View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF11889_low_6 (Length: 277)

Name: NF11889_low_6
Description: NF11889
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF11889_low_6
NF11889_low_6
[»] chr5 (41 HSPs)
chr5 (11-266)||(23881059-23881314)
chr5 (11-277)||(6499231-6499495)
chr5 (11-265)||(642598-642849)
chr5 (11-265)||(21099595-21099849)
chr5 (11-277)||(21072119-21072385)
chr5 (11-277)||(23412853-23413119)
chr5 (11-277)||(21198884-21199148)
chr5 (11-251)||(9398649-9398879)
chr5 (11-156)||(12352795-12352940)
chr5 (11-238)||(89339-89567)
chr5 (11-238)||(7745610-7745838)
chr5 (11-265)||(17814960-17815213)
chr5 (11-277)||(6512310-6512573)
chr5 (12-226)||(25096753-25096969)
chr5 (12-226)||(25154723-25154939)
chr5 (11-238)||(21910548-21910776)
chr5 (11-277)||(41566311-41566579)
chr5 (11-277)||(20550887-20551152)
chr5 (11-265)||(19536192-19536446)
chr5 (11-277)||(26784346-26784614)
chr5 (11-277)||(33022656-33022922)
chr5 (11-220)||(13545455-13545657)
chr5 (11-277)||(31117869-31118134)
chr5 (11-277)||(4887014-4887280)
chr5 (11-106)||(29138456-29138551)
chr5 (11-82)||(9088961-9089032)
chr5 (11-106)||(25930206-25930301)
chr5 (14-107)||(28464388-28464481)
chr5 (11-103)||(11993880-11993972)
chr5 (11-82)||(14086613-14086684)
chr5 (11-82)||(30115911-30115982)
chr5 (11-82)||(30742973-30743043)
chr5 (11-61)||(28139599-28139649)
chr5 (14-107)||(3245490-3245583)
chr5 (11-107)||(10848765-10848861)
chr5 (11-82)||(33933259-33933330)
chr5 (11-82)||(42243673-42243743)
chr5 (11-103)||(35932059-35932151)
chr5 (11-106)||(15516962-15517056)
chr5 (16-82)||(11208060-11208125)
chr5 (205-277)||(5430069-5430142)
[»] chr4 (54 HSPs)
chr4 (11-265)||(40846089-40846344)
chr4 (11-239)||(23750512-23750739)
chr4 (11-265)||(6641674-6641926)
chr4 (11-238)||(55380280-55380508)
chr4 (11-277)||(29680398-29680665)
chr4 (77-265)||(15139283-15139473)
chr4 (11-266)||(16632430-16632684)
chr4 (11-251)||(45833384-45833625)
chr4 (11-265)||(12811044-12811296)
chr4 (11-238)||(37435428-37435656)
chr4 (11-235)||(19884692-19884916)
chr4 (11-230)||(19620962-19621182)
chr4 (11-202)||(37985541-37985733)
chr4 (14-277)||(56034567-56034830)
chr4 (11-265)||(14604774-14605028)
chr4 (19-202)||(12601099-12601283)
chr4 (11-215)||(19666362-19666567)
chr4 (27-239)||(41114663-41114875)
chr4 (11-238)||(3395580-3395808)
chr4 (11-202)||(9140902-9141094)
chr4 (22-251)||(22675402-22675630)
chr4 (22-217)||(11915701-11915896)
chr4 (11-232)||(10072925-10073146)
chr4 (11-251)||(19911760-19912002)
chr4 (11-277)||(10692841-10693107)
chr4 (11-277)||(10906607-10906873)
chr4 (153-264)||(22089721-22089831)
chr4 (27-270)||(413008-413251)
chr4 (11-238)||(14904249-14904477)
chr4 (165-261)||(23123576-23123672)
chr4 (22-235)||(17247245-17247456)
chr4 (11-235)||(13576012-13576235)
chr4 (13-106)||(29121362-29121455)
chr4 (27-223)||(17787962-17788152)
chr4 (11-107)||(17398699-17398795)
chr4 (11-82)||(6517475-6517546)
chr4 (39-251)||(3483739-3483952)
chr4 (11-103)||(16853493-16853585)
chr4 (11-82)||(3105469-3105540)
chr4 (74-238)||(14833449-14833614)
chr4 (22-226)||(17540396-17540598)
chr4 (11-80)||(20977447-20977516)
chr4 (22-155)||(54679931-54680064)
chr4 (11-103)||(40860657-40860749)
chr4 (11-82)||(8105628-8105698)
chr4 (11-82)||(22190836-22190907)
chr4 (11-82)||(38513868-38513939)
chr4 (11-82)||(56533112-56533182)
chr4 (27-64)||(8685511-8685548)
chr4 (11-61)||(14154065-14154115)
chr4 (31-80)||(16940026-16940075)
chr4 (222-270)||(17540629-17540675)
chr4 (212-277)||(9751403-9751470)
chr4 (11-79)||(39419787-39419855)
[»] chr2 (61 HSPs)
chr2 (11-265)||(22454845-22455100)
chr2 (14-251)||(25189391-25189629)
chr2 (11-277)||(23595415-23595677)
chr2 (11-277)||(39037484-39037752)
chr2 (11-277)||(19540406-19540671)
chr2 (11-277)||(24377091-24377359)
chr2 (11-277)||(18376748-18377016)
chr2 (11-261)||(21537107-21537358)
chr2 (11-277)||(41121565-41121829)
chr2 (11-238)||(25829124-25829352)
chr2 (11-265)||(22187957-22188212)
chr2 (11-239)||(13963859-13964088)
chr2 (11-265)||(20568605-20568860)
chr2 (11-265)||(23234997-23235252)
chr2 (11-277)||(23184158-23184414)
chr2 (11-230)||(30666979-30667199)
chr2 (11-265)||(10009606-10009860)
chr2 (11-265)||(9015226-9015478)
chr2 (11-265)||(24850520-24850776)
chr2 (11-265)||(25037114-25037369)
chr2 (11-265)||(25041221-25041476)
chr2 (11-265)||(24576025-24576279)
chr2 (27-277)||(44881173-44881421)
chr2 (22-224)||(26618998-26619200)
chr2 (15-235)||(30621210-30621431)
chr2 (15-235)||(30623831-30624052)
chr2 (11-230)||(28140509-28140729)
chr2 (28-265)||(22272139-22272375)
chr2 (11-235)||(22317583-22317809)
chr2 (11-265)||(38781388-38781642)
chr2 (11-202)||(24779333-24779525)
chr2 (27-238)||(19115089-19115300)
chr2 (22-270)||(6573973-6574223)
chr2 (11-156)||(40782467-40782612)
chr2 (39-235)||(20151921-20152117)
chr2 (27-239)||(18702744-18702956)
chr2 (11-155)||(28711664-28711808)
chr2 (11-103)||(31800905-31800997)
chr2 (91-226)||(18430835-18430970)
chr2 (11-107)||(28550932-28551028)
chr2 (11-107)||(44840424-44840520)
chr2 (11-107)||(22776302-22776398)
chr2 (11-107)||(22781680-22781776)
chr2 (165-265)||(7609107-7609205)
chr2 (11-107)||(1587047-1587142)
chr2 (11-107)||(14581505-14581601)
chr2 (11-51)||(22258191-22258231)
chr2 (47-238)||(22260432-22260624)
chr2 (11-103)||(31968061-31968153)
chr2 (11-107)||(40332077-40332173)
chr2 (11-62)||(33074216-33074267)
chr2 (11-82)||(35744039-35744110)
chr2 (11-82)||(22802451-22802521)
chr2 (27-82)||(30557360-30557415)
chr2 (28-106)||(3277037-3277115)
chr2 (27-107)||(22785669-22785749)
chr2 (11-82)||(6392624-6392694)
chr2 (11-106)||(28701244-28701339)
chr2 (16-52)||(19498012-19498048)
chr2 (39-103)||(23392686-23392750)
chr2 (27-107)||(34321950-34322030)
[»] chr7 (63 HSPs)
chr7 (14-277)||(39284463-39284727)
chr7 (11-277)||(13018406-13018671)
chr7 (11-277)||(41842174-41842439)
chr7 (11-277)||(21695393-21695661)
chr7 (11-277)||(29935260-29935524)
chr7 (11-265)||(16316470-16316723)
chr7 (11-277)||(44467056-44467325)
chr7 (12-277)||(15088513-15088780)
chr7 (36-203)||(13032045-13032213)
chr7 (11-251)||(11792899-11793140)
chr7 (11-238)||(13302802-13303030)
chr7 (11-265)||(10883084-10883339)
chr7 (11-238)||(2913546-2913774)
chr7 (14-265)||(11319400-11319652)
chr7 (11-238)||(13137833-13138061)
chr7 (11-238)||(13648721-13648949)
chr7 (14-265)||(28409034-28409285)
chr7 (12-226)||(13893949-13894162)
chr7 (11-235)||(21692279-21692504)
chr7 (11-266)||(22577933-22578187)
chr7 (14-238)||(21283311-21283536)
chr7 (11-277)||(2500030-2500298)
chr7 (11-277)||(33691610-33691878)
chr7 (16-251)||(19236969-19237204)
chr7 (11-277)||(30025897-30026165)
chr7 (11-265)||(13880096-13880351)
chr7 (11-235)||(9069554-9069779)
chr7 (14-238)||(24788136-24788361)
chr7 (11-234)||(12366690-12366914)
chr7 (27-238)||(15467924-15468136)
chr7 (13-195)||(13730656-13730839)
chr7 (14-213)||(5000784-5000985)
chr7 (11-276)||(28622257-28622522)
chr7 (40-238)||(13692372-13692562)
chr7 (39-205)||(13880608-13880775)
chr7 (11-106)||(16309978-16310073)
chr7 (11-265)||(13260536-13260781)
chr7 (11-230)||(30944271-30944489)
chr7 (11-276)||(331637-331905)
chr7 (11-106)||(16111955-16112050)
chr7 (22-235)||(23279900-23280113)
chr7 (15-230)||(30945304-30945518)
chr7 (11-277)||(48236802-48237068)
chr7 (11-235)||(9709745-9709968)
chr7 (147-230)||(4494634-4494718)
chr7 (11-106)||(4821466-4821561)
chr7 (11-106)||(33605677-33605772)
chr7 (14-107)||(1293025-1293118)
chr7 (14-106)||(14426542-14426634)
chr7 (13-106)||(14193108-14193201)
chr7 (11-107)||(48062890-48062986)
chr7 (11-60)||(8182922-8182971)
chr7 (14-82)||(19711108-19711176)
chr7 (11-79)||(27871710-27871778)
chr7 (14-82)||(35952783-35952851)
chr7 (16-103)||(14425444-14425531)
chr7 (184-230)||(9098205-9098251)
chr7 (39-139)||(9098284-9098384)
chr7 (27-103)||(19339324-19339400)
chr7 (11-79)||(24794813-24794881)
chr7 (11-70)||(4494569-4494628)
chr7 (22-82)||(2265614-2265674)
chr7 (210-277)||(16111784-16111852)
[»] scaffold0047 (2 HSPs)
scaffold0047 (11-276)||(9899-10162)
scaffold0047 (74-238)||(30283-30448)
[»] scaffold0004 (4 HSPs)
scaffold0004 (11-265)||(220234-220488)
scaffold0004 (11-265)||(377419-377674)
scaffold0004 (20-239)||(244172-244390)
scaffold0004 (11-82)||(211394-211465)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (11-246)||(9952-10188)
[»] chr1 (55 HSPs)
chr1 (11-277)||(21028788-21029056)
chr1 (11-277)||(26701946-26702214)
chr1 (11-265)||(33256183-33256436)
chr1 (11-265)||(33276355-33276608)
chr1 (11-276)||(28492222-28492489)
chr1 (11-260)||(22153852-22154102)
chr1 (11-277)||(1577862-1578127)
chr1 (11-276)||(10757416-10757682)
chr1 (14-195)||(21191766-21191947)
chr1 (11-263)||(22600014-22600267)
chr1 (11-238)||(12284418-12284646)
chr1 (11-211)||(12613700-12613899)
chr1 (31-277)||(17024784-17025029)
chr1 (11-265)||(48704199-48704452)
chr1 (11-265)||(20954303-20954558)
chr1 (11-254)||(1900340-1900584)
chr1 (11-265)||(19717519-19717772)
chr1 (11-263)||(38282562-38282814)
chr1 (15-251)||(32785782-32786018)
chr1 (11-230)||(22201601-22201821)
chr1 (11-265)||(2268526-2268777)
chr1 (14-195)||(2267087-2267269)
chr1 (11-238)||(36134185-36134410)
chr1 (28-265)||(35401821-35402057)
chr1 (11-235)||(22427219-22427442)
chr1 (11-200)||(29215792-29215982)
chr1 (28-265)||(23036359-23036595)
chr1 (11-277)||(2834684-2834950)
chr1 (11-277)||(16235115-16235381)
chr1 (11-188)||(22464716-22464894)
chr1 (11-102)||(39200986-39201077)
chr1 (14-238)||(30893090-30893316)
chr1 (11-103)||(35040161-35040253)
chr1 (11-107)||(46088984-46089080)
chr1 (11-107)||(48570220-48570316)
chr1 (11-106)||(25448556-25448651)
chr1 (170-277)||(7309973-7310080)
chr1 (11-82)||(21702809-21702880)
chr1 (11-82)||(30572192-30572263)
chr1 (28-170)||(18896523-18896665)
chr1 (208-277)||(12284648-12284716)
chr1 (11-80)||(19215607-19215676)
chr1 (11-80)||(23024783-23024852)
chr1 (11-103)||(21121057-21121149)
chr1 (11-82)||(2327454-2327525)
chr1 (11-82)||(44821559-44821630)
chr1 (14-106)||(10250984-10251076)
chr1 (11-103)||(21135153-21135245)
chr1 (11-82)||(37642243-37642314)
chr1 (206-277)||(19215790-19215860)
chr1 (211-277)||(37642433-37642501)
chr1 (30-103)||(42284642-42284715)
chr1 (22-82)||(14263465-14263525)
chr1 (22-82)||(21204937-21204997)
chr1 (27-103)||(21984607-21984683)
[»] scaffold0364 (1 HSPs)
scaffold0364 (11-277)||(6003-6268)
[»] chr8 (53 HSPs)
chr8 (14-277)||(18321055-18321319)
chr8 (11-265)||(17701733-17701988)
chr8 (14-265)||(19707497-19707746)
chr8 (11-277)||(19156184-19156452)
chr8 (11-217)||(43644884-43645090)
chr8 (11-263)||(16207294-16207547)
chr8 (11-277)||(602615-602883)
chr8 (11-265)||(39693523-39693778)
chr8 (14-273)||(12757662-12757923)
chr8 (11-265)||(16188972-16189225)
chr8 (39-238)||(33082873-33083073)
chr8 (11-277)||(18121005-18121269)
chr8 (11-238)||(16681238-16681466)
chr8 (14-277)||(17441704-17441967)
chr8 (14-262)||(17525641-17525889)
chr8 (11-265)||(24646326-24646581)
chr8 (10-277)||(18679802-18680069)
chr8 (22-265)||(19943234-19943480)
chr8 (11-265)||(17914447-17914702)
chr8 (11-235)||(21932871-21933096)
chr8 (11-238)||(18718989-18719217)
chr8 (11-235)||(23185166-23185389)
chr8 (22-222)||(18685348-18685549)
chr8 (22-222)||(18722597-18722798)
chr8 (22-222)||(18730942-18731143)
chr8 (12-235)||(30421368-30421591)
chr8 (12-238)||(17267463-17267689)
chr8 (12-265)||(20382304-20382556)
chr8 (29-265)||(23263521-23263757)
chr8 (11-265)||(29693303-29693558)
chr8 (11-106)||(17797410-17797505)
chr8 (29-224)||(22461588-22461783)
chr8 (144-265)||(22745608-22745730)
chr8 (11-106)||(40845455-40845550)
chr8 (11-82)||(25164058-25164129)
chr8 (11-106)||(14989519-14989614)
chr8 (11-235)||(15336028-15336251)
chr8 (11-235)||(15425093-15425316)
chr8 (11-235)||(15516397-15516620)
chr8 (11-277)||(45538336-45538602)
chr8 (11-82)||(6407714-6407785)
chr8 (11-82)||(9320557-9320627)
chr8 (11-106)||(18151714-18151809)
chr8 (11-82)||(22673766-22673837)
chr8 (205-277)||(24832953-24833026)
chr8 (11-155)||(1237625-1237769)
chr8 (14-106)||(24551265-24551357)
chr8 (12-174)||(19956341-19956502)
chr8 (14-82)||(22663107-22663175)
chr8 (16-52)||(7018418-7018454)
chr8 (11-103)||(13430699-13430791)
chr8 (16-52)||(20259654-20259690)
chr8 (16-52)||(21046284-21046320)
[»] chr3 (60 HSPs)
chr3 (11-266)||(49642670-49642926)
chr3 (11-265)||(29951347-29951602)
chr3 (11-265)||(30000501-30000756)
chr3 (11-235)||(16032520-16032743)
chr3 (11-238)||(14392940-14393168)
chr3 (11-265)||(6090727-6090982)
chr3 (12-226)||(12388821-12389035)
chr3 (11-277)||(12962983-12963249)
chr3 (29-226)||(19249361-19249558)
chr3 (22-235)||(20725093-20725306)
chr3 (13-265)||(52920403-52920655)
chr3 (11-238)||(37467328-37467556)
chr3 (11-265)||(31303381-31303636)
chr3 (11-195)||(41494994-41495179)
chr3 (14-263)||(13948334-13948584)
chr3 (11-235)||(2561183-2561408)
chr3 (14-238)||(17238858-17239083)
chr3 (11-265)||(20646149-20646405)
chr3 (13-250)||(28582103-28582341)
chr3 (11-244)||(18121552-18121786)
chr3 (27-251)||(38177566-38177791)
chr3 (11-183)||(13780575-13780748)
chr3 (14-265)||(15903196-15903449)
chr3 (11-277)||(47207701-47207970)
chr3 (30-277)||(14969341-14969590)
chr3 (11-251)||(16658541-16658782)
chr3 (11-238)||(12726166-12726394)
chr3 (11-195)||(40799869-40800054)
chr3 (11-230)||(18142696-18142916)
chr3 (11-106)||(22804092-22804187)
chr3 (11-276)||(49553389-49553653)
chr3 (11-235)||(47405362-47405585)
chr3 (39-202)||(13824092-13824256)
chr3 (22-238)||(12968312-12968528)
chr3 (22-238)||(26417616-26417832)
chr3 (11-277)||(19888842-19889107)
chr3 (11-235)||(20627372-20627595)
chr3 (29-195)||(23538146-23538312)
chr3 (11-106)||(11223559-11223653)
chr3 (11-82)||(11868264-11868335)
chr3 (11-82)||(25398348-25398419)
chr3 (11-106)||(53056796-53056891)
chr3 (22-106)||(14955433-14955517)
chr3 (11-103)||(21605726-21605818)
chr3 (11-106)||(29855404-29855499)
chr3 (11-82)||(46796460-46796531)
chr3 (14-103)||(21640865-21640954)
chr3 (28-251)||(46349769-46349991)
chr3 (11-103)||(21636742-21636834)
chr3 (11-155)||(24775554-24775698)
chr3 (11-102)||(22140759-22140850)
chr3 (11-82)||(30054310-30054381)
chr3 (11-61)||(1728129-1728179)
chr3 (11-61)||(49666519-49666569)
chr3 (11-80)||(9700131-9700200)
chr3 (165-265)||(25398184-25398282)
chr3 (27-82)||(2785075-2785130)
chr3 (27-82)||(33583240-33583295)
chr3 (239-277)||(19249295-19249333)
chr3 (16-61)||(37412605-37412650)
[»] scaffold0084 (3 HSPs)
scaffold0084 (11-277)||(49328-49595)
scaffold0084 (11-277)||(32481-32749)
scaffold0084 (16-82)||(389-455)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (12-277)||(20112584-20112852)
chr6 (14-217)||(15987232-15987437)
chr6 (15-265)||(23284564-23284815)
chr6 (13-239)||(9717841-9718068)
chr6 (28-218)||(10640364-10640555)
chr6 (11-265)||(13602168-13602423)
chr6 (28-265)||(19470683-19470918)
chr6 (11-265)||(15531522-15531777)
chr6 (11-251)||(26972140-26972379)
chr6 (11-235)||(32544261-32544486)
chr6 (11-238)||(15302196-15302424)
chr6 (11-276)||(19623975-19624239)
chr6 (11-277)||(19086154-19086411)
chr6 (11-238)||(24116824-24117053)
chr6 (11-230)||(14100373-14100592)
chr6 (11-277)||(12715306-12715573)
chr6 (27-265)||(13435544-13435783)
chr6 (11-195)||(18378310-18378495)
chr6 (11-230)||(29918013-29918232)
chr6 (11-235)||(22802137-22802360)
chr6 (28-265)||(21625114-21625349)
chr6 (11-102)||(25594064-25594155)
chr6 (11-251)||(18435552-18435793)
chr6 (11-174)||(26943572-26943735)
chr6 (11-103)||(16265211-16265303)
chr6 (39-230)||(19688790-19688980)
chr6 (11-82)||(22076489-22076560)
chr6 (15-195)||(20730672-20730853)
chr6 (14-106)||(15954702-15954794)
chr6 (11-82)||(16336123-16336194)
chr6 (11-106)||(20487976-20488071)
chr6 (27-106)||(21235137-21235216)
chr6 (144-265)||(25597608-25597730)
chr6 (15-82)||(12423261-12423328)
chr6 (11-82)||(16877209-16877280)
chr6 (11-82)||(33352008-33352079)
chr6 (17-107)||(12348995-12349085)
chr6 (22-106)||(21618251-21618335)
chr6 (45-277)||(34451556-34451787)
chr6 (11-82)||(17381517-17381588)
chr6 (14-80)||(19482751-19482817)
chr6 (11-80)||(17316609-17316678)
chr6 (11-103)||(19066079-19066171)
chr6 (9-82)||(19833115-19833187)
[»] scaffold0161 (2 HSPs)
scaffold0161 (14-235)||(9997-10220)
scaffold0161 (14-82)||(14816-14884)
[»] scaffold0290 (1 HSPs)
scaffold0290 (13-265)||(18481-18734)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (14-265)||(19334-19584)
scaffold0035 (11-61)||(99270-99320)
[»] scaffold0359 (1 HSPs)
scaffold0359 (11-265)||(5552-5805)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (11-238)||(14644-14872)
[»] scaffold0210 (1 HSPs)
scaffold0210 (11-238)||(1656-1884)
[»] scaffold0411 (1 HSPs)
scaffold0411 (11-265)||(12205-12460)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (11-230)||(159051-159270)
scaffold0022 (119-251)||(39529-39662)
scaffold0022 (119-251)||(137589-137722)
scaffold0022 (11-76)||(37398-37463)
scaffold0022 (11-76)||(135458-135523)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (11-277)||(27278-27544)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (11-238)||(60012-60240)
scaffold0026 (11-238)||(7922-8150)
scaffold0026 (90-213)||(151783-151906)
[»] scaffold0065 (1 HSPs)
scaffold0065 (11-202)||(1686-1878)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (11-265)||(36635-36890)
scaffold0120 (11-265)||(42115-42370)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (11-265)||(20831-21086)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (14-263)||(474-724)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (14-251)||(25849-26087)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (11-277)||(9965-10231)
[»] scaffold0146 (1 HSPs)
scaffold0146 (14-238)||(15116-15341)
[»] scaffold0056 (3 HSPs)
scaffold0056 (29-265)||(36047-36281)
scaffold0056 (11-103)||(34827-34919)
scaffold0056 (14-79)||(25712-25777)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (12-223)||(43822-44032)
[»] scaffold0227 (1 HSPs)
scaffold0227 (11-251)||(22672-22913)
[»] scaffold0005 (2 HSPs)
scaffold0005 (11-265)||(212350-212604)
scaffold0005 (74-238)||(6085-6250)
[»] scaffold0081 (1 HSPs)
scaffold0081 (16-224)||(40638-40846)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (28-238)||(1409-1619)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (20-251)||(7708-7940)
[»] scaffold0023 (1 HSPs)
scaffold0023 (28-276)||(103585-103832)
[»] scaffold0861 (1 HSPs)
scaffold0861 (33-265)||(4807-5040)
[»] scaffold0426 (1 HSPs)
scaffold0426 (11-178)||(13567-13735)
[»] scaffold0273 (1 HSPs)
scaffold0273 (22-238)||(5634-5849)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (11-230)||(15789-16011)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (11-277)||(89904-90170)
[»] scaffold0217 (3 HSPs)
scaffold0217 (11-238)||(19027-19255)
scaffold0217 (14-79)||(9559-9624)
scaffold0217 (11-106)||(22151-22246)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (11-235)||(74577-74788)
[»] scaffold1747 (1 HSPs)
scaffold1747 (22-106)||(1324-1408)
[»] scaffold1745 (1 HSPs)
scaffold1745 (22-106)||(3-87)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (205-277)||(60717-60789)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (11-106)||(215517-215612)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (45-238)||(9825-10019)
scaffold0334 (14-49)||(7823-7858)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (132-251)||(5813-5934)
[»] scaffold1359 (2 HSPs)
scaffold1359 (14-106)||(675-767)
scaffold1359 (16-103)||(1778-1865)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (14-106)||(60802-60894)
[»] scaffold1434 (1 HSPs)
scaffold1434 (144-265)||(648-768)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (31-82)||(2039-2090)
[»] scaffold0043 (1 HSPs)
scaffold0043 (11-106)||(78386-78481)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (11-107)||(17784-17880)
[»] scaffold0439 (1 HSPs)
scaffold0439 (11-106)||(6760-6855)
[»] scaffold0280 (1 HSPs)
scaffold0280 (11-82)||(2774-2845)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (11-82)||(25443-25514)
scaffold0247 (11-52)||(15813-15854)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (11-106)||(9151-9246)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (11-82)||(7377-7448)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (144-202)||(4916-4975)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (11-82)||(5646-5717)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (16-106)||(15642-15732)
[»] scaffold0607 (1 HSPs)
scaffold0607 (11-52)||(6002-6043)
[»] scaffold0485 (1 HSPs)
scaffold0485 (205-265)||(9268-9326)
[»] scaffold0473 (1 HSPs)
scaffold0473 (11-79)||(2738-2806)
[»] scaffold1331 (1 HSPs)
scaffold1331 (11-82)||(1743-1814)
[»] scaffold0414 (1 HSPs)
scaffold0414 (22-61)||(7221-7260)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (210-265)||(13393-13448)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (11-82)||(87644-87715)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (16-82)||(164990-165056)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (22-82)||(3939-3999)


Alignment Details
Target: chr5 (Bit Score: 177; Significance: 2e-95; HSPs: 41)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 23881059 - 23881314
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23881059 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgcactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 23881158  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||  ||||||||||||    
T  23881159 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattaaacaaccttttgaagctt-tagtctctcatct 23881257  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgac 266  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| ||||||||||||||    
T  23881258 tctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgaggtgcttctgatgac 23881314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 6499231 - 6499495
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  6499231 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccgatgccttcaac 6499330  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    |||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||  ||||||||    
T  6499331 ttcatttgaaatagatgttgcttcactctcctggtcttctgcaatactgggtgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaag--tctcatct 6499428  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||    
T  6499429 tcatatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgaggtacttct-atgacgtcatcacttc 6499495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 642849 - 642598
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  642849 agcagagacacaa---gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgccttcaac 642753  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    || |||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  642752 tttatttgaattagccgttgtttcactctcctgatcttctgtaatgctaggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatctt 642653  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||||||||| ||  |||||||||||||  || ||| |||| |||||||||||||    
T  642652 ctgatgaactgcaatttctggtgatcttcagcatctcatgaggtgcttctgatga 642598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21099849 - 21099595
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||||| | |    
T  21099849 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgttcttcaaaaggcaagcatccaatgccttcagc 21099750  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| || |||| ||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||| |||||||| |||||    
T  21099749 ttcatttgaattagttgttgcttcactctcttggtcttttgtaatgctaggcatgattaaatccatttaacagcctttgaagctttaagtctctgatctt 21099650  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||| |||| |||||| ||||||    
T  21099649 ctgatgaactttagcttctggtgattttcagcttctgatgaggtgcttttgatga 21099595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21072385 - 21072119
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  21072385 agcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 21072286  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||| |  | |||||||||||||| | ||||||||| |||||| ||||||  |||||     
T  21072285 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctgtgagtgattaaatccatagaacaaccttttaagctttaagtcttgcatctc 21072186  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  21072185 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgacctcatcacttc 21072119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23413119 - 23412853
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||     
T  23413119 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaaaaacaagcatccaatgctttcaaa 23413020  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || || | |||| |||||||| |||||||||||||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  23413019 tcctttcaaaataatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttggatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 23412920  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  23412919 cctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 23412853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 21199148 - 21198884
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |  ||| | | ||||||||||||||| ||     
T  21199148 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctttccaaagaacgagcatccaatgccttcaaa 21199049  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    ||||||||||||||  |||| | || | | ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21199048 ttcatttgaattagccgttgct-catttttctggtcttctgcagtactaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatctt 21198950  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga-tgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | |||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||    
T  21198949 ctgatgaacttcagctcctggtga--tattgcttctgatgagtttgcttctgatgacgtcatcgcttc 21198884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 9398879 - 9398649
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| |||    
T  9398879 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagtaagcattcaatgccttcaac 9398780  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||||||||          || |||| || ||| ||||||| || |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  9398779 ttcatttgaattagtcgttgctccactctcctg----------atcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaacctttaagtctctcatctt 9398690  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  9398689 ctgatgaacttcaacttctggtgatcttgagcttctgatga 9398649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12352940 - 12352795
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  12352940 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaatgcaagcatccaatgcctttaac 12352841  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg 156  Q
    ||||||||||||||   ||| ||||| |||||| ||||||||||||    
T  12352840 ttcatttgaattagccattgcttcaccctcctgatcttctgcaatg 12352795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 89567 - 89339
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| | ||||||| |||||| || ||     
T  89567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatgcaatgctttcaaa 89468  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||| ||  || |||| |||| |||||||| |||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |  |||||    
T  89467 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttttgcatct 89368  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||    
T  89367 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 89339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 7745838 - 7745610
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  7745838 agcagagacaaaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 7745739  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| || ||||||| ||||| || |  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  7745738 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctccaatgcttggatgcgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatct 7745639  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  7745638 cctgatgtacttcagcttcttgtgatctt 7745610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 17814960 - 17815213
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||     
T  17814960 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactccgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaa 17815059  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||   | |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  17815060 tcctttcagaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 17815159  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
      ||||||| || ||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  17815160 cttgatgaaatttagcttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 17815213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 6512573 - 6512310
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||   |||||||||| ||     
T  6512573 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaag---ccaatgccttcaaa 6512477  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  |||||| |||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  6512476 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttcagcaatgcttagacgagattaaatccactgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 6512377  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     |||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6512376 cctgatgaactacaacttctagtgatc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 6512310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25096969 - 25096753
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggac---tttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttta 108  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |   ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |    
T  25096969 gcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttca 25096871  T
Q  109 acttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | | ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25096870 aatccttttgaattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctcttatc 25096771  T
Q  209 ttctgatgaacttcagct 226  Q
    || |||||| ||||||||    
T  25096770 ttatgatgatcttcagct 25096753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 25154939 - 25154723
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggac---tttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttta 108  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |   ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| |    
T  25154939 gcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgtcttca 25154841  T
Q  109 acttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | | ||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| |||    
T  25154840 aatccttttgaattaatcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtaattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctcttatc 25154741  T
Q  209 ttctgatgaacttcagct 226  Q
    || |||||| ||||||||    
T  25154740 ttatgatgatcttcagct 25154723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 21910548 - 21910776
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  21910548 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21910647  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || || | |||| |||||| | |  ||||| || |||| |||| || ||||||||| |||  ||| ||||||| |||| ||||||  |||||    
T  21910648 tcctttcaaaataatcgttgcttcacttttccagtcttttgtaatgcttagacgagattaaatcaattcaacagcctttgacgctttaagtcttgcatct 21910747  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21910748 cctgatgaactttagcttctggtgatctt 21910776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41566579 - 41566311
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| |  || ||||||||||||| ||     
T  41566579 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatatcaacgctcttcaaagaataaacatccaatgccttcaaa 41566480  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||| | || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | | | |||||||||| ||||||  |||||    
T  41566479 tcctttcaaaatagacgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagcttttgaagctttaagtcttgcatct 41566380  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     |||||||||| || |||||| |||||||  |||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||    
T  41566379 cctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgacatcacttc 41566311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 20550887 - 20551152
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  20550887 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgta-tttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20550985  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    |   ||  || |||| |||| |||||||| || || |||||||||| |||| || ||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  20550986 tcttttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagttttctgcaatgcttagacgagattaaaaccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 20551085  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga-tgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    | |||||||||||||||||||| |||     ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  20551086 tcctgatgaacttcagcttctgatga---gatgcttctaatgagcttgcttctgatgacgtcatcacttc 20551152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19536446 - 19536192
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || ||     
T  19536446 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 19536347  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcact-ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | ||||  ||  ||| |||| |||||| ||  ||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||  ||||    
T  19536346 tccattcaaaaaagtcgttgcttcactccttttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 19536247  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    | |||||||||||| |||||| | ||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  19536246 tcctgatgaacttctgcttcttgcgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 19536192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 26784346 - 26784614
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  ||||||||| | | |  ||     
T  26784346 agcagacacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccagttcttccaaa 26784445  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| ||||||   |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| ||||| |||||| || |||  |||||    
T  26784446 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcctttaaagctttaaatcttgcatct 26784545  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||| |||||    
T  26784546 cctgctgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatgacttc 26784614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 33022656 - 33022922
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| ||     
T  33022656 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 33022755  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  |||||    
T  33022756 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatct 33022853  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     |||||||||| ||  |||||||||| ||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  33022854 cctgatgaactgcaaattctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttc 33022922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 13545657 - 13545455
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  13545657 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtggtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13545558  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||        |||||||||||| |||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  13545557 tcctttcaaagtagttgttgcttcac--------tcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13545466  T
Q  210 tctgatgaact 220  Q
     ||||||||||    
T  13545465 cctgatgaact 13545455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 31117869 - 31118134
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  31117869 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggatgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacactctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 31117968  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    ||| ||  ||||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || | |||||||| ||  |||||| |||||||||| |  | |  ||||    
T  31117969 ttctttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagtttaaatccgttaaacaaccttttgaagcttta--tgttgcatc 31118066  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    | |||||||||| ||||||||| ||| |  ||||||||| | ||  ||||| ||||||||||| ||||||    
T  31118067 tcctgatgaactgcagcttctgatgaac--ttgcttctagtggacttgcttatgatgacgtcaccacttc 31118134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 4887014 - 4887280
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  4887014 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 4887113  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgtt-aggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    |   ||  || |||| |||| |  ||| | |  ||||| |||||| || || |  | |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||  |  ||||    
T  4887114 tcttttcaaaatagtcgttgctatacttttccagtcttttgcaatcttaagacaagtttaaatccattgaacaacttttgaagctttaagttgcatatct 4887213  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
      ||||||||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  4887214 --tgatgaactgcagcttctggtgattctcagcttctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 4887280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 29138551 - 29138456
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| || ||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  29138551 agcagagacacaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgacaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 29138456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 9088961 - 9089032
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  9088961 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 9089032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 25930301 - 25930206
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||  ||||  ||||||||||||||||    
T  25930301 agcagagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgcctt 25930206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28464481 - 28464388
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  28464481 agagacaaaaacagagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 28464388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 11993880 - 11993972
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||   | |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  11993880 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacatacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc 11993972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14086684 - 14086613
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  14086684 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 14086613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30115982 - 30115911
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  30115982 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 30115911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 30742973 - 30743043
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  30742973 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 30743043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Original strand, 28139599 - 28139649
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 61  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28139599 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 28139649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 3245583 - 3245490
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||| |||||||||    
T  3245583 agagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatcaaatgccttt 3245490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 10848765 - 10848861
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | | | |||||||||||||  || |  ||||||| |||||||||    
T  10848765 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatctaatgccttt 10848861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 33933259 - 33933330
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| | |||||||||||    
T  33933259 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctt 33933330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 42243673 - 42243743
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | | |||||||||||||||    
T  42243673 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtattttgtcaacgctctt 42243743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 35932151 - 35932059
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||  || |  |||||||||||||    
T  35932151 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 35932059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 15516962 - 15517056
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| || |||| |||||  || |  ||||||||||||||||    
T  15516962 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaaagtactatgccaacactctttgaagaataagcatccaatgcctt 15517056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11208125 - 11208060
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||| || | |||||||||||||||||    
T  11208125 agacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtac-atagtactttgtcaacgctctt 11208060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 205 - 277
Target Start/End: Original strand, 5430069 - 5430142
Alignment:
Q  205 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||  ||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  5430069 catctcctgatgaactgcagcttctggtgatttttaccttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttc 5430142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 54)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 40846089 - 40846344
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||    
T  40846089 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgctttcaac 40846188  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  40846189 ttcatttgaattagtcgttgcttcactttcctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtctctcatct 40846288  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  40846289 tctgatgaacttcagcttccggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 40846344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Original strand, 23750512 - 23750739
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaa-aaaagcaagcatccaatgcctttaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||   |||| ||| | |||| |||||||| |||||||||||    
T  23750512 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttg---acgcacttcataaaaacaagcatcaaatgcctttaa 23750608  T
Q  110 cttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    |||||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  23750609 cttcatttgaagcagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcagtgctaggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 23750708  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttt 239  Q
    | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23750709 tcctgatgaacttcagcttctggttatcttt 23750739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 6641674 - 6641926
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| ||| |||||||| ||     
T  6641674 agcagagacataaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatcaaatgccttcaaa 6641773  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    | | ||||||||||  |||| |||||||| ||| |||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  6641774 tccttttgaattagccgttgtttcactcttctgatcttctacaatgctaggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatctt 6641873  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||||||| |||||||||||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  6641874 ctgatgaaattcagcttctggtga--tattgcttctgatgaggtgcttctgatga 6641926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 55380280 - 55380508
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  55380280 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 55380379  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  |||||    
T  55380380 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttaggcatgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatct 55380479  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     || ||||||||||||||||| |||||||    
T  55380480 cctaatgaacttcagcttctgatgatctt 55380508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29680665 - 29680398
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  29680665 agcagagacacatactgagtagtggagataatgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29680566  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||  |||||    
T  29680565 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttggagctttaagtcttgcatct 29680466  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     ||| | ||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  29680465 cctggtaaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgacgtcatcacttc 29680398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 77 - 265
Target Start/End: Original strand, 15139283 - 15139473
Alignment:
Q  77 gctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatcca 175  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||  || |||||||||||    
T  15139283 gctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaacttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatcca 15139382  T
Q  176 ttgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaac-ttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||| | || |||||||| ||||    
T  15139383 ttgaacaacctttgaatctttaagtctatcatcttctgatgaacttttagcttctggtgatcttcagcttctgacgaggtgcttctaatga 15139473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Original strand, 16632430 - 16632684
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| ||     
T  16632430 agcagagacacaaactgattggtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagaatccaatgccttcaaa 16632529  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    |   ||  || |||| ||||||||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  16632530 tcttttcaaaatagtcgttgattcactcttccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 16632629  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgac 266  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||||  ||||| |||||||    
T  16632630 cctgatgaactttagcttctagtgatc--ttgcttctgatgagatgcttttgatgac 16632684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Original strand, 45833384 - 45833625
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| || ||     
T  45833384 agcagagaccaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaaaaagcatccaatgcattcaaa 45833483  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  45833484 tactttcaaaatagaagttgcttaactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 45833583  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  45833584 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatga 45833625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 12811296 - 12811044
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||     
T  12811296 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctattagaa---caagcatccaatgccttcaaa 12811200  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| ||  | ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  12811199 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgaaactaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 12811100  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     || |||||||  |||||||||||||||| | || || ||||  ||||||||||||    
T  12811099 cctaatgaactagagcttctggtgatcttctactactgatgagatgcttctgatga 12811044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 37435656 - 37435428
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  37435656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatagtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37435557  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttagg-cgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |   |||||||||||| | || || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  37435556 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 37435457  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37435456 cctgatgaacttcagcttctggtgatctt 37435428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 19884692 - 19884916
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  19884692 agcagagacaaaaacagattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19884791  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||||| || ||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  19884792 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 19884890  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  19884891 cctgatgaactacagcttctggtgat 19884916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19621182 - 19620962
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| | | | |||||||||||||| || ||     
T  19621182 agcagagacacaaactgaatagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgctttcaaa 19621083  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| ||||||   |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||    
T  19621082 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 19620983  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctg 230  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  19620982 cctgatgaacttcagcttctg 19620962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 37985733 - 37985541
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  37985733 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37985634  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 202  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| |    ||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  37985633 tcctttcaaaatagttgttgcttcactttttcagtcttctgcgatgcttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 37985541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Original strand, 56034567 - 56034830
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |   ||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || ||     
T  56034567 agagacacatattgagtagtggagatagtagttgtacattttagacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatta 56034666  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttagg-cgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| | || || |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  ||||||||    
T  56034667 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttct 56034766  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |  |||||||||| |||||||||||||    
T  56034767 gatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatgaacttgcttctgattacgtcatcacttc 56034830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 14605028 - 14604774
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  14605028 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14604929  T
Q  111 ttcattt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | |||  || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | | | |||||||||||| ||||||   |||    
T  14604928 tccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatc 14604829  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  14604828 tcctgatgaagtttagcttctgatgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 14604774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 202
Target Start/End: Original strand, 12601099 - 12601283
Alignment:
Q  19 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttg 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||      
T  12601099 cacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttca 12601198  T
Q  119 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 202  Q
    || |||| ||||||||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||    
T  12601199 aaatagtcgttgattcactattcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgacgctttaagtct 12601283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 215
Target Start/End: Original strand, 19666362 - 19666567
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | |||| || |||||| || ||     
T  19666362 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaagaacaagtattcaatgctttcaaa 19666461  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||  |||||    
T  19666462 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttcaagctttaagtcttgcatct 19666561  T
Q  210 tctgat 215  Q
     |||||    
T  19666562 cctgat 19666567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 41114875 - 41114663
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 126  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||||| ||||  || ||  |||||||||||||||| || |||||||||| |||      
T  41114875 gagtggtggaaatagtggttgtacacgacgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaagcatccaatgccttcaaattcatttgaaatagcc 41114776  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    |||| |||| ||| || ||||| |||||||  |||| |||||||||| |||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  41114775 gttgcttcattcttctagtcttttgcaatgacaggcttgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattctctcagcttctgatgatcttcagct 41114676  T
Q  227 tctggtgatcttt 239  Q
     ||| ||||||||    
T  41114675 cctgatgatcttt 41114663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 3395580 - 3395808
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||| || ||     
T  3395580 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaactagcatccaatgctttcaaa 3395679  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| |    || |||||||||| |||| ||  ||| ||||||||| ||||| ||||||| || ||||||  |||||    
T  3395680 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttttcagttttctgcaatgcttagacgatatttaatccattgaacaacttttgaagatttaagtcttgcatct 3395779  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  3395780 cctgatgaactatagcttctagtgatctt 3395808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 9140902 - 9141094
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  9140902 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 9141001  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 202  Q
    | | ||  || |||| |||| || ||| | |  ||||||| ||||| |||| || |||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||    
T  9141002 tcctttcaaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacccttgaagctttaagtct 9141094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 22 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 22675630 - 22675402
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| |||||||| || | | ||  ||     
T  22675630 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgccttcaaatcctttcaaac 22675531  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 220  Q
    |||| |||| |||||| | || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  ||||| || |||||||    
T  22675530 tagtcgttgcttcacttttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatctcctaatgaact 22675433  T
Q  221 tcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
     |||||||||| ||| |||||||||| ||||    
T  22675432 gcagcttctggggattttttgcttctgatga 22675402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 22 - 217
Target Start/End: Original strand, 11915701 - 11915896
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| |||||||||||   |||||||||||| | |||||||||  ||||  |||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || | ||||||||     
T  11915701 aaacagagtagtggaggcggtggttgtacactttgtacaattgtccttttccaacgctcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaaa 11915800  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 217  Q
    |||| |||| ||||||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||  |||  || |||||||||||| || ||||||| ||||||||||    
T  11915801 tagtcgttgcttcactcttttagtcttctgcaatgatgggcgtgattaaatcatttgagcagcctttgaagcttcaattctctcagcttctgatga 11915896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 232
Target Start/End: Original strand, 10072925 - 10073146
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||| ||||||||||| ||     
T  10072925 agcagagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcctccaatgccttcaaa 10073024  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||| | |  ||||||||| ||| |||  || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  10073025 tcctttcaaactagcagttgcttcacttttccagtcttctgctatgcttaaacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 10073123  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggt 232  Q
     |||||||||| | |||||||||    
T  10073124 cctgatgaactactgcttctggt 10073146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19912002 - 19911760
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc-ttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaa 109  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||  ||| ||||||||||| || ||| |  ||||||||||||| || ||    
T  19912002 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattatactatgtcaacgctctttcaaagaataagcatccaatgctttcaa 19911903  T
Q  110 cttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
     | | ||  || |||| |||| ||||||   |||||||| ||||||| || | || |||| |||| |||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||    
T  19911902 atcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatctattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatc 19911803  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
    | |||||||||| || |||||| |||||||  |||||| ||||    
T  19911802 tcctgatgaactacaacttctgatgatcttcagcttctgatga 19911760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 10692841 - 10693107
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  10692841 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10692940  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||| ||  ||||| |||||||||| |||  |  |||||    
T  10692941 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10693038  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     |||||||||| ||||||||||||||  |  |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10693039 cctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 10693107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 10906607 - 10906873
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  10906607 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 10906706  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||| ||  ||||| |||||||||| |||  |  |||||    
T  10906707 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgagtttgaatccgttaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 10906804  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     |||||||||| ||||||||||||||  |  |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10906805 cctgatgaactacagcttctggtgattctcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 10906873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 264
Target Start/End: Original strand, 22089721 - 22089831
Alignment:
Q  153 aatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgat 252  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||| ||||     
T  22089721 aatgttaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctt-aattctttcatcttctgatgatctttagcttctggtgatcttcaacttctgatgag 22089819  T
Q  253 gtgcttctgatg 264  Q
    || |||||||||    
T  22089820 gtacttctgatg 22089831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 27 - 270
Target Start/End: Original strand, 413008 - 413251
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 126  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || | ||| ||| ||||||||| || | | ||  ||||||      
T  413008 gagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaattagcc 413107  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |   |||| |||||||||| ||||    
T  413108 gttgcttcacttttcgagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgaatctcctgatgaactgcagc 413205  T
Q  226 ttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtca 270  Q
    |||||||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  413206 ttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 413251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14904477 - 14904249
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| ||     
T  14904477 agcagagacacaaactgagtggtggagataatggttgtttacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgtcttcaaa 14904378  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || | |  |||| |||||| | |  |||||||||||||  ||| || |||||||||| ||| | | | |||||||||| | ||||  |||||    
T  14904377 tcctttcaaaatggacgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcctagacgagattaaatcctttgaatagcttttgaagctttaggtcttgcatct 14904278  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||    
T  14904277 cctgatgaactacaacttctggtgatctt 14904249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 165 - 261
Target Start/End: Original strand, 23123576 - 23123672
Alignment:
Q  165 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctg 261  Q
    |||||||| ||||| |||| ||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||    
T  23123576 gattaaattcattgaacaatctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttctg 23123672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 17247245 - 17247456
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||  || | ||| ||| ||||||||| || | | ||  |||    
T  17247245 aaacagagtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgttctttgaagaacaaacattcaatgccttcaaatcctttcaaat 17247344  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 220  Q
    |||| |||| |||||| |||   |||||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||    |||||| ||||||||||    
T  17247345 tagtcgttgcttcactttcc-aatcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--attcatctcctgatgaact 17247441  T
Q  221 tcagcttctggtgat 235  Q
     ||||||||||||||    
T  17247442 gcagcttctggtgat 17247456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 13576235 - 13576012
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  || | |||||||| |||||||| ||     
T  13576235 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13576136  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||| |  | |  |||||    
T  13576135 tcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatct 13576038  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  13576037 cctgatgaactgcagcttctggtgat 13576012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 29121362 - 29121455
Alignment:
Q  13 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||    
T  29121362 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccagtgcctt 29121455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 17788152 - 17787962
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgt-caacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||| |||  ||| |  ||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  17788152 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattgtcctttttccaacgttctccaaagaataagcatctaatgcctttaaattcctttgaaatagt 17788053  T
Q  126 tgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttca 223  Q
      |||       || || ||||||||||||| || |||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||| ||| ||||| |||| |||||    
T  17788052 cattg-------cttctagtcttctgcaatgataagcgtgattaaatcatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctaatgatcttca 17787962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17398795 - 17398699
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  17398795 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 17398699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 6517475 - 6517546
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  6517475 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 6517546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 39 - 251
Target Start/End: Original strand, 3483739 - 3483952
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 138  Q
    |||||||||| | | ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| ||||||     
T  3483739 tagtggttgtgcgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactt 3483838  T
Q  139 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 237  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |   |||||||||| ||||||  |||||  | |||||||  | |||||||||||||    
T  3483839 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagtttttgaagctttaagtcttgcatctcttaatgaactataacttctggtgatct 3483938  T
Q  238 tttgcttctaatga 251  Q
    |  |||||| ||||    
T  3483939 tcagcttctgatga 3483952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 16853493 - 16853585
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||  || |||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||    
T  16853493 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacagatgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgc 16853585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3105540 - 3105469
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||| |||||||||||||    
T  3105540 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctt 3105469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 14833449 - 14833614
Alignment:
Q  74 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaat 172  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||    
T  14833449 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 14833548  T
Q  173 ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | || ||||||| ||||||    
T  14833549 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatctt 14833614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 226
Target Start/End: Original strand, 17540396 - 17540598
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||  ||  |  | ||||||| || ||| |  | ||| |||||    
T  17540396 aaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaat 17540495  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 221  Q
    ||||||||| |||| |||    ||||| ||||||| |||||| |||||||||  ||| ||| ||  |||||||| || ||| ||| |||||||||| |||    
T  17540496 tagttgttgcttcattctttcagtcttttgcaatgataggcgagattaaatcatttgaacagcc--tgaagcttcaattctttcaacttctgatgatctt 17540593  T
Q  222 cagct 226  Q
    |||||    
T  17540594 cagct 17540598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 20977447 - 20977516
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 80  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  20977447 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 20977516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 22 - 155
Target Start/End: Original strand, 54679931 - 54680064
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  ||     
T  54679931 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaa 54680030  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat 155  Q
    ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||    
T  54680031 tagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaat 54680064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 40860657 - 40860749
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  40860657 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacatcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 40860749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 8105628 - 8105698
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  8105628 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 8105698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 22190836 - 22190907
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  22190836 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 22190907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 38513868 - 38513939
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||| |  |||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  38513868 agcagagacaaaaacagagtagtgaaagtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 38513939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 56533182 - 56533112
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  56533182 agcagagaca-aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 56533112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 8685548 - 8685511
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattg 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8685548 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattg 8685511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 14154115 - 14154065
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 61  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||    
T  14154115 agcagagacaaaaacagagtagtggagaaggtggttgtacacttcgtacaa 14154065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 80
Target Start/End: Original strand, 16940026 - 16940075
Alignment:
Q  31 agtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 80  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  16940026 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctc 16940075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 222 - 270
Target Start/End: Original strand, 17540629 - 17540675
Alignment:
Q  222 cagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtca 270  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17540629 cagcttctggtgatctt--gcttctgatgaggtgcttctgatgacgtca 17540675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 212 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 9751470 - 9751403
Alignment:
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga--tgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||||| ||||||||||||||   | |||||| ||||  | ||||||||||||||||||||||||    
T  9751470 tgatgaactgcagcttctggtgatacatagcttctgatgaactttgcttctgatgacgtcatcacttc 9751403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 39419855 - 39419787
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  39419855 agcagagacaaaaacagagtaatggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 39419787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 61)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22455100 - 22454845
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22455100 agcagagacacaaactgagtagtggaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 22455001  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  22455000 ttcatttgaattaactgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttgggcgtgattaaatccattgaacacccttttgaagctttaagtctctcatct 22454901  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  22454900 tctgaagaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatga 22454845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Original strand, 25189391 - 25189629
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  25189391 agagacacaaattgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaacttc 25189490  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 213  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  25189491 atttgaattagtcattgcttcactctcctggtcttctgcaatgctaggtgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttcta 25189590  T
Q  214 atgaac-ttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
    || ||| || |||||| |||||||||  |||||| ||||    
T  25189591 ataaacttttagcttcaggtgatcttcagcttctgatga 25189629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23595677 - 23595415
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | | | | |||| |||||||||||| ||     
T  23595677 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct--tcagagaacaagaatccaatgccttcaaa 23595580  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  23595579 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggtgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctttcatctt 23595480  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23595479 ctgatgatcttcagcttctggtgaac--ttgcttctgatgaggtgcttctgatgacgtcatcacttc 23595415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39037752 - 39037484
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  39037752 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatctaatgccttcaac 39037653  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||| ||||  |||||||||||| |||| || ||| ||||||| || ||||||||||||| || |||||||||||||    
T  39037652 ttcatttgaattagccgttgcttcactttcctaatcttctgcaatgcttagacgagatcaaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtctctcatct 39037553  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||| ||||| | |||| |||||||||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  39037552 tctgatcaactttaacttccggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 39037484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 19540406 - 19540671
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||| ||     
T  19540406 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaataccttcaaa 19540505  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
      | || ||| |||  |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  19540506 acctttcgaaatagccgttgcttcactctcctagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 19540605  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
      |||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19540606 catgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatgaggtgcttctgatgacgtcatcacttc 19540671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 24377091 - 24377359
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||  | ||     
T  24377091 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctctcaaa 24377190  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
      | ||  || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  24377191 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatct 24377290  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  24377291 cttgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatgaactttcttctgatgacgtcatcacttc 24377359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18377016 - 18376748
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  18377016 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18376917  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| ||||||||||| |     |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  18376916 tcctttcaaaatagtagttgattcactattaaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtctctcatct 18376817  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  18376816 tcaaatgaacttcaacttctggtgatcttctgcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttc 18376748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 21537358 - 21537107
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||     
T  21537358 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaagcaagcatccaatgcctccaaa 21537259  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
      | ||  || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  21537258 acctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgtttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21537159  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctg 261  Q
     ||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||| |||||||||    
T  21537158 cctgatgaacttcatcttctagtgatctttaacttctgatgaggtgcttctg 21537107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41121829 - 41121565
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||| |||||| ||| |||||  |||||||||||| ||     
T  41121829 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacatttcgcacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagagcaataatccaatgccttcaaa 41121730  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    | | |||||||||||  ||| |||||||  |   |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||| || |||    
T  41121729 tccttttgaattagtctttgcttcactcatccaatcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaattctcacagctt 41121630  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||| ||||||||||||||||  | |||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  41121629 ctgatgatcttcagcttctggtga--tgttgcttctgatgaggtgcatctgatgacgtcatcacttc 41121565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 25829124 - 25829352
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  25829124 agcagagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 25829223  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||  |||||    
T  25829224 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtcttgcatct 25829323  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25829324 cctgatgaactttagcttctggtgatctt 25829352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 22188212 - 22187957
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  22188212 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgttaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22188113  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    |  |||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| |    
T  22188112 tctattcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatgt 22188013  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  22188012 cctgatgaacttcaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 22187957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 13964088 - 13963859
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  13964088 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13963989  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||| ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||    
T  13963988 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 13963889  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttt 239  Q
     ||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13963888 actgatgaactagagcttctagtgatcttt 13963859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20568860 - 20568605
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  20568860 agcagatacacaaactgagtagtggggatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 20568761  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || | ||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||| | ||| ||||| |||||| ||||||  |||||    
T  20568760 tcctttcaaaattgttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatggaacagcctttaaagctttaagtcttgcatct 20568661  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||  ||||||||||||    
T  20568660 cctgatgaactacagcttctggtgatcttgaacttcttatgagatgcttctgatga 20568605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 23234997 - 23235252
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||| ||     
T  23234997 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgccttcaaa 23235096  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||| ||  || |||| |||| || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  23235097 ttctttcaaaatagtcgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 23235196  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
      |||||||||  ||||||||||||| ||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  23235197 catgatgaactagagcttctggtgattttcagcttctgatgagatgcttctgatga 23235252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 23184414 - 23184158
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  | | | | || | |||||||||||| ||     
T  23184414 agcagagacacaaactgagtagaggaggtagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgct--tcagagaaca-gaatccaatgccttcaaa 23184318  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    ||||||||||||||| || | |||||||| ||||||||||||| || |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  23184317 ttcatttgaattagtcgt-gcttcactcttctggtcttctgca-tgctaggtgtgattaa-tcctttgaacaacctttgaagctt-aattct-tcatctt 23184223  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23184222 ctgatgatcttcagcttctggtgaactt--gcttctgatgaggtgcttctgatgacgtcatcacttc 23184158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 30666979 - 30667199
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  30666979 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgccttcaaa 30667078  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||| ||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||    
T  30667079 tcctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaattcttgcatct 30667178  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctg 230  Q
     |||||||||| || ||||||    
T  30667179 cctgatgaactacaacttctg 30667199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10009860 - 10009606
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  10009860 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 10009761  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcact-ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||  ||||    
T  10009760 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctcttggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatc 10009661  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||  ||||||||||||    
T  10009660 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttt--cttctgatgagatgcttctgatga 10009606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9015478 - 9015226
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || ||     
T  9015478 agcagagatacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac--cgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 9015381  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  9015380 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 9015281  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| ||||  || |||||||||    
T  9015280 cctgatgaactttagtttctgg-gatcttctgcttctgatgagttgtttctgatga 9015226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 24850776 - 24850520
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  24850776 agcagagacacacactgagtagtggatgtagtggttgtacatttcgtacacttgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttgaaa 24850677  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgt-taggcgtgattaaatccattgtacaaccttt-gaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | ||  || || | |||| |||||||| ||||||||| ||||||  ||| || |||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||  ||||    
T  24850676 tcctttcaaaatattcgttgcttcactcttctggtcttcagcaatgcgtagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 24850577  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    | |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||    
T  24850576 tcctgatgtacttcagcatctggtgatctttagcttctgatgaggtgcttctgatga 24850520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25037369 - 25037114
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || ||     
T  25037369 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25037270  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  ||||||| |||   ||||||| |  ||||||||||||| || | |  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  25037269 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25037170  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  25037169 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 25037114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25041476 - 25041221
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || ||     
T  25041476 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgaacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 25041377  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  ||||||| |||   ||||||| |  ||||||||||||| || | |  |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  25041376 tcctttcaaattagtcgttacatcactcttccagtcttctgcaatgcttcgacaagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 25041277  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  25041276 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 25041221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 24576025 - 24576279
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  | ||| || |||||||||||||     
T  24576025 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaactctcttcaacgaacaaacaaccaatgcctttaaa 24576124  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtga-ttaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||  | || |||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  ||||    
T  24576125 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagatttaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtattgcatc 24576224  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||  |||||| | ||||| ||||||||||||    
T  24576225 tcctaatgaactttagcttctggtgatc--ttgcttatgatgatatgcttctgatga 24576279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 277
Target Start/End: Original strand, 44881173 - 44881421
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||  || ||  || ||||||||||||| ||   |||||||||||| |    
T  44881173 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaactctctccaacaaaaaaacatccaatgccttcaaacccatttgaattagct 44881272  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    | || |||| ||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||| ||  ||| ||| |||||||||||| || | ||||| |||||||||| ||||||||    
T  44881273 gctgcttcattcttccagtcttctgcaatgatagacgtgattaagtcatttgaacagcctttgaagcttcaattatctcagcttctgatgatcttcagct 44881372  T
Q  227 tctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    | ||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  44881373 tttggtga--tgttgcttctgatgaggtgcttctgatgacgtcagcacttc 44881421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 22 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 26619200 - 26618998
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||  ||| |  |||||| ||||||||| || ||| ||||||     
T  26619200 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctccaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaa 26619101  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 221  Q
    ||||||||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||| ||| |||    
T  26619100 tagttgttgcttcattcttccagtcttctgcaatgataggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgttgatctt 26619001  T
Q  222 cag 224  Q
    |||    
T  26619000 cag 26618998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 30621210 - 30621431
Alignment:
Q  15 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | |     
T  30621210 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30621309  T
Q  115 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 213  Q
    ||  || |||| | || |||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||  ||||| |||    
T  30621310 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30621409  T
Q  214 atgaacttcagcttctggtgat 235  Q
    ||| ||| || ||||| |||||    
T  30621410 atgcactacaacttctagtgat 30621431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 235
Target Start/End: Original strand, 30623831 - 30624052
Alignment:
Q  15 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | |     
T  30623831 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagatcaaacatccaatgccttcaaatcct 30623930  T
Q  115 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 213  Q
    ||  || |||| | || |||||||| |  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||  ||||| |||    
T  30623931 ttcaaaatagtcgctgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttacacgagattaaatccattgaacaacctttgaacctttaattcttgcatctcctg 30624030  T
Q  214 atgaacttcagcttctggtgat 235  Q
    ||| ||| || ||||| |||||    
T  30624031 atgcactacaacttctagtgat 30624052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 28140729 - 28140509
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||  || ||     
T  28140729 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtgatggtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgttttcaaa 28140630  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||   || |||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||||||||||||| || ||||||  |||||    
T  28140629 tcctttcaaaatagttgttgcttcactccaatgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagttttaagtcttgcatct 28140530  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctg 230  Q
     | ||||||||||||||||||    
T  28140529 cccgatgaacttcagcttctg 28140509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 22272139 - 22272375
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaa-aagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||  ||  ||  |||||||||||||||| || | |||||||||||||     
T  22272139 agtagtggagatagtggttgtacacttcttacaattttcctttttcaactctctccaacgaaaaaagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtc 22272238  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
     ||| |||| ||| |  ||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||||||||||| ||  || ||||||| |||||||||| ||||||||    
T  22272239 attgcttcattcttccagtcttctgcaatgatagacgtgattaaatcatttgaacaacctttgaaactccaattctctcagcttctgatgatcttcagct 22272338  T
Q  227 tctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||  | |||||||| |||| ||| |||||||||    
T  22272339 tctggtga--tgttgcttctgatgaggtgtttctgatga 22272375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 22317583 - 22317809
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||| | ||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||     
T  22317583 agcagagataaaaactgaatagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22317682  T
Q  111 ttcatt-tgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | ||   || |||| |||| |||||||| || ||||| ||||||| ||||  | ||||||||||| || | | |||||||||||| ||||||  ||||    
T  22317683 tcctttcaaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttatgcaatgcttagatgagattaaatccaatgaaaagcctttgaagctttaagtcttgcatc 22317782  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
    |  ||||||| |  |||||||||||||    
T  22317783 tcttgatgaaatagagcttctggtgat 22317809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 38781388 - 38781642
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaact-gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaa 109  Q
    |||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||| ||||||||| ||    
T  38781388 agcagagacaaaaaatagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaatcattcaatgccttcaa 38781487  T
Q  110 cttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
     | | ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||| || || |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  38781488 atcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctacattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 38781587  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||||    || ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  38781588 ctctgatga--gacatcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 38781642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 24779333 - 24779525
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||| ||||| |||| || ||     
T  24779333 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcatacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaaacatccgatgctttcaaa 24779432  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 202  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||  |||||||| | ||||| || | || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  24779433 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtctttttcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagcttcaagtct 24779525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 19115089 - 19115300
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||| ||||  ||  |  | ||||||| || ||| |  | ||| ||||||||||    
T  19115089 gagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacactctccaacgaataggcatccactggcttcacatccatctgaattagtt 19115188  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    |||| |||| ||| |  ||||||||||||  |||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||||||     
T  19115189 gttgcttcattcttccagtcttctgcaatagtaggcgagattaaattctttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcagca 19115288  T
Q  227 tctggtgatctt 238  Q
     ||| |||||||    
T  19115289 cctgatgatctt 19115300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 6574223 - 6573973
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa-ttggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  ||    
T  6574223 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaa 6574124  T
Q  121 ttagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg--ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 218  Q
     |||| |||| |||||| | |  |||||||||||||  |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| |  | |  ||||||||||||||    
T  6574123 ctagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcattagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatcttctgatgaa 6574026  T
Q  219 cttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtca 270  Q
    || || ||||| ||||| ||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||    
T  6574025 ctgcaacttctagtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtca 6573973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 156
Target Start/End: Original strand, 40782467 - 40782612
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || ||     
T  40782467 agcagagacacaaactaagtattggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgctttcaaa 40782566  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg 156  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||  |||||||| |||||||    
T  40782567 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatg 40782612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 39 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20152117 - 20151921
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || ||   |||| ||||||     
T  20152117 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaactaaccgttgcttcactt 20152018  T
Q  139 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
    | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| || | |  ||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  20152017 ttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaa-tgttgcatctcctgatgagctgcagcttctggtgat 20151921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 239
Target Start/End: Original strand, 18702744 - 18702956
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 126  Q
    |||||||||||||||| |||| | || |||||||||||  ||||  ||||| |||  ||| || ||||||| |||||||| || ||| ||||||||||      
T  18702744 gagtagtggagatagttgttgcatacttcgtacaattgtccttttccaacgttctccaaagagtaagcatctaatgccttcaaattcttttgaattagcc 18702843  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    |||  ||||  || || |||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||| |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||| ||||| ||    
T  18702844 gttacttcatgcttctagtcttctgtaatgatagacgtgattaaaacatttgaacaacctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatcttcaact 18702943  T
Q  227 tctggtgatcttt 239  Q
     ||| ||||||||    
T  18702944 cctgatgatcttt 18702956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 28711808 - 28711664
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  28711808 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28711709  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat 155  Q
    |||||| ||| |||| |||| || ||| | |  ||||||||||||    
T  28711708 ttcattcgaaatagtcgttgctttacttttccagtcttctgcaat 28711664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 31800997 - 31800905
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||    
T  31800997 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactttgtcaacgctctttgaagatcaaacatccaatgc 31800905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 91 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 18430970 - 18430835
Alignment:
Q  91 aagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttga 190  Q
    |||||| ||||||||| || ||| ||||||||||  |||| ||||  || || ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||||||||||    
T  18430970 aagcattcaatgccttcaaattcttttgaattagccgttgcttcatgcttctagtcttctgcaatgataggcgtgattaaaacatttgaacaacctttga 18430871  T
Q  191 agcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    ||||| || ||| ||| |||||||||| ||||||||    
T  18430870 agctttaattctttcagcttctgatgatcttcagct 18430835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 28551028 - 28550932
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  28551028 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 28550932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 44840424 - 44840520
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  44840424 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 44840520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22776398 - 22776302
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  22776398 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 22776302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22781776 - 22781680
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  22781776 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 22781680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 165 - 265
Target Start/End: Original strand, 7609107 - 7609205
Alignment:
Q  165 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatg 264  Q
    |||| ||||||||| ||| || ||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||||    
T  7609107 gattgaatccattgaacagcccttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatg 7609204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 1587142 - 1587047
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |   ||||||||||||||||    
T  1587142 agcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaattagcatccaatgccttt 1587047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 14581505 - 14581601
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| || | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  14581505 agcagagacaaaatcagagaagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 14581601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 51
Target Start/End: Original strand, 22258191 - 22258231
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 51  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22258191 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtaca 22258231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 47 - 238
Target Start/End: Original strand, 22260432 - 22260624
Alignment:
Q  47 gtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtc 146  Q
    |||||| || |||||||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||||||| | |||| || | | |   || || |||||| |||||| | |  |||    
T  22260432 gtacacttcttacaattgtactatgtcaaagctcttcaaagaacaagcatccagttccttcaaatccttccaaaatatttgttgcttcacttttccagtc 22260531  T
Q  147 ttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||  ||||| ||||||| ||| | ||||||||||||||    
T  22260532 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgacgctttaagtcttgcatctcctgatgagctttaacttctggtgatctt 22260624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 31968153 - 31968061
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  31968153 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 31968061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 40332077 - 40332173
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  40332077 agcagagacaaaaacagagtaatggagttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 40332173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 62
Target Start/End: Original strand, 33074216 - 33074267
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaat 62  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33074216 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaat 33074267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35744110 - 35744039
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  35744110 agcagagacaaaaactgagtagtggagatagtagttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 35744039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 22802451 - 22802521
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||| |||||    
T  22802451 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaactctctt 22802521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30557415 - 30557360
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  30557415 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 30557360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 106
Target Start/End: Original strand, 3277037 - 3277115
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| | |||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  3277037 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatatcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 3277115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 22785749 - 22785669
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | ||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  22785749 gagtagtggagatagtggttatacactttgtacaaaagtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 22785669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 6392624 - 6392694
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  6392624 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgcgcacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 6392694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 28701339 - 28701244
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||| |||| ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||    
T  28701339 agcagggacaaaaacaaagtagtggaggtaatggttgtacacttcgtacaaacttactttgtcaacgccctttgaagaacaagcatccaatgcctt 28701244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 19498048 - 19498012
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 52  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  19498048 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 19498012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 39 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 23392750 - 23392686
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||  ||||||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  23392750 tagtggttgtacacttcgtacagttgtactaggtcaacgctctttgagaagaaagcatccaatgc 23392686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 34322030 - 34321950
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || |||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||| |||||||||||||    
T  34322030 gagtagtgaagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagaatccaatgccttt 34321950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 153; Significance: 4e-81; HSPs: 63)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 4e-81
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 39284727 - 39284463
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || |||    
T  39284727 agagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 39284628  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 213  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  39284627 atttgaattagtcgttgtttcactcttctggtcttcagcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagcctttgaagctttgattctctcatcttctg 39284528  T
Q  214 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  39284527 atgatcttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 39284463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 9e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 13018671 - 13018406
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| |||    
T  13018671 agcacagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaaaatccagcatccaatgccttcaac 13018572  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||||||| || |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||  |||| |||    
T  13018571 ttcatttaaaatagtcgttgcttcactctcctagtcttctgcaatactgggcgtgattaaatccattgaacagccttttgaagctttaag--tctcgtct 13018474  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  13018473 tcatatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgaggtgcttctgaagacgtcatcacttc 13018406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 126; E-Value: 5e-65
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 41842439 - 41842174
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||| |||| |||||||| ||| |||    
T  41842439 agcagagacacaaactgagtagtgcaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactctgtcaacgcactttaaaaaacaagtatccaatgtcttcaac 41842340  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||| |||| || |||| || ||| ||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  41842339 ttcatttgaattagtcgttgcttcactctcctgatcttatgcagtgcttagacgagatcaaatcaaatgaacaacctttgaagctt-aagtctctcatct 41842241  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| || | ||||||||||  ||||||||||    
T  41842240 tctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgctactaatgaatttacttctgatgatttcatcacttc 41842174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 21695393 - 21695661
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  21695393 agcagagacacaaactgagtagttgaggtactggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21695492  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    |   |||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  21695493 tcattttgaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatct 21695592  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
      |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  21695593 cttgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttc 21695661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 29935524 - 29935260
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  29935524 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 29935425  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||  |||| ||||||||||||  || ||||||  |||||     
T  29935424 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttaagtgtgattaaatatattgaacaacctttgaaattttaagtcttgcatctc 29935325  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  29935324 ctgatgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatgacatcatcacttc 29935260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16316723 - 16316470
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||     
T  16316723 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 16316624  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||| ||||| |||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||     
T  16316623 tcctttcaaaatagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaattcttagacgtgattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcc 16316524  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  16316523 cctgatgaacttcaacttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 16316470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 44467056 - 44467325
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  44467056 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 44467155  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  44467156 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 44467255  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||    
T  44467256 tcctgatgaacttcagcttttggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatggcgtcatcacttc 44467325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 12 - 277
Target Start/End: Original strand, 15088513 - 15088780
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| || |    
T  15088513 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgtcttcaaat 15088612  T
Q  112 tcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
     | ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| | ||||  |||||     
T  15088613 cctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttacgtcttgcatctc 15088712  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||||| |  ||||||||||||||||  |||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  15088713 ctgatgaattagagcttctggtgatcttcagcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 15088780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 36 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 13032213 - 13032045
Alignment:
Q  36 agatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattca 135  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13032213 agatagtggttgtacacttcgtacaattatactttgtcaacgctcttcaaaaagccagcatctaatgtcttcaacttcatttgaaatagttgttgcttca 13032114  T
Q  136 ctctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctc 203  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||    
T  13032113 ctctcctggtcttctgcaatactaggcgtgattaaatccattgaacaaccatttgaagctttaagtctc 13032045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Original strand, 11792899 - 11793140
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||     
T  11792899 agcagagacacaaactaagtggtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgctttcaaa 11792998  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| ||||||||  |||||||  |||||| |||| || |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||    
T  11792999 tgctttcaaaatagtcgttgcttcactcttatggtctttcgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatct 11793098  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  11793099 cctgatgaacttcagcttctggtgatctttagcttctgatga 11793140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 13302802 - 13303030
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||     
T  13302802 agcagagacacaaactgagtagtggtgatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 13302901  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| || ||||||| ||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  13302902 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctacaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13303001  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||    
T  13303002 cctaatgaactacagcttctggtgatctt 13303030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 10883339 - 10883084
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||     
T  10883339 agcagagacgcaaactgagtagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaggcatccaatgccttcaaa 10883240  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  |||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||  |||||    
T  10883239 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgaaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgcatct 10883140  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||   ||||||||||||    
T  10883139 cctgatgaactacagcttctggtgatcttcagcttctgatgggatgcttctgatga 10883084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 2913774 - 2913546
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  2913774 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 2913675  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| | |||| | || |||||||||| || ||||  | |||||||| ||||| ||| ||||||||| || ||||||  |||||    
T  2913674 tcctttcaaaatagtcgttgctccacttttctagtcttctgcattgtttagatgagattaaattcattgaacagcctttgaagatttaagtcttgcatct 2913575  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2913574 cctgatgaactacagtttctggtgatctt 2913546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Original strand, 11319400 - 11319652
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| || || | |    
T  11319400 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtgcaattgtaatttgtcaacgctcttcaaaaaacacgcatccaatgcattcaaatcc 11319499  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || ||||||||  ||||||||    ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||  |    
T  11319500 tttcaaaatagttgttacttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacatcctttgaagcttgaagtcttgcatctctt 11319599  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||| || || ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  11319600 gatgacctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 11319652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 13138061 - 13137833
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  13138061 agcagagacataaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 13137962  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    |   ||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||   |||||||||||||| ||||||  |||||    
T  13137961 tcttttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgattaacctttgaagctttaagtcttgcatct 13137862  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     || |||||||  ||||||||||||||||    
T  13137861 ccttatgaactagagcttctggtgatctt 13137833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 13648721 - 13648949
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||||||     
T  13648721 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagatcaagcatccaatgtctttaaa 13648820  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||| |||||    
T  13648821 tcctttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgcgattaaatccattgaacatcttttgaagctttaagtctcgcatct 13648920  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||||||| ||| |||||||| |||||||    
T  13648921 cctgatgagctttagcttctgttgatctt 13648949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Original strand, 28409034 - 28409285
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | |    
T  28409034 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcc 28409133  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || || |||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | | ||||  |||||  |    
T  28409134 tttcaaaataattgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttatgtcttgcatctctt 28409233  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||| |||||||||||| || |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  28409234 gatgaactttagcttctggtga-ctgttgcttctgatgagatgcttctgatga 28409285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 13894162 - 13893949
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact 111  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| ||| || ||| | ||| ||| ||||||||| || |    
T  13894162 gcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacgttgtacaattgtcctttttcaatgctttttaaagaacaaacattcaatgccttcaaat 13894064  T
Q  112 tcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
     | ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  13894063 ccttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtatttcatcttc 13893964  T
Q  212 tgatgaacttcagct 226  Q
    |||||| ||||||||    
T  13893963 tgatgatcttcagct 13893949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 21692279 - 21692504
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  21692279 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 21692378  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  ||  ||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||  | |||||||  ||||| | ||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  21692379 tcctttcaaaacagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagaagagattaaaatcattgaataacttttgaagctttaagtcttgcatct 21692478  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     || ||||||||||||||||| ||||    
T  21692479 cctaatgaacttcagcttctgatgat 21692504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 22578187 - 22577933
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||| ||||||||| ||     
T  22578187 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaatcattcaatgccttcaaa 22578088  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||  || ||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  22578087 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatct 22577988  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgac 266  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||  |||||||||||||    
T  22577987 cctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcctctgatgagatgcttctgatgac 22577933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 21283536 - 21283311
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |    
T  21283536 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcatccaatgccttcaaatcc 21283437  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || | |  |||| || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | ||    
T  21283436 tttcaaaatggacgttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcct 21283337  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21283336 gatgaacttcaacttctggtgatctt 21283311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 2500030 - 2500298
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| ||||| |||    ||||||||||||| || ||     
T  2500030 agcagagacacaaactgagtagtggagaaagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaactctcttcaaaggataagcatccaatgctttcaaa 2500129  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  2500130 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 2500229  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     ||||  |||   |||||||||||||| |  |||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  2500230 cctgaaaaacaagagcttctggtgatcctcagcttctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttc 2500298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 33691878 - 33691610
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| || ||||||||     
T  33691878 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaacgcctttaaa 33691779  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||| ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||||  |||||    
T  33691778 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccatttaacagcctttgaagctttatgtcttgcatct 33691679  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     ||||||||||  ||||||||||||| ||   ||||||||| |  |||||||||| |||||| ||||||    
T  33691678 cctgatgaactagagcttctggtgattttcaacttctaatgaacttgcttctgataacgtcaccacttc 33691610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 16 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 19237204 - 19236969
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 115  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | |    
T  19237204 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtagtttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctt 19237105  T
Q  116 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgat 215  Q
    |  || |||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  19237104 tcaaagtagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctagacgagattaaatcctttgaacagcctttgaagctttaactctctcatcttctggt 19237005  T
Q  216 gaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
     | |||||||| ||  |||||||  |||||| ||||    
T  19237004 aatcttcagctcctaatgatcttcagcttctgatga 19236969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 30025897 - 30026165
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||| ||     
T  30025897 agcagagacacaaactgagtagtagagatattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatcgaatgccttcaa- 30025995  T
Q  111 ttcattt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    ||| |||  || |||  |||| ||||||||    ||||||||| ||| |||  || || |||||||||||  || | |||||||||| ||||||  ||||    
T  30025996 ttcttttcaaaatagccgttgcttcactctttcagtcttctgcgatgcttatacgagactaaatccattgaccagcgtttgaagctttaagtcttgcatc 30026095  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |  |||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  30026096 tcttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 30026165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 13880096 - 13880351
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||| |||||||| ||     
T  13880096 agcagagacacaaagtgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatctaatgccttcaaa 13880195  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||  |  ||||||||||||| |||| || |||||| ||||||| ||| |||||||||||| | ||||  ||  |    
T  13880196 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcgtcgagtcttctgcaatgcttagacgagattaagtccattgaacagcctttgaagctttatgtcttgcaatt 13880295  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||||||  |||||||  |||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  13880296 cctgatgaactagagcttctcatgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 13880351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 9069554 - 9069779
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| |  || | ||||||| ||||||||||||     
T  9069554 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctccttgaagaacaagcatacaatgcctttaaa 9069653  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| ||  ||||||||| ||| |||||||||||||||| |||| |  |||||    
T  9069654 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatcccttgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 9069753  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||| |  |||||||||||||    
T  9069754 cctgatgaaatagagcttctggtgat 9069779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 24788136 - 24788361
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||  |||||  || | |||||| |||||||||| || | |    
T  24788136 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaattctctttgaagaacaagcacccaatgccttcaaatcc 24788235  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || || | |||| |||||||| || ||||||||||||| ||||  |  |||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  24788236 tttcaaaatattcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagatgatattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 24788335  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||    
T  24788336 aatgaacttcagcttctggtgatctt 24788361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 12366914 - 12366690
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||  |||||||||| || ||     
T  12366914 agcagagacacagactgattagtggaggtagtggttgtatacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacagacatccaatgctttcaaa 12366815  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| ||| || ||||||||| |||| |  || ||    
T  12366814 tcctttcaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaacagcccttgaagctttaagttttgcacct 12366715  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtga 234  Q
     ||||||||||||||||||||||||    
T  12366714 cctgatgaacttcagcttctggtga 12366690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 238
Target Start/End: Original strand, 15467924 - 15468136
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 126  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||| || ||||     
T  15467924 gagtagtggaggtaatggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttaaaatagtc 15468023  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 225  Q
    ||||||||||||| |  |||||||||| ||  ||| || ||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  |||    
T  15468024 gttgattcactcttccagtcttctgcattgcctagacgagattaaatctattgaacaccctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagc 15468123  T
Q  226 ttctggtgatctt 238  Q
    ||||||| |||||    
T  15468124 ttctggtaatctt 15468136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13730839 - 13730656
Alignment:
Q  13 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaactt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || |     
T  13730839 cagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcattcaaatc 13730740  T
Q  113 catttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 195  Q
      ||  || |||  |||| ||||||||  | ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13730739 ttttcaaaatagccgttgcttcactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 13730656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 5000985 - 5000784
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||| ||| | ||||||| |||||| || || | |    
T  5000985 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgttcttcaaagaacaagcattcaatgctttcaaatcc 5000886  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcac-tctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
     ||  || |||| |||| ||||| |||| ||||||| ||||||| || |||| |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||||    
T  5000885 tttcaaaatagtcgttgcttcacttctcttggtcttttgcaatgcttgggcgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatcttc 5000786  T
Q  212 tg 213  Q
    ||    
T  5000785 tg 5000784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28622522 - 28622257
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||| ||| ||||||||||||| ||     
T  28622522 agcagagacaaaaacagagaagtagaggtagtggttgtacacctcgtacaattgtactttgtcaacgccctttgaaaaacaaacatccaatgccttcaaa 28622423  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  ||||||  |||| |||||| | || || |||||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |  |||||    
T  28622422 tcctttcaaattagccgttgcttcacttttctagtattctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 28622325  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcactt 276  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||| |||||    
T  28622324 cctgatgaactgcagcttctggtgatttttagcttatgatgaacttgcttctgatgacgtcaccactt 28622257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 40 - 238
Target Start/End: Original strand, 13692372 - 13692562
Alignment:
Q  40 agtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactct 139  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||  ||| | ||||||||||||| |||| |         || ||||||||| ||||||||    
T  13692372 agtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctataaagatcaagcatccaatgtctttca---------aaatagttgttgcttcactct 13692462  T
Q  140 cctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     |  ||||||||||||| |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  13692463 tccagtcttctgcaatgcttatacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttacatcttctgatgagctttagcttctggtgatctt 13692562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Original strand, 13880608 - 13880775
Alignment:
Q  39 tagtggttgtac-acatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcact 137  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | |||||||||| |||||| || | | ||||||||||| |||| ||||||    
T  13880608 tagtggttgtaccacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaatccttttgaattagtcgttgcttcact 13880707  T
Q  138 ctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctc 205  Q
    || || ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||    
T  13880708 cttctagtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctc 13880775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16310073 - 16309978
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  16310073 agcagagacacaaactgagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctt 16309978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13260781 - 13260536
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| | |||| ||||||  || | ||||||||||||||           
T  13260781 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatctcaatgctcttccaagaacaagcatccaatgc------t 13260688  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    |||||  ||| ||||||||| || ||||  ||||||||| |||||| || | || |||||||||||||  |||  ||||| ||||| ||||||  |||||    
T  13260687 ttcataagaa-tagttgttgctttactcctctggtcttccgcaatgcttggacgagattaaatccatt-aacagtctttggagctttaagtcttgcatct 13260590  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||  ||||| ||||||    
T  13260589 cctgatgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctaatgagatgcttatgatga 13260536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30944489 - 30944271
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| ||     
T  30944489 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 30944390  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| | |   |||||||||||  |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |  |||||    
T  30944389 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctgcaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatct 30944292  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctg 230  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  30944291 cctgatgaactgcagcttctg 30944271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 331637 - 331905
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| || |  ||  |||||||||||||||| |      
T  331637 agcagagacacaaactgtgtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacatttgtactttgtcaacgcttttgagcaa-taagcatccaatgccttcaga 331735  T
Q  111 ttcatt-tgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | ||   || ||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||| || | ||   || |||||||   |||||||||||||||| ||||| | ||||    
T  331736 tcctttcaaaaatagctgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttggacgaccttgaatccataaaacaacctttgaagctttaagtc-cgcatc 331834  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga---tgtgcttctgatgacgtcatcactt 276  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||| ||||   | |||||||||||||||||||||||    
T  331835 tcctgatggacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttttgcttctgatgacgtcatcactt 331905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16112050 - 16111955
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  16112050 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 16111955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23280113 - 23279900
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  ||     
T  23280113 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaac 23280014  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 220  Q
    |||  |||| | |||| | |  ||||||| ||||| |||| |  ||||||||||| || | | |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||    
T  23280013 tagccgttgctccacttttccagtcttctacaatgcttagacaagattaaatcca-tgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaact 23279915  T
Q  221 tcagcttctggtgat 235  Q
     || |||||||||||    
T  23279914 acaacttctggtgat 23279900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 15 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30945518 - 30945304
Alignment:
Q  15 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 114  Q
    |||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |  | ||||||||||||||||| || | |     
T  30945518 gagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaggaacaagcatccaatgccttcaaatcct 30945419  T
Q  115 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 213  Q
    ||  || ||||||||| |||||| | |   |||||| ||||  |||| || |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||  |  ||||| |||    
T  30945418 ttcaaaatagttgttgcttcacttttccaatcttctacaatacttagacgagattaaatccgttgaacaacctttgaagctttaag--ttgcatctcctg 30945321  T
Q  214 atgaacttcagcttctg 230  Q
    ||||||| |||||||||    
T  30945320 atgaactgcagcttctg 30945304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 48237068 - 48236802
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||||||  ||||||| ||     
T  48237068 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatctgatgccttcaaa 48236969  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || | || |||| |||||  |    ||||| ||||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||| |||  |  |||||    
T  48236968 tcctttcaaacttgtcgttgcttcaccttttcagtcttatgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 48236871  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  48236870 cctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttc 48236802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 9709968 - 9709745
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||  |||||||| ||||| ||||||| ||| ||| |||||||||||||  || | |||||||| |||||||| ||     
T  9709968 agcagagacaaaaacagagcagtggatgtagtggttttacacttcgtacagttgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9709869  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||| |  | |  |||||    
T  9709868 tcctttcaaactaggcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaggctttgaagcttta--tgttgcatct 9709771  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  9709770 cctgatgaactgcagcttctggtgat 9709745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 147 - 230
Target Start/End: Original strand, 4494634 - 4494718
Alignment:
Q  147 ttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4494634 ttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctg 4494718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 4821466 - 4821561
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||| |||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  4821466 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttttcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 4821561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 33605677 - 33605772
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  33605677 agcagagacaaaaacatagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 33605772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 14 - 107
Target Start/End: Original strand, 1293025 - 1293118
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  1293025 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 1293118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 14426542 - 14426634
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  14426542 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 14426634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 106
Target Start/End: Original strand, 14193108 - 14193201
Alignment:
Q  13 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  14193108 cagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctt 14193201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 48062986 - 48062890
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  48062986 agcagagacagaaacagagtaatggagatagtggttgtacgcttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 48062890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Original strand, 8182922 - 8182971
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtaca 60  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8182922 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaca 8182971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 19711176 - 19711108
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  19711176 agagacaaaaacagagtagtggaaatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctt 19711108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Original strand, 27871710 - 27871778
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  27871710 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 27871778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 35952851 - 35952783
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  35952851 agagacaaaaacagagtaatggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 35952783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Original strand, 14425444 - 14425531
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  14425444 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 14425531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 184 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9098251 - 9098205
Alignment:
Q  184 cctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9098251 cctttgaagctttaattctctcatcttctgatgatcttcagcttctg 9098205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 9098384 - 9098284
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 138  Q
    |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | ||| |||| ||||| || || | | ||||||||||  |||| |||||||    
T  9098384 tagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaaacatctaatgcattcaaatccttttgaattagccgttgcttcactc 9098285  T
Q  139 t 139  Q
    |    
T  9098284 t 9098284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19339400 - 19339324
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  19339400 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19339324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 24794881 - 24794813
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  24794881 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 24794813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 70
Target Start/End: Original strand, 4494569 - 4494628
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggacttt 70  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4494569 agcagagacaaaaagagagtagtggaggtagcggttgtacacttcgtacaattgtacttt 4494628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2265674 - 2265614
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  2265674 aaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 2265614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 210 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16111852 - 16111784
Alignment:
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||| |  | |||||||||||||||||||||||    
T  16111852 tctgatcaactgcagcttctggtgatttttatcttctaataaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 16111784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047 (Bit Score: 147; Significance: 1e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0047
Description:

Target: scaffold0047; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 9899 - 10162
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||     
T  9899 agcagagacacaaacatagtagtggaggtagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 9998  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| | | ||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  9999 ttcatttgaattagtcgttgttgcactcttctgatcttctgcaatgctagacgtgattaaatccttagaacagcctttgaagctttaagtttctcatctt 10098  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcactt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10099 ctgatgaacttcagcttctggtga--tattgcttctaatgaggtgcttctgatgacgtcatcactt 10162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0047; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Original strand, 30283 - 30448
Alignment:
Q  74 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaat 172  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||    
T  30283 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 30382  T
Q  173 ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | || ||||||| ||||||    
T  30383 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatctt 30448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 4)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 220234 - 220488
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||     
T  220234 agcagaggcacaaactgagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatg-cttcaaa 220332  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| ||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  220333 ttcatttgaattagccgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaaaccaatgaacagcctttgaagctttaagtctctcatct 220432  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  220433 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaggtgcttctgatga 220488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 377674 - 377419
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  377674 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaa- 377576  T
Q  111 ttcatttgaat-tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
     || ||| ||| |||| |||| |||||||| | |||||||||||||| |||| || |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||  ||||    
T  377575 atcctttcaatatagtcgttgcttcactcttccggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattcaacaacatttgaagttttaagtcttgcatc 377476  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    | ||||||||||  | ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  377475 tcctgatgaactataacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 377419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 20 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 244390 - 244172
Alignment:
Q  20 acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttga 119  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| || | | |||||    
T  244390 acaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttga 244291  T
Q  120 attagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaac 219  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||||  ||| ||| |||||||| ||| || ||||||||||||| |||| |    
T  244290 attagttgttgcttcactcttctggtcttctgcaacgccaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaaacttcaattctctcatcttct-atgatc 244192  T
Q  220 ttcagcttctggtgatcttt 239  Q
    ||||||| ||| ||||||||    
T  244191 ttcagctcctgatgatcttt 244172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 211394 - 211465
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  211394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtagttgtatacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 211465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 11 - 246
Target Start/End: Original strand, 9952 - 10188
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||     
T  9952 agcagcgacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcgaatgccttcaaa 10051  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||||||||||||||  |||| ||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||| ||||    
T  10052 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatccattgaacagccatttgaagctttaagtctcttatct 10151  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttct 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  10152 tctgatgaacttcagcttctggtgaactttagcttct 10188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 55)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 21028788 - 21029056
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21028788 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggctgtacacttcatacaattgtactttgtcagcgctcttcaaaaagcaagcatccaatgccttcaac 21028887  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||||||| || |  | |||||||| ||||| ||||| | |||||||| ||||||||||| |    
T  21028888 ttcatttgaattagtcgttgcttcactcttatggtcttctgcaatgcttggatgagattaaattcattgaacaacatatgaagctttaagtctctcatat 21028987  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||| ||||  |||||||||||||||||||  |||||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  21028988 tctaatgatattcagcttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttttgatgacgtcatcacttc 21029056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 8e-67
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 26702214 - 26701946
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||||||| |||    
T  26702214 agcagagacacatactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcatcactcttcaaaaagcaagaatccaatgccttcaac 26702115  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |  || |||| |||||||   ||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  26702114 ttcatttgaattaattgttgcttcactctcctggtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccatataacagcctttgaagctttaagtctcccatct 26702015  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  | |||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  26702014 tctgatgaactttagcttctggtgatcttcagtttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttc 26701946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33256436 - 33256183
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  33256436 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33256337  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||| || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  33256336 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33256237  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  33256236 cctgttgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 33256183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 33276608 - 33276355
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  33276608 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 33276509  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||| || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  33276508 tccttttaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 33276409  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  33276408 cctggtgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 33276355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 28492489 - 28492222
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  28492489 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 28492390  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  28492389 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgatattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 28492290  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcactt 276  Q
     |||||||||| || ||||||  ||||||  |||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  28492289 cctgatgaactacaacttctgaagatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcactt 28492222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 260
Target Start/End: Original strand, 22153852 - 22154102
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||| || ||     
T  22153852 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 22153951  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  |||||||||||| |||||| | || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  22153952 tcctttcaaattagttgttgcttcactattctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22154051  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttct 260  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||||    
T  22154052 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttctacttcttatgagatgcttct 22154102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 1577862 - 1578127
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| || ||     
T  1577862 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattatactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 1577961  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||| ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  1577962 ttctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 1578061  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     ||||| ||||| ||||||| ||||||  |||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||    
T  1578062 cctgataaactttagcttcttgtgatc--ttgcttctgacgagatgtttctgatgacgtcatcacttc 1578127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 10757416 - 10757682
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||| |||||||||| || ||     
T  10757416 agcagagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaatcatccaatgctttcaaa 10757515  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| ||| | |||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||    
T  10757516 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgattttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatc 10757615  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcactt 276  Q
    | ||||||||||||||||| || |||||  |||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||    
T  10757616 tcctgatgaacttcagcttttgatgatc--ttgcttctgatgaacttgctcctgatgacgtcatcactt 10757682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 21191947 - 21191766
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |    
T  21191947 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 21191848  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 195  Q
     |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  21191847 ttttgaattagctgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttgggtgtgattaaatactttgaacaacctttgaagctt 21191766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22600267 - 22600014
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  22600267 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22600168  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| || ||||| |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  22600167 tcctttcaaaatagtcgttgttttactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatct 22600068  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgat 263  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||    
T  22600067 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgat 22600014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 12284418 - 12284646
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  12284418 agcagagacacaaactgattagtggagatagtgtttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12284517  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||  |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  12284518 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 12284617  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12284618 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 12284646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 12613899 - 12613700
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||| | |||||| ||||||| || ||     
T  12613899 agcagagacacaaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaacgctcttcaaagaacaagcaaccaatgctttcaaa 12613800  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    | | ||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || |||||||||||    
T  12613799 t-cttttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcttttgaacaacctttgaagctttaaatctctcatctt 12613701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17025029 - 17024784
Alignment:
Q  31 agtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttg 130  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||   ||| ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| ||||    
T  17025029 agtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcatttttcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcgttg 17024930  T
Q  131 attcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 230  Q
     ||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||  | ||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17024929 cttcactcttatggtcttttgcaatgttatgcgtgattaaatcctttgaacagacattgaagctttaattctctcagcttctgatgatcttcagcttctg 17024830  T
Q  231 gtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||  | |||||||| ||| |  ||||||||||||||| ||||||||    
T  17024829 gtga--tgttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgttatcacttc 17024784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 48704199 - 48704452
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | |||||||||| |||||| ||     
T  48704199 agcagagacataaattgagtagtggagacattggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaagcatccagtgccttcaaa 48704298  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| |  |||||||||| || |||  || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  48704299 tcctttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcattgcttaaacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 48704398  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||  | |||||| ||||  ||||||||||||    
T  48704399 tctgatgaactttagcttctggtgatc--tagcttctgatgagatgcttctgatga 48704452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20954558 - 20954303
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||| |||||||| || ||     
T  20954558 agcagagaaacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttggtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcctccaatgctttcaaa 20954459  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || | |   ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  20954458 tcctttcaaaatggccattgcttcactcttcctgtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20954359  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  20954358 cctgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 20954303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 254
Target Start/End: Original strand, 1900340 - 1900584
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||||     
T  1900340 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcttacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 1900439  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||  |||||    
T  1900440 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaataacctttgaagctttaagtcttgcatct 1900539  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt 254  Q
     ||||||||||  | ||||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  1900540 cctgatgaactagatcttctggcgatctttagcttctgatgatgt 1900584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 19717519 - 19717772
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||| | |||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||| ||     
T  19717519 agcagagacacaaactgatttgtggagttagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccgatgccttcaaa 19717618  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||| ||||||||| || | || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  19717619 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcctctgcaatgcttcgacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 19717718  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     |  |||||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  19717719 ccatatgaactttagcttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 19717772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 38282562 - 38282814
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||| ||||||||||||     
T  38282562 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgta-acttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctttaaa 38282660  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||   |||| |||||||| |  ||||||||| ||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  38282661 tcctttcaaaatacccgttgcttcactcttccagtcttctgcgatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 38282760  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgat 263  Q
     ||||||||||  ||||| ||||||||||| || ||| ||||  ||||||||||    
T  38282761 cctgatgaactagagcttttggtgatctttagcatctgatgagatgcttctgat 38282814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 15 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 32786018 - 32785782
Alignment:
Q  15 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 114  Q
    |||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | |     
T  32786018 gagacaaaaacatagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttttaagaacaagcatccaatgccttcaaatcct 32785919  T
Q  115 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 213  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||  ||    
T  32785918 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcatg 32785820  T
Q  214 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
    ||||||| || ||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  32785819 atgaactacaacttctagtgattttcagcttctaatga 32785782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 22201821 - 22201601
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | | | ||||||||||||||||| ||     
T  22201821 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcatagaacaagcatccaatgccttcaaa 22201722  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| || ||| |    ||||||||||||| |||| || |||||||| |||||  || ||||||  |||| ||||||  |||||    
T  22201721 tcctttcaaaatagttgttgctttactttttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatgcattgagcagcctttgtcgctttaagtcttgcatct 22201622  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctg 230  Q
     ||||||| ||| ||||||||    
T  22201621 cctgatgagctttagcttctg 22201601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 2268526 - 2268777
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  |  | ||||||| ||||||||| ||     
T  2268526 agcagagacaaaaacagagtagtcgaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgacgaacaagcattcaatgccttcaa- 2268624  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
     |||||| ||  | | |||| || ||||| |  ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  |||||    
T  2268625 atcatttcaa--aatagttgcttaactcttccagtcttctacaatgattagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagccttaagtcttgcatct 2268722  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     || |||||||| ||||||| ||||| | |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  2268723 cctaatgaactttagcttctagtgat-tgttgcttctgatgagatgcttctgatga 2268777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 14 - 195
Target Start/End: Original strand, 2267087 - 2267269
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || |||    
T  2267087 agagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgcactttgacaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaattc 2267186  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 195  Q
     ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2267187 tttcaaactagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctt 2267269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 36134185 - 36134410
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||| ||| ||     
T  36134185 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg-cttcaaa 36134283  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| | |||| | |  |||||||||| || ||||  | |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||   ||||    
T  36134284 tcctttcaaaatagttgttgctccacttttccagtcttctgcattgtttagatgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 36134383  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    ||||||||    |||||||||||||||||    
T  36134384 tctgatga--gacagcttctggtgatctt 36134410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 35401821 - 35402057
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |    
T  35401821 agtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcg 35401920  T
Q  128 ttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    ||| |||||| | |  |||||||| | || |||  || |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  |||||||||||||    |||||    
T  35401921 ttgcttcacttttccagtcttctgtattgtttaaacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagct 35402018  T
Q  227 tctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  35402019 tctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 35402057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 22427442 - 22427219
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  22427442 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttttaagaacaagcatccaatgccttcaaa 22427343  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||  ||||||||||| |  | |  |||||    
T  22427342 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacagtctttgaagcttta--tgttgcatct 22427245  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     ||||||||||  |||||||||||||    
T  22427244 cctgatgaactggagcttctggtgat 22427219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Original strand, 29215792 - 29215982
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | |||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  29215792 agcagagacaaaaacagagtagtggagctagtgattgtacacttcgtacaattgtactttgttatcgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29215891  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagt 200  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||| | || ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  29215892 tcctttcaaactagccgttgcttcacttttctagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagt 29215982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23036595 - 23036359
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 127  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||  ||||||||  || | ||||||||||||| ||| || | | ||  || ||||||    
T  23036595 agtagaggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgttgacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaatcctttcaaaatagttg 23036496  T
Q  128 ttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    ||| |||||| |  | |||||||||| |  |||| || |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||  |||||||||||||    |||||    
T  23036495 ttgtttcacttttttagtcttctgcattatttagacgagattaaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatga--gacagct 23036398  T
Q  227 tctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  23036397 tctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 23036359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 2834684 - 2834950
Alignment:
Q  11 agcagagacaca-aactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaa 109  Q
    |||||||||| | ||| |||||||||||  ||||||||||||  ||||||||| | |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||||||| ||    
T  2834684 agcagagacaaagaacagagtagtggaggcagtggttgtacaattcgtacaatcgtactttgtcaacgttctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa 2834783  T
Q  110 cttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
     | | ||  ||||||  |||| |||||| |    ||||||  ||||| |||| || |||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||  |  |||    
T  2834784 atcctttcaaattagccgttgcttcactttttcagtcttcaacaatgcttagacgagattgaatccattgaacaactttggaagctttaagttgc--atc 2834881  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    | | |||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||    
T  2834882 tcccgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctaatgacttgcttctgatgacgtcaccacttc 2834950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 16235381 - 16235115
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||   | | ||||||| ||||||||| ||     
T  16235381 agcagagacaaaaaaggagtagtggaggtagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttggagaacaagcattcaatgccttcaaa 16235282  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| | |  |||||||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| || || |||  |||||    
T  16235281 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcattgtttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagttttaaatcttgcatct 16235182  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    | ||||||    || ||||||||||||||  |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  16235181 tatgatga--gacaacttctggtgatcttcagcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttc 16235115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 22464894 - 22464716
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  22464894 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggatgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa- 22464796  T
Q  111 ttcattt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaaccttt 188  Q
     ||||||  ||||||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| ||||  | |||||||||| ||| |||||||||    
T  22464795 atcatttcaaattagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagatgagattaaatccgttgaacaaccttt 22464716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 39201077 - 39200986
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatg 102  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  39201077 agcagaaacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg 39200986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 30893090 - 30893316
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| |||| || ||| | |||||||| | ||| || || | |    
T  30893090 agagacacaaacttagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcagcgctattcaaagaacaagcatctagtgctttcaaatcc 30893189  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
     ||  || |||   ||| |||||||  ||| |||| ||||||| || | || |||| |||||| || |||||| |||||| ||| ||||||  ||||| |    
T  30893190 tttcaaaatagcctttgcttcactcctctgatcttttgcaatgcttggacgagattgaatccaatgaacaaccttttgaaactttaagtcttgcatctcc 30893289  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  30893290 tgatgaactttagcttttggtgatctt 30893316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 35040161 - 35040253
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  35040161 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagatcaagcatccaatgc 35040253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Original strand, 46088984 - 46089080
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  46088984 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 46089080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 48570316 - 48570220
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  48570316 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 48570220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 25448651 - 25448556
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  25448651 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 25448556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 170 - 277
Target Start/End: Original strand, 7309973 - 7310080
Alignment:
Q  170 aatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtc 269  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||| ||||| ||||||||||  |||||| ||||  || |||||||||||||    
T  7309973 aatccattgaacagcttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgagctttagcttatggtgatcttcagcttctgatgagatgtttctgatgacgtc 7310072  T
Q  270 atcacttc 277  Q
    ||||||||    
T  7310073 atcacttc 7310080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 21702809 - 21702880
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  21702809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 21702880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 30572192 - 30572263
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  30572192 agcagaaacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 30572263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 18896665 - 18896523
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  ||||  ||||| |||  ||| |  |||||||||||||||| || ||| ||||||||||  |    
T  18896665 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtccttttccaacgttctccaaagactaagcatccaatgccttcaaattcttttgaattagccg 18896566  T
Q  128 ttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaa 170  Q
    ||| |||   || || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  18896565 ttgcttcttgcttctagtcttctgcaatgataggcgtgattaa 18896523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 208 - 277
Target Start/End: Original strand, 12284648 - 12284716
Alignment:
Q  208 cttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12284648 cttctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 12284716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 19215607 - 19215676
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 80  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||   ||| |||||||||||    
T  19215607 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaatcacactatgtcaacgctc 19215676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 23024783 - 23024852
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 80  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  23024783 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 23024852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21121149 - 21121057
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21121149 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacgtcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21121057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2327525 - 2327454
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| || | ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||    
T  2327525 agcagagacaaaaccagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctt 2327454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 44821630 - 44821559
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  44821630 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctt 44821559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 10250984 - 10251076
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||  |||||  || |  ||||||||||||||||    
T  10250984 agagacaaaaacagagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaaaactctttgaagaataagcatccaatgcctt 10251076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21135245 - 21135153
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||  || |  |||||||||||||    
T  21135245 agcagagacaaaaacagagtagtggatttagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 21135153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 37642243 - 37642314
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  37642243 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtataaacgtactatgtcaacgctctt 37642314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 206 - 277
Target Start/End: Original strand, 19215790 - 19215860
Alignment:
Q  206 atcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||   ||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||    
T  19215790 atcttctgatgatctgcagcttctggtga--atttgcttctgatgaatttgcttctgatgacgacatcacttc 19215860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 211 - 277
Target Start/End: Original strand, 37642433 - 37642501
Alignment:
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga--tgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||  | ||||||| ||||||||||||||||    
T  37642433 ctgatgaactgcagcttctggtgatatatagcttctgatgaactttgcttctaatgacgtcatcacttc 37642501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 30 - 103
Target Start/End: Original strand, 42284642 - 42284715
Alignment:
Q  30 tagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  42284642 tagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaaaaagcatccaatgc 42284715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14263525 - 14263465
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |  ||||| ||||||||||    
T  14263525 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgctttgccaacgctctt 14263465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21204997 - 21204937
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  21204997 aaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 21204937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 103
Target Start/End: Original strand, 21984607 - 21984683
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21984607 gagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21984683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0364 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0364
Description:

Target: scaffold0364; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 6003 - 6268
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  6003 agcagagacacaaatagagtagtagaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 6102  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    | | |||||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  6103 tccttttgaattagttgttgcttcggtcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagctttaaatctctcatctt 6202  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  | |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  6203 ctgatgaacttcaacttctagtga--tattgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 6268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 53)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18321319 - 18321055
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| | || | |    
T  18321319 agagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcccttcaaagaacaagcatccaatgccctcaaatcc 18321220  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || ||| ||||| ||||||||  ||||||  ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  18321219 tttgaaaatagctgttgcttcactcttttggtctcatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcct 18321120  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18321119 gatgaacttcagcttctggtgatcttctacttctgatgagatgcttctgatgacgtcatcacttc 18321055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 8e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 17701733 - 17701988
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||  |||||| |||||||||||||  |   ||||||||||||||| ||     
T  17701733 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattatactttgccaacgctcttaaaggaattagcatccaatgccttcaaa 17701832  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17701833 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtctctcatct 17701932  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | || |||||||||||||    
T  17701933 tctgatgaacttcagcttctggtgatcatctgcttctgaagaggtgcttctgatga 17701988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Original strand, 19707497 - 19707746
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||| ||| | ||| ||| ||||||||| || |||    
T  19707497 agagacacaaactgagtagaggatgtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgttcttcaaagaacaaccattcaatgccttcaaattc 19707596  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 213  Q
    |||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||| ||| ||| ||| |||||||||||| || ||| ||||||||||    
T  19707597 atttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgttaggaatgattaagtcctttgaacagcctttgaagctttaattctttcatcttctg 19707696  T
Q  214 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| ||||    
T  19707697 atgatcttcagcttctggcgatc--ttgcttctaatgaggtgcttctaatga 19707746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 19156184 - 19156452
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  19156184 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 19156283  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  ||||||| |||| |||||||| || |||||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  |||||    
T  19156284 tcctttcaaattagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaattcttgcatct 19156383  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
      ||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  19156384 cttgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttc 19156452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 11 - 217
Target Start/End: Original strand, 43644884 - 43645090
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  43644884 agcagagacacaaaccgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttattaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 43644983  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    ||||||||||||||  |||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  43644984 ttcatttgaattagccgtttcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagctttgattctctcatctt 43645083  T
Q  211 ctgatga 217  Q
    | |||||    
T  43645084 ccgatga 43645090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 11 - 263
Target Start/End: Original strand, 16207294 - 16207547
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  16207294 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16207393  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| | |||||||||| ||||||  |||||    
T  16207394 tcctttcaaaatagtagttgctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatct 16207493  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgat 263  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  16207494 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctaatgagatgcttctgat 16207547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 602883 - 602615
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  602883 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 602784  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||||| || ||||||||||||| || ||||||  ||| |    
T  602783 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccaatgaacaacctttgaagttttaagtcttgcattt 602684  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||| |||| | ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  602683 cctgatgaactttagcttcttgtgatctttagcttttgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 602615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 39693523 - 39693778
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  39693523 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 39693622  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||  ||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  39693623 tcctttcaaaatagtcattgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 39693722  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||| || || ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||| ||||||    
T  39693723 cctgatgagctacaacttctggtgatcttcagcttctgatgacatgcttttgatga 39693778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 12757923 - 12757662
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |    
T  12757923 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 12757824  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||| ||| || ||||||  ||||| ||    
T  12757823 tttcaaaatagttgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttaaagttttaagtcttgcatctcct 12757724  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatca 273  Q
    ||||||||  |||| |||||||||||  |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||    
T  12757723 gatgaactagagctactggtgatcttcagcttctgatcaacttgcttctgatgacgtcatca 12757662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 16188972 - 16189225
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||| ||     
T  16188972 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttagaagaataagcatccaatgccttcaa- 16189070  T
Q  111 ttcattt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
     ||||||  || |||| |||| |||||||| |  |||||||||||| ||| | || |||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  16189071 atcatttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatggttggacgagattaaatccattaaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 16189170  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    | || ||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||  | ||||||||||    
T  16189171 tcctaatgaacttcggcttctggtgatc--ttgcttctaatgagatacttctgatga 16189225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 238
Target Start/End: Original strand, 33082873 - 33083073
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 138  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||| |||| |||||||    
T  33082873 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactc 33082972  T
Q  139 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatct 237  Q
    | ||| |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33082973 ttctgatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagcttctggtgatct 33083072  T
Q  238 t 238  Q
    |    
T  33083073 t 33083073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 18121269 - 18121005
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||   |||| ||||||||||| ||||||| || ||||||  || | ||||||||||||||||||||     
T  18121269 agcagagacagaaacagagtagttgaggtagtggt---acacttcgtacaattgtactttgttaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 18121173  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  |||||    
T  18121172 tcctttcaaaatagcagttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaaactttaagtcttgcatct 18121073  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  18121072 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatggcgtcatcacttc 18121005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 16681466 - 16681238
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||     
T  16681466 agcagagacacaaactgagtactagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 16681367  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||  |||||    
T  16681366 tcctttcaaactagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 16681267  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  16681266 cctgatgaactttagcttctagtgatctt 16681238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 14 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17441967 - 17441704
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||| ||| || | |    
T  17441967 agagacacaaaatgagtagtggagatagtggttgtacacttagtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatg-cttcaaatcc 17441869  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || |||| |||| || | ||| |  ||||||||||||| ||||  | |||||| ||||||| ||||||||| |||||| ||||||  ||||| ||    
T  17441868 tttcaaaatagtcgttgctttagtcttccagtcttctgcaatgcttagaggagattaagtccattgaacaacctttaaagctttaagtcttgcatctcct 17441769  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||||||||||||||||    
T  17441768 gatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgattagatgcttctgatgacgtcatcacttc 17441704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 262
Target Start/End: Complemental strand, 17525889 - 17525641
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | |    
T  17525889 agagacacaaactgagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcc 17525790  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
     ||  || ||||||||| |||||||| |  |||||||||| || |||| ||  ||||||||||||| |||||| ||||||| || ||||||  ||||| |    
T  17525789 tttcaaaatagttgttgtttcactcttccagtcttctgcagtgcttagacgatattaaatccattgaacaaccttttgaagatttaagtcttgcatctcc 17525690  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctga 262  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  |||||||| ||||  |||||||||    
T  17525689 tgatgaactacagtttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctga 17525641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 24646326 - 24646581
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| |  |||||||||||||||  ||     
T  24646326 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactcttcaaagaataagcatccaatgcctgcaaa 24646425  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||| ||||| | ||||||  | ||||| ||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| || |||  |||||    
T  24646426 tcctttcaaaatagctgttgctacactcttttagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaactcttgcatct 24646525  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
      |||||||||  ||||||||||||||||  |||||| || |  ||||||||||||    
T  24646526 cttgatgaactagagcttctggtgatcttcagcttctgataagatgcttctgatga 24646581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 10 - 277
Target Start/End: Original strand, 18679802 - 18680069
Alignment:
Q  10 aagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaa 109  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||    
T  18679802 aagcagagacacaaactgagtagtagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaa 18679901  T
Q  110 cttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
     | |  |  || |||| |||| || ||||  |||||||| ||||||| |||| || |||| |||||| || || ||||||||||||  ||||||  ||||    
T  18679902 atcctatcaaaatagtcgttgctttactcctctggtcttttgcaatgcttagacgagattgaatccactgaactacctttgaagctctaagtcttgcatc 18680001  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||||||| |  ||||||| ||||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  18680002 ttctgatgaaatgaagcttctagtgatc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 18680069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 265
Target Start/End: Original strand, 19943234 - 19943480
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaa-agcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaa 120  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| || |||  | ||||||||||||||||| || | | ||  ||    
T  19943234 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctttttaaaggaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaa 19943333  T
Q  121 ttagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaaccttt-gaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 218  Q
     ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| | | ||||| ||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  19943334 atagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaatagccttttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 19943433  T
Q  219 cttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||| ||||  ||||||||||||    
T  19943434 cttcagcttctagtgatctttagcttctgatgagatgcttctgatga 19943480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 17914447 - 17914702
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| ||     
T  17914447 agcagagaaacaaattgagtagtggagatagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaa 17914546  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| || |||  || ||    
T  17914547 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttacagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacttttgaagctttaactcttgcaact 17914646  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     || |||| || || ||||| ||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  17914647 cctaatgagctacaacttctagtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 17914702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 21932871 - 21933096
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||     
T  21932871 agcagagacaaacactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattttactttgtcaacgctctttgaaaaacaagcatacaatgcctttaaa 21932970  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| ||||||||    ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  21932971 tcctttcaaaatagccgttgtttcactctttcagtcttatgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 21933070  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||| |  |||||||||||||    
T  21933071 cctgatgaaatagagcttctggtgat 21933096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 18718989 - 18719217
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  18718989 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 18719088  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | |  |  || |||| |||| |||||||  |||||||| ||||||| ||   || |||| |||||| || ||| |||||||||||  ||||||  |||||    
T  18719089 tcctatcaaaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttgaacgagattgaatccactgaacagcctttgaagctctaagtcttgcatct 18719188  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18719189 tctgaagaacttaagcttctggtgatctt 18719217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 23185389 - 23185166
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  |||||||||||||||| ||     
T  23185389 agcagagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 23185290  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||    
T  23185289 tcctttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatct 23185192  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  23185191 cctgatgaactgcagcttctggtgat 23185166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18685549 - 18685348
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||  ||     
T  18685549 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18685450  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttc-tgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 220  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| ||| |||  ||||||||| | || ||| | |||||||||||| ||    
T  18685449 tagttgttgcttcactcttctggtcttcttgcaatgctagacgtgattatatcctttgaacagtctttgaagcattaactcttttatcttctgatgatct 18685350  T
Q  221 tc 222  Q
    ||    
T  18685349 tc 18685348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18722798 - 18722597
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||  ||     
T  18722798 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18722699  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttc-tgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 220  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || ||| |||||||||||||| ||    
T  18722698 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgctagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatgatct 18722599  T
Q  221 tc 222  Q
    ||    
T  18722598 tc 18722597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 18731143 - 18730942
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| |||||||| || ||| ||  ||     
T  18731143 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgccttcaaattctttcaaaa 18731044  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttc-tgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaact 220  Q
    |||| |||| |||||||| || |||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | || ||| |||||||||||||| ||    
T  18731043 tagtcgttgcttcactcttcttgtcttcttgcaatgctagccgtgattaaatcctttgaacagtctttgaagcattaactctttcatcttctgatgatct 18730944  T
Q  221 tc 222  Q
    ||    
T  18730943 tc 18730942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 30421591 - 30421368
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt--aaaaaagcaagcatccaatgcctttaa 109  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||  |||| | ||||||||||||||||| ||    
T  30421591 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaa-tgtactttgtcaacgctctttgaaaagaacaagcatccaatgccttcaa 30421493  T
Q  110 cttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
     | ||||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  ||||    
T  30421492 atccattcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatc 30421395  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||    
T  30421394 ttctgatgaactgcagcttctggtgat 30421368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 238
Target Start/End: Original strand, 17267463 - 17267689
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact 111  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||| |||||| |||||| ||| | |||||||| ||||| || || |    
T  17267463 gcagagacaaaaactgagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaattgtactatgtcaatgctcttcaaagaacaagcatctaatgctttcaaat 17267562  T
Q  112 tcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
     | ||  || ||| ||||| |||||||    |||||| ||||||| || | || |||| || |||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||     
T  17267563 cctttcaaaatagctgttgcttcactcctgcggtcttttgcaatgcttggacgagattgaa-ccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctc 17267661  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     |||||||||||||||||||||||||||    
T  17267662 ttgatgaacttcagcttctggtgatctt 17267689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 20382556 - 20382304
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact 111  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| |||||| | | || || |    
T  20382556 gcagagacacaaactgattagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccactactttcaaat 20382457  T
Q  112 tcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
     | ||   | |||  |||| |||||||  || ||||| |||||||  | | || |||| ||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||  |||||     
T  20382456 cctttcagaatagccgttgcttcactcctctagtcttttgcaatgcatggacgagattgaatccattgaacagcctttgaagctttaagacttgcatctc 20382357  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  20382356 ctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 20382304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 23263757 - 23263521
Alignment:
Q  29 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || ||||  |    
T  23263757 gtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaactgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcat 23263658  T
Q  129 tgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagct-tgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    || |||||||| || |||||||||| || |||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| | | |||| |  ||||| ||||||||||||||||    
T  23263657 tgtttcactcttctagtcttctgcattgtttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagttcttaagttttgcatctcctgatgaacttcagct 23263558  T
Q  227 tctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||| |||||  |||||||| |||| |||||||||||||    
T  23263557 tctgatgatc--ttgcttctgatgaggtgcttctgatga 23263521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 29693303 - 29693558
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||| |||||| || ||     
T  29693303 agcagagacacaaactgagtagtggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctcttcaaagaacaagcatacaatgctttcaaa 29693402  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||  |||  ||||| ||||| ||||||  |||||    
T  29693403 tcctttcaaaatagtggttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattaaacagtctttggagctttaagtcttgcatct 29693502  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     || ||||||| || ||| ||||||||||  |||| | ||||  ||||||||||||    
T  29693503 cctaatgaactacaacttatggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatga 29693558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 17797410 - 17797505
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  17797410 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 17797505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 22461783 - 22461588
Alignment:
Q  29 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 128  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||  |||| ||||| ||||  ||  |  |||||||||||||||| || | ||||||||||||| ||    
T  22461783 gtagtggagatagtggttgtgcactccgtacaattgtcctttttcaactctctccaacgaataagcatccaatgccttcaaatccatttgaattagtcgt 22461684  T
Q  129 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcag 224  Q
    || |||| ||| || ||||||||||||| || ||  |||||||||| | | |||||||||||||||| || ||  ||| |||||||||| ||||||    
T  22461683 tgcttcattcttctagtcttctgcaatgatatgctagattaaatccttcgaacaacctttgaagcttaaattcgttcagcttctgatgatcttcag 22461588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 144 - 265
Target Start/End: Original strand, 22745608 - 22745730
Alignment:
Q  144 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgc 242  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||    
T  22745608 gtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatcttcagc 22745707  T
Q  243 ttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  22745708 ttctgatgagatgcttctgatga 22745730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 40845550 - 40845455
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  40845550 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 40845455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 25164058 - 25164129
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| || |||| |||||    
T  25164058 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgacaacactctt 25164129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14989614 - 14989519
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  14989614 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14989519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15336251 - 15336028
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |  |  |||||||||||||||| ||     
T  15336251 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15336152  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| ||   ||||||||||||  |||| || | || | ||||||  ||||| |||||||||| |||  |  |||||    
T  15336151 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15336054  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  15336053 cctgatgaactacagcttctggtgat 15336028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15425316 - 15425093
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |  |  |||||||||||||||| ||     
T  15425316 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15425217  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| ||   ||||||||||||  |||| || | || | ||||||  ||||| |||||||||| |||  |  |||||    
T  15425216 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15425119  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  15425118 cctgatgaactacagcttctggtgat 15425093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 15516620 - 15516397
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  |  |  |||||||||||||||| ||     
T  15516620 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgacgaataagcatccaatgccttcaaa 15516521  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| ||   ||||||||||||  |||| || | || | ||||||  ||||| |||||||||| |||  |  |||||    
T  15516520 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactttctcagtcttctgcaatctttagacgagtttgattccattaaacaacttttgaagctttaag--ttgcatct 15516423  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||||| ||||||||||||||    
T  15516422 cctgatgaactacagcttctggtgat 15516397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 45538602 - 45538336
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |   |||||||||||||||  || | ||||||||||||| ||| ||     
T  45538602 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtgatttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgtcttcaaa 45538503  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||||||  ||||| |||||||| | |||  |  ||||     
T  45538502 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatctttagacgaggttgaatccattaaacaacttttgaagccttaag--ttgcatcc 45538405  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt-gcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
      ||||||||| |||||||||||||| ||| |||| | || |  | |||||||||||||||| ||||||    
T  45538404 catgatgaactgcagcttctggtgatttttggcttatgataaactcgcttctgatgacgtcaccacttc 45538336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 6407714 - 6407785
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||    
T  6407714 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtagaaacgtactatgtcaacgctctt 6407785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 9320557 - 9320627
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||||||||    
T  9320557 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaatatactttgtcaacgctctt 9320627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18151809 - 18151714
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||| ||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  18151809 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaacgtactatgtcaatgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 18151714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 22673766 - 22673837
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  22673766 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 22673837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 205 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 24833026 - 24832953
Alignment:
Q  205 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaat-gatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  24833026 catcctctgatgaactgcagcttctggtgatttttagcttctaataaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 24832953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Original strand, 1237625 - 1237769
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||  | |||||||||||||||||  || | |||  |||||||||||| ||     
T  1237625 agcagagacaacaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgcacaaaagtactttgtcaacgctctttgaagaacaaatatccaatgccttcaaa 1237724  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat 155  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| | | |||||||||||||    
T  1237725 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccggtcttctgcaat 1237769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 24551265 - 24551357
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||| |||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  24551265 agagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 24551357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19956502 - 19956341
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact 111  Q
    ||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||  | |||||||||  |||| ||||||||||| ||  |  ||| |||||||||||| || |    
T  19956502 gcagagaca-aaacagggtattggaggtagtggttgtacaattagtacaattgtcctttttcaacgctcttcaatgaaaaagtatccaatgccttcaaat 19956404  T
Q  112 tcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatcc 174  Q
     | || |||||||| |||| |||||||| ||| |||||| ||||  |||||| | ||||||||    
T  19956403 cctttagaattagtcgttgcttcactcttctgatcttctacaatactaggcgaggttaaatcc 19956341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Original strand, 22663107 - 22663175
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  22663107 agagacaaaaatagagtagtggagatattggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 22663175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 7018454 - 7018418
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 52  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  7018454 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 7018418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 13430791 - 13430699
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||  || |  |||||||||||||    
T  13430791 agcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgc 13430699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 20259690 - 20259654
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 52  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  20259690 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 20259654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 16 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 21046320 - 21046284
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 52  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21046320 agacacaaacagagtagtggaggtagtggttgtacac 21046284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 121; Significance: 5e-62; HSPs: 60)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 5e-62
Query Start/End: Original strand, 11 - 266
Target Start/End: Complemental strand, 49642926 - 49642670
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| ||     
T  49642926 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaatcatccaatgccttcaaa 49642827  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  49642826 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatctattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 49642727  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgac 266  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||    
T  49642726 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgac 49642670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 29951602 - 29951347
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  29951602 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 29951503  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  29951502 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 29951403  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  29951402 tctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatga 29951347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 30000756 - 30000501
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  30000756 agcagagactcaaactgagtggtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 30000657  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| |||    
T  30000656 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctctggtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaaaaacctttgaagctttaagtctctcgtct 30000557  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||| || | |||||||||||||    
T  30000556 tctgatgaacttcagcttctagtgatcttcagcttctgataaggtgcttctgatga 30000501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 16032520 - 16032743
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  16032520 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 16032619  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    | | ||  || |||| |||||| |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16032620 tcctttcaaaatagtcgttgatacactctcctggtcttctgcagtgataggcatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatctt 16032719  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||    
T  16032720 ctgatg-acttcaacttcgggtgat 16032743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 14393168 - 14392940
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  14393168 agcagagacacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 14393069  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||   ||||    
T  14393068 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaaactttaagtcttgtatct 14392969  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     || |||||||||||||||| ||||||||    
T  14392968 cctaatgaacttcagcttctagtgatctt 14392940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 6090727 - 6090982
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || ||| | ||||||| ||||||||| ||     
T  6090727 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaaagctttttaaagaacaagcattcaatgccttcaaa 6090826  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  |||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  |||||||||||| || ||||||  |||||    
T  6090827 tcctttcaaattagatgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcaacctttgaagttttaagtcttgcatct 6090926  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  6090927 cctgatgaacttcagcttctggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatga 6090982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 12 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 12389035 - 12388821
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact 111  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||| ||| |  |||||||||||||||| || |    
T  12389035 gcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttgccaacgctcttcaaagaagaagcatccaatgccttaaaat 12388936  T
Q  112 tcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
    || ||||||||||| || | |||||| | ||| |||||||||||  ||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12388935 tcttttgaattagtcgtagcttcactgttctgatcttctgcaattctagacatgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttc 12388836  T
Q  212 tgatgaacttcagct 226  Q
    | |||| ||||||||    
T  12388835 ttatgatcttcagct 12388821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12963249 - 12962983
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  12963249 agcagagacacatactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacactcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 12963150  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
      | | | || ||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||| |  |||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  12963149 accttctaaaatagttgttgcttcactctcccagtcttctgcattgcttagacaagattaaatcccttgaacaacccttgaagctttaagtcttgcatct 12963050  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     |||||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  12963049 cctgatgaactacaacttctggtgatc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 12962983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 19249558 - 19249361
Alignment:
Q  29 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 128  Q
    |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||  || | ||| ||||||| ||| | ||| ||||||||||||| || | | |||||||||| |||    
T  19249558 gtagtggagtaagtggttgtacacttcgtacaattgtcctatttcagcgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaatccttttgaattagctgt 19249459  T
Q  129 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    || |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  19249458 tgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcgtttgaacaacctttgaagctttaagtctctcatcttctaatgatcttcagct 19249361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 22 - 235
Target Start/End: Original strand, 20725093 - 20725306
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| ||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||  |||| ||||||||||| || || ||||||||||||| ||| || | | |||||||    
T  20725093 aaacagagtagtggagatagttattgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgctcttcaagaaacaagcatccaatgtcttcaaatccttttgaat 20725192  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 221  Q
    |||| |||| |||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| |||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||| ||| |||||| |||    
T  20725193 tagtcgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctagacgtgattagatcttttgaacagcctttgaagctttaattctctcagcttatgatgatctt 20725292  T
Q  222 cagcttctggtgat 235  Q
    ||||||||||||||    
T  20725293 cagcttctggtgat 20725306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Original strand, 52920403 - 52920655
Alignment:
Q  13 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaactt 112  Q
    |||||||| |||| | ||||| ||| ||||||||||| || ||||||||||  | ||||||||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || |     
T  52920403 cagagacaaaaacagggtagtagaggtagtggttgtatacttcgtacaattttaatttgtcaacgctctttaaagaacaagcatcaaatgccttcaaata 52920502  T
Q  113 catttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||| ||| ||||||  ||||| |    
T  52920503 c-tttaaattagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgagcagcctttgaaactttaagtcttgcatctcc 52920601  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  52920602 tgatgaacttcagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 52920655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 37467328 - 37467556
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  37467328 agcagagacacaaactgggtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 37467427  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||| |||| |||||||| || |||| |  |||||    
T  37467428 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacaagctttgaagatttaagttttgcatct 37467527  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     |||||||||| | |||||||||||||||    
T  37467528 cctgatgaactactgcttctggtgatctt 37467556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 9e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 31303381 - 31303636
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||| |||| ||| ||     
T  31303381 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaaacatcaaatgtcttcaaa 31303480  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||  ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  31303481 tcctttcaaaatagttgttccttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttaaagctttaagtctttcatct 31303580  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||  ||||  ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  31303581 cctgagtaactagagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 31303636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 195
Target Start/End: Original strand, 41494994 - 41495179
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  41494994 agcagatacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 41495093  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 195  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  41495094 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 41495179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 13948334 - 13948584
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |    
T  13948334 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 13948433  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||| ||    
T  13948434 tttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcct 13948533  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgat 263  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||    
T  13948534 gatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgat 13948584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 2561183 - 2561408
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||  || | ||||||||||||  ||| ||     
T  2561183 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtactttgtcaacgatctttgaagaacaagcatccaatttcttcaaa 2561282  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  2561283 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 2561382  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     ||||||||||  |||||||||||||    
T  2561383 cctgatgaactagagcttctggtgat 2561408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 17239083 - 17238858
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || || | |    
T  17239083 agagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcc 17238984  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || |||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  17238983 tttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 17238884  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||    
T  17238883 tatgcacttcatcttctggtgatctt 17238858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 20646149 - 20646405
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  20646149 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 20646248  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||||| |||||||||| ||||| || | || ||| |||| ||||| ||| || ||| |||||| ||||||  ||||    
T  20646249 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttctggtcttctacaatgcttggacgagatgaaatacattgaacagccttttaaagctttaagtcttgcatc 20646348  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    | |||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  20646349 tcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 20646405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 28582103 - 28582341
Alignment:
Q  13 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaactt 112  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||  || | ||||||||||||||| |||| |     
T  28582103 cagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccattaaatc 28582202  T
Q  113 catttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
    | ||  || |||| |||| |||||||| |   ||||||||||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |    
T  28582203 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcatagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcc 28582302  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg 250  Q
    ||||||| |  ||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  28582303 tgatgaaatagagcttctggtgattttcagcttctaatg 28582341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 18121786 - 18121552
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || |  |||||| ||||||||||||     
T  18121786 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18121687  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| | |  || |||| ||||||||| |||||||||||||||| || |||  |||||    
T  18121686 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaaatcttgcatct 18121587  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgctt 244  Q
     ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||    
T  18121586 cctgatgaactagagcttctggtgatctttagctt 18121552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 38177791 - 38177566
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | | ||  || |||||    
T  38177791 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtt 38177692  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||||| |   ||||||||| || | || || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| || || ||||  |||    
T  38177691 gttgcttcactcttccaatcttctgcattgctcagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcctaataaactagagc 38177592  T
Q  226 ttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
    ||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  38177591 ttctgatgatcttctgcttctgatga 38177566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 13780748 - 13780575
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  13780748 agcagagacacaaactgagtcgtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaataacaagcatccaatgccttcaaa 13780649  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaa 183  Q
    | | ||  || |||| |||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||    
T  13780648 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaa 13780575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Original strand, 15903196 - 15903449
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt-aaaaaagcaagcatccaatgcctttaactt 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||| ||  |||||| |||||| || || |     
T  15903196 agagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaatgctcttcaaagaacaaagcatgcaatgctttcaaatc 15903295  T
Q  113 catttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
    | ||  || |||| |||| |||||||| || |||||||| |||| |||| || |||| ||||||||| ||| | |||||||||| ||||||  ||||| |    
T  15903296 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgtaatgcttagacgagattgaatccattgaacagcgtttgaagctttaagtcttgcatctcc 15903395  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||| || | |||||| ||||||||||  |||||| ||||  || |||||||||    
T  15903396 tgataaattacagcttttggtgatcttcagcttctgatgagatggttctgatga 15903449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 47207701 - 47207970
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  47207701 agcaaagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaa- 47207799  T
Q  111 ttcattt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg--ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcat 207  Q
     ||||||  || |||  |||| |||||| | |  |||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||| || |  | |  |||    
T  47207800 atcatttcaaactagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgctttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagtttta--tgttgcat 47207897  T
Q  208 cttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgt---gcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| |||| ||   |||||||||||||||| ||||||    
T  47207898 ctcctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaagttcagcttctgatgacgtcaccacttc 47207970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 30 - 277
Target Start/End: Original strand, 14969341 - 14969590
Alignment:
Q  30 tagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgtt 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||| ||  || |  |||||||||||||| | || | | ||  || ||||||||    
T  14969341 tagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaatgtactttgtcaacgctatttgaagaataagcatccaatgccatcaaatcctttcaaaatagttgtt 14969440  T
Q  130 gattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttc 228  Q
    | || ||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| | || |||||||  ||||||    
T  14969441 gctttactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatatcctcatgaactagagcttc 14969540  T
Q  229 tggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||||||  || ||| ||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  14969541 tggtgatcttcagcatctgatgaacttgcttatgatgacgtcatcacttc 14969590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 16658782 - 16658541
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || ||     
T  16658782 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 16658683  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| ||||||   |||||||| || |||| || | || |||| |||| |||| ||||||||||||| || ||||||  |||||    
T  16658682 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactgctctggtcttttgtaatgcttggacgagattgaatcaattgaacaacctttgaagtttcaagtcttgcatct 16658583  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||    
T  16658582 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatga 16658541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12726394 - 12726166
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||| ||||| ||| || ||||||||||||| || ||     
T  12726394 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgttaactctctttaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 12726295  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||  |||||||| || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||   ||||    
T  12726294 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgaatct 12726195  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12726194 cctgatgaacttcaacttcttgtgatctt 12726166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 195
Target Start/End: Original strand, 40799869 - 40800054
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||| ||||||| |||| ||     
T  40799869 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagtatccaattccttcaaa 40799968  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 195  Q
    | | ||  || |||| |||| ||| || | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  40799969 tactttcaaactagtcgttgcttcgcttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctt 40800054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18142916 - 18142696
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || |  |||||| ||||||||||||     
T  18142916 agcagagacaaacacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtaaacgctctttgaagaaaaagcattcaatgcctttaaa 18142817  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| | |  || |||| ||||||||| | | |||||||||||| || |||  |||||    
T  18142816 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctcaaacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaaatcttgcatct 18142717  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctg 230  Q
     ||||||||||  ||||||||    
T  18142716 cctgatgaactagagcttctg 18142696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22804187 - 22804092
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||| |||| ||||||||    
T  22804187 agcagagacacaaattgagtagtggagatagtggttttacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaatcatcgaatgcctt 22804092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 49553653 - 49553389
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||   || | ||| ||||||||||||| ||     
T  49553653 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctctgaagaacaaacatccaatgccttcaaa 49553554  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||   || ||||||||     |||||||||||| |||| ||   ||||||| |||  ||| |||||||| ||| ||||||  |||||    
T  49553553 tcctttcaaaatagtcactgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgatgttaaatctattaaacagcctttgaaactttaagtcttgcatct 49553454  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcactt 276  Q
     |||||||||||| |||||||||||||  || ||||| ||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  49553453 cctgatgaacttcggcttctggtgatc--ttacttctgatgagatgcttctaatgacgtcatcactt 49553389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 47405585 - 47405362
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||  || | ||| |||| |||||||| ||     
T  47405585 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacactctttgaagaacaaacatcaaatgccttcaaa 47405486  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||| | | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| |  | |  |||||    
T  47405485 tcctttcaaactagttgttgcttcatttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagcttta--tgttgcatct 47405388  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
      ||||||||| ||||||||||||||    
T  47405387 cgtgatgaactgcagcttctggtgat 47405362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 13824092 - 13824256
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagttgttgattcact 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| ||  ||||||  || ||||||||| ||||||    
T  13824092 tagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaa-atcatttcaaaatagttgttgcttcact 13824190  T
Q  138 ctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 202  Q
    || |  ||||||| || || |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  13824191 cttccagtcttcttcattgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 13824256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 12968312 - 12968528
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||  ||||| |||| ||| |  ||| |||||||||||| || ||| |||||||    
T  12968312 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtataattgtccttttccaacgttcttcaaagaataagtatccaatgccttcaaattcttttgaat 12968411  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 221  Q
    |||| |||  ||||  || || ||||||||||||| |||  ||||||||| |  ||  |||||||||||||||| || ||| ||| |||||||||  | |    
T  12968412 tagtcgttacttcatgcttctagtcttctgcaatgatagatgtgattaaaacatttaaacaacctttgaagcttcaaatctttcagcttctgatggtcct 12968511  T
Q  222 cagcttctggtgatctt 238  Q
    ||||| ||| |||||||    
T  12968512 cagctcctgatgatctt 12968528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 26417832 - 26417616
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | |||||||||   |||  ||||| |||  ||| |   ||||||||||||||| || ||| |||||||    
T  26417832 aaacagagtagtgaagatagtggttgtacactttgtacaattgtcattttccaacgttctccaaagaatgagcatccaatgccttcaaattcttttgaat 26417733  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 221  Q
    |||  |||| |||| ||| || |||||||| |||| |||||||||||||| |  ||| |||| ||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||    
T  26417732 tagccgttgcttcattcttctagtcttctggaatgataggcgtgattaaaacatttgaacaaactttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatctt 26417633  T
Q  222 cagcttctggtgatctt 238  Q
    || || ||| |||||||    
T  26417632 caactcctgatgatctt 26417616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19889107 - 19888842
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||  || || ||| | |||||||||||||| || ||     
T  19889107 agcagagacacaaactgag--gtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtaatatgtcaatcctattcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 19889010  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtaca-acctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||  |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| |||  | ||| |||||| ||||||  ||||    
T  19889009 tcctttcaaaatagtcgttgcttcactcatctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagtctttttaagctttaagtcttgcatc 19888910  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |  |||||||||| ||||||| ||||||  |||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  19888909 tcttgatgaactttagcttctagtgatc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttc 19888842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 20627595 - 20627372
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||| | ||||  |||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||| ||     
T  20627595 agcagagataaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgataaacaagcatccaatgccttcaaa 20627496  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | ||||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||  |||| || | || ||||||||  ||| | |||||||||| |||  |  |||||    
T  20627495 tccattcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaatcattagacgagtttgaatccattaaacatcttttgaagctttaag--ttgcatct 20627398  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||||| || |||||||||||    
T  20627397 cctgatgaactgcaacttctggtgat 20627372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 29 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23538312 - 23538146
Alignment:
Q  29 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||| |||  ||| |  |||||| ||||||||| || ||| |||||| ||   ||    
T  23538312 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtcctttttcaacgttctctaaagaataagcattcaatgccttcaaattcttttgaaataaccgt 23538213  T
Q  129 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 195  Q
    || |||| ||| |  ||||||||||||| |||||||||||||| |  ||| |||| |||||||||||    
T  23538212 tgtttcattcttccagtcttctgcaatgataggcgtgattaaaacatttgaacaaactttgaagctt 23538146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 11223559 - 11223653
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  11223559 agcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacatactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 11223653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 11868264 - 11868335
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  11868264 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaacgctctt 11868335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25398419 - 25398348
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  25398419 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtgctttgtcaacgctctt 25398348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 53056891 - 53056796
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||||||| |||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  53056891 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtaaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 53056796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Original strand, 14955433 - 14955517
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  14955433 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 14955517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21605818 - 21605726
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21605818 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21605726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 29855404 - 29855499
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||| | |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||| ||  || | |||||||||||||||||    
T  29855404 agcagagataaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactctgtcaacgctttttgaagaacaagcatccaatgcctt 29855499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 46796531 - 46796460
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  46796531 agcagagacaaaaacaaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 46796460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 21640865 - 21640954
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||||||||||||  ||||  |||||||||||||    
T  21640865 agagacaaaaatagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactatgtcaacgctctttgaaaaataagcatccaatgc 21640954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 46349991 - 46349769
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 127  Q
    ||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| | |||||||||| | |||   || | ||||||||||||||||| || | | ||  ||||||| |    
T  46349991 agtagtggaggcagtggttgtacacttcgtacaatcgtactttgtcaatgttctctgaagaacaagcatccaatgccttcaaatcctttcaaattagtcg 46349892  T
Q  128 ttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    ||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||  ||| |||| ||||| |||||||  | ||||  ||  ||| |||||||||| || ||    
T  46349891 ttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattggatcaattgaacaacttttgaagtcttaagttgct--tctcctgatgaactgcaact 46349794  T
Q  227 tctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||    
T  46349793 tctggtgattttcagcttctaatga 46349769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 21636834 - 21636742
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  21636834 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 21636742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24775698 - 24775554
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||  || |  |||||| ||||||||| ||     
T  24775698 agcagagacaaaaacagagtagtggatgtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaaagctctttgaagaataagcattcaatgccttcaaa 24775599  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat 155  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| | |  ||||||||||||    
T  24775598 tcctttcaaaatagttgttgcttcacttttccagtcttctgcaat 24775554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 102
Target Start/End: Original strand, 22140759 - 22140850
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatg 102  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||   | ||| |||||||||||||  || | |||||||||||||    
T  22140759 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttatacacttcgtacatacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatg 22140850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 30054381 - 30054310
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  30054381 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacatttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 30054310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 1728179 - 1728129
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 61  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  1728179 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaa 1728129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 49666569 - 49666519
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 61  Q
    |||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  49666569 agcagagacagaatcagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 49666519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 9700200 - 9700131
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 80  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  9700200 agcagagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttatacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 9700131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 165 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 25398282 - 25398184
Alignment:
Q  165 gattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatg 264  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||| ||||||    || |||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||    
T  25398282 gattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatcttatgatga--gacaacttctgatgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatg 25398185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 2785075 - 2785130
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  2785075 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 2785130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 33583240 - 33583295
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  33583240 gagtattggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 33583295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19249333 - 19249295
Alignment:
Q  239 ttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19249333 ttgcttctgatgaggtgcttctgatgacgtcatcacttc 19249295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 16 - 61
Target Start/End: Original strand, 37412605 - 37412650
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 61  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37412605 agacagaaacagagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaa 37412650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 116; Significance: 5e-59; HSPs: 3)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 49328 - 49595
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  49328 agcagagacacaaactgagtagtggagatagttgttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 49427  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| |   |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||  |||||    
T  49428 tcctttcaaaatagtagttgcttcactcttcaaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaaactttgaagctttaagacttgcatct 49527  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     |||||||||| || ||||||||||||||  |||||| ||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  49528 cctgatgaactacaacttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgatgaagtcatcacttc 49595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #2
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 32481 - 32749
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||| ||||| || ||     
T  32481 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatcaaatgcattcaaa 32580  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||  |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||  ||||||||||| ||||||  |||||    
T  32581 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagtctttgaagctttaagtcttgcatct 32680  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     |||||||||| ||  || ||||||||||| |||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  32681 cctgatgaactacaagttgtggtgatctttagcttctgatgaacttacttctgatgacgtcatcacttc 32749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 455 - 389
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   | |||||||||||||||||    
T  455 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctt 389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 12 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 20112852 - 20112584
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || || |    
T  20112852 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaat 20112753  T
Q  112 tcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
     | ||  || |||| |||| |||| ||| | |||||||||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||| ||| |||||| ||||||  |||||    
T  20112752 cctttcaaaatagtcgttgcttcattcttccggtcttctgcaatgcttagaagagattaaatccattgaacaacctttttaagctttaagtcttgcatct 20112653  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttct-aatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  |  ||||||||||||||||||||||||    
T  20112652 cttgatgaacttcagcttcaggtgatctttagcttctgaagaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 20112584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 14 - 217
Target Start/End: Original strand, 15987232 - 15987437
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact-t 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || |      
T  15987232 agagacacaaactgagtaatggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 15987331  T
Q  113 catttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
    | ||| || ||||  ||| |||||||| |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  15987332 cttttaaaatagtcattgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctctaagtctctcatcttc 15987431  T
Q  212 tgatga 217  Q
    ||||||    
T  15987432 tgatga 15987437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 15 - 265
Target Start/End: Original strand, 23284564 - 23284815
Alignment:
Q  15 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||  | ||||||| ||||||||| || | |     
T  23284564 gagacacaaactgagtagtggagataatggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaggaacaagcattcaatgccttcaaatcct 23284663  T
Q  115 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctg 213  Q
    ||  || |||  |||| |||||| | |||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| |||    
T  23284664 ttcaaaataggcgttgcttcacttttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatctcctg 23284763  T
Q  214 atgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  23284764 atgaacttcagcttctagcgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatga 23284815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 239
Target Start/End: Original strand, 9717841 - 9718068
Alignment:
Q  13 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaactt 112  Q
    |||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||||| |     
T  9717841 cagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaatc 9717940  T
Q  113 catttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
    | ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||| |    
T  9717941 ctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctacaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatctcc 9718040  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgatcttt 239  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||    
T  9718041 tgatgaactagagcttctagtgatcttt 9718068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 10640555 - 10640364
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgt-caacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||||||||| ||| | |||||||| |||||||| || | | |||||||||||     
T  10640555 agtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttttcaacgctcttcaaagaacaagcatctaatgccttcaaatccttttgaattagtc 10640456  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 218  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||    
T  10640455 gttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctctcagcttctgatgaa 10640364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 13602168 - 13602423
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | |||||||||| |||| ||| |  |||||||||||||||| ||     
T  13602168 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttatacacttcttacaattgtattttgtcaacgttcttcaaagaataagcatccaatgccttcaa- 13602266  T
Q  111 ttcattt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    |||||||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| |  |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||    
T  13602267 ttcatttcaaaatagtggttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacaagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatc 13602366  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    | ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||| | ||||  ||||||||||||    
T  13602367 tcctgatgaactatagcttcttgtgatcttcggcttttgatgagatgcttctgatga 13602423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 19470683 - 19470918
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 127  Q
    |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||  |||| || |||||||  ||| | ||||||||||||||||| || | | ||||||||||| |    
T  19470683 agtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaattgtcctttttccacgctctgcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatccttttgaattagtcg 19470782  T
Q  128 ttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagctt 227  Q
    ||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  ||||||||||| |||||| ||||| |||    
T  19470783 ttgcttcattcttctggtcttgtgcaatgctaggcgtgattaaatctgttgaacaacctttgaagcttcagttctctcatcttttgatgatcttcaactt 19470882  T
Q  228 ctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    || ||||  | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  19470883 cttgtga--tgttgcttctgatgaggtgcttctgatga 19470918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 15531777 - 15531522
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| | || ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  15531777 agcagagacaaagacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 15531678  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||   |||| || ||||| || ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||  |||||    
T  15531677 tcctttcaaaataaccgttgttttactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttcaagctttaagtcttgcatct 15531578  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || |||| ||||  ||||||||||||    
T  15531577 tctgatgaactacaacttctggtgatcttatgattctgatgagatgcttctgatga 15531522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26972379 - 26972140
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||||||     
T  26972379 agcagagacaaatactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcg--caattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgcctttaaa 26972282  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  |||||    
T  26972281 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttcaagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacatttgaagctttaagtcttgcatct 26972182  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
     |||||||| |  ||||||||||||| || ||||||| ||||    
T  26972181 cctgatgaaatagagcttctggtgattttctgcttctgatga 26972140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 32544261 - 32544486
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  || ||||||||||||||||     
T  32544261 agcagagacagaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatccaatgcctttaaa 32544360  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  32544361 tcctttcaaaatagacgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 32544460  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     ||||||||||  ||||| |||||||    
T  32544461 cctgatgaactagagcttatggtgat 32544486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 15302196 - 15302424
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||     
T  15302196 agcagagacactaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtacaatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcctttaaa 15302295  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  |||||    
T  15302296 tcctttcaaaatagccgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgtttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatct 15302395  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     || |||| ||| ||||| ||||||||||    
T  15302396 cctaatgagctttagcttttggtgatctt 15302424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 276
Target Start/End: Original strand, 19623975 - 19624239
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactt-tgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaa 109  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||  ||| ||||||||  ||| | ||| |||||||||| || ||    
T  19623975 agcaaagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactagtgt-aacgctctccaaagaacaatcatccaatgctttcaa 19624073  T
Q  110 cttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttagg-cgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
     | | ||   | |||| |||| |||||||  |||||||| ||||||| | || || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| ||  ||||    
T  19624074 atcctttcagaatagtcgttgcttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagacttgcatc 19624173  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcactt 276  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  19624174 tcctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgtttctgatgagatgcttctgatgacgtcatcactt 19624239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 19086154 - 19086411
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || |      
T  19086154 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttca-- 19086251  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgta-caacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
            || |||| |||| ||||||||||  ||||||||||||  |||| || |||||||||||||| | || || ||| ||||| ||||||  ||||    
T  19086252 --------aaatagtcgttgcttcactctcccagtcttctgcaatacttagacgagattaaatccattgaatcagcccttg-agctttaagtcttgcatc 19086342  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  19086343 tcctgatgaacttcagcttctggtgatcttcagc-tctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 19086411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 24116824 - 24117053
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  24116824 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 24116923  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | ||  || ||   | |  |||||||  |||||||| ||||||| || | || |||| ||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  ||||    
T  24116924 tcctttcaaaataaccgctacttcactcctctggtcttttgcaatgcttggacgagattgaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcatc 24117023  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24117024 ttctgatgaacttcatcttctggtgatctt 24117053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 14100592 - 14100373
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |  |||||||||||||||| ||     
T  14100592 agcagagaca-aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtataattgtactttgtcaacgctctttaaagaagaagcatccaatgccttcaaa 14100494  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||  |||||||| |  ||||||| ||||| ||||  | |||||||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  |||||    
T  14100493 tcctttcaaaatagttgtttcttcactcttccagtcttctacaatgcttagatgagattaaatccattgaacatcctttgaaactttaagtcttgcatct 14100394  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctg 230  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  14100393 cctgatgaacttcagcttctg 14100373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 12715573 - 12715306
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  | |||| ||||| |||| |     
T  12715573 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttctacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataggcatacaatg-ctttcaa 12715475  T
Q  111 ttcattt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcat 207  Q
     ||||||  || |||| |||| ||||||||     |||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  |||    
T  12715474 atcatttcaaaatagtcgttgcttcactctttcaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagccttttgaagctttaagtcttgcat 12715375  T
Q  208 cttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    || |||||||||| || ||||| ||||||  |||||||| ||| |  | ||||||||||||||||||||||    
T  12715374 ctcctgatgaactacaacttctagtgatc--ttgcttctgatgaacttccttctgatgacgtcatcacttc 12715306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 265
Target Start/End: Original strand, 13435544 - 13435783
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagtt 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| ||| |||||| || || | | ||  || ||||     
T  13435544 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaacaatcattcaatgctttcaaatcctttcaaaatagtc 13435643  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||||| |   |||||||||||| |||  || |||||||||||||| | | |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  13435644 gttgcttcactcttccaatcttctgcaatgcttaaacgagattaaatccattgaaaatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 13435743  T
Q  226 ttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    || |||||||||| ||||||| ||||  ||||| ||||||    
T  13435744 ttatggtgatcttctgcttctgatgagatgcttttgatga 13435783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 195
Target Start/End: Original strand, 18378310 - 18378495
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| | || |||||||||||||| ||     
T  18378310 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttatcaacgctcttcaaagaacatgcatccaatgccttcaaa 18378409  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 195  Q
    | | ||  || ||||||||| || ||||| |  ||||| ||||||  |||| || |||| ||||||||| |||||| |||||||||    
T  18378410 tcctttcaaaatagttgttgcttgactcttccagtcttttgcaatacttagacgagatttaatccattgaacaaccgttgaagctt 18378495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 29918013 - 29918232
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||  ||||||| ||     
T  29918013 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatctgatgccttcaaa 29918112  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    |   ||  || |||| |||| |||||| | |   |||||||||||| |||| || ||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  29918113 tcttttcaaactagtcgttgcttcacttttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatcca-tgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 29918211  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctg 230  Q
     |||||||||| |||||||||    
T  29918212 cctgatgaactacagcttctg 29918232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 22802137 - 22802360
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || | ||||||||||||||||||||     
T  22802137 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctttaaa 22802236  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||| ||  || | || |||| |||||| | |  ||| ||||||||| |||| |   ||||||||||||| |||||||||||||||| |  | |  |||||    
T  22802237 ttctttcaaacttgtcgttgtttcacttttccagtcgtctgcaatgcttagacaatattaaatccattgaacaacctttgaagcttta--tgttgcatct 22802334  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
     |||||||||| || |||||||||||    
T  22802335 cctgatgaactacaacttctggtgat 22802360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 28 - 265
Target Start/End: Original strand, 21625114 - 21625349
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||  || | ||||||| ||||||||| || | | ||| || |||  |    
T  21625114 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgttaacgctctttgaagaacaagcatgcaatgccttcaaatgc-tttcaaatagccg 21625212  T
Q  128 ttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagct 226  Q
    ||| || ||||| |   |||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  ||||| |||||||    || ||    
T  21625213 ttgctttactcttccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctgtaagtcttgcatctcctgatga--gacaact 21625310  T
Q  227 tctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||  ||||| ||||||    
T  21625311 tctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttatgatga 21625349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 102
Target Start/End: Original strand, 25594064 - 25594155
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatg 102  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| | |||||||||||||    
T  25594064 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacatttcgtacaattgtactttgtcaacgcgcttcaaagaacaagcatccaatg 25594155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Original strand, 18435552 - 18435793
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| | ||| ||||| |||||||||||||| | ||||| ||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  18435552 agcagagacaaaaacagtgtactggaggtagtggttgtacactttgtacacttgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 18435651  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| | || ||||| || || | |||| || |||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||  |||||    
T  18435652 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttctagtcttttgaaattcttagacgagattaaatccattgaataaccttcaaagctttaagtcttgcatct 18435751  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
     ||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||| ||||    
T  18435752 cctgatgaactagagcttctagtgatcttcagcttctgatga 18435793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 26943572 - 26943735
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||| ||| | |||||||||||||||||  |     
T  26943572 agcaaagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaattgtacttcgccaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttctaa 26943671  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatcc 174  Q
    | |  ||||| |||  |||| |||||||| || ||||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  26943672 tcctattgaaatagcggttgcttcactcttctagtcttctgcaatgctagacatgattaaatcc 26943735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 16265303 - 16265211
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||||||  || | ||||||||||||||    
T  16265303 agcagagacacaaacagagtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttctcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgc 16265211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 39 - 230
Target Start/End: Original strand, 19688790 - 19688980
Alignment:
Q  39 tagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactc 138  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | | ||  || ||||  ||| |||||||    
T  19688790 tagtggttatacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtccttgcttcactc 19688889  T
Q  139 tcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    | |  || |||| ||||| || | || || ||||||||||| |||||||||||||||| |||  || ||||| ||||||||||||||||||||    
T  19688890 ttccagttttctacaatgcttggacgagaataaatccattgaacaacctttgaagctttaag--tcgcatctcctgatgaacttcagcttctg 19688980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 22076560 - 22076489
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  22076560 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctt 22076489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 15 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20730853 - 20730672
Alignment:
Q  15 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttca 114  Q
    |||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||  || | ||| ||||||||||||| || | |     
T  20730853 gagacaaaaacagagcagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaaacatccaatgccttcaaatcct 20730754  T
Q  115 tttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagctt 195  Q
    ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||  ||||  | |||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  20730753 ttcaaactagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatacttagatgagattaaatcccttgaacagcctttgaagctt 20730672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 15954702 - 15954794
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  15954702 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaataacaagcattcaatgcctt 15954794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 16336123 - 16336194
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  16336123 agcagagacaaaaacagagtagtgtagatagtggttgtacacttcgtacaatcgtactatgtcaacgctctt 16336194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20488071 - 20487976
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  20488071 agcagatacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtaaacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 20487976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Original strand, 21235137 - 21235216
Alignment:
Q  27 gagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||  || | |||||||| ||||||||    
T  21235137 gagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatcgaatgcctt 21235216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 265
Target Start/End: Original strand, 25597608 - 25597730
Alignment:
Q  144 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgc 242  Q
    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| | |||||||||| || ||||||||||||||  ||    
T  25597608 gtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatgtcctgatgaactacaacttctggtgatcttcagc 25597707  T
Q  243 ttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    || | ||||  ||||||||||||    
T  25597708 ttatgatgagatgcttctgatga 25597730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 82
Target Start/End: Original strand, 12423261 - 12423328
Alignment:
Q  15 gagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  12423261 gagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaaggtactatgtcaacgctctt 12423328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 16877209 - 16877280
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  16877209 agcagaggcaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 16877280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 33352079 - 33352008
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  33352079 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtgattgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 33352008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 17 - 107
Target Start/End: Original strand, 12348995 - 12349085
Alignment:
Q  17 gacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||||||    
T  12348995 gacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgccttt 12349085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Original strand, 21618251 - 21618335
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  21618251 aaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 21618335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 34451787 - 34451556
Alignment:
Q  45 ttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctgg 144  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||| || ||| |  | |||| |||||| || || | |  |  ||||||| |||| ||||||||    |    
T  34451787 ttgtacactttgtacaattgtactttgtcaacgcttttcaaagaataggcatacaatgctttcaaatcctctcaaattagtcgttgcttcactctttcag 34451688  T
Q  145 tcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgct 243  Q
    |||||||||||| |||| ||  | | ||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||     ||    
T  34451687 tcttctgcaatgcttagacgatactgaatccattgaacagcctttgaatctttaagtcttgcatctcctgatgaactagagcttctggtgatc---aact 34451591  T
Q  244 tctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  34451590 tctaatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 34451556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 17381517 - 17381588
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||    
T  17381517 agcagagacaaaaacagaatagtggaggtagtgattgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctt 17381588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 80
Target Start/End: Original strand, 19482751 - 19482817
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 80  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  19482751 agagacaaaaacagagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 19482817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 17316678 - 17316609
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctc 80  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||    
T  17316678 agcagagacaaaaacatagtagtgcagatagtggttgtacacttcgtacaaacgcactatgtcaacgctc 17316609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 19066171 - 19066079
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||    ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  19066171 agcagagacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaacatactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 19066079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 9 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 19833187 - 19833115
Alignment:
Q  9 gaagcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||    
T  19833187 gaagcagacaca-aaacagagtagtggaggtagtgcttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctt 19833115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 14 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 10220 - 9997
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || | |    
T  10220 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttaaaaaacaagcatccaatgccttcaaatcc 10121  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacc-tttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
     ||  || |||| |||| |||||||| || ||||||||||| | ||||  | |||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||  ||||| |    
T  10120 tttcaaaatagtcgttgcttcactcttctagtcttctgcaaagcttagatgagattaaatccattgaacaaccttttgaagctttaagtcttgcatctcc 10021  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10020 tgatgaacttcagcttctggtgat 9997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 14884 - 14816
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14884 agagacacaaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 14816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0290 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0290
Description:

Target: scaffold0290; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 18734 - 18481
Alignment:
Q  13 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaactt 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| | |||| |||||||||||| || |     
T  18734 cagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagtatccaatgccttcaaatc 18635  T
Q  113 catttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
    | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||    ||| |    
T  18634 ctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgtgtctcc 18535  T
Q  212 tgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  |||| | ||||  ||||||||||||    
T  18534 tgatgaactgcagcttctggtgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatga 18481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 14 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 19584 - 19334
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| | | ||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| | |    
T  19584 agagacacaaactgagtagtgaatatagtggttgtacacttcgtacaattgtattatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgcttttaaatcc 19485  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || ||||||||| |||||||| || ||||||||||| | |||||||  ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  19484 tttcaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaattcttaggcgaaattaaatccattgaacaacttttgaagctttaagtcttgcatctcct 19385  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||| || ||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  19384 catgaactacaacttctggtgatc--ttgcttcttatgagatgcttctgatga 19334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 99320 - 99270
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 61  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  99320 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 99270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5805 - 5552
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |      
T  5805 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtagttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttaaaagaacaagcatccaatgccttcata 5706  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||| ||||| | |||||| |   |||||| ||||  || | || |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||  |||||    
T  5705 tcctttcaaaatagatgttgctccactcttccaatcttctacaatacttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctctaagtcttgcatct 5606  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     |||||||||||||||||| |||||||  ||||||||| |||  ||||||||||||    
T  5605 cctgatgaacttcagcttcaggtgatc--ttgcttctagtgagatgcttctgatga 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0337 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 14644 - 14872
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||     
T  14644 agcagagacacaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtaaaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 14743  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||| |    
T  14744 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcattt 14843  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     || ||||  || ||||||||||||||||    
T  14844 cctaatgatttttagcttctggtgatctt 14872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 1656 - 1884
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||| || ||     
T  1656 agcagagacaaaaacaaagtagtggaggtagtggttgtacacttcctacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 1755  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||||| || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  1756 tcctttcaaaatagtcgttgtttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 1855  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1856 cctgatgaacttcagcttctggtgatctt 1884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0411 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0411
Description:

Target: scaffold0411; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 12205 - 12460
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||| || ||     
T  12205 agcagagacacaatctgagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaataagcatccaatgctttcaaa 12304  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    ||| ||  || ||||||||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| ||| |||||||||||| ||||||    |||    
T  12305 ttctttcaaaatagttgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagcctttgaagctttaagtcttgtgtct 12404  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
     ||||||||||  |||||||||||||| |   ||||| ||||  ||||||||||||    
T  12405 cctgatgaactagagcttctggtgatcctcaacttctgatgagatgcttctgatga 12460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 96; Significance: 4e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 159051 - 159270
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||  |||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||||||||||||||| ||| | |||||||  |||||||| ||     
T  159051 agcagagacacaaacaaagtagtagaggtagtggttttacacttcatacaattgtcctttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatataatgccttcaaa 159150  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||| ||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  159151 ttcatttgaattagccgttgcttcactcttctgatcttttgcaatgttagacgtgattaaatcctttgaacatcctttgaagctctaagtctctcatctt 159250  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctg 230  Q
     |||||  ||||||||||||    
T  159251 ttgatggtcttcagcttctg 159270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 251
Target Start/End: Original strand, 39529 - 39662
Alignment:
Q  119 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgt-taggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 217  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  ||||| |||||||    
T  39529 aattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatga 39628  T
Q  218 acttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
    |||  ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  39629 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 39662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 119 - 251
Target Start/End: Original strand, 137589 - 137722
Alignment:
Q  119 aattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgt-taggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatga 217  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||  ||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| || |||  ||||| |||||||    
T  137589 aattagttgttgcttcactcttctagtcttttgtaatgcctagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaaatcttgcatctcctgatga 137688  T
Q  218 acttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
    |||  ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  137689 actagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 137722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 37398 - 37463
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaac 76  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  37398 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 37463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 76
Target Start/End: Original strand, 135458 - 135523
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaac 76  Q
    |||||||||| |||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||    
T  135458 agcagagacaaaaatagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgccaac 135523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 94; Significance: 6e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 27544 - 27278
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  |     
T  27544 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaatggtactttgtcaacgctctttgaagagcaagcatccaatgccttcgaa 27445  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | |  |  || ||| ||||| ||||||||    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  27444 tcctatcaaaatagctgttgcttcactctttcagtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 27345  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||| ||| |  |||||||||||| |||||||||||    
T  27344 cctgatgaacttcagcatctggtgatc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgatgtcatcacttc 27278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 60012 - 60240
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||| ||| ||     
T  60012 agcagagacacaaactgagtagaagagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatggcttcaaa 60111  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||| | || | || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  |||||    
T  60112 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaattcttggacgagattaaatccattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatct 60211  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  60212 tctgatgaactttagcttctggtgatctt 60240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 7922 - 8150
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||  || ||     
T  7922 agcagagacacaaacttcgtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgaattcaaa 8021  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| |    ||||||| ||||| || | || |||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |  |||||    
T  8022 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttacagtcttctacaatgcttggacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagttttgcatct 8121  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||||||||||| |||||||||| |||||    
T  8122 cctgatgaactttagcttctggttatctt 8150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 90 - 213
Target Start/End: Complemental strand, 151906 - 151783
Alignment:
Q  90 caagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttg 189  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||  |||| |||||  | |||||||||| ||||  |||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  151906 caagcatctaatgccttcaaattcatttgaattagccgttgtttcacgtttctggtcttctacaatactaggtgtgattaaatcctttgaacaacctttg 151807  T
Q  190 aagcttgaagtctctcatcttctg 213  Q
    |||||| |||||||||||||||||    
T  151806 aagctttaagtctctcatcttctg 151783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0065 (Bit Score: 89; Significance: 6e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0065
Description:

Target: scaffold0065; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 11 - 202
Target Start/End: Original strand, 1686 - 1878
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||||||||||||||||| ||     
T  1686 agcagagacacaaactaagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagtacaagcatccaatgccttcaaa 1785  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 202  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||||  |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  1786 tcctttcaaaatagttgttgcttcactcctccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 1878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36890 - 36635
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  36890 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 36791  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  ||||||| |||| |||||| | || ||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||  |||||    
T  36790 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 36691  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  36690 cttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatga 36635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 42115 - 42370
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| ||     
T  42115 agcagagacaaaaacagagtagtagaggtagtggttgtacacttcgtacaattgttctttgtcaacactctttaaagaacaagcatccaatgccttcaaa 42214  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  ||||||| |||| |||||| | || ||| ||||||||| |||| || |||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||  |||||    
T  42215 tcctttcaaattagtcgttgcttcacttttctagtcatctgcaatgcttagacgagattaaattcattgagcagcctttgaagctttaagtcttgcatct 42314  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
      |||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||    
T  42315 cttgatgaacttcagcttctagtgatcttctgcttctgatgagatgcttctaatga 42370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 21086 - 20831
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||| ||||||||  || |  |||||||||||||||| ||     
T  21086 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtacttggtcgacgctctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 20987  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |    |||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  20986 tcctttcaaaatgaccgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 20887  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
      |||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||    
T  20886 cttgatgaacttcaacttttggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatga 20831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 263
Target Start/End: Original strand, 474 - 724
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |    
T  474 agagacacaacctgagtaatggagataatggttgtacacttcgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 573  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||| ||||||  ||||| ||    
T  574 tttcaaaatagtcgttgcttcactattccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatcaattgaacatcctttgacgctttaagtcttgcatctcct 673  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgat 263  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||  ||||||||||    
T  674 gatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatgagatgcttctgat 724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 87; Significance: 9e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 9e-42
Query Start/End: Original strand, 14 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 26087 - 25849
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||| ||| ||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||||| || | |    
T  26087 agagacacaaactgagtagtcgagatagtggttgtacacttcatacaattgtactatgtcaaccctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaaatcc 25988  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||  ||||| ||    
T  25987 tttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgacgctttaagtcttgcatctcct 25888  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  25887 gatgagctttagcttctggtgatcttcagcttctgatga 25849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Original strand, 9965 - 10231
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||| || ||     
T  9965 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacactttgtacaattgtactttgtgaacgctcttcaaagagtaagcatccaatgctttcaaa 10064  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||  |||||||| || ||||||||||| | |||| || |||| ||||||||| | | |||||||||||| ||||||  |||||    
T  10065 tcctttcaaaatagtcgttacttcactcttctagtcttctgcaaagcttagacgagattgaatccattgaatagcctttgaagctttaagtcttgcatct 10164  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     ||||||||||||| ||||| ||||||  |||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||    
T  10165 cctgatgaacttcaacttcttgtgatc--ttgcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcatcacttc 10231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 14 - 238
Target Start/End: Original strand, 15116 - 15341
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttc 113  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||| | ||| |||||||||| || || | |    
T  15116 agagatacaaactaagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctattcaaagaacaatcatccaatgctttcaaatcc 15215  T
Q  114 atttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttct 212  Q
     ||  || |||| | || |||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||  || |||||||||||| ||||||  ||||| ||    
T  15216 tttcaaaatagtcgatgcttcactcttctggtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgatcagcctttgaagctttaagtcttgcatctcct 15315  T
Q  213 gatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     ||| |||||| ||||||||||||||    
T  15316 tatgcacttcatcttctggtgatctt 15341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 29 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 36281 - 36047
Alignment:
Q  29 gtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | || ||||| ||||  ||  |  |||||||||||||||||||   |||||||| |||||||    
T  36281 gtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccattttcaactctctccaacgaaaaagcatccaatgcctttaaaaccatttgaaatagttgt 36182  T
Q  129 tgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttc 228  Q
    || |||| ||| |  ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||| || | |||||  ||||||||| |||||||||     
T  36181 tgcttcattcttccagtcttctgcaatgatagacgtgattaaatcaattgaacaacctttgaagcttcaattttctcagattctgatgatcttcagctta 36082  T
Q  229 tggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||||  | |||||||| |||| |||||||||||||    
T  36081 tggtga--tgttgcttctgatgaggtgcttctgatga 36047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 34919 - 34827
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||| |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  34919 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 34827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 25777 - 25712
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 79  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||    
T  25777 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgct 25712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 84; Significance: 6e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 12 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 44032 - 43822
Alignment:
Q  12 gcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaact 111  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  |||| ||||||||||| ||  | || |||||||||||||| || |    
T  44032 gcagagaca-aaacagagtagtggagatagtggttgtacaattcgtacaaatgtcctttttcaacgctcttcaaggaacaggcatccaatgccttcaaat 43934  T
Q  112 tcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttc 211  Q
       ||||||||||   ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||| || |||||||||||||||    
T  43933 ctttttgaattagcctttgcttcactcttctgatcttctgcaatgttaggcgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagttttaagtctctcatcttc 43834  T
Q  212 tgatgaacttca 223  Q
    |||||| |||||    
T  43833 tgatgatcttca 43822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0227 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0227
Description:

Target: scaffold0227; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 251
Target Start/End: Original strand, 22672 - 22913
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||| | || |||||||| ||||||||||| |||||  || |  |||||||||||||||| ||     
T  22672 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacgcttcatacaattgtactttgtcaacactctttgaagaataagcatccaatgccttcaaa 22771  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||| |||| |||||| | |  ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  |||||    
T  22772 tcctttcaaaatagtcgttgcttcacttttccagtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtcttgcatct 22871  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
     |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||| ||||    
T  22872 cctgatgaactacagcctctggtgatcttcagcttctgatga 22913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 82; Significance: 9e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 11 - 265
Target Start/End: Original strand, 212350 - 212604
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| || ||     
T  212350 agcatagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaa 212449  T
Q  111 ttcattt-gaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatc 208  Q
    | | |||  || ||||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||| || |||| ||||||| | | | |||||||||||| ||||||   |||    
T  212450 tccttttaaaaatagttgttgcttcactcttctagtcttctgcaatgcttagacgagattgaatccatagaatagcctttgaagctttaagtcttggatc 212549  T
Q  209 ttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    | |||||||| || |||||||| |||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  212550 tcctgatgaagtttagcttctgatgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 212604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 74 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6250 - 6085
Alignment:
Q  74 aacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaat 172  Q
    ||||||||| ||| | |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| || |||| |||    
T  6250 aacgctcttcaaagaacaagcatccaatgctttcaaatcctttcaaaatagtcgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgcttagacgagattgaat 6151  T
Q  173 ccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    | |||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| |||||||| | || ||||||| ||||||    
T  6150 ctattgaacatcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaattacaacttctggagatctt 6085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 224
Target Start/End: Original strand, 40638 - 40846
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcat 115  Q
    ||||| |||| |||||||| || |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||||||||| ||| | | | ||||  ||||||| || ||| |    
T  40638 agacataaacagagtagtgaaggtagtggttgtacacttcttacaattgttctttttcaacgctcttcaaagaaccaccatcatatgccttcaaattctt 40737  T
Q  116 ttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgat 215  Q
    |||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||| ||| |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  40738 ttgaattagccgttgcttcactcttctggtcttctgcaatgctaggtgtgattaaatcttttgaacagcctttgaagcttcaattctctcatcttctgat 40837  T
Q  216 gaacttcag 224  Q
    || ||||||    
T  40838 gatcttcag 40846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 1619 - 1409
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||| |||| ||| |  || | ||||||||||| || | | |||||| |||| |    
T  1619 agtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtccttttccaacgttcttcaaagaataaacgtccaatgccttcaaatccttttgaaatagtcg 1520  T
Q  128 ttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagctt 227  Q
    ||| |||||||   | ||||||||||||| | ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||||| ||||||||     
T  1519 ttgcttcactcctatagtcttctgcaatgatgggcgtgattaaatcatttgaacaacctttgaagcttcaattctctcagcttctgatgatcttcagctc 1420  T
Q  228 ctggtgatctt 238  Q
    ||| |||||||    
T  1419 ctgatgatctt 1409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 20 - 251
Target Start/End: Original strand, 7708 - 7940
Alignment:
Q  20 acaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttga 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || |  || ||| |||||||||||| | | |   |    
T  7708 acaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaataaacatacaatgcctttaaatccttccaa 7807  T
Q  120 attagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaa 218  Q
    | |||| || | |||||||| |  ||||| ||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||| ||||||||    
T  7808 aatagtcgtggcttcactcttccagtcttttgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatctcctgatgaa 7907  T
Q  219 cttcagcttctggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
     |  ||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  7908 atagagcttctggtgatcttcagcttctgatga 7940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 72; Significance: 8e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 276
Target Start/End: Original strand, 103585 - 103832
Alignment:
Q  28 agtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcattt-gaattagtt 126  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||||  || | ||||||||||||||| ||||  ||||||  || |||      
T  103585 agtagtggaggtagtggttgcacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcc-ttaatatcatttcaaaatagcc 103683  T
Q  127 gttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagc 225  Q
    |||| |||||||| |  ||||||||||||| |||| |   ||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  103684 gttgcttcactcttccagtcttctgcaatgtttagacaaaattaaattcatttaacaacctttcaagctttaagtcttgcatctcctgatgaacttcagc 103783  T
Q  226 ttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcactt 276  Q
    ||||||||  |  |||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||    
T  103784 ttctggtgtcc--ttgcttctgatgagatacttctgatgacgtcatcactt 103832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0861 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0861
Description:

Target: scaffold0861; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 33 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 5040 - 4807
Alignment:
Q  33 tggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgat 132  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||| ||||||||||||| || | | ||  || |||| || | |    
T  5040 tggaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaacgctctataaagaacaaacatccaatgccttcaaatcctttcaaaatagtcgtcgct 4941  T
Q  133 tcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctgg 231  Q
    |||||||    ||||||| ||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||  |||||||||    
T  4940 tcactctttcagtcttctacaatgcttagacgagattaaatccattgaacagcctttgaagctttaagtcttgcatcttctgatgaactagagcttctgg 4841  T
Q  232 tgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||||||  |||| | ||||  ||||||||||||    
T  4840 tgatcttcagcttatgatgagatgcttctgatga 4807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0426 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0426
Description:

Target: scaffold0426; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 178
Target Start/End: Original strand, 13567 - 13735
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| ||| | ||| ||||||||||||| ||     
T  13567 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaaacatccaatgccttcaaa 13666  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattg 178  Q
    | | ||  || ||||||||| |||||| | |   |||||||||||| |||| || ||||||||||||||    
T  13667 tcctttcaaaatagttgttgcttcactattccaatcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattg 13735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0273 (Bit Score: 69; Significance: 5e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0273
Description:

Target: scaffold0273; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 22 - 238
Target Start/End: Original strand, 5634 - 5849
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaat 121  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||  ||||| |||  ||| |  |||||||||||||||| || ||||||||||     
T  5634 aaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaattgtattttc-caacgttctccaaagaataagcatccaatgccttcaaattcatttgaaa 5732  T
Q  122 tagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaactt 221  Q
    |||| |||| |||| ||| || |||||||| |||| ||||| |||||||| |  ||| ||| |||||||||||| || ||| ||| |||||||||| |||    
T  5733 tagtcgttgcttcattcttctagtcttctggaatgataggcatgattaaaacatttgaacagcctttgaagcttcaattctttcagcttctgatgatctt 5832  T
Q  222 cagcttctggtgatctt 238  Q
    || || ||| |||||||    
T  5833 caactcctgatgatctt 5849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 67; Significance: 8e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 230
Target Start/End: Original strand, 15789 - 16011
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa-ttggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaa 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||| ||    
T  15789 agcagagacacaaactgagtagtagagatggtggttgtacacttcgtacaatttgtactatgtcaacgctcttcaaagaacaagcatccaatgccttcaa 15888  T
Q  110 cttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaa-tgttaggcgtgattaaatccattgtacaa-cctttgaagcttgaagtctctcat 207  Q
     | | ||  || || ||| || |||||||  |||||||| ||||| | || | || |||| ||||||||| |||| | |||||||||| ||||||  |||    
T  15889 gtcctttcaaaataattggtgcttcactcctctggtcttttgcaattcttggacgagattgaatccattgaacaatcttttgaagctttaagtcttgcat 15988  T
Q  208 cttctgatgaacttcagcttctg 230  Q
    || ||||||||||| ||||||||    
T  15989 ctcctgatgaactttagcttctg 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 3e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 90170 - 89904
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||  || | ||||||||||||||||| ||     
T  90170 agcagagacaaaaacagagtagtggaggtaggggttgtacacttcgtacacttgtattttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgccttcaaa 90071  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaat-gttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | ||  || |||  |||| |||||||| |  |||||||| |||  |||| || |||||||| |||||  ||||||||||||||| |||  |  |||||    
T  90070 tcctttcaaaatagccgttggttcactcttccagtcttctgtaatacttagacgagattaaatacattgatcaacctttgaagctttaag--ttgcatct 89973  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatg-atgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
     |||||||||| |||||||||||||| ||  |||||| ||| |  ||||||||||||||||| ||||||    
T  89972 cctgatgaactgcagcttctggtgattttcagcttctgatgaacttgcttctgatgacgtcaccacttc 89904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 3)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 11 - 238
Target Start/End: Original strand, 19027 - 19255
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| |||||  ||||||||||  || | |||||||| |||||||||||     
T  19027 agcagagacaaaaactgagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacacttgtacttttccaacgctctttgaagaacaagcatcaaatgcctttaaa 19126  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatct 209  Q
    | | |   || |||  |||| |||||||| |  ||||||||||||| || | || |||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||   |||     
T  19127 tccttccaaaatagccgttgcttcactcttccagtcttctgcaatgctttgacgagattaaatccattgaacagcctttcaagctttaagtcttgtatca 19226  T
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
     |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  19227 cctgatgaaatagagcttctggtgatctt 19255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 79
Target Start/End: Original strand, 9559 - 9624
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 79  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||||||||    
T  9559 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacagtcgtactatgtcaacgct 9624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22246 - 22151
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  | | | ||||||||||| |  || |  ||||||||||||||||    
T  22246 agcagagacaaaaacagagtactggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtattatgtcaacgctcattgaagaataagcatccaatgcctt 22151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 57; Significance: 7e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 235
Target Start/End: Original strand, 74577 - 74788
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaac 110  Q
    |||||||| ||||||  |||||| ||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||||| ||| || ||| |||||||||| ||| |||| ||     
T  74577 agcagagatacaaacaaagtagtagaggtagtggttgtacacttcatacaattgtactttgtcaatgcttttcaaagagcaagcatctaattccttcaaa 74676  T
Q  111 ttcatttgaattagttgttgattcactctcctggtcttctgcaatgttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatctt 210  Q
    | | ||||||||||  ||||||| | ||             ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| || |||| || |||    
T  74677 tccttttgaattagccgttgattaaatc-------------caatgctaggcgtgattaaatcctttgaacaacctttgaagctttaattctcacagctt 74763  T
Q  211 ctgatgaacttcagcttctggtgat 235  Q
    |||||||  ||||||||||||||||    
T  74764 ctgatgatgttcagcttctggtgat 74788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1747 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1747
Description:

Target: scaffold1747; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1408
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  1324 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgcctt 1408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1745 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold1745
Description:

Target: scaffold1745; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 22 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 87 - 3
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||  ||||||| ||||||||    
T  87 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtagtttttcaacgctcttcaaaaaataagcatctaatgcctt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 205 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 60789 - 60717
Alignment:
Q  205 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatgacgtcatcacttc 277  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  60789 catcttctgatgaacttcagcttgtggtgatcttcagcttctaatgagatgcttctgatgacgtcctcacttc 60717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 215612 - 215517
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  215612 agcagagacgaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 215517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 47; Significance: 7e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 238
Target Start/End: Original strand, 9825 - 10019
Alignment:
Q  45 ttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctttaacttcatttgaattagttgttgattcactctcctgg 144  Q
    |||||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||| |||   |||||||||||||| || || | | ||  || |||| |||  ||||||||  |||    
T  9825 ttgtacactttgtacaattgtactatgtcaacgctcttcaaagcacaagcatccaatgctttcaagtcctttcaaaatagtcgttacttcactcttttgg 9924  T
Q  145 tcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatctt 238  Q
    ||||||  |||| |||| || |||||||||||||  |||| | ||||||||| || |||  ||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  9925 tcttctataatgcttagacgagattaaatccattaaacaaaccttgaagctttaaatcttgcatctccagatgaacttcagcttctggtgatctt 10019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 14 - 49
Target Start/End: Original strand, 7823 - 7858
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgta 49  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7823 agagacacaaactgagtagaggagatagtggttgta 7858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 132 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 5934 - 5813
Alignment:
Q  132 ttcactctcctggtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaaccttt-gaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttct 229  Q
    ||||||||  ||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||| ||| ||||| ||||||| ||||||  ||||| || ||||||||||||||||    
T  5934 ttcactcttatggtcttctgcaatgcttaaacgagatgaaatccattgaacatccttttgaagctttaagtcttgcatctcctaatgaacttcagcttct 5835  T
Q  230 ggtgatcttttgcttctaatga 251  Q
    |||||||||| |||||| ||||    
T  5834 ggtgatctttagcttctgatga 5813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold1359
Description:

Target: scaffold1359; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 767 - 675
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||    
T  767 agagacaaaaacagagtagtggaggtagtggttgtacacttagtacaaacgtactttgtcaacgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1359; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 1865 - 1778
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgc 103  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | | | |||||||||||||  || |  |||||||||||||    
T  1865 agacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtaatatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgc 1778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 60802 - 60894
Alignment:
Q  14 agagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || | ||||||| |||||||||    
T  60802 agagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaacaagcattcaatgcctt 60894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1434 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1434
Description:

Target: scaffold1434; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 144 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 768 - 648
Alignment:
Q  144 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtctctcatcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgc 242  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||| ||||| |||  |||||||| || ||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  768 gtcttctgcaatgcttagacgagattaaattcattgaacagtctttgaagttttaagtcttgcatctcctgatgaactttagcttctggtgatc--ttgc 671  T
Q  243 ttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||| ||||  ||||||||||||    
T  670 ttctgatgagatgcttctgatga 648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 31 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2090 - 2039
Alignment:
Q  31 agtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2090 agtggagatagtggttgtacacttcgtacaattgtactttgtcaacgctctt 2039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 78481 - 78386
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| ||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||||    
T  78481 agcagagacaaaaacatagtagtgtaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaacgctctttaaagaataagcatccaatgcctt 78386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 17880 - 17784
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgccttt 107  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||  | ||| |||||||||||||  ||    |||||||||||||||||    
T  17880 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgctctttgaaggataagcatccaatgccttt 17784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 6855 - 6760
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||||||||| |||  ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||| ||||||  || | |||||||||||||||||    
T  6855 agcagagacaaaaatagagtactggaggtagtggttgtacacttcgtacaaacgtactttgtcaatgctctttgaagaacaagcatccaatgcctt 6760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2845 - 2774
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  2845 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctt 2774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 25514 - 25443
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||| |||||    
T  25514 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacactctt 25443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 15854 - 15813
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 52  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15854 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 15813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 9151 - 9246
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    |||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  | ||| |||||||||||||  || |  ||||||||||||||||    
T  9151 agcatagacaaaaacacagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaaacgtactatgtcaacgctctttgaagaataagcatccaatgcctt 9246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 7377 - 7448
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||| || ||| |||||||||||||    
T  7377 agcagggacaaaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacaaatgtactatgtcaacgctctt 7448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 4975 - 4916
Alignment:
Q  144 gtcttctgcaatg-ttaggcgtgattaaatccattgtacaacctttgaagcttgaagtct 202  Q
    ||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  4975 gtcttctgcaatgcttagacgagattaaatccattgaacaacctttgaagctttaagtct 4916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 5717 - 5646
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| ||||  |||||||||| |||||||||||||| || || || || |||||||||||||||||    
T  5717 agcagagacaaaaacatagtagtggaggtagtggttgtacacttcatataaatgtactttgtcaacgctctt 5646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15732 - 15642
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctcttaaaaaagcaagcatccaatgcctt 106  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||   | |||||||||| ||||||  |||   ||||||||||||||||    
T  15732 agacataaacagagtagtggagatagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaatgctctttgaaagataagcatccaatgcctt 15642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0607 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0607
Description:

Target: scaffold0607; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 11 - 52
Target Start/End: Original strand, 6002 - 6043
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacac 52  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  6002 agcagagacaaaaacagagtagtggagatagtggttgtacac 6043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0485 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0485
Description:

Target: scaffold0485; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 205 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 9326 - 9268
Alignment:
Q  205 catcttctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||  ||||||||||||    
T  9326 catctcctgatgaacttcagcttctggtgatc--ttgcttctgatgagatgcttctgatga 9268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0473 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0473
Description:

Target: scaffold0473; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 2806 - 2738
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgct 79  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||| || |||||  | ||| ||||||||||    
T  2806 agcagagacaaaaacagagtagtggagttagtggttgtacacttcatacaaacgtactatgtcaacgct 2738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1331 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold1331
Description:

Target: scaffold1331; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 1814 - 1743
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||| |||| || |||||||||||||| ||||| ||  | |||||||||||||||||    
T  1814 agcagagacaaaaacagagcagtgaaggtagtggttgtacacttcgtaaaaacgtactttgtcaacgctctt 1743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0414 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0414
Description:

Target: scaffold0414; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 22 - 61
Target Start/End: Complemental strand, 7260 - 7221
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaa 61  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7260 aaacagagtagtggagatagtggttgtacacttcgtacaa 7221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 13448 - 13393
Alignment:
Q  210 tctgatgaacttcagcttctggtgatcttttgcttctaatgatgtgcttctgatga 265  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||  ||||||||||||    
T  13448 tctgatgaacttcagcttctggtgttcttcagcttctgatgagatgcttctgatga 13393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 87715 - 87644
Alignment:
Q  11 agcagagacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||  |||||||||||||| |||||||   | ||| |||||||||||||    
T  87715 agcagagacagaaacagagtagtggaagtagtggttgtacacttcgtacagacgtactatgtcaacgctctt 87644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 165056 - 164990
Alignment:
Q  16 agacacaaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||   | |||||||||||||||||    
T  165056 agacataaacagagtagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagacgtactttgtcaacgctctt 164990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 22 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3999 - 3939
Alignment:
Q  22 aaactgagtagtggagatagtggttgtacacatcgtacaattggactttgtcaacgctctt 82  Q
    |||| ||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||||||||    
T  3999 aaacagagaagtggaggtagtggtcgtacacttcgtacagatgtactttgtcaacgctctt 3939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University