctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
     ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19264788 gggtacctacatctagggtcaacaattcctatg 19264820  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 26887349 - 26887575
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||||| || |||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||  | | |    
T  26887349 ctctctttacgctttcttagtagttctacaaacgagcagccctaatctacgtccaccttactaagggtttcaagagaatggttctattaggttgcaac-t 26887447  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    ||   |||| |||||||   ||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||| |||||||  ||| ||||||| || |||||||| |||    
T  26887448 tatttcggatagctaggcatttgtttccctaattactaaccagttaatacctaggttcggtaaggcaccacctgactcaatgggcataatccactaagta 26887547  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
     ||| ||||| ||| |||||||| ||||    
T  26887548 tctatgtctatggttaacaattcttatg 26887575  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 240
Target Start/End: Original strand, 17509795 - 17509978
Alignment:
Q  56 aatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccag 155  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | | |||   ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  17509795 aatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggttctattaggttacatc-ttatttcggacagctaggtacttgtttccctaattactaaccag 17509893  T
Q  156 ttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||| | ||||||||  ||||||  ||  |||||||| | |  || |  |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17509894 ttaattcctaggttcggtaagacaccacctgattcaatgggttttagacattgagtacctacgtctagggtcaacaattcatatg 17509978  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 238
Target Start/End: Original strand, 26138781 - 26138919
Alignment:
Q  100 taggttatagctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtat 199  Q
    ||||||||||||||||  | |||| |||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||| |||||| ||||||| ||||      
T  26138781 taggttatagctttaagtcagacaactaggtgcttgtttctctaattactaaccagttaattcctagctttggtaatgtaccacacgacccaaagggttc 26138880  T
Q  200 catccactaggtacctacgtctagggtcaacaattccta 238  Q
     | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26138881 tagccactgggtacctacgtctagggtcaacaattccta 26138919  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17101506 - 17101438
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatatt 100  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||    
T  17101506 gtagttctacaaatgggcatccctaatctacgtctaccttacaaagggtttcaagagaatggttctatt 17101438  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 18448108 - 18448025
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgg---gcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||||||||||   ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||| |||||    
T  18448108 gtagttctacaaacggcgggcagccctaatctacatctaccttactaagggtttcaagagaatggttctattcggttacagctt 18448025  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 32 - 95
Target Start/End: Original strand, 25226665 - 25226728
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggtt 95  Q
    |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||    
T  25226665 gtagttttacaaataggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttaaagataatggtt 25226728  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 39 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 24110232 - 24110176
Alignment:
Q  39 tacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggtt 95  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  24110232 tacaaacggtcatccctaatctacgtcgaccttacaaagggtttcaagagaatggtt 24110176  T

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Target: scaffold0756 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0756
Description:

Target: scaffold0756; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 15 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 4543 - 4325
Alignment:
Q  15 tctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagcttt 113  Q
    |||||||| |||| ||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||||||    
T  4543 tctctctaagcttacttagtagttctacaaacgttcaaccctaatttacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttattaggttgtagcttt 4444  T
Q  114 aaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtac 213  Q
    ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||   | ||||| |||||    
T  4443 aagtcggacagctaggtgcttgtttccctaattactaaccagttaattcctagcttcgctaatgcaccacatgacccaatgggttctagccactgggtac 4344  T
Q  214 ctacgtctagggtcaacaa 232  Q
    ||||||||||| |||||||    
T  4343 ctacgtctaggttcaacaa 4325  T

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Target: chr2 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 16)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Original strand, 25536429 - 25536637
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||  | ||||| |||||     
T  25536429 gtagttctacagacaggcagccctaatctacatctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagctttaattcagacagttaggtg 25536528  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||   |  ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25536529 cttgtttccctaattactaacctgttaattcctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatgggttctagtcactaggtacctacgtcgagggtcaaaa 25536628  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    |||||||||    
T  25536629 attcctatg 25536637  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 14 - 236
Target Start/End: Original strand, 26667857 - 26668080
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||  || ||   |||| |||    
T  26667857 ctctctctatgcttacttagtagttctacaaacaggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggttttgagagaatggtcttactaaactataactt 26667956  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| | | ||    
T  26667957 taaatcggacagctaggtacttgttaccctaattactaactagttaattcctagcttcactaatgcaccacacgacccaatgggtatcatccattggata 26668056  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcc 236  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  26668057 cctacgtctagggacgacaattcc 26668080  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 22379071 - 22378845
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |    
T  22379071 ctctctctacactttcttagtagttctacaaacggccagtcctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagataatggttttattaggttatagc-t 22378973  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||| || |||| |||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| | | |||||||| |||| ||  ||| ||||||| |||||||| |  |||    
T  22378972 taaatcgaacagttaggtgtttgtttacctaattactaaccagttaattcataggttcggtaaggcactactcgactcaatgggcatcatccattgagta 22378873  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22378872 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 22378845  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 243
Target Start/End: Original strand, 25531075 - 25531286
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||  | ||||| |||||     
T  25531075 gtagttttacaaacgggcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagctttaagtcagacagttaggtg 25531174  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||| || |||||||| ||||| |||||||||| | || |||||||||||||| |||| |||| ||   | ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25531175 cttgcttacctaattactaacctgttaattcctagcttgggtaatgcaccacacgacctaatgagttctagccactgggtacctacgtctagggtcaaca 25531274  T
Q  232 attcctatgcta 243  Q
    ||| ||||||||    
T  25531275 atttctatgcta 25531286  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 240
Target Start/End: Original strand, 25921132 - 25921358
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||| ||    
T  25921132 ctctctctaagcttacttagtagttctacaaacgagcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagttt 25921231  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  ||||| | ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||||||   | ||| | ||||    
T  25921232 taagtcggactgttaggtgcttg-ttccctaattactaaccaggtaattcctagcttcggtaattcaccacacgacccaatgggttctagccattgggta 25921330  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25921331 cctacatctagggtcaacaaatcctatg 25921358  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 9 - 238
Target Start/End: Original strand, 17198413 - 17198642
Alignment:
Q  9 acactctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttat 107  Q
    |||| ||||||||| |||| ||| |||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | || ||||||||    
T  17198413 acacactctctctaagcttacttagtagttttgcaaacgggcagctctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatgtct-tactaggttat 17198511  T
Q  108 agctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccact 207  Q
    | ||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |||||||   | |||||    
T  17198512 aactttaagtcggacagctaggtgcttgtttccataattactaactagttaatacctagcttcggtaatgcaccacacgatcaaatgggttctagccact 17198611  T
Q  208 aggtacctacgtctagggtcaacaattccta 238  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17198612 aggtacctacgtctagggtcaataattccta 17198642  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 54 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18121763 - 18121581
Alignment:
Q  54 ctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaacc 153  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||   |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||    
T  18121763 ctaatatatgtctaccttactaagggtttcaagagaatggttttactaaactatagctttaaatcggacagctaggcacttgtttccctaattactaacc 18121664  T
Q  154 agttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcc 236  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||  ||||||||    
T  18121663 agttaattcctagcttcggtaatgcaccacacgacccaatgggtatcatccattggatacctaagtctagggttgacaattcc 18121581  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 16 - 227
Target Start/End: Original strand, 29143465 - 29143676
Alignment:
Q  16 ctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagcttta 114  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||    
T  29143465 ctctctacactttcttagtagttctacaaacgagcaactctaatctatgtctaccttactaaaggtttcaagagaatggttttattaggttatagc-tta 29143563  T
Q  115 aaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacc 214  Q
    || | |||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||| | ||| |||| ||||||| |||| ||||||| |||||||||||  |||     
T  29143564 aatcagacagctaggtgtttgtttccctgattactaactagttaattcctaggttcagtaaggcaccaccagactcaatgggcatcatccactaaatact 29143663  T
Q  215 tacgtctagggtc 227  Q
    |||||||||||||    
T  29143664 tacgtctagggtc 29143676  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Original strand, 25535841 - 25536006
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||  |||||||||||| ||||||  |||| || |||||     
T  25535841 gtagttctacaaacgggcagccctaatctacgtctaccttactaaggctttcaagaaaatggtcttattaggttataactttaagtcggaaagttaggtg 25535940  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggt 197  Q
    ||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25535941 cttgtttccttaattactaaccaattaattcctagctttagtaatgcaccacacgacccaatgggt 25536006  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 25536116 - 25536300
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  || |||||||||| ||    
T  25536116 ctctctctaagcttacttagtagttctataaacgggcagccctaatctacgtctaccttactaagggttttaagagaatggtcttactaggttatagatt 25536215  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggt 197  Q
    ||   ||||||| ||||| ||||||||| |||| | ||||||  |||||||| | ||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25536216 tatgtcggacagttaggtgcttgtttccttaataactaaccaactaattcctagcttcagtaatgcaccacacgacccaatgggt 25536300  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 14 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 24090476 - 24090249
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttcttg-tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||| | ||| |||  ||||||  |  || |||||| |||    
T  24090476 ctctctctacgcttacttggtagttctacaaacgggcatccctaatataca-ctaccttactaaagatttaaagacaatggtcttgctaagttataactt 24090378  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  |||||| |||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||||||||||   | ||||| ||||    
T  24090377 taagtcggacaactaggtgcttgtttccctaattactaactagttaattcctagcttcgataatgcaccacacgacccaatgggttctagccactgggta 24090278  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaattcctatgc 241  Q
    |||| ||||||||| ||||| || |||||    
T  24090277 cctatgtctagggttaacaactcttatgc 24090249  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 17635365 - 17635279
Alignment:
Q  8 cacactctctctctatgctttcttgtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggtt 95  Q
    ||||||||||||||| ||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17635365 cacactctctctctacgctct-tagtagttctacaaacgggcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagagtggtt 17635279  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 34 - 103
Target Start/End: Original strand, 30412197 - 30412266
Alignment:
Q  34 agttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattagg 103  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30412197 agttctacaaatggacaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggttctattagg 30412266  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 32 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 17675196 - 17675142
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaag 86  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17675196 gtagttctacaaacgggcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaag 17675142  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 35 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 27908684 - 27908642
Alignment:
Q  35 gttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaag 77  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27908684 gttctacaaatgggcaaccctaatctacgtctaccttactaag 27908642  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 12950554 - 12950485
Alignment:
Q  33 tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggtt 105  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||| |||||||| ||| |||||||| |||||||||    
T  12950554 tagttctacaaacgggcagccct-atct-cgtctaccttaccaagggttt-aagagaatggttctattaggtt 12950485  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 14 - 197
Target Start/End: Original strand, 76966 - 77150
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || |||||||||||||    
T  76966 ctctctctaagcttacttagtagttctacaaacgcgcatccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagctt 77065  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggt 197  Q
    |||  || ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  77066 taagtcgaacatctaggtgcttgtttccctaattagtaaccagttaattcctagcttcggtaatgcaccgcacgacccaatgggt 77150  T

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Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 208 - 240
Target Start/End: Original strand, 80779 - 80811
Alignment:
Q  208 aggtacctacgtctagggtcaacaattcctatg 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  80779 aggtacctacgtctagggtcaacaattcatatg 80811  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 32 - 240
Target Start/End: Original strand, 234723 - 234930
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctttaaaacggacagctaggtt 131  Q
    |||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||  | || || |||||     
T  234723 gtagttctacaaacgaa-aaccttaatctacgtctaccttaataagggtttcaaaagaatggttctattaggttatagccttaagtcagaaagataggtg 234821  T
Q  132 cttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaaca 231  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  234822 cttgtttccctaattactaaccagttatttccttccttccgtaatgcaccacacgacccagtggatatcatccactaggtacctacgtctaaggtcaaca 234921  T
Q  232 attcctatg 240  Q
    ||| |||||    
T  234922 atttctatg 234930  T

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Target: scaffold0056 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 15 - 237
Target Start/End: Original strand, 21826 - 22049
Alignment:
Q  15 tctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagcttt 113  Q
    |||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||    
T  21826 tctctctgcgctttcttagtagttctacaaacgggcagccctaatctacgactaccttactaagggtttcaagagaatggtcttattaggttatagattt 21925  T
Q  114 aaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtac 213  Q
    ||   |||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| | |||||||| |||||||   ||| |||||||   | |||||||| ||    
T  21926 aagttggacagttaggtgcttgtttccctaattacttaccagttaattcctaggttcggtaaggcaccacctaacctaatgggttctagccactaggaac 22025  T
Q  214 ctacgtctagggtcaacaattcct 237  Q
    |||||||||| |||||||||||||    
T  22026 ctacgtctagcgtcaacaattcct 22049  T

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Target: scaffold0671 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 234
Target Start/End: Original strand, 991 - 1212
Alignment:
Q  14 ctctctctatgctttctt-gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattaggttatagctt 112  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||     
T  991 ctctctctaagcttacttagtacttctacaaacaggcagccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagagaatggtcttactaggttatagctc 1090  T
Q  113 taaaacggacagctaggttcttgtttccctaattattaaccagttaattccttgtttcggtaatgcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggta 212  Q
    |||  |||| | |||||| |||||||||||||||| |||| |||||||| ||   ||||||||||||||||| ||| ||||| ||   | ||||| ||||    
T  1091 taagtcggatatctaggtgcttgtttccctaattactaactagttaattactaacttcggtaatgcaccacacgactcaatgagttctagccactgggta 1190  T
Q  213 cctacgtctagggtcaacaatt 234  Q
    ||||  ||||||||||||||||    
T  1191 cctatttctagggtcaacaatt 1212  T

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Target: scaffold0016 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 177 - 236
Target Start/End: Original strand, 3843 - 3902
Alignment:
Q  177 gcaccacaagacccaatgggtatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcc 236  Q
    |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3843 gcaccacctgacccaatgggcatcatccactaggtacctacgtctagggtcaacaattcc 3902  T

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Target: scaffold1156 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1156
Description:

Target: scaffold1156; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 33 - 82
Target Start/End: Original strand, 128 - 177
Alignment:
Q  33 tagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggttt 82  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  128 tagttctacaaacgggcatccctaatctacgtctaccttactaagggttt 177  T

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Target: scaffold0035 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Original strand, 70438 - 70509
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattagg 103  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||||||| |||||||    
T  70438 gtagttctacaaacgagcaaccctaatctacgcctactttactaatggtttcaagataatggttctattagg 70509  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 102910 - 102840
Alignment:
Q  32 gtagttctacaaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattagg 103  Q
    |||||||||| |||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  102910 gtagttctactaacgggcagctataatctacgtccaccttactaagggttt-aagagaatggttctattagg 102840  T

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Target: scaffold0263 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0263
Description:

Target: scaffold0263; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 102
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16224
Alignment:
Q  42 aaacgggcaaccctaatctacgtctaccttactaagggtttcaagcgaatggttatattag 102  Q
    |||| |||| || |||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16164 aaacaggcagccttaatttatgtctaccttactaagggtttcaagagaatggttctattag 16224  T

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