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Alignment Overview

Query: NF11873_low_5 (Length: 526)

Name: NF11873_low_5
Description: NF11873
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11873_low_5
NF11873_low_5
[»] chr3 (45 HSPs)
chr3 (8-516)||(16743998-16744508)
chr3 (112-400)||(17912483-17912771)
chr3 (106-473)||(12030073-12030443)
chr3 (106-473)||(2049777-2050147)
chr3 (106-473)||(14842487-14842856)
chr3 (6-473)||(13838770-13839232)
chr3 (95-426)||(15858996-15859331)
chr3 (95-410)||(51158008-51158325)
chr3 (235-400)||(2449238-2449404)
chr3 (106-393)||(15936634-15936922)
chr3 (338-516)||(19231982-19232164)
chr3 (106-393)||(15938476-15938764)
chr3 (19-215)||(15468520-15468717)
chr3 (19-215)||(22275088-22275285)
chr3 (106-400)||(45860773-45861068)
chr3 (113-356)||(15614808-15615053)
chr3 (106-400)||(13954890-13955185)
chr3 (106-400)||(13975722-13976017)
chr3 (354-473)||(19260749-19260869)
chr3 (106-388)||(55316187-55316471)
chr3 (106-388)||(41270043-41270327)
chr3 (98-366)||(16821099-16821369)
chr3 (113-248)||(47984624-47984759)
chr3 (113-248)||(48003198-48003333)
chr3 (113-248)||(47993911-47994046)
chr3 (113-248)||(48012484-48012619)
chr3 (8-80)||(2449391-2449463)
chr3 (442-516)||(3992873-3992948)
chr3 (442-516)||(55513193-55513268)
chr3 (439-516)||(15857120-15857198)
chr3 (442-516)||(2844514-2844589)
chr3 (442-496)||(17955861-17955916)
chr3 (442-516)||(54037981-54038056)
chr3 (343-384)||(14080715-14080756)
chr3 (106-155)||(19231945-19231994)
chr3 (19-99)||(18969968-18970048)
chr3 (442-516)||(7854305-7854380)
chr3 (442-502)||(45581954-45582016)
chr3 (95-127)||(22144532-22144564)
chr3 (135-256)||(12264932-12265053)
chr3 (19-80)||(48421624-48421685)
chr3 (135-250)||(11329098-11329214)
chr3 (321-393)||(11986173-11986245)
chr3 (462-514)||(17191884-17191936)
chr3 (321-393)||(54651642-54651714)
[»] chr8 (35 HSPs)
chr8 (8-400)||(22907214-22907607)
chr8 (113-473)||(16193643-16194005)
chr8 (106-516)||(16404857-16405268)
chr8 (6-473)||(24928716-24929178)
chr8 (106-473)||(43373392-43373761)
chr8 (235-400)||(5238184-5238350)
chr8 (235-400)||(24661248-24661414)
chr8 (235-400)||(43685643-43685809)
chr8 (109-400)||(17345540-17345832)
chr8 (113-388)||(24548956-24549233)
chr8 (113-388)||(6774258-6774535)
chr8 (106-384)||(21844576-21844856)
chr8 (106-384)||(21851969-21852249)
chr8 (106-388)||(30120690-30120974)
chr8 (8-80)||(43685584-43685656)
chr8 (8-80)||(5238125-5238197)
chr8 (8-80)||(24661401-24661473)
chr8 (106-325)||(222754-222975)
chr8 (106-325)||(736377-736598)
chr8 (106-325)||(860272-860493)
chr8 (110-388)||(16674392-16674672)
chr8 (442-516)||(274766-274841)
chr8 (442-516)||(641008-641083)
chr8 (442-516)||(826814-826889)
chr8 (442-516)||(24716719-24716794)
chr8 (96-250)||(23837154-23837308)
chr8 (19-76)||(22321597-22321654)
chr8 (95-217)||(41246613-41246735)
chr8 (19-99)||(23217924-23218004)
chr8 (442-516)||(39115598-39115673)
chr8 (98-168)||(13662492-13662561)
chr8 (22-80)||(22981241-22981299)
chr8 (6-80)||(41507116-41507190)
chr8 (343-384)||(23149985-23150026)
chr8 (343-384)||(23226076-23226117)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (8-400)||(26680070-26680463)
chr4 (95-516)||(54118125-54118551)
chr4 (95-473)||(13246386-13246769)
chr4 (110-473)||(15675009-15675381)
chr4 (268-473)||(122020-122226)
chr4 (235-400)||(10488659-10488825)
chr4 (235-400)||(16327926-16328092)
chr4 (113-373)||(31115603-31115865)
chr4 (110-473)||(10104170-10104523)
chr4 (106-384)||(10644187-10644467)
chr4 (106-400)||(13048221-13048517)
chr4 (106-388)||(47357622-47357906)
chr4 (106-237)||(111362-111493)
chr4 (338-473)||(33240901-33241043)
chr4 (8-80)||(10488600-10488672)
chr4 (25-80)||(16328079-16328134)
chr4 (442-516)||(25119064-25119139)
chr4 (203-384)||(40885570-40885753)
chr4 (442-516)||(5682385-5682460)
chr4 (109-184)||(7849970-7850044)
chr4 (106-250)||(15044794-15044938)
chr4 (19-80)||(19559410-19559471)
chr4 (161-250)||(41166083-41166172)
chr4 (368-473)||(31132545-31132657)
chr4 (95-127)||(44055870-44055902)
chr4 (163-250)||(7185981-7186068)
chr4 (343-383)||(13809511-13809551)
[»] chr7 (31 HSPs)
chr7 (8-400)||(7292886-7293279)
chr7 (94-473)||(13036938-13037322)
chr7 (106-473)||(16211733-16212103)
chr7 (106-514)||(3059933-3060344)
chr7 (106-473)||(11580661-11581035)
chr7 (106-473)||(36052634-36053003)
chr7 (113-400)||(47481031-47481320)
chr7 (235-400)||(11516324-11516490)
chr7 (235-400)||(15441564-15441730)
chr7 (235-400)||(30262129-30262295)
chr7 (106-393)||(18253842-18254130)
chr7 (113-399)||(13320988-13321278)
chr7 (109-382)||(16478968-16479244)
chr7 (106-400)||(25292338-25292633)
chr7 (106-388)||(10989378-10989661)
chr7 (106-384)||(13572644-13572924)
chr7 (124-388)||(13911024-13911292)
chr7 (106-389)||(2437425-2437710)
chr7 (8-80)||(11516265-11516337)
chr7 (8-80)||(15441717-15441789)
chr7 (8-80)||(30262282-30262354)
chr7 (109-465)||(295900-296257)
chr7 (442-516)||(126738-126813)
chr7 (442-516)||(32493903-32493978)
chr7 (442-516)||(1936874-1936949)
chr7 (358-400)||(14113989-14114031)
chr7 (358-400)||(14423639-14423681)
chr7 (19-99)||(13351999-13352079)
chr7 (95-127)||(15822691-15822723)
chr7 (442-516)||(111126-111201)
chr7 (95-250)||(17224075-17224230)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (8-400)||(37066-37459)
scaffold0078 (442-516)||(41632-41707)
[»] chr1 (23 HSPs)
chr1 (109-516)||(41394191-41394602)
chr1 (106-473)||(20445646-20446019)
chr1 (106-461)||(20531411-20531770)
chr1 (106-473)||(20931312-20931682)
chr1 (95-473)||(20893551-20893933)
chr1 (106-473)||(20913004-20913367)
chr1 (106-473)||(37844374-37844746)
chr1 (235-400)||(51452589-51452755)
chr1 (106-389)||(22227777-22228061)
chr1 (106-389)||(22232474-22232758)
chr1 (113-388)||(2116228-2116506)
chr1 (106-388)||(5072388-5072672)
chr1 (106-388)||(18601118-18601402)
chr1 (113-193)||(45051416-45051496)
chr1 (268-388)||(45051554-45051674)
chr1 (8-80)||(51452530-51452602)
chr1 (442-516)||(21860334-21860409)
chr1 (442-515)||(44034829-44034903)
chr1 (462-516)||(41218749-41218803)
chr1 (96-127)||(49967607-49967638)
chr1 (343-384)||(22143361-22143402)
chr1 (462-514)||(13376711-13376763)
chr1 (462-514)||(27675139-27675191)
[»] chr2 (27 HSPs)
chr2 (95-516)||(19794586-19795011)
chr2 (106-473)||(36982364-36982737)
chr2 (106-516)||(20627195-20627609)
chr2 (106-516)||(43642838-43643250)
chr2 (106-473)||(462706-463075)
chr2 (106-467)||(8891209-8891574)
chr2 (110-473)||(24341309-24341681)
chr2 (235-400)||(19689401-19689567)
chr2 (235-400)||(23820168-23820334)
chr2 (235-400)||(14906440-14906606)
chr2 (113-400)||(25265390-25265679)
chr2 (235-400)||(20015108-20015274)
chr2 (106-400)||(17396653-17396948)
chr2 (109-350)||(7507894-7508138)
chr2 (106-388)||(19886661-19886945)
chr2 (442-516)||(22284278-22284353)
chr2 (378-473)||(22863169-22863267)
chr2 (8-80)||(14906593-14906665)
chr2 (8-80)||(20015049-20015121)
chr2 (8-80)||(23820109-23820181)
chr2 (442-516)||(22275045-22275120)
chr2 (443-516)||(15633538-15633612)
chr2 (34-80)||(19689554-19689600)
chr2 (161-217)||(19669279-19669335)
chr2 (6-80)||(25601898-25601972)
chr2 (458-514)||(19660217-19660273)
chr2 (95-127)||(32465813-32465845)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (106-473)||(1091-1462)
scaffold0266 (106-473)||(3508-3877)
[»] scaffold0023 (2 HSPs)
scaffold0023 (106-473)||(48565-48935)
scaffold0023 (110-366)||(36065-36323)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (106-474)||(36836-37209)
scaffold0077 (462-516)||(15324-15378)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (106-465)||(19173-19537)
scaffold0195 (106-400)||(21257-21553)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (95-473)||(23153403-23153786)
chr6 (113-429)||(14626089-14626407)
chr6 (106-400)||(35009439-35009735)
chr6 (109-400)||(1657748-1658040)
chr6 (109-400)||(15862443-15862734)
chr6 (113-388)||(1650105-1650382)
chr6 (106-388)||(25175531-25175815)
chr6 (106-388)||(27653983-27654267)
chr6 (106-388)||(16825752-16826038)
chr6 (109-242)||(27740808-27740941)
chr6 (405-473)||(23148266-23148335)
chr6 (442-516)||(19983149-19983224)
chr6 (442-516)||(35015014-35015089)
chr6 (95-249)||(18381821-18381975)
chr6 (317-400)||(27751605-27751688)
chr6 (203-400)||(29665937-29666137)
chr6 (19-80)||(15889853-15889914)
chr6 (442-516)||(18583640-18583715)
chr6 (120-226)||(22361926-22362032)
chr6 (22-80)||(25640702-25640760)
chr6 (343-384)||(16887792-16887833)
chr6 (95-124)||(32898745-32898774)
chr6 (343-384)||(33324898-33324939)
chr6 (343-384)||(35136013-35136054)
chr6 (19-99)||(15005034-15005114)
chr6 (19-99)||(22585674-22585754)
chr6 (19-99)||(22590505-22590585)
chr6 (135-250)||(25367374-25367490)
[»] chr5 (34 HSPs)
chr5 (106-473)||(23506932-23507302)
chr5 (95-473)||(27182471-27182854)
chr5 (114-473)||(18530988-18531355)
chr5 (110-473)||(22053753-22054125)
chr5 (235-400)||(20623066-20623232)
chr5 (235-400)||(21233528-21233694)
chr5 (238-400)||(37052844-37053007)
chr5 (235-400)||(16536294-16536460)
chr5 (109-400)||(34939248-34939540)
chr5 (235-398)||(25900408-25900571)
chr5 (106-388)||(22366481-22366765)
chr5 (106-388)||(25426596-25426880)
chr5 (106-385)||(18777995-18778276)
chr5 (106-388)||(12342-12626)
chr5 (106-388)||(19499867-19500151)
chr5 (106-388)||(21073595-21073879)
chr5 (125-388)||(4199985-4200251)
chr5 (19-215)||(17471768-17471956)
chr5 (106-385)||(43443398-43443679)
chr5 (106-384)||(27009809-27010089)
chr5 (8-80)||(20623007-20623079)
chr5 (8-80)||(21233681-21233753)
chr5 (268-388)||(29188284-29188404)
chr5 (113-187)||(29190478-29190552)
chr5 (8-80)||(25900558-25900630)
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Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 423; Significance: 0; HSPs: 45)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 423; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16744508 - 16743998
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 107  Q
    ||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
16744508 aatgagatcaacatcaactatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 16744409  T
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
16744408 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatttattagcatcaaca 16744309  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||     
16744308 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactataacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaaa 16744209  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaa 406  Q
    ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
16744208 atgtaatttaaccaacaatcatacacttattatcaattcatggatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttaacaacaatcatccataatcaa 16744109  T
407 aattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactt 505  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
16744108 aattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacctcgttaccttaattatctccaactattagctctagcttcactt 16744009  T
506 tggctcctatg 516  Q
    | |||||||||    
16744008 tagctcctatg 16743998  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 112 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17912771 - 17912483
Alignment:
112 caaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacat 211  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||||    
17912771 caaaacacccacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacat 17912672  T
212 caattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    | |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||     
17912671 cgattgaacatgaatcatagctcaattcaactacaacatatcaaattcatcaattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaacatgt 17912572  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17912571 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatc-aagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17912483  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 12030443 - 12030073
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| || | |    
12030443 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccataacatcaattaacaacca 12030344  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     | ||||||||| |||||||||| |  |||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||| ||||| ||||| ||| || |||||||||     
12030343 tagcatcaattgaacaagaatcaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaactttcacaacttatcacttttacatatttg 12030244  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
12030243 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 12030144  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || ||| ||||||||||||    
12030143 caaaagtcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataatgattaacccccttacctta 12030073  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 2049777 - 2050147
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
2049777 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 2049876  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     | ||||||||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||| | |||||||||     
2049877 tagcatcaattgaacaaaaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatgtttacatatttg 2049976  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
2049977 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcaggcatacaaacatatcgtcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 2050076  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
2050077 caaaattgatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 2050147  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 14842856 - 14842487
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | |||||| |||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
14842856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaatcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 14842758  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||     
14842757 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacacatttg 14842658  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
14842657 aacatgcaatttcaccaacaatcatacaattatcttcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 14842558  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  |||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
14842557 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 14842487  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Original strand, 13838770 - 13839232
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaa 105  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | || ||        |||||| ||    
13838770 gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcattcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgta--------attcaccaa 13838861  T
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||  |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
13838862 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 13838960  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
13838961 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 13839060  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
13839061 aacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattattcataat 13839160  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
13839161 caaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 13839232  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 95 - 426
Target Start/End: Complemental strand, 15859331 - 15858996
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95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
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15859331 caattcaccattttcaccaaaacaacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 15859232  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
15859231 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 15859132  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 392  Q
     | ||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
15859131 gttcatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 15859032  T
393 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaa 426  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||    
15859031 ttatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaa 15858996  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 95 - 410
Target Start/End: Complemental strand, 51158325 - 51158008
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    |||||||||||||| | ||||||||  |||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
51158325 caattcacaaattt-agcaaaacacttaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 51158227  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 291  Q
     |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
51158226 aattaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 51158127  T
292 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaaca 391  Q
    | ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
51158126 tttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 51158027  T
392 atcatccataatcaaaatt 410  Q
    || |||||||| |||||||    
51158026 attatccataagcaaaatt 51158008  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 2449404 - 2449238
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
2449404 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 2449305  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
2449304 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 2449238  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 106 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15936922 - 15936634
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
15936922 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15936824  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
15936823 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15936724  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
15936723 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 15936634  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 338 - 516
Target Start/End: Original strand, 19231982 - 19232164
Alignment:
338 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaa 434  Q
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19231982 atcaattcatgaatataaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaa 19232081  T
435 aatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
19232082 aatgatgatgattaagataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg 19232164  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 106 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 15938764 - 15938476
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
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15938764 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcagcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 15938666  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
15938665 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 15938566  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||||||||||| | |||||||||||| |||||| ||||||    
15938565 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgattacaaacatatcattacagttggagcacgtatttagtaacaat 15938476  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15468717 - 15468520
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt-cacaaatttcaccaaaac 117  Q
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15468717 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatacattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcaccaatttcacaaatttcaccaaaac 15468618  T
118 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 215  Q
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15468617 aacaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 15468520  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Original strand, 22275088 - 22275285
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttc-ctcaattcacaaatttcaccaaaac 117  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||| | ||||| ||| || | ||||||||||||||||||||    
22275088 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcataattcactaatttcacaaatttcaccaaaac 22275187  T
118 accaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
22275188 accaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacctaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 22275285  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 400
Target Start/End: Original strand, 45860773 - 45861068
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
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45860773 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 45860871  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
45860872 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 45860971  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
45860972 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 45861068  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 113 - 356
Target Start/End: Original strand, 15614808 - 15615053
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
15614808 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 15614907  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| || |||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
15614908 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccatattcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 15615007  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaa 356  Q
    ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||    
15615008 aatttcaccaacaatcctacaattatcatcaattcatgcatacaaa 15615053  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13955185 - 13954890
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
13955185 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13955087  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||  |||||| ||| |||||    
13955086 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataactgatcatttttacttattt 13954987  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13954986 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13954890  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13976017 - 13975722
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
13976017 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattatcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 13975919  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
13975918 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 13975819  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||||||| |||   ||||||||||||||| | || | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
13975818 aaacatgtaattccaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatacaa-catatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 13975722  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 354 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 19260869 - 19260749
Alignment:
354 aaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggta 453  Q
    ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||    
19260869 aaacatatcatcataattagagcacgaatttagcaacaattatccataaaaaaaattcatacaacatttgaaaacttacaaaatgatgatgattatgata 19260770  T
454 aagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||| ||||||||||||    
19260769 aagactaacccccttacctta 19260749  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Original strand, 55316187 - 55316471
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
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55316187 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 55316285  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
55316286 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 55316385  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
55316386 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 55316471  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Original strand, 41270043 - 41270327
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
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41270043 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 41270141  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
41270142 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 41270241  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| |||   |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
41270242 gaacatgtaattccaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 41270327  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 98 - 366
Target Start/End: Original strand, 16821099 - 16821369
Alignment:
98 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctatt 197  Q
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16821099 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaaccatttat-ttatcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaat 16821197  T
198 agcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttct 294  Q
    | |||  | ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| ||||| |  |  ||||||| | |||| |||||||  ||||| |||  ||||| |    
16821198 aacattcataacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcatagcttaacattttt 16821297  T
295 acatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
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16821298 acatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacataacatca 16821369  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 47984624 - 47984759
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
47984624 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 47984723  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 248  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
47984724 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47984759  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 48003198 - 48003333
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
48003198 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaaaaacatc 48003297  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 248  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
48003298 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48003333  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 47993911 - 47994046
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||    
47993911 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 47994010  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 248  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
47994011 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 47994046  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 248
Target Start/End: Original strand, 48012484 - 48012619
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | || ||| |||| || ||| ||||||    
48012484 aaaacatcagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaaaatcaattaacaacaaaaacatc 48012583  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac 248  Q
    ||||| ||| |||||| | |||||| |||| |||||    
48012584 aattgaacatgaatcacatctcaatccaacaacaac 48012619  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 2449463 - 2449391
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
2449463 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 2449391  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 3992873 - 3992948
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
3992873 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 3992948  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 55513193 - 55513268
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
55513193 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 55513268  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 439 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 15857198 - 15857120
Alignment:
439 atgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| |||||||||    
15857198 atgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaagtattagctctagcttcactttagctcctatg 15857120  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 2844514 - 2844589
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
2844514 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctcaaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 2844589  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 496
Target Start/End: Complemental strand, 17955916 - 17955861
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctcta 496  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
17955916 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcta 17955861  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 54038056 - 54037981
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||    
54038056 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 54037981  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Original strand, 14080715 - 14080756
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
14080715 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattt 14080756  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Original strand, 19231945 - 19231994
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa 155  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||    
19231945 tttcaccaaaacaccaacaacaatccaaattatcatcatcaattcatgaa 19231994  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 18969968 - 18970048
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| |  ||||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
18969968 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgctttccatcagaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 18970048  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 7854305 - 7854380
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||    
7854305 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 7854380  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 502
Target Start/End: Original strand, 45581954 - 45582016
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc--ttaccttaattatctccaactactagctctaacttca 502  Q
    ||||||||| |||| |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
45581954 atgattatgataaaaactaaccccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttca 45582016  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 22144564 - 22144532
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
22144564 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22144532  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 12265053 - 12264932
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 234  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||||||||||  || ||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
12265053 ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaagtcataattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 12264954  T
235 aattcaactacaacatgtcaaa 256  Q
    | |||||| ||||||| |||||    
12264953 atttcaacaacaacatatcaaa 12264932  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 48421624 - 48421685
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||  ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
48421624 catcaacaattaaccacaaccacaatttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 48421685  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11329214 - 11329098
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 233  Q
    ||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||| |||| | |||| | | ||||||  |||||| |||||||||||||||  || ||||| || |     
11329214 ttctcatcaacaaatcatgaatcatgcatacccaagccatgaattatcatcaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgatcatgaatcttatca 11329115  T
234 caattcaactacaacat 250  Q
    ||||||||| |||||||    
11329114 caattcaacaacaacat 11329098  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 11986245 - 11986173
Alignment:
321 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||||| || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
11986245 acaatcatacaattatcattaaatcatgcacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 11986173  T

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Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 462 - 514
Target Start/End: Original strand, 17191884 - 17191936
Alignment:
462 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 514  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||    
17191884 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 17191936  T

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Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 393
Target Start/End: Original strand, 54651642 - 54651714
Alignment:
321 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||||||    
54651642 acaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaatagcatcacagcaagagcacgaatttagcaacaat 54651714  T

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Target: chr8 (Bit Score: 338; Significance: 0; HSPs: 35)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 338; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 22907607 - 22907214
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
22907607 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatt 22907508  T
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
22907507 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 22907408  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
22907407 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac 22907308  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
22907307 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 22907214  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 16194005 - 16193643
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||  |||||||  |||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | | ||||||    
16194005 aaaacaccaacaacatctcaaattaacatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaaccataacatc 16193906  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    ||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  || |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
16193905 aattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16193806  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaatt 410  Q
    ||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
16193805 aatttccccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataagcaaaatt 16193706  T
411 catacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccccttacctta 473  Q
    ||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
16193705 catacaatatttgaaaatttaccaaatgatgatgattatgataaagactaaccccttacctta 16193643  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 106 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 16405268 - 16404857
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||||||  || ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
16405268 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcatcaattcatgaatttgcatacccaagcagtgattcatcaactaaaacatcaattaacaacaa 16405169  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
16405168 taacatcaattgaacaagaatcatatgtcaatttaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 16405072  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
16405071 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccatcat 16404972  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctaactt 500  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
16404971 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttac-aaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagctt 16404873  T
501 cactttggctcctatg 516  Q
    |||||| |||||||||    
16404872 cacttttgctcctatg 16404857  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24929178 - 24928716
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaa 105  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | || ||        |||||| ||    
24929178 gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccagaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcgta--------attcaccaa 24929087  T
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||| || |||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
24929086 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctcaacaacaaatcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacaacca 24928988  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||| ||||||| ||||||  |||| |||||| |||| ||||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
24928987 taacctcaattgaacaagagacataactcaatccaaccacaacttagcgaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 24928888  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
24928887 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatataatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 24928788  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttacctta 473  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
24928787 caaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgacgatgattatgataaagactaaccccattacctta 24928716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 43373761 - 43373392
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
43373761 tttcaccaaaacaccaacaa---ttcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 43373665  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     | ||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
43373664 tagcatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 43373565  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||    
43373564 aacatgtaatttcaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagcacgaatttagcattaattatccattat 43373465  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
43373464 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 43373392  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Original strand, 5238184 - 5238350
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
5238184 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 5238283  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
5238284 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 5238350  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 24661414 - 24661248
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
24661414 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 24661315  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
24661314 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 24661248  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Original strand, 43685643 - 43685809
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
43685643 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 43685742  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
43685743 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 43685809  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 400
Target Start/End: Original strand, 17345540 - 17345832
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
17345540 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 17345639  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
     ||||| || |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
17345640 tatcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 17345738  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||| |||||||||||| |||||||| ||||||    
17345739 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatataaacataacatcacagttagagcacgaatttcgcaacaattatccat 17345832  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 388
Target Start/End: Original strand, 24548956 - 24549233
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
24548956 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 24549055  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    |||||  ||||||||| | | ||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
24549056 aattgagcaagaatcaaatcccaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 24549155  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||    
24549156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 24549233  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 113 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 6774535 - 6774258
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
6774535 aaaacaccaacaacaaatcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 6774436  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
6774435 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 6774336  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||    
6774335 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaagagcacgaatctagca 6774258  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21844856 - 21844576
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
21844856 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21844758  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||| ||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
21844757 taacatcatttgaacaaaaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21844658  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
21844657 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21844576  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21852249 - 21851969
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
21852249 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcaacaatcaatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 21852151  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
21852150 taacatcatttgaacaagaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 21852051  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
21852050 aaacatttaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 21851969  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Original strand, 30120690 - 30120974
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
30120690 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattatcatcatcaatcgatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 30120788  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
30120789 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 30120888  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
30120889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 30120974  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 43685584 - 43685656
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
43685584 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 43685656  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 5238125 - 5238197
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
5238125 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 5238197  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24661473 - 24661401
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
24661473 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 24661401  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 222975 - 222754
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
222975 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 222877  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
222876 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 222777  T
303 aaacatggaatctaaccaacaat 325  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
222776 gaacatgtaatttcaccaacaat 222754  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 736598 - 736377
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
736598 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 736500  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
736499 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 736400  T
303 aaacatggaatctaaccaacaat 325  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
736399 gaacatgtaatttcaccaacaat 736377  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 860493 - 860272
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
860493 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 860395  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
860394 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 860295  T
303 aaacatggaatctaaccaacaat 325  Q
     |||||| ||| | |||||||||    
860294 gaacatgtaatttcaccaacaat 860272  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 110 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16674672 - 16674392
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  | |||    
16674672 accaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattcataac 16674574  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    |||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||    
16674573 atcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattaagcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaac 16674474  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  || |||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
16674473 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacataaattcatgcataaaaacataacatcacagaaagagcacgaatttagca 16674392  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 274766 - 274841
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
274766 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 274841  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
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Target Start/End: Complemental strand, 641083 - 641008
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442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
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641083 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 641008  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 826889 - 826814
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442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
826889 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 826814  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 24716794 - 24716719
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442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
24716794 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatcaccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 24716719  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 96 - 250
Target Start/End: Original strand, 23837154 - 23837308
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96 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    ||||||| |||||||| ||| ||||| |||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||     
23837154 aattcaccaatttcacaaaaccaccaccaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatca 23837252  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
     |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| |||||||    
23837253 cttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttaccacaattcaacaacaacat 23837308  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 22321654 - 22321597
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaa 76  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||| |||| |||||    
22321654 catcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatgcattccatcacaatttaacaa 22321597  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Original strand, 41246613 - 41246735
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | |||||     
41246613 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 41246711  T
194 tattagcatcaacaacatcaattg 217  Q
      ||| || |||||||||||||||    
41246712 acttaacaacaacaacatcaattg 41246735  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 23217924 - 23218004
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    |||||||||||||||||||  | ||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
23217924 catcaacaatcaaccacaactacaacttataatcatgcattccatcacatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 23218004  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 39115598 - 39115673
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| | || |||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||    
39115598 atgattatgatgaaaactaacacccttaccttaattattaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 39115673  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 98 - 168
Target Start/End: Complemental strand, 13662561 - 13662492
Alignment:
98 ttcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaa 168  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||||| |  ||||||||||||    
13662561 ttcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaatttag-ttctcatcatcaatccataattatgtatacccaa 13662492  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Original strand, 22981241 - 22981299
Alignment:
22 caacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
22981241 caacaatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaac 22981299  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 41507190 - 41507116
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
41507190 gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 41507116  T

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Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Original strand, 23149985 - 23150026
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||    
23149985 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaattt 23150026  T

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Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23226117 - 23226076
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
23226117 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacaaattt 23226076  T

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Target: chr4 (Bit Score: 330; Significance: 0; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 330; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Original strand, 26680070 - 26680463
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||    
26680070 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcgattcccaaatt 26680169  T
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
26680170 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 26680269  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
26680270 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatctattttgcacaattttcataacttttcatttttacatatttaaac 26680369  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
26680370 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 26680463  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 95 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 54118551 - 54118125
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
54118551 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 54118452  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||| ||    
54118451 attaacaactataacatcaattgaacaagaatcataactaaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcaatt 54118352  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 392  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
54118351 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaa 54118252  T
393 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactact 489  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
54118251 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactatt 54118152  T
490 agctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||    
54118151 agctctagcttcacttttgctcttatg 54118125  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 95 - 473
Target Start/End: Original strand, 13246386 - 13246769
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
13246386 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 13246485  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
13246486 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 13246585  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 392  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
13246586 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcattaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgtagcacgaatttaacaacaa 13246685  T
393 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
13246686 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 13246769  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 110 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 15675381 - 15675009
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||    
15675381 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataac 15675282  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 307  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
15675281 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 15675182  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 405  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |    
15675181 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 15675082  T
406 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
15675081 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 15675009  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 268 - 473
Target Start/End: Original strand, 122020 - 122226
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||     
122020 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcac 122119  T
368 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-cccct 466  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
122120 agttggagcacaaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaatcccct 122219  T
467 tacctta 473  Q
    |||||||    
122220 tacctta 122226  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Original strand, 10488659 - 10488825
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
10488659 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 10488758  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
10488759 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 10488825  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 16328092 - 16327926
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
16328092 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16327993  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16327992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16327926  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 113 - 373
Target Start/End: Original strand, 31115603 - 31115865
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
31115603 aaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 31115702  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  ||| |||||||| |||||| ||||| |||||| |  ||||||     
31115703 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagcataattttcacaacttcacatttttacataatggaacatgt 31115802  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgg 373  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
31115803 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgg 31115865  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 110 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 10104523 - 10104170
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||                   ||||||    
10104523 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaac-------------------aacaac 10104443  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 307  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
10104442 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 10104343  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 405  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||  ||   |    
10104342 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacggatttagcaacaattatccaattatgaa 10104243  T
406 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   |||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
10104242 aaattcataccacatttgaaaaattgtaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 10104170  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 10644187 - 10644467
Alignment:
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    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
10644187 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10644285  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| ||| |||||| | ||||| ||||| |||||  | |  ||||||| | |||| |||||||  |||||||||  ||||| |||||||||    
10644286 taacatcaattgaacatgaatcacatctcaaatcaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatactcataacttaacatttttacatattt 10644385  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
     |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
10644386 gaacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 10644467  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 13048517 - 13048221
Alignment:
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    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | | ||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||||| || |||  |    
13048517 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaactatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatctaataacattca 13048419  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | |||||   ||| ||||| |  |  ||||||||| |||  ||||||| |||||||||| || ||| |||||||||    
13048418 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaactaacaacaacttaggagaaattcatcaattgagcacaatattcataacttatcctttttacatattt 13048319  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
13048318 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaaatcatgcatacaaacatatcattgaagttggagcatgaatttagcaacaattatccat 13048221  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Original strand, 47357622 - 47357906
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| |||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
47357622 tttcaccaaaacaccaaca-cagctcaaattctcatcatcaatccatgaatatacatacccaatcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 47357720  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
47357721 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 47357820  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||| |||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
47357821 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaatccatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 47357906  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 237
Target Start/End: Original strand, 111362 - 111493
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
111362 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 111461  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 237  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
111462 taacatcaattgaacaagaatcataactcaat 111493  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 338 - 473
Target Start/End: Original strand, 33240901 - 33241043
Alignment:
338 atcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa 435  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    
33240901 atcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaa 33241000  T
436 ----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
        ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
33241001 aatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 33241043  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 10488600 - 10488672
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
10488600 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 10488672  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 25 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 16328134 - 16328079
Alignment:
25 caatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
16328134 caatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 16328079  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 25119139 - 25119064
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaac-cccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
25119139 atgattatgataaaaactaactcccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 25119064  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 203 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 40885753 - 40885570
Alignment:
203 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacata- 299  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| | ||| |  |||| |||| | |||  ||| ||||| ||||||||  ||||| ||||||     
40885753 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaataacttagcaaagttcaccaattgagcataattt-cataacttgacatttatacatac 40885655  T
300 tttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||| |||||| ||| | |||||||| ||| || |||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||    
40885654 tttgaacatgtaatttcaccaacaaacattcaattatcaccaattcatgcatacaaacatagcaccacagttggagtacgaattt 40885570  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 5682460 - 5682385
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaaccc-cttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||   ||||||||| |||||||||    
5682460 atgattatgataaaaactaacccacttaccttaattatcaccaactattagctcatgcttcacttttgctcctatg 5682385  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 184
Target Start/End: Original strand, 7849970 - 7850044
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaac 184  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| |||||  |||||||| ||||  |||||||||||||    
7849970 caccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcaccaattcatgattatgtatactcaagtcatgattcatcaac 7850044  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 250
Target Start/End: Original strand, 15044794 - 15044938
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca 204  Q
    |||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||  |||||   ||| | |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||    
15044794 tttcaccaaagcaacaacaacaatttat-ttctcatcatcaaatcatgatttatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 15044892  T
205 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
15044893 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 15044938  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 19559410 - 19559471
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
19559410 catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcaacaacaac 19559471  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41166172 - 41166083
Alignment:
161 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
    |||||||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| || || |  | ||||||||| |||||||    
41166172 atacccaagccatgattcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttgccacaattcaacaacaacat 41166083  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 368 - 473
Target Start/End: Original strand, 31132545 - 31132657
Alignment:
368 agttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   ||||||||||| ||||||||||| |  ||||    |||||||| |||||| | ||||||||    
31132545 agttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgataattatgatgaagactaa 31132644  T
462 -ccccttacctta 473  Q
     ||||||||||||    
31132645 cccccttacctta 31132657  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Original strand, 44055870 - 44055902
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
44055870 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 44055902  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 163 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 7186068 - 7185981
Alignment:
163 acccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
    |||||||| |||| |||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
7186068 acccaagccatgaatcatcaacaataatatctcttagcaacaacaacatcaattaaacatgaatctcatcacaattcaacaacaacat 7185981  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 13809551 - 13809511
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 383  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
13809551 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 13809511  T

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Target: chr7 (Bit Score: 326; Significance: 0; HSPs: 31)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 326; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Original strand, 7292886 - 7293279
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 107  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
7292886 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcatcaattcacaaatt 7292985  T
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
7292986 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 7293085  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||    
7293086 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaac 7293185  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
7293186 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattattaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 7293279  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 4e-98
Query Start/End: Original strand, 94 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 13037322 - 13036938
Alignment:
94 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||    
13037322 tcaattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatc 13037223  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 291  Q
     ||||  ||  | ||||| ||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
13037222 aattaatattcataacattaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 13037123  T
292 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaaca 391  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
13037122 tgttcctatttgaacatgcaatttcatcaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaca 13037023  T
392 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    || |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
13037022 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 13036938  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 16211733 - 16212103
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | |    
16211733 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcttcattaattcatgaatatgcatacccaagcaatgaatcatcaaccacaacatcaattaacaacca 16211832  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||  |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
16211833 taacatcaatttaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 16211932  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | || ||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||     
16211933 aacatgcaatttcacaaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattgtccataag 16212032  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
16212033 caaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 16212103  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 106 - 514
Target Start/End: Original strand, 3059933 - 3060344
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||| ||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |    
3059933 tttcatcaaaacacccacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 3060032  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| |||||||  || |||||||| || || |||||| |||||||||    
3060033 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttaacaaaattca-ccatttgagcataattttcacaatttatcatttttacatattt 3060131  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa 402  Q
     |||||| ||| | ||||||| |  |||| |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
3060132 gaacatgtaatttcaccaacagtattacaattatcatcaattaatgcatacaaatatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 3060231  T
403 tcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagac-taaccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttc 501  Q
     ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
3060232 gcaaaattcatataacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagacttacccccttaccttcattatctccaactattagctctagcttc 3060331  T
502 actttggctccta 514  Q
    ||||| |||||||    
3060332 acttttgctccta 3060344  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 11581035 - 11580661
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
11581035 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcgtcctcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 11580936  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
11580935 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 11580836  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||    
11580835 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaataattatccattat 11580736  T
404 ---caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
        ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
11580735 gcaaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaatccccttacctta 11580661  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 36052634 - 36053003
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
36052634 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 36052733  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
    |||||||||||| |||||||||| | ||||| | |||   ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
36052734 caacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaac---aacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36052830  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||| ||    
36052831 aacatgtaattttaccaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacaaacgtatcatcacagttggagtataaatttagcaacaattatccattat 36052930  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
36052931 acaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36053003  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 113 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 47481320 - 47481031
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | | ||||||    
47481320 aaaacaccaacaacaattcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaaaaacatcaattaagagcgataacatc 47481221  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 309  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
47481220 aattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 47481122  T
310 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
     ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
47481121 taatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 47481031  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Original strand, 11516324 - 11516490
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
11516324 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 11516423  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
11516424 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 11516490  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 15441730 - 15441564
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
15441730 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 15441631  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
15441630 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 15441564  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 30262295 - 30262129
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
30262295 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 30262196  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
30262195 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 30262129  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 6e-60
Query Start/End: Original strand, 106 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 18254130 - 18253842
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| || ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
18254130 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatactcaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 18254032  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
18254031 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 18253932  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
18253931 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 18253842  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 8e-50
Query Start/End: Original strand, 113 - 399
Target Start/End: Original strand, 13320988 - 13321278
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  || | |||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||||||    
13320988 aaaacaccaacaacaatccaaattctcatcatcaattcatgaatgtgcaaacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataacatc 13321087  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt--aaaca 307  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||| | |||| |  |||| |||| | |||  ||||||||| ||||||||  ||||| |||||| ||  |||||    
13321088 aattgaacatgaatcatatctcaattcaacaatcaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattt-cataacttgacatttatacatactttgaaaca 13321186  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca 399  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||    
13321187 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatcca 13321278  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 109 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 16479244 - 16478968
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
16479244 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 16479145  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 305  Q
    ||||||||||  ||||||||| | ||||| | ||  | ||| |  | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
16479144 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaaattaaaaataacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 16479045  T
306 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaat 382  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||||    
16479044 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcgcagtaagagcacgaat 16478968  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 106 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25292633 - 25292338
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| |   |||| ||| | || |||  |    
25292633 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcattaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattagtcataatatcaaataacattca 25292535  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |   | |||||| | |||  ||||||| |||||| ||| || ||| ||||||||||    
25292534 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacgacaacctaggagaattcaccaattgagcacaatattcatagcttatcctttttacatattta 25292435  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
25292434 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatacatacaaacatatcatcaaagttggagcacaaatttagcaacaattatccat 25292338  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Original strand, 10989378 - 10989661
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
10989378 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 10989476  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| |  || |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
10989477 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaat-tacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 10989575  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
10989576 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 10989661  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 13572644 - 13572924
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
13572644 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 13572742  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
13572743 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 13572842  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
13572843 aaacatgtaatttcaccaacaatcacacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 13572924  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 124 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 13911292 - 13911024
Alignment:
124 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaag 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| |    
13911292 aacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagaaattattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatg 13911193  T
224 aatcatagctcaattcaactacaacat---gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacc 319  Q
    ||||| | ||||| ||||| ||||| |   |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||    
13911192 aatcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcacc 13911093  T
320 aacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
    |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||    
13911092 aacaatcatacaattaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 13911024  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 389
Target Start/End: Original strand, 2437425 - 2437710
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
2437425 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 2437523  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatt 301  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||  | ||| |||||  | |  ||||||| ||| |||  |||||| |||||||||| |||||| | |||||     
2437524 taacatcatttgaacaagaatcaaatctcatattaacaacaacttaggaaaaattca-ccaattgaacacaatcttcataacttatcatttttgcatata 2437622  T
302 taaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 389  Q
    | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||||    
2437623 tgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 2437710  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 11516265 - 11516337
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
11516265 aatgagatcaacatcaacaatcaaccacaatcataacatatactcatacactccatcataattcaacaacaac 11516337  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15441789 - 15441717
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
15441789 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 15441717  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 30262354 - 30262282
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
30262354 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 30262282  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 296257 - 295900
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| || ||| |||||||||||||| | | |||||||| || | ||||||||||   |||||| ||||  | ||||||    
296257 caccaaaacaccaacacaaattcaatttttcaacatcaatccatgaataagcatacccaatcagtaattcatcaac---aacatcaattaatagcaacaa 296161  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaacta-caacatgtcaaa-ttcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaa 304  Q
    ||||||||| ||| |||||| | | ||||||||  | |||  |  |||| |||| ||||||| | |  ||||| |||||||||||||| |||||| || |    
296160 catcaattgaacatgaatcacaacacaattcaaacatcaatttagcaaaattca-ccatttggatataatttttataacttctcatttttacataattca 296062  T
305 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat- 403  Q
    ||||| ||| | |||||||||||||   |||| ||| ||||||||| ||||||||| || |  | || || |||||||||||||||||| || ||| ||     
296061 acatgaaatttcaccaacaatcataacattatcatcgattcatgcacacaaacataacacctcaattagaacacgaatttagcaacaattattcattatg 295962  T
404 caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 465  Q
    ||||| |||||||||  ||||||||| || ||||||||||  |||||| | ||||| ||||||    
295961 caaaatttcatacaaagtttgaaaatgca-aaaatgatgagaattatgttgaagacaaacccc 295900  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 126738 - 126813
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
126738 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcatttttgctcctatg 126813  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 32493978 - 32493903
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
32493978 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 32493903  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 1936949 - 1936874
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| ||| |||||    
1936949 atgattatgataaaaactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgcttctatg 1936874  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 358 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14114031 - 14113989
Alignment:
358 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14114031 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14113989  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 358 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14423681 - 14423639
Alignment:
358 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14423681 atatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14423639  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Original strand, 13351999 - 13352079
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    ||||||||||| ||||||| || ||| ||||||||| || ||||||  |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
13351999 catcaacaatctaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcccaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 13352079  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 15822723 - 15822691
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
15822723 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 15822691  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 111201 - 111126
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||  |||||| | ||||||||| |||||||||    
111201 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaacttttagctcaagcttcacttttgctcctatg 111126  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17224230 - 17224075
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    |||||||| ||||| || ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| ||||||   | ||||||    
17224230 caattcaccaattttacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcattaacaacatc 17224132  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || ||   ||||||||| |||||||    
17224131 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttacaacaattcaacaacaacat 17224075  T

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Target: scaffold0078 (Bit Score: 318; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 318; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 8 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 37459 - 37066
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatt 107  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
37459 aatgagatcaacattaacaatcaaccacaatcacaacatataatcatacactccatcataattcaacaaaaacttatcatatttcatcaattcacaaatt 37360  T
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
37359 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaactacaacatctattagcatcaaca 37260  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatcca-tttgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||    
37259 acatcaattgcacaagaatcatagctcaatccaactacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaac 37160  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
37159 atgtaatttaaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37066  T

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Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 41632 - 41707
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
41632 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 41707  T

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Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 23)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 109 - 516
Target Start/End: Original strand, 41394191 - 41394602
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
41394191 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaatcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 41394290  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 305  Q
    ||||||||||  ||||||||| | |||||   ||| | ||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||    
41394291 acatcaattgagcaagaatcaaatctcaacataacaataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaa 41394390  T
306 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca 405  Q
    |||| ||  | ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
41394391 catgtaacttcaccaacaatcatacaattatcatcaatttatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatca 41394490  T
406 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcact 504  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
41394491 aaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcact 41394590  T
505 ttggctcctatg 516  Q
    || |||||||||    
41394591 ttagctcctatg 41394602  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 20445646 - 20446019
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |    
20445646 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20445745  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
20445746 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20445845  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
20445846 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20445945  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaac-cccttacctta 473  Q
       ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
20445946 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaactcccttacctta 20446019  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 106 - 461
Target Start/End: Original strand, 20531411 - 20531770
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | |    
20531411 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacagcca 20531510  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     |||||||||||  ||||||||||| | ||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  ||||||||||||  |||| |||||| | | || ||     
20531511 taacatcaattgatcaagaatcataacacaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaccacttatcatttgttcctacttg 20531610  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
20531611 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacatttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 20531710  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa 461  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
20531711 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaa 20531770  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 20931312 - 20931682
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
20931312 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcattaattcatgaatatgcatacccaagaaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 20931411  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||  |  |||| |||| | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
20931412 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaatttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20931511  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
20931512 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 20931611  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||||||    
20931612 caaacttcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattatgataaaggctaacccccttacctta 20931682  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 95 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 20893933 - 20893551
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | ||||||     
20893933 caattcacaaatttcttcaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatttatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaaccacaacatca 20893834  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| ||   | ||||||||||| ||||||||||||  |||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
20893833 attaacagtcataacatcaattgaacaagaatcataaatcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 20893734  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 392  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
20893733 gttcctatttgaacatgtaatttcaacaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcaagaatttagcaacaa 20893634  T
393 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
20893633 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatt-acaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 20893551  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 20913004 - 20913367
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
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20913004 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaagatcaattaacaacca 20913103  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||||||||||      |||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||| |     
20913104 taacatcaattgaacaagaatca------aatt-aacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcataacttatcatttttacatatatg 20913196  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||     
20913197 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccgtaag 20913296  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||||||||||| |||||||||  |||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||    
20913297 caaaattcatacaacaattgaaaatttgcaaaatgaggatgattacgataaagactaacccccttacctta 20913367  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 37844746 - 37844374
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||| |||| || | |    
37844746 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgactcatcaaccacaacatcaattaacaacca 37844648  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttca-taacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||||  |||  |||||||||||| ||  || |||||| | | || ||    
37844647 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcattaattgagcacaattttcactattttatcatttgttcctactt 37844548  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa 402  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||| |    
37844547 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcatgaatttagcaacaattatccatta 37844448  T
403 t--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
37844447 tgcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 37844374  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Original strand, 51452589 - 51452755
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
51452589 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 51452688  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
51452689 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttgaagcacgaatttagcaacaattatccat 51452755  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 389
Target Start/End: Original strand, 22227777 - 22228061
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
22227777 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22227875  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
22227876 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22227975  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 389  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
22227976 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 22228061  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 106 - 389
Target Start/End: Original strand, 22232474 - 22232758
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
22232474 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 22232572  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | ||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
22232573 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaacaattggacacaattttcataacttatcatttttacatatttg 22232672  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 389  Q
    |||||| ||| | || |||||||||||| |||| ||||||||||||| |  || ||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
22232673 aacatgtaatttcactaacaatcatacaattatcatcaattcatgcacaagaaaataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 22232758  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 388
Target Start/End: Original strand, 2116228 - 2116506
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
2116228 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 2116327  T
213 aattgcacaagaatc-atagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 309  Q
    |||||  |||||||| | |  |||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||    
2116328 aattgagcaagaatcaaaatatcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatg 2116427  T
310 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||   ||||||||| |||||    
2116428 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagtaaaagcacgaatctagca 2116506  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 5072672 - 5072388
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
5072672 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 5072574  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
5072573 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 5072474  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
5072473 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 5072388  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 18601402 - 18601118
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||  ||| | || |||  |    
18601402 tttcaccaaaacaccaaca-caactctaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcatattatcaaataacattca 18601304  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
18601303 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaacttaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 18601204  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||| ||||||||||    
18601203 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcatgaatttagca 18601118  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 193
Target Start/End: Original strand, 45051416 - 45051496
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
45051416 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaataacatc 45051496  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 388
Target Start/End: Original strand, 45051554 - 45051674
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || |||||     
45051554 gcacaattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcac 45051653  T
368 agttggagcacgaatttagca 388  Q
    |||  || ||||||| |||||    
45051654 agtaagaacacgaatctagca 45051674  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 51452530 - 51452602
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
51452530 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 51452602  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 21860334 - 21860409
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
21860334 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 21860409  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 442 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 44034903 - 44034829
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 515  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
44034903 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 44034829  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 516
Target Start/End: Original strand, 41218749 - 41218803
Alignment:
462 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||    
41218749 ccccttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 41218803  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 96 - 127
Target Start/End: Original strand, 49967607 - 49967638
Alignment:
96 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
49967607 aattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 49967638  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22143402 - 22143361
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||    
22143402 ttcatgcatacaaacacatcatcatagttagagcacgaattt 22143361  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 462 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 13376763 - 13376711
Alignment:
462 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 514  Q
    |||||||||||||||||| |||| | ||||| | ||||||||||| |||||||    
13376763 ccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaaacttcactttagctccta 13376711  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 462 - 514
Target Start/End: Original strand, 27675139 - 27675191
Alignment:
462 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 514  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
27675139 ccccttaccttaattatctccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 27675191  T

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Target: chr2 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 27)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 95 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 19795011 - 19794586
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaa-caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
19795011 caattcacaa-tttcaccaaaaacaccaacaaaaattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 19794913  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatt 291  Q
     |||| |   || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||    
19794912 aattaacggaaataacatcaattgaacaagaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatt 19794813  T
292 tctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaaca 391  Q
    | | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||    
19794812 tgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacgaca 19794713  T
392 atcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaattatctccaactac 488  Q
    || |||||| ||   ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
19794712 attatccattatgcaaaaattcatacaacatttg-aaatttacaaaataatgatgattatgatgaagactaacccccttaccttaattatctccaactat 19794614  T
489 tagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||| ||||||||| |||| ||||    
19794613 tagctctagcttcacttttgctcttatg 19794586  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 36982737 - 36982364
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
36982737 tttcactaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaacaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 36982638  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
36982637 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttggcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 36982538  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||| ||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
36982537 aacatgtaatttcaccagcaatcttacaattatcatcaattcatgaatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 36982438  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
36982437 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 36982364  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 20627609 - 20627195
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||| || | |    
20627609 tttcatcaaaacaccaacaacatctcaaattatcatcctcaattcatgaatatccatacccaagcaatgattcatcaaccacaacaccaattaacaacca 20627510  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     || |||||||| |||||||| | | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || |||||| |||||||||     
20627509 taaaatcaattgaacaagaattaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaagttatcatttttacatatttg 20627410  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
     ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
20627409 gacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcgtgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccataat 20627310  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttc 501  Q
    || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
20627309 cataattcatacaatatttgaaaattttacaaaatgatgatgattatgataaagactaaccccgttaccttaattatctccaactattagctctagcttc 20627210  T
502 actttggctcctatg 516  Q
    ||||| |||||||||    
20627209 acttttgctcctatg 20627195  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 106 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 43643250 - 43642838
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||| |   ||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||    
43643250 tttcatcaaaacaccaacatc---tcaaattatcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaactacaacatcaattaacagcaa 43643154  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||| | ||  ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| | | |||||     
43643153 tagcatcaattgaacaagaatcatatctcaaattaataacaactaagaaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttgttcctatttg 43643054  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||| |||||  ||    
43643053 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacaaatttagcaacaattatccactat 43642954  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctaactt 500  Q
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    
43642953 gcaaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacctccttcccttaattatctccaactattagctctagctt 43642854  T
501 cactttggctcctatg 516  Q
    |||||| |||||||||    
43642853 cacttttgctcctatg 43642838  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 462706 - 463075
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| || | |    
462706 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattcttatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacgacatcaattaacagcca 462804  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||    
462805 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttatcatttttacatattt 462903  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataa 402  Q
     |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
462904 gaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataa 463003  T
403 tcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
     |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
463004 gcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 463075  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 106 - 467
Target Start/End: Original strand, 8891209 - 8891574
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | |    
8891209 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 8891308  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
8891309 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 8891408  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| |  |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
8891409 aacatgtaatttcgccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatattatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 8891508  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaacccctt 467  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
8891509 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccctt 8891574  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 110 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 24341681 - 24341309
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||||| |||| || ||| |||    
24341681 accaaaacaccaacaataattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaggaacatcaattaacaacaataac 24341582  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 307  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
24341581 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 24341482  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 405  Q
    |  ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||  ||   |    
24341481 tataatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcatgaatttagcaacaattatccaattatgaa 24341382  T
406 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
24341381 aaattcataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 24341309  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 19689567 - 19689401
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
19689567 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 19689468  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
19689467 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 19689401  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Original strand, 23820168 - 23820334
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
23820168 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 23820267  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
23820268 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 23820334  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 14906606 - 14906440
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
14906606 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 14906507  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
14906506 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 14906440  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 113 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 25265679 - 25265390
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||    
25265679 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 25265580  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
25265579 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 25265480  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
25265479 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 25265390  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 115; E-Value: 4e-58
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Original strand, 20015108 - 20015274
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |    
20015108 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcacacaat 20015207  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20015208 tattatcaattcatgcatgcaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20015274  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 106 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 17396948 - 17396653
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| || ||| ||  |||| ||| | || |||  |    
17396948 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattatccattaatcataatatcaaataacattca 17396850  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||  ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||    
17396849 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaatgacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacttattt 17396750  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
17396749 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcaacaattcatgcatac-aacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 17396653  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 109 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 7508138 - 7507894
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
7508138 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 7508039  T
208 acatcaatt-gcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
    |||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| | | |||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| | |||| |||||||||     
7508038 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaatt-aacaacaacttagccaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttattatttttacatatttg 7507941  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 350  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
7507940 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 7507894  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 19886945 - 19886661
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
19886945 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 19886847  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
19886846 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 19886747  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
19886746 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19886661  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 22284278 - 22284353
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
22284278 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctaacttcacttttgctcctatg 22284353  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 378 - 473
Target Start/End: Original strand, 22863169 - 22863267
Alignment:
378 cgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||   ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
22863169 cgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatacaacaattgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 22863267  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 14906665 - 14906593
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
14906665 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 14906593  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 20015049 - 20015121
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
20015049 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 20015121  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 23820109 - 23820181
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
23820109 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 23820181  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 22275045 - 22275120
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
22275045 atgattatgataaaggctaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 22275120  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 443 - 516
Target Start/End: Original strand, 15633538 - 15633612
Alignment:
443 tgattatggtaaagactaacc-ccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||||||||    
15633538 tgattatgataaagactaacctccttaccttaattatctccaactattaactctagcttcacttttgctcctatg 15633612  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 19689600 - 19689554
Alignment:
34 acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
19689600 acaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 19689554  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19669335 - 19669279
Alignment:
161 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 217  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||||    
19669335 atacccaagccatgaatcatcaacaataacatcacttagcaacaacaacatcaattg 19669279  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 25601898 - 25601972
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
25601898 gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 25601972  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 458 - 514
Target Start/End: Original strand, 19660217 - 19660273
Alignment:
458 ctaaccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctccta 514  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| | ||||| | | ||||||||| |||||||    
19660217 ctaaccccttaccttaattatcaccaattcctagcccaagcttcactttagctccta 19660273  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Original strand, 32465813 - 32465845
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
32465813 caattcataaatttcaccaaaacaccaacaaca 32465845  T

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Target: scaffold0266 (Bit Score: 188; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1462
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| | || ||| |||| || | |    
1091 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcacacccaagcaattattcatcaaccacaatatcaattaacaacca 1190  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
1191 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 1290  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
1291 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattattatcaattcatgcatactaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 1390  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaa-ttcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
1391 aaaaattcatacaacatttgaaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 1462  T

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Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 3877 - 3508
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||| ||||  | |||||| |||| |||| |    
3877 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaactctcctcatcaatccatcaatatgcatacccaagcaattattcctcaatcacaacatcaattaacatcca 3779  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
3778 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 3679  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
3678 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatctataat 3579  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||||    
3578 caaaattcatacaacttttgaaaatttacaaaatgaagatgattatgacaaagactaacccccttacctta 3508  T

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Target: scaffold0023 (Bit Score: 187; Significance: 1e-101; HSPs: 2)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 48565 - 48935
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | | |    
48565 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaatagcca 48664  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  | | ||||| |  |||| |||| | | |  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
48665 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctagcaacaacttagcaaaattcaccaactgagcacaattttcacaacttatcattttttcctatttg 48764  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
48765 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataag 48864  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
48865 caaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 48935  T

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Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 366
Target Start/End: Original strand, 36065 - 36323
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||  ||| | || |||  | |||    
36065 accataacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcatattatcaaataacattcataac 36163  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||| |||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | ||     
36164 atctattgaacatgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatatgaat 36263  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||| ||| | |||||||||||||||  ||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
36264 atgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatacatacaaacataacatca 36323  T

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Target: scaffold0077 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 106 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 37209 - 36836
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
37209 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 37110  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||| ||||| | |  ||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
37109 taacgtcaattgaacaagattcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 37010  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||||||| | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||    
37009 aacatgtaatttcaccaacaagcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttaacaacaattatccattat 36910  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttaccttaa 474  Q
       |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
36909 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttaccttaa 36836  T

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Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 462 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 15378 - 15324
Alignment:
462 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| | | ||||||||| |||||||||    
15378 ccccttaccttaattatctccaactattagcccaagcttcacttttgctcctatg 15324  T

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Target: scaffold0195 (Bit Score: 178; Significance: 9e-96; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 9e-96
Query Start/End: Original strand, 106 - 465
Target Start/End: Original strand, 19173 - 19537
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
19173 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 19272  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
19273 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 19372  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
19373 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 19472  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaacccc 465  Q
       ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||| | ||||||||||||    
19473 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaaattatgatgattatgatgaagactaacccc 19537  T

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Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 106 - 400
Target Start/End: Original strand, 21257 - 21553
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
21257 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaa 21356  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
21357 taacatcaattgaacaggaatcataactcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 21456  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21457 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21553  T

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Target: chr6 (Bit Score: 177; Significance: 4e-95; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 95 - 473
Target Start/End: Original strand, 23153403 - 23153786
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||     
23153403 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatccttaattcatgaatatgtatacccaagtaatgattcatcaaccacaacatca 23153502  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | || |||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
23153503 attaacagccataatatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 23153602  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 392  Q
     | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
23153603 gttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagaaacaa 23153702  T
393 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
23153703 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23153786  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 113 - 429
Target Start/End: Complemental strand, 14626407 - 14626089
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
14626407 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 14626308  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtca-aattcatccatttgcaca--attttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 309  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  || |||||| ||| |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
14626307 aattgagcaagaatcaaatctcaagttaacaacaacttagcataattca-ccaattgcacacaattttcataacttatcatttttacatatttgaacatg 14626209  T
310 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaat 409  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||    
14626208 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaataattatccataatcacaat 14626109  T
410 tcatacaacatttgaaaatt 429  Q
    ||| ||||||||||| ||||    
14626108 tcaaacaacatttgagaatt 14626089  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 35009735 - 35009439
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || |||    
35009735 tttcaccaaaacaccaacaataattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaa 35009636  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
    |||||||||||| ||| |  ||  | |  |||||||| ||||||| |  ||||||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||     
35009635 caacatcaattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcaaaacttcacatttttacataattg 35009536  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
35009535 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacttaacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 35009439  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 109 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1658040 - 1657748
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
1658040 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaataa 1657941  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
1657940 catcaactgaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 1657842  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
1657841 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatccaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 1657748  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 109 - 400
Target Start/End: Original strand, 15862443 - 15862734
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
15862443 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattatcagcaataa 15862542  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    ||| ||| | |||||||||||| ||||||||| | | ||| |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
15862543 cataaat-gaacaagaatcataactcaattca-caataacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttatacataattgaac 15862640  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||    
15862641 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagtaacaattatccat 15862734  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 113 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1650382 - 1650105
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
1650382 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 1650283  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    |||||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| ||||||     
1650282 aattgagcaagaatcaaatctcaaattaaccataacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattcttacatatttgaacatgt 1650183  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||  |||||||||| |||||    
1650182 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacgtaacatcacagtaagagcacgaatctagca 1650105  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Original strand, 25175531 - 25175815
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
25175531 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25175629  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
25175630 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25175729  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||    
25175730 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacaacacagcaagagcacgaatttagca 25175815  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 27654267 - 27653983
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
27654267 tttcaccaaaacaccgaca-caattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 27654169  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| | | |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
27654168 taacatcattggaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 27654069  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
27654068 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaagcataacatcacagcaagagcacgaatttagca 27653983  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 16826038 - 16825752
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||||||| |||||||||  |||| |||   || |||  |    
16826038 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataacaaagcaattattcatcaatcataatatcagataacattca 16825940  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaa--catgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||   | |  |||| || | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
16825939 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaaattaggagaaatccaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 16825840  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatca--tacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |  ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
16825839 gaacatgtaatttcaccaacaattaattacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 16825752  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 9e-22
Query Start/End: Original strand, 109 - 242
Target Start/End: Original strand, 27740808 - 27740941
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | |||||||||| || | ||||||   ||  | |||| |    
27740808 caccaaaacaccaacaccaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgcatacccaaaccatgattcatccacaacaacatcagataatagcaacca 27740907  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaac 242  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||||||||    
27740908 catcaattgaacatgaatcatatctcaattcaac 27740941  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 405 - 473
Target Start/End: Original strand, 23148266 - 23148335
Alignment:
405 aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
23148266 aaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 23148335  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 19983224 - 19983149
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
19983224 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 19983149  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 35015089 - 35015014
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
35015089 atgattatgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 35015014  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 95 - 249
Target Start/End: Complemental strand, 18381975 - 18381821
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| | ||||||    
18381975 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaacaacatc 18381877  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaaca 249  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| || || || | ||||||||| ||||||    
18381876 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgactcttatcacaattcaacaacaaca 18381821  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 400
Target Start/End: Original strand, 27751605 - 27751688
Alignment:
317 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||| | || ||||||||||||||| ||| | ||||||    
27751605 accaacaatcatacaattgtcatcaattcatgcatacaaacataacatcacaattagagcacgaatttagctacatttatccat 27751688  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 203 - 400
Target Start/End: Original strand, 29665937 - 29666137
Alignment:
203 caacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatat 300  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| |||| |||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | ||||||| ||||||||  ||||| | ||||     
29665937 caacaacatcaattgaacatgaatcatatctcatttcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattt-cataacttgacatttatgcatac 29666035  T
301 tt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 398  Q
    ||  ||||||| ||| | ||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||  || ||| ||||| || | ||||||||||||| ||||||| ||||    
29666036 tttgaaacatgtaatttcacccacaatcatacaattatcatcaattcatacataagaaaataacatcacagctagagcacgaatttaacaacaattatcc 29666135  T
399 at 400  Q
    ||    
29666136 at 29666137  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 15889914 - 15889853
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||||||||| || ||||||| |||||| |||||||    
15889914 catcaacaatcaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcacaattcatcaacaac 15889853  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 18583640 - 18583715
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||    
18583640 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 18583715  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 120 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 22362032 - 22361926
Alignment:
120 caacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgc 218  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||| |||| |||||||| | || |||  |||||| |||||||||||||||     
22362032 caacaacaactcaa-ttctcatcatcaattcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcaacaacaatatcacttagcaacaacaacatcaattga 22361934  T
219 acaagaat 226  Q
    ||| ||||    
22361933 acatgaat 22361926  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 22 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25640760 - 25640702
Alignment:
22 caacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||||||||  | ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||||||||    
25640760 caacaatcaaccacaacaacaacttataatcatgcattccatcaaaattcaacaacaac 25640702  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16887833 - 16887792
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||    
16887833 ttcatgcatacaaacatattatcatagttagagcacgaattt 16887792  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 124
Target Start/End: Original strand, 32898745 - 32898774
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
32898745 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 32898774  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Original strand, 33324898 - 33324939
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
33324898 ttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 33324939  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 35136054 - 35136013
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
35136054 ttcatgcatacaaacatatcatcctagttagagcacgaattt 35136013  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 15005114 - 15005034
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    |||||| ||||||| |||| || ||| ||||||||| || || |||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
15005114 catcaataatcaactacaaccacaacttataatcattcattctatcacaattcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 15005034  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22585754 - 22585674
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    |||||||||||||| | || || ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
22585754 catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaatt 22585674  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 19 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 22590585 - 22590505
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
    |||||||||||||| | || || ||| ||||||||| || | ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| ||||||    
22590585 catcaacaatcaactataaccacaacttataatcatgcattgcatcacaattcaacaacaacatgtcataattcttcaatt 22590505  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 25367490 - 25367374
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagct 233  Q
    ||||||||| |||| |||||| |||| | |||||||| |||| | ||| |  | ||||||  |||||| ||||||||||||||| ||| ||||| || |     
25367490 ttctcatcaacaattcatgaatcatgcacacccaagccatgaattatcgataacaacatcacttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatcttatca 25367391  T
234 caattcaactacaacat 250  Q
    ||||||||| |||||||    
25367390 caattcaacaacaacat 25367374  T

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Target: chr5 (Bit Score: 175; Significance: 6e-94; HSPs: 34)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 6e-94
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 23506932 - 23507302
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| || | |    
23506932 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 23507031  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
23507032 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 23507131  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||     
23507132 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattatccataag 23507231  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||||||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
23507232 caaaattcatacaacatttgaaatcttacaaaatggagatgattatgataaagactaacccccttacctta 23507302  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 95 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 27182854 - 27182471
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||     
27182854 caattcaaaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatactcaagcaatgattcatcaaccacaacatca 27182755  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| ||||||    
27182754 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcattt 27182655  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 392  Q
     | | ||||| |||||| ||| | | ||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
27182654 gttcctatttgaacatgtaatttcatcaacaatcatacaattatcatcagttcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcatgaatttagcaacaa 27182555  T
393 tcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    | |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
27182554 ttatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 27182471  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 114 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 18531355 - 18530988
Alignment:
114 aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatca 213  Q
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18531355 aaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccgagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataacatca 18531256  T
214 attgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
18531255 attgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 18531157  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc-ataatcaaa-a 408  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| || || ||| |    
18531156 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaaaca 18531057  T
409 ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgat---gattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||   ||||||| | |||||||| ||||||||||||    
18531056 ttcataccacatttgaaaaattgcaaaatgatgatgacgattatgatgaagactaacccccttacctta 18530988  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 110 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 22054125 - 22053753
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || ||| |||    
22054125 accaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtagacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataac 22054026  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 307  Q
    |||||||| ||| |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
22054025 atcaattgaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 22053926  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 405  Q
    || ||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |    
22053925 tgtaatttcaccaacaatcatacaactatcatcaattcatacatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 22053826  T
406 aaattcatacaacatttgaaaa--ttcacaaa--atgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| |||  ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
22053825 aaattcataccacatttgaaaaatttcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaacccccttacctta 22053753  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Original strand, 20623066 - 20623232
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
20623066 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 20623165  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
20623166 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 20623232  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 21233694 - 21233528
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
21233694 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatatttaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 21233595  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
21233594 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 21233528  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 238 - 400
Target Start/End: Original strand, 37052844 - 37053007
Alignment:
238 tcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttat 336  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
37052844 tcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcatttccacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaattat 37052943  T
337 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
37052944 tatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 37053007  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Original strand, 16536294 - 16536460
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
16536294 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 16536393  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
16536394 tattataaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 16536460  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 400
Target Start/End: Original strand, 34939248 - 34939540
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaa 208  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| || ||| ||    
34939248 caccaaaacaccaacaacaattcaaattttcatcacctattcatgaatatgcatacccaagcagtgattcatcaacaacaacatcaattaacagcaataa 34939347  T
209 catcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattc-atccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaac 306  Q
    |||||| || |||||||||||| ||||||||| | |  || |  |||| || ||| |||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||| || |||    
34939348 catcaactgaacaagaatcataactcaattca-caatgacttagcaaaatccatcaattgagcacaattttcataacttcacatttttacataattgaac 34939446  T
307 atggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||  || | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||| | ||||||    
34939447 atgtgatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacagttatccat 34939540  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 235 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 25900571 - 25900408
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||  ||| ||||||||||||||||| |    
25900571 aattcaacaacaacatgtcaa-ttcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatataatttaaccaacaatcatacaat 25900473  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcc 398  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
25900472 tatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatcc 25900408  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 22366765 - 22366481
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
22366765 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 22366667  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
22366666 taacatcatttgaacaagcatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 22366567  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
22366566 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 22366481  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Original strand, 25426596 - 25426880
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
25426596 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 25426694  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
25426695 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 25426794  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
25426795 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 25426880  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 18778276 - 18777995
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | ||  ||  |    
18778276 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataatattca 18778178  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
18778177 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 18778078  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 385  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
18778077 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 18777995  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Original strand, 12342 - 12626
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
12342 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 12440  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| ||| || | ||||| |    
12441 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcacttttgcatatat 12540  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
12541 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 12626  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Original strand, 19499867 - 19500151
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| ||| |||||  |||| ||| | || |||  |    
19499867 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcataccaaagcaattattaatcaatcataatatcaaataacattca 19499965  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
19499966 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 19500065  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
19500066 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 19500151  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 106 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 21073879 - 21073595
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
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21073879 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattga 21073781  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatc-catttgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||  |    ||||||| | | || ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
21073780 taacatcatttgaacaagaatcacaactcaaattaacaacaacttagaagaaattcaccactttagcacaatcttcataacttatcatttttgcatatat 21073681  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
     |||||| ||| | ||||||||| |||||  ||  ||| ||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||||||    
21073680 gaacatgtaatttcaccaacaattatacaactaacatccattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagca 21073595  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 125 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 4200251 - 4199985
Alignment:
125 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
4200251 acaattcaaattctcatcatcaacccatgaatatgcaaacccaagcaatcattcatcaatcataatatcaaataacattcataacatcaattgaacatga 4200152  T
225 atcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaa 321  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||||  |  ||||||| | |||| ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||    
4200151 atcacatctcaaatcaacaacaacataagagaaattcaccaatttagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaa 4200052  T
322 caatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagca 388  Q
    ||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| |    ||||||||||||||||    
4200051 caatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagca 4199985  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 17471956 - 17471768
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaatttcaccaaaaca 118  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||  |||||||||||| | |||||        |||||| |||||||||||||||    
17471956 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatgtttcaacaacaacatgtcata--------attcaccaatttcaccaaaaca 17471865  T
119 ccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 215  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||||||||||||||||  || ||||||||  ||| ||  ||||||||||||    
17471864 ccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcgtacccaagcaatgattcattcacaataacatcagttaacaataacaacatcaat 17471768  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
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Target Start/End: Complemental strand, 43443679 - 43443398
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106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
43443679 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaatcctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43443581  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| |||||| ||| | ||||| ||||| |||||  |    ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| |    
43443580 taacatcatttgaacaagactcacatctcaaatcaacaacaacttagaagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttgcatatat 43443481  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 385  Q
     |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||    
43443480 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattta 43443398  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 27009809 - 27010089
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106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
27009809 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 27009907  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  | ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
27009908 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagtacaatattcataacttatcatttttacatattt 27010007  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
27010008 aaacatgtaatttcaccaacactcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 27010089  T

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Target: chr5; HSP #21
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Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 20623007 - 20623079
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    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
20623007 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 20623079  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 21233753 - 21233681
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8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
21233753 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 21233681  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 268 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 29188404 - 29188284
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268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
29188404 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 29188305  T
368 agttggagcacgaatttagca 388  Q
    |||  |||||||||| |||||    
29188304 agtaagagcacgaatctagca 29188284  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 187
Target Start/End: Complemental strand, 29190552 - 29190478
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactat 187  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
29190552 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactat 29190478  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 25900630 - 25900558
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8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
25900630 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 25900558  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 37052782 - 37052854
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8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
37052782 aatgagatcaacatcatcaatcaaccacaatcataacatataatcataccctccatcataactcaacaacaac 37052854  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 16536235 - 16536307
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
16536235 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatacaatcataccctccatcataattcaacaacaac 16536307  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 117 - 250
Target Start/End: Original strand, 19862186 - 19862319
Alignment:
117 caccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaat 215  Q
    |||||||||||| |||  |||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||  |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||    
19862186 caccaacaacaactcat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagtcatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaat 19862284  T
216 tgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
    |||||| || || || | ||||||||| |||||||    
19862285 tgcacatgattcttatcacaattcaacaacaacat 19862319  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 250
Target Start/End: Original strand, 23493885 - 23494029
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatca 204  Q
    |||||||||| || ||||||||| | |  |||||||||||||  ||||||  ||| | |||||||| |||| |||||| | | ||||||  |||||| ||    
23493885 tttcaccaaaccaacaacaacaacttat-ttctcatcatcaaatcatgaattatgaacacccaagccatgaatcatcatcaacaacatcacttagcaaca 23493983  T
205 acaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
    ||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||||| |||||||    
23493984 acaacatcaattgaacatgaatcttatcacaattcaacaacaacat 23494029  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 2031684 - 2031758
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
2031684 gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 2031758  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 516
Target Start/End: Original strand, 11584394 - 11584448
Alignment:
462 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||    
11584394 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 11584448  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21310750 - 21310709
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||    
21310750 ttcatgcattcaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 21310709  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 23981557 - 23981516
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
23981557 ttcatgcatacaaacatatcatcataattagagcacgaattt 23981516  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 321 - 393
Target Start/End: Original strand, 32950879 - 32950951
Alignment:
321 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||| || || || ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
32950879 acaatcatacaattatcatcaaatcatacacacgaaaataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaat 32950951  T

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Target: scaffold0106 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 95 - 473
Target Start/End: Original strand, 41686 - 42066
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||||||| ||| |||| |     
41686 caattcacaa-tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctaataatcaattcatgaatatgcatacccaaccaatgattcatcatctacaacaaca 41784  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcattt 292  Q
    |||| || | | | ||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| || || ||||||    
41785 attaacagccatagcatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaaattatcattt 41884  T
293 ctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaa 392  Q
     ||||||||| | |||| ||| | |||||||||   ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
41885 ttacatatttgagcatgtaatttcaccaacaatatgacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaa 41984  T
393 tcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    | |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||    
41985 ttatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagaccaacccccttacctta 42066  T

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Target: scaffold0175 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 1250 - 882
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  |||||||  |||| |||| |    
1250 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacataaattaacatcca 1152  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||||| |||  |||||||||||| ||||| | |||| |||||||||     
1151 taacatcacttgaacaagaataaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttattatttttacatatttg 1053  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
1052 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 953  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    || |||||||||||||||||| ||||   ||| ||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
952 cacaattcatacaacatttgagaatttgtaaagtgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 882  T

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Target: scaffold0302 (Bit Score: 157; Significance: 3e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 12083 - 12450
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| ||  |||||||| |||| |||  |    
12083 tttcactaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatgaatcataacatcaattaacattca 12181  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | |||||||  || ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| |||| |||||    
12182 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt--acaacaacttaacaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttttacacattta 12279  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| | | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
12280 aacatgtattttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccataat 12379  T
404 caaaa-ttcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| || ||||||| | |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
12380 caaaatttcatacagcatttgaaagtt-acaaaattaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 12450  T

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Target: scaffold0008 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 128464 - 128095
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
128464 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaatcaattattcatcaatcacaacatccattaacatcca 128365  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| |||||  ||  | |||| ||||     
128364 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacctaacaaaattcgccaattgagcacaattttcacaacttaacacctttacacatttg 128266  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||     
128265 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttgaagcacgaatttagcaacaattatccataag 128166  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
128165 caaaattcatacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 128095  T

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Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 125 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 31942 - 31697
Alignment:
125 acaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaaga 224  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||  | || |||  | ||||||||||| ||| ||    
31942 acaattcaaattctcatcattaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatattaaataacattcataacatcaattgaacatga 31843  T
225 atcatagctcaattcaactacaac---atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaacca 320  Q
    |||| | ||||| ||||| |||||   | |  ||||||| | |||  ||| ||| |||||||||| |||||| | ||||| | || ||| ||| | ||||    
31842 atcacatctcaaatcaacaacaactttaggagaaattcaccaattgagcataatattcataacttatcatttttgcatatatgaatatgtaatttcacca 31743  T
321 acaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||||||||  ||  |||||||||||||| |||||||| |||||    
31742 acaatcatacaactaacatcaattcatgcattcaaacataacatca 31697  T

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Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 99 - 127
Target Start/End: Original strand, 22650 - 22678
Alignment:
99 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
22650 tcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 22678  T

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Target: scaffold0413 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 6358 - 5990
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||   |||| |||| |    
6358 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcataacaaaaattaacatcca 6260  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||| ||| |||||||||| | ||||||| ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| | |||| |||||||||     
6259 taacatcacttgaacaagaatcaaatctcaatt-aacaacaacttagcaaaattcaccaattcagcacaatttttacaacttattatttttacatatttg 6161  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
6160 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccataat 6061  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    || |||||||||||||||||| ||||  |||| |||  ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
6060 cacaattcatacaacatttgagaatttgcaaagtgaaaatgattatgataaagactaacccccttacctta 5990  T

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Target: scaffold0012 (Bit Score: 155; Significance: 5e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 5e-82
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 247738 - 247366
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| | |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| ||   |    
247738 tttcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcagttcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagtca 247639  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||| |  |||| |   ||| |||  ||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
247638 taacatcaattgaacaagaatcataactcaatctaacaacaacttagcaaaatttaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 247539  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||  |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
247538 aacatgaaatttcaccctcaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaattatccattat 247439  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
       ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
247438 gcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 247366  T

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Target: scaffold0001 (Bit Score: 154; Significance: 2e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Original strand, 171781 - 172242
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaa 105  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | |  ||        |||||| ||    
171781 gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgttgta--------attcaccaa 171872  T
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | || |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
171873 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 171971  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
171972 taacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 172071  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
172072 aacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataat 172171  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
172172 caaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 172242  T

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Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Original strand, 177484 - 177945
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaa 105  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| |||||||||||| | |  ||        |||||| ||    
177484 gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgttgta--------attcaccaa 177575  T
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||| | || |||  |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
177576 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttcttaacaacaaatcatgaatatgcatacctaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcca 177674  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
177675 taacatcaattgaacaagaatcgtaactcaattcaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 177774  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
177775 aacatgtaatttcaccatcaatcatacaattatcatcaattcatccatacaaacatatcatcacagttggagcacgtatttagcaacagttatccataat 177874  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
177875 caaaatttatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 177945  T

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Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 70914 - 70882
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
70914 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 70882  T

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Target: scaffold0011 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 123460 - 123087
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||| || |||||||||| | |||||| |||| || | |    
123460 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcttcaattcatgaatatgcatacccaagccattattcatcaaccacaacatcaattaacaacca 123361  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| || |||  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
123360 taacatcaattgaacaagaatcataacttaatctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 123261  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
123260 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacaattggagcacgaatttagcaacaattatccattat 123161  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac-aaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
       ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
123160 gcaaaaattcatacaacatttgcaaatttacaaaaattatgatgattatggtgaagactaacccccttacctta 123087  T

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Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 255106 - 255074
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
255106 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 255074  T

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Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 95 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 261712 - 261680
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaaca 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
261712 caattcacaaatttcacgaaaacaccaacaaca 261680  T

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Target: scaffold0218 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 106 - 464
Target Start/End: Complemental strand, 5356 - 4996
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
5356 tttcatcaaaacaccaacaaca-ttcaaattctcatcctcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 5258  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
5257 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaactttgcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 5158  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| | | | |||||||||| |||| |||| ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
5157 aacatgtactttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcgtcacagttggagtacgaatttagcaacaattatccattat 5058  T
404 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaaccc 464  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
5057 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgataatgattatgataaagactaaccc 4996  T

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Target: scaffold0498 (Bit Score: 143; Significance: 7e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 7e-75
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Original strand, 8846 - 9215
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
8846 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatacatgaatatgcatacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 8944  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||  ||||| |||||| ||     
8945 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttaacatttttacataattg 9044  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||||||||| ||||| |  |||||||||||||||||||||||  |||||||     
9045 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcgattcatgcatacaaacataacatcacaaatggagcacgaatttagcaacaattttccataag 9144  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
9145 caaaattcgtacaacttttgaaaatttgcaaaatgaagatgattatgataaagactaacccccttacctta 9215  T

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Target: scaffold0162 (Bit Score: 140; Significance: 4e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 106 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 26710 - 26340
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||| || ||| |||||||||||||||||||||||  | |||||| |||| || | |    
26710 tttcatcaaaacaccaacaacact-caaattctcatcctcaattcatcaatatgcatacccaagcaatgattcatcaatcacaacatcaattaacagcca 26612  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||||| |||| |  ||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
26611 taacatcaattgaacaagaatcataactcattctaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagaacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 26512  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| | | | ||||| |||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||    
26511 aacatgtactttcaccaataatcttacaattatcatcaattcacgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatacattat 26412  T
404 -caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
      ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
26411 gaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatcatgattatgataaagactaacccccttacctta 26340  T

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Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 113 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 8466 - 8180
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||| | |||||| |||| || ||||||||||    
8466 aaaacaccagcaacaattcaaattctcatcatcaattcatgtatatgcatacccaagccatgattcataaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 8367  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  ||||||||   |||||  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||| ||     
8366 aattgaacatggttctcatcataattcaac---aacatagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacctgt 8270  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
8269 aatttcaccaacaatcatacaattatcaccaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 8180  T

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Target: scaffold0025 (Bit Score: 137; Significance: 3e-71; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 3e-71
Query Start/End: Original strand, 110 - 462
Target Start/End: Original strand, 8820 - 9180
Alignment:
110 accaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaac 209  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||  | ||| |||    
8820 accaaaacaccaacaaaaattcaaattttcatcatcaattcatgaatatgtatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcaattaatagcaataac 8919  T
210 atcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaaca 307  Q
    |||||||| |||  ||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||    
8920 atcaattgaacattaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaaca 9019  T
308 tggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatcca--taatca 405  Q
    || ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||  ||   |    
9020 tgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagatggagcacgaatttagcaacaattatccaattatgaa 9119  T
406 aaattcatacaacatttgaaaattcacaaa----atgatgatgattatggtaaagactaac 462  Q
    |||| ||||| ||||||||||| |  ||||    ||||||||||||||| | |||||||||    
9120 aaatacataccacatttgaaaaattgcaaaaatgatgatgatgattatgatgaagactaac 9180  T

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Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 106 - 432
Target Start/End: Original strand, 148688 - 149018
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||  |||||||||||||||||||||||| | ||| || |||| || | |    
148688 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatacatacccaagcaatgattcatcaaccacaacttcaattaacaacca 148787  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||||||||     
148788 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacatatttg 148887  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||| || ||    
148888 aacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacaaatttaacaacaattatcaattat 148987  T
404 --caaaattcatacaacatttgaaaattcac 432  Q
       |||||||||||||||||||||| |||||    
148988 gcaaaaattcatacaacatttgaaatttcac 149018  T

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Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 374 - 473
Target Start/End: Original strand, 146838 - 146938
Alignment:
374 agcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctt 472  Q
    |||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
146838 agcatgaatttaggaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctt 146937  T
473 a 473  Q
    |    
146938 a 146938  T

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Target: scaffold0009 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 6 - 473
Target Start/End: Original strand, 271901 - 272362
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaattcacaaa 105  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||| || | || ||        |||||| ||    
271901 gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaactacatgtctta--------attcactaa 271992  T
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    |||||| ||| ||||||||||||| ||  |||||   | |||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| || | |    
271993 tttcacaaaaccaccaacaacaatccat-ttctctataacaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattaacagcta 272091  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     |||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| ||||| |  |||| |||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||| | | |||||     
272092 taacaccaattgaacaagaatcataactcaatccaaccacaacttagcaaaattcaccaatttagcacaattttcacaacttatcatttgttcctatttg 272191  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat 403  Q
    |||||| ||| |  ||| |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| | | |||||||||    
272192 aacatgtaatttctccatcaatcatacaattatcatcaattcattcatacaaacatatcattacagttggagtacgtatttagcaatatttatccataat 272291  T
404 caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
272292 caaaatttatacaatatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaacccccttacctta 272362  T

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Target: scaffold0049 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 106 - 393
Target Start/End: Original strand, 48155 - 48443
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
48155 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaatatgcatacccaggcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcta 48253  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||     
48254 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttaacaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttatcatttttacacatttg 48353  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
48354 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagcaacaat 48443  T

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Target: scaffold0018 (Bit Score: 126; Significance: 1e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 268 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 51314 - 51121
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||||| ||| | |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
51314 gcacaattttcacaacttatcatttttacctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcttacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 51215  T
368 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatcaaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa 461  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
51214 agttggagcacgaatttagcaacaattatccataagcaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgattatgataaagactaa 51121  T

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Target: scaffold0141 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Original strand, 26892 - 27058
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
26892 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 26991  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
26992 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 27058  T

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Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 4e-61
Query Start/End: Original strand, 235 - 393
Target Start/End: Original strand, 22637 - 22796
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
22637 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 22736  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
22737 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 22796  T

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Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 22578 - 22650
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
22578 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 22650  T

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Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Original strand, 26833 - 26905
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
26833 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 26905  T

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Target: scaffold0124 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 235 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1582
Alignment:
235 aattcaactacaacatgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacact 333  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
1748 aattcaacaacaacatgtcaaattcatccattttgcacaattttcataacttttcattttcacatattcaaacatgtaatttaaccaacaatcatacaat 1649  T
334 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
1648 tattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 1582  T

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Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1807 - 1735
Alignment:
8 aatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
1807 aatgagatcaacatcatcaatcaactacaatcataacatataatcataccctccatcataattcaacaacaac 1735  T

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Target: scaffold0125 (Bit Score: 116; Significance: 9e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 9e-59
Query Start/End: Original strand, 113 - 400
Target Start/End: Original strand, 41622 - 41911
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| || ||||||||||    
41622 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaacaacaacatcatttaacaacaacaacatc 41721  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 309  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||| ||| |||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
41722 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 41820  T
310 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||    
41821 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttaacaacaattatccat 41911  T

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Target: scaffold0132 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 113 - 400
Target Start/End: Original strand, 13480 - 13769
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||| |||||||||  ||||||||||||| | |||||| |||| || ||||||||||    
13480 aaaacacctacaaaaattcaaattctcatcgtcaattcatgaatatgcatacccaagtcatgattcatcaacaacaacatcaattaacaacaacaacatc 13579  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    ||||| ||| |  ||  | |  |||||||| |||||||  |||| |||||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||     
13580 aattgaacatggttctcatcataattcaacaacaacatagcaaaattcatcaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatgt 13679  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||    
13680 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaaagttagagcacgaatttagcaacaattatccat 13769  T

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Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 42677 - 42749
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||||   |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
42677 atgattatgataaaaactaacccccttacctt---tatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 42749  T

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Target: scaffold0026 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 106 - 393
Target Start/End: Original strand, 107715 - 108003
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  | |||||| |||| |||| |    
107715 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcacaacatcaattaacatcca 107813  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | ||||| |||| | |||  |||||||||| | ||||| |||||| | || ||||     
107814 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttatcaaaattcaccaattgagcacaatttttacaacttatcatttttgcacatttg 107913  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||    
107914 aacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcattacagttggagcacgaatttagtaacaat 108003  T

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Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 64812 - 64527
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
64812 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 64714  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
64713 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatattcataacttatcatttttacatattt 64614  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatc-----aattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || |||     |||||||||||| ||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
64613 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaatataattcatgcatataaacataacatcacagcaagagcacgaattt 64527  T

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Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 89905 - 89863
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattta 385  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
89905 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagcacgaattta 89863  T

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Target: scaffold1542 (Bit Score: 111; Significance: 9e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 9e-56
Query Start/End: Original strand, 108 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 828 - 534
Alignment:
108 tcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| | | |    
828 tcaccaaaacaccaacaaccattcaaattctcatcctcaattcctgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatcaattagcagccata 729  T
208 acatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaa 305  Q
    |||||||||  |||||||||||| || |||  |||   ||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||  |||||| | | ||||| ||    
728 acatcaattaaacaagaatcataacttaatctaacagtaacttagcaaaattcaccaattgagtacaattttcacaactcatcatttgttcctatttgaa 629  T
306 catggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
628 catgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacatatcatcacagttggagcacgaatttagcaacaattatccat 534  T

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Target: scaffold0028 (Bit Score: 102; Significance: 2e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 268 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 89586 - 89378
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    |||||||||||| ||||| | |||| | | ||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||     
89586 gcacaattttcacaacttataatttgttcctatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaatatatcatcac 89487  T
368 agttggagcacgaatttagcaacaatcatccataat--caaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgattatggtaaagactaa-ccc 464  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||   |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| |||    
89486 agttggagcacgaatttagcaacaattatccattatgcaaaaattcatagaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgatcatgatgaagactaacccc 89387  T
465 cttacctta 473  Q
    |||||||||    
89386 cttacctta 89378  T

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Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 349 - 473
Target Start/End: Complemental strand, 107835 - 107708
Alignment:
349 catacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccataatc--aaaattcatacaacatttgaaaattcacaaaatgatgatgat 446  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
107835 catacaaatatatcatcacagttggagcacgaatttagcaaaaattatccattatgcaaaaattcatacaacatttgaaaatttacaaaatgatgatgat 107736  T
447 tatggtaaagactaa-ccccttacctta 473  Q
     ||| | |||||||| ||||||||||||    
107735 catgatgaagactaacccccttacctta 107708  T

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Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 217
Target Start/End: Original strand, 79533 - 79616
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 217  Q
    ||||||||| |||| ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||| |||| |||  |||||| |||||||||||||||    
79533 ttctcatcaccaattcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaacaataatatcacttagcaacaacaacatcaattg 79616  T

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Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Original strand, 79745 - 79786
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||    
79745 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagtgcacgaattt 79786  T

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Target: scaffold0075 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 109 - 400
Target Start/End: Complemental strand, 34755 - 34460
Alignment:
109 caccaaaacaccaacaacaattcaaa-ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||| ||||||||| | |||||||||||| | |||||| | || || ||| |    
34755 caccaaaacaccaacaacaattcaaaattttcatcatcaatccatgaatatgcatacccaagtagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaata 34656  T
208 acatcaattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaa 304  Q
    |||||||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  | |||||||||| ||||||  |||| |||| | || |    
34655 acatcaattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcacctattgagaacaattttcacaacttcatatttttacacaattga 34556  T
305 acatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    ||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||    
34555 acatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagttagagcacgaatttagcaataattatccat 34460  T

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Target: scaffold0529 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 389
Target Start/End: Original strand, 2936 - 3215
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||| |||||||||||| | |||||| | || || ||| ||||||    
2936 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacacaagcagtgattcatcaacaacaacatcaaataacaacaataacatc 3035  T
213 aattgca-caagaatcatagctcaattcaactacaacatgtcaaa-ttcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatg 309  Q
    ||||  | || |||||||| ||||||||||| ||||| |  |||| |||| | |||  |||||||||||| |||||| ||||| |||||| || ||||||    
3036 aattaaaacatgaatcatatctcaattcaacaacaacttagcaaaattcaccaattgagcacaattttcacaacttcacatttttacataattgaacatg 3135  T
310 gaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 389  Q
     ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||   |||||||||||||||||    
3136 taatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatggatacaaacataacatcacagcaagagcacgaatttagcaa 3215  T

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Target: scaffold0215 (Bit Score: 96; Significance: 8e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 9626 - 9371
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
9626 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 9527  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
9526 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 9427  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
9426 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 9371  T

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Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 113 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16524 - 16269
Alignment:
113 aaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatc 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| || | | ||||||    
16524 aaaacaccaacaacaattcaaattctcataatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaactacaacatcaattaacaaccataacatc 16425  T
213 aattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatgg 310  Q
    | |||  ||||||||| | ||||| | ||| | ||| | |  ||||||| | |||  |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| ||||||     
16424 atttgagcaagaatcaaatctcaaattaacaataacttagcaaaattcaccaattgagcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgt 16325  T
311 aatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
16324 aatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatca 16269  T

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Target: scaffold0622 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 95 - 237
Target Start/End: Original strand, 9338 - 9480
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatct 194  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||     
9338 caattcaccattttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaattcatgaatatgcatacccaagcaatgattcatcaaccacaacatca 9437  T
195 attagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaat 237  Q
    |||| || | | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
9438 attaacagccataacatcaattgaacaagaatcataactcaat 9480  T

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Target: scaffold0772 (Bit Score: 82; Significance: 2e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 268 - 393
Target Start/End: Original strand, 5660 - 5785
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    ||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||||    
5660 gcacaatattcatgacttatcatttttacatatttaaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcaa 5759  T
368 agttggagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
5760 agttggagcacgaatttagcaacaat 5785  T

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Target: scaffold0076 (Bit Score: 80; Significance: 3e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 365
Target Start/End: Original strand, 42965 - 43226
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||| ||| | || |||  |    
42965 tttcaccaaaacaccaaca-caatttaaattctcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataatatcaaataacattca 43063  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac--atgtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||| |||||| | ||||| | ||| |||||  | |  ||||||| | |||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||    
43064 taacatcacttgaacacgaatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaatttagcacaatcttcataacttaacatttttacatattt 43163  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatc 365  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||    
43164 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatagaaacataacatc 43226  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 77; Significance: 2e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 5498 - 5254
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  | |||||| |||| |||  |    
5498 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgca-acccaagcaattattcattaatcacaacatcaattaacattca 5401  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaac-atgtcaaattcatccatttg--cacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| |||||   |  ||||||| ||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
5400 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaactcagcaaaattca-ccaattgaacacaattttcataacttatcatttttacatattt 5302  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 350  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
5301 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 5254  T

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Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 383
Target Start/End: Complemental strand, 102963 - 102923
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 383  Q
    ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||    
102963 ttcatgcattcaaacatatcatcataattggagcacgaatt 102923  T

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Target: scaffold0369 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 106 - 350
Target Start/End: Original strand, 3690 - 3936
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| ||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
3690 tttcaccaaaacatcaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagtaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 3788  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatttg-cacaattttcataacttctca-tttctacatattt 302  Q
     ||||||||||| |||||||||| | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | ||| | |||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||    
3789 taacatcaattgaacaagaatcaaatctcaaattaacaacaacttagcaaaattcaccaattggacacaatttccataacttatcattttttacatattt 3888  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgca 350  Q
     |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
3889 gaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgca 3936  T

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Target: scaffold0116 (Bit Score: 71; Significance: 6e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 384
Target Start/End: Original strand, 3 - 283
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| |||||| ||| | ||||||||||| |||||| ||  |||| ||| | || |||  |    
3 tttcaccaaaacaccaaca-caactcaaattctcatcaacaattcatgaatatgcaaacccaagcaattattcattaatcataatatcaaataacattca 101  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat--gtcaaattcatccattt-gcacaattttcataacttctcatttctacatattt 302  Q
     ||||||| ||| ||||| |||| | ||||| | ||| ||||| |  |  ||||||| | |||  ||||||| | |||||||| |||||| |||||||||    
102 taacatcatttgaacaagcatcacatctcaaattaacaacaacttaggagaaattcaccaattgagcacaatatacataacttatcatttttacatattt 201  T
303 aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||| ||| | ||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||| ||||| ||   ||||||||||||    
202 aaacatgtaatttcaccaacaatcatacaatcatcatcaattcatgcatacaaacataacatcacagcaagagcacgaattt 283  T

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Target: scaffold0139 (Bit Score: 67; Significance: 2e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 14344 - 14083
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| |  | |||  |    
14344 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaacaacattca 14246  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||| ||||| |||||||||  | ||||| | | | ||||| | |  ||||||| | |||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||     
14245 taacattaattgaacaagaatccaatctcaaattatcaacaacttaggaaaattcaccaattgagcacaatcttcataacttatcatttttacatatttc 14146  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatca 366  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
14145 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattcatgcatacagacataacatca 14083  T

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Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 106 - 389
Target Start/End: Complemental strand, 21399 - 21115
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||| |||||||||| ||| | || |||||||| |||||||||  |||||||| | || |||  |    
21399 tttcaccaaaacaccaaca-cagttcaaattttcatcattaatccatgaatatgcaaactcaagcaattattcatcaatcataacatcaaataacattca 21301  T
206 caacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat-gtcaaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacatattta 303  Q
     ||||||||||| |||||||||  | ||||| | ||| ||||| | |  ||||||| | |||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||     
21300 taacatcaattgaacaagaatccaatctcaaattaacaacaacttaggaaaattcaccaattgagctcaatcttcataacttatcatttttacatatttg 21201  T
304 aacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaa 389  Q
    |||||| ||| | || |||||||||| | |||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||| |    |||||||||||||||||    
21200 aacatgtaatttcactaacaatcatataattatcatcaattaatggatacaaacataacatcacaacaagagcacgaatttagcaa 21115  T

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Target: scaffold0104 (Bit Score: 59; Significance: 9e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Original strand, 48482 - 48603
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||| |    
48482 tttcatcaaaacaccaaca-caattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacatcca 48580  T
206 caacatcaattgcacaagaatca 228  Q
     |||||||| || ||||||||||    
48581 taacatcaagtgaacaagaatca 48603  T

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Target: scaffold0420 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 268 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 13445 - 13325
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
13445 gcaccattttcacaacttatcatttttacatatttgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaattatcatcaattcatgcatacaaacataacatcac 13346  T
368 agttggagcacgaatttagca 388  Q
    | |  |||||||||| |||||    
13345 actaagagcacgaatctagca 13325  T

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Target: scaffold1560 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 147 - 26
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaa 205  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||  |||||||| |||| |||  |    
147 tttcaccaaaacaccaa-aacaattcaaattttcatcatcaatccatgaatatgcaaacccaagcaattattcatcaatcataacatcaattaacattca 49  T
206 caacatcaattgcacaagaatca 228  Q
     || |||| ||| ||||||||||    
48 taatatcatttgaacaagaatca 26  T

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Target: scaffold1711 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 268 - 388
Target Start/End: Complemental strand, 1424 - 1304
Alignment:
268 gcacaattttcataacttctcatttctacatatttaaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaa 367  Q
    ||||||| |||||||||| |||||| | ||||| | |||||| ||| | |||||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||| |||||     
1424 gcacaatattcataacttatcatttttgcatatatgaacatgtaatttcaccaacaatcatacaactaacatcaattcatgcatacaaacataacatcac 1325  T
368 agttggagcacgaatttagca 388  Q
    ||   ||||||||||||||||    
1324 agcaagagcacgaatttagca 1304  T

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Target: scaffold0034 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Original strand, 80187 - 80262
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||    
80187 atgattatgataaagactaacccccttaccttaattatctccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 80262  T

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Target: scaffold0016 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 441 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 166197 - 166121
Alignment:
441 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
166197 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 166121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 441 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 162111 - 162036
Alignment:
441 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 515  Q
    |||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
162111 gatgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 162036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 44; Significance: 8e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 442 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 31212 - 31137
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||    
31212 atgattgtgataaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctatg 31137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 5809 - 5735
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 515  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
5809 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5735  T

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Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 442 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 6015 - 5941
Alignment:
442 atgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctat 515  Q
    ||||||||| | || ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||||    
6015 atgattatgatgaaaactaacccccttaccttaattatctccaactattagctctagcttcacttttgctcctat 5941  T

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Target: scaffold1404 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 106 - 155
Target Start/End: Original strand, 1815 - 1863
Alignment:
106 tttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa 155  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
1815 tttcaccaaaacaccaaca-caattcaaattctcatcatcaatccatgaa 1863  T

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Target: scaffold0361 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 114 - 183
Target Start/End: Original strand, 3183 - 3252
Alignment:
114 aaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaa 183  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
3183 aaacaccaacaacaattccaattctcttcatcaattcatgaatatgcctacccaaacaatgattcatcaa 3252  T

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Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 400
Target Start/End: Original strand, 3370 - 3453
Alignment:
317 accaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatttagcaacaatcatccat 400  Q
    |||||||||||||||  ||| || ||||||||||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||| |||| ||||||    
3370 accaacaatcatacaaatatcattaattcatgcatacaaacttaacatcacagctagagcacgaatttagcatcaattatccat 3453  T

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Target: scaffold0342 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 441 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 385 - 309
Alignment:
441 gatgattatggtaaagactaacccc-ttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||||||    
385 gatgattatgataaagaataaccccgttaccttaattatcaccaactattagctcaagcttcacttttgctcctatg 309  T

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Target: scaffold0066 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 350
Target Start/End: Original strand, 54412 - 54630
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctc 234  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||   |||||||| | || | ||||||  |||  | ||||||||||||| | ||| |||||| | |||    
54412 ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaactcatgattcacccacaacaacatcagttaatagcaacaacatcaatggaacatgaatcacatctc 54511  T
235 aattcaactacaacatgtc-aaattcatccatt-tgcacaattttcataacttctcatttctacata--tttaaacatggaatctaaccaacaatcatac 330  Q
    | |||||| ||||||| || ||||||| | |||  | |||| |||||||||||  ||||| ||||||  || ||||||| ||| | ||| ||||||||||    
54512 atttcaacaacaacatatcaaaattcaccaattgagtacaa-tttcataacttgacatttatacatactttgaaacatgcaatttcacccacaatcatac 54610  T
331 acttattatcaattcatgca 350  Q
    | |||| |||||||||||||    
54611 aattatcatcaattcatgca 54630  T

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Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 135 - 179
Target Start/End: Original strand, 45007 - 45051
Alignment:
135 ttctcatcatcaatccatgaacatgtatacccaagcaatgattca 179  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||    
45007 ttctcatcatcaatccataaatatgtatacccaagtcatgattca 45051  T

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Target: scaffold0053 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 95 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 77139 - 76984
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaac-atgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    |||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||  ||||||||| |||  ||||||  ||| |||||||||| |||| |||||||  | || |||    
77139 caattcaccaatttcacaaaaccaccaacaacaactcat-ttctcatcaacaaatcatgaattatgaatacccaagccatgaatcatcaataacaatatc 77041  T
194 tattagcatcaacaacatcaattgcacaagaatcatagctcaattcaactacaacat 250  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||| |||||  | | ||||||||| |||||||    
77040 acttagcaacaacaacatcaattgaacatgaatctcaccacaattcaacaacaacat 76984  T

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Target: scaffold0021 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 95 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 132542 - 132420
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacaattcaaattctcatcatcaatccatgaa-catgtatacccaagcaatgattcatcaactataacatc 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| || ||| ||||||| |||| | |||||||| |||| | |||| | | |||||     
132542 caattcacaaatttcaccaaaacaccaacaacatttc-atttctcaacaacaaaccatgaatcatgcaaacccaagccatgaattatcatcaacaacatg 132444  T
194 tattagcatcaacaacatcaattg 217  Q
      ||| || |||||||||||||||    
132443 acttaacaacaacaacatcaattg 132420  T

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Target: scaffold0483 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 1089 - 1028
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
1089 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 1028  T

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Target: scaffold0456 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1546
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
1587 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1546  T

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Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 8732 - 8691
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
8732 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8691  T

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Target: scaffold0123 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Original strand, 8216 - 8257
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
8216 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 8257  T

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Target: scaffold0109 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 45876 - 45815
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
45876 catcaacaattaaccacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 45815  T

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Target: scaffold0084 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 275 - 393
Target Start/End: Complemental strand, 56226 - 56106
Alignment:
275 tttcataacttctcatttctacatattt--aaacatggaatctaaccaacaatcatacacttattatcaattcatgcatacaaacatatcatcaaagttg 372  Q
    |||||||||||  ||||| |||||| ||  ||||||| ||| | | | ||||||||||| |||| ||||| ||||||| || || ||| ||||| ||||     
56226 tttcataacttgacatttatacatactttaaaacatgtaatttcagccacaatcatacaattatcatcaaatcatgcacacgaaaataacatcacagtta 56127  T
373 gagcacgaatttagcaacaat 393  Q
    ||||||||||||| |||||||    
56126 gagcacgaatttaacaacaat 56106  T

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Target: scaffold0058 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 70348 - 70307
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
70348 ttcatgcatacaaacatatcatcatagttggagtacgaattt 70307  T

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Target: scaffold1734 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Original strand, 1273 - 1347
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
1273 gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 1347  T

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Target: scaffold1164 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 516
Target Start/End: Original strand, 1721 - 1775
Alignment:
462 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||    
1721 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 1775  T

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Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 1386 - 1348
Alignment:
346 atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
1386 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 1348  T

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Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 9641 - 9603
Alignment:
346 atgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
9641 atgcatacaaacatatcatcatagttagagcacgaattt 9603  T

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Target: scaffold0396 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 12081 - 12007
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||   |||||||||| || ||||| || ||| ||||||||| || ||||||||| ||||||||||||    
12081 gcaatgagattatcatcaacaattaaacacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 12007  T

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Target: scaffold0122 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 462 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 19861 - 19807
Alignment:
462 ccccttaccttaattatctccaactactagctctaacttcactttggctcctatg 516  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||||| |||||||||    
19861 ccccttaccttaattatcaccaactattaactcaagcttcacttttgctcctatg 19807  T

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Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 24570 - 24496
Alignment:
6 gcaatgagatggacatcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    ||||||||||   |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
24570 gcaatgagattatcatcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 24496  T

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Target: scaffold0240 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 124
Target Start/End: Original strand, 7522 - 7551
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
7522 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 7551  T

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Target: scaffold0160 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0160
Description:

Target: scaffold0160; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 80
Target Start/End: Original strand, 3406 - 3467
Alignment:
19 catcaacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaac 80  Q
    |||||||||| |||||||| || ||| ||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||    
3406 catcaacaattaaccacaaccacaacttatgatcatgcattccatcatatttcaacaacaac 3467  T

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Target: scaffold0151 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 22463 - 22422
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
22463 ttcatgcatacaaacatatcatcatatttagagcacgaattt 22422  T

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Target: scaffold0044 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 95 - 124
Target Start/End: Original strand, 38253 - 38282
Alignment:
95 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
38253 caattcacaaatttcaccaaaacaccaaca 38282  T

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Target: scaffold0032 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 343 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 93814 - 93773
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaattt 384  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
93814 ttcatgcatacatacatatcatcataattggagcacgaattt 93773  T

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Target: scaffold0970 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0970
Description:

Target: scaffold0970; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Original strand, 2476 - 2532
Alignment:
161 atacccaagcaatgattcatcaactataacatctattagcatcaacaacatcaattg 217  Q
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2476 atacccaagccatgaatcatcaacaacaacatcacttagcaacaacaacatcaattg 2532  T

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Target: scaffold0507 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 23 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 1705 - 1629
Alignment:
23 aacaatcaaccacaatcataacatataatcatacactccatcataattcaacaacaacttatcatatttcctcaatt 99  Q
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1705 aacaattaatcacaaccacaacttataatcatgcattccatcatatttcaacaacaacatgtcataattcatcaatt 1629  T

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Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 343 - 383
Target Start/End: Original strand, 10868 - 10908
Alignment:
343 ttcatgcatacaaacatatcatcaaagttggagcacgaatt 383  Q
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10868 ttcatgcatacaaacatatcatcatagatagagcacgaatt 10908  T

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